View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2870R-Insertion-4 (Length: 870)

Name: NF2870R-Insertion-4
Description: NF2870R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2870R-Insertion-4
NF2870R-Insertion-4
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (7-840)||(4369493-4370322)
chr6 (9-774)||(4365162-4365920)
chr6 (15-263)||(4360270-4360518)
chr6 (52-254)||(4414439-4414640)
chr6 (57-249)||(4389919-4390111)
chr6 (54-276)||(4377209-4377431)
chr6 (57-304)||(4384754-4385001)
chr6 (20-271)||(5725395-5725643)
chr6 (555-623)||(5725918-5725986)
chr6 (437-513)||(4360023-4360099)
chr6 (444-513)||(4414828-4414897)
chr6 (555-623)||(4389553-4389621)
chr6 (667-765)||(4359778-4359876)
chr6 (555-603)||(4376888-4376936)
chr6 (807-840)||(4365092-4365125)
chr6 (565-611)||(4359931-4359977)
chr6 (438-511)||(4384547-4384620)
chr6 (670-743)||(4415047-4415120)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (130-163)||(15658720-15658753)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 756; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 756; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 4370322 - 4369493
Alignment:
Q  7 cagagagtaggaccataataaacttgttagtgaacagtccaaacggaacattctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaatcgcctgacaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4370322 cagagagtaggaccataataaacttgttagtgaacagtccaaacggaacattctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaatcgcctgacaa 4370223  T
Q  107 actctttcggattttggacaacattgttgaagaggttggagaagaaaatgttgtccaaattgtgacggacgatacaccattctgcagagctgttggtgag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4370222 actctttcggattttggacaacattgttgaagaggttggagaagaaaatgttgtccaaattgtgacggacaatacaccattctgcagagctgttggtgag 4370123  T
Q  207 atgttgatggagaaaagaactaggctgtattggaccccttgtgcaacaaattgcattcagatgattttggcagactgtgagacgaatatacctattcact 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4370122 atgttgatggagaaaagaactaggctgtattggaccccttgtgcaacaaattgcattcagatgattttggcagactgtgagacgaatatacctattcact 4370023  T
Q  307 cagagataactaagaaatgtcaagatcttatagcctttatttatataagcccttctgtcaagtctctaatgcggcatttcacaaaaggaaaagatatttt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4370022 cagagataactaagaaatgtcaagatcttatagcctttatttatgtaagcccttctgtcaagtctctaatgcggcatttcacaaaaggaaaagatatttt 4369923  T
Q  407 aaaagtgggcatgtatcaaagtgaaacatcatactttactttatgttgtattcacgagaacaaaggagctttggtaagaatgttcacatccgaggaatgg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4369922 aaaagtgggcatgtatcaaagtgaaacatcatactttactttatgttgtattcacgagaacaaaggagctttggtaagaatgttcacttccgaggaatgg 4369823  T
Q  507 aagtccacatccgacgagtttgcagagccgaagtctaggaaatgggcagaggatatgattttggacaaggagttttggaaatatgttatgatttgttata 606  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369822 aagtccacatccaacgagtttgcagagccgaagtctaggaaatgggcagaggatatgattttggacaaggagttttggaaatatgttatgatttgttata 4369723  T
Q  607 aaggtgtaaaacctctgctgaatttgcttcttatggtcaaactcaaccgtggtcccgatgatgggtttcatttatgaggatatggagagagctaaagata 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369722 aaggtgtaaaacctctgctgaatttgcttcttatggtc-aactcaaccgtggtcccgatgatgggtttcatttatgaggatatggagagagctaaagata 4369624  T
Q  707 agatacggaggagtctttccaaaagtgccatagaaagagaaaggtaaatatgttcggcaaaatcaagtatcacnnnnnnnnnnnaaatcgaacattttgg 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           |||||||||| |||||    
T  4369623 agatacggaggagtctttccaaaagtgccatagaaagagaaaggtaaatatgttcggcaggatcaagtatcac--tttttttttaaatcgaaca-tttgg 4369527  T
Q  807 tctgtagtcttggtttgaaaagcgaaaagtaatt 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369526 tctgtagtcttggtttgaaaagcgaaaagtaatt 4369493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4365920 - 4365162
Alignment:
Q  9 gagagtaggaccataataaacttgttagtgaacagtccaaacggaacattctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaatcgcctgacaaac 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4365920 gagagtaggaccatactaaactggttagtgaacagtccaaagggaacattctttttgaagtctattgatgcgtctgatatgttggaatcgcctgagaaac 4365821  T
Q  109 tctttcggattttggacaacattgttgaagaggttggagaagaaaatgttgtccaaattgtgacggacgatacaccattctgcagagctgttggtgagat 208  Q
    |||||  |||  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||  || || |  ||| |  | |  |||    
T  4365820 tctttaagatgatggatgacgttgttgaagaggttggggaagaaaatgctgtccacattgtgacggaatatacagaatactacgcagcagccgctatgat 4365721  T
Q  209 gttgatggagaaaagaactaggctgtattggaccccttgtgcaacaaattgcattcagatgattttggcagactgtgagacgaatatacctattcactca 308  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4365720 gctgatggcgaaaaggactaggctgtattggaccccttgtgcaacagattgcattctgacgatattggaagactgtgaggagaatatacctattcactca 4365621  T
Q  309 gagataactaagaaatgtcaagatcttatagcctttatttatataagcccttctgtcaagtctctaatgcggcatttcacaaaaggaaaagatattttaa 408  Q
    ||||||| |||||| |||||   ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4365620 gagataattaagaagtgtcagagtcttataacctttattcatacaaggccttctgtcaagtctctattgtggcacttcacaaaaggaaaagatattttaa 4365521  T
Q  409 aagtgggcatgtatcaaagtgaaacatcatactttactttatgttgtattcacgagaacaaaggagctttggtaagaatgttcacatccgaggaatggaa 508  Q
    || |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4365520 aattgggcatgtatcaatggcaaacatcatactatactttatgttgtattcacgagaacaaaggagctttggtaagaatgttcacatccgaggaatggaa 4365421  T
Q  509 gtccacatccgacgagtttgcagagccgaagtctaggaaatgggcagaggatatgattttggacaaggagttttggaaatatgttatgatttgttataaa 608  Q
    |||||       ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4365420 gtccag------cgagtttgcagagccaaggtctaggaaatgggcagaggatatgattttggacaaggagttttggaaatatgttatgatttgttataaa 4365327  T
Q  609 ggtgtaaaacctctgctgaatttgcttcttatggtcaaactcaaccgtggtcccgatgatgggtttcatttatgaggatatggagagagctaaagataag 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4365326 ggtgtaaaacctctgctgaatttgcttcttatggtc-gattcaaccatggtcccgatcatgggcttcatttatgaggcaatggagagagctaaagataag 4365228  T
Q  709 atacggaggagtctttccaaaagtgccatagaaagagaaaggtaaatatgttcggcaaaatcaagt 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4365227 atacggaggagtctttccaaaagtgccatagaaagagaaaggtaaatatgttcggcaggatcaagt 4365162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4360518 - 4360270
Alignment:
Q  15 aggaccataataaacttgttagtgaacagtccaaacggaacattctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaatcgcctgacaaactctttc 114  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  4360518 aggaacatactaaacttgttactgaacagtccaaagggaacattctttttgaagactattgatgcgtctgatatgttggaatcgtctgagaaactcttta 4360419  T
Q  115 ggattttggacaacattgttgaagaggttggagaagaaaatgttgtccaaattgtgacggacgatacaccattctgcagagctgttggtgagatgttgat 214  Q
      ||  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||| ||    |||||  | || |||||||||    
T  4360418 aaatgatggatgacgttgttgaagaggttggggaagaaaatgttgtccacgttgtaacggaatatacaccatactatgtagctgccgctgggatgttgat 4360319  T
Q  215 ggagaaaagaactaggctgtattggaccccttgtgcaacaaattgcatt 263  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4360318 ggcgaaaaggactaggctgtattggacaccttgcgcaacacattgcatt 4360270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 254
Target Start/End: Original strand, 4414439 - 4414640
Alignment:
Q  52 gaacattctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaatcgcctgacaaactctttcggattttggacaacattgttgaagaggttggagaaga 151  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |  ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||  ||||  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  4414439 gaacattctttttgaagtccgttgatgcgtcgaatatgttggaatcacctaacaaactctttaagatgatggatgaaattgtagaagaggttgg-gaaga 4414537  T
Q  152 aaatgttgtccaaattgtgacggacgatacaccattctgcagagctgttggtgagatgttgatggagaaaagaactaggctgtattggaccccttgtgca 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | || || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  4414538 aaatgttgtccaaattgtgacagacaatacaacctactacaaagttgctggtgagatgtagatggtgaaaaggactaggttgtattggacaccttgtgca 4414637  T
Q  252 aca 254  Q
    |||    
T  4414638 aca 4414640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4390111 - 4389919
Alignment:
Q  57 ttctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaatcgcctgacaaactctttcggattttggacaacattgttgaagaggttggagaagaaaatg 156  Q
    ||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||| |||| ||| | |||  |||  ||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4390111 ttctttttgaagtcggttgatgcgtccgatatgttggaatcgtctgagaaattgtttaagatgatggatgatgttgttgaagaggttggtgaagaaaatg 4390012  T
Q  157 ttgtccaaattgtgacggacgatacaccattctgcagagctgttggtgagatgttgatggagaaaagaactaggctgtattggaccccttgtg 249  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||  |||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||    
T  4390011 ttgttcaagttgtgacggataatacggcatatttcagagctgctggtgagatgttgatggagaagaggactaggttgtattggacaccttgtg 4389919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4377431 - 4377209
Alignment:
Q  54 acattctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaatcgcctgacaaactctttcggattttggacaacattgttgaagaggttggagaagaaa 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  | |||||| ||||||||||||| ||| | |||  |||  ||||  |  |||||||||||||||| |||||||    
T  4377431 acattctttttgaagtcggttgatgcgtcagatatgatggaatcgcctgagaaattgtttaagatgatggatgatgttgttgaagaggttggggaagaaa 4377332  T
Q  154 atgttgtccaaattgtgacggacgatacaccattctgcagagctgttggtgagatgttgatggagaaaagaactaggctgtattggaccccttgtgcaac 253  Q
    ||||||| ||| |||| |||||  ||||  | |  | || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  4377331 atgttgttcaagttgtaacggataatacgacttatttcaaagctgctggtgagatgttgatggagaagaggactaggttgtattggacaccttgtgcgac 4377232  T
Q  254 aaattgcattcagatgattttgg 276  Q
    | | |||||| ||||||| ||||    
T  4377231 acactgcattgagatgatgttgg 4377209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4385001 - 4384754
Alignment:
Q  57 ttctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaatcgcctgacaaactctttcggattttggacaacattgttgaagaggttggagaagaaaatg 156  Q
    |||||||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||| |||| ||| | |||  |||  ||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4385001 ttctttttaaagtcggttgatgcgtcagatatgttggaatcgtctgagaaattgtttaagatgatggatgatgttgttgaagaggttggggaagaaaatg 4384902  T
Q  157 ttgtccaaattgtgacggacgatacaccattctgcagagctgttggtgagatgttgatggagaaaagaactaggctgtattggaccccttgtgcaacaaa 256  Q
    |||| ||| |||| |||||  ||||  | |  | || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||| |    
T  4384901 ttgttcaagttgtcacggataatacggcttatttcaaagctgctggtgagatgttgatggagaagaggactaggttgtattggacaccttgtgcgacaca 4384802  T
Q  257 ttgcattcagatgattttggcagactgtgagacgaatatacctattca 304  Q
     |||||| ||| ||| |||| ||| | ||||| ||| |||||| ||||    
T  4384801 ctgcattgagaggatgttggaagattatgagaagaagatacctgttca 4384754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 271
Target Start/End: Original strand, 5725395 - 5725643
Alignment:
Q  20 cataataaacttgttagtgaacagtccaaacggaacattctttttgaagtctattgatgcaactgatatgttggaa--tcgcctgacaaactctttcgga 117  Q
    |||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||     ||  || |||||  |||| |||  ||    
T  5725395 catactaaacttcttcgtaaacagtccaaagggaacattctttttgaagtctgttgaatcagctgatat-----aagttcacctgaagaactatttaaga 5725489  T
Q  118 ttttggacaacattgttgaagaggttggagaagaaaatgttgtccaaattgtgacggacgatacaccattctgcagagctgttggtgagatgttgatgga 217  Q
    |  ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| ||    |   | |||||||||||||||| |    
T  5725490 tgatggatgacattgttgaagaagttggggaagaaaatgttgtccaaattgtgacggacagtgcaacatactatgaaaaggctggtgagatgttgatgaa 5725589  T
Q  218 gaaaagaactaggctgtattggaccccttgtgcaacaaattgcattcagatgat 271  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||    
T  5725590 gaaaaggactaggttgtattggacaccttgtgcaacacggtgcattgagatgat 5725643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 555 - 623
Target Start/End: Original strand, 5725918 - 5725986
Alignment:
Q  555 gaggatatgattttggacaaggagttttggaaatatgttatgatttgttataaaggtgtaaaacctctg 623  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5725918 gaggatttggttttggacaaggagttttggaaagatgttatgatttgttataaaggtgcaaatcctctg 5725986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 437 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4360099 - 4360023
Alignment:
Q  437 atactttactttatgttgtattcacgagaacaaaggagctttggtaagaatgttcacatccgaggaatggaagtcca 513  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  4360099 atacttaactttatgttgtcttcatgagaacaaaggagctttgagaagaatgttcaaatccaaggagtggaagtcca 4360023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 513
Target Start/End: Original strand, 4414828 - 4414897
Alignment:
Q  444 actttatgttgtattcacgagaacaaaggagctttggtaagaatgttcacatccgaggaatggaagtcca 513  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4414828 actttaggttgtattcatgagaacgaaggagctttgagaagaatgttcacatccaaggagtggaagtcca 4414897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 555 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 4389621 - 4389553
Alignment:
Q  555 gaggatatgattttggacaaggagttttggaaatatgttatgatttgttataaaggtgtaaaacctctg 623  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  4389621 gaggatgtggttttggacaaggagttttggaaaaatgttatgatttgtttgaaaggtgcaaatcctctg 4389553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 667 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 4359876 - 4359778
Alignment:
Q  667 atgggtttcatttatgaggatatggagagagctaaagataagatacggaggagtctttccaaaagtgccatagaaagagaaaggtaaatatgttcggca 765  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||  |||||| || |||||||||| ||  || || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4359876 atgggtttcatttatgaggcaatggtgaaagctatagaggagatacagaagagtctttccgaagatgacaaagaaagggaaaggtaaatatgttcggca 4359778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 4376936 - 4376888
Alignment:
Q  555 gaggatatgattttggacaaggagttttggaaatatgttatgatttgtt 603  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4376936 gaggatgtggttttggacaaggagttttggaaaaatgttatgatttgtt 4376888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 807 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 4365125 - 4365092
Alignment:
Q  807 tctgtagtcttggtttgaaaagcgaaaagtaatt 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4365125 tctgtagtcttggtttgaaaagcgaaaagtaatt 4365092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4359977 - 4359931
Alignment:
Q  565 ttttggacaaggagttttggaaatatgttatgatttgttataaaggt 611  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4359977 ttttgaacaaagggttttggaaaaatgttatgatttgttataaaggt 4359931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 4384620 - 4384547
Alignment:
Q  438 tactttactttatgttgtattcacgagaacaaaggagctttggtaagaatgttcacatccgaggaatggaagtc 511  Q
    ||||| |||||||  ||| |||| |||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4384620 tacttaactttatactgtcttcatgagaccaagggagctttgagaacaatgttcacatccgaggcatggaagtc 4384547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 743
Target Start/End: Original strand, 4415047 - 4415120
Alignment:
Q  670 ggtttcatttatgaggatatggagagagctaaagataagatacggaggagtctttccaaaagtgccatagaaag 743  Q
    |||| |||||||||||   |||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4415047 ggttccatttatgaggcattggagcaagctaaagaggagatacgaaggagtctttccaaaggtgtcatagaaag 4415120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 163
Target Start/End: Original strand, 15658720 - 15658753
Alignment:
Q  130 ttgttgaagaggttggagaagaaaatgttgtcca 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15658720 ttgttgaagagattggagaagaaaatgttgtcca 15658753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University