View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2859R-Insertion-2 (Length: 970)

Name: NF2859R-Insertion-2
Description: NF2859R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2859R-Insertion-2
NF2859R-Insertion-2
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (8-482)||(14421192-14421665)
chr2 (491-970)||(14420626-14421110)
chr2 (673-932)||(41665700-41665955)
chr2 (673-927)||(37355031-37355284)
chr2 (688-926)||(44424591-44424825)
chr2 (672-926)||(24774861-24775113)
chr2 (673-927)||(34329997-34330247)
chr2 (676-927)||(15851526-15851775)
chr2 (672-926)||(17663620-17663872)
chr2 (673-955)||(247625-247907)
chr2 (672-926)||(38449571-38449823)
chr2 (671-926)||(28264809-28265060)
chr2 (673-925)||(8064931-8065180)
chr2 (672-927)||(28733820-28734071)
chr2 (672-926)||(27297573-27297825)
chr2 (673-926)||(45214721-45214972)
chr2 (674-925)||(2048689-2048936)
chr2 (672-926)||(20361979-20362230)
chr2 (672-926)||(7278470-7278722)
chr2 (700-926)||(9718057-9718281)
chr2 (673-927)||(17250819-17251071)
chr2 (673-926)||(41865712-41865962)
chr2 (672-911)||(31644300-31644536)
chr2 (672-927)||(1246269-1246523)
chr2 (702-911)||(11071679-11071887)
chr2 (673-926)||(11459149-11459401)
chr2 (673-927)||(3237716-3237962)
chr2 (672-926)||(40345933-40346190)
chr2 (773-918)||(375301-375446)
chr2 (694-927)||(3326719-3326953)
chr2 (672-757)||(41327661-41327746)
chr2 (687-894)||(4758054-4758259)
chr2 (710-898)||(2521195-2521381)
chr2 (826-926)||(44421445-44421544)
chr2 (673-763)||(534622-534712)
chr2 (672-926)||(3645319-3645567)
chr2 (773-926)||(21012849-21013002)
chr2 (675-897)||(7255626-7255844)
chr2 (708-918)||(2131761-2131968)
chr2 (672-894)||(23464711-23464929)
chr2 (826-926)||(4033577-4033676)
chr2 (688-763)||(4398457-4398532)
chr2 (773-913)||(6275523-6275663)
chr2 (837-911)||(4398545-4398618)
chr2 (681-931)||(13534405-13534644)
chr2 (786-892)||(38982038-38982146)
chr2 (787-910)||(43650046-43650169)
chr2 (834-926)||(44274685-44274776)
chr2 (673-764)||(27749623-27749714)
chr2 (788-926)||(35178764-35178902)
chr2 (787-926)||(42250849-42250985)
chr2 (673-763)||(44421890-44421980)
chr2 (690-911)||(25731063-25731280)
chr2 (718-918)||(32677479-32677678)
chr2 (672-764)||(43119223-43119315)
chr2 (787-918)||(2917071-2917198)
chr2 (785-907)||(28190613-28190735)
chr2 (820-911)||(35241712-35241802)
chr2 (845-927)||(8384001-8384082)
chr2 (820-926)||(26512067-26512172)
chr2 (673-719)||(34042053-34042099)
chr2 (672-764)||(38107660-38107751)
chr2 (820-927)||(7257942-7258048)
chr2 (673-764)||(45150600-45150691)
chr2 (820-923)||(45150740-45150842)
chr2 (826-908)||(14527637-14527718)
chr2 (864-926)||(27749508-27749570)
chr2 (676-764)||(12417530-12417618)
chr2 (676-764)||(12429590-12429678)
chr2 (786-909)||(16808792-16808915)
chr2 (786-909)||(16848073-16848196)
chr2 (788-926)||(43709914-43710053)
chr2 (678-764)||(4033982-4034068)
chr2 (723-822)||(44274426-44274524)
chr2 (830-926)||(8667634-8667730)
chr2 (688-757)||(43650190-43650258)
chr2 (875-918)||(2395806-2395849)
chr2 (688-755)||(2916974-2917041)
chr2 (826-896)||(8393234-8393303)
chr2 (826-896)||(36846781-36846850)
chr2 (826-896)||(44462591-44462660)
chr2 (786-858)||(2654364-2654437)
chr2 (673-702)||(12890265-12890294)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (673-927)||(5845171-5845423)
chr5 (673-935)||(15898319-15898580)
chr5 (673-926)||(39690343-39690594)
chr5 (673-927)||(25017528-25017783)
chr5 (700-926)||(29866185-29866409)
chr5 (673-927)||(36177287-36177540)
chr5 (673-927)||(4738625-4738876)
chr5 (680-926)||(10523137-10523382)
chr5 (673-926)||(3558884-3559135)
chr5 (673-955)||(21912086-21912367)
chr5 (703-926)||(36347488-36347709)
chr5 (680-926)||(35568869-35569113)
chr5 (673-926)||(20946083-20946334)
chr5 (673-927)||(34877661-34877913)
chr5 (673-926)||(38971985-38972234)
chr5 (673-955)||(27642468-27642749)
chr5 (701-926)||(4857378-4857606)
chr5 (673-926)||(43453978-43454228)
chr5 (673-927)||(3247128-3247383)
chr5 (673-926)||(27587834-27588087)
chr5 (705-926)||(27798152-27798371)
chr5 (789-926)||(43060482-43060618)
chr5 (776-935)||(25690644-25690807)
chr5 (673-764)||(27925429-27925520)
chr5 (773-927)||(16070-16224)
chr5 (704-927)||(40979098-40979321)
chr5 (673-927)||(9946215-9946467)
chr5 (775-919)||(600768-600912)
chr5 (786-926)||(30348045-30348185)
chr5 (787-927)||(11980711-11980851)
chr5 (730-862)||(8717873-8718004)
chr5 (703-927)||(10934001-10934221)
chr5 (773-912)||(12895164-12895303)
chr5 (739-927)||(21574802-21574989)
chr5 (673-757)||(25690510-25690594)
chr5 (673-822)||(31641047-31641196)
chr5 (773-926)||(42644433-42644586)
chr5 (688-926)||(18729584-18729824)
chr5 (680-926)||(36750640-36750882)
chr5 (820-911)||(4745138-4745228)
chr5 (820-911)||(41521199-41521289)
chr5 (786-896)||(19281460-19281569)
chr5 (688-897)||(3630990-3631199)
chr5 (672-751)||(43060071-43060151)
chr5 (673-764)||(7510695-7510786)
chr5 (673-755)||(12895037-12895118)
chr5 (673-859)||(32401313-32401496)
chr5 (864-926)||(7510602-7510664)
chr5 (673-763)||(20975662-20975752)
chr5 (835-908)||(457785-457857)
chr5 (786-926)||(14044466-14044606)
chr5 (671-764)||(15966940-15967031)
chr5 (688-764)||(129761-129837)
chr5 (790-909)||(9375611-9375730)
chr5 (773-879)||(5151156-5151261)
chr5 (843-918)||(32067832-32067906)
chr5 (864-926)||(15967158-15967220)
chr5 (792-925)||(16496434-16496566)
chr5 (846-900)||(29874200-29874253)
chr5 (826-927)||(16969369-16969469)
chr5 (673-757)||(29874469-29874554)
chr5 (786-878)||(30317793-30317885)
chr5 (826-881)||(731961-732016)
chr5 (723-859)||(7736042-7736177)
chr5 (673-749)||(18032766-18032842)
chr5 (672-754)||(30317910-30317992)
chr5 (885-926)||(20976357-20976398)
chr5 (773-822)||(29874258-29874307)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (676-927)||(25198284-25198532)
chr8 (665-927)||(38761207-38761469)
chr8 (667-926)||(31746259-31746515)
chr8 (673-926)||(40517739-40517987)
chr8 (673-955)||(26878587-26878869)
chr8 (673-955)||(24962224-24962505)
chr8 (673-927)||(24512025-24512278)
chr8 (673-926)||(57047-57298)
chr8 (673-926)||(7172215-7172464)
chr8 (673-898)||(31252514-31252737)
chr8 (680-927)||(39543526-39543774)
chr8 (673-918)||(12762846-12763088)
chr8 (673-934)||(41086962-41087220)
chr8 (673-926)||(43980442-43980693)
chr8 (675-918)||(43191342-43191579)
chr8 (678-908)||(30262404-30262630)
chr8 (684-927)||(38202862-38203103)
chr8 (673-927)||(25185025-25185280)
chr8 (673-927)||(38773207-38773460)
chr8 (673-926)||(885458-885707)
chr8 (673-926)||(2562587-2562840)
chr8 (670-908)||(36309451-36309688)
chr8 (673-927)||(38770046-38770298)
chr8 (673-926)||(40790785-40791035)
chr8 (673-927)||(37956116-37956361)
chr8 (674-926)||(10396090-10396338)
chr8 (786-926)||(14577622-14577762)
chr8 (685-926)||(37141722-37141961)
chr8 (702-926)||(45185154-45185377)
chr8 (673-926)||(5191410-5191658)
chr8 (672-926)||(1769307-1769557)
chr8 (672-918)||(45183720-45183963)
chr8 (673-926)||(1177014-1177265)
chr8 (683-911)||(7772523-7772748)
chr8 (777-918)||(25888599-25888740)
chr8 (675-935)||(17933691-17933948)
chr8 (776-927)||(24276517-24276666)
chr8 (672-911)||(36437512-36437750)
chr8 (724-927)||(40337101-40337302)
chr8 (673-900)||(45203780-45204005)
chr8 (672-764)||(3005982-3006074)
chr8 (788-926)||(3113505-3113643)
chr8 (673-764)||(40601899-40601990)
chr8 (820-930)||(44255445-44255554)
chr8 (786-926)||(14846891-14847031)
chr8 (773-926)||(31673593-31673746)
chr8 (673-754)||(2303258-2303339)
chr8 (673-754)||(2327852-2327933)
chr8 (706-927)||(37600779-37600999)
chr8 (820-926)||(34882666-34882771)
chr8 (773-927)||(12998645-12998804)
chr8 (723-926)||(22590371-22590572)
chr8 (673-841)||(40807870-40808037)
chr8 (820-927)||(16002728-16002834)
chr8 (671-754)||(45283344-45283427)
chr8 (864-926)||(14522652-14522714)
chr8 (864-926)||(16644084-16644146)
chr8 (820-908)||(35794756-35794843)
chr8 (832-923)||(3006798-3006888)
chr8 (673-764)||(34158072-34158163)
chr8 (672-749)||(16357158-16357235)
chr8 (864-956)||(45283830-45283923)
chr8 (790-913)||(12894178-12894301)
chr8 (687-751)||(23280817-23280881)
chr8 (864-927)||(4273956-4274019)
chr8 (703-764)||(4273855-4273916)
chr8 (687-756)||(10709477-10709546)
chr8 (787-858)||(23399748-23399820)
chr8 (826-910)||(40602052-40602135)
chr8 (801-911)||(14739440-14739550)
chr8 (826-888)||(34157951-34158012)
chr8 (703-764)||(10860876-10860937)
chr8 (684-721)||(14522226-14522263)
chr8 (839-908)||(14906615-14906683)
chr8 (680-733)||(41371667-41371720)
[»] chr1 (90 HSPs)
chr1 (673-927)||(5084946-5085198)
chr1 (672-926)||(48721725-48721976)
chr1 (676-927)||(34696743-34696992)
chr1 (680-955)||(23982456-23982731)
chr1 (673-927)||(36084964-36085216)
chr1 (673-926)||(15512638-15512889)
chr1 (673-926)||(28948821-28949072)
chr1 (673-926)||(4817763-4818012)
chr1 (673-926)||(4829563-4829812)
chr1 (672-927)||(5321878-5322132)
chr1 (673-934)||(3143389-3143650)
chr1 (687-926)||(35365853-35366092)
chr1 (673-911)||(46591112-46591348)
chr1 (673-926)||(51390395-51390643)
chr1 (685-927)||(16582527-16582769)
chr1 (688-911)||(28723522-28723746)
chr1 (673-927)||(8877766-8878016)
chr1 (673-926)||(30898420-30898671)
chr1 (673-892)||(3831076-3831293)
chr1 (688-926)||(32152153-32152387)
chr1 (701-927)||(33231834-33232058)
chr1 (688-926)||(25258325-25258561)
chr1 (826-926)||(38680470-38680569)
chr1 (673-926)||(52141032-52141285)
chr1 (673-930)||(47643533-47643786)
chr1 (701-918)||(51996958-51997174)
chr1 (673-926)||(25063205-25063458)
chr1 (703-926)||(46495304-46495525)
chr1 (672-926)||(4813317-4813570)
chr1 (673-926)||(44163227-44163468)
chr1 (786-926)||(8984629-8984769)
chr1 (673-934)||(32047428-32047677)
chr1 (677-927)||(28334081-28334324)
chr1 (786-951)||(2342873-2343039)
chr1 (795-926)||(23393492-23393620)
chr1 (775-927)||(29140611-29140763)
chr1 (672-927)||(25269371-25269622)
chr1 (673-756)||(32715956-32716038)
chr1 (773-925)||(44652816-44652965)
chr1 (673-926)||(13723326-13723586)
chr1 (788-935)||(44335275-44335426)
chr1 (673-926)||(15179405-15179656)
chr1 (786-926)||(30336054-30336194)
chr1 (786-910)||(31807940-31808064)
chr1 (788-918)||(15911522-15911652)
chr1 (787-901)||(47070930-47071044)
chr1 (773-918)||(32144314-32144459)
chr1 (774-926)||(20564770-20564922)
chr1 (826-926)||(15457824-15457923)
chr1 (806-897)||(24415024-24415115)
chr1 (808-926)||(31305313-31305431)
chr1 (820-927)||(35001273-35001379)
chr1 (682-852)||(46732827-46732995)
chr1 (773-926)||(28679777-28679928)
chr1 (820-918)||(47754645-47754742)
chr1 (795-926)||(3143713-3143842)
chr1 (774-917)||(9675623-9675766)
chr1 (673-897)||(16395409-16395627)
chr1 (677-849)||(34012558-34012728)
chr1 (705-911)||(3072149-3072350)
chr1 (787-925)||(44395531-44395669)
chr1 (673-747)||(8984366-8984440)
chr1 (682-764)||(9684582-9684664)
chr1 (826-916)||(41737130-41737219)
chr1 (806-926)||(34102331-34102451)
chr1 (835-925)||(50692405-50692494)
chr1 (672-764)||(29302345-29302437)
chr1 (773-879)||(291590-291696)
chr1 (680-763)||(7957551-7957634)
chr1 (773-926)||(10842324-10842475)
chr1 (773-883)||(13145456-13145566)
chr1 (776-926)||(27531094-27531244)
chr1 (864-927)||(29302495-29302558)
chr1 (673-764)||(47753894-47753985)
chr1 (837-923)||(13352832-13352917)
chr1 (841-926)||(47133463-47133548)
chr1 (664-733)||(20487123-20487192)
chr1 (672-733)||(31305455-31305516)
chr1 (843-927)||(34012050-34012134)
chr1 (680-764)||(5852568-5852652)
chr1 (673-753)||(41737236-41737316)
chr1 (837-924)||(40261592-40261678)
chr1 (773-916)||(4081931-4082074)
chr1 (832-928)||(6282467-6282562)
chr1 (673-749)||(12844000-12844076)
chr1 (673-721)||(44652728-44652776)
chr1 (672-763)||(49033829-49033920)
chr1 (840-917)||(13698592-13698670)
chr1 (694-764)||(24415144-24415214)
chr1 (679-764)||(23393117-23393202)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (673-926)||(1763809-1764060)
chr6 (673-926)||(31945771-31946022)
chr6 (683-926)||(6791374-6791613)
chr6 (694-926)||(15981790-15982020)
chr6 (708-926)||(16327119-16327336)
chr6 (673-926)||(19838927-19839178)
chr6 (708-926)||(16350517-16350734)
chr6 (684-918)||(30465838-30466070)
chr6 (673-927)||(11302850-11303104)
chr6 (737-927)||(5895726-5895914)
chr6 (702-923)||(197337-197558)
chr6 (694-927)||(31536007-31536239)
chr6 (701-926)||(22410729-22410953)
chr6 (673-924)||(28238175-28238422)
chr6 (676-822)||(30248962-30249105)
chr6 (710-911)||(34513115-34513313)
chr6 (801-911)||(12514570-12514680)
chr6 (820-926)||(9428163-9428268)
chr6 (775-858)||(3729485-3729569)
chr6 (672-926)||(31780120-31780374)
chr6 (773-925)||(3887899-3888051)
chr6 (833-925)||(5084555-5084650)
chr6 (824-918)||(3729393-3729486)
chr6 (673-757)||(10260462-10260546)
chr6 (680-927)||(9461288-9461533)
chr6 (773-918)||(33607359-33607504)
chr6 (705-893)||(5457216-5457400)
chr6 (839-923)||(30248563-30248645)
chr6 (864-927)||(4250706-4250769)
chr6 (820-908)||(10669279-10669366)
chr6 (819-926)||(1514232-1514337)
chr6 (787-911)||(16186584-16186705)
chr6 (786-852)||(31039215-31039282)
chr6 (791-920)||(20522974-20523103)
chr6 (866-927)||(11081891-11081952)
chr6 (723-757)||(10669199-10669233)
[»] scaffold1091 (1 HSPs)
scaffold1091 (673-926)||(1771-2022)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (672-934)||(48767551-48767813)
chr7 (673-927)||(1324703-1324954)
chr7 (673-926)||(19235923-19236176)
chr7 (672-927)||(4089358-4089610)
chr7 (673-926)||(2276437-2276686)
chr7 (680-926)||(21388238-21388482)
chr7 (672-926)||(10685081-10685332)
chr7 (673-911)||(35128395-35128632)
chr7 (673-927)||(18121902-18122152)
chr7 (788-926)||(20123446-20123585)
chr7 (704-927)||(37673732-37673953)
chr7 (773-926)||(6376088-6376242)
chr7 (673-904)||(36726030-36726260)
chr7 (675-911)||(29635901-29636134)
chr7 (673-926)||(37048031-37048277)
chr7 (678-926)||(26632842-26633088)
chr7 (673-926)||(25750364-25750613)
chr7 (673-926)||(33181291-33181540)
chr7 (703-926)||(48610026-48610245)
chr7 (672-926)||(37491477-37491728)
chr7 (683-926)||(21809516-21809756)
chr7 (685-926)||(21800927-21801165)
chr7 (773-927)||(27162859-27163012)
chr7 (672-927)||(36116316-36116567)
chr7 (673-904)||(43465004-43465230)
chr7 (679-926)||(46783706-46783950)
chr7 (787-926)||(26200938-26201077)
chr7 (786-927)||(40263706-40263847)
chr7 (787-911)||(5334365-5334489)
chr7 (676-906)||(49100687-49100919)
chr7 (784-926)||(27213483-27213625)
chr7 (773-926)||(28663752-28663904)
chr7 (773-927)||(40740945-40741101)
chr7 (834-927)||(40211295-40211387)
chr7 (680-908)||(42983479-42983705)
chr7 (678-762)||(8318689-8318773)
chr7 (808-926)||(31373689-31373807)
chr7 (673-858)||(21759783-21759967)
chr7 (786-926)||(48193611-48193751)
chr7 (777-908)||(21392853-21392984)
chr7 (672-755)||(5333756-5333839)
chr7 (820-926)||(23876033-23876138)
chr7 (688-764)||(34118166-34118242)
chr7 (688-879)||(47458060-47458248)
chr7 (792-918)||(21752532-21752657)
chr7 (820-918)||(29992979-29993076)
chr7 (832-926)||(10595115-10595206)
chr7 (678-754)||(43601031-43601107)
chr7 (823-926)||(4068395-4068497)
chr7 (776-926)||(27170008-27170157)
chr7 (773-862)||(13907699-13907789)
chr7 (806-910)||(44648704-44648810)
chr7 (683-764)||(29723616-29723697)
chr7 (673-730)||(20124362-20124419)
chr7 (672-749)||(25098243-25098320)
chr7 (773-849)||(28038844-28038921)
chr7 (863-911)||(41672613-41672661)
chr7 (826-918)||(42993198-42993289)
chr7 (672-757)||(20123609-20123693)
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (673-926)||(26517075-26517326)
chr3 (673-926)||(20945160-20945411)
chr3 (679-926)||(14645755-14646000)
chr3 (673-911)||(44083637-44083873)
chr3 (673-934)||(12077601-12077863)
chr3 (673-926)||(42891414-42891664)
chr3 (675-911)||(28477395-28477628)
chr3 (680-927)||(40645668-40645911)
chr3 (676-926)||(13084223-13084469)
chr3 (673-918)||(22659583-22659826)
chr3 (673-927)||(29676601-29676851)
chr3 (672-926)||(46048517-46048770)
chr3 (688-927)||(41308652-41308888)
chr3 (673-926)||(31819401-31819652)
chr3 (774-927)||(27638036-27638189)
chr3 (672-835)||(31530987-31531149)
chr3 (688-918)||(26043022-26043247)
chr3 (773-926)||(50363022-50363175)
chr3 (688-926)||(50524851-50525087)
chr3 (683-927)||(41727108-41727350)
chr3 (694-926)||(831239-831471)
chr3 (773-927)||(30476035-30476189)
chr3 (725-926)||(46435643-46435841)
chr3 (820-926)||(29645353-29645458)
chr3 (773-926)||(33287861-33288014)
chr3 (678-910)||(39617117-39617345)
chr3 (724-926)||(11388116-11388318)
chr3 (683-911)||(31474434-31474659)
chr3 (808-918)||(26121335-26121445)
chr3 (837-926)||(31531448-31531536)
chr3 (693-911)||(11140715-11140922)
chr3 (672-764)||(29645479-29645571)
chr3 (672-764)||(35145387-35145478)
chr3 (784-930)||(27047147-27047293)
chr3 (724-891)||(35055816-35055980)
chr3 (788-926)||(51263077-51263215)
chr3 (801-910)||(29611845-29611954)
chr3 (673-900)||(29349395-29349624)
chr3 (786-930)||(41825108-41825252)
chr3 (673-925)||(44338078-44338326)
chr3 (673-927)||(43186961-43187205)
chr3 (673-755)||(11345484-11345566)
chr3 (773-926)||(41543565-41543718)
chr3 (773-926)||(42010863-42011016)
chr3 (821-926)||(37729036-37729140)
chr3 (773-917)||(48309449-48309592)
chr3 (672-954)||(28228144-28228427)
chr3 (828-926)||(11393917-11394014)
chr3 (832-926)||(52325521-52325614)
chr3 (808-904)||(26243489-26243585)
chr3 (826-927)||(26998889-26998989)
chr3 (673-892)||(21932955-21933172)
chr3 (682-911)||(33411845-33412069)
chr3 (673-764)||(53716828-53716919)
chr3 (788-926)||(54425929-54426067)
chr3 (677-763)||(3475606-3475692)
chr3 (820-918)||(25750530-25750627)
chr3 (773-926)||(41739931-41740084)
chr3 (788-911)||(48903056-48903179)
chr3 (673-764)||(26999198-26999289)
chr3 (820-895)||(28243785-28243859)
chr3 (673-720)||(30476224-30476271)
chr3 (678-918)||(35765506-35765749)
chr3 (826-926)||(11344553-11344651)
chr3 (863-923)||(23157093-23157153)
chr3 (847-927)||(34055895-34055974)
chr3 (788-911)||(48901490-48901613)
chr3 (773-847)||(5504533-5504608)
chr3 (788-926)||(54555897-54556035)
chr3 (672-764)||(25750673-25750766)
chr3 (732-927)||(49000446-49000640)
chr3 (775-891)||(28229195-28229311)
chr3 (679-720)||(41543516-41543557)
chr3 (691-764)||(50092824-50092897)
chr3 (788-911)||(383616-383739)
chr3 (877-925)||(5504604-5504652)
chr3 (673-720)||(12236506-12236553)
chr3 (831-926)||(31650682-31650776)
chr3 (675-754)||(34055727-34055806)
chr3 (673-764)||(44698381-44698472)
chr3 (832-927)||(50092662-50092756)
chr3 (820-926)||(2421080-2421184)
chr3 (826-892)||(39931910-39931975)
chr3 (820-858)||(44647838-44647876)
chr3 (832-926)||(48213620-48213713)
chr3 (722-763)||(6719288-6719329)
[»] chr4 (81 HSPs)
chr4 (673-926)||(22750700-22750951)
chr4 (678-911)||(5932897-5933128)
chr4 (672-926)||(25477221-25477472)
chr4 (673-926)||(30153081-30153331)
chr4 (673-926)||(38136351-38136597)
chr4 (673-898)||(43800832-43801055)
chr4 (667-911)||(46729316-46729558)
chr4 (673-927)||(39237446-39237699)
chr4 (683-926)||(43509079-43509319)
chr4 (680-926)||(20291336-20291579)
chr4 (676-927)||(24072762-24073011)
chr4 (672-926)||(31840094-31840343)
chr4 (673-886)||(40411201-40411412)
chr4 (673-927)||(54438505-54438757)
chr4 (673-911)||(33246357-33246591)
chr4 (680-926)||(37624989-37625234)
chr4 (673-926)||(52198587-52198837)
chr4 (673-926)||(12624692-12624943)
chr4 (689-918)||(39196907-39197136)
chr4 (673-927)||(50782773-50783018)
chr4 (672-926)||(51787767-51788018)
chr4 (673-927)||(52226014-52226266)
chr4 (672-923)||(34543701-34543953)
chr4 (673-926)||(19654424-19654676)
chr4 (673-927)||(20262254-20262504)
chr4 (724-926)||(14602560-14602764)
chr4 (673-934)||(20116439-20116698)
chr4 (673-926)||(22651460-22651711)
chr4 (673-897)||(5168004-5168226)
chr4 (673-927)||(16070426-16070678)
chr4 (788-926)||(29584890-29585028)
chr4 (675-916)||(54359690-54359927)
chr4 (680-926)||(54701159-54701396)
chr4 (710-911)||(13096436-13096636)
chr4 (687-927)||(5536492-5536717)
chr4 (673-764)||(31936952-31937043)
chr4 (776-926)||(41919997-41920147)
chr4 (788-926)||(56373315-56373453)
chr4 (672-926)||(20185517-20185765)
chr4 (674-879)||(21171767-21171969)
chr4 (710-926)||(41945668-41945881)
chr4 (672-927)||(5448657-5448906)
chr4 (680-955)||(26203095-26203371)
chr4 (673-926)||(31486484-31486735)
chr4 (694-911)||(52552391-52552605)
chr4 (676-764)||(20792147-20792235)
chr4 (827-926)||(37175033-37175130)
chr4 (773-926)||(39414232-39414383)
chr4 (820-926)||(28116509-28116614)
chr4 (673-911)||(10602068-10602300)
chr4 (673-934)||(32236818-32237080)
chr4 (679-911)||(48472360-48472589)
chr4 (808-910)||(31937383-31937485)
chr4 (773-918)||(10541213-10541358)
chr4 (820-926)||(26186759-26186864)
chr4 (673-764)||(51918513-51918606)
chr4 (673-857)||(20293811-20293995)
chr4 (788-911)||(45628046-45628168)
chr4 (840-918)||(3094186-3094263)
chr4 (673-911)||(7002194-7002429)
chr4 (675-897)||(44812467-44812687)
chr4 (789-926)||(3684159-3684297)
chr4 (808-924)||(5416860-5416974)
chr4 (673-744)||(45627947-45628017)
chr4 (672-762)||(31917533-31917623)
chr4 (820-893)||(32107874-32107946)
chr4 (672-748)||(39813815-39813891)
chr4 (788-859)||(20540033-20540104)
chr4 (864-927)||(45079858-45079921)
chr4 (773-862)||(21121026-21121116)
chr4 (724-926)||(20016521-20016717)
chr4 (673-749)||(50438172-50438248)
chr4 (773-908)||(52977570-52977705)
chr4 (724-764)||(56216673-56216713)
chr4 (773-856)||(56217009-56217093)
chr4 (673-720)||(28115099-28115146)
chr4 (808-890)||(52768890-52768972)
chr4 (864-918)||(20791931-20791985)
chr4 (824-857)||(10540468-10540501)
chr4 (780-856)||(31294221-31294298)
chr4 (786-858)||(41459650-41459723)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (673-918)||(49140-49383)
scaffold0013 (820-896)||(61286-61361)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (724-926)||(214614-214818)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (673-924)||(38337-38584)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (778-926)||(99778-99926)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (673-849)||(25771-25946)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (676-751)||(20175-20250)
[»] scaffold0460 (2 HSPs)
scaffold0460 (664-733)||(12928-12997)
scaffold0460 (664-733)||(8112-8181)
[»] scaffold0182 (3 HSPs)
scaffold0182 (791-898)||(22084-22191)
scaffold0182 (673-764)||(22585-22677)
scaffold0182 (820-908)||(18703-18790)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (673-720)||(990-1037)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (683-757)||(24222-24296)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (673-745)||(54975-55047)
[»] scaffold0559 (1 HSPs)
scaffold0559 (704-757)||(6672-6725)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 451; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14421665 - 14421192
Alignment:
Q  8 actaattgatggaacattataaattaaagacagtgacttggtcccatgcatggccaacaaaaggaatttcagctaattgaccttataaggaattaaaata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14421665 actaattgatggaacattataaattaaagacagtgacttggtcccatgcatggccatcaaaaggaatttcagctaattgaccttataaggaattaaaata 14421566  T
Q  108 ttgttcattataatgcaaattatggtgagtattgttcaacatcgcagtcacaggaccatcttgcacgaggaggagatggaaaattgaagcagagtcacga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14421565 ttgttcattataatgcaaattatggtgagtattgttcaacatcgcagtcacaggaccatcttgcacgaggaggagatggaaaattgaagtagagtcacga 14421466  T
Q  208 ccatggtgttgggttaaagagaatatttgtgccttaaagccctacattttttatggctcaattaaaaaccatgttttgattgggtaggatagggtgttgg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14421465 ccatggtgttgggttaaagagaatatttgtgccttaaagccctacattttttatggctcaattaaaaaccatgttttgattgggtaggata-gctgttgg 14421367  T
Q  308 aatcttcctatactttttattcccttcctagttgttgtgtgcttgacatttcctaaatcttccagaaaatactattagtaacctagaactccccaaacac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14421366 aatcttcctatactttttattcccttcatagttgttgtgtgcttgacatttcctaaatcttccagaaaatactattagtaacctagaactccccaaacac 14421267  T
Q  408 ttgattgattgattgatatatcctctgttttttggatagattgatatccttagtagacaaattcatacttagttt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14421266 ttgattgattgattgatatatcctctgttttttggatagattgatatccttagtagacaaattcatacttagttt 14421192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 491 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 14421110 - 14420626
Alignment:
Q  491 gacaattaatataatacttatcaagttatcatgcatatgtcctttgnnnnnnnnnnta--cttataattaatgttgcacataagtgcatggtactataca 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14421110 gacaattaatataatacttatcaagctatcatgcatatgtcctttgaaaaaaaaaaaaaacttataattaatgttgcacataagtgcatggtactataca 14421011  T
Q  589 agagtcatcttgcatggctatataatttgta---atttagaataggatggtgtgtgaagcttaaactatgtctttcccaataattgttactccctccgtc 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14421010 agagtcatcttgcatggctatataatttgtagtaatttagaataggatggtgagtgaagcatagactatgtctttcccaataattgttactccctccgtc 14420911  T
Q  686 cctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgct 785  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||||| ||    
T  14420910 cttatatttaagcattcatttgactttatttttgtttctaaatgtaaacctcttttcagattactagatgcatttattattttaa--tcctaaacatact 14420813  T
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  14420812 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaaagttaaatt-aatacacatgcaaacaaaggacaatttggta-atattaacacacaaaacagac 14420715  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa--gcaatggggcttagatatagagacggag-gagtaatagtgagtga 970  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    || |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  14420714 acattaattacactaacaacttttctttagaaaaataaaaaaagtaaagggggcttacatatagggacggagagagtaatactgagtga 14420626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 673 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 41665955 - 41665700
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctct-tttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||            
T  41665955 tacttcctccgtccctatatctaagctcccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaa-ctctctttcaaattactagatgcttttattttttt--- 41665860  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  41665859 -tcctaaacatacccctaattaatactattaacttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgatac-tattaa 41665762  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaatg 932  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41665761 cacacaaaacagacacattaattacactgacaacatttcttaagaaatgtgaaaaaacaatg 41665700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 37355284 - 37355031
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  37355284 tactccatctgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtctctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattatttattt- 37355186  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||  || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  37355185 tcctaaacatacccttaattaatacttttatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-atattaac 37355087  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37355086 acacaaaagagacacattaattacacaaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 37355031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 688 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 44424825 - 44424591
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||         |||||||||| | ||    
T  44424825 tatatctaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttattttttt----tcctaaacatacccc 44424730  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||    
T  44424729 taattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaacatacaaaacagacac 44424631  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44424630 attaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 44424591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 24775113 - 24774861
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||||           
T  24775113 ttactctctccgtccctatatttaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatttaaatctcttttcgaattactagatatatttattatttttt- 24775015  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | ||  |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  24775014 -tcctaaacatacccccgattagtactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaa 24774917  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||    
T  24774916 cacacaaaatagatacattaattacactaataaattttcttaaaaaatgtgaaaaa 24774861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 34330247 - 34329997
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||             
T  34330247 tactccctccgtcactatatctaaacatctatttgattttatttttgtctataaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattttttt---- 34330152  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  34330151 tcctaaacatatccctgattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattttgta-atattaac 34330053  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  34330052 acacaaaacaggtacattaattatactaacaactttttttaagaaatgtgaaaaag 34329997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 676 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 15851775 - 15851526
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcc 775  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||        |||    
T  15851775 tccctccgtccctatatctaagcc-ccatttgattttatttttctccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt-tcc 15851678  T
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  15851677 taaacatacccctaattaatactactattttgtcttgaaatatgaaaattcaaatttaatacacatataaacaaaggacaatttcata-atattaacaca 15851579  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15851578 aaaaacagacacattaattacactcacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 15851526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 17663872 - 17663620
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  17663872 ttactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt- 17663774  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  17663773 -tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaa 17663676  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17663675 cacataaaataggcacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 17663620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 673 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 247907 - 247625
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||       |    
T  247907 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgactttagttttatctctaaatgtaaactccttttcaaattagtagatgcaattattattttttcc 247808  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
      ||| |||| | | |||| ||||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  247807 --ctacacatacccttaatcaatactactaacttgtcttgagatatgaaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaagggcaattttata-atattaac 247711  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa--gcaatggggcttagatatagagacggagg 955  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||   |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  247710 acacaaaatagacacattaattacactaacaactttccttaaaaaatgtgaaaaaacccaatggagcttaaatatagggacggagg 247625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Original strand, 38449571 - 38449823
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  |||||           
T  38449571 ttactcccgccgtccctatatataagcactcatttgactttatttttattcctaaatgtaaaccccttttcaacttactagatgcatatattatttttt- 38449669  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | ||||||||||| || | || ||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38449670 -tcctaaacatacccctaattaatattattgacctgtcttgaaatatgaataatcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttgata-atattaa 38449767  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| || |||||| |||||||    
T  38449768 tacacaaaacagacacattaattacaaaaataacttttattaagaaatgtgaaaaa 38449823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 671 - 926
Target Start/End: Original strand, 28264809 - 28265060
Alignment:
Q  671 gttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnn 770  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||          
T  28264809 gttactccctccgtctctatatctaaacactcatctgattttatttttgtcctttaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattaatattt 28264908  T
Q  771 nctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
      |||||||||| | ||||||||||| |||   | ||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28264909 t-tcctaaacatacccctaattaatattaa---cttgtcttgaaatatgaatagtcaaatttaatatacatacaaacaaatgacaatttggta-atatta 28265003  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  28265004 acgcacaaaacaaacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 28265060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 673 - 925
Target Start/End: Original strand, 8064931 - 8065180
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||             
T  8064931 tactccctccgtccctatatttaagcccccatttgactttattattgtccctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatacatttattcatttt--- 8065027  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | ||| | |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  8065028 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaagttaatacacatacaaacaaaggataatttggta-atattaac 8065126  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  8065127 acacaaaacagacacattaattacactgacaacatttcttaggaaatgtgaaaa 8065180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 672 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 28734071 - 28733820
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||           
T  28734071 ttactccatccgtccctatatctaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatctaaacctcttttcaaattactatatgcatttattattgttt- 28733973  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| |||  | ||||||||| |  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  28733972 -tcctaaacatacccctaattaatactactaatttatcttgaaatataaaaagtcaaattttatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atatta- 28733876  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  28733875 -acataaaacagacacattaattacaccgacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaag 28733820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 27297825 - 27297573
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||   ||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||           
T  27297825 ttactccctccatccctatatctaagtaccaatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattagtagatgcatttattatttttt- 27297727  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     ||||||||||   |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||  || |||||||    
T  27297726 -tcctaaacatatccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattttgta-atattaa 27297629  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  27297628 cacacaaaacagacacattaattacactaacagtttttcttaagaaatgtgaaaaa 27297573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 45214972 - 45214721
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||||||  | |||||||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||       |    
T  45214972 tactccctctgtccttatatttacgcactcatttgactttattttcttctctaaatgtatatcccatttcaaattactagatacatttattatttttttc 45214873  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  ||||||| | |||||||||||||| |||  | |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  45214872 t--taaacatacccctaattaatactactaatttatcttaaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaagggcaatttgaaa-atattaac 45214776  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  45214775 acacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 45214721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 674 - 925
Target Start/End: Original strand, 2048689 - 2048936
Alignment:
Q  674 actccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnct 773  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||       ||    
T  2048689 actccttccgtttctatatttaagcatccatttgattttatttttgtttctaaatgtaaatcttttttcaaattattagatgcatttattatttttttct 2048788  T
Q  774 cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
      ||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||   ||| ||||||    
T  2048789 --taaacatacccctaataaatactactaacttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa-gataatttg--gtatgttaaca 2048883  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    || |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2048884 cataaaatagagacattatttacaccaacaacttttcttaagaaatgtgaaaa 2048936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 20362230 - 20361979
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  20362230 ttactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt- 20362132  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||    ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  20362131 -tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatt-tatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaa 20362035  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20362034 cacataaaatagacacattaactacactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 20361979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Original strand, 7278470 - 7278722
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  7278470 ttactctctacgtccatatatctaagcaccaatttgattttatttttatctctaaatgtaaatcccttttcaaattactagatgcatttattattatttt 7278569  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgat-atatatta 869  Q
    ||  ||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  7278570 ct--taaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatattaatagtcaaatttaatacacatacaaacaaagggcaatttgataatatatt- 7278666  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     ||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||    
T  7278667 -cacacaaaacaaacatattaattacactgacaatttttcttaacaaatgtgaaaaa 7278722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 700 - 926
Target Start/End: Original strand, 9718057 - 9718281
Alignment:
Q  700 tccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatacta 799  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||| ||||||        |||||||||| | | ||||||||||||    
T  9718057 tccatttgattttatttttgtttctaaatgtaaacaccctttcaaattattagatgcatttattatttttt--tcctaaacatacccttaattaatacta 9718154  T
Q  800 ataacatgtcttgaaatttga-aagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacact 898  Q
     |||| |||||||||||  || |||  ||||| ||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9718155 ctaacttgtcttgaaatacgataagacaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttggta-atattaacacacaaaacagacacattaattacact 9718253  T
Q  899 aacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  9718254 gacaacatttcttaagaaatgtgaaaaa 9718281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 17250819 - 17251071
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||            
T  17250819 tactccctctgtccc-atatgtaaacactcatttaattttatttttgtctctaaatgtaaactcctttttaaattactatatgcatttattattttttt- 17250916  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| |   |||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  17250917 tcctaaacatacctttaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaatttaaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-atattaac 17251015  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  17251016 acacaaaacagacacattaattatactaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 17251071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 41865962 - 41865712
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||            
T  41865962 tactccatccgtccctatatttaagcactcatttgattttatttttgttcctaaatgtaaacaccttttcaaattattagatgcatttattatttttt-- 41865865  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||| |||| || |||| |||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||| || || |||||| || || |||||    
T  41865864 tcctaaacatacccctaataaatattactaacttgtcttaaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaac-aaggataatttggta-atgttaac 41865767  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41865766 acacaaaatagacacattaattagaccaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 41865712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 672 - 911
Target Start/End: Original strand, 31644300 - 31644536
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttattannnnnn 770  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||          
T  31644300 ttactcactctgtccttatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaa-ctcattttcaaattactagatgcatttattattttt- 31644397  T
Q  771 nctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
      |||||||||| | |||||||||||||| ||   | ||||||| | || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  31644398 --tcctaaacatacccctaattaatactactattttatcttgaattatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-atatta 31644494  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  31644495 acacaaaaaacagacacattaattaaactgataacttttctt 31644536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 672 - 927
Target Start/End: Original strand, 1246269 - 1246523
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    ||||| |||| | ||||||||||||||| || || ||||||           
T  1246269 ttactccctccatccttatatctaaacatccatttaattttatttttgcccttaaatataaaccacttttcaaattactaaatacatttattattattt- 1246367  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
     | |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  1246368 -ttctaaacatacccctaattaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttcata-atatta 1246465  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| | || ||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  1246466 acacacaaaacaaacacgttaattatactgacaactttttttaagaaatgtgaaaaag 1246523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 702 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 11071887 - 11071679
Alignment:
Q  702 catttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaat 801  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||| ||||||||||| || |    
T  11071887 catttgactttatttttgtccctaaatctaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattttttcctaaacatgcccctaattaatattact 11071788  T
Q  802 aacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaa 900  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||    
T  11071787 aac-tgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaagcaaaggacaatttagta-atattaacacataaattagacacattaattgcactaa 11071690  T
Q  901 caacttttctt 911  Q
    |||||||||||    
T  11071689 caacttttctt 11071679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 11459401 - 11459149
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||| |   ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||||             
T  11459401 tactcactccctccctctatttaagaatccattcgattttatttttatccttaaatataaatctctttttaaattattagatgtatttatttttttttt- 11459303  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  11459302 tcctaaacatactcttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaaatcaaatttaatacatatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 11459204  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| | |||||| |||||||    
T  11459203 acacaaaacagacacattatttacaccgacaacttttcataagaaatgtgaaaaa 11459149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 3237962 - 3237716
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||||||||| || ||             
T  3237962 tactctcttcgtccctatatctaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgcatttttttt------- 3237870  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
       |||||||   |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||    
T  3237869 ---taaacatatccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattttgta-atattaac 3237774  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaaca--acttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||| | |||| ||||||||    
T  3237773 acacaaaacagacacattaattacattaataacacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 3237716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Original strand, 40345933 - 40346190
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||           
T  40345933 ttactctctccgtccctatatctaaacactcattttattttatttttgttcctaaatgtaaactccttttcaaattactagatacatttattattttttt 40346032  T
Q  772 c---tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatat 867  Q
        |||||||||| | ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||    
T  40346033 tccttcctaaacatacccctaattaatactacaaacttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttagta-atat 40346131  T
Q  868 taacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40346132 taacacacaaaatgaacacattaattgcacaaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 40346190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 773 - 918
Target Start/End: Original strand, 375301 - 375446
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  375301 tcctaaacatattcgtaatcaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-atactaac 375399  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  375400 acacaaaatagacacattaattacacaaacaacttttttttaaaaat 375446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 694 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 3326953 - 3326719
Alignment:
Q  694 taagcatccatttgactttatttttgtttct-aaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaatt 792  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||        | |||||||| | |||||||    
T  3326953 taagcatccgtttgactttatttttgtccattaaatgtaaatctattttcaaattactagatgtatttattattatttttttctaaacatacccctaatt 3326854  T
Q  793 aatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaa 891  Q
    ||||||| ||   | ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  3326853 aatactactacgttatcttgaaatatgaaaagttaaattttatacacatataaacaaaggacaatttaata-atattaatatacaaaacagacacattaa 3326755  T
Q  892 ttacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||  |||| |||| || | |||||||||||||    
T  3326754 ttacaccgacaattttttttaaaaaatatgaaaaag 3326719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 672 - 757
Target Start/End: Original strand, 41327661 - 41327746
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41327661 ttactccctccgtccatatatctaagcacccatttgactttatttttgtccataaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 41327746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 687 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 4758259 - 4758054
Alignment:
Q  687 ctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctc 786  Q
    |||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||        ||||||||||  ||    
T  4758259 ctatatgtaaccacccgtttgattttatttttgtttctaaatgtaaatttcttttcagattattagatgcatttattatttttt--tcctaaacatattc 4758162  T
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||||| |||  | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| | | |    
T  4758161 ctaattaatactactaatttttcttaaaatatgtaaagtcaaatttaatacacataaaaacaaaggacaatttcata-atattaacacacaaaataaaca 4758063  T
Q  886 cattaatta 894  Q
    |||||||||    
T  4758062 cattaatta 4758054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 710 - 898
Target Start/End: Original strand, 2521195 - 2521381
Alignment:
Q  710 tttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtc 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||        |||||||||| | |||||||||| ||| |||  ||||    
T  2521195 tttatttttgtttctaaatgtaaatttcttttcaaattgctagatgcatttattattattt--tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtc 2521292  T
Q  810 ttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacact 898  Q
    |||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  2521293 ttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttaata-atattaccacataaaatagacacattaactacact 2521381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 826 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 44421544 - 44421445
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  44421544 aaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaacaaacaaaacagatacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtgaaaa 44421446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 673 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 534712 - 534622
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatt 763  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  534712 tactccctccgtctctatatttaagcatccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttatt 534622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 3645567 - 3645319
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  |||||||||| || |||||||||||| ||||| || || ||            
T  3645567 ttactcactccgtccttatatctaagcacccatttgattttctttttatccctaaatgtaagtcccttttcaaattattagatacattttttttct---- 3645472  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     || ||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||| || ||||||||  || |||||||    
T  3645471 -tcataaacatac-cctaattaatactactaacttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatatacacacaaacgaaggacaatttagta-atattaa 3645375  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3645374 tacacaaaatagacacattaagtaaactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 3645319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 21013002 - 21012849
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| | ||| || ||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  21013002 tcctaaatatactcctaatttatactactaacttgttttgaaatataaaaagtcaaatttaatatgcatacaaacaaaggataatttgata-atattaac 21012904  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21012903 acacaaaataaacacattaattgcactaacaacttttcttaagaaatttgaaaaa 21012849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 675 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 7255844 - 7255626
Alignment:
Q  675 ctccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctc 774  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |  |||||| |||| |   ||||||||||||||||| | ||||||        ||    
T  7255844 ctccctccgttcctatatctaagtctccatctgactttatttttatccctaaatataaaccc--tttcaaattactagatgtatttattattattt--tc 7255749  T
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacac 873  Q
    ||||||||   |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| || ||||||| ||    
T  7255748 ctaaacatatccctaattaatactactaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacaaacaatcaaaggataatttggta-atattaatac 7255650  T
Q  874 acaaaacagatacattaattacac 897  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  7255649 acaaaacagacacattaattacac 7255626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 708 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 2131968 - 2131761
Alignment:
Q  708 actttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| | || ||         || ||||||| | |||||||||||| | |||| ||    
T  2131968 actttatttttgtgtctaaatgtaaacccctattcaaattactagatgtatttttttttcct---tcttaaacatacccctaattaatacaactaacttg 2131872  T
Q  808 tcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactt 906  Q
    |||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  2131871 tctttaaatatgaaaagtcaaatttaatacagatacaaacaaaagataatttggta-atattaacacacaaaatagacatgttaattgcactaacaactt 2131773  T
Q  907 ttctttagaaat 918  Q
    ||||| ||||||    
T  2131772 ttcttaagaaat 2131761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 672 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 23464929 - 23464711
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||            
T  23464929 ttactacctccgtctctatatgtaaacactcatttaactttatttttgtccctaaatgtaaatctctttt-aaattactagatgcatttatt---tattt 23464834  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     | ||| | || | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |    
T  23464833 tttctacaaatacccctaattaatactactaacttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaataaaggacaatttgata-atattta 23464735  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaatta 894  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||    
T  23464734 cgcacaaaatagacacattaatta 23464711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 826 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 4033676 - 4033577
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  4033676 aaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttagta-atattaacacagaaaacagaaacattaattacactaataacttttcttaagaaatataaaaa 4033578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 688 - 763
Target Start/End: Original strand, 4398457 - 4398532
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatt 763  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  4398457 tatatctaagcattcatttgactttatttttgttcctaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttatt 4398532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 773 - 913
Target Start/End: Original strand, 6275523 - 6275663
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  6275523 tcctaaacatacctctaattaatattattaacttgtcttgaaatatgaaatagttaaatttaatacatatacaaacaaaagacaatttcata-at-ttaa 6275620  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttcttta 913  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  6275621 cacacaaaatagacacattaattgcactaacaattttttttta 6275663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 837 - 911
Target Start/End: Original strand, 4398545 - 4398618
Alignment:
Q  837 acatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4398545 acatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaacttttctt 4398618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 681 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 13534644 - 13534405
Alignment:
Q  681 ccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaac 780  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||  ||||||        ||||||||    
T  13534644 ccgtccttatatctaagtttccgtttgattttatttttttctctaaatttaaattccatttcaaattactagatgcgtttattaattttt--tcctaaac 13534547  T
Q  781 atgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaa 879  Q
    ||   |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| || || ||||        ||||||||||||||    
T  13534546 atatccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataca--tacaaaccaaggataatt--------attaacacacaaaa 13534457  T
Q  880 cagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaat 931  Q
    || | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||    
T  13534456 caaacacattaattacactgacaacatttcttaagaaatgtgaaaaggcaat 13534405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 786 - 892
Target Start/End: Original strand, 38982038 - 38982146
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataaca--tgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  38982038 cctaattaatactactaacaattgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaaaataatttggta-atattaacacacaaaacag 38982136  T
Q  883 atacattaat 892  Q
    ||||||||||    
T  38982137 atacattaat 38982146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 787 - 910
Target Start/End: Complemental strand, 43650169 - 43650046
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||| |||||||||| |    
T  43650169 ctaattaatacaactaacttgttttgaaatttaaaaggtcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttagta-atattaacatacaaaacagaca 43650071  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttct 910  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  43650070 cattaattacactgacaatttttct 43650046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 834 - 926
Target Start/End: Original strand, 44274685 - 44274776
Alignment:
Q  834 tacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||    
T  44274685 tacacatacaaacaaatgacaatttggca-atattaacacataaaacagacacattaattacattgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 44274776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 27749714 - 27749623
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27749714 tacttcctccgtccttatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattacaagatgcatttatta 27749623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Original strand, 35178764 - 35178902
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| || | || |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||  || |||||| ||||||||||| | ||    
T  35178764 taattaatactactatcttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacaaatacaaataaaagacaatttcgta-atattatcacacaaaacatacac 35178862  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  35178863 attaactacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 35178902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 787 - 926
Target Start/End: Original strand, 42250849 - 42250985
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||     | ||||| |||||||| ||| |    
T  42250849 ctaattaatactattaacttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatataaataaatgacaattt----aacattaaaacacaaaatagaca 42250944  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  42250945 cattaattacactaccaacttttcataagaaatgtgaaaaa 42250985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 44421980 - 44421890
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatt 763  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||  |||||| |||||||| |||||    
T  44421980 tactccctccatccctatatctaagcacctatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacccctttctaaattattagatgcatttatt 44421890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 690 - 911
Target Start/End: Original strand, 25731063 - 25731280
Alignment:
Q  690 tatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctccta 789  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||| |  || |||| |        |||||||||| | ||||    
T  25731063 tatctaaacattcatttgactttatttttgtccttaaatgtaaacc-cttttcaaattactataaccatttataattttt---tcctaaacataccccta 25731158  T
Q  790 attaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacat 888  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || | | ||    
T  25731159 attaatactactaacttgtcttaaaatatgaaaaatcaaatttaatatacatacaaacaaaagataatttgata-atattaacacacaaaccaaacatat 25731257  T
Q  889 taattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||| ||  | ||||||||||    
T  25731258 taattataccgataacttttctt 25731280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 718 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 32677678 - 32677479
Alignment:
Q  718 tgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatt 817  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||        || ||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||     
T  32677678 tgtttctaaatataaattttttttcaaattactagatacatttattatgtttttttc-taaacatacccctaattaatactactaatttgtcttgaaata 32677580  T
Q  818 tg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaa 916  Q
    || ||| | ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| |||||||||  | |||||| ||||||| ||||    
T  32677579 tgaaaaatcaaatttagtacatgtacaaacaaatgacaatttga-aaatattaacccataaaatagacacattaattgtattaacaatttttcttaagaa 32677481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 672 - 764
Target Start/End: Original strand, 43119223 - 43119315
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43119223 ttacaccctccgtccctatatgtaagcatctatttgactaaaaatttgtccctaaatataaatctcttttcaaattactagatgtatttatta 43119315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 787 - 918
Target Start/End: Original strand, 2917071 - 2917198
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||    ||| |||||| ||| |    
T  2917071 ctaattaatactactaacttgtcttaaaatataaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaagacaattt-attaat----acatacaaaatagaca 2917165  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2917166 cattaattatactaacaacttttcttaagaaat 2917198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 785 - 907
Target Start/End: Complemental strand, 28190735 - 28190613
Alignment:
Q  785 tcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacaga 883  Q
    ||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |    
T  28190735 tcctaattattactactaaattgtcttgaaatatgaaaaattaaacttaatacatatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacaaaaaataaa 28190637  T
Q  884 tacattaattacactaacaacttt 907  Q
     | |||||||| ||||||||||||    
T  28190636 catattaattatactaacaacttt 28190613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 820 - 911
Target Start/End: Original strand, 35241712 - 35241802
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  35241712 aaagtcaaatttattacgcatacaaacaaatgataatttgata-atattaacaaacaaaacagacacattaattacacagacaacatttctt 35241802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 845 - 927
Target Start/End: Original strand, 8384001 - 8384082
Alignment:
Q  845 acaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  8384001 acaaatgacaatttggta-atattaacacacaaaataaacacattaattgcactaactatttttcttaagaaatatgaaaaag 8384082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 820 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 26512172 - 26512067
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||| |||| || ||||||     
T  26512172 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaacacataaaataaacacattaattatactaacaattttttttaagaaatg 26512074  T
Q  920 tgaaaaa 926  Q
    |||||||    
T  26512073 tgaaaaa 26512067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 719
Target Start/End: Original strand, 34042053 - 34042099
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttg 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34042053 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgactttatttttg 34042099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 672 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 38107751 - 38107660
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||  || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38107751 ttactccctccgtcgctatatctaagcacccatttga-tttttttttgtcgctaaacatacacctcttttcaaattacaagatgcatttatta 38107660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 820 - 927
Target Start/End: Original strand, 7257942 - 7258048
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||| || ||||||| | |||||    
T  7257942 aaagtcaaattttatacacgtacaaacgaatgacaatttaata-atattaatacactaaacaaacacattaattacattaataatttttcttaaaaaata 7258040  T
Q  920 tgaaaaag 927  Q
    ||||||||    
T  7258041 tgaaaaag 7258048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Original strand, 45150600 - 45150691
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||| |||||| || ||||||    
T  45150600 tactccctccgtccctatatttaatcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattgctagatacatttatta 45150691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 820 - 923
Target Start/End: Original strand, 45150740 - 45150842
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||     
T  45150740 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattgagta-atattaacacacaaaatgaacacattaattgcacaaacaacttttcttaagaaatg 45150838  T
Q  920 tgaa 923  Q
    ||||    
T  45150839 tgaa 45150842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 826 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 14527718 - 14527637
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  14527718 aaatttaatatacatacaaacaaatgataattcggta-atattaacacacaaaatagacacattaattaccctaacaattttt 14527637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 864 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 27749570 - 27749508
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  27749570 atattaatacacaaaacagacatattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 27749508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 764
Target Start/End: Original strand, 12417530 - 12417618
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12417530 tccctccgtctctatatttaatcatttatttgactttatttttgtctttaaatataaacattttttcaaattattagatgcatttatta 12417618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 764
Target Start/End: Original strand, 12429590 - 12429678
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12429590 tccctccgtctctatatttaatcatttatttgactttatttttgtctttaaatataaacattttttcaaattattagatgcatttatta 12429678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 786 - 909
Target Start/End: Original strand, 16808792 - 16808915
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||| | |     
T  16808792 cctaatttatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaattaattttaatatacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaatacataaaatatac 16808890  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttc 909  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||    
T  16808891 acattaattgcactcaaaacttttc 16808915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 786 - 909
Target Start/End: Original strand, 16848073 - 16848196
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||| | |     
T  16848073 cctaatttatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaattaattttaatatacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaatacataaaatatac 16848171  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttc 909  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||    
T  16848172 acattaattgcactcaaaacttttc 16848196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 43710053 - 43709914
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaatta-aatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| | |||  ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||   || |||||||||||||||| |||  |    
T  43710053 taattaatactactaacttatcttgaaatataaaaagtaaattttaatacacatataaacaaaggacaattaagta-atattaacacacaaaatagacgc 43709955  T
Q  887 attaattacactaacaactttt-ctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  43709954 attaattgcactaacaatttttgcttaagaaatgtgaaaaa 43709914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 678 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 4034068 - 4033982
Alignment:
Q  678 cctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4034068 cctccgtctctatatctaaacatccatttgattttattttagtccttaaatgtaatcccctttctaaattactagatgcatttatta 4033982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 723 - 822
Target Start/End: Original strand, 44274426 - 44274524
Alignment:
Q  723 ctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa 822  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||       | | ||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  44274426 ctaaatgtaaatcccttttcaaattactaaatgcatttattatttttttc-cttaaacatacccctaattaataccactaacttgtcttgaaatttgaaa 44274524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 830 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 8667730 - 8667634
Alignment:
Q  830 taaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac-acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  | |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  8667730 taaacacacatacaaacaaaggagaatttgata-atattaaagatacaaaacagacatattaattagactgacaacttttcttaggaaatgtgaaaaa 8667634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 688 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 43650258 - 43650190
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  43650258 tatatctaaacatccatttgattttatttttgttcttaaatgtaaacct-tttttaacttactagatgca 43650190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 875 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 2395849 - 2395806
Alignment:
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2395849 caaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaat 2395806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 755
Target Start/End: Original strand, 2916974 - 2917041
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatg 755  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| | | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  2916974 tatatctaagcactcatttaactttatttttatctttaaatgtgaacttcttttcaaattactagatg 2917041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 826 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 8393303 - 8393234
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattaca 896  Q
    ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  8393303 aaatttaaaacacatacaaacaaagaaaaatttgata-atattaacacacaaaacaaacacattaactaca 8393234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 826 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 36846850 - 36846781
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattaca 896  Q
    ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  36846850 aaatttaaaacacatacaaacaaagaaaaatttgata-atattaacacacaaaacaaacacattaactaca 36846781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 826 - 896
Target Start/End: Original strand, 44462591 - 44462660
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattaca 896  Q
    ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  44462591 aaatttaaaacacatacaaacaaagaaaaatttgata-atattaacacacaaaacaaacacattaactaca 44462660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 786 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 2654437 - 2654364
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaattt 858  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2654437 cctaattaatactattaacttatcttaaaatatgaaaaatcaaattaaatacacatataaacaaaagacaattt 2654364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 673 - 702
Target Start/End: Original strand, 12890265 - 12890294
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatcc 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890265 tactccctccgtccctatatctaagcatcc 12890294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 5845423 - 5845171
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||            
T  5845423 tactctctccgtccctatatcgaagccttcatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatcctctttcaaattattagatgcatttattaattttt-- 5845326  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5845325 tcctaaacatactcctaattaatactactaacttgtattgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-atattaat 5845227  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  5845226 acacaaaacaaatacattaattacactgacaacaattcttaagaaatatgaaaaag 5845171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 673 - 935
Target Start/End: Original strand, 15898319 - 15898580
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctctttt-caaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||           
T  15898319 tactccctccgtccctatatctaagcatccgtttgactttatttttgtccctaaatataaa-ctctttttcaaattactagatgcatttattattatttt 15898417  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| ||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15898418 -tcctaaacatacttttaattaatactgctaacttgtcttgaaatttgaaaggccaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgata-atattaa 15898515  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaatgggg 935  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||    
T  15898516 cacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaaagtgaaaatgcaaagggg 15898580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 39690343 - 39690594
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  39690343 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt-- 39690440  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  39690441 tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 39690539  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39690540 acataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 39690594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 25017528 - 25017783
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaatta---ctagatgcagttattannnnn 769  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | | ||||||||||   ||| ||||| ||||||         
T  25017528 tactctctccgtccctatatctaagcattcatttgactttatttttgtccttaaatgtaaaccccctttcaaattattactatatgcatttattattttt 25017627  T
Q  770 nnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatt 868  Q
       ||||||| || | |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25017628 t--tcctaaatatacccctaattaatactattaacttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atatt 25017724  T
Q  869 aacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  25017725 aacacacaaaacagacacattaattatactgacaacatttcttaagaaacgtgaaaaag 25017783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 700 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 29866409 - 29866185
Alignment:
Q  700 tccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatacta 799  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |        |||||||||| | ||||||||||||||    
T  29866409 tccatttgactttattctttttcctaaatgtaaacctcttttcaagttactagatgcatttataatttttt--tcctaaacatacccctaattaatacta 29866312  T
Q  800 ataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacact 898  Q
     |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  29866311 ctaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaacttggta-atattaacacacaaaaaagacatattaattgcact 29866213  T
Q  899 aacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29866212 aacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 29866185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 36177540 - 36177287
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||            
T  36177540 tactccctccgtccatatatctaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaattcattttcaaattactagatgtatttattattttttt- 36177442  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |    ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  36177441 tcctaaacatacccttaattaatactacttttttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-atattaac 36177343  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||    
T  36177342 acacaaaatagacacattaattacactgataacttttcttaagaaatgtaaaaaag 36177287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 4738876 - 4738625
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaa-tctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||           
T  4738876 tactcccttcgtccctatatctaagcccccatctgagtttatttttgtccctaaatgtaaactctctttt-aaattactagatgcatttattaatttt-- 4738780  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  || |||||||    
T  4738779 -tcctaaacatacccctaactaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacataaaaacaaaggtcaatttagta-atattaa 4738682  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  4738681 cacacaaaacaaatacattaattacactgacaatatttcttaagaaatgtgaaaaag 4738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 680 - 926
Target Start/End: Original strand, 10523137 - 10523382
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctc-ctaa 778  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||        || ||||    
T  10523137 tccgtgcctatatctaagcacccatttgactttatttttgtccataaatgtaaa-ct-ttttcaaattattagatgcatttattattattttttctctaa 10523234  T
Q  779 acatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaa 877  Q
    |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||||    
T  10523235 acatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatataaatagtcaaatttaatacacataaaaacaaaaaacaatttggta-atattaacacacaa 10523333  T
Q  878 aacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  10523334 aacagacacattaattacactgataacttttcttaaaaaatatgaaaaa 10523382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 3558884 - 3559135
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||            
T  3558884 tactccctccatccctatatctaggcacctattttattttatttttgtccctaaatataaccctcttttcaaattactagatgcatttattatttttt-- 3558981  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  3558982 tcctaaacatacccttaataaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaac 3559080  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  3559081 acacaaaatagacacattaattataccaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 3559135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 673 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 21912367 - 21912086
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| ||| || |||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||            
T  21912367 tactccttccatctctatatataagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattacaagatgcatttattattattt-- 21912270  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||   ||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  21912269 tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaacttaatacacatacaaacaaaagacaatttaata-atattaac 21912171  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatg-aaaaagcaatggggcttagatatagagacggagg 955  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  21912170 acataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaataaatgtgaaaaaagcaaaggggcttatatatagggacggagg 21912086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 703 - 926
Target Start/End: Original strand, 36347488 - 36347709
Alignment:
Q  703 atttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaata 802  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||        ||||||||||   ||||||||||| || ||    
T  36347488 atttgattttatttttgtccataaatgtaaatttcttttcaaattattagatgcatttattacctttt--tcctaaacatatccctaattaatattacta 36347585  T
Q  803 acatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaac 901  Q
    || ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36347586 acttgtcttgaaatgtgaatagtcaaatttaatacacatacaaacaaaaatcaatttgata-atattaatacacaaaacagatacattaattacactgac 36347684  T
Q  902 aacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| || |||||| |||||||    
T  36347685 aacttttattaagaaatctgaaaaa 36347709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 680 - 926
Target Start/End: Original strand, 35568869 - 35569113
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||        |||||||    
T  35568869 tccgtccctatatctaagcatccatttaattttatttttgtccctaattgtaaaccccttttcaaattactaaatgcatttattattattt--tcctaaa 35568966  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    ||| | |||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||||  || ||||||| ||| |||    
T  35568967 catacccctaattagtactactaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttagta-atattaatacataaa 35569065  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||    
T  35569066 acagacacattaattacactgataacttttcttaagaaatgtgaaaaa 35569113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 20946334 - 20946083
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||| |  |  ||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||            
T  20946334 tactcgctccatccctatatctaagcactcttttgagtaaaaatttgtctctaaatataaacccctttttaaattactagacgcatttattatttttt-- 20946237  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20946236 tgctaaacatactcctaattagtactactaacttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-atattaac 20946138  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20946137 acacaaaatagacacgttaattgcactaacaacgtttcttaagaaatatgaaaaa 20946083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 34877913 - 34877661
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||| |||||| |||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||| | ||| |||||| || ||||| ||||||            
T  34877913 tactccctccgtctctatatataaatctccatttgattttatttttgtccataaatgtaaatccccttttaaattattatatgcatttattattttat-- 34877816  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  34877815 tcctaaatatactcctaattaatactacaaacttgtcttgaaaaatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaacaaatgataatttggta-atattaac 34877717  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  34877716 acacaaaacagacaaattaattacactgacaacatttcttaagaaatgtgaaaaag 34877661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 38971985 - 38972234
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |  |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||            
T  38971985 tactccctccgttcctatatctaagcacatatttgactttattttt-tccctaaatttaaaccccttttcaaattaatagatgcatttattatttttt-- 38972081  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||| | ||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  38972082 tcctaaacatacccttaattaatactactaacttatcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaac 38972180  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38972181 a-tttaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 38972234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 673 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 27642749 - 27642468
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||   ||||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  27642749 tactccctccgtccctatatgtaagcactcatttgattttatttttgtccataaatataaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt-- 27642652  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    | |||||||| | | |||||||| ||| |||  | |||||||||   ||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||    
T  27642651 ttctaaacatacccttaattaatcctactaatttatcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttagta-atattaac 27642553  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatg-aaaaagcaatggggcttagatatagagacggagg 955  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||    
T  27642552 acataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagggggttacatatagggacggagg 27642468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 701 - 926
Target Start/End: Original strand, 4857378 - 4857606
Alignment:
Q  701 ccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatacta 799  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||        || ||||||| ||||||||||||||||    
T  4857378 ccatttgactttatttttgtctctaaatgtaaa-ctcattttcaaattaccaaatgcatttattattttttt-tcttaaacatactcctaattaatacta 4857475  T
Q  800 ataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac----attaatta 894  Q
     |||| | |||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||| ||    ||||||||    
T  4857476 ctaacttatcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaacacataaaatagacacattaattaatta 4857574  T
Q  895 cactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  4857575 cactaacaacttttattaagaaatgtgaaaaa 4857606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 43454228 - 43453978
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||  |||| | |||| |            
T  43454228 tactccctcagtccctatatgtaaacacccaattgactttatttttgtctctcaatgtaaacaccttttcaaattacatgatgtatttataattttt--- 43454132  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   || ||||||||| | |||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||    
T  43454131 tcctaaacatatcccgaattaataccactaacttgtcttgaaatttgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaagatagtttgata-atattaac 43454033  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  43454032 atacaaaactgacacattaattatactaacaactttttttaagaaatataaaaaa 43453978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 3247128 - 3247383
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccattt-gactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |  | |||| |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||           
T  3247128 tactccctccgttcctatatataagcacccattttgattttatttttatccccaaatataaatcccttttcaaattattatatgcatttattattttttt 3247227  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
      |||||| || | ||||||||||||||  | | | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  3247228 tccctaaatatacccctaattaatactacaatcttttcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaa 3247326  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3247327 catacaaaacagacatattaattacactgtcaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 3247383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 27588087 - 27587834
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagtt-attannnnnnn 771  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||   |||||||||| | |||| ||||||||| ||| || || |||            
T  27588087 tactccctccgtgcctatatctaaaca-ccatttgattttatttttgtccgtaaatgtaaacccctttccaaattact-gatacattttattttattttt 27587990  T
Q  772 ct-cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
    || ||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||||    
T  27587989 cttcctaaacatactcttaaataatactactaacttgtattgaaatttgaaaaatcaaatttaatacacatacatacaaaggacaatttagta-atatta 27587891  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  27587890 acacacaaaacagacacattaattatactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 27587834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 705 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 27798371 - 27798152
Alignment:
Q  705 ttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataac 804  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||        |    || || | |||||||||||| ||||||    
T  27798371 ttgactttatttttgttcctaaatgtaaatcaccttttaaattactaaatgcatttattattttattttag--aatatacccctaattaataccaataac 27798274  T
Q  805 atgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaa 903  Q
     ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  27798273 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaacttaatacacatacaaacaaatgataatttgata-atattaacacacaaaacagacaaattaattacactgacaa 27798175  T
Q  904 cttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
      |||||| | |||| |||||||    
T  27798174 tatttcttaaaaaatgtgaaaaa 27798152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 789 - 926
Target Start/End: Original strand, 43060482 - 43060618
Alignment:
Q  789 aattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacat 888  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  43060482 aattaatactactaacttgtcttggaatatgaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatatggta-atattaacacacaaaatagacacat 43060580  T
Q  889 taattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  43060581 taattacactaacaacttttattaaaaaatgtgaaaaa 43060618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 776 - 935
Target Start/End: Original strand, 25690644 - 25690807
Alignment:
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-tatattaaca 872  Q
    ||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  25690644 taaacatacccctaattaatacaactaacttgtcttgaaatttaaaaaagttgaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgtaactatattaaca 25690743  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaa-aaagcaatgggg 935  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||    
T  25690744 cacaaaacatacacattaattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaacaaagcaaagggg 25690807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 27925520 - 27925429
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27925520 tactccctccgtccctgtatctaagcccccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaatcccttttcaaattactagatgcatttatta 27925429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 773 - 927
Target Start/End: Original strand, 16070 - 16224
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||| ||    
T  16070 tcctaaacatacccctggttaatactactaacttgtcttgaaatgtgaaaagtcaaatttaatacaaatacaaacaaaggacaatttagta-atattcac 16168  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  16169 acaaaaaatagatacattaattgcactaacaactttccgttagaaatgtgaaaaag 16224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 704 - 927
Target Start/End: Original strand, 40979098 - 40979321
Alignment:
Q  704 tttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataa 803  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||         |||||||||| | |||||||||||||| ||     
T  40979098 tttgattttatttttatccctaaatgtaaagcccttttcaaatttctagatgcatttatttatttattttcctaaacatacccctaattaatactactat 40979197  T
Q  804 catgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaaca 902  Q
    | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||| | |  ||||||||  | |||    
T  40979198 cttgtctttaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaatacacaaaacatacatgttaattaccttgaca 40979296  T
Q  903 acttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||| || |||||||||||||||    
T  40979297 acttttattaagaaatatgaaaaag 40979321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 9946215 - 9946467
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||            
T  9946215 tactcccttcgtccctatatcttaaca-ccatttgattttatttttgtccctaaatgtaattctcttttcaaattattagatgcatttattattttttt- 9946312  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| |  |||||  |||| ||||||| |||||||||| || |||||  || |||||||     
T  9946313 tcctaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatataaaaagtcgaatttaatacacgtacaaacaaaggataatttcgta-atattaat 9946411  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||  |||||||| |||||||||| |   ||||||||| || | |||| ||||||||    
T  9946412 acgtaaaacagacacattaattatatcgacaacttttattaaaaaatgtgaaaaag 9946467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 775 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 600912 - 600768
Alignment:
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacac 873  Q
    ||||||||  |||||||||||| || |||| |||||| |||| | |||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  600912 ctaaacataatcctaattaatattactaacttgtcttaaaatataaaaaatcaaatttaatacatatacaaacaaatgacaatttgata-atattaacac 600814  T
Q  874 acaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  600813 acataatagacacattaattgcactaacaagttttcttaagaaata 600768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 786 - 926
Target Start/End: Original strand, 30348045 - 30348185
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||     
T  30348045 cctaattaatactactaacttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaacaaaggaaaatttggta-atattaacacacaaaatagac 30348143  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30348144 acattaagtaaattaacaacttttcttcagaaatgtgaaaaa 30348185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 787 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 11980851 - 11980711
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||   || ||| |  || |||||||||||||||| ||| |    
T  11980851 ctaattaatactactaacatgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacagtggataatatagta-atattaacacacaaaatagaca 11980753  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  11980752 cattaattacactaacaacttttattaaaaaatatgaaaaag 11980711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 730 - 862
Target Start/End: Original strand, 8717873 - 8718004
Alignment:
Q  730 taaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaa 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| | ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  8717873 taaatctcttttcaaattactagatgcacttattatttttt--tcctaaacatacccctaattaataatacgaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaa 8717970  T
Q  829 ttaaatacacatacaaacaaatgacaatttgata 862  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8717971 tttaatacatatacaaacaaatgacaatttgata 8718004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 703 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 10934221 - 10934001
Alignment:
Q  703 atttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaata 802  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||        || |||||||  || ||||||||| || ||    
T  10934221 atttgactttattttttctt-taaatgtaaattctttttcaaattattagatgcatttattattttt---tcttaaacatattcttaattaatattacta 10934126  T
Q  803 acatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaac 901  Q
    || ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10934125 acttgtattgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttggta-atattaacatacaaaacagacacattaattacactgac 10934027  T
Q  902 aacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||| |||||  | |||| ||||||||    
T  10934026 aacatttctgaaaaaatgtgaaaaag 10934001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 773 - 912
Target Start/End: Original strand, 12895164 - 12895303
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||     
T  12895164 tcctaaacatacctctaattaatacaactaacttgtcttaaaatttaaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaat 12895262  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttcttt 912  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12895263 acacaaaacagacacattaattacaccgacaacttctcttt 12895303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 739 - 927
Target Start/End: Original strand, 21574802 - 21574989
Alignment:
Q  739 tttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaataca 837  Q
    ||||||||||||||||||| || |||        |||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||  || ||||  ||||| ||||||    
T  21574802 tttcaaattactagatgcatttgttatttttttttcctaaacatacccctaattaatactacaaacttgtcttgaaacatgaaaagacaaatttaataca 21574901  T
Q  838 catacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    | |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  21574902 c-tacaaacaaaggacaatttggta-atattaacatacaaaatagacacattaagtacactaaaaacatttcttaagaaatgtgaaaaag 21574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 757
Target Start/End: Original strand, 25690510 - 25690594
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  25690510 tactcccttcgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaacttactagatgca 25690594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 822
Target Start/End: Original strand, 31641047 - 31641196
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||            
T  31641047 tactccctccgtccttatatgtaaacactcgtttgactttatttttgtccctaaatttaaatctcttttcaaattactagatgtatttattattattttt 31641146  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa 822  Q
    | |||||||| | |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||    
T  31641147 ttctaaacatacccctaattaataccactaacttatcttgaaatttgaaa 31641196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Original strand, 42644433 - 42644586
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  42644433 tcctaaacatacccttaattaatacaactaacttgtcttgaaatatgaaaagacaaatttaatatacatacaaacaaatgacaatttgata-atattagc 42644531  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | |||||| |   |||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||||||    
T  42644532 atacaaaataatcacattaattacactaacagctttttttttaaaatgtgaaaaa 42644586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 688 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 18729824 - 18729584
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||  |  |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||        |||||||||| | ||    
T  18729824 tatagctaagcatccatttgattttatttta-tccctaaatctaaaccccttttcaaattattagatgcatttattattatttt-tcctaaacatacccc 18729727  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaa----tgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    |||||||||||| |||  |   ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    ||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  18729726 taattaatactattaatttaatttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaacaaatgatactttaata-atattaacacacaaaatag 18729628  T
Q  883 atacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||||    
T  18729627 acacattaattacacaaataatttttcttaagaaatgtgaaaaa 18729584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 680 - 926
Target Start/End: Original strand, 36750640 - 36750882
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||   ||||||||||||||||||||| |||||          ||||||    
T  36750640 tccgtccctatatttaggcatccatttgattttatttttgtccctaaatataaacgccttttcaaattactagatgcatttatttttttttc--cctaaa 36750737  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
     || | | |||||||||||  |||| ||| ||||||| |  ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||    
T  36750738 tatacccttaattaatactgctaacttgttttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaggacagtctaata-atattaacacacaaa 36750836  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||  | |||||| |||| |||||||||||| || |||| | |||||||    
T  36750837 ac--acacattacttacgctaacaacttttattaagaattgtgaaaaa 36750882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 820 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 4745228 - 4745138
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4745228 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacccacaaaataaacacattaattgcactaactacttttctt 4745138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 820 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 41521289 - 41521199
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  41521289 aaagtcaaatttaatacacatataaacaaatgacaatttaata-atattaacacacaaaatagacatattaatttcactaacaatttttctt 41521199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 786 - 896
Target Start/End: Original strand, 19281460 - 19281569
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  19281460 cctaattaatactactaatttgttttgaaatatgaatttcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttagta-atattaatacacaaaacagata 19281558  T
Q  886 cattaattaca 896  Q
    |||||||||||    
T  19281559 cattaattaca 19281569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 688 - 897
Target Start/End: Original strand, 3630990 - 3631199
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaa-tctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctc 786  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||        |||||||||| | |    
T  3630990 tatatctaaacatccatttgattttatttttattcttaaatgtaaactct-ttttcaaattactagatgtatttattattttt---tcctaaacataccc 3631085  T
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaat----ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    |||||||||||||  |   |||||||||||    |  ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||   || ||||||||||||||||| |    
T  3631086 ctaattaatactaccattttgtcttgaaatattatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggtcaattgcgta-atattaacacacaaaaccg 3631184  T
Q  883 atacattaattacac 897  Q
    | |||||||||||||    
T  3631185 acacattaattacac 3631199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 672 - 751
Target Start/End: Original strand, 43060071 - 43060151
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatct-cttttcaaattacta 751  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43060071 ttactccatccgttcttatatctaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaactccttttcaaattacta 43060151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 7510786 - 7510695
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||    
T  7510786 tactccctccgtccctatatgtaaacactcatttgactttattattgtccctaaatgtaaacgccttttcaaattactagatacatttatta 7510695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 755
Target Start/End: Original strand, 12895037 - 12895118
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatg 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  12895037 tactccctccgtccctatatctaagcat-catttaattttatttttgtccttaaatgtaaacctcttttcaacttattagatg 12895118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 859
Target Start/End: Original strand, 32401313 - 32401496
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||||            
T  32401313 tactccctacgtccctatatcaaaccc-ccatttgactttatttttgtccctaaatgcaaa-ctcttttcaaattactagaaacatttattattattt-- 32401408  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttg 859  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32401409 tcctaagcacactcctaattaatactaccaacttgtcttaaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaagacattttg 32401496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 864 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 7510664 - 7510602
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||    
T  7510664 atattaacacacaaaacatacacattaattacactaataacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 7510602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 763
Target Start/End: Original strand, 20975662 - 20975752
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatt 763  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20975662 tactccatccgtctctacatctaaacactcatttgattttatttttgttcttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttatt 20975752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 835 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 457857 - 457785
Alignment:
Q  835 acacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  457857 acacatataaacaaatgacaatttaata-atattcagacacaaaatagatacattaattgtactaacaactttt 457785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 786 - 926
Target Start/End: Original strand, 14044466 - 14044606
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||  |||| | |||| |||| ||||| || ||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||     
T  14044466 cctaattaatactgctaacttatcttcaaatatgaaaagtcaaatttaacacacataaaaataaatgataatttgata-atattaatacataaaatagac 14044564  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | ||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14044565 atattaactgcattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 14044606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 671 - 764
Target Start/End: Original strand, 15966940 - 15967031
Alignment:
Q  671 gttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||  | |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15966940 gttactccctccgtctctatagataagcc-ctatttaactttatttttgtccctaaatgtaaacctc-tttcaaattactagatgcatttatta 15967031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 129837 - 129761
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  129837 tatatttaagcattcatttgactttatttttgtctctacatataaaccattttttaaattactagatgcatttatta 129761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 790 - 909
Target Start/End: Original strand, 9375611 - 9375730
Alignment:
Q  790 attaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacat 888  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| | ||| ||    
T  9375611 attaatactactaacttatcttgaaatatgaaaaatcaaatttaataaacatacaaacaaaagacaatttggta-atattagcacacaaaataaatatat 9375709  T
Q  889 taattacactaacaacttttc 909  Q
    ||||| |||||| || |||||    
T  9375710 taattgcactaataatttttc 9375730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 773 - 879
Target Start/End: Original strand, 5151156 - 5151261
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||     
T  5151156 tcctaaacatac-cctaattagtactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaataaaggacaatttggta-atattaat 5151253  T
Q  872 acacaaaa 879  Q
    ||||||||    
T  5151254 acacaaaa 5151261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 843 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 32067906 - 32067832
Alignment:
Q  843 aaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||    
T  32067906 aaacaaatgacaatttggta-atattaacacacaaaatagacacatgaattgcactaactatttttcttaagaaat 32067832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 864 - 926
Target Start/End: Original strand, 15967158 - 15967220
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  15967158 atattaatacacaaaacagacacattaattacaccgacaacctttcttaagaaatgtgaaaaa 15967220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 792 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 16496566 - 16496434
Alignment:
Q  792 taatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacatta 890  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||| || |||||| || ||||||| |||||||  ||| | | ||    
T  16496566 taatactattaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaaggataatttggta-atattaatacacaaat-agacataata 16496469  T
Q  891 attacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  16496468 attacactaacaacttttggtaagaaatgtgaaaa 16496434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 846 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 29874253 - 29874200
Alignment:
Q  846 caaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaa 900  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29874253 caaatgacaatttggta-atattaacacacaaaatagatacattaactacactaa 29874200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 826 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 16969469 - 16969369
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||| |||| || | |||| ||||||    
T  16969469 aaatttaacacacatacaaataaataacagtttgata-atattaacaaacaaattagacacattaattatactaacaatttttgttaaaaaatgtgaaaa 16969371  T
Q  926 ag 927  Q
    ||    
T  16969370 ag 16969369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 29874554 - 29874469
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttattttt-gtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  29874554 tactccctcagtccctatatataagtcctcatttgacttttttttttgttcctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatgca 29874469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 786 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 30317885 - 30317793
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    |||||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||    
T  30317885 cctaattaatactactaacttgcattgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaacaaaggaaaatttggta-atattaacacacaaa 30317793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 826 - 881
Target Start/End: Original strand, 731961 - 732016
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatg-acaatttgatatatattaacacacaaaaca 881  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  731961 aaatttaatacacatacaaacaaaagaacaatttgata-atattaacacacaaaaca 732016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 723 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 7736177 - 7736042
Alignment:
Q  723 ctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa 822  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||||   |||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||    
T  7736177 ctaaatataaaccccttttcaaattactagacgcatttattatttttt--tcctaaacatatccctaattaatactgctaacttatcttgaaatatgaaa 7736080  T
Q  823 -gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttg 859  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  7736079 agtcaaatttaacacacatacaaacaaatgataatttg 7736042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 18032842 - 18032766
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattac 749  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || || ||||| |||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||    
T  18032842 tactccctccgttcctatatgtaaccacccttttgattttatttttgtccttaaatgtaaagcccttttcaaattac 18032766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 672 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 30317992 - 30317910
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagat 754  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| ||| ||||| |  |||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  30317992 ttactcactccgtccttatatctaggtacccatttgattttctttttatccctaaatgtaagtcccttttcaaattattagat 30317910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 885 - 926
Target Start/End: Original strand, 20976357 - 20976398
Alignment:
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20976357 acattaattacactgacaaattttcttaagaaatatgaaaaa 20976398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 773 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 29874307 - 29874258
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa 822  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  29874307 tcctaaacatacccctaattaatactaataacttgttttgaaatatgaaa 29874258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 676 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 25198532 - 25198284
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcc 775  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||        |||    
T  25198532 tccctccgtccctatatctaagcacctatttgactttatttttgtccctaaatgtaaa-ctcttttcaaattactagatgcatttattattattt--tcc 25198436  T
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  25198435 taaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaacaca 25198337  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25198336 caaaacaaacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 25198284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 665 - 927
Target Start/End: Original strand, 38761207 - 38761469
Alignment:
Q  665 ataattgttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38761207 ataaatgttactcccattgtccttatatctaagcattcatttgattttatttttgtccctatatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttatta 38761306  T
Q  765 nnnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatat 863  Q
           || ||||||||   |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38761307 tttttttcttctaaacatatccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcata- 38761405  T
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  38761406 atattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaactttttttaataaatatgaaaaag 38761469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 667 - 926
Target Start/End: Original strand, 31746259 - 31746515
Alignment:
Q  667 aattgttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattann 766  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||      
T  31746259 aatttttacttcctcagtccctataactaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatacatttattatt 31746358  T
Q  767 nnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatat 865  Q
          |||||||||| | ||||||||||| || |||| ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  31746359 ttt---tcctaaacatacccctaattaataatactaacttgctttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-at 31746454  T
Q  866 attaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31746455 attaacacacaaaatagacacattaattgcactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 31746515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 40517987 - 40517739
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||| ||||| || ||||||            
T  40517987 tactccctccgtccctatatctaaacatccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattattagatccatttattatttttt-- 40517890  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaattt-gaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  40517889 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatttaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaac 40517791  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| ||||   |||| || |||||||||||| | |||| |||||||    
T  40517790 acacaaaacagacacat---ttactctgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 40517739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 673 - 955
Target Start/End: Original strand, 26878587 - 26878869
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||            
T  26878587 tactccctccgtccctatatgtaacaacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacttttttttaaattactagatgtatttattatttttt-- 26878684  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  26878685 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaac 26878783  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag--caatggggcttagatatagagacggagg 955  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   || |||| ||| |||||||||||||||    
T  26878784 acacaaaatagacacattaattacattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaggcaaagggggtttacatatagagacggagg 26878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 673 - 955
Target Start/End: Original strand, 24962224 - 24962505
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  24962224 tactccctccgtccctatatgtaggcatccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt-- 24962321  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  24962322 tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 24962420  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatg-aaaaagcaatggggcttagatatagagacggagg 955  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||    
T  24962421 acataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaaagggaattacatatagggacggagg 24962505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 24512025 - 24512278
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||            
T  24512025 tactccctccgtccatatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaatcctttttcaaattcttagatgcatttattattatttt- 24512123  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    || ||||||| | |||||||||||||| ||   | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24512124 tcttaaacatacccctaattaatactactattttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgata-atattaac 24512222  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  24512223 acacaaaacagacacattaattacactgacaaattttcttaaaaaatgtgaaaaag 24512278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 57047 - 57298
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  57047 tactccatctgtccctatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatttttt-- 57144  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||    
T  57145 tcctaaacatacccttaattaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaagaacaatttcgta-atattaac 57243  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  57244 acacaaaacagacacattaattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 57298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 7172464 - 7172215
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  7172464 tactccctccgtctctatatctaaccatccatttgactttattttagtccctaaatgtaaccc-cttttcaaattactagatgcatttattattttt--- 7172369  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    || ||||||||| | |||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7172368 tcataaacatgcccataataaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaattttaatgcacatacaaacaaatgacaattttata-atattaac 7172270  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||||    
T  7172269 acacaaaatagacacattaattacaccaaaaagttttcttaagaaatgtgaaaaa 7172215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 673 - 898
Target Start/End: Original strand, 31252514 - 31252737
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||       |    
T  31252514 tactcccttcgtccttatatctaagcatccatttgattttatttttgttcctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattattattttc 31252613  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  ||||||| | ||||||| |||||| || | |||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||   ||||  || ||||||||    
T  31252614 t--taaacatacccctaatttatactactatcttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatgcaaacaaatgtttatttcgta-atattaac 31252710  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacact 898  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31252711 acacaaaacagacacattaattacact 31252737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 680 - 927
Target Start/End: Original strand, 39543526 - 39543774
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||         |||||||    
T  39543526 tccgtccctatatctaagttcccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttatttatttttt-tcctaaa 39543624  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatat--atattaacacaca 876  Q
    ||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||| ||||    
T  39543625 cat-ctcctacttaatgctactaacttgtcttgagatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggtaataatattaacgcaca 39543723  T
Q  877 aaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39543724 aaacagacacattaattacacggacaacatttcttaagaaatatgaaaaag 39543774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 673 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 12763088 - 12762846
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||            
T  12763088 tactccctccgtccttatatctaaacatccatttgattttatttttgtccctaaatctaaacc-ctttccaaattactagatgcatttattatttttt-- 12762992  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| || | ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  12762991 tcctaaagatacccctaattaatattactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 12762893  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  12762892 acacaaaatagacacattaattgcattaacaacttttttttaaaaat 12762846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 673 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 41087220 - 41086962
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||| ||||| ||||||            
T  41087220 tactccctccgtccttatatctaacctctcatttgactttatttttattcctaaatgtaaacatcctttcaaattactatatgcatttattatttttt-- 41087123  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| || | | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  41087122 tcctaaa-atacccttaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaggaaaatttgata-atattaac 41087025  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaatggg 934  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  41087024 acacaaatcagacacattaattacactgacaatatttcttaagaaatgtgaaaaggcaatggg 41086962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 43980442 - 43980693
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  43980442 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt-- 43980539  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||  | |||||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  43980540 tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttatcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttagta-atattaac 43980638  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43980639 acataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 43980693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 675 - 918
Target Start/End: Original strand, 43191342 - 43191579
Alignment:
Q  675 ctccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctc 774  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||        |||    
T  43191342 ctccctccgtccttatatgtaagcatccatttgattttatttttgtctctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttttt------ttctc 43191435  T
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacac 873  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| |||| | ||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  43191436 ctaaacatacccctaattaatcctactaacttatcttgaaatatgaaaatttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaacac 43191534  T
Q  874 acaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    | |||| ||| ||||||| || | |||||  ||||||| ||||||    
T  43191535 ataaaatagacacattaactaaattaacattttttcttaagaaat 43191579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 678 - 908
Target Start/End: Original strand, 30262404 - 30262630
Alignment:
Q  678 cctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctccta 777  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||| |||| ||||||   ||||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||        | |||    
T  30262404 cctccgtctctatatctaagcacttatttgattttaattttgtccataaatataaatccttattcaaattactagatgca-ttattattttt---ttcta 30262499  T
Q  778 aacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacaca 876  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  30262500 aacatgcccctaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagttagatttaagacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacataca 30262598  T
Q  877 aaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30262599 aaatagacacattaattgcactaacaactttt 30262630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 684 - 927
Target Start/End: Original strand, 38202862 - 38203103
Alignment:
Q  684 tccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatg 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||       ||  |||| ||     
T  38202862 tccctatatctaaacacccatttgattttatttttgtctctacatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattatttttttct--taaatata 38202959  T
Q  784 ctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    | ||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||     
T  38202960 cccctaattaatactaccatcttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaacacacaaaacaa 38203058  T
Q  883 atacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    | | |||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  38203059 acatattaattacaccgacaacttttattaagaaatgtgaaaaag 38203103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 25185280 - 25185025
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| | | |||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |  |||            
T  25185280 tactccctctgtccttatatctaagcactcatttaattctatttttgtccataaatgtaaacaccttttcaaattactagatgcattatttatctttttt 25185181  T
Q  773 t-cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  25185180 ttcctaaacatacccctaattaatactactatcttatcttgaaatatgaaaagacaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaa 25185082  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25185081 cacacaaaacagacacattagttacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 25185025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 38773207 - 38773460
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||            
T  38773207 tactccctccgtcactatatctaagcactcatttgattttatttttatccctaaatttaaacctcttttcaaattattagatgcatttattatttttt-- 38773304  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||  | | ||||||||||| |||||  | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||  || || |||||    
T  38773305 tcctaaacatacctctaattaatactaccatcttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttcatacacatacaaacaaaagacaatttcgta-atgttaac 38773403  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttcttt-agaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  38773404 acacaaaacagacacattaattgcactgacaacttttttttaagaaatgtgaaaaag 38773460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 885707 - 885458
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||       |    
T  885707 tactccctccgttcgtatatctaagcacccatttgattttatttttggtcctaaatttaaaccccttttcaaattactagatgaatttattattttttcc 885608  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
       |||| || | | |||||||||| | |||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  885607 a--taaatatac-cttaattaataccactaatttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgata-atattaac 885512  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  885511 acac-aaacagacataataattacactgacaacttttcttaataaatgtgaaaaa 885458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 2562587 - 2562840
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||            
T  2562587 tacttcctccgtctctatatctatgcatccatttgattttatttttttttctaaatgtaaattcctttttaaattattagatgcatttattattttttt- 2562685  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtctt-gaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    || |||| ||   |||||||||||||| || | |||||| | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  2562686 tcataaatatatccctaattaatactactatcttgtcttagtaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaa 2562784  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||    
T  2562785 catacaaaacagacacattaattacactgacagtttttcttaagaaatgtgaaaaa 2562840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 670 - 908
Target Start/End: Original strand, 36309451 - 36309688
Alignment:
Q  670 tgttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnn 769  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |  |  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||         
T  36309451 tgttactcccttcgtccttatatctaagcatctttttgattaaaaatttgtctctaaatataaatctctttttaaattcttagatgcatttattattatt 36309550  T
Q  770 nnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatt 868  Q
       ||||||||||   ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36309551 tt-tcctaaacataaccctaattaataatactaacttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-atatt 36309648  T
Q  869 aacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  36309649 aacacacaaaatagacacattaattacggtaacaaatttt 36309688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 38770046 - 38770298
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||| ||  | ||||||            
T  38770046 tactctctccgtccttatatctaagcacccatttgattttatttttgtttccagatataaaccccttttcaaattactaaatatatttattatttttt-- 38770143  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||    | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  38770144 tcctaaatatatccctaattaatactatcctcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaaattaatacacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaac 38770242  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38770243 acacaaaataaacacattaattacactgacaacttatcttaagaaatatgaaaaag 38770298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 40791035 - 40790785
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||| | | ||||||       |    
T  40791035 tactcgctctgtccctatgtctaaacacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaatttccttttcaaattactagaggtatttattatttttttc 40790936  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  40790935 t--taaacatgcccctagttaatactactaagttgtcttgaaatatgaatagtcaaatttattacatatacaaacaaatgacaatttggta-atattaat 40790839  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  40790838 acacaaa-cagacgcattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 40790785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 37956361 - 37956116
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| || ||             
T  37956361 tactcgcttcgtccctatatctaagtatctatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacccctttttaaattactaaatgcattttttt-------- 37956270  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    || ||||||| | ||||||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||    
T  37956269 tcgtaaacatac-cctaattaatattattatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatctaatatacatacaaacaaaggacaaattcgta-atattaac 37956172  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37956171 acacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 37956116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 674 - 926
Target Start/End: Original strand, 10396090 - 10396338
Alignment:
Q  674 actccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnct 773  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||  || ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||         |    
T  10396090 actcccttcgtccctatatctaagcacccgtttgattttgtttttgtcccttaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttatttattttt--t 10396187  T
Q  774 cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
    |||||||||   ||||||||||| || || | |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  10396188 cctaaacatatccctaattaatattattatcttgtcttgaaatacgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaaca 10396286  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||    
T  10396287 cacaaaac--aaacattaattacattgacaacttttcttaataaatgtgaaaaa 10396338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 786 - 926
Target Start/End: Original strand, 14577622 - 14577762
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||| |||     
T  14577622 cctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaagtacaatttggta-atattaacaaacaaaatagac 14577720  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14577721 acattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 14577762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 685 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 37141961 - 37141722
Alignment:
Q  685 ccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgc 784  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||| |||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||        ||||||||||      
T  37141961 ccctatatctaagcaccgatttgattttatttttgtccctaattgtaaaccctttttcacattactagatgcatttattattttttt-tcctaaacatat 37141863  T
Q  785 tcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacaga 883  Q
    || |||||| ||||  || | || ||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  37141862 tcttaatta-tacttctatcttgacttgaaatacgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaacacacaaaacaga 37141765  T
Q  884 tacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||||    
T  37141764 tacattaattacactgacaactttttttaaaaaatgtgaaaaa 37141722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 702 - 926
Target Start/End: Original strand, 45185154 - 45185377
Alignment:
Q  702 catttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaa 800  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||        || ||||||| | | |||| |||||||     
T  45185154 catttgactttatttttgtctctaaatgtaaa-ctcattttcaaattactggatgcatttattattattttttc-taaacatacccttaatcaatactac 45185251  T
Q  801 taacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacacta 899  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||       
T  45185252 taacttgtcttaaaatttgaaaagtcaaaatgaatacacatacaaacaaaggacaatttgata-atattaatacataaaacagacacatttattacaacg 45185350  T
Q  900 acaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||    
T  45185351 acaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 45185377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 5191410 - 5191658
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||       |    
T  5191410 tactccatccgtccctat--ctaagcacctattttattttatttttgttcctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttaatatttttttc 5191507  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  ||||||| | |||||||| ||||  |||  ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  5191508 t--taaacatacccctaattagtactgctaaattgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatataaacaatggacaatttggta-atattaac 5191604  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  5191605 acacaaaacagacacattaattgc-ctaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 5191658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Original strand, 1769307 - 1769557
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||           
T  1769307 ttactccatctgttcctttatctaagcattcatttgattttatttttgttactaaatgtaaacctcatttcaaattattagatgcatttattattttt-- 1769404  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     || ||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  1769405 -tcttaaacatacccttaattaatactactaacttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaat-cacatacaaacaaatgacaatgtggta-atattaa 1769501  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || ||||||    ||||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |||||||    
T  1769502 catacaaaaggagtacattaattacactgataacatttcttaaaaaatgtgaaaaa 1769557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 672 - 918
Target Start/End: Original strand, 45183720 - 45183963
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||           
T  45183720 ttactccctccgtccctatatctaaacacacgtttgattttatttttgtctctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgcatttattatttttt- 45183818  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     | |||||||| | |||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  45183819 -ttctaaacatacccctaatcaat-ctactaacttgtcttcaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaggacaatttggta-atattaa 45183915  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||| |||||| | | ||| |||||  | |||||||||||| ||||||    
T  45183916 cacataaaacaaacatatttattactatgacaacttttcttaagaaat 45183963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 1177014 - 1177265
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| | |||| |||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||            
T  1177014 tactccctccgtccctatatgtaaacactcatttaattttacttttgtctctaaatataaacccctttttaaattactagatgcatttattattttttt- 1177112  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||     
T  1177113 tcctaaacatacccctaattaatactactatcttgttttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttcgta-atattaat 1177211  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||||||    
T  1177212 atacaaaacagacacattaattacact-ataacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 1177265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 683 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 7772748 - 7772523
Alignment:
Q  683 gtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacat 782  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||        ||||||||||    
T  7772748 gtccctatatgtaaacacccatttgattttacttttgtccctaaatataaacatcttttcaaattactagatgtatttattattttt---tcctaaacat 7772652  T
Q  783 gctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaaca 881  Q
       |||||||||||  |||| | | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  7772651 atccctaattaatatcaatatcttatcttgaaatatgaaaagtgaaatttaatacacatacaaataaaggacaatttcgta-atattaacacacaaaaca 7772553  T
Q  882 gatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  7772552 gacacattaattacaatgacaacttttctt 7772523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 777 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 25888740 - 25888599
Alignment:
Q  777 aaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacac 875  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||  |||||| |||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  25888740 aaacatactcctaattaatagtactaatttgtcttaaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatatgata-atattaacatac 25888642  T
Q  876 aaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25888641 aaaatagacatattaattacactaacaacttttcttaagaaat 25888599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 675 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 17933948 - 17933691
Alignment:
Q  675 ctccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctc 774  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||  |||||| || |||  ||||||||||||||||| || ||||||        ||    
T  17933948 ctccctccgtccttatatctaaacactcatttgattttatttttgtccctaaatatacatcctttttcaaattactagatacatttattatttt----tc 17933853  T
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgat-atatattaaca 872  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||   || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||    
T  17933852 ctaaacatactcataattaatattaataccttgtcttcgtatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacagtttggtaatat-ttaaca 17933754  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaatgggg 935  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||   |||| |||||||  ||||| ||||||| ||| ||||    
T  17933753 cacaaaatagacacattaattacatcgacaatttttcttacgaaatgtgaaaaaacaaagggg 17933691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 776 - 927
Target Start/End: Original strand, 24276517 - 24276666
Alignment:
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||| ||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24276517 taaacatacccctaattaatattactaacttgttttgaaatatgtaaagtaaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacaca 24276615  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |  || ||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  24276616 c--aatagacacattaattatactaacaactttttttaagaaatgtgaaaaag 24276666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 672 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 36437750 - 36437512
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  |  |||||   ||||| ||||    |||||||||||||||||||| ||||||           
T  36437750 ttactccctccatccctatatataagcactcatttgactaaaaatttgtccttaaatataaactaattttcaaattactagatgcatttattattttttt 36437651  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
      ||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||    
T  36437650 g-cctaaacatacccctaactaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atgttaa 36437553  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||    
T  36437552 cacacaaaatagacacattaattgcactaacattttttctt 36437512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 724 - 927
Target Start/End: Original strand, 40337101 - 40337302
Alignment:
Q  724 taaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa- 822  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||        |||||||||| | | |||||||||||| || | ||||||||||| |||||     
T  40337101 taaatgtaaacctattttcaaattactatatgcatttattatttttt--tcctaaacatacccttaattaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaa 40337198  T
Q  823 gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatga 922  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| | |||||||| | |||||| |||    
T  40337199 gtcaatttaaatacacatacaaacaaaggacaattttgta-atattaacatacaaaacatacacattaattatactgataacttttcataagaaatgtga 40337297  T
Q  923 aaaag 927  Q
    |||||    
T  40337298 aaaag 40337302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 673 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 45204005 - 45203780
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||| |  |||| |||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||            
T  45204005 tactctctccatccctatatctaagcatccttttgactaaaaatttgtcttgaaatataaacccctttataaattactagatgcatttattattattt-- 45203908  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||    
T  45203907 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacgcatacaaacaaaggacaagttggta-atattaac 45203809  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaa 900  Q
    | |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  45203808 atacaaaatagacacattaattgcactaa 45203780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 672 - 764
Target Start/End: Original strand, 3005982 - 3006074
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3005982 ttactccctccgtcccggtatgtaaacacctatttgactttatttttgttcctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgaatttatta 3006074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Original strand, 3113505 - 3113643
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    ||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  3113505 taattaatactataaacttatcttgaaatatgaaaaattaaatttaatacacatataaacaaaagacaatttgata-atattaacacacaaaacagacat 3113603  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| | || |||| || |||||| |||||||    
T  3113604 attaattacactgataattttttttaagaaatgtgaaaaa 3113643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Original strand, 40601899 - 40601990
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40601899 tactccctccatcattatatctaaacatccatttgactttatttttgtccttaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttatta 40601990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 820 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 44255554 - 44255445
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||||| | ||||     
T  44255554 aaagtcaaatttaatacacgtacaaacaaatgacaatttgata-atattaacacacaaaaaaggcacattaattacgctcacatcttttcttaacaaatg 44255456  T
Q  920 tgaaaaagcaa 930  Q
    |||||||||||    
T  44255455 tgaaaaagcaa 44255445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 786 - 926
Target Start/End: Original strand, 14846891 - 14847031
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||| ||||     
T  14846891 cctaattaataccactaacttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatatggta-atattaacgcacaaagcagac 14846989  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||    
T  14846990 acattaattacaccgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 14847031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 31673746 - 31673593
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtc-ttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  31673746 tcctaaacatacccttaattaatactactaacctgtcattgaaatttgaatagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta-atattaa 31673648  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || |||||| | | |||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||    
T  31673647 catacaaaataaacacattaattacac-cacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 31673593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 2303339 - 2303258
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagat 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  2303339 tactccctccgtccctatatctaagcaaccatttgaatttatttttgtcccgaaatgtaaactccttttcaaattactagat 2303258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 2327933 - 2327852
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagat 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  2327933 tactccctccgtccctatatctaagcaaccatttgaatttatttttgtcccgaaatgtaaactccttttcaaattactagat 2327852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 706 - 927
Target Start/End: Original strand, 37600779 - 37600999
Alignment:
Q  706 tgactttatttttgtttctaaatgtaaatctct-tttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaa-tactaataa 803  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||        | |||||||| | ||||||||| || || |||    
T  37600779 tgactttatttttgtccctaaatgtaaa-ctctctttcaaattattagatgcatttattatttttt--ttctaaacatacccctaattaaatattactaa 37600875  T
Q  804 catgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaaca 902  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||  |  |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  37600876 cttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggca-gtattaacacataaatcagacacattaattatacttaca 37600974  T
Q  903 acttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    || |||||| | |||| ||||||||    
T  37600975 acatttcttaaaaaatgtgaaaaag 37600999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 820 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 34882771 - 34882666
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||| | ||||     
T  34882771 aaagtcaaatttaacacacatacaaacaaaagataatttgata-atattaacacacaaaatagacacattaattgcattaacaatttttcttaaaaaatg 34882673  T
Q  920 tgaaaaa 926  Q
    |||||||    
T  34882672 tgaaaaa 34882666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 773 - 927
Target Start/End: Original strand, 12998645 - 12998804
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttg-----aaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatata 866  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||     |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||    
T  12998645 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgtcttgaaatatgaaaggtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-ata 12998743  T
Q  867 ttaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    || |||||||||| |   |||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12998744 ttcacacacaaaatatgcacattaattgaactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 12998804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 723 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 22590572 - 22590371
Alignment:
Q  723 ctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa 822  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||       ||  | ||||| | |||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  22590572 ctaaatataaacctcttttcaaattactagatccatttattattatttcct--tgaacatacccctaattaatactactaacttatcttgcaatatgaaa 22590475  T
Q  823 -gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatg 921  Q
     || ||||| || ||  ||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  22590474 agtcaaatttaacacttatacaaacaatggacaatttggtg-atattaacacaaaaaatagacacattaattgcactaacaaattttcttaagaaatgtg 22590376  T
Q  922 aaaaa 926  Q
    |||||    
T  22590375 aaaaa 22590371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 673 - 841
Target Start/End: Original strand, 40807870 - 40808037
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||            
T  40807870 tactccctccgtccctacatgtaaacccccatttgactttatttttgtccttaaatgtaaacctcatttcaaattactacatgcatttaatattattt-- 40807967  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacata 841  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  40807968 tcctaaacatacaactaatcaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacata 40808037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 820 - 927
Target Start/End: Original strand, 16002728 - 16002834
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| | ||||     
T  16002728 aaagtcaaatttaatacaaatacaaacaaaggataatttctta-atattaacacacaaaactgacacattaattacacagacaacttttcttaaaaaatg 16002826  T
Q  920 tgaaaaag 927  Q
    ||||||||    
T  16002827 tgaaaaag 16002834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 671 - 754
Target Start/End: Original strand, 45283344 - 45283427
Alignment:
Q  671 gttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagat 754  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  45283344 gttactccctccgtccttatatctaagcatttatttgactttatttttgtccttaaatgtaaattctttttcaaattattagat 45283427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 864 - 926
Target Start/End: Original strand, 14522652 - 14522714
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  14522652 atattaacacacaaaacatacacattaattacactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 14522714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 864 - 926
Target Start/End: Original strand, 16644084 - 16644146
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16644084 atattaacacacaaaatatacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 16644146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 820 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 35794843 - 35794756
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| || || ||| ||||| ||||    
T  35794843 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-atattaatacacaaaatagacacaatagttgcacaaacaattttt 35794756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 832 - 923
Target Start/End: Original strand, 3006798 - 3006888
Alignment:
Q  832 aatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaa 923  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||  || ||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3006798 aatacacatacagataaatgataatttagta-atattaacacataaaatagacatattaattatactaacaacttttcttaagaaatatgaa 3006888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 34158163 - 34158072
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34158163 tactctctccgttcctatatttaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaattcattttcaaattactatatgcatttatta 34158072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 672 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 16357235 - 16357158
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattac 749  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||  |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  16357235 ttactccctccgtccctatatgtaaccacccctttgtttttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattac 16357158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 864 - 956
Target Start/End: Original strand, 45283830 - 45283923
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagc-aatggggcttagatatagagacggagga 956  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | || ||||||| |||||| ||||||| | || |||||||| |||||| |||||||||    
T  45283830 atattaacacataaaacagacacattaattacattgataatttttcttaagaaatttgaaaaaacaaaaggggcttacatatagggacggagga 45283923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 790 - 913
Target Start/End: Original strand, 12894178 - 12894301
Alignment:
Q  790 attaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacat 888  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||||  || |||||| ||| ||||    
T  12894178 attaatactaataaattatcttgaaatatgaaaagtcaaactaaatacaaatacaaacaaatgacaatatggta-atatttccatacaaaatagacacat 12894276  T
Q  889 taattacactaacaacttttcttta 913  Q
    ||||  ||| || ||||||||||||    
T  12894277 taatcgcacaaaaaacttttcttta 12894301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 23280881 - 23280817
Alignment:
Q  687 ctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattacta 751  Q
    |||||| |||||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23280881 ctatatataagcaccaattttattttatttttgttcctaaatgtaaatctattttcaaattacta 23280817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 864 - 927
Target Start/End: Original strand, 4273956 - 4274019
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  4273956 atattaacacataaaacaaacacattaattacactaacaatatttcttaagaaatgtgaaaaag 4274019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 703 - 764
Target Start/End: Original strand, 4273855 - 4273916
Alignment:
Q  703 atttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4273855 atttaactttatttttgtccttaaatgtaaacttcttttcaaattactagatgcatttatta 4273916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10709546 - 10709477
Alignment:
Q  687 ctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgc 756  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  10709546 ctatatctaagctcctatttgattttatttttgtatttaaatgtaaatattttttcaaattattagatgc 10709477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 787 - 858
Target Start/End: Original strand, 23399748 - 23399820
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaattt 858  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23399748 ctaattaatactactaacttggtttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattt 23399820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 826 - 910
Target Start/End: Original strand, 40602052 - 40602135
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttct 910  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  40602052 aaatttaatacacatacaaacaaaggataatttagta-atattaacacataaataagacacattaattgcactaataacttttct 40602135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 801 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 14739550 - 14739440
Alignment:
Q  801 taacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacacta 899  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||| ||||||||| || |||||| || ||||||||| | |||| | | |||||||||||||      
T  14739550 taacttgtcttgaaatatgaatagtcacatttaatacacacacaaacaaaggataatttggta-atattaacatataaaataaacacattaattacacgg 14739452  T
Q  900 acaacttttctt 911  Q
    ||||||||||||    
T  14739451 acaacttttctt 14739440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 826 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 34158012 - 34157951
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacat 888  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  34158012 aaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaacacataaaatagacacat 34157951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 703 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 10860937 - 10860876
Alignment:
Q  703 atttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  10860937 atttaactttatttttatccctaaatgtaaatccatcttcaaattactagatgcatttatta 10860876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 684 - 721
Target Start/End: Original strand, 14522226 - 14522263
Alignment:
Q  684 tccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtt 721  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14522226 tccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtt 14522263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 839 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 14906683 - 14906615
Alignment:
Q  839 atacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  14906683 atacaaacaaaggataatttggta-atattaacacacaaaatagacatattaattacattaataactttt 14906615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 733
Target Start/End: Original strand, 41371667 - 41371720
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaa 733  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41371667 tccgtcccgatatctaagccctcatttgactttatttttgtccctaaatgtaaa 41371720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 115; Significance: 7e-58; HSPs: 90)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 5084946 - 5085198
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  5084946 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatttttt-- 5085043  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  5085044 tcctaaacatacccctaattaatactactatcttctcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttcgta-atattaac 5085142  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  5085143 acacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 5085198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Original strand, 48721725 - 48721976
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||           
T  48721725 ttactccacccgtccctatatctaaacacctatttgattttatttttgtccctaaatgtaaccctcttttcaaattactagatgcatttattattttt-- 48721822  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  48721823 -tcctaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaa 48721920  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  48721921 cacacaaaacagacacattaattacactgacagcttttcttaagaaatgtgaaaaa 48721976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 676 - 927
Target Start/End: Original strand, 34696743 - 34696992
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcc 775  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||        |||    
T  34696743 tccctccatccctatatctaagcatccatttgattttatttttgttcctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgtatttattatttttt--tcc 34696840  T
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||   |||||||||||  | ||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  34696841 taaacatgtccctaattaatactactattttgtcttgaaataggaaaagtcaaatttcatgcacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaacaca 34696939  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  34696940 caaaacagacatattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 34696992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 680 - 955
Target Start/End: Original strand, 23982456 - 23982731
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||        |||||||    
T  23982456 tccgtccctatatctaaacactcatttgactttatttttatttcataatgtaaaccccttttcaaattgctagatacatttattattattt--tcctaaa 23982553  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    |||   |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23982554 catatccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaacaaatgtcaatttgata-atattaacacacaaa 23982652  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa-gcaatgggg-cttagatatagagacggagg 955  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||| ||||||||    
T  23982653 acagacacattaattacattgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaatgcaaaggggacttacatatagggacggagg 23982731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 36085216 - 36084964
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||       |    
T  36085216 tactccttccgtccctatatctaagcactcatttaattttatttttgtccctaaatgtaaatcttttttcaaattactagatgcatttattatttttttc 36085117  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  ||||||| | |||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  || ||||||||    
T  36085116 t--taaacatacccctaattaatactattatcttgtctcgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaataaaggataatttctta-atattaac 36085020  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||| ||||||||    
T  36085019 acacaaaacagatacattaattacactgataatttttcttaaaaaatgtgaaaaag 36084964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 15512638 - 15512889
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  15512638 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt-- 15512735  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  15512736 tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 15512834  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15512835 acataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 15512889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 28948821 - 28949072
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  28948821 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt-- 28948918  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  28948919 tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 28949017  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28949018 acataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 28949072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 4817763 - 4818012
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttc-aaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||           
T  4817763 tactccctccgtcactatatctaagcacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaa-ctcatttccaaattactagatgtatttattattttgtt 4817861  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    ||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4817862 ct--taaacatactcttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgata-atattaa 4817958  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     |||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  4817959 tacacaaaac--acacaataattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 4818012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 4829563 - 4829812
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttc-aaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||           
T  4829563 tactccctccgtcactatatctaagcacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaa-ctcatttccaaattactagatgtatttattattttgtt 4829661  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    ||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4829662 ct--taaacatactcttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgata-atattaa 4829758  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     |||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  4829759 tacacaaaac--acacaataattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 4829812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 672 - 927
Target Start/End: Original strand, 5321878 - 5322132
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||           
T  5321878 ttactccctccgtccctatgtctaaacacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatacatttattattttttt 5321977  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    | ||||||||| | |||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||| || || || |||||| |||||||||||| |||||||  || |||| ||    
T  5321978 c-cctaaacatacccctagttaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaattttaatacatatacaaacaaataacaatttcgta-atataaa 5322075  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||    
T  5322076 cacacaaaacagacacattaattacattgataacttttcttaaaaaatatgaaaaag 5322132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 673 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 3143650 - 3143389
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||  ||||||| ||||||            
T  3143650 tactctctccgtccctatatttaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtacaccccttttcaaattatcagatgcatttattattattttt 3143551  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  3143550 tcc-aaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacataaaaacaaaagacaattttgta-atattaac 3143453  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatg-aaaaagcaatggg 934  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  3143452 acacaaagcagacacattaattacaatgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaatggg 3143389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 687 - 926
Target Start/End: Original strand, 35365853 - 35366092
Alignment:
Q  687 ctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctc 786  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| | ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||| |      
T  35365853 ctatatttaagcacacatttgactttatttttgtccctaaacgcaaacccattttcaaattactagatgcatttattattattattttctaaacatacct 35365952  T
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
     |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35365953 ttaattaatactgttaacttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgata-atattaacacacaaaatagata 35366051  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  35366052 cattacttacactaacaacttttagtaagaaatatgaaaaa 35366092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 673 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 46591348 - 46591112
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || |||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||            
T  46591348 tactccctctgtccctatatctaagcactcatttgactttatttttgtctttagatgtaaactttttttcaaattactagatgtatttattatctttt-- 46591251  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||| ||| |  | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  46591250 tcccaaatacacccctaattaatattactaacttgtcttgaaatttgaaaaatcaaatttaatacacatagaaacaaaggacaattcgata-atattaac 46591152  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  46591151 acacaaaacaaacacattaattacactcacaacttttctt 46591112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 51390395 - 51390643
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||            
T  51390395 tactccctccatccctatatctaaacacccatttgactttaattttgtccctaaatgtaaacccctttttaaattactagatgcatttattattttt--- 51390491  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     || ||||    
T  51390492 tcctaaacatacccttaattaaaactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttg----gtaataac 51390587  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttcttt-agaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || |||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  51390588 acacaaaatagacacattaattgcattaacaattcttctttaagaaatgtgaaaaa 51390643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 685 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 16582769 - 16582527
Alignment:
Q  685 ccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnct-cctaaacatg 783  Q
    |||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||        | ||||||||      
T  16582769 ccctatatgtaaacacccatttgattttacttttgttcctaaatataaatttcttttcaaattactagatgcatttattattattattttcctaaacaca 16582670  T
Q  784 ctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    | |||||||||||  | || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  16582669 c-cctaattaatatcactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttcgta-atattaacacacaaaacag 16582572  T
Q  883 atacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16582571 acacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 16582527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 688 - 911
Target Start/End: Original strand, 28723522 - 28723746
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||   ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| | ||    
T  28723522 tatatctaagtatctatttgattttatttttgtccttaaatataaacatcttttcaaattactagatgcagttattattatttt-tcctaaacatacccc 28723620  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttg---aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||| |    ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||     
T  28723621 taattaatattaccaacttgtcttgaaatatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggta-atattaacacacaaaatagac 28723719  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28723720 acattaattacactaacaacttttctt 28723746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 8878016 - 8877766
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||            
T  8878016 tactacctccgtccctatatctaagcaccaatttgattttatttt-gttcttaaatgtaaa-ctattttcaaattactagatgcatttattatttttt-- 8877921  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  ||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8877920 taataaacatacccctaattaatactactatcttatcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaac 8877822  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8877821 acacaaaacaaacacattaattatactgacaatttttcttaaaaaatatgaaaaag 8877766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 30898420 - 30898671
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||| || ||||||            
T  30898420 tactccctctgtccctatatctaagtacctatttgattttatttttgttcctaaatgtaaaccctttttcaaattaccagatacatttattatttttt-- 30898517  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||| ||||| ||| |||| | |||| |||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  30898518 tcctaaacatacccctatttaatgctactaacttatcttaaaatatgaatagtcacatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta-atattaac 30898616  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30898617 acataaaacagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 30898671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 3831293 - 3831076
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  3831293 tactccctccgttcctatatctaagcgccaatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattaattttt-- 3831196  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   |||||||||||||  || | ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  3831195 tcctaaacatatccctaattaatacttctatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacatacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaac 3831097  T
Q  872 acacaaaacagatacattaat 892  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  3831096 acacaaaatagatacattaat 3831076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 688 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 32152387 - 32152153
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   || ||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||        |||||||||| | ||    
T  32152387 tatatctaagcacacatttaactttatttttgtccttagatgtaaatcccttttgaa-ttactatatgcatttattattttt---tcctaaacatacccc 32152292  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  32152291 taattaatactactaacttatcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaataacaatttggta-atattaacacacaaaatagacac 32152193  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32152192 attaattgcaccaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 32152153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 701 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 33232058 - 33231834
Alignment:
Q  701 ccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaa 800  Q
    |||||||| |||| ||||||  |||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| | |||||||||||| |     
T  33232058 ccatttgattttacttttgtccctaaatataaattcattttcaaattactagatgcatttattatttttt--tcctaaacatacccctaattaataccac 33231961  T
Q  801 taacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacacta 899  Q
    || | ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33231960 tatcttgtcttgaaatatgaaaagtcagatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaacacacaaaacagacacattaattacactg 33231862  T
Q  900 acaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  33231861 acaactttttttaagaaatgtgaaaaag 33231834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 688 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 25258561 - 25258325
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||        | |||||||| ||||    
T  25258561 tatatttaagcaaccatttaattttatttttgttcttaaatgtaaattcattttcaaattacaagatgcatttattattttt---ttctaaacatactcc 25258465  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||| |||| ||| |    
T  25258464 taattaatactactaaattgttttgaaacatgaaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atatcaagacataaaatagaca 25258366  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25258365 cattaattgcactaacaacttttcttaaaaaatatgaaaaa 25258325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 826 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 38680569 - 38680470
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38680569 aaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-atattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaa 38680471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 52141032 - 52141285
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||            
T  52141032 tactccatccgtccatatatttaagcatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaatcactagatgcatttattatttttt-- 52141129  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   |||| |||||| || |||| |||||| |||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  52141130 tcctaaacatatccctagttaatattactaacttgtcttaaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttgata-atattaac 52141228  T
Q  872 acacaaaacagata--cattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| |  ||||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||    
T  52141229 acacaaaatagacacgcattaattacactaataatttttcttaaaaaatgtgaaaaa 52141285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 673 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 47643786 - 47643533
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||| || |||||||| |||||||||||   |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||            
T  47643786 tactccttccgtccatacgtctaaacacccatttgattttatttttgtccataaatgtaaacccctttccaaattactagatgcatttattattattttt 47643687  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |   |||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  47643686 ta--aaacatacccttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatgcaaacaaaggacaatttagta-atattaac 47643590  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaa 930  Q
    |||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47643589 aca--aaacatacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaagcaa 47643533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 701 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 51997174 - 51996958
Alignment:
Q  701 ccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaa 800  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||| | ||||| ||||||        |||||||||| ||| ||||||||||||     
T  51997174 ccatttgattttatttttgtccctaaatgtaatccccttttcaaattacaatatgcatttattatttttt--tcctaaacatactcttaattaatactac 51997077  T
Q  801 taacatgtctt-gaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacact 898  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  51997076 taacttgtctttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacgatttggta-atattaacacagaaaacatacaaattaattacact 51996978  T
Q  899 aacaacttttctttagaaat 918  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  51996977 gacaacttttcttaagaaat 51996958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 25063458 - 25063205
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcag--ttattannnnnn 770  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||   |||||||||||||||||| ||   ||||||          
T  25063458 tactccctccatccctatatgtaaccacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatacatatttattatttttt 25063359  T
Q  771 nctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
      |||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  25063358 --tcctaaacatacccctaattaatcctactaacttgtcgtgaaatatgaaaagtgaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattaggta-atatta 25063262  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  25063261 acacacaaaacagacacattatttgcattaataacttttcttaaaaaatataaaaaa 25063205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 703 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 46495525 - 46495304
Alignment:
Q  703 atttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaata 802  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||        |||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  46495525 atttgattttatttttgtccgtaaatgtaaatccttttttaaattacaagatgcatttattattttt---tcctaagcatacgcttaattaatactatta 46495429  T
Q  803 acatgtctt-gaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaa 900  Q
    || |||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  46495428 acttgtctttgaaatttgaaaagtcaaatttaatatacatacaaataaaggacaatttgata-atattaacacacaaaacagacacattaattacactga 46495330  T
Q  901 caacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||| |||| |||| |||||||    
T  46495329 caatttttttttaaaaatgtgaaaaa 46495304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Original strand, 4813317 - 4813570
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |   ||||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  4813317 ttacttcctccgtccctatatataaccatccatttgactaaaaaattgtccctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattattttttt 4813416  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     ||||||||||  |||||||||||||   |||| | | ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||  | |||||| || |||||||    
T  4813417 -tcctaaacatattcctaattaatacggctaacttattttgaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaagaataatttggta-atattaa 4813514  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4813515 cacacaaaatagacacattaattgcattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 4813570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 44163468 - 44163227
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||            
T  44163468 tactccctccgtccctatacataagcacccatttgactttatttttatccctaaatgtaaaccccttt-caaattactagatgcatttattattttt--- 44163373  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
    | | ||| |  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||   |       ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44163372 tgccaaatacactcttaattaatactactaacttgtcttgaaatatgatcat-------aatacacatacaaacaaatgacaatttaata-atattaaca 44163281  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||||    
T  44163280 cacaaaacaaacacattaattacactgataactttttttaagaaatgtgaaaaa 44163227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 786 - 926
Target Start/End: Original strand, 8984629 - 8984769
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||     
T  8984629 cctaattaatactactaatttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaacacacaaaacagac 8984727  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||    
T  8984728 acattaattacactaacaattttccttaaaaaatgtgaaaaa 8984769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 673 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 32047677 - 32047428
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||            
T  32047677 tactccctccgtccctatatctaagcat---------tttatttttatccctaaatgtaaaccctttttcaaattacttgatgcatttattattttt--- 32047590  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    || ||||||| | ||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||  || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  32047589 tcttaaacatacccctaaataatactactatcttgtcttgaaatatgaaaaagtcaaatttaa--cacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaa 32047493  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatg-aaaaagcaatggg 934  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  32047492 cacacaaaacaaacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaaagcaatggg 32047428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 677 - 927
Target Start/End: Original strand, 28334081 - 28334324
Alignment:
Q  677 ccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcct 776  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||         ||||    
T  28334081 ccctccgtccctatatgtaaacacccatttgattttacttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttatt-tttatttttcct 28334179  T
Q  777 aaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacac 875  Q
    |||||| | |||||||||||| | || | || ||| |||| ||||| || ||||| |||||||||| || |||| |||||||       |  ||||||||    
T  28334180 aaacatacccctaattaataccactatcttgccttaaaatatgaaaattcaaatttaatacacatataagcaaaggacaatt-------tcgtaacacac 28334272  T
Q  876 aaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28334273 aaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 28334324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 786 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 2343039 - 2342873
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  2343039 cctaattaatactactaacttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaacaaaagacaatttggta-atattaacacacaaaatagac 2342941  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatg-aaaaagcaatggggcttagatatagagacg 951  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||| | |||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  2342940 acattaagtaaactaacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaaagcaaaggggcttacacatagagacg 2342873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 795 - 926
Target Start/End: Original strand, 23393492 - 23393620
Alignment:
Q  795 tactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaatt 893  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  23393492 tactaataacttgtcttgaaatatgaatagtcaaat--aatacacatacaaacaaatgacaatttaataaat--taatacacaaaatagatacattaatt 23393587  T
Q  894 acactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23393588 acattaacaacttttcttaaaaaatatgaaaaa 23393620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 775 - 927
Target Start/End: Original strand, 29140611 - 29140763
Alignment:
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacac 873  Q
    |||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||    
T  29140611 ctaaacatacccctaattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattttgta-atattaatac 29140709  T
Q  874 acaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29140710 acaaaacagacacattaattacaccggcaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 29140763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 672 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 25269622 - 25269371
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||  | |||||||| |||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  25269622 ttactccc-ccgtctctatatataaatacccatttgattttacttttgttcctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattactttt-- 25269526  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     || ||||||| | |||||||||||  | || | || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||  || |||||||    
T  25269525 -tcttaaacatacccctaattaatatcattatcttgcctcgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggaaaatttcgta-atattaa 25269428  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  25269427 cacataaaacagacacattatttacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 25269371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 673 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 32716038 - 32715956
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgc 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32716038 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtctctaaatgtaaa-cccttttcaaattactagatgc 32715956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 773 - 925
Target Start/End: Original strand, 44652816 - 44652965
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||     
T  44652816 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatgtggta-atattaaa 44652914  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||    
T  44652915 acacaaaacagacacattaattacactaaca---tttcttaagaaatgtgaaaa 44652965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 13723326 - 13723586
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactt-tatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||  || |||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  13723326 tactccctccatccctatatataaacacccttttgactaataatttt-tctctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattattatttt 13723424  T
Q  772 ct-cctaaacatgctcctaattaatactaata------acatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatat 863  Q
     | ||||||||||| |||||||| ||||| ||      || | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||     
T  13723425 tttcctaaacatgcccctaattattactactagtactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta- 13723523  T
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13723524 atattaatacacaaaatagacacattaattgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 13723586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 788 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 44335426 - 44335275
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtctt-gaaatttgaaa-gttaaattaaat---acacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||   |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44335426 taattaatactactaacttgtctttgaaatttgaaaagtcaaatttaattatacacgtacaaacaaaggacaatttggta-atattaacacacaaaacag 44335328  T
Q  883 atacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaatgggg 935  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||    
T  44335327 acacattaattacactgacaacttttattaagaaatgtgaaaaaacaaagggg 44335275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 15179656 - 15179405
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||            
T  15179656 tactcccttcgtccctatacgtaaccatccattttattttatttttgttcataaatgtaaaac-ctttttaaattattagatgcatttattattatattt 15179558  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  |||||||   |||||||||| ||| |||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||    
T  15179557 tt-taaacatatccctaattaatcctactaacttgtcttgaaatacgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattttgta-atatttac 15179460  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     || |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  15179459 gcataaaatagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 15179405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 786 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 30336194 - 30336054
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  30336194 cctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaattcaaattttatacgcatagaaacaaaggacaatttggta-atattaacacacaaaatagac 30336096  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  30336095 acattaattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 30336054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 786 - 910
Target Start/End: Original strand, 31807940 - 31808064
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||  |||||||| |||||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||     
T  31807940 cctaattaatactactaacttgtcttgaaataggaaatgtcaaatttgatacacatgcaaacaaaagataatttggta-atattaacacacaaaatagac 31808038  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttct 910  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31808039 acattaattacactaacaacttttct 31808064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 788 - 918
Target Start/End: Original strand, 15911522 - 15911652
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  15911522 taattaatattactaacttgtcttgaaatatgaaatgtcacatttaatacacatacaaacaaatggttatttggta-atattaacacacaaaatagacac 15911620  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15911621 attaagtacactaacaacttttcttaagaaat 15911652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 787 - 901
Target Start/End: Original strand, 47070930 - 47071044
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |    
T  47070930 ctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacgcatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacataaaatagaca 47071028  T
Q  886 cattaattacactaac 901  Q
    ||||||||||||||||    
T  47071029 cattaattacactaac 47071044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 773 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 32144459 - 32144314
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   ||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32144459 tcctaaacatatccctaattaatattattaacttgtcttaaaatatgaaaagtcaaattttatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaac 32144361  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
     ||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  32144360 gcacaaaatagacacattaaatgcaccaacaacttttcttaagaaat 32144314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 774 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 20564922 - 20564770
Alignment:
Q  774 cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  20564922 cctaaacatacatctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacattcaaacaaaagacaattttgta-atattaaca 20564824  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || |||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  20564823 cataaagtagacacattagttacactatcaacttttcttaacaaatgtgaaaaa 20564770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 826 - 926
Target Start/End: Original strand, 15457824 - 15457923
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15457824 aaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-atattatcacacaaaataaatatattaactgtactaacaactttttttaagaaatatgaaaa 15457922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 806 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 24415115 - 24415024
Alignment:
Q  806 tgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacac 897  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24415115 tgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttggta-atattaacacacaaaagagatacattaattacac 24415024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 808 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 31305431 - 31305313
Alignment:
Q  808 tcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactt 906  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31305431 tcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atattagcatacaaaatagacacattaattacaccaacaactt 31305333  T
Q  907 ttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| | |||| |||||||    
T  31305332 ttcttaataaatgtgaaaaa 31305313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 820 - 927
Target Start/End: Original strand, 35001273 - 35001379
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||| | ||||     
T  35001273 aaagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcata-acattaacacacaaaacagacattttgattacactgacaacttttcttaataaatg 35001371  T
Q  920 tgaaaaag 927  Q
    ||||||||    
T  35001372 tgaaaaag 35001379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 682 - 852
Target Start/End: Original strand, 46732827 - 46732995
Alignment:
Q  682 cgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaaca 781  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||         ||||||||    
T  46732827 cgtccctatatctaaacatctatttgactttatttttgtccctaaatgtaaatccttttttaaattacta-atgcatttattattttttc--cctaaaca 46732923  T
Q  782 tgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatga 852  Q
    | | |||||||| ||||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46732924 tacccctaattattactactaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaatga 46732995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Original strand, 28679777 - 28679928
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| ||| | ||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  28679777 tcctaaaaatacccctaattaatactaaaaacttatcttgaaatattaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaaa-acaatttaata-atattaac 28679874  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  28679875 acacaaaatagacacattaattgcattaacaactttt-tttaaaaatgtgaaaaa 28679928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 820 - 918
Target Start/End: Original strand, 47754645 - 47754742
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  47754645 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacaaaaaatagacacattaattgcactaacaattttttttaagaaat 47754742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 795 - 926
Target Start/End: Original strand, 3143713 - 3143842
Alignment:
Q  795 tactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaa-attaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaatt 893  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||||||||    
T  3143713 tactactaacttgtcttgaaatatgaaaaataatatttaataaacatacaaacaaaagacaatttgata-ataataacaca--aaatagacacattaatt 3143809  T
Q  894 acactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3143810 acactatcaacttttcttaagacatatgaaaaa 3143842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 774 - 917
Target Start/End: Original strand, 9675623 - 9675766
Alignment:
Q  774 cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || || | | | ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||||    
T  9675623 cctaaacatacccctaattaatattattatcttattttgaaatatgaatagtcaaatttaatacacatacaaataaaggacaatttcgta-atattaaca 9675721  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaa 917  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9675722 cacaaatcagacaaattaattacactgacaacttttcttaagaaa 9675766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 897
Target Start/End: Original strand, 16395409 - 16395627
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||            
T  16395409 tactctctccgtctctatatctaagcatttatttgactttatttttgttcgtaaatgcaaa-ctctttttaaattattagatgcatttattatttt---- 16395503  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||  ||  ||||||||| || |||| |||  |||||| || ||||| |||||  | ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  16395504 tcctaaacacact-ttaattaatattattaacttgttatgaaatatgaaaagtcaaattttacacacatacaaacaaaagataatttggta-atattaac 16395601  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacac 897  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||    
T  16395602 atacaaaatagacacattaattacac 16395627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 677 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 34012728 - 34012558
Alignment:
Q  677 ccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcct 776  Q
    ||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||   ||||||||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||        ||||    
T  34012728 ccctccgtctctatatctaagcacatatttgattttatttttgtcgttaaatgtaaacttttttttaaattactagatgcatttattattttt---tcct 34012632  T
Q  777 aaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaa 849  Q
    |||||| | | |||||||||||| || | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34012631 aaacatacccttaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatataaacaaa 34012558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 705 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 3072350 - 3072149
Alignment:
Q  705 ttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataac 804  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| ||||||| ||||| || ||||||        | |||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  3072350 ttgactttatttttgttcctaaatgtaaccttatttacaaattagtagatacatttattattttt---ttctaaacatacctctaattaatactactaac 3072254  T
Q  805 atgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaa 903  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||  ||||||| ||| ||||||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||    
T  3072253 ttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacataaaaaaaaa--acaatttaata-atattaacacataaaataaacacattaattgcactaacaa 3072157  T
Q  904 cttttctt 911  Q
    ||||||||    
T  3072156 cttttctt 3072149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 787 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 44395669 - 44395531
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||||||||||||| || |||||  || ||||||||||| |||| | | |    
T  44395669 ctaattaatactattaacatgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatatacatacaaacaaaggataattttgta-atattaacacataaaataaaca 44395571  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
     |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||    
T  44395570 tattaattacactgacaacatttcttaagaaatgtgaaaa 44395531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 747
Target Start/End: Original strand, 8984366 - 8984440
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaatt 747  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||    
T  8984366 tactccctccatccctatatctaagcacccatttgactttatttttgtcccgaaatttaaaactcttttcaaatt 8984440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 682 - 764
Target Start/End: Original strand, 9684582 - 9684664
Alignment:
Q  682 cgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  9684582 cgtccttatatctaagcatccatttgattttatttttgttattaaatgtaaacccctttttaaattattagatgcatttatta 9684664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 826 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 41737219 - 41737130
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaa 916  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41737219 aaatttaaaacacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaacacacaaaatagacattttaattacactaacaacttttcttaagaa 41737130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 806 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 34102451 - 34102331
Alignment:
Q  806 tgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaac 904  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||     
T  34102451 tgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataaacatacaaacaaagaataatttgata-atattaacacacaaaacagacacattaattacaatgaaaat 34102353  T
Q  905 ttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| | |||| |||||||    
T  34102352 ttttcttaaaaaatttgaaaaa 34102331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 835 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 50692494 - 50692405
Alignment:
Q  835 acacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  50692494 acacatacaaacaaaggacaatttggta-atactaacacacaaaatagacacattaattgcattgacaacttttcttaagaaatgtgaaaa 50692405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 672 - 764
Target Start/End: Original strand, 29302345 - 29302437
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| || |||||| | || ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29302345 ttacttcctccatctctatatctaaacacccatttaatttaatttttgtccttaaatataaatctcttttcaaattactagatgcatttatta 29302437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 773 - 879
Target Start/End: Original strand, 291590 - 291696
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||| | |||| |||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  291590 tcctaaatatactcctaattaatactactaacttatcttaaaatataaaaagttaaatttaatacaaatacaaacaaatgacaatttagta-atattaac 291688  T
Q  872 acacaaaa 879  Q
    | ||||||    
T  291689 atacaaaa 291696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 763
Target Start/End: Original strand, 7957551 - 7957634
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatt 763  Q
    ||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  7957551 tccgtccatatatctcaacactcatttgactttatttttgttcttaaatgtaaacccctcttcaaattactagatgcatttatt 7957634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 10842475 - 10842324
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | ||||||||||||   ||||   ||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  10842475 tcctaaacatacccctaattaataccgttaactcatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaacgataatttggta-atattaac 10842377  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||  ||| ||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10842376 aca--aaatagacatattaattgcattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 10842324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 773 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 13145566 - 13145456
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || |||| | |||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  13145566 tcctaaacatacccctaattaatattactaacttatcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatgcacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaac 13145468  T
Q  872 acacaaaacaga 883  Q
    | ||||||||||    
T  13145467 atacaaaacaga 13145456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 776 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 27531244 - 27531094
Alignment:
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    ||||||| ||| ||||||||| || |||| | ||||||||| || | | |||||||   || |||||||||||||  ||||||   || |||||||||||    
T  27531244 taaacatactcataattaatattactaacttatcttgaaatatgtagggttaaattttttatacatacaaacaaagaacaattaagta-atattaacaca 27531146  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  27531145 caaaacaaacacattaattatactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 27531094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 864 - 927
Target Start/End: Original strand, 29302495 - 29302558
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29302495 atattaacatacaaaacaaatacattgattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 29302558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Original strand, 47753894 - 47753985
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47753894 tactccatctgtccctatatctaaacactcatttgactttatttttgtccctaaacgtaaacccattttcaacttactagatgcatttatta 47753985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 837 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 13352917 - 13352832
Alignment:
Q  837 acatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaa 923  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| || |||||| |||||| ||||    
T  13352917 acatacaaataaatgacaatttgcta-atattaacacataaaacagacacattaattgaactaactacatttcttaagaaatgtgaa 13352832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 841 - 926
Target Start/End: Original strand, 47133463 - 47133548
Alignment:
Q  841 acaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttcttt-agaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  47133463 acaaacaaatgacaatttaata-atattaacacacaaaataaacacattaattacattaacaatttttttttaagaaatgtgaaaaa 47133548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 664 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 20487192 - 20487123
Alignment:
Q  664 aataattgttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaa 733  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20487192 aataattattatttcctccgtccctatatctaaacactcattcgactttatttttgtctctaaatgtaaa 20487123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 672 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 31305516 - 31305455
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaa 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  31305516 ttactccctccgtccctatatctaagcactcatttgactttatgtttgtccctgaatgtaaa 31305455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 843 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 34012134 - 34012050
Alignment:
Q  843 aaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttcttt-agaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  34012134 aaacaaaagacaatttcata-atattaacacataaaacagacacattaattgcactgacaacttttgtttaagaaataggaaaaag 34012050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 764
Target Start/End: Original strand, 5852568 - 5852652
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||||  |||  ||| |||| | ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5852568 tccgtccctataattaaaaatctatttaattttatttttattcttaaatgtaaaactcttttcaaattactagatgcatttatta 5852652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 41737316 - 41737236
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactaga 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  41737316 tactccctccgtccctatatctaagtattcatttaacgttatttttgtccctaaacgtaaacccattttcaaattattaga 41737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 837 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 40261678 - 40261592
Alignment:
Q  837 acatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaa 924  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||    
T  40261678 acatataaacaaagggcaatttgata-atattaacacacaaaataaacacattaattgcactaactacttttcataagaaatgtgaaa 40261592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 773 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 4082074 - 4081931
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   ||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||  | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||    
T  4082074 tcctaaacatatccctaattaataatactaacttgtctttaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacagacaaatgataatttagta-atattaac 4081976  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaa 916  Q
    | |||||  | | ||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  4081975 atacaaactaaacacattaattgcattaataacttttcttaagaa 4081931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 928
Target Start/End: Complemental strand, 6282562 - 6282467
Alignment:
Q  832 aatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagc 928  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||  ||||  |||||||||    
T  6282562 aatacatatataaacaaaggacaattttata-atattaacacataaaatagacacattaattgtactaacaatttttcttatgaaacgtgaaaaagc 6282467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 749
Target Start/End: Original strand, 12844000 - 12844076
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattac 749  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || ||||  |||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  12844000 tactccctccgtccctatatgtaaccacccttttgtttttatttttgtccctaaatgtaaacccctttttaaattac 12844076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 721
Target Start/End: Original strand, 44652728 - 44652776
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtt 721  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  44652728 tactccatccgtccctatatctaagcccccatttaactttatttttgtt 44652776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 49033920 - 49033829
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatt 763  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||| |||| ||||||  |||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  49033920 ttactccctccgtccctgtatgtaaccaccaatttgattttacttttgtccctaaacataaacccctttttaaattactagatgcatttatt 49033829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 840 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 13698670 - 13698592
Alignment:
Q  840 tacaaacaaatgacaatttgatata-tattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaa 917  Q
    |||||||||||||||||||    || ||||||||| ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13698670 tacaaacaaatgacaatttttagtaatattaacacgcaaaataaacatattaattacactaacaacttttcttaagaaa 13698592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 694 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 24415214 - 24415144
Alignment:
Q  694 taagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24415214 taagcctccatttgactttatttttatccttaaatataaatccccttttaaattactagatgcatttatta 24415144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 764
Target Start/End: Original strand, 23393117 - 23393202
Alignment:
Q  679 ctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||  ||||| |||||||  |||| | ||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  23393117 ctccgtctttatatttaagcatttatttaattttatttttgttcttgaatgtaaatttctttttaaattattagatgcatttatta 23393202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 3e-57; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 1764060 - 1763809
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||| ||||||| |||||||| ||||||            
T  1764060 tactccctccgtccctatatctaagcactcatttgattttatttttgtctctaaatataaacacctttccaaattattagatgcatttattattattt-- 1763963  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  1763962 tcctaaacatacccttaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 1763864  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1763863 acacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatatgaaaaa 1763809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 31945771 - 31946022
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||            
T  31945771 tactccctccgtccttatatgtaaccactcatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacttcttttcaaattactagatgcatttattatttttt-- 31945868  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  31945869 tcctaaacatatccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatataaacaaacgacaatttggta-atattaac 31945967  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31945968 acacaaaatagacacattaattacactaacaaattttcttaagaaatgtgaaaaa 31946022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 683 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 6791613 - 6791374
Alignment:
Q  683 gtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacat 782  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  6791613 gtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgtctttaaatgtaaaccccttttcaacttactagatgcatttattatttttt--tcctaaacat 6791516  T
Q  783 gctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaaca 881  Q
     |||||| ||||||| | || | ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  6791515 actcctagttaatacaattatcttgtcttgaaatttaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttaata-atattaacacacaaaac- 6791418  T
Q  882 gatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     | |||||||||||| | ||||||||| || |||||| |||||||    
T  6791417 -acacattaattacattgacaactttttttaagaaatgtgaaaaa 6791374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 694 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 15982020 - 15981790
Alignment:
Q  694 taagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaatta 793  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||        | | |||||| |   ||||||    
T  15982020 taagcacccatttaactttatttttgtccctaaatgtaaaccttttttcaaattactagatgcatttattatatttt--ttcaaaacatacctataatta 15981923  T
Q  794 atactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaat 892  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15981922 atactattaacttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaagacacatacaaactaatgacaatttggta-atattaacacacaaaacagacacattaat 15981824  T
Q  893 tacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15981823 tacaccaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 15981790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 708 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 16327336 - 16327119
Alignment:
Q  708 actttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaa-taacat 806  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| |  |||||||||||||| |||| |    
T  16327336 actttatttttgtctctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattatatttt--tcctaaacatacctctaattaatactaaataactt 16327239  T
Q  807 gtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaact 905  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||    
T  16327238 gtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacaaatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacacaaaacagacacattaattatattgacaact 16327140  T
Q  906 tttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  16327139 tttcttaagaaatgtgaaaaa 16327119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 19839178 - 19838927
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  19839178 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattattt-- 19839081  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| |||  | |||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  19839080 tcctaaacatacccctaattaatcctactaatttatcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 19838982  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19838981 acataaaatagacacattaactacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 19838927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 708 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 16350734 - 16350517
Alignment:
Q  708 actttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaa-taacat 806  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| |  |||||||||||||| |||| |    
T  16350734 actttatttttgtctctaaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattatatttt--tcctaaacatacctctaattaatactaaataactt 16350637  T
Q  807 gtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaact 905  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16350636 gtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacaaatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacacaaaacagactcattaattacactgacaact 16350538  T
Q  906 tttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| || | |||| |||||||    
T  16350537 tttattaaaaaatgtgaaaaa 16350517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 684 - 918
Target Start/End: Original strand, 30465838 - 30466070
Alignment:
Q  684 tccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatg 783  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||     
T  30465838 tccctatatctaaacatctatttgactttatttttgttcataaatgtaaacttcttttcaaattactagatgcatttattatttttt--tcctaaacatc 30465935  T
Q  784 ctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    | | |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||     
T  30465936 cccttaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggta-atattaacacacaaaacaa 30466034  T
Q  883 atacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    | | |||||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  30466035 acatattaattacaccgacaacttttgttaagaaat 30466070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 11303104 - 11302850
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagtt-attannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||   ||||||||||  ||||||||||| |||||||||  || ||||           
T  11303104 tactccctccgtccctatatctaagaacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaacttcttttcaaataactagatgctttttattattttttt 11303005  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     || ||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||    
T  11303004 -tcttaaacatacccctaattaatactactattttgtcttgaaatgtgaaaagtcaaatttaatacacatgcaaacaaaggacaattttgta-atattaa 11302907  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11302906 cacaaaaaacagacacattaattatactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 11302850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 737 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 5895914 - 5895726
Alignment:
Q  737 cttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaata 835  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||| |||| |||||||||||| | || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5895914 cttttcaaattactagatgcatttattaattttt--tcctaaatatgcccctaattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaata 5895817  T
Q  836 cacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5895816 cacataaaaataaaggacaatttcgta-atattaatacacaaaacagacacattaattacattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 5895726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 702 - 923
Target Start/End: Original strand, 197337 - 197558
Alignment:
Q  702 catttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaat 801  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||||        || |||| || |  ||||||||||||| |    
T  197337 catttgactttatttttgtccttaaatgtaaacttctttttaaattactagatgcctttattatttatttttcttaaatatacctctaattaatactact 197436  T
Q  802 aacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaa 900  Q
    ||| |||||| |||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |    
T  197437 aacttgtcttaaaattgaaaaaattaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttaata-atattgacacacaaaacaaacacattaattatactga 197535  T
Q  901 caacttttctttagaaatatgaa 923  Q
     |||||||||| |||||| ||||    
T  197536 taacttttcttaagaaatgtgaa 197558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 694 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 31536239 - 31536007
Alignment:
Q  694 taagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaatta 793  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||  || |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||        ||||| |||| |   ||||||    
T  31536239 taagcacccatttgattttatatttgtcactgaatgtaaaccccttttcaaattactagttgcatttattattttttt-tcctatacatacctataatta 31536141  T
Q  794 atactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaat 892  Q
    |||||| |||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||    
T  31536140 atactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaagataatttgata-atattaacaaataaaatagatatattaat 31536042  T
Q  893 tacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  31536041 tacactaacaacttttcttaagaaatgtaaaaaag 31536007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 701 - 926
Target Start/End: Original strand, 22410729 - 22410953
Alignment:
Q  701 ccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaa 800  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |  ||||||| ||||||        |||||| ||| | | ||||||||||||     
T  22410729 ccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaatcctttttcaaataataagatgcatttattatttttt--tcctaagcatacccttaattaatactac 22410826  T
Q  801 taacatgtctt-gaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacact 898  Q
    | |  |||||| | |||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22410827 ttatttgtctttgtaatttgaaaggtcaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttggta-atattaacataaaaaacagacacattaattacact 22410925  T
Q  899 aacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22410926 aacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 22410953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 673 - 924
Target Start/End: Original strand, 28238175 - 28238422
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| |  ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||            
T  28238175 tacttcctctgtcactatatctaagcatccgtttgattttctttgtcctt--aaatgtaaatcctttttcaaattactagatgcatttattattttt--- 28238269  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  || ||||| |||| ||||| ||||||  || ||| || || |||||||    
T  28238270 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaagtcaaatttaataaacataaaaacaatggataatatggta-atattaa 28238368  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaa 924  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||    
T  28238369 cacacaaaatagacacattaattatactaacaatttttattaagaaatgtgaaa 28238422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 676 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 30249105 - 30248962
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcc 775  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||        |||    
T  30249105 tcccttcgttcctatatctaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacctattttcaaattactagatccatttattattttt---tcc 30249009  T
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa 822  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  30249008 taaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaa 30248962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 710 - 911
Target Start/End: Original strand, 34513115 - 34513313
Alignment:
Q  710 tttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtc 809  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||| | |||||||| ||||| || | ||||    
T  34513115 tttatttttgttcctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattttt---ttctaaacatacccctaattattactactatcttgtc 34513211  T
Q  810 ttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||  || |||| ||||    
T  34513212 ttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttcgta-atattaacacacaaaacagacacattatttatgctgacaaatttt 34513310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 801 - 911
Target Start/End: Original strand, 12514570 - 12514680
Alignment:
Q  801 taacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacacta 899  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  12514570 taacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaacacacaaaatagacacattaattgcacta 12514668  T
Q  900 acaacttttctt 911  Q
    |||| |||||||    
T  12514669 acaatttttctt 12514680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 820 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 9428268 - 9428163
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||      
T  9428268 aaagtaaaattcaatatacatacaaacaaatgataatttgata-atattaacacacaaaatagatacattaattatagtagcaacttttcttaagaaacg 9428170  T
Q  920 tgaaaaa 926  Q
    |||||||    
T  9428169 tgaaaaa 9428163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 775 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 3729569 - 3729485
Alignment:
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaattt 858  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3729569 ctaaacatactcctaattaatattactaacttgtcttgaaatatgtaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattt 3729485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 31780374 - 31780120
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||  |  ||||| ||||||| ||||   | ||||||||||||||||  | ||||||           
T  31780374 ttactcccttcgttcctatatctaagcatcattttgactaaaaatttgtctctaaatataaactccatttcaaattactagatagatttattattattat 31780275  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
     |||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||  || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  || |||| |    
T  31780274 -tcctaaacataccccttattaatactattaacttgtcttgaaaaatgaaaaagtgaaatttaatacacaaacaaacaaaggacaatttagta-atatca 31780177  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||    
T  31780176 acatacaaaatagacacattaattgcattatcaacttttattaagaaatatgaaaaa 31780120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 773 - 925
Target Start/End: Original strand, 3887899 - 3888051
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag--ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||   | ||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| || |||||||    
T  3887899 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaaatcaaatttaatacacatgtaaacataagacaatttg-ta-atattaa 3887996  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3887997 cacacaaaatagacacattaactgcaataacaacttttcttaagaaatgtgaaaa 3888051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 833 - 925
Target Start/End: Original strand, 5084555 - 5084650
Alignment:
Q  833 atacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacatt----aattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5084555 atacacatacaaacaaaggacaatttgata-atattaacacacaaaacaaacacatttattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaa 5084650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 824 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 3729486 - 3729393
Alignment:
Q  824 ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  3729486 ttaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttggta-atattaacacacaaaatagacacattaattacaccaacaatttttcttaagaaat 3729393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 757
Target Start/End: Original strand, 10260462 - 10260546
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10260462 tactccctccgttgctatatttaaacacccatttgattttatttttgtttttaaatgtaaattttttttcaaattactagatgca 10260546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 680 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 9461533 - 9461288
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||  |||||||||||||   |||||||||| |   |||||||||| |||||||| ||||||        | |||||    
T  9461533 tccgtccatatatttaagcttctattcaactttatttttgtccttaaatgtaaaccctctttcaaattattagatgcatttattatttttt--ttctaaa 9461436  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    ||| | | |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||||  || ||||||||||| |||    
T  9461435 catacccataattaattctactaacctgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttagta-atattaacacataaa 9461337  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||| | |||||||||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  9461336 acaaacacattaattacaccgacaacatttcttaataaatgtgaaaaag 9461288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 773 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 33607504 - 33607359
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||| | || |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  33607504 tcctaaacatacccctaattaatactgctaacttatcatgaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttgata-atattaac 33607406  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| || |||||| |||| |||| ||||    
T  33607405 acactaaatagacacattaattgcattaacaatttttttttaaaaat 33607359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 705 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 5457400 - 5457216
Alignment:
Q  705 ttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataac 804  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||        | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  5457400 ttgactttatttttatctctaaatataaatccattttcaaattattagatgcatttatt----ttttcccctaaacatacctctaattaatactactaac 5457305  T
Q  805 atgtcttgaaattt-gaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaatt 893  Q
     ||| |||||||||  ||| | ||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5457304 ttgttttgaaatttaaaaaatcaaatttaatacatttacaaacaaagaacaatttgata-atattaacgtataaaacagatacattaatt 5457216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 839 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 30248645 - 30248563
Alignment:
Q  839 atacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaa 923  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  30248645 atacaaacaaatgccaatttggta-atattaacacacaaaacaaacacattaa-tacacttacaacttttcttaagaaatgtgaa 30248563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 864 - 927
Target Start/End: Original strand, 4250706 - 4250769
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  4250706 atattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtaaaaaag 4250769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 820 - 908
Target Start/End: Original strand, 10669279 - 10669366
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  10669279 aaagtcaaatttaatacagatacaatcaaagaacaatttggta-atattaacacacaaaatagacacattaattgcactaacaattttt 10669366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 819 - 926
Target Start/End: Original strand, 1514232 - 1514337
Alignment:
Q  819 gaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||| |||||| | | | ||||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  1514232 gaaagtcaaatttaatacacatataaacaattgataatttggta-atattaacatacaaaataaacatattaattgcactaacaac-tttcttaaaaaat 1514329  T
Q  919 atgaaaaa 926  Q
    ||||||||    
T  1514330 atgaaaaa 1514337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 787 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 16186705 - 16186584
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||  ||||||||  || ||  ||||| |||||||||| |    
T  16186705 ctaattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaataca--tacaaacaagggacaatttcgtaaat--taacatacaaaacagaca 16186610  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16186609 cattaattacactaataacttttctt 16186584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 786 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 31039282 - 31039215
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatga 852  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31039282 cctaatcaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaattaaatgcacatacaaacaaatga 31039215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 791 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 20523103 - 20522974
Alignment:
Q  791 ttaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacatt 889  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||   | |||||| || ||||| |||||||||  | |  ||||    
T  20523103 ttaatgctaataacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaagaaataatttggta-atattgacacacaaactaaactcatt 20523005  T
Q  890 aattacactaacaacttttctttagaaatat 920  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  20523004 aattgcactaacaacatttcttaagaaatat 20522974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 866 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 11081952 - 11081891
Alignment:
Q  866 attaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  11081952 attaatacagaaaatagatatattaattacactaacaacttttcttaagatatgtgaaaaag 11081891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 723 - 757
Target Start/End: Original strand, 10669199 - 10669233
Alignment:
Q  723 ctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10669199 ctaaatataaatctcttttcaaattactagatgca 10669233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1091 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1091
Description:

Target: scaffold1091; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 1771 - 2022
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  1771 tactccctccatccctatatctaagcacccatttgactttatttttgtccctcaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatgtttt-- 1868  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  1869 tcctaaacatacccctaattaatactactaatttgtcttgcaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta-atattaac 1967  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1968 acacaaaatagacacattaattacactaacaacttatcttaagaaatgtgaaaaa 2022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 109; Significance: 3e-54; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 672 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 48767813 - 48767551
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||            
T  48767813 ttactccctccgtccctatatctaagcccccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatgcatttatttattttt- 48767715  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaa-caaatgacaatttgatatatatta 869  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||    
T  48767714 -tcctaaacatacccctaattaatactaataacatgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaaacaaaggacaatttcgta-atatta 48767617  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatg-aaaaagcaatggg 934  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||| || |||||||||||||    
T  48767616 acacacaaaacagacacattaattacactgacaacgttttttaagaaatgtgaaaaaagcaatggg 48767551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 1324954 - 1324703
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||            
T  1324954 tactccctctgtccctatatctaagcccccattttattttatttttgtccctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatgaatttattattttt--- 1324858  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1324857 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-agattaac 1324759  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  1324758 acacaaaacagacacattaattacactgataacatttcttaagaaatgtgaaaaag 1324703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 19235923 - 19236176
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||             
T  19235923 tacttcctccgtccctatatctaagcactcatttgactttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttatttatttattt 19236022  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||    
T  19236023 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatatggta-atattaac 19236121  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  19236122 atacaaaaccgacacattaattacactaacaacttttcttacgaaatgtgaaaaa 19236176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 672 - 927
Target Start/End: Original strand, 4089358 - 4089610
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaa-ttactagatgcagttattannnnnn 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||          
T  4089358 ttactccctccgtccctatatctaaacacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaa-ctctttttaaaattactagatgcatttattattttt- 4089455  T
Q  771 nctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
      |||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||| || |||||  || ||||||    
T  4089456 --tcctaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaacaaaagataatttcgta-atatta 4089552  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4089553 acacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 4089610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 2276437 - 2276686
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||             
T  2276437 tactccctccgtccctatatataagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaatcgcttttcaaattactagacacatttttttttct---- 2276532  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  2276533 tcctaaacatacccttaattaatactagtaacttatcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaac 2276631  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||| || |||||| |||||||    
T  2276632 acacaaaacagacaaattaactacactgacaacttttgttaagaaatgtgaaaaa 2276686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 680 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 21388482 - 21388238
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||        |||||||    
T  21388482 tccgtccctatatttaagcacccatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacccctttccaaattactagatgcatttattatttttt--tcctaaa 21388385  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    ||| |   |||||||||||| |||| | |||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  21388384 cataccattaattaatactactaacttatcttaaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaacacacaaa 21388286  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21388285 acagacacattaattacaccgacaaattttcttaagaaatgtgaaaaa 21388238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 10685332 - 10685081
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  10685332 ttactccctccgtccttatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattattttt-- 10685235  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     | |||||| | | | ||||||||| || ||   ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  10685234 -ttctaaacgtacccataattaatattactattttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaa 10685137  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  10685136 cacataaaacagacacattaattacactgataacttttcttaagaaatatgaaaaa 10685081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 673 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 35128632 - 35128395
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||| | | ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||            
T  35128632 tactccctccattcttatatttaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattattttttt- 35128534  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  35128533 tcttaaacatacccctaattaatactatcatcttgtcttgaaatatgaaaattcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcata-atattaac 35128435  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  35128434 acacaaaacagacatattaattacactgacaacttttctt 35128395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 18121902 - 18122152
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||            
T  18121902 tactccctccgtccctatatgtaagcacgcatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacc-ctttttaaattactagatgcatttattattttt--- 18121997  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||||||| |||||||| || |||||  || ||||||||    
T  18121998 tcctaaacatacgtctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatacacattcaaacaaaggaaaatttagta-atattaac 18122096  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18122097 acataaaacagacacactaattacactcacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 18122152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 20123585 - 20123446
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtctt-gaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20123585 taattaatactaataacttgtctttgaaatttgaaaattcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttgata-atattaacacacaaaacagaca 20123487  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  20123486 cattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 20123446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 704 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 37673953 - 37673732
Alignment:
Q  704 tttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataa 803  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||| | ||||||       ||  ||||||||| ||||||||||| || ||     
T  37673953 tttgattttatttttgtctctaaatgtaaactcctttttaaattactagatgtatttattatttttttct--taaacatgcccctaattaatattattat 37673856  T
Q  804 catgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaaca 902  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37673855 cttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttcata-atattaacacacaaaacagacacattaattacactcaca 37673757  T
Q  903 acttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    || |||||| |||||| ||||||||    
T  37673756 acatttcttaagaaatgtgaaaaag 37673732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Original strand, 6376088 - 6376242
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataa-catgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  6376088 tcctaaacatactcctaattaataatattaaacttgtcttaaaatttgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaa 6376186  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6376187 cacacaaaacagagacattaattacactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 6376242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 673 - 904
Target Start/End: Original strand, 36726030 - 36726260
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||            
T  36726030 tactccatccatccctatatctaagcccccatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacccactttcaaattactagatgcatttattatttttttt 36726129  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  36726130 tcctaaacttacccctaattaatactaccaacttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacata-aaacaaaggacaatttggta-atattaac 36726227  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaac 904  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36726228 acacaaaacaaacacattaattacactaacaac 36726260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 675 - 911
Target Start/End: Original strand, 29635901 - 29636134
Alignment:
Q  675 ctccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctc 774  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||        ||    
T  29635901 ctccctctgtccttatatctaagcacccatgtgactttatttttgtccctaaatgtaaatccattttcaaattattagatgcatttattatttttt--tc 29635998  T
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacac 873  Q
    |||||||    ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  29635999 ctaaacagatccctaagtagtactactaacttgtcttgaaatatgaaaaattaaattaaatacacataaaaacaaagg-caatttggta-atattaacac 29636096  T
Q  874 acaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  29636097 acaaaacagacacattaattacattgacaacttttctt 29636134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 37048277 - 37048031
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||             
T  37048277 tactccctccgtcc-tatatctaaacacctatttgactttatttttgtca-taaatgttaacttcttttcaaattactagatgcatttttttttct---- 37048184  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||    
T  37048183 ttctaaacatac-cctaattaatactactaacttgtattgaaatatgaatagttaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggga-acattaac 37048086  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||    
T  37048085 acacaaaacagacacattaattacactgataacttttcttaagaaatgtgaaaaa 37048031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 678 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 26633088 - 26632842
Alignment:
Q  678 cctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctccta 777  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||        |||||    
T  26633088 cctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtagacttcttttcaaattactagatgcatttattattactt--tccta 26632991  T
Q  778 aacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacaca 876  Q
    ||||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||||  || ||||||||||| |    
T  26632990 aacatacccctaattaatcctactaatttgtcttgaaatacaaaaagtcaaatttaatgcacatacaaacaaaagataatttagta-atattaacacata 26632892  T
Q  877 aaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  26632891 aaatagacacattaactacactaacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaa 26632842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 25750613 - 25750364
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctctttt-caaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||     |||| ||||||           
T  25750613 tactcactccgtctctatatctaagcaccgatttgactttatttttgtctctaaatataaa-ctctttttcaaaata-----tgcatttattactttttt 25750520  T
Q  772 -ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
     || |||||||| | ||||||||||| || || | ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  25750519 tcttctaaacatacccctaattaatattactaccttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-atatta 25750421  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||    
T  25750420 acacacaaaacagacacattaattacactgacaactttttttaagaaatgtgaaaaa 25750364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 33181540 - 33181291
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||   |||||||||| |   |||||||||| |||||||| ||||||       |    
T  33181540 tactctctccgtctctatatctaagtcctcatttgactttatttttgtccataaatgtaaaccc--tttcaaattattagatgcatttattaattttttc 33181443  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  33181442 t--taaacatactcctaattaatattactaacttgtcttaaagtatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaat 33181346  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | |||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  33181345 atacaaaacaaacacattaactacactgacaacattttttaagaaatatgaaaaa 33181291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 703 - 926
Target Start/End: Original strand, 48610026 - 48610245
Alignment:
Q  703 atttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaata 802  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||        | ||||||||   |||||||||||| | ||    
T  48610026 atttgattttatttttgtctttaaatgtaaatc-cttttcaaattactagatgcatttattattttt---ttctaaacatatccctaattaataccacta 48610121  T
Q  803 acatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaac 901  Q
     | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  48610122 tcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttcgta-atattaatacacaaaacagacacattaattacagtgac 48610220  T
Q  902 aacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||| | |||| |||||||    
T  48610221 aacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 48610245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Original strand, 37491477 - 37491728
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||| ||||||  |||| || ||||||           
T  37491477 ttactccctccgtccatatatctaagcatctatttgactttatttttatccttaaatgtaaa-ctctttttaaattaacagatacatttattatgtttt- 37491574  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | ||||||||||| ||  ||  || |||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  37491575 -tcctaaacatacccctaattaatattacaaatttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaacaaaggataatttggta-atattaa 37491672  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37491673 catataaaatagacacattaattgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 37491728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 683 - 926
Target Start/End: Original strand, 21809516 - 21809756
Alignment:
Q  683 gtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacat 782  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| || |||| | ||||| || | ||||||||||||||| |||||        ||  |||||||    
T  21809516 gtccctatatctaagcatagatttaattttatttttgtctccaaatattaatcttttct-aaattactagatgcatttattttatttttct--taaacat 21809612  T
Q  783 gctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaaca 881  Q
     | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  21809613 acccctaattaatactactaacttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaacacaaaaaaca 21809711  T
Q  882 gatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||    
T  21809712 gacacattaattacatcgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 21809756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 685 - 926
Target Start/End: Original strand, 21800927 - 21801165
Alignment:
Q  685 ccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgc 784  Q
    ||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||       ||  ||||||| |    
T  21800927 ccctatatccaagcacacatttcattttatttttgtctctaaatataaatcttttct-aaattactagatgcatttaatattattttct--taaacatac 21801023  T
Q  785 tcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacaga 883  Q
    ||||||||||||||| |||  | | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21801024 tcctaattaatactattaatttattttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaatgacaatttagta-atattaacacacaaaacaga 21801122  T
Q  884 tacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     ||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||    
T  21801123 cacattaattacatcgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 21801165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 773 - 927
Target Start/End: Original strand, 27162859 - 27163012
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  27162859 tcctaaacatacttctaattaatactattaacttgtcttgaaatatgaaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggca-atattaa 27162957  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
     |||||||  | | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  27162958 aacacaaa--atacacattaattgcactaacaactttacttaagaaatgtgaaaaag 27163012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 672 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 36116567 - 36116316
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttg--actttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnn 769  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||   | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||          
T  36116567 ttactccctccgtctctatatttaagcacccattttttattttatttttgtctctaattgtaaatctctttttaaattactagatgcgtttattttt--- 36116471  T
Q  770 nnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatt 868  Q
       | || || || |  |||||||||| || || | ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  36116470 ---ttcttaagatacctctaattaatattattatcttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgta-atatt 36116375  T
Q  869 aacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  36116374 aacacataaaacagacacattaattacaccgacaacatttcttaagaaatgtgaaaaag 36116316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 673 - 904
Target Start/End: Original strand, 43465004 - 43465230
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctct-tttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| ||||||           
T  43465004 tactccctctgtccctatatctaagctcccatttgactttatttttgtctttaaatgtaca-ctctctttcaaattactaaatgcatttattattttttt 43465102  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    | | ||||||| | | ||||||||     | || | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||    
T  43465103 cccttaaacatacccataattaat-----tgacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttga-aaatactaa 43465196  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaac 904  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43465197 cacacaaaacagacacattaattacactgacaac 43465230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 679 - 926
Target Start/End: Original strand, 46783706 - 46783950
Alignment:
Q  679 ctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaa 778  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||  ||||| |||||||  |||||||||||   | |||||| ||||||||| || ||||||        | ||||    
T  46783706 ctccgtccatatatctaaacacccattgaactttgtttttgtccctaaatgtaaactccatttcaacttactagatacatttattatgtttt--ttctaa 46783803  T
Q  779 acatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaa 877  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| ||    
T  46783804 acatgctc-taattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacgaacaaaagacaatttggta-atattaacacataa 46783901  T
Q  878 aacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     | ||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  46783902 gatagacacattaatttcactaataacttttcttaagaaatgtgaaaaa 46783950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 787 - 926
Target Start/End: Original strand, 26200938 - 26201077
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  26200938 ctaattaatactactaacttgttttaaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaagaataatttgata-atattaatacacaaaatagaca 26201036  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26201037 caataattgcactaataacttttcttaagaaatatgaaaaa 26201077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 786 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 40263847 - 40263706
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||     
T  40263847 cctaattaatactactatcttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-atattaacaatcaaaacagac 40263749  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  40263748 acattaattacaccgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 40263706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 787 - 911
Target Start/End: Original strand, 5334365 - 5334489
Alignment:
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagata 885  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||| | |    
T  5334365 ctaattaataccactaatttgtcttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgatagtttggta-atattaacatacaaaacaaaca 5334463  T
Q  886 cattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  5334464 cattaattacactaacaatttttctt 5334489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 676 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 49100919 - 49100687
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnct- 773  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||| | | |||| ||||||||| ||||| |||||         |     
T  49100919 tcccttcgtccatatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaattgtaaaccccctttttaaattactatatgcatttatttttattttttt 49100820  T
Q  774 cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||   | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  49100819 cctaaacatacccctaattaatattattattttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaaca 49100721  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaactt 906  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49100720 cataaaacagacacattaattacactgacaactt 49100687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 784 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 27213625 - 27213483
Alignment:
Q  784 ctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| ||    
T  27213625 ctcctaataaatactattaacttgtcttgaaatatgaaatgtcaattttaatagacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaacacacaaaatag 27213527  T
Q  883 atacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | | |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27213526 acatattagttgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 27213483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 28663904 - 28663752
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttga-aagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||  | ||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  28663904 tcctaaacatacccctaattaatactactaatttatcttgaaatatgagaagtcaaatttaatatacatacaaacaaataataatttgata-atattaac 28663806  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  28663805 acacaaaatagacacattaattgtattaacaac-tttcttaagaaatgtgaaaaa 28663752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 773 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 40741101 - 40740945
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacata--caaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||| |||||| |||||| || ||||||    
T  40741101 tcctaaacatacccctaattaatactgctaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatatacaaagaaatgataatttggta-atatta 40741003  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40741002 acacacaaaatagacatattaattacattaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 40740945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 834 - 927
Target Start/End: Original strand, 40211295 - 40211387
Alignment:
Q  834 tacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  40211295 tacacatacaaataaatgacaatttcgta-atattaacacacaaaacagacacattaattacacaaacaatttttcttaaaaaatatgaaaaag 40211387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 680 - 908
Target Start/End: Original strand, 42983479 - 42983705
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaa 778  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||  |||||  | ||||||        ||||||    
T  42983479 tccgtccatatatctaagcatcaatttgattttatttttgtctttaaatataaa-ctcattttcaaattgttagatctatttattattattt--tcctaa 42983575  T
Q  779 acatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaa 877  Q
    |||| |   |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| | ||    
T  42983576 acataccattaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacataagacaatttaata-atattaacatataa 42983674  T
Q  878 aacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    || ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  42983675 aagagacacattaattacaccatcaactttt 42983705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 678 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 8318773 - 8318689
Alignment:
Q  678 cctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttat 762  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8318773 cctccgtccttaaatctaagcatccatttgacgttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttat 8318689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 808 - 926
Target Start/End: Original strand, 31373689 - 31373807
Alignment:
Q  808 tcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactt 906  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  31373689 tcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaacacacaaaatagacacattaattgccctaacaattt 31373787  T
Q  907 ttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  31373788 ttcttaagaaatgtgaaaaa 31373807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 21759967 - 21759783
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctct-tttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||           
T  21759967 tactccctccgtccctatatgtaagaatccatttgattttatgtttgtccctaaatgtaaa-ctctatttcaaattactagatgcatttattacttttt- 21759870  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaattt 858  Q
     |||||||||| | | |||||||| ||| |||  |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  21759869 -tcctaaacatacccgtaattaatcctactaatttgtcttgaaatacgaaaagttaaatttaatacccattcaaacaaaagactattt 21759783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 786 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 48193751 - 48193611
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||||| |||     
T  48193751 cctaattaatacaactaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatactaatataaacaaaggataatttggta-atattaacacacaaaatagac 48193653  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  48193652 acattaattacactaacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaa 48193611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 777 - 908
Target Start/End: Original strand, 21392853 - 21392984
Alignment:
Q  777 aaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacac 875  Q
    |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||| |    
T  21392853 aaacatactcctaattaaatctactaacatgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaatataatttggta-atattaacactc 21392951  T
Q  876 aaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  21392952 aaaatagacacattaattgcactaacaaatttt 21392984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 672 - 755
Target Start/End: Original strand, 5333756 - 5333839
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatg 755  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5333756 ttactccctcggtccctatatgtaaacatacatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacccctttttaaattactagatg 5333839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 820 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 23876138 - 23876033
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||  || | ||||| |||||||||||||||| || ||||||     
T  23876138 aaagttaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttagta-atattaacacataaaatggacatattaactacactaacaactttttttaagaaatg 23876040  T
Q  920 tgaaaaa 926  Q
    |||||||    
T  23876039 tgaaaaa 23876033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 688 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 34118242 - 34118166
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34118242 tatatgtaagcacctatttgactttatttttgtctctaaatgtaaacttttttttaaattactagatgcagttatta 34118166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 688 - 879
Target Start/End: Original strand, 47458060 - 47458248
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||       |  |||||||| | ||    
T  47458060 tatatctaatcatctatttaattttatttttgtccctaaatgtaaattcctttttaaattactaaatgcatttattattttttcc--ctaaacatac-cc 47458156  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaa 879  Q
    |||||| ||| | || | ||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47458157 taattagtaccactatcttgtcttgaaatataaaatattaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcata-atattaacacacaaaa 47458248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 792 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 21752657 - 21752532
Alignment:
Q  792 taatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacatta 890  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| | | | ||||    
T  21752657 taatactattaac-tgttttgaaatgtgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttggta-atattaacccacaaaataaacaaatta 21752560  T
Q  891 attacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21752559 attgcactaacaactttttttaagaaat 21752532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 820 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 29993076 - 29992979
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29993076 aaagttaaatttaacaaacacacaaacaaatgataatttggtag-tattaacatacaaaatagacacattaattgcactaacaacttttcttaagaaat 29992979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 832 - 926
Target Start/End: Original strand, 10595115 - 10595206
Alignment:
Q  832 aatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||   |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  10595115 aatacacatacaaacaaaagacagtttcgta---attaacacacaaaacagacatattaattatactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 10595206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 678 - 754
Target Start/End: Original strand, 43601031 - 43601107
Alignment:
Q  678 cctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagat 754  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43601031 cctcggtccctatatttaagcactcatttgactttatttttgtccataaatgtaaaccacttttcaaattactagat 43601107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 823 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 4068497 - 4068395
Alignment:
Q  823 gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatga 922  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |  | ||||||||    
T  4068497 gttaaatctaatacacatacaaacaaagaataatttgata-atattaacatacaaaatagatatattaattgcattaacaacttttttaaaaaaatatga 4068399  T
Q  923 aaaa 926  Q
    ||||    
T  4068398 aaaa 4068395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 776 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 27170157 - 27170008
Alignment:
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  27170157 taaacatactcataattaatactattaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatagacatatgaacaaatcacaatttggta-atatt-acaca 27170060  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||||  || |||| |||||| |||||||    
T  27170059 caaaatagacaaattaattgcactaacatgttgtcttaagaaatgtgaaaaa 27170008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 773 - 862
Target Start/End: Original strand, 13907699 - 13907789
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgata 862  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13907699 tcctaaacacacccctaattaatactactaacttgtctttaaatatgaaaagtcaaatttattaaacatacaaacaaatgacaatttgata 13907789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 910
Target Start/End: Original strand, 44648704 - 44648810
Alignment:
Q  806 tgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatata-tattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaa 903  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  44648704 tgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaactaaagacaatttgatccaatattaacatacaaaatagacacattgattacattaacaa 44648803  T
Q  904 cttttct 910  Q
    |||||||    
T  44648804 cttttct 44648810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 683 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 29723697 - 29723616
Alignment:
Q  683 gtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29723697 gtccctatatctaaacattcatttaattttatttttgtctttaaatataaatccatttttaaattactagatgcatttatta 29723616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 20124419 - 20124362
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgt 730  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  20124419 tactccctccgtccctatatttaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgt 20124362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 749
Target Start/End: Original strand, 25098243 - 25098320
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattac 749  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||  |||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25098243 ttactccctccgtccctatatgtaaccacccttttgtttttatttttgtccttaaatgtaaatcctttttcaaattac 25098320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 773 - 849
Target Start/End: Original strand, 28038844 - 28038921
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaa 849  Q
    ||||||||||  || |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28038844 tcctaaacatattcataattaatactgctaacttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacaaatacaaacaaa 28038921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 863 - 911
Target Start/End: Original strand, 41672613 - 41672661
Alignment:
Q  863 tatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41672613 tatattcacacacaaaatagacacattaattacactaacaagttttctt 41672661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 826 - 918
Target Start/End: Original strand, 42993198 - 42993289
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  42993198 aaatttaatacacatactaacaaaggttaatttgata-atattaacacataaaatagacacgttaattgtattaacaacttttcttaagaaat 42993289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 672 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 20123693 - 20123609
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    |||||||||||||||||  || ||  || |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  20123693 ttactccctccgtcccttaatgtagccacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaa-cccctttcaaattacaagatgca 20123609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 26517075 - 26517326
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctctttt-caaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||           
T  26517075 tactccctccgtccatatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaa-ctcttttacaaattactagatgcatttattattttttg 26517173  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |  |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||    
T  26517174 c--ctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaggacaatttggta-atattaa 26517270  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  26517271 cacagaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 26517326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 20945160 - 20945411
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||            
T  20945160 tactcccttcgtccctatatctaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttgttattattt-- 20945257  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||    
T  20945258 tcctaaacataaccctaattaatactactaacttgtcttaaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataattaggta-atattaac 20945356  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20945357 acataaaatagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 20945411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 679 - 926
Target Start/End: Original strand, 14645755 - 14646000
Alignment:
Q  679 ctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaa 778  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||        | ||||    
T  14645755 ctccgtccttatatctaagcacccatttgactttatttttgttcttaaatgtaaacccctttttaaattactatatgcatttattatttttt--ttctaa 14645852  T
Q  779 acatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaa 877  Q
    |||| | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14645853 acatacccctagttaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaataacaatttggta-atattaacacacaa 14645951  T
Q  878 aacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  14645952 aatagacacattaattacactaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 14646000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 673 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 44083873 - 44083637
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||            
T  44083873 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacccattttcaaattactagatccatttattattttttc- 44083775  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
     ||||||||| | |||||||||||  | |||| | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  44083774 -cctaaacatacccctaattaatatcactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttggta-atattaac 44083677  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44083676 acacaaaatagatacattaattacaataacaatttttctt 44083637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 673 - 934
Target Start/End: Original strand, 12077601 - 12077863
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  12077601 tactccttccgtccctatatctaatcactcatttgattttatttttgtccttaaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattaattttttt 12077700  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  || | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  12077701 tcctaaacatacccctaattaatacttctatcttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-atattaac 12077799  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa-gcaatggg 934  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  12077800 acacaaaagagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatttgaaaaatgcaatggg 12077863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 42891664 - 42891414
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||            
T  42891664 tactccctccgtccctatacgtaaacacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaacccctcttcaaattactagatgcatttattattttt--- 42891568  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  42891567 tcctaaacatacccctaattaataccactaacttgtctttaaatttgaaaagtcaaatttaatatacatacaaacaaaggacagtttggta-atattaac 42891469  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42891468 acacaaaacagacaaattaattatactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 42891414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 675 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 28477628 - 28477395
Alignment:
Q  675 ctccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctc 774  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||        ||    
T  28477628 ctccctccgtccctatatctaagcctccatttgactttatttttgcccctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattattttt---tc 28477532  T
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacac 873  Q
      ||| || | |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  28477531 taaaatatacccctaattaatactactaatttgtcttgaaatatgaatagtcaaatttaatgcacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaacac 28477433  T
Q  874 acaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  28477432 acaaaacagacacattaattgcaccgacaacttttctt 28477395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 680 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 40645911 - 40645668
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |  |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||        |||||||    
T  40645911 tccgtccctatatctaagccttcgtttgactttatttttatccctaaatataaacctcctttcaaattattagatgcatttattatttt----tcctaaa 40645816  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaa-ttaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    || || |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  40645815 catacccctaattaatactaataacttgtcttgaaatatgaaaaaccaagtttaatacacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaacacacaaa 40645717  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  40645716 acagacacattaattacacagacaacatttcttaagaaatgtgaaaaag 40645668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 676 - 926
Target Start/End: Original strand, 13084223 - 13084469
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcc 775  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |   |||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||        |||    
T  13084223 tccctccgtccctatatctaaacatccaattgattttatttttatccttaaacgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattatttt----tcc 13084318  T
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    |||||||   |||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||    
T  13084319 taaacatatccctaattaatgctactaacttgtgttaaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggta-atattaacaca 13084417  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13084418 caaaacagacacattaattatactgacaacttttcttaagaaatatgaaaaa 13084469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 673 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 22659826 - 22659583
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||            
T  22659826 tactctctccgtccttatatctaaatactcatttgactttatttttgtctccaaatgtaaatctctttttaaattactagatgcatttattattattt-- 22659729  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    || |||||||   | |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  22659728 tcataaacatatccttaattaatactactaatttgttttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaagataatttggta-atattaac 22659630  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22659629 acacaaaataaatacattaattatactaacaacttttcttaagaaat 22659583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 29676601 - 29676851
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||            
T  29676601 tactccctccgtccctatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacctcatttcaaattacta-atgcatttattatttttc-- 29676697  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
     ||||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||    
T  29676698 -cctaaacatacccctaattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaatgccaaatttaatacacatacaaataaaagacaatttcgta-atattaac 29676795  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29676796 acataaaatagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatatgaaaaag 29676851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 46048770 - 46048517
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||           
T  46048770 ttactccattcgtccctatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattaatagatgcatttattatttttt- 46048672  T
Q  772 ctcctaaacatgctcc-taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
     | |||||||| | || ||||||| |||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||    
T  46048671 -ttctaaacataccccctaattaacactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atatta 46048574  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  46048573 atacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 46048517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 688 - 927
Target Start/End: Original strand, 41308652 - 41308888
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||| | ||    
T  41308652 tatatctaagcccccatttgactttatttttgtctctaaat-taaatcccctttcaaattactagatgcatttattatttttt--tcctaaacatacccc 41308748  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||| |||||||  | || ||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  41308749 taattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagccaaatttaatacacatataaacaaagaataaattggta-atattaacacacaaaacagacac 41308847  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  41308848 attaattacactgacaacattttttaagaaatgtgaaaaag 41308888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 31819652 - 31819401
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||||||||| ||||||            
T  31819652 tactccctctatccctatatctaagcacctatttgattttatttttgtccctaaatataacccaattttcaaattactagatgcatttattatttttt-- 31819555  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  31819554 tcctaaacatacccctaattaatactactatattgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaac 31819456  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||    
T  31819455 acataaaacagacacattaattacaccgataacttttcttaagaaatgtgaaaaa 31819401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 774 - 927
Target Start/End: Original strand, 27638036 - 27638189
Alignment:
Q  774 cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  27638036 cctaaacatacccctaattaataccactatcttgtcttgaaatatgaaatgtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaattttata-atattaaca 27638134  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  27638135 cacaaaatagagacattaattacactaataacttttcttaagaaatgtgaaaaag 27638189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 672 - 835
Target Start/End: Original strand, 31530987 - 31531149
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||           
T  31530987 ttactccctccgtccctatatctaagcacccatttgacttta-ttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattattatttt 31531085  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaata 835  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31531086 -tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatttgaaaagttaaatttaata 31531149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 688 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 26043247 - 26043022
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||        |||||||||| | ||    
T  26043247 tatatctaagcacccatttgactttatttt-gtccctaaatgtaaactccttttcaaattactagacgcatttattatttttt--tcctaaacatac-cc 26043152  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||  | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |     
T  26043151 taattaatactactaat-tatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-acattaacacacaaaacagacat 26043054  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  26043053 attaattacactgacaatttttcttaagaaat 26043022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 50363175 - 50363022
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  50363175 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaat 50363077  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||    
T  50363076 acataaaacagacatattaattacactgacaatttttcttaaaaaatgtgaaaaa 50363022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 688 - 926
Target Start/End: Original strand, 50524851 - 50525087
Alignment:
Q  688 tatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcc 787  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||        |||||||||| | ||    
T  50524851 tatatctaagcacccatttgactttatttttgtccttaaatctaaaccctttttcaaattacaagatgcatttattatttttt--tcctaaacatacccc 50524948  T
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | | |     
T  50524949 taattaaaactactaacttgtcttgaaatttcaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaacacacaaaatatacat 50525047  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||| |  | | |||||||| |||||| |||||||    
T  50525048 attaattaccccgagagcttttcttaagaaatgtgaaaaa 50525087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 683 - 927
Target Start/End: Original strand, 41727108 - 41727350
Alignment:
Q  683 gtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacat 782  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||| |||| |||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||       ||  |||||||    
T  41727108 gtccctatatgtaaacactcatttgattttacttttgttcttaaatgtaaacccctttttaaattactaaatgcatttattatttttttct--taaacat 41727205  T
Q  783 gctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaaca 881  Q
     | |||||||||||  | || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  41727206 acccctaattaatatcactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaggacaattttgta-atattaacacacaaaaca 41727304  T
Q  882 gatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  41727305 gacacattaattacactgacaactttttttaagaaatgtgaaaaag 41727350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 694 - 926
Target Start/End: Original strand, 831239 - 831471
Alignment:
Q  694 taagcatccatttgactttatttttgtttc--taaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaat 791  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| ||||||        |||||||||| ||||||||    
T  831239 taagcatctatttgactttatttttttgtccttaaatgtaaactcctttttaaactactagatgcatttattattattt--tcctaaacatactcctaat 831336  T
Q  792 taatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacatta 890  Q
    ||||||||||||| | | ||||||| |||||  | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||   ||||||    
T  831337 taatactaataacttatattgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatataaacaaaggacaatttggta-atattaacacgcaatacatgcacatta 831435  T
Q  891 attacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  831436 attacattgacaacttttcttaagaaatatgaaaaa 831471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 773 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 30476189 - 30476035
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  30476189 tcctaaacatacccctaattaatactactatcttctcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatagacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaac 30476091  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  30476090 acacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 30476035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 725 - 926
Target Start/End: Original strand, 46435643 - 46435841
Alignment:
Q  725 aaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtctt-gaaatttgaaa- 822  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||        || ||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||     
T  46435643 aaatgtaaaccttttttcaaattacaagatgcatttatt--ttttttcttctaaatatgcccttaattaatactactaacttgtctttgaaatttgaaaa 46435740  T
Q  823 gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatga 922  Q
    || ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  46435741 gtcaaatttaataca--tacaaacaaaggacaatttggta-atattaacacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtga 46435837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 820 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 29645458 - 29645353
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||     
T  29645458 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcgta-atattaacacataaaacagatacattaattacactaacaacatttcttaataaatg 29645360  T
Q  920 tgaaaaa 926  Q
    |||||||    
T  29645359 tgaaaaa 29645353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 33288014 - 33287861
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  33288014 tcctaaacatacatctaattaatactactaacttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacaaacaaacaaaggacaatttaata-atattaac 33287916  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  33287915 acacaaaatagacaaattaattacactacaaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 33287861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 678 - 910
Target Start/End: Original strand, 39617117 - 39617345
Alignment:
Q  678 cctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctccta 777  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||| || |||| |||| | |||||||| ||||||       ||  ||    
T  39617117 cctccgtctttatatctaagcattcatttcattttatttttgtcactaaatgtaaacctttttttaaatgattagatgcatttattatttttttct--ta 39617214  T
Q  778 aacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacaca 876  Q
    || ||   |||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||    
T  39617215 aatatatccctaattaatactact--cttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaacataca 39617311  T
Q  877 aaacagatacattaattacactaacaacttttct 910  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39617312 aaacagacacattaattacactgacaacttttct 39617345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 724 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 11388318 - 11388116
Alignment:
Q  724 taaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaata--ctaataacatgtcttgaaatttgaa 821  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||| | |||||||||||  ||| |||| | ||||||||| ||||    
T  11388318 taaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttattatttttt--ttctaaacatacccctaattaatatactactaacttatcttgaaatatgaa 11388221  T
Q  822 a-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatat 920  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  11388220 aagtcaaatttaatacacatacaaacaaaatacaatttggta-atattaacacgcaaaatagacacattaattacactaacaatttttcttaagaaatgt 11388122  T
Q  921 gaaaaa 926  Q
    ||||||    
T  11388121 gaaaaa 11388116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 683 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 31474659 - 31474434
Alignment:
Q  683 gtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaaca 781  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||| |||||| | ||||||        |||||||||    
T  31474659 gtccctatatttaaacatctatttgactttatttttgtctctaaatataaa-ctcatttttaaattattagatgtatttattattttt---tcctaaaca 31474564  T
Q  782 tgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagt-taaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaac 880  Q
    | | |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  31474563 tacccctaattaatactactaatttgtcttaaaatttgaaaaactaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttaata-atattaacgcacaaaac 31474465  T
Q  881 agatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||| |||||| ||| || || || |||||||    
T  31474464 agacacattagttataccaaaaaattttctt 31474434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 808 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 26121445 - 26121335
Alignment:
Q  808 tcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactt 906  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  26121445 tcttgaaatatgaaaagtcaagtttaatacacatacaaacaaaggacaatttgata-atattaacacacaaaacaaacacattaattacactgacaactt 26121347  T
Q  907 ttctttagaaat 918  Q
    ||||| ||||||    
T  26121346 ttcttaagaaat 26121335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 837 - 926
Target Start/End: Original strand, 31531448 - 31531536
Alignment:
Q  837 acatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  31531448 acatacaaacaaaagacaatttgata-atatcaacacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 31531536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 693 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 11140922 - 11140715
Alignment:
Q  693 ctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaatt 792  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||| |||||||    
T  11140922 ctaagcacctatttgattttatttttatccctgaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattattttt---tcctaaacatgcccctaatt 11140826  T
Q  793 aatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaa 891  Q
    ||||||| |||    ||||||||| || ||||||||||||    |||||||||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||     
T  11140825 aatactactaa----tcttgaaatatggaaagttaaatta----cacatacaaacaaaggataatttggta-atactaacacacaaaacatacacattat 11140735  T
Q  892 ttacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  11140734 ttacactgataacttttctt 11140715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 672 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 29645571 - 29645479
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29645571 ttactccctccgtccttatatctaagcatttatttgattttatttttgtccctaaatgtaaaccacttttcaaattactagatgcatttatta 29645479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 672 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 35145478 - 35145387
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35145478 ttactccctccgtccctatatataagcaaccatttgattttatttttgtccctaaatataaa-ctcttttcaaattactagatgcatttatta 35145387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 784 - 930
Target Start/End: Original strand, 27047147 - 27047293
Alignment:
Q  784 ctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacag 882  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| |||| | ||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  27047147 ctcctaattaatactattaaattgtcttaaaatataaaaagtcaaatttaatgcacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaacacacaaaatag 27047245  T
Q  883 atacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaa 930  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||    
T  27047246 acacattaattgcactaacagcttttcttaaggaatgtgaaaatgcaa 27047293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 724 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 35055980 - 35055816
Alignment:
Q  724 taaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa- 822  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||        |||||||||| | | |||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||     
T  35055980 taaatataaatctcttttcaaattattagatgcatttattatttta---tcctaaacatacccataattaatactactaacttgtattgaaatataaaaa 35055884  T
Q  823 gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaa 891  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  35055883 gtcaaatttaatacacatacaagcaaatgacaatttggta-atattaacacacaaaatagacacattaa 35055816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 51263215 - 51263077
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||| |||||||| ||    
T  51263215 taattaatactactaacttatctttaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atactaacacataaaacagacac 51263117  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  51263116 attaattacactaacaattttttttaagaaatgtgaaaaa 51263077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 801 - 910
Target Start/End: Complemental strand, 29611954 - 29611845
Alignment:
Q  801 taacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacacta 899  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29611954 taacttgtcttgaaatatgaaatgtcaaatttgatacacatacaaacaaaagataatttgata-atattaacacacaaaatagacacattaattacacta 29611856  T
Q  900 acaacttttct 910  Q
    ||||| |||||    
T  29611855 acaacatttct 29611845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 29349624 - 29349395
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||           
T  29349624 tactccctccgttcctatatctaaacactcatttgactttatttttgttcctaaatgtaaa-ctcattttcaaattactagatgcattaattattttttt 29349526  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacaca-tacaaacaaatgacaatttgata--tatat 867  Q
    ||  ||||||| |  ||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||| |||||  ||||| | ||||| ||||| |||||||| ||   ||||    
T  29349525 ct--taaacatacctctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatacatagtacaatcaaataacaatttggtagtaatat 29349428  T
Q  868 taacacacaaaacagatacattaattacactaa 900  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| |||||    
T  29349427 taacgcacaaaacagacacgttaattatactaa 29349395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 786 - 930
Target Start/End: Original strand, 41825108 - 41825252
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagat 884  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| |||| |||     
T  41825108 cctagttaatactactaacttgtcttaaaatatgaaatgtcaaatttgatacacatacaaacaaaagataatttggta-atattaacacataaaatagac 41825206  T
Q  885 acattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaagcaa 930  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  41825207 acattaattacactgacaacttttcttaagaagtgtgaaaatgcaa 41825252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 44338326 - 44338078
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||  |  |||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||              
T  44338326 tactccctccgtcccaatatgtaaacacccatttgactaaaaatttgtacctaaatgtaaaccccttttcaaattcctagatgcatttat---attattt 44338230  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || |||| | ||||||||| | ||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  44338229 tcctaaacatacccctaattaatagtactaacttatcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatagaaacaaaggacaatttggta-atattaac 44338131  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||| |||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  44338130 acaaaaattagaca-attaactacactaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaa 44338078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 43186961 - 43187205
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||   ||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||            
T  43186961 tacttcctccgtccctatatgtaaacatccatttgattttacttttgtccttaaatataaaccccttttcaatttactagatgcatttattatttttt-- 43187058  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
    |||||||||| | |  ||||||||  | || | ||||||||||| |||||  | ||       |||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |    
T  43187059 tcctaaacataccctgaattaatatcactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaa-------cacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaata 43187150  T
Q  873 cacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  43187151 cacaaaacagacacattaattacattgacaactttttttaagaaatatgaaaaag 43187205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11345566 - 11345484
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  11345566 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgcccctaaatttaaaccccttttcaaattactagatg 11345484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Original strand, 41543565 - 41543718
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| || | |||||||||||| | || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| |    
T  41543565 tcctaaatatacgcctaattaatacaactatcttgtcttgaaatatgaaatgtcaaatttaatacacatacaaataaaagacaattttata-atattatc 41543663  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| || |||||| |||||||    
T  41543664 acacaaaatagacacattaaatacacagacaactttttttaagaaatgtgaaaaa 41543718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 42011016 - 42010863
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||  |||  | ||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  42011016 tcctaaacatacccataattaatactgctaatttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacatacatacaaacaaagaataatttgata-atattaac 42010918  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  42010917 acacaaaatagacacattaattacattaacaaattttcttaagaaatgtgaaaaa 42010863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 821 - 926
Target Start/End: Original strand, 37729036 - 37729140
Alignment:
Q  821 aagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatat 920  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |    
T  37729036 aagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagataatatgata-atattaacacacaaaatagacacattaattatattaacaatttttcttaagaaatgt 37729134  T
Q  921 gaaaaa 926  Q
    ||||||    
T  37729135 gaaaaa 37729140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 773 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 48309592 - 48309449
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||| || |||||  || ||||||||    
T  48309592 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaaggataattttgta-atattaac 48309494  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaa 917  Q
    | |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48309493 atacaaaatagacaca-taattgcactaacaacttttcttaagaaa 48309449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 672 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 28228427 - 28228144
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatc--tcttttcaaattactagatgcagttattannnnn 769  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||  | ||||||  |||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||         
T  28228427 ttactccctccgtccatatatataagcactcatt-gactaaaattttgtccctaaatataaaccattcttttcaaattagtagatgcatttattataatt 28228329  T
Q  770 nnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatt 868  Q
       | ||||| || ||| |||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  28228328 t--ttctaaatatactcataattaatactactaatttgtcttgaaaaatgaaaagtcacatttaatacacatacaaacaaatgacgttttgata-atatg 28228232  T
Q  869 aacacacaaa-acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatat-gaaaaagcaatgg-ggcttagatatagagacggag 954  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| || |||||| |||||| |||||||    
T  28228231 aacacacaaacaca-acacattaattgcactaacaactttttttaagaaatatcaaaaaagcaaaggaggcttatatatagggacggag 28228144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 828 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 11394014 - 11393917
Alignment:
Q  828 attaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  11394014 attagatatacatataaataaatgacaatttgatag-tattaacacacaaaatagacacattaattacactaacaactttttttaaaaaatgtgaaaaa 11393917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 832 - 926
Target Start/End: Original strand, 52325521 - 52325614
Alignment:
Q  832 aatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  52325521 aataaacatataaacaaaggacaatttgata-atattaacacataaaatagacacattaattacactaacattttttcttaagaaatgtgaaaaa 52325614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 808 - 904
Target Start/End: Complemental strand, 26243585 - 26243489
Alignment:
Q  808 tcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaac 904  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||    
T  26243585 tcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttaata-acattaacacacaaaacaaacatattaattacactgacaac 26243489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 826 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 26998989 - 26998889
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  26998989 aaatttaatacacgtacaaacaaaagacaatttcgta-atattaacaaacaaaatagatacattaattataatgacaacttttcttaagaaatgtgaaaa 26998891  T
Q  926 ag 927  Q
    ||    
T  26998890 ag 26998889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 21933172 - 21932955
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |   ||||  || ||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||            
T  21933172 tactacctctgtccctatatataaccatccatttgactaaaaaattgtccctgaatataaacccattttcaaattactagatgcatttattatttttt-- 21933075  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | ||||||||||||   |||| | ||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  21933074 tcctaaacatacccctaattaatacggttaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttggta-atattaac 21932976  T
Q  872 acacaaaacagatacattaat 892  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  21932975 acacaaaatagacacattaat 21932955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 682 - 911
Target Start/End: Original strand, 33411845 - 33412069
Alignment:
Q  682 cgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaaca 781  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||   ||||||||||| ||||| || ||||||         |||||| |    
T  33411845 cgtccctatatctaagtatccatttgattttatttttattcttaaatgtaaattcattttcaaattattagatacatttattatttttc---cctaaata 33411941  T
Q  782 tgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaac 880  Q
    |   | |||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||||  ||||| |||  ||||||||| |||  |||||||| || ||||||||||||||||     
T  33411942 tatccttaattaatactactaacttgcattgaaatatgaaaagacaaatttaat--acatacaaagaaaaaacaatttggta-atattaacacacaaaat 33412038  T
Q  881 agatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33412039 agacacattaattgcactaacaatttttctt 33412069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Original strand, 53716828 - 53716919
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  53716828 tactccatccgttcatatatctaagcctccatttaactttatttttgtccttaaatgtaaatcccctttcaatttactagatgcatttatta 53716919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Original strand, 54425929 - 54426067
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| ||||  | ||| |||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  54425929 taattaatactactaaccagacttaaaatatgaaaaattaaatttaatacacatataaacaaatgacaatttggta-atattaacacacaaaacagacac 54426027  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    || || |||| | | |  ||||||| |||||| |||||||    
T  54426028 atcaactacattgatattttttcttaagaaatgtgaaaaa 54426067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 677 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 3475692 - 3475606
Alignment:
Q  677 ccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatt 763  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  3475692 ccctccgtttctatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatataaacctctttttaacttactagatgcatttatt 3475606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 820 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 25750627 - 25750530
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  25750627 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaagttggta-atattaacacacaaaatagacaaattaattacattaacaacctttcttaagaaat 25750530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Original strand, 41739931 - 41740084
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  41739931 tcctaaacatacccttaattaatactgctaacttatcttgaaatatgaaaattcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttggta-atattaac 41740029  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | ||| || ||||||| | |||| |||||||    
T  41740030 acacaaaatagacacattaattgtattaataatttttcttaaaaaatgtgaaaaa 41740084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 788 - 911
Target Start/End: Original strand, 48903056 - 48903179
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||  | ||||||||| || ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |     
T  48903056 taattaatactactaatttttcttgaaatattaaaagtcaaatttaatatatatacaaacaaatgacaatttagta-atattaacacacaaaatagacaa 48903154  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||    
T  48903155 attaattgcactaactatttttctt 48903179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 26999289 - 26999198
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  26999289 tactccatccgtctctatatctaaacatccatttgattttatttttgtcctcaaatgtaaacccctttttaaattattagatgcatttatta 26999198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 820 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 28243859 - 28243785
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattac 895  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  28243859 aaagttaaatttaatacacacataaacaaaggacaatttgat-tatattaacacacaaaataaacacattaattac 28243785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 30476271 - 30476224
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgt 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30476271 tactccctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgt 30476224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 678 - 918
Target Start/End: Original strand, 35765506 - 35765749
Alignment:
Q  678 cctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttatta-nnnnnnnctcc 775  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||         | |    
T  35765506 cctccgtccctatatctaaacacttatttgactttatttttttctctaaatat-aatctcattttcaaattaatagatgtatttattattattttttttc 35765604  T
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacac---atacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| |   |||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   ||| |||| || | ||||||| || |||||||     
T  35765605 taaacatacctataattaatactactaacttgttttgaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatgatataaac-aaggtcaatttggta-atattaat 35765702  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35765703 acacaaaacagacatattaattacactgataacttttcttaagaaat 35765749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 826 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 11344651 - 11344553
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  | |||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  11344651 aaatttaatacacatacaaa-aaagaataatttggta-atgttaacacacaaaatagacacattaattacaccaataacttttcttaagaaatgtgaaaa 11344554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 863 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 23157153 - 23157093
Alignment:
Q  863 tatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaa 923  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  23157153 tatattaactcacaaaacagacacattaattacactgacaatttttcttaagaaatgtgaa 23157093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 847 - 927
Target Start/End: Original strand, 34055895 - 34055974
Alignment:
Q  847 aaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||| || |||||| ||||||||    
T  34055895 aaatgacaatttcata-atattaacacacaaaacagacatattaattacattgacaattttttttaagaaatgtgaaaaag 34055974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 788 - 911
Target Start/End: Original strand, 48901490 - 48901613
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||  | |||| |||| || ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |     
T  48901490 taattaatactattaatttttcttaaaatattaaaagtcaaatttaatatatatacaaacaaatgacaatttagta-atattaacacacaaaatagacaa 48901588  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||    
T  48901589 attaattgcactaactatttttctt 48901613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 773 - 847
Target Start/End: Original strand, 5504533 - 5504608
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaaca 847  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5504533 tcctaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaaca 5504608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Original strand, 54555897 - 54556035
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||  |||||| || | ||||| |||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||| || | ||||||| | |||| ||| |     
T  54555897 taattaatactactaatttgtcttaaagtatgaaaagttaaaattaatatacatataaacaaatgataatttggtaaa-attaacatataaaatagacat 54555995  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  54555996 attaattacactaacagcatttattaagaaatatgaaaaa 54556035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 672 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 25750766 - 25750673
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttat-ttttgtttctaaatgtaaa-tctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  25750766 ttactccctccgtctttatatctaagcacccacttgactttattttttgtccttaaatgtaaactct-ttttcaaattactagatacatttatta 25750673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 732 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 49000640 - 49000446
Alignment:
Q  732 aatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaatt 830  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||        | |||||||  ||| |||||||||||| |||| | |||| |||| | |||  |||||||    
T  49000640 aatcttttttcaaattaatagatgcatttattattatatttttctaaacacactcttaattaatactattaacttatcttaaaatataaaaaattaaatt 49000541  T
Q  831 aaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-tatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
     |||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||   ||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  49000540 taatacacataaaaacagaggacactttgataatatatta---cacaaaatagacacattaattgcatcaacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 49000446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 775 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 28229311 - 28229195
Alignment:
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacac 873  Q
    |||||||| | | |||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||    
T  28229311 ctaaacatacccataattaatactactaacttgtcttaaaatattaaaagtcaaatttaatatacatacaaataaaggacaatttggta-atattaatac 28229213  T
Q  874 acaaaacagatacattaa 891  Q
    | |||| | |||||||||    
T  28229212 ataaaatatatacattaa 28229195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 720
Target Start/End: Original strand, 41543516 - 41543557
Alignment:
Q  679 ctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgt 720  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41543516 ctccgtccctgtatctaagcatccatttgattttatttttgt 41543557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 691 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 50092897 - 50092824
Alignment:
Q  691 atctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  50092897 atctaagcacccatttaattttatttttgtccataaatataaatctattttcaaattaatagatgcatttatta 50092824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 788 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 383739 - 383616
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||     
T  383739 taattaatactactaacttgtattagaatgtgaaaagttaaattaaatacacatataaacaaatgataatttagta-aaattcacacacaaactagatat 383641  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||| | ||||||| ||| |||||||    
T  383640 attgactacactaccaatttttctt 383616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 877 - 925
Target Start/End: Original strand, 5504604 - 5504652
Alignment:
Q  877 aaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaa 925  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||    
T  5504604 aaacagatacattaattacactgacaacatttcttaagaaatgtgaaaa 5504652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 12236553 - 12236506
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgt 720  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12236553 tactctctccatccctatatctaatcacccatttgactttatttttgt 12236506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 831 - 926
Target Start/End: Original strand, 31650682 - 31650776
Alignment:
Q  831 aaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||||||| || |||||| |||| || | |||| |||||||    
T  31650682 aaatatacatacaaataaatgacaatttggta-atattaccacataaaatagacacattaattgcattaacaattttttttaataaatgtgaaaaa 31650776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 675 - 754
Target Start/End: Original strand, 34055727 - 34055806
Alignment:
Q  675 ctccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagat 754  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  34055727 ctccctgcgtctttatatctaagcacctatttgattttatttttttctctaaatgtatacccctttttaaattactagat 34055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Original strand, 44698381 - 44698472
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||||||| |||| || ||||||    
T  44698381 tactccctccgcccttatatctaatcactcatttgactttatttttgtccttagatgtaaacccattttcaaattacaagatacatttatta 44698472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 832 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 50092756 - 50092662
Alignment:
Q  832 aatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||| |||||||||  | ||||||||||||||  |||||||| || |||||| | ||||||    
T  50092756 aatacacatacaaataaaggacaattttgta-atattaatacacaaaaccaacacattaattacactgtcaacttttgttaagaaatgtaaaaaag 50092662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 820 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 2421184 - 2421080
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || | ||| | |||||||  | ||||||||||| || ||||||     
T  2421184 aaagtcaaatttaatatacatacaaacaaatgacaattttgta-atattaacacataagataga-aaattaattgtattaacaactttttttaagaaatg 2421087  T
Q  920 tgaaaaa 926  Q
    |||||||    
T  2421086 tgaaaaa 2421080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 826 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 39931975 - 39931910
Alignment:
Q  826 aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaat 892  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| | | ||||||||    
T  39931975 aaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttaata-accttaacacacaaaatatacacattaat 39931910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 820 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 44647876 - 44647838
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaattt 858  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44647876 aaagtcaaattaaatacacatataaacaaatgacaattt 44647838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 832 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 48213713 - 48213620
Alignment:
Q  832 aatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  | || |||||||||||||||| | | |||||||||  | ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  48213713 aatacacatacaaataaatgataataaggta-atattaacacacaaaataaacacattaattttattaataacttttcttaaaaaatatgaaaaa 48213620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 722 - 763
Target Start/End: Original strand, 6719288 - 6719329
Alignment:
Q  722 tctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatt 763  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6719288 tctaaataaaaatctcttttcaaattactagatgcatttatt 6719329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 81)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 22750700 - 22750951
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||            
T  22750700 tactccctccgtccctatatgtaaccaccaatttgattttatttttgttcctaaatctaaatcctttttcaaattagtagatgcatttattattattt-- 22750797  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  22750798 tcctatacatacccctaattaatactactaagttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaat 22750896  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  22750897 acacaaaacagatacattaattacacagacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 22750951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 678 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 5933128 - 5932897
Alignment:
Q  678 cctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctccta 777  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||        ||  ||    
T  5933128 cctccgtctcaatatctaagcattcatttgactttatttttgtccctaaatataaatttcttttcaaattactagatgcaattattttttttttct--ta 5933031  T
Q  778 aacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacaca 876  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5933030 aacatactcataattaataatactaacttgtcttgaaattaaaaaaattaaatttaatacacataaaaacaaatgacaatttgata-atattaacacaca 5932932  T
Q  877 aaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5932931 aaacaaacacattaattacactgacaacttttctt 5932897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 25477472 - 25477221
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||           
T  25477472 ttacttcctccgtcc-tatatctaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtatacttattttcaaattactagatgcatttattatttttt- 25477375  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  25477374 -tcctaaacatacccctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaattttgta-atattaa 25477277  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  25477276 cacataaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 25477221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 30153081 - 30153331
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatcc-atttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||||           
T  30153081 tactccctccgtccttatatctaagccccctatttgactttatttttgtctctaaatgtaaatccatttttaaattattagatgcatttattattttt-- 30153178  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| || |||||| || ||||||     
T  30153179 -tcctaaacatactc-taattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaggataatttggta-atattat 30153275  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  30153276 cacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 30153331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 38136597 - 38136351
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||   |||||||||||||||||| || || ||             
T  38136597 tactccctccgtctctatatttaagcatccatttgactttatttttatccataaatgtaaactccttttcaaattactagatacatttttttt------- 38136505  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38136504 tcctgaacatacccctaattaatactactaacttgccttgaaatatgaaaaatcaaattaattacacatacaaacaaatgacaatttgata-atattaac 38136406  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  38136405 acacaaaatagacacattaattacactaacaaattttcttaagaaatgtgaaaaa 38136351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 673 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 43801055 - 43800832
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||||            
T  43801055 tactccctccgtccctatatctaagcccccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaaccccctttcaaattactagatacatttattattattt-- 43800958  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  43800957 tcctaaatatacccctaattaatactaccaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaattaaatacacatacaaacaaaggacaatttggta-atattaac 43800859  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacact 898  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  43800858 acacaaaacagacaccttaattacact 43800832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 667 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 46729558 - 46729316
Alignment:
Q  667 aattgttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattann 766  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||      
T  46729558 aattattactccctccgtccctatatctaaacacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaatctctttttaaattattagatgcatttattatt 46729459  T
Q  767 nnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatat 865  Q
          ||| |||||| | |||||||||||| |  | | || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||  || ||    
T  46729458 tttt--tcccaaacatacccctaattaataccatcatcttgccttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacataggacaatttcgta-at 46729362  T
Q  866 attaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  46729361 attaacacacaaaacagacacattaattacactgacaacttttctt 46729316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 39237446 - 39237699
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatc-tcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||| | ||||||           
T  39237446 tactccctccgtccatgtatctaagcattcatttgattttatttctgtctctaaatataaaaccttttttcaaattactagatgtatttattatttttt- 39237544  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| | ||||||||||| || || | ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  39237545 -tcctaaacatacccctaattaataatattatcttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaa 39237642  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  39237643 cacacaaaacagatacattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaag 39237699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 683 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 43509319 - 43509079
Alignment:
Q  683 gtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacat 782  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||        || |||| ||    
T  43509319 gtccctaaatgtaagcatccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaattattagatgcatttattattttttt-tcttaaagat 43509221  T
Q  783 gctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaaca 881  Q
     | |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43509220 acccctaattaatactactaatttgtcttgaaatttgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgata-atattaacacacaaaaca 43509122  T
Q  882 gatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
     | |||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  43509121 -acacattaattacac-gacaacgtttcttaagaaatgtgaaaaa 43509079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 680 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 20291579 - 20291336
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||        |||||||    
T  20291579 tccgttcctatatctaaacatccatttaactttatttttgtctttaaatataaatctcttttcaaattactaaatgtatttattacttttt--tcctaaa 20291482  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    |||  ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||    
T  20291481 cata-tcctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttagta-atattaacccacaaa 20291384  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  20291383 atagacacattaattacattaccaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 20291336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 676 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 24073011 - 24072762
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcc 775  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||        |||    
T  24073011 tccctccgtctctatatctaagcacccatttgattttatttttgtccataaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttattatttttt--tcc 24072914  T
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    ||||||| | | ||||||||||||  | | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24072913 taaacatacccttaattaatactaccatcttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacattcaagcaaatgacaatttcata-atattaacaca 24072815  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
     |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  24072814 aaaaacagacacattaattacattgacaacttttcttaagaaatgtaaaaaag 24072762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 31840343 - 31840094
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| |           
T  31840343 ttactcactccgtccctatttctaagcattcatttgactttatttttgtccctaaatataaaccccttttcaaattattagatgcatttatcatattt-- 31840246  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     | ||||||||   |||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31840245 -ttctaaacatatccctaattaatactattaatctgtcttgaaatataaaaagacaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaa 31840148  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31840147 cacacaaaaaa--tacattaattacactaacaatttttcttaagaaatttgaaaaa 31840094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 673 - 886
Target Start/End: Original strand, 40411201 - 40411412
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||       |    
T  40411201 tactccctccgtccatatatttaagcatccatttgattttatttttgtccctaattgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattatttttttc 40411300  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |  ||||||| | ||||||||||| || || | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40411301 t--taaacatacccctaattaatattattatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttcata-atattaac 40411397  T
Q  872 acacaaaacagatac 886  Q
    |||||||| ||||||    
T  40411398 acacaaaatagatac 40411412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 54438757 - 54438505
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||            
T  54438757 tactccctccgtctctatatctaagcatccattttattttatttttgtccctaaatgtaaatctcttttcaaattagtaga-gcatttattattttttt- 54438660  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || | ||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||  || ||||||||    
T  54438659 tcctaaacatgcctctaattaatactactatcttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaggataatttcgta-atattaac 54438561  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  54438560 acacaaaacagacactttaattatacggacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 54438505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 673 - 911
Target Start/End: Original strand, 33246357 - 33246591
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctctttt-caaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||| || || ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||           
T  33246357 tactccctccgtccata-atgtaaccacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaa-ctctttttcaaattactagatgcatttattattttt-- 33246452  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||    
T  33246453 -ttctaaacatactcctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttggta-atattaa 33246550  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33246551 cacacaaaatagacattttaattacactaacaacttttctt 33246591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 680 - 926
Target Start/End: Original strand, 37624989 - 37625234
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||        |||||||    
T  37624989 tccgttcctatatttaagcactcatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacctcttttcaaattattagatgcatttattattatttt-tcctaaa 37625087  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||    
T  37625088 catactcttaattaatactactaactaatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaatgataatttagta-atattaacacacaaa 37625186  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | | | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  37625187 ataaacacattaattatactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 37625234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Original strand, 52198587 - 52198837
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||            
T  52198587 tacttcctccgtccctatatgtaagcacccatttga-tttagttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattactagatacatttattatttttt-- 52198683  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||     
T  52198684 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgttttgaaatataaaaagtcaaattcaatacacatacaaataaaagataatttggta-atattaat 52198782  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  52198783 acacagaacagacatattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 52198837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 12624943 - 12624692
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||            
T  12624943 tactccctccgtccctatatgtaagcacccatttgattttatttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttactattattt-- 12624846  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | ||| |||||| ||| |||  |||||| ||||   ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  12624845 tcctaaacatacccctcattaatcctactaatttgtcttaaaatacaaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggacaatttagta-atattaac 12624747  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12624746 acataaaatagtcacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 12624692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 689 - 918
Target Start/End: Original strand, 39196907 - 39197136
Alignment:
Q  689 atatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcct 788  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||        || |||| || | |||    
T  39196907 atatctaagcacccatttgactttatttttgtccctaaatgtaaattatttttcaaattactagatgcatttattatttttttttc-taaatatacacct 39197005  T
Q  789 aattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaac-agatac 886  Q
    |||||||| || |||| ||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  39197006 aattaataatactaacttgttttaaaatttgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttgata-atattaacacacaaaacaagacac 39197104  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||| | | | |||| ||||||| ||||||    
T  39197105 attaatcatagtgacaatttttcttaagaaat 39197136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 50783018 - 50782773
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||  | ||||| || |||||||||||| ||||||            
T  50783018 tacttcctccgtccctatatctaagcacccatttgattttatttttgttcctaaatataaccc-ctttttaagttactagatgcatttattattttt--- 50782923  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaag-ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || ||     ||||||||| | |||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||     
T  50782922 tcctaaacatacccctaattaatattatta-----tcttgaaatataaaaaattaaagttaatacacatacaaacaaaggacaatttcgta-atattaag 50782829  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50782828 acacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 50782773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 51788018 - 51787767
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||   ||||| ||||   ||||| |||||||||||| || ||||||           
T  51788018 ttactccattcgtctctatatctaagtatccatttgattttatttttgtccttaaatataaactcctttttaaattactagatacatttattattttt-- 51787921  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     ||||||||||   |||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||    
T  51787920 -tcctaaacatatccctaattaatactattattttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgtctatttcgta-atattaa 51787823  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  51787822 cacacaaaacagacacattaattacaccgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 51787767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 52226266 - 52226014
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||            
T  52226266 tactccctcc-tccctgtatctaagctcccatttaactttgtttttgtccttaaatgtaaacacattttcaaattactagatgcatttattattatttt- 52226169  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    || ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52226168 tcttaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaaggacaatttgata-atattaac 52226070  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    | | |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  52226069 atataaaacagacacattaattatactgacaacatttcttaaaaaatgtgaaaaag 52226014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 672 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 34543953 - 34543701
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||           
T  34543953 ttactcccttcgtccctatatataagcacccatttgattttctttttgttcctaattgtaaacttcttttcaaattactagatgcatttattattttt-- 34543856  T
Q  772 ctcctaaacatgctcc-taattaatactaataac---atgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatata 866  Q
     ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    | ||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||  ||||| || |||    
T  34543855 -tcctaaacattatccataattaatactactaactaattatcttgaaatatgaaaagtcaaaattaatacacatacaaacaaaggattatttggta-ata 34543758  T
Q  867 ttaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaa 923  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  34543757 ttaacacacaaaatagacacattaattacacggacaacttttcttaagaaatgtgaa 34543701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 19654676 - 19654424
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctctttt-caaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||  ||||||           
T  19654676 tacttcctccgttcttatatctaagcatccatttgattttattttcatccctaaatgtaaa-ctctttttcaaattattaaatgcgtttattattttttt 19654578  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||    
T  19654577 -tcctaaacatactcctaactaatactactaacttgttttgaaatatgaaaagataaatttaatacacatacaaataaatgataatttggta-atatcaa 19654480  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  19654479 cacataaaatagacacattaattacactaacagtttttcttaagaaatgtgaaaaa 19654424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Original strand, 20262254 - 20262504
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |    | ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||             
T  20262254 tactccctccgtccctatatttaagcacgcgtaattcattatttttgtccctaaatgtaaacccattttcaaattactaaatgcatttattttttt---- 20262349  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    || ||||||| | | |||||||||||| || | ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  20262350 tcttaaacatacccttaattaatactactatcttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaataacaatttcgta-atattaac 20262448  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20262449 acacaaaacagacacattaattacactgacaacttttcttaagaaatgtgaaaaag 20262504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 724 - 926
Target Start/End: Original strand, 14602560 - 14602764
Alignment:
Q  724 taaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaata--ctaataacatgtcttgaaatttgaa 821  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||| | |||||||||||  ||| |||| | |||| |||| | ||    
T  14602560 taaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatatattttttctaaacatacccctaattaatatactactaacttatcttaaaatataaa 14602659  T
Q  822 a-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatat 920  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14602660 aagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacaaaaactagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgt 14602758  T
Q  921 gaaaaa 926  Q
    ||||||    
T  14602759 gaaaaa 14602764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 673 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 20116698 - 20116439
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||  || ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||             
T  20116698 tactccctccgtccctatatctaagcacccgtttgattttgtctttgtcccttaatataaaccccttttcaaattactagatgcatttatttatttttgt 20116599  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaatt-aatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
      |||||||| | ||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  20116598 --ctaaacatacccctaatttaatactattatcttgtcttgaaatatgaaaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttccta-atattaa 20116502  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa-gcaatggg 934  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  20116501 cacacaaaacag--gcattaattacattgacaacttttcttaataaatatgaaaaatgcaatggg 20116439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 22651711 - 22651460
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||| |   ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||            
T  22651711 tactcccttcatccttatatgtaatcacccatttgattttatttttatccttaaatgtaaactccttttcaaattactagatgcatttattatttttt-- 22651614  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  22651613 tcctaaacatacccctaattaatattaataacttgtcttgaaacacgtaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaac 22651515  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    | |||||| | | |||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  22651514 atacaaaataaacacattaattacattaataaattttcttaagaaatgtgaaaaa 22651460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 673 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 5168226 - 5168004
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||             
T  5168226 tacttcctccgtccctatatctaagcaccaatttgattttatttttgtctctaaatgtaaacccgttttcatattactagatgcatttttt--ttttttt 5168129  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    | |||||||| | | |||||||||||| || | ||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  5168128 ttctaaacatacccttaattaatactactagcttgtattgaaatatgaaaaattaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttagta-atattaac 5168030  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacac 897  Q
     ||||||||||| | |||||||||||    
T  5168029 gcacaaaacagacatattaattacac 5168004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 673 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 16070678 - 16070426
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| |  ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| | ||||||       |    
T  16070678 tactccttccgtccctatatctaagcctccatttaatttaatttttatccctaaatgtaaaccccattttaaattactagatgtatttattattttttcc 16070579  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
      | |||| | | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| || ||||||||    
T  16070578 --caaaacgtacccctaattaatactactaacttgtattgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatataaacaaaagataatttggta-atattaac 16070482  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  16070481 acacaaaacagacacattaattacactgacagcatttcttaagaaatgtgaaaaag 16070426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 29585028 - 29584890
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| ||    
T  29585028 taattaatactattaacttgtcttaaaatataaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacacagaatagacac 29584930  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  29584929 attaattacactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 29584890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 675 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 54359927 - 54359690
Alignment:
Q  675 ctccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctc 774  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||        ||    
T  54359927 ctccctctgtctctatatctaaacactcatttaattttatttttgtctttaaatgtaaaccacttttcaaattactagatgcatttattattttt---tc 54359831  T
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaattt-gatata-tattaac 871  Q
    |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |    ||||||| |  ||| |||||||    
T  54359830 ctaaacatacacctaattaatactactatcttgtcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaaga----acaatttcgtaatattattaac 54359735  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaa 916  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  54359734 acataaaacagacacattaattatactgacaacttttcttaagaa 54359690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 680 - 926
Target Start/End: Original strand, 54701159 - 54701396
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||        |||||||    
T  54701159 tccgtccttatatctaagcactcatttgactttatttttgtccataaatgtaaacctcttttcaaattactagatacatttattattattttttcctaaa 54701258  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    ||| | | ||||      || |||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||||||| ||    
T  54701259 catacccttaat------tactaacttatcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacacatacaaataaatgacaatttg----ataataacacactaa 54701348  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| | | |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  54701349 acaaacatattaattacactgacaacttttcttaaaaaatgtgaaaaa 54701396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 710 - 911
Target Start/End: Original strand, 13096436 - 13096636
Alignment:
Q  710 tttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtc 809  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||        |||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||    
T  13096436 tttatttttatccctaaatgcaaaccccttttcaaattactagatacatttattattatttt-tcctaaacatacccttaattaatactagtaacttgtc 13096534  T
Q  810 ttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    || |||| ||||| ||||| ||  || |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13096535 ttaaaatatgaaaagttaatttttatgcacatagaaacaaatgacaatttggta-atattaacacacaacacagacacattaattacactaacaactttt 13096633  T
Q  909 ctt 911  Q
    |||    
T  13096634 ctt 13096636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 687 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 5536717 - 5536492
Alignment:
Q  687 ctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctc 786  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||| | |    
T  5536717 ctatatctaagtacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatgcatttattattttt--ctcctaaacataccc 5536620  T
Q  787 ctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    |||||||||| |||||| |||            ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||| ||||||||| ||    
T  5536619 ctaattaata-taataatatga-----------aaaatcaaatttaatacacatacaaacaaatgaaaatttcgtag-tattaacacgcaaaacagacac 5536533  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  5536532 attaattacactgacaatttttcttaagaaatgtgaaaaag 5536492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Original strand, 31936952 - 31937043
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31936952 tacttcctccgtccctatatctaagcatctatttaactttatttttgtccctaaatgtaaatcccttttcaaattactagatgcatttatta 31937043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 776 - 926
Target Start/End: Original strand, 41919997 - 41920147
Alignment:
Q  776 taaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacaca 874  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| || ||||| | | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  41919997 taaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttatttcacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaacaca 41920095  T
Q  875 caaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41920096 caaaatagaaatattaattgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 41920147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 788 - 926
Target Start/End: Original strand, 56373315 - 56373453
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||    
T  56373315 taattaatactaataacttgtcttgaaatatgaaaaaacaaatttaatacacagacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacacaaaataaacac 56373413  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  56373414 attaattgcactaacaatttttcttaagaaatgtgaaaaa 56373453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 672 - 926
Target Start/End: Original strand, 20185517 - 20185765
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |   ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||  |            
T  20185517 ttactccctccgtccctattactaaactctcatttgattttatttttttttctaaatgtaaa-ctctttttaaattactagaagcattttcttttt---- 20185611  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     || ||||||| | | |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  20185612 -tcttaaacatacccttaattaatactactaatttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacaaatacaaacaaaaggcaatttggta-atattaa 20185709  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20185710 cacacaaaacttgcacattaattacactaacaaattttcttaagaaatgtgaaaaa 20185765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 674 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 21171969 - 21171767
Alignment:
Q  674 actccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnct 773  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||        |    
T  21171969 actccctccgtccctatatgtaaccacctatttgattttatttatgtctctaaatgtaaacttcttttcaaattactatatacatttattattttt---t 21171873  T
Q  774 cctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaaca 872  Q
     |||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||     
T  21171872 tctaaacatacccctaattaatactactaacttatcttgaaatatgtaaagtcaaatttaatacacatacaaataaaagataatttgata-atattaacc 21171774  T
Q  873 cacaaaa 879  Q
    |||||||    
T  21171773 cacaaaa 21171767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 710 - 926
Target Start/End: Original strand, 41945668 - 41945881
Alignment:
Q  710 tttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtc 809  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||        |||||||||| |||||| |||||| || || | ||||    
T  41945668 tttatttttgtccctaaatgtaaatcccttttcaaattactatatgcatttattatttttt--tcctaaacatactcctacttaatattactatcttgtc 41945765  T
Q  810 ttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  41945766 ttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacatatacaaacaaaggacaatttcgta-atattatcacataaaaca-acacattaattacactgacaattttt 41945863  T
Q  909 ctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| | |||| |||||||    
T  41945864 cttaaaaaatgtgaaaaa 41945881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 672 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 5448906 - 5448657
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||  ||||||||||| | | ||  |||||| |||||| | |||||            
T  5448906 ttactccctccgtccctatatctaagcc-ccgtttgattttatttttgtccctaaatgtaaacccccttctaaattattagatgtatttattttttt--- 5448811  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
     ||| |||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||  || |||||||    
T  5448810 -tcc-aaacatacccataattaatactactaacatatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaggataatttcgta-atattaa 5448714  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | | ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  5448713 cacacaaaacagacacattaattatattgataacatttcttaagaaatgtgaaaaag 5448657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 680 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 26203371 - 26203095
Alignment:
Q  680 tccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaa 779  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||   ||||||||||   |||||||||||| ||||| || ||||||        |||||||    
T  26203371 tccgttcctatatgtaatcatccatttgattttacttttgtccttaaatgtaaactccttttcaaattattagatacatttattattttttt-tcctaaa 26203273  T
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaa 878  Q
    ||| | ||||||||||  || |||| |||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||| |||    
T  26203272 cattcccctaattaatcatactaacttgtcttgaaatacgaaaagtcaaatttaatatacatacaaagaaaagacaattttgta-atattaacacataaa 26203174  T
Q  879 acagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatat-gaaaaag-caatggggcttagatatagagacggagg 955  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||  || |||||||| |||||| ||||||||    
T  26203173 atatatacattaattacagtaacaacttttcttaataaatgtggaaaaagtaaagggggcttacatatagggacggagg 26203095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 673 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 31486735 - 31486484
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||            
T  31486735 tactccctccggccctatatctaaacacatatttgactttatttttgtctttaaatgtaaaccccttttcaaattactaaattcatttattattattt-- 31486638  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||     ||||||||| ||  ||| || |||||||| | |||  | ||||| ||||| |||| ||||||| || |||||  || ||||||||    
T  31486637 tcctaaacatatctttaattaatattaccaacttgccttgaaatataaaaaatcaaatttaatacgcatataaacaaaggataatttagta-atattaac 31486539  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31486538 acacaaaatagacacattaattgcactaacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 31486484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 694 - 911
Target Start/End: Original strand, 52552391 - 52552605
Alignment:
Q  694 taagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaatta 793  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||        || ||||||| | ||||||||    
T  52552391 taagcacccatttgactttatttttgtccctaaatataaatccctttttaaattattagatacatttattattttt---tcttaaacatacccctaatta 52552487  T
Q  794 atactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaat 892  Q
    |||||| |||| | ||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||| |||| | ||| ||    
T  52552488 atactactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaattttatacacgtacaaacaaaggataatttggta-atattaacacataaagcagacaaatttat 52552586  T
Q  893 tacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  52552587 tacactgacaacttttctt 52552605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 676 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 20792235 - 20792147
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20792235 tccctccgtccctatatctaaacacccatttgattttatttttgatcctaaatgtaaatctctttttaaattactagatacatttatta 20792147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 827 - 926
Target Start/End: Original strand, 37175033 - 37175130
Alignment:
Q  827 aattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37175033 aatttaatacacatacaaacaaaagacaatttggta-atattaacacacaaaatagacacattaattacac-aacaacttttcttaagaaatgtgaaaaa 37175130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 773 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 39414383 - 39414232
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  39414383 tcctaaacatacccctaattaataccactaacttatcttgaaatatgaaaagtcaaatttaa--cacatacaaacaaaagataatttgata-atattaac 39414287  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||| ||| | ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39414286 acacaaaatagacatattaattgcattatcaacttttcttaagaaatatgaaaaa 39414232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 820 - 926
Target Start/End: Original strand, 28116509 - 28116614
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  28116509 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgataatttggca-atattaacacacaaaatagacatattaattacactaacaacttttcttaaaaaatg 28116607  T
Q  920 tgaaaaa 926  Q
    |||||||    
T  28116608 tgaaaaa 28116614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 911
Target Start/End: Original strand, 10602068 - 10602300
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||| | | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||   ||||| ||||||||||||||| | ||||            
T  10602068 tactccctccattcatataactaagcacccattttactttatttttgtccataaatgtaaactcctttttaaattactagatgcattcattatttttt-- 10602165  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    |||||| ||||||||  || ||||||||    
T  10602166 tcctaaacatactcttaattaatactactaatttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacaca----aacaaaagacaatttagta-atattaac 10602260  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  10602261 acacaaaatagacaaattaattacactaccaacttttctt 10602300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 673 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 32237080 - 32236818
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatg--cagttattannnnnn 770  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |  |||  |||||||||||||  |||||| |||||| | ||| |||||||||||||  || ||||||          
T  32237080 tactccctccgttcctatatctaaacttttattgaactttatttttgtccctaaatataaatccccttttaaattactagatgtgcatttattatttttt 32236981  T
Q  771 nctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatatta 869  Q
      | |||||||| | ||||||||||| || |||  | | ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||    
T  32236980 --ttctaaacatacccctaattaatattactaatttatattgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaacaaagaataatttgata-atatta 32236884  T
Q  870 acacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaa-aaagcaatggg 934  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  32236883 acacacaaaacagacatattaattacactgacaacatttctaaaaaaatatgaataaagcaatggg 32236818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 679 - 911
Target Start/End: Original strand, 48472360 - 48472589
Alignment:
Q  679 ctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaa 778  Q
    |||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||| || ||||  ||||||        ||||||    
T  48472360 ctccctccctgtatctaaacacccatttgattttatttttgtctttaaatgtaaactttttttcaaattaataaatgcttttattatttttt--tcctaa 48472457  T
Q  779 acatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaa 877  Q
     ||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| | ||| || |||||  ||||||||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||||    
T  48472458 -catacccctaattaatactattatcttgtcttgaaatataaaaagtcaaatttcatacacatacaaagaaaggataatttcgta-atattaacacacaa 48472555  T
Q  878 aacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48472556 aatagacacattaattacactgacaacttttctt 48472589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 808 - 910
Target Start/End: Original strand, 31937383 - 31937485
Alignment:
Q  808 tcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactt 906  Q
    ||||||||| ||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  31937383 tcttgaaatatgaaaagtcaaattttatatacatacaaacaaatgacaatttaata-atattaacacacaaaacagacacattaattacagtgacaactt 31937481  T
Q  907 ttct 910  Q
    ||||    
T  31937482 ttct 31937485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 773 - 918
Target Start/End: Original strand, 10541213 - 10541358
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||| || | ||| || ||||| |||||||||  ||||||| || |||||| || |||||||     
T  10541213 tcctaaacatatccctaattaatactactaacatatcttgacatataaaaagtcaaatttaatacacatttaaacaaaggataatttggta-atattaat 10541311  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10541312 acacaaaatatatacattaattgcattaacaacttttctttagaaat 10541358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 820 - 926
Target Start/End: Original strand, 26186759 - 26186864
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaata 919  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||| | || || ||||||     
T  26186759 aaagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttgata-atattaacacacaaaataaatatcttaattgcactaacaattattattaagaaatg 26186857  T
Q  920 tgaaaaa 926  Q
    |||||||    
T  26186858 tgaaaaa 26186864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Original strand, 51918513 - 51918606
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaa--atctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51918513 tactccctccgtctttatatctaagcacccatttgattttatttttgtccctaaatgtaattatcccttttcaaattactagatgcatttatta 51918606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 673 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 20293995 - 20293811
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctc-ttttcaaattactagatgcagttattannnnnnn 771  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||||           
T  20293995 tactcctttcgtccctatatctaagcatccatttgattttattttttttcataaatgtgaa-ctcattttcaaattattagatgcatttattattttttt 20293897  T
Q  772 ctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaa-agttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatt 857  Q
     |||||||||| | | || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  20293896 -tcctaaacatacccttacttaatactactaacttgtattgaaatatgaatagtcaaatttaatacaaatacaaacaaaagacaatt 20293811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 788 - 911
Target Start/End: Original strand, 45628046 - 45628168
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||    
T  45628046 taattaatattattaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacata-aaataaagggcaatttggta-atattaatacacaaaacagacac 45628143  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctt 911  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  45628144 atcaattacactaacaacttttctt 45628168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 840 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 3094263 - 3094186
Alignment:
Q  840 tacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  3094263 tacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacacaaaatagacacattaattactttaacaacttttcttaagaaat 3094186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 7002429 - 7002194
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  |   ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||            
T  7002429 tactccctccatccctatatataaccacccatttgactaaaaaattgtccctaaatataaacctcttttcaaattactagatgtatttattattttt--- 7002333  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagtt-aaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| | | |||||||||||  |||| | ||||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  7002332 tcctaaacatacccttaattaatactgctaacttatcttgaaatatgaaaaatcaaatttaacacacatacaaacaaaggataatttggta-atattaac 7002234  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctt 911  Q
    ||| |||| | | ||||||||| || |||||| |||||||    
T  7002233 acataaaatataaacattaattgcattaacaatttttctt 7002194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 675 - 897
Target Start/End: Original strand, 44812467 - 44812687
Alignment:
Q  675 ctccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctc 774  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||| || ||||| ||||| ||| || || ||||| ||||||        ||    
T  44812467 ctccatccgtccttatatctaagcattcatttgattttatttttgtccataattgaaaatccctttttaaagtattatatgcatttattatttttt--tc 44812564  T
Q  775 ctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacac 873  Q
    ||||| || | |||||||||||||| ||   ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||     
T  44812565 ctaaagatacccctaattaatactactattttgttttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacacacaaataaatgacaattttgta-atattaacat 44812663  T
Q  874 acaaaacagatacattaattacac 897  Q
    | |||||| |||||||||||||||    
T  44812664 ataaaacaaatacattaattacac 44812687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 789 - 926
Target Start/End: Original strand, 3684159 - 3684297
Alignment:
Q  789 aattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatac 886  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||    
T  3684159 aattaatactactaacttatcttgaaatatgaaaacgttaaatttaatatacatataaacaaatgataatttaata-atattaatacacaaaatagacac 3684257  T
Q  887 attaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| | |||| |||||||    
T  3684258 attaattacaccgacaatctttcttaataaatgtgaaaaa 3684297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 808 - 924
Target Start/End: Original strand, 5416860 - 5416974
Alignment:
Q  808 tcttgaaat-ttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactt 906  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  5416860 tcttgaaatattaaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaaacacaatttggta-atattaacaaacaaaatagacacatta--tacacaaacaactt 5416956  T
Q  907 ttctttagaaatatgaaa 924  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  5416957 ttcttaagaaatgtgaaa 5416974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 744
Target Start/End: Original strand, 45627947 - 45628017
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaa 744  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  45627947 tactccctc-gtccctatatctaagcatctatttgattttatttttgtccttaaatataaatctcttttcaa 45628017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 31917623 - 31917533
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttat 762  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  31917623 ttactccctccgtccttatatttaagcactcatttgattttatttttatccttaaatgtaaaccctttttcaaattactagatgcatttat 31917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 820 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 32107946 - 32107874
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaatt 893  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32107946 aaagtcaaatttaatacatatacaaataaaagacaatttgata-atattaatacacaaaacatatacattaatt 32107874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 748
Target Start/End: Original strand, 39813815 - 39813891
Alignment:
Q  672 ttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaatta 748  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||    
T  39813815 ttactccctccgttcttatatgtaaccatccatttgattttatttttgtccctaaatgtaaactccttttcaaatta 39813891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 788 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 20540104 - 20540033
Alignment:
Q  788 taattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttg 859  Q
    |||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20540104 taattaatactagtaacttgtattaaaatatgaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaagaacaatttg 20540033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 864 - 927
Target Start/End: Original strand, 45079858 - 45079921
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaag 927  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  45079858 atattaacacacaaaatagatatgttaattgcactaactacttttcttaagaaatgtgaaaaag 45079921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 773 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 21121116 - 21121026
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgata 862  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  21121116 tcctaaacgtacccctaattaatactactaacttgtcttaaaatataaaaagttaaatttaatacgcatacaaacaaaagacagtttgata 21121026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 724 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 20016717 - 20016521
Alignment:
Q  724 taaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaa 822  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||        || ||||||| ||  |||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||    
T  20016717 taaatataaacctcttttcaaattactagattcatttattatttttt--tcataaacatacttttaattaatgctactaacttgtcttgaaatatgtaaa 20016620  T
Q  823 gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatga 922  Q
     | ||||| |||  ||||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| || |||||| | |||| |||    
T  20016619 ctcaaatttaat--acatacaaacaaaggaaaatttggta-atattaacatacaaaatag--acattaattgcactaactacctttcttaaaaaatgtga 20016525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 749
Target Start/End: Original strand, 50438172 - 50438248
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattac 749  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||   |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  50438172 tactccctccgtccctatatgtaatcacccttttatttttatttttgtccctaaatgtaaaccccttttcaaattac 50438248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 773 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 52977705 - 52977570
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttga-aagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaac 871  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| | | ||||||| | | |||| ||||||| |||||||||||| |||  | | ||| ||| ||||||||    
T  52977705 tcctaaacatacttctaattaatactactaacttattttgaaatataagaagtcaaattaagtacacatacaaataaaaaatagtttaata-atattaac 52977607  T
Q  872 acacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||| |||| ||| |||| |||| || |||||||||||    
T  52977606 acataaaatagacacatgaattgcattaacaactttt 52977570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 724 - 764
Target Start/End: Original strand, 56216673 - 56216713
Alignment:
Q  724 taaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56216673 taaatgtaaatttcttttcaaattactagatgcatttatta 56216713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 773 - 856
Target Start/End: Original strand, 56217009 - 56217093
Alignment:
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaat 856  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  56217009 tcctaaacatacctctaattaatactactatcttatcttgaaatatgaaaagttaaatttaatacaaatacaaacaaaggacaat 56217093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 720
Target Start/End: Original strand, 28115099 - 28115146
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgt 720  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  28115099 tactccctccgtctctatatctaagcactcatttaactttatttttgt 28115146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 808 - 890
Target Start/End: Original strand, 52768890 - 52768972
Alignment:
Q  808 tcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacatta 890  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  52768890 tcttgaaatctgtaaagtcaaatttaatacacatacaaataaatgacaattttgta-atattcacacacaaaatagacacatta 52768972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 864 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 20791985 - 20791931
Alignment:
Q  864 atattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20791985 atattaacacacaaaatagacatattaattgcactaccaacttttcttaagaaat 20791931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 824 - 857
Target Start/End: Original strand, 10540468 - 10540501
Alignment:
Q  824 ttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatt 857  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10540468 ttaaattaaatatacatacaaacaaatgacaatt 10540501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 780 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 31294298 - 31294221
Alignment:
Q  780 catgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaat 856  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  31294298 catgcttctaattaatactattaatatgtcttacaatatgaaaagtcaaatcaaattcacatacaaacaaataacaat 31294221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 786 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 41459723 - 41459650
Alignment:
Q  786 cctaattaatactaataacatgtcttgaaatttg-aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaattt 858  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  41459723 cctaattaatactactaacttgtcatgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacatataaataaaagacaattt 41459650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 673 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 49383 - 49140
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||            
T  49383 tactctctcagtccatatatttaagcacccatttaactttatttttttctttaaatgtaaatcccttttcaaattactagatgtatttattattttt--- 49287  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||  || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49286 tcctaaacatacccctaattaatactactaatttgttttgaaatatgaaaaagtcaaatttaataaacatgcaaacaaatgacaatttaata-atattaa 49188  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaat 918  Q
    ||||||||  ||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  49187 cacacaaagtagacatattaattacattaacaatttttcttaagaaat 49140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 820 - 896
Target Start/End: Original strand, 61286 - 61361
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattaca 896  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  61286 aaagttaaatttaatacacatataaataaaggacaatttaata-atattaacacacaaaacaaacacgttaattaca 61361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 724 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 214818 - 214614
Alignment:
Q  724 taaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnctcctaaacatgctcctaattaata--ctaataacatgtcttgaaatttgaa 821  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||        | |||||||| | |||||||||||  ||| |||| | |||| |||| | ||    
T  214818 taaatgtaaaccccttttcaaattactagatgcatttattatatattttttctaaacatacccctaattaatatactactaacttatcttaaaatataaa 214719  T
Q  822 a-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatat 920  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  214718 aagtcaaatttaatacacatacaaacaaatgacaatttggta-atattaacacaaaaactagacacattaattacactaacaacttttcttaagaaatgt 214620  T
Q  921 gaaaaa 926  Q
    ||||||    
T  214619 gaaaaa 214614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 673 - 924
Target Start/End: Original strand, 38337 - 38584
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| |  ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||            
T  38337 tacttcctctgtcactatatctaagcatccgtttgattttctttgtcctt--aaatgtaaatcctttttcaaattactagatgcatttattattttt--- 38431  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa--gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaa 870  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  || ||||| |||| ||||| ||||||  || ||| || || |||||||    
T  38432 tcctaaacatacccctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaaagtcaaatttaataaacataaaaacaatggataatatggta-atattaa 38530  T
Q  871 cacacaaaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaa 924  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||    
T  38531 cacacaaaatagacacattaattatactaacaatttttattaagaaatgtgaaa 38584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 778 - 926
Target Start/End: Original strand, 99778 - 99926
Alignment:
Q  778 aacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacaca 876  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  99778 aacatgcctctaattaatactactaacttgtcttgaaatatgaaaagtcaaatttaatacacattcaaacaaaagacaatttcgta-atattaacacaca 99876  T
Q  877 aaacagatacattaattacactaacaacttttctttagaaatatgaaaaa 926  Q
    ||| ||| |||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  99877 aaatagacacataagttgcactaacaacttttcttaacaaatatgaaaaa 99926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 673 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 25946 - 25771
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttattannnnnnnc 772  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||            
T  25946 tactccctctgttcctatatgtaagcacctatttgattttagttttgtccctaaatgtaaacctcttttcaaattactagatatatttattatttttttt 25847  T
Q  773 tcctaaacatgctcctaattaatactaataacatgtcttgaaatttgaaagttaaattaaatacacatacaaacaaa 849  Q
    || ||||||| | |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25846 tc-taaacatacccctaattaatactactcacttgtcttgaaatatgaaagtcaaatttaatacacatacaaacaaa 25771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 676 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 20250 - 20175
Alignment:
Q  676 tccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattacta 751  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20250 tccctccgtccttatatgtaagcatccatttgattttatttttgatcctaaatgtaaatctctttttaaataacta 20175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 664 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12997 - 12928
Alignment:
Q  664 aataattgttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaa 733  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12997 aataattattacttcctccgtccctatatctaaacactcattcgactttatttttgtctctaaatgtaaa 12928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 664 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 8181 - 8112
Alignment:
Q  664 aataattgttactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaa 733  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8181 aataattattatttcctccgtccctatatctaaacactcattcgactttatttttgtctctaaatgtaaa 8112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 791 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 22191 - 22084
Alignment:
Q  791 ttaatactaataacatgtcttgaaatttgaaa-gttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacatt 889  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||| | |||||    
T  22191 ttaataatactaacttgtcttcaaatatgaaaagttaaatttaatatacatacaaacaaaggacaatatggta-atattaatacacaaaacaaacacatt 22093  T
Q  890 aattacact 898  Q
    |||||||||    
T  22092 aattacact 22084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 673 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 22677 - 22585
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaag-catccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgcagttatta 764  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22677 tactccatccgtctatatatctaagtcctccatttgactttatttttgtctctacatgtaaacacactttcaaattactagatgcatttatta 22585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 820 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 18790 - 18703
Alignment:
Q  820 aaagttaaattaaatacacatacaaacaaatgacaatttgatatatattaacacacaaaacagatacattaattacactaacaactttt 908  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | | | ||||||| || |||||||||||    
T  18790 aaagtcaaatttaaaacacatagaaacaaatgacaatttggta-atattaacccacaaaataaacaaattaattgcattaacaactttt 18703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 673 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 1037 - 990
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgt 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1037 tactccctccgtccctatatctaagctcccatttgactttatttttgt 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 683 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 24296 - 24222
Alignment:
Q  683 gtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    |||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24296 gtccctatatctaaactcctatttgattttatttttgtccctaaatgtaaatcttctttcaaattactagatgca 24222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 673 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 55047 - 54975
Alignment:
Q  673 tactccctccgtccctatatctaagcatccatttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaa 745  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||    
T  55047 tactccatccgttcctatatttaagcacctatttgattttatttttatctctaaatgtaaaccccttttcaaa 54975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0559
Description:

Target: scaffold0559; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 704 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 6725 - 6672
Alignment:
Q  704 tttgactttatttttgtttctaaatgtaaatctcttttcaaattactagatgca 757  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6725 tttgactttatttttgtccttaaatgtaaacctcatttcaaattactacatgca 6672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University