View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2922_high_2 (Length: 640)

Name: NF2922_high_2
Description: NF2922
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2922_high_2
NF2922_high_2
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (259-622)||(46693586-46693950)
chr1 (259-622)||(35759459-35759821)
chr1 (257-555)||(20054385-20054683)
chr1 (257-555)||(20054841-20055139)
chr1 (257-555)||(20055297-20055595)
chr1 (257-555)||(20055753-20056051)
chr1 (257-555)||(20056209-20056507)
chr1 (257-555)||(20057112-20057410)
chr1 (258-555)||(20053930-20054227)
chr1 (257-556)||(20057568-20057867)
chr1 (257-555)||(50002556-50002854)
chr1 (259-555)||(16451784-16452080)
chr1 (259-555)||(16460937-16461233)
chr1 (259-555)||(20845512-20845808)
chr1 (259-555)||(38340905-38341201)
chr1 (259-555)||(52250205-52250501)
chr1 (257-518)||(20056665-20056926)
chr1 (257-555)||(50002924-50003222)
chr1 (259-498)||(20060191-20060431)
chr1 (339-622)||(35760845-35761127)
chr1 (257-555)||(43056914-43057211)
chr1 (266-544)||(51372732-51373010)
chr1 (259-455)||(52250641-52250838)
chr1 (259-455)||(52250978-52251175)
chr1 (404-623)||(20061188-20061405)
chr1 (257-555)||(43057372-43057670)
chr1 (368-555)||(50002246-50002432)
chr1 (289-623)||(23180663-23180995)
chr1 (405-623)||(2328247-2328463)
chr1 (368-571)||(2634909-2635109)
chr1 (261-555)||(12883523-12883815)
chr1 (325-554)||(31822577-31822809)
chr1 (285-555)||(30872824-30873097)
chr1 (259-503)||(16907284-16907530)
chr1 (388-503)||(12728041-12728157)
chr1 (86-256)||(51093412-51093577)
chr1 (355-556)||(7548089-7548289)
chr1 (290-555)||(2634464-2634730)
chr1 (259-429)||(35009859-35010018)
chr1 (257-471)||(7229792-7230007)
chr1 (257-348)||(35759913-35760004)
chr1 (389-555)||(10820591-10820758)
chr1 (257-381)||(31822968-31823093)
chr1 (375-503)||(16440547-16440675)
chr1 (284-399)||(7547791-7547907)
chr1 (10-78)||(51080672-51080740)
chr1 (258-544)||(16410573-16410859)
chr1 (257-445)||(8278065-8278247)
chr1 (257-342)||(39582553-39582638)
chr1 (379-543)||(842905-843068)
chr1 (258-341)||(49996530-49996613)
chr1 (420-484)||(31823097-31823161)
chr1 (367-519)||(2739557-2739708)
chr1 (265-333)||(28181350-28181418)
chr1 (446-484)||(46411173-46411211)
chr1 (259-296)||(12728210-12728247)
chr1 (258-347)||(16440429-16440518)
chr1 (374-430)||(35168630-35168686)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (258-623)||(9124891-9125255)
chr7 (259-621)||(2941608-2941969)
chr7 (267-623)||(13124994-13125350)
chr7 (257-623)||(42515024-42515389)
chr7 (259-555)||(34405442-34405738)
chr7 (257-555)||(36422251-36422548)
chr7 (259-555)||(28495853-28496149)
chr7 (257-623)||(18833218-18833583)
chr7 (257-555)||(2193255-2193553)
chr7 (277-555)||(42515543-42515821)
chr7 (260-555)||(2189143-2189438)
chr7 (259-555)||(6718926-6719221)
chr7 (259-555)||(28495470-28495755)
chr7 (259-521)||(2465957-2466218)
chr7 (259-457)||(7646329-7646528)
chr7 (259-556)||(679815-680111)
chr7 (404-623)||(11517386-11517602)
chr7 (259-556)||(2611510-2611800)
chr7 (258-555)||(35473971-35474268)
chr7 (256-555)||(29038868-29039167)
chr7 (304-623)||(5406483-5406801)
chr7 (257-454)||(7646514-7646712)
chr7 (267-469)||(13122363-13122567)
chr7 (259-556)||(6747457-6747746)
chr7 (259-555)||(22529086-22529382)
chr7 (334-503)||(2465783-2465953)
chr7 (259-621)||(25182296-25182656)
chr7 (365-555)||(46425740-46425929)
chr7 (293-544)||(29357341-29357592)
chr7 (300-439)||(43776182-43776322)
chr7 (356-555)||(35527070-35527268)
chr7 (278-552)||(11372453-11372719)
chr7 (463-623)||(13124757-13124915)
chr7 (258-503)||(26421610-26421856)
chr7 (261-612)||(31406440-31406787)
chr7 (257-436)||(3305197-3305377)
chr7 (302-488)||(9623273-9623459)
chr7 (389-552)||(26421287-26421449)
chr7 (432-555)||(43233412-43233534)
chr7 (369-550)||(20966055-20966235)
chr7 (257-373)||(43233137-43233254)
chr7 (367-503)||(1628766-1628899)
chr7 (400-554)||(36015404-36015557)
chr7 (257-379)||(6747925-6748047)
chr7 (417-503)||(31743834-31743920)
chr7 (453-555)||(26957603-26957704)
chr7 (400-499)||(16192373-16192472)
chr7 (259-345)||(36422591-36422677)
chr7 (255-346)||(31743736-31743827)
chr7 (277-341)||(26419104-26419168)
chr7 (381-492)||(37672221-37672332)
chr7 (400-481)||(7461344-7461424)
chr7 (374-552)||(11372901-11373074)
chr7 (469-555)||(3305374-3305459)
chr7 (258-315)||(43776324-43776381)
chr7 (259-487)||(37671614-37671836)
chr7 (391-503)||(33316778-33316885)
chr7 (375-499)||(6585662-6585787)
chr7 (284-345)||(7461258-7461319)
chr7 (257-346)||(36015318-36015407)
chr7 (456-499)||(2490093-2490136)
chr7 (461-503)||(16811900-16811942)
chr7 (276-346)||(33316909-33316979)
chr7 (261-310)||(26957545-26957594)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (258-623)||(30966622-30966986)
chr2 (261-623)||(30966166-30966527)
chr2 (259-623)||(24818258-24818620)
chr2 (258-623)||(5399667-5400031)
chr2 (258-556)||(25337847-25338145)
chr2 (300-623)||(29259512-29259834)
chr2 (259-555)||(33174957-33175251)
chr2 (257-555)||(16379392-16379690)
chr2 (259-518)||(33771037-33771296)
chr2 (258-556)||(1912523-1912820)
chr2 (304-546)||(8256534-8256776)
chr2 (257-553)||(16378938-16379234)
chr2 (322-556)||(41754287-41754521)
chr2 (259-555)||(25433907-25434203)
chr2 (257-555)||(33174504-33174799)
chr2 (365-555)||(29804681-29804870)
chr2 (355-555)||(11388188-11388385)
chr2 (259-555)||(1707041-1707336)
chr2 (267-447)||(32377575-32377756)
chr2 (259-623)||(82952-83312)
chr2 (259-500)||(15639787-15640029)
chr2 (257-421)||(32377756-32377921)
chr2 (270-623)||(30961745-30962104)
chr2 (258-499)||(30963113-30963355)
chr2 (261-555)||(15619897-15620195)
chr2 (355-503)||(11394585-11394731)
chr2 (403-555)||(18098874-18099025)
chr2 (257-555)||(27882779-27883073)
chr2 (258-503)||(30963568-30963816)
chr2 (362-554)||(38898867-38899058)
chr2 (257-503)||(13191024-13191271)
chr2 (261-544)||(8073902-8074185)
chr2 (367-612)||(1953100-1953341)
chr2 (259-519)||(8181212-8181462)
chr2 (399-552)||(20502023-20502176)
chr2 (375-503)||(16542035-16542164)
chr2 (443-555)||(18447954-18448065)
chr2 (259-488)||(37552632-37552860)
chr2 (260-346)||(20502172-20502258)
chr2 (258-330)||(29804871-29804943)
chr2 (10-78)||(40287017-40287085)
chr2 (438-502)||(36924453-36924519)
chr2 (266-344)||(11389693-11389771)
chr2 (266-344)||(11406354-11406432)
chr2 (289-347)||(36924362-36924420)
chr2 (431-544)||(9909102-9909214)
chr2 (289-429)||(18875866-18876007)
chr2 (381-496)||(26864791-26864905)
chr2 (257-334)||(1952921-1952998)
chr2 (260-339)||(38898777-38898856)
chr2 (276-344)||(26865121-26865189)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (259-623)||(31284127-31284490)
chr3 (259-619)||(8067216-8067575)
chr3 (239-555)||(16811380-16811694)
chr3 (267-621)||(27187188-27187542)
chr3 (257-556)||(39653162-39653461)
chr3 (261-546)||(11179887-11180172)
chr3 (259-556)||(28561744-28562040)
chr3 (257-503)||(13150403-13150650)
chr3 (259-555)||(32227072-32227368)
chr3 (259-555)||(50347745-50348041)
chr3 (262-555)||(13149953-13150246)
chr3 (259-555)||(32227500-32227795)
chr3 (257-555)||(14813948-14814246)
chr3 (258-620)||(25248046-25248408)
chr3 (257-555)||(16810924-16811222)
chr3 (259-555)||(14820153-14820449)
chr3 (269-523)||(32386595-32386849)
chr3 (258-554)||(25230098-25230394)
chr3 (258-554)||(25237685-25237981)
chr3 (259-554)||(20884968-20885263)
chr3 (259-555)||(37045034-37045327)
chr3 (355-623)||(41472233-41472498)
chr3 (259-556)||(30529685-30529981)
chr3 (257-554)||(25230554-25230851)
chr3 (257-554)||(25238141-25238438)
chr3 (258-622)||(7477125-7477487)
chr3 (258-622)||(7493815-7494177)
chr3 (259-501)||(4067212-4067454)
chr3 (257-503)||(25238533-25238780)
chr3 (302-623)||(41473929-41474249)
chr3 (259-555)||(2911094-2911379)
chr3 (365-555)||(39640936-39641125)
chr3 (259-545)||(25802399-25802685)
chr3 (400-555)||(25239070-25239224)
chr3 (367-552)||(29224326-29224510)
chr3 (367-555)||(25802964-25803151)
chr3 (284-493)||(15405606-15405816)
chr3 (284-493)||(15392570-15392780)
chr3 (272-464)||(53150676-53150869)
chr3 (519-623)||(32388842-32388945)
chr3 (408-555)||(32796936-32797082)
chr3 (284-493)||(15388203-15388413)
chr3 (284-493)||(15411015-15411225)
chr3 (284-493)||(15417431-15417641)
chr3 (258-485)||(3899868-3900096)
chr3 (487-623)||(12820576-12820710)
chr3 (286-493)||(15377344-15377552)
chr3 (258-503)||(26309839-26310085)
chr3 (257-347)||(25238976-25239066)
chr3 (299-493)||(15376056-15376251)
chr3 (257-347)||(41473748-41473838)
chr3 (257-341)||(25230946-25231030)
chr3 (382-503)||(31103933-31104056)
chr3 (258-347)||(18318862-18318951)
chr3 (380-503)||(47518295-47518415)
chr3 (10-78)||(37796648-37796716)
chr3 (356-425)||(15410629-15410698)
chr3 (437-485)||(3890046-3890094)
chr3 (373-425)||(15381258-15381310)
chr3 (373-425)||(15396493-15396545)
chr3 (401-463)||(43736715-43736777)
chr3 (373-425)||(15373696-15373748)
chr3 (259-315)||(18547418-18547474)
chr3 (259-334)||(30477270-30477344)
chr3 (259-345)||(39641133-39641219)
chr3 (371-456)||(12762939-12763023)
chr3 (466-495)||(25238816-25238845)
chr3 (381-425)||(15392183-15392227)
chr3 (373-425)||(15417045-15417096)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (259-623)||(10232-10594)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (259-622)||(2061-2423)
scaffold0040 (257-298)||(2515-2556)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (259-623)||(3886452-3886815)
chr5 (257-623)||(22556468-22556834)
chr5 (258-623)||(22556901-22557266)
chr5 (258-623)||(2474337-2474701)
chr5 (257-623)||(3886906-3887271)
chr5 (259-558)||(8641886-8642184)
chr5 (259-555)||(17445306-17445602)
chr5 (260-623)||(2473891-2474243)
chr5 (259-623)||(1821838-1822201)
chr5 (259-570)||(189053-189363)
chr5 (257-555)||(34371611-34371909)
chr5 (259-555)||(42788497-42788793)
chr5 (258-555)||(2193815-2194100)
chr5 (258-555)||(34372067-34372364)
chr5 (261-555)||(10927256-10927550)
chr5 (259-555)||(15512863-15513160)
chr5 (257-555)||(27646683-27646982)
chr5 (288-555)||(8391202-8391468)
chr5 (328-555)||(21886066-21886293)
chr5 (259-555)||(34867789-34868073)
chr5 (258-555)||(20039326-20039621)
chr5 (355-555)||(10926894-10927093)
chr5 (257-544)||(29679957-29680236)
chr5 (259-556)||(39146937-39147227)
chr5 (259-499)||(20858393-20858633)
chr5 (259-540)||(18750047-18750328)
chr5 (292-554)||(18304431-18304693)
chr5 (259-592)||(30684407-30684739)
chr5 (275-503)||(24182113-24182341)
chr5 (369-592)||(30719767-30719988)
chr5 (276-473)||(11757149-11757347)
chr5 (473-624)||(22975076-22975225)
chr5 (259-606)||(2058508-2058853)
chr5 (259-423)||(30720111-30720276)
chr5 (369-552)||(16370673-16370852)
chr5 (374-503)||(42429195-42429324)
chr5 (269-484)||(1880146-1880361)
chr5 (259-423)||(30684862-30685027)
chr5 (259-379)||(38063680-38063800)
chr5 (402-499)||(4673466-4673563)
chr5 (420-549)||(11160694-11160822)
chr5 (261-333)||(21883938-21884010)
chr5 (381-493)||(32574632-32574744)
chr5 (369-556)||(4657956-4658140)
chr5 (388-555)||(5066872-5067038)
chr5 (151-246)||(22630803-22630900)
chr5 (288-424)||(8366595-8366730)
chr5 (353-441)||(4102908-4102996)
chr5 (302-361)||(187750-187810)
chr5 (370-440)||(5785958-5786028)
chr5 (438-552)||(43356651-43356762)
chr5 (400-453)||(5785901-5785954)
chr5 (443-476)||(39801498-39801531)
chr5 (511-553)||(11757345-11757387)
chr5 (301-346)||(5066781-5066826)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (257-623)||(34308784-34309153)
chr8 (258-623)||(25147899-25148262)
chr8 (257-623)||(25147468-25147832)
chr8 (258-623)||(34308329-34308693)
chr8 (258-623)||(21315960-21316323)
chr8 (258-551)||(10844465-10844758)
chr8 (262-623)||(12100624-12100982)
chr8 (257-555)||(27022188-27022485)
chr8 (259-554)||(22548400-22548695)
chr8 (256-555)||(12827102-12827401)
chr8 (257-555)||(22548844-22549142)
chr8 (259-555)||(22026378-22026675)
chr8 (258-555)||(27925898-27926194)
chr8 (258-549)||(17103086-17103378)
chr8 (276-555)||(41658973-41659252)
chr8 (259-555)||(2044057-2044353)
chr8 (257-556)||(8080192-8080490)
chr8 (257-555)||(32292396-32292701)
chr8 (368-623)||(25144704-25144957)
chr8 (257-475)||(31283501-31283719)
chr8 (264-556)||(28453336-28453628)
chr8 (393-555)||(10844882-10845043)
chr8 (284-518)||(41913006-41913240)
chr8 (259-556)||(33852109-33852406)
chr8 (369-555)||(6464872-6465057)
chr8 (265-623)||(27819105-27819459)
chr8 (257-402)||(32292092-32292238)
chr8 (268-503)||(15818876-15819111)
chr8 (368-551)||(3745104-3745286)
chr8 (275-488)||(30527349-30527563)
chr8 (395-543)||(28375042-28375189)
chr8 (363-556)||(22840486-22840677)
chr8 (305-545)||(22705181-22705424)
chr8 (369-527)||(3744665-3744822)
chr8 (432-544)||(27021904-27022015)
chr8 (367-503)||(15567516-15567652)
chr8 (261-481)||(6466329-6466549)
chr8 (258-488)||(6466775-6467001)
chr8 (276-464)||(25307855-25308042)
chr8 (367-503)||(1297057-1297193)
chr8 (259-341)||(9251098-9251180)
chr8 (259-347)||(6463394-6463483)
chr8 (258-502)||(15567859-15568100)
chr8 (391-555)||(30334892-30335055)
chr8 (151-246)||(23121677-23121774)
chr8 (375-457)||(10729654-10729736)
chr8 (258-454)||(10729722-10729919)
chr8 (261-346)||(29117444-29117529)
chr8 (258-463)||(34687920-34688132)
chr8 (284-336)||(22840425-22840477)
chr8 (456-556)||(29971450-29971549)
chr8 (442-500)||(17429553-17429611)
chr8 (285-430)||(29971304-29971448)
chr8 (446-503)||(36968434-36968491)
chr8 (383-499)||(28912826-28912942)
chr8 (376-428)||(29117361-29117413)
chr8 (569-623)||(31283356-31283410)
chr8 (459-496)||(3508790-3508827)
chr8 (295-344)||(12119224-12119273)
chr8 (258-322)||(27021839-27021903)
chr8 (391-447)||(44041986-44042042)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (259-623)||(107314-107677)
[»] chr4 (84 HSPs)
chr4 (276-623)||(35871560-35871905)
chr4 (259-623)||(49998568-49998931)
chr4 (257-623)||(44471168-44471533)
chr4 (259-623)||(23350128-23350491)
chr4 (259-621)||(44470720-44471080)
chr4 (259-555)||(50398383-50398679)
chr4 (257-555)||(24629279-24629574)
chr4 (259-503)||(7678467-7678712)
chr4 (322-555)||(12691907-12692140)
chr4 (257-555)||(50398837-50399134)
chr4 (257-555)||(4127737-4128030)
chr4 (259-555)||(1645594-1645890)
chr4 (259-555)||(51331128-51331422)
chr4 (267-622)||(14572007-14572357)
chr4 (257-555)||(23943085-23943379)
chr4 (259-555)||(3169205-3169501)
chr4 (259-555)||(23942634-23942930)
chr4 (259-555)||(4127263-4127578)
chr4 (257-555)||(21067281-21067579)
chr4 (276-623)||(27578319-27578661)
chr4 (259-555)||(9423703-9423999)
chr4 (363-555)||(24628927-24629121)
chr4 (319-487)||(50814730-50814899)
chr4 (258-571)||(13266070-13266382)
chr4 (261-555)||(1464146-1464439)
chr4 (374-623)||(15306052-15306304)
chr4 (259-523)||(21067765-21068026)
chr4 (257-555)||(14351794-14352092)
chr4 (365-555)||(21220283-21220472)
chr4 (258-623)||(27578753-27579116)
chr4 (394-622)||(14571702-14571928)
chr4 (277-503)||(17628561-17628788)
chr4 (259-555)||(29628499-29628808)
chr4 (268-555)||(31817707-31817993)
chr4 (258-499)||(27026557-27026798)
chr4 (291-503)||(8467690-8467890)
chr4 (388-555)||(53996090-53996256)
chr4 (355-556)||(17029328-17029528)
chr4 (258-441)||(27578133-27578314)
chr4 (396-499)||(27029331-27029434)
chr4 (372-572)||(17028858-17029055)
chr4 (263-492)||(23091358-23091590)
chr4 (302-488)||(13613786-13613972)
chr4 (271-425)||(14571545-14571700)
chr4 (369-503)||(33764910-33765044)
chr4 (367-503)||(4185765-4185901)
chr4 (391-555)||(31817376-31817539)
chr4 (365-493)||(20306116-20306241)
chr4 (259-415)||(40607069-40607226)
chr4 (375-551)||(17628971-17629145)
chr4 (376-543)||(43928927-43929092)
chr4 (258-371)||(7381449-7381563)
chr4 (257-378)||(15268016-15268138)
chr4 (276-594)||(41869880-41870196)
chr4 (258-346)||(35477868-35477956)
chr4 (370-552)||(23976175-23976357)
chr4 (367-437)||(11828439-11828509)
chr4 (326-552)||(26200205-26200425)
chr4 (367-552)||(24271505-24271690)
chr4 (275-457)||(33294753-33294936)
chr4 (367-496)||(42838680-42838812)
chr4 (284-552)||(52048547-52048804)
chr4 (405-496)||(4186224-4186315)
chr4 (404-503)||(44831047-44831146)
chr4 (464-555)||(53854858-53854948)
chr4 (265-347)||(4414238-4414320)
chr4 (377-499)||(34554483-34554605)
chr4 (259-379)||(31816983-31817104)
chr4 (259-324)||(50399334-50399399)
chr4 (269-425)||(53854702-53854859)
chr4 (262-337)||(53995978-53996053)
chr4 (258-347)||(5810041-5810130)
chr4 (258-331)||(13265859-13265932)
chr4 (430-478)||(39902470-39902518)
chr4 (419-503)||(53391937-53392021)
chr4 (480-537)||(34801394-34801450)
chr4 (438-499)||(45682257-45682318)
chr4 (259-338)||(2499347-2499426)
chr4 (284-339)||(33987019-33987074)
chr4 (507-572)||(33987164-33987227)
chr4 (466-547)||(2499647-2499727)
chr4 (586-622)||(8467994-8468030)
chr4 (454-550)||(17506389-17506484)
chr4 (372-448)||(52299826-52299902)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (259-623)||(13492721-13493085)
chr6 (257-621)||(7911812-7912175)
chr6 (258-554)||(17027381-17027677)
chr6 (259-623)||(17730960-17731327)
chr6 (258-623)||(9351995-9352358)
chr6 (259-623)||(13191364-13191727)
chr6 (257-555)||(20850320-20850618)
chr6 (262-623)||(7912242-7912602)
chr6 (259-555)||(20896538-20896835)
chr6 (350-623)||(16519901-16520171)
chr6 (259-555)||(23986168-23986464)
chr6 (259-556)||(20126033-20126330)
chr6 (257-492)||(13492393-13492630)
chr6 (257-556)||(23776439-23776737)
chr6 (259-555)||(2681071-2681363)
chr6 (257-555)||(21311514-21311812)
chr6 (259-556)||(21311969-21312266)
chr6 (284-555)||(2890715-2890985)
chr6 (263-546)||(2720419-2720702)
chr6 (259-454)||(28780209-28780405)
chr6 (258-555)||(17850917-17851214)
chr6 (306-555)||(6330811-6331059)
chr6 (258-592)||(9440707-9441037)
chr6 (281-503)||(11062335-11062558)
chr6 (259-555)||(9440160-9440456)
chr6 (284-555)||(14771595-14771866)
chr6 (284-555)||(17851373-17851644)
chr6 (367-555)||(15929581-15929768)
chr6 (259-552)||(28065687-28065982)
chr6 (405-555)||(3652485-3652634)
chr6 (413-556)||(27334159-27334301)
chr6 (413-556)||(27394899-27395041)
chr6 (324-503)||(33774918-33775100)
chr6 (258-418)||(3652658-3652819)
chr6 (284-503)||(1991603-1991823)
chr6 (275-454)||(2891161-2891340)
chr6 (276-553)||(20735696-20735973)
chr6 (419-555)||(31821704-31821839)
chr6 (381-552)||(32292887-32293055)
chr6 (388-503)||(20732628-20732743)
chr6 (464-594)||(9440485-9440612)
chr6 (367-487)||(17205405-17205524)
chr6 (289-475)||(12194406-12194592)
chr6 (414-501)||(15929251-15929338)
chr6 (389-503)||(28583013-28583127)
chr6 (293-500)||(3884977-3885180)
chr6 (261-407)||(3653048-3653191)
chr6 (289-361)||(11062022-11062094)
chr6 (506-621)||(13490055-13490169)
chr6 (257-334)||(6331217-6331294)
chr6 (375-503)||(30729807-30729935)
chr6 (283-342)||(27334305-27334364)
chr6 (283-342)||(27395045-27395104)
chr6 (258-347)||(15929346-15929435)
chr6 (259-340)||(21312453-21312533)
chr6 (481-552)||(3652981-3653051)
chr6 (371-544)||(33470848-33471019)
chr6 (367-484)||(34660468-34660585)
chr6 (410-518)||(10964340-10964447)
chr6 (270-426)||(31415951-31416107)
chr6 (259-309)||(33774868-33774918)
chr6 (259-315)||(31821643-31821699)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (257-623)||(105652-106017)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (258-554)||(18966-19262)
scaffold0322 (489-623)||(18203-18335)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (262-623)||(162531-162892)
scaffold0022 (259-457)||(163167-163366)
scaffold0022 (257-454)||(162983-163181)
scaffold0022 (259-552)||(69666-69959)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (259-555)||(1219-1515)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (257-555)||(1900-2198)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (258-555)||(2741-3038)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (262-555)||(154756-155049)
scaffold0002 (257-345)||(154511-154599)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (257-555)||(4560-4857)
scaffold0333 (257-555)||(5015-5317)
scaffold0333 (258-345)||(5331-5419)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (267-622)||(245019-245369)
scaffold0005 (394-622)||(245448-245674)
scaffold0005 (271-425)||(245676-245831)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (259-467)||(13384-13593)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (257-555)||(17447-17745)
scaffold0047 (257-556)||(17985-18282)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (259-454)||(14553-14749)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (259-503)||(2155-2391)
scaffold0557 (507-555)||(749-797)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (259-442)||(421-605)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (438-623)||(142305-142488)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (259-412)||(1552-1706)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (86-256)||(24466-24636)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (317-555)||(14740-14978)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (284-493)||(44597-44807)
scaffold0071 (373-425)||(45142-45193)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (426-557)||(4001-4131)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (441-555)||(23672-23785)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (282-550)||(26074-26340)
scaffold0036 (277-340)||(16259-16321)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (258-485)||(7009-7237)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (269-331)||(62968-63030)
scaffold0065 (257-331)||(67212-67286)
[»] scaffold0442 (2 HSPs)
scaffold0442 (261-328)||(1-68)
scaffold0442 (511-555)||(2504-2548)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (442-500)||(45439-45497)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (296-346)||(37201-37251)
[»] scaffold1138 (1 HSPs)
scaffold1138 (444-554)||(734-843)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (259-311)||(246638-246690)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 259 - 622
Target Start/End: Original strand, 46693586 - 46693950
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  46693586 tgtaacatcccaaactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcataccgggaaa 46693685  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46693686 ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatgaaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgtt 46693785  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46693786 gatataggtagtaccaaacaatttttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacatgcacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 46693885  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  46693886 cttttgcctagaagcatgacaagagtcggaccactcctagccctcatcagcctcgggtgttacat 46693950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 259 - 622
Target Start/End: Original strand, 35759459 - 35759821
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa- 357  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  35759459 tgtaacaccccagactactttcatgattgccgactgaccccaaaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaa 35759558  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759559 cttcccggtaggtcaccaatcccaaaatagctccaagtcaagcacgtttaactatgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 35759658  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759659 gatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcaa 35759757  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
     |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  35759758 -tttttcctagaagcatgctaggagccagaccactccccgccgtcatcagcctcgggcgttacat 35759821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 20054385 - 20054683
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20054385 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20054484  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054485 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20054584  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20054585 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20054683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 20054841 - 20055139
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20054841 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20054940  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054941 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20055040  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20055041 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20055139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 20055297 - 20055595
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20055297 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20055396  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055397 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20055496  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20055497 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20055595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 20055753 - 20056051
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20055753 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20055852  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055853 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20055952  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20055953 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20056051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 20056209 - 20056507
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20056209 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20056308  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056309 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20056408  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20056409 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20056507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 20057112 - 20057410
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20057112 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20057211  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057212 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20057311  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20057312 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20057410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 258 - 555
Target Start/End: Original strand, 20053930 - 20054227
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  20053930 ttgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccagaaa 20054029  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054030 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcctagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 20054129  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20054130 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 20054227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 257 - 556
Target Start/End: Original strand, 20057568 - 20057867
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20057568 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20057667  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057668 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20057767  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||    
T  20057768 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcatttcggtgtgattc 20057866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 50002556 - 50002854
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  50002556 tttgtaacatcctagacgactttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggg 50002655  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50002656 aacttcccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactatggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 50002755  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50002756 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatgcctacacggcctcaggatctctctcattccgatgtgattc 50002854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 16451784 - 16452080
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||    
T  16451784 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcatcacgcgcacgcttattggaaaa 16451883  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16451884 ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgtt 16451983  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16451984 gatataggtagtacccaacaattcttataagctttccttcaaccat-gtagtcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 16452080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 16460937 - 16461233
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||    
T  16460937 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcatcacgcgcacgcttattggaaaa 16461036  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16461037 ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgtt 16461136  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16461137 gatataggtagtacccaacaattcttataagctttccttcaaccat-gtagtcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 16461233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 20845512 - 20845808
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  20845512 tgtaacatctcagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 20845611  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20845612 cttcccggtaggtcacccatcccaaaatttctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20845711  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||    
T  20845712 gatataggtagtaacaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattc 20845808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 38341201 - 38340905
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  38341201 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccataaaccaacacgagtcttttccgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 38341102  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38341101 cttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaatgaagatgcatcttgtt 38341002  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||    
T  38341001 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccatctcattccggtgtgattc 38340905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 52250501 - 52250205
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||    
T  52250501 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 52250402  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52250401 cttcccggtaggtcacccattccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 52250302  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  52250301 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcgaccat-gtagtcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggtgtgattc 52250205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 257 - 518
Target Start/End: Original strand, 20056665 - 20056926
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20056665 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20056764  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056765 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20056864  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  20056865 ttgatataggtagtaccaaacaattctcataagccttccttcaaccct-gcagtcccatacct 20056926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 50002924 - 50003222
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  50002924 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgctgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 50003023  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50003024 aacttcccggtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttttggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttg 50003123  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||  |||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50003124 ttgatataggtagtacccaacaattattataagtctccctttaaccat-gcagtcctatacctgcatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 50003222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 259 - 498
Target Start/End: Original strand, 20060191 - 20060431
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20060191 tgtaacaccccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttccatcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaa 20060290  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060291 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 20060390  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20060391 gatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttca 20060431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 339 - 622
Target Start/End: Original strand, 35760845 - 35761127
Alignment:
Q  339 ctcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccg 437  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||     
T  35760845 ctcgcacgcttaccgggaaacttcccgataggttacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactacggagttctcatggaatgagctacca 35760944  T
Q  438 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccct 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  35760945 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacggcctcaggatccct 35761043  T
Q  538 ctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  35761044 ctcattccgatgtgattcaa-tttttcctagaagcatgccaggagccagaccactcgccaccctcatcagcctcggacgttacat 35761127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 43056914 - 43057211
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || |    
T  43056914 tttgtaacatccccgacgactttaataattgccgactgaccctacaaaccaacacaagttttttcagtgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccggga 43057013  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43057014 aacttcccagtaggtcacccatccaaagaccactctaagtcaatcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttg 43057113  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43057114 ttgatataggtagtatcaaacaattcttctaagccttccttcaaccat-gtagtcacatacctacacggccttaggatccc-ctcattctgatgtgattc 43057211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 266 - 544
Target Start/End: Original strand, 51372732 - 51373010
Alignment:
Q  266 tcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa-cttcccg 364  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  51372732 tcccatactgctttcaagattgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcggattttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttcctg 51372831  T
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51372832 ataggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaataagatgcatcttgtcgatatag 51372931  T
Q  465 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattc 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | | |||  |||||||||||||||    
T  51372932 gtagtactaaacaattcttataagccttccttcaaccat-acagtcacatacctgtatggcctcgggatccctctcattc 51373010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 259 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 52250838 - 52250641
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || |||    
T  52250838 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccgggaaa 52250739  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52250738 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 52250641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 259 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 52251175 - 52250978
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || |||    
T  52251175 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccgggaaa 52251076  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52251075 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 52250978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 404 - 623
Target Start/End: Original strand, 20061188 - 20061405
Alignment:
Q  404 cttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20061188 cttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat 20061287  T
Q  504 cacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctca 603  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  20061288 -gcagtcccatacctgcacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattc-agtttagcctagaagattgccaagagccggaccactccccgccctca 20061385  T
Q  604 tcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  20061386 tcagcctcgggcgttacatg 20061405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 43057372 - 43057670
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||||||   || ||||| || ||||  |||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || || ||| || |    
T  43057372 tttgtaacatccttaacgactttaagaattgctgactgacaatacaaaccaacacaagtctttttagcgtgttttgttctcactcacatgcttaccggga 43057471  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43057472 aacttcccagtaggtcaccgatccaaagaccactccaagtcaatcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttg 43057571  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43057572 ttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 43057670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 368 - 555
Target Start/End: Original strand, 50002246 - 50002432
Alignment:
Q  368 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 467  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50002246 ggtcaccaatcccaaaattgctccaagtcaagcacactcaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgataaaggta 50002345  T
Q  468 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  50002346 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatgcctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattc 50002432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 289 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 23180995 - 23180663
Alignment:
Q  289 cgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa-cttcccggtaggtcacccatcccaaaattg 387  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||   |   ||||| ||| || | |||| |||||||||||||||     
T  23180995 cgactaacccgacaaaccaacattagtcttttcagcatgttttgtcgtcactcgcacattttttgaaaaactttccagaaggtaacccatcccaaaattt 23180896  T
Q  388 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23180895 ctccaagtcaagcacgcttaattgtggaattcttatggaatgggctagcgaatagaagatacatcttgttgatataggtagtaccaagcaattcttataa 23180796  T
Q  488 gccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccgga 587  Q
     | |||||||||||| |  |||||||| |||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |   ||||| ||||    
T  23180795 tcattccttcaacca-cgtagtcccattcctacacggcttcaagatccctctcattccaatgtgattcaa-tttttcctataagc-tactaggagtcgga 23180699  T
Q  588 ccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||||||| |||| |||||| || || ||||||||||    
T  23180698 ccactccccgccttcatcagccacgagcgttacatg 23180663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 405 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 2328463 - 2328247
Alignment:
Q  405 ttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2328463 ttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat- 2328365  T
Q  505 acagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcat 604  Q
     |||||||||||||  ||| ||| |  ||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  2328364 gcagtcccatacctgtacggcctcataatttctctcattccaatgtgattc-agttttgcctaaaagcatgccaggagccagaccactctccgccctcat 2328266  T
Q  605 caacctcgggcgttacatg 623  Q
    || ||| ||| ||||||||    
T  2328265 cagccttgggtgttacatg 2328247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 368 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 2635109 - 2634909
Alignment:
Q  368 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 467  Q
    |||||| ||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2635109 ggtcactcatccaaagattactccaagccaaacacgcttaactgtggagttcttattgaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggta 2635010  T
Q  468 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgccta 567  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  2635009 gtaccaaacaattcttatgagttatccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacaacctcatgatccctctcattccgatgtgattcga--tttgccta 2634913  T
Q  568 gaag 571  Q
    ||||    
T  2634912 gaag 2634909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 12883815 - 12883523
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaact 359  Q
    ||||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    || || ||| || |||||    
T  12883815 taacatctcagatgactttaagcattgtcgattgaccttacaaatcaacacgagttttt-cagcatgttttgtccacaaaa-catgcttactgggaaact 12883718  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12883717 tcccagtaggtcatccatccaaaaactacttcaagtcaaacacacttaactgtggagtttttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttga 12883618  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  12883617 tataggtagtaccaaacaattcttataagtattccttcaatcat-gcagtcccatacctgcacagcctcgggatccatctcattccggtgtgattc 12883523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 325 - 554
Target Start/End: Original strand, 31822577 - 31822809
Alignment:
Q  325 gtgttttgtcctcactcgcacgcatac--ggaaa--acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  |||||  ||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31822577 gtgttttgtcctcactcgcacgtctacagggaaataacttccgagtaggtcgtccatcccaaaattgttccaagtcaaaaacgcttaactgtggagttct 31822676  T
Q  421 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctac 520  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  31822677 tttggattgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatatatgtagtaccaaataattcttataaatcttccttcaaccat-gtagtctcatacctac 31822775  T
Q  521 acgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  31822776 acggcctcatgatccctctcattctgatgtgatt 31822809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 555
Target Start/End: Original strand, 30872824 - 30873097
Alignment:
Q  285 ttgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcg-cacgcata---cggaaaacttcccggtaggtcacccatccc 380  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || | |||||| | ||||||||||||||||| |||  ||    ||  ||||||  | |||||||||||||||     
T  30872824 ttgtcgactgaccctacaaattaacatgaatcttttcaacatgttttgtcctcactcgtcacatatttttcgtgaaacttttcagtaggtcacccatcca 30872923  T
Q  381 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt 480  Q
    || | | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30872924 aagactactgcaagtcaagcatgcttaattgtggagttcttatagaatggactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaatt 30873023  T
Q  481 cttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  30873024 cttaaaagtcttccttcaaccat-acagtctcatacctgcacggcctcagaatccctctcattccggtgtgattc 30873097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 259 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16907530 - 16907284
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctc-actcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    ||||||||||||  || |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||| ||| || |    | ||    
T  16907530 tgtaacatcccatgctgctttaaggattgttggctgaccccacaaaccaacacgagtctttccagtgtattttgtcctttacttgcatgcttttcaagaa 16907431  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||  | || |||||||||||| |||||||    
T  16907430 acttctcaaaaggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactatggagttcttgtagaatggaccactgaaaagaagatgtatcttgt 16907331  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16907330 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccat 16907284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 388 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12728157 - 12728041
Alignment:
Q  388 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagt-accaaacaattcttata 486  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12728157 ctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggcagtaaccaaacaattcttata 12728058  T
Q  487 agccttccttcaaccat 503  Q
    || ||||||||||||||    
T  12728057 agtcttccttcaaccat 12728041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Original strand, 51093412 - 51093577
Alignment:
Q  86 ctctttgagatgatatctctttgctgcaaccacactnnnnnnnnnnnnntatcacttccctcctaattttgtttaaaattattttctctacattcagagg 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51093412 ctctttgagatgatatctcttttctgcaaccacactaaaaaagcaaaaatatgacttccctcctaattttgtttaaaattattttctctacattctgagg 51093511  T
Q  186 ggaggactatactttgagcacatgggtctggtaagaaggtaagaaaccccttcaacaatttcaatagtgtg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51093512 ggaggactatactttgagcacatggttctggtaag-----aagaaaccccttcaacaatttcaacagtgtg 51093577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 355 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 7548289 - 7548089
Alignment:
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  7548289 aaacttctcggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagtacgcttaattgtggagttcttatcaaatgggctaccaaaaagaatatgcatctt 7548190  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||| || |||   |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||||    
T  7548189 gttgatatagttaataccaaacaatttttataagtcttcctttaatcat-gtagtctcatacctacacggcctcatgatccctctcattgcaatgtgatt 7548091  T
Q  555 ca 556  Q
    ||    
T  7548090 ca 7548089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 290 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2634730 - 2634464
Alignment:
Q  290 gactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 388  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||  |||||| ||||| || |   |||||||||||| | | |||| |||||| || | | |    
T  2634730 gactgaccttacaaacaaacaagagtcttttcagcgtgcttcatcctcattcgcatgctttttggaaaacttcccagaatgtcatccatccaaagactac 2634631  T
Q  389 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 488  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  2634630 tccaagtcaagcacgtttaacagtgaagttcttattgaatagactatcgaaaagaagatgcatcttgtttgtatagctagtaccaaacaattcttgcaag 2634531  T
Q  489 ccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggat-ccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||| || |||  || || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2634530 ccttcctttaatcat-gcaatctcatacatacacaacctcaggatcccctctcatttcgatgtgattc 2634464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 429
Target Start/End: Original strand, 35009859 - 35010018
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||           ||| |||     
T  35009859 tgtaacatcccagacgactttgagcattgccgactgaccctacaaacgaacatgagttttttcagtgtgttttgtcctcac-----------cgggaaaa 35009947  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatg 429  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35009948 ttctcggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatg 35010018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 471
Target Start/End: Original strand, 7229792 - 7230007
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaa 355  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |  || ||    
T  7229792 tttgtaacatcctagactgttttcttgattgacgactcaccccacaaagcaacacgagttttttcagcatgttttatcctcactttcacgcttttcgaaa 7229891  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||      |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||    
T  7229892 aactttatataaggtcaccaatcctaaaattgctccaagtcaaacatgcttatctatggagttcttatgtaatgaactaccgaaatgaagatgcttcgtg 7229991  T
Q  456 ttgatataggtagtac 471  Q
    ||||||||| ||||||    
T  7229992 ttgatatagttagtac 7230007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 348
Target Start/End: Original strand, 35759913 - 35760004
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgca 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35759913 tttgtaacatcccagactgctttcatgattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcgctcgcacgca 35760004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 389 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10820758 - 10820591
Alignment:
Q  389 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaa--gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttata 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  | |||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10820758 tccaagtcaagcacgcttaactgtgaatttcttatgaaatgagtcatcgaaaaaaaaagatgtatcttattgatataggtagtaccaaacaattcttata 10820659  T
Q  487 agccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |  ||||||||||||||   ||||| |||| |||||  ||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  10820658 aatcttccttcaaccat-gtagtccaatacatacaccgcctcataatccctctcactccgatgtgattc 10820591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 381
Target Start/End: Original strand, 31822968 - 31823093
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |    
T  31822968 tttgtaacatcccagaatgctttctggattgctgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcatgcttaccgaga 31823067  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatccca 381  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  31823068 aacttcccagtaggtcacccatccca 31823093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 375 - 503
Target Start/End: Original strand, 16440547 - 16440675
Alignment:
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 474  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  16440547 catcccaaaattgcttcgagtcaatcacacttaactttgaagttattatagaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgttatcggtagtagcaa 16440646  T
Q  475 acaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  16440647 acagttcttataagtctttcttcaaccat 16440675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 284 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7547907 - 7547791
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  7547907 attgtcgactgaccctacaaatcaacacgagacttttcagtgtgttttgtccttactcgcacgcttatcgaaaaactttccggtaggtcacccatccaaa 7547808  T
Q  383 aattgctccaagtcaag 399  Q
     | | ||||||||||||    
T  7547807 cactactccaagtcaag 7547791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 51080672 - 51080740
Alignment:
Q  10 acatcatcacaaatggtggggctatgatcagatggggctactttcgctaattcatgagcgaccccatta 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  51080672 acatcatcacaaatggtggggctatgatcagatggggctaccctcgctaattcatgagcgaccccatta 51080740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 544
Target Start/End: Original strand, 16410573 - 16410859
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaa 356  Q
    ||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||   || |||||| ||||| |||||||||| | |||||| || ||||||| |||| | |  | ||    
T  16410573 ttgtaacatcccatacgactttaaatattgtcgacttgtcccacaaactaacacaagttttttcaacatgttttatcatcactcgtacgctttcttggaa 16410672  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||| | | | || |  ||||||||| |||||||||||||| || | |||||| || ||||||| | ||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  16410673 acttctcagaatgttaaacatcccaaacttgctccaagtcaaacatgtttaactttgaagttcttctagaataggctaccaaaaacaagatgcatcttgt 16410772  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattc 544  Q
    || ||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||  |||||| || || |||||||||||||    
T  16410773 tggtattggtagtagtaaataattcttataagctttccttcaacaat-gcattcccatactcacacgatctcagaatccctctcattc 16410859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 8278247 - 8278065
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    |||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||  |||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| || |           
T  8278247 tttgtaacatcccaaacagcttccaggattttcgaccaaccctacagactaacacgagtctttttaacgtgttttgtcctcacttgcaagcttt------ 8278154  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaag 445  Q
    ||||  |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  8278153 acttttcaaaaggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagtctttatgaaatggactaccaaaaagaag 8278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39582638 - 39582553
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcg 342  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39582638 tttgtaacatcccaaactactttaagcattgccgactgatcctacaaaccaaaacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcg 39582553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 543
Target Start/End: Original strand, 842905 - 843068
Alignment:
Q  379 ccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 478  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||  | || ||| | ||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  842905 ccaaaattgttcaaagtcaagcacgttcaactgttgagttcttatgtgacgatctatcaaaaagaacatgcatcttgttggaatggatagtaccaaacaa 843004  T
Q  479 ttcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcatt 543  Q
    |||||| | | |||||||||| |||  ||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  843005 ttcttacacgacttccttcaatcat-gcagacacatacctacacgatctcatgatccctctcatt 843068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 341
Target Start/End: Original strand, 49996530 - 49996613
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactc 341  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49996530 ttgtaacatctcagactgcttttaggattgccgactgaccccacaaactaacaagagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 49996613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 31823097 - 31823161
Alignment:
Q  420 ttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 484  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31823097 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcattttattgatataggtagtaccaaataattctta 31823161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 2739708 - 2739557
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||   |||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  2739708 aggtcatccatatcaaaattgctcaaagtcaaacacacttaaccatgaagttcttatggaatagactataaaaaagaagatacatattgttgatatatgt 2739609  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccataccta 519  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||| | | |||||| |||||| ||||||||    
T  2739608 agtgctaaacaattcttataagtctttccttaaccat-acagtctcataccta 2739557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 333
Target Start/End: Original strand, 28181350 - 28181418
Alignment:
Q  265 atcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgt 333  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28181350 atcccatactgctttcaggattgtcaactgcctccacaaaccaacacgagtcttttcagagtgttttgt 28181418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 484
Target Start/End: Original strand, 46411173 - 46411211
Alignment:
Q  446 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 484  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46411173 atgcatcttattgatataggtagtaccaaataattctta 46411211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12728247 - 12728210
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgac 296  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12728247 tgtaacatctcagacgactttcaggattgtcgactgac 12728210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 16440429 - 16440518
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||| |||||  ||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||    
T  16440429 ttgtaacattccagacaactttaaatattgccgattgaccacacaaaccaacacatgtttttttagcgtgtttaatcctcactcgtacgc 16440518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 35168686 - 35168630
Alignment:
Q  374 ccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatga 430  Q
    ||||| || |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35168686 ccatcacacaattactccaagttaaacacgcttaactgtggagctctaatggaatga 35168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 9125255 - 9124891
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9125255 ttgtaacaccccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaa 9125156  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9125155 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccgagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 9125056  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  9125055 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttcctttaaccat-acagtctcatacctgcacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc- 9124958  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9124957 agttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 9124891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 259 - 621
Target Start/End: Original strand, 2941608 - 2941969
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||    
T  2941608 tgtaacatcccagactgctttcgtgattgccgactgaccgcacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttctcctcactcgcacgcttaccgggaaa 2941707  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2941708 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 2941807  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2941808 gatataggtagtaccaaacaattcttatcagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattc-a 2941905  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttaca 621  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2941906 gttttgcctagaagcatggcgggagccgggccactcctcgccctcatcagccttgggcgttaca 2941969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 267 - 623
Target Start/End: Original strand, 13124994 - 13125350
Alignment:
Q  267 cccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccg 364  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  13124994 cccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcctttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccg 13125093  T
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13125094 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatatag 13125193  T
Q  465 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  13125194 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcagggcctcaagatccctctcattccgatatgattc-agttttgc 13125291  T
Q  565 ctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13125292 ctagaagcatgccaggagccagaccactccccgccctcatccgcctcgggcgttacatg 13125350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 257 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 42515389 - 42515024
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  42515389 tttgtaacatcacagacgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacccgcacgcttaccgaaa 42515290  T
Q  357 ac-ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |  |||| |||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42515289 aagttcctggtatgtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttg 42515190  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42515189 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaatcat-gcagtctcatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 42515091  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42515090 aa-ttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactctccaccctcatcagcctcgggcgttacatg 42515024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 34405442 - 34405738
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  34405442 tgtaacatcctagacaacttttaggattgtcgactgaccccacaaatcaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 34405541  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34405542 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcctgtt 34405641  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34405642 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggtgtgattc 34405738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 36422548 - 36422251
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  36422548 tttgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccggga 36422449  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36422448 aacttcccggtaggtcacccatcccaaa-ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 36422350  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36422349 ttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattc 36422251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 28496149 - 28495853
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  28496149 tgtaacattccaaactgttttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 28496050  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496049 cttcccaataggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 28495950  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28495949 gatataggtagtacccaacagttcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattc 28495853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 257 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 18833583 - 18833218
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |    
T  18833583 tttgtaacaccccagactgctttcaggattgccgacttatcccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccggga 18833484  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18833483 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaattagctaccgaaaagaagatgcatcttg 18833384  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18833383 ttgatataggtagtactaaacaattcatataagctttccctcaaccat-gcagttccatacctgtacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattc 18833285  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  18833284 -agttttgcctagaagcatgccaggaaccggaccactccccgccctcatcagccctgagcgttacatg 18833218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2193553 - 2193255
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  2193553 tttgtaacatctcagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccggga 2193454  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2193453 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcctatgaaatgagctaccgaatagaagatgcatcttg 2193354  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2193353 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggtctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 2193255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 277 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 42515821 - 42515543
Alignment:
Q  277 tttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcaccc 375  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  42515821 tttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaatttccatgtaggtcaccc 42515722  T
Q  376 atcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42515721 atcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 42515622  T
Q  476 caattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    || |||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42515621 cacttcttataagccttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattc 42515543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 260 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2189438 - 2189143
Alignment:
Q  260 gtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaac 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||    
T  2189438 gtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgtccccacaaatcaacacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaac 2189339  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2189338 ttcccggtaggtcactcatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttg 2189239  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2189238 atataggtagtgccaaacaattcttataagccttctttcaaccat-gcagtcccacacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 2189143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 6718926 - 6719221
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  6718926 tgtaacatcccagacgacttttaggattgctgactgaccccacaaaccaacacgattcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 6719025  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
     |||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719026 gttcccgatatgtcacccatcccaaa-ttactccaagtcaagcacgcttaactctggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 6719124  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6719125 gatataggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccat-gtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattc 6719221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 28495470 - 28495755
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |             
T  28495470 tgtaacatcgcagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgggttttgtcctcactcgcacgctt--------- 28495560  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28495561 -tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctacctaaaagaagatgcatcttgttg 28495659  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28495660 atataggtaaaactcaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctcattccgatgggattc 28495755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 259 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2466218 - 2465957
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| || |||    
T  2466218 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgacc-tacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcatgcttaccgggaaa 2466120  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2466119 tttcccggtaggtcacccatcccgaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcaacttgtt 2466020  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctaca 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2466019 gatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctaca 2465957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 259 - 457
Target Start/End: Original strand, 7646329 - 7646528
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||    
T  7646329 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaa 7646428  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7646429 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 7646528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 680111 - 679815
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |  ||| |  ||    
T  680111 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtagactgacc-tacaaaccaacatgagtcttttcagcgtgtttttgttctcactcgcatgtttaccgcgaa 680013  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  680012 acttcccggcaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaatatgcatcttgt 679913  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  679912 tgatataggtagtacc-aacaattcttataagccttccttcagccat-gtactcccatacctacacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattca 679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 404 - 623
Target Start/End: Original strand, 11517386 - 11517602
Alignment:
Q  404 cttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11517386 cttaactgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagtagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttc-accat 11517484  T
Q  504 cacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctca 603  Q
      |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11517485 -gcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc-agttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctca 11517582  T
Q  604 tcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11517583 tcaacctcgggcgttacatg 11517602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Original strand, 2611510 - 2611800
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    |||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |        
T  2611510 tgtaacattccatacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagagtgttttgtcctcactcgcacgcttagtta---- 2611605  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
      ||||||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2611606 --cccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtaaagcacgcttaactatggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttg 2611703  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2611704 ttatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttccaccat-atagtctcatacctacatgacctcaggacccctctcattccgatgtgattca 2611800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 258 - 555
Target Start/End: Original strand, 35473971 - 35474268
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |  |||| |  || ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||    
T  35473971 ttgtaacatcctagacgactttaaacattgccctctaaccctacaaaccaacacaagtcatttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaa 35474070  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    | ||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35474071 aattcccggtacgtcacccatccaaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgt 35474170  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35474171 tgatataagtagtactaaacaattcttataagtctttcttcaaccat-gtagtctcatacctacacgacctaaggatccctctcattccggtgtgattc 35474268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 256 - 555
Target Start/End: Original strand, 29038868 - 29039167
Alignment:
Q  256 gtttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cgga 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||     
T  29038868 gtttgtaacatcccagacgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcagtcacacgcttaccggg 29038967  T
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   || | |||||||||||||| ||    
T  29038968 aaacttaccggtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaaatgtagagttcttatggaatggattatcaaaaagaagatgcatgtt 29039067  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||   |||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29039068 gttgatataggtagtaccaaacaattcttgtaagcctccattcaaccat-gtagtcacatatctacacggcctcaggatgcctctcattccgatgtgatt 29039166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 304 - 623
Target Start/End: Original strand, 5406483 - 5406801
Alignment:
Q  304 accaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata--cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagca 401  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |   |||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5406483 accaacacgagtgttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgttttttcggaaaactttccagaaagtcatccatcccaaaattgctcaaagtcaagca 5406582  T
Q  402 cgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaacc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5406583 cgcttaactgtggagttcttatggtttgggcaaccaaaaataagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataaatcttccttcaacc 5406682  T
Q  502 atcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccct 601  Q
    ||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || || ||||||||||||||  | ||||    
T  5406683 at-gcagtcccataccggcacgactttaggatccctatcattccgatgtgattc-agttttgcttagaagc-tgtcatgagccggaccactctccaccct 5406779  T
Q  602 catcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  5406780 catcagcctcgagcgttacatg 5406801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 257 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7646712 - 7646514
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaa 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7646712 tttgtaacatcccagacgacttttaggattgtcgactaaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcggaa 7646613  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7646612 aactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagttaccgaaaacaagatgcatctt 7646514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 267 - 469
Target Start/End: Original strand, 13122363 - 13122567
Alignment:
Q  267 cccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccg 364  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  13122363 cccagactgctttcaggattgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccg 13122462  T
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13122463 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatatat 13122562  T
Q  465 gtagt 469  Q
    |||||    
T  13122563 gtagt 13122567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Original strand, 6747457 - 6747746
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||       |||    
T  6747457 tgtaacatcccagactgctttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacaagtcttttcaacttgttttgtcctcactcgcaagca-------aac 6747549  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
    |||||| |||||||||||||| || | | |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6747550 ttcccgataggtcacccatccaaagactacgataagtcaagcacgcttaactgtggagtttttatggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgttg 6747649  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6747650 atataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccat-gtagtatcatacctacacggcctcaggatccctctcattccaatgtgattca 6747746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 22529086 - 22529382
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  22529086 tgtaacatctcggacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacatgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcacacgcttaccgagaaa 22529185  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||| | ||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22529186 cttctcagtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtgaagttcttttgtaatgagttactgaaaagaagatgcatcttgtt 22529285  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22529286 tatatagatagtaccaaacatttcttataagccttccttcaaccat-gtaggcccatacttacatgacctcaggatccctctcattcggatatgattc 22529382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 334 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2465953 - 2465783
Alignment:
Q  334 cctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagc 432  Q
    ||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2465953 cctcactcgcatgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagc 2465854  T
Q  433 taccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2465853 taccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccat 2465783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 259 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 25182656 - 25182296
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||| |||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |   || |||    
T  25182656 tgtaacatccctgagtgcttttaggattttcgattgaccccacaacccaatacgagtttttttagcgtgttttgccctcactcgaacgctttttgagaaa 25182557  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| | |||||  |||||| || | | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  25182556 cttcccagaaggtcctccatccaaagactactccaagtcaaacacacttaactgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaataagatgtatcttgtt 25182457  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| | |||   || |||||| ||||||||||||||||| ||      
T  25182456 gatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtctcatacttgcacagtctcaggatctctctcattccgatgtgactcgt 25182358  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttaca 621  Q
    | ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||    
T  25182357 c-tttgcctagaagc-tgctaggagcctgaccactccccgcctttgtcatcctcgggcgttaca 25182296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 365 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 46425929 - 46425740
Alignment:
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46425929 gtaggtcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaataagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 46425830  T
Q  465 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  46425829 gtaataccaaacaattcttataagccttatttcaaccat-gtagtcccatacctacatggtctcaggatccctctcattccgatgtgattc 46425740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 293 - 544
Target Start/End: Original strand, 29357341 - 29357592
Alignment:
Q  293 tgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaa-aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| |   ||  ||||| |||| |||||| |||||  || | | |||     
T  29357341 tgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgcttttcgaggaacttaccggaaggtcatccatcttaagactactct 29357440  T
Q  392 aagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 491  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  29357441 aagtcaaacacggttaactgtgtagttcttatgaaacgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaacaattcttataaacat 29357540  T
Q  492 tccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattc 544  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||    
T  29357541 tccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacgacctcgggatacctctcattc 29357592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 300 - 439
Target Start/End: Original strand, 43776182 - 43776322
Alignment:
Q  300 acaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43776182 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcattcgcacgcttactggaaaacttccccgcaggtcacccattccaaaattgctccaagtcaa 43776281  T
Q  399 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaa 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43776282 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaa 43776322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 356 - 555
Target Start/End: Original strand, 35527070 - 35527268
Alignment:
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||| | ||||||||||||| | || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  35527070 aacttctcagtaggtcacccatgcaaagactactccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcctatggaatggactactgaaaagaatatgcatcttg 35527169  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  35527170 ttgatataggtagcaccaaacaattcttataagccttctttcaaccaac-cagtcccatatttgcacgacctcgggatccctctcatttcggtgtgattc 35527268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 11372719 - 11372453
Alignment:
Q  278 ttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaacttcccggtaggtcacccat 377  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||        | ||||||||||| |||   ||||| |||    
T  11372719 ttcaggattgctgagtgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactgatt----tccggaaaacttctcgg---gtcactcat 11372627  T
Q  378 cccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaca 477  Q
    ||||||||||||  ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  11372626 cccaaaattgctataagtcaaacgtgcttaactttggagttcttatggtttgagctaccaaaaataacatgcatcatgttggtacaggtagtaccaaaca 11372527  T
Q  478 attcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  11372526 attcttataagccttccttcaaccat-acaatttcatacctacatggccttgggaaccctctcgttccaatgtga 11372453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 463 - 623
Target Start/End: Original strand, 13124757 - 13124915
Alignment:
Q  463 aggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaactttt 562  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  13124757 aggtagtaccacacaattcttataagccttccttcaaccatg-cagtcccatacctgcacggcctcaagatccctctcattccaatatgattcag-tttt 13124854  T
Q  563 gcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13124855 gcctagaagcatgccaggagccagaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 13124915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 258 - 503
Target Start/End: Original strand, 26421610 - 26421856
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||| || |  | |  | ||    
T  26421610 ttgtaacatcccagacaactttaagcaatgacgactgaccctacataccaacacgagtattttcggcattctttgtcctcactcacatgttttccaagaa 26421709  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||   |||||||| |||| || | | ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26421710 acttcccataaggtcaccaatccaaagactactcgaagccaaacacgcttaactgtgtagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagattcatcttgt 26421809  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26421810 tggtatagggagtacctaacaattcttatgagccttacttcaaccat 26421856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 612
Target Start/End: Original strand, 31406440 - 31406787
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgac--cctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |  | |||    
T  31406440 taacatctcagtctgctttcaggattaccgactgacaccctacaaaccaacacatgtcttttcagcatgttttgtcctcactcacacgctttctaagaaa 31406539  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    | ||  |  ||| ||||||||| || | | ||||||    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31406540 cgtctaga-aggccacccatccaaagactactccaa----agcacgcttaactgtggagttcttatgaaacgggctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 31406634  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| | || |||||||||  |||||||| | || |||| | | |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  31406635 gatataggtaacaccaaacaattctaataagtcatctttcaaccat-tcagtcccagatctgcacggcttcaggatccctctcattttgatgtgattcga 31406733  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcg 612  Q
     |||||  ||||||| |  || |||| | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  31406734 tttttgtttagaagc-ttccaagagctgaaccactccccgccctcatcagcctcg 31406787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 257 - 436
Target Start/End: Original strand, 3305197 - 3305377
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaa 355  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | |    
T  3305197 tttgtaacattccagacgactttaagtattgctgactgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgttctcactcgcactcttaccagga 3305296  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctacc 436  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  3305297 aactttccggtaggtcacccatccaaagactactccaaatcaagcacgcttaactgtgaagtttttatgtaatgagctacc 3305377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 302 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 9623459 - 9623273
Alignment:
Q  302 aaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagc 400  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| | || |  | ||||||||| | | | ||||||||||| || | |  |||||||||| |    
T  9623459 aaaccaacatgagtctttacagcgtgctttgtcctcactcgaaggcttttcagaaaacttctcagaacgtcacccatccaaagactagtccaagtcaaac 9623360  T
Q  401 acgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 488  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9623359 acgcttaactgtggagttcttatagaatgaactaccg-aaagaagatgcatcttgttgatataggtggtatcaaacaattcttataag 9623273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 389 - 552
Target Start/End: Original strand, 26421287 - 26421449
Alignment:
Q  389 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 488  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26421287 tccaattcaaacacgtttaactgtggagttcttatggaatggactaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtagtatcaagcaattcttataag 26421386  T
Q  489 ccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
     |||||||||||||| || | |||||||||||| | ||| | || |||| |||||| |||||||    
T  26421387 tcttccttcaaccat-actgacccatacctacatggcctcaagaaccctatcattctgatgtga 26421449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 432 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 43233534 - 43233412
Alignment:
Q  432 ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttagg 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| | |    
T  43233534 ctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagtcttcctttaaccat-acagtcacatacctacacggcctcatg 43233436  T
Q  532 atccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  43233435 atccctctcatttcggtgtgattc 43233412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 369 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 20966235 - 20966055
Alignment:
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||     
T  20966235 gtcacccatcccaaaattgatacaagtcatgcatgtttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaataatatacatcttgttggtataggtat 20966136  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgt 550  Q
    ||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||| |||||||| | | ||| | || | |||||||||||||||    
T  20966135 tacaaaataattcttataagtcatccttcaatcat-gcagtctcatacctagatggcctcaagaccactctcattccgatgt 20966055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 257 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43233254 - 43233137
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaa 355  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43233254 tttgtagcatcccaatctgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaa 43233155  T
Q  356 aacttcccggtaggtcac 373  Q
    |||||| |||||||||||    
T  43233154 aacttctcggtaggtcac 43233137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1628899 - 1628766
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1628899 aggtcacccatcccaaaattgctccaagccaaatacacttaactatggagttcttatggtatgggcttcaaaaaagaagatgcatcttgttgatatcgat 1628800  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  1628799 agtaccaaacaa---ttataagcctttcttcaaccat 1628766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 400 - 554
Target Start/End: Original strand, 36015404 - 36015557
Alignment:
Q  400 cacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36015404 cacgtttaactgtgaagttcttatggaatgggctatttaaaagaagaggcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttttaagctttccttcaa 36015503  T
Q  500 ccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||   |||| ||||| | |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36015504 ccat-ggagtctcatacttgcactgccttgggatccctctcattccggtgtgatt 36015557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Original strand, 6747925 - 6748047
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  6747925 tttgtaacctctcagacgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgaaa 6748024  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcc 379  Q
    | | || ||||| ||||||||||    
T  6748025 aatacctggtagatcacccatcc 6748047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 417 - 503
Target Start/End: Original strand, 31743834 - 31743920
Alignment:
Q  417 ttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31743834 ttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagcaccaaaccattcttataagcattccttcaaccat 31743920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 453 - 555
Target Start/End: Original strand, 26957603 - 26957704
Alignment:
Q  453 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26957603 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccat-gtagttccatacctacacagcctcaagatccctctcattccgatgtga 26957701  T
Q  553 ttc 555  Q
    |||    
T  26957702 ttc 26957704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 400 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16192472 - 16192373
Alignment:
Q  400 cacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16192472 cacgcttcactgtatagttcttatggaatgggctaccaaaacgaagatgcatcttgttgatgtaggtaataccaaacaattcttataatccttcattcaa 16192373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36422677 - 36422591
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 345  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36422677 tgtaacatcccagattacttttagcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcac 36422591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 31743736 - 31743827
Alignment:
Q  255 tgtttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 346  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  31743736 tgtttgtaacatcccaaacgactttaagcattgtcgactaaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgcgttgacctcactcgcacg 31743827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Original strand, 26419104 - 26419168
Alignment:
Q  277 tttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactc 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26419104 tttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacatgttttgtcctcactc 26419168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37672332 - 37672221
Alignment:
Q  381 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt 480  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| | |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  37672332 aaaattgttcaaagtcaaacacgcttaactgtgtatttcttatgaaatcaactaacaaaaagaagttgcatcttgttggtacaagtagtaccaaacaatt 37672233  T
Q  481 cttataagcctt 492  Q
     |||||| ||||    
T  37672232 attataaacctt 37672221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 481
Target Start/End: Original strand, 7461344 - 7461424
Alignment:
Q  400 cacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 481  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  7461344 cacgcttaactgtagagttcttatg-aatgaactaccaaaaagaagatgtatcttgtttatatagttagtatcaaacaattc 7461424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 11373074 - 11372901
Alignment:
Q  374 ccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 473  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  |  |||||  |||||||||  |||||||||| ||||| || ||  |    
T  11373074 ccatcccaaaattg----aagtcaagcacacttaattgtgtagttcttatggtttaggctacgaaaaagaagactcatcttgttggtatagatactatga 11372979  T
Q  474 aacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||  || || |||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  11372978 aacaattcttacaagtcttcattcaaccat-gcaatctcatacctacatggccttaggaaccctctcattttgatgtga 11372901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 469 - 555
Target Start/End: Original strand, 3305374 - 3305459
Alignment:
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  3305374 taccaaacaattctcataagccttcattcaaccatgt-agtcccatacttacacggcctcaggatccccctcatttcgatgtgattc 3305459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43776381 - 43776324
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43776381 ttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactaaccccacaaaccaacacgagt 43776324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 487
Target Start/End: Original strand, 37671614 - 37671836
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||| | ||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||| |||||||||| ||||| |   || |||    
T  37671614 tgtaacatctcagacgactttaagtattg-caactgacccc-caaaccaacacgagactttttagtgtgtttggtcctcactcacacgctttatgagaaa 37671711  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||  |   |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||| | || ||||    ||| ||||||||    
T  37671712 cttttcaaaaggtgacccatcacaaaattgctccaattcaagcacgcttaaatgtggatttcatatgaaatgagttgccaaaaa----atgtatcttgtt 37671807  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataa 487  Q
    |  |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37671808 ggcataggtagtacc-aacaatttttataa 37671836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33316885 - 33316778
Alignment:
Q  391 caagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcc 490  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||     ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||       
T  33316885 caagtcaaacacgtttaattgtggagttcttatagtttgggctaccgaaaaga-----catcttgttgatataagtattgtcaaacaattcttataattt 33316791  T
Q  491 ttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||||||    
T  33316790 ttccttcaaccat 33316778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 6585787 - 6585662
Alignment:
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt--gttgatataggtagtacc 472  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |  |||| |||||   ||  ||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  6585787 catcctaaatttgcttcaagtcaagcacacttaactataaagtttttatgttttgc-ctaccaaaaggaagatgtatcttttgttgatataggtagtacc 6585689  T
Q  473 aaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||    
T  6585688 aaacaatttttataagtcttctttcaa 6585662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 345
Target Start/End: Original strand, 7461258 - 7461319
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 345  Q
    |||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7461258 attgtcgattgatcccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttatcttcactcgcac 7461319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 346
Target Start/End: Original strand, 36015318 - 36015407
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 346  Q
    ||||||||||| || | |  ||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36015318 tttgtaacatctcatattgtttttaggattgccgactaactctacaaactaacacgagtctttttagcgtattttgtcctcactcacacg 36015407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 2490136 - 2490093
Alignment:
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2490136 ttgatataggtagtaacaaacacttcttataagcattccttcaa 2490093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 461 - 503
Target Start/End: Original strand, 16811900 - 16811942
Alignment:
Q  461 ataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16811900 atagatagtacaaaacaattcttataagcattccttcaaccat 16811942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33316979 - 33316909
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 346  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  33316979 cttttaggattgtcgactgacctcacaaaccaacatgggtcttttcaacgtattttgtcattactcgcacg 33316909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Original strand, 26957545 - 26957594
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaaca 310  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  26957545 taacatcccagacgactttaagcattgccgactggccctacaaaccaaca 26957594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 30966986 - 30966622
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  30966986 ttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgactccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaa 30966887  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966886 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagttaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 30966787  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  30966786 tgatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccat-gcagtcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgcgattc- 30966689  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30966688 agttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 30966622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 261 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 30966527 - 30966166
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaact 359  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||    
T  30966527 taacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaact 30966428  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30966427 tcccggtaggtcacccatcccaaaattggtccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgttga 30966328  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaact 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  30966327 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgcgattc-agt 30966230  T
Q  560 tttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30966229 tttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccccaccctcatcagcctcgggcgttacatg 30966166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 24818620 - 24818258
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaa 357  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  24818620 tgtaacatccccgactactttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaa 24818521  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24818520 cttcccggtaggtcacccatcc-aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgtt 24818422  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24818421 gatataggtagtactaaacaattcttataagccttccttgaaccat-gcagtcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc-a 24818324  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24818323 gttttacctagaagcatgccaggagccggaccactccccaccctcatcagcctcgggcgttacatg 24818258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Original strand, 5399667 - 5400031
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  5399667 ttgtaacatcccagactgcttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtctttccagcgtgttttgttctcactcgcacgcttaccggaaa 5399766  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5399767 acttcctggtaggtcacccatcccaaaatttctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 5399866  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5399867 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctcccttaaaccat-acactcccatacttgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattca 5399965  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||    
T  5399966 a-ttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccctgccctcatcagcctcaggcattacatg 5400031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 258 - 556
Target Start/End: Original strand, 25337847 - 25338145
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||    
T  25337847 ttgtaacatctcagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaa 25337946  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25337947 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgt 25338046  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25338047 tgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattca 25338145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 300 - 623
Target Start/End: Original strand, 29259512 - 29259834
Alignment:
Q  300 acaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 398  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29259512 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaa 29259611  T
Q  399 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 498  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29259612 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattttaataagccttccttca 29259711  T
Q  499 accatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgc 598  Q
    |||||  ||||||||||| |  |||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29259712 accat-gcagtcccatacttgtacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattc-agtcttacctagaagcatgccaggagccggaccactccccgc 29259809  T
Q  599 cctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  29259810 cctcatcagcctcgagcgttacatg 29259834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 33175251 - 33174957
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||     
T  33175251 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaactaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaat 33175152  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33175151 ttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaa-cacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttg 33175053  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33175052 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 33174957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16379690 - 16379392
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    |||||||||| | |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |    
T  16379690 tttgtaacattcgagacaactttaagcattgtcgaatgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacagtga 16379591  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16379590 aacttcccggtaggtcacccatccaaagattactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttg 16379491  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  16379490 ttgatataggtagtaccaaacaattcgtataagtcttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattccaatttgattc 16379392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 259 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 33771296 - 33771037
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || |||    
T  33771296 tgtaacatcccagattgctttcagaattgccggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaa 33771197  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33771196 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 33771097  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacct 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  33771096 gatataggtagtaccaaacaattcttataagcctttcttcaaccct-gcagtcccatacct 33771037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 258 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 1912820 - 1912523
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  1912820 ttgtaacatcccagacgactttaagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaa 1912721  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1912720 acttcccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaatcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctacc-aaaagaagatgcatcttgt 1912622  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1912621 tgatataggtagtaccaaacaattcttataaatctactttcaaccat-gtagtctcatacctacataacctcaggatccctctcattccgatgtgattca 1912523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 304 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8256776 - 8256534
Alignment:
Q  304 accaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcac 402  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8256776 accaacatgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttatcggaaaacttcccagcaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcac 8256677  T
Q  403 gcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaacca 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8256676 gcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaacca 8256577  T
Q  503 tcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccg 546  Q
    |   ||||||||||||||| | | | | ||||||||||||||||    
T  8256576 t-gtagtcccatacctacaaggcttcaagatccctctcattccg 8256534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 257 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16379234 - 16378938
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaa 355  Q
    |||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |    
T  16379234 tttgtaacattccaaacaactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacccgga 16379135  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16379134 aacttcccgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttg 16379035  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgat 553  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| | |||| |||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  16379034 ttgatataggtagtatcaaacaattcgtataagacttccttcaaccat-gcagtctcatacttgcacggcctcggaatccctctcattccggtgtgat 16378938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 322 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41754521 - 41754287
Alignment:
Q  322 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41754521 agcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 41754422  T
Q  421 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |    
T  41754421 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctgc 41754323  T
Q  521 acgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  41754322 acggcctcaagaaccctctcattccggtgtgattca 41754287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 25433907 - 25434203
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaa 357  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||    
T  25433907 tgtaacatcccagatgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtccttactcacacgcttaccagaaaa 25434006  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| || |||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  25434007 cttccctgttggtcacccatccaaagaccactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccagaaaggagatgcatcttgtt 25434106  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25434107 gataaaggttgtatcaaacaattcttataagccttccttcaaccatga-agtcccataccagcacggcctcaggatccctctcattccggtgtgattc 25434203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 33174799 - 33174504
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    |||| |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||| |||||| |||| |||||||||| ||| |  |    
T  33174799 tttgcaacatcacatacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaacaaacacgggtctttctagcatgttttttcctaactcgcacgcttaccggga 33174700  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    | ||||||||| ||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33174699 atttcccggtatgtcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgt 33174600  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33174599 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaactgt---agtcccatacctacacggcatcaggatccctctcattccgatgtgattc 33174504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 365 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 29804870 - 29804681
Alignment:
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29804870 gtaggtcaaacatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 29804771  T
Q  465 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29804770 gtagtacccaacaattcttataagcctgccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 29804681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 355 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 11388385 - 11388188
Alignment:
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11388385 aaacttcctagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 11388286  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11388285 gttgatataggtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccat-gtagtctcatacctacacggcatcaggat-cctctcattccgatgtgatt 11388189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 1707336 - 1707041
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||    
T  1707336 tgtaacatcccagacgactttaagcattgccgactgaccctataaatcaacgcgaatctttttagcgtgttttgtattcactcgcacgcttaccgggaaa 1707237  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||| |||||||||||||||| || | | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1707236 cttcctggtaggtcacccatccaaagactacttcaagtcaaacactcttaactgtggagttcttatgagatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 1707137  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| |||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1707136 gatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaatcat-gtagtctcatacctacacagtctcaggat-cctctcattccgatgtgattc 1707041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 267 - 447
Target Start/End: Original strand, 32377575 - 32377756
Alignment:
Q  267 cccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccgg 365  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  32377575 cccagactgcttttaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaactttccgg 32377674  T
Q  366 taggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagat 447  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32377675 taggtcacctatcccaaaattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttttggaatgagctaccgaaaacaagat 32377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 83312 - 82952
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||     
T  83312 tgtaacatctcagactactttcatgattgccgaataaccccacaaaccaacataagtcttatcaacgtgttttgtcctcactcgcacactttctgaaaaa 83213  T
Q  359 tt-cccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    || |||   |||||||  ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  83212 ttaccctaaaggtcacatatcacaaaattgttccaaatcaaacacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaagattcatcttgtt 83113  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||   |||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  83112 ggtataggtagtaccaaacgattcttataagcataccttcaaccat-gtagtctcatacctgcacaatctcaggatccctctcatttcgacgtgattca- 83015  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
       |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  83014 --gttgcctagaagc-tgccaggagccagaccactctccgccctcgtcagcttcgggcgttacatg 82952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 259 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15640029 - 15639787
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||    
T  15640029 tgtaacatcccagacgactttaagcattgccgactgaccctaccaaccaacacgagtcttttctgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgagaaa 15639930  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || | | || ||||||||||| || |||||    
T  15639929 cttcccagtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttgtggattgggtttccaaaaagaagatgtatgttgtt 15639830  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaac 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  15639829 gatataggtagtaccaaacaattcctataagcgtgccttcaac 15639787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 257 - 421
Target Start/End: Original strand, 32377756 - 32377921
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32377756 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaa 32377855  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttctt 421  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32377856 aacttcccagtagatcacccatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttctt 32377921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 270 - 623
Target Start/End: Original strand, 30961745 - 30962104
Alignment:
Q  270 agactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtag 368  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| | ||    
T  30961745 agactcctttcatgattgccgattgaccccacaaactaacacaagtcttttcactgtgttttgtcctcactcgcacgctttctgagaaactacccagaag 30961844  T
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30961845 gtcacccatcccaaaattgctctaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggtttcggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtag 30961944  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaa-ccatca------cagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttt 561  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||| || || |||      || ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  30961945 taccaatcaaatcttataagacttccttaaatccttcaaccatgcaatcccatacctacacggcttcaggatctctctcattctgatgtgattcga-ttt 30962043  T
Q  562 tgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | ||||||||| || ||||||| | |||||||| | ||||   || ||||||||||||||||    
T  30962044 ttcctagaagc-tgccaggagctgaaccactccccacccttgacagcctcgggcgttacatg 30962104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 258 - 499
Target Start/End: Original strand, 30963113 - 30963355
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| | | || ||    
T  30963113 ttgtaacatccaaaactgctttcatgattgccgattgacctcacaaaccaacacgagtcttttcaacgtattttatcctcactcgcacgctttccgagaa 30963212  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  30963213 acttccaagaaggtcactcatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgttgaattcttatgatttgggctaccaaaaataagatgcatcttgt 30963312  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30963313 tgatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttcaa 30963355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 261 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15620195 - 15619897
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctac----aaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||  |||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  15620195 taacatctcagacgactttaagcatttccgactgaccctaccaattaaccaacacgagtcttttcagcgagttttgtcctcactcgcacgcttaccgaga 15620096  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | || ||||||||||| ||||||    
T  15620095 aacttcccagtaggtcacccatccaaagactactcaaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttatggattgggtttccaaaaagaagatgtatcttg 15619996  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||||| | |||| | |  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15619995 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcttgccttcaactat-gcagtctcatacttgcacggcatcgggatccctctcattctgatgtaattc 15619897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 355 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11394731 - 11394585
Alignment:
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11394731 aaacttcctagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaat-agctaccgaaaagaagatgcatctt 11394633  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11394632 gttgatataggtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccat 11394585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 403 - 555
Target Start/End: Original strand, 18098874 - 18099025
Alignment:
Q  403 gcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaacca 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18098874 gcttaactatggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaacca 18098973  T
Q  503 tcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |   |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18098974 t-gtagtctcatacctacacggcctcaggattcctctcattccgatgtgattc 18099025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 27882779 - 27883073
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||    
T  27882779 tttgtaacatctcagacgactttgagcattgctgactga----acaaaccaacaagattcttttcagcgtgttttgtcctgacttgcacacttaccgaaa 27882874  T
Q  357 a-cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    | |||| | |||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||     
T  27882875 aacttctcagtaggtcacctatccaaagactactccaagtcaaacacgcttaattgtggagttcttatggaacggcctacaaaaaagaagatgcatctta 27882974  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  27882975 ttgatatagataataccaaacaattcttataagcattccttcaacaat-gcagtctcatacatgcacggcctcaggatccctctcatttcggtgtgattc 27883073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 258 - 503
Target Start/End: Original strand, 30963568 - 30963816
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgt--cgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga- 354  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||  ||  ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  | | ||     
T  30963568 ttgtaacacccaagacttctttcaggaaagtgccgactgatcccacaaaccaaaacgagtcttttcactgtgttttgtcctcactcgcacggtttccgac 30963667  T
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||||  | |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||  ||||||||||||||||    
T  30963668 aaacttcctagaaggtcacctatcccaaaactccgccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggtttgggctaccagaaagaagatgcatctt 30963767  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30963768 gttgatataggtagaaccatacaattcttataagttttccttcaaccat 30963816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 362 - 554
Target Start/End: Original strand, 38898867 - 38899058
Alignment:
Q  362 ccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgata 461  Q
    ||||||||||||| |||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38898867 ccggtaggtcacctatccaaagactactctaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgtgttaccaaaaagaaaatgcatcttgttgata 38898966  T
Q  462 taggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||  ||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  38898967 taggtagtaccaaacaattcttataagctctccttcaaccat-gtagtctgatacctacacggcctcaagatcactctccttccgatgtgatt 38899058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 257 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 13191271 - 13191024
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || || ||||| |   || |    
T  13191271 tttgtaacatcccatatgactttcaagattgtcgactgactccataaaccaacactagtctttttagcgtgttttgtccgcattcacacgctttttgaga 13191172  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||| || | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  13191171 aactttccagaaggtcacctatctcaaaatttcttcaagtcaagcacacataactatggagttcttataaaatggactaccaaaaagaagatgcatcttg 13191072  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13191071 ttggtatatgtagtaccaaacaattcttataagtcttccttgaaccat 13191024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 8074185 - 8073902
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaact 359  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||| | |   || |||||    
T  8074185 taacagcccagataactttcaagattgtcgactgatcccacaaacaaacacaagttttttcatcgtgttttgttctcaatcacacacttttcgagaaact 8074086  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    | | || ||||||| ||||||||||||   |||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||     
T  8074085 ttctggaaggtcactcatcccaaaatttaaccaagtcaagaaggcttatctatggagttcttatgaaatgggctacaagaaagaagatgcatcttgttgg 8073986  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | || ||||||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  8073985 tataggtagtaccaaacaattcttataagtctcccttcaacc-ttatagacccatacctgcacaatctcatgatccctctcattc 8073902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 367 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 1953341 - 1953100
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    |||| |||||||||||||| || | |||| ||||| |||||||  || |||  ||||||  ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1953341 aggtaacccatcccaaaatagcgcaaagttaagcatgcttaaccatgaagtaattatggtttggactaccaaaaagaagatgcatctagttgatataggt 1953242  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcct 566  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  1953241 agtaccaaacaattcttataggtcttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattc-ggttttgcc- 1953145  T
Q  567 agaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcg 612  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1953144 aaaagc-tgtcagaagccggaccactccttgccctcatcatcctcg 1953100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 519
Target Start/End: Original strand, 8181212 - 8181462
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcagg-attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaa 356  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  8181212 tgtaacatcccagacgacttttaagcattgtcgactgacc-tgcaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacgtttatcggaaa 8181310  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgga----atgagctaccgaaaagaagatgcatc 452  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  | | |||||    | |||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||| |           |||    
T  8181311 acttcccagtaggtcacccatccaacgactactcca---gatgcacgcttaactgtggagtttttatggaatatatgagctaccaa-----------atc 8181396  T
Q  453 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccataccta 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8181397 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttaaaagtcttccttcaacca-caaagtcccataccta 8181462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 399 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20502176 - 20502023
Alignment:
Q  399 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 498  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502176 gcacgtttaattgtgaagttcttatgaaatgggctaccaaaaa-aagaagcatcttgttgatatagaaagtaccaaacaattcttataagccttccttca 20502078  T
Q  499 accatcacagtcccatacctacacgacc--ttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    |||||  ||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  20502077 accat-gcagtcccatacttgcacgaccttttgggatccctctcattccggtgtga 20502023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 375 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16542164 - 16542035
Alignment:
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagcta-ccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 473  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16542164 catcctaaaattgctccaagtcaaacacatttaactgtagagtttttatggaatgagctataaaaaaaaaagatacatcttgttgatataggtagtacaa 16542065  T
Q  474 aacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16542064 aacaattattataagtcttccttcaaccat 16542035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 443 - 555
Target Start/End: Original strand, 18447954 - 18448065
Alignment:
Q  443 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcat 542  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18447954 aagatgcatcttgttgatacaagtagtaccaaacaattcttataagtcttacttcaaccat-gtagtcacatacctacacggcctcaggatccctatcat 18448052  T
Q  543 tccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||    
T  18448053 tccgatgtgattc 18448065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 259 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 37552860 - 37552632
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    ||||||||| | |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||| |  |  ||| |||    
T  37552860 tgtaacatctccgacagctttcaagactgtcgactgaccctacaaaccaacacgggtattttaagcgtgttttttcctcaatcgcatgattttcgggaaa 37552761  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||  | | ||||  ||| ||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||| | ||    
T  37552760 cttttcagaaggtttcccgtcccagaattgattaaagtcaagcatgcttaactgtggaattcttacggaatgcgctgccaaaaagaaga-gcatcatttt 37552662  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataag 488  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37552661 g-tatatgtagtaccaaacaattcttataag 37552632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20502258 - 20502172
Alignment:
Q  260 gtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 346  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502258 gtaacatcccagacaactttaaaaattgccgactgaccctacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 20502172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29804943 - 29804871
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29804943 ttgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttt 29804871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 40287017 - 40287085
Alignment:
Q  10 acatcatcacaaatggtggggctatgatcagatggggctactttcgctaattcatgagcgaccccatta 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40287017 acatcatcataaatggtggggctaggatcagatggggctaccctcgctaattcatgagtgaccccatta 40287085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 438 - 502
Target Start/End: Original strand, 36924453 - 36924519
Alignment:
Q  438 aaaagaagatgcatcttgttgatatag--gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaacca 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36924453 aaaagaagatgcatcttgttgatatataagtaataccaaacaattcttataagccttccttcaacca 36924519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11389771 - 11389693
Alignment:
Q  266 tcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgca 344  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  11389771 tcccagatgacttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacatgagttttttcagcatgttttattctcactcgca 11389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11406432 - 11406354
Alignment:
Q  266 tcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgca 344  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  11406432 tcccagatgacttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacatgagttttttcagcatgttttattctcactcgca 11406354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 36924362 - 36924420
Alignment:
Q  289 cgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36924362 cgactaactctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 36924420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 9909214 - 9909102
Alignment:
Q  431 gctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttag 530  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| || |||||||||||| | |||| ||||| || ||||  | ||    
T  9909214 gctaccaaaaagaagttgaatcttgttggtataggtagtaccaattaatcattataaaccctccttcaaccat-atagtctcatacttatacgatttcag 9909116  T
Q  531 gatccctctcattc 544  Q
    ||||||||||||||    
T  9909115 gatccctctcattc 9909102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 429
Target Start/End: Original strand, 18875866 - 18876007
Alignment:
Q  289 cgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg-catacggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattg 387  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||   | |   ||||||  | | || ||||||||||||||||||    
T  18875866 cgactgtccccacaaaccaacacgtgtctttacagtgtgttttgtcctcactcgcacgattttcaagaaacttttcagaagatcacccatcccaaaattg 18875965  T
Q  388 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatg 429  Q
    ||| || ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  18875966 ctcaaaatcaagcacgctaagttgttgagtttttatggaatg 18876007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 496
Target Start/End: Original strand, 26864791 - 26864905
Alignment:
Q  381 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt 480  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||  || ||||||||   | ||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||    
T  26864791 aaaattgttctaagtcaatcacgcttaacgatgaagttcttaac-attgacctaccaaatggaagatgcatcttgtcgatgtaggtagtaccaaagagtt 26864889  T
Q  481 cttataagccttcctt 496  Q
    |||| |||||||||||    
T  26864890 cttacaagccttcctt 26864905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1952998 - 1952921
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtc 334  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  1952998 tttgttacatctcagactatttttaggagtgccgactgaccccacaaaccaacacgggtctttttagcgtgttctgtc 1952921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 339
Target Start/End: Original strand, 38898777 - 38898856
Alignment:
Q  260 gtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcac 339  Q
    |||| ||| ||||| ||||| || |||||||| |||   |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38898777 gtaatatctcagacaactttaagcattgtcgattgataatacaaaccaacttgagtcttttcagcgtgttttgtcctcac 38898856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Original strand, 26865121 - 26865189
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgca 344  Q
    |||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  26865121 cttttaggatttccgaatgaccccacaaaccaacacggatcttttcagcatgctttgtcctcactcgca 26865189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Original strand, 31284127 - 31284490
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||    
T  31284127 tgtaacatcccagattgctttcatgattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcggcgtgttttgtccccactcgcacgcttgtcggaaaa 31284226  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284227 cttcccggcaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 31284326  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31284327 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattc-a 31284424  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31284425 gttttgcctagaagcatgccaggagtcggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgatacatg 31284490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 259 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 8067575 - 8067216
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  8067575 tgtaacatcccagactgcttttaggattgccgattgacctcacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaa 8067476  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8067475 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgtt 8067376  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8067375 gatataggtagtactaaacaattcttataagccggccttcaaccat-gcaatcccatacctgcacggcctcagggtccctctcattccgatgtgattcaa 8067277  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgtta 619  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8067276 -ttttgcttagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgtta 8067216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 239 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16811694 - 16811380
Alignment:
Q  239 aacaatttcaatagtgtgtttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctca 338  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  16811694 aacaatttcagcagagtttttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgt--tttgtcctca 16811597  T
Q  339 ctcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccg 437  Q
    |||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16811596 ctcgcatgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttatggaatgagctaccg 16811497  T
Q  438 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccct 537  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  16811496 aaaagaagatgcatcttgttgaaataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-ggagtcccaaacctacacggcctcaggatccct 16811398  T
Q  538 ctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16811397 ctcattccgatgtgattc 16811380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 267 - 621
Target Start/End: Original strand, 27187188 - 27187542
Alignment:
Q  267 cccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccg 364  Q
    ||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  27187188 cccagactgttttcagaattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccg 27187287  T
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27187288 gtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttagtgatatag 27187387  T
Q  465 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  27187388 gtagtaccaaacaattcttataagccttcatttaaccat-gcagtcccatacatgcacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattcaa-tttttc 27187485  T
Q  565 ctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttaca 621  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27187486 ctagaagcttgctaggagccggaccacttgccgccctcatcagcctcgggcgttaca 27187542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 257 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 39653461 - 39653162
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  39653461 tttgtaacatcccagactgcttttagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccggga 39653362  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39653361 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactgtggagttctcatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 39653262  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39653261 ttgatataggtagtatccaacaattcttataagctttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 39653163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 261 - 546
Target Start/End: Original strand, 11179887 - 11180172
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaact 359  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||     
T  11179887 taacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacacttaccgggaaaca 11179986  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11179987 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 11180086  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccg 546  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  11180087 tataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccg 11180172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 28562040 - 28561744
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  28562040 tgtaacatctcatactgctttcaagattaccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 28561941  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28561940 cttccccgtaggtcacc-atcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 28561842  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28561841 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattca 28561744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 257 - 503
Target Start/End: Original strand, 13150403 - 13150650
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  13150403 tttgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccggga 13150502  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150503 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 13150602  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150603 ttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat 13150650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 32227072 - 32227368
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||| || |||    
T  32227072 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttttcctcactcgcacacttaccgggaaa 32227171  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32227172 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 32227271  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32227272 aatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattc 32227368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 50348041 - 50347745
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||    
T  50348041 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttatcgggaaa 50347942  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50347941 cttctcggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 50347842  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  50347841 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaacca-agtagtctcatacatacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattc 50347745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 262 - 555
Target Start/End: Original strand, 13149953 - 13150246
Alignment:
Q  262 aacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaactt 360  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||    
T  13149953 aacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacacttaccgagaaactt 13150052  T
Q  361 cccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgat 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13150053 cccggtaggtcacccattccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgat 13150152  T
Q  461 ataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  13150153 acaggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattc 13150246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 32227795 - 32227500
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| | || ||| |||    
T  32227795 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttttcctcactcgcacacttatcgggaaa 32227696  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32227695 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 32227596  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  32227595 aatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggcctca-gatccctctcattccggcgtgattc 32227500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 14814246 - 14813948
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |    
T  14814246 tttgtaacatcccagactgctttcagtattgccgactaaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacgcttaccggga 14814147  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  14814146 aacctttcggtaggtcacccatcacaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatctta 14814047  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14814046 ttgatataggtagtaccaaacaattattataagccttcctttaaccat-gcagtctcatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 14813948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 258 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 25248408 - 25248046
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagt-tttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  |    
T  25248408 ttgtaacatcccagactgcttttaggattgtcgactaacctcacaaatcaacacgagtctttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgtga 25248309  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25248308 aacttcccggtaggtcatccatcataagactactccaagtcaagcacgctgaaccgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttg 25248209  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25248208 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattcctttaaccat-gcagtcccatacctgcacggccttagaatccctctcattccgatgtgattc 25248110  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttac 620  Q
     | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  25248109 -agttttgcctataagcatgccaggagcctgaccactccccaccctcattagcctcgggcgttac 25248046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16811222 - 16810924
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |    
T  16811222 tttgtaacatcccagattgctttcaggattgccgaccgaccccacaaaccaacacgaatcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttacgggga 16811123  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16811122 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctacaagtcaagcacacttaaatgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 16811023  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16811022 tagatatagttagtacgcaacaattcttataagccttccatcaaccat-gcagtcccatatctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattc 16810924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 14820449 - 14820153
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| || |||    
T  14820449 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcatgcttaccgggaaa 14820350  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14820349 ctttccgataggtcacccatcccaaaattgttccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaataagatgcatcttgtt 14820250  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  ||| ||||||||||||||  || |||| |||||||||| || ||||||||    
T  14820249 gatataagtagtaccaaacaattcttataagccttcctttagccgt-gcagccccatacctacacgggctcaggaaccctctcattgcggtgtgattc 14820153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 269 - 523
Target Start/End: Original strand, 32386595 - 32386849
Alignment:
Q  269 cagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggta 367  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||||     
T  32386595 cagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcggacgcttaccaagaaactttccggtg 32386694  T
Q  368 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32386695 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctactgaaaagaagatgcatcttgttaatataggta 32386794  T
Q  468 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacg 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32386795 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-acagtcccatacctgcacg 32386849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 258 - 554
Target Start/End: Original strand, 25230098 - 25230394
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  25230098 ttgtaacatctcaaacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacactagtctttccaacgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccggaaa 25230197  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||| | |||||||||||||  || | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  25230198 acttcctgataggtcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcataactgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgt 25230297  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25230298 tgatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatt 25230394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 258 - 554
Target Start/End: Original strand, 25237685 - 25237981
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  25237685 ttgtaacatctcaaacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacactagtctttccaacgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccggaaa 25237784  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||| | |||||||||||||  || | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  25237785 acttcctgataggtcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcataactgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgt 25237884  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25237885 tgatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatt 25237981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 259 - 554
Target Start/End: Original strand, 20884968 - 20885263
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| |||    
T  20884968 tgtaacatcccaaacgactttaagcattgcagactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctaacttgcacgcttaacgggaaa 20885067  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
     ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  20885068 tttcccggtaggtcacccatccaaatactactccaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttatggaatgtgctactaaaaagaagatgcatcttgtt 20885167  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20885168 gatataggtagtatcaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gtagtcacatacctacacgacctcaagatccctctcattgcgatgtgatt 20885263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 37045327 - 37045034
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||     
T  37045327 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttatcgggaa- 37045229  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
      |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  37045228 --tcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatagggtaccaaaaagaagatgcaccttgtt 37045131  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||   ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37045130 gatataggtattaccaaacaattcttataagcattccttcattcat-gtagtcccacacctacacggcctcaggatccctctcattcagatgtgattc 37045034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 355 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 41472498 - 41472233
Alignment:
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41472498 aaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgtttcaagtcaagcacgtttaaccgtggagttcttatggaatgatctaccgaaaagaagatgcatctt 41472399  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41472398 gttgatatatgtagtaccaaacaattcttataag-cttccttcaaccat-gcagtctcatacctgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgatt 41472301  T
Q  555 caacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | | | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  41472300 c-agtcttgcctagatgcatgccaggagccggaccactcaccaccctcttcagccttgggcgttacatg 41472233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 30529981 - 30529685
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| || |||    
T  30529981 tgtaacatcctagacaactttaagcattgccgactaaccctgcaaaccaacacaagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttactgggaaa 30529882  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||| | |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30529881 cttccag-taggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 30529783  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30529782 gatataggtagtaccaaaaaattcttataagccttacttcaaccat-gtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattca 30529685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 257 - 554
Target Start/End: Original strand, 25230554 - 25230851
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||| | || |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |    
T  25230554 tttgtaacatcctaaacgactttatgcattgtagactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgatctcactcgcacgcttaccggga 25230653  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  25230654 aacttcccagtagggcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcttaattgttgagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttg 25230753  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25230754 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataaaccttccttcaaccat-gtagtctcatacctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatt 25230851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 257 - 554
Target Start/End: Original strand, 25238141 - 25238438
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||| | || |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |    
T  25238141 tttgtaacatcctaaacgactttatgcattgtagactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgatctcactcgcacgcttaccggga 25238240  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  25238241 aacttcccagtagggcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcttaattgttgagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttg 25238340  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25238341 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataaaccttccttcaaccat-gtagtctcatacctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatt 25238438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 258 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 7477487 - 7477125
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| | | || ||    
T  7477487 ttgtaacatcctagacgactttaagaattgtcgactgaccccacataccaacatgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgctttccgagaa 7477388  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    | |||||   |||||| |||||| || | | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  7477387 atttcccataaggtcagccatcctaagactactctaagtcaagcatgcttaaatgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgtatcttgt 7477288  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7477287 tgatataagtagtaccaaaaaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacgactttaggatccctctcattccgatgtgatt-a 7477190  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
      |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||    
T  7477189 tgttttgcctagaaac-tgccaggagtcggaccactccccgtcctcatcagcctcgagcattacat 7477125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 258 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 7494177 - 7493815
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcat-acggaaa 356  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||    
T  7494177 ttgtaacatcctagacgactttaagaattgtcgactgaccccacataccaacatgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgctttacgggaa 7494078  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    | ||||  | |||||| |||| | || |   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7494077 atttcctagaaggtcagccatgctaagacaactccaagtcaagcatgcttaaatgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgt 7493978  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7493977 tgatataagtagtaccaaaaaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacgactttaggatctctctcattccgatgtgatt-a 7493880  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
      ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||    
T  7493879 tgttttgcctagaagc-cgccagaagccggaccactccccgtcctcatcagcctcgagcattacat 7493815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 259 - 501
Target Start/End: Original strand, 4067212 - 4067454
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaa 357  Q
    |||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||    
T  4067212 tgtaacatcc-agacgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacactggtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccagaaaa 4067310  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4067311 ctttccggtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgtaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 4067410  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaacc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4067411 gatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttccttcaacc 4067454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 257 - 503
Target Start/End: Original strand, 25238533 - 25238780
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||    
T  25238533 tttgtaacatcccagacgactttaaccattgccgaccgaccatacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccaaaa 25238632  T
Q  357 a-cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    | ||||||| ||||||||| |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25238633 aacttcccgataggtcaccaatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttg 25238732  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25238733 ttgataaagatagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat 25238780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 302 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 41474249 - 41473929
Alignment:
Q  302 aaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagc 400  Q
    |||| |||| |||| |||||| | ||||||||  |||| ||||||  ||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41474249 aaactaacatgagtcttttcaacatgttttgtattcacccgcacgattactgggaaactttctggtatgtcacccatcccaaaattgttccaagtcaagc 41474150  T
Q  401 acgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaac 500  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41474149 acgcttgactgtggagtttttatagaatgatccaccaaaaagaatatcaatcttgttgatataggaagtatcaaacaattcttataagtcttcctttaac 41474050  T
Q  501 catcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccc 600  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41474049 catc-cagtcacatacctgaacgacctcaagatccctctcatttcgatgtgattc-agtcttgccgagaagcatgctaggagccggaccactccccgccc 41473952  T
Q  601 tcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||| |||| |||||||||||    
T  41473951 tcatcagcctcaggcgttacatg 41473929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2911379 - 2911094
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||     
T  2911379 tgtaacatcccacacgactttaagcattgtcgattgatcctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaa- 2911281  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
             |||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2911280 ---------ggtcactcatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttg 2911190  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| | ||| |||||||||    ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2911189 atataggtaatatcaaacaatttttataaccattctttcaaccat-gtggtcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattcaggtgtgattc 2911094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 365 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 39641125 - 39640936
Alignment:
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    |||||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39641125 gtaggtcaccaatccaaagactgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttattgatatag 39641026  T
Q  465 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39641025 gtagtaccaaacaactcttataagtcttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacggcctcaggatctctctcattctgatgtgattc 39640936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 259 - 545
Target Start/End: Original strand, 25802399 - 25802685
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |   || |||    
T  25802399 tgtaacatctcaaacgactttaagcattgttgactgaccctacaaaccaacacacgtcttttcagcgtgttttgaccttactcgcactcttttcgagaaa 25802498  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||  | ||||||||| ||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25802499 cttcctagaaggtcacccgtcctaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggatttcttatggaatgggctatcgaaaagaagatgcatcttgtt 25802598  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattcc 545  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||  ||||| |||||||||| | ||  | |||||||||||||||    
T  25802599 gatataggtagtaccaaaccattcttatcagccttccgttaaccat-gcagtctcatacctacatggccacatgatccctctcattcc 25802685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 400 - 555
Target Start/End: Original strand, 25239070 - 25239224
Alignment:
Q  400 cacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25239070 cacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaattcttataagcgttccttcaa 25239169  T
Q  500 ccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  25239170 ccat-atagtcccatacctacacgacctcagaatccctctcataccggtgtgattc 25239224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 29224510 - 29224326
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29224510 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaattgtgaagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttagtataggt 29224411  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| | || |||| |||||| |||||||    
T  29224410 agtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtctcatatctacatggcctcatgaaccctttcattctgatgtga 29224326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 367 - 555
Target Start/End: Original strand, 25802964 - 25803151
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    ||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  25802964 aggtcacccatcctaagactagtccaagtcaagcacgcttaactacggagttcttatgaaatgggataccgaaaagaagatacatcttgtttttataggt 25803063  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25803064 agtaccaaacaattcttacaagtcttacttcaaccat-gcagtcccatacctacacgacattaggaaccctcttattccgatatgattc 25803151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 284 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15405816 - 15405606
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |   |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15405816 attgtcgcctgaccttacaaaccaacacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaa 15405717  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  15405716 aattgatccaagtcaagcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattct 15405617  T
Q  483 tataagccttc 493  Q
    |||||||||||    
T  15405616 tataagccttc 15405606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 284 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15392780 - 15392570
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| | |   |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15392780 attgtcgccttaccttacaaaccaacacgagttctttcagcgtgctatgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaa 15392681  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  15392680 aattgatccaagtcaagcacatttaactttggagttctgatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattct 15392581  T
Q  483 tataagccttc 493  Q
    |||||||||||    
T  15392580 tataagccttc 15392570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 272 - 464
Target Start/End: Original strand, 53150676 - 53150869
Alignment:
Q  272 actactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggt 370  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |   || ||||||| |   ||||    
T  53150676 actactgtcaggattgttgactgaccccacaaactaacatgagtcttttcaacatgttttgtcctcactcgcccgctttttgggaaacttctcataaggt 53150775  T
Q  371 cacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  53150776 cacccatcccaaaattgctccaagttaagcacggttaactgtgaagttcttatgaaattggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttaatatag 53150869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 519 - 623
Target Start/End: Original strand, 32388842 - 32388945
Alignment:
Q  519 acacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgtt 618  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32388842 acacgacctcaggatccctctcattccgatgtgattcaa-ttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgtt 32388940  T
Q  619 acatg 623  Q
    |||||    
T  32388941 acatg 32388945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 408 - 555
Target Start/End: Original strand, 32796936 - 32797082
Alignment:
Q  408 actgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcaca 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |    
T  32796936 actgtggagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccat-gta 32797034  T
Q  508 gtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||  |||||||||| |  || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32797035 gtttcatacctacatggtctcaggatccctcttatttcgatgtgattc 32797082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 284 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15388413 - 15388203
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| | |   |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15388413 attgtcgccttaccttacaaaccaacacgagttctttcagcgtgctatgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaa 15388314  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||    
T  15388313 aattgatccaagtcaagcacatttaactttggagttctgatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtactggtaatacgaaacaattct 15388214  T
Q  483 tataagccttc 493  Q
    |||||||||||    
T  15388213 tataagccttc 15388203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 284 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15411225 - 15411015
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| |||| | |   ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15411225 attgtcgtctgaccttacaaaccaacacgggttctttcaccgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccaaaaggtcacccatcccaa 15411126  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  15411125 aattgatccaagtcaagcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattct 15411026  T
Q  483 tataagccttc 493  Q
    |||||||||||    
T  15411025 tataagccttc 15411015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 284 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15417641 - 15417431
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |   |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15417641 attgtcgccggaccttacaaaccaatacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaa 15417542  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  15417541 aattgatccaagtcaagcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattct 15417442  T
Q  483 tataagccttc 493  Q
    |||||||||||    
T  15417441 tataagccttc 15417431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3900096 - 3899868
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||||| || | |||||| ||||  ||||||||| ||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||  |||| ||||| |   || ||    
T  3900096 ttgtaacatcccataccattttcagaattgctgactgaccccacagatcaacacgagtcttttcaccttgttttgtccatactcacacgctttttgggaa 3899997  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||   || | |  |||||| ||||||||||||||    
T  3899996 actttccagaaggtcacccataccaaaattgctccaagtcaagcatgctttattgtggagttcttatgatttgtgttgtcgaaaaaaagatgcatcttgt 3899897  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttat 485  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||    
T  3899896 tggtatatgtagtaccaaacaattcttat 3899868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 487 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 12820710 - 12820576
Alignment:
Q  487 agccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccgg 586  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  12820710 agcctttcttcaaccatg-cagtcccatacctgtacggccttagaatccctctcattccgatgtgattcag-ttttgcctagaagcatgcaaggagccgg 12820613  T
Q  587 accactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12820612 accactccccgccctcatcagcctcgagcgttacatg 12820576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 286 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15377552 - 15377344
Alignment:
Q  286 tgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaa 384  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| |||| | |   |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15377552 tgtcgcctgaccttataaaccaacacgggttctttcaacgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaa 15377453  T
Q  385 ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 484  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||     | ||| |||||||||  ||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  15377452 ttgatccaagtcaagcacatttaactgtggagttctaatggtcctgggtactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccagtaataccaaacaattctta 15377353  T
Q  485 taagccttc 493  Q
    |||||||||    
T  15377352 taagccttc 15377344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 503
Target Start/End: Original strand, 26309839 - 26310085
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc-atacggaaa 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  |||||  ||| |||| ||||||||||| |||| |||| || || ||||||| ||||| |||||| || | | ||    
T  26309839 ttgtaacatcccagacgactttaattattgttaactaaccccacaaaccaacatgagtcttttgagtgtattttgtcttcacttgcacgctatccaggaa 26309938  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    || ||| |  || |||||||||||||||||| |  |||||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  26309939 acatcctgaaagatcacccatcccaaaattgttttaagtcaaatacatttaactgtcgagttctaatggaatgagctaccataaagaagatgcatctttt 26310038  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    || |||| |||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  26310039 tggtatatgtagtaacaaaaaattcttataaatcgtccttcaaccat 26310085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Original strand, 25238976 - 25239066
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25238976 tttgtaacatctcatacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgc 25239066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 15376251 - 15376056
Alignment:
Q  299 tacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 397  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||| | |   ||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15376251 tacaaaccaacacgggttctttcagcgtgctttgtcatcacttgcacacttttaggaaaacttcccaaaagttcacccatcccaaaattgatccaagtca 15376152  T
Q  398 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttc 493  Q
    |||||  |||||| ||||||||| ||||     | ||| |||||||||  ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15376151 agcacatttaactttggagttctaatggtcctgggtactgaaaagaagtggcatcttgttggtacctgtaataccaaacaattcttataagccttc 15376056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41473838 - 41473748
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41473838 tttgtaacatctcatactgctttcacgattggcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 41473748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 341
Target Start/End: Original strand, 25230946 - 25231030
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactc 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25230946 tttgtaacatcccagacgactttaaccattgccgaccgaccatacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 25231030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 382 - 503
Target Start/End: Original strand, 31103933 - 31104056
Alignment:
Q  382 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgag--ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 479  Q
    ||||| ||| |||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31103933 aaattactcaaagtcaaagacacttaaatgtgaagttcttatggaatgagagctaccaaaaagaaaatgcatctagttggtatagatagtatcaaacaat 31104032  T
Q  480 tcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  31104033 tcttataagtcttccttgaaccat 31104056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18318951 - 18318862
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18318951 ttgtaacatcacagacgactttctggattgccgattgtcccaacaaaccaacccgaatcttttcagcgtgttttgttctcactcgcacgc 18318862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 503
Target Start/End: Original strand, 47518295 - 47518415
Alignment:
Q  380 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 479  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| |||  |||| ||||||||||||||||    || || ||||||||||||| || || ||||  ||||||||    
T  47518295 caaaattgctccaaatcaagctcacttaattgtaaagttattatggaatgagctac---taaaaaaatgcatcttgttggtagagatagtttcaaacaat 47518391  T
Q  480 tcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  47518392 tcttataagttttccttcaaccat 47518415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 37796716 - 37796648
Alignment:
Q  10 acatcatcacaaatggtggggctatgatcagatggggctactttcgctaattcatgagcgaccccatta 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||    
T  37796716 acatcatcataaatggtggggctaggatcagatggggctaccctcgctaatttgtgagcgacctcatta 37796648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15410698 - 15410629
Alignment:
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    |||||||| | ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15410698 aacttcccagaaggtttcccatctcaaaattgatccaagtcaagcacacttaaatgtggagttcttatgg 15410629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3890094 - 3890046
Alignment:
Q  437 gaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttat 485  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3890094 gaaaaaaagatgcatcttgttgatatatgtagtagcaaacaattcttat 3890046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15381310 - 15381258
Alignment:
Q  373 cccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15381310 cccatctcaaaattgatccaagtcaagcacacttaaatgtggagttcttatgg 15381258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15396545 - 15396493
Alignment:
Q  373 cccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15396545 cccatctcaaaattgatccaagtcaagcacacttaaatgtggagttcttatgg 15396493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 43736715 - 43736777
Alignment:
Q  401 acgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatata 463  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  43736715 acgcttaacagtgaaattcttatgaaatgagctaccaacaagaagatgcatattgttgatata 43736777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15373748 - 15373696
Alignment:
Q  373 cccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  15373748 cccatctcaaaattgatccaagtcaagcacacctaaatgtggagttcttatgg 15373696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Original strand, 18547418 - 18547474
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagt 315  Q
    ||||||||||||  | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18547418 tgtaacatcccaatcgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagt 18547474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30477344 - 30477270
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtc 334  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30477344 tgtaacatcctagactgcttttaagattgttgactgacctcataaatcaacacgagt-ttttcagcgtgttttgtc 30477270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39641219 - 39641133
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 345  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  |||| ||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  39641219 tgtaacatcccagacgattttaaacattgccgacttaccctacaaatcaacataagtcttttcagtgcattttgtcctcactcgcac 39641133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12763023 - 12762939
Alignment:
Q  371 cacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||| |||||  |  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  12763023 cacccatcccaaaatt-ctccaagtcaagtacaattacctgttgagttcctatggtttaggctacctaaaagacgatgcatcttgt 12762939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 495
Target Start/End: Original strand, 25238816 - 25238845
Alignment:
Q  466 tagtaccaaacaattcttataagccttcct 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25238816 tagtaccaaacaattcttataagccttcct 25238845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 381 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15392227 - 15392183
Alignment:
Q  381 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15392227 aaaattgatccatgtcaagcacacttaaatgtggagttcttatgg 15392183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 373 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15417096 - 15417045
Alignment:
Q  373 cccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15417096 cccatctcaaaattgatc-aagtcaagcacacttaaatgtggagttcttatgg 15417045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 10594 - 10232
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaa 357  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  10594 tgtaacatccccgactactttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaa 10495  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10494 cttcccggtaggtcacccatcc-aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgtt 10396  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10395 gatataggtagtactaaacaattcttataagccttccttgaaccat-gcagtcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc-a 10298  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10297 gttttacctagaagcatgccaggagccggaccactccccaccctcatcagcctcgggcgttacatg 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 259 - 622
Target Start/End: Original strand, 2061 - 2423
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2061 tgtaacatcccagacaacttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaa 2160  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2161 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactattgagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 2260  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2261 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctgcacggccttaggatccttctcattccgatgtgattc-a 2358  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
     |||| ||||||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2359 gtttttcctagaagcatgctagaagctggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacat 2423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 298
Target Start/End: Original strand, 2515 - 2556
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccc 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2515 tttgtaacatcccagacaacttttaggattgtcgactgaccc 2556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Original strand, 3886452 - 3886815
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  3886452 tgtaacatcccagaatgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaa 3886551  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886552 cttcccggtaggtcacccatccaaaaattgctccacgtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 3886651  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886652 gatataggtagtaccaaacaattcatataagcattccttctaccat-gcagtcccatacttgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgattcaa 3886750  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3886751 -tttttcctagaagcatgctaggagccggaccattccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 3886815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 257 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 22556834 - 22556468
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtttttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga- 354  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  22556834 tttgtaacatcccagacgacattaaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttacagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgag 22556735  T
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556734 aaacttcctggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcagccacgcttaactgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 22556635  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22556634 gttgatataggtagtaccaaacaattcatataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgatt 22556536  T
Q  555 caacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22556535 c-agttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcattagcctcgggcgttacatg 22556468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 22557266 - 22556901
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtttttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  22557266 ttgtaacatcccagacgacattcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttacagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 22557167  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22557166 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaggcacgcttaactgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 22557067  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| | || | ||||||||||||||||||||    
T  22557066 ttgatattggtagtaccaaacaattcatataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcatgaactctctcattccgatgtgattc 22556968  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22556967 -agttttgccaagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 22556901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 2474701 - 2474337
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || ||    
T  2474701 ttgtaacgtcccagactgcttttaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttttcctcactcgcatgcttaccgggaa 2474602  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2474601 actttccggtaggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 2474502  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  2474501 tgatataggtagtaccaaacaattcttttaagtcttccttcaaccat-gcagtcccatatctgtacgaccttaggatctctctcattccgatgtgattc- 2474404  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2474403 agtttttcctagaagcatgccaggagtcggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 2474337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 257 - 623
Target Start/End: Original strand, 3886906 - 3887271
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  3886906 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttgtcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactggga 3887005  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3887006 aacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaagaagatgcatcttg 3887105  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3887106 ttgatataggtagtaccaaataattcatataagtcttccttcaaccat-gcagtcccatacctgtacggcctcaggatcactctcattccgatgtgattc 3887204  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3887205 -agttttgcctaaaagcatgccaggagctggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 3887271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 259 - 558
Target Start/End: Original strand, 8641886 - 8642184
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  8641886 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaa 8641985  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8641986 cttccc-gtaggtcacccatcttaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 8642084  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8642085 gatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggccttaggatccctctcattctgatgtgattcaa 8642183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 17445306 - 17445602
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  17445306 tgtaacatcccaggcgacttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 17445405  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17445406 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggatttcttatggaatgagctaccgataagaagatgcatcttgtt 17445505  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17445506 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatgcctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattc 17445602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 260 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 2474243 - 2473891
Alignment:
Q  260 gtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaact 359  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |       
T  2474243 gtaacatcccatactgcttttaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga--- 2474147  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2474146 ------taggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 2474053  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaact 559  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2474052 tataggcagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatgcctgtacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc-agt 2473955  T
Q  560 tttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2473954 ttttcctaaaagcatgccaggagtcggaccactccccgccctcatcagcttcgggcgttacatg 2473891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 1822201 - 1821838
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||    
T  1822201 tgtaacatcccagacgactttaagcattgttgaccgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcattcacacgcttaccgggaaa 1822102  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1822101 cttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaaatgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 1822002  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1822001 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacgaccttaagatctctctcattccgatgtaattcaa 1821903  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| | |||||||||    
T  1821902 c-tttgcctagaagcatgccatgagccggaccactccccaccctcgtcagcctcagacgttacatg 1821838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 259 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 189363 - 189053
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||    
T  189363 tgtaacatcccagactactttcaggattgcggactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaa 189264  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  189263 ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatacatcttgtt 189164  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  189163 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc-a 189066  T
Q  558 cttttgcctagaa 570  Q
     ||||||||||||    
T  189065 gttttgcctagaa 189053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 34371909 - 34371611
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  34371909 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 34371810  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34371809 aacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggtgttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 34371710  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34371709 ttgatataggtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaaccat-gcagtcccacacctgtacggccttgggaaccctctcattccggtgtgattc 34371611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 42788497 - 42788793
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||    
T  42788497 tgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgactccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcaagcttaccgagaaa 42788596  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42788597 cttcccggtaggtcacctatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttgtggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 42788696  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42788697 gatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttctttcaaccat-gtagtcccaatcctacacggcctcaggatccctctcattccgttgtgattc 42788793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 258 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2194100 - 2193815
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  2194100 ttgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac-----------a 2194012  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194011 cttaccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 2193912  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  2193911 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggcgtgattc 2193815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 258 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 34372364 - 34372067
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaa 356  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  34372364 ttgtaacattccagactgctttcaggattgccgactgacgccataaaccaacacgagtattttcagcgtgttttttcctcactcgcacgcttatcggaaa 34372265  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34372264 acttcccggtaggtcaccaatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 34372165  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||| |  ||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34372164 tgatataggtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaaccat-gtagtcccatacttgtacggccttgggaaccctctcattctggtgtgattc 34372067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 261 - 555
Target Start/End: Original strand, 10927256 - 10927550
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa-ct 359  Q
    |||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||    
T  10927256 taacatcccatacgtcttttgggattgtcgaccgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcattcacacgcttaccgaaaaact 10927355  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    ||||||| |||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10927356 tcccggtcggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttga 10927455  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10927456 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattc 10927550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 15512863 - 15513160
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  15512863 tgtaatatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtattttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 15512962  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15512963 cttcccggtaggtcatccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgtttaattgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgcatcttgtt 15513062  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagc--cttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15513063 gatattggtagtacc-aacaattcttataagcatattccttcaaccat-gtagtcccatacctacacagcctaatgatccctctcattccgatgtgattc 15513160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 27646683 - 27646982
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtc-gactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-gga 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||     
T  27646683 tttgtaacatcccagacaactttaagcattttccgactgaccatacaaaccaacatgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgtttattggg 27646782  T
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27646783 aaacttcccggtaggtcacccatgcaaagactactccaagacaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatctt 27646882  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27646883 gttgttataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagccccatacctacacggccctaggatccctctcattccgatgtgatt 27646981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 288 - 555
Target Start/End: Original strand, 8391202 - 8391468
Alignment:
Q  288 tcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaatt 386  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8391202 tcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttatcgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaatt 8391301  T
Q  387 gctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttata 486  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8391302 gctccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatacagg-agtaccaaacaattcttata 8391400  T
Q  487 agccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    || |||||||||| |||   |||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8391401 agtcttccttcaatcat-gtagtctcatgcctacacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattc 8391468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 328 - 555
Target Start/End: Original strand, 21886066 - 21886293
Alignment:
Q  328 ttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgga 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21886066 ttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactttggagttcttatgga 21886165  T
Q  427 atgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgacc 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  21886166 atgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacaacc 21886264  T
Q  527 ttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21886265 tcaggaaccctctcattccggtgtgattc 21886293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 34868073 - 34867789
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||           
T  34868073 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgacggatcccacaaatcaacacgagtctttttagcgtgttttgtccttacttgcacgcttac------- 34867981  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
        ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867980 ----cggtaagtcacctatcccaaaattgctcaaagttaagcacgcttaactatggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 34867885  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34867884 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 34867789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 258 - 555
Target Start/End: Original strand, 20039326 - 20039621
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || |||| | ||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  20039326 ttgtaacatcctagacgactttaagcattgccaactgatca-acaaaccaacatgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 20039424  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || | | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  20039425 acttcccaataggtcaccaatccaaagactactctaagtcaagcacacttaactgtagagttcttatggaatgggctacc-aaaagaaaatgcatcttgt 20039523  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20039524 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaactat-gtagtcctatacctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattc 20039621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 355 - 555
Target Start/End: Original strand, 10926894 - 10927093
Alignment:
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  10926894 aaacttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggaatggactaccaaaaggaagatgcatctt 10926993  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10926994 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctcattctgatgtgatt 10927092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 257 - 544
Target Start/End: Original strand, 29679957 - 29680236
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaa 355  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |    
T  29679957 tttgtaacatcc-agacgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcatttgcacgcttatcggga 29680055  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29680056 aacttctcggaaggtcacccatccaaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttg 29680155  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattc 544  Q
    |||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  29680156 ttgatataggtattacca-------cttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcaagatctctctcattc 29680236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 39147227 - 39146937
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||           
T  39147227 tgtaacatcccagacgactttaagcattgccgattgaccctacaaaccaacatgagtctttctagcgttttttgtcctctctcgcacgcttact------ 39147134  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
    ||||| ||||||||||||||  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  39147133 ttcccagtaggtcacccatcatacgactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtta 39147034  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39147033 atataagtagtatcaaacaattcttataagtctaccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcatgatccctctcatttcgatgtgattca 39146937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 259 - 499
Target Start/End: Original strand, 20858393 - 20858633
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |  | |||||    
T  20858393 tgtaacatcccaaacttctttcaggattgtcgactgacctaacaaatcaacacgagtattttcagcgtgttttgtcctcactagcatgcttttcagaaaa 20858492  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20858493 cttcccagaaggtcacc-atcccaaagttgctccaagtcaagcaaccttaactatggagttcttatggaatgagctacagaaaagaagaagcatcttgtt 20858591  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20858592 gatatagaaaataccaaacaattcttataagcctttcttcaa 20858633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 259 - 540
Target Start/End: Original strand, 18750047 - 18750328
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa- 357  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |  ||||     
T  18750047 tgtaacatcccatacgactttaagtattgttgactgaccccacaaaccaactcgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacactttctaaaaaa 18750146  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18750147 cttcctagaaggtcacccatcctaaaattgctccaagtcaagtacgattaattatggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttttt 18750246  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctc 540  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||| | |||||| |||||    
T  18750247 ggtataggtagtaccaaacaattgttataatccttccttcaaccat-gcagttccaaacctgcacgacttcaggatctctctc 18750328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 292 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18304693 - 18304431
Alignment:
Q  292 ctgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctc 390  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | | |  ||||||| |   |||||||||||| |||||||||||    
T  18304693 ctgaccccagaaatcaacacgagtttgttcagcgtgttttgtcctcactcgcacaatttctgtgaaacttctcaaaaggtcacccatcacaaaattgctc 18304594  T
Q  391 caagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcc 490  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  18304593 caagtcaaacatgcttaactgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttatataagct 18304494  T
Q  491 ttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    || | ||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  18304493 tttcatcatccat-gtagtcccatacctacacgacctcaggatccttctcattccgttgtgatt 18304431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 259 - 592
Target Start/End: Original strand, 30684407 - 30684739
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||||| || |||  ||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| | |||| |||| ||  | ||||||||| |||||||||| |   || |||    
T  30684407 tgtaacatctcatactgtttttaggattgacgattgaccccacaaatcaatatgagtctttttagtatattttgtccttactcgcacgcttttcgagaaa 30684506  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30684507 cttttcagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagttgagcacgcttaactgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 30684606  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
      ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |  || |||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||       
T  30684607 tttatagatagtaccaaacaattcatataagcctcccttcaacaatga-tgttccatacttgcacaacctcaggatccccctcattccgatgtgatt-tg 30684704  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccact 592  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  30684705 gttttgcctataagcatgccaggagtcggaccact 30684739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 503
Target Start/End: Original strand, 24182113 - 24182341
Alignment:
Q  275 actttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtaggtcac 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| | | | || ||||||    | |||||||    
T  24182113 actttcaggattgtcgactaaccccacaaaccaacacgaatcttttcaacgtgttttatcctcactcgcacactttccgagaaactttttagaaggtcac 24182212  T
Q  374 ccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||  || | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24182213 ccatcccaaaattgctccaagtcaaccacgcttaactgttaagttattatggtttggggtaccgaaa-gaagatgcatcttgttggtatagatagtacca 24182311  T
Q  474 aacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24182312 aataattcttataagccttccttcaaccat 24182341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 369 - 592
Target Start/End: Original strand, 30719767 - 30719988
Alignment:
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30719767 gtcacccgtcccaaaattgctccaagttgagcacgcttaattgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttataggtag 30719866  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctag 568  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |     
T  30719867 taccaaacaattcatataagccttccttcaacaatga-tgtcccatacttgcacaacctcaggatccctctcattctgatgtgattc-ggttttgccaat 30719964  T
Q  569 aagcatgacaggagccggaccact 592  Q
    |||| || |||||| |||||||||    
T  30719965 aagcgtgtcaggagtcggaccact 30719988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 276 - 473
Target Start/End: Original strand, 11757149 - 11757347
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaactt-cccggtaggtcacc 374  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11757149 cttttaggattgccgactgaccccgcaaaccaacaagagtcttttaagcggatttcgtcctcactcacacgcttaccgaaaaatttcccggtaggtcacc 11757248  T
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 473  Q
    |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11757249 catctcgaaattgctgtaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggattgaactaccgaaaagaagatgcattttgttgatataagtagtacca 11757347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 473 - 624
Target Start/End: Original strand, 22975076 - 22975225
Alignment:
Q  473 aaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagc 572  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22975076 aaacaattcttataagcttttcttcaaccatg-cagtcacatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcag-ttttgcctagaagc 22975173  T
Q  573 atgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatga 624  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22975174 atgccaagagctggaccactcctcgccctcatcagcctcgggcgttacatga 22975225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 606
Target Start/End: Original strand, 2058508 - 2058853
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccct-acaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaa 356  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||| ||||  |  ||| |     
T  2058508 tgtaacatctcaaactgctttcaggattgtctattgacccccacaaactaacacgagttttttcaatgtattttgtactcactcacacgtttttcgggag 2058607  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   | | |  | |||||||||||||| ||||   || ||||  |||||||||    
T  2058608 acttcttagaaggtcactcatcccaaaattgctccaagtcaagcatcc---agtctcaaagttcttatggaatgtgctatttaacagaatttgcatcttg 2058704  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||| || || ||| | |||||| |||||| |||||||||||||    
T  2058705 ttgatataggtagtaccaaacaattcatataagtcttccttcaatcatc-cagtctcatagctgcatgacttcaggatctctctcaatccgatgtgattc 2058803  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatca 606  Q
       ||||||||||||| |||||||||| || |||||||   ||||||||||    
T  2058804 ggtttttgcctagaag-atgacaggagtcgaaccactctctgccctcatca 2058853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 423
Target Start/End: Original strand, 30720111 - 30720276
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc-atacggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||     
T  30720111 tgtaacatcccagactgctttcaagattgtcgattgactccacaaaccaacaggagtcttttcagcgtgttttgtcctcgctcgcacgcttttcggaaag 30720210  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttat 423  Q
    ||| |  | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30720211 ctttcaagaaagtcatccatcccaaaattgttccaagtcaagcacgattaactgtagagttcttat 30720276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 369 - 552
Target Start/End: Original strand, 16370673 - 16370852
Alignment:
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||  |    |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16370673 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaacatgcttaactgcggggttctgatttag---gctaccaaaaagaagatacgtcttgttgatataagtag 16370769  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||  ||||||||| | | | |||| |||||||||| ||||||||    
T  16370770 taccaaacaattcttataagttttccttcaaccat-gcagtcttatacctacatggcatcaggaaccctctcatttcgatgtga 16370852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 374 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 42429324 - 42429195
Alignment:
Q  374 ccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 473  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||| || | ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42429324 ccattccaaaattgctttaagtcaagcacccttaactatgaagttcttatgtaacgggctacggaaaagaatatgcatattgttgataaaggtagtacca 42429225  T
Q  474 aacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42429224 aacaattcttataagtcctccttcaaccat 42429195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 269 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 1880361 - 1880146
Alignment:
Q  269 cagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggta 367  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||  |||    
T  1880361 cagacgactttaagcattgtcgacggaccttacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccataaaacttcctagta 1880262  T
Q  368 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 467  Q
     |||| | |||| || ||| | |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  1880261 agtcatctatccaaatattacaccaactcatgcacgcttaactgtagagttcttgtggaatagactaccaaaaagaatatgcat-ttgttaatataggaa 1880163  T
Q  468 gtaccaaacaattctta 484  Q
    ||||   ||||||||||    
T  1880162 gtactggacaattctta 1880146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 423
Target Start/End: Original strand, 30684862 - 30685027
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc-atacggaaaa 357  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||    
T  30684862 tgtaacatctcaaactgctttcaagattgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcgcttgcacgcttttcggaaaa 30684961  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttat 423  Q
    ||| |  | | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  30684962 ctttcaagaaagtcatccatctcaaaattgttccaagtcaagcacacttaaccgtagagttcttat 30685027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 379
Target Start/End: Original strand, 38063680 - 38063800
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  38063680 tgtaacatcccagacgactctaagcattgtcgaatgaccctacacaccaacacgag-tttttcagcgtattttgtcctcattcgcacgcttaccggaaaa 38063778  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcc 379  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  38063779 cttcccagtaggtcacccatcc 38063800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 402 - 499
Target Start/End: Original strand, 4673466 - 4673563
Alignment:
Q  402 cgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4673466 cgcttaactgtggagttcttatggaatgaaataccaaaaagaatatgcatcttgttgatacaggtgctaccaaataattcttataagacttccttcaa 4673563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 420 - 549
Target Start/End: Original strand, 11160694 - 11160822
Alignment:
Q  420 ttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccataccta 519  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||  ||||||||    
T  11160694 ttatggaatgaactacgtgaaagaatatgcatcttgttgacatagatagtaccaaacaattattataagccttccttcaactat-gtagtgtcataccta 11160792  T
Q  520 cacgaccttaggatccctctcattccgatg 549  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  11160793 cacgacttcatgatccctctcattccgatg 11160822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 333
Target Start/End: Original strand, 21883938 - 21884010
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgt 333  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21883938 taacatcccagactgctttcaagattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 21884010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 493
Target Start/End: Original strand, 32574632 - 32574744
Alignment:
Q  381 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |  || |||||| |||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  32574632 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttattatagtttgggctaccaaaagaaagatgcattttgtttgtataggtagtaccaaacaatt 32574731  T
Q  481 cttataagccttc 493  Q
    | |||||||||||    
T  32574732 cctataagccttc 32574744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 556
Target Start/End: Original strand, 4657956 - 4658140
Alignment:
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    ||||||||| |||||||   || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4657956 gtcacccattccaaaatatatctaagtcaagcatgat-aactgtgaagttcttatggaatggactaccaaaaagaagatgcatgttgttgttataggtag 4658054  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    || ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||   | | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4658055 tatcaaacaagtcttataa-tcttcgttcaaccatga-agtctcatacctgcacggtttcaagatccctcttatttcgatgtgattca 4658140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 388 - 555
Target Start/End: Original strand, 5066872 - 5067038
Alignment:
Q  388 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 487  Q
    ||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5066872 ctccaaggcaaacacgtttaattgtggagtttttatgaaatagactaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatatagataataccaaacaattcttataa 5066971  T
Q  488 gccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |  |||||| || ||| |||||| ||||| | |||| |||  ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  5066972 gttttcctttaatcat-acagtctcatacatgcacggcctcgggatctctctcattctggtgtgattc 5067038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 246
Target Start/End: Original strand, 22630803 - 22630900
Alignment:
Q  151 attttgtttaaaattattttctctaca--ttcagaggggaggactatactttgagcacatgggtctggtaagaaggtaagaaaccccttcaacaattt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22630803 attttgtttaaaattattttctctacacattcagaggaaaggactatactttgagcacgtggttctagtaagaaactgagaaaccccttcaacaattt 22630900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 8366730 - 8366595
Alignment:
Q  288 tcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaatt 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| || | |    
T  8366730 tcgactgacc-tacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcgtcactcac-cgcttattggaaaacttcccagtaggtcacccatccaaatact 8366633  T
Q  387 gctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatg 424  Q
     || ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  8366632 acttcaaatcaaacacgcttaactatagagttcttatg 8366595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 353 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4102996 - 4102908
Alignment:
Q  353 gaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaa 441  Q
    ||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  4102996 gaaaacttctcagaaggtcactcatctcaaaattgctccaagtcaagcacgtttaactgtgaagttcttatggtttgggctaccgaaaa 4102908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 187810 - 187750
Alignment:
Q  302 aaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttc 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  187810 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttc 187750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5786028 - 5785958
Alignment:
Q  370 tcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaa 440  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  5786028 tcactcatcctaaaattgctccaagtcaaacacgcttaagcgtagagttcttatggaatgggctatcgaaa 5785958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 552
Target Start/End: Original strand, 43356651 - 43356762
Alignment:
Q  438 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccct 537  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||  ||||| ||||||| || || || |||| ||||    
T  43356651 aaaagaagatgcatattgttggtttaggttgtaccaaacaattcttataagtcatcc-tcaatcat-gcagtctcatacctgcatgatctcagga-ccct 43356747  T
Q  538 ctcattccgatgtga 552  Q
    |||||||||||||||    
T  43356748 ctcattccgatgtga 43356762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 453
Target Start/End: Original strand, 5785901 - 5785954
Alignment:
Q  400 cacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatct 453  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  5785901 cacgcttaactgtggagttcttacggaacgagctaccaaaaagatgatgcatct 5785954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 443 - 476
Target Start/End: Original strand, 39801498 - 39801531
Alignment:
Q  443 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaac 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39801498 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaac 39801531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 553
Target Start/End: Original strand, 11757345 - 11757387
Alignment:
Q  511 ccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgat 553  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11757345 ccatagctacacggctttaggatccctctcattccgatgtgat 11757387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 346
Target Start/End: Original strand, 5066781 - 5066826
Alignment:
Q  301 caaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 346  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5066781 caaaccaacatgaatcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacg 5066826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 257 - 623
Target Start/End: Original strand, 34308784 - 34309153
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |    
T  34308784 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgctgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccggga 34308883  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34308884 aacttcccggtaggtcacccatctcaaaattgctccaagccaagcacgcttaactgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttg 34308983  T
Q  456 ttg----atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtg 551  Q
    |||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34308984 ttgatatatataggtagtaccaaacagttcttataagccttccttcaaccat-acagtctcatacttgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtg 34309082  T
Q  552 attcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34309083 attc-agttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactcctcgccctcatcagcctcgggcgttacatg 34309153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 25148262 - 25147899
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa 357  Q
    |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  | |||    
T  25148262 ttgtaacatctcatactgcttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgacctcactcgcacgtttatcggaaa 25148163  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25148162 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgtt 25148063  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |    
T  25148062 gatataggtaagaccaaacaattcttataagccttccttcaacga-cacagtcccatacctacacgacctcgggatccctctcattcttatgtgattc-a 25147965  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  25147964 gttttgcctagaagcatgccaggagccaaaccactccccgccctcatcatactcgagcgttacatg 25147899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 257 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 25147832 - 25147468
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaa 355  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |    
T  25147832 tttgtaacacccaagactgctttcaggattgccgactgaccc-acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtactcactcgcacgcttatcagga 25147734  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25147733 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgattaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 25147634  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  25147633 ttgatataggtagcaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctacacagtcttaggatctctctcattccgatgtgatt- 25147536  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  25147535 tagttttgcctagaagcatgccaagagccggaccactccccgccctcatcagcctcgagtgttacatg 25147468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Original strand, 34308329 - 34308693
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||    
T  34308329 ttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccagcacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaa 34308428  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34308429 acttcccggtaggtcacccatctcaaaattgctccaagccaagcacgcttaagtgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgt 34308528  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  34308529 tgatataggtagtaccaaacagttcttataagccttccttcaaccat-acagtctcatacttgtacggcctcaggatccctttcattccgatgtgattc- 34308626  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34308627 agttttgcctagaagcacgccaggagccggaccactccccgcccttatcagcctcgggcgttacatg 34308693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Original strand, 21315960 - 21316323
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  21315960 ttgtaacatcccagactgcttttaggattgtcgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaa 21316059  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21316060 cttcgcggtaggtcacccttaccaaaattactccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatgaaatgagctactgaaaagacgatgcatcttgtt 21316159  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21316160 gatataggtagtaccaaacaattcttttaagcgctcatttaaccat-acagtctcatacctgcacggccttaggatccctctcatcgcgatgtgattcaa 21316258  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     |||| |||||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21316259 -tttttcctagatgcttgccagaagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 21316323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 258 - 551
Target Start/End: Original strand, 10844465 - 10844758
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||    
T  10844465 ttgtaacatcccagacgacttttaggattgtcgactgaccctacaaacaaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaa 10844564  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844565 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 10844664  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtg 551  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10844665 taatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcaaggcctcaggaaccctctcattccggtgtg 10844758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 262 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 12100982 - 12100624
Alignment:
Q  262 aacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaactt 360  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  12100982 aacatcccatacgactttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacgaggaaactt 12100883  T
Q  361 cccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgat 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12100882 cccggtaggtcacccatcc-aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgat 12100784  T
Q  461 ataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaactt 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||  ||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||||| | ||    
T  12100783 ataggtagtaccaaacaaatcttataagcttgccttcaaccat-gcagtctcatacctgtacggcctcaggat-cttctcatttcgatgtgattc-agtt 12100687  T
Q  561 ttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12100686 tttcctagaagcatgccaggagtcggaccactccccgccctcatcagcctcgggtgttacatg 12100624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 27022188 - 27022485
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  27022188 tttgtaacatcccagactgcttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaaaa 27022287  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  27022288 actttccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctgccgaaaataagatgcatgttgt 27022387  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27022388 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccat-gtagtcccatacctacatggcctcaagatccctctcattccgatgtgattc 27022485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 259 - 554
Target Start/End: Original strand, 22548400 - 22548695
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  22548400 tgtaacatcccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaa 22548499  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22548500 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 22548599  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  22548600 gatataggtagtaccaaacaattcttataaaacttccttcaaccat-gcagtcacatacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgatt 22548695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 256 - 555
Target Start/End: Original strand, 12827102 - 12827401
Alignment:
Q  256 gtttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-gga 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||||  |||||||||||| | ||| ||     
T  12827102 gtttgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttaaaagtgttttaacctcactcgcacacttaccggg 12827201  T
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827202 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 12827301  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  12827302 gttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaacca-agtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgatt 12827400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 22548844 - 22549142
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  22548844 tttgtaacatcccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctgttcagcgtgttttatcctcactcgcacgcttactggga 22548943  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22548944 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagtttttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 22549043  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||| ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  22549044 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtcacatacctgcacagcctcaggaagcctctcattccggtgtgattc 22549142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22026675 - 22026378
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||    
T  22026675 tgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 22026576  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22026575 acttcccgataggttacccatcccaatattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 22026476  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  22026475 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcacgaaccctctcattccggtgtgattc 22026378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 258 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 27926194 - 27925898
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||    
T  27926194 ttgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaa 27926095  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27926094 acttcccggtacctcacccatcccaaa-ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 27925996  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27925995 tgatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 27925898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 258 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 17103378 - 17103086
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  17103378 ttgtaacatcccagacgacttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 17103279  T
Q  357 acttcccggtaggtca-cccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17103278 acttcccggtaggtcaacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcagcttg 17103179  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17103178 ttgatataggcagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtctcatacctgtacggcctcaggatctctctcattccgatg 17103086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 276 - 555
Target Start/End: Original strand, 41658973 - 41659252
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacc 374  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  41658973 ctttcagcattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttacagggaaacttcccggtaggtcacc 41659072  T
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 474  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41659073 tatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 41659172  T
Q  475 acaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41659173 acaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacgacatcaggaaccctctcattccggtgtgattc 41659252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2044353 - 2044057
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2044353 tgtaacatcccaaacgactttaagcattggtgactgaccctacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaa 2044254  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||  |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2044253 cttcccattaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgtt 2044154  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2044153 gatataggtagtatcaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 2044057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 257 - 556
Target Start/End: Original strand, 8080192 - 8080490
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  8080192 tttgtaacatcc-agacgactttaagcattgtcgactggccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaga 8080290  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||  |||||| |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  8080291 aacttcctagtaggttacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttg 8080390  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8080391 ttgatataggtagtaccaaacaattcttatcagctttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcttcaggatccctctcattccgatgtgattc 8080489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 32292701 - 32292396
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaa-------ccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcat 349  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32292701 tttgtaacatcccagactgcttttaggattgccgactgaccctacaaagtacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgctt 32292602  T
Q  350 ac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatg 448  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  32292601 accggaaaacttcccggtagatcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctagcaaaaagaagatg 32292502  T
Q  449 catcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgat 548  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||| |    
T  32292501 caacttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccat-gcagtcccatacttgcacggcctcaggaaccctctcattccggt 32292403  T
Q  549 gtgattc 555  Q
    |||||||    
T  32292402 gtgattc 32292396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 368 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 25144957 - 25144704
Alignment:
Q  368 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25144957 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgctgatataggta 25144858  T
Q  468 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgccta 567  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  25144857 gtaccaaacaattcttataagcctgccttcaatcat-gcaatcccatacctgcacgacctcgagatctctctcattctgatgtgattc-agttttgccta 25144760  T
Q  568 gaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  25144759 gaagcatgccaggagccagaccactccccgccctcatcagcctcgaacgttacatg 25144704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 257 - 475
Target Start/End: Original strand, 31283501 - 31283719
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  31283501 tttgtaacatcccagacgactttcaacattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgcgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 31283600  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31283601 aacttcccggtaggtcacccatcc-aaaattgctcaaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttg 31283699  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaa 475  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31283700 ttaatataggtagtaccaaa 31283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 264 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 28453628 - 28453336
Alignment:
Q  264 catcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaacttcc 362  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  | ||   | ||||||||    
T  28453628 catcccagactgcttttaggattgtcgactgatcttacaaacaaacacgactcttttcagcatgttttgtcctcactcgcagtcttattaggaaacttcc 28453529  T
Q  363 cggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatat 462  Q
      |||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28453528 gagtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtagagttcttatggaatgggctaccataaagaagatgcatcttgttaatat 28453429  T
Q  463 aggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28453428 aggtagtataaaacaattcttataagttttctttcaaccatga-agtctcatacctgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattca 28453336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 393 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10845043 - 10844882
Alignment:
Q  393 agtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10845043 agtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcttt 10844944  T
Q  493 ccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10844943 ccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 10844882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 284 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41913240 - 41913006
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||| |  ||||||||| ||||| ||    
T  41913240 attgtcgactgaccctataaactaacacgagttttttcaacgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccaagaaactttctagtaggtcactcatccaaa 41913141  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
     | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41913140 gactacttcaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagacgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattct 41913041  T
Q  483 tataagccttccttcaaccatcacagtcccatacct 518  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  41913040 tataagccttctttcaaacat-gcagtcccatacct 41913006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Original strand, 33852109 - 33852406
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    ||||||||||  ||| ||||| || ||||  | ||||||  ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |   |||    
T  33852109 tgtaacatccgtgacaactttaagcattgctgtctgacctgacaaatcaacatgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcatgaaa 33852208  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  33852209 ctttccgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaattgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatacatcttgtt 33852308  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | |||||||||    
T  33852309 aatataggtagtaccaaacaattcttataagttttccttcaaccat-acagtctcatacctgcacggtctcgggatccctctcattctggtgtgattca 33852406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 369 - 555
Target Start/End: Original strand, 6464872 - 6465057
Alignment:
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6464872 gtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttgttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtag 6464971  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6464972 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagttccatacctacacggcctcatgattcctctcattccaatgtgattc 6465057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 265 - 623
Target Start/End: Original strand, 27819105 - 27819459
Alignment:
Q  265 atcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttccc 363  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||| ||| || |||||||||| ||||| | | |||||||||  |    
T  27819105 atcctagactgcttttaggattgtcgactgaccccacaatc-aacacgggtcttttcagtgtgctt-gtcctcactcacacgctttctggaaaacttatc 27819202  T
Q  364 ggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatata 463  Q
     | ||||||||||||| || | | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27819203 agaaggtcacccatccaaatactactcaaagtcaaacacacttaactgtggagtttttatggaatgagctattgaaaagaagatgcattttgttgatata 27819302  T
Q  464 ggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttg 563  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| | || ||| | | |||||||||||||| ||||||||||   |||||    
T  27819303 ggtagtaccaaacaattcttattagccttccttcaaccatga-agtctcatacttgcatgacttcatgatccctctcattctgatgtgattc-ggttttg 27819400  T
Q  564 cctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||| |||| |  |||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| || |||||||    
T  27819401 cctaaaagc-ttccaggagtcggaccacttcctaccctcatcaacctcgagccttacatg 27819459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 257 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 32292238 - 32292092
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  32292238 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 32292139  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcac 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||    
T  32292138 aacttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcac 32292092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 268 - 503
Target Start/End: Original strand, 15818876 - 15819111
Alignment:
Q  268 ccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggt 366  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||| |     
T  15818876 ccagacgactttaagtattgccgactggccccacaaaccaacacaagtcttttcagtgtgctttgtcctcactcgcacacttttcgggaaacttcccaga 15818975  T
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    ||||| ||||||| ||   | ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15818976 aggtcgcccatccaaagcctactccaagtcaagcaaatttaactgtg-agttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcatgttgatatatgt 15819074  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  15819075 agtaccaaacaatttttctaagcattccttcaaccat 15819111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 368 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3745286 - 3745104
Alignment:
Q  368 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 467  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3745286 ggtcagccatcccaaaattgctctaagtcaagcacgcttgactgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatattgttggtataggta 3745187  T
Q  468 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtg 551  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||   |||||    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3745186 gtactaaacagttcttataagttttccttcaaccat-gtagtccttagcctgcacgaccttaggatccctctcatttcgatgtg 3745104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 488
Target Start/End: Original strand, 30527349 - 30527563
Alignment:
Q  275 actttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcac 373  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  || | ||||| ||||    
T  30527349 actttaagcattgtcgactgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttatcctcactcgcacgcttaccgggaagttttcaggtagatcac 30527448  T
Q  374 ccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 473  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  30527449 ccatccaaagattactcaaagtcaaacaatcttaactgtggagttcttatgaaatgggctacccaaaagaagatgtatcttattgatgtaagtggtacca 30527548  T
Q  474 aacaattcttataag 488  Q
    |||||||||||||||    
T  30527549 aacaattcttataag 30527563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 543
Target Start/End: Original strand, 28375042 - 28375189
Alignment:
Q  395 tcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcc 494  Q
    |||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375042 tcaagcacgcttaactatgaagctgttatggaaagagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatgtaggtagtaccaaacaattcttataagccttcc 28375141  T
Q  495 ttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcatt 543  Q
    ||||| |||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  28375142 ttcaatcat-gcagtctcatacctgcacggcctcaggatccctctcatt 28375189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 363 - 556
Target Start/End: Original strand, 22840486 - 22840677
Alignment:
Q  363 cggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatat 462  Q
    ||||||||||||||||| || | |  || |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22840486 cggtaggtcacccatccaaagactaatctaagtcaagcatgatta-ctgtggagttcttatggaatgagctaacaaaaagaagatgcatcttgttgatat 22840584  T
Q  463 aggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||   |||| ||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22840585 agatagtaccaaacaattcttataagtcttcattcgaccat-gtagtctcatacctacaaagcctcaggatctctctcattccgatgtgattca 22840677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 305 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 22705424 - 22705181
Alignment:
Q  305 ccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcc-------------caaa-attgct 389  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||             |||| | | ||    
T  22705424 ccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactggcacgcttactggaaaacttcccggtaggtcacccgtccaaagctactcattcaaagactact 22705325  T
Q  390 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||        ||||||||| | |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22705324 ccaagtcaagcacgcttaactgt--------tatggaatgggttaccaaaaaga---tgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataacc 22705236  T
Q  490 cttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattcc 545  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22705235 cttccttcaatcatc-cagtcccatacctacacggcttcaggatccctctcattcc 22705181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 3744822 - 3744665
Alignment:
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  3744822 gtcaccaatcccaaaattgctcaaagttaataaagcttaattgtagagttcttatgaaatgtgctaccaaaaagaaggtgcatattgttggtataggtag 3744723  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgacct 527  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3744722 tgtcaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtcccatacctacacgacct 3744665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 432 - 544
Target Start/End: Original strand, 27021904 - 27022015
Alignment:
Q  432 ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttagg 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | ||| |||    
T  27021904 ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcttatacctacatggcctcagg 27022002  T
Q  532 atccctctcattc 544  Q
    |||||||||||||    
T  27022003 atccctctcattc 27022015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 503
Target Start/End: Original strand, 15567516 - 15567652
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    |||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  15567516 aggtcatccattccaaaactactccaagtcaaacacgattaactgcggagttcttatgaaatgaactaccaaaaagaagatgtatcttgttggtatatgt 15567615  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15567616 agtgtcaaacaattcttataagccttccttccaccat 15567652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 6466549 - 6466329
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaact 359  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| | || |   || |||||    
T  6466549 taacatcccagacgactttcagtattgccgactggccccacaaaccaacacaagtctttttagcgtgctttgtcctcactcgtatgctttttgagaaact 6466450  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    ||||   ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||| | ||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||     
T  6466449 tcccaaaaggccacttatctcaaaattgcttcaagtcaagcacacctaacaatggatttcttatgaaatga-ctaccaaaaggaagatgcaacttgttgg 6466351  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattc 481  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6466350 tataagtagtaccaaacaattc 6466329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 6467001 - 6466775
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaa 356  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||  ||||||| | || | |  ||||    
T  6467001 ttgtaacatccctgacgactta-agcattgccgactgaccccacaaaccaacatgagtttttttagtgtgctttgttttcactcgtatgctttctagaaa 6466903  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  6466902 acttccaagaaggtcacccataccaaaattgctccaagtcaagtacacttaaatttgtagttcttatgaaatg-gctat-gaaaa--agatgcatcttgt 6466807  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataag 488  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6466806 tggtataggtagtaccaaacaatttttataag 6466775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 25308042 - 25307855
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcat-acggaaaacttcccggtaggtcacc 374  Q
    |||| ||||||| ||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||||||| |  ||| ||||||    
T  25308042 cttttaggattgccgactgatcccataaatcaacacgagtcttttcagcgtactttgtcctcactcgcacgcttgccgaaaaactttcaagtacgtcacc 25307943  T
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    ||||| || | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  25307942 catccaaagactacaccaagtcaagcaagcttaactgtggagttcttacagaatgggctacc--aaaaaagatgtatcttgttgatatag 25307855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 367 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1297193 - 1297057
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    ||||||| ||||| || ||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  1297193 aggtcactcatccaaagattacttcaagtcaaacacacttaactatggagttcttatataatgggataccgaaaagaatataaatcttgttggtataggt 1297094  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  1297093 agtaccaaacaattcttataagttttacttcaaccat 1297057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9251180 - 9251098
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactc 341  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9251180 tgtaacatcatagactgctttcaggattgtcgattgaccccacaaaccaacacaagttttttcagcgtgttttgtcctcactc 9251098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Original strand, 6463394 - 6463483
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaa-ccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6463394 tgtaacatcctagacgactttaagcattgtcgactgaccctaaaaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 6463483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 502
Target Start/End: Original strand, 15567859 - 15568100
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||| || |||||| || |||| | |||||||||||||||||| |||   | | || ||    
T  15567859 ttgtaatatctcagacgactttaagtattgccgactggccccacatactaacacgggtctttttaacgtgttttgtcctcactctcacattttccgagaa 15567958  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||  | |  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  |   |    ||| ||||||||||||||    
T  15567959 acttcctagaaattcacccatcccaaaattgctctgagtcaagtacgcttaattgtggagttcttattaaaaaaaaaa----aaaaaagatgcatcttgt 15568054  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaacca 502  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15568055 tgatataggtcataccaaacaattgttataagtcttccttcaacca 15568100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 391 - 555
Target Start/End: Original strand, 30334892 - 30335055
Alignment:
Q  391 caagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcc 490  Q
    |||||||| |||  |||||| || |||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  30334892 caagtcaaacacatttaactatgaagttattatgaattgagctatcgaaaagaagatgtatcttgttggtataggtagtatcaaacaatttttataagtc 30334991  T
Q  491 ttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||| ||||||| |  ||||| ||||||| |||   || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30334992 ttctttcaacc-ttgcagtcgcatacctgcacagtctcaggatccatctaattccgatgtgattc 30335055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23121774 - 23121677
Alignment:
Q  151 attttgtttaaaattattttctctacat--tcagaggggaggactatactttgagcacatgggtctggtaagaaggtaagaaaccccttcaacaattt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23121774 attttgtttaaaattattttctctacatattcagaggaaatgactatactttgagcacgtggttctggtaagaaactgagaaaccccttcaacaattt 23121677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 457
Target Start/End: Original strand, 10729654 - 10729736
Alignment:
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10729654 catcccaaaattgcttcaagccaagcacccttaattgtggagtccttatggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 10729736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10729919 - 10729722
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||| || || ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |  | |     
T  10729919 ttgtaacatcctagacgactttcagtattgccaactaactcttcaaaataacacgagtcttttcagcgtgctttgtccacactcgcacgctttctaggat 10729820  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    | |||||   ||||||||||||  || | | ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||    
T  10729819 atttcccataaggtcacccatcaaaagactactccaagtctatcacgcttaattgtggagttcttatggaatgggtaacagaaaacaagatgcatctt 10729722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29117529 - 29117444
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 346  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29117529 taacatcccggatgactttcaggattaccgaccgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaggatgatttgtcctcactcgcacg 29117444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34688132 - 34687920
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa 357  Q
    |||||||||  || || ||||| || |||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  | |  ||||    
T  34688132 ttgtaacatatcatacgactttaagtattgtccactggtcctacaaaccaacatgagtcttttcaacgtgttttgtcctcattcgcacgtttccttaaaa 34688033  T
Q  358 cttcccggtagg-------tcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgca 450  Q
    |||  | | |||       ||| |||| ||| |||||||||||||||  |||  |||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  34688032 cttttcagaaggccatcggtcatccataccataattgctccaagtcagacacatttaactatggaattcttatggaataacctaccaaaaagaagatgca 34687933  T
Q  451 tcttgttgatata 463  Q
    |||| ||| ||||    
T  34687932 tctttttggtata 34687920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 336
Target Start/End: Original strand, 22840425 - 22840477
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcct 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22840425 attgtcgactgaccatacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcct 22840477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 556
Target Start/End: Original strand, 29971450 - 29971549
Alignment:
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  29971450 ttgatatagatagtatcaaacaattcttataaatcttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacggcctcaggatccttccaattctgatgtgattc 29971548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17429611 - 17429553
Alignment:
Q  442 gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaac 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  17429611 gaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaataatactcataagtcttccttcaac 17429553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 430
Target Start/End: Original strand, 29971304 - 29971448
Alignment:
Q  285 ttgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaa 384  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||  || || ||  | ||||||||||||| | || |    
T  29971304 ttgtcgactgactttatagaccaacacgagttttttcagcatgttttgtcctcacttgcatgtttattgagaaatt-tcagtaggtcacccatacaaaga 29971402  T
Q  385 ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatga 430  Q
     |  |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  29971403 ctattccaagtcaaacacgtttaactgtgaagtttttatggaatga 29971448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 503
Target Start/End: Original strand, 36968434 - 36968491
Alignment:
Q  446 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36968434 atgcatcttgttgatataagtagcaccaatcaattcttataagtcatccttcaaccat 36968491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 383 - 499
Target Start/End: Original strand, 28912826 - 28912942
Alignment:
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    |||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||| |||| ||||| | || | |||| |||||||||||||| |||| || || || || ||||||||    
T  28912826 aattgctcaaagtcgaacatacttaactgtggagttattatagaatgggatatcaaaaataagatgcatcttgtcgatacagataatatcagacaattct 28912925  T
Q  483 tataagccttccttcaa 499  Q
    |||| | |||| |||||    
T  28912926 tatatgacttctttcaa 28912942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29117413 - 29117361
Alignment:
Q  376 atcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||    
T  29117413 atcccaaaattgctccaagtcaagcacgttgaagtgtagagttctcatggaat 29117361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 569 - 623
Target Start/End: Original strand, 31283356 - 31283410
Alignment:
Q  569 aagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31283356 aagcatgctaggagccggaccactctccaccctcatcagcctcgggcgttacatg 31283410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 3508827 - 3508790
Alignment:
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttcctt 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3508827 atataggtagtaccaaataattcttataaaccttcctt 3508790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Original strand, 12119224 - 12119273
Alignment:
Q  295 accctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgca 344  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  12119224 accccacaaaccaacacgagtattttcaatgtgctttgtcctcactcgca 12119273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Original strand, 27021839 - 27021903
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttca 322  Q
    |||||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  27021839 ttgtaacatctcatactgttttcaggattgccgactgacttcacaaaccaacacgagtcttttca 27021903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 391 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 44042042 - 44041986
Alignment:
Q  391 caagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagat 447  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  44042042 caagtcaagcacgcttaacaatgaagttcttgtggaatgtgttactgaaaagaagat 44041986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Original strand, 107314 - 107677
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  107314 tgtaacatcccagactgctttcagaatagccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 107413  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107414 cttcccggtacgtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 107513  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  107514 gatattggtagtatcaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgtacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattc-a 107611  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  107612 gtttttcctagaagcatgccaggaaccggaccactccccgtcctcatcagcctcgggtgttacatg 107677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 276 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 35871905 - 35871560
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacc 374  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||| |||||||||    
T  35871905 ctttcaggattgccgactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccgataggtcacc 35871806  T
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35871805 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaa-atgcatcttgttgatataggtggtaccaa 35871707  T
Q  475 acaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcat 574  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35871706 acaattcatataagccttccttcaaccatga-agtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc-agttttgcctagaagcat 35871609  T
Q  575 gacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35871608 gccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 35871560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 49998931 - 49998568
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||    
T  49998931 tgtaacaccccaaactgctttcagaattgccgactgtccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 49998832  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998831 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 49998732  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  49998731 gatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtcccatgcctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgatt-ta 49998634  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  49998633 gttttgtctagaagcatgccaagagctggaccactccccgccctcatcagccttgagctttacatg 49998568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 257 - 623
Target Start/End: Original strand, 44471168 - 44471533
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  44471168 tttgtaacaccccaaacgactttaagaattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcatgttttgtcctcactcgcccgcttaccggga 44471267  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471268 aatttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 44471367  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||  ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  44471368 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gtagtctcatacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc 44471466  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44471467 -agtttttcctagaagcatgctaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 44471533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Original strand, 23350128 - 23350491
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  23350128 tgtaacaccccagactgctttcagaattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcacacgcttacagagaaa 23350227  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23350228 cttctcggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatggaaggagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 23350327  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||| |    
T  23350328 gatataggaagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccctacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc-a 23350425  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23350426 gttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgagcgttacatg 23350491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 259 - 621
Target Start/End: Original strand, 44470720 - 44471080
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  44470720 tgtaacaccccagacgactttaagaattgttgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 44470819  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  44470820 cttcccggtaggtcaaccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagtta-cgaacagaagatgcatcttgtt 44470918  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |  ||  | | | |||| |||||||||||||||||||| |    
T  44470919 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccat-acagtcacatacttgtacagcgtcatgatctctctcattccgatgtgattc-a 44471016  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttaca 621  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  44471017 gttttgcctagaagcatgctaggagccggaccactccccgccctcattagcctcgggcgttaca 44471080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 50398383 - 50398679
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  50398383 tgtaacatctcagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagtgtattttgtcctcactcgcacgcttaccggtaaa 50398482  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50398483 cttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 50398582  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50398583 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcctatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 50398679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 24629279 - 24629574
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |       
T  24629279 tttgtaacatcacagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggt 24629378  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24629379 --ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttatggaacgaggtaccgaaaagaagatgcatcttgt 24629476  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24629477 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagcattcctttaaccat-gcagtcccatacctacacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 24629574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 259 - 503
Target Start/End: Original strand, 7678467 - 7678712
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||    
T  7678467 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaacctacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 7678566  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678567 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 7678666  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678667 gatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat 7678712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 322 - 555
Target Start/End: Original strand, 12691907 - 12692140
Alignment:
Q  322 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12691907 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 12692006  T
Q  421 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctac 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  12692007 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgc 12692105  T
Q  521 acgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12692106 acggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 12692140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 50398837 - 50399134
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||  ||| |  |    
T  50398837 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccaacgtgttttgtcctcacttgcacgtttaccggga 50398936  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    | | ||||||||||||||||||  || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50398937 attccccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcgtgt 50399036  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  50399037 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtaatctcatacctacacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattc 50399134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 4127737 - 4128030
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  4127737 tttgtaacatcccagactgctttcaagattgccgac-----ccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccggaa 4127831  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4127832 aacttttcggtaggtcacccatcccaaaattgctctaagccaagcacgcttaactctgaagttcttatggaattggctaccgaaaagaagatgcatcttg 4127931  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4127932 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-atagtctcatgcctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 4128030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 1645594 - 1645890
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  1645594 tgtaacatcccatacgactttaagcattgccaactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttacaaagaaa 1645693  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||| |||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1645694 cttcctggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 1645793  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  1645794 gatataggtaataccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcaagattcctctcattccgatgtgattc 1645890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 51331128 - 51331422
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||     
T  51331128 tgtaacatcctagactacttttaggattgccgactgaccctacaaactaatacgagtcttt-cagtgtgttttgtcctcattcgcacgcttatcgaaaat 51331226  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
    ||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51331227 ttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgtatcttgttg 51331326  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  51331327 atatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattc 51331422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 267 - 622
Target Start/End: Original strand, 14572007 - 14572357
Alignment:
Q  267 cccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccgg 365  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||||| |    
T  14572007 cccatactgctttcaggattgccgactgaccccgcaaaccaacacgagtcttttcaccgtgttttgtcctcactcacacgctttccgagaaacttcccag 14572106  T
Q  366 taggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 465  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572107 aaggtcacccatctcaaaattgctctaagtcaagcacgctt---tgtggagttcttatggtttaggctaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatatagg 14572202  T
Q  466 tagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |    
T  14572203 tagtaccaaacaattcttataagcctcccttcaaccat-gtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcatatttt-tc 14572300  T
Q  566 tagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14572301 tagatgcatgccaagagccggaccactccccgccctcatcagccttgggcgttacat 14572357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 23943085 - 23943379
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  23943085 tttgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 23943184  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23943185 aacttcccggttggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttg 23943284  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||    ||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  23943285 ttgatataggtagtaccaaatattttttataagtcttccttcaaccat----gtgacatacctacacg-cctcaggatccctatcattttgatgtgattc 23943379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 3169501 - 3169205
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    |||| ||||| |||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  3169501 tgtagcatcctagacgactttaagtattgccaactgaccctacaaaccaacacgagtattttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaagaaa 3169402  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| | |||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  3169401 ctttctggtaggtcactcatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaagtgtggagttcttatggattgggttaccaaaaagaagatgcatcttgtt 3169302  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  3169301 gatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattc 3169205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 23942634 - 23942930
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||   |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||   | |||    
T  23942634 tgtaacatcccatacaactttaagcattgttgactattcctacaaaccaacacgggtcctttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttatttggaaa 23942733  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  23942734 ctttccggtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgtt 23942833  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23942834 gatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat-gtagttccatacctacacggccccaggatccctctcattccgatgtgattc 23942930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 4127263 - 4127578
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  4127263 tgtaacattctaaactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaa 4127362  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaact-------------------gtggagttcttatggaatgagctaccga 438  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4127363 cttcccgatagctcacccatcccaaaattgctccaagccaatcatgcttaactgtggagttcttatggaactgtggagttcttatggaatgagctaccga 4127462  T
Q  439 aaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctc 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  4127463 aaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaactat-gtagtcccatacctacatggcctcaggatccctc 4127561  T
Q  539 tcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||    
T  4127562 tcattccgatgtgattc 4127578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21067579 - 21067281
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  21067579 tttgtaacatcccagacgactttaagcattgtggactgacccaacaaactaacacgagtcttttcagtgtgttttgtccccactcgcacgcttaccgaga 21067480  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21067479 aactttccggtaggtcacccctccaaagactactccaagtcaagcacgcttaattgtggagtacttttagaatgagctaccggaaagaagatgcatcttg 21067380  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21067379 ttgatatatgtagtaccaaataattattattagtcttccttcaaccat-gcagtctcatacatgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattc 21067281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 276 - 623
Target Start/End: Original strand, 27578319 - 27578661
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacc 374  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||| |     
T  27578319 ctttcaggattgttgactgatcccacaaaccatcacgagtcttttctgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttgtcggaaaacttcccagaaggtcgct 27578418  T
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 474  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27578419 catcccaaaattgttcgaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggtttgggataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagcaccaa 27578518  T
Q  475 acaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcat 574  Q
    | ||||||||||| || || |||||||| ||||||| || |||| |||||| | ||   || |||||||| ||| ||||||   |||||||||||||| |    
T  27578519 ataattcttataaaccatcattcaacca-cacagtctcacacctccacgacttcag---ccatctcattctgatatgattc-ggttttgcctagaagc-t 27578612  T
Q  575 gacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  27578613 gccaggagccggaccgctccccgccctcatcagcctcgagtgttacatg 27578661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 9423703 - 9423999
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||| |  ||||| || |||| | || |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||    
T  9423703 tgtaacatcccaaatgactttaagcattgccaacggaccgtacacaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaacgggaaa 9423802  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
     ||||||||||||||||||||| || | | |||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  9423803 tttcccggtaggtcacccatcctaagactactccaattcaagcacacttaattgtgaaattcttatggaatgggctactagaaagaagatgcatcttgtt 9423902  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9423903 gatataggtagtaccaaacaattattataagccttctttcaaccat-gcagtcccatacatgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattc 9423999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 363 - 555
Target Start/End: Original strand, 24628927 - 24629121
Alignment:
Q  363 cggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatat 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24628927 cggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 24629026  T
Q  463 aggtagtaccaaacaattcttataagcc---ttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24629027 aggtagtaccaaacaattcttataagcctaattcctttaaccat-gcagtcccatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 24629121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 319 - 487
Target Start/End: Original strand, 50814730 - 50814899
Alignment:
Q  319 ttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50814730 ttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaacttcccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagt 50814829  T
Q  418 tcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50814830 tcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataa 50814899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 258 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 13266382 - 13266070
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaa 356  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||| | |  ||||||    
T  13266382 ttgtaacatcccatactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcaacatgttttctcctcactcgcacacttttcggaaa 13266283  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||   ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||   || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  13266282 acttcccaaaaggtcacccatcctaaaatttctcaaagtcaagcacgcttaactgtggggttcttgtgatttgggctaccgaaaataagatgcatcttat 13266183  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13266182 tgatatagggagtactaaaaaattattataagccttccttcaaccat-gcattcccatacctgcacggctttaagatccctctcattctaatgtgattca 13266084  T
Q  557 acttttgcctagaag 571  Q
    | ||||||| |||||    
T  13266083 a-ttttgcccagaag 13266070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 261 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 1464439 - 1464146
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaact 359  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |   ||||||||    
T  1464439 taacatcccagactgcttttaggattatcgaccgaccccacaaatcaacacgagttttt-cagcgtgttgtgtcctaactcgcacgttttttggaaaact 1464341  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1464340 tctcagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagttaagcacgctaaattgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 1464241  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||   | || ||||||||||||  |  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  1464240 tataggtagtaccaaacaattcttataagttttctttcaactat-gtattctcatacctacacggtcgcatgatccctctcattctgatgtgattc 1464146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 374 - 623
Target Start/End: Original strand, 15306052 - 15306304
Alignment:
Q  374 ccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 473  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15306052 ccatcccaagattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtacca 15306151  T
Q  474 aa------caattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgccta 567  Q
    ||      ||| ||||||||| |||| ||| |||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||    
T  15306152 aaattgctcaaatcttataagtcttctttcgaccat-gtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattctgatgtggttc-tgttttgccta 15306249  T
Q  568 gaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15306250 gaagc-tgccaggagccagaccactcctcgccctcatcagcctcgggcgttacatg 15306304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 259 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 21068026 - 21067765
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| |||    
T  21068026 tgtaacatcccagatgactttaagcattgccgactaagcctacaaaccaacacgaattttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccggtaaa 21067927  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||   || || ||| ||||||||    
T  21067926 cttcccggtaggtcacccatccaaagactacttcaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatggactacc---aaaaaaatgtatcttgtt 21067830  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacg 523  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  21067829 gatataggtagcaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacg 21067765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 14352092 - 14351794
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  14352092 tttgtaacatcccatacgactttaagcattgctgactgaccatacaaaccaacatgagtcttttcagcatattttgtcttcacttgcacgcttactggaa 14351993  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||  | |||||||| |||||| || | | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||    
T  14351992 aactttgcagtaggtcatccatccaaagactactcgaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaataggataccaaaaagaagatgcatcttg 14351893  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  14351892 ttgatatagatagtaccaaaaaactcttacaagccttccttcaaccat-gcagactcatacatgcacgacctcaggatccctctcattctggtgtgattc 14351794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 365 - 555
Target Start/End: Original strand, 21220283 - 21220472
Alignment:
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21220283 gtaggtcacccgtcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtgtagttcttatagaatgagttaccaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 21220382  T
Q  465 gtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21220383 gtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccat-atagtttcatacctacatggcctcatgatccctctcattctgatgtgattc 21220472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Original strand, 27578753 - 27579116
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | | || ||    
T  27578753 ttgtaacatctcagacgacattaagtattctcgattgaccctacaaatcaacacaagtcttttcagcatgatttgtcctcactcgcacgctttctgggaa 27578852  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  |||  |    
T  27578853 acttcccagaaggtcacgcatcccaaaatcgctccaagttaagcacgcttaactgtgtagttcttatggatagggctactgaaaagaagatgtgtctaat 27578952  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    |||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  27578953 tgatatatgtagtaccaaacaattcttataagtcttcagtcaacca-agtagtgtcatacctacacgactttaagatccctcttattccgatgtgattc- 27579050  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
      |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||| | |||||| || ||||| || |||||||    
T  27579051 ggttttacctagaagc-tgtcaagagtcggaccactccccaccctcaccagcctcgagcattacatg 27579116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 394 - 622
Target Start/End: Original strand, 14571702 - 14571928
Alignment:
Q  394 gtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14571702 gtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcc 14571801  T
Q  494 cttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactc 593  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||  |||||||||| | |||| ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  14571802 cttcaaccatga-agtcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattc-agtttttcctagaaccaagccaggagccggaccactc 14571899  T
Q  594 ctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14571900 cccgccctcatcagcctcgggtgttacat 14571928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 277 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17628788 - 17628561
Alignment:
Q  277 tttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcat-acggaaaacttcccggtaggtcaccc 375  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | | || || |||||  | |||||||||    
T  17628788 tttcaggattgccgactgactccacataccaacacaagtctttccagtgtgttttgtcctcactcacacgctttatgggaatcttcctagaaggtcaccc 17628689  T
Q  376 atcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 475  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17628688 atctcaaaattgctccaagtcaggcacgctcaactgtggaattcttatgggttgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaa 17628589  T
Q  476 caattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17628588 caattcttataagcctaccttcaaccat 17628561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 29628499 - 29628808
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||| |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||| || |||    
T  29628499 tgtaacattccagacgacttaaagcattgccgactgatcctacaaatcaacacgagttttttcagcgtattttatcctcactcgtacacttactgggaaa 29628598  T
Q  358 c--------------ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaga 443  Q
    |              ||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  29628599 caaactttctggagtttcccggtaagtcacccatccaaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaca-a 29628697  T
Q  444 agatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcatt 543  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29628698 agacacatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcatt 29628796  T
Q  544 ccgatgtgattc 555  Q
     |||||||||||    
T  29628797 tcgatgtgattc 29628808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 268 - 555
Target Start/End: Original strand, 31817707 - 31817993
Alignment:
Q  268 ccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggt 366  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||  || || | || ||||||||||||||||||| | | |  ||||||| | |     
T  31817707 ccagactgctttcaggattgctgactgatccctcaaaccaacacgagtcatt-caacatgatttgtcctcactcgcacgctttccgcgaaacttcaccga 31817805  T
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31817806 aggtcgcccatcctaaaactactacaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatgaaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggt 31817905  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  31817906 agtaccgaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacatgcatgacctcataatccctcttattccgatgtgattc 31817993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 258 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 27026798 - 27026557
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||| || | |||||||| | |||   |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| |   || ||    
T  27026798 ttgtaacatctcatattactttcaagtttgctaactggccccacaaacaaacacgagtcttttcagcgtgttttttcctcagtcacacgctttttggtaa 27026699  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  27026698 acttcctagaaggtcacccttcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactacgtagttcttatggaatgggctaccaaaaa-aagatgcatcttgt 27026600  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27026599 tgatataggtagtatcaaacaattcttataagccttccttcaa 27026557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 291 - 503
Target Start/End: Original strand, 8467690 - 8467890
Alignment:
Q  291 actgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgct 389  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | | || |||||||||   ||||||||||     ||||||||    
T  8467690 actgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgctttccgagaaacttcccataaggtcaccca-----aaattgct 8467784  T
Q  390 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagc 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8467785 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct--------gggctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagt 8467876  T
Q  490 cttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||||    
T  8467877 cttccttcaaccat 8467890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 388 - 555
Target Start/End: Original strand, 53996090 - 53996256
Alignment:
Q  388 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53996090 ctccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataa 53996189  T
Q  488 gccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    || |||||||||||||   ||||||||| |||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  53996190 gcattccttcaaccat-gtagtcccatatctacatagcctcaggatccttctcattccgatgtgattc 53996256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 355 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17029528 - 17029328
Alignment:
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  || |||||||||    
T  17029528 aaacttcccagaaggtcacccaacccaaaaatgctccaagttaagcactcttaactgtggagttcttatggaataaggtaccaaaagtaatatgcatctt 17029429  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||| |||    
T  17029428 gttgatataggtagtactaaacaattattacaagtcttcattcaactat-gcagtcccatacttgcacgacctctagatccctctcattccgatgtaatt 17029330  T
Q  555 ca 556  Q
    ||    
T  17029329 ca 17029328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 441
Target Start/End: Original strand, 27578133 - 27578314
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | || ||    
T  27578133 ttgtaacatcccagactcctttcaggattaccgact---cctacaacccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgttttcagggaa 27578229  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaa 441  Q
    |||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||    
T  27578230 acttcccataaggtcactcatcccaaaactgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatagtttgggctaccgaaaa 27578314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 396 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 27029434 - 27029331
Alignment:
Q  396 caagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcct 495  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27029434 caagcacacttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaataattcttataagtcttcct 27029335  T
Q  496 tcaa 499  Q
    ||||    
T  27029334 tcaa 27029331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 372 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 17029055 - 17028858
Alignment:
Q  372 acccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtac 471  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17029055 acccatcccgaaattgctccaagtcaagcactcttaactatgaagttcttatggaataagctaggtaaaataagacgcatcttgttgatataggtagcac 17028956  T
Q  472 caaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaag 571  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||||||| ||  ||||||||||| | || | | | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17028955 ctaacaattcttacaaatcctccttcaactat-gcagtcccatacatgcaaggcttcaggatccctctcattccgatgtgattca--gtttgcctagaag 17028859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 492
Target Start/End: Original strand, 23091358 - 23091590
Alignment:
Q  263 acatcccagactactttcaggattgtcgactgaccct-acaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac--ggaaaact 359  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| || ||  |    ||||||||    
T  23091358 acataccaaactgctttcagggttgccgactgacccccataaactaacactagtttttttagcgtgttttatcctcacttgcccgtttttcgggaaaact 23091457  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    ||||   |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  23091458 tcccaaaatatcacccatcccaaaattgctacaagtcaagcatgcttaactgtggagtttttatagaataagctaccagaaagaagatgcatcttgttaa 23091557  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagcctt 492  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23091558 tatatgtagtaccaaacaatttttatacgcctt 23091590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 302 - 488
Target Start/End: Original strand, 13613786 - 13613972
Alignment:
Q  302 aaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagc 400  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| | || |  | ||||||||| | | | ||||||||||| || | |  |||||||||| |    
T  13613786 aaaccaacatgagtctttacagcgtgctttgtcctcactcgaaggcttttcagaaaacttctcagaacgtcacccatccaaagactagtccaagtcaaac 13613885  T
Q  401 acgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 488  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13613886 acgcttaactgtggagttcttatagaatgaactaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtggtatcaaacaattcttataag 13613972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 425
Target Start/End: Original strand, 14571545 - 14571700
Alignment:
Q  271 gactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtagg 369  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | | | || |||||||||   ||     
T  14571545 gactgctttcaggattcccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcacacactttccgagaaacttcccaaaaga 14571644  T
Q  370 tcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14571645 tcacccatctcgaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 14571700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33765044 - 33764910
Alignment:
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33765044 gtcacccatcccaaaattgatccaaatcaagcacgcttaagtgtgaagttcttataaaatgagctacaaaaaagaagatgcatcttgttggtataggtag 33764945  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
     ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  33764944 caccaaacaattcttaaaagtcttcatccaaccat 33764910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4185901 - 4185765
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4185901 aggtcacctatcccaaaattgctccaagtcaagcatacttaactgtagagttcttgtagaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgt 4185802  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
     ||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  4185801 ggtatcaaacaattcttatatgtattcctttaaccat 4185765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 391 - 555
Target Start/End: Original strand, 31817376 - 31817539
Alignment:
Q  391 caagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcc 490  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  31817376 caagtcaaacacgcttaattgtagagttcttaaggaatgggctgcggaaaagaagatgcattttgttggtataggtagtaccaaacaattattataaacg 31817475  T
Q  491 ttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  31817476 ttccttcaaccatga-agtctcatacatgcacgacctcatgatccctcttatttcgatgtgattc 31817539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 365 - 493
Target Start/End: Original strand, 20306116 - 20306241
Alignment:
Q  365 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 464  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| | |||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  20306116 gtagggcacccatctaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaaccgtgtagttcttatgaaatgggataccaaaaaga---tgcatcttgttgatatag 20306212  T
Q  465 gtagtaccaaacaattcttataagccttc 493  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20306213 atagtaccaaacaattcttataagccttc 20306241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40607226 - 40607069
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||||||||||| || || || |||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||    
T  40607226 tgtaacatcccagacgaccttaagcattgccgactgattccacaaatcaacacgagttttttcagcgtattttgtcctcactcgaacgcttaccgataaa 40607127  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgga 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||||    
T  40607126 ctttccggtaggtcacccatcccaaatttgctccaaatcaaacacgtttaactatgga 40607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 375 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17629145 - 17628971
Alignment:
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 474  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| || ||| |  ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  17629145 catctcaaaattgctccaagtcaagcatgcttaa-tgtggaattcttttggattgggcttctaaaaagaagaggcatcttattagtataggtagtaccaa 17629047  T
Q  475 acaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtg 551  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17629046 acaattcttataagtttttattcaaccat-acattcacatacctgcacgaccttaggatcccactcattctgatgtg 17628971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 376 - 543
Target Start/End: Original strand, 43928927 - 43929092
Alignment:
Q  376 atcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 475  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43928927 atcccaaaattgctcaaagtcaagcacgtttaattgtggatttcttatgaaataa-ctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaa 43929025  T
Q  476 caattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcatt 543  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||  | |||| ||||||| |||| | | |||| ||||||||||    
T  43929026 caattcttgtaagctttccttcgacca-aatagtctcatacctgcacggcttcaggaaccctctcatt 43929092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7381563 - 7381449
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaa 356  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7381563 ttgtaacatcccatacgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaa 7381464  T
Q  357 acttcccggtaggtc 371  Q
    ||||| |||||||||    
T  7381463 acttctcggtaggtc 7381449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 378
Target Start/End: Original strand, 15268016 - 15268138
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  15268016 tttgtaacagccgagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgaga 15268115  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatc 378  Q
    || |||||||||| |||||||||    
T  15268116 aatttcccggtagctcacccatc 15268138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 41870196 - 41869880
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacc 374  Q
    |||| ||||||  ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||  ||||| |  || |||||||  | | |||||  |    
T  41870196 cttttaggattaccgactaaccccacaaataaacacgagtcttttcagcgtgttctgtcatcccttacacgcttttcgaaaaacttttcagaaggtcttc 41870097  T
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 474  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || || ||| |||| ||||||||||   || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  41870096 catcccaaaattgctctatgtcaaacatgcataattgtgaagttcttatgatttgggttactgaaaagaagatgcgtcttgttgatataggtagtatcat 41869997  T
Q  475 acaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcat 574  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||  |  ||   || ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |    
T  41869996 acaattcttataagtcttccttcaatcat-gcagtcccatatatgtacagtctcaggatccctctcactccgatgtgatt-tagttttgcctagaagc-t 41869900  T
Q  575 gacaggagccggaccactcc 594  Q
     ||||||| || ||||||||    
T  41869899 tacaggagacgtaccactcc 41869880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35477956 - 35477868
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 346  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35477956 ttgtaacatcccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctctctcgcacg 35477868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 370 - 552
Target Start/End: Original strand, 23976175 - 23976357
Alignment:
Q  370 tcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtag 468  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |  ||||   |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23976175 tcactcatcccaaaattattccaagtcaagcacgtttaactgtggagtttttatgattttggctatgaaaaaagaagatgcatcttgttagtataggtag 23976274  T
Q  469 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||  ||||  ||||||||| ||||||||    
T  23976275 taccaaacaattcttataactcttccttcaatcat-gcagacccatacctacatggccccaggaaacctctcatttcgatgtga 23976357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Original strand, 11828439 - 11828509
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccg 437  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11828439 aggtcacccatcccaaaaatgctccaagtaaagcacgcttaactgtggagttcttatggaaggagctaccg 11828509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 552
Target Start/End: Original strand, 26200205 - 26200425
Alignment:
Q  326 tgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatg 424  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||  ||||||||||    
T  26200205 tgttttgtcctcactcacacgcttttcgtgaaacttcgctgaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagca--------tgttaagttcttatg 26200296  T
Q  425 gaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagc--cttccttcaaccatcacagtcccatacctacac 522  Q
    |  |  ||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26200297 gtttcggctaccacaaagaatatgcatcttgtttgtatagttagtatcaaacaattgttataagcctcttccttcaaccatga-tgtcccatacctacac 26200395  T
Q  523 gaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
     |  | |||||||||||||||| |||||||    
T  26200396 aatatcaggatccctctcattctgatgtga 26200425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Original strand, 24271505 - 24271690
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||||| | |||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||  |||||||    
T  24271505 aggtcacgcatcccaaaattgttctaactcaagcatgtttatttgcagagttcttatggaatgggctacccaaaa-aatatgcatcttgttcgtataggt 24271603  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacct--acacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| ||| ||||||   |||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24271604 agtatcaaataattcttatatgtcttactttaaccat-gtagtctcatacctgcacacgacctcaggaaccctctcattccgatgtga 24271690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 457
Target Start/End: Original strand, 33294753 - 33294936
Alignment:
Q  275 actttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaacttcccggtaggtcacc 374  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |  |  ||| || ||   | | || |    
T  33294753 actttcaggattgtagattgacgctacaacccaacacgagtcttttcagcgtgttttgttctcacttgcacacttttgagaaattttccataatggcatc 33294852  T
Q  375 catcccaaaattgctcc-aagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  33294853 cattccaaaattgttccaaagtcgagcacgctttactgtggagttcttatggagtgaactacaaaaaagaagatgcattttgtt 33294936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 367 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 42838812 - 42838680
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgga-gttcttatggaatgagctaccgaaaag--aagatgcatcttgttgatata 463  Q
    |||||| |||| |||  |||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  42838812 aggtcatccattccattattgttctaagtcaaacacgcttaactgtgaaagttcttatggaatgaactatcgaaaaagaaagatgcattttgttgatata 42838713  T
Q  464 ggtagtaccaaacaattcttataagccttcctt 496  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  42838712 ggtagtaccaaacaatttttatacgtcttcctt 42838680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 552
Target Start/End: Original strand, 52048547 - 52048804
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| | |   || ||||||||  | |||||| |||||  ||    
T  52048547 attgtcgactgatctcacaaaccaacatgaatcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcactcttttcgagaaacttcctagaaggtcatccatct-aa 52048645  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  52048646 aattgctccaagt---------ttaactgtggagttcttatggaatgacttaca-aaatgaagatgcatcttgttagtatacgtagtatcaaacaattct 52048735  T
Q  483 tataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    |||||   |||||||| | ||  ||||  |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  52048736 tataaattttccttcagctat-gcagtttcatacctgtacggccttaggaaccctctcattccgacgtga 52048804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 4186315 - 4186224
Alignment:
Q  405 ttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcctt 496  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  4186315 ttaactgtgtagttcttatgcaatgggctaccaaaaagaagatgaatcttgttcatgtaggtagtaccaaatcattcttataagcattcctt 4186224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44831146 - 44831047
Alignment:
Q  404 cttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  44831146 cttaactgtgaagttcatatgaaatgggctaccgaaaagaatatacatcttgttagtttaggtagtaccaaacaatttttataagcttcccttcaaccat 44831047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 555
Target Start/End: Original strand, 53854858 - 53854948
Alignment:
Q  464 ggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  53854858 ggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-atagtctcatacctacactgcttcatgatccctctcattccgatgtgattc 53854948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Original strand, 4414238 - 4414320
Alignment:
Q  265 atcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    |||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4414238 atcccatacgactttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctgactcgcacgc 4414320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 34554605 - 34554483
Alignment:
Q  377 tcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaac 476  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || | |||||| || |||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  34554605 tcccaaaatttctctaagtcaaacatgtttaactatgaagttcttatggaatggtctaccaaaaataaaatgcatcttgctggtataggtagtgtcaaac 34554506  T
Q  477 aattcttataagccttccttcaa 499  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  34554505 aattcttataagcattctttcaa 34554483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 379
Target Start/End: Original strand, 31816983 - 31817104
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| | | || |||    
T  31816983 tgtaacatcccatactactatcaggattgtcgattggccccacaaaccagcacgagtcttttcaacatgttttgtcctcactcgtacgctttctgggaaa 31817082  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcc 379  Q
    |||||| | | |||||||||||    
T  31817083 cttcccagaatgtcacccatcc 31817104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50399399 - 50399334
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagc 324  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50399399 tgtaacatcgcagactgctttcaggattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagc 50399334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 425
Target Start/End: Original strand, 53854702 - 53854859
Alignment:
Q  269 cagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggta 367  Q
    ||||| ||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||  || ||| ||||||   ||||    
T  53854702 cagacgactttaagcattgccgactaaccctacaaatcaacacgagtcttttcaacgtattttgtcatcactcgcacgtttaccggtaaactttttggta 53854801  T
Q  368 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    |||||| ||||| |||| | || |||||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  53854802 ggtcacacatccaaaaactacttcaagtctaacatgcttaactatggagttcttatgg 53854859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 337
Target Start/End: Original strand, 53995978 - 53996053
Alignment:
Q  262 aacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctc 337  Q
    ||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  53995978 aacatccgagacgactttaaacattgtccactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 53996053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5810130 - 5810041
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5810130 ttgtaacatctcatacttcttttaggattgccgactaaccccacaaatcaacatgagtcttttcagcgtgttttatcctcactcacacgc 5810041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13265932 - 13265859
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt 331  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13265932 ttgtaacatctcagactgctttcaggattaccgactgaccgcacaaactaacacgagtcttttcagcgtgtttt 13265859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 430 - 478
Target Start/End: Original strand, 39902470 - 39902518
Alignment:
Q  430 agctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 478  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39902470 agctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaa 39902518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 53392021 - 53391937
Alignment:
Q  419 cttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||  ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  53392021 cttatggtctgaactaccgaaaaaaatatgtatcttgttgatatagatggtatcaaacaatttttataagcatttcttcaaccat 53391937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 480 - 537
Target Start/End: Original strand, 34801394 - 34801450
Alignment:
Q  480 tcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccct 537  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34801394 tcttataagccctccttcaactat-atagtctcatacctacacgaccttaggatccct 34801450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 438 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 45682318 - 45682257
Alignment:
Q  438 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaa 499  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  45682318 aaaagaaaatgcatcttgttggtatagataataccaaataattcttataaaccttcattcaa 45682257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 338
Target Start/End: Original strand, 2499347 - 2499426
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctca 338  Q
    ||||||||||| ||| ||| | || |||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  2499347 tgtaacatccctgacaactctaagtattgccgattaaccgtacaaaccaacacgcgtcttttcaacgtgttttgtcctca 2499426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 339
Target Start/End: Original strand, 33987019 - 33987074
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcac 339  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33987019 attgtcgactgattccacaaaccaacacaagttctttcagcgtgttttgtcatcac 33987074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 507 - 572
Target Start/End: Original strand, 33987164 - 33987227
Alignment:
Q  507 agtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagc 572  Q
    |||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33987164 agtcacatacctgcacgatctcatgatccctctcattccgatgtgattca--gtttgcctagaagc 33987227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 547
Target Start/End: Original strand, 2499647 - 2499727
Alignment:
Q  466 tagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccga 547  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||| | |||| ||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||    
T  2499647 tagtaccaaacaatttttataagtgttgcttcaaccatga-agtctcatacctgcacggttttagaatccctctcattccga 2499727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 622
Target Start/End: Original strand, 8467994 - 8468030
Alignment:
Q  586 gaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8467994 gaccactccccgccctcgtcaacctcgggcgttacat 8468030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 454 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 17506484 - 17506389
Alignment:
Q  454 tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgt 550  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || || |||  || || ||||| | || ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  17506484 tgttgatataggtagtactatacaattcttataagtcttcttttaatcat-gcactctcatacatgcatgacctcatgatccctctcattctgatgt 17506389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Original strand, 52299826 - 52299902
Alignment:
Q  372 acccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatg 448  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||| | |||||| || ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||    
T  52299826 acccatcctaaaattgctcaaaatcaagcatgtttaactatgaagttcttattgaataggctacaaaaaagaagatg 52299902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 13493085 - 13492721
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||  |    
T  13493085 tgtaacaccccagactgctttcaggattgctgactgaccctacaaatcaacacgagtcttttcagcatgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggta 13492986  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492985 actttccggtaggtcacccatcccaaaattgctctaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 13492886  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||     
T  13492885 tgatataggtagtaccaaacaattattataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacagcctcaggatccttctcattccgatatgattc- 13492788  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13492787 agttttgcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 13492721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 257 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 7912175 - 7911812
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |    
T  7912175 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgaga 7912076  T
Q  357 a-cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7912075 atcttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcaagcataactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 7911976  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  7911975 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagttttccttcaaccat-gcagtcctatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattc 7911877  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttaca 621  Q
     | |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  7911876 -agtttttcctagaaacatgccaggagtcggaccactccccgctctcatcagcctcgggtgttaca 7911812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 258 - 554
Target Start/End: Original strand, 17027381 - 17027677
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||    
T  17027381 ttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaa 17027480  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17027481 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgt 17027580  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17027581 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatt 17027677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Original strand, 17730960 - 17731327
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||    
T  17730960 tgtaacatcctagacgactctcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccgataaa 17731059  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgc----atct 453  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  17731060 ctttccggtaggtcacctatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaaatgtggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatctatct 17731159  T
Q  454 tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17731160 tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttcctttaaccat-gcagtcccatacctgaacggcctcaggatccctctcattccgatgtgat 17731258  T
Q  554 tcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17731259 tcaa-ttttgcctagaagcatgctaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcaggcgttacatg 17731327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 258 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 9352358 - 9351995
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aa 356  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  9352358 ttgtaacgtcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaa 9352259  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9352258 acttccaggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 9352159  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||   |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9352158 ttatataggtagtaccaaacaaatattataagtctcccttcgaccat-gtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcatttcgatgtgatt-a 9352061  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
      |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9352060 tgttttgcctagaagc-tgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggtgttacatg 9351995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 259 - 623
Target Start/End: Original strand, 13191364 - 13191727
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  13191364 tgtaacaccccagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtattttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaa 13191463  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191464 cttcccggttggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 13191563  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13191564 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctacatagtcttaggatccctctcattccgatgtgatt-ta 13191661  T
Q  558 cttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     |||| ||| |||||||  || ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13191662 gtttttcctcgaagcataccaagagccggactactcgccgccctcatcagcctcaggcgttacatg 13191727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 20850618 - 20850320
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20850618 tttgtaacaccccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga 20850519  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850518 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 20850419  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  20850418 ttgatataggtagtacaaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcatgaaccctctcattccggtgtgattc 20850320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 262 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 7912602 - 7912242
Alignment:
Q  262 aacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaactt 360  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||    
T  7912602 aacatcccagattgctttcaggattgccgactaaccccacaaaccaacatgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgtacgcttaacgggaaactt 7912503  T
Q  361 cccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgat 460  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7912502 cccagcaggtcacccattccaaaattgctccaagtcaagcacgtttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgat 7912403  T
Q  461 ataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaactt 560  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7912402 ataggtagtaccaaacaattcatataagttttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattc-agtt 7912305  T
Q  561 ttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  7912304 tttcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgccctcatctgcgtcgggcgttacatg 7912242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 20896538 - 20896835
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttg-tcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||| || ||    
T  20896538 tgtaacatcccagactgctttcaagattgccggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgtttttctcctcactcgcacacttaccgggaa 20896637  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20896638 atttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagccaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgt 20896737  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20896738 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacggcctaaggatccctctcattccgatgtgattc 20896835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 350 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 16520171 - 16519901
Alignment:
Q  350 acggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgc 449  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16520171 acgggaaacttcccggcaggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgc 16520072  T
Q  450 atcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  16520071 atcttgttgatataggtagtaccaaacaaatctcataagccttccttcgaccat-gtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatg 16519973  T
Q  550 tgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    ||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16519972 tgattc-tgttttgcctagaagc-tgccaggagccggaccactccccgccctcatcagcctcgggcgttacatg 16519901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 23986168 - 23986464
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | | |  |||    
T  23986168 tgtaacatcccatactgctttcagaattgccgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcagcgtgtcttctcctcactcgcacgctttccgtgaaa 23986267  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23986268 cttcccagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactgtgaagttcttatggtttgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 23986367  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23986368 catataggtagtaccaaacaattcttataagcctaccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctccggatccctctcattccgatgtgattc 23986464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Original strand, 20126033 - 20126330
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  20126033 tgtaacgtcccagacgactttaagcattgtcgacggaccctacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaa 20126132  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||  |||||||| ||||| | || | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20126133 cttctaggtaggtcgcccattcaaagactactccaagtcaagcacgcttaattgtggaattcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 20126232  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20126233 gatataggtagtatcaaaccattcttataagccttccttcaaccat-gtagtctcatacctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgattca 20126330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 257 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13492630 - 13492393
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgt-cctcactcgcacgcatac-gga 354  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||     
T  13492630 tttgtaacaccctagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttttcctcactcgcacgcttactggg 13492531  T
Q  355 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13492530 aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatctt 13492431  T
Q  455 gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctt 492  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13492430 gttgatataggtaatatcaaacaattcttataagcctt 13492393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 257 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23776737 - 23776439
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaa 355  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  |||  | |    
T  23776737 tttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgactccacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtcgtcactcgcacgtttactagga 23776638  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776637 aacttcccagtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagtacgcttaa-tgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 23776539  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  23776538 ttgatataggtagtaccagacgattcttataagtcttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggcctcaggatacctctcattccggcgtgattc 23776440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 2681071 - 2681363
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaa 357  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||  | |||    
T  2681071 tgtaacatcccagacagctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttctcaacgtgttttgtcctcacttgcacgcttactaggaaa 2681170  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| |||    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2681171 cttcccagta----acccatcccaaaattgttccaaattaagcacgcttaattgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 2681266  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2681267 gatatgggtagtaccaaacaattcttataagtcttcattcaaccat-gcagtcccaaacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattc 2681363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21311812 - 21311514
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||    
T  21311812 tttgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgattgaccctacaaaccaacacgagtccttacagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccggaa 21311713  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||| |||||||||||||||||||  || | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21311712 aacatcccggtaggtcacccatcataagactactcaaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgagcttccaaaaagaagatggatcttg 21311613  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  21311612 tttatctaggtaataccaaacaattcttataaggcttccttcaaccat-gcagtcccatacttgtacggcctcatgaaccctctcattccgatgtgattc 21311514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 259 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 21312266 - 21311969
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||  ||| | ||| || |||    
T  21312266 tgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacaccagtcttttcaatgtgttttgtcttcacttacacacttaccgggaaa 21312167  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21312166 cttcccggtaggtcactcatcataagactgctccaagtcaagcacgtttaactatggatttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 21312067  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||| | || ||||||||||| | |||||||||    
T  21312066 gatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacagcctcatgaaccctctcattctggtgtgattca 21311969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 284 - 555
Target Start/End: Original strand, 2890715 - 2890985
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||||||| |     
T  2890715 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttctcagtaggtcacccatcctag 2890814  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
     | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2890815 tactatttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctactgaaaagaagaagcatctttttgatataggtagtccctaacaattct 2890914  T
Q  483 tataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||  |||||||||    
T  2890915 tataaaccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcgggat-cctctcattctaatgtgattc 2890985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 263 - 546
Target Start/End: Original strand, 2720419 - 2720702
Alignment:
Q  263 acatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttc 361  Q
    |||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2720419 acatcctagactactta-agcattgccgactgaccctgcaaaccgacacgagtcttctcagcgtgttttgttctcactcgcacgcttatcgggaaacttc 2720517  T
Q  362 ccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctacc-gaaaagaagatgcatcttgttgat 460  Q
    ||  || ||||||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||| ||    
T  2720518 ccaatatgtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaaagatgtgtcttgttaat 2720617  T
Q  461 ataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccg 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2720618 ataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacgaccttgggatccctctcattccg 2720702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28780405 - 28780209
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||| | |||  |||||    
T  28780405 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaaaatgttttatcctcactcgcacacttaccagaaaa 28780306  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28780305 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 28780209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 258 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 17851214 - 17850917
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaa 356  Q
    |||||||| | ||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||| |||  | ||    
T  17851214 ttgtaacaactcagacgacattaagtattgccgattgaccctacaaaccaacacgagtcttttcgacttgttttgtcctaactcgcacgcgtactaggaa 17851115  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  17851114 acttcccagtaggtctcccatccgaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatagaatgggctaccagaaagaagatgcatcttgt 17851015  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||| || ||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17851014 tgataaaggtagtaccaaacatatcttatcagcattcttttaaccat-gcagtcccatacttgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattc 17850917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 306 - 555
Target Start/End: Original strand, 6330811 - 6331059
Alignment:
Q  306 caacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgct 405  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||| ||||| |||||| ||| || || ||  |||||||||||| |||  || | | ||| ||||||||||||||    
T  6330811 caacacgagtctttctcgcgtgttttgtcatcacttgcacgcttactgagaatttttcggtaggtcaccaatcataagaatactcaaagtcaagcacgct 6330910  T
Q  406 taactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatca 505  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  6330911 taactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-g 6331009  T
Q  506 cagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
     |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6331010 tagtctcatacctacacggcctcaggatccatctcattccgatgtgattc 6331059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 258 - 592
Target Start/End: Original strand, 9440707 - 9441037
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||   |  ||| ||    
T  9440707 ttgtaacatcccagactgctttcaagattgccgactgaccccacaaaccagcacgagttttttcagcgtattttgtcatcacttgcacatttttcgggaa 9440806  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9440807 acttccaagaaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaaacacacttaactgtgaagttcttatggtttgggctactgaaaagaaaatgcatcttgt 9440906  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||| ||| |||||  |||||||||||   |||  ||||||||||     
T  9440907 tgataaaagtagtaccaaagaattcttataagcattccttcaaccat-gtagttccatgcctgcacga--ttaggatcccttctattttgatgtgattc- 9441002  T
Q  557 acttttgcctagaagcatgacaggagccggaccact 592  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9441003 agttttgcctagaagc-tgccaggagccggaccact 9441037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 281 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11062558 - 11062335
Alignment:
Q  281 aggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcc 379  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  |  || ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  11062558 aggattgccgactgactctataaatcaacacaaattttttcagcgtgttttgtcctcactcacgggtttatcgggaaactttccgataggtcacccatcc 11062459  T
Q  380 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 479  Q
     || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11062458 aaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacaaaacact 11062359  T
Q  480 tcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11062358 tcttataagccttccttcaaccat 11062335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Original strand, 9440160 - 9440456
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||| ||| || ||||  |    | |||    
T  9440160 tgtaacaccccaaactacttttaaaattgtcgactgatcccacaaatcaacacgagtttttttagtatattttgtcatcattcacacgtttttttagaaa 9440259  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9440260 cttcccataaggtcacccatccaaaaattgctccaaatcaagcacacttaactgtgaagttcttatggagtgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgtt 9440359  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9440360 gatataagtagtaccgaacaattcttataagctttcattcaaccat-gcagttccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattc 9440456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 284 - 555
Target Start/End: Original strand, 14771595 - 14771866
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| |||  ||| || ||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  14771595 attgtcgactgactctacaaaccaacatgagtcttatcagcgtgttttgtcctcgctcgtacgtttactggtaaacttccgagtaggtcactcatccaaa 14771694  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
     | | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14771695 gactactccacgtctagcacacttaactgtggagttcttatggaatagattaccaaaaagaatatggatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 14771794  T
Q  483 tataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  14771795 tataagtcttccttcaaccat-gcagtctcatacctacacggcttcgggatccctctcattccggcgtgattc 14771866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 284 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 17851644 - 17851373
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgg-aaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||| | |||| | ||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||| ||||  ||| |||||||||| ||    
T  17851644 attgttgactgaccttacaaaccaatacgattctttttaccgtgttttgccctcgctcgcacgctaacgggaaaacctcccaatagatcacccatccgaa 17851545  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
     | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  17851544 gactactccaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatct 17851445  T
Q  483 tataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||||||||| | |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17851444 tataagccttcttttaaccat-gcagtcccatacttgcacggcctcgggatccctctcattccggtgtgattc 17851373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 367 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15929768 - 15929581
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15929768 aggtcacccatcccaaaattgcttcatgttaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgttgatataggt 15929669  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||| |||| | | |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  15929668 agtaccaaataattcttataagccttcattcaaccat-gtagtccaatacatacaaggcattaggatctctcttattctgatgtgattc 15929581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 259 - 552
Target Start/End: Original strand, 28065687 - 28065982
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||   || |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |   | ||||    
T  28065687 tgtaacatcgcagacaactttaagtattgtcgattgaccccgtaatccaacatgagattttttagcgtgttttgtcatcattcacacgcttttcggaaac 28065786  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaa---gatgcatcttg 455  Q
    ||| ||  |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||   |||||||||||    
T  28065787 ttctcgaaaggttacccatcacaaaactgctcaaagtcaaacatgcttaattgtggagttcttatggaataagctaccaaaaaaaaaaagatgcatcttg 28065886  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28065887 ttgatagagatagtaccaaacaattcttataagctttcattcaatcat-acagtctcatttctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 28065982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 405 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 3652634 - 3652485
Alignment:
Q  405 ttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3652634 ttaactgtggagttcttatggaatgaactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcagacaattcttataagccttccttcaaccat- 3652536  T
Q  505 acagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
      ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3652535 gtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 3652485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 413 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27334301 - 27334159
Alignment:
Q  413 ggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtccc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||    
T  27334301 ggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat-gcagttcc 27334203  T
Q  513 atacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  27334202 atacctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattca 27334159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 413 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 27395041 - 27394899
Alignment:
Q  413 ggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtccc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||    
T  27395041 ggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat-gcagttcc 27394943  T
Q  513 atacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 556  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  27394942 atacctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattca 27394899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 324 - 503
Target Start/End: Original strand, 33774918 - 33775100
Alignment:
Q  324 cgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaa-cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttctta 422  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||| || | | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33774918 cgtgttttttcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttctcagtaggtcacccatccaaagactactgcaagtcaaacacacttaactgtggagttctta 33775017  T
Q  423 tggaatgagctaccgaaaagaagatgca--tcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33775018 tggaatggactatcaaaaagaagatgcatctcttgttgatataggtagcaccagacaattcttataatccttccttcaaccat 33775100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3652819 - 3652658
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaa 356  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  3652819 ttgtaacatctcagacaactttaagcattgtcaactgaccctacaaaccaacaagagtcttttcagctttttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaa 3652720  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagtt 418  Q
     |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3652719 gcttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcaagcttaactgtggagtt 3652658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 284 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1991823 - 1991603
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| || || |  ||||||||||  | | ||||||||||||| ||    
T  1991823 attgttgactgatcccacaaatcaacacgagttttttcagcgtactttgtcttcactcacatgcttttcggaaaacttttcagaaggtcacccatccaaa 1991724  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    || | |||||| ||||  | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  1991723 aactactccaaatcaataatgtttaactgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttagatatgtaataccaaacaattct 1991624  T
Q  483 tataagccttccttcaaccat 503  Q
    | ||||||||| | |||||||    
T  1991623 tgtaagccttcttccaaccat 1991603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 454
Target Start/End: Original strand, 2891161 - 2891340
Alignment:
Q  275 actttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaacttcccggtaggtcacc 374  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||   ||||||||||    
T  2891161 actttaagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaacatcgtagtaggtcacc 2891260  T
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||| || | | |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  2891261 catccaaagactactccaaatcaagcacatttaactgtggagtttttatggaatgggctaccaaaacaaagatgcatctt 2891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 276 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20735973 - 20735696
Alignment:
Q  276 ctttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaaaacttcccggtaggtcacc 374  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||| | ||| || | |  | ||||||||  | |||| |||    
T  20735973 ctttcaggattgtcaactgaccccacaaaccgacgcaagtctttttagcgtgttttgtcctcaattgcatgctttcctggaaacttccttgaaggttacc 20735874  T
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 474  Q
    ||||| ||   | ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  20735873 catccaaaggctactccaagccaaccacacttaactatggagtttttatagaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtatcaa 20735774  T
Q  475 acaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgat 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||   || | |||||||||||||  ||||||||    
T  20735773 acaattcttataagccttcctacaatcat-gtagtcacatacctacacagtctcaagatccctctcattatgatgtgat 20735696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 555
Target Start/End: Original strand, 31821704 - 31821839
Alignment:
Q  419 cttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacct 518  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||    
T  31821704 cttatggaatgagctaccaaaaaaaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaataattcttataagcattccttcaaccat-gtagtctcatacct 31821802  T
Q  519 acacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31821803 acatggcctcatgatccctctcattccgatgtgattc 31821839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32293055 - 32292887
Alignment:
Q  381 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt 480  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||| | |||  |||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32293055 aaaattgctcaaagtcaagttcgcttaactatggagttcttat--aatgtgttactaaaaacaagatgtattttgttggtataggtagtaccaaacaatt 32292958  T
Q  481 cttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||| || |||||  |||||||||| ||||||    
T  32292957 cttataagccttcattcaaccat-gcagtctcatacctgcacgatctaaggatttctctcattccaatgtga 32292887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 388 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20732743 - 20732628
Alignment:
Q  388 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 487  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20732743 ctccaagtcaagcactcttaaccgtagagtttttattgaatgggctaccgaaaagaatatgcatattattaatataggtagtaccaaataattcttataa 20732644  T
Q  488 gccttccttcaaccat 503  Q
    |||||||| |||||||    
T  20732643 gccttcctacaaccat 20732628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 594
Target Start/End: Original strand, 9440485 - 9440612
Alignment:
Q  464 ggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  9440485 ggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatga-agtcccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattc-agttttc 9440582  T
Q  564 cctagaagcatgacaggagccggaccactcc 594  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  9440583 cctagaagc-tgcaaagagccggaccactcc 9440612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 367 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 17205524 - 17205405
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| || ||||    
T  17205524 aggtctcccatcccaaaattactccaaatcaagcatgtttaacaatggagttcttatggaatgggctacc-aaaacaagatgaatcttgttggtaaaggt 17205426  T
Q  467 agtaccaaacaattcttataa 487  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17205425 agtaccaaacaattcttataa 17205405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12194592 - 12194406
Alignment:
Q  289 cgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattg 387  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||  | | ||||||||| |    |||||| |||||| |||||||    
T  12194592 cgactgacccca-aaaccaacatgagtcttttcagtgtgttttgtccaaactcacacgttttctggaaaactttctaaaaggtcatccatcctaaaattg 12194494  T
Q  388 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 475  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12194493 ctccatgtcaaacatgcttaactgtggagttcttatggaatgaattataaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtgccaaa 12194406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 414 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 15929338 - 15929251
Alignment:
Q  414 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaacc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15929338 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttattgatataggcattaccaaacaattcttataagcttttcttcaacc 15929251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 389 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28583127 - 28583013
Alignment:
Q  389 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 488  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  28583127 tccatgtcaaggacacttagctgtggatttcttatggaatgaactaccggaaagatgatgcatcttgttgatatagatcgtatcaaataattcttataag 28583028  T
Q  489 ccttccttcaaccat 503  Q
    ||||| |||||||||    
T  28583027 ccttcattcaaccat 28583013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 500
Target Start/End: Original strand, 3884977 - 3885180
Alignment:
Q  293 tgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcca 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| || || |   |  ||||| | |  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  3884977 tgaccctacaaaccaacacaagtctttacatcgtgttttgtcctcactcacatgcttcttgggaactttc-gaaatgtcacctatctcaaaattgctcca 3885075  T
Q  393 agtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctt 492  Q
    ||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||   || |||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3885076 agtcaagcacgttcaactttgaagttcttatggaataagctacc---aaaaagatgtattttgttagtatatgtagtaccaaacaattcttttaagcatt 3885172  T
Q  493 ccttcaac 500  Q
    ||||||||    
T  3885173 ccttcaac 3885180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3653191 - 3653048
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaact 359  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| || ||| |||||    
T  3653191 taacatcccagacgattttaagcattgccgattgaccctacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgttttgtc----ctcgcacgcttatcgggaaact 3653096  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgctta 407  Q
    || || |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  3653095 tctcgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgctta 3653048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 289 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11062094 - 11062022
Alignment:
Q  289 cgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaacttc 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  11062094 cgactaaccctacaaaccaacacgagtttttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaacttc 11062022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 13490169 - 13490055
Alignment:
Q  506 cagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatc 605  Q
    |||||| |||||| |||  ||| | |||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13490169 cagtcctatacctgcacagcctcatgatctctctcatttcgatgtgatt-aagtttttcctagaagcatgtcaggagccggaccactccccgccttcatc 13490071  T
Q  606 aacctcgggcgttaca 621  Q
    | ||||||||||||||    
T  13490070 agcctcgggcgttaca 13490055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 334
Target Start/End: Original strand, 6331217 - 6331294
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtc 334  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  6331217 tttgtaacatctcagactgctttcaagattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcatgttttgtc 6331294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 503
Target Start/End: Original strand, 30729807 - 30729935
Alignment:
Q  375 catcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 474  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  30729807 catcccaaaattgctcaaattcaagaacgcttaactataaagttcttatagaattgactacccaaaagaagatcaatcatgtttatatacgtagtaccaa 30729906  T
Q  475 acaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    |||||| |||| || | ||||||||||||    
T  30729907 acaatttttatgagtcctccttcaaccat 30729935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 283 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27334364 - 27334305
Alignment:
Q  283 gattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcg 342  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27334364 gattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 27334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 283 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27395104 - 27395045
Alignment:
Q  283 gattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcg 342  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27395104 gattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 27395045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15929435 - 15929346
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 347  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15929435 ttgtaacatcccagactgctttaaggattgccgagtgaccccacaaatcaacacaagtctttttagcgtattttgtcctcactcacacgc 15929346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21312533 - 21312453
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcact 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21312533 tgtaacatcccagacgactttaaccattgtcgactgaccctacaaaccaacaccagtcttttcagc-tgttttgtcttcact 21312453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 3653051 - 3652981
Alignment:
Q  481 cttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3653051 cttataagccttcgttcaaccatg-cagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtga 3652981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33471019 - 33470848
Alignment:
Q  371 cacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagta 470  Q
    ||||||||||||||    || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||    
T  33471019 cacccatcccaaaaaatttcaaagtcaaacacgcataactgtggaattcttatgtaatgaactacaaaaaagaatatgcatcttgttagtataggtaata 33470920  T
Q  471 ccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattc 544  Q
    ||||  || ||| ||||| ||||||| |||||| | |||| | |||| ||| || |||||| |||| |||||||    
T  33470919 ccaagtaa-tctaataagtcttcctttaaccatga-agtctcttaccaacatgatcttagggtcccactcattc 33470848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 484
Target Start/End: Original strand, 34660468 - 34660585
Alignment:
Q  367 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 466  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||   |||||||||  || |||||||||| |||| ||||||| |    
T  34660468 aggtcacccatctaaaacttgcttcaagtcaagtatgcttaactatggagttcgtatgatttgagctaccagaaggaagatgcatattgtcgatatagat 34660567  T
Q  467 agtaccaaacaattctta 484  Q
    | |||||||||| |||||    
T  34660568 aataccaaacaactctta 34660585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 410 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10964447 - 10964340
Alignment:
Q  410 tgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagt 509  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||  || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  10964447 tgtggagtttttatggattaagctaccaaaaagaatatttattttattgatatatgtagtaccaaacaattcttgtaagtctttcttctaccat-acagt 10964349  T
Q  510 cccatacct 518  Q
    | |||||||    
T  10964348 ctcatacct 10964340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 426
Target Start/End: Original strand, 31415951 - 31416107
Alignment:
Q  270 agactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg-catacggaaaacttcccggtag 368  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||  |||||| ||   ||    
T  31415951 agacaactttaagtattgccgactgatcccacaaaccaacacga-tcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgtttttcgagaaactttccataag 31416049  T
Q  369 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgga 426  Q
     ||  ||||||||||| |  || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31416050 atcgtccatcccaaaactaatctaagtcaaacacgcttaattgtggagttcttatgga 31416107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 309
Target Start/End: Original strand, 33774868 - 33774918
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaac 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  33774868 tgtaacatcccagacgactttaaacattgccgactgaccctacaaaccaac 33774918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Original strand, 31821643 - 31821699
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagt 315  Q
    |||||||||||| |  ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31821643 tgtaacatcccatatgactttaagcattgccgactgaccatacaaaccaacacgagt 31821699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 257 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 106017 - 105652
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacg-gaa 355  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |    
T  106017 tttgtaacatctcagactgctttcagaattgccgactgaccctataaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccagga 105918  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  105917 aacttctcggtaggtcacacatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttg 105818  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  105817 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccct-gcagttccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgatt- 105720  T
Q  556 aacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  105719 tagttttgcctagaagcatgccaggaaccagaccactccccgccctcatcagccttgggtgttacatg 105652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 258 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 19262 - 18966
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||    
T  19262 ttgtaacatcccagactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaa 19163  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19162 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgt 19063  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgatt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19062 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatt 18966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 489 - 623
Target Start/End: Original strand, 18203 - 18335
Alignment:
Q  489 ccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggac 588  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18203 ccttccttcaaccatg-cagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgattcag-tgttgcctagaagcatgccaggagccggac 18300  T
Q  589 cactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  18301 cactccccgccctcatccgcctcgagcgttacatg 18335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 262 - 623
Target Start/End: Original strand, 162531 - 162892
Alignment:
Q  262 aacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagt-tttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaact 359  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  162531 aacatcccatactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgcgaaact 162630  T
Q  360 tcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttga 459  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  162631 tccaggtaggtcactcatcccaaagttgctccaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaa 162730  T
Q  460 tataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaact 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  162731 tataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccat-gcagtcacatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtaattc-agt 162828  T
Q  560 tttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  162829 tttgcctagaagcatgtcaggagccagaccactccccaccctcatcagcctcgggcattacatg 162892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 259 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 163366 - 163167
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  163366 tgtaacatcccagacgactttcaggattgtcgacagaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaa 163267  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163266 cttctcggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 163167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 257 - 454
Target Start/End: Original strand, 162983 - 163181
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-a 355  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |    
T  162983 tttgtaacatcccagactgttttcaggattgccgactggccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgaacgcttaccgaga 163082  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  163083 aacttcccgataggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 163181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 259 - 552
Target Start/End: Original strand, 69666 - 69959
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||| | |  | |||    
T  69666 tgtaacatcccaaactgctttcaggattgccgactgaaccaacaaaccaacacgagtctttttagcgtggtttgtcatcactcacacgctttcccataaa 69765  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    |||||| | ||||||||||||| || | | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  69766 cttccctgaaggtcacccatccaaagactactcctagtcaagcccgcataactgtggagttcttatggaatgagctaatgaaaaaaagatgcatcatgtt 69865  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 552  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||| ||    ||||||||||||||||||  |||||||    
T  69866 gatataggtagtaccaaacaattattataagcattccttcaacgat-gcagtctcatacctgcatagtcttaggatccctctcattatgatgtga 69959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 259 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 1515 - 1219
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  1515 tgtaacatcccagactgctttcaggattgtcgactgacgccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaa 1416  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1415 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 1316  T
Q  458 gatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||| || |||||||||| ||||||||    
T  1315 tatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattc 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2198
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  1900 tttgtaacatcccaaacgacttttaggattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttaccggga 1999  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2000 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 2099  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||| |||| |||||| | ||||||||    
T  2100 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtctcatacctgcacggcctcaggaaccctttcattctggtgtgattc 2198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 258 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 3038 - 2741
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaa 356  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||    
T  3038 ttgtaacatccgagactgctttcagcattgccgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaa 2939  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2938 acttcccggtaggtctcccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgt 2839  T
Q  457 tgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2838 tgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattc 2741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 262 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 155049 - 154756
Alignment:
Q  262 aacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaactt 360  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||    
T  155049 aacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactagcacacttaccgagaaactt 154950  T
Q  361 cccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgat 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  154949 cccggtaggtcacccattccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgat 154850  T
Q  461 ataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  154849 acaggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaaccat-gtagtcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattc 154756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 257 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 154599 - 154511
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  154599 tttgtaacatcccagactgctttcagcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 154511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 4857 - 4560
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  4857 tttgtaacatcccagtcgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccggga 4758  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757 aacttcccggtaggtcacccatcccaaa-ttgctccaagttaagcacacttaactgtggagttcttataaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 4659  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4658 ttgatataggtagtaccaaacaattcttctaaaccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctccttccgatgtgattc 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 5317 - 5015
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaa 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |    
T  5317 tttgtaacatcccagacgactttaagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccggga 5218  T
Q  356 aacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5217 aatttccaggtaggtcacccatcccaaa-ttgctccaagttaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 5119  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttat-----aagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgt 550  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |     || |||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||| |||    
T  5118 ttaatataggtagtaccaaacaattcttctcttttaaaccttccttcaaccatg-cagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctcattccggtgt 5020  T
Q  551 gattc 555  Q
    |||||    
T  5019 gattc 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5419 - 5331
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtg-ttttgtcctcactcgcac 345  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5419 ttgtaacatcctagacgactttaagcattgtcgacttaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcac 5331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 267 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 245369 - 245019
Alignment:
Q  267 cccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccgg 365  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||||| |    
T  245369 cccatactgctttcaggattgccgactgaccccgcaaaccaacacgagtcttttcaccgtgttttgtcctcactcacacgctttccgagaaacttcccag 245270  T
Q  366 taggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 465  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  245269 aaggtcacccatctcaaaattgctctaagtcaagcacgctt---tgtggagttcttatggtttaggctaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatatagg 245174  T
Q  466 tagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcc 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |    
T  245173 tagtaccaaacaattcttataagcctcccttcaaccat-gtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcatatttt-tc 245076  T
Q  566 tagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  245075 tagatgcatgccaagagccggaccactccccgccctcatcagccttgggcgttacat 245019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 394 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 245674 - 245448
Alignment:
Q  394 gtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  245674 gtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcc 245575  T
Q  494 cttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactc 593  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||  |||||||||| | |||| ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  245574 cttcaaccatga-agtcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattc-agtttttcctagaaccaagccaggagccggaccactc 245477  T
Q  594 ctcgccctcatcaacctcgggcgttacat 622  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  245476 cccgccctcatcagcctcgggtgttacat 245448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 245831 - 245676
Alignment:
Q  271 gactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtagg 369  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | | | || |||||||||   ||     
T  245831 gactgctttcaggattcccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcacacactttccgagaaacttcccaaaaga 245732  T
Q  370 tcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245731 tcacccatctcgaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 245676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 259 - 467
Target Start/End: Original strand, 13384 - 13593
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaa 357  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  13384 tgtaacatcccggactgctttcaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacaaagaaa 13483  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13484 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 13583  T
Q  458 gatataggta 467  Q
    ||||||||||    
T  13584 gatataggta 13593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 257 - 555
Target Start/End: Original strand, 17447 - 17745
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    |||||||||| |||||| | ||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17447 tttgtaacattccagacgattttaagtattgccgactgaccctatgaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaaa 17546  T
Q  357 a-cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    | ||| |  ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  17547 aactttcgagtaggtcacccatccaaagagtactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaattgagctaccaaaaagaagatacatcctg 17646  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17647 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat-gtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtcattc 17745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 257 - 556
Target Start/End: Original strand, 17985 - 18282
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaa 356  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  17985 tttgtaacatcc-agacgactttaagcattgtcgattgaccctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttgtgtcctcactcgcacgtttaccgaaa 18083  T
Q  357 a-cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 455  Q
    | ||| ||  |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  18084 aactttccaataggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctacc-aaaaaaagatgcatcttg 18182  T
Q  456 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18183 ttgatataggtagtatcaaacaattcttataagtcttccttcaactat-gtagtcacatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 18281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Original strand, 14553 - 14749
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||    
T  14553 tgtaacatcccagactgctttcagcattgtcggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaa 14652  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14653 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 14749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 259 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2391 - 2155
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacggaaaac 358  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||        
T  2391 tgtaaaatcccagactgcttttaggattgtcgactgatcctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttctcctcactcgcacgcttaccgag--- 2295  T
Q  359 ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttg 458  Q
         |||||||||||||||  || | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  2294 -----ggtaggtcacccatcataagactactccatgtcaagcatgcttaactgtggagttcttaaggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttt 2200  T
Q  459 atataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 503  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2199 atatagggagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 2155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 749
Alignment:
Q  507 agtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  797 agtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 259 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 421
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||| |||    
T  605 tgtaacatccgagactacttttaggattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttatcgggaaa 506  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaag 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  505 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccatgtcaagcacgcttaactatggagattttatggaatgagctaccgaaaag 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 438 - 623
Target Start/End: Original strand, 142305 - 142488
Alignment:
Q  438 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccct 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  142305 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattccttcaaccatga-agtcccatacctgcacggcctcaggatccct 142403  T
Q  538 ctcattccgatgtgattcaacttttgcctagaagcatgacaggagccggaccactcctcgccctcatcaacctcgggcgttacatg 623  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  142404 ctcattccgatgtgattc-agtttttcctagaagcatgccaggagccggaccactccccgtcctcatcagcctcgggcgttacatg 142488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 259 - 412
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1706
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaa 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || || ||| |||    
T  1552 tgtaacatcccagactgctttcaggattatcgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaa 1651  T
Q  358 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1652 cttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgt 1706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Original strand, 24466 - 24636
Alignment:
Q  86 ctctttgagatgatatctctttgctgcaaccacactnnnnnnnnnnnnntatcacttccctcctaattttgtttaaaattattttctctacattcagagg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24466 ctctttgagatgatagctctttgctgcaaccacactcaaaaagcaaaaatatcacttccctcctatttttgtttaaaattcttttctctacattcagagg 24565  T
Q  186 ggaggactatactttgagcacatgggtctggtaagaaggtaagaaaccccttcaacaatttcaatagtgtg 256  Q
     ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24566 agaggactgtactttgagcacgtggttctggtaaaaaggtaagaaaccccttcaacaatttcaacagtgtg 24636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 317 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 14978 - 14740
Alignment:
Q  317 ttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgga 415  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||    |||||||||||| || |   ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  14978 tttttagcgtgttttgtcatcactcgcacgtttttcggaaaacttcccatatggtcacccatccaaagaccactccaagtcaaacatgcttaactgtgaa 14879  T
Q  416 gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccata 515  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||| |||    
T  14878 gttcttattcaatgaattaccgaaaagacgatgcatcttattgatataggtattaccaaacaattcttataagcattccttcaa-cactgcagtcctata 14780  T
Q  516 cctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    | | |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14779 catgcacgatattaggatccctcttgttccgatgtgattc 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 284 - 493
Target Start/End: Original strand, 44597 - 44807
Alignment:
Q  284 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatac-ggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 382  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |   |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44597 attgtcgccggaccttacaaaccaatacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaa 44696  T
Q  383 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 482  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  44697 aattgatccaagtcaagcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattct 44796  T
Q  483 tataagccttc 493  Q
    |||||||||||    
T  44797 tataagccttc 44807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 373 - 425
Target Start/End: Original strand, 45142 - 45193
Alignment:
Q  373 cccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 425  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45142 cccatctcaaaattgatc-aagtcaagcacacttaaatgtggagttcttatgg 45193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 426 - 557
Target Start/End: Original strand, 4001 - 4131
Alignment:
Q  426 aatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgac 525  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |    
T  4001 aatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaacaat-gcagtcccatacctgcacggc 4099  T
Q  526 cttaggatccctctcattccgatgtgattcaa 557  Q
    ||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4100 ctcgggatccctctcattctggtgtgattcaa 4131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 441 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23785 - 23672
Alignment:
Q  441 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctc 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| | || |||||||    
T  23785 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat-gcagtcccatacctgcacggcctcaagaaccctctc 23687  T
Q  541 attccgatgtgattc 555  Q
    ||| || ||||||||    
T  23686 atttcggtgtgattc 23672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 282 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26340 - 26074
Alignment:
Q  282 ggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcatacgga-aaacttcccggtaggtcacccatccc 380  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| || |   || |||||| |    || |||| |||||     
T  26340 ggattgccgattgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttatgttctccctcgcaagcttttcgagaaactttctataagctcactcatcct 26241  T
Q  381 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatt 480  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26240 aaaaatactccaagtcaagcacacttaactg--gagttcttataaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaaaaatt 26143  T
Q  481 cttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgt 550  Q
      |||||||| |  | ||||||| | |||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  26142 tgtataagccattatgcaaccatga-agtctcacacctgcacggccttaggatccctctctttctgatgt 26074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16321 - 16259
Alignment:
Q  277 tttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcact 340  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||    
T  16321 tttcgggattgccgactgaccctacaaaccaacacgag-cctttcagcatgttttgtcatcact 16259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7237 - 7009
Alignment:
Q  258 ttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcata-cggaaa 356  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||| || || |  ||| ||    
T  7237 ttgtaacattccagacgattttcagaattgtcgattgaccccacaggccaacacgagtcttttcaccttgttt-gtccccactcacatgcttttcgggaa 7139  T
Q  357 acttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgt 456  Q
    |||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||   |  | |||| ||| ||||||||||    
T  7138 actttccaaaaggtcacccataccaaaattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatggtttggattgtcaaaaaaaaggtgcatcttgt 7039  T
Q  457 tgat-ataggtagtaccaaacaattcttat 485  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  7038 tggtaatatgtagtaccaaacaattcttat 7009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 62968 - 63030
Alignment:
Q  269 cagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  62968 cagactactttcaggattgccgactgaccccacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgtttt 63030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 331
Target Start/End: Original strand, 67212 - 67286
Alignment:
Q  257 tttgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgtttt 331  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  67212 tttgtaacatcacagactgctttcaggattgccgattgaccccacaaaccaacacaagtgtttttagcgtctttt 67286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 68 - 1
Alignment:
Q  261 taacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgt 328  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68 taacatcccaaactgcttttaggattgcctactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 2548 - 2504
Alignment:
Q  511 ccatacctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 555  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2548 ccatacctacatggcctcaggatccctctcattctgatgtgattc 2504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 442 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 45497 - 45439
Alignment:
Q  442 gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaac 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  45497 gaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaataattctcataagtcttccttcaac 45439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 346
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37251
Alignment:
Q  296 ccctacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 346  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37201 ccctacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgtttttccctcactcgcacg 37251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1138
Description:

Target: scaffold1138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 554
Target Start/End: Original strand, 734 - 843
Alignment:
Q  444 agatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatcacagtcccatacctacacgaccttaggatccctctcatt 543  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |  ||| | |||||| | |||||||||||| | | || |||||||| |||| |||| |  ||||||||||    
T  734 agatgcatcttgttgatgtatgtagtaccgattaatccatataagtcctccttcaaccat-ataatctcatacctatacgatcttatgcaccctctcatt 832  T
Q  544 ccgatgtgatt 554  Q
    | |||||||||    
T  833 ctgatgtgatt 843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 311
Target Start/End: Original strand, 246638 - 246690
Alignment:
Q  259 tgtaacatcccagactactttcaggattgtcgactgaccctacaaaccaacac 311  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  246638 tgtaacatcccagacgactttaagcattgccgacagacactacaaaccaacac 246690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University