View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2870R-Insertion-3 (Length: 895)

Name: NF2870R-Insertion-3
Description: NF2870R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2870R-Insertion-3
NF2870R-Insertion-3
[»] chr1 (130 HSPs)
chr1 (200-625)||(29256181-29256601)
chr1 (624-860)||(29256746-29256983)
chr1 (702-885)||(25088010-25088191)
chr1 (709-862)||(10654262-10654414)
chr1 (699-851)||(23281254-23281405)
chr1 (706-876)||(16267910-16268077)
chr1 (703-862)||(37199154-37199312)
chr1 (702-865)||(45305640-45305801)
chr1 (711-885)||(51691877-51692049)
chr1 (706-885)||(34028932-34029109)
chr1 (711-862)||(35986235-35986385)
chr1 (708-862)||(42607522-42607675)
chr1 (701-862)||(10923596-10923756)
chr1 (706-879)||(30792438-30792609)
chr1 (708-879)||(6181616-6181785)
chr1 (708-878)||(30293231-30293398)
chr1 (703-862)||(33753220-33753378)
chr1 (707-862)||(50574750-50574904)
chr1 (708-865)||(50118347-50118503)
chr1 (706-862)||(30611218-30611373)
chr1 (711-862)||(16267718-16267868)
chr1 (711-885)||(13944722-13944894)
chr1 (705-859)||(30293010-30293163)
chr1 (706-862)||(9881550-9881704)
chr1 (711-851)||(18793694-18793833)
chr1 (706-862)||(34028719-34028874)
chr1 (711-862)||(14775968-14776118)
chr1 (714-865)||(22584357-22584507)
chr1 (711-862)||(51692104-51692253)
chr1 (711-862)||(52412831-52412981)
chr1 (708-862)||(24655586-24655739)
chr1 (721-879)||(33753433-33753589)
chr1 (702-859)||(14118524-14118680)
chr1 (709-862)||(49291216-49291368)
chr1 (718-879)||(52412608-52412767)
chr1 (703-879)||(4045094-4045268)
chr1 (702-879)||(18793909-18794085)
chr1 (706-862)||(19986355-19986510)
chr1 (706-862)||(32564183-32564337)
chr1 (711-862)||(5463351-5463501)
chr1 (706-885)||(10654028-10654204)
chr1 (711-862)||(21035988-21036138)
chr1 (711-862)||(28970422-28970572)
chr1 (711-865)||(11394890-11395043)
chr1 (711-865)||(11787743-11787896)
chr1 (719-861)||(24590459-24590600)
chr1 (711-865)||(37198935-37199088)
chr1 (712-865)||(36657731-36657883)
chr1 (712-865)||(51810141-51810293)
chr1 (711-865)||(30611450-30611604)
chr1 (711-862)||(50921063-50921213)
chr1 (719-845)||(22584602-22584727)
chr1 (721-879)||(50574527-50574683)
chr1 (711-860)||(32563962-32564110)
chr1 (711-884)||(46738936-46739106)
chr1 (753-885)||(5118096-5118226)
chr1 (706-862)||(6181849-6182004)
chr1 (706-862)||(13944509-13944664)
chr1 (711-835)||(34279501-34279624)
chr1 (706-866)||(44222190-44222349)
chr1 (699-862)||(29257056-29257218)
chr1 (711-865)||(14775748-14775901)
chr1 (711-879)||(45305412-45305579)
chr1 (711-879)||(34279243-34279409)
chr1 (731-879)||(49291016-49291162)
chr1 (711-862)||(4045332-4045482)
chr1 (719-865)||(10923373-10923519)
chr1 (707-866)||(34621864-34622022)
chr1 (719-865)||(24590237-24590382)
chr1 (753-862)||(28112795-28112903)
chr1 (711-820)||(50921366-50921474)
chr1 (758-862)||(13831255-13831358)
chr1 (707-815)||(19885981-19886088)
chr1 (706-862)||(25088249-25088403)
chr1 (708-879)||(1831881-1832050)
chr1 (711-862)||(11787974-11788123)
chr1 (705-864)||(21385167-21385325)
chr1 (719-862)||(51810371-51810513)
chr1 (705-879)||(24655803-24655975)
chr1 (700-865)||(32517743-32517905)
chr1 (745-879)||(46949953-46950085)
chr1 (706-862)||(21384935-21385089)
chr1 (706-866)||(4550829-4550988)
chr1 (720-879)||(27209181-27209338)
chr1 (732-839)||(32517629-32517735)
chr1 (711-862)||(46949759-46949909)
chr1 (9-94)||(29256054-29256139)
chr1 (710-859)||(40533927-40534075)
chr1 (711-879)||(42607719-42607885)
chr1 (768-879)||(9119509-9119618)
chr1 (698-848)||(4054538-4054688)
chr1 (705-862)||(1831661-1831813)
chr1 (705-792)||(36077268-36077355)
chr1 (720-858)||(3569388-3569526)
chr1 (712-862)||(40703098-40703247)
chr1 (711-792)||(5117996-5118077)
chr1 (707-862)||(2125442-2125589)
chr1 (700-792)||(28112713-28112805)
chr1 (711-865)||(31125939-31126085)
chr1 (706-860)||(9119290-9119443)
chr1 (705-862)||(20260612-20260768)
chr1 (721-865)||(5463130-5463274)
chr1 (711-792)||(11797149-11797230)
chr1 (711-865)||(36657503-36657657)
chr1 (707-788)||(36884721-36884802)
chr1 (753-865)||(11797220-11797330)
chr1 (708-789)||(19886219-19886300)
chr1 (720-879)||(40702880-40703034)
chr1 (780-885)||(50921271-50921374)
chr1 (761-865)||(36884934-36885037)
chr1 (775-862)||(30792673-30792759)
chr1 (720-879)||(40534142-40534299)
chr1 (731-885)||(21036193-21036345)
chr1 (753-865)||(19886117-19886226)
chr1 (711-862)||(27209382-27209532)
chr1 (705-851)||(48702125-48702269)
chr1 (712-785)||(11394697-11394769)
chr1 (720-815)||(20260440-20260534)
chr1 (707-862)||(34621620-34621774)
chr1 (711-789)||(19269363-19269441)
chr1 (743-851)||(31126173-31126280)
chr1 (753-792)||(5118067-5118106)
chr1 (549-638)||(28016583-28016672)
chr1 (792-860)||(2125302-2125369)
chr1 (615-678)||(23994659-23994722)
chr1 (153-184)||(29256139-29256170)
chr1 (721-771)||(6714698-6714748)
chr1 (721-771)||(37708574-37708624)
chr1 (778-856)||(38961145-38961223)
chr1 (706-771)||(49548120-49548185)
[»] chr8 (94 HSPs)
chr8 (702-885)||(24456863-24457044)
chr8 (711-885)||(37393688-37393860)
chr8 (706-865)||(6843493-6843653)
chr8 (713-879)||(14920628-14920792)
chr8 (711-885)||(40040165-40040337)
chr8 (711-852)||(1826034-1826174)
chr8 (711-852)||(1860479-1860619)
chr8 (708-885)||(26736125-26736300)
chr8 (711-862)||(119120-119269)
chr8 (711-879)||(31230830-31230996)
chr8 (704-879)||(18017786-18017959)
chr8 (706-879)||(35223772-35223943)
chr8 (706-862)||(35224000-35224155)
chr8 (708-885)||(23244515-23244690)
chr8 (705-862)||(23244748-23244904)
chr8 (707-879)||(758343-758513)
chr8 (711-862)||(18018019-18018169)
chr8 (706-845)||(30872781-30872919)
chr8 (707-865)||(40094473-40094631)
chr8 (699-865)||(11198435-11198600)
chr8 (706-862)||(37393475-37393630)
chr8 (711-862)||(9495256-9495406)
chr8 (711-862)||(39240033-39240183)
chr8 (711-860)||(18914486-18914634)
chr8 (707-865)||(29026967-29027128)
chr8 (711-879)||(8653939-8654105)
chr8 (702-862)||(18621980-18622139)
chr8 (718-850)||(31230623-31230754)
chr8 (707-851)||(39912163-39912306)
chr8 (701-885)||(44254858-44255040)
chr8 (711-862)||(3869182-3869332)
chr8 (703-865)||(39240249-39240410)
chr8 (711-860)||(40032429-40032578)
chr8 (701-862)||(5416805-5416965)
chr8 (711-879)||(5417030-5417196)
chr8 (704-865)||(30650186-30650346)
chr8 (707-862)||(8654169-8654323)
chr8 (705-862)||(758577-758733)
chr8 (713-862)||(14920416-14920564)
chr8 (702-879)||(7041621-7041798)
chr8 (706-865)||(11639050-11639207)
chr8 (711-850)||(21515445-21515583)
chr8 (711-861)||(30568510-30568659)
chr8 (711-879)||(3868947-3869117)
chr8 (701-854)||(28206994-28207146)
chr8 (705-851)||(29027216-29027357)
chr8 (706-862)||(7041862-7042012)
chr8 (711-862)||(16645778-16645931)
chr8 (711-862)||(119349-119499)
chr8 (702-862)||(12873281-12873438)
chr8 (702-850)||(40094720-40094867)
chr8 (711-862)||(26736358-26736508)
chr8 (711-865)||(33542387-33542540)
chr8 (711-845)||(1825813-1825945)
chr8 (711-845)||(1860258-1860390)
chr8 (711-789)||(24456737-24456815)
chr8 (706-860)||(30873013-30873166)
chr8 (718-865)||(5525881-5526025)
chr8 (711-859)||(28206769-28206916)
chr8 (706-862)||(36343960-36344114)
chr8 (715-862)||(39911924-39912070)
chr8 (719-850)||(44255107-44255237)
chr8 (711-820)||(6844715-6844823)
chr8 (747-879)||(33542601-33542731)
chr8 (745-862)||(18914296-18914413)
chr8 (720-865)||(410592-410736)
chr8 (763-884)||(30568331-30568450)
chr8 (763-852)||(44678427-44678515)
chr8 (720-824)||(40032699-40032802)
chr8 (711-787)||(44678320-44678396)
chr8 (720-879)||(26217082-26217238)
chr8 (706-828)||(21512411-21512531)
chr8 (699-851)||(35486107-35486258)
chr8 (779-865)||(40040392-40040477)
chr8 (727-860)||(12873076-12873208)
chr8 (720-861)||(35485883-35486023)
chr8 (710-865)||(36344191-36344345)
chr8 (744-862)||(410405-410522)
chr8 (702-865)||(32733699-32733867)
chr8 (711-789)||(44678518-44678595)
chr8 (729-862)||(19302206-19302338)
chr8 (761-862)||(26217302-26217402)
chr8 (711-856)||(45436399-45436545)
chr8 (827-879)||(16645663-16645714)
chr8 (791-862)||(11639283-11639354)
chr8 (713-792)||(15740618-15740697)
chr8 (711-788)||(26217404-26217484)
chr8 (710-856)||(29769365-29769510)
chr8 (792-860)||(9495115-9495183)
chr8 (711-751)||(11639378-11639418)
chr8 (751-815)||(18623669-18623732)
chr8 (720-771)||(7117111-7117162)
chr8 (720-771)||(43633135-43633186)
chr8 (702-771)||(13364043-13364112)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (707-885)||(24604874-24605049)
chr6 (707-878)||(31029523-31029692)
chr6 (707-862)||(33544821-33544975)
chr6 (711-879)||(33329209-33329375)
chr6 (706-865)||(3338475-3338633)
chr6 (711-862)||(9173904-9174054)
chr6 (711-885)||(3288933-3289105)
chr6 (707-859)||(25551572-25551723)
chr6 (711-879)||(29009957-29010123)
chr6 (711-862)||(35132604-35132754)
chr6 (703-865)||(33545052-33545213)
chr6 (711-879)||(6220273-6220439)
chr6 (711-862)||(3289143-3289293)
chr6 (713-862)||(24605107-24605254)
chr6 (711-862)||(14336905-14337055)
chr6 (711-885)||(25551350-25551522)
chr6 (711-879)||(11524983-11525148)
chr6 (713-865)||(1158593-1158746)
chr6 (711-865)||(1860716-1860868)
chr6 (711-862)||(12903224-12903374)
chr6 (711-862)||(31029757-31029907)
chr6 (711-862)||(33346481-33346631)
chr6 (711-862)||(35119044-35119194)
chr6 (719-862)||(3338710-3338850)
chr6 (711-862)||(7537838-7537989)
chr6 (711-879)||(14337119-14337284)
chr6 (700-864)||(19135677-19135840)
chr6 (721-845)||(11524778-11524901)
chr6 (704-850)||(6220052-6220197)
chr6 (702-862)||(2949290-2949444)
chr6 (719-879)||(13155850-13156008)
chr6 (719-879)||(13160706-13160864)
chr6 (753-885)||(33972417-33972547)
chr6 (704-862)||(1158824-1158979)
chr6 (708-862)||(13156072-13156220)
chr6 (708-862)||(13160928-13161076)
chr6 (711-862)||(29010187-29010337)
chr6 (753-879)||(2949508-2949632)
chr6 (720-851)||(24548485-24548615)
chr6 (711-879)||(35132818-35132973)
chr6 (711-792)||(11524708-11524789)
chr6 (706-865)||(17544683-17544840)
chr6 (711-862)||(24548244-24548394)
chr6 (720-846)||(2814560-2814685)
chr6 (711-809)||(17245609-17245707)
chr6 (719-824)||(32283037-32283141)
chr6 (738-865)||(12903441-12903567)
chr6 (711-809)||(6229672-6229769)
chr6 (707-773)||(33971927-33971993)
chr6 (721-862)||(2315592-2315732)
chr6 (730-845)||(29999653-29999767)
chr6 (708-862)||(17544454-17544606)
chr6 (789-859)||(33329442-33329512)
chr6 (710-866)||(31754206-31754361)
chr6 (711-778)||(33548173-33548240)
chr6 (765-849)||(33972260-33972344)
chr6 (709-861)||(34181898-34182050)
chr6 (744-824)||(7162399-7162479)
chr6 (806-862)||(29999510-29999566)
chr6 (702-741)||(33548121-33548160)
chr6 (547-604)||(2428028-2428085)
[»] chr4 (95 HSPs)
chr4 (712-879)||(33625868-33626033)
chr4 (704-879)||(46620923-46621096)
chr4 (706-865)||(52914950-52915108)
chr4 (708-862)||(25218084-25218237)
chr4 (708-885)||(1157417-1157592)
chr4 (711-851)||(21218091-21218230)
chr4 (708-862)||(45911579-45911732)
chr4 (711-861)||(54136094-54136243)
chr4 (711-879)||(21217850-21218016)
chr4 (711-862)||(32384656-32384806)
chr4 (711-862)||(33626097-33626247)
chr4 (712-879)||(33882166-33882331)
chr4 (707-865)||(46621157-46621314)
chr4 (709-885)||(1205379-1205552)
chr4 (711-862)||(29864179-29864329)
chr4 (711-866)||(29864404-29864558)
chr4 (705-879)||(25058830-25059002)
chr4 (707-865)||(34959061-34959218)
chr4 (722-884)||(4965885-4966042)
chr4 (706-862)||(9010503-9010658)
chr4 (707-879)||(24504157-24504327)
chr4 (710-865)||(29970195-29970348)
chr4 (711-879)||(40067565-40067731)
chr4 (709-884)||(8246958-8247131)
chr4 (711-862)||(10014468-10014617)
chr4 (711-862)||(10021609-10021758)
chr4 (711-865)||(18862670-18862824)
chr4 (708-862)||(2738880-2739033)
chr4 (711-885)||(25593302-25593474)
chr4 (711-885)||(45911785-45911957)
chr4 (699-884)||(43317091-43317274)
chr4 (706-860)||(52915178-52915333)
chr4 (711-865)||(34958835-34958987)
chr4 (711-862)||(40067351-40067501)
chr4 (711-862)||(44710406-44710556)
chr4 (707-885)||(22831008-22831185)
chr4 (719-885)||(27347608-27347772)
chr4 (708-862)||(1157203-1157359)
chr4 (730-875)||(25218305-25218448)
chr4 (713-862)||(27347830-27347978)
chr4 (706-879)||(32385029-32385199)
chr4 (712-879)||(44710620-44710785)
chr4 (711-862)||(45683120-45683270)
chr4 (720-851)||(53645463-53645593)
chr4 (719-865)||(9010735-9010880)
chr4 (713-851)||(12381298-12381435)
chr4 (707-861)||(37515687-37515840)
chr4 (703-865)||(38866393-38866554)
chr4 (704-862)||(43316876-43317032)
chr4 (711-885)||(45683328-45683500)
chr4 (707-864)||(4793830-4793985)
chr4 (713-862)||(22830801-22830950)
chr4 (711-835)||(46200487-46200610)
chr4 (711-850)||(28570666-28570804)
chr4 (706-884)||(10014676-10014851)
chr4 (706-884)||(10021817-10021992)
chr4 (708-862)||(38866632-38866786)
chr4 (712-862)||(44432857-44433006)
chr4 (705-862)||(4966101-4966257)
chr4 (711-859)||(1205613-1205760)
chr4 (711-879)||(21051362-21051528)
chr4 (711-879)||(46200702-46200868)
chr4 (711-879)||(46535526-46535691)
chr4 (711-862)||(8751290-8751440)
chr4 (711-850)||(48209951-48210089)
chr4 (707-855)||(15985465-15985613)
chr4 (705-851)||(11102218-11102364)
chr4 (758-862)||(54191638-54191741)
chr4 (753-879)||(44428616-44428740)
chr4 (708-852)||(25977768-25977912)
chr4 (704-859)||(43969763-43969917)
chr4 (711-858)||(44169982-44170129)
chr4 (711-862)||(46535755-46535905)
chr4 (753-862)||(21051580-21051688)
chr4 (711-851)||(24503942-24504082)
chr4 (711-885)||(54136302-54136470)
chr4 (711-866)||(9657670-9657824)
chr4 (711-862)||(11242702-11242847)
chr4 (711-862)||(8246772-8246920)
chr4 (711-879)||(15985679-15985846)
chr4 (702-879)||(44170196-44170373)
chr4 (711-879)||(54191802-54191967)
chr4 (711-792)||(44428516-44428597)
chr4 (744-865)||(21885054-21885174)
chr4 (707-824)||(37515528-37515643)
chr4 (719-862)||(9657880-9658022)
chr4 (761-862)||(42779573-42779673)
chr4 (711-749)||(10017818-10017856)
chr4 (792-862)||(29970425-29970495)
chr4 (721-771)||(28504590-28504640)
chr4 (582-644)||(29276234-29276296)
chr4 (721-771)||(41610528-41610578)
chr4 (711-765)||(43969557-43969611)
chr4 (721-771)||(46307569-46307619)
chr4 (711-756)||(29970511-29970555)
[»] chr3 (129 HSPs)
chr3 (711-885)||(54107672-54107844)
chr3 (698-878)||(40410702-40410880)
chr3 (706-865)||(4846826-4846984)
chr3 (703-865)||(41208396-41208557)
chr3 (711-879)||(45871700-45871866)
chr3 (706-865)||(12123309-12123467)
chr3 (711-885)||(41997822-41997994)
chr3 (711-879)||(15862185-15862351)
chr3 (711-879)||(50819434-50819600)
chr3 (711-879)||(50856264-50856430)
chr3 (711-865)||(26332322-26332475)
chr3 (707-885)||(34629981-34630157)
chr3 (711-879)||(10756721-10756886)
chr3 (706-851)||(34521264-34521408)
chr3 (711-879)||(45171284-45171450)
chr3 (711-862)||(44069356-44069506)
chr3 (711-885)||(8846287-8846459)
chr3 (705-862)||(26332551-26332711)
chr3 (708-879)||(54081284-54081452)
chr3 (711-865)||(54081513-54081667)
chr3 (711-862)||(54108353-54108503)
chr3 (703-865)||(50819215-50819376)
chr3 (703-865)||(50856488-50856649)
chr3 (712-849)||(7274889-7275024)
chr3 (706-862)||(7742998-7743154)
chr3 (705-862)||(15862408-15862564)
chr3 (713-862)||(53841259-53841407)
chr3 (711-879)||(7950278-7950444)
chr3 (702-862)||(8846070-8846229)
chr3 (711-879)||(44069126-44069292)
chr3 (706-862)||(45171066-45171221)
chr3 (711-862)||(14353281-14353430)
chr3 (711-862)||(31513866-31514016)
chr3 (706-861)||(40926009-40926163)
chr3 (710-860)||(34521492-34521641)
chr3 (706-862)||(12123088-12123243)
chr3 (706-862)||(35753664-35753819)
chr3 (711-862)||(7937796-7937946)
chr3 (711-862)||(28688223-28688373)
chr3 (706-865)||(31514093-31514250)
chr3 (707-834)||(35580210-35580336)
chr3 (705-866)||(14353043-14353202)
chr3 (705-862)||(43899307-43899463)
chr3 (711-860)||(52606132-52606279)
chr3 (709-865)||(17273778-17273933)
chr3 (711-863)||(27940275-27940426)
chr3 (706-846)||(41208649-41208788)
chr3 (711-862)||(19124192-19124342)
chr3 (710-861)||(21169668-21169818)
chr3 (701-844)||(28691364-28691506)
chr3 (711-865)||(52268334-52268486)
chr3 (731-885)||(27254007-27254159)
chr3 (711-884)||(40926223-40926393)
chr3 (702-879)||(40639334-40639509)
chr3 (707-879)||(37133276-37133446)
chr3 (738-865)||(28688020-28688146)
chr3 (705-879)||(46766619-46766792)
chr3 (709-862)||(2829408-2829561)
chr3 (706-879)||(9028189-9028360)
chr3 (711-862)||(17102387-17102537)
chr3 (711-862)||(40969258-40969408)
chr3 (722-865)||(47891527-47891669)
chr3 (708-879)||(53678433-53678602)
chr3 (711-845)||(51170631-51170764)
chr3 (719-860)||(19124407-19124546)
chr3 (711-820)||(43899114-43899222)
chr3 (702-815)||(52609642-52609754)
chr3 (706-862)||(5348577-5348732)
chr3 (706-845)||(46766863-46767002)
chr3 (711-865)||(28691117-28691270)
chr3 (719-849)||(45871935-45872064)
chr3 (706-865)||(2829638-2829795)
chr3 (738-865)||(17102607-17102733)
chr3 (710-861)||(29248542-29248692)
chr3 (706-865)||(40969484-40969642)
chr3 (746-885)||(53841065-53841202)
chr3 (711-851)||(10756952-10757091)
chr3 (712-844)||(22354946-22355077)
chr3 (711-863)||(33773022-33773174)
chr3 (753-885)||(35753477-35753606)
chr3 (711-862)||(9028424-9028574)
chr3 (713-792)||(35753408-35753487)
chr3 (711-861)||(588384-588534)
chr3 (709-862)||(17274009-17274161)
chr3 (707-824)||(33812723-33812839)
chr3 (705-862)||(47891746-47891902)
chr3 (712-864)||(49222040-49222182)
chr3 (707-850)||(2078717-2078859)
chr3 (720-879)||(5348785-5348942)
chr3 (702-861)||(7742769-7742927)
chr3 (731-850)||(29248342-29248460)
chr3 (707-862)||(40639116-40639270)
chr3 (711-809)||(49529105-49529203)
chr3 (711-809)||(13866949-13867047)
chr3 (711-784)||(7937646-7937719)
chr3 (711-879)||(53309946-53310105)
chr3 (703-860)||(41998054-41998205)
chr3 (711-835)||(51883862-51883985)
chr3 (727-862)||(53678666-53678800)
chr3 (711-862)||(54247275-54247415)
chr3 (753-862)||(22444419-22444527)
chr3 (702-815)||(38911498-38911610)
chr3 (711-856)||(50259110-50259255)
chr3 (711-885)||(7274656-7274818)
chr3 (707-850)||(21918496-21918637)
chr3 (711-785)||(33812852-33812926)
chr3 (711-809)||(44316630-44316727)
chr3 (706-856)||(50393315-50393464)
chr3 (705-787)||(51311825-51311907)
chr3 (703-865)||(51885594-51885755)
chr3 (713-809)||(20963574-20963670)
chr3 (744-879)||(2078519-2078652)
chr3 (720-834)||(43844359-43844473)
chr3 (804-885)||(51311685-51311765)
chr3 (736-792)||(22444235-22444291)
chr3 (827-879)||(22444304-22444355)
chr3 (708-860)||(49222262-49222411)
chr3 (711-765)||(43527026-43527080)
chr3 (782-860)||(43527068-43527145)
chr3 (703-820)||(43839957-43840072)
chr3 (721-801)||(52705472-52705552)
chr3 (792-879)||(43527202-43527287)
chr3 (545-647)||(35970432-35970534)
chr3 (781-862)||(52268176-52268257)
chr3 (812-862)||(52606351-52606401)
chr3 (779-849)||(4846667-4846735)
chr3 (721-771)||(47872529-47872579)
chr3 (706-792)||(50394326-50394412)
chr3 (698-771)||(24242992-24243065)
[»] chr2 (104 HSPs)
chr2 (711-879)||(31450669-31450835)
chr2 (705-885)||(13354388-13354566)
chr2 (711-862)||(28203093-28203243)
chr2 (703-885)||(21470290-21470470)
chr2 (707-879)||(34820278-34820448)
chr2 (711-865)||(38275685-38275840)
chr2 (706-865)||(43183813-43183971)
chr2 (711-885)||(25642479-25642651)
chr2 (711-885)||(41377358-41377529)
chr2 (711-884)||(4104371-4104542)
chr2 (711-884)||(12303788-12303959)
chr2 (706-862)||(32933589-32933744)
chr2 (707-879)||(37744605-37744775)
chr2 (702-862)||(41377587-41377746)
chr2 (711-862)||(5961672-5961822)
chr2 (711-862)||(20908744-20908894)
chr2 (711-885)||(16736309-16736481)
chr2 (711-865)||(27883471-27883624)
chr2 (706-860)||(39454449-39454602)
chr2 (708-879)||(4120980-4121149)
chr2 (712-879)||(16655610-16655775)
chr2 (706-865)||(27132509-27132667)
chr2 (702-885)||(32933802-32933983)
chr2 (711-862)||(36211353-36211503)
chr2 (711-865)||(17856202-17856355)
chr2 (706-860)||(18565064-18565217)
chr2 (707-857)||(28631512-28631661)
chr2 (711-885)||(43183586-43183758)
chr2 (712-865)||(28631278-28631430)
chr2 (704-856)||(39912865-39913018)
chr2 (711-879)||(27476584-27476750)
chr2 (711-879)||(28202863-28203029)
chr2 (711-862)||(13354180-13354330)
chr2 (711-862)||(16260874-16261023)
chr2 (711-862)||(16736104-16736254)
chr2 (711-862)||(31450899-31451049)
chr2 (703-862)||(34820512-34820670)
chr2 (711-862)||(39912630-39912781)
chr2 (711-885)||(44612694-44612867)
chr2 (706-862)||(12304387-12304542)
chr2 (711-879)||(16261087-16261253)
chr2 (711-851)||(37412822-37412961)
chr2 (711-862)||(4104162-4104312)
chr2 (711-879)||(37412596-37412762)
chr2 (719-879)||(41659756-41659914)
chr2 (715-862)||(12304018-12304164)
chr2 (711-865)||(15137034-15137187)
chr2 (707-865)||(40694405-40694557)
chr2 (706-862)||(16655839-16655994)
chr2 (700-865)||(27883687-27883855)
chr2 (700-862)||(17856421-17856583)
chr2 (711-862)||(27132743-27132893)
chr2 (711-862)||(34127798-34127947)
chr2 (719-862)||(36442367-36442509)
chr2 (702-862)||(39454675-39454825)
chr2 (713-862)||(10833267-10833416)
chr2 (711-865)||(20908514-20908667)
chr2 (706-860)||(39150060-39150213)
chr2 (713-858)||(21470532-21470675)
chr2 (712-885)||(34127570-34127740)
chr2 (711-862)||(4120767-4120916)
chr2 (706-848)||(14877481-14877620)
chr2 (703-850)||(44915735-44915880)
chr2 (699-865)||(45389122-45389287)
chr2 (713-862)||(25642273-25642421)
chr2 (710-862)||(27476368-27476520)
chr2 (707-860)||(32503772-32503924)
chr2 (709-865)||(38275478-38275633)
chr2 (703-862)||(33819392-33819549)
chr2 (719-862)||(40694206-40694348)
chr2 (700-862)||(27246216-27246377)
chr2 (711-879)||(33819613-33819777)
chr2 (706-862)||(5921619-5921774)
chr2 (720-860)||(35408756-35408895)
chr2 (721-850)||(15829733-15829861)
chr2 (711-820)||(18565278-18565386)
chr2 (722-838)||(34484303-34484418)
chr2 (708-862)||(32503546-32503699)
chr2 (711-821)||(37744452-37744561)
chr2 (720-879)||(27913906-27914062)
chr2 (731-862)||(39149867-39149997)
chr2 (707-860)||(41659971-41660123)
chr2 (711-792)||(20297413-20297494)
chr2 (711-792)||(36211701-36211782)
chr2 (720-860)||(16350306-16350445)
chr2 (705-879)||(36442130-36442303)
chr2 (710-862)||(16350079-16350230)
chr2 (747-879)||(44915956-44916086)
chr2 (792-879)||(27246066-27246152)
chr2 (753-860)||(36211576-36211682)
chr2 (706-852)||(5720140-5720285)
chr2 (704-773)||(44610858-44610926)
chr2 (711-862)||(27914126-27914276)
chr2 (707-778)||(34484234-34484305)
chr2 (727-815)||(11943768-11943855)
chr2 (707-787)||(1580148-1580228)
chr2 (711-809)||(23992191-23992289)
chr2 (721-831)||(1580019-1580128)
chr2 (800-854)||(29078008-29078062)
chr2 (701-771)||(40469092-40469162)
chr2 (702-785)||(38073790-38073873)
chr2 (765-820)||(44612548-44612602)
chr2 (721-771)||(15136364-15136414)
chr2 (721-771)||(26424819-26424869)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (704-879)||(4535-4708)
scaffold0809 (699-862)||(4329-4491)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (702-885)||(10625294-10625476)
chr7 (706-865)||(31715631-31715789)
chr7 (711-885)||(8769493-8769665)
chr7 (705-879)||(23437149-23437321)
chr7 (704-862)||(35085735-35085892)
chr7 (711-862)||(18731022-18731172)
chr7 (711-862)||(23472789-23472939)
chr7 (711-885)||(34568586-34568758)
chr7 (711-860)||(31715857-31716004)
chr7 (708-865)||(39118010-39118166)
chr7 (711-860)||(47250781-47250929)
chr7 (711-879)||(11678706-11678872)
chr7 (714-879)||(21522226-21522387)
chr7 (704-865)||(8769278-8769438)
chr7 (706-862)||(5238449-5238604)
chr7 (707-862)||(21522451-21522603)
chr7 (705-885)||(23472590-23472768)
chr7 (706-862)||(43726475-43726630)
chr7 (706-885)||(9034526-9034703)
chr7 (707-862)||(43140697-43140850)
chr7 (711-865)||(11678933-11679085)
chr7 (711-879)||(35085957-35086123)
chr7 (711-879)||(44486149-44486315)
chr7 (711-862)||(26920150-26920300)
chr7 (711-862)||(44448145-44448295)
chr7 (711-885)||(44447917-44448088)
chr7 (706-862)||(9230910-9231065)
chr7 (704-864)||(32706728-32706887)
chr7 (711-862)||(2357070-2357220)
chr7 (711-850)||(2357300-2357438)
chr7 (699-862)||(32706965-32707126)
chr7 (748-865)||(9230716-9230832)
chr7 (711-860)||(47251132-47251279)
chr7 (720-879)||(22338284-22338442)
chr7 (720-859)||(41758691-41758829)
chr7 (711-885)||(44485543-44485715)
chr7 (720-865)||(36507039-36507183)
chr7 (711-862)||(38842255-38842404)
chr7 (704-879)||(43726240-43726411)
chr7 (705-860)||(473415-473569)
chr7 (738-852)||(34568827-34568940)
chr7 (706-862)||(37143996-37144151)
chr7 (719-862)||(48704042-48704183)
chr7 (711-862)||(473195-473342)
chr7 (758-860)||(38842082-38842182)
chr7 (715-862)||(47250565-47250710)
chr7 (711-862)||(47305130-47305280)
chr7 (711-865)||(31623654-31623807)
chr7 (711-852)||(24119717-24119857)
chr7 (720-865)||(28349611-28349754)
chr7 (720-879)||(37143776-37143932)
chr7 (711-859)||(22338509-22338659)
chr7 (731-879)||(47305344-47305490)
chr7 (753-879)||(48703854-48703978)
chr7 (752-862)||(23437385-23437494)
chr7 (706-783)||(10625104-10625181)
chr7 (709-856)||(38676059-38676205)
chr7 (753-850)||(47250942-47251038)
chr7 (709-809)||(4156538-4156638)
chr7 (806-862)||(10625180-10625236)
chr7 (704-787)||(15326868-15326951)
chr7 (720-815)||(43050396-43050491)
chr7 (744-862)||(36506848-36506965)
chr7 (721-773)||(19543503-19543555)
chr7 (797-885)||(24119916-24120003)
chr7 (706-792)||(28263494-28263580)
chr7 (702-792)||(38677044-38677134)
chr7 (711-856)||(40263551-40263694)
chr7 (720-771)||(43704957-43705008)
chr7 (705-755)||(9225632-9225681)
chr7 (545-679)||(23540176-23540310)
chr7 (721-771)||(45457099-45457149)
[»] chr5 (87 HSPs)
chr5 (706-879)||(7399075-7399246)
chr5 (719-879)||(28391986-28392145)
chr5 (712-879)||(15267456-15267622)
chr5 (698-879)||(12593673-12593852)
chr5 (711-885)||(10656097-10656269)
chr5 (699-865)||(12694916-12695081)
chr5 (712-879)||(31656361-31656527)
chr5 (711-862)||(10656327-10656477)
chr5 (711-865)||(7210675-7210828)
chr5 (711-885)||(9693129-9693301)
chr5 (707-885)||(19205154-19205330)
chr5 (698-863)||(40589044-40589208)
chr5 (706-862)||(16353387-16353542)
chr5 (707-875)||(31909151-31909317)
chr5 (698-862)||(40589647-40589810)
chr5 (711-879)||(42710567-42710733)
chr5 (711-884)||(29023940-29024108)
chr5 (711-862)||(31656591-31656741)
chr5 (712-862)||(39706284-39706433)
chr5 (711-860)||(9692922-9693069)
chr5 (705-862)||(35263491-35263647)
chr5 (711-862)||(3878484-3878634)
chr5 (712-879)||(5087811-5087976)
chr5 (711-865)||(16353154-16353310)
chr5 (711-862)||(31908931-31909083)
chr5 (711-865)||(36751905-36752058)
chr5 (713-862)||(7210461-7210609)
chr5 (706-851)||(33699273-33699417)
chr5 (704-865)||(40589284-40589444)
chr5 (704-865)||(40589887-40590047)
chr5 (711-879)||(35263711-35263877)
chr5 (698-851)||(18514278-18514430)
chr5 (709-862)||(25923119-25923271)
chr5 (711-862)||(334299-334449)
chr5 (710-861)||(5624381-5624531)
chr5 (711-862)||(38416367-38416517)
chr5 (720-879)||(41372375-41372532)
chr5 (720-862)||(7399311-7399452)
chr5 (706-865)||(33762899-33763061)
chr5 (711-865)||(40774341-40774493)
chr5 (707-862)||(41859910-41860066)
chr5 (720-865)||(5152845-5152989)
chr5 (711-844)||(8418435-8418567)
chr5 (711-852)||(32272083-32272223)
chr5 (706-862)||(12593454-12593609)
chr5 (703-851)||(15476503-15476649)
chr5 (711-858)||(40774574-40774720)
chr5 (711-865)||(43570001-43570154)
chr5 (713-845)||(8418206-8418336)
chr5 (702-879)||(14143722-14143897)
chr5 (719-864)||(26289031-26289175)
chr5 (713-862)||(28391773-28391922)
chr5 (706-837)||(5088386-5088516)
chr5 (711-850)||(33763153-33763290)
chr5 (705-843)||(15267239-15267375)
chr5 (705-862)||(19204941-19205096)
chr5 (706-865)||(39706053-39706207)
chr5 (711-845)||(42710353-42710486)
chr5 (708-820)||(15476266-15476377)
chr5 (706-862)||(36752135-36752289)
chr5 (703-845)||(38416138-38416279)
chr5 (703-860)||(14051884-14052040)
chr5 (719-862)||(17861050-17861191)
chr5 (704-792)||(21750806-21750894)
chr5 (701-865)||(25923349-25923511)
chr5 (707-865)||(15670381-15670538)
chr5 (721-813)||(17736529-17736620)
chr5 (705-884)||(17861250-17861419)
chr5 (714-865)||(26289250-26289400)
chr5 (706-859)||(5152614-5152766)
chr5 (721-862)||(14143524-14143661)
chr5 (711-784)||(5460191-5460264)
chr5 (711-809)||(19185533-19185631)
chr5 (708-768)||(5460272-5460332)
chr5 (711-802)||(3879305-3879395)
chr5 (547-599)||(15191054-15191106)
chr5 (707-856)||(2597323-2597471)
chr5 (806-884)||(3878693-3878770)
chr5 (706-750)||(19615420-19615464)
chr5 (551-611)||(18400844-18400904)
chr5 (701-749)||(26288984-26289032)
chr5 (721-771)||(37191606-37191656)
chr5 (827-865)||(41859795-41859833)
chr5 (829-862)||(5088040-5088073)
chr5 (546-603)||(14717340-14717397)
chr5 (698-771)||(37192467-37192540)
chr5 (698-771)||(38384858-38384931)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (703-885)||(13752-13932)
scaffold0188 (711-858)||(13545-13690)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (723-877)||(11228-11380)
scaffold0236 (711-862)||(11447-11597)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (711-859)||(11723-11870)
scaffold0168 (705-864)||(11485-11643)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (700-862)||(45069-45230)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (711-862)||(40585-40735)
scaffold0051 (706-879)||(40350-40521)
[»] scaffold1436 (2 HSPs)
scaffold1436 (706-884)||(1474-1649)
scaffold1436 (753-862)||(1708-1815)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (708-860)||(65739-65890)
scaffold0045 (708-860)||(73071-73222)
scaffold0045 (711-884)||(65951-66122)
scaffold0045 (711-884)||(73283-73454)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (706-862)||(177298-177453)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (714-879)||(90811-90974)
scaffold0016 (758-879)||(91725-91844)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (711-862)||(93191-93343)
scaffold0022 (805-879)||(93407-93479)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (753-879)||(11713-11837)
scaffold0444 (711-792)||(11642-11723)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (707-789)||(25966-26048)
scaffold0193 (828-874)||(26055-26100)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (707-809)||(10905-11007)
scaffold0225 (703-789)||(9777-9863)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (709-773)||(6229-6293)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 130)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 200 - 625
Target Start/End: Original strand, 29256181 - 29256601
Alignment:
Q  200 ttctacacttgttcaacctctcattttctttctatctctttttctatcgtattattttatacatgcatttaacttggaaaatatggaagggacacaaaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29256181 ttctacacttgttcaacctctcattttctttctatctctttttctatcgtattattttatacatgcatttaacttggaaaatatggaagggacaca--ga 29256278  T
Q  300 ttttttcatgaaaaactagtaagttgatctctaaatttgtgaaatgttaaaaaatatgtctttgactatatcgatatttcaatatggtccataaccctat 399  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29256279 ttttttcatgaaaaactattaagttgatctctaaatttgtgaaatgttaaaaaatatgtctttgactatatcgatatttcaatatggtccataaccctat 29256378  T
Q  400 cagatgttactatgttaggttgctcgtcgtttctttaattattagacattctaactggttcttagatcaatcagttgaagcaatgaatttgattttgaca 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29256379 cagatgttactatgttaggttgctcgtcgtttctttaattattagacattctaaccggttcttagatcaatcaattgaagcaatgaattcgattttgaca 29256478  T
Q  500 atattgatccgaggttacattgtcttgacacctaattttatccaagtataattattttatacatgtatttaacgatgtgctatcatatcaattaatgaat 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||   || |  ||| |||||| ||||    
T  29256479 atattgatccgaggttacattgtcttgacacctaattttatccaactataattattttatacatgcatttaatgat---ctgttgtattaattaacgaat 29256575  T
Q  600 atgacggctcatatgtttaaatatta 625  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29256576 atgacagctcatatgtttaaatatta 29256601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 624 - 860
Target Start/End: Original strand, 29256746 - 29256983
Alignment:
Q  624 taattaattgatgtgataacatattattagattaacgtgtaaaataattatacacttatatcaattaaactcc--tttaaattttaggttaaattgcatt 721  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||    
T  29256746 taattaattgatgtgacaacatattattagattaatgtgtaaaataattacacacttatatcaattaaactctcttttaaatttcaggttaaattatatt 29256845  T
Q  722 tttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtca 821  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29256846 tttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacacattttggtcc 29256944  T
Q  822 tttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29256945 tttctgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 29256983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 702 - 885
Target Start/End: Original strand, 25088010 - 25088191
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25088010 attttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctc 25088108  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25088109 tctgttacacattttggtcctttcggttagttttaattcaaaaacattaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 25088191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 709 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 10654414 - 10654262
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10654414 gttaatttgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgtta 10654316  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10654315 cacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 10654262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 699 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 23281405 - 23281254
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23281405 taaattttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ataactt 23281307  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23281306 ctctctgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 23281254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 706 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 16268077 - 16267910
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  16268077 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcc--ttaacttctctccg 16267980  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaat 876  Q
    |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16267979 ttacacattttggttctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaat 16267910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 703 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 37199312 - 37199154
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37199312 ttttaggttaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattctggtccc-ttaacttctct 37199214  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37199213 ccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 37199154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 702 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 45305801 - 45305640
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45305801 attttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaac-tctc 45305704  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  45305703 tctgttacacattttggtcatttacgttagttttaattaaaaaacgttagagttttttcatttt 45305640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 51691877 - 51692049
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  51691877 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatctattttggt-ccattaacttctctctattaca 51691975  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  51691976 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttatggaatttttctggg 51692049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 706 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 34029109 - 34028932
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34029109 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttg 34029011  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  34029010 ttatacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctagaatttttctggg 34028932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 35986235 - 35986385
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | ||||    
T  35986235 taaattgcatttttgttcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctcgccgataca 35986333  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35986334 cattttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 35986385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Original strand, 42607522 - 42607675
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42607522 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttagataatatcgttttggtcccttaatttaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgtt 42607620  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42607621 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 42607675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 701 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 10923756 - 10923596
Alignment:
Q  701 aattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttct 800  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10923756 aatttaaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtggtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttct 10923658  T
Q  801 ctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10923657 cttcgttacacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 10923596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 706 - 879
Target Start/End: Original strand, 30792438 - 30792609
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  30792438 taggctaaattgcatttttggtcccctaactatttaggtactgtcgctttgatcccttaaataaaattcgatttattttggtccc-ttatcttttctctg 30792536  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||    
T  30792537 ttacacattttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtcaagttttcttca-ttatcttctggaatttt 30792609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 708 - 879
Target Start/End: Original strand, 6181616 - 6181785
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  6181616 ggttaaattgcatttttgatcccttaattatttagttagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctccatt 6181714  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6181715 acatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 6181785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 708 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 30293398 - 30293231
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  30293398 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcctttaattaaaattcgatttattttggtcc--ttaacttctctatgtt 30293301  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattt 878  Q
    |||||||| |||  |||   |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  30293300 acacattttggtattttccattagttttaattcaaaaatgttaggtttttttca-ttttcttctggaattt 30293231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 703 - 862
Target Start/End: Original strand, 33753220 - 33753378
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33753220 ttttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctcc 33753318  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | |||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33753319 cagttacacatttttgtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagcttttcttcat 33753378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 50574904 - 50574750
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50574904 aggttagattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctctgt 50574806  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  50574805 tacacattttggtcctttcggttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcat 50574750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 708 - 865
Target Start/End: Original strand, 50118347 - 50118503
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  50118347 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattacaattcgatttattttggtctc-ttaatttctctctgtt 50118445  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50118446 acacattttgatcattttcgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcatttt 50118503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 30611218 - 30611373
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30611218 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttagatattatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttagtccc-ttaacttctctctg 30611316  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30611317 ttacataatttggtcatttctattagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcat 30611373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 16267718 - 16267868
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16267718 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 16267816  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16267817 cattttggtcattaccgttggttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 16267868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 13944894 - 13944722
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  13944894 taaattgtatttttggtcccttaatcatttaggtagtatcgttttgatcccttaattagaattcgatttattttggtccc-ttaacttttctccgttaca 13944796  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13944795 aattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttattca-ttttcttctggaatttttctggg 13944722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 705 - 859
Target Start/End: Original strand, 30293010 - 30293163
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  30293010 ttaggttaaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttggtctctttattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctctat 30293108  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30293109 gttatacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttctt 30293163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 9881550 - 9881704
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  9881550 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccctaaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctc-g 9881647  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9881648 ttacacattttggtcttttccattaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 9881704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 711 - 851
Target Start/End: Original strand, 18793694 - 18793833
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18793694 taaatttcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctattaca 18793792  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18793793 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 18793833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 34028719 - 34028874
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  34028719 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaactaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctatttg 34028817  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34028818 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 34028874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 14776118 - 14775968
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||    
T  14776118 taaattgcatttttggtcacttaactatttaggtagtatcgttttgttcccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaaattctccctgttaca 14776020  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14776019 cattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 14775968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 714 - 865
Target Start/End: Original strand, 22584357 - 22584507
Alignment:
Q  714 attgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacat 813  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22584357 attgcattttttgtctcttaactatttaggtagtatcacattggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacacat 22584455  T
Q  814 ttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22584456 tttggtcctttccgttagttttaaatcaaaaacgttaggttttcttcatttt 22584507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 51692253 - 51692104
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  51692253 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgttttggtccattaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctc-gttaca 51692156  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51692155 cattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 51692104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 52412981 - 52412831
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52412981 taaattacatttttggtcccttaactatttaggtggtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 52412883  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52412882 cattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 52412831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Original strand, 24655586 - 24655739
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24655586 ggttaaattgcatatttggtcccttaagtatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgattcattttggtctc-ttaacttctctttgtt 24655684  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24655685 acacattttgggcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 24655739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 721 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 33753589 - 33753433
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  33753589 ttttggtcccataactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttacacattttagtc 33753491  T
Q  821 atttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  33753490 ttttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttgttctggaatttt 33753433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 702 - 859
Target Start/End: Original strand, 14118524 - 14118680
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  14118524 attttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggttccttaattaaaattcgatttattttggt-actttaacttttc 14118622  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    || |||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14118623 tccgttacacattttagtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttctt 14118680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 709 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 49291368 - 49291216
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  49291368 gttaaattgcatttttcgtcccttaactatttagatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaatttctctatgtta 49291270  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  49291269 cacattttggtcatttcggttagttttgattcaaaaacgttagattttcttcat 49291216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 718 - 879
Target Start/End: Original strand, 52412608 - 52412767
Alignment:
Q  718 catttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcg 817  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  52412608 catttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctttgttacacattttg 52412706  T
Q  818 gtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||| |||   ||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  52412707 gtcctttccattagttttaattccaaaacgttaggttttttttattttt-ttctggaatttt 52412767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 703 - 879
Target Start/End: Original strand, 4045094 - 4045268
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  4045094 ttttaggttaaattgtatttttagccccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatccc-ttaaattctct 4045192  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  4045193 ctgttacacattttggtcatttccattgattttaattcaaaaacgttaggtgttcttca-ttttcttctggaatttt 4045268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 702 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 18794085 - 18793909
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtat--cgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttc 799  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18794085 attttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttc 18793987  T
Q  800 tctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    | |  ||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18793986 ttttcgttacacattt-ggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 18793909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 19986510 - 19986355
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  19986510 taggataaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtctcttaaataaaatttgatttattttggt-cctttaacttctttctc 19986412  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19986411 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 19986355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 32564337 - 32564183
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  32564337 taggctaaattgcatttttagtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctatc-g 32564240  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  32564239 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatattaggttttcttcat 32564183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 5463501 - 5463351
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5463501 taaaatgcatttttagtcccttaactatttagctagtatcgctttggtccgttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 5463403  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5463402 cattttggtcctctctgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 5463351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 706 - 885
Target Start/End: Original strand, 10654028 - 10654204
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  10654028 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagta-cgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccctt-aacttctgtccg 10654125  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  10654126 ttacacattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttctcatca-ttttcttatggaatttttctggg 10654204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 21035988 - 21036138
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21035988 taaattgcatttttgattccttaactatttagatagtatcactttggtccattaattaaaattcaatttattttggtccctt-aacttctctctgttaca 21036086  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21036087 cattttggtcctttaagttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcat 21036138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 28970422 - 28970572
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  28970422 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggt-ccatgaacttctctctgttaca 28970520  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28970521 cattttggtcttttccgttagttttaattaaaaaacattaggttttcttcat 28970572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 11395043 - 11394890
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11395043 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagttttgttttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 11394945  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  11394944 cattatggttatttccgttagttttaattcaaaaatgttagattttcttcatttt 11394890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 11787743 - 11787896
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  11787743 taaattgaatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgaattattttggtccc-ttaacttctctccgttata 11787841  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11787842 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 11787896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 719 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 24590600 - 24590459
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24590600 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtctctt-aacttctctctgttacacattttgg 24590502  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24590501 tcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttca 24590459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 37198935 - 37199088
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  37198935 taaattgtatttttggtttcttaactatttaggcaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctatctgttaca 37199033  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37199034 cattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 37199088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 712 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 36657883 - 36657731
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  36657883 aaattgtatttttggtcccttaactatttatgcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttctgtctattacac 36657785  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36657784 attttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 36657731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 712 - 865
Target Start/End: Original strand, 51810141 - 51810293
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  51810141 aaattgcatttttagtctcttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttttctccgttacac 51810239  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  51810240 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattaggtttttttcatttt 51810293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 30611604 - 30611450
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttatttt-ggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||    
T  30611604 taaattgtatttttgatcccttaactatttaggttgtatcgctttggtccctaaattaaaattcgatttatttttggtccctt-atcttttctttgttac 30611506  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30611505 acattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 30611450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 50921063 - 50921213
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  50921063 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatccgatttattttggtccc-ttgatttctctctgttaca 50921161  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50921162 cattttagtttttttcgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 50921213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 719 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 22584727 - 22584602
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22584727 atttttggtcccttaactaattaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacacattttgg 22584629  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  22584628 tcatttccgttagttttaattaaaaaa 22584602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 721 - 879
Target Start/End: Original strand, 50574527 - 50574683
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50574527 tttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtctattaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacacattttggtc 50574625  T
Q  821 atttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||  ||||||||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||||||||||||    
T  50574626 atttccgttagttttaactcaataactttcggttttctcca-ttttcttctggaatttt 50574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 711 - 860
Target Start/End: Original strand, 32563962 - 32564110
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32563962 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggctgtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctttctgttaca 32564060  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  32564061 cattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacattatgttttcttc 32564110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 711 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 46739106 - 46738936
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  46739106 taaattgtatttttg-tcccctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttactttggtcgctt-aacttctctctgttaca 46739009  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  46739008 cattttagtcatttccgttagttttaattcaaaaacattagattttcttca-ttttcttctgaaatttttctgg 46738936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 753 - 885
Target Start/End: Original strand, 5118096 - 5118226
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5118096 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctctgttatacattttggtcatttctgttagttttaattcaaaaacattagg 5118194  T
Q  853 gtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  5118195 ttttcttca-ttttcttctgaaatttttctggg 5118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 6182004 - 6181849
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6182004 taggctaaattgtatttttggtctcataactatttatgtagtatcgctttagtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctg 6181906  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6181905 ttacacattttggtcctttcaattagttttaattcaaaaacgtaaggttttcttcat 6181849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 13944509 - 13944664
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||      
T  13944509 taggttaaattgcatttttggtcctttaactatttagctagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttatattggtccc-ttaacttctctcca 13944607  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13944608 ttaaacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 13944664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 711 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 34279624 - 34279501
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34279624 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 34279526  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagtttt 835  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||    
T  34279525 cattttggtcctttccgttagtttt 34279501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 706 - 866
Target Start/End: Original strand, 44222190 - 44222349
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  44222190 taggttaaattgcatttttggtcctttaattatttatgtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctccg 44222288  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattttt 866  Q
    |||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  44222289 ttacacattttgattctttctgttagttttaattcaaaaacattagattttattcattttt 44222349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 699 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 29257218 - 29257056
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  29257218 taaaatttaggtttaattgcatttttggtctcttaactatttagctagtattaattttgtcccctaattaaaattcaatttattttggtccatt-aactt 29257120  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29257119 ctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 29257056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 14775748 - 14775901
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14775748 taaattgtatttttgttcccttaattatttaggtagtattgttttgcttctttaattaaaattcgatttattttgctccctt-aacttatctctgttaca 14775846  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14775847 cattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 14775901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 45305412 - 45305579
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaac-ttctctctgttac 809  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  45305412 taaattgcatttttggtcagttaactatttaggtagtattgctttggtcctttaattaagattcgatttattttggt-cctttaactttctctctgttat 45305510  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    || ||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  45305511 accttttggtcttttccgttacttttaattcaaaaacgttagtgtttcttcattttt-ttttggaatttt 45305579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 34279243 - 34279409
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |  |||||     
T  34279243 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtaacgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctc-ttaacttcttttcgttacg 34279341  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  34279342 cattttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 34279409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 731 - 879
Target Start/End: Original strand, 49291016 - 49291162
Alignment:
Q  731 ttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgtta 830  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||   ||||||||||  |||||||  ||||    
T  49291016 ttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttttgttcc-ttaacttctcttcattacacattttcgtcatttccgtta 49291114  T
Q  831 gttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  49291115 gttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 49291162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 4045482 - 4045332
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
T  4045482 taaattgcatgtttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtctcttaattaaaattcgatttattttagt-cctttaacttttctctgctaca 4045384  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||  ||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4045383 cattttagtcctttccattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 4045332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 719 - 865
Target Start/End: Original strand, 10923373 - 10923519
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  10923373 atttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaagtaaaatttgatttattttgatccc-ttaacttttctccgttacacattttgg 10923471  T
Q  819 tcatttatgttagt-tttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10923472 tcatttcggttagtatttaattcaaaaacgttatgttttcttcatttt 10923519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 707 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 34622022 - 34621864
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| || ||    
T  34622022 aggttaaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtatc-ttaacttctttccgt 34621924  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattttt 866  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  34621923 tacacattttggtcatttcagttagttttaattcaaaaacgttaaattttcttcattttt 34621864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 719 - 865
Target Start/End: Original strand, 24590237 - 24590382
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||| ||||||||||||  |    
T  24590237 atttttagtcacttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-ctattaatttgtctatgttacacattttag 24590335  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24590336 tcctttatgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 24590382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 753 - 862
Target Start/End: Original strand, 28112795 - 28112903
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28112795 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctctattacacattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 28112893  T
Q  853 gtttcttcat 862  Q
     |||||||||    
T  28112894 ttttcttcat 28112903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 711 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 50921474 - 50921366
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  50921474 taaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaagtaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctcagttaca 50921376  T
Q  811 catttcggtc 820  Q
    ||||| ||||    
T  50921375 cattttggtc 50921366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 758 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 13831358 - 13831255
Alignment:
Q  758 tcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttc 857  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13831358 tcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctccgttacacattttggtcatttctgttagttttaattcaaaaatgttaggttttc 13831260  T
Q  858 ttcat 862  Q
    |||||    
T  13831259 ttcat 13831255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 707 - 815
Target Start/End: Original strand, 19885981 - 19886088
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19885981 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttttgtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctctctgt 19886079  T
Q  807 tacacattt 815  Q
    |||||||||    
T  19886080 tacacattt 19886088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 25088403 - 25088249
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||    
T  25088403 taggttaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcc-ttaactaaaattcgatttagttcggtccctt-aacttctccatg 25088306  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25088305 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttcat 25088249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 708 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 1832050 - 1831881
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||    
T  1832050 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatatatgtagtatcgttttagtcctttaattaaaattcgatttattttcgtctc-ttaacttttctccgtt 1831952  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    | | |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1831951 atatattatggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 1831881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 11788123 - 11787974
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||    
T  11788123 taaattgcatttttggtcttttaattatttaagcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttatctccattaca 11788025  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11788024 cattttgctc-tttctgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 11787974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 705 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 21385325 - 21385167
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  21385325 ttaggctaaattgcacttttaatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttgatccc-ttaacttctctat 21385227  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattt 864  Q
    || |||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21385226 gtaacacattttggtcatttccgttgattttaattcaaaaacgttaggttttctacattt 21385167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 719 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 51810513 - 51810371
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  51810513 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttttgttcctgaattaaaaattgatttattttggtccc-ttaatttctctctgttacacattttgg 51810415  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    || ||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  51810414 tccttcttgttagttttaattcaaaaatgttagattttcttcat 51810371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 705 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 24655975 - 24655803
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||     
T  24655975 ttaggctaaattgcatttttagtctcttaactatttaagtagtatcgctttggtctcgtaattaaaattcgatttatttt-gagccattaacttctatcc 24655877  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  24655876 gttacacattttggtccttccggttagttttaattcaaaaacgttaggttttctt-aattttcttcaggaatttt 24655803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 700 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 32517905 - 32517743
Alignment:
Q  700 aaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttc 799  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||    
T  32517905 aaatttaaggttaaattgcatttttgatcccttatctatttaggtagtatcactttggtt--ttaattaaaatttgatttattttgatccctc-aacttc 32517809  T
Q  800 tctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  32517808 tctcatttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcatcatttt 32517743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 745 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 46950085 - 46949953
Alignment:
Q  745 agtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaa 844  Q
    |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  46950085 agtatcacattgctcctttaattaaaattcgatttattttggtctctt-aacttctctcagttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaa 46949987  T
Q  845 acgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  46949986 acgttaggttttcttca-ttttcttctagaatttt 46949953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 21384935 - 21385089
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||| ||| | |||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      
T  21384935 taggctaaattacatctctggttctttaactatttatgtagtatcgcttttatcccttaattaaaattcgatttattttggt--ctttaacttctctcca 21385032  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  21385033 ttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgatagattttcttcat 21385089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 706 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 4550988 - 4550829
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||      
T  4550988 taggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-c 4550890  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattttt 866  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4550889 ttacacattttggtcctttccgttaggttaaattcaaaaacgttaggttttcttcattttt 4550829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Original strand, 27209181 - 27209338
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||| |||    
T  27209181 tttttggtcccttaactatttaattaatatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatctt-aacttatcttcgttacacattttggt 27209279  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  27209280 catttccgttagttttaattcaaaaccgttaggttttcttca-ttttcttatggaatttt 27209338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 732 - 839
Target Start/End: Original strand, 32517629 - 32517735
Alignment:
Q  732 taactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttag 831  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  32517629 taactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgattcc-ttaacttctctctgttacacattttggttatttttgttag 32517727  T
Q  832 ttttaatt 839  Q
    ||||||||    
T  32517728 ttttaatt 32517735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 46949759 - 46949909
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||    
T  46949759 taaattgcatttttaattcattaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctattcgttaca 46949857  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | || |||  |||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  46949858 cattttgatcctttccgttagttttaattcaaaaacgtcaagttttcttcat 46949909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 94
Target Start/End: Original strand, 29256054 - 29256139
Alignment:
Q  9 ccataagccagccaaaattatcaactcgactgtaaagtagggatttatgtatgtcaataaatccctgtaatatacaactacaaaga 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  29256054 ccataagccagccaaaattatcaactcgattgtaaagtagggatttatgtatgtcaataaatcattgtaatatacaactaaaaaga 29256139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 710 - 859
Target Start/End: Original strand, 40533927 - 40534075
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  | ||||||| ||||  ||||    
T  40533927 ttaaattgcatttttagtctcttaactatttaattagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttatttcgctatc-ttaacttttctccattac 40534025  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40534026 acattttggtcatttccgttagttttaatttaaaaacgttaggttttctt 40534075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 42607885 - 42607719
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  42607885 taaattgtatttttgatcccttaattatttagatagtatcgttttggtctcttaattaaaatttgatttatttcggt-cctttaattactctctgttaca 42607787  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  42607786 aattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaaggttagattttcttca-ttttcttctgaaatttt 42607719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 768 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 9119618 - 9119509
Alignment:
Q  768 aaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttc 867  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9119618 aaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctttgttacacattttggtcctttcagttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttc 9119521  T
Q  868 ttctggaatttt 879  Q
    |||||| |||||    
T  9119520 ttctggtatttt 9119509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 698 - 848
Target Start/End: Original strand, 4054538 - 4054688
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact 797  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  4054538 ttaaagtttagactaaattgtatttttatccccttaactatttagatagtatcgatttaattctttaattaaaattcgatttattttggtctctttactt 4054637  T
Q  798 tctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgt 848  Q
    |||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4054638 tctctccgttacacattttagtcttttacgttagttttaattcaaaaacgt 4054688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Original strand, 1831661 - 1831813
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  1831661 ttaggctaaattgaattttcggtctcttaactatttaggtagtatcactttggtcttttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctcttc 1831759  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||||||||| |||| |||  ||||||||||    |||||||||||| |||||||||    
T  1831760 tttacacattttggtcctttccgttagtttta----aaaaacgttaggttttcttcat 1831813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 705 - 792
Target Start/End: Original strand, 36077268 - 36077355
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36077268 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccctt 36077355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 720 - 858
Target Start/End: Original strand, 3569388 - 3569526
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  3569388 tttttggtcccttaattatttaattagtatcgttttggttccttaattaaaatttgatatattttggtatcttaattttctctctgttacacattttggt 3569487  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttct 858  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3569488 aatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggatttct 3569526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 712 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 40703247 - 40703098
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||   ||| |  |||||||  ||||||    
T  40703247 aaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttagttaaaatttgatttattttggcatcttaactttctctc-cttacac 40703149  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  40703148 attttggtccttttcgttagttttaatttaaaaacgttagattttcttcat 40703098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 711 - 792
Target Start/End: Original strand, 5117996 - 5118077
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5117996 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccctt 5118077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 2125589 - 2125442
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||      ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  2125589 aggtcaaattacatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtccct------aaatttgatttattttggtccctt-aacttctcttcgt 2125497  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    || |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  2125496 ta-acattttggtcctttctgttagttttaattaaaaaacgttaggttttattcat 2125442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 700 - 792
Target Start/End: Original strand, 28112713 - 28112805
Alignment:
Q  700 aaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28112713 aaatcttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggttccttaattaaaattcaatttattttgatccctt 28112805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 31125939 - 31126085
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||    
T  31125939 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgcttt-------taattaaaattcgatttattttgattcctt-aacttctctccattaca 31126030  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| | ||||||  |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  31126031 cattttgatcatttccgttaattttaattaaaaaatgttagattttcttcatttt 31126085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 706 - 860
Target Start/End: Original strand, 9119290 - 9119443
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |       
T  9119290 taggttaaattatattttttatcccttaactacttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatccc-ttaacttctataca 9119388  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||| |||||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  9119389 ttatacattttgtttatttccgttagtttcaattcaaaaacgttagattttcttc 9119443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 20260768 - 20260612
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact-tctctc 803  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  20260768 ttaggctaaattgcatttttagtcccttaattatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtatc-ttaactctctctc 20260670  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
      ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  20260669 -cttacatattttggtcatttttgttagttttaatttaaaaacgttatgttttcttcat 20260612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 721 - 865
Target Start/End: Original strand, 5463130 - 5463274
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    ||||||| | |||| | ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  5463130 ttttggttctttaattatttagataatatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctcaggtacatattttggtc 5463228  T
Q  821 atttatgttagttttaatt-caaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
     |||  || ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  5463229 ctttccgtcagttttaattaaaaaaacgttaggttttcttcatttt 5463274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 711 - 792
Target Start/End: Original strand, 11797149 - 11797230
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11797149 taaattgcatttttggtcctttaattatttaggtagtatcgcttttgtcccttaattaaaattcaatttattttggtccctt 11797230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 36657503 - 36657657
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact--tctctctgtta 808  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||| ||||    
T  36657503 taaattgcatttttcgtcccctaactatttagtttgcatctcttgggtcccttaattaaaatttgatttattttgatccc-ttaactcctctctccgtta 36657601  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || ||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36657602 catattt-tgtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 36657657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 707 - 788
Target Start/End: Original strand, 36884721 - 36884802
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtc 788  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36884721 aggttaaattgtatttttgttcctttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtc 36884802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 753 - 865
Target Start/End: Original strand, 11797220 - 11797330
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  11797220 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacctctctccgttatacattttggtcctttccgttagttttaattcaagaatgtta-g 11797317  T
Q  853 gtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||||||    
T  11797318 gtttcttcatttt 11797330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 708 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 19886300 - 19886219
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcc 789  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886300 ggttaaattgtatttttggtcctttaattatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcc 19886219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Original strand, 40702880 - 40703034
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |   | ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||| | |    
T  40702880 tttttggtcccttaactatttaattagtatcac---ggtccctaaattaaaatttgatttattttggtatctt-aacttctctgagttacacattttgat 40702975  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    | |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  40702976 ctttttcgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttc-cttttcttctggaatttt 40703034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 780 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 50921374 - 50921271
Alignment:
Q  780 attttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  50921374 attttggtccctt-aacttctctcagttacacattttggtcatttcaattagttttaattcaaaaacgttaggttttattca-ttttcttctgaaatttt 50921277  T
Q  880 gctggg 885  Q
     |||||    
T  50921276 tctggg 50921271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 761 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 36885037 - 36884934
Alignment:
Q  761 cttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  36885037 cttaattaaaattcgatttattttggttcctt-aacttatctctgttacacatttttgtcatttccgttaattttaattaaaaaatgttaggtttacttc 36884939  T
Q  861 atttt 865  Q
    |||||    
T  36884938 atttt 36884934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 775 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 30792759 - 30792673
Alignment:
Q  775 gatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30792759 gatttattttggtccctt-aacttctctccgttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggtttacttcat 30792673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 40534299 - 40534142
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||| ||||  |||||||||| |      
T  40534299 tttttgatcccttaactatttaattagtatcgctttggtctcttaattaaaatttgatttatttcggtatc-ttaacttttctccattacacattttgac 40534201  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  40534200 cctttctgttagttttaattaaaaaatgttaagttttcttca-tgttcttctggaatttt 40534142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 731 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 21036345 - 21036193
Alignment:
Q  731 ttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgtta 830  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   || | ||||||  ||||    
T  21036345 ttaactatttaggtaccatcactttggttctttaattaaaatttgatttattttggtctc-ttaacttttctctgttacattgtttgatcatttccgtta 21036247  T
Q  831 gttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  21036246 gttttaattcaagaactttagggtttcttta-tgttcttctggaatttttctggg 21036193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 753 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 19886226 - 19886117
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  19886226 tttggtcctttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctc--tcacacatttttgtcatttccgttagttttaatttaaaaacgttatg 19886130  T
Q  853 gtttcttcatttt 865  Q
     ||||||| ||||    
T  19886129 ttttcttcctttt 19886117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 27209532 - 27209382
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||  || ||    
T  27209532 taaattgcatttttggtcccttgacaatttaattagtatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-cttgca 27209434  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  27209433 cattttggtcctttccgttaattttaattaaaaaacgttaggtcttcttcat 27209382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 705 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 48702269 - 48702125
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaac-ttctctc 803  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||| ||    
T  48702269 ttaggctaaattgcatttttagtcccttaattattttgttagtatcgttttggtcctttaattaaaattggatttattttggt-attttaactttctatc 48702171  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
     ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  48702170 -gttacacattttggtcattt-cgttggttttaattcaaaaacattag 48702125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 712 - 785
Target Start/End: Original strand, 11394697 - 11394769
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttg 785  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11394697 aaattgcatttttg-tctcttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttcttttg 11394769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 720 - 815
Target Start/End: Original strand, 20260440 - 20260534
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacattt 815  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  20260440 tttttggtctcttaactatttaattagtatcattttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-attttaacttctctccgttacacattt 20260534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Original strand, 34621620 - 34621774
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||  |||||||| |||| || |||||||||||||  |||||||||  |  ||| |  || ||||  |    
T  34621620 aggttaaattgcatttttgatcctttaattatttaattagtatcgttttggtctcttaattaaaattttatttattttaatatcttaactttttctc-ct 34621718  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34621719 tacacattttggtcctttcgattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 34621774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 711 - 789
Target Start/End: Original strand, 19269363 - 19269441
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcc 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19269363 taaattgcatttttggtcccttaactatttatccagtatcactttggtctcttagttaaaattcggtttattttggtcc 19269441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 31126280 - 31126173
Alignment:
Q  743 gtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaa 842  Q
    ||||||| |||||| | | |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||  ||  |||  ||||||||||||||||    
T  31126280 gtagtattgctttggtacattaattaaaatttgatttattttagtccc-ttaacttttctatgtcacacattttagttcttttcgttagttttaattcaa 31126182  T
Q  843 aaacgttag 851  Q
    |||||||||    
T  31126181 aaacgttag 31126173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 753 - 792
Target Start/End: Original strand, 5118067 - 5118106
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5118067 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 5118106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 549 - 638
Target Start/End: Original strand, 28016583 - 28016672
Alignment:
Q  549 aattattttatacatgtatttaacgatgtgctatcatatcaattaatgaatatgacggctcatatgtttaaatattaattaattgatgtg 638  Q
    |||||||||| ||||  ||| || |||||| | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  28016583 aattattttacacatacattcaatgatgtgttgtcatttcaattaacgaatatgacagctcatatgttttcatgttcattaattgatgtg 28016672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 860
Target Start/End: Original strand, 2125302 - 2125369
Alignment:
Q  792 ttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2125302 ttaacttctctccgttacacattttgatc-tttatattaattttaattcaaaaatgttaggttttcttc 2125369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 23994722 - 23994659
Alignment:
Q  615 tttaaatattaattaattgatgtgataacatattattagattaacgtgtaaaataattatacac 678  Q
    |||||||||| |||||||||  || |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  23994722 tttaaatatttattaattgacttggtaacatatcattaaattaatgcgtaaaataattatacac 23994659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 184
Target Start/End: Original strand, 29256139 - 29256170
Alignment:
Q  153 atttgaacatcaattattttcctacacttctc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29256139 atttgaacatcaattattttcctacacttctc 29256170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 6714748 - 6714698
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6714748 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 6714698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 37708624 - 37708574
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  37708624 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttgatcccttaactaaaa 37708574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 778 - 856
Target Start/End: Original strand, 38961145 - 38961223
Alignment:
Q  778 ttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  38961145 ttattttggtcccttaactttctctccgttatacattttggtcatttccgttaaatttaattaaaaaacgttagagttt 38961223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 771
Target Start/End: Original strand, 49548120 - 49548185
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  49548120 taggtttaaatgcttttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 49548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 94)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 702 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 24457044 - 24456863
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24457044 attttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgccttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctc 24456946  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24456945 tccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 24456863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 37393860 - 37393688
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37393860 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 37393762  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37393761 cattttggtcatttccgtaagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 37393688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Original strand, 6843493 - 6843653
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt-taacttctctct 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6843493 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactatgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttataacttctctct 6843592  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6843593 gttacacattttggtcatttctgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcatttt 6843653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 713 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 14920792 - 14920628
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14920792 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacaca 14920694  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14920693 ttttggtcatttctgttacttttaattcgaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggattttt 14920628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 40040165 - 40040337
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  40040165 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtaccttaattaaaattcgatttattttgttccc-ttaacttctctccgttaca 40040263  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  40040264 cattttggccctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgtaatttttctggg 40040337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 1826174 - 1826034
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1826174 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 1826076  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1826075 cattttggtcctttacattagttttaattcaaaaacgttagg 1826034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 1860619 - 1860479
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1860619 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 1860521  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1860520 cattttggtcctttacattagttttaattcaaaaacgttagg 1860479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 708 - 885
Target Start/End: Original strand, 26736125 - 26736300
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26736125 ggttaaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttttttaaaatttaatttattttggtccc-ttaccttctctctgtt 26736223  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26736224 acacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggctttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 26736300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 119120 - 119269
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  119120 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattactttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtcc--ttaacttctctctgttaca 119217  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  119218 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 119269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 31230996 - 31230830
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  31230996 taaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatccc-ttaacttctctttgttaca 31230898  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31230897 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 31230830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 704 - 879
Target Start/End: Original strand, 18017786 - 18017959
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18017786 tttaggctaaattgcatatttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcacttaattaaaattcaatttattttggt-cctttaacttctctc 18017884  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  18017885 tgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagtttttcttta-ttttcttctggaatttt 18017959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 706 - 879
Target Start/End: Original strand, 35223772 - 35223943
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  35223772 taggctaaattgcatttttggtccctttactatttaggtagtatcgctttggtcccttgactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttg 35223870  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  35223871 ttacacattttggtcatttccgtttgttttaattcaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctagaatttt 35223943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 35224155 - 35224000
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  35224155 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagttagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttg 35224057  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35224056 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagtttttcttcat 35224000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 708 - 885
Target Start/End: Original strand, 23244515 - 23244690
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23244515 ggttaaattgcatttttggtccactaaccatttatgtagtatcgctttggttctttaattaaaatttgatttattttggtccctt-aacttctctctgtt 23244613  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  23244614 acacattttggtcgtttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttatggaatttttctggg 23244690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 23244904 - 23244748
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  23244904 ttaggttagattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttagttaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctat 23244806  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23244805 gttacatattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 23244748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 707 - 879
Target Start/End: Original strand, 758343 - 758513
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  758343 aggttaaattgcatttttggccccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattaaatttattttgatccc-ttaaattctctctgt 758441  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||| ||||||||   ||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  758442 tacacattttggtcatttccattgattttaattcaaaaacgttaggtgttcttca-ttttcttctggaatttt 758513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 18018169 - 18018019
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18018169 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggaagtattgctttgctcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 18018071  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18018070 cattttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttaggttttcttcat 18018019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 706 - 845
Target Start/End: Original strand, 30872781 - 30872919
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30872781 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttg 30872879  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30872880 taacacattttggtcatttctgttagttttaattaaaaaa 30872919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 707 - 865
Target Start/End: Original strand, 40094473 - 40094631
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttg-gtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |    
T  40094473 aggttaaattgcatttttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggttcc-ttaacttctctccg 40094571  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  40094572 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaagaacgttagattttcttcatttt 40094631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 699 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 11198600 - 11198435
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  11198600 taaatattaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagacagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatccc-ttaactt 11198502  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11198501 ctctccgttacacattttggtcctttccattagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcatttt 11198435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 37393475 - 37393630
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  37393475 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctcaa 37393573  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37393574 ttacatattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagtttttcttcat 37393630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 9495406 - 9495256
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  9495406 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtattgctttggtccgttaattaaagtttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttact 9495308  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9495307 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 9495256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 39240033 - 39240183
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||    
T  39240033 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttgattcc-ttaacttctcttcgttaca 39240131  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39240132 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 39240183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 711 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 18914634 - 18914486
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18914634 taaattgcatttttggtcccctaactatttaggtagcatcgctcttgtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 18914536  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18914535 cattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 18914486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 707 - 865
Target Start/End: Original strand, 29026967 - 29027128
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactg----tttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  29026967 aggttaaattgcatttttggtcccttaactagctatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctac 29027065  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29027066 ccgttacacaatttggtcatttctgttagttttaattctaaaacgttaggttttcttcatttt 29027128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 8653939 - 8654105
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   | |||||||    
T  8653939 taaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaactttcatttgttaca 8654037  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8654038 tattttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 8654105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 702 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 18622139 - 18621980
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  18622139 attttgggctaaattgcacttttggtctcttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttcta 18622041  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18622040 tctgttacacattttgctcttttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 18621980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 718 - 850
Target Start/End: Original strand, 31230623 - 31230754
Alignment:
Q  718 catttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcg 817  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  31230623 catttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttacacattttg 31230721  T
Q  818 gtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31230722 gtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtta 31230754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 707 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 39912306 - 39912163
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  39912306 aggttaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccat 39912208  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  39912207 tacacattttagtcatttccgttagttttaattcaaaaacattag 39912163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 701 - 885
Target Start/End: Original strand, 44254858 - 44255040
Alignment:
Q  701 aattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttct 800  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  44254858 aattttagactaaattgcatttttggatccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttct 44254956  T
Q  801 ctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     ||||||||||||||  ||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  44254957 ttctgttacacattttagtgttttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttta-ttttcttctgaaatttttctggg 44255040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 3869332 - 3869182
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  3869332 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttttttttgtccc-ttaacttctctccgttaca 3869234  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3869233 ctttttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 3869182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 703 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 39240410 - 39240249
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |    
T  39240410 tttttggttaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgttttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtctc-ttaacttcttt 39240312  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39240311 ccgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttatgttttcttcatttt 39240249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 711 - 860
Target Start/End: Original strand, 40032429 - 40032578
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaa-ttaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40032429 taaattgcatttttggtcacttaattatttaggtagtatcgctttggtctcttaaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctgtctgttac 40032527  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  40032528 acattttggtcctttctgttagttttaattaaaaaacattaggttttcttc 40032578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 701 - 862
Target Start/End: Original strand, 5416805 - 5416965
Alignment:
Q  701 aattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttct 800  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  5416805 aattataggctaaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgttttggtcctctaattaaaattcgattgattttggt-cttttaacttct 5416903  T
Q  801 ctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5416904 ttctgttacacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 5416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 5417196 - 5417030
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttc-tctctgttac 809  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| ||| |    
T  5417196 taaactgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggttcc-ttaacttcttctc-gttgc 5417099  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  5417098 acattttggtcatttccgttagttttatttcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 5417030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 704 - 865
Target Start/End: Original strand, 30650186 - 30650346
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30650186 tttaggctaaattgcatttttagtcctctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttcc-ttaacttctctc 30650284  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
     ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  30650285 cgttacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaaccttaggttttcttcatttt 30650346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 8654323 - 8654169
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  8654323 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatattgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttgctccc-ttaacttctctccgt 8654225  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8654224 tacacattttggtactttccgttagttttaattcaaaaacgttatgttttcttcat 8654169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 758733 - 758577
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  758733 ttaggctaaattgcatgtttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtccttaaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttttctct 758635  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | |||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  758634 gctacacattttagtcatttccattagttttaattcaaaaacgttaagttttcttcat 758577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Original strand, 14920416 - 14920564
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  14920416 aattgcatttttggttccttaactatttaggtagtattgttttggtcatttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctccctgttacata 14920514  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14920515 ttttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 14920564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 702 - 879
Target Start/End: Original strand, 7041621 - 7041798
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggt--cccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttc 799  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7041621 attttaggtcaaattgcattttttttttcctctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttc 7041719  T
Q  800 tctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||  |  |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  7041720 tctctattacacattttggtccttttcgaaagttttaattgaaaaacattaggttttcttca-ttttcttctgtaatttt 7041798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Original strand, 11639050 - 11639207
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |    
T  11639050 taggctaaattgtattttttgtcccttaactatttaggtagcgtcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttcgtctc-ttaacttctctccg 11639148  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11639149 ttacacattttggtcattttcgtaagttttaattc-aaaacgttaggttttgttcatttt 11639207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 21515583 - 21515445
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21515583 taaattacatttttagtcttttaactatttacgtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttgttaca 21515485  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
     |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  21515484 tattttggtcatttccgttagctttaattcaaaaacgtta 21515445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 711 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 30568659 - 30568510
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  30568659 taaattgtatttttggtcccttaactatttagttagtatcgatttggtcccttatttaaaatttgatttattttggtccc-ttaatttttctccgttaca 30568561  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30568560 cattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttca 30568510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 3868947 - 3869117
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac- 809  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||     
T  3868947 taaattgcacttttgatcccttaactatttatgtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtctc-ttaacttctctccgttaca 3869045  T
Q  810 --acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
      |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  3869046 gtacattttggtcttttctgttagttttaattcaaaaacattaggttttttttcattttcttctggaatttt 3869117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 701 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 28207146 - 28206994
Alignment:
Q  701 aattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttct 800  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||    
T  28207146 aattttaggctaaattgcatttttgatcccttaattattttgctagtatcgctttgaccccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttct 28207047  T
Q  801 ctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggt 854  Q
     || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207046 atc-gttacaaattttggtcatttacgttagttttaattcaaaaacgttagggt 28206994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 705 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 29027357 - 29027216
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29027357 ttaggctaaattatatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctcc 29027259  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||||||||| ||    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29027258 gttacacattttgg----tttcgttagttttaattcaaaaacgttag 29027216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 7042012 - 7041862
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||     ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7042012 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttatatagtatcgctttggtcccttaa-----atttgatttattttggtccctt-aacttctctttg 7041919  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7041918 ttacacattttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 7041862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 16645931 - 16645778
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc---tctgtt 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||    
T  16645931 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctcatcagtt 16645833  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||| | || |||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  16645832 acacattttgttcctttccattagttttaattcaaaaagattaggttttcttcat 16645778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 119499 - 119349
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  119499 taaattgcattgttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgctttattttggtccc-ttaacttctcaccggtaca 119401  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  119400 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaataataggttttcttcat 119349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 702 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 12873438 - 12873281
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||| ||||    
T  12873438 attttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtatc-ttaac-tctc 12873341  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12873340 tc-cttacacattttggtcattttttttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 12873281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 702 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 40094867 - 40094720
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40094867 attttaggcaaaattacatttttggtcccttaactatttaattagtactgttttggtcctttaattaaaattcgatttatttttgtccc-ttaacttctc 40094769  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    || ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40094768 tccgttacactttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtta 40094720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 26736508 - 26736358
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||    
T  26736508 taaattacattttcgatcccttaactatttagatagtattgatttggtcctttaattaaaattcgatttattgtggtcc-tttaacttctcttcgataca 26736410  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26736409 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtttgagtttcttcat 26736358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 33542387 - 33542540
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact-tctctctgttac 809  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| ||||||  ||||    
T  33542387 taaattgtatttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatctgatttattttggt-attttaactctctctc-cttac 33542484  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33542485 acattttggtcatttttgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 33542540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 711 - 845
Target Start/End: Original strand, 1825813 - 1825945
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1825813 taaattgtatttttggtcccttaactatttaaggagcatcgttttgatctcttaattaaaatttgatt-attttagtccctt-aacttctctctgttaca 1825910  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1825911 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 1825945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 711 - 845
Target Start/End: Original strand, 1860258 - 1860390
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1860258 taaattgtatttttggtcccttaactatttaaggagcatcgttttgatctcttaattaaaatttgatt-attttagtccctt-aacttctctctgttaca 1860355  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1860356 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 1860390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 711 - 789
Target Start/End: Original strand, 24456737 - 24456815
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcc 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24456737 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcc 24456815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 706 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 30873166 - 30873013
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |    
T  30873166 taggctaaattgcattttttgtcccttaattattttggtagtattagtttgattccttaattaaaatttgatttattttgatccc-ttaacttctatccg 30873068  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30873067 ttacacattttagtcattttcgttagttttagttcaaaaacgttaggttttcttc 30873013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 718 - 865
Target Start/End: Original strand, 5525881 - 5526025
Alignment:
Q  718 catttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcg 817  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||  ||| |||||| |    
T  5525881 catttttagtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtcccttt-acttatctc--ttatacattttg 5525977  T
Q  818 gtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5525978 gccatttcctttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 5526025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 711 - 859
Target Start/End: Original strand, 28206769 - 28206916
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |  |||| || ||||||    
T  28206769 taaattgaatttttggtcccataactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatgtattttggtatcttaattttctatc-gttaca 28206867  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28206868 cattttgatcctttatgttagttttaattcaaaaacgttaggttttctt 28206916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 36343960 - 36344114
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||    
T  36343960 taggctaaattgtatttttggttc-ttaattatttaggtagtattattttggtcccttaattaaaattcgattaattttggtcc-tttaacttttctatg 36344057  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36344058 ttacacattttggtctttttcgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 36344114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 715 - 862
Target Start/End: Original strand, 39911924 - 39912070
Alignment:
Q  715 ttgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatt 814  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| || |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||    
T  39911924 ttgcattttttgtcccttaattatttagatattatctctttggtcgcttaattaaaattcggtttattttggt-cctttaacttctctccgttatatatt 39912022  T
Q  815 tcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39912023 ttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 39912070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 719 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 44255237 - 44255107
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||| | || | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  44255237 atttttgatcctttaactatttaggtgggattgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctctt-aacttatctctgttacacattttgg 44255139  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44255138 tcatttacgttagttttaattcaaaaatgtta 44255107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 711 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 6844823 - 6844715
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||    
T  6844823 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagcatcgctttgatctcttaattaaaaatcgatttatcttggtccc-ttaacttctctccattaca 6844725  T
Q  811 catttcggtc 820  Q
    ||||| ||||    
T  6844724 cattttggtc 6844715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 747 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 33542731 - 33542601
Alignment:
Q  747 tatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaac 846  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33542731 tatcgctttggtcatttaattaaaatttgatttattttgatttctt-aacttctctccgttacatattttggtcctttatgttagttttaattcaaaaat 33542633  T
Q  847 gttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33542632 gttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 33542601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 745 - 862
Target Start/End: Original strand, 18914296 - 18914413
Alignment:
Q  745 agtatcgctttgatcccttaattaaaa-ttcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaa 843  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  18914296 agtatcgctttggttctttaattaaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctccgttacacattttggtcatttcagttagttttaattcaaa 18914394  T
Q  844 aacgttagggtttcttcat 862  Q
    || |||||| ||| |||||    
T  18914395 aatgttaggtttttttcat 18914413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 720 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 410736 - 410592
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    |||||| |||||||||| |||   |||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||| |||    
T  410736 tttttgatcccttaactattttattagtatcgttttggttccttaattaaaatttgatttattttggtatctt-accttctctctattacacattttggt 410638  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  410637 ccttttcgtttgttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 410592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 763 - 884
Target Start/End: Original strand, 30568331 - 30568450
Alignment:
Q  763 taattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |   ||||||||     
T  30568331 taattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctatttgttacacattttggtcatttccgtttgttttaattcaaaaacgtcatattttcttca- 30568428  T
Q  863 ttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  30568429 ttttcttctggaatttttctgg 30568450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 763 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 44678515 - 44678427
Alignment:
Q  763 taattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44678515 taattaaaattcgatttattttggtcc-tttaacttctttctgttacacgttttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagg 44678427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 720 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 40032802 - 40032699
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |    
T  40032802 ttttttgtcccttagctatttatgtagtatcattttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctctctgttacacattttgat 40032704  T
Q  820 cattt 824  Q
    |||||    
T  40032703 cattt 40032699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 711 - 787
Target Start/End: Original strand, 44678320 - 44678396
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggt 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44678320 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggt 44678396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Original strand, 26217082 - 26217238
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  26217082 tttttggtcccttaactatttaagtagtatcattttggccctttaattaaaatttaatttattttggtccc-ttaactcctctttgttacacatttc-gt 26217179  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    | |||  ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  26217180 cctttccgttagttttaatttaaaaacgttggattttcttca-ttttcttcttgaatttt 26217238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 706 - 828
Target Start/End: Original strand, 21512411 - 21512531
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  21512411 taggctaaattgtatttttcgtcccttaactatttagg-agtatcgctttagtccattaattaaaatttgatttattttgg-ccccttaacttctctccg 21512508  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgt 828  Q
     ||||||||| |||| |||||||    
T  21512509 ctacacattttggtcctttatgt 21512531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 699 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 35486258 - 35486107
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||| |  ||    
T  35486258 taaatatttggttagattgcatttttggtcccctaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttagtatcttaacttt 35486159  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    |||||  |||||| ||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35486158 ctctc-cttacaccttgtgctcctttctgttagttttaattcaaaaacgttag 35486107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 779 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 40040477 - 40040392
Alignment:
Q  779 tattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  40040477 tattttggtccctt-aacttctctctgttacacattttggtcattttcattagttttaattcaaaaatgttaggtgttcttcatttt 40040392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 727 - 860
Target Start/End: Original strand, 12873076 - 12873208
Alignment:
Q  727 tcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttat 826  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | || |||      
T  12873076 tcccttaactatttaattagtatcactttggtcctttaattaaaatttaatttattttggtttctt-aacttctctccgttacacattttgatcctttcc 12873174  T
Q  827 gttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  12873175 gttagttttaattcaaaaatgttagattttcttc 12873208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 720 - 861
Target Start/End: Original strand, 35485883 - 35486023
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    |||||| |||||||||| || |  || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||    ||||||||||| ||| | |||||| |||    
T  35485883 tttttgatcccttaactattcaattaatatcgctttagtcccttaattaaaatttgttttattttggt-atattaacttctctttgtcaaacattttggt 35485981  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35485982 cattttcattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca 35486023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 710 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 36344345 - 36344191
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | || || ||    
T  36344345 ttaaattgcattttttatcctttaactatttaggtagtattgctttggtcttttaattaaaatttgatttattttgat-cctttaacttatttccgtcac 36344247  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||| ||||| ||   ||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||||    
T  36344246 acattttggtcaattcctttaattttgattcaaaaacattaaattttcttcatttt 36344191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 744 - 862
Target Start/End: Original strand, 410405 - 410522
Alignment:
Q  744 tagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaa 843  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||  ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  410405 tagtatcgcgttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctcc-ttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaa 410503  T
Q  844 aacgttagggtttcttcat 862  Q
    || |||||| |||||||||    
T  410504 aatgttaggttttcttcat 410522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 702 - 865
Target Start/End: Original strand, 32733699 - 32733867
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttag------gtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaa 795  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||      ||| |||  ||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32733699 attttaggttaaattgtatttttggtctcttaactatttagatttaggtaatattactttggttttttaattaaaatttgatttattttggtcc-tttaa 32733797  T
Q  796 cttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |  ||||||||||| | || |||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  32733798 cttctatacgttacacattttgctcctttccgttaattttaattcaaaaatgttatgttttcttcatttt 32733867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 711 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 44678595 - 44678518
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcc 789  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44678595 taaattgtatttttgttcc-ttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcc 44678518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 729 - 862
Target Start/End: Original strand, 19302206 - 19302338
Alignment:
Q  729 ccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgt 828  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  | |||||||||| ||  ||| |   |||||||||||||||||  |||| |||  ||    
T  19302206 ccttaactattttggtagtatcgttttgg-cccttaattaaatattgatttattttagtatcttaatggtctctctgttacacattgtggtcttttgcgt 19302304  T
Q  829 tagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19302305 tagttttaattcaaaaacgtttgggtttcttcat 19302338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 761 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 26217402 - 26217302
Alignment:
Q  761 cttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26217402 cttaattaaaatttgatttattttgtaccctt-aacttctcttcgttacacattttcgtcatttccattagttttaattcaaaaacgttcggttttcttc 26217304  T
Q  861 at 862  Q
    ||    
T  26217303 at 26217302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 711 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 45436545 - 45436399
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttatttt--ggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  | || ||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||    
T  45436545 taaattacattttttgtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttatttttgggtcccttaactttctctctgtta 45436446  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    ||||||| ||||||||  ||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  45436445 cacattttggtcatttccgttaaatttaatt-aataacgttagggttt 45436399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 827 - 879
Target Start/End: Original strand, 16645663 - 16645714
Alignment:
Q  827 gttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16645663 gttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 16645714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 791 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 11639354 - 11639283
Alignment:
Q  791 tttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11639354 tttaacttctctccgttacatattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagattttcttcat 11639283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 713 - 792
Target Start/End: Original strand, 15740618 - 15740697
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15740618 aattgcctttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtccctt 15740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 711 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 26217484 - 26217404
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtt----taggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtc 788  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26217484 taaattgcattttttgtcccttaactatttaggtaggtagtatcg-tttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtc 26217404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 710 - 856
Target Start/End: Original strand, 29769365 - 29769510
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||  | || ||| |||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  29769365 ttaaattacctttttggtctcttaactatttaattggtttcggtttggttccttaactaaattttgatttattttggtcccttaactttctctttgttac 29769464  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    |  ||| ||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  29769465 aagttttggtcatttccgttaaatttaatt-aaaaacgttagagttt 29769510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 792 - 860
Target Start/End: Original strand, 9495115 - 9495183
Alignment:
Q  792 ttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9495115 ttaacttctctctcttataaattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 9495183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 711 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 11639418 - 11639378
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcg 751  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11639418 taaattgcatttttcgtcccttaactatttaggtagtatcg 11639378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 18623732 - 18623669
Alignment:
Q  751 gctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacattt 815  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  18623732 gctttgatttctaaattaaaattcgatttattttgct-tctttaatttctctctgttacacattt 18623669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 7117162 - 7117111
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  7117162 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttgatcccttaactaaaa 7117111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 771
Target Start/End: Original strand, 43633135 - 43633186
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43633135 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 43633186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 771
Target Start/End: Original strand, 13364043 - 13364112
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13364043 attttaggtttaaatgcgtttttggtcccttaaatatttatttagtatcactttggtcccttaactaaaa 13364112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 707 - 885
Target Start/End: Original strand, 24604874 - 24605049
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24604874 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt--acttctctctgt 24604971  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24604972 tacacgttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 24605049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 707 - 878
Target Start/End: Original strand, 31029523 - 31029692
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  31029523 aggttaaattgcatttttgatcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctgcgt 31029621  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattt 878  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  31029622 tacacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttatggaattt 31029692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Original strand, 33544821 - 33544975
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33544821 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctatctgt 33544919  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33544920 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaaggttaggttttcttcat 33544975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 33329209 - 33329375
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  33329209 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctccccgttaca 33329307  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  33329308 cattttggtcctttctattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttatggaatttt 33329375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Original strand, 3338475 - 3338633
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  3338475 taggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctcttcg 3338573  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3338574 ttacacattttgctcatttccgttagttttaattcaaaaacgttacgttttcttcatttt 3338633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 9173904 - 9174054
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9173904 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctttctgttaca 9174002  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9174003 cattttggtcctttatgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcatcat 9174054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 3288933 - 3289105
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||    
T  3288933 taaattgcatttatggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccc-ctaacttctctccattaca 3289031  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3289032 cattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggtttttttca-ttttcttctggaatttttctggg 3289105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 707 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 25551723 - 25551572
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  25551723 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctcttcgt 25551625  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25551624 tacacatttaggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttctt 25551572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 29009957 - 29010123
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||||    
T  29009957 taaattgaatttttggtcccttaactatttacgtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgaattatttcggtccc-ttaacttctctccgctaca 29010055  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  29010056 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 29010123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 35132604 - 35132754
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  35132604 taaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttggtcccataattaaaattagatttattttggt-cctttaacttctctctgttgca 35132702  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35132703 cattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 35132754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 703 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 33545213 - 33545052
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33545213 ttttaggctaaattatatttttggtgcattaactatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctct 33545115  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
      ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33545114 tcgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 33545052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 6220439 - 6220273
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6220439 taaattgcatttttaatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccatcaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 6220341  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  6220340 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttatggaatttt 6220273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 3289293 - 3289143
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3289293 taaattgcatttttggtccctaaactatttaggtaatatcgctttggtgccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 3289195  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3289194 cattttggtgttttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 3289143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 24605254 - 24605107
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24605254 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctctgttacaca 24605156  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24605155 ttt-tgtcattttcgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcat 24605107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 14336905 - 14337055
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  14336905 taaattgcatttttgatcccttaattatttagctagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctttgttata 14337003  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14337004 cattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 14337055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 25551350 - 25551522
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  25551350 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattgaaatttgatttattttagtccc-ttaacttttctctgttaca 25551448  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  25551449 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattatgttttcttca-ttttcttgtgaaattttgctggg 25551522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 11525148 - 11524983
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||  |||||||    
T  11525148 taaattgcatttttggtcccttaacaatttaggtagtatcggtttggtcccttatttaaaattcaatttattttggtctc-ttaactt-tccttgttaca 11525051  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11525050 cattttggtcatttccgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 11524983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 713 - 865
Target Start/End: Original strand, 1158593 - 1158746
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1158593 aattacatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttgttacaca 1158691  T
Q  813 tttcggtcattt--atgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | | |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1158692 tgttggtcctttccgtgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 1158746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 1860868 - 1860716
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||    
T  1860868 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggt-gtatctctttggtcccttaattaaaattcgatttatttgggttcctt-aacttctcttcgttaca 1860771  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1860770 cattttggtcatttccgttagtcttaattcaaaaacgttaagttttcttcatttt 1860716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 12903224 - 12903374
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||    
T  12903224 taaattgtatttttggttctttaattatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttatctccattaca 12903322  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12903323 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 12903374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 31029907 - 31029757
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  31029907 taaattgcatttttggtcccttaaccatttaaatagtattgttttagtcccttaactaaaattcgatttattttggtcc-tttatcttttctctgttaca 31029809  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31029808 cattttgatcatttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 31029757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 33346481 - 33346631
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33346481 taaatttcattttggatcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 33346579  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | || |||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33346580 cattttgatcctttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttctcttcat 33346631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 35119194 - 35119044
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  35119194 taaatttcattttggatcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-ccattaatttctctccgttaca 35119096  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35119095 cattttggtcctttctgttaattttaattcaaaaacgttaggttatcttcat 35119044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 719 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 3338850 - 3338710
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3338850 atttttggtcccttaactatttaagtagtatcgttttgatcccttaattaaaattcgatttattttggt-tctttaacttctatctgttacacattttgg 3338752  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||  ||  |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  3338751 tc--tttcgttagttttaattcgaaaaggttaggttttcttcat 3338710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 7537989 - 7537838
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttg-gtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  7537989 taaattgcatttttttgtcccttaactatttaagtggtatcgcttttgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccat-aacttctctcggttac 7537891  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7537890 acattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcat 7537838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 14337284 - 14337119
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  14337284 taaattgcattttta-tcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttagttaaaatttgatttattttggtccc-ttaaattctttccgttaca 14337187  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  14337186 cattttggtcttttccgttaattttaattcaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctggaatttt 14337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 700 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 19135840 - 19135677
Alignment:
Q  700 aaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttc 799  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19135840 aaatgttaggctaaattgcatttttggtccattaagtatttaggtagtatcgttttgatctcttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttc 19135742  T
Q  800 tctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattt 864  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||   |||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  19135741 tctccgttacacatgttggtcctttccattagttttaattaaaaaacgttcggttttctttattt 19135677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 721 - 845
Target Start/End: Original strand, 11524778 - 11524901
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  11524778 ttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacctctctccgttacacattttagtc 11524876  T
Q  821 atttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
     ||| |||| |||||||||||||||    
T  11524877 ctttctgttggttttaattcaaaaa 11524901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 704 - 850
Target Start/End: Original strand, 6220052 - 6220197
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6220052 tttagtttaaattgtatttttggtcccttaactatttaattaatatcgctttcgtctcttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctccc 6220150  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  6220151 tgttacacattttggtcctttccgttagttttcattcaaaaacgtta 6220197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 702 - 862
Target Start/End: Original strand, 2949290 - 2949444
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||       
T  2949290 attttaggctaaattgcattttttgtccgttaactatttaagtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-ccattaactt--- 2949385  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
      |||||||||||| |||| |||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2949386 --tgttacacattttggtcctttccagtagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 2949444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 719 - 879
Target Start/End: Original strand, 13155850 - 13156008
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||||| |     
T  13155850 atttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcgc-ttaacttctttccgttacacattttga 13155948  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||||  ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  13155949 ccatttccgtttgttttaattcaaattcgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttt 13156008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 719 - 879
Target Start/End: Original strand, 13160706 - 13160864
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||||| |     
T  13160706 atttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcgc-ttaacttctttccgttacacattttga 13160804  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||||  ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  13160805 ccatttccgtttgttttaattcaaattcgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttt 13160864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 753 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 33972547 - 33972417
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||       
T  33972547 tttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccctt-aacttctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttgaa 33972449  T
Q  853 gtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33972448 ttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 33972417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 704 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 1158979 - 1158824
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | || ||||    
T  1158979 tttaggctaacttgcatttttggtaccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaatt-aaatttgatttattttggtccctt--aattatctc 1158883  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  1158882 cgttatacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtttcgttttcttcat 1158824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 13156220 - 13156072
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||  |||    
T  13156220 ggttaaattacattttttgtcccttaactatttaggtagtat-----tggtcccttaattaaaattcgatttattttgatccctt-aatttttcttcgtt 13156127  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13156126 acatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 13156072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 13161076 - 13160928
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||  |||    
T  13161076 ggttaaattacattttttgtcccttaactatttaggtagtat-----tggtcccttaattaaaattcgatttattttgatccctt-aatttttcttcgtt 13160983  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13160982 acatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 13160928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 29010337 - 29010187
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||    
T  29010337 taaattgcatttttggttccttgactatttatgtagtatcgctgtggtcccttaactaaaattcgatttattttgg-ccccttaacttccatccattaca 29010239  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29010238 cattttggtccattctgttaattttaattcaaaaacattaggttttcttcat 29010187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 753 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 2949632 - 2949508
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  2949632 tttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctctt-aacttctctctgttacacattttggtccttatggttagttttaattcaacaacgttagg 2949534  T
Q  853 gtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    
T  2949533 ttttcttca-ttttcttctagaatttt 2949508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 720 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 24548615 - 24548485
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  24548615 tttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatc-ttaacttctctgagttacacattttggt 24548517  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24548516 ccttttcgttagttttaattcaaaaacgttag 24548485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 35132973 - 35132818
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||           |||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  35132973 taaattgtattttcggtcccttaactatttaggtagtaccgctttggtcccttaatt-----------tattttggtccctt-aacttctctccgttata 35132886  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  35132885 cattttggtcctttctattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttt 35132818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 711 - 792
Target Start/End: Original strand, 11524708 - 11524789
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11524708 taaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccctt 11524789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 17544840 - 17544683
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | || |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||| || |    
T  17544840 taggttaaattgcatttttg-tcccgtaactattttgctaatatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttgattttctatc-g 17544743  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17544742 ttacatattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcatttt 17544683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 24548244 - 24548394
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||  |||||    
T  24548244 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgcttttgagccttagttaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-cttaca 24548342  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24548343 cattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 24548394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 720 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 2814685 - 2814560
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | |    
T  2814685 tttttggtctcttaactatttaattagtatcgctttggttctttaattaaaatttgatttattttggtttc-ttaacttctctctgttacacattttgat 2814587  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaac 846  Q
      |||  ||||||||||||||||||||    
T  2814586 tctttccgttagttttaattcaaaaac 2814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 711 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 17245707 - 17245609
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17245707 taaattgcatttttggtcccttaattatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttac 17245609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 719 - 824
Target Start/End: Original strand, 32283037 - 32283141
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |     
T  32283037 atttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatc-ttaacttctctccgttacacattttga 32283135  T
Q  819 tcattt 824  Q
    ||||||    
T  32283136 tcattt 32283141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 738 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 12903567 - 12903441
Alignment:
Q  738 tttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaa 837  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| || | ||||||  ||| |||  |||||||||||    
T  12903567 tttaggtagtatccctttggtcctttaattaaaattcgaattattttgattcc-ttaacttctctccgtaatacattttagtcctttccgttagttttaa 12903469  T
Q  838 ttcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  12903468 ttcaaaaatgttagattttcttcatttt 12903441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 711 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 6229769 - 6229672
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6229769 taaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtccct-aactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttac 6229672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 707 - 773
Target Start/End: Original strand, 33971927 - 33971993
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatt 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  33971927 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgtttttatcccttaattaaaatt 33971993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 721 - 862
Target Start/End: Original strand, 2315592 - 2315732
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||  ||||| |||| ||||    
T  2315592 ttttggtttcttaactatttaattagtatcgctttggtcgcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-cttacatattttggtc 2315690  T
Q  821 atttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2315691 ctttccgttagttttaattcaaaaacgtttggttttcttcat 2315732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 730 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 29999767 - 29999653
Alignment:
Q  730 cttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgtt 829  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||    
T  29999767 cttaactatttaattagtatcgctttagtcccgtaattaaaatttgatttattttggtatctt-aacttctatctgttacacattttagtcctttctgtt 29999669  T
Q  830 agttttaattcaaaaa 845  Q
    | ||||||||||||||    
T  29999668 acttttaattcaaaaa 29999653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Original strand, 17544454 - 17544606
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||| |  |||| || |||    
T  17544454 ggttaaattgcatttttg-tcccttaactattttgctaatatcgctttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtatcttaattttctatc-gtt 17544551  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||   || |||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  17544552 acacattttaatcctttacgttagttttgattcaagaatgttagagtttcttcat 17544606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 789 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 33329512 - 33329442
Alignment:
Q  789 cctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33329512 cctttaacttctctctgttgcacattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttctt 33329442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 710 - 866
Target Start/End: Original strand, 31754206 - 31754361
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||  |||||| || ||||||||| |||  ||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||||    
T  31754206 ttaaattatattttttgttccttaactgattatatagaatcgttttggtctcttaattaaaattctatttattttaatctctt-aacttctctccgttac 31754304  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattttt 866  Q
      |||| || | |||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31754305 ttattttggacctttccattagttttaattcaaaaacgttatgttttcttcattttt 31754361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 711 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 33548240 - 33548173
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatt 778  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  33548240 taaattgaatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggccccttaattaaaatttgatt 33548173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 765 - 849
Target Start/End: Original strand, 33972260 - 33972344
Alignment:
Q  765 attaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtt 849  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||  ||| |||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  33972260 attaaaattcgatttattttttttcccataatttctctctgttacacattttagtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 33972344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 709 - 861
Target Start/End: Original strand, 34181898 - 34182050
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||| | |||| ||| |||  | | | |||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||| || ||||    
T  34181898 gttaaattttatttttgatcccttaactattttgctagtttcgttttagttcttcaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatccgtta 34181997  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    ||||||| |||||||||   || ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34181998 cacattttggtcatttacaataattttaattcaagaacgttaaggtttcttca 34182050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 744 - 824
Target Start/End: Original strand, 7162399 - 7162479
Alignment:
Q  744 tagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcattt 824  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7162399 tagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccgttgcacattttggtcattt 7162479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 806 - 862
Target Start/End: Original strand, 29999510 - 29999566
Alignment:
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29999510 ttacatattttggtcattttcgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcat 29999566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 741
Target Start/End: Original strand, 33548121 - 33548160
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgttta 741  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33548121 attttaggctaaattgcatttttggtcccttaactattta 33548160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 547 - 604
Target Start/End: Original strand, 2428028 - 2428085
Alignment:
Q  547 ataattattttatacatgtatttaacgatgtgctatcatatcaattaatgaatatgac 604  Q
    |||||||||||| ||||| || | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2428028 ataattattttacacatgcatcttatgatgtgttatcacatcaattaatgaatatgac 2428085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 6e-61; HSPs: 95)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 712 - 879
Target Start/End: Original strand, 33625868 - 33626033
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33625868 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttatctctgttacac 33625966  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33625967 attttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 33626033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 704 - 879
Target Start/End: Original strand, 46620923 - 46621096
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46620923 tttaggtcaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctc 46621021  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  46621022 cgttacacattttggtcatttccgttatttttaattcaaaaacgttaggttttcttcattttt-ttctggaatttt 46621096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Original strand, 52914950 - 52915108
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52914950 taggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctg 52915048  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52915049 ttacacattttggtcctttcggttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 52915108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Original strand, 25218084 - 25218237
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25218084 ggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtccc-ttaacttctctctgtt 25218182  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25218183 acacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 25218237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 708 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 1157592 - 1157417
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  1157592 ggttaaattgtatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttttctccgtt 1157494  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  1157493 acacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttttctggg 1157417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 711 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 21218230 - 21218091
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21218230 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 21218132  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21218131 cattttggtcatttcagttagttttaattcaaaaacgttag 21218091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Original strand, 45911579 - 45911732
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  45911579 ggttaaattgcatttttggttcattaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgtt 45911677  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45911678 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 45911732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 711 - 861
Target Start/End: Original strand, 54136094 - 54136243
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  54136094 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgat-cctttaatttctctctgttaca 54136192  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54136193 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttca 54136243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 21217850 - 21218016
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  21217850 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctttccgttaca 21217948  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21217949 cattttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttaggttttcttca-ttttcttctagaatttt 21218016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 32384656 - 32384806
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  32384656 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggt-tctttaacctctttctgttaca 32384754  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32384755 cattttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 32384806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 33626247 - 33626097
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33626247 taaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 33626149  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33626148 cattttggtcttttccgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcat 33626097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 712 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 33882331 - 33882166
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  33882331 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttttctccgttacac 33882233  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  33882232 attttggtcctttccgttagtcttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggattttt 33882166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 707 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 46621314 - 46621157
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46621314 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaattcgatttattttggt-cctttaatttctctctgt 46621216  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  46621215 tacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcatttt 46621157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 709 - 885
Target Start/End: Original strand, 1205379 - 1205552
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1205379 gttaaattgcacttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaactt-tctctgtta 1205476  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  1205477 cacatttcgatcattgccgttagttttaattaaaaaacattgggttttcttca-ttttcttctgaaatttttctggg 1205552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 29864179 - 29864329
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29864179 taaattgcattttttatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttttctctgttaca 29864277  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29864278 catgttggtcctttctgttagttttaattcaaaaaggttaggttttcttcat 29864329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 29864558 - 29864404
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  29864558 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctatctgttaca 29864460  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattttt 866  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  29864459 cattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttattcattttt 29864404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 705 - 879
Target Start/End: Original strand, 25058830 - 25059002
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  25058830 ttaggttaaattgcattttttgtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctc-ttaacttctctat 25058928  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  25058929 gttacacattttgctcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagcttttcttca-ttttcttctggtatttt 25059002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 707 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 34959218 - 34959061
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  34959218 aggttaaattgcaattttggtcccttaactatttaggtattatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggt-tctttaatttctttctgt 34959120  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34959119 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcatttt 34959061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 722 - 884
Target Start/End: Original strand, 4965885 - 4966042
Alignment:
Q  722 tttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtca 821  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4965885 tttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttgctcccttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctctgttacacattttggtca 4965983  T
Q  822 tttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||| ||||    
T  4965984 tttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttc----attttcttctggaatttttctgg 4966042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 9010503 - 9010658
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9010503 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctttg 9010601  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  9010602 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattaggtttgcttcat 9010658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 707 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 24504327 - 24504157
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24504327 aggttaaattacatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgttttagtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgt 24504229  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  24504228 tacacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagtttttcttca-ttttcttcttgaatttt 24504157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 710 - 865
Target Start/End: Original strand, 29970195 - 29970348
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  29970195 ttaaattgcatttttggtcccataactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggt--cattaacttatctccgttac 29970292  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29970293 acattttggtcttatccgttagttttaattcaaaaacgttaggctttcttcatttt 29970348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 40067731 - 40067565
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||    
T  40067731 taaattgtatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcaatttattttggttcc-ttaacttcttcctgttaca 40067633  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  40067632 cattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 40067565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 709 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 8247131 - 8246958
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  8247131 gttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtaatatttctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccctta 8247033  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
     ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  8247032 aacattttcgtcatttctgttatttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttttctgg 8246958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 10014468 - 10014617
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10014468 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaat-cgatttattttgatccatt-aacttctctctgttaca 10014565  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10014566 cattttggtcatttcggttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 10014617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 10021609 - 10021758
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10021609 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaat-cgatttattttgatccatt-aacttctctctgttaca 10021706  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10021707 cattttggtcatttcggttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 10021758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 18862824 - 18862670
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt-ctctctgttac 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18862824 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcctttaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttgctctctgttac 18862726  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || |||  |||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18862725 acctttttgtccattccgttagttttaattaaaaaacgttaggatttcttcatttt 18862670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Original strand, 2738880 - 2739033
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  2738880 ggttaaattgcatttttgatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctatt 2738978  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2738979 acacattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaatattaggttttcttcat 2739033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 25593474 - 25593302
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  25593474 taaattgtattttttgtcccttaactatttagggagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctttccgttaca 25593376  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  25593375 cattttggtcatttccgttagttttaatttaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttttctggg 25593302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 45911957 - 45911785
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  45911957 taaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttatcttctctctgttaca 45911859  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  45911858 cattttggtcttttccgttagttttaatttaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctgaaatttttctggg 45911785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 699 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 43317274 - 43317091
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43317274 taaattataggctaaattgcatttttagtctcctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-cctttaactt 43317176  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||  |||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  43317175 ctctctattacacattttggtcctttccgttaattttaattgaaaaacgttaggtttccttca-ttttcttctgaaatttttctgg 43317091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 52915333 - 52915178
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttg--gtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52915333 taggctaaattgcattttttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctc 52915235  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52915234 cgttacacattttggtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttc 52915178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 34958835 - 34958987
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||    
T  34958835 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgttcc--ttaacttatctctgttaca 34958932  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  34958933 caatttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggtttttttcatttt 34958987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 40067351 - 40067501
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40067351 taaattgtattttttgtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctttctgttaca 40067449  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40067450 cattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttatgttttcttcat 40067501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 44710406 - 44710556
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  44710406 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaacaaaaatttgatttattttgatccc-ttaacttctctccgttaca 44710504  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44710505 cattttggtcctttctgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 44710556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 707 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 22831185 - 22831008
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||| ||  |    
T  22831185 aggttaaattggatttttggtcccttaactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatccat 22831086  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22831085 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca-ttttcttctgaaattttcctggg 22831008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 719 - 885
Target Start/End: Original strand, 27347608 - 27347772
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  27347608 atttttggtcccttgactatttagatagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctcttcgttacacattttgg 27347706  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  27347707 tcctttccattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctagaatttttctggg 27347772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Original strand, 1157203 - 1157359
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttta--acttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  1157203 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtaatatcgctttggttccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaagtacttctctctg 1157302  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1157303 ttacacattttggtcctttctgttaattttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 1157359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 730 - 875
Target Start/End: Complemental strand, 25218448 - 25218305
Alignment:
Q  730 cttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgtt 829  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  25218448 cttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccatt-aacttctctctgttacacattttggtcatttccgtt 25218350  T
Q  830 agttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaa 875  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  25218349 agttttaattcaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctggaa 25218305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 27347978 - 27347830
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27347978 aattgcattttatgttccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttacaca 27347880  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27347879 ttttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 27347830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 706 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 32385199 - 32385029
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||  | |    
T  32385199 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttt-atcccttaactaaaatttgatttattttggttcc-ttaacttcttcccg 32385102  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  32385101 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 32385029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 712 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 44710785 - 44710620
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44710785 aaattgcatttttgatcccttaagtatttatgtagtatcgttttggttccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacac 44710687  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||  ||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  44710686 attttagtccttttcgttggttttaattcaaaaaagttagattttcttca-ttttcttctggaatttt 44710620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 45683120 - 45683270
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45683120 taaattacatttttgatctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaagtaaaatttgatttattttgatccctt-aacttctctctgttaca 45683218  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45683219 cattttggtcctttttgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcat 45683270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 720 - 851
Target Start/End: Original strand, 53645463 - 53645593
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  53645463 ttttttgtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcggtttattttggt-cctttaacttctctccgttacacattttggt 53645561  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  53645562 catttccgttagttttaattcaaaaacgttag 53645593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 719 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 9010880 - 9010735
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||    
T  9010880 atttttggtcccttaactatttaggtagtatctctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttacatattttgg 9010782  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | | ||  |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  9010781 ttacttccgttagttttaattcaaaaacataaggttttcttcatttt 9010735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 713 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 12381435 - 12381298
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12381435 aattgtatttttggtccctaaactatttaggcaatatcgctttcatcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttgttacaca 12381337  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12381336 ttttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 12381298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 707 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 37515840 - 37515687
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  37515840 aggttaaattttatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctatttgt 37515742  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    ||||||||| ||||| ||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37515741 tacacattttggtcaattccattagttttaattaaaaaacgttagactttcttca 37515687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 703 - 865
Target Start/End: Original strand, 38866393 - 38866554
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||      
T  38866393 ttttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaactaaaatttgatttattttggttcc-ttaacttcttc 38866491  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  38866492 ccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacctcaggttttcttcatttt 38866554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 704 - 862
Target Start/End: Original strand, 43316876 - 43317032
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||     
T  43316876 tttaggctaaattgtatttttggtcc-ttaactattaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattttatttattttggtccc-ttaacttatctt 43316973  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43316974 tgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 43317032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 45683500 - 45683328
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  45683500 taaattgtatttttggttccttaactatttaggtaatattgctttggttccttaactaaaatttgatttattttggtcc-tttaacttatctccgttaca 45683402  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  45683401 cattttggtcctttcggttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttatggaatttttctggg 45683328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 707 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 4793985 - 4793830
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||  | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4793985 aggttaaattgtatttttgaccccttat-tatttaggtagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctccgt 4793888  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattt 864  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4793887 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttaattt 4793830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Original strand, 22830801 - 22830950
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||| ||||||||    
T  22830801 aattggatttttggtcccttaactattttgctagtatagctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccgttacaca 22830900  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22830901 ttttggtcctttatgttagttttaattcaaaaatgttagggtttcttcat 22830950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 711 - 835
Target Start/End: Original strand, 46200487 - 46200610
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46200487 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 46200585  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagtttt 835  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||    
T  46200586 cattttggtcctttccgttagtttt 46200610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28570804 - 28570666
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28570804 taaattgcatttttgatcacttaactatttaggtggtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-cctttaacttctatctgttaca 28570706  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28570705 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaaagtta 28570666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 706 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 10014851 - 10014676
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||    
T  10014851 taggctaagttgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatctc-ttaacttctctttg 10014753  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  10014752 ttacacattt-ggtcatttccgttagttttaattcaaacacgttagcttttcttta-ttttcttctggaatttttctgg 10014676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 706 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 10021992 - 10021817
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||    
T  10021992 taggctaagttgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatctc-ttaacttctctttg 10021894  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  10021893 ttacacattt-ggtcatttccgttagttttaattcaaacacgttagcttttcttta-ttttcttctggaatttttctgg 10021817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 38866786 - 38866632
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  38866786 ggttaaattgtatttttgattccttaactatttaggtagtatcgctttggtactctaattaaaattcgatttatttttgatcctttaacttctttctgtt 38866687  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||    
T  38866686 acacattttggtcatttatgttagttttaaataaaaaacattagcttttcttcat 38866632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 712 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 44433006 - 44432857
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44433006 aaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcactttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctttgttacac 44432908  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  44432907 attttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgtcagattttcttcat 44432857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 4966257 - 4966101
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||     
T  4966257 ttagggtaaattgcatttcttgccccttaactatttaggtggtatcgttttgattccttaattaaaattcgatttatttttgtctc-ttaacttctctcc 4966159  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4966158 attatacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 4966101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 1205760 - 1205613
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||    
T  1205760 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggcagtatcgcttttctcccttaattaaaattcgatttatttttgtccc-ttaccttctttccgttaca 1205662  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    ||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1205661 cattttggtcttttccattagttttaattcaaaaacgttatgttttctt 1205613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 21051362 - 21051528
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  21051362 taaattacattttttgtcccttaattatttaggtagcatcgctttgatctcttaactaaaatttgatttattttggt-ccattaacttctatccgttaca 21051460  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21051461 cattttggtcatttccgttaaatttaattcaaaaacgttaggttttcttcattttt-ttctggattttt 21051528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 46200868 - 46200702
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |  |||||     
T  46200868 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtaacgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctc-ttaacttcttttcgttacg 46200770  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  46200769 cattttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 46200702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 46535526 - 46535691
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||  | ||    
T  46535526 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttcc-ttagtttct-tctcgttca 46535623  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46535624 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcattttt-ttctgaaatttt 46535691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 8751290 - 8751440
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  8751290 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtataattttggtcccttaactaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctccgttaca 8751388  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | || ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  8751389 cattttgatcctttctgttagttttaattaaaaaacgttagattttcttcat 8751440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 850
Target Start/End: Original strand, 48209951 - 48210089
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||    
T  48209951 taaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgat-cctttaacttctctcccttaca 48210049  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  48210050 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaaggtta 48210089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 707 - 855
Target Start/End: Original strand, 15985465 - 15985613
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  || |||||      
T  15985465 aggttaaattgcatttttggtctcttaactattttgctagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttttctctaa 15985564  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtt 855  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15985565 tacacattttggtcctttacgttagttttaattcaaaaacgttagggtt 15985613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 705 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 11102364 - 11102218
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |  |||||||     
T  11102364 ttaggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtatcttaactttctctcc 11102265  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11102264 gttacacattttggtcatttacgttagttttaattcaaaaatgttag 11102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 758 - 862
Target Start/End: Original strand, 54191638 - 54191741
Alignment:
Q  758 tcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttc 857  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54191638 tcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctccgttacacattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttc 54191736  T
Q  858 ttcat 862  Q
    |||||    
T  54191737 ttcat 54191741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 753 - 879
Target Start/End: Original strand, 44428616 - 44428740
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44428616 tttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccctt-aacttctctttgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 44428714  T
Q  853 gtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    
T  44428715 ttttcttca-ttttcttctagaatttt 44428740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 708 - 852
Target Start/End: Original strand, 25977768 - 25977912
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttt-tggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25977768 ggttaaattgtattttttggtcccttaactatctaggtactatcgctttggtctctcaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctccgt 25977866  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| |||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  25977867 tacatattttggtcttttccattagttttaattcaaaaacgttagg 25977912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 704 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 43969917 - 43969763
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |     
T  43969917 tttaggctaaattttatttttggttcgttaactatttatgtagtatcgttttgatcccttgattaaaattcgatttactttggtccc-ttaacttctttt 43969819  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    ||||| |||||| | || |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43969818 tgttatacattttgatcctttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttctt 43969763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 711 - 858
Target Start/End: Original strand, 44169982 - 44170129
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||| |  |||| || ||||||    
T  44169982 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttgattaaaatttgatttattttagtatcttaactttctatccgttaca 44170081  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttct 858  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44170082 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttatggtttct 44170129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 46535905 - 46535755
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| || |    
T  46535905 taaattgtatttttggtcacttaactatttaggtagtattgttttggtcctctaattaaaattctatttatcttggt-cctttaacttctttctggtata 46535807  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  46535806 cattttggtcctttctgttagttttaattaaaaaacattaggttttcttcat 46535755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 753 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 21051688 - 21051580
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21051688 tttggtcccttaattaaaattagatttattttggtccctt-aacttctctttattacacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagg 21051590  T
Q  853 gtttcttcat 862  Q
     |||||||||    
T  21051589 ttttcttcat 21051580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 711 - 851
Target Start/End: Original strand, 24503942 - 24504082
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24503942 taaattgcatttttaatcccttaattatttaggtagtattgttttggttctttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctctctgttaca 24504040  T
Q  811 catttcggt-catttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||| | ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24504041 catcttggtccttttccgttagttttaattcaaaaacgttag 24504082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 54136470 - 54136302
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    |||||| ||    
T  54136470 taaattgcaatttttgtcctttaactatttaggtagaattgttttgatcctttaattaaaatttgatttattttggttcc-ttaact----tctgttgca 54136376  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  54136375 tattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattagggttttttca-ttttcttctgaaatttttctggg 54136302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 711 - 866
Target Start/End: Original strand, 9657670 - 9657824
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |  |||||||  |||||    
T  9657670 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatatcttaactttctctc-cttaca 9657768  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattttt 866  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  9657769 cattttagtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttattttcattttt 9657824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 11242847 - 11242702
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||| |    
T  11242847 taaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtccc-ttaatttctttccgttata 11242749  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||| ||| ||     ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11242748 tattttggttat-----ttccttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 11242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 8246772 - 8246920
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | ||||| || ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  8246772 taaattgtatttttggtcc-ttaattatttagataatatcattttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatccctt-aacttctctc-gttaca 8246868  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8246869 cattttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggtttttttcat 8246920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 15985846 - 15985679
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatccc-ttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||  ||| |  |||| ||||||||    
T  15985846 taaatagcatttttagtctcttaactattttgctagtatcgttttggtccccttaattgaaatttgatttatcttggtatcttaactttctatctgttac 15985747  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15985746 acattt-gattatttttgttagttttaattaaaaaacgttagggtttcttca-ttttcttctgaaatttt 15985679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 702 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 44170373 - 44170196
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaac-ttct 800  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||    
T  44170373 attttagactaaattgcatttttgatcccttaactatttaattagtattgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggt-attttaactttct 44170275  T
Q  801 ctctgttacaca--tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     || | |||| |  ||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  44170274 atccg-tacatattttttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttagagttttttca-ttttcttctggaatttt 44170196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 54191967 - 54191802
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||    
T  54191967 taaattgtatttttggtcccttaactatttagatagcatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-tcattaacttctccccattaca 54191869  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||   ||||||| |||| ||||| |||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  54191868 cattttggtccttt-ccttagtttcaattaaaaaatgttagattttcttca-tgttcttctgaaatttt 54191802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 711 - 792
Target Start/End: Original strand, 44428516 - 44428597
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44428516 taaattgcatttttgataccttaactatttaggtattatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccctt 44428597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 744 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 21885174 - 21885054
Alignment:
Q  744 tagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaa 843  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||| |||||| |||| |||  |||| ||||||||||||    
T  21885174 tagtatcgctttggtcacttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaatttctatccgttaaacattttggtcctttccgttacttttaattcaaa 21885076  T
Q  844 aacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||| || |  ||||||||||||    
T  21885075 aacatttgattttcttcatttt 21885054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 707 - 824
Target Start/End: Original strand, 37515528 - 37515643
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  37515528 aggttaaattgcatttttgtttc-ttaactatttaggtagtatcccgttgatcctttaattaaaatttaatttatttttgtccc-ttaacttctcttcgt 37515625  T
Q  807 tacacatttcggtcattt 824  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  37515626 tacacatttggatcattt 37515643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 719 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 9658022 - 9657880
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||||||  |||||||||| ||    
T  9658022 atttttgatcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccctaattaaaatttaatttattttggtatcttaactttctctc-cttacacattttgg 9657924  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |  |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9657923 ttctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttatcttcat 9657880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 761 - 862
Target Start/End: Original strand, 42779573 - 42779673
Alignment:
Q  761 cttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| || || || ||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42779573 cttaattaaaattcgatttattttaatccgtt-aatttatctttgttacacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 42779671  T
Q  861 at 862  Q
    ||    
T  42779672 at 42779673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 711 - 749
Target Start/End: Original strand, 10017818 - 10017856
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtat 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10017818 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtat 10017856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 792 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 29970495 - 29970425
Alignment:
Q  792 ttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  29970495 ttaacttctctctgttacacattttggagctttccgttagttttaattcaaaatcgttaagttttcttcat 29970425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Original strand, 28504590 - 28504640
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  28504590 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttgatcccttaactaaaa 28504640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 582 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 29276296 - 29276234
Alignment:
Q  582 tcatatcaattaatgaatatgacggctcatatgtttaaatattaattaattgatgtgataaca 644  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| |||| ||||    
T  29276296 tcatgtcaattaatgaatatgacagctcatatgctaccatattaattaattgaagtgacaaca 29276234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 41610578 - 41610528
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  41610578 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttgatcccttaactaaaa 41610528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 711 - 765
Target Start/End: Original strand, 43969557 - 43969611
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaa 765  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  43969557 taaattgtatttttggtcccttaattatttatgtagtattgctttggtcccttaa 43969611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Original strand, 46307569 - 46307619
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  46307569 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttgatcccttaactaaaa 46307619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 711 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 29970555 - 29970511
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttg 756  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  29970555 taaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcgttttg 29970511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 129)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 54107672 - 54107844
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  54107672 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctccgttaca 54107770  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  54107771 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttca-ttttcttctgaaatttttctggg 54107844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 698 - 878
Target Start/End: Original strand, 40410702 - 40410880
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact 797  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40410702 ttaaaattaaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaact 40410800  T
Q  798 tctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattt 878  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40410801 tctctttgttacacattttggttatttccgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaattt 40410880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 4846984 - 4846826
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  4846984 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ataacttctctctg 4846886  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4846885 ttacacattttggccatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 4846826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 703 - 865
Target Start/End: Original strand, 41208396 - 41208557
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41208396 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctct 41208494  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | ||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41208495 ccgttgcacattttggtcatttccgttagatttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 41208557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 45871700 - 45871866
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  45871700 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaaattctctctgttata 45871798  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  45871799 catttgggtcatttccgttagttttaattaaaaatcgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttt 45871866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 12123467 - 12123309
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  12123467 taggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctttccg 12123369  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12123368 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaagcgttaggttttcttcatttt 12123309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 41997822 - 41997994
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41997822 taaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtccc-ttaacttctctctattaca 41997920  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  41997921 cattttggtcatttttgttagttttaattcaaaaacgttaggtttacttca-ttttcttctggtatttttctggg 41997994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 15862185 - 15862351
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15862185 taaattccattttaggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttgttaca 15862283  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15862284 cattttggtcatttctattagttttaattcaaaaacattaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 15862351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 50819600 - 50819434
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  50819600 taaattgcatttttggtctcttaactgttaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttt-acttctatgtgttaca 50819502  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  50819501 cattttcgtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctgaaatttt 50819434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 50856264 - 50856430
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  50856264 taaattgcatttttggtctcttaactgttaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttt-acttctatgtgttaca 50856362  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  50856363 cattttcgtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctgaaatttt 50856430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 26332322 - 26332475
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26332322 taaattgcatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaatttcaatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 26332420  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26332421 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcatttt 26332475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 707 - 885
Target Start/End: Original strand, 34629981 - 34630157
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  34629981 aggttaaattatatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-ccattaacttctctccgt 34630079  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34630080 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 34630157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 10756721 - 10756886
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10756721 taaattgtatttttggtcccttagctatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 10756819  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| | |  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  10756820 cattttgttgctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt--ttctggaatttt 10756886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 706 - 851
Target Start/End: Original strand, 34521264 - 34521408
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34521264 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctg 34521362  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  34521363 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaatgttag 34521408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 45171450 - 45171284
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||    
T  45171450 taaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaatttctttccattaca 45171352  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  45171351 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggagtttt 45171284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 44069506 - 44069356
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44069506 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctttctgttaca 44069408  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44069407 cattttggtcctttctattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 44069356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 8846459 - 8846287
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  8846459 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcacttaactaaaattccatttattttggt-cttttaacttctctttgttaca 8846361  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  8846360 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagattttcttca-ttttcttctagaatttttctggg 8846287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 26332711 - 26332551
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccct----ttaacttct 800  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  26332711 ttaggctaaattgcatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttaacttct 26332613  T
Q  801 ctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  26332612 ctctgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattaggttttcatcat 26332551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 708 - 879
Target Start/End: Original strand, 54081284 - 54081452
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  54081284 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggcagtatcgctttggtcc-ttaattaaaattcgatttattttagtccctt-aacttctctctgtt 54081381  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||| |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  54081382 acatattttggtcttttctgttagttttaatttaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctgaaatttt 54081452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 54081667 - 54081513
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  54081667 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttctctctgttaca 54081569  T
Q  811 ca-tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  54081568 catttttggtcattttcgttatttttaattcaaaaatgttaggttttcttcatttt 54081513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 54108503 - 54108353
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  54108503 taaattgcatttttggtcccttaattatttagctagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttttctctgttata 54108405  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  54108404 cattttggttatttccgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcat 54108353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 703 - 865
Target Start/End: Original strand, 50819215 - 50819376
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  50819215 ttttaggcttaattgcatttttggtcccttaactatttacgtagcatcgctttcgtcgcttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttatct 50819313  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  50819314 ctgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaagttttcttcatttt 50819376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 703 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 50856649 - 50856488
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  50856649 ttttaggcttaattgcatttttggtcccttaactatttacgtagcatcgctttcgtcgcttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttatct 50856551  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  50856550 ctgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaagttttcttcatttt 50856488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 712 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 7275024 - 7274889
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7275024 aaattgcatttttggtccgttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctct-tgttacac 7274927  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtt 849  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7274926 attttggtcatttcttttagttttaattcaaaaacgtt 7274889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 7743154 - 7742998
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcattttt-ggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||    
T  7743154 taggttaaattacattttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtctc-ataacttatctct 7743056  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7743055 gttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 7742998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 15862564 - 15862408
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15862564 ttaggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatctcttttgtccctttattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctcttt 15862466  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15862465 gttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 15862408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 53841407 - 53841259
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  53841407 aattgcatttttggtcccttaactatttagctagtattgctttggtctcgtaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaatttctctccgttacaca 53841309  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53841308 ttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 53841259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 7950278 - 7950444
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7950278 taaattgcatttttagtcccttaactatttatgtagtattgttttggtctcttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttttctctgttaca 7950376  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  7950377 cattttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 7950444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 702 - 862
Target Start/End: Original strand, 8846070 - 8846229
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8846070 atttttggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtctcttaactaaaattcgattaattttggtccc-ttaacttctc 8846168  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8846169 tttgttacacattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 8846229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 44069126 - 44069292
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||    
T  44069126 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttcttcccgttaca 44069224  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  44069225 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 44069292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 45171066 - 45171221
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  45171066 taggctaaattgtatttctggtcccttaactatttaggtagtattgctttggccccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctaag 45171164  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45171165 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttatgttttcttcat 45171221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 14353430 - 14353281
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14353430 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcattggtcccttaaataaaattcgatttatcttggt-cctttaacttctctccgttaca 14353332  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14353331 cattt-ggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 14353281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 31513866 - 31514016
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31513866 taaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttgattctttaattaaaatttgatttattttggt-cctttaacttctctatgttaca 31513964  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31513965 cattttggtccttccagttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 31514016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 706 - 861
Target Start/End: Original strand, 40926009 - 40926163
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| |    
T  40926009 taggttaaattgcatttttggtcttttaactatttatgtagtatcgctttgatctcttaattaaaatttgatttattttgat-ccattaacttctctccg 40926107  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40926108 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattgaaaaacgttaggttttcttca 40926163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 710 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 34521641 - 34521492
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||    
T  34521641 ttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaatttctttccgttac 34521543  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||||| |||  |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34521542 acattttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttaggttttcttc 34521492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 12123088 - 12123243
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |    
T  12123088 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttctcttcg 12123186  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12123187 ttacacattttggttctttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 12123243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 35753819 - 35753664
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  35753819 taggttaaattacatttttggtaccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaatttaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctcca 35753721  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35753720 tcacatattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 35753664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 7937946 - 7937796
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  7937946 taaatttcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgaattattttggtctc-ttaacttctctccgttaca 7937848  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7937847 cattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttcat 7937796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 28688373 - 28688223
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28688373 taaattacattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctttgttaca 28688275  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | ||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28688274 cgttttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgttagattttcttcat 28688223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 31514250 - 31514093
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  31514250 taggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttttctccg 31514152  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||| || |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31514151 ttacacagtttggtc-tttccgttagctttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 31514093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 707 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 35580336 - 35580210
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35580336 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-cctttaacttctctccgt 35580238  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttt 834  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  35580237 tacacattttggtcattttcgttagttt 35580210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 705 - 866
Target Start/End: Original strand, 14353043 - 14353202
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  14353043 ttaggttaaattgcatttttgatcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtccc-ttaactttcctct 14353141  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattttt 866  Q
    || |||||||| || |||||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14353142 gtgacacattttggccatttccgtcagttttaattcaaaaatgtta-ggtttcttcattttt 14353202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 43899463 - 43899307
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  43899463 ttaggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctcc 43899365  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||| |||| |||| ||   ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  43899364 gttacatattttggtccttaccgttagttttaattaaacaacgttaggttttcttcat 43899307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 711 - 860
Target Start/End: Original strand, 52606132 - 52606279
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  52606132 taaattgcatttt-ggtcccttaactatttatgtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 52606229  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  52606230 cattttggtcatttccgttagttttaaataaaaaacgttaggttttcttc 52606279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 709 - 865
Target Start/End: Original strand, 17273778 - 17273933
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||    
T  17273778 gttaaaatgcatttttggtcccttaactatttaggccgtatcgttttgattccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctcttcatta 17273876  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || |||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17273877 catattttggtctttttcgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcatttt 17273933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 711 - 863
Target Start/End: Original strand, 27940275 - 27940426
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  27940275 taaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaatttaaatttgatttattttggtccc-taaacttctctccgttaca 27940373  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatt 863  Q
    ||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27940374 cattttggtcatttccgttaggttcaattcaaaaacattaggttttcttcatt 27940426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 706 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 41208788 - 41208649
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41208788 taggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtccc-ttaacatctctctg 41208690  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaac 846  Q
    |||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  41208689 ttacacattttggtcctttccgttaattttaattcaaaaac 41208649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 19124192 - 19124342
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||  ||||||    
T  19124192 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtaatattgctttggtcccctaattaaaattcgatctattttgatctc-ttaacttctcttcgttaca 19124290  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19124291 cattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 19124342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 710 - 861
Target Start/End: Original strand, 21169668 - 21169818
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  21169668 ttaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttat 21169766  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
      |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21169767 caattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca 21169818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 701 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 28691506 - 28691364
Alignment:
Q  701 aattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttct 800  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||    
T  28691506 aattttaggttaaattgtattttttgtcccttaattatttaggtagtatcgcttttgtccctaaattaaaatttgatttattttgat-catttaacttct 28691408  T
Q  801 ctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaa 844  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28691407 ctctgttacacattttggtcttttctgttagttttaattcaaaa 28691364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 52268486 - 52268334
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||    
T  52268486 taaattgcatttttggtccattaactatttagttagtatcgttttggtcctttaattaaaattcaatttattttggt--ctttaacttctcttcgttaca 52268389  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  52268388 cattttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttcatttt 52268334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 731 - 885
Target Start/End: Original strand, 27254007 - 27254159
Alignment:
Q  731 ttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgtta 830  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| | | ||||  ||||    
T  27254007 ttaactatttaggcagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttcc-ttaacttctctccgttacacattttgattatttccgtta 27254105  T
Q  831 gttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27254106 gttttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 27254159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 40926393 - 40926223
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  40926393 taaattgcatttttagtcccctaactatttaggtagtatcactttggtccattaattaaaatttgatttattttggtcc--ttaacttcactctgttaca 40926296  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  40926295 cattttggtcatttccgttaattttaattgaaaaacgtta-ggttcctttcattttcttctggaatttttctgg 40926223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 702 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 40639509 - 40639334
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  40639509 attttaggctaaattatgtttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatattggtatctt-aacttctc 40639411  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40639410 tctgttacatattttggtcatttccgtgtgttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 40639334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 707 - 879
Target Start/End: Original strand, 37133276 - 37133446
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||  ||    
T  37133276 aggttaaattatgtttttggtcccttagctatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatc-ttaacttctcttcgt 37133374  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  37133375 tacacattttggtccttttcgtaagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 37133446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 738 - 865
Target Start/End: Original strand, 28688020 - 28688146
Alignment:
Q  738 tttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaa 837  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  28688020 tttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccggtacacattttggtcatttccattagttttaa 28688118  T
Q  838 ttcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||    
T  28688119 ttcaaaaacgttaggtattcttcatttt 28688146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 705 - 879
Target Start/End: Original strand, 46766619 - 46766792
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||| ||     
T  46766619 ttaggttaaattgcatttttggtccttttactattttgctaatatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatcc 46766718  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  46766719 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 46766792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 709 - 862
Target Start/End: Original strand, 2829408 - 2829561
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  2829408 gttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtctcttaattaacatttgatttattttggttttcttaacttctctctgtta 2829507  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2829508 aacattttggtcttttctgctagttttaattcaaaaacattaggttttcttcat 2829561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 706 - 879
Target Start/End: Original strand, 9028189 - 9028360
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| || | |||||| ||  |||    
T  9028189 taggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtccctaagttaaaatttgatttattttgttctc-ttaactccttcctg 9028287  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     ||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9028288 ctacacattttggtatttttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 9028360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 17102387 - 17102537
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17102387 taaattgcatttttggtttcttaattatttaggtaatattgttttcttcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctccctgttaca 17102485  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17102486 tattttgggcatttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 17102537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 40969258 - 40969408
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||| | |||||    
T  40969258 taaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctct-tcttaca 40969356  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40969357 cattttggtcatttccgtcagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 40969408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 722 - 865
Target Start/End: Original strand, 47891527 - 47891669
Alignment:
Q  722 tttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtca 821  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |  ||||||||||| ||||     
T  47891527 tttggtcccttaacaatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatctt-aacttctattcgttacacattttggtcc 47891625  T
Q  822 tttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47891626 tttttgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 47891669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 708 - 879
Target Start/End: Original strand, 53678433 - 53678602
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||| |||    
T  53678433 ggttaaattacgtttttggtcccttaattatttaaatagtatcgctttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtatctt-aacttctctccgtt 53678531  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  53678532 acacattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 53678602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 711 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 51170764 - 51170631
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51170764 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgttttgatcatttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctatgttaca 51170666  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    |||||  ||| |||   |||||||||||| |||||    
T  51170665 cattttagtcttttcaattagttttaattaaaaaa 51170631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 719 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 19124546 - 19124407
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||    
T  19124546 atttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctc-ttgacttttctctgttacacattttgg 19124449  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19124448 ttatttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 19124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 711 - 820
Target Start/End: Original strand, 43899114 - 43899222
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43899114 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtaacatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 43899212  T
Q  811 catttcggtc 820  Q
    ||||| ||||    
T  43899213 cattttggtc 43899222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 702 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 52609754 - 52609642
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  52609754 atttttggctaaattccatttttggtcccttaactatttaggtactatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaatttctc 52609656  T
Q  802 tctgttacacattt 815  Q
    ||||||||| ||||    
T  52609655 tctgttacatattt 52609642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 5348577 - 5348732
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||      
T  5348577 taggttaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtccctcaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-c 5348675  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5348676 ttacacattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagattttcttcat 5348732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 706 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 46767002 - 46766863
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |  ||||||| |    
T  46767002 taggctaaattgtatttttggtcccttaactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttttgtatcttaactttctctccg 46766903  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46766902 ttacacattttggtcatttacgttagttttaattaaaaaa 46766863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 28691117 - 28691270
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||    
T  28691117 taaattgtatttttggtcccttaattatttaggtggtattgctttgttcccttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttttctgcattaca 28691215  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  28691216 cattttgatcctttatgttaattttaatttaaaaacgttagatttttttcatttt 28691270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 719 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 45872064 - 45871935
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  45872064 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcc-ttaaattctctccgttatacatttggg 45871966  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgtt 849  Q
    || |||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  45871965 tcctttccgttagttttaattaaaaagcgtt 45871935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 2829795 - 2829638
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||| | |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  2829795 taggctaaattgcatttttgatcc-ttaactatttatgtattattgatttggtcttttaattaaaatttgatttattttggtccctt-aacttttctccg 2829698  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2829697 ttacatattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 2829638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 738 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 17102733 - 17102607
Alignment:
Q  738 tttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaa 837  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||  |||||||||||    
T  17102733 tttaggtagtatcgctttggtccattaaataaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctctcttatagattttggtcctttccgttagttttaa 17102635  T
Q  838 ttcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  17102634 ttcaaaaacgttagttttttttcatttt 17102607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 710 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 29248692 - 29248542
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||  ||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29248692 ttaaattgtatttatgctcccttaactatttagatagtattactttagtcctttaattaaaatttgatctattttggtccctt-aacttctctccgttac 29248594  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29248593 acaatttggtcaatttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca 29248542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 40969642 - 40969484
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||| |     
T  40969642 taggttaaattatatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttagtctcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctct-tc 40969544  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40969543 ttacacattttggtcctttccgtcagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 40969484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 746 - 885
Target Start/End: Original strand, 53841065 - 53841202
Alignment:
Q  746 gtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | || |||  |||| ||||||||||||||    
T  53841065 gtatcgctttggtcgcttaattaaaattcaatttattttggtccctt-aacttatctctgttgcacattttgatcctttccgttaattttaattcaaaaa 53841163  T
Q  846 cgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  53841164 cgttaggttttcttca-ttttattctggaatttttctggg 53841202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 711 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 10757091 - 10756952
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  10757091 taaattgtattttttgtcctttaactatttaggcagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctc-ttaatttctctccgttaca 10756993  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||| | || |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  10756992 cattttgatcttttccgttaattttaattcaaaaacgttag 10756952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 712 - 844
Target Start/End: Original strand, 22354946 - 22355077
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  22354946 aaattgtatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgttttggttctttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttttctgtgttacac 22355044  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaa 844  Q
    |||| |||| |||  |||| |||||||||||||    
T  22355045 attttggtcctttccgttaattttaattcaaaa 22355077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 711 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 33773174 - 33773022
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||| ||    
T  33773174 taaattgtgtttttggtcccttaactatttaattagtatcactttgatcccttgattaaaatttgatttattttggtatcttaattttctctctgttcca 33773075  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatt 863  Q
     |||| |||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33773074 tattttggtcgtttccgttggttttaatttaaaaacgttagagtttcttcatt 33773022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 753 - 885
Target Start/End: Original strand, 35753477 - 35753606
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  35753477 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctacgtgacacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtta-g 35753574  T
Q  853 gtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     ||||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  35753575 ttttcttcatattt-ttttggaatttttctggg 35753606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 9028574 - 9028424
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || || |||||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| |    
T  9028574 taaattgcatttttggttcattaactattaagctagtattgttttggtcctttaattaaaattcaatttattttggt-cctttaacttctcttcgttata 9028476  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9028475 cattttagttttttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 9028424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 713 - 792
Target Start/End: Original strand, 35753408 - 35753487
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35753408 aattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtttcttaattaaaattcgatttattttggtccctt 35753487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 711 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 588534 - 588384
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||  || |||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |  ||||||||||||||    
T  588534 taaattgcatttttgatatcttaactatttaattaatatcgcttcggttccttaattaaaatttgatttgttttggtatcttaattttctctctgttaca 588435  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  588434 cattttggtcctttacgttagttttaattaaaaaatgttagggtttcttca 588384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 709 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 17274161 - 17274009
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||   ||||    
T  17274161 gttaaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcttttaattaaaattcgaattattttggtctc-ttaatttctcatcgtta 17274063  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||| |||   ||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17274062 cacattttggttcattccgttatttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 17274009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 707 - 824
Target Start/End: Original strand, 33812723 - 33812839
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  33812723 aggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggttctttaattaaaatttgatttattttgat-cctttaacttctatccgt 33812821  T
Q  807 tacacatttcggtcattt 824  Q
    |||||||||  |||||||    
T  33812822 tacacattttcgtcattt 33812839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 47891902 - 47891746
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||| |  |||||||     
T  47891902 ttaggttaaattccatttttgttcctttaactatttaattagtattgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggcatcttaactttctctc- 47891804  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47891803 cttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 47891746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 712 - 864
Target Start/End: Original strand, 49222040 - 49222182
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  49222040 aaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgcttcggtcttttaattaaaattcgatttatttcggt-tcttcaacttctctctgttacac 49222138  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattt 864  Q
    |||| ||||         ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  49222139 attttggtc---------agttttaattcaaaaacattaggttttcttcattt 49222182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 707 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 2078859 - 2078717
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||| | |    
T  2078859 aggttaaattgtatttttagtcccttaactatttaattaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctct-tct 2078761  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2078760 tacacattttagtcttttctgttagttttaattcaaacacgtta 2078717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 5348942 - 5348785
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||| |||||| |||| |||    
T  5348942 ttttttgtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccgtaattaaaatttgatttattttggt-attttaacttttctccgttacatattttggt 5348844  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    | |||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  5348843 cctttccgtgtgttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-tattcttctggaatttt 5348785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 702 - 861
Target Start/End: Original strand, 7742769 - 7742927
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||   |||| |  ||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||    
T  7742769 atttttggttatattgcatttttagtcccttaactatttaggtaacattattttggttacttaattaaaatttgatttattttgttctctt-atcttctc 7742867  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
    |||||| ||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7742868 tctgttgcacattttggtcttttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttca 7742927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 731 - 850
Target Start/End: Original strand, 29248342 - 29248460
Alignment:
Q  731 ttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgtta 830  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||   |||    
T  29248342 ttaactatttaggtggtatcgttttagtcccttaattaaaatttaatttattttggttcctt-aacttctctctgttacacattttggtccttttcatta 29248440  T
Q  831 gttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29248441 gttttaattcaaaaacgtta 29248460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Original strand, 40639116 - 40639270
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||  |    
T  40639116 aggttaaattgcatttttagttctttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-ct 40639214  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40639215 tacaaattttggtcatttccgttggttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 40639270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 711 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 49529203 - 49529105
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  49529203 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttac 49529105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 711 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 13867047 - 13866949
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  13867047 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctcagttac 13866949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 711 - 784
Target Start/End: Original strand, 7937646 - 7937719
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttatttt 784  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7937646 taaattgcatttttggttgcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgattcatttt 7937719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 53310105 - 53309946
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  53310105 taaattgcatttttagtctcctaattatttaggtagtatcactttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccattaca 53310007  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||      ||   |||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  53310006 cattt------ttgccgttaattttaattcaaaaacgtta-attttcttca-ttttcttctggaatttt 53309946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 703 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 41998205 - 41998054
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||           ||  ||||||||||    
T  41998205 ttttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgat-----------cccctaacttctct 41998117  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcat-----ttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |  |||||||||| ||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41998116 ccattacacattttggtcatttccgttacgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttc 41998054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 711 - 835
Target Start/End: Original strand, 51883862 - 51883985
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||||| | |||||    
T  51883862 taaattgcatttttaatcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaactttctct-tcttaca 51883960  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagtttt 835  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  51883961 cattttggtcttttatgttagtttt 51883985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 727 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 53678800 - 53678666
Alignment:
Q  727 tcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttat 826  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||  |||||||||| |||  |||      
T  53678800 tcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-cttacacattttggttctttcc 53678702  T
Q  827 gttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  53678701 gttggttttagttcaaaaacgttaggttttcttcat 53678666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 54247275 - 54247415
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  54247275 taaattgcattttta-tcccttaactatttaaatagtatcgctttggtccattgattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctttccattaca 54247372  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54247373 ---------catttttgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 54247415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 753 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 22444527 - 22444419
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||     
T  22444527 tttggtcccttaattaaaattcgatttatttcggttcctt-aacttctctctgttacatattttggtccttttgtttagttttaattcgaaaacattaga 22444429  T
Q  853 gtttcttcat 862  Q
     |||||||||    
T  22444428 ttttcttcat 22444419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 702 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 38911610 - 38911498
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| |||| | |||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  38911610 attttaggctaaattgtattttttgtcctttaattatttaggtaatattgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggt-tcattaacttttc 38911512  T
Q  802 tctgttacacattt 815  Q
    ||||||||||||||    
T  38911511 tctgttacacattt 38911498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 711 - 856
Target Start/End: Original strand, 50259110 - 50259255
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||  | || ||| |||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  50259110 taaattacatttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgaattattttggtcccttaactttctctttgttaca 50259209  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    ||||| | ||||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  50259210 cattttgatcattttctttaaatttaattaaaaaacgttagggttt 50259255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 7274656 - 7274818
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||           || |||||||||||| ||||||    
T  7274656 taaattgcatttttggtcccttaaatatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaatttgat-----------cccttaacttctctccgttaca 7274744  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     |||| | ||||||   |||| |||||||||||||| ||||  ||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  7274745 gattttgttcatttccattagctttaattcaaaaacattagattttcttca-cgttcttctggaatttttctggg 7274818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 707 - 850
Target Start/End: Original strand, 21918496 - 21918637
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||  ||| |  || ||||  |    
T  21918496 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtccctaaattaaaatttgatttttttttgtatcttaactttatctc-ct 21918594  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21918595 tacacattttgatccttt-cgttagttttaattcaaaaacgtta 21918637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 711 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 33812926 - 33812852
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttg 785  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33812926 taaatttcatttttggtctcttaaatatttaggtagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgatttattttg 33812852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 711 - 809
Target Start/End: Original strand, 44316630 - 44316727
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||  |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  44316630 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttagtcccctaactaaaatttgattta-tttggtcccttaaatttctctctgttac 44316727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 706 - 856
Target Start/End: Original strand, 50393315 - 50393464
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||| | ||||||  ||||||| | ||||  |||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  50393315 taggctaaattacctttttgaccccttaattatttaattagtttcggtttgatcccttaactaaattttgatttattttggtcccttaactttctctctg 50393414  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  50393415 ttacacgttttggtcatttccgttaaatttaatt-aaaaacattagggttt 50393464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 705 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 51311907 - 51311825
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggt 787  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51311907 ttaggctaaattacatttttggtctgttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 51311825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 703 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 51885755 - 51885594
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  |||    ||||||    
T  51885755 ttttaggttaaattatgtttttggtcccttaactatttaattaatatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttagctttctct 51885656  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
     | ||||| |||| |  | |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51885655 -tcttacatattttgaccctttccgtcagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 51885594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 713 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 20963670 - 20963574
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  20963670 aattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctctctgttac 20963574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 879
Target Start/End: Original strand, 2078519 - 2078652
Alignment:
Q  744 tagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaa 843  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||| |  |||||| | |||||||||| |||| |||   |||||||| |||||||    
T  2078519 tagtatcgctctggtcccttaaataaaatttgatttattttgatatcttaactttctct-tcttacacattttggtcctttccattagttttgattcaaa 2078617  T
Q  844 aacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  2078618 aacgttaggttttcttca-ttttcttctcgaatttt 2078652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 720 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 43844473 - 43844359
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||| | |||||||||| |||| || || ||||||| ||||||||||| |||    
T  43844473 tttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaaatttctctccgttacacattttggt 43844374  T
Q  820 catttatgttagttt 834  Q
    |||||  ||||||||    
T  43844373 catttccgttagttt 43844359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 804 - 885
Target Start/End: Original strand, 51311685 - 51311765
Alignment:
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  51311685 tgttacgcattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagagtttcttca-ttttcttctgaaatttttctggg 51311765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 736 - 792
Target Start/End: Original strand, 22444235 - 22444291
Alignment:
Q  736 tgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22444235 tgtttaggtagtatcgatttggtccattaattaaaattcgatttattttgctccctt 22444291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 827 - 879
Target Start/End: Original strand, 22444304 - 22444355
Alignment:
Q  827 gttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22444304 gttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcattttt-ttctggaatttt 22444355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 708 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 49222411 - 49222262
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||| | ||||| | |||     
T  49222411 ggttaaattacgtttctggtctcttaactatttagatagtatcgttttggtcccttagttaaattt-gatctattt-ggtccctt-accttctatatgtc 49222315  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49222314 acatattttggtcattttcattagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 49222262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 711 - 765
Target Start/End: Original strand, 43527026 - 43527080
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaa 765  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43527026 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaa 43527080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 782 - 860
Target Start/End: Original strand, 43527068 - 43527145
Alignment:
Q  782 tttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  43527068 tttggtccctt-aacttctctctggtacacattttggtcatttccgttagttttgattcaaaaacattagattttcttc 43527145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 703 - 820
Target Start/End: Original strand, 43839957 - 43840072
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  43839957 ttttaggctaaattgttttttt--tcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaaatttctct 43840054  T
Q  803 ctgttacacatttcggtc 820  Q
    | ||||||| ||| ||||    
T  43840055 ccgttacacgttttggtc 43840072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 801
Target Start/End: Original strand, 52705472 - 52705552
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    ||||| |||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  52705472 ttttgatcccttaactatttaattagtattggtttgatcccttaactaaaatttgatttattttgatcccttaaatttctc 52705552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 792 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 43527287 - 43527202
Alignment:
Q  792 ttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  43527287 ttaacttctct-tgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaagaacattatgttttcttcattttt-ttttggaatttt 43527202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 545 - 647
Target Start/End: Original strand, 35970432 - 35970534
Alignment:
Q  545 gtataattattttatacatgtatttaacgatgtgctatcatatcaattaatgaatatgacggctcatatgtttaaatattaattaattgatgtgataaca 644  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  35970432 gtatgattattttacacatgcattcaatcatgtgttgtcacgtcaattaatgaatatgacggcttatgtgttttcatatttattaattgacgtgacaaca 35970531  T
Q  645 tat 647  Q
    |||    
T  35970532 tat 35970534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 781 - 862
Target Start/End: Original strand, 52268176 - 52268257
Alignment:
Q  781 ttttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattca-aaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  52268176 ttttggtccctt-aacttctctcacttacacattttggtcattttcgttagttttaatttataaaacgttagtttttcttcat 52268257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 812 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 52606401 - 52606351
Alignment:
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52606401 attttggtcctttatgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 52606351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 779 - 849
Target Start/End: Original strand, 4846667 - 4846735
Alignment:
Q  779 tattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtt 849  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||   |||| |||||||||||||||||    
T  4846667 tattttggtccctt-aacttctctctcttacacattttggtcctttccattag-tttaattcaaaaacgtt 4846735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Original strand, 47872529 - 47872579
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47872529 ttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttgctcccttaactaaaa 47872579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 706 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 50394412 - 50394326
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  | || | | |||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  50394412 taggttaaattacctttttggtcccttaactatttaattggttttggtttggtcccttaactaaattttgatttattttgatccctt 50394326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 24243065 - 24242992
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||| | || |||  |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24243065 ttaaattttaggcttaaatgctcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 24242992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 104)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 31450669 - 31450835
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31450669 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 31450767  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  31450768 cattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggattttt 31450835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 705 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 13354566 - 13354388
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  13354566 ttaggctaaattgtaattttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctcttc 13354468  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  13354467 gttacacatattggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttttctggg 13354388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 28203243 - 28203093
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28203243 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtcgtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctctgttaca 28203145  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28203144 cattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 28203093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 703 - 885
Target Start/End: Original strand, 21470290 - 21470470
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21470290 ttttaggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggcagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-tcaacttctct 21470388  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  21470389 ctgttacacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttca-ttttcttttggaatttttctggg 21470470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 707 - 879
Target Start/End: Original strand, 34820278 - 34820448
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34820278 aggtcaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggttccttaattaaaattagatttattttggt-cctttaacttctctctgt 34820376  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  34820377 tacacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttca-ttttcttttggaatttt 34820448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 38275840 - 38275685
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttta-acttctctctgttac 809  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  38275840 taaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccgtaactcttctctctgttac 38275741  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38275740 acattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 38275685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 43183971 - 43183813
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43183971 taggttaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccg 43183873  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43183872 ttacacattttggtcatttccgttagatttaattcaaaaacgttaggttttctttatttt 43183813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 25642651 - 25642479
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  25642651 taaattgtatttttgttcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctttccgttaca 25642553  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  25642552 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttgtggaatttttctggg 25642479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 41377358 - 41377529
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41377358 taaattgtatttttggtcc-ttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 41377455  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  41377456 gattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctagaatttttctggg 41377529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 4104542 - 4104371
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |    
T  4104542 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttctctccgttata 4104444  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  4104443 catttgggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttca-ttttcttttggaatttttctgg 4104371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 711 - 884
Target Start/End: Original strand, 12303788 - 12303959
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  12303788 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcacttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaactcatctctgttaca 12303886  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12303887 cattttggtcctttccgttagttttatttcaaaaacattaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctgg 12303959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 32933589 - 32933744
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  32933589 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaactaaaattccatttattttggt-cttttaacttctctttg 32933687  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32933688 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtcaggttttcttcat 32933744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 707 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 37744775 - 37744605
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37744775 aggttaaattgcatttttgattccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctct 37744677  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    || | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  37744676 tatagattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 37744605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 702 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 41377746 - 41377587
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41377746 atttttggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccgtaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctc 41377648  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41377647 tttgttacacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 41377587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 5961672 - 5961822
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5961672 taaattgcatttttggccccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccataattaaaaattgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 5961770  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5961771 cattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 5961822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 20908894 - 20908744
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20908894 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctttctgttaca 20908796  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20908795 cattttggtcatttctgttagttttaattcaaaaactttaggttttcttcat 20908744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 16736481 - 16736309
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16736481 taaattgcacttttggtcccttaactgtttaggttgtatcgctgtagtcccttaattaaaattcgatttatttcggtccc-ttaacttctctctgttaca 16736383  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  16736382 cattttggtcctttccgttagttttaattcagaaacgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttttctggg 16736309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 27883471 - 27883624
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27883471 taaattgcattttttgtcccttaactatttaagtaatatcgctttggtcccttaagtaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 27883569  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27883570 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 27883624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 706 - 860
Target Start/End: Original strand, 39454449 - 39454602
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  39454449 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctccg 39454547  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39454548 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttc 39454602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 708 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 4121149 - 4120980
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4121149 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctatt 4121051  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  4121050 acacactttgttcattttcgttagttttaagtcaaaaacgtcaggttttcttca-ttttcttttggaatttt 4120980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 712 - 879
Target Start/End: Original strand, 16655610 - 16655775
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16655610 aaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctctgttgcac 16655708  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16655709 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttcttgaatttt 16655775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Original strand, 27132509 - 27132667
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  27132509 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctcttcg 27132607  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||| |||| |||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27132608 ttacacattttggtcctttccgatagttttaattcaaaaacattaggttttcttcatttt 27132667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 702 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 32933983 - 32933802
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32933983 atttttggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctttaaataaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctc 32933885  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    | |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  32933884 tttgttacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaacgttaggttttgttca-ttttcttctagaatttttctggg 32933802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 36211353 - 36211503
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  36211353 taaattgcatttttggtcacttaactgtttaggttgtattgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-cctttaacttctgttcgttaca 36211451  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36211452 cattttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 36211503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 17856202 - 17856355
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  17856202 taaatttcattttcggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctccttgttaca 17856300  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17856301 cattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 17856355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 706 - 860
Target Start/End: Original strand, 18565064 - 18565217
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18565064 taggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaggcagtatcgctttagtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccg 18565162  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18565163 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 18565217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 707 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 28631661 - 28631512
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28631661 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttgggtagtatcgctttgctctcttaattaaaattcgatttattttagtccc-ttaacttctctctgt 28631563  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttc 857  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28631562 tacacattttcgtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttc 28631512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 43183586 - 43183758
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  43183586 taaattacatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattagatttattttggtccc-ataacatctctctgttaca 43183684  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  43183685 cattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttatattttcttca-ttttcttcaggaatttttctggg 43183758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 712 - 865
Target Start/End: Original strand, 28631278 - 28631430
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  28631278 aaattacatttttggtcccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtccc-ttaacttctctcctttacac 28631376  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28631377 attttggtcatttccgatagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 28631430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 704 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 39913018 - 39912865
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgttt-aggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||    
T  39913018 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactattttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccttaactttctct 39912919  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39912918 ctgttacaccttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 39912865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 27476750 - 27476584
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27476750 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 27476652  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||  |||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  27476651 tattatggtcctttccgttagttttaaatcaagaacgttagattttcttca-ttttcttctggaatttt 27476584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 28202863 - 28203029
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  28202863 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttatattggt-cctttaacttctatccgttaca 28202961  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28202962 cattttggttcttttcgttagttttaattcaataacgttaggttttcttca-tcttcttctggaatttt 28203029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 13354180 - 13354330
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  13354180 taaattgaattttcggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccattaca 13354278  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13354279 tattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggtttacttcat 13354330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 16260874 - 16261023
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  16260874 taaatagcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgattt-ttttggt-cctttaacttctctccgttaaa 16260971  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16260972 cattttggtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 16261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 16736104 - 16736254
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16736104 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctcagttaca 16736202  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  16736203 cattttggtcctttccagtagttttaatttgaaaacgttaggttttcttcat 16736254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 31451049 - 31450899
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||    
T  31451049 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaactaaaattcgatttattttgat-cctttaacttctctacgttaca 31450951  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31450950 cattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 31450899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 703 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 34820670 - 34820512
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34820670 ttttaggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtctcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctct 34820572  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  34820571 ccgttacacattttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttagattttcttcat 34820512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 39912630 - 39912781
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  39912630 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccgttaactttctctctgttaca 39912729  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  39912730 cattttggtcttttacgttagttttaattcaaaaatattagggttttttcat 39912781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 44612867 - 44612694
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggta--gtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  44612867 taaattgcatgtttggtcc-ttaactatttacgtatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctctt-aacttctctatgtta 44612770  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44612769 cacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 44612694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 12304542 - 12304387
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  12304542 taggctaaattgcattttttgtcccttaacaatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctctccg 12304444  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12304443 ttacacattttggccatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 12304387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 16261253 - 16261087
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  16261253 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttatttttgtccc-ttagcttatctccgttaca 16261155  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16261154 cattttggtcattttggttagttttaattcaaaaacattaggttttcttca-ttttcttctagaatttt 16261087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 711 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 37412961 - 37412822
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37412961 taaattgcatttttggccccttaactatttaagtagtatcgcattggtcccttaattaaaattcaatttattttggt-ccattaacttctctctgttaca 37412863  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37412862 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 37412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 4104162 - 4104312
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  4104162 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtatc-ttaacttctctctgttata 4104260  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  4104261 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaatgttgggtttccttcat 4104312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 37412596 - 37412762
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||    
T  37412596 taaattgcatttttggtcccttaactatttagttagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttgacttctttccgttaca 37412694  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||  ||  |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  37412695 cattttagttcttttcgttagttttaattcaaaagcgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 37412762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 719 - 879
Target Start/End: Original strand, 41659756 - 41659914
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  41659756 attttttgtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatctt-aacttctctctgttacacattttgg 41659854  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41659855 gcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 41659914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 715 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 12304164 - 12304018
Alignment:
Q  715 ttgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatt 814  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  12304164 ttgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttcgtcctttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctcttcgttacacatt 12304066  T
Q  815 tcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12304065 ttggccatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 12304018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 15137187 - 15137034
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  15137187 taaattacatttttggtcacataactatttaggtagtaccgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcc-tttaacttttctctgttgca 15137089  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15137088 catttgggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 15137034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 707 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 40694557 - 40694405
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||||     |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  40694557 aggttaaattgcatttttg-----ttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattagatttattttggtccctt-aatttctctccgt 40694464  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40694463 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 40694405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 16655994 - 16655839
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16655994 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccg 16655896  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16655895 ttacacattttggtcctttccactagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcat 16655839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 700 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 27883855 - 27883687
Alignment:
Q  700 aaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgt----ttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaa 795  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||    
T  27883855 aaatattaggctaaattgcattttcgatcccttaactatatatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtgactt-aa 27883757  T
Q  796 cttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27883756 cttctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 27883687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 700 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 17856583 - 17856421
Alignment:
Q  700 aaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttc 799  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17856583 aaattataggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattggtttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctc-ttaacttc 17856485  T
Q  800 tctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaa-acgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  17856484 tctctgttatacattttagttatttccgttagttttaattaaaaatacgttaggttttcttcat 17856421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 27132893 - 27132743
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  27132893 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtgtcgatttggtcctttaattaaaattcgatttattttggt-ccattaacttctatccgttaca 27132795  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     ||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27132794 tattttagtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 27132743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 34127947 - 34127798
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34127947 taaattgtatttttggacccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaactaaagttcgatttattttgatccc-ttaacttctctctgttaca 34127849  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34127848 cattt-ggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttatgttttcttcat 34127798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 719 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 36442509 - 36442367
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  |    
T  36442509 atttttggtcccttaactatttagatagtattgctttgatcctttaattaaaatttaatttattttgatcc-tttaacttctttctgttacacattttag 36442411  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36442410 tcatttctgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcat 36442367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 702 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 39454825 - 39454675
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  39454825 attttagactaaattgcatttttggtcccttgactattcaggtagtatcgctttgattccttaattaaaattcgatttatttttgtccc-ttaatttctc 39454727  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||||||||   ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39454726 tctgttacacattt---tc------gttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 39454675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 10833416 - 10833267
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  10833416 aattgcatttttggtcccttagctatttaggtagtatcgctttagtccctcaattaaaattcgatttattttggt-ccattaacttctctctgttataca 10833318  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaatt-caaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  10833317 ttttggtcatttcgattagttttaattaaaaaaacgttaggttttcttcat 10833267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 20908514 - 20908667
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||  | ||||||    
T  20908514 taaattgtatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttagttcc-ttaacttcttcccgttaca 20908612  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20908613 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 20908667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 706 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 39150213 - 39150060
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  39150213 taggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgcttttgtaccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctttccg 39150115  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||||  ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39150114 ttacacattttagtccttcctgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttc 39150060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 713 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 21470675 - 21470532
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  21470675 aattccatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgcttgg-tcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctacgttacaca 21470578  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttct 858  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21470577 ttttggtcctttccgttagttttaattaaaaaacgttaggttttct 21470532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 712 - 885
Target Start/End: Original strand, 34127570 - 34127740
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||  ||||||    
T  34127570 aaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttatttttgtcgc-ttaacttctatccattacac 34127668  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  34127669 attttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgtta-gttttcttca-ttttcttatggaatttttctggg 34127740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 4120767 - 4120916
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  4120767 taaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaatcaaaattcgatttattttggt-cctttaatttctctccgttaca 4120865  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||| |||| |||   ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  4120866 tattttggtcgtttccattagttttaattcaaaaatctta-ggtttcttcat 4120916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 706 - 848
Target Start/End: Original strand, 14877481 - 14877620
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  14877481 taggctaaattgcatttttggtcccaaaactatttaggtagtatcgatttggtccattaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctc-- 14877577  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgt 848  Q
    |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14877578 ttacacattttggtaatttccgttagttttaattcaaaaacgt 14877620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 703 - 850
Target Start/End: Original strand, 44915735 - 44915880
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||    
T  44915735 ttttaggttaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatc-ttaacttatct 44915833  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    |  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44915834 c-cttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtta 44915880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 699 - 865
Target Start/End: Original strand, 45389122 - 45389287
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  45389122 taaattctaggctaaattgcatttttggtccctgaactatttaggtagtgtcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-ccattaactt 45389220  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
     |||  ||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  45389221 ttcttcgttacacattttggtcctttccgttaattttaattcaaaaatattaggttttcttcatttt 45389287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Original strand, 25642273 - 25642421
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  25642273 aattgtatttttagtcccttaactatttaagtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttttatctgttacaca 25642371  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| | || |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25642372 ttttgatcctttcagttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 25642421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 710 - 862
Target Start/End: Original strand, 27476368 - 27476520
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  27476368 ttaaattgtatttttggtccctagactatttaggtagtatcgctttgttcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaaa-ttctctcctttac 27476466  T
Q  810 acatttc-ggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||  |||| | |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27476467 acatttttggtcctatccgttagttttaattcaaaaacgttaggtttacttcat 27476520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 707 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 32503924 - 32503772
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  32503924 aggttaaattgcattcttagtcctttaactatttaggtagtattgatttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctttccgt 32503826  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  32503825 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcgaaaacgttagattttcttc 32503772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 709 - 865
Target Start/End: Original strand, 38275478 - 38275633
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||    
T  38275478 gttaaattgtatttttgatcccttaactatttatgtagtattgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-tctttaacttccctctatta 38275576  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  38275577 cacattttggtcctttccgttagttttaattcaaagacgttagattttctttatttt 38275633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 703 - 862
Target Start/End: Original strand, 33819392 - 33819549
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  33819392 ttttaggttaaattgcacttttggtccattaactatttaggtagtaccgttttggtctcttaattaaaatttgattta-tttggtccc-ttaacttttct 33819489  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
      |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33819490 tcgttacagattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 33819549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 719 - 862
Target Start/End: Original strand, 40694206 - 40694348
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  40694206 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttagtcccttaattaacattcgatttattttagtccc-ttaacttctctcagttgcacattttgg 40694304  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40694305 ccatttccattacttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 40694348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 700 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 27246377 - 27246216
Alignment:
Q  700 aaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttc 799  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||    
T  27246377 aaatttaaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaattaggatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaattttc 27246278  T
Q  800 tctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||  |||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27246277 tctc-cttacacattttggtcctttcggttatttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 27246216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 33819777 - 33819613
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  33819777 taaattgtatttttg-tctcataactgtttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtcc--ttaacttctctccgttaca 33819681  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||| ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  33819680 tattttggctatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 33819613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 5921774 - 5921619
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||    
T  5921774 taggctaaattgtgtttttgatcccttaactatttatatagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttttttttgttcctt-aacttctctttg 5921676  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  5921675 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttggattttcttcat 5921619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 720 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 35408895 - 35408756
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  35408895 tttttggtccattaactatttaattagtatcgctttggttccttaattaaaatttgatttattttggtatctt-aacttctctctgttacacattttggt 35408797  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35408796 cctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 35408756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 721 - 850
Target Start/End: Original strand, 15829733 - 15829861
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||    
T  15829733 ttttggtctcttagctatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctatccgttacacatcttggtc 15829831  T
Q  821 atttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15829832 atttccgttagttttaattcaaaaatgtta 15829861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 711 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 18565386 - 18565278
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  18565386 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttgggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttttccctgttaca 18565288  T
Q  811 catttcggtc 820  Q
     |||| ||||    
T  18565287 tattttggtc 18565278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 722 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 34484418 - 34484303
Alignment:
Q  722 tttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtca 821  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  34484418 tttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtatcttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttatctccgttacacattttggtca 34484320  T
Q  822 tttatgttagttttaat 838  Q
    |||  ||||||||||||    
T  34484319 tttccgttagttttaat 34484303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 708 - 862
Target Start/End: Original strand, 32503546 - 32503699
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||| | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32503546 ggttaaattgtatttttgatcgattaattatttaggtagtatcgttttgcttccttaactaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttctctctgtt 32503644  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||| | ||||||   ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  32503645 acacattttgatcatttcctttaattttaagtcaaaaacgttagattttcttcat 32503699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 711 - 821
Target Start/End: Original strand, 37744452 - 37744561
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  37744452 taaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatccc-ttaacttctcttcgttaca 37744550  T
Q  811 catttcggtca 821  Q
    ||||| |||||    
T  37744551 cattttggtca 37744561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Original strand, 27913906 - 27914062
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  27913906 tttttggttccttaactatttaattagtatcgctttagtccctttattaaaatttaatttattttgctatctt-aacttctctccgttacatattttggt 27914004  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27914005 cttttatgttagttttaattcaaaaacatta-ggttttttca-ttttcttctggaatttt 27914062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 731 - 862
Target Start/End: Original strand, 39149867 - 39149997
Alignment:
Q  731 ttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgtta 830  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||    
T  39149867 ttaactatttaaatagtatcactttagtcctttaactaaaattcgatttattttgatccctt-aacttctatttgttacacattttggtcatttccgtta 39149965  T
Q  831 gttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39149966 gttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 39149997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 707 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 41660123 - 41659971
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg- 805  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||| ||||||     
T  41660123 aggttaaattgcatttttggtcctttaactatttaattagtatcactttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtatc-ttaactt-tctctgc 41660026  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41660025 ttacacattttggttctttctgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 41659971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 711 - 792
Target Start/End: Original strand, 20297413 - 20297494
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297413 taaatttcatttttggtcccttaactattcaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 20297494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 711 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 36211782 - 36211701
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36211782 taaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttcgtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 36211701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 720 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 16350445 - 16350306
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    |||||| |||||||||| ||||  || ||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  16350445 tttttgttcccttaactatttaattattattgttttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtatctt-aacttctctctgttgcacattttagt 16350347  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16350346 cattcatgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttc 16350306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 705 - 879
Target Start/End: Original strand, 36442130 - 36442303
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||| |     
T  36442130 ttaggctaaattgtatttttgttcccttcactatttaggtagtatcgttttggtctattaataaaaatttgatttattttggt-tcattaacttctcccc 36442228  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaatt-caaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  36442229 gttacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctgaaatttt 36442303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 710 - 862
Target Start/End: Original strand, 16350079 - 16350230
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||  ||||    
T  16350079 ttaaattgcatttttggtctcttgactatttaattagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-cttac 16350177  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||| ||||||||   || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16350178 acattttggtcatttccatttgttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 16350230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 747 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 44916086 - 44915956
Alignment:
Q  747 tatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaac 846  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  44916086 tatcgttttggtcccttaattaaaatttcatttattttggtatctt-aacttctctccgttacatattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaac 44915988  T
Q  847 gttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    || ||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  44915987 gtgaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 44915956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 792 - 879
Target Start/End: Original strand, 27246066 - 27246152
Alignment:
Q  792 ttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27246066 ttaacttctctctgttacacatttttgtcatttctattagttttaattaaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 27246152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 753 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 36211682 - 36211576
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36211682 tttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccctt-aacttctctccgttacacattttggtcctttccgttagctttaattcaaaaatgttagg 36211584  T
Q  853 gtttcttc 860  Q
     |||||||    
T  36211583 ttttcttc 36211576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 706 - 852
Target Start/End: Original strand, 5720140 - 5720285
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| | |||| | | |||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||      
T  5720140 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattaatattgttttggttctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctc-c 5720238  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    || ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5720239 tttcacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 5720285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 704 - 773
Target Start/End: Original strand, 44610858 - 44610926
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44610858 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttg-tcccttaattaaaatt 44610926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 27914276 - 27914126
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||||||   ||| |  |||||||| |||||    
T  27914276 taaattgtatttttgatcccttaactatttaattagtatcgttttggttccttagttaaaatttgatttattttggcatcttaactttctctct-ttaca 27914178  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27914177 cattttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgttaggttttgttcat 27914126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 707 - 778
Target Start/End: Original strand, 34484234 - 34484305
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatt 778  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34484234 aggttaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatt 34484305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 727 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 11943855 - 11943768
Alignment:
Q  727 tcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacattt 815  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  11943855 tccctgaactatttaggtagtatcgctttggtactttaattaaaattcgatttattttggt-tcattaacttctctccgttacacattt 11943768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 707 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 1580228 - 1580148
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggt 787  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1580228 aggttaaattatgtttttggttccttaactatttaaatagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 1580148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 711 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 23992289 - 23992191
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  23992289 taaattgtctttttggtccctgaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctttgttac 23992191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 721 - 831
Target Start/End: Original strand, 1580019 - 1580128
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  1580019 tttttgtcccataactatttaattagtatcgttttggtcc-ttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctctgttgcacattttggtc 1580117  T
Q  821 atttatgttag 831  Q
     |||| |||||    
T  1580118 ttttacgttag 1580128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 800 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 29078062 - 29078008
Alignment:
Q  800 tctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggt 854  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29078062 tctctgttacacattttggtcattttcattagttttaattcaaaaatgttagggt 29078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 701 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 40469162 - 40469092
Alignment:
Q  701 aattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40469162 aattttaggtttaaatgcgtttttggtcccttaactatttatttggtatcactttggtcccttaattaaaa 40469092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 38073873 - 38073790
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttg 785  Q
    ||||| || ||||||  ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  38073873 atttttggctaaattatatttttgatcatttaactatttagatagtatcgttttaattctttaattaaaattcgatttattttg 38073790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 765 - 820
Target Start/End: Original strand, 44612548 - 44612602
Alignment:
Q  765 attaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  44612548 attaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctatccgttacacattttggtc 44612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Original strand, 15136364 - 15136414
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  15136364 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttgatcccttaactaaaa 15136414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 26424869 - 26424819
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26424869 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 26424819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 704 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 4708 - 4535
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4708 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctc 4610  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||| ||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4609 tgtcacagattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 4535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 699 - 862
Target Start/End: Original strand, 4329 - 4491
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  4329 taaatttaaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtactatcactttggttccttaattgaaatttgatttattttggtctc-ttaactt 4427  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4428 cactccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 4491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 702 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 10625476 - 10625294
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10625476 atttaaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctc 10625378  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10625377 tctgttacacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttacgttttcttcattttttttctggaatttttctggg 10625294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Original strand, 31715631 - 31715789
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31715631 taggctaaattgtattttttgtctcttaactatttaggtagtatcgctttgaccccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttttctctg 31715729  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31715730 ttacagattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 31715789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 8769665 - 8769493
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8769665 taaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacatctctctgttaca 8769567  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8769566 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttatattttcttca-ttttcttcaggaatttttctggg 8769493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 705 - 879
Target Start/End: Original strand, 23437149 - 23437321
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  23437149 ttaggctaaattgcatttttgattccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacctctctcg 23437247  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||| |||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23437248 gttacatattttggtcctttccattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 23437321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 704 - 862
Target Start/End: Original strand, 35085735 - 35085892
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35085735 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctt 35085833  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35085834 tgttacacattttgatcctttcagttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 35085892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 18731022 - 18731172
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||    
T  18731022 taaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttatcttcgttaca 18731120  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18731121 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 18731172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 23472939 - 23472789
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  23472939 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttattaca 23472841  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23472840 cattttggtcttttccgttagttttaatttaaaaacgttaggttttcttcat 23472789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 34568586 - 34568758
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  34568586 taaattgtattttttgtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctcttcgttaca 34568684  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34568685 cattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctggaattttcctggg 34568758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 31716004 - 31715857
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31716004 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-cctataacttctctccgttaca 31715906  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31715905 cattttggtcattt-cgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttc 31715857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 708 - 865
Target Start/End: Original strand, 39118010 - 39118166
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||    
T  39118010 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttgatcccttaattaaatttcgatttattttgattcc-ctaacttctatctgtt 39118108  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39118109 acacattttggtcatttctgttaattttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 39118166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 47250929 - 47250781
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  47250929 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttaca 47250831  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
     |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47250830 tattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttc 47250781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Original strand, 11678706 - 11678872
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |    
T  11678706 taaattgcatttttggtcctttaaatatttagataatatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctcttcgttata 11678804  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11678805 cattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttt 11678872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 714 - 879
Target Start/End: Original strand, 21522226 - 21522387
Alignment:
Q  714 attgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacat 813  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  21522226 attgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattc--tttattttggtctctt-aacttctctctgttacatat 21522322  T
Q  814 ttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  21522323 tttggtcttttctgttaattttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggagtttt 21522387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 704 - 865
Target Start/End: Original strand, 8769278 - 8769438
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8769278 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtccctgaattaaaatttgatttattttgatccc-ttaacttctctc 8769376  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
     ||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8769377 cgttacacattttggtcctttccgttagatttaattcaaaaacgttaggttttctttatttt 8769438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 5238449 - 5238604
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5238449 taggctaaattgcatttttgatccattaactgtttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaagttctctctg 5238547  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  5238548 ttacacattttagtcctttccgttagttttacttcaaaaacgttaagttttcttcat 5238604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 21522603 - 21522451
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  21522603 aggttaaattgtgtttttggtcccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcc--ttaacttctctccgt 21522506  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21522505 ta-acattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 21522451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 705 - 885
Target Start/End: Original strand, 23472590 - 23472768
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  23472590 ttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcttttaattaaaattcgattcattttggt-tctttaacttctctcc 23472688  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23472689 gttacatattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagattttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 23472768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 43726630 - 43726475
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  43726630 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtggtattgttttagttccttaattaaaatttgatttattttggtccctt-aacttctctcta 43726532  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43726531 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagagtttcttcat 43726475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 706 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 9034703 - 9034526
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9034703 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttccctctg 9034605  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  9034604 ttacagattttggtccttttcgttagttttaaatcaaaaacgttagattttcttca-ttttcttttggaatttttctggg 9034526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Original strand, 43140697 - 43140850
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  43140697 aggttaaattgcatttttagtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctc-ttaactcctctctgt 43140795  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  43140796 tacatattttggtcatttctgttagttttaattc-aaaacgttacgttttcttcat 43140850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 11679085 - 11678933
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  11679085 taaattgtatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgat-cctttaacttctatctgttaca 11678987  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  11678986 cattttggtcatttccgttagtttt-attcaaaaaggttagtttttcttcatttt 11678933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 35086123 - 35085957
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35086123 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattgtggtccc-ttaacttctctttgttaca 35086025  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  35086024 tattttggacctttccgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttca-ttttcttctagaatttt 35085957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 44486315 - 44486149
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44486315 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaatatttaatttattttggtccc-ttaatttctctctgttaca 44486217  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  44486216 tattttggtcctttctgttagtttaaattccaaaacgttagattttcttca-ttttcttctggaatttt 44486149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 26920300 - 26920150
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26920300 taaattgcatttttaatcccttatctatttcggttgtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctttgttaca 26920202  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26920201 cattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttaagttttcttcat 26920150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 44448295 - 44448145
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44448295 taaattggatttttagtcctttaattatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtccctt-aacttttctctgttaca 44448197  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44448196 cattttggtcctttatgttagttttaattcaaaaatgttaggttttcttcat 44448145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 44447917 - 44448088
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  44447917 taaattgcatttttggtccgttaactatttagatagtattgttttggtcc-ttaattaaaatttgatttattttggtccctt-aacttttctcttttaca 44448014  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  44448015 cattttggccatttctgttagttttaattcaaaaacgttagactttcttca-ttttcttttggaatttttctggg 44448088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 9231065 - 9230910
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9231065 taggctaagttgtatttttggtcccttaacgatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaagatttgatttattttggtcactt-aacttctctctg 9230967  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9230966 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttatgttttcttcat 9230910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 704 - 864
Target Start/End: Original strand, 32706728 - 32706887
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32706728 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgtttttgacccttaattaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttctctc 32706826  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattt 864  Q
      ||||||||||  ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32706827 aattacacattttagtcctttccgttagttctaattcaaaaacgttaggttttcttcattt 32706887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 2357070 - 2357220
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  2357070 taaattgcatttttgatctcttaactatttaaatagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatccctt-aacttctctccattaca 2357168  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2357169 cattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 2357220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 2357438 - 2357300
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2357438 taaattgtatttctggtcccttaactatttaggtagtatcgttttgggcccttaactaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 2357340  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2357339 cattttggtcctttttgttagttttaattcaaaaatgtta 2357300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 699 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 32707126 - 32706965
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||    
T  32707126 taaatgttaggctaaattgtatttttagtcccttaattatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaactcgatttcttttggt-ccattaactt 32707028  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32707027 ctctctgttacatattttggtcctttctgtt-gttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 32706965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 748 - 865
Target Start/End: Original strand, 9230716 - 9230832
Alignment:
Q  748 atcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacg 847  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  9230716 atcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctctgttacacattttgatcatttccgttaattttaattcaaaaacg 9230814  T
Q  848 ttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  9230815 ttaggttttcttcatttt 9230832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 711 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 47251279 - 47251132
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  47251279 taaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtattgctttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtccc-ttaacttttctc-gttaca 47251182  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  47251181 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttatgttttcttc 47251132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Original strand, 22338284 - 22338442
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||| |||    
T  22338284 tttttggtcccttaactatttaattagtattgctttggtaccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatctgttacacattttggt 22338383  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22338384 catttccgttagttttaattcaaaaacgttagagtttcttca-ttttcttttggaatttt 22338442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 720 - 859
Target Start/End: Original strand, 41758691 - 41758829
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  41758691 ttttttgtcccttaactatttaaatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctctccgttacacattttggt 41758789  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41758790 catttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttctt 41758829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 44485715 - 44485543
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  44485715 taaattgcatttttggtcctttaactatttaagtattatcgctttggtcctttaattaatattcaatttattttgatccc-ttaacttctctccgttaca 44485617  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| |||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44485616 cattttggtcctttccgttagtttaaattccaaaacattaggttttcatca-ttttcttctggaatttttctggg 44485543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 720 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 36507183 - 36507039
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  36507183 tttttggtctcttaactatttaattagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttatttcggtatctt-aacttctttctgttacacattttggt 36507085  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36507084 catttctgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcatttt 36507039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 38842404 - 38842255
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||  | ||||||    
T  38842404 taaattgtatttttgattccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggt--ctctaacttctacccgttaca 38842307  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38842306 catattggtcatttctgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 38842255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 704 - 879
Target Start/End: Original strand, 43726240 - 43726411
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  43726240 tttaggttaaattgtatttttggtcccttaattatttaagtagtctcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttggttcc--ttaacttctctc 43726337  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  43726338 tgttacacattttgatc-ttttcattagttttaattcaaaaatgttaagttttcttca-ttttcttctgaaatttt 43726411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 705 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 473569 - 473415
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||||||||||||||| ||  | | |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  473569 ttaggttaaattgcattgttaattctttaactatttaggtagtatcgctttggtcttttaattaaaatttgatttattttcgtccc-ttaacttctctca 473471  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
     |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  473470 attacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttc 473415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 738 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 34568940 - 34568827
Alignment:
Q  738 tttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaa 837  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  34568940 tttatgtagtatcactttgatcccttaattaaaatttgatttatttttgtccctt-aacttctctctgttatacattttggtcatttccgttagttttaa 34568842  T
Q  838 ttcaaaaacgttagg 852  Q
    |||||||||||||||    
T  34568841 ttcaaaaacgttagg 34568827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 37144151 - 37143996
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||      
T  37144151 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaattttctctc-c 37144053  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  37144052 ttacacattttgatcatttccgttagttttaatttaaatacgttaggttttcttcat 37143996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 719 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 48704183 - 48704042
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaac-ttctctctgttacacatttcg 817  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||||| |    
T  48704183 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggt-cctttaactttctgtccgatacacattt-g 48704086  T
Q  818 gtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  48704085 gtcctttatgttag-tttaattcaaacacgttagagttttttcat 48704042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 473195 - 473342
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  473195 taaattgcatttttgatcgcttaactatttaggcagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttttctctgttaca 473293  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||   ||| |||   |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  473294 catt---gtcctttcctttagttttaagtcaaaaacgttagattttcttcat 473342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 758 - 860
Target Start/End: Original strand, 38842082 - 38842182
Alignment:
Q  758 tcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttc 857  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38842082 tcccttaattaaaattcgatttattttgatcc--ttaacttctctctgttacacattttggtcctttctgttaattttaattcaaaaacgttaggttttc 38842179  T
Q  858 ttc 860  Q
    |||    
T  38842180 ttc 38842182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 715 - 862
Target Start/End: Original strand, 47250565 - 47250710
Alignment:
Q  715 ttgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatt 814  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||    
T  47250565 ttgcatttttg-tcccttaattatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctccccattacatatt 47250662  T
Q  815 tcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47250663 ttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 47250710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 47305130 - 47305280
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  || ||||  |||||    
T  47305130 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttatctc-cttaca 47305228  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47305229 cattttgatcatttccgttagttttaattcaaagacgttaggttttcttcat 47305280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 31623807 - 31623654
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  31623807 taaattgcatttttagtaccttaattattcaggtagtatcgttttggaccctcaagtaaaatttgatttattttggtcccat-aacttttctccgttaca 31623709  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31623708 cattttggtcctttcgattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 31623654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 711 - 852
Target Start/End: Original strand, 24119717 - 24119857
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  24119717 taaattacatttttggtttcttaactatttagatagtatcactttggtctcttaattaaaatttgatttcttttgatccc-ttaacttctctccgttaca 24119815  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  24119816 aattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattagg 24119857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 720 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 28349754 - 28349611
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  28349754 tttttggtcccttaactatttaattagtattgttttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtatctt-aacttttctct-ttacacattttggt 28349657  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28349656 ccttttcgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 28349611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Original strand, 37143776 - 37143932
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |    
T  37143776 tttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgattta-tttggtatc-ttaacttttctctgttacacattttgat 37143873  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    | |||  |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  37143874 cctttccgttagttttaattcaaaaacatcagattttcttcattttt-ttctagaatttt 37143932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 711 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 22338659 - 22338509
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccct-ttaac-ttctctctgtta 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||   |  |||| |||||||| |||    
T  22338659 taaattgcatttttggtcccttaactaattaattagtatcgctttcgtcccttaattaaaatttcatttattttggtatgtcgtaactttctctctatta 22338560  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
    ||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22338559 cacattttggtcctttacattaattttaattcaaaaatgttagggtttctt 22338509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 731 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 47305490 - 47305344
Alignment:
Q  731 ttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgtta 830  Q
    |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||   |||    
T  47305490 ttaactatttaattagtatcgttttgctcccttaattaaaatttaatttattttggtatctt-aacttcactccattacacattttggtcatttccatta 47305392  T
Q  831 gttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  47305391 gttttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttt 47305344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 753 - 879
Target Start/End: Original strand, 48703854 - 48703978
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaa-cttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  48703854 tttgatcacttaattaaaattcgatttattttggt--ttttaattttctctctgttacaacttttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttag 48703951  T
Q  852 ggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  48703952 ggtttattca-ttttcttctggattttt 48703978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 752 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 23437494 - 23437385
Alignment:
Q  752 ctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  23437494 ctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcgt-aacttatctttgttacacattttggtccttcccgttagttttaattcaaaaatgttag 23437396  T
Q  852 ggtttcttcat 862  Q
    | |||||||||    
T  23437395 gttttcttcat 23437385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 706 - 783
Target Start/End: Original strand, 10625104 - 10625181
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattt 783  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10625104 taggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgtgttggtcccttaactaaaattcgatttattt 10625181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 709 - 856
Target Start/End: Original strand, 38676059 - 38676205
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |  | ||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  38676059 gttaaattatatttttggtcccttaactatttaattgatttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattttggtctcttaactttctctctgtta 38676158  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    ||| ||| ||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  38676159 cacgttttggtcatttccgttaaatttaatt-aaaaacgttagggttt 38676205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 753 - 850
Target Start/End: Original strand, 47250942 - 47251038
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttct-ctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  47250942 tttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctcccccgttacacattttggtcctttccgttagttttaa-tcaaaaacgtta 47251038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 709 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 4156638 - 4156538
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  4156638 gttaaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatctgtttggtaccctaactaaaatttgatttattttggtctcttaaatttctctctgtta 4156539  T
Q  809 c 809  Q
    |    
T  4156538 c 4156538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 806 - 862
Target Start/End: Original strand, 10625180 - 10625236
Alignment:
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10625180 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 10625236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 704 - 787
Target Start/End: Original strand, 15326868 - 15326951
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggt 787  Q
    |||||| |||||||||||||| ||   |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15326868 tttaggctaaattgcatttttagttttttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt 15326951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 720 - 815
Target Start/End: Original strand, 43050396 - 43050491
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacattt 815  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  43050396 tttttggtcccttaactatttaattaatattggtttggtcccctaattaaaaattgatttattttggtcccttaaatttctctttgttacatattt 43050491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 862
Target Start/End: Original strand, 36506848 - 36506965
Alignment:
Q  744 tagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaa 843  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||  |    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  36506848 tagtatcgttttgatctcttaattaaaatttgatttattttggtatc-ttaactttccatccttacatattttggtcttttatgttagttttaatttaaa 36506946  T
Q  844 aacgttagggtttcttcat 862  Q
    || ||| || |||||||||    
T  36506947 aatgttgggttttcttcat 36506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 773
Target Start/End: Original strand, 19543503 - 19543555
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatt 773  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19543503 ttttcgtcccttaactatttatttagtatcgctttgatcccttaattaaaatt 19543555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 24120003 - 24119916
Alignment:
Q  797 ttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24120003 ttctctctgttacatattttggttctttctgttaattttaattaaaaaatgttagattttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 24119916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 792
Target Start/End: Original strand, 28263494 - 28263580
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28263494 taggctaaattacttttttgatcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtacctt 28263580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 38677134 - 38677044
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||  | || ||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  38677134 attttaggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattttgatccctt 38677044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 711 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 40263694 - 40263551
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||  | || ||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||   | |||||||    
T  40263694 taaattacctttttggtcccttaaatatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattttggtccc-ttaactttcttttgttaca 40263596  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    | ||| ||||||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  40263595 cgttttggtcatttccattaaatttaatt-aaaaacgttagggttt 40263551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 771
Target Start/End: Original strand, 43704957 - 43705008
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43704957 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 43705008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 705 - 755
Target Start/End: Original strand, 9225632 - 9225681
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgcttt 755  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  9225632 ttaggctaaattgcatttttggtctcttaa-tatttaggtagtatcgcttt 9225681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 545 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 23540310 - 23540176
Alignment:
Q  545 gtataattattttatacatgtatttaacgatgtgctatcatatcaattaatgaatatgacggctcatatgtttaaatattaattaattgatgtgataaca 644  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| || |||| | | ||| |||||||||| |||| |||   |||||| |||  ||||| |||||| || |||||||||    
T  23540310 gtataattattttacacataaattcaatgatgcgttgtcacatcaattaataaataagacaattcatatattttcatattcattaatagacgtgataaca 23540211  T
Q  645 tattattagattaacgtgtaaaataattatacact 679  Q
     || |||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  23540210 catcattagatacatgtgcaaaataattatacact 23540176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 45457149 - 45457099
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45457149 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 45457099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 87)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 706 - 879
Target Start/End: Original strand, 7399075 - 7399246
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7399075 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccg 7399173  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  7399174 ttacacattttggtccttttcgttatttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttatggaatttt 7399246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 719 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 28392145 - 28391986
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||    
T  28392145 atttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaaccttctctccgttacacattttgg 28392046  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28392045 tcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctccattttt-ttctggaatttt 28391986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 712 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 15267622 - 15267456
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15267622 aaattgcatttttgatcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcc-tttaacttctctccgttacac 15267524  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  15267523 attttggtcctttatgttagttttaattcaaaaacgttaggttttttttcattttcttctggaatttt 15267456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 698 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 12593852 - 12593673
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact 797  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12593852 ttaatttttaggttaaattacatttttagtcctttaactatttaggtagtattgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaact 12593754  T
Q  798 tctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12593753 tctctctgttacacattttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctcgaatttt 12593673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Original strand, 10656097 - 10656269
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||    
T  10656097 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttgct-cctttaacttatctccgttaca 10656195  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  10656196 cattttggtcatttcggttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttatggaatttttctggg 10656269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 699 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 12695081 - 12694916
Alignment:
Q  699 taaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaactt 798  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12695081 taaattttaggccaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaactt 12694983  T
Q  799 ctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || ||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12694982 ctttccattacacattttggttatttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 12694916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 712 - 879
Target Start/End: Original strand, 31656361 - 31656527
Alignment:
Q  712 aaattgcatttt-tggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  31656361 aaattgcattttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgat-cctttaacttctctctgataca 31656459  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31656460 cattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacattaggttttcttcattttt-ttccggaatttt 31656527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 10656477 - 10656327
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10656477 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaagtaaaatttgatttattttagtccctt-aacttctctctgttaca 10656379  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10656378 cattttggtcctttttgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 10656327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 7210828 - 7210675
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  7210828 taaattgcattcttggtcacttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cttttaacttctttatgttaca 7210730  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7210729 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 7210675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 711 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 9693301 - 9693129
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9693301 taaattgcatttttggtcccttaacgatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaaatcgatttatattggtccc-ttaacttctctctgttaca 9693203  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  9693202 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgtttggtttttttc-gttttcttctggaattttcctggg 9693129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 707 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 19205330 - 19205154
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||    
T  19205330 aggttaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttatttt-gaccccttaacttctctccgt 19205232  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  19205231 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaactttaggttttcttca-ttctcttttggaatttttctggg 19205154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 698 - 863
Target Start/End: Original strand, 40589044 - 40589208
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact 797  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  40589044 ttaaatttttggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcactttggtctccaaattaaaattcgatttattttggtccc-ttgact 40589142  T
Q  798 tctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatt 863  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40589143 tctctttgttacacattttggtcatttctgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatt 40589208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 16353542 - 16353387
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  16353542 taggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctcttcg 16353444  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16353443 ttacacattttggtcctttttgttagttttaattaaaaaacgttaggttttcttcat 16353387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 707 - 875
Target Start/End: Complemental strand, 31909317 - 31909151
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  31909317 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgttttcgtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctatcttt 31909219  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaa 875  Q
    |||| |||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31909218 tacatattttggtcattttcgttaattttaattaaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctggaa 31909151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 698 - 862
Target Start/End: Original strand, 40589647 - 40589810
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact 797  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  40589647 ttaaatttttggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcactttggtctccaaattaaaattcgatttattttggtccc-ttgact 40589745  T
Q  798 tctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40589746 tctctttgttacacattttggtcatttctgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 40589810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 42710733 - 42710567
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |    
T  42710733 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatccc-ttaacttctctttgttata 42710635  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  42710634 aattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttctaca-ttttcttctggaatttt 42710567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 884
Target Start/End: Original strand, 29023940 - 29024108
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29023940 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgat---ttttggtccc-ttaatttctctctgttaca 29024035  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
     |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29024036 tattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctgg 29024108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 31656741 - 31656591
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31656741 taaattacatttttggtcccttaacttattaggcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ataacttctctctgttaca 31656643  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31656642 cattttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 31656591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 712 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 39706433 - 39706284
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39706433 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattcttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttacac 39706335  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  39706334 attttggtcatttttgttagtttcaattcaaaaacgttggattttcttcat 39706284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 711 - 860
Target Start/End: Original strand, 9692922 - 9693069
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  9692922 taaattgtatttttggtccct-aactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttgacttctctccgttaca 9693019  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9693020 cattttggtcatttccgttagttttaattcaataacgttaggttttcttc 9693069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Original strand, 35263491 - 35263647
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  35263491 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctcttt 35263589  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||| |||| |||| |||  |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  35263590 gttacatattttggtcctttccgttaattttaattaaaaaacattaggttttcttcat 35263647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 3878484 - 3878634
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  3878484 taaattgtatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcgtttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctctattgca 3878582  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3878583 cattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 3878634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 712 - 879
Target Start/End: Original strand, 5087811 - 5087976
Alignment:
Q  712 aaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacac 811  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||  | |||||||    
T  5087811 aaattgaatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcaatttattttggttcc-ttaacttcttcccgttacac 5087909  T
Q  812 atttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  5087910 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttt 5087976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 16353154 - 16353310
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactg---tttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16353154 taaattacatttttggtcccttaactactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccctt-aacttttctatgtt 16353252  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16353253 actcatttcggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 16353310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 31908931 - 31909083
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgt--ttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  31908931 taaattgtatttttggtgccttaactatatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctctattg 31909029  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31909030 cacattttggtcatttccgttagtttcaattcaaaaacgttaggttttcttcat 31909083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 36751905 - 36752058
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  36751905 taaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtccc-ttaacttctctctgttaaa 36752003  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36752004 cattttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 36752058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Original strand, 7210461 - 7210609
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7210461 aattgcatttttggtcccttaaatatttaggtactatcgttttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacaca 7210559  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7210560 ttttgatcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcatcat 7210609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 706 - 851
Target Start/End: Original strand, 33699273 - 33699417
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33699273 taggctaaattgcatttatggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaattcggtttattttggtccc-ttaacttctctctg 33699371  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33699372 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttag 33699417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 704 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 40589444 - 40589284
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40589444 tttaggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctc 40589346  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
     |||||| |||  |||| |||   |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  40589345 cgttacatattctggtcctttccattagttttaattcaaaaatgttagattttcttcatttt 40589284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 704 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 40590047 - 40589887
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctc 803  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40590047 tttaggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctctc 40589949  T
Q  804 tgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
     |||||| |||  |||| |||   |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  40589948 cgttacatattctggtcctttccattagttttaattcaaaaatgttagattttcttcatttt 40589887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 711 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 35263877 - 35263711
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  35263877 taaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatgactttggtcccttaactaaaattcgatttattttggt-ccattaaattctctttgttaca 35263779  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  35263778 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttctcca-ttttcttctagaatttt 35263711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 698 - 851
Target Start/End: Original strand, 18514278 - 18514430
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact 797  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18514278 ttaagttttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggaagtatccctttggtcgcttagttaaaattcaatttattttggtccc-ttaact 18514376  T
Q  798 tctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  18514377 tctctatgttacacattttggtcgtttccattagttttaattcaaaaacgttag 18514430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 709 - 862
Target Start/End: Original strand, 25923119 - 25923271
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtta 808  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  25923119 gttaaattgtatttttgatcccttaactatttaggtagtatcggtttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaacttctctccgtta 25923217  T
Q  809 cacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     ||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25923218 tacatttttaccatttctgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 25923271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 334299 - 334449
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  334299 taaattgcatttttagtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctcctttaca 334397  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  334398 cattttggtccttcccattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 334449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 710 - 861
Target Start/End: Original strand, 5624381 - 5624531
Alignment:
Q  710 ttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  5624381 ttaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctccgttat 5624479  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttca 861  Q
      |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5624480 caattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca 5624531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 38416517 - 38416367
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  38416517 taaattgtatttttggtctcttaattatttaggtagtatcgctttgctcacttaattaaaattcgatttattttggttcc-ttaacttctttccgttaca 38416419  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38416418 cattttgatcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 38416367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 720 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 41372532 - 41372375
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  41372532 tttttggtcccttaactatttaattaatatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatctt-aacttctctctattacacattttggt 41372434  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  41372433 cattttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttttggaatttt 41372375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 720 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 7399452 - 7399311
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7399452 ttttttgtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacacattttggt 7399354  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | |||  ||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  7399353 cctttccgttagtttttattcaaacaagttaggatttcttcat 7399311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Original strand, 33762899 - 33763061
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtccc-ttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaa-ttaaaattcgatttattttggtccctt-taacttctct 802  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33762899 taggctaaaatgcattcttggtccccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaaattaaaattcgatttattttgatcccttataacttctct 33762998  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  33762999 ctgttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttaggttttctttatttt 33763061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Original strand, 40774341 - 40774493
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40774341 taaatttcattttttgtcccttaactatttaggtagtattgttttagtcccttaattaaaat-cgatttattttggtccctt-aacttctctctcttaca 40774438  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  40774439 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacattagattttcttcatttt 40774493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 707 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 41860066 - 41859910
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggta--gtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  41860066 aggttaaattgcatttttggtctcttaactatttaggtatagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatccctt-aacttctttct 41859968  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41859967 gttacacattttggtcctttccgttagtattaattcaaaaaggttaggttttcttcat 41859910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 720 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 5152989 - 5152845
Alignment:
Q  720 tttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggt 819  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||| |||    
T  5152989 tttttggtcccttaactatttatttagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatc-ttaatttctctttgttacacattttggt 5152891  T
Q  820 catttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5152890 catttccgttggttttaattcaaaaacgttaggttttcttcatttt 5152845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 711 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 8418567 - 8418435
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |    
T  8418567 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccgttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttttctctgttata 8418469  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaa 844  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  8418468 cattttggttctttctgttagttttaattaaaaa 8418435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 711 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 32272223 - 32272083
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  32272223 taaattgcatttttggtctcttaactatttagataatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctatgttata 32272125  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
     |||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32272124 tattttgttcattttcgttagttttaatttaaaaacgttagg 32272083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Original strand, 12593454 - 12593609
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  12593454 taggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgcttcagtcccttaactaaaattcgatttatattggttcc-ttaacttctttctg 12593552  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  12593553 ttacacattttggtcatttcctttagttttaagtcaaaaacgttagattttcttcat 12593609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 703 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 15476649 - 15476503
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  15476649 ttttaggttaaattgcattttag-tcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctc-ttaacttctct 15476552  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttag 851  Q
      ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  15476551 tcgttacacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaatgttag 15476503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 711 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 40774720 - 40774574
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||    
T  40774720 taaattgcatttttgattccttaattatttagctagtatcgctttagtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttt-atttctctacgtcaca 40774622  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttct 858  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40774621 cattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttct 40774574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 711 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 43570154 - 43570001
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  43570154 taaattgtattttttgtcccttaactatttagatagcatcgctttgttcccttaattaaaatttgatttatttt-gtcccattaacttctctccgttaca 43570056  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||| | ||||||   |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43570055 cattttgatcatttcgattagttttgattcaaaaacgttaagttttcttcatttt 43570001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 713 - 845
Target Start/End: Original strand, 8418206 - 8418336
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  8418206 aattgcatttttggtccattaattatttaggtagtatcgttttggtcacttaattaaaattcgatttattttggttc--ttaacttctctctgttacaca 8418303  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  8418304 tttttgtcatttccgttagttttaattcaaaaa 8418336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 702 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 14143897 - 14143722
Alignment:
Q  702 attttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctc 801  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14143897 atttaaggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaagtagtattactttggtctcttcattaaaatttaatttattttggtctctt-aacttctc 14143799  T
Q  802 tctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14143798 tctgttacacattttggtcacttttgttaattttaattaaaaaatattagggtttctcca-ttttcttctggaatttt 14143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 719 - 864
Target Start/End: Original strand, 26289031 - 26289175
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||  |    
T  26289031 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttcgtcccttaattaaaatttgatttattttggt-cctttaacttctatatgtcacacattttcg 26289129  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattt 864  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  26289130 tcctttccgttagttttaatttaaaaacgttagattttcttcattt 26289175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Original strand, 28391773 - 28391922
Alignment:
Q  713 aattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacaca 812  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||  |||||||    
T  28391773 aattgcatttttggtcccttaactatttaggcagtattactttggtcccttaattaaagttcgatttattttgatcccttaactttctctccattacaca 28391872  T
Q  813 tttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28391873 ttttggtccttttagttagttttaattcaaaaatgttagggttttttcat 28391922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 706 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 5088516 - 5088386
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  5088516 taggctaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggt-cctttaacttctttttg 5088418  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaa 837  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  5088417 ttacacattttggtcctttctgttagttttaa 5088386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 711 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 33763290 - 33763153
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  33763290 taaattgcatttttggtcccttaactatttag-tagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttatttcggtccc-ttaacttctctccgttaca 33763193  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtta 850  Q
    ||||| |  |||||   || ||||||||||||||||||||    
T  33763192 cattttgtacatttcctttggttttaattcaaaaacgtta 33763153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 705 - 843
Target Start/End: Original strand, 15267239 - 15267375
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  15267239 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatt-aggtagtatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttgg-ccccttaacttctctca 15267336  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaa 843  Q
     |||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||    
T  15267337 attacacattttgctcatttctattagttttaattcaaa 15267375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Original strand, 19204941 - 19205096
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||   ||     ||  |||||||||||||    
T  19204941 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatggcttaaatacc--ttaacttctctct 19205038  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19205039 ggtacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 19205096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 706 - 865
Target Start/End: Original strand, 39706053 - 39706207
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  39706053 taggctaaattgcatttttggtctcttaactatttatgta----cgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccctt-aacttctctcag 39706147  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||| | |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39706148 ttagatattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttctttatttt 39706207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 711 - 845
Target Start/End: Original strand, 42710353 - 42710486
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  42710353 taaattgcatttttagtcatttaactatttcggtagtatcgctttagttctttaattaaaattcgatttattttggt-ccattaacttctctatgttaca 42710451  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42710452 cattttggtcctttatgttagttttaattcaaaaa 42710486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 708 - 820
Target Start/End: Original strand, 15476266 - 15476377
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  15476266 ggttaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattttatttattttggtctc-ttaacttctctccgtt 15476364  T
Q  808 acacatttcggtc 820  Q
    |||||||| ||||    
T  15476365 acacattttggtc 15476377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 36752289 - 36752135
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  36752289 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttatgtagtatcgcttcaat-ccttaattaaaattcgatttattttggt-ccattaacttctctttg 36752192  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    || ||||||| |||| |||   || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  36752191 ttgcacattttggtccttttcattggttttaatttaaaaaagttaggttttcttcat 36752135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 703 - 845
Target Start/End: Original strand, 38416138 - 38416279
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||    
T  38416138 ttttaggctaaattgcatttttaatctcttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttgttttc-ttaacttctct 38416236  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaa 845  Q
    | ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  38416237 cggttacacattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaa 38416279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 703 - 860
Target Start/End: Original strand, 14051884 - 14052040
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||    
T  14051884 ttttaggttaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtaatattgttttggttttttaattaaaattcgatttattttggttcctg-aacttttct 14051982  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    | ||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14051983 ccgttacacattttggtcctttcaattagttttaattcaaaaacgttaggctttcttc 14052040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 719 - 862
Target Start/End: Original strand, 17861050 - 17861191
Alignment:
Q  719 atttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcgg 818  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||| ||    
T  17861050 atttttggtcctttaactatttaggtaatgttgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcc--ttaacttctcttcggtacacattttgg 17861147  T
Q  819 tcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17861148 tccattccgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttcat 17861191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 704 - 792
Target Start/End: Original strand, 21750806 - 21750894
Alignment:
Q  704 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21750806 tttaggctaaattgcctttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 21750894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 701 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 25923511 - 25923349
Alignment:
Q  701 aattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttct 800  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||    
T  25923511 aatttaaggctaaattgcatttttggttcaa-aactatttatgtagtattgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctctt-aatttct 25923414  T
Q  801 ctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25923413 ctccgttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttcatttt 25923349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 707 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 15670538 - 15670381
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  15670538 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggttatttaattaaaattttatttattttggtccc-ttaacttctctgcat 15670440  T
Q  807 tacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||||||| | |||| |||   ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  15670439 tacacatgttggtcctttcgattagttttaattcaaaaacgttagattttctttatttt 15670381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 721 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 17736620 - 17736529
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacat 813  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  17736620 ttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaattaaaattcgatttattttggtctc-ttaaattctctctgttacacat 17736529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 705 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 17861419 - 17861250
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||      ||||||||||||| | |||||||||||     
T  17861419 ttaggctaaattgtatttttggtccct-aattatttaggtagtatcactttggtcc-ttaattaaa------tttattttggtcc-tgtaacttctctcc 17861329  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17861328 gttacacattttggtccttttcgttggttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatttttctgg 17861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 714 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 26289400 - 26289250
Alignment:
Q  714 attgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacat 813  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||  || |||||    
T  26289400 attgcatttttggtcctttaactatttaaatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgattcattttgatcc--ttaacttctctccattgcacat 26289303  T
Q  814 ttcggtcatttatgttag-ttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    ||  ||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26289302 ttttgtccttttcgttggtttttaattcaaaaacgttaggttttctacatttt 26289250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 706 - 859
Target Start/End: Original strand, 5152614 - 5152766
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaact-tctctct 804  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| | ||| |    
T  5152614 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatgtaattagtatgactttggccccttaattaaaatttgatttattttggtatc-ttaactctatct-t 5152711  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
     |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5152712 cttacacattttggtcctttttgttagttttaattcaaaaactttaggttttctt 5152766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 721 - 862
Target Start/End: Original strand, 14143524 - 14143661
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtc 820  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |   |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14143524 tttttgtcccttaactatttagatagtatcgttttggttt-ttaattaaaatt-gatttattttagtcc--ttaacttctctccgttacacattttggtc 14143619  T
Q  821 atttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
     |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14143620 ttttccgttagttttaattcaaaaacattaggttttcttcat 14143661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 711 - 784
Target Start/End: Original strand, 5460191 - 5460264
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttatttt 784  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5460191 taaattgtatttttggtcccttaactatttagacagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttatttt 5460264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 711 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 19185631 - 19185533
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttac 809  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19185631 taaattacctttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttac 19185533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 708 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 5460332 - 5460272
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaatta 768  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5460332 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaatta 5460272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 711 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 3879395 - 3879305
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  3879395 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatgactttggttcattatttaaaatttgatttattttggtctc-ttaacttctct 3879305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 547 - 599
Target Start/End: Original strand, 15191054 - 15191106
Alignment:
Q  547 ataattattttatacatgtatttaacgatgtgctatcatatcaattaatgaat 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  15191054 ataattattttatacatgtatttaatgatgtgttttcatatcaattaatgaat 15191106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 2597471 - 2597323
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaac-ttctctctg 805  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||  | || | | |||| || ||||| |||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  2597471 aggttaaattatctttttggtcccttaactatttaattggttttggtttggtctcttaactaaattttgatttattttggt-cctttaactttctctttg 2597373  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggttt 856  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2597372 ttacacgttttggtcatttccgttaaatttaatt-aaaaacgttagggttt 2597323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 3878770 - 3878693
Alignment:
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  3878770 ttacacattttggtcatttctgttaattttaattaaaaaaccttaggttttctttatttt-cttctggaattttcctgg 3878693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 706 - 750
Target Start/End: Original strand, 19615420 - 19615464
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatc 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19615420 taggttaaattgcatttttggtcccttgactatttaggtagtatc 19615464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 18400904 - 18400844
Alignment:
Q  551 ttattttatacatgtatttaacgatgtgctatcatatcaattaatgaatatgacggctcat 611  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18400904 ttatttaacacatgtatttaataatgtgttaccatatcaattaatgaatatgacagctcat 18400844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 701 - 749
Target Start/End: Original strand, 26288984 - 26289032
Alignment:
Q  701 aattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtat 749  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26288984 aattttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggttgtat 26289032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 721 - 771
Target Start/End: Original strand, 37191606 - 37191656
Alignment:
Q  721 ttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37191606 ttttggtcccttaactgtttatttggtatcgctttggtcccttaactaaaa 37191656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 827 - 865
Target Start/End: Original strand, 41859795 - 41859833
Alignment:
Q  827 gttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttt 865  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41859795 gttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcatttt 41859833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 829 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 5088073 - 5088040
Alignment:
Q  829 tagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5088073 tagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 5088040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 546 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 14717397 - 14717340
Alignment:
Q  546 tataattattttatacatgtatttaacgatgtgctatcatatcaattaatgaatatga 603  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  14717397 tataattattttacacatgcatctaatgatgtgttgtcacatcaattaatgaatatga 14717340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 37192540 - 37192467
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    |||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37192540 ttaaattttaggcttaaatgtgtttttggtcccttaactatttatttggtatcgctttggtcccttaactaaaa 37192467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 771
Target Start/End: Original strand, 38384858 - 38384931
Alignment:
Q  698 ttaaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaa 771  Q
    ||||| |||||| | || ||| |||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38384858 ttaaaatttaggcttaaatgcgtttttgatcccttaactatttatttggtatcgctttggtcccttaattaaaa 38384931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 703 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 13932 - 13752
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctct 802  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13932 tttttggttaaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctct 13834  T
Q  803 ctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctggg 885  Q
     |||||||||||| ||| ||||  |||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13833 ttgttacacattttggttatttccgttgattttaattcaaaaacgttgggttttcttca-ttttcttctggaatttttctggg 13752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 711 - 858
Target Start/End: Original strand, 13545 - 13690
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13545 taaattgcatttttggtcc-ttaactatttagttagaattgctttggtcccttagttaaaatccgatttattttggtccctt-aacttctctctgttaca 13642  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttct 858  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13643 cattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttaggttttct 13690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 103; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 723 - 877
Target Start/End: Original strand, 11228 - 11380
Alignment:
Q  723 ttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcat 822  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11228 ttggtcccttaactatttaggtagtattgctttcgtcccttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttacacattttggtcct 11326  T
Q  823 ttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatt 877  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11327 ttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttca-ttttcttctggaatt 11380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 11597 - 11447
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11597 taaattgcattttttatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccc-ttaacttctctctgttaca 11499  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11498 cattttggtcctttccattagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 711 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 11870 - 11723
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11870 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccc-ttaacttctctctgttata 11772  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttctt 859  Q
     |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11771 tattttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttctt 11723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 705 - 864
Target Start/End: Original strand, 11485 - 11643
Alignment:
Q  705 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctct 804  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  11485 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagaaagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtccc-ttaacttctctcc 11583  T
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcattt 864  Q
    ||| || |||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  11584 gttgcatattttggtctttttcgttagttttaatttaaaaacgttagattttcctcattt 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 700 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 45230 - 45069
Alignment:
Q  700 aaattttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttc 799  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  45230 aaattttcggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtattatcgctttgctcccttaattaaaaattgatttattgtggtccc-ttaacttc 45132  T
Q  800 tctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45131 tctttgttacacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 45069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 40735 - 40585
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  40735 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-tcattaacttctctccgttaca 40637  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40636 cattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagattttcttcat 40585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 706 - 879
Target Start/End: Original strand, 40350 - 40521
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||  |    
T  40350 taggctaaattgtatttttggtcccttaattatttagatagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgatttatttcggtccc-ttaattactctacg 40448  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||| |||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  40449 ttacagattttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgttaagttttcttca-ttttcttctgaaatttt 40521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 706 - 884
Target Start/End: Original strand, 1474 - 1649
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  1474 taggctaagttgcattttttgtcacttaactatttaggtagtatcgcattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatccc-ttaacttctctttg 1572  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  1573 ttacacattt-ggtcatttccgttagttttaattcaaacacgttagcttttcttta-ttttcttctggaatttttctgg 1649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 753 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 1815 - 1708
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  1815 tttggtcccttaattaaaat-cgatttattttgatccatt-aacttctctctgttacacattttggtcatttcggttaattttaattcaaaaacgttagg 1718  T
Q  853 gtttcttcat 862  Q
     |||||||||    
T  1717 ttttcttcat 1708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 708 - 860
Target Start/End: Original strand, 65739 - 65890
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||    
T  65739 ggttaaactgcatttttggtctcttaactatttaggtaatattgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctccatt 65837  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  65838 acacattttggtcatttccgttagttttaattccaaaacgttaggttttcttc 65890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 708 - 860
Target Start/End: Original strand, 73071 - 73222
Alignment:
Q  708 ggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgtt 807  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||    
T  73071 ggttaaactgcatttttggtctcttaactatttaggtaatattgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctccatt 73169  T
Q  808 acacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttc 860  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  73170 acacattttggtcatttccgttagttttaattccaaaacgttaggttttcttc 73222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 711 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 66122 - 65951
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  66122 taaattacatttttggtcgcttaactatttaggtagtatcgttttagttccttaattaaaattcaatttattttagtccc-ttaacttctctttgttaca 66024  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
     |||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  66023 tattttggtcctttttattagttttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttttctgg 65951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 711 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 73454 - 73283
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttaca 810  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  73454 taaattacatttttggtcgcttaactatttaggtagtatcgttttagttccttaattaaaattcaatttattttagtccc-ttaacttctctttgttaca 73356  T
Q  811 catttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaattttgctgg 884  Q
     |||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  73355 tattttggtcctttttattagttttaattcaaaaatgttaggttttcttca-ttttcttctgaaatttttctgg 73283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 706 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 177453 - 177298
Alignment:
Q  706 taggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg 805  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  177453 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtattatcagatcgatcccttaattaaaattcgatttattttgatccc-ttaacttctctatg 177355  T
Q  806 ttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  177354 ttacacattttgttcctttccgttagttttaattcaaaaacgttaggttttcttcat 177298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 714 - 879
Target Start/End: Original strand, 90811 - 90974
Alignment:
Q  714 attgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacat 813  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||    
T  90811 attgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgcttttgtcccttaattgaaatttgatttattttggtaac-ttaacttctttctcttacacat 90909  T
Q  814 ttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    || |||| |||  ||||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  90910 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaattattaggttttcttca-ttttcttcaggaatttt 90974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 758 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 91844 - 91725
Alignment:
Q  758 tcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttc 857  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||| || ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  91844 tcccttaattaaaatttgatttattttggtaactt-aacttctttctcttgcacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaatcattaggttttc 91746  T
Q  858 ttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  91745 ttca-ttttcttcaggaatttt 91725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 73; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 711 - 862
Target Start/End: Original strand, 93191 - 93343
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctg-ttac 809  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||| ||||    
T  93191 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttagtcacttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctctgtttac 93290  T
Q  810 acatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcat 862  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  93291 acattttggtcctttacgttagttttaattcaaaaacgttagggttttttcat 93343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 805 - 879
Target Start/End: Complemental strand, 93479 - 93407
Alignment:
Q  805 gttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  93479 gttacacattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacggtagggttt-ttca-ttttcttcttgaatttt 93407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 753 - 879
Target Start/End: Original strand, 11713 - 11837
Alignment:
Q  753 tttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgttacacatttcggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgttagg 852  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11713 tttggtcccttgactaaaatttgatttattttggtccctt-aacttctctttgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagg 11811  T
Q  853 gtttcttcatttttcttctggaatttt 879  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    
T  11812 ttttcttca-ttttcttctagaatttt 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 711 - 792
Target Start/End: Original strand, 11642 - 11723
Alignment:
Q  711 taaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctt 792  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11642 taaattgcatttttgataccttaactatttaggtattatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtccctt 11723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 707 - 789
Target Start/End: Original strand, 25966 - 26048
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcc 789  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25966 aggttaaattgcacttttggtctcctaactatgtagttggtatcactttgatcccttaattaaaactcgatttattttggtcc 26048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 828 - 874
Target Start/End: Original strand, 26055 - 26100
Alignment:
Q  828 ttagttttaattcaaaaacgttagggtttcttcatttttcttctgga 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  26055 ttagttttaattcaaaaacgttaggttttcatca-ttttcttctgga 26100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 707 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 11007 - 10905
Alignment:
Q  707 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtccctttaacttctctctgt 806  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  11007 aggtttaattgtctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttctgt 10908  T
Q  807 tac 809  Q
    |||    
T  10907 tac 10905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 703 - 789
Target Start/End: Original strand, 9777 - 9863
Alignment:
Q  703 ttttaggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcc 789  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||  | |||||| |||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9777 ttttaggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttgctcctctaactaaaatttgatttattttggtcc 9863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 709 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 6293 - 6229
Alignment:
Q  709 gttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatt 773  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6293 gttaaattgctattttcgtctcttaactatttaattagtatcgctttgatcccataattaaaatt 6229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University