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Alignment Overview

Query: NF2880R-Insertion-10 (Length: 940)

Name: NF2880R-Insertion-10
Description: NF2880R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2880R-Insertion-10
NF2880R-Insertion-10
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (484-932)||(12263980-12264430)
chr3 (481-932)||(38653923-38654376)
chr3 (485-932)||(49672343-49672791)
chr3 (485-932)||(34121136-34121584)
chr3 (485-932)||(21098084-21098533)
chr3 (484-932)||(43363610-43364059)
chr3 (485-932)||(3898203-3898651)
chr3 (483-932)||(20671031-20671480)
chr3 (485-932)||(4584434-4584880)
chr3 (487-932)||(31488194-31488638)
chr3 (484-932)||(36076453-36076899)
chr3 (485-932)||(49477989-49478437)
chr3 (487-932)||(39146228-39146667)
chr3 (483-912)||(45557882-45558309)
chr3 (12-350)||(46531040-46531366)
chr3 (490-932)||(55041588-55042036)
chr3 (527-932)||(24118991-24119394)
chr3 (485-804)||(1941720-1942038)
chr3 (483-730)||(49506347-49506594)
chr3 (485-730)||(54073011-54073259)
chr3 (485-729)||(26948783-26949027)
chr3 (647-932)||(26052240-26052527)
chr3 (485-669)||(40014653-40014837)
chr3 (752-930)||(26948556-26948736)
chr3 (517-639)||(26051334-26051457)
chr3 (793-940)||(49506643-49506792)
chr3 (483-591)||(6460166-6460273)
chr3 (494-545)||(37099713-37099764)
chr3 (9-91)||(46554847-46554929)
chr3 (449-485)||(1546278-1546314)
chr3 (449-485)||(5273674-5273710)
chr3 (449-485)||(8068616-8068652)
chr3 (449-485)||(10049209-10049245)
chr3 (449-485)||(10471448-10471484)
chr3 (449-485)||(13286929-13286965)
chr3 (449-485)||(20607785-20607821)
chr3 (449-485)||(24348802-24348838)
chr3 (449-485)||(26229371-26229407)
chr3 (449-485)||(35846746-35846782)
chr3 (449-485)||(37126725-37126761)
chr3 (449-485)||(47697767-47697803)
chr3 (449-485)||(51167271-51167307)
chr3 (449-485)||(51754422-51754458)
chr3 (450-485)||(28555261-28555296)
chr3 (451-485)||(5218974-5219008)
chr3 (451-485)||(26718061-26718095)
chr3 (451-485)||(48458387-48458421)
chr3 (451-485)||(53018982-53019016)
chr3 (485-550)||(5189787-5189852)
chr3 (668-713)||(26948687-26948732)
chr3 (756-801)||(26948799-26948844)
chr3 (449-485)||(10659525-10659561)
chr3 (449-485)||(31655044-31655080)
chr3 (449-485)||(37821061-37821097)
chr3 (449-485)||(43973325-43973361)
chr3 (449-485)||(46528089-46528125)
chr3 (449-485)||(55274241-55274277)
chr3 (450-485)||(998412-998447)
chr3 (450-485)||(2445961-2445996)
chr3 (450-485)||(8828710-8828745)
chr3 (450-485)||(30357251-30357286)
chr3 (450-485)||(44377782-44377817)
chr3 (494-525)||(53556920-53556951)
chr3 (451-485)||(501740-501774)
chr3 (485-539)||(13364022-13364076)
chr3 (451-485)||(17338573-17338607)
chr3 (451-485)||(22497241-22497275)
chr3 (451-485)||(41454247-41454281)
chr3 (451-485)||(43218757-43218791)
chr3 (484-538)||(46921423-46921477)
chr3 (497-526)||(5561565-5561594)
chr3 (484-521)||(20370357-20370394)
chr3 (756-801)||(54073028-54073073)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (482-932)||(52434405-52434856)
chr4 (483-932)||(16917886-16918336)
chr4 (485-932)||(30824922-30825370)
chr4 (484-932)||(53143261-53143712)
chr4 (485-932)||(12090459-12090908)
chr4 (484-932)||(31965968-31966417)
chr4 (483-912)||(16904950-16905374)
chr4 (484-932)||(47142799-47143248)
chr4 (474-932)||(39058346-39058800)
chr4 (485-932)||(37590804-37591248)
chr4 (485-931)||(48118534-48118979)
chr4 (494-932)||(44376088-44376525)
chr4 (482-914)||(46255839-46256266)
chr4 (484-932)||(41386907-41387356)
chr4 (509-932)||(52098214-52098638)
chr4 (485-730)||(37651650-37651895)
chr4 (485-729)||(33139471-33139715)
chr4 (487-914)||(54624764-54625177)
chr4 (482-729)||(35760566-35760813)
chr4 (487-729)||(45976992-45977234)
chr4 (534-932)||(45782478-45782859)
chr4 (508-726)||(31628510-31628728)
chr4 (547-932)||(50229768-50230161)
chr4 (752-928)||(45977260-45977438)
chr4 (755-932)||(31628720-31628899)
chr4 (833-932)||(14148709-14148809)
chr4 (525-579)||(50229712-50229766)
chr4 (484-526)||(18209699-18209741)
chr4 (449-485)||(3875717-3875753)
chr4 (449-485)||(17445712-17445748)
chr4 (483-550)||(22289953-22290020)
chr4 (592-639)||(34684603-34684650)
chr4 (494-544)||(19745228-19745278)
chr4 (494-544)||(19794528-19794578)
chr4 (451-485)||(27767687-27767721)
chr4 (451-485)||(54202332-54202366)
chr4 (451-485)||(56162475-56162509)
chr4 (756-801)||(31628670-31628715)
chr4 (452-485)||(35949554-35949587)
chr4 (756-801)||(45977173-45977218)
chr4 (668-713)||(45977264-45977309)
chr4 (449-485)||(3932041-3932077)
chr4 (449-485)||(7554492-7554528)
chr4 (449-485)||(22169109-22169145)
chr4 (449-485)||(24745042-24745078)
chr4 (484-524)||(26724134-26724174)
chr4 (449-481)||(28573824-28573856)
chr4 (449-485)||(33961853-33961889)
chr4 (453-485)||(36309055-36309087)
chr4 (450-486)||(36432537-36432573)
chr4 (449-485)||(39677757-39677793)
chr4 (453-485)||(50621666-50621698)
chr4 (450-485)||(7327748-7327783)
chr4 (495-526)||(11238181-11238212)
chr4 (494-529)||(23976715-23976750)
chr4 (758-801)||(33139656-33139699)
chr4 (450-485)||(36225185-36225220)
chr4 (451-485)||(2491833-2491867)
chr4 (451-485)||(7326491-7326525)
chr4 (451-485)||(11005704-11005738)
chr4 (485-527)||(18258213-18258255)
chr4 (756-798)||(35760585-35760627)
chr4 (496-550)||(37340614-37340667)
chr4 (451-485)||(43957911-43957945)
chr4 (451-485)||(49332184-49332218)
chr4 (484-521)||(8371079-8371116)
chr4 (756-801)||(37651667-37651712)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (484-932)||(16526305-16526755)
chr5 (484-932)||(38246864-38247313)
chr5 (485-932)||(20874469-20874917)
chr5 (483-932)||(34107336-34107786)
chr5 (485-932)||(34110431-34110881)
chr5 (483-932)||(2398940-2399388)
chr5 (483-932)||(10729440-10729890)
chr5 (485-932)||(17373161-17373612)
chr5 (520-932)||(33570342-33570756)
chr5 (492-932)||(1395772-1396211)
chr5 (485-914)||(20655049-20655472)
chr5 (483-932)||(5478980-5479427)
chr5 (532-932)||(14141154-14141555)
chr5 (485-932)||(33375545-33375993)
chr5 (494-932)||(25158335-25158772)
chr5 (503-932)||(24223182-24223612)
chr5 (494-932)||(25099245-25099683)
chr5 (524-932)||(27647710-27648120)
chr5 (521-932)||(29275405-29275817)
chr5 (527-932)||(6940545-6940946)
chr5 (540-932)||(1394541-1394928)
chr5 (548-932)||(17913523-17913907)
chr5 (485-635)||(40177120-40177270)
chr5 (749-932)||(40176898-40177083)
chr5 (485-550)||(8179753-8179818)
chr5 (494-550)||(30088711-30088767)
chr5 (449-485)||(3390923-3390959)
chr5 (494-550)||(30096285-30096341)
chr5 (450-485)||(15472758-15472793)
chr5 (450-485)||(25031424-25031459)
chr5 (450-485)||(35066135-35066170)
chr5 (451-485)||(8782775-8782809)
chr5 (451-485)||(8935978-8936012)
chr5 (451-485)||(33570161-33570195)
chr5 (668-713)||(40177031-40177076)
chr5 (449-485)||(33591786-33591822)
chr5 (450-485)||(8836622-8836657)
chr5 (450-485)||(10692002-10692037)
chr5 (450-485)||(18185762-18185797)
chr5 (450-485)||(41743452-41743487)
chr5 (450-485)||(42675750-42675785)
chr5 (451-485)||(25472381-25472415)
chr5 (451-485)||(42221727-42221761)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (484-932)||(6120332-6120782)
chr2 (483-932)||(18351332-18351782)
chr2 (485-932)||(41663017-41663466)
chr2 (485-932)||(41664291-41664739)
chr2 (485-932)||(44901863-44902310)
chr2 (485-932)||(42441741-42442193)
chr2 (487-932)||(31423789-31424236)
chr2 (484-932)||(19596362-19596813)
chr2 (481-932)||(26231255-26231705)
chr2 (485-932)||(36279455-36279901)
chr2 (485-929)||(34007714-34008156)
chr2 (484-860)||(8700118-8700491)
chr2 (526-932)||(16214606-16215012)
chr2 (516-932)||(999262-999677)
chr2 (484-712)||(20544827-20545055)
chr2 (485-729)||(42055184-42055428)
chr2 (483-638)||(27944794-27944949)
chr2 (510-639)||(692227-692356)
chr2 (776-928)||(20597393-20597547)
chr2 (793-932)||(42055033-42055174)
chr2 (833-932)||(19597004-19597104)
chr2 (419-485)||(11124424-11124490)
chr2 (485-544)||(25889039-25889097)
chr2 (494-545)||(31572450-31572501)
chr2 (420-485)||(20115032-20115097)
chr2 (449-485)||(17977838-17977874)
chr2 (449-485)||(21867074-21867110)
chr2 (449-485)||(25336524-25336560)
chr2 (449-485)||(30787234-30787270)
chr2 (449-485)||(33965536-33965572)
chr2 (450-485)||(4049460-4049495)
chr2 (451-485)||(19390662-19390696)
chr2 (485-550)||(2988885-2988950)
chr2 (482-535)||(22139558-22139611)
chr2 (449-485)||(6034411-6034447)
chr2 (449-485)||(8113687-8113723)
chr2 (449-485)||(11978762-11978798)
chr2 (449-485)||(14287542-14287578)
chr2 (449-485)||(31547365-31547401)
chr2 (453-485)||(39430350-39430382)
chr2 (449-485)||(41568797-41568833)
chr2 (450-485)||(26479943-26479978)
chr2 (451-485)||(2380382-2380416)
chr2 (451-485)||(12242744-12242778)
chr2 (483-521)||(17839249-17839287)
chr2 (452-485)||(43652933-43652966)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (476-932)||(21804563-21805020)
chr7 (482-932)||(33916944-33917395)
chr7 (484-932)||(3840640-3841090)
chr7 (483-932)||(42242152-42242602)
chr7 (485-932)||(27138528-27138976)
chr7 (485-932)||(21341602-21342052)
chr7 (485-932)||(17178237-17178686)
chr7 (485-914)||(21669780-21670210)
chr7 (499-932)||(24923863-24924294)
chr7 (481-932)||(15109661-15110108)
chr7 (487-932)||(43933546-43933991)
chr7 (482-932)||(27903414-27903860)
chr7 (485-929)||(13785957-13786399)
chr7 (484-878)||(16376544-16376935)
chr7 (485-730)||(38163339-38163584)
chr7 (484-804)||(31373365-31373686)
chr7 (517-932)||(21753524-21753937)
chr7 (485-815)||(21656531-21656857)
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Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12264430 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 12264331  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12264330 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 12264231  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
12264230 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctttttcttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 12264131  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
12264130 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 12264032  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
12264031 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 12263980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 481 - 932
Target Start/End: Original strand, 38653923 - 38654376
Alignment:
481 aataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatat 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38653923 aataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatat 38654022  T
581 gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38654023 gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc 38654122  T
681 ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaat 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||    
38654123 ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaat 38654222  T
781 tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgg 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
38654223 tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-g 38654321  T
880 gcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
38654322 gcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 38654376  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 49672791 - 49672343
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49672791 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 49672692  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49672691 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 49672592  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
49672591 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttctgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 49672493  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
49672492 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 49672394  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
49672393 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 49672343  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 34121584 - 34121136
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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34121584 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatacgtgg 34121485  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34121484 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 34121385  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
34121384 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 34121286  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
34121285 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 34121187  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
34121186 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 34121136  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 21098533 - 21098084
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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21098533 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 21098434  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21098433 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 21098334  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
21098333 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttaaaaaattgttacttcattcttttgtaaaaattata 21098234  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
21098233 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 21098135  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
21098134 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 21098084  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 43363610 - 43364059
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43363610 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 43363709  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43363710 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 43363809  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
43363810 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 43363908  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||     
43363909 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-ggct 43364007  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
43364008 tttaccgtaaatgataccctttaactatttgttgaaatgtttcttccacctg 43364059  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 3898651 - 3898203
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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3898651 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtgg 3898552  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3898551 tcccaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 3898452  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
3898451 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcgta-tttttttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 3898353  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
3898352 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcat 3898254  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
3898253 ttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 3898203  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 20671480 - 20671031
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
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20671480 taactagactttccacccgtgctgccacacgagtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 20671381  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20671380 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 20671281  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||    
20671280 ttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--cttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 20671183  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
20671182 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggt 20671084  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
20671083 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 20671031  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 4584434 - 4584880
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4584434 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 4584533  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
4584534 tcccaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattctttt 4584633  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
4584634 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-ctttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 4584732  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
4584733 tgttaa--ttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 4584829  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
4584830 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccgcctg 4584880  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 31488638 - 31488194
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
31488638 tagactttccatccgtgctgccgcacgggttatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgttgtc 31488539  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
31488538 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttactttattcttttgt 31488439  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg 786  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
31488438 taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---ctttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatg 31488342  T
787 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
31488341 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccttt 31488243  T
886 accgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
31488242 aacgtaaatgatacgctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 31488194  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 36076453 - 36076899
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
36076453 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtg 36076552  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36076553 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacttcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 36076652  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
36076653 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----ttttatttttattttgacaaaatcttacttcattcttttgtaaaaattat 36076748  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
36076749 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggct 36076847  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | |   |||||||||||||||||    
36076848 tttaccgtaaataataccctttacctgtatattgaaatgtttcttccacctg 36076899  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 49478437 - 49477989
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
49478437 actagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatttacattgtagacgtagtagataaaaacaaatctcaatacatatcaaagataatgaaatatgtgg 49478338  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49478337 tcccaaatatatgcaaatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 49478238  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
49478237 attaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttatttcat-ctttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 49478139  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
49478138 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 49478040  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
49478039 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 49477989  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 39146667 - 39146228
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39146667 tagactttccatctgtgttgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtc 39146568  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
39146567 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgt 39146468  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg 786  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
39146467 taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--------cttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatg 39146376  T
787 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt 885  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||    
39146375 ttaatgttatattatgtacttaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacattt 39146277  T
886 accgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
39146276 accgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 39146228  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 483 - 912
Target Start/End: Original strand, 45557882 - 45558309
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45557882 taactagactttccaccagtgctaccgtacaggtcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 45557981  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
45557982 ggtcccaagtatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattctt 45558081  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgt-aaaatt 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
45558082 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat--cttttttttttatttttgacaaaatgttacttcatt-tttttgtaaaaatt 45558178  T
782 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
45558179 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-gg 45558277  T
881 cctttaccgtaaatgataccctttaactgttt 912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
45558278 cctttaccgtaaatgataccctttaactgttt 45558309  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46531366 - 46531040
Alignment:
12 ccaaggaaggagagaagctgacattgtgtcggaccctcggaaccggcagctactatgctgagcacagtttggagtgacaacggtgaaagcacgacattct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46531366 ccaaggaaggagagaagctgacattgcgtcggaccctcggaaccggcagctactatgctgagcacagtttggagtgacaacggtgaaagcacgacattct 46531267  T
112 tcttcttgaattctgtttttgataccaaatgtttggtgatgttcatagcattcttggttaaattagcgattgattcgcggtggtaactcattcttcttct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46531266 tcttcttgaattctgtttttgataccaaatgtttggtgatgttcatagcattcttggttaaattagcgattgattcgcggtggtaactcattcttcttct 46531167  T
212 tgnnnnnnncaattgtgaaagtagaagagtgctgcggttgaaatcctctgtgctgtcaaggtgaaacgattgagactattgaagacctaaatatatatcg 311  Q
     |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
46531166 ggtttttttcaattgtgaaagtagaagagtgctgcggttgaaatcctctgtgccgtcaaggagaaacgattgagactattgaagacctaaa--------- 46531076  T
312 tttaattgtgagagagaggtgttttagacttctagggtt 350  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
46531075 ---aattgtgagagagaggtgttttaaacttctagggtt 46531040  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 490 - 932
Target Start/End: Original strand, 55041588 - 55042036
Alignment:
490 actttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccca 589  Q
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55041588 actttccacccgtgctaccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttcca 55041687  T
590 aatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntatta------atttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||    
55041688 aatatatgcagatgtttgaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatttttatcaatcgtgtgttacttcactcttt 55041787  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || | |||||||||||||||||||   ||||||||    
55041788 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--cttttttttttttttttgacagaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 55041885  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
55041886 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattctaaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 55041984  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
55041985 tttaccgtaaatgatacgctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 55042036  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 527 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 24119394 - 24118991
Alignment:
527 gtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacacc 626  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
24119394 gtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagataatgaaatatatggtcccaaatatatgcagatgttggaattcaaacctcagacacc 24119295  T
627 acgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttactt 726  Q
    || ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
24119294 acacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttactt 24119195  T
727 catannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaa 826  Q
    |||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24119194 cat----ttttattttatttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaaagttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaa 24119099  T
827 cctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttc 923  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
24119098 cctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcatttatcgtaaatgataccctttaactgtttgtcgaaatgtttc 24119000  T
924 ttccacctg 932  Q
    |||||||||    
24118999 ttccacctg 24118991  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 485 - 804
Target Start/End: Original strand, 1941720 - 1942038
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1941720 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 1941819  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1941820 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacatcacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 1941919  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
1941920 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttaattcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 1942018  T
785 tgttaatgttatattatgta 804  Q
    ||||||||||||||||||||    
1942019 tgttaatgttatattatgta 1942038  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 483 - 730
Target Start/End: Original strand, 49506347 - 49506594
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49506347 taactagactttccacccgtactgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 49506446  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
49506447 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtggtacttcattctt 49506546  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49506547 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 49506594  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 54073259 - 54073011
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatata---cattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54073259 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatagtacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 54073160  T
582 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54073159 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 54073060  T
682 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54073059 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 54073011  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 26949027 - 26948783
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26949027 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 26948928  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
26948927 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 26948828  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
26948827 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 26948783  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 647 - 932
Target Start/End: Original strand, 26052240 - 26052527
Alignment:
647 tattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnn 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                     
26052240 tattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcatctttttttattttattt 26052339  T
747 nngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgttt 845  Q
      || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
26052340 ttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacataaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttt 26052439  T
846 aatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
26052440 tatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 26052527  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 485 - 669
Target Start/End: Original strand, 40014653 - 40014837
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40014653 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataataaacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 40014752  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtg 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
40014753 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtg 40014837  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 752 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 26948736 - 26948556
Alignment:
752 aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt 850  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
26948736 aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttattt 26948637  T
851 aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc 930  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
26948636 aaataattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgtaaacgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc 26948556  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 517 - 639
Target Start/End: Original strand, 26051334 - 26051457
Alignment:
517 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggt-cccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 615  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
26051334 catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccccaaatatatgctgaggttggaattcgaa 26051433  T
616 cctcagacaccacgcttattcacc 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
26051434 cctcagacaccacgcttattcacc 26051457  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 793 - 940
Target Start/End: Original strand, 49506643 - 49506792
Alignment:
793 ttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctca-catgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgta 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
49506643 ttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaaactcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgta 49506741  T
892 aatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctgattaaata 940  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
49506742 aatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctgtttaaata 49506792  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 591
Target Start/End: Original strand, 6460166 - 6460273
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
6460166 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatacatatcaaa-agaataaaatatgt 6460264  T
583 ggtcccaaa 591  Q
    |||||||||    
6460265 ggtcccaaa 6460273  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 37099764 - 37099713
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaa 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
37099764 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaa 37099713  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Original strand, 46554847 - 46554929
Alignment:
9 gatccaaggaaggagagaagctgacattgtgtcggaccctcggaaccggcagctactatgctgagcacagtttggagtgacaa 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  || || ||||||  |||||||||||||||    
46554847 gatccgaggaaggagagaagctgacgttgagtgggaccctcggaaccagcagtgaccatactgagcgtagtttggagtgacaa 46554929  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1546314 - 1546278
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1546314 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 1546278  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5273710 - 5273674
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5273710 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 5273674  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8068652 - 8068616
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8068652 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 8068616  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10049245 - 10049209
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10049245 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 10049209  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10471484 - 10471448
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10471484 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 10471448  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 13286929 - 13286965
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13286929 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 13286965  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20607821 - 20607785
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20607821 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 20607785  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 24348802 - 24348838
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24348802 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 24348838  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 26229371 - 26229407
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26229371 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 26229407  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 35846746 - 35846782
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35846746 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 35846782  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 37126761 - 37126725
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37126761 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 37126725  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 47697767 - 47697803
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47697767 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 47697803  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 51167307 - 51167271
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51167307 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 51167271  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 51754422 - 51754458
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51754422 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 51754458  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28555296 - 28555261
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28555296 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 28555261  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 5218974 - 5219008
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5218974 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 5219008  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26718095 - 26718061
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26718095 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 26718061  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 48458387 - 48458421
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48458387 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 48458421  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 53018982 - 53019016
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
53018982 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 53019016  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 5189787 - 5189852
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||    
5189787 actagactttacacccgtgctaccgcaagggtcatatataatgtaaaaatagtagacaaaagcaaa 5189852  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 26948732 - 26948687
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 713  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
26948732 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 26948687  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 26948844 - 26948799
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
26948844 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 26948799  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 10659525 - 10659561
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
10659525 caagttaaacccaaatttatttaaaattttacaataa 10659561  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 31655044 - 31655080
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
31655044 caagttacacccaaatttatttaaaatttaacaataa 31655080  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 37821061 - 37821097
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
37821061 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa 37821097  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 43973361 - 43973325
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
43973361 caagttatacccaaatttatttaaaattttacaataa 43973325  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 46528089 - 46528125
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
46528089 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 46528125  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 55274277 - 55274241
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
55274277 caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 55274241  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 998447 - 998412
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
998447 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 998412  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 2445961 - 2445996
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
2445961 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 2445996  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8828745 - 8828710
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
8828745 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 8828710  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 30357251 - 30357286
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
30357251 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 30357286  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 44377782 - 44377817
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
44377782 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 44377817  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 525
Target Start/End: Original strand, 53556920 - 53556951
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacat 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
53556920 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacat 53556951  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 501740 - 501774
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
501740 agttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 501774  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 539
Target Start/End: Original strand, 13364022 - 13364076
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtag 539  Q
    ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
13364022 actagacatttcacctctgctgccgcacgggtcatatacattgtatatgtagtag 13364076  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17338607 - 17338573
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
17338607 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa 17338573  T

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Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 22497241 - 22497275
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
22497241 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa 22497275  T

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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 41454247 - 41454281
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
41454247 agttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 41454281  T

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Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 43218757 - 43218791
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
43218757 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa 43218791  T

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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 538
Target Start/End: Original strand, 46921423 - 46921477
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagta 538  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
46921423 aactagacttttcacccgtgctttcgcacgagtcatatacaatgtaaatatagta 46921477  T

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Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 526
Target Start/End: Original strand, 5561565 - 5561594
Alignment:
497 acccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
5561565 acccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 5561594  T

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Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 20370357 - 20370394
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 521  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
20370357 aactagaccatccacccgtgctgccgcacgggtcatat 20370394  T

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Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 54073073 - 54073028
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
54073073 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 54073028  T

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Target: chr4 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 482 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 52434856 - 52434405
Alignment:
482 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52434856 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 52434757  T
582 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52434756 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 52434657  T
682 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatt 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||    
52434656 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatt 52434558  T
782 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
52434557 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gg 52434459  T
881 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
52434458 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 52434405  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 16917886 - 16918336
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16917886 taactagactttccacctgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 16917985  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16917986 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 16918085  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
16918086 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 16918184  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
16918185 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtcaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 16918283  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
16918284 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 16918336  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 30824922 - 30825370
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30824922 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 30825021  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30825022 ttccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 30825121  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
30825122 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 30825220  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
30825221 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 30825319  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
30825320 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 30825370  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 53143261 - 53143712
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
53143261 aactagatttttcacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 53143360  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
53143361 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 53143460  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-nnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
53143461 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 53143560  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
53143561 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 53143659  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttg--tgaatgtttcttccacctg 932  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
53143660 ttttaccgtaaatgataccctttaactgtttgtttaaatgtttcttccacctg 53143712  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 12090459 - 12090908
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12090459 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 12090558  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttca-ttcttt 683  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
12090559 tcccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaaccaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttcttt 12090658  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
12090659 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 12090757  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
12090758 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcgtaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 12090856  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
12090857 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 12090908  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 31965968 - 31966417
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31965968 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatttattatacataaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 31966067  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31966068 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 31966167  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
31966168 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 31966266  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacc-tcacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
31966267 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaaccttaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 31966365  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
31966366 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 31966417  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 483 - 912
Target Start/End: Original strand, 16904950 - 16905374
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16904950 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 16905049  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16905050 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattctt 16905149  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||    
16905150 ttgttaaaattatatgtcaatgttatataattggtatgttacttcat-----ttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 16905244  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
16905245 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 16905343  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgttt 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
16905344 ctttaccgtaaatgataccctttaactgttt 16905374  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 47142799 - 47143248
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
47142799 aactagactttccacccgtgctgccgcactggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgacatatgtg 47142898  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
47142899 gtctcaaatatatgcagatgttagaattcgaacctcagacaccatgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcgattgtgtgttacttcattcttt 47142998  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||                  || |||||||||||||||||||||   ||||||||    
47142999 tgttaaaattatatctcaatgttaaattattggtatgttacttcata-ttttttattttatttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 47143097  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
47143098 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttctttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 47143196  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
47143197 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 47143248  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 474 - 932
Target Start/End: Original strand, 39058346 - 39058800
Alignment:
474 attttacaataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaat 573  Q
    |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
39058346 attttataaaaactagattttccacctgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaattttaatatatatcaaagagaat 39058445  T
574 gaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttac 673  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||    
39058446 gaaatatgtggtcccaaatatatcaagatgttggaattcgaacctcagataccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtgttac 39058545  T
674 ttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattcttttt 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||     
39058546 ttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat------ttttattttttttgacaaaatgttacttcattcttttg 39058639  T
774 gtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaa 872  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
39058640 taaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaa 39058739  T
873 tatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
39058740 tattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 39058800  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 37590804 - 37591248
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
37590804 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaatcaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtgg 37590903  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
37590904 tcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtcttacttcattctttt 37591003  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   ||||||| |    
37591004 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-----ctttatttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattaca 37591098  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |    
37591099 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacat 37591197  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
37591198 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 37591248  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 485 - 931
Target Start/End: Original strand, 48118534 - 48118979
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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48118534 actagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagat---gtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 48118630  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
48118631 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacgtattcaccttaaaaatattaatttttaccaatcgtgtgttacttcattctttt 48118730  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
48118731 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcatcttttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 48118830  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
48118831 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcat 48118929  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacct 931  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||    
48118930 ttaccgtaaatgatactctttaaatgtttgttgaaatgtttcttccacct 48118979  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 494 - 932
Target Start/End: Original strand, 44376088 - 44376525
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaata 593  Q
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44376088 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaata 44376187  T
594 tatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaatt 693  Q
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44376188 tatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaatt 44376287  T
694 atatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgt 793  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
44376288 atatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---ctttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgt 44376384  T
794 tatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaa 892  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||    
44376385 tatattatgtatctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttaacaaatattt-gacatttaccgtaa 44376483  T
893 atgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
44376484 atgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 44376525  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 482 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 46256266 - 46255839
Alignment:
482 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 581  Q
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46256266 ataagtagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatg 46256167  T
582 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 681  Q
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46256166 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattggaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtatcttacttcattct 46256067  T
682 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatt 781  Q
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46256066 tttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-----cttttttttttcttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaatt 46255972  T
782 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg 880  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |     
46255971 atatgttaatgtcatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ga 46255873  T
881 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt 914  Q
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46255872 catttagcgtaaatgatatcctttaactgtttgt 46255839  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 41387356 - 41386907
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
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41387356 aactagactttccatccgtgctgccgtacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtg 41387257  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
41387256 gtcccaaatatatgcagatgctgaaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcgatcgtgtcttacttcattcttt 41387157  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   ||||||||    
41387156 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-ctttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattat 41387058  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |     
41387057 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gaca 41386959  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
41386958 tttagcgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 41386907  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 509 - 932
Target Start/End: Original strand, 52098214 - 52098638
Alignment:
509 gcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga 608  Q
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52098214 gcacgggtcatatacactgtaaatatagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga 52098313  T
609 attcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntatt-aatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta 707  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
52098314 attcaaacttcagacacaacacttattcaccttaaaaatattaaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtta 52098413  T
708 tattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacct 807  Q
    |||||||||| |||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
52098414 tattattggtttgttacttcat--tttttattttattttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacct 52098511  T
808 aaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaa 906  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
52098512 aaaaatagcttattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaagaattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgtaaatgataccctttaa 52098610  T
907 ctgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||    
52098611 ctgtttgttgaaatgtttcttccacctg 52098638  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 37651895 - 37651650
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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37651895 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatgaaagagaatgaaatatgtgg 37651796  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37651795 tctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 37651696  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37651695 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 37651650  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Original strand, 33139471 - 33139715
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
33139471 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatttagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaattaaatatgttg 33139570  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
33139571 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacatttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattctttt 33139670  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
33139671 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 33139715  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 487 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 54625177 - 54624764
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    |||| |||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
54625177 tagattttccacatgtgatgtcgcacgggttatatacattgtagacgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 54625078  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||      ||||||||||||| |||||    
54625077 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatca------tgttacttcattc-tttgt 54624985  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg 786  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
54624984 taaaattatatgtcaatgttatattattggtatg--acttcat-----ctttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatg 54624892  T
787 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt 885  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
54624891 ttaatgttatattatgtacttaaaaataactcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggccttt 54624793  T
886 accgtaaatgataccctttaactgtttgt 914  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
54624792 accgtaaatgatgccctttaactgtttgt 54624764  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 482 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 35760813 - 35760566
Alignment:
482 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 581  Q
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35760813 ataactagattttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatatagtagataaaaataaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatg 35760714  T
582 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35760713 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacaattattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 35760614  T
682 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
35760613 tttgttaaaattatatgtcaatgttatataattggtatgttacttcat 35760566  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 487 - 729
Target Start/End: Original strand, 45976992 - 45977234
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45976992 tagactttccatccgtgctgctgcacgggtcatatacatcgtagatgtagtagataaaaataaatatcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 45977091  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
45977092 ctaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgt 45977191  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
45977192 taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 45977234  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 534 - 932
Target Start/End: Original strand, 45782478 - 45782859
Alignment:
534 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgctta 633  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
45782478 tagtagacaaaaataaatctcaatatatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgaagatgttggaatttgaacctcagacaccacactta 45782577  T
634 ttcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannn 733  Q
    ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        
45782578 ttcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---c 45782674  T
734 nnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-ac 832  Q
                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||                |||||| ||||| |||||||| ||    
45782675 tttttttttagttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgt----------------aaatagctcatttttaacctcaac 45782758  T
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||    
45782759 atgtaaaatgttttatttaaataattttgcttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatgtctcttccacc 45782857  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 508 - 726
Target Start/End: Original strand, 31628510 - 31628728
Alignment:
508 cgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
31628510 cgcacgggtcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaattaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttgg 31628609  T
608 aattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta 707  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
31628610 aattcgaacctcatacaccacacttattcatcttaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtta 31628709  T
708 tattattggtatgttactt 726  Q
    |||||||||||||||||||    
31628710 tattattggtatgttactt 31628728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 547 - 932
Target Start/End: Original strand, 50229768 - 50230161
Alignment:
547 caaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnn 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||           
50229768 caaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaacatgtggtccaaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccatacttattcaccttaaaaa 50229867  T
647 tattaa-tttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatta-ttggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnn 744  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||                   
50229868 tattaattttttatcaatagtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattatttgctatgttacttcat---cctttttctttt 50229964  T
745 nnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacct-aaaaatagttcattcttaacctc-------acatgt 836  Q
         | |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  |  ||  ||||       | ||||    
50229965 tttttacaaaatgctacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatatacctcaaaaaaaggttttattttccctcaaaaaaaaaatgt 50230064  T
837 aaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
50230065 aaaaggttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggccttaaccgtaaatgataacctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 50230161  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 752 - 928
Target Start/End: Original strand, 45977260 - 45977438
Alignment:
752 aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt 850  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
45977260 aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttattt 45977359  T
851 aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttcca 928  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
45977360 aaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttcca 45977438  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 755 - 932
Target Start/End: Original strand, 31628720 - 31628899
Alignment:
755 atgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaag 853  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
31628720 atgttacttaattcttttgtaaaaattatatgttaatgctatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaa 31628819  T
854 taattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
31628820 taatttttcttttgtcgaatattt-gacctttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 31628899  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Original strand, 14148709 - 14148809
Alignment:
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
14148709 atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc 14148807  T
931 tg 932  Q
    ||    
14148808 tg 14148809  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 525 - 579
Target Start/End: Original strand, 50229712 - 50229766
Alignment:
525 ttgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 579  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
50229712 ttgtagatgtagtagacaaaaaaaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 50229766  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 18209741 - 18209699
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18209741 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 18209699  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3875753 - 3875717
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3875753 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 3875717  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17445748 - 17445712
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17445748 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 17445712  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 550
Target Start/End: Original strand, 22289953 - 22290020
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| || ||||||||||    
22289953 taactagaccttgcacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgaaaatgtagaaggcaaaaacaaa 22290020  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 592 - 639
Target Start/End: Original strand, 34684603 - 34684650
Alignment:
592 tatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc 639  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
34684603 tatatgcagaggttggaattcgaacctcagacaccccacttattcacc 34684650  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19745278 - 19745228
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaa 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
19745278 tccacccgtgcggccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaa 19745228  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Original strand, 19794528 - 19794578
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaa 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
19794528 tccacccgtgcggccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaa 19794578  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27767721 - 27767687
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27767721 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 27767687  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 54202332 - 54202366
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
54202332 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 54202366  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 56162475 - 56162509
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
56162475 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 56162509  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 31628670 - 31628715
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
31628670 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 31628715  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35949587 - 35949554
Alignment:
452 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35949587 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 35949554  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 45977173 - 45977218
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
45977173 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 45977218  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Original strand, 45977264 - 45977309
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 713  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
45977264 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 45977309  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3932077 - 3932041
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
3932077 caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataa 3932041  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7554528 - 7554492
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
7554528 caagttacacccaaatttatttcaaattttacaataa 7554492  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 22169109 - 22169145
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
22169109 caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataa 22169145  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24745078 - 24745042
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
24745078 caagttacacccaaatttatttacaattttacaataa 24745042  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 484 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26724174 - 26724134
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatataca 524  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
26724174 aactagacttttcacccgtgctgccgcacgggttatataca 26724134  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 28573856 - 28573824
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttaca 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
28573856 caagttacacccaaatttatttaaaattttaca 28573824  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33961889 - 33961853
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
33961889 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 33961853  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 36309087 - 36309055
Alignment:
453 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
36309087 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 36309055  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 36432573 - 36432537
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataac 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
36432573 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataac 36432537  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 39677793 - 39677757
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
39677793 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 39677757  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Original strand, 50621666 - 50621698
Alignment:
453 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
50621666 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 50621698  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7327783 - 7327748
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
7327783 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 7327748  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11238212 - 11238181
Alignment:
495 ccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
11238212 ccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 11238181  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 529
Target Start/End: Original strand, 23976715 - 23976750
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgta 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23976715 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatatattgta 23976750  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Original strand, 33139656 - 33139699
Alignment:
758 ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
33139656 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 33139699  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 36225220 - 36225185
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
36225220 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 36225185  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 2491833 - 2491867
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
2491833 agttacacccaaatttatttaaaatttaacaataa 2491867  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7326525 - 7326491
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
7326525 agttacacccaaatttatttaaaattttagaataa 7326491  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11005738 - 11005704
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
11005738 agttacacccaaatttatttaaaatttaacaataa 11005704  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 527
Target Start/End: Original strand, 18258213 - 18258255
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattg 527  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
18258213 actagactgtctatccgtgctgccgcacgggtcatatacattg 18258255  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 756 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 35760627 - 35760585
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatat 798  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
35760627 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat 35760585  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 496 - 550
Target Start/End: Original strand, 37340614 - 37340667
Alignment:
496 cacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
37340614 cacccgtgctgacgcacgggtcatatacaatgta-aaatagtagacaaaagcaaa 37340667  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 43957945 - 43957911
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
43957945 agttacccccaaatttatttaaaattttacaataa 43957911  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 49332218 - 49332184
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
49332218 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa 49332184  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 8371079 - 8371116
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 521  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
8371079 aactagaccttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat 8371116  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 37651712 - 37651667
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
37651712 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 37651667  T

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Target: chr5 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 16526305 - 16526755
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16526305 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 16526404  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16526405 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcgttcttt 16526504  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
16526505 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatattcttcttctttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 16526604  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
16526605 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 16526703  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
16526704 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 16526755  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 38246864 - 38247313
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38246864 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 38246963  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38246964 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 38247063  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
38247064 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 38247162  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
38247163 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 38247261  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
38247262 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 38247313  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 20874917 - 20874469
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20874917 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 20874818  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20874817 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 20874718  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
20874717 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 20874619  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
20874618 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 20874520  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
20874519 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 20874469  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 34107336 - 34107786
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34107336 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 34107435  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34107436 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 34107535  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
34107536 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 34107634  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
34107635 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaaactcaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 34107733  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
34107734 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 34107786  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 34110881 - 34110431
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34110881 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 34110782  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34110781 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 34110682  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-nnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
34110681 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 34110582  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
34110581 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 34110483  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
34110482 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 34110431  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 2398940 - 2399388
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2398940 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 2399039  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
2399040 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatc--gtgttacttcattctt 2399137  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
2399138 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 2399236  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
2399237 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 2399335  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
2399336 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 2399388  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 10729440 - 10729890
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
10729440 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatccaagagaatgaaatatgt 10729539  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
10729540 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 10729639  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
10729640 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 10729738  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
10729739 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 10729837  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
10729838 atttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 10729890  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 17373161 - 17373612
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatata---cattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17373161 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatagtacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 17373260  T
582 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17373261 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 17373360  T
682 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatt 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||    
17373361 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatt 17373459  T
782 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
17373460 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gg 17373558  T
881 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
17373559 catttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 17373612  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 520 - 932
Target Start/End: Original strand, 33570342 - 33570756
Alignment:
520 atacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctc 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33570342 atacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcataccaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctc 33570441  T
620 agacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtat 719  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33570442 agacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtat 33570541  T
720 gttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttca 819  Q
    |||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33570542 gttacttcatatttttttattttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttca 33570641  T
820 ttcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--ga 916  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
33570642 ttcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaa 33570740  T
917 atgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||    
33570741 atgtttcttccacctg 33570756  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 492 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 1396211 - 1395772
Alignment:
492 tttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaa 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1396211 tttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgcagatgtagcagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaa 1396112  T
592 tatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaa 691  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
1396111 tatctgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcagtcgtgtgttacttcattcttttgttaaaa 1396012  T
692 ttatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaat 791  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
1396011 ttatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---cttcttttctttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaat 1395915  T
792 gttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgt 890  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
1395914 gttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcctttaccgt 1395816  T
891 aaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
1395815 aaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 1395772  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 485 - 914
Target Start/End: Original strand, 20655049 - 20655472
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
20655049 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtgg 20655148  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
20655149 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtcttacttcattctttt 20655248  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
20655249 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat------cttctttttttttgacaaaatgttacttcattattttggaaaaattata 20655342  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |    
20655343 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacat 20655441  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt 914  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
20655442 ttagcgtaaatgataccctttaactgtttgt 20655472  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 5479427 - 5478980
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5479427 taactagacttttcacctgtgttgtcgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 5479328  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5479327 gatcccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcagacactacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 5479228  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||    
5479227 ttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----cttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 5479132  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
5479131 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gac 5479033  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttg-tg-aatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
5479032 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgatgaaatgtttcttccacctg 5478980  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 532 - 932
Target Start/End: Original strand, 14141154 - 14141555
Alignment:
532 tatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgct 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14141154 tatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgct 14141253  T
632 tattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatan 731  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
14141254 tattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgccaatattatattattggtatgttacttcatat 14141353  T
732 nnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-c 830  Q
                      |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
14141354 ttttcttttttttttta-aaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctga 14141452  T
831 acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttcca 928  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
14141453 acatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttcca 14141551  T
929 cctg 932  Q
    ||||    
14141552 cctg 14141555  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 33375993 - 33375545
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg- 583  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
33375993 actaaactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtgg 33375894  T
584 -gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
33375893 tgtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattctt 33375794  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   |||||||    
33375793 ttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---cttcttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaatta 33375697  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | |    
33375696 tatgttaatgttatattatgtaactaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-gac 33375598  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
33375597 atttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 33375545  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 494 - 932
Target Start/End: Original strand, 25158335 - 25158772
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaata 593  Q
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25158335 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctgaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaata 25158434  T
594 tatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaatt 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
25158435 tatgcagatgttggaattcgaacctcaggcaccacacttattcgccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaatt 25158534  T
694 atatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgt 793  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
25158535 atatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---cttttttattttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgt 25158631  T
794 tatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaa 892  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
25158632 tatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacatttaccgtaa 25158730  T
893 atgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
25158731 atgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 25158772  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 503 - 932
Target Start/End: Original strand, 24223182 - 24223612
Alignment:
503 gctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagat 602  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24223182 gctgccgcacgggtcatatacatcgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatgaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagat 24223281  T
603 gttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24223282 gttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattactctttaccaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaagtatatgtcaa 24223381  T
703 tattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatg 802  Q
    | | |||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
24223382 tgtgatattattggtatgttacttcat-cttcttttttctttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatg 24223480  T
803 tacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccc 901  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
24223481 tacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttctttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccc 24223579  T
902 tttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||    
24223580 tttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 24223612  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 494 - 932
Target Start/End: Original strand, 25099245 - 25099683
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaata 593  Q
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25099245 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctgaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaata 25099344  T
594 tatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaatt 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
25099345 tatgcagatgttggaattcgaacctcaggcaccacacttattcgccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaatt 25099444  T
694 atatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttt-tgtaaaattatatgttaatg 792  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
25099445 atatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---cttttttattttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaaattatatgttaatg 25099541  T
793 ttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgta 891  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
25099542 ttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacatttaccgta 25099640  T
892 aatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
25099641 aatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 25099683  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 524 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 27648120 - 27647710
Alignment:
524 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 623  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
27648120 attgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatacagatgttggaattcgaacctcagac 27648021  T
624 accacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgtta 723  Q
    ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
27648020 accacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattgttggtatgtta 27647921  T
724 cttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattct 823  Q
    ||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27647920 cttcatctattttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattct 27647821  T
824 taacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgt 920  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||    
27647820 taacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgtaaatgatatcctttagctgtttgttgaaatgt 27647722  T
921 ttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||    
27647721 ttcttccacctg 27647710  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 521 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 29275817 - 29275405
Alignment:
521 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 620  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29275817 tacattgtagatgtaatagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 29275718  T
621 gacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatg 720  Q
    |||||||| ||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
29275717 gacaccacacttattcaccttaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatg 29275618  T
721 ttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcat 820  Q
    |||||||||                   || |||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
29275617 ttacttcat-ctttttttctttttttttgagaaaatgatacttcattcttttgtaaaaaatatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcat 29275519  T
821 tcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaa 917  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
29275518 tcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaa 29275420  T
918 tgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||    
29275419 tgtttcttccacctg 29275405  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 527 - 932
Target Start/End: Original strand, 6940545 - 6940946
Alignment:
527 gtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacacc 626  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
6940545 gtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacacc 6940644  T
627 acgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttactt 726  Q
    || ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
6940645 acacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattggtatgttactt 6940744  T
727 catannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaa 826  Q
    |||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
6940745 cat------cttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtaccaaaaaatagctcattcttaa 6940838  T
827 cctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttc 923  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
6940839 cctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccataaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttc 6940937  T
924 ttccacctg 932  Q
    |||||||||    
6940938 ttccacctg 6940946  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 540 - 932
Target Start/End: Original strand, 1394541 - 1394928
Alignment:
540 acaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
1394541 acaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttgttcacc 1394640  T
640 nnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnn 739  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||              
1394641 ttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaatttatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-------ctt 1394733  T
740 nnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaa 838  Q
             || |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
1394734 tttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatggtaatgttatattatgtacctaaaaatagttcatttttaacctcaacatgtaa 1394833  T
839 aatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
1394834 aatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcatttaccgtaaatgataccctttaactatttgttgaaatgtttcttccacctg 1394928  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 548 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 17913907 - 17913523
Alignment:
548 aaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnnt 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||       |    
17913907 aaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcaaataccacacttattcaccttaaaaat 17913808  T
648 attaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnn 747  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||                      
17913807 attaatctttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgtcatgttacttcatctttttttattttttttt 17913708  T
748 ngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgttta 846  Q
       | ||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
17913707 g--acaaatgttacttcattattttgtaaaaattatacgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgtttt 17913610  T
847 atttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
17913609 atttaaataattttcctattatcgaatattt-gacatttaccgtaaatgataccctttaactgtttgtagaaatgtttcttccacctg 17913523  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 485 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 40177270 - 40177120
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
40177270 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatataaaagagaatgaaatatgtgg 40177171  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttatt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40177170 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttatt 40177120  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 749 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 40177083 - 40176898
Alignment:
749 gaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaa 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
40177083 gaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgtttta 40176984  T
848 tttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
40176983 tttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 40176898  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 8179753 - 8179818
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||    
8179753 actagactttccacccgtgctgccgcacggatcatatatattgtagatgtagtagaccaaagcaaa 8179818  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 30088711 - 30088767
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
30088711 tccatccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtattgtagacaaaaacaaa 30088767  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3390959 - 3390923
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3390959 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 3390923  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 30096285 - 30096341
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
30096285 tccacccgtgctgccgcacggatcatatacattgtaagtattgtagacaaaagcaaa 30096341  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15472793 - 15472758
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15472793 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 15472758  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 25031424 - 25031459
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25031424 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 25031459  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35066170 - 35066135
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35066170 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 35066135  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8782809 - 8782775
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8782809 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 8782775  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8936012 - 8935978
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8936012 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 8935978  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33570195 - 33570161
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33570195 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 33570161  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 40177076 - 40177031
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 713  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
40177076 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 40177031  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33591822 - 33591786
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
33591822 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 33591786  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8836657 - 8836622
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
8836657 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 8836622  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10692037 - 10692002
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
10692037 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 10692002  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 18185762 - 18185797
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18185762 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 18185797  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 41743487 - 41743452
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
41743487 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 41743452  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 42675785 - 42675750
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
42675785 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 42675750  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25472415 - 25472381
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
25472415 agttacacccaaatttatttaaaattttataataa 25472381  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 42221727 - 42221761
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
42221727 agttacactcaaatttatttaaaattttacaataa 42221761  T

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Target: chr2 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 6120782 - 6120332
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6120782 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 6120683  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6120682 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 6120583  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
6120582 tgttaaaactatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctattttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 6120483  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
6120482 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 6120384  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
6120383 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 6120332  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 18351782 - 18351332
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18351782 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 18351683  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18351682 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 18351583  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
18351582 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 18351484  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
18351483 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 18351385  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
18351384 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 18351332  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 41663466 - 41663017
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41663466 actagactttccacccgtgctgccgcatgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 41663367  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41663366 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 41663267  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
41663266 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 41663167  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
41663166 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 41663068  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
41663067 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 41663017  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 41664739 - 41664291
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41664739 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 41664640  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41664639 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 41664540  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
41664539 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttataaaaattata 41664441  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
41664440 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacct 41664342  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
41664341 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 41664291  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 44902310 - 44901863
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44902310 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 44902211  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44902210 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacaaaaaaaata-taatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 44902112  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
44902111 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttaattcattcttttgtaaaaattata 44902013  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
44902012 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagtacattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggctt 44901914  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
44901913 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 44901863  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 42442193 - 42441741
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42442193 actagactttccacccgtgttgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 42442094  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa------cctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcat 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
42442093 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgt--tacttcat 42441996  T
679 tcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaa 778  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||    
42441995 tcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttctttttttt-gaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaa 42441897  T
779 attatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatattt 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
42441896 attatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt 42441797  T
878 gggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
42441796 -ggcctttaccgtaaattataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 42441741  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 31424236 - 31423789
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31424236 tagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 31424137  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
31424136 ccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgt 31424037  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg 786  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
31424036 taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcatcttttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatg 31423937  T
787 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
31423936 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccttt 31423838  T
886 accgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
31423837 accgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 31423789  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 19596362 - 19596813
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19596362 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtg 19596461  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19596462 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttt 19596561  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||                   || || ||||||||||||||||||  |||||||||    
19596562 tgttaaaattatatgtcaatgttaaattattggtatgttacttcatctttttttattttatttttgacaatatgttacttcattcttttgttaaaattat 19596661  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
19596662 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacc 19596760  T
883 tttaccgtaaat-gataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
19596761 tttactgtaaatggatactctttaactgtttgttgaaatgttttttccacctg 19596813  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 481 - 932
Target Start/End: Original strand, 26231255 - 26231705
Alignment:
481 aataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatat 580  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
26231255 aataattagacttttcacccgtgctaccgcacaggttatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaatat 26231354  T
581 gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc 680  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26231355 gtggtctcaaatatattcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcatcttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc 26231454  T
681 ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaat 780  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||    
26231455 ttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---ttttttatttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaat 26231551  T
781 tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgg 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
26231552 tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaataactcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttcattttatcgaatattt-g 26231650  T
880 gcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
26231651 gtctttaccgtaaatgataccctttaaatgtttgttgaaatgtttcttccacctg 26231705  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 36279455 - 36279901
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
36279455 actagactttccacccgtgc-gtagcacgagtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatatcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtgg 36279553  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36279554 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaatctcagataccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 36279653  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || ||||||||| |||||||||||   |||||||||    
36279654 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--cctttttttttttttttgacaaaatgttatttcattcttttgtaaaaattata 36279751  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
36279752 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaacattt-ggcct 36279850  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
36279851 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 36279901  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 485 - 929
Target Start/End: Original strand, 34007714 - 34008156
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
34007714 actagactttccacccgtgct-----acgggtaatatccattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtag 34007808  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
34007809 tcccaaatatatgccgatgttggaattcgaacctcagacaccacacttatccaccttaaaaatattaatttttataaatcgtgtgttacttcattctttt 34007908  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
34007909 gttaaaattatatgtcaatgttatattattgatacgttacttcatttttattttttttatatttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 34008008  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatg-tttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
34008009 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgtttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacc 34008107  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccac 929  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
34008108 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccac 34008156  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 484 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 8700491 - 8700118
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
8700491 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 8700392  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8700391 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacattttttcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 8700292  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   |||||||     
8700291 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgctacttcat----cttttttttttgtttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattac 8700196  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaatttt 860  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
8700195 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttt 8700118  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 526 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 16215012 - 16214606
Alignment:
526 tgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacac 625  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||    
16215012 tgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccaaaatatatgcaaatgtaggaattcgaacctctaacac 16214913  T
626 cacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttact 725  Q
    ||| ||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
16214912 cacacttattcaccttaaaaatattaatttttattaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcagtgttacattattggtatgttact 16214813  T
726 tcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattctta 825  Q
    ||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
16214812 tcat--cttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagtttattctta 16214715  T
826 acctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgttt 922  Q
    || || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
16214714 acatcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgttt 16214616  T
923 cttccacctg 932  Q
    ||||||||||    
16214615 cttccacctg 16214606  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 516 - 932
Target Start/End: Original strand, 999262 - 999677
Alignment:
516 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 615  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
999262 tcatatactttgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa 999361  T
616 cctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 715  Q
    ||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
999362 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 999461  T
716 gtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatag 815  Q
    ||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
999462 gtatgttacttcat--cttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtatctaaaaatag 999559  T
816 ttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt 914  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
999560 ctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataa-tttccttttattgtatattt-gacatttagcgtaaatgataccctttaactgtttat 999657  T
915 --gaatgtttcttccacctg 932  Q
       |||||||||||||||||    
999658 tgaaatgtttcttccacctg 999677  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 484 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 20545055 - 20544827
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20545055 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatggtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 20544956  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
20544955 gtcccaaatatatgcagatgttagaattcgaacctaaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtggtacttcattcttt 20544856  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatatta 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
20544855 tgttaaaattatatgtcaatattatatta 20544827  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 42055428 - 42055184
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgc--cgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
42055428 actagactttccacccgtgctacaccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaataggt 42055329  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42055328 gatcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 42055229  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
42055228 ttgttaagat--tatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 42055184  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 483 - 638
Target Start/End: Original strand, 27944794 - 27944949
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27944794 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 27944893  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcac 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27944894 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcac 27944949  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 510 - 639
Target Start/End: Original strand, 692227 - 692356
Alignment:
510 cacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaa 609  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
692227 cacgggtcatatacattgtaaatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatatggtcccaaatatatgcagatgttggaa 692326  T
610 ttcgaacctcagacaccacgcttattcacc 639  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
692327 ttcgaacctcagacaccacacttattcacc 692356  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 776 - 928
Target Start/End: Original strand, 20597393 - 20597547
Alignment:
776 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
20597393 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaata 20597492  T
875 tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttcca 928  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
20597493 ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttcca 20597547  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 793 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 42055174 - 42055033
Alignment:
793 ttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgta 891  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||    
42055174 ttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtcaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-gacatttaccgta 42055076  T
892 aatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
42055075 aatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 42055033  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Original strand, 19597004 - 19597104
Alignment:
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
19597004 atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc 19597102  T
931 tg 932  Q
    ||    
19597103 tg 19597104  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11124490 - 11124424
Alignment:
419 ggaccggtgctagtcacacccnnnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11124490 ggaccggtgctagtcacacccaaaaaaaaacaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 11124424  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 485 - 544
Target Start/End: Original strand, 25889039 - 25889097
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaa 544  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
25889039 actagactttccactcgtgctgccgcacgggtcatatacaatgta-aaatagtagacaaa 25889097  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31572501 - 31572450
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaa 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
31572501 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaa 31572450  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 485
Target Start/End: Original strand, 20115032 - 20115097
Alignment:
420 gaccggtgctagtcacacccnnnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20115032 gaccggtgctagtcacaccccaaaaaaaacaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 20115097  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17977874 - 17977838
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17977874 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 17977838  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 21867110 - 21867074
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21867110 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 21867074  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 25336524 - 25336560
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25336524 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 25336560  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30787270 - 30787234
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30787270 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 30787234  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33965572 - 33965536
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33965572 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 33965536  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 4049460 - 4049495
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4049460 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 4049495  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 19390696 - 19390662
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19390696 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 19390662  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 2988950 - 2988885
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | | | | ||||||||||||||    
2988950 actagacttttcacccgtgctgccgcatgggtcatatacaatgcaaaaacaatagacaaaaacaaa 2988885  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 535
Target Start/End: Original strand, 22139558 - 22139611
Alignment:
482 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatata 535  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||    
22139558 ataactagacttttcacccgtgttgcagcacgggtcatatacaatgtaaatata 22139611  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 6034411 - 6034447
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
6034411 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa 6034447  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 8113687 - 8113723
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8113687 caagttacacccaaatttatttaaaattttactataa 8113723  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 11978762 - 11978798
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
11978762 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 11978798  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 14287578 - 14287542
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
14287578 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 14287542  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31547401 - 31547365
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
31547401 caagttagacccaaatttatttaaaattttacaataa 31547365  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 39430382 - 39430350
Alignment:
453 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
39430382 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 39430350  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 41568833 - 41568797
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
41568833 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 41568797  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26479978 - 26479943
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
26479978 aagttacaccccaatttatttaaaattttacaataa 26479943  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 2380416 - 2380382
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
2380416 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa 2380382  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 12242744 - 12242778
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12242744 agttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 12242778  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17839287 - 17839249
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 521  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
17839287 taactagaccatccacccgtgctgccgcacgggtcatat 17839249  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Original strand, 43652933 - 43652966
Alignment:
452 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
43652933 gttatacccaaatttatttaaaattttacaataa 43652966  T

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Target: chr7 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 476 - 932
Target Start/End: Original strand, 21804563 - 21805020
Alignment:
476 tttacaataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatga 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21804563 tttataataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatga 21804662  T
576 aatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttactt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
21804663 aatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttactt 21804762  T
676 cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgt 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||       
21804763 cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttttttcttttgaaaaaatgttacttcattcttttgta 21804861  T
776 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
21804862 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaata 21804961  T
875 tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
21804962 ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 21805020  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 482 - 932
Target Start/End: Original strand, 33916944 - 33917395
Alignment:
482 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33916944 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 33917043  T
582 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
33917044 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttatttcattct 33917143  T
682 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatt 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||    
33917144 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatt 33917242  T
782 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
33917243 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gg 33917341  T
881 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
33917342 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 33917395  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 3840640 - 3841090
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
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3840640 aactagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 3840739  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3840740 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 3840839  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
3840840 tgttaaaattatatgtcaatattatattattgatatgttacttcatatttttcttttttttttatgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 3840939  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
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3840940 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 3841038  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
3841039 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 3841090  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 42242152 - 42242602
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42242152 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 42242251  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42242252 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 42242351  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
42242352 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 42242450  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
42242451 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttctttcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 42242549  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
42242550 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 42242602  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 27138528 - 27138976
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27138528 actagactttccacccgtgctgccgcacaggtcatatacattctagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 27138627  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27138628 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 27138727  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
27138728 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttaata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 27138826  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
27138827 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 27138925  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
27138926 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 27138976  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 21342052 - 21341602
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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21342052 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataatagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtag 21341953  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21341952 tctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 21341853  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-nnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
21341852 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 21341753  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
21341752 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 21341654  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
21341653 tttaccgtaaatgataccctttaactgttagttgaaatgtttcttccacctg 21341602  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 17178237 - 17178686
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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17178237 actagactttccacccgtgctgccgcatgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaattcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 17178336  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc-nnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
17178337 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccaaaaaaaatattaatttttatcaatcgggtgttacttcattcttt 17178436  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
17178437 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaattgttacttcattcttttgtaaaaattat 17178535  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
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17178536 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggtc 17178634  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
17178635 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 17178686  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 485 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 21670210 - 21669780
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
21670210 actagactttccacccgtgctgccgcacaggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtgg 21670111  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21670110 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 21670011  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat-annnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||                    || |||||||||||||||||||||   ||||||||    
21670010 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttactttatctttttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 21669911  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||     
21669910 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttcaataattttccttttatcgaatattt-ggca 21669812  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt 914  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
21669811 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt 21669780  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 499 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 24924294 - 24923863
Alignment:
499 ccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
24924294 ccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgt 24924195  T
599 agatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatg 698  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24924194 agatgttggaatttgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaaattttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatg 24924095  T
699 tcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatat 798  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |    
24924094 tcaatgttatattattggtatgttacttcat----ctttttgttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatgt 24923999  T
799 tatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgat 897  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
24923998 tatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgat 24923900  T
898 accctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
24923899 accctttaactgtttgttgaaatgtttgttccacctg 24923863  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 481 - 932
Target Start/End: Original strand, 15109661 - 15110108
Alignment:
481 aataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatat 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15109661 aataactagactttccacccgtgctatcgcaccggacatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatat 15109760  T
581 gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15109761 gtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcatcttaaaagtattaatttttatcaattgtgtgttacttcattc 15109860  T
681 ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaat 780  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||    
15109861 ttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtttgttacttcat------cttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaat 15109954  T
781 tatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgg 879  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
15109955 tatatgttaatattatattatgtacctaaaaacagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-g 15110053  T
880 gcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||    
15110054 gcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttctacctg 15110108  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Original strand, 43933546 - 43933991
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
43933546 tagactttccacccgtgctaccgcaagggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaaaaaatctcaatgcatataaaagagaataaaatatgtggtc 43933645  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43933646 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 43933745  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg 786  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || ||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
43933746 taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--cttttttttttatttttgacaaaatattacttcattcttttgtaaaaattatatg 43933843  T
787 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||    
43933844 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcaaatattt-gaccttt 43933942  T
886 accgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
43933943 accgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 43933991  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 482 - 932
Target Start/End: Original strand, 27903414 - 27903860
Alignment:
482 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
27903414 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatg 27903513  T
582 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||       |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
27903514 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttaccaatcgtgtcttacttcattct 27903613  T
682 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatt 781  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   ||||||    
27903614 tttgttaaaattctatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--cttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaatt 27903711  T
782 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     |     
27903712 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaat-----ga 27903806  T
881 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
27903807 catttagcgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 27903860  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 485 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 13786399 - 13785957
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
13786399 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtgg 13786300  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
13786299 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgcgtcttacttcattttttt 13786200  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || ||||||||||||| || ||||   |||||||||    
13786199 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----cttttttttttttttgacaaaatgttacttccttattttgtaaaaattata 13786104  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |    
13786103 tgttaatgttatactatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatataaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacat 13786005  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccac 929  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||    
13786004 ttagcgtaaatgatacactttaactgtttgttgaaatgtttcttccac 13785957  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 484 - 878
Target Start/End: Original strand, 16376544 - 16376935
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
16376544 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtg 16376643  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
16376644 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttt 16376743  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   ||||||||    
16376744 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----cttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattat 16376839  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttg 878  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
16376840 atgtcaatgttatattatgtacctaaaaagagctcattcttaacctcaacatgtaaaaggttttatttaaataattttccttttatcgaatatttg 16376935  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Original strand, 38163339 - 38163584
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38163339 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 38163438  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38163439 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 38163538  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38163539 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 38163584  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 484 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 31373686 - 31373365
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31373686 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 31373587  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
31373586 gtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattcttt 31373487  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-nnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
31373486 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 31373387  T
783 tatgttaatgttatattatgta 804  Q
    ||||||||||||||||||||||    
31373386 tatgttaatgttatattatgta 31373365  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 517 - 932
Target Start/End: Original strand, 21753524 - 21753937
Alignment:
517 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaac 616  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
21753524 catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtctcaaatatatgcagatgttaaaattcgaac 21753623  T
617 ctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 716  Q
    || ||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
21753624 cttagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 21753723  T
717 tatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagt 816  Q
    |||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
21753724 tatgttacttcat---ctttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagc 21753820  T
817 tcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt- 914  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
21753821 tcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaa-taattttccttttatcaaatattt-gacatttactgtaaacgataccctttaactgtttgtt 21753918  T
915 -gaatgtttcttccacctg 932  Q
      |||||||||||||||||    
21753919 gaaatgtttcttccacctg 21753937  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 485 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 21656857 - 21656531
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
21656857 actagactttccacccgtgctaccacacgggtcatatacactgtagatgaagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtgg 21656758  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21656757 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 21656658  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                    | |||||||||||||||||||||   |||||||||    
21656657 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----ttttttttttttttttacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 21656562  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatag 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
21656561 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatag 21656531  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 484 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 40969121 - 40968879
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
40969121 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacacaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtg 40969022  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
40969021 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttt 40968922  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttactt 726  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
40968921 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttactt 40968879  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 666 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 31096748 - 31096480
Alignment:
666 tgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttca 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                  |||||||||||||||||    
31096748 tgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcttatttttcttttttttttttgaaaaaatgttacttca 31096649  T
766 ttctttttgtaa-aattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttcct 863  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
31096648 ttctttt-gtaagaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttcct 31096550  T
864 tttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
31096549 tttatcgaatattt-ggcatttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 31096480  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 509 - 679
Target Start/End: Original strand, 39030276 - 39030446
Alignment:
509 gcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga 608  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
39030276 gcacgggtcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga 39030375  T
609 attcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt 679  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
39030376 attcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcatt 39030446  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 847 - 932
Target Start/End: Original strand, 7889742 - 7889828
Alignment:
847 atttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
7889742 atttaaataattttccttttatcgaatatttggtc-tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 7889828  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 31097932 - 31097881
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaa 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
31097932 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaa 31097881  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 9741358 - 9741322
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9741358 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 9741322  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 18676888 - 18676852
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18676888 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 18676852  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31588050 - 31588014
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31588050 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 31588014  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 44508503 - 44508539
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44508503 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 44508539  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 47455050 - 47455086
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47455050 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 47455086  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5544435 - 5544400
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5544435 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 5544400  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 47020600 - 47020565
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
47020600 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 47020565  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3112205 - 3112171
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3112205 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 3112171  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 42697408 - 42697442
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42697408 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 42697442  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 11001323 - 11001360
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 521  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
11001323 aactagaccttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 11001360  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 32661086 - 32661033
Alignment:
497 acccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
32661086 acccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaagcaaa 32661033  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 3887670 - 3887706
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
3887670 caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataa 3887706  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12726350 - 12726314
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
12726350 caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataa 12726314  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 12848440 - 12848476
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12848440 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 12848476  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 38743355 - 38743319
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
38743355 caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataa 38743319  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 44291052 - 44291088
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
44291052 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 44291088  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30888523 - 30888488
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
30888523 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 30888488  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 40968935 - 40968892
Alignment:
758 ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
40968935 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 40968892  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 484 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 13765380 - 13765318
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaa 546  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| || ||  |||||||||    
13765380 aactagactttccacccgtgttgccgcacaggtcatgtacactgtaaatgtaacagacaaaaa 13765318  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 39494886 - 39494920
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
39494886 agttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 39494920  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 40431405 - 40431371
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
40431405 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa 40431371  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 42076336 - 42076370
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
42076336 agttacacccaaatttatttaaatttttacaataa 42076370  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 38163522 - 38163567
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
38163522 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 38163567  T

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Target: chr1 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 4266610 - 4266162
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4266610 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 4266511  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4266510 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 4266411  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
4266410 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 4266312  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
4266311 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 4266213  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
4266212 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 4266162  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 38913747 - 38914195
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38913747 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 38913846  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38913847 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 38913946  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
38913947 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgtaacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 38914045  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
38914046 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 38914144  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
38914145 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 38914195  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 2951366 - 2951814
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2951366 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaaatataataaacaaaaaaaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 2951465  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2951466 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 2951565  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
2951566 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 2951664  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
2951665 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 2951763  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
2951764 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 2951814  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 1232025 - 1231590
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1232025 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaaatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 1231926  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1231925 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 1231826  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    |||||||||||             ||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
1231825 gttaaaattat-------------attattggtatgttacttcatatttttcttctttttttt-gaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 1231740  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
1231739 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 1231641  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
1231640 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 1231590  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 23482706 - 23483150
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23482706 aactagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatgtagtagacaaatacaaatctcaatgcatatcaaagagcatgaaatatgtg 23482805  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23482806 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 23482905  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||    
23482906 tgttaaaattatatgtcaacgttatattattggtatgttacttcat------cttttatttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 23482999  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacc-tcacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
23483000 atgttaatgttatattatgtaccaaaaaatagctcattcttaaccttaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 23483098  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
23483099 tttaccataaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 23483150  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 7334174 - 7333728
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
7334174 aactagacttttcacccgtgctgctgcacgggttatatagatggtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtg 7334075  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7334074 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcaaacctcagacaccacacttattcaccataaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 7333975  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                    | |||||| ||||||||||||||   ||||||||    
7333974 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----ctttttttttttttttacaaaatgctacttcattcttttgtaaaaattat 7333879  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
7333878 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 7333780  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
7333779 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 7333728  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 18706509 - 18706951
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18706509 actagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 18706608  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
18706609 t-ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgtaacttcattctttt 18706707  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
18706708 gttaaaattatatgtcaacgttatattattggtatgttacttcat------cttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 18706801  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
18706802 tgttaatgttatattatgtaccaaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 18706900  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
18706901 ttaccataaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 18706951  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 490 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 35614291 - 35613849
Alignment:
490 actttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccca 589  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35614291 actttccacccgtgctaccgcacgggtcatatacattgtaaatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccca 35614192  T
590 aatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35614191 aatatatgcagatgttggaattcgaacttaagacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaa 35614092  T
690 aattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgtta 789  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||                    | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
35614091 aattatatgtcaatgtcatattattggtatgttacttcat--ctttcttttttttgggtaacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgtta 35613994  T
790 atgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttacc 888  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
35613993 attttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaattatttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccgttacc 35613895  T
889 gtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
35613894 gtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 35613849  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 38444860 - 38444414
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38444860 actagactttccacccgtgatgccgcatgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 38444761  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
38444760 tcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacttcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaataatgtgttacttcattctttt 38444661  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||                   || ||||||||| |||||||||||   |||||||||    
38444660 gataaaattatatgtcaatgttatattattggtatgtaacttcat---ttttattttattttttgacaaaatgttaattcattcttttgtaaaaattata 38444564  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
38444563 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-agcat 38444465  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
38444464 ttaccgaaaatgataccctttaactgtttgttgaaatatttcttccacctg 38444414  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 525 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 39728169 - 39727761
Alignment:
525 ttgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagaca 624  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39728169 ttgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagaca 39728070  T
625 ccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttac 724  Q
    |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
39728069 ccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttac 39727970  T
725 ttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattctt 824  Q
    ||||||                  || |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
39727969 ttcata-ttttttattttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgtaatattatgtacctaaaaatagctcattctt 39727871  T
825 aacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtt 921  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
39727870 aacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacatttaccgtaaatgatacactttaactgtttgttgaaatgtt 39727772  T
922 tcttccacctg 932  Q
    |||||||||||    
39727771 tcttccacctg 39727761  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 484 - 721
Target Start/End: Original strand, 34888685 - 34888922
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34888685 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 34888784  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34888785 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 34888884  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgt 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34888885 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgt 34888922  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 528 - 932
Target Start/End: Original strand, 19764593 - 19764992
Alignment:
528 tagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacacca 627  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
19764593 tagatgtagtatacaaaaacaaatctcaatgcatattaaaaagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcaaatgtttgaattcgaacctcagacacca 19764692  T
628 cgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaat-attatattattggtatgttactt 726  Q
    | ||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
19764693 cacttattcaccttaaaaatattaatttttatgaatcgtgtgttacttcattattttgttaaaattacatgtcaatgtttatattattggtatattactt 19764792  T
727 catannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaa 826  Q
    |||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
19764793 cat--------tttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaa 19764884  T
827 cctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttc 923  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
19764885 cctcaacatgtaaattgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttc 19764983  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 509 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 50151265 - 50151044
Alignment:
509 gcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50151265 gcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga 50151166  T
609 attcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattat 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50151165 attcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattat 50151066  T
709 attattggtatgttacttcata 730  Q
    ||||||||||||||||||||||    
50151065 attattggtatgttacttcata 50151044  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 483 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 9216262 - 9216016
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
9216262 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagataaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgt 9216163  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
9216162 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttatttaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattctt 9216063  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
9216062 ttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 9216016  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 524 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 35615005 - 35614599
Alignment:
524 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 623  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35615005 attgtaaatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 35614906  T
624 accacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg-----ta 718  Q
    ||||| |||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||     ||    
35614905 accacacttatttaccttaaaa-tattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtcatattaatgggaaggta 35614807  T
719 tgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttc 818  Q
    ||||||||| |                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
35614806 tgttacttcgt--------tttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctc 35614715  T
819 attcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--g 915  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||       
35614714 attcttaacctcaacatgtaaaattatttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccgttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttga 35614616  T
916 aatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||    
35614615 aatgtttcttccacctg 35614599  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 576 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19768602 - 19768247
Alignment:
576 aatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttactt 675  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||||    
19768602 aatatgtggttccaaatacatgtagatgttgaatttcgaacctcagacaccacacttattcatcttaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttactt 19768503  T
676 cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgt 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||       
19768502 cattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---ctttttttttatttttgacaaaatgttacttcattcttttgta 19768406  T
776 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
19768405 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttcaataatttttcttttatcgaata 19768306  T
875 tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
19768305 ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 19768247  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 484 - 729
Target Start/End: Original strand, 18855232 - 18855476
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
18855232 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgcagtagacaaat-caaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtg 18855330  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
18855331 gtcccaaatatatgtagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtattacttcattcttt 18855430  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18855431 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 18855476  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 485 - 729
Target Start/End: Original strand, 52687114 - 52687357
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
52687114 actagactttccacccgtgctgtcgcacgggtcatatacattgtagatgtagtatacaaaaacaaatctcaatgcctatgaaagagaatgaaatatgtgg 52687213  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
52687214 tcccaaatatatgcagatgttggaatccgaacctca-acaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattttttt 52687312  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
52687313 attaaaattatatgtcaatgttatattaatggtatgttacttcat 52687357  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 485 - 639
Target Start/End: Original strand, 31018200 - 31018354
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31018200 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 31018299  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31018300 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc 31018354  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 487 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 50326228 - 50326076
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50326228 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 50326129  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50326128 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcacc 50326076  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 752 - 932
Target Start/End: Original strand, 52036306 - 52036488
Alignment:
752 aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt 850  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
52036306 aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatatttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttattt 52036405  T
851 aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
52036406 aaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 52036488  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 754 - 932
Target Start/End: Original strand, 52687379 - 52687559
Alignment:
754 aatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaa 852  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
52687379 aatgttgcttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttctatttaa 52687478  T
853 gtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
52687479 aaaattttccttttatcgaatattt-ggcatttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 52687559  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 580 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 2590468 - 2590320
Alignment:
580 tgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt 679  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
2590468 tgtggttccaaatatatgcagatgttcgaattc-aacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcatt 2590370  T
680 cttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
2590369 cttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 2590320  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 485 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 29942247 - 29942153
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29942247 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 29942153  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 518 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 5061419 - 5061335
Alignment:
518 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagat 602  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5061419 atatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagat 5061335  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 52957105 - 52957058
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagat 532  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52957105 actagactctccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagat 52957058  T

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Target: chr1; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 2590510 - 2590466
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484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgt 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
2590510 aactagactttccacccgtgctgccgcacgagtcatatacattgt 2590466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 29387896 - 29387952
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494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
29387896 tccacccgtactgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaaacaaa 29387952  T

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Target: chr1; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 420 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15476136 - 15476071
Alignment:
420 gaccggtgctagtcacacccnnnnnnnnncaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15476136 gaccggtgctagtcacaccccaaaaaaaacaagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 15476071  T

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Target: chr1; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3994996 - 3994960
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449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3994996 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 3994960  T

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Target: chr1; HSP #31
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 6978901 - 6978937
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449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6978901 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 6978937  T

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Target: chr1; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11335715 - 11335679
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449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11335715 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 11335679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11493735 - 11493699
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449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11493735 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 11493699  T

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Target: chr1; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20599722 - 20599686
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449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20599722 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 20599686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26770252 - 26770216
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26770252 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 26770216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 28947463 - 28947519
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||    
28947463 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattataagtgtagtagacaaaagcaaa 28947519  T

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Target: chr1; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 883 - 932
Target Start/End: Original strand, 41530992 - 41531043
Alignment:
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
41530992 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 41531043  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 42885266 - 42885302
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42885266 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 42885302  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 44234155 - 44234119
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44234155 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 44234119  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 50490801 - 50490837
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50490801 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 50490837  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 52469560 - 52469524
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52469560 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 52469524  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4490267 - 4490232
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4490267 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 4490232  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 8895622 - 8895657
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8895622 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 8895657  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 26497688 - 26497649
Alignment:
482 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 521  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
26497688 ataactagactttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat 26497649  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 37094278 - 37094243
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37094278 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 37094243  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 48542678 - 48542643
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48542678 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 48542643  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 13556077 - 13556111
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13556077 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 13556111  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14009895 - 14009849
Alignment:
500 cgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaa 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
14009895 cgtgctgccgcacgggtcatataaattgtaaatgtagtagacaaaaa 14009849  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17926315 - 17926281
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17926315 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 17926281  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25730045 - 25730011
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25730045 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 25730011  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 25828677 - 25828711
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25828677 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 25828711  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 40359667 - 40359701
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40359667 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 40359701  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Original strand, 52036310 - 52036355
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 713  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
52036310 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 52036355  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24180688 - 24180652
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
24180688 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa 24180652  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 30159012 - 30159048
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
30159012 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 30159048  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31760829 - 31760793
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
31760829 caagttacactcaaatttatttaaaattttacaataa 31760793  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 35719709 - 35719745
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
35719709 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa 35719745  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 36465920 - 36465864
Alignment:
489 gactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaa 545  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
36465920 gacttttcacccgtgctgccgcacaggtcatatacggtgtaaatatagttgacaaaa 36465864  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 44054944 - 44054908
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
44054944 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 44054908  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 2590379 - 2590336
Alignment:
758 ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
2590379 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 2590336  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 3770504 - 3770539
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
3770504 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 3770539  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 9216075 - 9216032
Alignment:
758 ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
9216075 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 9216032  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17581009 - 17580974
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
17581009 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 17580974  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Original strand, 18855417 - 18855460
Alignment:
758 ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
18855417 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 18855460  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28226469 - 28226434
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
28226469 aagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 28226434  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 481
Target Start/End: Original strand, 641458 - 641488
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttaca 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
641458 agttacacccaaatttatttaaaattttaca 641488  T

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Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 46674745 - 46674779
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451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
46674745 agttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 46674779  T

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Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 47534001 - 47534035
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
47534001 agttacactcaaatttatttaaaattttacaataa 47534035  T

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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Original strand, 4325453 - 4325490
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484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 521  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
4325453 aactagaccttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat 4325490  T

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Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Original strand, 18604860 - 18604893
Alignment:
452 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18604860 gttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 18604893  T

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Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 34888869 - 34888914
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
34888869 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 34888914  T

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Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 50151106 - 50151061
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
50151106 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 50151061  T

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Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Original strand, 52687381 - 52687426
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 713  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
52687381 tgttgcttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 52687426  T

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Target: chr6 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 487 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19997892 - 19997445
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19997892 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 19997793  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19997792 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 19997693  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
19997692 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatg 19997593  T
787 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
19997592 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccttt 19997494  T
886 accgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
19997493 accgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 19997445  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 12597264 - 12597713
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12597264 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 12597363  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12597364 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 12597463  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
12597464 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 12597562  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
12597563 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 12597661  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
12597662 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 12597713  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 33646171 - 33645723
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33646171 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 33646072  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33646071 ttccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 33645972  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
33645971 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 33645873  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
33645872 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 33645774  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
33645773 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 33645723  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 28099597 - 28100043
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28099597 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 28099696  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28099697 tcccaaatatatgctgatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 28099796  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
28099797 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttctttttcttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 28099896  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaatttt-ccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||    
28099897 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttcccttttatcgaatattt--gcc 28099994  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgtgaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
28099995 tttaccgtaaatgata-cctttaactgtttgtgaaatgttcttccacctg 28100043  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 484 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 2267006 - 2266550
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2267006 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 2266907  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacac--------cacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttactt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
2266906 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttactt 2266807  T
676 cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgt 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||       
2266806 cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgta 2266708  T
776 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
2266707 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattgtccttttatcgaata 2266608  T
875 tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacct 931  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
2266607 ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacct 2266550  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 484 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 17202662 - 17202214
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17202662 aactagactttccacccgtgctgccgcacaagtcatatacattgtagatgtagtagacaaatacaaatcacaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 17202563  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17202562 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 17202463  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||    
17202462 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-tttttattttatttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 17202364  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |       
17202363 atgttaatgttatattatgtacttaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gaaa 17202265  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacct 931  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
17202264 tttaccataaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacct 17202214  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 3593123 - 3592677
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
3593123 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatccaagagaatgaaatatgtg 3593024  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
3593023 atcccaaatatattcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatgaatcgtgtgttacttcattcttt 3592924  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||    
3592923 tgttaaaattatatctcaatgttatattattggtatgttacttcat----tttatttatttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 3592828  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaac-ctcacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
3592827 atgttaatgttgtattatgtacctaaaaatagctcatttttaactccaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 3592729  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
3592728 tttaccgtaagtgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 3592677  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 10584728 - 10585177
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
10584728 actagactttccacccgtgctgccatatgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 10584827  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10584828 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacactacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 10584927  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
10584928 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat---ctttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 10585024  T
785 tgttaatgtta---tattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg 880  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||    
10585025 tgttaatgttatattattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataactttccttttatcaaatattt-gg 10585123  T
881 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
10585124 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 10585177  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 485 - 914
Target Start/End: Complemental strand, 15044951 - 15044524
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15044951 actagactttccacccgtgctgccgcacaggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatttcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtgg 15044852  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15044851 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgttttacttcattctttt 15044752  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
15044751 gttaaaattatatgtcaatgttatattattgctatgttacttcat--cttttctttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 15044654  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
15044653 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaattttttattttaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 15044555  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt 914  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
15044554 ttaccgtaaatgataccatttaactgtttgt 15044524  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 587 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 25448876 - 25448530
Alignment:
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
25448876 ccaaatatatgtagatgttggaattcgaaactcagacaccacgcttattcaccaaaaatatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttttttgt 25448777  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
25448776 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatattttttttttttttttt-gaaaaaatgttactttattcttttgtaaaaattatatg 25448678  T
787 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggccttt 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
25448677 ttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgtttaatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggctttt 25448579  T
886 accgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
25448578 accgtaaatgataccctttaactttttgttgaaatgtttcttccacctg 25448530  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 485 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 2005657 - 2005332
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
2005657 actagactttccactcgtgcggccgcacgggtcatatacattgtagatgcagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtgg 2005558  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
2005557 tcttaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattctttt 2005458  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   |||||||||    
2005457 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-----cttcttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattata 2005363  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatag 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
2005362 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatag 2005332  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 485 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 13533996 - 13533771
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
13533996 actagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtgg 13533897  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13533896 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 13533797  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatat 710  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
13533796 gttaaaattatatgtcaatgttatat 13533771  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 552 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 17594979 - 17594598
Alignment:
552 ctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntatt- 650  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||       ||||     
17594979 ctcaatgcatatcaaagaaaatgaaatatgtggtcccaaatatatggagatgttgaaattcaaacttcagacaccacacttattcaccttaaaaatatta 17594880  T
651 aatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnnga 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||                   ||    
17594879 aatttttatcaatcgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtttgttacttcat--tttttattttattttttga 17594782  T
751 aaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatt 849  Q
     |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
17594781 caaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatatacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatt 17594682  T
850 taagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
17594681 taaagaattttccttttatcgaatattt-ggtctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatgttttttccacctg 17594598  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 752 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 3589111 - 3588929
Alignment:
752 aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt 850  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||    
3589111 aaaatgttacttcactcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcatttttaatctcaacatgtaaaatgttttattt 3589012  T
851 aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
3589011 aaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 3588929  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 752 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 3592134 - 3591952
Alignment:
752 aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt 850  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||    
3592134 aaaatgttatttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattttcaacctcaacatgtaaaatgttttattt 3592035  T
851 aagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
3592034 aaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 3591952  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 588 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 8539726 - 8539585
Alignment:
588 caaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtt 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8539726 caaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtt 8539627  T
688 aaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
8539626 aaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 8539585  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 484 - 610
Target Start/End: Original strand, 1405562 - 1405688
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
1405562 aactagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatattaaagagaatgaaatatgtg 1405661  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaat 610  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
1405662 atcccaaatatatgcagatgttggaat 1405688  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 798 - 932
Target Start/End: Original strand, 1405745 - 1405881
Alignment:
798 ttatgtacctaaaaatagttcattcttaacctca-catgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatga 896  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1405745 ttatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatga 1405843  T
897 taccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||    
1405844 tacattttaactgtttgttaaaatgtttcttccacctg 1405881  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 521 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 33035626 - 33035523
Alignment:
521 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 620  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
33035626 tacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatgtcaaagagaataaaacatgtggtctcaaatatatgcagatgctggaattcgaatctca 33035527  T
621 gaca 624  Q
    ||||    
33035526 gaca 33035523  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 807 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 33035520 - 33035393
Alignment:
807 taaaaatagttcattcttaacctca-catgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgatacccttta 905  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||    
33035520 taaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-gacatttagcgtaaatgataccattta 33035422  T
906 actgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||    
33035421 actgtttgttgaaatgtttcttccacctg 33035393  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 27448531 - 27448431
Alignment:
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
27448531 atgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcaaatatttgg-cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc 27448433  T
931 tg 932  Q
    ||    
27448432 tg 27448431  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 485 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 8539782 - 8539723
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaa 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
8539782 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaa 8539723  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 6300709 - 6300774
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
6300709 actagactatgcacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtatatctagtaggcaaaaacaaa 6300774  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Original strand, 6307519 - 6307584
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
6307519 actagactatgcacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtatatctagtaggcaaaaacaaa 6307584  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 484 - 526
Target Start/End: Original strand, 162668 - 162710
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
162668 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 162710  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 8657073 - 8657129
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
8657073 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaagcaaa 8657129  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 4169664 - 4169700
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4169664 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 4169700  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 4210393 - 4210429
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4210393 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 4210429  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 8658987 - 8659023
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8658987 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 8659023  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17595996 - 17595960
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17595996 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 17595960  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 33489792 - 33489828
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33489792 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 33489828  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 5545373 - 5545407
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5545373 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 5545407  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 11590248 - 11590282
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11590248 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 11590282  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 527
Target Start/End: Original strand, 14986391 - 14986433
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattg 527  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
14986391 actagactttgcacccgtgctgctgcacgggtcatatacattg 14986433  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 550
Target Start/End: Original strand, 15432336 - 15432402
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||| || ||||||||||    
15432336 aactagactttctacccgtgcggccgcacgggtcatatacatcgaaaatgtagaaggcaaaaacaaa 15432402  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 32938531 - 32938497
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32938531 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 32938497  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 8539646 - 8539601
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
8539646 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 8539601  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 10790491 - 10790527
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
10790491 caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataa 10790527  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 487 - 535
Target Start/End: Original strand, 25342639 - 25342687
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatata 535  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
25342639 tagacttttcacccgtgctgccgcacgagtcatatacaatgtaaatata 25342687  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28914257 - 28914221
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
28914257 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 28914221  T

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Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 8062790 - 8062825
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
8062790 aagttacacccaaatttatttaaaattttataataa 8062825  T

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Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 529
Target Start/End: Original strand, 24570763 - 24570798
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgta 529  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24570763 tccacccgtgctgccacacgggtcatatacattgta 24570798  T

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Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 529
Target Start/End: Original strand, 33289079 - 33289114
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgta 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
33289079 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatagattgta 33289114  T

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Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 535
Target Start/End: Original strand, 2965459 - 2965509
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatata 535  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
2965459 actagacttatcacccgtgctgccgcacgggtcataaacaatgtaaatata 2965509  T

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Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8933935 - 8933901
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
8933935 agttacacccaaatttatttaaaattttactataa 8933901  T

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Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 9576031 - 9576065
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
9576031 agttacacacaaatttatttaaaattttacaataa 9576065  T

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Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12713216 - 12713182
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
12713216 agttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 12713182  T

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Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 756 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 13533813 - 13533771
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatat 798  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
13533813 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat 13533771  T

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Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 742980 - 742947
Alignment:
452 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
742980 gttacactcaaatttatttaaaattttacaataa 742947  T

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Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 3589107 - 3589062
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 713  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
3589107 tgttacttcactcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 3589062  T

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Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 3592130 - 3592085
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 713  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
3592130 tgttatttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattat 3592085  T

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Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 526
Target Start/End: Original strand, 24165091 - 24165132
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 526  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
24165091 actagacttatcacccgtgctgacgcacgggtcatatacatt 24165132  T

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Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30143049 - 30142984
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | |||| | ||||||||||||| ||||    
30143049 actagactttacacccgtgttgccgcacgagacatatataatgtaaaaatagtagacaaaagcaaa 30142984  T

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Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 10478167 - 10477718
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10478167 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 10478068  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10478067 gtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 10477968  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
10477967 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 10477869  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
10477868 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 10477770  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
10477769 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 10477718  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 30473883 - 30474331
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30473883 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 30473982  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30473983 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 30474082  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
30474083 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata--tttttcttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 30474180  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
30474181 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 30474279  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
30474280 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 30474331  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 482 - 929
Target Start/End: Original strand, 44832183 - 44832632
Alignment:
482 ataactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 581  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44832183 ataactagactttccacccgtgttgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatg 44832282  T
582 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44832283 tggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattct 44832382  T
682 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatt 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||    
44832383 tttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatatttttcttttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatt 44832482  T
782 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttggg 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
44832483 atatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gg 44832581  T
881 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccac 929  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
44832582 cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccac 44832632  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 6299020 - 6299468
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6299020 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 6299119  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6299120 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattccttt 6299219  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
6299220 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 6299318  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
6299319 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 6299417  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
6299418 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 6299468  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Original strand, 32110859 - 32111309
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32110859 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 32110958  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32110959 ggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 32111058  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
32111059 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 32111157  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
32111158 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatattttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggc 32111256  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
32111257 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 32111309  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Original strand, 995814 - 996263
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
995814 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 995913  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
995914 gtcccaaatatatgcatatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 996013  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
996014 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 996112  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
996113 atgttaatgttgtattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 996211  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
996212 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 996263  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 18175612 - 18175162
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18175612 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 18175513  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
18175512 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccaaaaaaatattaattattatcaaacgtgtgttacttcattctt 18175413  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   |||||||    
18175412 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttcttcttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaatta 18175314  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
18175313 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatggaatattt-ggc 18175215  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
18175214 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 18175162  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 18997930 - 18997481
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18997930 aactagactatccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 18997831  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18997830 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 18997731  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
18997730 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata-tttttctttttttttttgaaaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 18997632  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacct-cacatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||     
18997631 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctgaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatccaatattt-ggca 18997533  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
18997532 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 18997481  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 484 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 11725420 - 11724971
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
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11725420 aactagactttccacccgtgctgctgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 11725321  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11725320 gtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 11725221  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||    
11725220 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat-ctttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 11725122  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
11725121 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 11725023  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
11725022 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 11724971  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 44837138 - 44836689
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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44837138 actagcctttccacccgtgctgccgcacgggttatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatacatatcaaagagaataaaatatgtgg 44837039  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
44837038 tcctaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattctttt 44836939  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
44836938 gttaaaattatatctcaatgttaaattattggtatgttacttcatctttttttattttatttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 44836839  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
44836838 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 44836740  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
44836739 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 44836689  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 483 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 28583086 - 28582642
Alignment:
483 taactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgt 582  Q
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28583086 taactagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgt 28582987  T
583 ggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 682  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28582986 ggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctt 28582887  T
683 ttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaatta 782  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||     
28582886 ttgttaaaattatatgtcaatgttatataattggtatgttacttcat-------cttcttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattg 28582794  T
783 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggc 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
28582793 tatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcaaatattt-ggc 28582695  T
882 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
28582694 ctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttaaaatgtttcttccacctg 28582642  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 24409105 - 24408660
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
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24409105 actagactttctacccgtgttgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatcttaatgcatatcaaagataatgaaatatgtgg 24409006  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24409005 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacatcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 24408906  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
24408905 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----ctttttttttttgttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 24408810  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
24408809 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcct 24408711  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
24408710 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 24408660  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 485 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 18842133 - 18841720
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18842133 actagactttccacccgttctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 18842034  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
18842033 tccaaaatatatgcagatgttggaattcgaatctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtatgttacttcattctttt 18841934  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
18841933 gttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat----------tttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 18841844  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
18841843 cgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcat 18841745  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaact 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
18841744 ttaccgtaaatgataccctttaact 18841720  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 490 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 11142691 - 11142246
Alignment:
490 actttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccca 589  Q
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11142691 actttccacccgtgctgccgcacggatcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgctccca 11142592  T
590 aatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntatta------atttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
11142591 aatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 11142492  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat 783  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||    
11142491 tgttaaaattatatgtcagtgttatattattggtatgttacttcat-----cttcttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattat 11142397  T
784 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
11142396 atgttaatgttatattatgtacctaaaaatagatcattcttatcctcaacgtgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcc 11142298  T
883 tttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
11142297 tttaccgtaaatgatacgctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 11142246  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 35122322 - 35122763
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35122322 actagactttccacccctgctgtcgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 35122421  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35122422 tccaaaatatatgcagatgttggaattcgaatctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 35122521  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
     |||||||||||||||||| |    |||| |||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
35122522 attaaaattatatgtcaatgt----ttatcggtatgttacttcat----cttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 35122613  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcct 883  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
35122614 tgttaatgttatattatgtccctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaacgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcct 35122712  T
884 ttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
35122713 ttatcgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 35122763  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 524 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19413022 - 19412617
Alignment:
524 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 623  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19413022 attgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 19412923  T
624 accacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattc-ttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgtt 722  Q
    |||||  |||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19412922 accacagttattcaccttaaaaatattaatttttatccatcgtgtgttacttcattctttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgtt 19412823  T
723 acttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattc 822  Q
    |||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19412822 acttcat------tttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattc 19412729  T
823 ttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatg 919  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||    
19412728 ttaacctcaacatgtaaaatgttgtatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgatactctttaactgtttgttgaaatg 19412630  T
920 tttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||    
19412629 tttcttccacctg 19412617  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 509 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 39257648 - 39257217
Alignment:
509 gcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga 608  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39257648 gcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgga 39257549  T
609 attcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattat 708  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
39257548 atttgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttat 39257449  T
709 attattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattat------atgttaatgttatattatg 802  Q
    |||||||| ||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||      ||||||||||||||||||     
39257448 attattggcatgttacttcatcttttttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttaatgttatattata 39257349  T
803 tacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccc 901  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
39257348 tacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatttaaaatgttttatttaaataatttttcttttatcgaatattt-ggcatataccgtaaatgataccc 39257250  T
902 tttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||    
39257249 tttaactgtttgttgaaatgttttttccacctg 39257217  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 485 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 15961361 - 15961116
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15961361 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 15961262  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15961261 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 15961162  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15961161 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 15961116  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 534 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19240843 - 19240445
Alignment:
534 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgctta 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19240843 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacactta 19240744  T
634 ttcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannn 733  Q
    |||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        
19240743 ttcacgttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--ct 19240646  T
734 nnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacc-tcac 832  Q
                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | ||    
19240645 tttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatatacctaaaaaaagctcattcttaaccttaac 19240546  T
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttg-tgaa-tgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
19240545 atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccattaccgtaaatgatgccctttaactgtttgttgaattgtttcttccacc 19240447  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 534 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 19314027 - 19313629
Alignment:
534 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgctta 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19314027 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacactta 19313928  T
634 ttcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannn 733  Q
    |||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        
19313927 ttcacgttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--ct 19313830  T
734 nnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacc-tcac 832  Q
                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | ||    
19313829 tttttttttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatatacctaaaaaaagctcattcttaaccttaac 19313730  T
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttg-tgaa-tgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
19313729 atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggccattaccgtaaatgatgccctttaactgtttgttgaattgtttcttccacc 19313631  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 487 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 18569092 - 18568853
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18569092 tagactttccacccgtgctaccgcacgggtcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtc 18568993  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18568992 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttattcatcttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 18568893  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttactt 726  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
18568892 taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttactt 18568853  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 508 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 40027006 - 40026785
Alignment:
508 cgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgg 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
40027006 cgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagataatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgg 40026907  T
608 aattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta 707  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
40026906 aatttgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtta 40026807  T
708 tattattggtatgttacttcat 729  Q
    ||||||||||||||||||||||    
40026806 tattattggtatgttacttcat 40026785  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 487 - 730
Target Start/End: Original strand, 28274217 - 28274459
Alignment:
487 tagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 586  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28274217 tagactttccatccgtgcggc-gcacggatcatatacattgtagatgtagcagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtc 28274315  T
587 ccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 686  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28274316 ccaaatatacgcagatgttggaattcgaacctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgt 28274415  T
687 taaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 730  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
28274416 taaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcata 28274459  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 517 - 932
Target Start/End: Original strand, 25875322 - 25875745
Alignment:
517 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaac 616  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||    
25875322 catatacatcgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaataaaacatgtgctccc-----tatgcagatgctggaattcgaac 25875416  T
617 ctcagacacc--------------acgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa 702  Q
    ||||||||                || ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
25875417 ctcagacatattaaagagaataaaacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa 25875516  T
703 tattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatg 802  Q
    | |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
25875517 tgttatattattggtatgttacttcat---ctttttttttttttttgacaaaatgttacttcattattttgtaaaaattatatgttaatgttatattatg 25875613  T
803 tacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccc 901  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||    
25875614 tacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-gacatttagcgtaaatgataccc 25875712  T
902 tttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||    
25875713 tttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 25875745  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 517 - 729
Target Start/End: Original strand, 18210656 - 18210868
Alignment:
517 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaac 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
18210656 catatacattgtagatatagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaatttgaac 18210755  T
617 ctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 716  Q
    |||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
18210756 ctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttatttccttcttttgttaaagttatatgtcaatgttatattattgt 18210855  T
717 tatgttacttcat 729  Q
    |||||||||||||    
18210856 tatgttacttcat 18210868  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 484 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 39997921 - 39997726
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
39997921 aactagaatttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtg 39997822  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt 679  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
39997821 gttccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcacctttaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt 39997726  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 537 - 729
Target Start/End: Original strand, 24004779 - 24004971
Alignment:
537 tagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattc 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
24004779 tagacaaaatcaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattc 24004878  T
637 accnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    |||       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
24004879 accttaaaaatattaatttttatcaatcatgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 24004971  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 668 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 39997708 - 39997445
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcatt 767  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                  || ||||||||||||||||    
39997708 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcatatttttattttttttt---gacaaaatgttacttcatt 39997612  T
768 ctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttcctttt 866  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
39997611 cttttgtaaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatattttatttaaataattttcctttt 39997512  T
867 atcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
39997511 atcgaatgttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 39997445  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 596 - 863
Target Start/End: Original strand, 23353688 - 23353955
Alignment:
596 tgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattat 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
23353688 tgcagatgttggaattcgaacctcagacaccccacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattat 23353787  T
696 atgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgtta 795  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
23353788 atgtcaatgttatattattggtatgttacttcat--ttttttattttttttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgtta 23353885  T
796 tattatgtacct-aaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttcct 863  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
23353886 tattatgtacctaaaaaaaagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttcct 23353955  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 776 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 40026770 - 40026612
Alignment:
776 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaata 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
40026770 aaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaata 40026671  T
875 tttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
40026670 ttt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttctttcacctg 40026612  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 755 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 18568861 - 18568682
Alignment:
755 atgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaatttaag 853  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
18568861 atgttacttaattcttttgtaaaaattatatgttaatgctatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttatttaaa 18568762  T
854 taattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
18568761 taatttttcttttgtcgaatattt-gacctttaccgtaaatgatatcctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 18568682  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 44836499 - 44836399
Alignment:
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
44836499 atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc 44836401  T
931 tg 932  Q
    ||    
44836400 tg 44836399  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 654 - 729
Target Start/End: Original strand, 18481929 - 18482004
Alignment:
654 ttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
18481929 ttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 18482004  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 840 - 932
Target Start/End: Original strand, 18210934 - 18211027
Alignment:
840 atgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
18210934 atgttttatttaaataattttccttttatcgaatattt-ggcctttaccgtaaatgacaccctttaactgtttgttgaaatgtttattccacctg 18211027  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 485 - 543
Target Start/End: Original strand, 23353622 - 23353680
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
23353622 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgtagtagacaa 23353680  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 405363 - 405419
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
405363 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtatagtagacaaaagcaaa 405419  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 19241055 - 19241008
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagat 532  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19241055 actagactttccacccgcgctgccgcacgggtcatatacattgtagat 19241008  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 19314239 - 19314192
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagat 532  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
19314239 actagactttccacccgcgctgccgcacgggtcatatacattgtagat 19314192  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 8352379 - 8352415
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8352379 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 8352415  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 20818954 - 20818990
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20818954 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 20818990  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25487349 - 25487313
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25487349 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 25487313  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 27719241 - 27719277
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27719241 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 27719277  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 33411044 - 33411080
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33411044 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 33411080  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35393646 - 35393610
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35393646 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 35393610  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 36781651 - 36781687
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36781651 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 36781687  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 29997494 - 29997529
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29997494 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 29997529  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Original strand, 31097515 - 31097550
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31097515 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 31097550  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 5458261 - 5458295
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5458261 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 5458295  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 752 - 798
Target Start/End: Original strand, 18210889 - 18210935
Alignment:
752 aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatat 798  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
18210889 aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatat 18210935  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 38098907 - 38098873
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38098907 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 38098873  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Original strand, 45084246 - 45084280
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45084246 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 45084280  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 18568911 - 18568866
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
18568911 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 18568866  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Original strand, 28274397 - 28274442
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
28274397 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 28274442  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 39997712 - 39997663
Alignment:
752 aaaatgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
39997712 aaaatgttacttcattcttttgtaaaaattatatgtcaatgttatattat 39997663  T

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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 40026846 - 40026801
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
40026846 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 40026801  T

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Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 483282 - 483246
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
483282 caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 483246  T

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Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 11020402 - 11020438
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
11020402 caagttacacccgaatttatttaaaattttacaataa 11020438  T

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Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 12986670 - 12986706
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
12986670 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 12986706  T

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Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 17695653 - 17695597
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| ||||    
17695653 tccacccgtgctgccgcacgggtaatatacattgtaagtgtagtagataaaagcaaa 17695597  T

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Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 20187471 - 20187507
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
20187471 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 20187507  T

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Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 20206540 - 20206576
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
20206540 caagttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 20206576  T

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Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26416424 - 26416388
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
26416424 caagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 26416388  T

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Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 485
Target Start/End: Original strand, 30655004 - 30655036
Alignment:
453 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
30655004 ttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 30655036  T

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Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Original strand, 39780311 - 39780347
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
39780311 caagttacacccaaatttatttaaaattttataataa 39780347  T

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Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Original strand, 44831143 - 44831199
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||    
44831143 tccacccgtgctgccgctcgggtcatatacattgtaagtgtagtagataaaagcaaa 44831199  T

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Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Original strand, 18481945 - 18481988
Alignment:
758 ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
18481945 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 18481988  T

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Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Original strand, 24004912 - 24004955
Alignment:
758 ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
24004912 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 24004955  T

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Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24757891 - 24757856
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
24757891 aagttacatccaaatttatttaaaattttacaataa 24757856  T

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Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30700140 - 30700105
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
30700140 aagttacactcaaatttatttaaaattttacaataa 30700105  T

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Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 668 - 710
Target Start/End: Original strand, 18210893 - 18210935
Alignment:
668 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat 710  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
18210893 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatat 18210935  T

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Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1105066 - 1105033
Alignment:
452 gttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
1105066 gttacacctaaatttatttaaaattttacaataa 1105033  T

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Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 15961178 - 15961133
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
15961178 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 15961133  T

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Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24471909 - 24471872
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 521  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
24471909 aactagaccttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat 24471872  T

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Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34815285 - 34815244
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacatt 526  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
34815285 actagacttatcacccgtgctgacgcacgggtcatatacatt 34815244  T

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Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 522
Target Start/End: Original strand, 40169720 - 40169757
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatata 522  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
40169720 actagtctttccacccgtgctaccgcacgggtcatata 40169757  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 484 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 46504 - 46258
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46504 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 46405  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46404 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 46305  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
46304 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcata 46258  T

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Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 46320 - 46275
Alignment:
756 tgttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
46320 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattat 46275  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 485 - 850
Target Start/End: Original strand, 149050 - 149413
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
149050 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatataaattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 149149  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
149150 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacatcaaacacaacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattctttt 149249  T
685 gttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcatannnnnnnnnnnnnnnnnngaaaaaatgttacttcattctttttgtaaaattata 784  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||                   || |||||||||||||||||||||   |||||||||    
149250 gttaaaattatatgtcaacgttatattattggtatgttacttcat---ttttatttttatttttgacaaaatgttacttcattcttttgtaaaaattata 149346  T
785 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagttcattcttaacctc-acatgtaaaatgtttaattt 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
149347 tgttaatgttatattatgtacctaaaaatagctcattcttaacctcaacatgtaaaatgttttattt 149413  T

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Target: scaffold0173 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 484 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 19577 - 19332
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtg 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
19577 aactagactttccacccgtgctgccgtacgggtcctatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagataattaaatatgtg 19478  T
584 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattcaccnnnnnnntattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
19477 gtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttt 19378  T
684 tgttaaaattatatgtcaatattatattattggtatgttacttcat 729  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
19377 tgttaaaattatatgtcaatgttatattattggtatgttacttcat 19332  T

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Target: scaffold0173; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 19391 - 19348
Alignment:
758 ttacttcattctttttgtaaaattatatgttaatgttatattat 801  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
19391 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 19348  T

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Target: scaffold0836 (Bit Score: 145; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0836
Description:

Target: scaffold0836; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 485 - 637
Target Start/End: Original strand, 5278 - 5430
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5278 actagactttccacccgtgctgccgcacgggacatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 5377  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattca 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5378 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattca 5430  T

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Target: scaffold0515 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 485 - 637
Target Start/End: Original strand, 6061 - 6213
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6061 actagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 6160  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattca 637  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
6161 tctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttattca 6213  T

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Target: scaffold0306 (Bit Score: 125; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 485 - 637
Target Start/End: Original strand, 6071 - 6223
Alignment:
485 actagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 584  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6071 actagattttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgg 6170  T
585 tcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgcttattca 637  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
6171 tctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttattca 6223  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Original strand, 38827 - 38927
Alignment:
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
38827 atgtaaaatgttttatttaaataattttacttttatcaaatatttgg-cctttaccgtaaaggataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacc 38925  T
931 tg 932  Q
    ||    
38926 tg 38927  T

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Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 833 - 932
Target Start/End: Original strand, 38536 - 38636
Alignment:
833 atgtaaaatgtttaatttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacc 930  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
38536 atgtaaaatgttttatttaaataattttccttttatcaaatattt-ggcatttaccgtaaaggataccctttaactttttgttgaaatgtttcttccacc 38634  T
931 tg 932  Q
    ||    
38635 tg 38636  T

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Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 847 - 932
Target Start/End: Original strand, 38259 - 38345
Alignment:
847 atttaagtaattttccttttatcgaatatttgggcctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgt--gaatgtttcttccacctg 932  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
38259 atttaaataattttccttttattgaatatttga-cctttaccgtaaatgataccctttaactgtttgttgaaatgtttcttccacctg 38345  T

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Target: scaffold0896 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0896
Description:

Target: scaffold0896; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 1137 - 1081
Alignment:
494 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
1137 tccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattgtaagtgtagtagacaaaagcaaa 1081  T

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Target: scaffold0562 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6572 - 6536
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6572 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 6536  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20468 - 20432
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20468 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 20432  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27937 - 27903
Alignment:
451 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27937 agttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 27903  T

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Target: scaffold1360 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1072 - 1036
Alignment:
449 caagttacacccaaatttatttaaaattttacaataa 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
1072 caagttacaccaaaatttatttaaaattttacaataa 1036  T

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Target: scaffold0316 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14764 - 14730
Alignment:
493 ttccacccgtgctgccgcacgggtcatatacattg 527  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
14764 ttccacccgtgttgccgcacgggtcatatacattg 14730  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 450 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 42805 - 42771
Alignment:
450 aagttacacccaaatttatttaaaattttacaata 484  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
42805 aagttacactcaaatttatttaaaattttacaata 42771  T

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Target: scaffold1234 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1234
Description:

Target: scaffold1234; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 484 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1084 - 1047
Alignment:
484 aactagactttccacccgtgctgccgcacgggtcatat 521  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
1084 aactagaccttgcacccgtgctgccgcacgggtcatat 1047  T

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