View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2924_high_4 (Length: 289)

Name: NF2924_high_4
Description: NF2924
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2924_high_4
NF2924_high_4
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (12-273)||(8370450-8370711)
chr3 (9-271)||(30709755-30710018)
chr3 (9-273)||(40592745-40593010)
chr3 (9-273)||(36028965-36029217)
chr3 (9-273)||(48438074-48438338)
chr3 (16-273)||(16264216-16264473)
chr3 (11-273)||(26298844-26299112)
chr3 (12-273)||(3715965-3716226)
chr3 (16-273)||(40844519-40844775)
chr3 (9-273)||(6794676-6794939)
chr3 (61-273)||(18552846-18553059)
chr3 (34-271)||(21711108-21711344)
chr3 (12-273)||(27974915-27975173)
chr3 (9-273)||(35925342-35925603)
chr3 (31-273)||(3328320-3328561)
chr3 (11-233)||(39039995-39040216)
chr3 (95-273)||(1736268-1736447)
chr3 (12-233)||(33386669-33386890)
chr3 (9-273)||(1417454-1417716)
chr3 (9-273)||(24695127-24695390)
chr3 (74-273)||(25795704-25795905)
chr3 (12-273)||(32143186-32143445)
chr3 (9-273)||(37466151-37466414)
chr3 (12-233)||(27986449-27986668)
chr3 (9-262)||(4386901-4387158)
chr3 (9-130)||(27026805-27026925)
chr3 (9-130)||(27038150-27038270)
chr3 (114-273)||(27452923-27453082)
chr3 (136-269)||(47923873-47924006)
chr3 (16-273)||(1305818-1306072)
chr3 (80-273)||(26928563-26928757)
chr3 (47-244)||(25929435-25929633)
chr3 (12-112)||(1417129-1417227)
chr3 (204-273)||(8126685-8126754)
chr3 (79-269)||(8477290-8477483)
chr3 (173-273)||(40372768-40372868)
chr3 (173-273)||(3323654-3323753)
chr3 (12-102)||(47924007-47924093)
chr3 (12-167)||(1309719-1309872)
chr3 (173-273)||(7167268-7167369)
chr3 (173-273)||(8739035-8739136)
chr3 (173-273)||(9091273-9091374)
chr3 (86-170)||(34491363-34491449)
chr3 (173-271)||(2671560-2671659)
chr3 (128-256)||(2672910-2673038)
chr3 (128-256)||(2677066-2677194)
chr3 (194-253)||(21353607-21353666)
chr3 (9-130)||(8126561-8126682)
chr3 (180-271)||(8512248-8512340)
chr3 (180-271)||(8517128-8517220)
chr3 (148-246)||(18656435-18656530)
chr3 (173-247)||(22173184-22173256)
chr3 (7-122)||(21156287-21156403)
chr3 (153-217)||(38210565-38210629)
chr3 (173-248)||(28503864-28503937)
chr3 (194-248)||(28501697-28501749)
chr3 (194-247)||(24968152-24968204)
chr3 (232-273)||(47649652-47649693)
chr3 (9-256)||(29100030-29100267)
chr3 (12-63)||(47649604-47649655)
chr3 (203-244)||(25929365-25929406)
chr3 (153-217)||(50494194-50494258)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (12-273)||(10445417-10445679)
chr2 (12-273)||(13569191-13569452)
chr2 (9-273)||(10707225-10707490)
chr2 (9-273)||(23078444-23078709)
chr2 (9-258)||(34388719-34388967)
chr2 (12-273)||(8390123-8390387)
chr2 (12-273)||(17865066-17865327)
chr2 (12-273)||(20522083-20522344)
chr2 (9-262)||(33528605-33528858)
chr2 (9-273)||(31055902-31056168)
chr2 (12-273)||(34682307-34682568)
chr2 (34-273)||(39482815-39483055)
chr2 (12-273)||(8039923-8040186)
chr2 (9-264)||(16940191-16940446)
chr2 (9-264)||(17010856-17011111)
chr2 (9-273)||(28259151-28259414)
chr2 (11-273)||(33117998-33118260)
chr2 (9-273)||(21629810-21630067)
chr2 (9-273)||(36757736-36757998)
chr2 (9-269)||(42039646-42039906)
chr2 (9-273)||(14698981-14699235)
chr2 (49-262)||(2869677-2869892)
chr2 (12-273)||(3491616-3491874)
chr2 (12-273)||(25398358-25398619)
chr2 (12-273)||(25403496-25403757)
chr2 (9-227)||(35397372-35397590)
chr2 (12-233)||(40738704-40738926)
chr2 (180-273)||(25407653-25407746)
chr2 (173-273)||(11098899-11099000)
chr2 (173-262)||(27149278-27149367)
chr2 (137-253)||(1345533-1345652)
chr2 (152-252)||(2838024-2838124)
chr2 (173-273)||(14291512-14291613)
chr2 (173-248)||(9296400-9296474)
chr2 (9-122)||(40014788-40014899)
chr2 (149-246)||(39811978-39812072)
chr2 (49-112)||(28770909-28770972)
chr2 (173-263)||(32246812-32246900)
chr2 (173-247)||(44312613-44312685)
chr2 (194-247)||(19344466-19344518)
chr2 (194-247)||(19349324-19349376)
chr2 (47-103)||(12632454-12632510)
chr2 (204-273)||(40014980-40015049)
chr2 (203-262)||(15903874-15903932)
chr2 (67-112)||(5699703-5699748)
chr2 (222-255)||(17490228-17490261)
chr2 (153-217)||(35215586-35215650)
chr2 (153-217)||(35217963-35218027)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (9-273)||(38152412-38152677)
chr4 (12-273)||(3777413-3777672)
chr4 (9-273)||(10047239-10047503)
chr4 (9-273)||(16630653-16630917)
chr4 (9-273)||(5396645-5396911)
chr4 (12-273)||(3796492-3796755)
chr4 (12-272)||(24333674-24333932)
chr4 (9-273)||(5147537-5147801)
chr4 (16-249)||(39245860-39246094)
chr4 (9-273)||(54867042-54867307)
chr4 (9-273)||(5143119-5143383)
chr4 (9-233)||(25862035-25862259)
chr4 (106-273)||(16623266-16623434)
chr4 (7-273)||(42599546-42599816)
chr4 (9-233)||(5269204-5269431)
chr4 (92-271)||(36315205-36315384)
chr4 (92-271)||(36329414-36329593)
chr4 (12-273)||(31985607-31985866)
chr4 (9-273)||(6743389-6743657)
chr4 (33-233)||(8689498-8689696)
chr4 (12-233)||(28468542-28468760)
chr4 (9-262)||(1983284-1983536)
chr4 (9-113)||(16624143-16624246)
chr4 (9-256)||(37781722-37781969)
chr4 (46-247)||(34495822-34496023)
chr4 (137-256)||(5112226-5112344)
chr4 (19-262)||(18377241-18377472)
chr4 (173-273)||(24741964-24742065)
chr4 (173-272)||(29760665-29760765)
chr4 (162-262)||(39774289-39774389)
chr4 (148-263)||(3814024-3814136)
chr4 (148-263)||(5732665-5732777)
chr4 (173-247)||(51520481-51520553)
chr4 (173-247)||(56146700-56146772)
chr4 (173-236)||(9224406-9224468)
chr4 (173-236)||(9229193-9229255)
chr4 (173-263)||(45357269-45357357)
chr4 (173-246)||(45347807-45347878)
chr4 (52-112)||(4956087-4956147)
chr4 (128-217)||(12743899-12743990)
chr4 (128-217)||(12745288-12745379)
chr4 (200-259)||(18912350-18912409)
chr4 (148-246)||(18855727-18855821)
chr4 (153-217)||(16931789-16931853)
chr4 (153-217)||(16934143-16934207)
chr4 (153-217)||(22780373-22780437)
chr4 (153-217)||(22782738-22782802)
chr4 (153-217)||(44599838-44599902)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (9-273)||(29651670-29651935)
chr1 (11-273)||(19072788-19073052)
chr1 (11-273)||(19120678-19120942)
chr1 (12-273)||(47703909-47704171)
chr1 (9-273)||(26644871-26645134)
chr1 (12-273)||(13598259-13598522)
chr1 (7-273)||(16124489-16124756)
chr1 (9-273)||(21536543-21536806)
chr1 (12-273)||(3281571-3281831)
chr1 (12-258)||(27104360-27104602)
chr1 (9-273)||(47098798-47099060)
chr1 (16-273)||(9476130-9476385)
chr1 (9-236)||(775532-775759)
chr1 (9-273)||(37069628-37069890)
chr1 (9-273)||(47102815-47103077)
chr1 (23-273)||(32889313-32889563)
chr1 (12-273)||(13604596-13604857)
chr1 (12-273)||(19358816-19359079)
chr1 (12-273)||(19361405-19361669)
chr1 (12-273)||(19380045-19380309)
chr1 (9-134)||(40816844-40816970)
chr1 (12-273)||(24202742-24203001)
chr1 (9-253)||(17345512-17345756)
chr1 (218-273)||(40816787-40816842)
chr1 (12-182)||(50521165-50521337)
chr1 (180-271)||(43988426-43988518)
chr1 (148-246)||(25445079-25445174)
chr1 (194-255)||(22819474-22819535)
chr1 (173-246)||(41390605-41390676)
chr1 (173-246)||(41398260-41398331)
chr1 (173-248)||(24787364-24787437)
chr1 (189-260)||(48382467-48382538)
chr1 (67-121)||(48382607-48382662)
chr1 (129-217)||(3156968-3157058)
chr1 (200-262)||(9023823-9023885)
chr1 (148-246)||(39445500-39445594)
chr1 (148-246)||(44023864-44023958)
chr1 (68-108)||(9023971-9024011)
chr1 (153-217)||(9459419-9459483)
chr1 (153-217)||(9463246-9463310)
chr1 (153-217)||(16226382-16226446)
chr1 (9-111)||(32737132-32737232)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (15-273)||(29159669-29159927)
chr7 (9-273)||(49091522-49091785)
chr7 (7-273)||(55797-56071)
chr7 (9-273)||(46516283-46516548)
chr7 (9-273)||(2647669-2647934)
chr7 (9-273)||(4796640-4796907)
chr7 (12-273)||(9189981-9190241)
chr7 (11-273)||(33332423-33332685)
chr7 (9-273)||(20283949-20284212)
chr7 (9-273)||(2479199-2479459)
chr7 (9-273)||(21983142-21983409)
chr7 (9-272)||(21988766-21989030)
chr7 (9-272)||(44848659-44848922)
chr7 (9-273)||(23402987-23403250)
chr7 (12-273)||(2580251-2580513)
chr7 (9-273)||(35960674-35960940)
chr7 (12-233)||(9185178-9185396)
chr7 (9-230)||(47263540-47263757)
chr7 (9-167)||(9235634-9235794)
chr7 (12-273)||(18413506-18413763)
chr7 (86-262)||(28617209-28617386)
chr7 (12-273)||(18408629-18408887)
chr7 (12-273)||(21639673-21639932)
chr7 (79-250)||(5817266-5817438)
chr7 (12-273)||(21645871-21646130)
chr7 (79-272)||(1533417-1533613)
chr7 (173-273)||(2057989-2058090)
chr7 (120-217)||(30814539-30814637)
chr7 (92-152)||(22270143-22270204)
chr7 (180-271)||(24261285-24261377)
chr7 (180-271)||(24266164-24266256)
chr7 (86-262)||(3047192-3047368)
chr7 (148-246)||(19992313-19992408)
chr7 (173-236)||(4866754-4866816)
chr7 (173-248)||(20357547-20357620)
chr7 (148-235)||(24024326-24024411)
chr7 (173-247)||(12396935-12397007)
chr7 (148-246)||(31109573-31109668)
chr7 (153-217)||(7351652-7351716)
chr7 (223-273)||(9235556-9235605)
chr7 (173-247)||(12406355-12406427)
chr7 (180-271)||(16880104-16880195)
chr7 (180-271)||(16884960-16885051)
chr7 (129-189)||(47676111-47676172)
chr7 (153-217)||(31155911-31155975)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (9-273)||(14520089-14520353)
chr5 (12-273)||(17003933-17004193)
chr5 (9-273)||(19588606-19588870)
chr5 (7-273)||(11916945-11917214)
chr5 (46-273)||(12084149-12084376)
chr5 (9-273)||(9353306-9353567)
chr5 (12-273)||(36932323-36932583)
chr5 (9-273)||(42127384-42127646)
chr5 (12-273)||(3880166-3880423)
chr5 (9-256)||(28832120-28832365)
chr5 (9-255)||(24553499-24553743)
chr5 (12-273)||(15464396-15464656)
chr5 (121-273)||(10281722-10281875)
chr5 (9-262)||(11181816-11182071)
chr5 (12-273)||(31300569-31300829)
chr5 (12-273)||(38192036-38192297)
chr5 (12-273)||(38219261-38219522)
chr5 (88-255)||(6741789-6741958)
chr5 (74-262)||(33030924-33031115)
chr5 (12-272)||(35387527-35387785)
chr5 (12-273)||(24135712-24135972)
chr5 (7-256)||(2630082-2630338)
chr5 (180-271)||(31401812-31401904)
chr5 (86-252)||(7160897-7161062)
chr5 (173-263)||(15044710-15044798)
chr5 (86-170)||(28278467-28278553)
chr5 (180-271)||(31396955-31397047)
chr5 (86-166)||(38747160-38747241)
chr5 (180-247)||(2785406-2785472)
chr5 (180-247)||(33768210-33768276)
chr5 (173-247)||(43592303-43592375)
chr5 (173-247)||(43598748-43598820)
chr5 (173-247)||(43604240-43604312)
chr5 (173-247)||(43609732-43609804)
chr5 (7-122)||(5611000-5611116)
chr5 (195-247)||(33791362-33791413)
chr5 (12-103)||(34842467-34842557)
chr5 (180-247)||(1457151-1457216)
chr5 (180-247)||(27445001-27445066)
chr5 (180-247)||(27449845-27449910)
chr5 (173-248)||(31180238-31180311)
chr5 (180-245)||(37556613-37556676)
chr5 (180-245)||(37561435-37561498)
chr5 (153-217)||(4410237-4410301)
chr5 (180-248)||(30631437-30631503)
chr5 (180-263)||(28807546-28807626)
chr5 (153-217)||(15552460-15552524)
chr5 (153-217)||(31179371-31179435)
chr5 (153-217)||(31542949-31543013)
chr5 (153-217)||(31545295-31545359)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (9-273)||(10077138-10077402)
chr6 (13-269)||(22963563-22963819)
chr6 (13-269)||(23824574-23824830)
chr6 (9-273)||(5757452-5757713)
chr6 (7-273)||(18232703-18232969)
chr6 (9-233)||(5017482-5017709)
chr6 (9-273)||(31979373-31979637)
chr6 (9-273)||(21355898-21356160)
chr6 (9-271)||(31086448-31086699)
chr6 (60-273)||(4629863-4630078)
chr6 (13-273)||(21801317-21801583)
chr6 (12-233)||(31936451-31936671)
chr6 (118-273)||(5572214-5572369)
chr6 (22-233)||(22708892-22709102)
chr6 (50-266)||(24435951-24436165)
chr6 (79-272)||(5674743-5674939)
chr6 (9-106)||(5572737-5572833)
chr6 (102-233)||(27165635-27165767)
chr6 (128-256)||(33335921-33336049)
chr6 (74-256)||(31076931-31077114)
chr6 (180-263)||(28155542-28155623)
chr6 (128-256)||(33330424-33330552)
chr6 (173-247)||(11856998-11857070)
chr6 (173-246)||(14742426-14742497)
chr6 (180-247)||(6005448-6005514)
chr6 (12-63)||(26258182-26258233)
chr6 (173-247)||(22010686-22010758)
chr6 (173-246)||(14737566-14737637)
chr6 (194-247)||(16838789-16838841)
chr6 (140-253)||(14521663-14521777)
chr6 (173-236)||(28184529-28184591)
chr6 (11-122)||(33721683-33721792)
chr6 (173-246)||(6438525-6438595)
chr6 (153-217)||(12195515-12195579)
chr6 (56-112)||(20504792-20504848)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (9-273)||(23799550-23799815)
chr8 (9-271)||(5702458-5702720)
chr8 (12-273)||(26403203-26403464)
chr8 (9-273)||(4455888-4456151)
chr8 (12-273)||(6127082-6127345)
chr8 (9-273)||(19175727-19175994)
chr8 (9-273)||(7412197-7412464)
chr8 (12-273)||(19752367-19752627)
chr8 (34-233)||(4696609-4696808)
chr8 (9-217)||(9765848-9766057)
chr8 (12-273)||(31071202-31071462)
chr8 (12-233)||(26287766-26287985)
chr8 (12-233)||(26313017-26313236)
chr8 (79-262)||(6813611-6813796)
chr8 (12-270)||(1261930-1262185)
chr8 (89-261)||(9054822-9054995)
chr8 (173-273)||(4760047-4760148)
chr8 (173-273)||(18853139-18853241)
chr8 (173-273)||(18870533-18870635)
chr8 (12-252)||(28307424-28307664)
chr8 (9-262)||(5990545-5990796)
chr8 (127-253)||(3051097-3051224)
chr8 (115-233)||(26301124-26301242)
chr8 (173-273)||(36979401-36979502)
chr8 (173-273)||(10689115-10689216)
chr8 (173-273)||(30655670-30655771)
chr8 (180-271)||(10684226-10684318)
chr8 (173-248)||(6311321-6311394)
chr8 (9-98)||(7493210-7493305)
chr8 (173-273)||(33037779-33037879)
chr8 (180-247)||(35745422-35745488)
chr8 (173-247)||(7289915-7289987)
chr8 (173-246)||(25328268-25328339)
chr8 (233-273)||(4696580-4696620)
chr8 (153-217)||(18810978-18811042)
chr8 (148-246)||(39784813-39784907)
chr8 (129-197)||(43036547-43036616)
chr8 (177-217)||(18813152-18813192)
chr8 (153-217)||(43079873-43079937)
chr8 (153-217)||(43082244-43082308)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (46-273)||(10625-10853)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (9-271)||(85545-85804)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (12-273)||(5544-5807)
scaffold0006 (9-273)||(2352-2616)
scaffold0006 (12-273)||(133253-133514)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (9-273)||(43935-44196)
scaffold0087 (9-273)||(36806-37069)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (12-273)||(8392-8653)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (9-273)||(17126-17387)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (9-233)||(45115-45337)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (12-273)||(17925-18185)
scaffold0188 (12-273)||(24018-24278)
[»] scaffold1805 (1 HSPs)
scaffold1805 (9-63)||(1268-1322)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (180-271)||(14271-14363)
scaffold0197 (180-271)||(19127-19219)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (173-246)||(9632-9703)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (180-271)||(2213-2305)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (180-271)||(148918-149010)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (173-236)||(35061-35123)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (148-246)||(363-457)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (153-217)||(265-329)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8370711 - 8370450
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8370711 aaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 8370613  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  8370612 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 8370513  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8370512 tccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaac 8370450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30710018 - 30709755
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  30710018 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtttagagcaacaccataagcataatcaa 30709920  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||    
T  30709919 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctc 30709820  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30709819 caatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaaga 30709755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40593010 - 40592745
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40593010 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 40592912  T
Q  109 agcacaa-agataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||  || ||||| |||||||    
T  40592911 agcaatatagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctc 40592812  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40592811 caatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 40592745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 36028965 - 36029217
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||        
T  36028965 agcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtatagagcaacaccacaagcataa---- 36029059  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  36029060 -------agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctcca 36029152  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36029153 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaac 36029217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 48438074 - 48438338
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||| | |||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48438074 agcaaaggaaatggtaatcaatagataaagtatctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 48438172  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  48438173 aacaataaagataaacaatgacagaaaggaacaaacacaccaagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 48438272  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48438273 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcatataagcttacacaagaac 48438338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 16264216 - 16264473
Alignment:
Q  16 gaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcacaa 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16264216 gaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaa-caatcctagatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcacaa 16264314  T
Q  116 agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacac--caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatcca 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  16264315 agataaacaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 16264414  T
Q  214 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  16264415 ctatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttccacaagaac 16264473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 26298844 - 26299112
Alignment:
Q  11 caaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa-----aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat 105  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26298844 caaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaaacaacaacaacaacaacaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataat 26298943  T
Q  106 caaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||| |    
T  26298944 caaagcaataaagataagcaacgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccc 26299043  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  26299044 tccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaacttagacaagaac 26299112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3716226 - 3715965
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  3716226 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctacaagcaacaacaacaaaaa-cagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcacaac 3716128  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||    
T  3716127 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaat 3716028  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3716027 ctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaaacttacacaagaac 3715965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 40844519 - 40844775
Alignment:
Q  16 gaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-a 114  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  40844519 gaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctaaatctaagtgtagagcaacactacaagcataatcaaagcaata 40844617  T
Q  115 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccac 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||||    
T  40844618 aagataagcaatgaaagaaatgaacgaacacaccaagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgg-ggagagagcagccctcaaatccac 40844716  T
Q  215 tatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40844717 tatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 40844775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6794939 - 6794676
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  6794939 agcaaaggaagtggtaatcaatagaaaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaca--gacctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaa 6794842  T
Q  109 agcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6794841 agcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcc 6794742  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6794741 aatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaattagcttgcaagcttacacaagaac 6794676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18553059 - 18552846
Alignment:
Q  61 aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttga 159  Q
    ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18553059 aaaacagaactaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataatcaatgaaagaaaggaacaaatacaccaagattgttga 18552960  T
Q  160 accagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaa 259  Q
     ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18552959 cccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataa 18552860  T
Q  260 gcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||    
T  18552859 gcttacacaagaac 18552846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 21711108 - 21711344
Alignment:
Q  34 taaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcacaa-agataagcaatgaaaga 132  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  21711108 taaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatcaccatgtagagcaacaccataggcataatcaaagcaatagagataagcaatgaaaga 21711206  T
Q  133 aaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  21711207 aaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttac- 21711305  T
Q  233 aaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21711306 aaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaaga 21711344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27975173 - 27974915
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||     
T  27975173 aaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagcaaaaca--gaccta-atcta-gtgtagagcaacaccacaagcataaataaaga 27975078  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  27975077 acaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 27974979  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27974978 tccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 27974915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 35925342 - 35925603
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35925342 agcaaagcaggtggtaatcaatgtgtaaaatgtctccaagtaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 35925440  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||  |   | |||| ||||    
T  35925441 aacacaaagatgagcaatgaaagaaaagaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatttgggag---gggcagttctc 35925537  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  35925538 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaattagtttataagcttacactagaac 35925603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3328561 - 3328320
Alignment:
Q  31 gtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaa 129  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3328561 gtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaacaataaagataagcaatgaa 3328463  T
Q  130 agaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtt 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  3328462 agagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgtt 3328363  T
Q  230 acaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3328362 ac-aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 3328320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39040216 - 39039995
Alignment:
Q  11 caaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaag 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39040216 caaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaca--gacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaag 39040120  T
Q  111 cacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| |  |||| || |||||||    
T  39040119 cacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctcca 39040020  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39040019 atccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 95 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1736447 - 1736268
Alignment:
Q  95 acaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggt 193  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||     
T  1736447 acaagcataatcaaagcaataaacataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaatattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggga 1736348  T
Q  194 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1736347 gagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacacaagaac 1736268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33386890 - 33386669
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| |    
T  33386890 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaac 33386793  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  33386792 aataaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 33386694  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33386693 atccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1417716 - 1417454
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| |   || || |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  1417716 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaacat--acataaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaa 1417619  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||| | ||||    
T  1417618 agcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctcc 1417519  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  1417518 aatccactaagaagaaagtgttac-aatgagttataagaaattagcttataaacttacaaaagaac 1417454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24695390 - 24695127
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||| |||||  |||||||||||||||||| | || ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  24695390 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtcttcaagcaacaacaacaaaaa-cagagctaaatctaagtatagagcaacac-acaagcataatcaa 24695293  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||| | |||     
T  24695292 agcaataaagataaacaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctct 24695193  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  24695192 aatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaacttacaaaagaac 24695127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 273
Target Start/End: Original strand, 25795704 - 25795905
Alignment:
Q  74 atctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggtt 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||     
T  25795704 atctaagtgtagagcaacaccacaagcataataaaaacaataaaaataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtc 25795803  T
Q  172 aaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
     ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25795804 caatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaaga 25795903  T
Q  272 ac 273  Q
    ||    
T  25795904 ac 25795905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 32143186 - 32143445
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  32143186 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagc 32143282  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  32143283 aataaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 32143380  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32143381 atccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 32143445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 37466151 - 37466414
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||| | ||||||||||  | ||||||||| ||  || || || ||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  37466151 agcaaaggaaatggtaatcaatggattaagtgtctccaaaaaaaaaaaa-aaaaaacagacattaatctaagtgtagagcaacattacaagcataatcaa 37466249  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||    
T  37466250 agcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctcc 37466349  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  37466350 aatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattaatttataagcttacaaaagaac 37466414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27986668 - 27986449
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  27986668 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaata-gacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaaagc 27986572  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  27986571 aataaagataagcaa-gaaagaatg-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 27986474  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27986473 atccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4387158 - 4386901
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaact--gacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||    ||||||  ||| | ||| || |||| ||||| ||||||||    
T  4387158 agcaaagaaagtagtaatcaatgagtaaagtagccataagcaacaacaacaaaaaaaaaagacctaagtcttaatgtagaacaacgccacatgcataatc 4387059  T
Q  107 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||  ||| | ||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  4387058 aaaacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctc 4386959  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    ||||||||| || ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  4386958 tccaatccaataagataaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaagct 4386901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 27026805 - 27026925
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27026805 agcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaagaaaaa-cagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 27026903  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27026904 agcacaaagataagcaatgaaa 27026925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 27038150 - 27038270
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27038150 agcaaatgaaatggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaa-cagatctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 27038248  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27038249 agcacaaagataagcaatgaaa 27038270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 273
Target Start/End: Original strand, 27452923 - 27453082
Alignment:
Q  114 aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatc 211  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  27452923 aaagataagcaa-gaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatc 27453020  T
Q  212 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27453021 cactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 27453082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 47924006 - 47923873
Alignment:
Q  136 gaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| | | || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  47924006 gaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaa 47923907  T
Q  236 gagttacaagaaattagcttacaagcttacacaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47923906 gagttacaagaaattagcttaaaagtttacacaa 47923873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 1305818 - 1306072
Alignment:
Q  16 gaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca-ca 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |     
T  1305818 gaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaacc 1305914  T
Q  115 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatcc 212  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| | | || || ||||||||||||||||    
T  1305915 aagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatcc 1306011  T
Q  213 actatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  1306012 actacgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaac 1306072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26928757 - 26928563
Alignment:
Q  80 gtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaata 176  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  || ||    
T  26928757 gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagcaataaagataagcta-gaaagaaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagccaa-ta 26928661  T
Q  177 tgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag--aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26928660 tgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 26928563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25929633 - 25929435
Alignment:
Q  47 agcaacaacaacaa-aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaa--caaa 142  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||| ||  ||||    
T  25929633 agcaacaacaacaacaaaacaaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaacaaagataagaaa-gcaagaaagaaaaacaaa 25929535  T
Q  143 cacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttac 242  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  |||| |||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  25929534 cacaccaagatggta-acccagttcggtccaatacgacctactctggggg-gagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttac 25929437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 1417129 - 1417227
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  1417129 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaac--aaaacagacctaaatctaagtgtagagtagcatcacaagcataatcaaagc 1417226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 273
Target Start/End: Original strand, 8126685 - 8126754
Alignment:
Q  204 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8126685 ctccaatccactacgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 8126754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 269
Target Start/End: Original strand, 8477290 - 8477483
Alignment:
Q  79 agtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---ttgttgaaccagttcggttaa 173  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |  ||    
T  8477290 agtgtagaacaacaccacaaagataatacaaagcaaacaagataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaa 8477387  T
Q  174 atatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaa 269  Q
     |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  8477388 -tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaa 8477483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40372868 - 40372768
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  40372868 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaaga 40372770  T
Q  272 ac 273  Q
    ||    
T  40372769 ac 40372768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3323753 - 3323654
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaa 272  Q
    ||||||||||||| |||  | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3323753 aatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaa 3323655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 47924093 - 47924007
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcat 102  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47924093 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaa----aaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcat 47924007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 1309719 - 1309872
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  1309719 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagc 1309815  T
Q  112 -acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttc 167  Q
     || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  1309816 aaccaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttc 1309872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Original strand, 7167268 - 7167369
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  7167268 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 7167366  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  7167367 aac 7167369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8739136 - 8739035
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  8739136 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 8739038  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  8739037 aac 8739035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9091374 - 9091273
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  9091374 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 9091276  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  9091275 aac 9091273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34491449 - 34491363
Alignment:
Q  86 agcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc-aagattgttgaaccagttcggt 170  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  34491449 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggt 34491363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2671659 - 2671560
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  2671659 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagattgcaagcttacacaag 2671561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2673038 - 2672910
Alignment:
Q  128 aaagaaaggaacaaacac--accaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaag 225  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |  || | || |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  2673038 aaagaaaagaacaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaa-tgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatg 2672941  T
Q  226 tgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2672940 tgttacaaaagagttacaagaatctagctta 2672910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2677194 - 2677066
Alignment:
Q  128 aaagaaaggaacaaacac--accaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaag 225  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |  || | || |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  2677194 aaagaaaagaacaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaa-tgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatg 2677097  T
Q  226 tgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2677096 tgttacaaaagagttacaagaatctagctta 2677066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 253
Target Start/End: Original strand, 21353607 - 21353666
Alignment:
Q  194 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagc 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21353607 gagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagc 21353666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 8126561 - 8126682
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||| |||||   || | |||||| || |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  8126561 agcaaaggaagtggtattcaatagatacaatgtctccaaccaacaacaacaaaaacat-acctaaatctaagtgtagagcaacaccacactcataatcaa 8126659  T
Q  109 agc-acaaagataagcaatgaaa 130  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  8126660 agcaataaagataagcaatgaaa 8126682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Original strand, 8512248 - 8512340
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  8512248 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 8512340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Original strand, 8517128 - 8517220
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  8517128 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 8517220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Original strand, 18656435 - 18656530
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18656435 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 18656530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22173256 - 22173184
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22173256 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 22173184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 21156287 - 21156403
Alignment:
Q  7 gaagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagt-gtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||| |    
T  21156287 gaagcaaatgaagtagtaatcaatgagtaaagtagtct-taagcaacaaaaataacaaacaaacctagatctaagagtgaaacaacaccataagaatatt 21156385  T
Q  106 caaagc-acaaagataag 122  Q
    |||||| |||||||||||    
T  21156386 caaagcaacaaagataag 21156403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210565
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactat 38210565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28503937 - 28503864
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 248  Q
    |||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28503937 aatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaaa 28503864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28501749 - 28501697
Alignment:
Q  194 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28501749 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaaa 28501697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Original strand, 24968152 - 24968204
Alignment:
Q  194 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24968152 gagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24968204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 273
Target Start/End: Original strand, 47649652 - 47649693
Alignment:
Q  232 aaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47649652 aaaagagttacaagaaattaacttacaagcttccacaagaac 47649693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Original strand, 29100030 - 29100267
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgta-aagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||| |||  || |||||||||| |||| |||    
T  29100030 agcaaaggaagtagtaatcaatgagtagaatagtctc-aagcaacaacaac---aaactgagatagatctaactgtgaagaaacaccacaaacatattca 29100125  T
Q  108 aagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||   |||| ||| |  |||||||   ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||  || || ||| | ||| | |  ||||||||||||||    
T  29100126 aagc---aaga-aagaagagaaagaa---aac-aacacaccaatattgtttacccagttcggtccaaaattacccactatagggaagagagcagctctcc 29100217  T
Q  208 aatccactatgatgaa-agtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
    | ||||||||||| || |||| ||||||   |||| ||||||||||||||    
T  29100218 attccactatgataaagagtgatacaaagaggttataagaaattagctta 29100267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 47649604 - 47649655
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaa 63  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47649604 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa 47649655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25929406 - 25929365
Alignment:
Q  203 tctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaa 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  25929406 tctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaa 25929365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494194
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 50494194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10445679 - 10445417
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10445679 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaaaaccacaagcataatcaaagc 10445580  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10445579 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 10445480  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10445479 ccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaatcttacacaagaac 10445417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 13569191 - 13569452
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13569191 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacaggcttagatctaagtatagagaaacaccacaagcataatcaaagc 13569290  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatc 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  13569291 acaaagataatcaatgaaagaaaggaataaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 13569390  T
Q  212 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13569391 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagtttacacaagaac 13569452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10707490 - 10707225
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactg-acctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  10707490 agcaaaagaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaagaaaatatacctagatctaagtgtagagcaacactgcaagcataatca 10707391  T
Q  108 aagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| || ||||||    
T  10707390 aagcacaaagataagcaaagaaagaaatgaataaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctcc 10707291  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707290 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 10707225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23078709 - 23078444
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23078709 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 23078610  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  23078609 agcacaaagataagcaatgaaagaatggaacaaacacaccaaaagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctc 23078510  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23078509 caatccactatgatgaaagtgtta-gaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 23078444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 34388719 - 34388967
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34388719 agcaaaggaagtggtaatcaatatgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcaaaatcaa 34388817  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  34388818 agcacaaagataaacaaagaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctcca 34388917  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34388918 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaca 34388967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8390387 - 8390123
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaaca---acaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||| || || ||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8390387 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtatccaaacaacaacaacaacaaaaaccagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 8390288  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  8390287 agcacaaagataagcgatgaaagaaatgaacaaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctcca 8390188  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8390187 atccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttgcacaagaac 8390123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 17865066 - 17865327
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17865066 aaaggaagtggtaatcaatggataaaatgtctccaaccaacaacaacaaaaacat-acctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 17865164  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||    
T  17865165 aataaagataatcaatgaaagaaaggaacaatcacaccaagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaat 17865264  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17865265 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 17865327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 20522083 - 20522344
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20522083 aaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaacaaaaaaa-gacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 20522181  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||    
T  20522182 aataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaat 20522281  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  20522282 ccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaattagattataagcttacaaaagaac 20522344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33528858 - 33528605
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33528858 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtccccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatcaa 33528760  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| | ||||    
T  33528759 agcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctcc 33528660  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33528659 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagct 33528605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 31055902 - 31056168
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31055902 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 31056000  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||    
T  31056001 agcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctct 31056100  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31056101 ccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaataaattagcttataagcttacaaaagaac 31056168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34682568 - 34682307
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    |||| |||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  34682568 aaagaaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaca 34682470  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  34682469 aataaatataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaat 34682370  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34682369 ccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaggcttacacaagaac 34682307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 273
Target Start/End: Original strand, 39482815 - 39483055
Alignment:
Q  34 taaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaaga 132  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  39482815 taaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagaacaacaccacaagcataaccaaagcaataaagataaacaatgaaaga 39482914  T
Q  133 aaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaca 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39482915 gaggaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttaca 39483014  T
Q  233 aaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39483015 aaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 39483055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 8039923 - 8040186
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8039923 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 8040021  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  8040022 aataaagataagcaatgaaggagaggaaaaaatacatcaagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 8040121  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaa--agagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8040122 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 8040186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16940446 - 16940191
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  16940446 agcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaa 16940348  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||| ||| ||  ||| |||| ||||    
T  16940347 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctcc 16940248  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagctta 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16940247 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagcttataagctta 16940191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17011111 - 17010856
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  17011111 agcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctctatgcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgcagagcgacaccaaaagcataatcaa 17011013  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||| ||| ||  ||| |||| ||||    
T  17011012 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctcc 17010913  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagctta 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17010912 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagcttataagctta 17010856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28259414 - 28259151
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa-ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  ||    
T  28259414 agcaaaggaagtaataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaataacaaaaaaacagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcatataca 28259317  T
Q  108 aagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  28259316 aagaacaaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctct 28259218  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28259217 ccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 28259151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 33117998 - 33118260
Alignment:
Q  11 caaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaag 110  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||  || || |||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33117998 caaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaaacatcaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaag 33118096  T
Q  111 cac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  33118097 taataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaa 33118196  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33118197 tccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 33118260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 21629810 - 21630067
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||      ||||    
T  21629810 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaca--gacctagatctaagtgtagagcagcaccacaat-----tcaa 21629902  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  21629903 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgg-ggagagagcagctctcc 21630001  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21630002 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttataagcttacacaagaac 21630067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36757998 - 36757736
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36757998 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaca--gacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 36757902  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| || || | ||||||||    
T  36757901 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctc 36757802  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  36757801 caatccagtatgatgaaagtgtttc-aaagagttataagaaaaaagctttcaagcttacacaagaac 36757736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42039906 - 42039646
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  42039906 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaacat-acctagat-taagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 42039809  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  42039808 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggagcaagcacaccaaaagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctc 42039709  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaa 269  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42039708 taatccactatgatgaaagtgttac-gaagagttacaagaaaattagcttgcaagcttacacaa 42039646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14699235 - 14698981
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa---ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat 105  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14699235 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaagcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataat 14699136  T
Q  106 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    |||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  14699135 caaagca------------atgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccct 14699048  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14699047 ccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 14698981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2869892 - 2869677
Alignment:
Q  49 caacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca-caaagataagcaatgaaagaaag-gaacaaacaca 146  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  2869892 caacaacaacaacaaatagacctaaatctaagtgtagagcaacaccataagcatattcaaagcaacaaagataagcaaataaaggaagagaacaaacaca 2869793  T
Q  147 ccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||| | | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2869792 ccaatattgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaaga 2869693  T
Q  247 aattagcttacaagct 262  Q
    |||||||||| |||||    
T  2869692 aattagcttaaaagct 2869677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 3491616 - 3491874
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  3491616 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatagaaagc 3491712  T
Q  112 a-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  3491713 aaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 3491809  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3491810 atccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 3491874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 25398358 - 25398619
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccaca-agcataat-caaa 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  | ||| ||||    
T  25398358 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctaga-cta-gtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaa 25398454  T
Q  110 gcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  25398455 gcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatgacctaatctgggggagagagcagctct 25398551  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25398552 ccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 25398619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 25403496 - 25403757
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccaca-agcataat-caaa 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  | ||| ||||    
T  25403496 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctaga-cta-gtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaa 25403592  T
Q  110 gcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||  |||||| |  || ||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  25403593 gcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcagccaa-tatgacctaatctgggggagagagcagctct 25403689  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25403690 ccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 25403757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Original strand, 35397372 - 35397590
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || || |   ||||||||||||||||| |   ||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  35397372 agcagaggaagtagtaatcaatgagtgaaatgacctcaagcaacaacaacaaaatat--acctaaatctatgtgcagagcaaaaccacaagcataatcaa 35397469  T
Q  109 agcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgaccta-atatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||   || |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| | ||||| || |||||| || |||||||||     
T  35397470 agcaatcaatataagcaatgaaagaaggaaacaaacacaccaatattgtttacccagttcggttcaatctaacctacatctggaggagatagcagctctt 35397569  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  35397570 caatccactaagatgaaagtg 35397590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 40738704 - 40738926
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatcta----agtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||   | | |||||||    ||||| ||||||||||||||||| |  ||    
T  40738704 aaaggaagtggtaatctatatgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaa--aaccagatctagtctagtgtagagcaacaccacaagcaaataca 40738801  T
Q  108 aagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    |||||  |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  40738802 aagcaataaagataagcta-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatgacctaatctggggg-gagagcagctc 40738897  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40738898 tccaatccactatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 273
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407746
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 25407746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11099000 - 11098899
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  11099000 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaag 11098902  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  11098901 aac 11098899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27149367 - 27149278
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||| |||||    
T  27149367 aatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaaggggtaacaagaaattaccttaaaagct 27149278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1345652 - 1345533
Alignment:
Q  137 aacaaacacaccaaga--ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccac-tatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||| |||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  1345652 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccacttaagatgaaagtgatacaa 1345553  T
Q  234 aagagttacaagaaattagc 253  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  1345552 atgagttgcaagaaattagc 1345533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838024
Alignment:
Q  152 attgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatta 251  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaatta 2838025  T
Q  252 g 252  Q
    |    
T  2838024 g 2838024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Original strand, 14291512 - 14291613
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  14291512 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 14291610  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  14291611 aac 14291613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9296474 - 9296400
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 248  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9296474 aatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 9296400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 40014788 - 40014899
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||   ||||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  40014788 agcaaaggaagtagtaatcaatgg--aaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaacagtcctaaaactaagtgtaaaacatcaccacaagcataatcaa 40014885  T
Q  109 agcacaaagataag 122  Q
    ||||  ||||||||    
T  40014886 agcaacaagataag 40014899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39812072 - 39811978
Alignment:
Q  149 aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    ||||||||||||||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39812072 aagattgttgaaccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 39811978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28770972 - 28770909
Alignment:
Q  49 caacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca 112  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28770972 caacaactacaacaaatagacctagatctaagtgtgaagcaacaccacaagcataatcaaagca 28770909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Original strand, 32246812 - 32246900
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagctt 263  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||    
T  32246812 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctttcaagctt 32246900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44312685 - 44312613
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44312685 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 44312613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Original strand, 19344466 - 19344518
Alignment:
Q  194 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19344466 gagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 19344518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Original strand, 19349324 - 19349376
Alignment:
Q  194 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19349324 gagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 19349376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Original strand, 12632454 - 12632510
Alignment:
Q  47 agcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcata 103  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12632454 agcaacaacaataacaaacagacctagatataagtgtcaagcaacaccacaagcata 12632510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 273
Target Start/End: Original strand, 40014980 - 40015049
Alignment:
Q  204 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  40014980 ctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttgcgagaaattagcttaaaaactcacaaaagaac 40015049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15903932 - 15903874
Alignment:
Q  203 tctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  15903932 tctccaatccactaagataaaagtgatacaaaggggttacaagaaa-tagcttacaagct 15903874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 112
Target Start/End: Original strand, 5699703 - 5699748
Alignment:
Q  67 gacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca 112  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  5699703 gacctagatctaagtgtaaagcaacaccacaagcttattcaaagca 5699748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 255
Target Start/End: Original strand, 17490228 - 17490261
Alignment:
Q  222 aaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17490228 aaagagttacaaaagagttacaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215650
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 35215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218027
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 35218027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38152677 - 38152412
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa-aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38152677 agcaaatgaagtggtaatcaatgtatgaagtgtttccaagcaacaacaacaataaaacagacctagatctaagtgtatagcaacaccacaagcataatca 38152578  T
Q  108 aagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  38152577 aagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctcc 38152478  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38152477 aatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaaattagcttataagcttacacaagaac 38152412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 3777413 - 3777672
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  3777413 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagaacaaaaccacaagcataatcaaagc 3777511  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  3777512 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatc 3777611  T
Q  212 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  3777612 cactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaaacttacacaagaac 3777672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 10047239 - 10047503
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10047239 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaataacaacaaaaata-gacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 10047337  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  10047338 agcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 10047437  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10047438 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 10047503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16630917 - 16630653
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16630917 agcaaaggaactggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcagcaacaacaaaaa-caaacctagatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaa 16630819  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  16630818 agaacaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctcc 16630719  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16630718 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 16630653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5396911 - 5396645
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaa---gtgtcgagcaacaccacaagcataat 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||     
T  5396911 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaga-ctaattagtgtagagcaacaccacaagcataaa 5396814  T
Q  106 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagct 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5396813 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaagaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagct 5396714  T
Q  204 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5396713 ctccaatccactatgatgaaagtgttgc-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 5396645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3796755 - 3796492
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    |||||||||  ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3796755 aaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaatcagacctaaatctaagtgtagagtaacatcacaagcataatcaaagc 3796656  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||    
T  3796655 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaa 3796556  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3796555 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttgcacaagaac 3796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 24333674 - 24333932
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  24333674 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacac---aagcataatcaaagc 24333770  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24333771 aataaagataagcaatgaaagaaagaaacaaacacaccaagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaat 24333870  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaa 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24333871 ccactatgatgaacgtgttacaaaagagttataaaaaattagcttacaagcttacacaagaa 24333932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 5147537 - 5147801
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5147537 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagaaacaacaacaataa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaa 5147635  T
Q  109 agcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  5147636 aacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctcc 5147735  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5147736 agtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 5147801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 39245860 - 39246094
Alignment:
Q  16 gaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-a 114  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |    
T  39245860 gaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaggcataatcaaaacaata 39245959  T
Q  115 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  39245960 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccac 39246059  T
Q  215 tatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39246060 tatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 39246094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 54867042 - 54867307
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa-ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54867042 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacatagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatca 54867141  T
Q  108 aagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||     
T  54867142 aagtaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgg-ggagagagcagccctt 54867240  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54867241 caatcaactatgatgaaaatgttacaaaatagttataagaaattagcttataagcttacacaagaac 54867307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 5143119 - 5143383
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  5143119 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagaacaacaccacaaacataatcaa 5143217  T
Q  109 agcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  5143218 aacaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactgagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 5143317  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5143318 aacccactatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaaaatagcttgcaagcatacacaagaac 5143383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25862259 - 25862035
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25862259 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 25862161  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||| || ||||    
T  25862160 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaataaacacaccaagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctcc 25862061  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25862060 aatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16623434 - 16623266
Alignment:
Q  106 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16623434 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctc 16623335  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  16623334 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctaataagcttacagaagaac 16623266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42599816 - 42599546
Alignment:
Q  7 gaagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaa--aactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42599816 gaagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgactccaagcaacaacaacaaaacaaacaaacctagatctaaatgtagagcaacaccacaagcataa 42599717  T
Q  105 tcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggag--gtgagagcag 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||| |||||||| |  | |||||||     
T  42599716 tcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcagtccaatatgacataatatgggggagagagagcaa 42599617  T
Q  202 ctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42599616 ccctccaatccactaagatgaaaatgttac-aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 42599546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5269431 - 5269204
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa--aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5269431 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaacaaaaatatacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatc 5269332  T
Q  107 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  5269331 aaagcaataaatataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaacaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccct 5269232  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5269231 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36315384 - 36315205
Alignment:
Q  92 accacaagcataatcaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatgga 190  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  36315384 accacaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg 36315285  T
Q  191 ggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36315284 ggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaattagcttagaagcttacacaaga 36315205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36329593 - 36329414
Alignment:
Q  92 accacaagcataatcaaagcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatgga 190  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  36329593 accacaagcataatcaaagcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggg 36329494  T
Q  191 ggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36329493 ggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaattagcttagaagcttacacaaga 36329414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31985866 - 31985607
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||    
T  31985866 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaactccacaagcatatacaaagc 31985769  T
Q  112 -acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
     | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  31985768 aataaagataagcaa-gaaaggaa-gaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg-ggagagagcagctctcca 31985672  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31985671 atccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 31985607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6743657 - 6743389
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa---ctgac-ctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| |   || |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6743657 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaacaaacctaaatctaaatctgagtgtagagcaacaccacaagcataa 6743558  T
Q  105 tcaaagcacaaaga--taagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagc 202  Q
    |||||||| | |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |   || |||||||||    
T  6743557 tcaaagcatatagagataagaaatggaagaaaggaacaaacacaccaagat-gttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagc 6743459  T
Q  203 tctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||    
T  6743458 cctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagctacaaaaaattagctta-tagcttacaaaagaac 6743389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8689696 - 8689498
Alignment:
Q  33 gtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaaga 132  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8689696 gtaaagtgtctccaagtaacaacaacaaaaa-cagacctagacttaa-tgcagagcaacaccacaagcataaacaaagcacaaagataagcaatgaaaga 8689599  T
Q  133 aaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 230  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8689598 aagtaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgatctaatatg--ggggagaggagctctcctatccactatgatgaaagtgtta 8689501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28468760 - 28468542
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  28468760 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagc 28468664  T
Q  112 a-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28468663 aaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatgacctaatctggaggagagagcagctctcca 28468567  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28468566 atccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1983536 - 1983284
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  1983536 agcaaaggaagtaataatcaatggataaagtgggttcaagcaacaacaacaacaaactgacttaaatctaagtgtaaagcatcaccacaaacataatcaa 1983437  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | ||  || ||||| || | ||||||| || |||||||||||| || ||  | ||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  1983436 aacaacaatataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaatatggta-acccagttcggtccaatatgacctactatgggggagatagcagctctcc 1983339  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  1983338 aatccactaggatcaaagtgatacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagct 1983284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16624246 - 16624143
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16624246 agcaaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaca-aaaacagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagaataatcaa 16624148  T
Q  109 agcac 113  Q
    |||||    
T  16624147 agcac 16624143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Original strand, 37781722 - 37781969
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||||||| ||   || |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  37781722 agcaaaagaagtagtcattaatgagtaaagtatcatcaatcaacaacatcaacaaatagacctagatctaagtgtgaagcaacaccacaagcatattcaa 37781821  T
Q  109 agc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcgg-ttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||| ||||||||||| ||| | || ||| ||  |||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |  ||| | ||||| | |||||    
T  37781822 agcaacaaagataagaaataatag-aagaaaacaacaaaccaatattgtttacccagttcggtttaaatatgacctacttcgga-gagagagtaactctc 37781919  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  37781920 caatccactataataaaagtgatacaaagaggttacaagaaattagctta 37781969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34496023 - 34495822
Alignment:
Q  46 aagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaaca 144  Q
    ||||||||||||||| |||| | || | | ||||||||  |||| || |||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| || ||||||    
T  34496023 aagcaacaacaacaacaaacagtcccaaaactaagtgtaaagcatcaacacaagcataatcaaagcaataaaacaagcaatgaaagaaagaaaacaaaca 34495924  T
Q  145 caccaagattgttgaacc-agttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttaca 243  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||  || ||||| || | ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  34495923 caccaagatggt--aacctagttcggtccaacatgacttactctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgggttaca 34495826  T
Q  244 agaa 247  Q
    ||||    
T  34495825 agaa 34495822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Original strand, 5112226 - 5112344
Alignment:
Q  137 aacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 236  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  5112226 aacaaacacaccaagatggta-acccagttcggtccaatatgatctactttgggggtgagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaaatg 5112324  T
Q  237 agttacaagaaattagctta 256  Q
     |||||||||||||||||||    
T  5112325 ggttacaagaaattagctta 5112344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Original strand, 18377241 - 18377472
Alignment:
Q  19 gtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca-caaag 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| |||| | |||| | ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||     
T  18377241 gtagtaatcaatggataaagtgtcctcaagcaacaacaacaacaaacagtcctaaaactaagtgtaaagcataaccacaagcataatcaaagcaacaaaa 18377340  T
Q  118 ataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||| ||            ||||||||||||||| || | | ||||||| |||  |||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  18377341 ataagaaa------------acaaacacaccaaga-tggtaacccagttcagttctatatgacctactctggaggagagagcagccctccattccactaa 18377427  T
Q  218 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    |||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||||    
T  18377428 gatgaaagtgatacaaatgggttataagaaatcagcttaaaagct 18377472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Original strand, 24741964 - 24742065
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  24741964 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 24742062  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  24742063 aac 24742065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 272
Target Start/End: Original strand, 29760665 - 29760765
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  29760665 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagcctgcaagcttacacaag 29760763  T
Q  271 aa 272  Q
    ||    
T  29760764 aa 29760765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39774389 - 39774289
Alignment:
Q  162 cagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagc 261  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  39774389 cagttcggtccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaagaaattagcttaaaagc 39774290  T
Q  262 t 262  Q
    |    
T  39774289 t 39774289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 3814024 - 3814136
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  3814024 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaagac 3814120  T
Q  248 attagcttacaagctt 263  Q
      |||||| |||||||    
T  3814121 tctagctttcaagctt 3814136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 263
Target Start/End: Original strand, 5732665 - 5732777
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  5732665 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagac 5732761  T
Q  248 attagcttacaagctt 263  Q
      |||||| |||||||    
T  5732762 tctagctttcaagctt 5732777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 51520481 - 51520553
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51520481 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 51520553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 56146772 - 56146700
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  56146772 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 56146700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9224468 - 9224406
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 236  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9224468 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 9224406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9229255 - 9229193
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 236  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9229255 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 9229193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45357357 - 45357269
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagctt 263  Q
    |||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||    
T  45357357 aatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctttcaagctt 45357269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45347878 - 45347807
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  45347878 aatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 45347807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Original strand, 4956087 - 4956147
Alignment:
Q  52 caacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca 112  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4956087 caacaacaacaaacggatctagatttaagtgtgaagcaacaccacaaacataatcaaagca 4956147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 12743899 - 12743990
Alignment:
Q  128 aaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgaga-gcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||    
T  12743899 aaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 12743990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 12745288 - 12745379
Alignment:
Q  128 aaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgaga-gcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||    
T  12745288 aaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 12745379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18912409 - 18912350
Alignment:
Q  200 agctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  18912409 agctctccaatccactatgataagagtgatacaaaaaggatacaagaaattagtttacaa 18912350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Original strand, 18855727 - 18855821
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18855727 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 18855821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931853
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16931853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934207
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16934207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780437
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 22780437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782802
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 22782802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599902
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 44599902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 29651670 - 29651935
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29651670 agcaaaggaagtggtaatcaatgaataaagtgtctataatcaacaacaacaaaaaacagacttagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 29651769  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  29651770 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactcc 29651869  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29651870 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattaacttataagcttacacaagaac 29651935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 19072788 - 19073052
Alignment:
Q  11 caaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19072788 caaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaacaaaaatcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaa 19072887  T
Q  111 cac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  19072888 caataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 19072987  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19072988 atccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 19073052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 19120678 - 19120942
Alignment:
Q  11 caaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19120678 caaaggaagtagtaatcaatagataaagtgtctcgaagcaacaacaacaaaaatcagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaaa 19120777  T
Q  111 cac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  19120778 caataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 19120877  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19120878 atccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 19120942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47704171 - 47703909
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  47704171 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcagcaacaacaaaaaatagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtttaatcaaagc 47704072  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  47704071 aataaagataagcaatgaaagaaaggaaaaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 47703972  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47703971 ccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 47703909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26645134 - 26644871
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26645134 agcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctttaagcaacaacaacaaaag-cagacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 26645037  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  26645036 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctc 26644937  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26644936 caatccattatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 26644871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 13598259 - 13598522
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa--aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13598259 aaaggaagtggtaatcaata-gttaagtgtctccaaacaacaacaacaacaaaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaa 13598357  T
Q  110 gcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||    
T  13598358 gcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttca 13598457  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13598458 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 13598522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16124756 - 16124489
Alignment:
Q  7 gaagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  16124756 gaagcaaaggaagtggtaatcaatgaataaaatgtgtccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaaatgtagagcaacaccacaaacataatc 16124658  T
Q  107 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| |    
T  16124657 aaagcaataaagataagctatgaaagaaaaggaacaaacacaccaagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccc 16124558  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16124557 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacataagaac 16124489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21536806 - 21536543
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  21536806 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaatcaacaacaacaaaaata-gacctaga-cttactgtagagcaacaccacaagcatagacaa 21536709  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21536708 agcacaaagataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctc 21536609  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21536608 caatccactataatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 21536543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 3281571 - 3281831
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3281571 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaa-gacataga-ctttgtgtagagcaacaccacaagaataaacaaagc 3281668  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  3281669 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 3281768  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3281769 tccacgatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 3281831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27104602 - 27104360
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||     ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27104602 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaa-----aacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 27104508  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27104507 aataaagataagcaatgaaataaaggaacaaacacaccaagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaat 27104408  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104407 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaca 27104360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47099060 - 47098798
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47099060 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagtaacaacaacaaaaca--gacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataatcaa 47098963  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||    
T  47098962 agcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctcc 47098863  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47098862 aatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 47098798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 9476130 - 9476385
Alignment:
Q  16 gaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcacaa 115  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||| || || ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9476130 gaagtagtaattaatggataaagtgtctccaagcaacaataacaaaaca--gacataaatataagtgtagaa-aacatcacaagcataatcaaagcaaaa 9476226  T
Q  116 a-gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccac 214  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||    
T  9476227 aagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccac 9476326  T
Q  215 tatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9476327 tatgatgaaagtattacaaaagagttataagaaattagcttacaagcttacacaagaac 9476385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 236
Target Start/End: Original strand, 775532 - 775759
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  775532 agcaaaggaagtggtaaccaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 775630  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  775631 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctcc 775730  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaag 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  775731 aatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 37069628 - 37069890
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa-ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  37069628 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaaaaaaaaaaaacagacttagacttaa-tgtagagcaacaccacaagcataaaca 37069726  T
Q  108 aagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  37069727 aagcacaaagataagcaacgaaataaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctct 37069826  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  37069827 ccgatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttac---aaaatagtttgcaagcttacacaagaac 37069890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47103077 - 47102815
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  47103077 agcaaatgaagtggtaatcaatagataaagtgtctcaaagcaacaacaacaaaaca--gacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataatcaa 47102980  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | || |||||||||  |||    
T  47102979 agcaataaagataagcaatcaaagaaaggaacaaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatcc 47102880  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    
T  47102879 aatccactaagatgaaaatgttac-aatgagttacaagaaattaacttataagcatacaaaagaac 47102815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Original strand, 32889313 - 32889563
Alignment:
Q  23 taatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  || ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  32889313 taatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaaaaca--gatctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtataaccaaagcaataaagataa 32889410  T
Q  122 gcaatgaaa-gaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgat 220  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  32889411 gcaatgaaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagat 32889510  T
Q  221 gaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32889511 gaaagtgttac-aatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 32889563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13604857 - 13604596
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||| ||| ||| |||| || | |||||||| ||||||||||  ||||||    
T  13604857 aaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaaagcaaaacagacatag-tcta-gtatagagcaacatcacaagcatatacaaagc 13604760  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13604759 aataaagataagtaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 13604661  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  13604660 atccactatgatgaaaatgttac-aaagagttacaagaaaaatagcttgcaaacttacacaagaac 13604596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19359079 - 19358816
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaact---gacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  19359079 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaatacagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaa 19358982  T
Q  109 agca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    |||| | |||||||||||  |||| ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19358981 agcaaccaagataagcaagaaaaggaag-aacaaacacatcaaaagattgttgacccagttcagtcaa-tatgacctaatatgggggagagagcagctct 19358884  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19358883 ccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 19358816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19361669 - 19361405
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa----ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||    
T  19361669 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaaacagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaataca 19361572  T
Q  108 aagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    ||||| | |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19361571 aagcaaccaagataagcaagaaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagtcaa-tatgacctaatatgggggagagagcagctc 19361474  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  19361473 tccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaac 19361405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19380309 - 19380045
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa----ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||    
T  19380309 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaaacagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaataca 19380212  T
Q  108 aagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    ||||| | |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19380211 aagcaaccaagataagcaagaaaaggaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagtcaa-tatgacctaatatgggggagagagcagctc 19380114  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  19380113 tccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaac 19380045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40816970 - 40816844
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40816970 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacgagcataatcaa 40816871  T
Q  109 agc-acaaagataagcaatgaaagaaa 134  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  40816870 agcaataaagataagtaatgaaagaaa 40816844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24203001 - 24202742
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa-aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaa 109  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| | |||| | ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||    
T  24203001 aaagggagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaa--acaacaacaaaacagccctaaa-cta-gtgtagagcaacaccacaag-agaatacaaa 24202907  T
Q  110 gcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || ||||||||||||    
T  24202906 gcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctct 24202810  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24202809 ccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 24202742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17345756 - 17345512
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaa-gt-gtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||  | |  ||||   || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  17345756 agcaaaggaagtagtaatcaatgagtaaaagtagcctc-aagcaacaacaacaaagtaat--cctaagacttagtgtagaacaacaccataagcataatc 17345660  T
Q  107 aaagc-acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||| || | ||||||||||  ||||||||||| | ||| ||  |||| |||||    
T  17345659 aaagccataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaaaacataaaagattattaacccagttcggtctaatatgacctactctgg-ggaaagaggagctc 17345561  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagc 253  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  17345560 tccaatccactaagatgaacgtggtacaaatgtgctacaagaaattagc 17345512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40816842 - 40816787
Alignment:
Q  218 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40816842 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 40816787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50521337 - 50521165
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaa-gt-gtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||  ||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  50521337 aaaggaagtggtaatcaatgagtaaaagtagtctcaaa-caacaacaacaaaata--gacctaagtcctagtgtagaacaacaccacaaacataatcaaa 50521241  T
Q  110 gcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gatt-gttgaaccagttcggttaaatatgacct 182  Q
    |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | ||||||||||| ||||||||||    
T  50521240 gcaataaagagaaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagatttggtaacccagttcggttcaatatgacct 50521165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43988518 - 43988426
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  43988518 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 43988426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25445174 - 25445079
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25445174 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 25445079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 255
Target Start/End: Original strand, 22819474 - 22819535
Alignment:
Q  194 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 255  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22819474 gagagtagccctccaatccaccaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagctt 22819535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 41390605 - 41390676
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  41390605 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 41390676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 41398260 - 41398331
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  41398260 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 41398331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24787437 - 24787364
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 248  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24787437 aatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 24787364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48382538 - 48382467
Alignment:
Q  189 gaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaag 260  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  48382538 gaggttagagcaattctccaatccaatatgatgaaagtgatacaaataggttacaagaaattaacttacaag 48382467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48382662 - 48382607
Alignment:
Q  67 gacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc-acaaagataa 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  48382662 gacctagatctaagtgtgaagcaacaccacaaacataattaaagcaacaaagataa 48382607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3157058 - 3156968
Alignment:
Q  129 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgaga-gcagctctccaatccactat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||    
T  3157058 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 3156968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9023885 - 9023823
Alignment:
Q  200 agctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| |||||||| || |||||    
T  9023885 agctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgggatacaataaattagcataaaagct 9023823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Original strand, 39445500 - 39445594
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  39445500 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 39445594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44023958 - 44023864
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  44023958 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 44023864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9024011 - 9023971
Alignment:
Q  68 acctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9024011 acctaaatctaagtgtatagcaacaccacaagcataatcaa 9023971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459483
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9459483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463310
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 9463310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226382
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 16226382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 32737232 - 32737132
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagt-gtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    |||||||||||| || ||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  32737232 agcaaaggaagtggtgatcaatgagcaaagtagcctc-aagcaacaacaacgaaaca--gacttagatctaagtgtgaagcaacaccacaaatataatca 32737136  T
Q  108 aagc 111  Q
    ||||    
T  32737135 aagc 32737132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 29159669 - 29159927
Alignment:
Q  15 ggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac- 113  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  29159669 ggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaat 29159767  T
Q  114 aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatcca 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||    
T  29159768 aaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatcca 29159867  T
Q  214 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159868 ctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 29159927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 49091522 - 49091785
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49091522 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 49091620  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||    
T  49091621 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacgcaccaagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctcca 49091720  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49091721 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaagaac 49091785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Original strand, 55797 - 56071
Alignment:
Q  7 gaagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaa--------aactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaa 98  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||        ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  55797 gaagtaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaataaaataaaaaaaaacagacctagatctaagtatagagcaacaccacaa 55896  T
Q  99 gcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||    
T  55897 gcataatcaaagcacaaagataagcaatggaaggaaaggaacaaacacaccaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgg-ggagaga 55995  T
Q  198 gcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55996 gcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 56071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46516548 - 46516283
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  46516548 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaaacaacaacaacaaaaaacagacttaaatctaagtgtaaagcaacaccaaaagcataatcaa 46516449  T
Q  109 agcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||||||| ||||    
T  46516448 agcaatagagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctcc 46516349  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46516348 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaagaac 46516283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2647934 - 2647669
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||| | |||||||||   |||| | |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2647934 agcaaaggaaatggtaatcaatagataaaatatctccaaacaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtttagagcaacaccacaagcataatcaa 2647835  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||   ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||    
T  2647834 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctcc 2647735  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2647734 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 2647669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4796907 - 4796640
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa--ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4796907 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtttctccaagcaacaacaacaaaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatc 4796808  T
Q  107 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||| ||| || || |||||| ||    
T  4796807 aaagcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccaagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccct 4796708  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4796707 caaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 4796640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9190241 - 9189981
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9190241 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaacaa--acctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 9190144  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  9190143 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaat 9190044  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9190043 ccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 9189981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33332685 - 33332423
Alignment:
Q  11 caaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaag 110  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||| || || ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  33332685 caaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtatccaaacaacaacaacaaaaa-caaacctaaatctaagtgtagagcaacaccataagcataatcaaat 33332587  T
Q  111 cac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  33332586 caataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaa 33332487  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33332486 tccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 33332423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 20283949 - 20284212
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| |||||  |||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20283949 agcaaaagaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 20284047  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  20284048 agcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 20284147  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20284148 aatccactaagatgaaagtgttac-aatgcgttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 20284212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 2479199 - 2479459
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  2479199 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaac-aaaaacagacctag-tct-agtgtagagcaacaccacaagcatatacaa 2479295  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||||||    
T  2479296 agaacaaagataagcaatgaaag-aagaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctag-ggggagagcagctctc 2479393  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2479394 aaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttataagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 2479459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 21983142 - 21983409
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   | |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21983142 agcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtatctccaagcaacaacaacaaactccagacctaaatctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaa 21983241  T
Q  109 agcacaa-agataagcaatgaaagaaa-ggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21983242 agcaatagagataagcaacgaaagaaaaggaacaaatgcaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctc 21983341  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttac-aaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21983342 caatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 21983409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Original strand, 21988766 - 21989030
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   | |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21988766 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcaccaagcaacaacaacaaactccagacctaaatctgggtgtagagcaacaccacaaacataatcaa 21988865  T
Q  109 agc-acaaagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  21988866 agcaataaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctc 21988963  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttac-aaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaa 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  21988964 caatccactttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaaatagattgcaagcttatacaagaa 21989030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44848922 - 44848659
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa--ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc 106  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  |    
T  44848922 agcaaaggtagtgctaatcaatgtgcaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaaacagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcatatac 44848825  T
Q  107 aaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  44848824 aaagaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacatacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctc 44848726  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaa 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  44848725 tccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaaaagcttgcaagcttacacaagaa 44848659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23403250 - 23402987
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23403250 agcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtttccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatgtaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 23403152  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||  || | ||||||| ||||    
T  23403151 agcaataaatataagcaatgaaagaaaggaacaaacacactaagattgttgacccaattcggtctaatatgacctaatctgagggagtgagcagccctcc 23403052  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23403051 aatctactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 23402987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 2580251 - 2580513
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||    
T  2580251 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaca--gacctaaatctaagtgtagagatacaccacaagtataaccaaagc 2580348  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaa---aggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    |  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  2580349 aataaagataagcaatgaaaaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctcc 2580448  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2580449 aatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 2580513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 35960674 - 35960940
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa-aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||  |    
T  35960674 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtttccaagcaacaacaacaacaaaacaggcctaaatctaagtgtagagaaacaccaccagcataaata 35960773  T
Q  108 aagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    |||||  ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||    
T  35960774 aagcaataaagataagaaattaatgaaatgaacaaacacaccaagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctc 35960873  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35960874 caaaccactatgatgaaagtgttacaaatgagttagaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 35960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9185396 - 9185178
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9185396 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaca--gacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataaacaaagc 9185299  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  9185298 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacac--caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaat 9185201  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  9185200 ccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 47263540 - 47263757
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  47263540 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaaaaacaaaaata-gacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 47263636  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  47263637 agaataaagataagcaatgaaataa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatggggg--agagcagctctc 47263733  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgtta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  47263734 caatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9235794 - 9235634
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa-ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9235794 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacctaaatctaaatgtagagcaacaccacaagcataatca 9235695  T
Q  108 aagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttc 167  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9235694 aagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttc 9235634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 18413506 - 18413763
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  18413506 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagc 18413602  T
Q  112 a-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  18413603 aaccaagataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgg-ggagagagcagctctcca 18413698  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  18413699 atccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagattgcaagcttacacaagaac 18413763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28617386 - 28617209
Alignment:
Q  86 agcaacaccacaagcataatcaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgaccta 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||||    
T  28617386 agcaacaccacaagcatattcaaagcaacaaagataagcaa-gaaaggaagaaaacaaacacaccaatattgtttacccagttcggtccaatatgaccta 28617288  T
Q  184 atatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
     | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  28617287 ctctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaatggggttacaagaaattagcttaaaagct 28617209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 18408629 - 18408887
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | | | ||| |||| |||| |||||||||||||| || |  ||||||    
T  18408629 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccacgcaacaacaacaaaaa-cagccgtag-tcta-gtgtagagcaacaccacaaacaaatacaaagc 18408725  T
Q  112 aca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  18408726 aaacaagataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 18408822  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||    
T  18408823 atccagtatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaataacttgcaagcttacacaagaac 18408887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 21639673 - 21639932
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaag 110  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||    
T  21639673 aaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaag-agaatacaaag 21639768  T
Q  111 caca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  21639769 caaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctc 21639865  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21639866 caatccactataatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 21639932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5817438 - 5817266
Alignment:
Q  79 agtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaa-gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaata 176  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||  ||||    
T  5817438 agtgtagaacaacaccacaagcataatcaacacaataatgataagcaatgtaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttaactcagttcggtccaata 5817339  T
Q  177 tgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatt 250  Q
    ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  5817338 tgacctactctgg-ggagagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgatacaaaggggttacaagaaatt 5817266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 21645871 - 21646130
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaag 110  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||     
T  21645871 aaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaag-agaatacaaaa 21645966  T
Q  111 caca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| | | |  |||||||||||||    
T  21645967 caaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctagggaagagagcagctctc 21646063  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21646064 caatccactatgatgaaagtgtta-aaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 21646130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1533613 - 1533417
Alignment:
Q  79 agtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaa 173  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  ||    
T  1533613 agtgtagagcaacaccacaaagagaatacaaagcaaacaatataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaataagattgttgacccagttcagccaa 1533516  T
Q  174 atatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaaga 271  Q
     |||| |||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  1533515 -tatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaaga 1533418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Original strand, 2057989 - 2058090
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  2057989 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaag 2058087  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  2058088 aac 2058090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30814637 - 30814539
Alignment:
Q  120 aagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgaga-gcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||    
T  30814637 aagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactat 30814539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22270204 - 22270143
Alignment:
Q  92 accacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga 152  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22270204 accacaatcataatcaaagcaataaagataaacaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga 22270143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24261377 - 24261285
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  24261377 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 24261285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24266256 - 24266164
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  24266256 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 24266164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 262
Target Start/End: Original strand, 3047192 - 3047368
Alignment:
Q  86 agcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  || | ||||||| || ||||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||||||      
T  3047192 agcaacaccacaagcataatcaaatcaacaagataataaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaagatcgta-acccagttcggtccaatatgacctgc 3047289  T
Q  185 tatggaggt-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    | ||| ||  |||||| | | ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  3047290 tctggggggagagagccgttatccaatccactaatatgaaagtggtacaaatgagttacaagaaatcaacttaaaagct 3047368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Original strand, 19992313 - 19992408
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19992313 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 19992408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Original strand, 4866754 - 4866816
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 236  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4866754 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 4866816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20357620 - 20357547
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 248  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20357620 aatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 20357547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24024411 - 24024326
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 235  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24024411 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 24024326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 12396935 - 12397007
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12396935 aatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 12397007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31109668 - 31109573
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| | | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31109668 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 31109573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351716
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactat 7351716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9235605 - 9235556
Alignment:
Q  223 aagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9235605 aagtgttacaat-gagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 9235556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 12406355 - 12406427
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12406355 aatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 12406427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Original strand, 16880104 - 16880195
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16880104 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttac-aaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 16880195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Original strand, 16884960 - 16885051
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16884960 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttac-aaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 16885051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 189
Target Start/End: Original strand, 47676111 - 47676172
Alignment:
Q  129 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatgg 189  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  47676111 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgg 47676172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155975
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31155975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 14520089 - 14520353
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14520089 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 14520187  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||||||||||     
T  14520188 agcacaaagataagcactgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctctt 14520287  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14520288 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 14520353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17004193 - 17003933
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17004193 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgta-agcaacaccacaagcataatcaaagc 17004096  T
Q  112 acaaa-gataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  17004095 aaaaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaat 17003996  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17003995 ccactatgatgaaagtatttcaaaagagttacaaaaaattaacttacaagcttacacaagaac 17003933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 19588606 - 19588870
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19588606 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagcgtctccaagcaacaacaacaaaaaaa-gacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 19588704  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |   || ||||||||| ||||    
T  19588705 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacactcaaagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctcc 19588804  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19588805 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattaccttataagcttacacaagaac 19588870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11917214 - 11916945
Alignment:
Q  7 gaagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaact--gacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataa 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11917214 gaagcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaagacctagatcttagtgtagagcaacaccacaagcataa 11917115  T
Q  105 tcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagct 203  Q
     ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11917114 acagtgcaataaagataagcaatgagagaaaggaacaaacacaccgagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagct 11917015  T
Q  204 ctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  11917014 ctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaaatagtttgcaagcttacacaagaac 11916945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12084376 - 12084149
Alignment:
Q  46 aagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacac 145  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12084376 aagcaacaaaaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacac 12084278  T
Q  146 acc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttaca 243  Q
    |||  || |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12084277 accaaaatattgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttaca 12084179  T
Q  244 agaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12084178 agaaattaacttaaaagcttacacaagaac 12084149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9353567 - 9353306
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  |||    
T  9353567 agcaaaggaagtggtaaacaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaa 9353471  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  9353470 agaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctc 9353372  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  9353371 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaaaagcttgcaagcttacacaagaac 9353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36932583 - 36932323
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  36932583 aaaggaagaggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaaaga 36932486  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  36932485 acaaagataagcaatgaaa-aaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 36932387  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||    
T  36932386 tccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaaatagcttgcaagtttacataagaac 36932323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42127646 - 42127384
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42127646 agcaaagaaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaca--gacttaaatctaattgtagagcaacaccacaagcataatcaa 42127549  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||    
T  42127548 aacaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagcccccc 42127449  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42127448 aatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 42127384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 3880166 - 3880423
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||  || |||||||||    |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3880166 aaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaatcaacaacaa----aaacagacctaaatctaagtgtaaagcaacaccacaagcataatcaaagc 3880261  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||    
T  3880262 aataaagataagcaatgaaagaaaggaacaa-cacaccaagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaat 3880360  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3880361 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagcttacacaagaac 3880423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Original strand, 28832120 - 28832365
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28832120 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaa-cagaccta-atctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 28832217  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  28832218 atcaataaagataagcaatgaaagaaacaaacaaacacaccaagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 28832317  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28832318 aatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagctta 28832365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24553743 - 24553499
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24553743 agcaaaggaagtgataatcaatggataaagtgtctccaagcaacatcaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaa 24553645  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||| ||||    
T  24553644 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctcc 24553546  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 255  Q
    | ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24553545 actccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaattagctt 24553499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 15464396 - 15464656
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| |    
T  15464396 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaac 15464492  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  15464493 aataaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctcca 15464591  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15464592 atccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 15464656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 273
Target Start/End: Original strand, 10281722 - 10281875
Alignment:
Q  121 agcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatga 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10281722 agcaaagaaagaaaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatga 10281821  T
Q  220 tgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10281822 tgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 10281875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11182071 - 11181816
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa-ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatca 107  Q
    ||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11182071 agcaaagtaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaaacagacttaaatctaagtgtagagcaataccacaagcataatca 11181972  T
Q  108 aagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaacc-agttcggttaaatatgacctaatat-ggaggtgagagcagctc 204  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||  ||||||||||| | | || || ||||||| | |    
T  11181971 aagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaagatggt--aacctagttcggtctaatatgacctactctagggggagagagcaaccc 11181874  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  11181873 tccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcctaaaagct 11181816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31300829 - 31300569
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||| | |||||||||   |||||||| |  |||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |    
T  31300829 aaaggaactggtaatcaatagataaagtgttttcaagcaaaaacaacaaaaca--gacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagtgtaatcaaaac 31300732  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||  || ||||| | |||||||||    
T  31300731 aataaagataagcaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaat 31300632  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  31300631 ccactaagatgaaagtgtta-taatgagttgcaagaaaaatagtttgcaagcttacacaagaac 31300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 38192036 - 38192297
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccaca-agcataat-caaa 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  | ||| ||||    
T  38192036 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctaga-cta-gtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaa 38192132  T
Q  110 gcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || ||||||||||||    
T  38192133 gcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctct 38192229  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38192230 ccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 38192297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 38219261 - 38219522
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccaca-agcataat-caaa 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  | ||| ||||    
T  38219261 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctaga-cta-gtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaa 38219357  T
Q  110 gcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || ||||||||||||    
T  38219358 gcaaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctct 38219454  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38219455 ccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 38219522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 255
Target Start/End: Original strand, 6741789 - 6741958
Alignment:
Q  88 caacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |  |||||||||| |||||||| || |    
T  6741789 caacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaatgaacaaacacaccaaagattattaacacagttcggttcaatatgacatact 6741888  T
Q  186 atggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctt 255  Q
     ||| ||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6741889 ctgggggatagagcagctctccaatccattaagatggaagtgatacaaagaagttacaagaaattagctt 6741958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33031115 - 33030924
Alignment:
Q  74 atctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggt 170  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||    
T  33031115 atctaagtgtagagcaataccacgagaataatcaaagcaataaagataaccaatgaaaataaaggaacaaacacatcaaagattgttaattcagttcggt 33031016  T
Q  171 taaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
     ||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  33031015 caaatatgacatactctgggggagagagcagctctccaattcactaagatgaaagtgatgcaatggggttacaagaaattagcttaaaagct 33030924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 35387527 - 35387785
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaag 110  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||| ||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  35387527 aaaggaagtgataatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaccctag-tcta-gtgtagagcaactccacaag-agaatacaaag 35387622  T
Q  111 cacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || |  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  35387623 caaacgagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctc 35387719  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaa 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35387720 caatctactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaa 35387785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 24135712 - 24135972
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa-aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaa 109  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24135712 aaagggagtggtaatctatgagtaaagagtctccaagcaa--acaacaacaaaacagccctaga-cta-gtgtagagcaacaccacaag-ataatacaaa 24135806  T
Q  110 gcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||| | ||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||| |    
T  24135807 gcaaacaagataagctagaaaaggaag-aacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctat 24135904  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24135905 ccaatgcactaagatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 24135972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 2630082 - 2630338
Alignment:
Q  7 gaagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagt-gtctctaagcaacaacaacaa--aaaactga----cctagatctaagtgtcgagcaacaccacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||| | ||| |||||||||||||||  |||||  |    |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  2630082 gaagcaaaggaagtagtaagcaatgaataaagtagcctc-aagcaacaacaacaacaaaaacaaataggcctaaatctaagtgcagagcaacaccacaag 2630180  T
Q  100 cataatcaaagcacaa-agataagcaatgaa-agaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgaga 197  Q
    |||| | ||||||  | ||||||| || ||| ||||   ||||||| || ||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||  | ||  || || |    
T  2630181 catatttaaagcaatagagataag-aaggaagagaataaaacaaacgcatcaatattgttaacctagttcggtccaatatgacctgctttgagggagata 2630279  T
Q  198 gcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2630280 gcagctcttcaatccactatgatgaaagtgatacaaaagggttacaataaattagctta 2630338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31401904 - 31401812
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  31401904 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 31401812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7161062 - 7160897
Alignment:
Q  86 agcaacaccacaagcataatcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaa 184  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| || | ||||||| || |||||||||||| || ||  | |||||| | || |||||||||||     
T  7161062 agcaacaccacaggcataatcaaagcaacaaaataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacaccaaaatggta-atccagtttgattcaatatgacctac 7160965  T
Q  185 tatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattag 252  Q
    ||| | || |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  7160964 tataggggagagatcagctctccaatccactcagatgaaagtgatacaaaggggttacaaaaaattag 7160897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Original strand, 15044710 - 15044798
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagctt 263  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||    
T  15044710 aatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctttcaagctt 15044798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28278553 - 28278467
Alignment:
Q  86 agcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaag-attgttgaaccagttcggt 170  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  28278553 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaagaaagaaacacaccaagaattgttcacccagttcggt 28278467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31397047 - 31396955
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  31397047 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 31396955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38747241 - 38747160
Alignment:
Q  86 agcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagtt 166  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  38747241 agcaaaaccacaatcataatcaaagcaataaagataagcaattaaagaaaggaacaaatccaccaagattattgacccagtt 38747160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Original strand, 2785406 - 2785472
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2785406 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2785472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Original strand, 33768210 - 33768276
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33768210 cctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33768276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 43592303 - 43592375
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43592303 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 43592375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 43598748 - 43598820
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43598748 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 43598820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 43604240 - 43604312
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43604240 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 43604312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 43609732 - 43609804
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43609732 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 43609804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 5611000 - 5611116
Alignment:
Q  7 gaagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagt-gtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||| |    
T  5611000 gaagcaaatgaagtagtaatcaatgagtaaagtagtct-taagcaacaaaaataacaaacaaacctagatctaagagtgaaacaacaccataagaatatt 5611098  T
Q  106 caaagc-acaaagataag 122  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5611099 caaagcaacaaagataag 5611116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 33791362 - 33791413
Alignment:
Q  195 agagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33791362 agagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33791413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Original strand, 34842467 - 34842557
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagt-gtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcata 103  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34842467 aaaggaagtagtaatcaa-gagtaaagtagcctc-aagcagcaacaacaataaacaaacctagatctaagtgtgaagcaacaccacaagcata 34842557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1457216 - 1457151
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1457216 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 1457151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Original strand, 27445001 - 27445066
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27445001 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 27445066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Original strand, 27449845 - 27449910
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27449845 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 27449910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Original strand, 31180238 - 31180311
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 248  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31180238 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 31180311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37556676 - 37556613
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag 245  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37556676 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaag 37556613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37561498 - 37561435
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag 245  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37561498 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaag 37561435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410237
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactat 4410237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 248
Target Start/End: Original strand, 30631437 - 30631503
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 248  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30631437 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 30631503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28807626 - 28807546
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagctt 263  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  28807626 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctt 28807546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552460
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 15552460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179435
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31179435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542949
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31542949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545295
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 31545295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10077402 - 10077138
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10077402 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 10077304  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  10077303 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcc 10077204  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10077203 aatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 10077138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Original strand, 22963563 - 22963819
Alignment:
Q  13 aaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc- 111  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  22963563 aaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 22963662  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatc 211  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  22963663 atagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgg-ggagagagcagccctccaatc 22963761  T
Q  212 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22963762 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaccttacacaa 22963819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23824830 - 23824574
Alignment:
Q  13 aaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc- 111  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23824830 aaggaagtggtaatcaattaataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagca 23824731  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatc 211  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  23824730 atagagataagctatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgg-ggagagagcagccctccaatc 23824632  T
Q  212 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23824631 cactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataaccttacacaa 23824574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5757713 - 5757452
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5757713 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagaccta-atcta-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 5757617  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  5757616 agaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctc 5757518  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  5757517 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttatacaagaac 5757452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Original strand, 18232703 - 18232969
Alignment:
Q  7 gaagcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18232703 gaagcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatc 18232801  T
Q  107 aaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||  ||||||||||||| ||| || ||||||| | ||    
T  18232802 aaagcaataaagataagcgatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgactcaaatcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccct 18232901  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18232902 ccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatcagcttataagcttacacaagaac 18232969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5017709 - 5017482
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa---ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5017709 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaacaacaaaaaaaaaaaacagacctagatctaagtgtagagcaacaccacaagcataat 5017610  T
Q  106 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | | || ||||||| | ||    
T  5017609 caaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccct 5017510  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5017509 ccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 31979373 - 31979637
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31979373 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacatcacaagcataatcaa 31979471  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||    
T  31979472 agcaataaagataagcaatgaaatagaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctcc 31979571  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  31979572 aatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaaattaacttataagcttacaaaagaac 31979637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 21355898 - 21356160
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  |||    
T  21355898 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtcttcaagcaacaacaacaaaaa-cagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcatatacaa 21355994  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21355995 agaacaaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctc 21356093  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||    
T  21356094 caatccactatgatgaaagtgttac-taagagttacaagaaaaataacttgcaagcttacacaagaac 21356160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31086699 - 31086448
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||| |||||              
T  31086699 agcaaaggaagtggtaatcaatggataaagtgtctccaagcaaaaacaacaaaaa-cagacataaatctaagtgtagagcaacatcacaa---------- 31086611  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||| | | || ||||||| |||||||    
T  31086610 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctcca 31086511  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31086510 atccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaaattagcttataagcttacacaaga 31086448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 273
Target Start/End: Original strand, 4629863 - 4630078
Alignment:
Q  60 aaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgtt 157  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4629863 aaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacatcaaagattgtt 4629962  T
Q  158 gaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttac 257  Q
    ||  |||||| ||  ||||||||||||| | | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  4629963 gactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaattaacttat 4630062  T
Q  258 aagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4630063 aagcttacaaaagaac 4630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21801583 - 21801317
Alignment:
Q  13 aaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc- 111  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||     
T  21801583 aaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaatcagacctaaatctaagtgtagaacaataccacaatcataatcaaagca 21801484  T
Q  112 acaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc-aagat-----tgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctct 205  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  21801483 ataaagataagtaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaagataaaagtgttg-accagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctct 21801385  T
Q  206 ccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  21801384 ccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaaattatcttataagcttacaaaagaac 21801317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 31936451 - 31936671
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31936451 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaca--gaccttaatcaaagtgtagagcaacaccacaagcataaacaaagc 31936548  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| | |||  | |||||||||||||||||    
T  31936549 aataaagataagcaatgaaagataggaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaat 31936648  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  31936649 ccactaatatgaaagtgttacaa 31936671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 118 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5572369 - 5572214
Alignment:
Q  118 ataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  5572369 ataagcagtgaaagaaatgaacaaacacaccaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 5572270  T
Q  218 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5572269 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 5572214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 22708892 - 22709102
Alignment:
Q  22 gtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagata 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||  |||||||  |||||||    
T  22708892 gtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaa-tgtagagcaacaccacaagtgtatccaaagcaataaagata 22708989  T
Q  121 agcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga--ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatg 218  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22708990 agcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaaattgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 22709087  T
Q  219 atgaaagtgttacaa 233  Q
    |||||||||||||||    
T  22709088 atgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24436165 - 24435951
Alignment:
Q  50 aacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca-caaagataagcaatgaaagaaaggaa-caaacacac 147  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||| || |||||||||    
T  24436165 aacaacaacaaaaataagatctaaatctaagtgtagag--acacaacaagcataaacaaagcaacaaagataagaaa-gcaagaaagaaaacaaacacac 24436069  T
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| ||  | |||||||| |  ||||||||||| | | | || ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  24436068 caagatggta-acccagttcgatccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccactaggatgaaaatgttacaaatgaattacaagaa 24435970  T
Q  248 attagcttacaagcttaca 266  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  24435969 attagcttataagcttaca 24435951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5674939 - 5674743
Alignment:
Q  79 agtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaagcaca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaa 173  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  ||    
T  5674939 agtgtagagcaacaccacaaagagaatacaaagcaaacaatataagcaa-gaaagaaag-aacaaacacaccaaagagattgttgacccagttcagccaa 5674842  T
Q  174 atatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaaga 271  Q
     |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  5674841 -tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaaga 5674744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5572833 - 5572737
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5572833 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacagcaaaaa-cagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatc 5572737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Original strand, 27165635 - 27165767
Alignment:
Q  102 taatcaaagcacaaagataagcaatgaaag-aaaggaacaaacacacc-aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagc 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||| ||  ||||     
T  27165635 taatcaaagcaaaaagataagcaatgaaagaaaaggaacaaccacaccaaagattgtttacccag-tcggtccaatatgacctactatgggggacagagt 27165733  T
Q  200 agctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  27165734 agccctccaatcaactaagatgaaagtgatacaa 27165767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33336049 - 33335921
Alignment:
Q  128 aaagaaaggaacaaacac--accaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaag 225  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |  || | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  33336049 aaagaaaagaacaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaa-tgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatg 33335952  T
Q  226 tgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33335951 tgttacaaaagagttacaagaatctagctta 33335921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31077114 - 31076931
Alignment:
Q  74 atctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaa-gca-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggtt 171  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||| | | | ||||  ||     
T  31077114 atctaagtgtagaacaacatcataagcataatcaaaagcaacaaatataagcca-gaaagaatgaaacaaacataccaagattggtaacctagtttagtc 31077016  T
Q  172 aaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
     ||||||||||| | |  ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  31077015 caatatgacctactctctaggagatagcagctctccaatccactaagataaaagtgatacaaatgggttacaataaattagctta 31076931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28155623 - 28155542
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagctt 263  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  28155623 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatttagctttcaagctt 28155542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33330552 - 33330424
Alignment:
Q  128 aaagaaaggaacaaacac--accaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaag 225  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |  || | || |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  33330552 aaagaaaagaacaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaa-tgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatg 33330455  T
Q  226 tgttacaaaagagttacaagaaattagctta 256  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33330454 tgttacaaaagagttacaagaatctagctta 33330424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 11856998 - 11857070
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11856998 aatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 11857070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14742497 - 14742426
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14742497 aatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 14742426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Original strand, 6005448 - 6005514
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6005448 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 6005514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26258233 - 26258182
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaa 63  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26258233 aaaggaagtggtaaccaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa 26258182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22010758 - 22010686
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22010758 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 22010686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14737637 - 14737566
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14737637 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 14737566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Original strand, 16838789 - 16838841
Alignment:
Q  194 gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16838789 gagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 16838841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 253
Target Start/End: Original strand, 14521663 - 14521777
Alignment:
Q  140 aaacacaccaagat--tgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaga 237  Q
    |||||||||||||   |||||| | ||||||||  ||||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||||| ||    
T  14521663 aaacacaccaagaaaatgttgacctagttcggtccaatatgacctactctcgaggagagagcacctctccaattcaataagatgaaagtgatacaaatga 14521762  T
Q  238 gttacaagaaattagc 253  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14521763 gttacaa-aaattagc 14521777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Original strand, 28184529 - 28184591
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 236  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  28184529 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatga-gaaagtgttacaaaag 28184591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33721792 - 33721683
Alignment:
Q  11 caaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagt-gtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||| | |   |||||||||||||||  | || |||||||| |||| |||||    
T  33721792 caaaggaagtagtaatcgatgagtaaagtagtttc-aagcaacaacaacaaacatc---cctagatctaagtgtgaaacatcaccacaaacatattcaaa 33721697  T
Q  110 gc-acaaagataag 122  Q
    || |||||||||||    
T  33721696 gcaacaaagataag 33721683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 6438525 - 6438595
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  6438525 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 6438595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195579
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 12195579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Original strand, 20504792 - 20504848
Alignment:
Q  56 aacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagca 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||    
T  20504792 aacaacaaactgacgtagatcttagtgtaaaggaacaccacaagcataaacaaagca 20504848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23799815 - 23799550
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||| ||||  ||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||    
T  23799815 agcaaagaaagtgttaatcaatagataaagtgtctccaagaaacaacaacaaaaaatagacctagatctaagtgtagagaagtaccacaaacataatcaa 23799716  T
Q  109 agcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  23799715 agcaatagagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctcc 23799616  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23799615 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 23799550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5702720 - 5702458
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  5702720 agcaaatgaagtggtaatcaatgaataaagtgtctcctagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagagcatcaccacaagcataattaa 5702622  T
Q  109 agcacaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||    
T  5702621 agcaatagagataagctatgaaggaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctcc 5702522  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5702521 aatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaaga 5702458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26403464 - 26403203
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   ||| ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26403464 aaaggaagtggtaatcaatagataatgtgtctccaagcaataacaacaaaaa-cagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 26403366  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  26403365 aataaagataagcaatgaaaacgaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 26403266  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26403265 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaaattagcttacaagcttgcacaagaac 26403203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 4455888 - 4456151
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  4455888 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacagcaaaaa-cagacctgga-cttagtgtagagcaacacaacaagcataaacaa 4455985  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||  |||||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  4455986 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctc 4456085  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4456086 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagctggcaagcttacacaagaac 4456151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 6127082 - 6127345
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6127082 aaaggaagtggtaatcaatagattaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaacagatataaatttaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagc 6127181  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaag-attgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  6127182 actaaagataagcaatgaaagagatgaacaaacacatcaaatattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaa 6127281  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6127282 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacaaaagaac 6127345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19175994 - 19175727
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaat----gtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19175994 agcaaaggaagtggtaatcaattaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaagca--gacctaga-cttagtgtagagcaacaccacaagcataa 19175898  T
Q  105 tcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacac--caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagc 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||| |    
T  19175897 acaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaac 19175798  T
Q  203 tctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||    
T  19175797 tctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaaatagcctgcaagcttacacaagaac 19175727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 7412197 - 7412464
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaa----ctgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataa 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || || ||||||    | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||     
T  7412197 agcaaaggaagtggtaatgaatgtgtaaagtgtctccaagcaaaaaaaaaaaaaaaaaaacagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcatat 7412294  T
Q  105 tcaaagcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaaga---ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcag 201  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7412295 acaaagaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 7412393  T
Q  202 ctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  7412394 ctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaataacttgcaagcttacacaagaac 7412464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19752627 - 19752367
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19752627 aaaggaagtggtaatcaatatataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaca--gacctaaatctaagtgtagtgcaacaccacaagcataatcaaagc 19752530  T
Q  112 acaa-agataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaat 210  Q
    |  | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| | | | || |||||||||||||||||    
T  19752529 aatagagataagtaatgaaagagaggaacaaacacaccaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaat 19752430  T
Q  211 ccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19752429 ccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 19752367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4696808 - 4696609
Alignment:
Q  34 taaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaaga 132  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4696808 taaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacataaatctaagtgtagagcaacaccacaaacataatcaaagcaataaagataagcaatgaaaga 4696710  T
Q  133 aaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaca 232  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4696709 aatgaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttaca 4696610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9766057 - 9765848
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||||||||  ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9766057 agcaaaggaagtgataatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-caaacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaa 9765959  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  9765958 agcaataaagataagcaatgaaagaagggaacaaacacaccaatgattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctc 9765859  T
Q  207 caatccactat 217  Q
    |||||||||||    
T  9765858 caatccactat 9765848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31071462 - 31071202
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  31071462 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagc 31071366  T
Q  112 a-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  31071365 aaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 31071268  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31071267 aatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 31071202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 26287766 - 26287985
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  26287766 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagc 26287862  T
Q  112 a-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  26287863 aaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 26287959  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26287960 aatccactatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 26313017 - 26313236
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||    
T  26313017 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagcaaatacaaagc 26313113  T
Q  112 a-caaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  26313114 aaccaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 26313210  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26313211 aatccactatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 262
Target Start/End: Original strand, 6813611 - 6813796
Alignment:
Q  79 agtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaata 176  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||  ||||    
T  6813611 agtgtagaacaacatcacaagcataatcaaagcaataaagataagaaatgaaagaaaggaacaaacataccaaagattgttaacccagttcggtccaata 6813710  T
Q  177 tgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    | |||||   | | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  6813711 taacctacactaggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagct 6813796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1262185 - 1261930
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||    
T  1262185 aaagggagtggtaatctatgagtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagccctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaag-agaatacaagc 1262090  T
Q  112 aca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    | | ||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  1262089 aaacaagataagata-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcaaccaa-tatgacctaatctgggggagagagcagctctcc 1261993  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  1261992 aatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaag 1261930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9054995 - 9054822
Alignment:
Q  89 aacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatat 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||   | |||||||||||| ||| || |  | |||| ||  ||||||||||| | |    
T  9054995 aacaccacaagtataatcaaagcaataaagataagtcatgaaagaagcaatcaaacacaccaatattatttactctgttcagtccaatatgacctactct 9054896  T
Q  188 ggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagc 261  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  9054895 ggaggagagagcagctctctaatccactaagatgaaagtgatacaaagtggttacaagaaattagcttaaaagc 9054822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4760148 - 4760047
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  4760148 aatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 4760050  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  4760049 aac 4760047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18853241 - 18853139
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  18853241 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaag 18853142  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  18853141 aac 18853139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18870635 - 18870533
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  18870635 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaag 18870536  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  18870535 aac 18870533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 252
Target Start/End: Original strand, 28307424 - 28307664
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagt-gtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaag 110  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||| ||| ||||||| |||   ||||| ||||||||||  | || |||||||||||||| |||||    
T  28307424 aaaggaagtagtaatcaatgagtcaagtagcctc-aagtaacgacaacaacaaataaacctaaatctaagtgtataacagcaccacaagcataaacaaag 28307522  T
Q  111 cac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaa 209  Q
    ||  ||| ||||| || | ||||| | || |||||| ||||||||| | | ||||||||||  || |||||||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  28307523 caataaatataagaaa-gcaagaatgaaataaacacgccaagattggtaacccagttcggtccaaaatgacctactctggggatgagagcagctctccaa 28307621  T
Q  210 tccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattag 252  Q
    ||||||| |||| ||||  |||| | | |||||||||||||||    
T  28307622 tccactaagatggaagtaatacacatgggttacaagaaattag 28307664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5990796 - 5990545
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatc-a 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |   |||||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| || |    
T  5990796 agcaaaggaagtagtaatcaatggataaagtagcatcaagcaacaacaacaaata---gacctaaatctaagtgtagaacaaaaccacaagcatattcaa 5990700  T
Q  108 aagc-acaaagataagcaatgaaagaa--aggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctc 204  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||  |  ||||| |||| |||||||| | ||| |||| |||  |||||||| || | ||| || |||||| ||||    
T  5990699 aagcaacaaagataagcaa-gcaagaatgaaaaacaagcacaacaagattggt-aacaagtttggtccaatatgacatattgtgggggagagagcggctc 5990602  T
Q  205 tccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagct 262  Q
    ||||||  |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  5990601 tccaat-tactaagatgaaagtgatacaaagatgttacaagaaattagcttaaaagct 5990545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 253
Target Start/End: Original strand, 3051097 - 3051224
Alignment:
Q  127 gaaagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaag 225  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||  | | ||| ||||||  ||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3051097 gaaagaaaacaacaaacacaccaaagattagtaacccaattcggtctaatataacctcctctggaggagagagcacctctccaatccactaagatgaaag 3051196  T
Q  226 tgttacaaaagagttacaagaaattagc 253  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||    
T  3051197 tgatacaaatgagttacaagaaattagc 3051224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 26301124 - 26301242
Alignment:
Q  115 aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatc 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  26301124 aagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 26301220  T
Q  212 cactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26301221 cactatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Original strand, 36979401 - 36979502
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  36979401 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 36979499  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  36979500 aac 36979502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10689216 - 10689115
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  10689216 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-agagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 10689118  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  10689117 aac 10689115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Original strand, 30655670 - 30655771
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  30655670 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 30655768  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  30655769 aac 30655771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10684318 - 10684226
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  10684318 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 10684226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Original strand, 6311321 - 6311394
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 248  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6311321 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaaa 6311394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7493305 - 7493210
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagt-gtctcta-----agcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     |||||||||||||| |||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7493305 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtagtctcaagcagcagcaacaacaacaacaaatagatctaaatctaagtgtagagcaacaccacaa 7493210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33037879 - 33037779
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attagcttacaagcttacacaag 270  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| | ||||||||||||||    
T  33037879 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 33037782  T
Q  271 aac 273  Q
    |||    
T  33037781 aac 33037779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Original strand, 35745422 - 35745488
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35745422 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 35745488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7289987 - 7289915
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 247  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7289987 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 7289915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25328339 - 25328268
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25328339 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 25328268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4696620 - 4696580
Alignment:
Q  233 aaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4696620 aaagagttacaagaaattagcttataagcttacgcaagaac 4696580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18811042 - 18810978
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18811042 ttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactat 18810978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39784907 - 39784813
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  39784907 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 39784813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43036616 - 43036547
Alignment:
Q  129 aagaaaggaacaaacacaccaa-gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgaga 197  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||| ||||    
T  43036616 aagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagaga 43036547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18813192 - 18813152
Alignment:
Q  177 tgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18813192 tgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactat 18813152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079873
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 43079873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082244
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 43082244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 273
Target Start/End: Original strand, 10625 - 10853
Alignment:
Q  46 aagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaaca 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10625 aagcaacaacaacaaaaaacagacctaaatctaagtgtagagcaacaccacaagcataatcaaagcaataaagataagcaatgaaagagaggaacaaaca 10724  T
Q  145 caccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaa 244  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10725 caccaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaa 10824  T
Q  245 gaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10825 gaaattagtttacaagcttacacaagaac 10853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Original strand, 85545 - 85804
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  85545 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaataaaaca--gacctagatctaagtgtagagcaacatcacaagcataaccaa 85642  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  85643 agcacaaagataagcaatgaaagaaaagaacaaacacatctagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctcca 85742  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaaga 271  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  85743 atccaccatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaattagcttaaaagcttacacaaga 85804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Original strand, 5544 - 5807
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaa--aaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5544 aaaggaagtggtaatcaata-gttaagtgtctccaaacaacaacaacaacaaaaacagacctagatctaagtgtagagaaacaccacaagcataatcaaa 5642  T
Q  110 gcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||    
T  5643 gcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttca 5742  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5743 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 5807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 2352 - 2616
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    ||||||||||||  | ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2352 agcaaaggaagtgttgatcaatagataaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctagatctaagtgtagaacaacaccacaagcataatcaa 2450  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||| || || |||||| ||||    
T  2451 agcaataaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctcc 2550  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2551 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattataagaaattagcttataagcttacacaagaac 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 133514 - 133253
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||| ||| ||| |||| || | |||||||| ||||||||||  ||||||    
T  133514 aaaggaagtgataatcaatgtgtaaagtgtctccaaacaacaacaaagcaaaacagacatag-tcta-gtatagagcaacatcacaagcatatacaaagc 133417  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  133416 aataaagataagtaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 133318  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  133317 atccactatgatgaaaatgttac-aaagagttacaagaaaaatagcttgcaaacttacacaagaac 133253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44196 - 43935
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  44196 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagaccta-atcta-gtgtagagcaacaccacaagcataaacaa 44100  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| | ||| || |||||||||||||    
T  44099 agaacaaagataagcaatgaaagaa-ggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctc 44001  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  44000 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttatacaagaac 43935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37069 - 36806
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||| || |||||||||||| |||| |||    
T  37069 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagacctaga-cttggtgtagaccaacaccacaagtataaacaa 36972  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacacc--aagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | |  ||||||||||| |    
T  36971 agcacaaagataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgc 36872  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36871 caacccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 36806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8653 - 8392
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaaagc 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| |    
T  8653 aaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaataacaacaaaaaacagacctag-tcta-gtgtagagcaacaccacaagtataaccaaaac 8556  T
Q  112 ac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcca 208  Q
    |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  8555 aataaagataagcaatgaaagaa-gaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 8457  T
Q  209 atccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8456 atccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 8392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 17126 - 17387
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||| |||||| || |||||||||    ||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  17126 agcaaaggaagtggtaatcaatagataaaatgtctccaaacaacaacaa----aaacatacctaaatctaagtatagagcaacaccacaagcataattaa 17221  T
Q  109 agcac-aaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctcc 207  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||| | ||||    
T  17222 agcaataaagataagaaatgaaagaaaggagcaaacacaccaaaattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctcc 17321  T
Q  208 aatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17322 aatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagcttacacaagaac 17387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 45115 - 45337
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataatcaa 108  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||  |||    
T  45115 agcaaatgaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa-cagaccaag-tcta-gtgtagagcaacaccacaaacatatacaa 45211  T
Q  109 agcacaaagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa--gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  45212 agaacaaagataagcaatgaaagaatg-aacaaacacaccaaaagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctc 45310  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  45311 caatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18185 - 17925
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaag 110  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||    
T  18185 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaccagccctaga-cta-gtgtagagcaacaccacaag-agaatacaaag 18089  T
Q  111 caca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  18088 caaacaagataagcaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctc 17992  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17991 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 17925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24278 - 24018
Alignment:
Q  12 aaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaaactgacctagatctaagtgtcgagcaacaccacaagcataat-caaag 110  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||    
T  24278 aaaggaagtggtaatctatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaaccagccctaga-cta-gtgtagagcaacaccacaag-agaatacaaag 24182  T
Q  111 caca-aagataagcaatgaaagaaaggaacaaacacaccaa---gattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctc 206  Q
     | | |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  24181 aaaacaagataagaaa-gaaaggaag-aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctc 24085  T
Q  207 caatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaag-aaattagcttacaagcttacacaagaac 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24084 caatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagcttacacaagaac 24018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1805 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1805
Description:

Target: scaffold1805; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 1268 - 1322
Alignment:
Q  9 agcaaaggaagtagtaatcaatgtgtaaagtgtctctaagcaacaacaacaaaaa 63  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1268 agcaaaggaagtggtaatcaatgtgtaaagtgtctccaagcaacaacaacaaaaa 1322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14363 - 14271
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14363 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 14271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19219 - 19127
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  19219 cctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatg-tgagtgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 19127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9703 - 9632
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9703 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 9632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2305 - 2213
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2305 cctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 149010 - 148918
Alignment:
Q  180 cctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagctta-caagc-ttacacaaga 271  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  149010 cctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaaga 148918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35123 - 35061
Alignment:
Q  173 aatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 236  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35123 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 35061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Original strand, 363 - 457
Alignment:
Q  148 caagattgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |  || |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  363 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 265
Alignment:
Q  153 ttgttgaaccagttcggttaaatatgacctaatatggaggtgagagcagctctccaatccactat 217  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactat 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University