View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2892_low_3 (Length: 774)

Name: NF2892_low_3
Description: NF2892
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2892_low_3
NF2892_low_3
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (537-755)||(3415373-3415591)
chr4 (537-756)||(35095793-35096012)
chr4 (542-752)||(32429507-32429718)
chr4 (537-752)||(18716251-18716467)
chr4 (537-755)||(3424921-3425139)
chr4 (531-755)||(30020071-30020295)
chr4 (537-756)||(34279711-34279931)
chr4 (537-756)||(35090680-35090899)
chr4 (537-752)||(18736924-18737140)
chr4 (575-755)||(47071212-47071391)
chr4 (537-756)||(14646488-14646707)
chr4 (537-758)||(18670606-18670826)
chr4 (537-626)||(34128566-34128655)
chr4 (671-755)||(34128458-34128542)
chr4 (130-198)||(37078940-37079008)
chr4 (654-719)||(23920292-23920357)
chr4 (607-755)||(54859378-54859525)
chr4 (654-719)||(23908769-23908834)
chr4 (158-199)||(30666554-30666595)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (537-756)||(17720746-17720965)
chr2 (537-756)||(14917602-14917821)
chr2 (537-756)||(45120151-45120370)
chr2 (542-755)||(42779953-42780167)
chr2 (551-756)||(16284215-16284421)
chr2 (537-727)||(39196121-39196311)
chr2 (537-635)||(716126-716224)
chr2 (537-756)||(30283661-30283868)
chr2 (202-281)||(29393063-29393142)
chr2 (146-199)||(817075-817128)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (537-755)||(31076623-31076841)
chr3 (537-756)||(5458232-5458451)
chr3 (537-756)||(5481708-5481927)
chr3 (537-756)||(8458076-8458295)
chr3 (537-756)||(1302465-1302684)
chr3 (537-756)||(4049572-4049791)
chr3 (537-756)||(4054706-4054925)
chr3 (537-756)||(8464515-8464734)
chr3 (537-756)||(10591515-10591734)
chr3 (537-756)||(10673158-10673377)
chr3 (537-756)||(10678273-10678492)
chr3 (537-755)||(31081728-31081946)
chr3 (537-756)||(6853172-6853391)
chr3 (537-756)||(10586402-10586621)
chr3 (537-756)||(33702820-33703039)
chr3 (537-756)||(6858275-6858494)
chr3 (540-756)||(33703068-33703283)
chr3 (537-756)||(29827193-29827413)
chr3 (547-752)||(20890836-20891039)
chr3 (8-37)||(34531293-34531322)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (536-756)||(21275537-21275757)
chr6 (537-756)||(24509048-24509267)
chr6 (537-756)||(20752338-20752556)
chr6 (531-754)||(24509462-24509685)
chr6 (542-756)||(21937340-21937554)
chr6 (530-755)||(2887252-2887473)
chr6 (537-751)||(21936905-21937119)
chr6 (530-755)||(2888974-2889195)
chr6 (547-675)||(12909404-12909532)
chr6 (547-675)||(12934511-12934639)
chr6 (146-199)||(20592056-20592109)
chr6 (146-199)||(19314507-19314560)
chr6 (558-623)||(26910704-26910769)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (537-756)||(26982096-26982315)
chr8 (537-756)||(34107994-34108213)
chr8 (537-756)||(14318835-14319054)
chr8 (540-756)||(18608848-18609064)
chr8 (537-756)||(14315131-14315350)
chr8 (537-756)||(26987209-26987428)
chr8 (537-753)||(25953382-25953598)
chr8 (545-756)||(43957069-43957280)
chr8 (543-756)||(10341177-10341389)
chr8 (536-756)||(18884828-18885048)
chr8 (130-198)||(8472618-8472686)
chr8 (131-198)||(32593464-32593531)
chr8 (134-198)||(541761-541825)
chr8 (8-37)||(18347139-18347168)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (537-756)||(12856554-12856773)
chr7 (537-756)||(14610129-14610348)
chr7 (537-756)||(26050786-26051005)
chr7 (537-756)||(26060145-26060364)
chr7 (537-756)||(26055899-26056118)
chr7 (537-756)||(26065258-26065477)
chr7 (537-756)||(12851439-12851658)
chr7 (537-755)||(11056390-11056608)
chr7 (537-756)||(35352511-35352730)
chr7 (537-756)||(5436750-5436969)
chr7 (537-756)||(37460061-37460279)
chr7 (537-697)||(14615195-14615355)
chr7 (537-756)||(4181601-4181820)
chr7 (130-198)||(1012240-1012308)
chr7 (130-198)||(321888-321954)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (537-756)||(39908723-39908942)
chr5 (537-756)||(9872644-9872863)
chr5 (537-756)||(9877759-9877978)
chr5 (535-756)||(39903608-39903829)
chr5 (544-756)||(2022735-2022948)
chr5 (537-756)||(13556525-13556744)
chr5 (537-751)||(43378202-43378416)
chr5 (537-756)||(35369111-35369341)
chr5 (537-756)||(25183859-25184082)
chr5 (133-198)||(4446332-4446397)
chr5 (662-699)||(4555543-4555580)
chr5 (146-199)||(22160471-22160524)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (537-756)||(28598074-28598293)
chr1 (537-755)||(43358516-43358736)
chr1 (537-756)||(28574062-28574281)
chr1 (537-756)||(13654100-13654319)
chr1 (540-756)||(16050974-16051190)
chr1 (537-751)||(44524244-44524457)
chr1 (560-756)||(19310613-19310808)
chr1 (542-755)||(10186804-10187010)
chr1 (540-756)||(1187595-1187812)
chr1 (537-756)||(3465244-3465457)
chr1 (537-756)||(48366271-48366490)
chr1 (537-756)||(29681356-29681574)
chr1 (537-732)||(35624782-35624977)
chr1 (573-723)||(21431918-21432069)
chr1 (537-755)||(17415406-17415624)
chr1 (715-756)||(3468010-3468051)
chr1 (146-199)||(47065085-47065138)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (537-756)||(143861-144080)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (537-735)||(16372-16570)
scaffold0391 (537-629)||(16277-16369)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (537-756)||(170583-170802)
[»] scaffold0223 (2 HSPs)
scaffold0223 (537-697)||(7256-7416)
scaffold0223 (660-756)||(2239-2335)
[»] scaffold0756 (1 HSPs)
scaffold0756 (537-635)||(3910-4008)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 537 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3415591 - 3415373
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  3415591 tgttgtatatcttgattgttgggaagatgttgttgcacttgaaacctgaaaagtttaattatcatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgccacac 3415492  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  3415491 taacctttaggttcaattcgcccccaccaataactgtatattggatgtaataggaatgaccaacgaatctccttcaggatactatgagttcattgatgtg 3415392  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaa 755  Q
     ||||||||||||||||||    
T  3415391 tattgcacaaccacaccaa 3415373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 35095793 - 35096012
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  35095793 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 35095892  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35095893 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 35095992  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  35095993 tattgcacaaccacaccaag 35096012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 542 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 32429718 - 32429507
Alignment:
Q  542 tatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaata 641  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||      
T  32429718 tatatcttgattgttgggaagatgtggctgcacttgaaacctgaaaattttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacc 32429619  T
Q  642 tataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcatt 740  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  32429618 tttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtatt 32429519  T
Q  741 gcacaaccacac 752  Q
    ||||||||||||    
T  32429518 gcacaaccacac 32429507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 752
Target Start/End: Original strand, 18716251 - 18716467
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||     
T  18716251 tgttgtatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggtaatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacac 18716350  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||   ||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  18716351 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataaagaatgaccggcgaatccccttcaggatactaagagttctttgacgt 18716450  T
Q  736 gcattgcacaaccacac 752  Q
    | |||||||||||||||    
T  18716451 gtattgcacaaccacac 18716467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 537 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3425139 - 3424921
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||     
T  3425139 tgttgtatatcttgattgttgggaagattgtgttgcacttgaaacctgaaaagtttaattattatgcatgcaaaactcaaagcgcatgggattgtcacac 3425040  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||    
T  3425039 taacctttaggttcgattctcccccaccaataactgaatattggatgcaataggaatgaacagcgaatctcctttaggatactatgagttcattgatgtg 3424940  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaa 755  Q
     ||||||||||||||||||    
T  3424939 tattgcacaaccacaccaa 3424921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 531 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30020295 - 30020071
Alignment:
Q  531 aaatactgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattg 630  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||     
T  30020295 aaatattgttgtctatcttgattgttgagaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagttcaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggtta 30020196  T
Q  631 ccacattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttcct 729  Q
    ||| |||||  | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  30020195 ccatattaacct-ttggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttcct 30020097  T
Q  730 tgacgtgcattgcacaaccacaccaa 755  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||    
T  30020096 tgacgtgtattgcataaccacaccaa 30020071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 34279931 - 34279711
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagttt-aattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccaca 635  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  34279931 tgttatatatcttgtttgtagggaagaggcggctgcacttgaaacctgaaacgttttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgtcaca 34279832  T
Q  636 ttaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
     |||  | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | || |  ||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  34279831 ctaacctttagcttcgattcgcccccaccaataactgtatattgaatgcaataggaatgaccgacgattccccttcaaaatactatgagtttcttgacgt 34279732  T
Q  736 gcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  34279731 gtattgcacaaccacaccaag 34279711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 35090680 - 35090899
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||  | |||| | || || ||||||||     
T  35090680 tgttataaatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaatttaaagtgtatggggttgccacac 35090779  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35090780 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 35090879  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  35090880 tattgcacaaccacaccaag 35090899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 537 - 752
Target Start/End: Original strand, 18736924 - 18737140
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | | |||| |     
T  18736924 tgttgtatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggtagccaaac 18737023  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
    |||  | ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18737024 taacctttaggttcaattcgcccccaccaataactatatattagatgcaataaagaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 18737123  T
Q  736 gcattgcacaaccacac 752  Q
    | |||||||||||||||    
T  18737124 gtattgcacaaccacac 18737140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 575 - 755
Target Start/End: Original strand, 47071212 - 47071391
Alignment:
Q  575 ttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgta 674  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||  | ||||||||| || || ||| |||||| ||||    
T  47071212 ttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcacc-ccatcaataattgta 47071310  T
Q  675 tattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgcacaaccacaccaa 755  Q
    |||| ||||||| | |||||||||  ||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47071311 tatttgatgcaatatgaatgaccagcgaatccccttcatgatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaa 47071391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 14646707 - 14646488
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| || || |||||     
T  14646707 tgttatatatcttgattgttaggatgaagctgctgcacttgaaatctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaacttaaagctcatggggtttccacac 14646608  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    | |  | ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||  |||| || |||||||||||||||| | |||    
T  14646607 tgacctttaggttcgatttgcccccactaataactgtatattggatgcaataggaatgacccgcgaatcccctttaggatactatgagttccttaatgtg 14646508  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  14646507 tattgcagaaccacaccaag 14646488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 537 - 758
Target Start/End: Original strand, 18670606 - 18670826
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||     
T  18670606 tgttgtatatcttgattgttgggaagttgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaattcaaagcgcatggagttgccacac 18670705  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgc-caccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacg 734  Q
    |||  | ||||||||| || | | |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |     
T  18670706 taacctttaggttcgattcacaccccaccaataactatatattgaatgcaataaggaatgaccggcgaat-cccttcaggatactatgagttcctt--ca 18670802  T
Q  735 tgcattgcacaaccacaccaagtg 758  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  18670803 tgtattgcacaaccacaccaagtg 18670826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 537 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 34128655 - 34128566
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcatagg 626  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34128655 tgttatatatcttgattgttgggaagagactgctgcacttgaaaccttaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagtgcatagg 34128566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 671 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34128542 - 34128458
Alignment:
Q  671 tgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgcacaaccacaccaa 755  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34128542 tgtatattggatgcaaaaggaatgaccagcaaatctccttcaggatactatgagtttcatgaggtgtattgcacaaccacaccaa 34128458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37079008 - 37078940
Alignment:
Q  130 aagattctaaattttcacacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaa 198  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37079008 aagattcttaactttaacacccctcctcaagctgtagcatacatgacatataaaccaagcttgttacaa 37078940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 654 - 719
Target Start/End: Original strand, 23920292 - 23920357
Alignment:
Q  654 tcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatact 719  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23920292 tcgcccccaccaatatttgtatattggatgcaaacagaatgaccactgaatctccttcagaatact 23920357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 607 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 54859525 - 54859378
Alignment:
Q  607 taaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgt 706  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| |||  | || |||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||  |||       
T  54859525 taaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttatgttcaattcgtc-ccaccaataattgtatattggatgcaataggaattaccagcgaaacc 54859427  T
Q  707 ccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgcacaaccacaccaa 755  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  54859426 ccttcatgataatatgagttccttgatgtgtattacacaactacaccaa 54859378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 23908834 - 23908769
Alignment:
Q  654 tcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatact 719  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23908834 tcgcccccaccaatatttatatattggatgcaaatagaatgaccactgaatttccttcagaatact 23908769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30666595 - 30666554
Alignment:
Q  158 aagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaaa 199  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30666595 aagctggagcatgcatgttatatgcaccaagcttgttacaaa 30666554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 17720965 - 17720746
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  17720965 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacat 17720866  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17720865 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 17720766  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  17720765 tattgcacaaccacaccaag 17720746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 14917821 - 14917602
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  14917821 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 14917722  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14917721 taacctttaggttcgattcgcctccaccaataaatgtatattggatgcaatagaaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 14917622  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  14917621 tattgcacaaccacaccaag 14917602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 45120151 - 45120370
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  45120151 tgttatatatattgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 45120250  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45120251 taacctttaggttcgactcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 45120350  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  45120351 tattgcacaaccacaccaag 45120370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 542 - 755
Target Start/End: Original strand, 42779953 - 42780167
Alignment:
Q  542 tatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaata 641  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || || || ||||| |||      
T  42779953 tatatcttgtttgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcatatggggttaccacactaacc 42780052  T
Q  642 tataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcatt 740  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  42780053 tttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataacgaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtatt 42780152  T
Q  741 gcacaaccacaccaa 755  Q
    |||||||||||||||    
T  42780153 gcacaaccacaccaa 42780167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 551 - 756
Target Start/End: Original strand, 16284215 - 16284421
Alignment:
Q  551 attgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatataggttc 650  Q
    |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||   | |||||||    
T  16284215 attgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaccttttaggttc 16284314  T
Q  651 gagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtcc-ttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgcacaacca 749  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16284315 gattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcccctttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgtacaacca 16284414  T
Q  750 caccaag 756  Q
    |||||||    
T  16284415 caccaag 16284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 537 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 39196311 - 39196121
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  39196311 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggatgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 39196212  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttc 727  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  39196211 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttc 39196121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 537 - 635
Target Start/End: Original strand, 716126 - 716224
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccaca 635  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  716126 tgttgtatatcttgattgttgggaagatgttgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccaca 716224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 30283868 - 30283661
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||            ||| ||||||||| ||  | ||||||||     
T  30283868 tgttatatatcttgtttgttgggaaga-gctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaat-----------gaaaactcaaagcgtatgtggttgccacac 30283781  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30283780 taacctttaagttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 30283681  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  30283680 tattgcacaaccacaccaag 30283661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 281
Target Start/End: Original strand, 29393063 - 29393142
Alignment:
Q  202 tggccctgattttcgatcactttagcaattttctcagcaacaccgaaaccatcacctcgatgaagtgagttatcagtccc 281  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  29393063 tggccgtgattttcgatcacttcagcaatttgctcagcatcgcccaaactatcaactcgatgaactgagacatcagtccc 29393142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Original strand, 817075 - 817128
Alignment:
Q  146 acacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaaa 199  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  817075 acactcctcctcaagctgaagcatacatgtcatatgcaccaagcttgttacaaa 817128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 537 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31076841 - 31076623
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  31076841 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 31076742  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31076741 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 31076642  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaa 755  Q
     ||||||||||||||||||    
T  31076641 tattgcacaaccacaccaa 31076623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5458451 - 5458232
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  5458451 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 5458352  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5458351 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 5458252  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  5458251 tattgcacaaccacaccaag 5458232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5481927 - 5481708
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  5481927 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 5481828  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5481827 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 5481728  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  5481727 tattgcacaaccacaccaag 5481708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 8458076 - 8458295
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  8458076 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 8458175  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8458176 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 8458275  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  8458276 tattgcacaaccacaccaag 8458295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 1302684 - 1302465
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  1302684 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 1302585  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1302584 taacctttaggttcgatacgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 1302485  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  1302484 tattgcacaaccacaccaag 1302465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 4049572 - 4049791
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  4049572 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatatttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 4049671  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4049672 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 4049771  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4049772 tattgcacaaccacaccaag 4049791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 4054706 - 4054925
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  4054706 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctggaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 4054805  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4054806 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttaacgtg 4054905  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4054906 tattgcacaaccacaccaag 4054925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 8464515 - 8464734
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  8464515 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 8464614  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8464615 taacctttaggttcgattcgccccaaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 8464714  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  8464715 tattgcacaaccacaccaag 8464734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10591734 - 10591515
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  10591734 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 10591635  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10591634 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttcattgacgtg 10591535  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  10591534 tattgcacaaccacaccaag 10591515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10673377 - 10673158
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  10673377 tgttatatattttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 10673278  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10673277 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 10673178  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  10673177 tattgcacaaccacaccaag 10673158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10678492 - 10678273
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  10678492 tgttatatattttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 10678393  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10678392 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 10678293  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  10678292 tattgcacaaccacaccaag 10678273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31081946 - 31081728
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  31081946 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctaaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 31081847  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31081846 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 31081747  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaa 755  Q
     ||||||||||||||||||    
T  31081746 tattgcacaaccacaccaa 31081728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6853391 - 6853172
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  6853391 tgttatataactagtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 6853292  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6853291 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 6853192  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  6853191 tattgcacaaccacaccaag 6853172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10586621 - 10586402
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||     
T  10586621 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacac 10586522  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10586521 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 10586422  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  10586421 tattgcacaaccacgccaag 10586402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 33703039 - 33702820
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  33703039 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 33702940  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33702939 taacctttaggttcgattcgctcccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgactggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 33702840  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  33702839 tattgcacaaccacaccaag 33702820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6858494 - 6858275
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  6858494 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggatgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 6858395  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6858394 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcaaatccccttcaagatactatgagttccttgacgtg 6858295  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  6858294 tattgcacaaccacaccaag 6858275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 540 - 756
Target Start/End: Original strand, 33703068 - 33703283
Alignment:
Q  540 tatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaa 639  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  33703068 tatatatcttgtttgttggaaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaa 33703167  T
Q  640 tatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcat 739  Q
      | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  33703168 cctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaat-ccgttcaggatactatgagttccttgacgtgtat 33703266  T
Q  740 tgcacaaccacaccaag 756  Q
    |||||||||||||||||    
T  33703267 tgcacaaccacaccaag 33703283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 29827193 - 29827413
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccaca- 635  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||     
T  29827193 tgttgtatatcttgattgttggaaagatactgctgcacttaaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttaccacac 29827292  T
Q  636 ttaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
    | ||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||   ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29827293 taaacctttaggttcgattcgcctccaccaataattgtatattggatgcaataggagcgaccggcgaatccccttcaagatactatgagttccttgacgt 29827392  T
Q  736 gcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  29827393 gtattgcacaaccacaccaag 29827413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 547 - 752
Target Start/End: Original strand, 20890836 - 20891039
Alignment:
Q  547 cttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatatag 646  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||  | ||     
T  20890836 cttgattgttgggaagagactgctgcactttaaatctaaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaa 20890935  T
Q  647 gttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgcacaa 746  Q
    ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  20890936 gtttgattcgcg-ccaccaataactgtatattggatgcaatatgaatgactagtgaatccccttcag-atactatgagttccttgatgtgtattacacaa 20891033  T
Q  747 ccacac 752  Q
     |||||    
T  20891034 tcacac 20891039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 34531293 - 34531322
Alignment:
Q  8 ccaataatatcatttgacttttctacaatt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34531293 ccaataatatcatttgacttttctacaatt 34531322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 536 - 756
Target Start/End: Original strand, 21275537 - 21275757
Alignment:
Q  536 ctgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccaca 635  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  21275537 ctgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccaca 21275636  T
Q  636 ttaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
     |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21275637 ctaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 21275736  T
Q  736 gcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21275737 gtattgcacaaccacaccaag 21275757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24509267 - 24509048
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |     
T  24509267 tgttatatatcttgattgttgggaagaggctgctgcacttgaaacttcaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaaacgcatggggttgccatac 24509168  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |   ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24509167 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataggaatgatcggcgaatccccttcataatactatgagttccttgacgtg 24509068  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24509067 tattgcacaaccacaccaag 24509048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 20752556 - 20752338
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |     
T  20752556 tgttatatatcttgtttgttggga-gaggctgttgcacttgaaacctgaaatgtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgccatac 20752458  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20752457 taacctttaggttcgattcgcccccacaaataactgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactacgagttccttgacgtg 20752358  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  20752357 tattgcacaaccacaccaag 20752338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 531 - 754
Target Start/End: Original strand, 24509462 - 24509685
Alignment:
Q  531 aaatactgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattg 630  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |||    
T  24509462 aaatattgttgtatatcttgattgttgggaagaggttgttgcacttgaaaccttaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaatcgcatggggttg 24509561  T
Q  631 ccacattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttcctt 730  Q
    ||| | |||  | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |   ||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  24509562 ccatactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataggaatgatcggcgaatccccttcataatactatgagttcctt 24509661  T
Q  731 gacgtgcattgcacaaccacacca 754  Q
    || ||| |||||||||||||||||    
T  24509662 gatgtgtattgcacaaccacacca 24509685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 542 - 756
Target Start/End: Original strand, 21937340 - 21937554
Alignment:
Q  542 tatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaata 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| || || ||| | |||      
T  21937340 tatatcttgattgttgggaagagactgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatggtaatgcatataaaactcaaagcgcatggggtttccatactaacc 21937439  T
Q  642 tataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattg 741  Q
    | |||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||   ||||  |||| || |||||||||||||||||  ||| ||||    
T  21937440 tttaggctcgattcgcccccaccaataaccatatattggatgcaataggaatgaccggcgaatcccctttaggatactatgagttccttgttgtgtattg 21937539  T
Q  742 cacaaccacaccaag 756  Q
    |||||||||||||||    
T  21937540 cacaaccacaccaag 21937554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 530 - 755
Target Start/End: Original strand, 2887252 - 2887473
Alignment:
Q  530 taaatactgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggatt 629  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||  |||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||    
T  2887252 taaatattgttgtatatcttgattgttgaaaagaagttgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaactcaaagcgcatggggtt 2887351  T
Q  630 gccacattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttcc 728  Q
    | |||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||     | |||||||||||| || |||||||| | ||||   |||||  ||||||||| ||||    
T  2887352 gtcacactaacatttaggttcgattcgcccccaccaat-----tttattggatgcaataaggaatgaccgacgaatcctcttcacgatactatgaattcc 2887446  T
Q  729 ttgacgtgcattgcacaaccacaccaa 755  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
T  2887447 ttcacgtgtattgcacaaccacaccaa 2887473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 21937119 - 21936905
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| |     
T  21937119 tgttttatatcttgattgttgggaacaggttgctgcacttgaaactcgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagtgcatagggtttccatac 21937020  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | |||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||  |   ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  21937019 taacctttaggctcgattcgtccccaccaataattgtatattagatgcaataggaatggtcggagaatccccttcagaatactatgagttccttgatgtg 21936920  T
Q  737 cattgcacaaccaca 751  Q
     ||||||||||||||    
T  21936919 tattgcacaaccaca 21936905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 530 - 755
Target Start/End: Original strand, 2888974 - 2889195
Alignment:
Q  530 taaatactgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggatt 629  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||  |||| | || || |||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||    
T  2888974 taaatattgttgtatatcttgattgttgaaaagaagttgctgcacttgaaatctggaaagtttaatggttatgaatgtaaaactcaaagcgcatggggtt 2889073  T
Q  630 gccacattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttcc 728  Q
    | |||| ||| || ||||||||| ||||| ||||||||     | |||||||||||| || ||||||||   ||||   |||||  ||||||||| ||||    
T  2889074 gtcacactaacatttaggttcgattcgcccccaccaat-----tttattggatgcaataaggaatgaccggcgaatcctcttcacgatactatgaattcc 2889168  T
Q  729 ttgacgtgcattgcacaaccacaccaa 755  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
T  2889169 ttcacgtgtattgcacaaccacaccaa 2889195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 547 - 675
Target Start/End: Original strand, 12909404 - 12909532
Alignment:
Q  547 cttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatatag 646  Q
    |||||||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  | |||    
T  12909404 cttgattgttgggaagaggcggctgcacttaaaacctgaaaaaattaatcgttatgcatgtaaacttcaaagcgcatggggttgccacactaacctttag 12909503  T
Q  647 gttcgagtcgccaccaccaataactgtat 675  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12909504 gttcgattcgcccccaccaataacggtat 12909532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 547 - 675
Target Start/End: Original strand, 12934511 - 12934639
Alignment:
Q  547 cttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatatag 646  Q
    |||||||| ||||||||||| | || |||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  | ||     
T  12934511 cttgattgttgggaagaggcggctgcacttaaaacctgaaaaaattaatcattatgcatgtaaacttcaaagcgcatggggttgccacactaacctttat 12934610  T
Q  647 gttcgagtcgccaccaccaataactgtat 675  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12934611 gttcgattcgcccccaccaataacggtat 12934639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Original strand, 20592056 - 20592109
Alignment:
Q  146 acacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaaa 199  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20592056 acactcctcctcaagctggagcatacatgtcatatgcaccaagcttgttacaaa 20592109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19314560 - 19314507
Alignment:
Q  146 acacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaaa 199  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||    
T  19314560 acactcctcctcaagctggagcatacttgtcatatgcaccaagcttgtaacaaa 19314507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 558 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 26910769 - 26910704
Alignment:
Q  558 ggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcat 623  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||||| ||||    
T  26910769 ggaagaggttgttgcacttgaaacctgaaaagattaaggattatgcatgtaaaattcaaagtgcat 26910704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 26982315 - 26982096
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  26982315 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 26982216  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26982215 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 26982116  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  26982115 tattgcacaaccacaccaag 26982096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 34107994 - 34108213
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||  |||||||| || || ||||||||     
T  34107994 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaaatcaaagcgtatggggttgccacac 34108093  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34108094 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 34108193  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  34108194 tattgcacaaccacaccaag 34108213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 14319054 - 14318835
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  14319054 tgttatatattttatttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 14318955  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14318954 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 14318855  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  14318854 tattgcacaaccacaccaag 14318835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 540 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18609064 - 18608848
Alignment:
Q  540 tatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaa 639  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||    
T  18609064 tatataacttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttgatggttatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgccacactaa 18608965  T
Q  640 tatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcat 739  Q
      | ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| | |||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||    
T  18608964 cctttaggttcaattcgcccccaccaataattgtatattggatgaaataggaatgaccagtaaatccccttcaggataatatgagttccttgatgtgtat 18608865  T
Q  740 tgcacaaccacaccaag 756  Q
    |||||||||||||||||    
T  18608864 tgcacaaccacaccaag 18608848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 14315350 - 14315131
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  14315350 tgttatatattttgtttgttgggaagaagctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 14315251  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14315250 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaatagaaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 14315151  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  14315150 tattgcacaaccacaccaag 14315131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 26987428 - 26987209
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||     
T  26987428 tgttatatatcttgtttgtagggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaacttaaagcgtatgtggttgccacac 26987329  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26987328 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 26987229  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  26987228 tattgcacaaccacaccaag 26987209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 537 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25953598 - 25953382
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||     
T  25953598 tgttgtatatcttaattgttgggaagagactactgcacttgaaacctgaaaagtttgatggttaagcatgtaaaactcaaagtgcatggggttgccacac 25953499  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | || || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25953498 taacctttaagtacgattcgcccccaccaataactgtataatggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcagggtactatgagttccttgacgtg 25953399  T
Q  737 cattgcacaaccacacc 753  Q
     ||||||||||||||||    
T  25953398 tattgcacaaccacacc 25953382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 545 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 43957280 - 43957069
Alignment:
Q  545 atcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatat 644  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||  |||||||| || || ||| |||| |||  | |    
T  43957280 atcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacactaaccttt 43957181  T
Q  645 aggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgcac 744  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||    
T  43957180 aggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggattctatgagttctttgacgtgtattgcac 43957081  T
Q  745 aaccacaccaag 756  Q
    ||||||||||||    
T  43957080 aaccacaccaag 43957069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 543 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10341389 - 10341177
Alignment:
Q  543 atatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatat 642  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  || | ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |    
T  10341389 atatcttgattgttgggaagatgctactgcatttgaaacttgaaaagttcaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgccatactaacct 10341290  T
Q  643 ataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgc 742  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |   ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10341289 -taggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagtgatcggcgaatccccttcatgatactatgagttccttgacgtgtattgc 10341191  T
Q  743 acaaccacaccaag 756  Q
    ||||| ||||||||    
T  10341190 acaactacaccaag 10341177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 536 - 756
Target Start/End: Original strand, 18884828 - 18885048
Alignment:
Q  536 ctgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccaca 635  Q
    ||||||||||||||||||| | | || ||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||| |||||| || || || ||||||||    
T  18884828 ctgttatatatcttgattgtttgaaaaaggatgttgcacttggaatctgaaaagtttaacggttatgcacataaaactcaaaacgtatggggttgccaca 18884927  T
Q  636 ttaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
     ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||   ||||||||| ||||   ||||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  18884928 ctaacatttaggttcgattcgcccccaccaattactgtagattggattcaatgggaatgaccagtgaacccccttcaggatactttaagttccttgatgt 18885027  T
Q  736 gcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    | ||||||||| |||||||||    
T  18885028 gtattgcacaatcacaccaag 18885048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8472686 - 8472618
Alignment:
Q  130 aagattctaaattttcacacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaa 198  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8472686 aagattcttaactttaacacccctcctcaagctggagcatacatgacatatgcaccaagcttgttacaa 8472618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32593531 - 32593464
Alignment:
Q  131 agattctaaattttcacacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaa 198  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32593531 agattcttaattttaacacctctcctcaagctggaacatgcatgacatgtgcaccaagcttgttacaa 32593464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Original strand, 541761 - 541825
Alignment:
Q  134 ttctaaattttcacacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaa 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  541761 ttcttaattttaacacccctcctcaagctggagcatatctgacataagcaccaagcttgttacaa 541825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 18347139 - 18347168
Alignment:
Q  8 ccaataatatcatttgacttttctacaatt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18347139 ccaataatatcatttgacttttctacaatt 18347168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 12856554 - 12856773
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  12856554 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 12856653  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12856654 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 12856753  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  12856754 tattgcacaaccacaccaag 12856773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 14610129 - 14610348
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  14610129 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 14610228  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14610229 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatccccttcaggatactatgagtttcttgacgtg 14610328  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  14610329 tattgcacaaccacaccaag 14610348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 26050786 - 26051005
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  26050786 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 26050885  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26050886 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 26050985  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  26050986 tattgcacaaccacaccaag 26051005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 26060145 - 26060364
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  26060145 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 26060244  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26060245 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 26060344  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  26060345 tattgcacaaccacaccaag 26060364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 26055899 - 26056118
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||     
T  26055899 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacac 26055998  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26055999 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 26056098  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  26056099 tattgcacaaccacaccaag 26056118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 26065258 - 26065477
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||     
T  26065258 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacac 26065357  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26065358 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 26065457  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  26065458 tattgcacaaccacaccaag 26065477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 12851439 - 12851658
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  12851439 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaaactgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 12851538  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12851539 taacctttaggttcgattcgaacacaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 12851638  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  12851639 tattgcacaaccacaccaag 12851658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 537 - 755
Target Start/End: Original strand, 11056390 - 11056608
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||     
T  11056390 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggttgctgcacttgaaacatgaaatgtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacac 11056489  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | || ||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11056490 taacctttatgtgtgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaatatgaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 11056589  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaa 755  Q
      |||||||| ||||||||    
T  11056590 tgttgcacaatcacaccaa 11056608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 35352730 - 35352511
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |  || ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || || |||||     
T  35352730 tgttatataacttgattgatgggaagaggttcctgcacttgaaacatggaaagtttaatggttaagcatgtaaaactcaaagcgcatggggttaccacac 35352631  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  ||||   |||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  35352630 taacctttaggttcaattcgcccccaccaataattgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcctcttcaggatactatgagttccatgatgtg 35352531  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  35352530 tattgcacaaccacatcaag 35352511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5436969 - 5436750
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |     
T  5436969 tgttgtatatcttgatcgttgggaagatgctgctgcacttgaaacttgaaaaatctaatggttatgcatgtaaa-ctcaaagcgcatggggttgccatac 5436871  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
     ||  | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||  |||| || |||||||||| ||||||||||    
T  5436870 caacctttaggttcgatttgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaattcccttgaggatactatgaggtccttgacgt 5436771  T
Q  736 gcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  5436770 gtattgcacaaccacaccaag 5436750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 37460279 - 37460061
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || ||||||||  || || ||| |     
T  37460279 tgttatataacttgattgctggaaagagactgttggacttgaaacctgaaatttttaatgattatgcatgtaaaacttaaagcgcacggg-ttcccatac 37460181  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  ||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  37460180 taacctatagcttcaattcacccccaccaataactgtatattggatgcaataagaatgaccgatgaatccacttcatgatactatgagttccttgatgtg 37460081  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  37460080 tattgcacaaccacatcaag 37460061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 537 - 697
Target Start/End: Original strand, 14615195 - 14615355
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || || |||||     
T  14615195 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggtttccacac 14615294  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgacc 697  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  14615295 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgacc 14615355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 4181820 - 4181601
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| || || ||| ||||     
T  4181820 tgttatataacttgattgttagaaagaggttgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgtatgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacac 4181721  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  4181720 taacctttaggttcgattcttccccaccaataactctatattggatgcaattggaatgaccagagaatccccttcatgatactatgagttccttgacatg 4181621  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  4181620 tattgcacaaccacatcaag 4181601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1012308 - 1012240
Alignment:
Q  130 aagattctaaattttcacacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaa 198  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1012308 aagattcttaactttaacacccctcctcaagctggagcatacatgacatatgcaccaagcttgttacaa 1012240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 321954 - 321888
Alignment:
Q  130 aagattctaaattttcacacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaa 198  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  321954 aagattcttaattttaacatccctcctcaagctgaagcatacatgacat--gcaccaagcttgttacaa 321888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 39908723 - 39908942
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  39908723 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 39908822  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39908823 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 39908922  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  39908923 tattgcacaaccacaccaag 39908942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9872863 - 9872644
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||| | || || ||||||||     
T  9872863 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagtgtatggggttgccacac 9872764  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9872763 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 9872664  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  9872663 tattgcacaaccacaccaag 9872644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9877978 - 9877759
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||| | || || ||||||||     
T  9877978 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagtgtatggggttgccacac 9877879  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9877878 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 9877779  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  9877778 tattgcacaaccacaccaag 9877759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 535 - 756
Target Start/End: Original strand, 39903608 - 39903829
Alignment:
Q  535 actgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccac 634  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  39903608 actgttatatatcttgtttgttggaaagaggctgctgcacttgaaacccgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccac 39903707  T
Q  635 attaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacg 734  Q
    | |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39903708 actaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacg 39903807  T
Q  735 tgcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  39903808 tgtattgcacaaccacaccaag 39903829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 544 - 756
Target Start/End: Original strand, 2022735 - 2022948
Alignment:
Q  544 tatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatata 643  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | |||||| | |||  |     
T  2022735 tatcttgattgttgtaaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggttgccatactaacctt 2022834  T
Q  644 taggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgc 742  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2022835 taggttccattcgcccccaccaataactgtatatttgatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgc 2022934  T
Q  743 acaaccacaccaag 756  Q
    ||||||| ||||||    
T  2022935 acaaccaaaccaag 2022948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 13556744 - 13556525
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  13556744 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggttactgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 13556645  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | | || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | | ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13556644 taaccttttggctcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgatcgacgaatcccctttaggatactatgagttccttgacgtg 13556545  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  13556544 tattgcacaaccacaccaag 13556525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 537 - 751
Target Start/End: Original strand, 43378202 - 43378416
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||     
T  43378202 tgttgtatatcttgattgttgggaagaagttgctgcacttgaaacttgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcacac 43378301  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    ||| || ||||||||| |  || |||||||||| |||||||| |||||||   ||||||| | |||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  43378302 taacatttaggttcgatttacccccaccaataattgtatatttgatgcaattggaatgacaagtgaatccccttcaggatattattagttccttgacgtg 43378401  T
Q  737 cattgcacaaccaca 751  Q
     ||||||||| ||||    
T  43378402 tattgcacaatcaca 43378416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 35369341 - 35369111
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcata---ggattgcca 633  Q
    |||| ||||||||||||| |   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||    
T  35369341 tgttgtatatcttgattgtt---aagagactgctgcacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcatatgggggttgcca 35369245  T
Q  634 cattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataac-----------tgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatg 722  Q
    || |||| | ||||||||| ||||  |||||||||||           |||||||||||||||| | |||||||||  ||||  || |||| ||||||||    
T  35369244 cactaatctttaggttcgattcgcacccaccaataactgtatattggatgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatccccctcaggatactatg 35369145  T
Q  723 agttccttgacgtgcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35369144 agttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaag 35369111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 25183859 - 25184082
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcatagga----ttgcc 632  Q
    |||||| ||| ||| ||| | ||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||     |||||    
T  25183859 tgttatttatattgtttgttcggaagaggcttctgcacttgaaacctgaaatctttaatgattatgcatgtaaaactgaaagcgcatgggccgggttgcc 25183958  T
Q  633 acattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttga 732  Q
    ||| ||   | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25183959 acactatcctttaggttcgattctcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttga 25184058  T
Q  733 cgtgcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    |||  |||||||||||| ||||||    
T  25184059 cgtttattgcacaaccataccaag 25184082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4446397 - 4446332
Alignment:
Q  133 attctaaattttcacacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaa 198  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4446397 attcttaactttaacacccctcctcaagctggagcatacatgacatatgcaccaagcttgttacaa 4446332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 662 - 699
Target Start/End: Original strand, 4555543 - 4555580
Alignment:
Q  662 accaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaa 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4555543 accaataactgtatattggatgcaataggaatgaccaa 4555580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Original strand, 22160471 - 22160524
Alignment:
Q  146 acacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaaa 199  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22160471 acactcctcctcaagctgaagcatacatgtcatatacaccaagcttgttacaaa 22160524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 28598074 - 28598293
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  28598074 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 28598173  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28598174 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 28598273  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  28598274 tattgcacaaccacaccaag 28598293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 537 - 755
Target Start/End: Original strand, 43358516 - 43358736
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||     
T  43358516 tgttgtatatcttgattgttgggaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggttgccacac 43358615  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatac--tatgagttccttgacg 734  Q
    ||| || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  43358616 taacatttaggttcgatttgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagtgaccggcgaatccccttcagaatactatatgagttccttgacg 43358715  T
Q  735 tgcattgcacaaccacaccaa 755  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  43358716 tgtattgcacaaccacaccaa 43358736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 28574062 - 28574281
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| || |||||| || || ||||||||     
T  28574062 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaacttaaagcgtatggggttgccacac 28574161  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28574162 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 28574261  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  28574262 tattgcacaaccacaccaag 28574281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 13654100 - 13654319
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||     
T  13654100 tgttagatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgcttacgcatgtaaaattcaaagcgcatggggttgccacac 13654199  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13654200 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 13654299  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  13654300 tattgcacaaccacaccaag 13654319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 540 - 756
Target Start/End: Original strand, 16050974 - 16051190
Alignment:
Q  540 tatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaa 639  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||| |||    
T  16050974 tatataacttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaaatttaatggttatgcatgtaaaactcagagcgcacggggttgccacactaa 16051073  T
Q  640 tatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcat 739  Q
      | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  16051074 cctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatatttgatgcaaaatgaatgactagcgaatacccttcaagatactatgagttccttgatgtgtat 16051173  T
Q  740 tgcacaaccacaccaag 756  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16051174 tgcacagccacaccaag 16051190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 537 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 44524457 - 44524244
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||     
T  44524457 tgttgtatatcttgattgttgggaagatgctgctgcacttgaaacctgaaaagtgtaatggttatgcatgcaaaactcaaagcgcatggggttgtcacac 44524358  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    ||| || || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | | ||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  44524357 taacattta-gttcgattcgcccccatcaataactgtatattggatgcaataggaatgatcgacgaatccccttcggaatactatgagttccttgatgtg 44524259  T
Q  737 cattgcacaaccaca 751  Q
     ||||||||||||||    
T  44524258 tattgcacaaccaca 44524244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 560 - 756
Target Start/End: Original strand, 19310613 - 19310808
Alignment:
Q  560 aagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatataggttcgagtcgcca 659  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || |||| ||| |||  | ||||||||| || ||     
T  19310613 aagaggctgttgtacttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtgaaactcaaagcgcatggggttgcaacactaacctttaggttcgattcaccc 19310712  T
Q  660 ccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||  |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19310713 ccaccaataactctatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcccctt-agtatattatgagttccttgacgtgtattgcacaaccgcaccaag 19310808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 542 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10187010 - 10186804
Alignment:
Q  542 tatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaata 641  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||      
T  10187010 tatatcttgatttttgagaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaagtttaatgattatacatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacc 10186911  T
Q  642 tataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattg 741  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||||  |||      |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10186910 tttaggttcgattcgcccccaccaataattgtatattggatgcaatagaaatgaccagtgaa--tcc-----gatactatgagttccttgacgtgtattg 10186818  T
Q  742 cacaaccacaccaa 755  Q
    ||||||||||||||    
T  10186817 cacaaccacaccaa 10186804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 540 - 756
Target Start/End: Original strand, 1187595 - 1187812
Alignment:
Q  540 tatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacct-gaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacatta 638  Q
    |||||| ||| |||| ||| || || ||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||    
T  1187595 tatataactttattgttggaaatagactgctgcacttgaaacctagaaaaatttaatagttatgcatgtaaaactcaaagtgcatggggttgccacacta 1187694  T
Q  639 atatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgca 738  Q
    |  | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| |    
T  1187695 acctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggaaagaccagcgaatctccttcatgatactatgagttccttgatgtgta 1187794  T
Q  739 ttgcacaaccacaccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1187795 ttgcacaaccacaccaag 1187812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 3465244 - 3465457
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||      ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  3465244 tgttatatatcttatttgttgggaagaggc------acttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 3465337  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3465338 taacctttaggttcgattcgtccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 3465437  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  3465438 tattgcacaaccacaccaag 3465457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 48366490 - 48366271
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |     
T  48366490 tgttgtatatcttgatcgttgggaagatgttgttgcacttgaaacctgaaaaatctaatggttatgcatgtaaa-ctcaaagcgcatggggttgccatac 48366392  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
     ||  | ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||   ||||  |||| || |||||||||| ||||||||||    
T  48366391 caacctttaggttcgatttgcccccaccaataattgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttgaggatactatgaggtccttgacgt 48366292  T
Q  736 gcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  48366291 gtattgcacaaccacaccaag 48366271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 29681356 - 29681574
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |     
T  29681356 tgttgtatatcttgatcgttgggaagatgctgttgcacttgaaacctgaaaaatctaatggttatgcatgtaaa-ctcaaagcgcatggggttgccatac 29681454  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
     ||  | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    |||  | || || |||||||||| ||||||||||    
T  29681455 caacctttaggttcgatttgcc-ccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatgaccggcaaatccctttgaggatactatgaggtccttgacgt 29681553  T
Q  736 gcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  29681554 gtattgcacaaccacaccaag 29681574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 537 - 732
Target Start/End: Original strand, 35624782 - 35624977
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||||| |||  || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||| || |     
T  35624782 tgttgtatattttgattgttcggaagatgctactgcacttgaaacatgaaaaatttaatggttatgcatgtaaaactcaaagcgcgtggggttgtcatac 35624881  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttga 732  Q
    |||  | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35624882 taacctttaggttcgattcgcccccaccaacaactgtatattggatgcaataggagtgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttga 35624977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 573 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 21432069 - 21431918
Alignment:
Q  573 acttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacattaatatataggttcgagtcgccaccaccaataactg 672  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| |||  | ||| ||||| || || ||||||||||||     
T  21432069 acttgaaacctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaactcaaatcgcatgaggttgccacactaacttttagattcgattcacccccaccaataacta 21431970  T
Q  673 tatattggatgcaa-aacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatga 723  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||  |||||  ||||| | |||||||||    
T  21431969 tatattgtttgcaataaggaatgaccggtgaatccccttctggatactatga 21431918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 537 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 17415624 - 17415406
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||  |||| ||  | ||||||||||| |||||||| |||||  |||||| | || || ||| ||||     
T  17415624 tgttaaataacttgattgttgagaagaggttgttgcgcttgcaatgtaaaaagtttaatggttatgcacgtaaaaatcaaagtgtatggggttgtcacac 17415525  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    ||| || ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||   |||   |||||| ||||||| |||| ||||| |||    
T  17415524 taacatttaggttcgatttgcccccaccaataattgtatattggatgaaataggaatgaccatcaaatcctcttcaggatactattagtttcttgatgtg 17415425  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaa 755  Q
     |||||| || ||||||||    
T  17415424 tattgcataatcacaccaa 17415406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 715 - 756
Target Start/End: Original strand, 3468010 - 3468051
Alignment:
Q  715 atactatgagttccttgacgtgcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3468010 atactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaag 3468051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Original strand, 47065085 - 47065138
Alignment:
Q  146 acacccctcctgaagctggagcattcatgacatatgcaccaagcttgttacaaa 199  Q
    |||||| |||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47065085 acacccttcctcaagctggggtatacatgtcatatgcaccaagcttgttacaaa 47065138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 143861 - 144080
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||     
T  143861 tgttagatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgcttacgcatgtaaaattcaaagcgcatggggttgccacac 143960  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    |||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  143961 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtg 144060  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||||||||||||||||    
T  144061 tattgcacaaccacaccaag 144080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 537 - 735
Target Start/End: Original strand, 16372 - 16570
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  16372 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 16471  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgt 735  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16472 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgt 16570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 537 - 629
Target Start/End: Original strand, 16277 - 16369
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggatt 629  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  16277 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatgggatt 16369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 537 - 756
Target Start/End: Original strand, 170583 - 170802
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| || || |||||     
T  170583 tgttatatatcttgattgttaggatgaagctgctgcacttgaaatctgaaaagtttaatggttatgcatgtaaaacttaaagctcatggggtttccacac 170682  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtg 736  Q
    | |  | ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||  |||| || |||||||||||||||| | |||    
T  170683 tgacctttaggttcgatttgcccccactaataactgtatattggatgcaataggaatgacccgcgaatcccctttaggatactatgagttccttaatgtg 170782  T
Q  737 cattgcacaaccacaccaag 756  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  170783 tattgcagaaccacaccaag 170802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 537 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7256
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccacat 636  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||  ||  ||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||     
T  7416 tgttatatatcttgtttgttgggaagaggctgctgcacttgaaatctttaatttttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacac 7317  T
Q  637 taatatataggttcgagtcgccaccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgacc 697  Q
    |||  | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  7316 taacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgacc 7256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 660 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 2335 - 2239
Alignment:
Q  660 ccaccaataactgtatattggatgcaaaacgaatgaccaatgaatgtccttcagcatactatgagttccttgacgtgcattgcacaaccacaccaag 756  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2335 ccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaag 2239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0756 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0756
Description:

Target: scaffold0756; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 537 - 635
Target Start/End: Original strand, 3910 - 4008
Alignment:
Q  537 tgttatatatcttgattgctgggaagaggctgttgaacttgaaacctgaaaagtttaattgttatgcatgtaaatctcaaagcgcataggattgccaca 635  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  3910 tgttatatatcttgtttgttgagaagaggctgctgcacttgaaacctgaaatgtttaatgatcatgcatgtaaaactcaaagcgtatggggttgccaca 4008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University