View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2880R-Insertion-10 (Length: 940)
Name: NF2880R-Insertion-10
Description: NF2880R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2880R-Insertion-10 |
 |  |
|
| [»] scaffold0031 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0173 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0836 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0515 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0306 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0896 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0562 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1360 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0316 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 12264430 - 12263980
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
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| T |
12264430 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
12264331 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
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| T |
12264330 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
12264231 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
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| T |
12264230 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctttttcttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
12264131 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
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| T |
12264130 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
12264032 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
12264031 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
12263980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 481 - 932
Target Start/End: Original strand, 38653923 - 38654376
Alignment:
| Q |
481 |
aataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatat |
580 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
38653923 |
aataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatat |
38654022 |
T |
 |
| Q |
581 |
gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc |
680 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38654023 |
gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc |
38654122 |
T |
 |
| Q |
681 |
ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaat |
780 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38654123 |
ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaat |
38654222 |
T |
 |
| Q |
781 |
tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgg |
879 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38654223 |
tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-g |
38654321 |
T |
 |
| Q |
880 |
gcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38654322 |
gcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
38654376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 49672791 - 49672343
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49672791 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
49672692 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49672691 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
49672592 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
49672591 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttctgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
49672493 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
49672492 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
49672394 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49672393 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
49672343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 34121584 - 34121136
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34121584 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatacgtgg |
34121485 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34121484 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
34121385 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34121384 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
34121286 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34121285 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
34121187 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34121186 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
34121136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 21098533 - 21098084
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
21098533 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
21098434 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21098433 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
21098334 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21098333 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttaaaaaattgttacttcattcttttgtaaaaattata |
21098234 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
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| T |
21098233 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
21098135 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21098134 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
21098084 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 43363610 - 43364059
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43363610 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
43363709 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43363710 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
43363809 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43363810 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
43363908 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
43363909 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-ggct |
43364007 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43364008 |
tttaccgtaaatgataccctttaactatttgttgaaatgtttcttccacctg |
43364059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 3898651 - 3898203
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3898651 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtgg |
3898552 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3898551 |
tcccaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
3898452 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3898451 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcgta-tttttttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
3898353 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
3898352 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcat |
3898254 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3898253 |
ttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
3898203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 20671480 - 20671031
Alignment:
| Q |
483 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
582 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20671480 |
taactagactttccacccgtgctgccacacgagtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
20671381 |
T |
 |
| Q |
583 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
682 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20671380 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
20671281 |
T |
 |
| Q |
683 |
ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta |
782 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20671280 |
ttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--cttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta |
20671183 |
T |
 |
| Q |
783 |
tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc |
881 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20671182 |
tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggt |
20671084 |
T |
 |
| Q |
882 |
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Q |
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ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
20671031 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 4584434 - 4584880
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T |
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684 |
Q |
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T |
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T |
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| T |
4584733 |
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T |
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Q |
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ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccgcctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 31488638 - 31488194
Alignment:
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Q |
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T |
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686 |
Q |
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| T |
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31488439 |
T |
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| T |
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31488243 |
T |
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| Q |
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Q |
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aacgtaaatgatacgctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 36076453 - 36076899
Alignment:
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| T |
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T |
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| Q |
584 |
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683 |
Q |
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| T |
36076553 |
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T |
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| Q |
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783 |
Q |
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| T |
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T |
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T |
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883 |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 49478437 - 49477989
Alignment:
| Q |
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584 |
Q |
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49478437 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatttacattgtagacgtagtagataaaaacaaatctcaatacatatcaaagataatgaaatatgtgg |
49478338 |
T |
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| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
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| T |
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T |
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784 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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883 |
Q |
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| T |
49478138 |
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49478040 |
T |
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| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
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| T |
49478039 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
49477989 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 39146667 - 39146228
Alignment:
| Q |
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586 |
Q |
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| T |
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686 |
Q |
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| T |
39146567 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgt |
39146468 |
T |
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| Q |
687 |
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786 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
787 |
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885 |
Q |
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| T |
39146375 |
ttaatgttatattatgtacttaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacattt |
39146277 |
T |
 |
| Q |
886 |
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932 |
Q |
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accgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
39146228 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 483 - 912
Target Start/End: Original strand, 45557882 - 45558309
Alignment:
| Q |
483 |
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T |
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682 |
Q |
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45557982 |
ggtcccaagtatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattctt |
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T |
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| Q |
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Q |
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880 |
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T |
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Q |
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cctttaccgtaaatgataccctttaactgttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46531366 - 46531040
Alignment:
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T |
 |
| Q |
112 |
tcttcttgaattctgtttttgataccaaatgtttggtgatgttcatagcattcttggttaaattagcgattgattcgcggtggtaactcattcttcttct |
211 |
Q |
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| T |
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tcttcttgaattctgtttttgataccaaatgtttggtgatgttcatagcattcttggttaaattagcgattgattcgcggtggtaactcattcttcttct |
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T |
 |
| Q |
212 |
tgnnnnnnncaattgtgaaagtagaagagtgctgcggttgaaatcctctgtgctgtcaaggtgaaacgattgagactattgaagacctaaatatatatcg |
311 |
Q |
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| T |
46531166 |
ggtttttttcaattgtgaaagtagaagagtgctgcggttgaaatcctctgtgccgtcaaggagaaacgattgagactattgaagacctaaa--------- |
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T |
 |
| Q |
312 |
tttaattgtgagagagaggtgttttagacttctagggtt |
350 |
Q |
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| T |
46531075 |
---aattgtgagagagaggtgttttaaacttctagggtt |
46531040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 490 - 932
Target Start/End: Original strand, 55041588 - 55042036
Alignment:
| Q |
490 |
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Q |
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T |
 |
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590 |
aatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntatta------atttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
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| T |
55041688 |
aatatatgcagatgtttgaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatttttatcaatcgtgtgttacttcactcttt |
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T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
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T |
 |
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784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
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| T |
55041886 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattctaaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
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T |
 |
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tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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Q |
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| T |
55041985 |
tttaccgtaaatgatacgctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
55042036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 527 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 24119394 - 24118991
Alignment:
| Q |
527 |
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T |
 |
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acgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttactt |
726 |
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T |
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catannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaa |
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Q |
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|
|
| T |
24119194 |
cat----ttttattttatttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaaagttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaa |
24119099 |
T |
 |
| Q |
827 |
cctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttc |
923 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24119098 |
cctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcatttatcgtaaatgataccctttaactgtttgtcgaaatgtttc |
24119000 |
T |
 |
| Q |
924 |
ttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
24118999 |
ttccacctg |
24118991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 485 - 804
Target Start/End: Original strand, 1941720 - 1942038
Alignment:
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485 |
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584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1941720 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
1941819 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1941820 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacatcacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
1941919 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1941920 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttaattcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
1942018 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgta |
804 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1942019 |
tgttaatgttatattatgta |
1942038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 483 - 730
Target Start/End: Original strand, 49506347 - 49506594
Alignment:
| Q |
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taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
582 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49506347 |
taactagactttccacccgtactgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
49506446 |
T |
 |
| Q |
583 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
682 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49506447 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtggtacttcattctt |
49506546 |
T |
 |
| Q |
683 |
ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49506547 |
ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
49506594 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 54073259 - 54073011
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatata---cattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54073259 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatagtacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg |
54073160 |
T |
 |
| Q |
582 |
tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct |
681 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54073159 |
tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct |
54073060 |
T |
 |
| Q |
682 |
tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54073059 |
tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
54073011 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 26949027 - 26948783
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26949027 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
26948928 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26948927 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
26948828 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26948827 |
gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
26948783 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 647 - 932
Target Start/End: Original strand, 26052240 - 26052527
Alignment:
| Q |
647 |
tattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnn |
746 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26052240 |
tattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcatctttttttattttattt |
26052339 |
T |
 |
| Q |
747 |
nngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgttt |
845 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26052340 |
ttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacataaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttt |
26052439 |
T |
 |
| Q |
846 |
aatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26052440 |
tatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
26052527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 485 - 669
Target Start/End: Original strand, 40014653 - 40014837
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40014653 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataataaacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
40014752 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtg |
669 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40014753 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtg |
40014837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 752 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 26948736 - 26948556
Alignment:
| Q |
752 |
aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt |
850 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
26948736 |
aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttattt |
26948637 |
T |
 |
| Q |
851 |
aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc |
930 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26948636 |
aaataattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgtaaacgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc |
26948556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 517 - 639
Target Start/End: Original strand, 26051334 - 26051457
Alignment:
| Q |
517 |
catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggt-cccaaatatatgcagatgttggaattcgaa |
615 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
26051334 |
catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccccaaatatatgctgaggttggaattcgaa |
26051433 |
T |
 |
| Q |
616 |
cctcagacaccacgcttattcacc |
639 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26051434 |
cctcagacaccacgcttattcacc |
26051457 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 793 - 940
Target Start/End: Original strand, 49506643 - 49506792
Alignment:
| Q |
793 |
ttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctca-catgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgta |
891 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
49506643 |
ttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaaactcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgta |
49506741 |
T |
 |
| Q |
892 |
aatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctgattaaata |
940 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
49506742 |
aatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctgtttaaata |
49506792 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 591
Target Start/End: Original strand, 6460166 - 6460273
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| Q |
483 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
582 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
6460166 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatacatatcaaa-agaataaaatatgt |
6460264 |
T |
 |
| Q |
583 |
ggtcccaaa |
591 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
6460265 |
ggtcccaaa |
6460273 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 37099764 - 37099713
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaa |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
37099764 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaa |
37099713 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Original strand, 46554847 - 46554929
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| Q |
9 |
gatccaaggaaggagagaagctgacattgtgtcggaccctcggaaccggcagctactatgctgagcacagtttggagtgacaa |
91 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
46554847 |
gatccgaggaaggagagaagctgacgttgagtgggaccctcggaaccagcagtgaccatactgagcgtagtttggagtgacaa |
46554929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1546314 - 1546278
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1546314 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
1546278 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5273710 - 5273674
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5273710 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
5273674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8068652 - 8068616
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8068652 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
8068616 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10049245 - 10049209
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
10049209 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10471484 - 10471448
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10471484 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
10471448 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 13286929 - 13286965
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13286929 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
13286965 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20607821 - 20607785
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449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20607821 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24348802 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
24348838 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
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449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 35846746 - 35846782
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35846746 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
35846782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 37126761 - 37126725
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37126761 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
37126725 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 47697767 - 47697803
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47697767 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
47697803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 51167307 - 51167271
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51167307 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
51167271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 51754422 - 51754458
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51754422 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
51754458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28555296 - 28555261
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28555296 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
28555261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 5218974 - 5219008
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5218974 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
5219008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26718095 - 26718061
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26718095 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
26718061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 48458387 - 48458421
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48458387 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
48458421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 53018982 - 53019016
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53018982 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
53019016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 5189787 - 5189852
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5189787 |
actagactttacacccgtgctaccgcaagggtcatatataatgtaaaaatagtagacaaaagcaaa |
5189852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 26948732 - 26948687
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
713 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
26948732 |
tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat |
26948687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 26948844 - 26948799
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26948844 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
26948799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 10659525 - 10659561
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10659525 |
caagttaaacccaaatttatttaaaattttacaataa |
10659561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 31655044 - 31655080
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
31655044 |
caagttacacccaaatttatttaaaatttaacaataa |
31655080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 37821061 - 37821097
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37821061 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa |
37821097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 43973361 - 43973325
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43973361 |
caagttatacccaaatttatttaaaattttacaataa |
43973325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 46528089 - 46528125
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46528089 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
46528125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 55274277 - 55274241
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55274277 |
caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
55274241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 998447 - 998412
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
998447 |
aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
998412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 2445961 - 2445996
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2445961 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
2445996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8828745 - 8828710
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8828745 |
aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
8828710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 30357251 - 30357286
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30357251 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
30357286 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 44377782 - 44377817
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44377782 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
44377817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 525
Target Start/End: Original strand, 53556920 - 53556951
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacat |
525 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53556920 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacat |
53556951 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 501740 - 501774
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
501740 |
agttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
501774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 539
Target Start/End: Original strand, 13364022 - 13364076
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtag |
539 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13364022 |
actagacatttcacctctgctgccgcacgggtcatatacattgtatatgtagtag |
13364076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17338607 - 17338573
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17338607 |
agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa |
17338573 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 22497241 - 22497275
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22497241 |
agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa |
22497275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 41454247 - 41454281
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41454247 |
agttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
41454281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 43218757 - 43218791
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43218757 |
agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa |
43218791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 538
Target Start/End: Original strand, 46921423 - 46921477
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagta |
538 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
46921423 |
aactagacttttcacccgtgctttcgcacgagtcatatacaatgtaaatatagta |
46921477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 526
Target Start/End: Original strand, 5561565 - 5561594
Alignment:
| Q |
497 |
acccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
526 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5561565 |
acccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
5561594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 20370357 - 20370394
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20370357 |
aactagaccatccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
20370394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 54073073 - 54073028
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
54073073 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
54073028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 482 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 52434856 - 52434405
Alignment:
| Q |
482 |
ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52434856 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 16917886 - 16918336
Alignment:
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 30824922 - 30825370
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 53143261 - 53143712
Alignment:
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T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 12090459 - 12090908
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T |
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12090757 |
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12090856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 31965968 - 31966417
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T |
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| Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 483 - 912
Target Start/End: Original strand, 16904950 - 16905374
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 47142799 - 47143248
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gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
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Q |
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T |
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| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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Q |
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47143197 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 474 - 932
Target Start/End: Original strand, 39058346 - 39058800
Alignment:
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gaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttac |
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T |
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ttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattcttttt |
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39058739 |
T |
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932 |
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39058740 |
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39058800 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 37590804 - 37591248
Alignment:
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T |
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684 |
Q |
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| T |
37590904 |
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37591003 |
T |
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| Q |
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784 |
Q |
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| T |
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37591098 |
T |
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883 |
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| T |
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37591197 |
T |
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932 |
Q |
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37591198 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 485 - 931
Target Start/End: Original strand, 48118534 - 48118979
Alignment:
| Q |
485 |
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584 |
Q |
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actagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagat---gtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
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T |
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684 |
Q |
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| T |
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48118730 |
T |
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| Q |
685 |
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784 |
Q |
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| T |
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48118830 |
T |
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| Q |
785 |
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883 |
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| T |
48118831 |
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48118929 |
T |
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| Q |
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931 |
Q |
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48118930 |
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48118979 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 494 - 932
Target Start/End: Original strand, 44376088 - 44376525
Alignment:
| Q |
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Q |
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| T |
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tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaata |
44376187 |
T |
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| Q |
594 |
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693 |
Q |
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| T |
44376188 |
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44376287 |
T |
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| Q |
694 |
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793 |
Q |
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| T |
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44376384 |
T |
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| Q |
794 |
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892 |
Q |
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| T |
44376385 |
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44376483 |
T |
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| Q |
893 |
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932 |
Q |
| |
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| T |
44376484 |
atgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
44376525 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 482 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 46256266 - 46255839
Alignment:
| Q |
482 |
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581 |
Q |
| |
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| T |
46256266 |
ataagtagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatg |
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T |
 |
| Q |
582 |
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681 |
Q |
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| T |
46256166 |
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46256067 |
T |
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| Q |
682 |
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781 |
Q |
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| T |
46256066 |
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46255972 |
T |
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| Q |
782 |
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880 |
Q |
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| T |
46255971 |
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46255873 |
T |
 |
| Q |
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914 |
Q |
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| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
46255872 |
catttagcgtaaatgatatcctttaactgtttgt |
46255839 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 41387356 - 41386907
Alignment:
| Q |
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583 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
584 |
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683 |
Q |
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| T |
41387256 |
gtcccaaatatatgcagatgctgaaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcgatcgtgtcttacttcattcttt |
41387157 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
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| T |
41387156 |
tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-ctttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattat |
41387058 |
T |
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| Q |
784 |
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882 |
Q |
| |
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| T |
41387057 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gaca |
41386959 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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|
| T |
41386958 |
tttagcgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
41386907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 509 - 932
Target Start/End: Original strand, 52098214 - 52098638
Alignment:
| Q |
509 |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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gcacgggtcatatacactgtaaatatagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga |
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T |
 |
| Q |
609 |
attcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntatt-aatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta |
707 |
Q |
| |
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| T |
52098314 |
attcaaacttcagacacaacacttattcaccttaaaaatattaaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtta |
52098413 |
T |
 |
| Q |
708 |
tattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacct |
807 |
Q |
| |
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| T |
52098414 |
tattattggtttgttacttcat--tttttattttattttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacct |
52098511 |
T |
 |
| Q |
808 |
aaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaa |
906 |
Q |
| |
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| T |
52098512 |
aaaaatagcttattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaagaattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgtaaatgataccctttaa |
52098610 |
T |
 |
| Q |
907 |
ctgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52098611 |
ctgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
52098638 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 37651895 - 37651650
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatgaaagagaatgaaatatgtgg |
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T |
 |
| Q |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
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| T |
37651795 |
tctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
37651696 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
730 |
Q |
| |
|
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| T |
37651695 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
37651650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Original strand, 33139471 - 33139715
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
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|
| T |
33139471 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatttagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaattaaatatgttg |
33139570 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
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| T |
33139571 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacatttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattctttt |
33139670 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
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| T |
33139671 |
gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
33139715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 487 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 54625177 - 54624764
Alignment:
| Q |
487 |
tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
586 |
Q |
| |
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| T |
54625177 |
tagattttccacatgtgatgtcgcacgggttatatacattgtagacgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
54625078 |
T |
 |
| Q |
587 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
686 |
Q |
| |
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| T |
54625077 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatca------tgttacttcattc-tttgt |
54624985 |
T |
 |
| Q |
687 |
taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg |
786 |
Q |
| |
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| T |
54624984 |
taaaattatatgtcaatgttatattattggtatg--acttcat-----ctttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatg |
54624892 |
T |
 |
| Q |
787 |
ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt |
885 |
Q |
| |
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| T |
54624891 |
ttaatgttatattatgtacttaaaaataactcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggccttt |
54624793 |
T |
 |
| Q |
886 |
accgtaaatgataccctttaactgtttgt |
914 |
Q |
| |
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| T |
54624792 |
accgtaaatgatgccctttaactgtttgt |
54624764 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 482 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 35760813 - 35760566
Alignment:
| Q |
482 |
ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg |
581 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35760813 |
ataactagattttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatatagtagataaaaataaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatg |
35760714 |
T |
 |
| Q |
582 |
tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct |
681 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35760713 |
tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacaattattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct |
35760614 |
T |
 |
| Q |
682 |
tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35760613 |
tttgttaaaattatatgtcaatgttatataattggtatgttacttcat |
35760566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 487 - 729
Target Start/End: Original strand, 45976992 - 45977234
Alignment:
| Q |
487 |
tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
586 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45976992 |
tagactttccatccgtgctgctgcacgggtcatatacatcgtagatgtagtagataaaaataaatatcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
45977091 |
T |
 |
| Q |
587 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
686 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45977092 |
ctaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgt |
45977191 |
T |
 |
| Q |
687 |
taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45977192 |
taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
45977234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 534 - 932
Target Start/End: Original strand, 45782478 - 45782859
Alignment:
| Q |
534 |
tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgctta |
633 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45782478 |
tagtagacaaaaataaatctcaatatatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgaagatgttggaatttgaacctcagacaccacactta |
45782577 |
T |
 |
| Q |
634 |
ttcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannn |
733 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45782578 |
ttcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---c |
45782674 |
T |
 |
| Q |
734 |
nnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-ac |
832 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |
|
|
| T |
45782675 |
tttttttttagttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgt----------------aaatagctcatttttaacctcaac |
45782758 |
T |
 |
| Q |
833 |
atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc |
930 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45782759 |
atgtaaaatgttttatttaaataattttgcttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatgtctcttccacc |
45782857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 508 - 726
Target Start/End: Original strand, 31628510 - 31628728
Alignment:
| Q |
508 |
cgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgg |
607 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628510 |
cgcacgggtcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaattaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttgg |
31628609 |
T |
 |
| Q |
608 |
aattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta |
707 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
31628610 |
aattcgaacctcatacaccacacttattcatcttaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtta |
31628709 |
T |
 |
| Q |
708 |
tattattggtatgttactt |
726 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628710 |
tattattggtatgttactt |
31628728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 547 - 932
Target Start/End: Original strand, 50229768 - 50230161
Alignment:
| Q |
547 |
caaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnn |
646 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50229768 |
caaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaacatgtggtccaaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccatacttattcaccttaaaaa |
50229867 |
T |
 |
| Q |
647 |
tattaa-tttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatta-ttggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnn |
744 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
50229868 |
tattaattttttatcaatagtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattatttgctatgttacttcat---cctttttctttt |
50229964 |
T |
 |
| Q |
745 |
nnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacct-aaaaatagttcattcttaacctc-------acatgt |
836 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | | || |||| | |||| |
|
|
| T |
50229965 |
tttttacaaaatgctacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatatacctcaaaaaaaggttttattttccctcaaaaaaaaaatgt |
50230064 |
T |
 |
| Q |
837 |
aaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50230065 |
aaaaggttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggccttaaccgtaaatgataacctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
50230161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 752 - 928
Target Start/End: Original strand, 45977260 - 45977438
Alignment:
| Q |
752 |
aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt |
850 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
45977260 |
aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttattt |
45977359 |
T |
 |
| Q |
851 |
aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttcca |
928 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45977360 |
aaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttcca |
45977438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 755 - 932
Target Start/End: Original strand, 31628720 - 31628899
Alignment:
| Q |
755 |
atgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaag |
853 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31628720 |
atgttacttaattcttttgtaaaaattatatgttaatgctatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaa |
31628819 |
T |
 |
| Q |
854 |
taattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31628820 |
taatttttcttttgtcgaatattt-gacctttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
31628899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Original strand, 14148709 - 14148809
Alignment:
| Q |
833 |
atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc |
930 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14148709 |
atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc |
14148807 |
T |
 |
| Q |
931 |
tg |
932 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
14148808 |
tg |
14148809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 525 - 579
Target Start/End: Original strand, 50229712 - 50229766
Alignment:
| Q |
525 |
ttgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata |
579 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50229712 |
ttgtagatgtagtagacaaaaaaaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata |
50229766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18209741 - 18209699
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
526 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18209741 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
18209699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3875753 - 3875717
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3875753 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
3875717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17445748 - 17445712
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17445748 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
17445712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 550
Target Start/End: Original strand, 22289953 - 22290020
Alignment:
| Q |
483 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
22289953 |
taactagaccttgcacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgaaaatgtagaaggcaaaaacaaa |
22290020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 592 - 639
Target Start/End: Original strand, 34684603 - 34684650
Alignment:
| Q |
592 |
tatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc |
639 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
34684603 |
tatatgcagaggttggaattcgaacctcagacaccccacttattcacc |
34684650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19745278 - 19745228
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaa |
544 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
19745278 |
tccacccgtgcggccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaa |
19745228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Original strand, 19794528 - 19794578
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaa |
544 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
19794528 |
tccacccgtgcggccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaa |
19794578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27767721 - 27767687
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27767721 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
27767687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 54202332 - 54202366
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54202332 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
54202366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 56162475 - 56162509
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56162475 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
56162509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 31628670 - 31628715
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31628670 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
31628715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35949587 - 35949554
Alignment:
| Q |
452 |
gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35949587 |
gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
35949554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 45977173 - 45977218
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45977173 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
45977218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Original strand, 45977264 - 45977309
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
713 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
45977264 |
tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat |
45977309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3932077 - 3932041
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3932077 |
caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataa |
3932041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7554528 - 7554492
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7554528 |
caagttacacccaaatttatttcaaattttacaataa |
7554492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 22169109 - 22169145
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22169109 |
caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataa |
22169145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24745078 - 24745042
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24745078 |
caagttacacccaaatttatttacaattttacaataa |
24745042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 484 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26724174 - 26724134
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatataca |
524 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26724174 |
aactagacttttcacccgtgctgccgcacgggttatataca |
26724134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 28573856 - 28573824
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttaca |
481 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28573856 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttaca |
28573824 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33961889 - 33961853
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33961889 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
33961853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 36309087 - 36309055
Alignment:
| Q |
453 |
ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36309087 |
ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
36309055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 36432573 - 36432537
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataac |
486 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36432573 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataac |
36432537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 39677793 - 39677757
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39677793 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
39677757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Original strand, 50621666 - 50621698
Alignment:
| Q |
453 |
ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50621666 |
ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
50621698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7327783 - 7327748
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7327783 |
aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
7327748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11238212 - 11238181
Alignment:
| Q |
495 |
ccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
526 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11238212 |
ccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
11238181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 529
Target Start/End: Original strand, 23976715 - 23976750
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgta |
529 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23976715 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatatattgta |
23976750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Original strand, 33139656 - 33139699
Alignment:
| Q |
758 |
ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33139656 |
ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
33139699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 36225220 - 36225185
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36225220 |
aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
36225185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 2491833 - 2491867
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2491833 |
agttacacccaaatttatttaaaatttaacaataa |
2491867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7326525 - 7326491
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7326525 |
agttacacccaaatttatttaaaattttagaataa |
7326491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11005738 - 11005704
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11005738 |
agttacacccaaatttatttaaaatttaacaataa |
11005704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 527
Target Start/End: Original strand, 18258213 - 18258255
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattg |
527 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18258213 |
actagactgtctatccgtgctgccgcacgggtcatatacattg |
18258255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 756 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 35760627 - 35760585
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatat |
798 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35760627 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat |
35760585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 496 - 550
Target Start/End: Original strand, 37340614 - 37340667
Alignment:
| Q |
496 |
cacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37340614 |
cacccgtgctgacgcacgggtcatatacaatgta-aaatagtagacaaaagcaaa |
37340667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 43957945 - 43957911
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43957945 |
agttacccccaaatttatttaaaattttacaataa |
43957911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 49332218 - 49332184
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
49332218 |
agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa |
49332184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 8371079 - 8371116
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8371079 |
aactagaccttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat |
8371116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 37651712 - 37651667
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
37651712 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
37651667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 16526305 - 16526755
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16526305 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
16526404 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16526405 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcgttcttt |
16526504 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16526505 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatattcttcttctttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
16526604 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16526605 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
16526703 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16526704 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
16526755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 38246864 - 38247313
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38246864 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
38246963 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38246964 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
38247063 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
38247064 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
38247162 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38247163 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
38247261 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38247262 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
38247313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 20874917 - 20874469
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20874917 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
20874818 |
T |
 |
| Q |
585 |
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Q |
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Target: chr5; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 34107336 - 34107786
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T |
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Q |
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T |
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782 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 34110881 - 34110431
Alignment:
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T |
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684 |
Q |
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| T |
34110781 |
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 2398940 - 2399388
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T |
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T |
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782 |
Q |
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| T |
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T |
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tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc |
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T |
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Q |
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ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 10729440 - 10729890
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| T |
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taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatccaagagaatgaaatatgt |
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T |
 |
| Q |
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ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
682 |
Q |
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| T |
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ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
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T |
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| Q |
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782 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
783 |
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881 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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atttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
10729890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 17373161 - 17373612
Alignment:
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T |
 |
| Q |
582 |
tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct |
681 |
Q |
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| T |
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tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct |
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T |
 |
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682 |
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781 |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 520 - 932
Target Start/End: Original strand, 33570342 - 33570756
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Q |
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T |
 |
| Q |
720 |
gttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttca |
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Q |
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gttacttcatatttttttattttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttca |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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| Q |
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33570741 |
atgtttcttccacctg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 492 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 1396211 - 1395772
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T |
 |
| Q |
592 |
tatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaa |
691 |
Q |
| |
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tatctgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcagtcgtgtgttacttcattcttttgttaaaa |
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T |
 |
| Q |
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ttatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaat |
791 |
Q |
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ttatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---cttcttttctttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaat |
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T |
 |
| Q |
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gttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgt |
890 |
Q |
| |
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| T |
1395914 |
gttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcctttaccgt |
1395816 |
T |
 |
| Q |
891 |
aaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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| T |
1395815 |
aaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 485 - 914
Target Start/End: Original strand, 20655049 - 20655472
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
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20655148 |
T |
 |
| Q |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
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Q |
| |
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| T |
20655149 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtcttacttcattctttt |
20655248 |
T |
 |
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685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
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20655249 |
gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat------cttctttttttttgacaaaatgttacttcattattttggaaaaattata |
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T |
 |
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785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
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Q |
| |
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| T |
20655343 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacat |
20655441 |
T |
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884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt |
914 |
Q |
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| T |
20655442 |
ttagcgtaaatgataccctttaactgtttgt |
20655472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 5479427 - 5478980
Alignment:
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582 |
Q |
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| T |
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taactagacttttcacctgtgttgtcgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
5479328 |
T |
 |
| Q |
583 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
682 |
Q |
| |
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| T |
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gatcccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcagacactacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
5479228 |
T |
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| Q |
683 |
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782 |
Q |
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| T |
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5479132 |
T |
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| Q |
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| T |
5479131 |
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5479033 |
T |
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| Q |
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932 |
Q |
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5479032 |
ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgatgaaatgtttcttccacctg |
5478980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 532 - 932
Target Start/End: Original strand, 14141154 - 14141555
Alignment:
| Q |
532 |
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631 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14141154 |
tatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgct |
14141253 |
T |
 |
| Q |
632 |
tattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatan |
731 |
Q |
| |
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| T |
14141254 |
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14141353 |
T |
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| Q |
732 |
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Q |
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| T |
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928 |
Q |
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| T |
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14141551 |
T |
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| Q |
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932 |
Q |
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| T |
14141552 |
cctg |
14141555 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 33375993 - 33375545
Alignment:
| Q |
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583 |
Q |
| |
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actaaactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtgg |
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T |
 |
| Q |
584 |
-gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
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Q |
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tgtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattctt |
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T |
 |
| Q |
683 |
ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta |
782 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
783 |
tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc |
881 |
Q |
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| T |
33375696 |
tatgttaatgttatattatgtaactaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-gac |
33375598 |
T |
 |
| Q |
882 |
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932 |
Q |
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| T |
33375597 |
atttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
33375545 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 494 - 932
Target Start/End: Original strand, 25158335 - 25158772
Alignment:
| Q |
494 |
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593 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
594 |
tatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaatt |
693 |
Q |
| |
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| T |
25158435 |
tatgcagatgttggaattcgaacctcaggcaccacacttattcgccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaatt |
25158534 |
T |
 |
| Q |
694 |
atatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgt |
793 |
Q |
| |
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|
| T |
25158535 |
atatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---cttttttattttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgt |
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T |
 |
| Q |
794 |
tatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaa |
892 |
Q |
| |
|
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| T |
25158632 |
tatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacatttaccgtaa |
25158730 |
T |
 |
| Q |
893 |
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932 |
Q |
| |
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|
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| T |
25158731 |
atgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
25158772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 503 - 932
Target Start/End: Original strand, 24223182 - 24223612
Alignment:
| Q |
503 |
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602 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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gttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa |
702 |
Q |
| |
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| T |
24223282 |
gttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattactctttaccaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaagtatatgtcaa |
24223381 |
T |
 |
| Q |
703 |
tattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatg |
802 |
Q |
| |
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| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
24223382 |
tgtgatattattggtatgttacttcat-cttcttttttctttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatg |
24223480 |
T |
 |
| Q |
803 |
tacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccc |
901 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24223481 |
tacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttctttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccc |
24223579 |
T |
 |
| Q |
902 |
tttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24223580 |
tttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 494 - 932
Target Start/End: Original strand, 25099245 - 25099683
Alignment:
| Q |
494 |
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593 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
25099245 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctgaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaata |
25099344 |
T |
 |
| Q |
594 |
tatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaatt |
693 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25099345 |
tatgcagatgttggaattcgaacctcaggcaccacacttattcgccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaatt |
25099444 |
T |
 |
| Q |
694 |
atatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttt-tgtaaaattatatgttaatg |
792 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25099445 |
atatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---cttttttattttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaaattatatgttaatg |
25099541 |
T |
 |
| Q |
793 |
ttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgta |
891 |
Q |
| |
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| T |
25099542 |
ttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacatttaccgta |
25099640 |
T |
 |
| Q |
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932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
25099641 |
aatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 524 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 27648120 - 27647710
Alignment:
| Q |
524 |
attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27648120 |
attgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatacagatgttggaattcgaacctcagac |
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T |
 |
| Q |
624 |
accacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgtta |
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Q |
| |
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|
| T |
27648020 |
accacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattgttggtatgtta |
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T |
 |
| Q |
724 |
cttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattct |
823 |
Q |
| |
|
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|
| T |
27647920 |
cttcatctattttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattct |
27647821 |
T |
 |
| Q |
824 |
taacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgt |
920 |
Q |
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| T |
27647820 |
taacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgtaaatgatatcctttagctgtttgttgaaatgt |
27647722 |
T |
 |
| Q |
921 |
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932 |
Q |
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| T |
27647721 |
ttcttccacctg |
27647710 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 521 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 29275817 - 29275405
Alignment:
| Q |
521 |
tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca |
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Q |
| |
|
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|
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tacattgtagatgtaatagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca |
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T |
 |
| Q |
621 |
gacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatg |
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Q |
| |
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| T |
29275717 |
gacaccacacttattcaccttaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatg |
29275618 |
T |
 |
| Q |
721 |
ttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcat |
820 |
Q |
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ttacttcat-ctttttttctttttttttgagaaaatgatacttcattcttttgtaaaaaatatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcat |
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T |
 |
| Q |
821 |
tcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaa |
917 |
Q |
| |
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tcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaa |
29275420 |
T |
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| Q |
918 |
tgtttcttccacctg |
932 |
Q |
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| T |
29275419 |
tgtttcttccacctg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 527 - 932
Target Start/End: Original strand, 6940545 - 6940946
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| |
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6940545 |
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 |
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acgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttactt |
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acacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattggtatgttactt |
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727 |
catannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaa |
826 |
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| T |
6940745 |
cat------cttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtaccaaaaaatagctcattcttaa |
6940838 |
T |
 |
| Q |
827 |
cctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttc |
923 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6940839 |
cctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccataaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttc |
6940937 |
T |
 |
| Q |
924 |
ttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
6940938 |
ttccacctg |
6940946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 540 - 932
Target Start/End: Original strand, 1394541 - 1394928
Alignment:
| Q |
540 |
acaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc |
639 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
1394541 |
acaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttgttcacc |
1394640 |
T |
 |
| Q |
640 |
nnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnn |
739 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1394641 |
ttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaatttatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-------ctt |
1394733 |
T |
 |
| Q |
740 |
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838 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1394734 |
tttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatggtaatgttatattatgtacctaaaaatagttcatttttaacctcaacatgtaa |
1394833 |
T |
 |
| Q |
839 |
aatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1394834 |
aatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcatttaccgtaaatgataccctttaactatttgttgaaatgtttcttccacctg |
1394928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 548 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 17913907 - 17913523
Alignment:
| Q |
548 |
aaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnnt |
647 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
17913907 |
aaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcaaataccacacttattcaccttaaaaat |
17913808 |
T |
 |
| Q |
648 |
attaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnn |
747 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17913807 |
attaatctttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgtcatgttacttcatctttttttattttttttt |
17913708 |
T |
 |
| Q |
748 |
ngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgttta |
846 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17913707 |
g--acaaatgttacttcattattttgtaaaaattatacgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgtttt |
17913610 |
T |
 |
| Q |
847 |
atttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17913609 |
atttaaataattttcctattatcgaatattt-gacatttaccgtaaatgataccctttaactgtttgtagaaatgtttcttccacctg |
17913523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 485 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 40177270 - 40177120
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40177270 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatataaaagagaatgaaatatgtgg |
40177171 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttatt |
635 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40177170 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttatt |
40177120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 749 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 40177083 - 40176898
Alignment:
| Q |
749 |
gaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaa |
847 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40177083 |
gaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgtttta |
40176984 |
T |
 |
| Q |
848 |
tttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40176983 |
tttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
40176898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 8179753 - 8179818
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
8179753 |
actagactttccacccgtgctgccgcacggatcatatatattgtagatgtagtagaccaaagcaaa |
8179818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 30088711 - 30088767
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30088711 |
tccatccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtattgtagacaaaaacaaa |
30088767 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3390959 - 3390923
Alignment:
| Q |
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3390959 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
3390923 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 30096285 - 30096341
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
30096285 |
tccacccgtgctgccgcacggatcatatacattgtaagtattgtagacaaaagcaaa |
30096341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15472793 - 15472758
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15472793 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
15472758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 25031424 - 25031459
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25031424 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
25031459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35066170 - 35066135
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35066170 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
35066135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8782809 - 8782775
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8782809 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
8782775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8936012 - 8935978
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8936012 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
8935978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33570195 - 33570161
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33570195 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
33570161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 40177076 - 40177031
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
713 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
40177076 |
tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat |
40177031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33591822 - 33591786
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33591822 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
33591786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8836657 - 8836622
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8836657 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
8836622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10692037 - 10692002
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10692037 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
10692002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 18185762 - 18185797
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18185762 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
18185797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 41743487 - 41743452
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41743487 |
aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
41743452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 42675785 - 42675750
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42675785 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
42675750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25472415 - 25472381
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25472415 |
agttacacccaaatttatttaaaattttataataa |
25472381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 42221727 - 42221761
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42221727 |
agttacactcaaatttatttaaaattttacaataa |
42221761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 6120782 - 6120332
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6120782 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
6120683 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6120682 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
6120583 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6120582 |
tgttaaaactatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctattttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
6120483 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6120482 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
6120384 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6120383 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
6120332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 18351782 - 18351332
Alignment:
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582 |
Q |
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| T |
18351782 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
18351683 |
T |
 |
| Q |
583 |
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682 |
Q |
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| T |
18351682 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
18351583 |
T |
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| Q |
683 |
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782 |
Q |
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| T |
18351582 |
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18351484 |
T |
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| Q |
783 |
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881 |
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| T |
18351483 |
tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc |
18351385 |
T |
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| Q |
882 |
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932 |
Q |
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| T |
18351384 |
ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 41663466 - 41663017
Alignment:
| Q |
485 |
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|
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T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
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| T |
41663366 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
41663267 |
T |
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| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
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| T |
41663266 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
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T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
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| T |
41663166 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
41663068 |
T |
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| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
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| T |
41663067 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 41664739 - 41664291
Alignment:
| Q |
485 |
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584 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
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| T |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
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T |
 |
| Q |
685 |
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784 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
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| T |
41664440 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacct |
41664342 |
T |
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| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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| T |
41664341 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
41664291 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 44902310 - 44901863
Alignment:
| Q |
485 |
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584 |
Q |
| |
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| T |
44902310 |
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T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
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| T |
44902210 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacaaaaaaaata-taatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
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T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
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| T |
44902111 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttaattcattcttttgtaaaaattata |
44902013 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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| T |
44902012 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagtacattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggctt |
44901914 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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| T |
44901913 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
44901863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 42442193 - 42441741
Alignment:
| Q |
485 |
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584 |
Q |
| |
|
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|
| T |
42442193 |
actagactttccacccgtgttgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
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T |
 |
| Q |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa------cctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcat |
678 |
Q |
| |
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| T |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgt--tacttcat |
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T |
 |
| Q |
679 |
tcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaa |
778 |
Q |
| |
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| T |
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tcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttctttttttt-gaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaa |
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T |
 |
| Q |
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attatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatattt |
877 |
Q |
| |
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|
| T |
42441896 |
attatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt |
42441797 |
T |
 |
| Q |
878 |
gggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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| T |
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-ggcctttaccgtaaattataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 31424236 - 31423789
Alignment:
| Q |
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| |
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|
|
| T |
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tagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
31424137 |
T |
 |
| Q |
587 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
686 |
Q |
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| T |
31424136 |
ccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgt |
31424037 |
T |
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| Q |
687 |
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786 |
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|
| T |
31424036 |
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31423937 |
T |
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| Q |
787 |
ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt |
885 |
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| |
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| T |
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ttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccttt |
31423838 |
T |
 |
| Q |
886 |
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932 |
Q |
| |
|
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| T |
31423837 |
accgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 19596362 - 19596813
Alignment:
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| |
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T |
 |
| Q |
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gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
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Q |
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| T |
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gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttt |
19596561 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
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| T |
19596562 |
tgttaaaattatatgtcaatgttaaattattggtatgttacttcatctttttttattttatttttgacaatatgttacttcattcttttgttaaaattat |
19596661 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
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| T |
19596662 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacc |
19596760 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaat-gataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
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19596761 |
tttactgtaaatggatactctttaactgtttgttgaaatgttttttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 481 - 932
Target Start/End: Original strand, 26231255 - 26231705
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481 |
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580 |
Q |
| |
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 |
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581 |
gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc |
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
26231455 |
ttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---ttttttatttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaat |
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T |
 |
| Q |
781 |
tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgg |
879 |
Q |
| |
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| T |
26231552 |
tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaataactcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttcattttatcgaatattt-g |
26231650 |
T |
 |
| Q |
880 |
gcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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| T |
26231651 |
gtctttaccgtaaatgataccctttaaatgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
26231705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 36279455 - 36279901
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actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
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| T |
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 |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
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685 |
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784 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
36279654 |
gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--cctttttttttttttttgacaaaatgttatttcattcttttgtaaaaattata |
36279751 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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| T |
36279752 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaacattt-ggcct |
36279850 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 485 - 929
Target Start/End: Original strand, 34007714 - 34008156
Alignment:
| Q |
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584 |
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| T |
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T |
 |
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585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcccaaatatatgccgatgttggaattcgaacctcagacaccacacttatccaccttaaaaatattaatttttataaatcgtgtgttacttcattctttt |
34007908 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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gttaaaattatatgtcaatgttatattattgatacgttacttcatttttattttttttatatttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
34008008 |
T |
 |
| Q |
785 |
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882 |
Q |
| |
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|
| T |
34008009 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgtttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacc |
34008107 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccac |
929 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34008108 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 484 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 8700491 - 8700118
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Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacattttttcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
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T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8700291 |
tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgctacttcat----cttttttttttgtttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattac |
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T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaatttt |
860 |
Q |
| |
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|
| T |
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atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttt |
8700118 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 526 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 16215012 - 16214606
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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tgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccaaaatatatgcaaatgtaggaattcgaacctctaacac |
16214913 |
T |
 |
| Q |
626 |
cacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttact |
725 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
16214912 |
cacacttattcaccttaaaaatattaatttttattaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcagtgttacattattggtatgttact |
16214813 |
T |
 |
| Q |
726 |
tcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattctta |
825 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
16214812 |
tcat--cttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagtttattctta |
16214715 |
T |
 |
| Q |
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acctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgttt |
922 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16214714 |
acatcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgttt |
16214616 |
T |
 |
| Q |
923 |
cttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16214615 |
cttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 516 - 932
Target Start/End: Original strand, 999262 - 999677
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615 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tcatatactttgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa |
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T |
 |
| Q |
616 |
cctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg |
715 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
999362 |
cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg |
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T |
 |
| Q |
716 |
gtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatag |
815 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
999462 |
gtatgttacttcat--cttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtatctaaaaatag |
999559 |
T |
 |
| Q |
816 |
ttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt |
914 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
999560 |
ctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataa-tttccttttattgtatattt-gacatttagcgtaaatgataccctttaactgtttat |
999657 |
T |
 |
| Q |
915 |
--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
999658 |
tgaaatgtttcttccacctg |
999677 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 484 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 20545055 - 20544827
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| Q |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20545055 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatggtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
20544956 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20544955 |
gtcccaaatatatgcagatgttagaattcgaacctaaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtggtacttcattcttt |
20544856 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatatta |
712 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20544855 |
tgttaaaattatatgtcaatattatatta |
20544827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 42055428 - 42055184
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| Q |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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actagactttccacccgtgctacaccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaataggt |
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T |
 |
| Q |
583 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
682 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42055328 |
gatcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
42055229 |
T |
 |
| Q |
683 |
ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42055228 |
ttgttaagat--tatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 483 - 638
Target Start/End: Original strand, 27944794 - 27944949
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| Q |
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taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
582 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27944794 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
27944893 |
T |
 |
| Q |
583 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcac |
638 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27944894 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 510 - 639
Target Start/End: Original strand, 692227 - 692356
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
692227 |
cacgggtcatatacattgtaaatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatatggtcccaaatatatgcagatgttggaa |
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T |
 |
| Q |
610 |
ttcgaacctcagacaccacgcttattcacc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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ttcgaacctcagacaccacacttattcacc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 776 - 928
Target Start/End: Original strand, 20597393 - 20597547
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
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aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaata |
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T |
 |
| Q |
875 |
tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttcca |
928 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20597493 |
ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttcca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 793 - 932
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| |
|
|
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42055174 |
ttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtcaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-gacatttaccgta |
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T |
 |
| Q |
892 |
aatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42055075 |
aatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
42055033 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Original strand, 19597004 - 19597104
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc |
19597102 |
T |
 |
| Q |
931 |
tg |
932 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
19597103 |
tg |
19597104 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11124490 - 11124424
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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11124490 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 25889039 - 25889097
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Q |
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|
|
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25889039 |
actagactttccactcgtgctgccgcacgggtcatatacaatgta-aaatagtagacaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
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Q |
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|
|
| T |
31572501 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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| Q |
420 |
gaccggtgctagtcacacccnnnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20115032 |
gaccggtgctagtcacaccccaaaaaaaacaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
20115097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17977874 - 17977838
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17977874 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
17977838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 21867110 - 21867074
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21867110 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
21867074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 25336524 - 25336560
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25336524 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
25336560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30787270 - 30787234
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30787270 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
30787234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33965572 - 33965536
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33965572 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
33965536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 4049460 - 4049495
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4049460 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
4049495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 19390696 - 19390662
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19390696 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
19390662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 2988950 - 2988885
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | | | | |||||||||||||| |
|
|
| T |
2988950 |
actagacttttcacccgtgctgccgcatgggtcatatacaatgcaaaaacaatagacaaaaacaaa |
2988885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 535
Target Start/End: Original strand, 22139558 - 22139611
Alignment:
| Q |
482 |
ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatata |
535 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
22139558 |
ataactagacttttcacccgtgttgcagcacgggtcatatacaatgtaaatata |
22139611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 6034411 - 6034447
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6034411 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa |
6034447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 8113687 - 8113723
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8113687 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttactataa |
8113723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 11978762 - 11978798
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11978762 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
11978798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 14287578 - 14287542
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14287578 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
14287542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31547401 - 31547365
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31547401 |
caagttagacccaaatttatttaaaattttacaataa |
31547365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 39430382 - 39430350
Alignment:
| Q |
453 |
ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39430382 |
ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
39430350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 41568833 - 41568797
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41568833 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
41568797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26479978 - 26479943
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26479978 |
aagttacaccccaatttatttaaaattttacaataa |
26479943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 2380416 - 2380382
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2380416 |
agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa |
2380382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 12242744 - 12242778
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12242744 |
agttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
12242778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17839287 - 17839249
Alignment:
| Q |
483 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
521 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17839287 |
taactagaccatccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
17839249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Original strand, 43652933 - 43652966
Alignment:
| Q |
452 |
gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43652933 |
gttatacccaaatttatttaaaattttacaataa |
43652966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 476 - 932
Target Start/End: Original strand, 21804563 - 21805020
Alignment:
| Q |
476 |
tttacaataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatga |
575 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21804563 |
tttataataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatga |
21804662 |
T |
 |
| Q |
576 |
aatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttactt |
675 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21804663 |
aatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttactt |
21804762 |
T |
 |
| Q |
676 |
cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgt |
775 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21804763 |
cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttttttcttttgaaaaaatgttacttcattcttttgta |
21804861 |
T |
 |
| Q |
776 |
aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata |
874 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21804862 |
aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaata |
21804961 |
T |
 |
| Q |
875 |
tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21804962 |
ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
21805020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 482 - 932
Target Start/End: Original strand, 33916944 - 33917395
Alignment:
| Q |
482 |
ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33916944 |
ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg |
33917043 |
T |
 |
| Q |
582 |
tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct |
681 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33917044 |
tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttatttcattct |
33917143 |
T |
 |
| Q |
682 |
tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatt |
781 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33917144 |
tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatt |
33917242 |
T |
 |
| Q |
782 |
atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg |
880 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
33917243 |
atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gg |
33917341 |
T |
 |
| Q |
881 |
cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33917342 |
cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
33917395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 3840640 - 3841090
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3840640 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
3840739 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3840740 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
3840839 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3840840 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattgatatgttacttcatatttttcttttttttttatgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
3840939 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3840940 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
3841038 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3841039 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
3841090 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 42242152 - 42242602
Alignment:
| Q |
483 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
582 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42242152 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt |
42242251 |
T |
 |
| Q |
583 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
682 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42242252 |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 27138528 - 27138976
Alignment:
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 21342052 - 21341602
Alignment:
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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21341654 |
T |
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| Q |
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Q |
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21341653 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 17178237 - 17178686
Alignment:
| Q |
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T |
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| Q |
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683 |
Q |
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| T |
17178337 |
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T |
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| Q |
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783 |
Q |
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| T |
17178437 |
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T |
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17178536 |
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17178634 |
T |
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Q |
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17178686 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 485 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 21670210 - 21669780
Alignment:
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
21670110 |
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783 |
Q |
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882 |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 499 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 24924294 - 24923863
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T |
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699 |
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798 |
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T |
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897 |
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T |
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| Q |
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Q |
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accctttaactgtttgttgaaatgtttgttccacctg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 481 - 932
Target Start/End: Original strand, 15109661 - 15110108
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T |
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Q |
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| T |
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gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcatcttaaaagtattaatttttatcaattgtgtgttacttcattc |
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| T |
15109955 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Original strand, 43933546 - 43933991
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Q |
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ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
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T |
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| Q |
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786 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
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43933943 |
accgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 482 - 932
Target Start/End: Original strand, 27903414 - 27903860
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tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct |
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Q |
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| T |
27903514 |
tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttaccaatcgtgtcttacttcattct |
27903613 |
T |
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tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatt |
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Q |
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atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg |
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Q |
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atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaat-----ga |
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cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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catttagcgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
27903860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 485 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 13786399 - 13785957
Alignment:
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584 |
Q |
| |
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| T |
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actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtgg |
13786300 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgcgtcttacttcattttttt |
13786200 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
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||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||| |
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|
| T |
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gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----cttttttttttttttgacaaaatgttacttccttattttgtaaaaattata |
13786104 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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| T |
13786103 |
tgttaatgttatactatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatataaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacat |
13786005 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccac |
929 |
Q |
| |
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||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13786004 |
ttagcgtaaatgatacactttaactgtttgttgaaatgtttcttccac |
13785957 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 484 - 878
Target Start/End: Original strand, 16376544 - 16376935
Alignment:
| Q |
484 |
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583 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
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aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtg |
16376643 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttt |
16376743 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
16376744 |
tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----cttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattat |
16376839 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttg |
878 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgtcaatgttatattatgtacctaaaaagagctcattcttaacctcaacatgtaaaaggttttatttaaataattttccttttatcgaatatttg |
16376935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Original strand, 38163339 - 38163584
Alignment:
| Q |
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584 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38163339 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
38163438 |
T |
 |
| Q |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
38163538 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
730 |
Q |
| |
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| T |
38163539 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
38163584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 484 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 31373686 - 31373365
Alignment:
| Q |
484 |
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583 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
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|
| T |
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gtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattcttt |
31373487 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-nnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta |
782 |
Q |
| |
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|
| T |
31373486 |
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31373387 |
T |
 |
| Q |
783 |
tatgttaatgttatattatgta |
804 |
Q |
| |
|
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|
| T |
31373386 |
tatgttaatgttatattatgta |
31373365 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 517 - 932
Target Start/End: Original strand, 21753524 - 21753937
Alignment:
| Q |
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616 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21753524 |
catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtctcaaatatatgcagatgttaaaattcgaac |
21753623 |
T |
 |
| Q |
617 |
ctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg |
716 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
21753624 |
cttagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg |
21753723 |
T |
 |
| Q |
717 |
tatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagt |
816 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21753724 |
tatgttacttcat---ctttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagc |
21753820 |
T |
 |
| Q |
817 |
tcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt- |
914 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21753821 |
tcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaa-taattttccttttatcaaatattt-gacatttactgtaaacgataccctttaactgtttgtt |
21753918 |
T |
 |
| Q |
915 |
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932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21753919 |
gaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 485 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 21656857 - 21656531
Alignment:
| Q |
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584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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actagactttccacccgtgctaccacacgggtcatatacactgtagatgaagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtgg |
21656758 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21656757 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
21656658 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21656657 |
gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----ttttttttttttttttacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
21656562 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatag |
815 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21656561 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatag |
21656531 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 484 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 40969121 - 40968879
Alignment:
| Q |
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583 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
40969121 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacacaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtg |
40969022 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
40969021 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttt |
40968922 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttactt |
726 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40968921 |
tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttactt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 666 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 31096748 - 31096480
Alignment:
| Q |
666 |
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765 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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31096649 |
T |
 |
| Q |
766 |
ttctttttgtaa-aattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttcct |
863 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31096648 |
ttctttt-gtaagaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttcct |
31096550 |
T |
 |
| Q |
864 |
tttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttatcgaatattt-ggcatttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 509 - 679
Target Start/End: Original strand, 39030276 - 39030446
Alignment:
| Q |
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608 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gcacgggtcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga |
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T |
 |
| Q |
609 |
attcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt |
679 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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attcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcatt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 847 - 932
Target Start/End: Original strand, 7889742 - 7889828
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7889742 |
atttaaataattttccttttatcgaatatttggtc-tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31097932 - 31097881
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaa |
545 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
31097932 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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9741358 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
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|
|
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
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caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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Q |
| |
|
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5544435 - 5544400
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5544435 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
5544400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 47020600 - 47020565
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47020600 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
47020565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3112205 - 3112171
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3112205 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
3112171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 42697408 - 42697442
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42697408 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
42697442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 11001323 - 11001360
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11001323 |
aactagaccttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
11001360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 32661086 - 32661033
Alignment:
| Q |
497 |
acccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32661086 |
acccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaagcaaa |
32661033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 3887670 - 3887706
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3887670 |
caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataa |
3887706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12726350 - 12726314
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12726350 |
caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataa |
12726314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 12848440 - 12848476
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12848440 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
12848476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 38743355 - 38743319
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38743355 |
caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataa |
38743319 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 44291052 - 44291088
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44291052 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
44291088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30888523 - 30888488
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30888523 |
aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
30888488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 40968935 - 40968892
Alignment:
| Q |
758 |
ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40968935 |
ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
40968892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13765380 - 13765318
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaa |
546 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
13765380 |
aactagactttccacccgtgttgccgcacaggtcatgtacactgtaaatgtaacagacaaaaa |
13765318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 39494886 - 39494920
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39494886 |
agttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
39494920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 40431405 - 40431371
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40431405 |
agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa |
40431371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 42076336 - 42076370
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42076336 |
agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa |
42076370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 38163522 - 38163567
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
38163522 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
38163567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 4266610 - 4266162
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4266610 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
4266511 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4266510 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
4266411 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4266410 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
4266312 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4266311 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
4266213 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4266212 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
4266162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 38913747 - 38914195
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38913747 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
38913846 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38913847 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
38913946 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38913947 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgtaacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
38914045 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38914046 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
38914144 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38914145 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
38914195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 2951366 - 2951814
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2951366 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaaatataataaacaaaaaaaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
2951465 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2951466 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
2951565 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2951566 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
2951664 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2951665 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
2951763 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2951764 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
2951814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 1232025 - 1231590
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1232025 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaaatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
1231926 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1231925 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
1231826 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1231825 |
gttaaaattat-------------attattggtatgttacttcatatttttcttctttttttt-gaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
1231740 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1231739 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
1231641 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1231640 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
1231590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 23482706 - 23483150
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23482706 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatgtagtagacaaatacaaatctcaatgcatatcaaagagcatgaaatatgtg |
23482805 |
T |
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683 |
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783 |
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23482999 |
T |
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23483000 |
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23483098 |
T |
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| Q |
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Q |
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23483099 |
tttaccataaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
23483150 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 7334174 - 7333728
Alignment:
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
584 |
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683 |
Q |
| |
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| T |
7334074 |
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7333975 |
T |
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684 |
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783 |
Q |
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| T |
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T |
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882 |
Q |
| |
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| T |
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atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
7333780 |
T |
 |
| Q |
883 |
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932 |
Q |
| |
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| T |
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tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 18706509 - 18706951
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
18706609 |
t-ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgtaacttcattctttt |
18706707 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
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| T |
18706708 |
gttaaaattatatgtcaacgttatattattggtatgttacttcat------cttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
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T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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| T |
18706802 |
tgttaatgttatattatgtaccaaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
18706900 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
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| T |
18706901 |
ttaccataaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 490 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 35614291 - 35613849
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Q |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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|
| T |
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aatatatgcagatgttggaattcgaacttaagacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaa |
35614092 |
T |
 |
| Q |
690 |
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789 |
Q |
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| T |
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aattatatgtcaatgtcatattattggtatgttacttcat--ctttcttttttttgggtaacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgtta |
35613994 |
T |
 |
| Q |
790 |
atgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttacc |
888 |
Q |
| |
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| T |
35613993 |
attttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaattatttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccgttacc |
35613895 |
T |
 |
| Q |
889 |
gtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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Q |
| |
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|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 38444860 - 38444414
Alignment:
| Q |
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584 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
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|
| T |
38444760 |
tcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacttcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaataatgtgttacttcattctttt |
38444661 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
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| T |
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gataaaattatatgtcaatgttatattattggtatgtaacttcat---ttttattttattttttgacaaaatgttaattcattcttttgtaaaaattata |
38444564 |
T |
 |
| Q |
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tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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| T |
38444563 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-agcat |
38444465 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
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|
| T |
38444464 |
ttaccgaaaatgataccctttaactgtttgttgaaatatttcttccacctg |
38444414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 525 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 39728169 - 39727761
Alignment:
| Q |
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624 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagaca |
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T |
 |
| Q |
625 |
ccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttac |
724 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
39728069 |
ccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttac |
39727970 |
T |
 |
| Q |
725 |
ttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattctt |
824 |
Q |
| |
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|
| T |
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39727871 |
T |
 |
| Q |
825 |
aacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtt |
921 |
Q |
| |
|
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| T |
39727870 |
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39727772 |
T |
 |
| Q |
922 |
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932 |
Q |
| |
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||||||||||| |
|
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| T |
39727771 |
tcttccacctg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 484 - 721
Target Start/End: Original strand, 34888685 - 34888922
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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34888784 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
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| T |
34888785 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
34888884 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgt |
721 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34888885 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 528 - 932
Target Start/End: Original strand, 19764593 - 19764992
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| Q |
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tagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacacca |
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Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19764593 |
tagatgtagtatacaaaaacaaatctcaatgcatattaaaaagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcaaatgtttgaattcgaacctcagacacca |
19764692 |
T |
 |
| Q |
628 |
cgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaat-attatattattggtatgttactt |
726 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |
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| T |
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cacttattcaccttaaaaatattaatttttatgaatcgtgtgttacttcattattttgttaaaattacatgtcaatgtttatattattggtatattactt |
19764792 |
T |
 |
| Q |
727 |
catannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaa |
826 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19764793 |
cat--------tttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaa |
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T |
 |
| Q |
827 |
cctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttc |
923 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
19764885 |
cctcaacatgtaaattgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttc |
19764983 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 509 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 50151265 - 50151044
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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attcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattat |
708 |
Q |
| |
|
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|
| T |
50151165 |
attcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattat |
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T |
 |
| Q |
709 |
attattggtatgttacttcata |
730 |
Q |
| |
|
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attattggtatgttacttcata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 483 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 9216262 - 9216016
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582 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
9216262 |
taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagataaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgt |
9216163 |
T |
 |
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ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttatttaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattctt |
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T |
 |
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ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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ttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 524 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 35615005 - 35614599
Alignment:
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524 |
attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac |
623 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35615005 |
attgtaaatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac |
35614906 |
T |
 |
| Q |
624 |
accacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg-----ta |
718 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |
|
|
| T |
35614905 |
accacacttatttaccttaaaa-tattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtcatattaatgggaaggta |
35614807 |
T |
 |
| Q |
719 |
tgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttc |
818 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35614806 |
tgttacttcgt--------tttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctc |
35614715 |
T |
 |
| Q |
819 |
attcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--g |
915 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35614714 |
attcttaacctcaacatgtaaaattatttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccgttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttga |
35614616 |
T |
 |
| Q |
916 |
aatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35614615 |
aatgtttcttccacctg |
35614599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 576 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19768602 - 19768247
Alignment:
| Q |
576 |
aatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttactt |
675 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19768602 |
aatatgtggttccaaatacatgtagatgttgaatttcgaacctcagacaccacacttattcatcttaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttactt |
19768503 |
T |
 |
| Q |
676 |
cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgt |
775 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19768502 |
cattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---ctttttttttatttttgacaaaatgttacttcattcttttgta |
19768406 |
T |
 |
| Q |
776 |
aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata |
874 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19768405 |
aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttcaataatttttcttttatcgaata |
19768306 |
T |
 |
| Q |
875 |
tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19768305 |
ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
19768247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 484 - 729
Target Start/End: Original strand, 18855232 - 18855476
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
18855232 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgcagtagacaaat-caaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtg |
18855330 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18855331 |
gtcccaaatatatgtagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtattacttcattcttt |
18855430 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18855431 |
tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
18855476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Original strand, 52687114 - 52687357
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52687114 |
actagactttccacccgtgctgtcgcacgggtcatatacattgtagatgtagtatacaaaaacaaatctcaatgcctatgaaagagaatgaaatatgtgg |
52687213 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
52687214 |
tcccaaatatatgcagatgttggaatccgaacctca-acaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattttttt |
52687312 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
52687313 |
attaaaattatatgtcaatgttatattaatggtatgttacttcat |
52687357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 485 - 639
Target Start/End: Original strand, 31018200 - 31018354
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31018200 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
31018299 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc |
639 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31018300 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc |
31018354 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 487 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 50326228 - 50326076
Alignment:
| Q |
487 |
tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
586 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50326228 |
tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
50326129 |
T |
 |
| Q |
587 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc |
639 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50326128 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc |
50326076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 752 - 932
Target Start/End: Original strand, 52036306 - 52036488
Alignment:
| Q |
752 |
aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt |
850 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
52036306 |
aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatatttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttattt |
52036405 |
T |
 |
| Q |
851 |
aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52036406 |
aaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
52036488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 754 - 932
Target Start/End: Original strand, 52687379 - 52687559
Alignment:
| Q |
754 |
aatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaa |
852 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
52687379 |
aatgttgcttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttctatttaa |
52687478 |
T |
 |
| Q |
853 |
gtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52687479 |
aaaattttccttttatcgaatattt-ggcatttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
52687559 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 580 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 2590468 - 2590320
Alignment:
| Q |
580 |
tgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt |
679 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2590468 |
tgtggttccaaatatatgcagatgttcgaattc-aacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcatt |
2590370 |
T |
 |
| Q |
680 |
cttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2590369 |
cttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
2590320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 485 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 29942247 - 29942153
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata |
579 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29942247 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata |
29942153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 518 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 5061419 - 5061335
Alignment:
| Q |
518 |
atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagat |
602 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5061419 |
atatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagat |
5061335 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 52957105 - 52957058
Alignment:
| Q |
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actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagat |
532 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52957105 |
actagactctccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagat |
52957058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 484 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 2590510 - 2590466
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| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgt |
528 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2590510 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgt |
2590466 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 29387896 - 29387952
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29387896 |
tccacccgtactgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaaacaaa |
29387952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 420 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15476136 - 15476071
Alignment:
| Q |
420 |
gaccggtgctagtcacacccnnnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15476136 |
gaccggtgctagtcacaccccaaaaaaaacaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
15476071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3994996 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
3994960 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6978901 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
6978937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11335715 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11493735 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
11493699 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20599722 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
20599686 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
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| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26770252 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
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T |
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Target: chr1; HSP #36
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tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28947463 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattataagtgtagtagacaaaagcaaa |
28947519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 883 - 932
Target Start/End: Original strand, 41530992 - 41531043
Alignment:
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41530992 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
41531043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 42885266 - 42885302
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42885266 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
42885302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 44234155 - 44234119
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44234155 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
44234119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 50490801 - 50490837
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50490801 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
50490837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 52469560 - 52469524
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52469560 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
52469524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4490267 - 4490232
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4490267 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
4490232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 8895622 - 8895657
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8895622 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
8895657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26497688 - 26497649
Alignment:
| Q |
482 |
ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
521 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26497688 |
ataactagactttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat |
26497649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 37094278 - 37094243
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37094278 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
37094243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 48542678 - 48542643
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48542678 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
48542643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 13556077 - 13556111
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13556077 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
13556111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14009895 - 14009849
Alignment:
| Q |
500 |
cgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaa |
546 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
14009895 |
cgtgctgccgcacgggtcatataaattgtaaatgtagtagacaaaaa |
14009849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17926315 - 17926281
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17926315 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
17926281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25730045 - 25730011
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25730045 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
25730011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 25828677 - 25828711
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25828677 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
25828711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 40359667 - 40359701
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40359667 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
40359701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Original strand, 52036310 - 52036355
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
713 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
52036310 |
tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat |
52036355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24180688 - 24180652
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24180688 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa |
24180652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 30159012 - 30159048
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30159012 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
30159048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31760829 - 31760793
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31760829 |
caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataa |
31760793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 35719709 - 35719745
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35719709 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa |
35719745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 36465920 - 36465864
Alignment:
| Q |
489 |
gactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaa |
545 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36465920 |
gacttttcacccgtgctgccgcacaggtcatatacggtgtaaatatagttgacaaaa |
36465864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 44054944 - 44054908
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44054944 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
44054908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 2590379 - 2590336
Alignment:
| Q |
758 |
ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2590379 |
ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
2590336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 3770504 - 3770539
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3770504 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
3770539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 9216075 - 9216032
Alignment:
| Q |
758 |
ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9216075 |
ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
9216032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17581009 - 17580974
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17581009 |
aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
17580974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Original strand, 18855417 - 18855460
Alignment:
| Q |
758 |
ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18855417 |
ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
18855460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28226469 - 28226434
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28226469 |
aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
28226434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 481
Target Start/End: Original strand, 641458 - 641488
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttaca |
481 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
641458 |
agttacacccaaatttatttaaaattttaca |
641488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 46674745 - 46674779
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46674745 |
agttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
46674779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 47534001 - 47534035
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47534001 |
agttacactcaaatttatttaaaattttacaataa |
47534035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 4325453 - 4325490
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4325453 |
aactagaccttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat |
4325490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Original strand, 18604860 - 18604893
Alignment:
| Q |
452 |
gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18604860 |
gttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
18604893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 34888869 - 34888914
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
34888869 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
34888914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 50151106 - 50151061
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
50151106 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
50151061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Original strand, 52687381 - 52687426
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
713 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
52687381 |
tgttgcttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat |
52687426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19997892 - 19997445
Alignment:
| Q |
487 |
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586 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19997892 |
tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
19997793 |
T |
 |
| Q |
587 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
686 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19997792 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
19997693 |
T |
 |
| Q |
687 |
taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg |
786 |
Q |
| |
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| T |
19997692 |
taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatg |
19997593 |
T |
 |
| Q |
787 |
ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt |
885 |
Q |
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| T |
19997592 |
ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccttt |
19997494 |
T |
 |
| Q |
886 |
accgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19997493 |
accgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
19997445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 12597264 - 12597713
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12597264 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
12597363 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12597364 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
12597463 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12597464 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
12597562 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
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|
| T |
12597563 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
12597661 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12597662 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
12597713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 33646171 - 33645723
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33646171 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
33646072 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33646071 |
ttccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
33645972 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
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|
| T |
33645971 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
33645873 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33645872 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
33645774 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33645773 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
33645723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 28099597 - 28100043
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28099597 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
28099696 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28099697 |
tcccaaatatatgctgatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
28099796 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28099797 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctttttcttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
28099896 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaatttt-ccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28099897 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttcccttttatcgaatattt--gcc |
28099994 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgtgaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28099995 |
tttaccgtaaatgata-cctttaactgtttgtgaaatgttcttccacctg |
28100043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 484 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 2267006 - 2266550
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2267006 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
2266907 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacac--------cacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttactt |
675 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2266906 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttactt |
2266807 |
T |
 |
| Q |
676 |
cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgt |
775 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2266806 |
cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgta |
2266708 |
T |
 |
| Q |
776 |
aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata |
874 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2266707 |
aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattgtccttttatcgaata |
2266608 |
T |
 |
| Q |
875 |
tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacct |
931 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2266607 |
ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacct |
2266550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 484 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17202662 - 17202214
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17202662 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacaagtcatatacattgtagatgtagtagacaaatacaaatcacaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
17202563 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17202562 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
17202463 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17202462 |
tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-tttttattttatttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
17202364 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
17202363 |
atgttaatgttatattatgtacttaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gaaa |
17202265 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacct |
931 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17202264 |
tttaccataaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacct |
17202214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 3593123 - 3592677
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3593123 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatccaagagaatgaaatatgtg |
3593024 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3593023 |
atcccaaatatattcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatgaatcgtgtgttacttcattcttt |
3592924 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3592923 |
tgttaaaattatatctcaatgttatattattggtatgttacttcat----tttatttatttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
3592828 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaac-ctcacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3592827 |
atgttaatgttgtattatgtacctaaaaatagctcatttttaactccaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
3592729 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3592728 |
tttaccgtaagtgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
3592677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 10584728 - 10585177
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10584728 |
actagactttccacccgtgctgccatatgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
10584827 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10584828 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacactacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
10584927 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10584928 |
gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---ctttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
10585024 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgtta---tattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg |
880 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |
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|
| T |
10585025 |
tgttaatgttatattattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataactttccttttatcaaatattt-gg |
10585123 |
T |
 |
| Q |
881 |
cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10585124 |
cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
10585177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 485 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 15044951 - 15044524
Alignment:
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485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
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| |
|
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|
|
| T |
15044951 |
actagactttccacccgtgctgccgcacaggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatttcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtgg |
15044852 |
T |
 |
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684 |
Q |
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|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
15044851 |
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15044752 |
T |
 |
| Q |
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gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
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| T |
15044751 |
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15044654 |
T |
 |
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785 |
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883 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15044653 |
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15044555 |
T |
 |
| Q |
884 |
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914 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15044554 |
ttaccgtaaatgataccatttaactgtttgt |
15044524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 587 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 25448876 - 25448530
Alignment:
| Q |
587 |
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686 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25448876 |
ccaaatatatgtagatgttggaattcgaaactcagacaccacgcttattcaccaaaaatatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttttttgt |
25448777 |
T |
 |
| Q |
687 |
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786 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25448776 |
taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatattttttttttttttttt-gaaaaaatgttactttattcttttgtaaaaattatatg |
25448678 |
T |
 |
| Q |
787 |
ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt |
885 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
25448677 |
ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgtttaatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggctttt |
25448579 |
T |
 |
| Q |
886 |
accgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25448578 |
accgtaaatgataccctttaactttttgttgaaatgtttcttccacctg |
25448530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 485 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 2005657 - 2005332
Alignment:
| Q |
485 |
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584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
2005657 |
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2005558 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2005557 |
tcttaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattctttt |
2005458 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
2005457 |
gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-----cttcttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattata |
2005363 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatag |
815 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2005362 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatag |
2005332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 485 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 13533996 - 13533771
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13533996 |
actagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
13533897 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13533896 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
13533797 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatat |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13533796 |
gttaaaattatatgtcaatgttatat |
13533771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 552 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 17594979 - 17594598
Alignment:
| Q |
552 |
ctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntatt- |
650 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
17594979 |
ctcaatgcatatcaaagaaaatgaaatatgtggtcccaaatatatggagatgttgaaattcaaacttcagacaccacacttattcaccttaaaaatatta |
17594880 |
T |
 |
| Q |
651 |
aatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnnga |
750 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
17594879 |
aatttttatcaatcgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtttgttacttcat--tttttattttattttttga |
17594782 |
T |
 |
| Q |
751 |
aaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatt |
849 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17594781 |
caaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatatacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatt |
17594682 |
T |
 |
| Q |
850 |
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932 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17594681 |
taaagaattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatgttttttccacctg |
17594598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 752 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 3589111 - 3588929
Alignment:
| Q |
752 |
aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt |
850 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3589111 |
aaaatgttacttcactcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcatttttaatctcaacatgtaaaatgttttattt |
3589012 |
T |
 |
| Q |
851 |
aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3589011 |
aaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
3588929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 752 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 3592134 - 3591952
Alignment:
| Q |
752 |
aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt |
850 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3592134 |
aaaatgttatttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattttcaacctcaacatgtaaaatgttttattt |
3592035 |
T |
 |
| Q |
851 |
aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3592034 |
aaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
3591952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 588 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 8539726 - 8539585
Alignment:
| Q |
588 |
caaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtt |
687 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8539726 |
caaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtt |
8539627 |
T |
 |
| Q |
688 |
aaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8539626 |
aaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
8539585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 484 - 610
Target Start/End: Original strand, 1405562 - 1405688
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1405562 |
aactagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatattaaagagaatgaaatatgtg |
1405661 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaat |
610 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1405662 |
atcccaaatatatgcagatgttggaat |
1405688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 798 - 932
Target Start/End: Original strand, 1405745 - 1405881
Alignment:
| Q |
798 |
ttatgtacctaaaaatagttcattcttaacctca-catgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatga |
896 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1405745 |
ttatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatga |
1405843 |
T |
 |
| Q |
897 |
taccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1405844 |
tacattttaactgtttgttaaaatgtttcttccacctg |
1405881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 521 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 33035626 - 33035523
Alignment:
| Q |
521 |
tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca |
620 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33035626 |
tacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatgtcaaagagaataaaacatgtggtctcaaatatatgcagatgctggaattcgaatctca |
33035527 |
T |
 |
| Q |
621 |
gaca |
624 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
33035526 |
gaca |
33035523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 807 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 33035520 - 33035393
Alignment:
| Q |
807 |
taaaaatagttcattcttaacctca-catgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgatacccttta |
905 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33035520 |
taaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-gacatttagcgtaaatgataccattta |
33035422 |
T |
 |
| Q |
906 |
actgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33035421 |
actgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
33035393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 27448531 - 27448431
Alignment:
| Q |
833 |
atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc |
930 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27448531 |
atgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcaaatatttgg-cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc |
27448433 |
T |
 |
| Q |
931 |
tg |
932 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
27448432 |
tg |
27448431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 485 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 8539782 - 8539723
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaa |
544 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8539782 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaa |
8539723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 6300709 - 6300774
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6300709 |
actagactatgcacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtatatctagtaggcaaaaacaaa |
6300774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 6307519 - 6307584
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6307519 |
actagactatgcacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtatatctagtaggcaaaaacaaa |
6307584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 526
Target Start/End: Original strand, 162668 - 162710
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
526 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162668 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
162710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 8657073 - 8657129
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8657073 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaagcaaa |
8657129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 4169664 - 4169700
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4169664 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
4169700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 4210393 - 4210429
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4210393 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
4210429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 8658987 - 8659023
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8658987 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
8659023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17595996 - 17595960
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17595996 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
17595960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 33489792 - 33489828
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33489792 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
33489828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 5545373 - 5545407
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5545373 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
5545407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 11590248 - 11590282
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11590248 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
11590282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 527
Target Start/End: Original strand, 14986391 - 14986433
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattg |
527 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14986391 |
actagactttgcacccgtgctgctgcacgggtcatatacattg |
14986433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 550
Target Start/End: Original strand, 15432336 - 15432402
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
15432336 |
aactagactttctacccgtgcggccgcacgggtcatatacatcgaaaatgtagaaggcaaaaacaaa |
15432402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 32938531 - 32938497
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32938531 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
32938497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 8539646 - 8539601
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8539646 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
8539601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 10790491 - 10790527
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10790491 |
caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataa |
10790527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 487 - 535
Target Start/End: Original strand, 25342639 - 25342687
Alignment:
| Q |
487 |
tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatata |
535 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
25342639 |
tagacttttcacccgtgctgccgcacgagtcatatacaatgtaaatata |
25342687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28914257 - 28914221
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28914257 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
28914221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 8062790 - 8062825
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8062790 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttataataa |
8062825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 529
Target Start/End: Original strand, 24570763 - 24570798
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgta |
529 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24570763 |
tccacccgtgctgccacacgggtcatatacattgta |
24570798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 529
Target Start/End: Original strand, 33289079 - 33289114
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgta |
529 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33289079 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatagattgta |
33289114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 535
Target Start/End: Original strand, 2965459 - 2965509
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatata |
535 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
2965459 |
actagacttatcacccgtgctgccgcacgggtcataaacaatgtaaatata |
2965509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8933935 - 8933901
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8933935 |
agttacacccaaatttatttaaaattttactataa |
8933901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 9576031 - 9576065
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9576031 |
agttacacacaaatttatttaaaattttacaataa |
9576065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12713216 - 12713182
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12713216 |
agttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
12713182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 756 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 13533813 - 13533771
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatat |
798 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13533813 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat |
13533771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 742980 - 742947
Alignment:
| Q |
452 |
gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
742980 |
gttacactcaaatttatttaaaattttacaataa |
742947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 3589107 - 3589062
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
713 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3589107 |
tgttacttcactcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat |
3589062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 3592130 - 3592085
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
713 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3592130 |
tgttatttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat |
3592085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 526
Target Start/End: Original strand, 24165091 - 24165132
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
526 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24165091 |
actagacttatcacccgtgctgacgcacgggtcatatacatt |
24165132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30143049 - 30142984
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | |||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30143049 |
actagactttacacccgtgttgccgcacgagacatatataatgtaaaaatagtagacaaaagcaaa |
30142984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 10478167 - 10477718
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10478167 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
10478068 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10478067 |
gtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
10477968 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10477967 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
10477869 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10477868 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
10477770 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10477769 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
10477718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 30473883 - 30474331
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30473883 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
30473982 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30473983 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
30474082 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30474083 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata--tttttcttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
30474180 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30474181 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
30474279 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30474280 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
30474331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
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Target Start/End: Original strand, 44832183 - 44832632
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ataactagactttccacccgtgttgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg |
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T |
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681 |
Q |
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| T |
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T |
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781 |
Q |
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| T |
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44832482 |
T |
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| Q |
782 |
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Q |
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44832581 |
T |
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Q |
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cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 6299020 - 6299468
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actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
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T |
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684 |
Q |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattccttt |
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T |
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784 |
Q |
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T |
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785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
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tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
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T |
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884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 32110859 - 32111309
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T |
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ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
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Q |
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| T |
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ggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
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T |
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782 |
Q |
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ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta |
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T |
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tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc |
881 |
Q |
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| T |
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tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc |
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T |
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ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 995814 - 996263
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T |
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Q |
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995914 |
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T |
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Q |
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T |
 |
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atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
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| T |
996113 |
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T |
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tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 18175612 - 18175162
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| Q |
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T |
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ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
682 |
Q |
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18175512 |
ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccaaaaaaatattaattattatcaaacgtgtgttacttcattctt |
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T |
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782 |
Q |
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881 |
Q |
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| T |
18175313 |
tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatggaatattt-ggc |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 18997930 - 18997481
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T |
 |
| Q |
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gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
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| T |
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gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
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T |
 |
| Q |
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783 |
Q |
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| T |
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tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
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T |
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784 |
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882 |
Q |
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| T |
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18997533 |
T |
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| Q |
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tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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Q |
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18997532 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 11725420 - 11724971
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T |
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| Q |
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gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
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| T |
11725320 |
gtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
11725221 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat |
783 |
Q |
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| T |
11725220 |
tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-ctttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
11725122 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
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11725121 |
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11725023 |
T |
 |
| Q |
883 |
tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 44837138 - 44836689
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actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
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| |
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 |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
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Q |
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gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
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Q |
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tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
44836740 |
T |
 |
| Q |
884 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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| T |
44836739 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 28583086 - 28582642
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T |
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ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt |
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ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta |
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| T |
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28582794 |
T |
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28582695 |
T |
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932 |
Q |
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| T |
28582694 |
ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttaaaatgtttcttccacctg |
28582642 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 24409105 - 24408660
Alignment:
| Q |
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Q |
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| T |
24409105 |
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T |
 |
| Q |
585 |
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684 |
Q |
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| T |
24409005 |
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24408906 |
T |
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| Q |
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784 |
Q |
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| T |
24408905 |
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24408810 |
T |
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| T |
24408809 |
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24408711 |
T |
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932 |
Q |
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| T |
24408710 |
ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
24408660 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 485 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 18842133 - 18841720
Alignment:
| Q |
485 |
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584 |
Q |
| |
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| T |
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actagactttccacccgttctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
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T |
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| Q |
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684 |
Q |
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| T |
18842033 |
tccaaaatatatgcagatgttggaattcgaatctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtatgttacttcattctttt |
18841934 |
T |
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| Q |
685 |
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784 |
Q |
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| T |
18841933 |
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18841844 |
T |
 |
| Q |
785 |
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883 |
Q |
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| T |
18841843 |
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18841745 |
T |
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| Q |
884 |
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908 |
Q |
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| T |
18841744 |
ttaccgtaaatgataccctttaact |
18841720 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 490 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 11142691 - 11142246
Alignment:
| Q |
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Q |
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| T |
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actttccacccgtgctgccgcacggatcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgctccca |
11142592 |
T |
 |
| Q |
590 |
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683 |
Q |
| |
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| T |
11142591 |
aatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
11142492 |
T |
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| Q |
684 |
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783 |
Q |
| |
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| T |
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tgttaaaattatatgtcagtgttatattattggtatgttacttcat-----cttcttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat |
11142397 |
T |
 |
| Q |
784 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc |
882 |
Q |
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| T |
11142396 |
atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagatcattcttatcctcaacgtgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc |
11142298 |
T |
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| Q |
883 |
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932 |
Q |
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| T |
11142297 |
tttaccgtaaatgatacgctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
11142246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 35122322 - 35122763
Alignment:
| Q |
485 |
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584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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actagactttccacccctgctgtcgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
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T |
 |
| Q |
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tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
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| T |
35122422 |
tccaaaatatatgcagatgttggaattcgaatctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
35122521 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
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| T |
35122522 |
attaaaattatatgtcaatgt----ttatcggtatgttacttcat----cttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
35122613 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct |
883 |
Q |
| |
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| T |
35122614 |
tgttaatgttatattatgtccctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaacgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct |
35122712 |
T |
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| Q |
884 |
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932 |
Q |
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| T |
35122713 |
ttatcgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
35122763 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 524 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19413022 - 19412617
Alignment:
| Q |
524 |
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623 |
Q |
| |
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| T |
19413022 |
attgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac |
19412923 |
T |
 |
| Q |
624 |
accacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc-ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgtt |
722 |
Q |
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| T |
19412922 |
accacagttattcaccttaaaaatattaatttttatccatcgtgtgttacttcattctttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgtt |
19412823 |
T |
 |
| Q |
723 |
acttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattc |
822 |
Q |
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| T |
19412822 |
acttcat------tttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattc |
19412729 |
T |
 |
| Q |
823 |
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919 |
Q |
| |
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| T |
19412728 |
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19412630 |
T |
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| Q |
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932 |
Q |
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| T |
19412629 |
tttcttccacctg |
19412617 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 509 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 39257648 - 39257217
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
609 |
attcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattat |
708 |
Q |
| |
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| T |
39257548 |
atttgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttat |
39257449 |
T |
 |
| Q |
709 |
attattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat------atgttaatgttatattatg |
802 |
Q |
| |
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| T |
39257448 |
attattggcatgttacttcatcttttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttaatgttatattata |
39257349 |
T |
 |
| Q |
803 |
tacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccc |
901 |
Q |
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| T |
39257348 |
tacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatttaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcatataccgtaaatgataccc |
39257250 |
T |
 |
| Q |
902 |
tttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
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| T |
39257249 |
tttaactgtttgttgaaatgttttttccacctg |
39257217 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 15961361 - 15961116
Alignment:
| Q |
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584 |
Q |
| |
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| T |
15961361 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
15961262 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
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| T |
15961261 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
15961162 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
730 |
Q |
| |
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| T |
15961161 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
15961116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 534 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19240843 - 19240445
Alignment:
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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Q |
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| T |
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ttcacgttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--ct |
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T |
 |
| Q |
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nnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacc-tcac |
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Q |
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| T |
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tttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatatacctaaaaaaagctcattcttaaccttaac |
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T |
 |
| Q |
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atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttg-tgaa-tgtttcttccacc |
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Q |
| |
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atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccattaccgtaaatgatgccctttaactgtttgttgaattgtttcttccacc |
19240447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 534 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19314027 - 19313629
Alignment:
| Q |
534 |
tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgctta |
633 |
Q |
| |
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| T |
19314027 |
tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacactta |
19313928 |
T |
 |
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634 |
ttcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannn |
733 |
Q |
| |
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| T |
19313927 |
ttcacgttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--ct |
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T |
 |
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nnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacc-tcac |
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Q |
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| T |
19313829 |
tttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatatacctaaaaaaagctcattcttaaccttaac |
19313730 |
T |
 |
| Q |
833 |
atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttg-tgaa-tgtttcttccacc |
930 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19313729 |
atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccattaccgtaaatgatgccctttaactgtttgttgaattgtttcttccacc |
19313631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 487 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 18569092 - 18568853
Alignment:
| Q |
487 |
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586 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18569092 |
tagactttccacccgtgctaccgcacgggtcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtc |
18568993 |
T |
 |
| Q |
587 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
686 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18568992 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttattcatcttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
18568893 |
T |
 |
| Q |
687 |
taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttactt |
726 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18568892 |
taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttactt |
18568853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 508 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 40027006 - 40026785
Alignment:
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607 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40027006 |
cgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagataatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgg |
40026907 |
T |
 |
| Q |
608 |
aattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta |
707 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40026906 |
aatttgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtta |
40026807 |
T |
 |
| Q |
708 |
tattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40026806 |
tattattggtatgttacttcat |
40026785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 487 - 730
Target Start/End: Original strand, 28274217 - 28274459
Alignment:
| Q |
487 |
tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
586 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28274217 |
tagactttccatccgtgcggc-gcacggatcatatacattgtagatgtagcagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc |
28274315 |
T |
 |
| Q |
587 |
ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
686 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28274316 |
ccaaatatacgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt |
28274415 |
T |
 |
| Q |
687 |
taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28274416 |
taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcata |
28274459 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 517 - 932
Target Start/End: Original strand, 25875322 - 25875745
Alignment:
| Q |
517 |
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616 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25875322 |
catatacatcgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaataaaacatgtgctccc-----tatgcagatgctggaattcgaac |
25875416 |
T |
 |
| Q |
617 |
ctcagacacc--------------acgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa |
702 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875417 |
ctcagacatattaaagagaataaaacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa |
25875516 |
T |
 |
| Q |
703 |
tattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatg |
802 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875517 |
tgttatattattggtatgttacttcat---ctttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattatg |
25875613 |
T |
 |
| Q |
803 |
tacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccc |
901 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25875614 |
tacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacatttagcgtaaatgataccc |
25875712 |
T |
 |
| Q |
902 |
tttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875713 |
tttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
25875745 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 517 - 729
Target Start/End: Original strand, 18210656 - 18210868
Alignment:
| Q |
517 |
catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaac |
616 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18210656 |
catatacattgtagatatagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaatttgaac |
18210755 |
T |
 |
| Q |
617 |
ctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg |
716 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18210756 |
ctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttatttccttcttttgttaaagttatatgtcaatgttatattattgt |
18210855 |
T |
 |
| Q |
717 |
tatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
18210856 |
tatgttacttcat |
18210868 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 484 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 39997921 - 39997726
Alignment:
| Q |
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583 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39997921 |
aactagaatttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtg |
39997822 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt |
679 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39997821 |
gttccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcacctttaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt |
39997726 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 537 - 729
Target Start/End: Original strand, 24004779 - 24004971
Alignment:
| Q |
537 |
tagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattc |
636 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24004779 |
tagacaaaatcaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattc |
24004878 |
T |
 |
| Q |
637 |
accnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24004879 |
accttaaaaatattaatttttatcaatcatgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
24004971 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 668 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 39997708 - 39997445
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcatt |
767 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39997708 |
tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcatatttttattttttttt---gacaaaatgttacttcatt |
39997612 |
T |
 |
| Q |
768 |
ctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttcctttt |
866 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39997611 |
cttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttcctttt |
39997512 |
T |
 |
| Q |
867 |
atcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39997511 |
atcgaatgttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
39997445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 596 - 863
Target Start/End: Original strand, 23353688 - 23353955
Alignment:
| Q |
596 |
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695 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23353688 |
tgcagatgttggaattcgaacctcagacaccccacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattat |
23353787 |
T |
 |
| Q |
696 |
atgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgtta |
795 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23353788 |
atgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--ttttttattttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgtta |
23353885 |
T |
 |
| Q |
796 |
tattatgtacct-aaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttcct |
863 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23353886 |
tattatgtacctaaaaaaaagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttcct |
23353955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 776 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 40026770 - 40026612
Alignment:
| Q |
776 |
aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata |
874 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40026770 |
aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaata |
40026671 |
T |
 |
| Q |
875 |
tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40026670 |
ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttctttcacctg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 755 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 18568861 - 18568682
Alignment:
| Q |
755 |
atgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaag |
853 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18568861 |
atgttacttaattcttttgtaaaaattatatgttaatgctatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaa |
18568762 |
T |
 |
| Q |
854 |
taattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18568761 |
taatttttcttttgtcgaatattt-gacctttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
18568682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 44836499 - 44836399
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| Q |
833 |
atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc |
930 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
44836499 |
atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc |
44836401 |
T |
 |
| Q |
931 |
tg |
932 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
44836400 |
tg |
44836399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 654 - 729
Target Start/End: Original strand, 18481929 - 18482004
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| Q |
654 |
ttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18481929 |
ttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
18482004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 840 - 932
Target Start/End: Original strand, 18210934 - 18211027
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| Q |
840 |
atgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18210934 |
atgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgacaccctttaactgtttgttgaaatgtttattccacctg |
18211027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 485 - 543
Target Start/End: Original strand, 23353622 - 23353680
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaa |
543 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23353622 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaa |
23353680 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 405363 - 405419
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| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
405363 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtatagtagacaaaagcaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 19241055 - 19241008
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| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagat |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19241055 |
actagactttccacccgcgctgccgcacgggtcatatacattgtagat |
19241008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 19314239 - 19314192
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagat |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19314239 |
actagactttccacccgcgctgccgcacgggtcatatacattgtagat |
19314192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 8352379 - 8352415
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8352379 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
8352415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 20818954 - 20818990
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20818954 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
20818990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25487349 - 25487313
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25487349 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
25487313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 27719241 - 27719277
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27719241 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
27719277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 33411044 - 33411080
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33411044 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
33411080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35393646 - 35393610
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35393646 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
35393610 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 36781651 - 36781687
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36781651 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
36781687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 29997494 - 29997529
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29997494 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
29997529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 31097515 - 31097550
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31097515 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
31097550 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 5458261 - 5458295
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5458261 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
5458295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 752 - 798
Target Start/End: Original strand, 18210889 - 18210935
Alignment:
| Q |
752 |
aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatat |
798 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18210889 |
aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatat |
18210935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 38098907 - 38098873
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38098907 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
38098873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 45084246 - 45084280
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45084246 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
45084280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 18568911 - 18568866
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18568911 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
18568866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 28274397 - 28274442
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28274397 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
28274442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 39997712 - 39997663
Alignment:
| Q |
752 |
aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39997712 |
aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgtcaatgttatattat |
39997663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 40026846 - 40026801
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40026846 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
40026801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 483282 - 483246
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
483282 |
caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
483246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 11020402 - 11020438
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11020402 |
caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataa |
11020438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 12986670 - 12986706
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12986670 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
12986706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 17695653 - 17695597
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
17695653 |
tccacccgtgctgccgcacgggtaatatacattgtaagtgtagtagataaaagcaaa |
17695597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 20187471 - 20187507
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20187471 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
20187507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 20206540 - 20206576
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20206540 |
caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
20206576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26416424 - 26416388
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26416424 |
caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
26416388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Original strand, 30655004 - 30655036
Alignment:
| Q |
453 |
ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30655004 |
ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
30655036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 39780311 - 39780347
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39780311 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa |
39780347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 44831143 - 44831199
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
44831143 |
tccacccgtgctgccgctcgggtcatatacattgtaagtgtagtagataaaagcaaa |
44831199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Original strand, 18481945 - 18481988
Alignment:
| Q |
758 |
ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18481945 |
ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
18481988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Original strand, 24004912 - 24004955
Alignment:
| Q |
758 |
ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24004912 |
ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
24004955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24757891 - 24757856
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24757891 |
aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa |
24757856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30700140 - 30700105
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30700140 |
aagttacactcaaatttatttaaaattttacaataa |
30700105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 668 - 710
Target Start/End: Original strand, 18210893 - 18210935
Alignment:
| Q |
668 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
18210893 |
tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatat |
18210935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1105066 - 1105033
Alignment:
| Q |
452 |
gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1105066 |
gttacacctaaatttatttaaaattttacaataa |
1105033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 15961178 - 15961133
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15961178 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
15961133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24471909 - 24471872
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24471909 |
aactagaccttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat |
24471872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34815285 - 34815244
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt |
526 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34815285 |
actagacttatcacccgtgctgacgcacgggtcatatacatt |
34815244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 522
Target Start/End: Original strand, 40169720 - 40169757
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatata |
522 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40169720 |
actagtctttccacccgtgctaccgcacgggtcatata |
40169757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 484 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 46504 - 46258
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46504 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
46405 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46404 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
46305 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46304 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata |
46258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 46320 - 46275
Alignment:
| Q |
756 |
tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
46320 |
tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat |
46275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 485 - 850
Target Start/End: Original strand, 149050 - 149413
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
149050 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatataaattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
149149 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
684 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
149150 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacatcaaacacaacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt |
149249 |
T |
 |
| Q |
685 |
gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata |
784 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
149250 |
gttaaaattatatgtcaacgttatattattggtatgttacttcat---ttttatttttatttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata |
149346 |
T |
 |
| Q |
785 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt |
850 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
149347 |
tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttattt |
149413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0173 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0173
Description:
Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 484 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 19577 - 19332
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg |
583 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19577 |
aactagactttccacccgtgctgccgtacgggtcctatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagataattaaatatgtg |
19478 |
T |
 |
| Q |
584 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt |
683 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19477 |
gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttt |
19378 |
T |
 |
| Q |
684 |
tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat |
729 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19377 |
tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat |
19332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0173; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 19391 - 19348
Alignment:
| Q |
758 |
ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat |
801 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19391 |
ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat |
19348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0836 (Bit Score: 145; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0836
Description:
Target: scaffold0836; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 485 - 637
Target Start/End: Original strand, 5278 - 5430
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5278 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggacatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
5377 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattca |
637 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5378 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattca |
5430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0515 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:
Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 485 - 637
Target Start/End: Original strand, 6061 - 6213
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6061 |
actagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
6160 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattca |
637 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6161 |
tctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttattca |
6213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0306 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:
Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 485 - 637
Target Start/End: Original strand, 6071 - 6223
Alignment:
| Q |
485 |
actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
584 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6071 |
actagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg |
6170 |
T |
 |
| Q |
585 |
tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattca |
637 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6171 |
tctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttattca |
6223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Original strand, 38827 - 38927
Alignment:
| Q |
833 |
atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc |
930 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
38827 |
atgtaaaatgttttatttaaataattttacttttatcaaatatttgg-cctttaccgtaaaggataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc |
38925 |
T |
 |
| Q |
931 |
tg |
932 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
38926 |
tg |
38927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Original strand, 38536 - 38636
Alignment:
| Q |
833 |
atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc |
930 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
38536 |
atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-ggcatttaccgtaaaggataccctttaactttttgttgaaatgtttcttccacc |
38634 |
T |
 |
| Q |
931 |
tg |
932 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
38635 |
tg |
38636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 847 - 932
Target Start/End: Original strand, 38259 - 38345
Alignment:
| Q |
847 |
atttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg |
932 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38259 |
atttaaataattttccttttattgaatatttga-cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg |
38345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0896 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0896
Description:
Target: scaffold0896; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 1137 - 1081
Alignment:
| Q |
494 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa |
550 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1137 |
tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaagcaaa |
1081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0562 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0562
Description:
Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6572 - 6536
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6572 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
6536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20468 - 20432
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20468 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
20432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27937 - 27903
Alignment:
| Q |
451 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27937 |
agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
27903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1360 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:
Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1072 - 1036
Alignment:
| Q |
449 |
caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa |
485 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1072 |
caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataa |
1036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0316 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:
Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14764 - 14730
Alignment:
| Q |
493 |
ttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattg |
527 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14764 |
ttccacccgtgttgccgcacgggtcatatacattg |
14730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 42805 - 42771
Alignment:
| Q |
450 |
aagttacacccaaatttatttaaaattttacaata |
484 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42805 |
aagttacactcaaatttatttaaaattttacaata |
42771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1234 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1234
Description:
Target: scaffold1234; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1084 - 1047
Alignment:
| Q |
484 |
aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1084 |
aactagaccttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat |
1047 |
T |
 |
Back To:
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