View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2926_low_55 (Length: 265)

Name: NF2926_low_55
Description: NF2926
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2926_low_55
NF2926_low_55
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (14-252)||(19467958-19468196)
chr6 (14-250)||(19451422-19451658)
chr6 (17-250)||(17414133-17414365)
chr6 (17-239)||(10582645-10582869)
chr6 (30-250)||(25396140-25396361)
chr6 (15-250)||(24720735-24720971)
chr6 (14-237)||(23234731-23234954)
chr6 (14-234)||(19819051-19819270)
chr6 (15-250)||(14375115-14375351)
chr6 (69-250)||(23233267-23233448)
chr6 (69-250)||(14724501-14724685)
chr6 (17-250)||(25347221-25347457)
chr6 (14-250)||(14616075-14616312)
chr6 (15-250)||(19588387-19588623)
chr6 (136-235)||(24513754-24513853)
chr6 (17-237)||(26418469-26418691)
chr6 (150-236)||(5290081-5290167)
chr6 (27-225)||(22798336-22798534)
chr6 (145-250)||(2708506-2708611)
chr6 (85-233)||(19439855-19440001)
chr6 (69-238)||(23105342-23105511)
chr6 (69-237)||(8768033-8768202)
chr6 (52-233)||(29416310-29416490)
chr6 (77-230)||(14995817-14995970)
chr6 (17-237)||(18315786-18316005)
chr6 (69-237)||(8760286-8760455)
chr6 (69-249)||(14132899-14133083)
chr6 (156-250)||(18786202-18786297)
chr6 (138-233)||(21566117-21566212)
chr6 (180-250)||(19472294-19472365)
chr6 (97-233)||(19726758-19726895)
chr6 (152-233)||(18788511-18788592)
chr6 (152-233)||(18799491-18799572)
chr6 (180-226)||(4476526-4476572)
chr6 (180-226)||(9099973-9100019)
chr6 (180-226)||(20008849-20008895)
chr6 (180-226)||(21365437-21365483)
chr6 (180-226)||(23969419-23969465)
chr6 (180-226)||(29096972-29097018)
chr6 (180-226)||(31251530-31251576)
chr6 (180-233)||(12941951-12942003)
chr6 (94-233)||(22907118-22907257)
chr6 (166-218)||(15457632-15457684)
chr6 (166-218)||(15464227-15464279)
chr6 (152-233)||(1592911-1592992)
chr6 (180-230)||(19300640-19300689)
chr6 (152-233)||(21724704-21724785)
chr6 (180-225)||(17027159-17027204)
chr6 (180-216)||(4476616-4476652)
chr6 (180-238)||(221818-221876)
chr6 (178-233)||(937653-937707)
chr6 (180-223)||(21469886-21469929)
chr6 (180-223)||(21476387-21476430)
chr6 (23-81)||(2708675-2708733)
chr6 (167-225)||(10470705-10470762)
chr6 (152-233)||(28290152-28290233)
chr6 (167-204)||(12447170-12447207)
chr6 (180-225)||(25749876-25749921)
chr6 (167-234)||(23021323-23021390)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (14-250)||(19666534-19666772)
chr1 (14-250)||(21664299-21664537)
chr1 (17-250)||(11140809-11141043)
chr1 (14-250)||(21732613-21732847)
chr1 (35-250)||(21410501-21410716)
chr1 (17-250)||(15316311-15316546)
chr1 (14-250)||(16883346-16883581)
chr1 (17-250)||(20849164-20849395)
chr1 (17-229)||(23631115-23631325)
chr1 (69-238)||(21698245-21698415)
chr1 (17-237)||(24108828-24109050)
chr1 (69-250)||(19853170-19853350)
chr1 (69-250)||(19859305-19859485)
chr1 (135-250)||(11157146-11157261)
chr1 (29-250)||(23195284-23195514)
chr1 (14-250)||(29554251-29554486)
chr1 (14-237)||(24079704-24079927)
chr1 (17-237)||(20086289-20086508)
chr1 (150-233)||(32650254-32650337)
chr1 (148-236)||(19778399-19778487)
chr1 (52-225)||(30491280-30491453)
chr1 (116-250)||(20941762-20941897)
chr1 (91-226)||(41312309-41312443)
chr1 (180-226)||(16371698-16371744)
chr1 (27-159)||(20108326-20108458)
chr1 (85-169)||(31927189-31927273)
chr1 (94-227)||(954950-955084)
chr1 (156-238)||(31927365-31927447)
chr1 (180-230)||(19961292-19961341)
chr1 (180-226)||(20852035-20852081)
chr1 (180-226)||(20858661-20858707)
chr1 (180-226)||(21705383-21705429)
chr1 (179-233)||(23066672-23066725)
chr1 (141-233)||(19664062-19664154)
chr1 (117-237)||(20824266-20824387)
chr1 (180-233)||(20242686-20242738)
chr1 (189-226)||(21709924-21709961)
chr1 (180-216)||(13226881-13226917)
chr1 (180-216)||(16371789-16371825)
chr1 (117-235)||(20838075-20838194)
chr1 (167-238)||(21734429-21734500)
chr1 (52-133)||(5380882-5380963)
chr1 (180-225)||(22030705-22030750)
chr1 (181-233)||(3706736-3706787)
chr1 (167-238)||(21745621-21745691)
chr1 (27-133)||(21986720-21986826)
chr1 (167-209)||(21986921-21986963)
chr1 (180-225)||(20108501-20108546)
chr1 (164-225)||(24475476-24475537)
chr1 (209-250)||(29535065-29535106)
chr1 (180-209)||(32650338-32650367)
chr1 (167-204)||(49328175-49328212)
chr1 (167-234)||(36615048-36615115)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (14-250)||(6777-7013)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (14-239)||(45044-45272)
scaffold0124 (14-250)||(9363-9601)
scaffold0124 (130-237)||(43914-44021)
scaffold0124 (150-227)||(36759-36836)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (14-238)||(234-458)
scaffold0034 (14-238)||(6393-6617)
scaffold0034 (18-237)||(9914-10133)
scaffold0034 (18-250)||(17210-17442)
scaffold0034 (180-230)||(72386-72435)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (17-250)||(21690239-21690472)
chr8 (17-239)||(21683496-21683719)
chr8 (17-239)||(21687845-21688068)
chr8 (62-250)||(20783719-20783912)
chr8 (14-250)||(20839729-20839964)
chr8 (69-250)||(21300002-21300184)
chr8 (34-250)||(36445576-36445791)
chr8 (69-250)||(10607069-10607252)
chr8 (17-234)||(23653993-23654211)
chr8 (29-250)||(19859646-19859866)
chr8 (17-250)||(39363619-39363855)
chr8 (15-250)||(41009264-41009500)
chr8 (85-233)||(21669010-21669156)
chr8 (139-250)||(16259652-16259765)
chr8 (27-225)||(22743867-22744063)
chr8 (150-226)||(8728951-8729027)
chr8 (85-233)||(21282212-21282358)
chr8 (98-225)||(20005512-20005638)
chr8 (15-237)||(31412315-31412535)
chr8 (15-237)||(31418497-31418717)
chr8 (148-235)||(21322199-21322286)
chr8 (113-250)||(23652886-23653025)
chr8 (15-239)||(20973828-20974053)
chr8 (148-236)||(21326787-21326875)
chr8 (88-233)||(22063466-22063611)
chr8 (74-227)||(22175924-22176077)
chr8 (156-250)||(21686052-21686147)
chr8 (156-237)||(20006371-20006452)
chr8 (27-169)||(21685900-21686041)
chr8 (88-233)||(22025463-22025608)
chr8 (94-233)||(22177738-22177878)
chr8 (116-250)||(19988095-19988230)
chr8 (135-195)||(18613282-18613342)
chr8 (156-238)||(14594699-14594781)
chr8 (191-237)||(18609941-18609987)
chr8 (180-226)||(24321572-24321618)
chr8 (141-233)||(14057540-14057632)
chr8 (156-233)||(25110994-25111071)
chr8 (189-226)||(8596070-8596107)
chr8 (167-238)||(25624680-25624751)
chr8 (167-238)||(33088965-33089036)
chr8 (167-226)||(20012138-20012197)
chr8 (27-140)||(33089124-33089237)
chr8 (75-197)||(1264221-1264342)
chr8 (167-234)||(29299028-29299095)
chr8 (167-234)||(29305574-29305641)
chr8 (179-233)||(22050353-22050406)
chr8 (179-233)||(22055871-22055924)
chr8 (180-209)||(8728921-8728950)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (17-250)||(20648210-20648443)
chr2 (27-250)||(22860440-22860663)
chr2 (69-250)||(22796484-22796667)
chr2 (14-250)||(23752927-23753162)
chr2 (35-250)||(25267340-25267555)
chr2 (14-250)||(24652466-24652700)
chr2 (14-237)||(28971081-28971304)
chr2 (17-239)||(8889775-8889996)
chr2 (14-250)||(19649347-19649583)
chr2 (14-250)||(23291062-23291297)
chr2 (14-250)||(24658910-24659144)
chr2 (69-239)||(25107327-25107498)
chr2 (17-250)||(19035618-19035851)
chr2 (14-250)||(19703285-19703523)
chr2 (98-250)||(21073867-21074021)
chr2 (135-250)||(23062687-23062802)
chr2 (18-237)||(21133061-21133278)
chr2 (15-233)||(22810035-22810248)
chr2 (128-250)||(21907385-21907507)
chr2 (135-250)||(23264118-23264233)
chr2 (17-238)||(20914141-20914361)
chr2 (15-237)||(20724182-20724405)
chr2 (14-250)||(24943513-24943751)
chr2 (138-233)||(23089960-23090055)
chr2 (138-233)||(23102388-23102483)
chr2 (180-226)||(19662794-19662840)
chr2 (180-226)||(27208614-27208660)
chr2 (180-226)||(27210949-27210995)
chr2 (180-223)||(24660629-24660672)
chr2 (180-226)||(9683-9729)
chr2 (152-233)||(2105730-2105811)
chr2 (180-226)||(25181802-25181848)
chr2 (180-226)||(29281102-29281148)
chr2 (167-238)||(17633978-17634049)
chr2 (180-227)||(9241491-9241537)
chr2 (180-250)||(38931527-38931598)
chr2 (180-226)||(26884314-26884359)
chr2 (180-233)||(20260975-20261027)
chr2 (180-216)||(6261437-6261473)
chr2 (180-216)||(19662713-19662749)
chr2 (180-226)||(6261518-6261563)
chr2 (27-133)||(17634146-17634252)
chr2 (91-225)||(21123753-21123889)
chr2 (180-233)||(23877991-23878043)
chr2 (66-139)||(24669680-24669753)
chr2 (73-133)||(25365784-25365844)
chr2 (167-234)||(45028622-45028689)
chr2 (31-140)||(9241635-9241743)
chr2 (180-225)||(24669760-24669805)
chr2 (167-204)||(25590159-25590196)
chr2 (167-204)||(32911440-32911477)
chr2 (167-234)||(15643247-15643314)
[»] scaffold0405 (2 HSPs)
scaffold0405 (14-250)||(3108-3338)
scaffold0405 (14-174)||(15989-16149)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (17-250)||(17496258-17496490)
chr3 (14-246)||(12362324-12362556)
chr3 (14-246)||(12355775-12356007)
chr3 (14-250)||(12479511-12479746)
chr3 (17-250)||(12152990-12153224)
chr3 (14-250)||(15518632-15518867)
chr3 (69-250)||(11305630-11305810)
chr3 (69-250)||(11644677-11644858)
chr3 (98-249)||(2270149-2270299)
chr3 (73-250)||(13692059-13692239)
chr3 (17-235)||(17512693-17512912)
chr3 (29-250)||(14569936-14570154)
chr3 (88-237)||(17243557-17243708)
chr3 (69-237)||(31690457-31690623)
chr3 (92-239)||(12202429-12202578)
chr3 (15-250)||(12961206-12961443)
chr3 (69-237)||(31943592-31943758)
chr3 (69-227)||(23173920-23174077)
chr3 (14-237)||(18756766-18756988)
chr3 (74-250)||(18129668-18129843)
chr3 (150-236)||(11850602-11850688)
chr3 (16-226)||(12419555-12419765)
chr3 (116-250)||(18136222-18136357)
chr3 (17-169)||(15954760-15954911)
chr3 (27-218)||(13036802-13036992)
chr3 (130-250)||(18900142-18900263)
chr3 (156-250)||(15934937-15935032)
chr3 (150-233)||(23174309-23174391)
chr3 (14-120)||(10597496-10597601)
chr3 (85-227)||(34852086-34852227)
chr3 (17-169)||(12274473-12274624)
chr3 (85-237)||(12255274-12255426)
chr3 (130-250)||(18889103-18889224)
chr3 (17-169)||(15934765-15934916)
chr3 (14-167)||(12363592-12363744)
chr3 (156-250)||(15954958-15955053)
chr3 (180-250)||(11964873-11964943)
chr3 (86-225)||(18719010-18719150)
chr3 (139-233)||(16802380-16802474)
chr3 (180-230)||(19443627-19443677)
chr3 (180-226)||(23371846-23371892)
chr3 (14-130)||(11939697-11939811)
chr3 (98-233)||(14652604-14652740)
chr3 (145-237)||(18914155-18914246)
chr3 (156-237)||(10597677-10597759)
chr3 (100-233)||(14292857-14292988)
chr3 (150-226)||(20249072-20249152)
chr3 (180-226)||(10390367-10390413)
chr3 (180-226)||(10415476-10415522)
chr3 (180-226)||(10422146-10422192)
chr3 (180-226)||(12034317-12034363)
chr3 (180-230)||(13313908-13313957)
chr3 (180-226)||(14764100-14764146)
chr3 (180-226)||(14864949-14864995)
chr3 (180-226)||(19235970-19236016)
chr3 (180-226)||(51300263-51300309)
chr3 (14-130)||(11964742-11964856)
chr3 (27-140)||(24284248-24284361)
chr3 (156-231)||(12274382-12274458)
chr3 (85-204)||(12255750-12255871)
chr3 (180-230)||(13324820-13324869)
chr3 (179-233)||(14544162-14544215)
chr3 (180-226)||(17130857-17130903)
chr3 (180-230)||(38312119-38312168)
chr3 (180-233)||(12304900-12304952)
chr3 (137-233)||(17157213-17157309)
chr3 (137-233)||(24191914-24192010)
chr3 (52-140)||(14288885-14288973)
chr3 (180-216)||(14764019-14764055)
chr3 (180-216)||(23371765-23371801)
chr3 (167-238)||(24284449-24284520)
chr3 (52-140)||(35984931-35985019)
chr3 (180-216)||(51300353-51300389)
chr3 (180-230)||(13303232-13303281)
chr3 (164-225)||(1989215-1989276)
chr3 (164-225)||(15011956-15012017)
chr3 (17-58)||(19343999-19344040)
chr3 (167-234)||(8373912-8373979)
chr3 (181-233)||(16829952-16830003)
chr3 (181-233)||(16838475-16838526)
chr3 (167-238)||(42109271-42109342)
chr3 (179-222)||(16382851-16382893)
chr3 (179-233)||(13203510-13203563)
chr3 (180-209)||(11850572-11850601)
chr3 (180-225)||(14288979-14289024)
chr3 (180-209)||(20249042-20249071)
chr3 (180-225)||(35984880-35984925)
chr3 (180-209)||(38312059-38312088)
chr3 (73-133)||(9533159-9533219)
chr3 (167-234)||(18961067-18961134)
[»] chr7 (99 HSPs)
chr7 (14-234)||(3327955-3328176)
chr7 (17-250)||(11857507-11857741)
chr7 (14-250)||(16187530-16187764)
chr7 (17-250)||(46681998-46682229)
chr7 (25-250)||(10519975-10520199)
chr7 (87-250)||(14178882-14179046)
chr7 (17-250)||(81881-82113)
chr7 (14-237)||(15085724-15085946)
chr7 (17-250)||(15097770-15098002)
chr7 (17-250)||(15104147-15104379)
chr7 (17-250)||(16952040-16952273)
chr7 (69-250)||(46348610-46348790)
chr7 (14-204)||(14169334-14169525)
chr7 (14-233)||(18958231-18958448)
chr7 (17-238)||(45185599-45185816)
chr7 (17-239)||(12547322-12547546)
chr7 (15-237)||(26289572-26289791)
chr7 (15-237)||(37244111-37244331)
chr7 (135-250)||(13678466-13678581)
chr7 (17-232)||(15142357-15142570)
chr7 (69-218)||(12801145-12801300)
chr7 (14-133)||(14173581-14173701)
chr7 (27-225)||(16475951-16476147)
chr7 (15-250)||(11219918-11220153)
chr7 (85-233)||(1612775-1612922)
chr7 (71-250)||(14945728-14945907)
chr7 (71-250)||(15373321-15373500)
chr7 (124-250)||(32771634-32771760)
chr7 (30-235)||(12694740-12694944)
chr7 (17-223)||(16073774-16073978)
chr7 (180-250)||(3289751-3289821)
chr7 (17-223)||(11309161-11309366)
chr7 (85-227)||(36305938-36306077)
chr7 (99-233)||(6411974-6412108)
chr7 (180-250)||(832952-833022)
chr7 (180-250)||(836995-837065)
chr7 (180-250)||(1198132-1198202)
chr7 (180-250)||(1202175-1202245)
chr7 (97-233)||(14281532-14281669)
chr7 (156-238)||(15437549-15437631)
chr7 (145-223)||(11312469-11312547)
chr7 (94-233)||(35962621-35962761)
chr7 (180-250)||(46624982-46625057)
chr7 (180-226)||(147229-147275)
chr7 (180-226)||(14320535-14320581)
chr7 (180-226)||(15166936-15166982)
chr7 (97-233)||(15723103-15723240)
chr7 (180-226)||(18872027-18872073)
chr7 (180-226)||(20907330-20907376)
chr7 (30-169)||(15437387-15437524)
chr7 (180-226)||(2464473-2464519)
chr7 (180-226)||(2966092-2966138)
chr7 (180-226)||(3858326-3858372)
chr7 (180-226)||(10897154-10897200)
chr7 (152-233)||(15710935-15711016)
chr7 (180-226)||(16008245-16008291)
chr7 (180-226)||(16090190-16090236)
chr7 (97-233)||(19599994-19600131)
chr7 (180-226)||(29182013-29182059)
chr7 (141-233)||(11390259-11390351)
chr7 (142-233)||(11383772-11383863)
chr7 (142-233)||(15338978-15339069)
chr7 (142-233)||(20328182-20328273)
chr7 (180-227)||(18607024-18607070)
chr7 (180-226)||(14565870-14565915)
chr7 (137-233)||(16676344-16676441)
chr7 (137-233)||(17650580-17650677)
chr7 (156-233)||(21231981-21232058)
chr7 (180-233)||(11303003-11303055)
chr7 (180-216)||(10897073-10897109)
chr7 (53-202)||(14265843-14265994)
chr7 (164-238)||(14581399-14581475)
chr7 (180-216)||(16008336-16008372)
chr7 (180-216)||(18872118-18872154)
chr7 (116-225)||(19145729-19145840)
chr7 (116-225)||(20745128-20745239)
chr7 (166-218)||(31154535-31154587)
chr7 (52-151)||(23442423-23442522)
chr7 (156-218)||(14255672-14255734)
chr7 (181-250)||(14128306-14128374)
chr7 (181-250)||(14432124-14432192)
chr7 (52-133)||(19152097-19152178)
chr7 (52-133)||(20751496-20751577)
chr7 (180-216)||(14565960-14565996)
chr7 (167-223)||(16575387-16575442)
chr7 (167-223)||(16590220-16590275)
chr7 (180-250)||(23442358-23442428)
chr7 (167-225)||(14038740-14038798)
chr7 (167-225)||(14348770-14348828)
chr7 (152-233)||(23665772-23665853)
chr7 (152-233)||(29795881-29795962)
chr7 (152-233)||(29799700-29799781)
chr7 (167-225)||(46649893-46649950)
chr7 (180-209)||(10896987-10897016)
chr7 (167-204)||(13019850-13019887)
chr7 (180-209)||(15167017-15167046)
chr7 (167-238)||(12461626-12461697)
chr7 (53-169)||(14253818-14253934)
chr7 (167-234)||(23521114-23521181)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (17-238)||(16228927-16229148)
chr4 (17-250)||(18166092-18166327)
chr4 (14-237)||(13453879-13454102)
chr4 (17-250)||(53905122-53905356)
chr4 (14-234)||(17176516-17176737)
chr4 (15-237)||(37881549-37881771)
chr4 (15-237)||(15325023-15325246)
chr4 (92-239)||(15360704-15360853)
chr4 (85-238)||(18261449-18261602)
chr4 (85-238)||(18271414-18271567)
chr4 (135-250)||(14063046-14063161)
chr4 (98-249)||(12931978-12932131)
chr4 (15-246)||(41528890-41529121)
chr4 (14-237)||(49051083-49051321)
chr4 (27-229)||(15407068-15407269)
chr4 (52-233)||(4830932-4831112)
chr4 (52-233)||(4834227-4834407)
chr4 (17-238)||(30237897-30238121)
chr4 (180-250)||(14048337-14048407)
chr4 (95-250)||(14485647-14485803)
chr4 (180-250)||(2585140-2585210)
chr4 (156-238)||(16484748-16484830)
chr4 (73-225)||(14821519-14821670)
chr4 (164-250)||(10972858-10972945)
chr4 (17-156)||(16484874-16485012)
chr4 (145-250)||(14556016-14556121)
chr4 (99-227)||(17000056-17000185)
chr4 (17-169)||(15546818-15546969)
chr4 (150-230)||(14910742-14910823)
chr4 (146-237)||(26077649-26077739)
chr4 (180-250)||(30146903-30146973)
chr4 (94-233)||(14484582-14484721)
chr4 (99-233)||(43284785-43284920)
chr4 (180-230)||(1651028-1651078)
chr4 (180-226)||(16147735-16147781)
chr4 (180-233)||(18212290-18212342)
chr4 (180-223)||(40908747-40908790)
chr4 (156-237)||(15546720-15546801)
chr4 (179-233)||(23121752-23121805)
chr4 (180-230)||(27905368-27905417)
chr4 (180-233)||(15533937-15533989)
chr4 (167-238)||(27849429-27849501)
chr4 (180-250)||(13899583-13899656)
chr4 (32-154)||(15004864-15004986)
chr4 (94-233)||(11171142-11171282)
chr4 (167-232)||(41404660-41404724)
chr4 (167-234)||(899656-899723)
chr4 (179-238)||(15004977-15005036)
chr4 (152-237)||(16156782-16156868)
chr4 (167-225)||(42955974-42956031)
chr4 (167-204)||(46044823-46044860)
chr4 (180-208)||(13886848-13886876)
chr4 (180-208)||(13887714-13887742)
chr4 (180-208)||(15244281-15244309)
chr4 (181-233)||(20940412-20940463)
chr4 (167-234)||(42220494-42220561)
[»] scaffold0011 (10 HSPs)
scaffold0011 (14-250)||(154267-154504)
scaffold0011 (14-250)||(197245-197480)
scaffold0011 (35-250)||(75270-75484)
scaffold0011 (17-250)||(56583-56806)
scaffold0011 (14-250)||(147146-147383)
scaffold0011 (69-250)||(252023-252203)
scaffold0011 (69-238)||(258641-258809)
scaffold0011 (14-130)||(187618-187732)
scaffold0011 (85-233)||(152513-152659)
scaffold0011 (180-225)||(21720-21765)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (14-250)||(38472-38707)
scaffold0022 (14-250)||(136532-136767)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (17-238)||(18652-18865)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (14-250)||(21829641-21829879)
chr5 (14-250)||(27635679-27635915)
chr5 (14-250)||(6404301-6404536)
chr5 (20-239)||(427367-427588)
chr5 (88-250)||(18408877-18409040)
chr5 (17-225)||(25013719-25013925)
chr5 (27-225)||(18819070-18819266)
chr5 (150-236)||(24668931-24669017)
chr5 (150-236)||(24738700-24738786)
chr5 (150-236)||(24751469-24751555)
chr5 (17-238)||(21888700-21888923)
chr5 (17-225)||(10035279-10035485)
chr5 (88-230)||(23112614-23112758)
chr5 (74-250)||(22232501-22232676)
chr5 (105-249)||(23561503-23561648)
chr5 (30-238)||(21901682-21901889)
chr5 (85-227)||(23538960-23539101)
chr5 (85-233)||(10816927-10817074)
chr5 (100-238)||(6728148-6728288)
chr5 (93-225)||(21869433-21869564)
chr5 (93-225)||(21873713-21873844)
chr5 (17-120)||(23561398-23561502)
chr5 (146-239)||(20843293-20843388)
chr5 (97-250)||(22312717-22312870)
chr5 (156-250)||(15193975-15194070)
chr5 (156-250)||(23444144-23444239)
chr5 (180-226)||(20780853-20780899)
chr5 (180-226)||(22336268-22336314)
chr5 (180-226)||(22339806-22339852)
chr5 (180-226)||(22466887-22466933)
chr5 (180-226)||(37599256-37599302)
chr5 (152-233)||(758195-758276)
chr5 (180-226)||(19236008-19236054)
chr5 (180-226)||(20772078-20772124)
chr5 (180-226)||(20819291-20819337)
chr5 (180-226)||(20826391-20826437)
chr5 (179-233)||(20937747-20937800)
chr5 (180-226)||(22749915-22749961)
chr5 (180-226)||(28897001-28897047)
chr5 (180-226)||(28910249-28910295)
chr5 (180-226)||(28931941-28931987)
chr5 (180-226)||(28933444-28933490)
chr5 (180-226)||(28946644-28946690)
chr5 (180-230)||(34829186-34829235)
chr5 (180-226)||(22460263-22460309)
chr5 (179-233)||(22509141-22509194)
chr5 (180-226)||(24930830-24930876)
chr5 (180-226)||(28371395-28371440)
chr5 (180-226)||(28890297-28890343)
chr5 (85-162)||(23444057-23444134)
chr5 (180-233)||(37805289-37805341)
chr5 (152-250)||(22007864-22007963)
chr5 (180-216)||(22336359-22336395)
chr5 (180-216)||(22339897-22339933)
chr5 (180-216)||(37599175-37599211)
chr5 (180-216)||(38145643-38145679)
chr5 (180-216)||(42960332-42960368)
chr5 (152-238)||(18941178-18941264)
chr5 (152-238)||(22439669-22439755)
chr5 (180-226)||(21624692-21624738)
chr5 (180-226)||(38145724-38145769)
chr5 (180-226)||(42960242-42960287)
chr5 (167-234)||(23076270-23076337)
chr5 (167-234)||(23081718-23081785)
chr5 (180-216)||(28371314-28371350)
chr5 (167-226)||(17022816-17022875)
chr5 (152-233)||(9775618-9775699)
chr5 (167-225)||(19362721-19362778)
chr5 (167-225)||(23544840-23544897)
chr5 (180-250)||(26753705-26753778)
chr5 (167-204)||(19801864-19801901)
chr5 (180-225)||(21495060-21495105)
chr5 (180-209)||(22749996-22750025)
chr5 (167-203)||(39608852-39608888)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (17-250)||(9469-9703)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (14-237)||(46564-46786)
scaffold0106 (14-237)||(50837-51059)
scaffold0106 (180-235)||(28750-28806)
scaffold0106 (180-238)||(36333-36392)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (17-250)||(539-774)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (17-250)||(8612-8847)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (69-250)||(57042-57224)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (69-250)||(141409-141591)
scaffold0017 (27-138)||(2782-2892)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (17-250)||(3345-3580)
scaffold0301 (14-239)||(13219-13445)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (17-238)||(25734-25957)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (14-250)||(43922-44157)
scaffold0010 (14-250)||(48988-49223)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (14-250)||(458-694)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (17-207)||(743-932)
scaffold0035 (92-239)||(10594-10743)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (14-250)||(370523-370758)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (14-250)||(95984-96219)
scaffold0001 (180-250)||(488351-488422)
scaffold0001 (180-226)||(493929-493974)
scaffold0001 (167-234)||(179116-179183)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (27-250)||(27377-27599)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (14-250)||(9376-9614)
[»] scaffold0243 (3 HSPs)
scaffold0243 (14-251)||(7833-8069)
scaffold0243 (14-250)||(15853-16088)
scaffold0243 (14-219)||(12139-12343)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (17-238)||(29954-30175)
scaffold0102 (74-250)||(44721-44896)
scaffold0102 (156-234)||(38539-38617)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (69-250)||(5683-5865)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (17-250)||(17234-17469)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (28-239)||(76866-77077)
scaffold0025 (85-233)||(71242-71390)
scaffold0025 (137-250)||(15385-15498)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (14-238)||(4811-5036)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (14-239)||(8386-8613)
scaffold0298 (14-239)||(18470-18697)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (85-239)||(10532-10687)
scaffold0261 (85-239)||(18711-18866)
scaffold0261 (180-230)||(24473-24522)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (130-250)||(65105-65226)
scaffold0028 (180-217)||(1128-1165)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (14-250)||(34914-35152)
scaffold0008 (66-133)||(124785-124852)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (17-225)||(19998-20205)
scaffold0167 (14-250)||(7075-7302)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (69-237)||(4868-5034)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (15-237)||(28011-28234)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (135-250)||(115871-115986)
scaffold0004 (69-237)||(326921-327091)
scaffold0004 (69-250)||(321199-321382)
scaffold0004 (180-239)||(129661-129721)
scaffold0004 (180-209)||(129597-129626)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (17-238)||(1160-1382)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (130-250)||(976-1096)
scaffold0461 (130-250)||(7912-8032)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (98-250)||(3008-3162)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (85-250)||(16766-16933)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (135-250)||(15923-16038)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (130-238)||(1437-1546)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (14-250)||(55998-56234)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (85-250)||(5777-5944)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (135-250)||(359-474)
[»] scaffold0026 (11 HSPs)
scaffold0026 (17-248)||(27721-27956)
scaffold0026 (17-248)||(38558-38793)
scaffold0026 (69-237)||(124330-124499)
scaffold0026 (27-169)||(24972-25114)
scaffold0026 (180-226)||(110354-110400)
scaffold0026 (182-233)||(63168-63218)
scaffold0026 (75-168)||(35783-35876)
scaffold0026 (180-216)||(110445-110481)
scaffold0026 (180-233)||(12849-12902)
scaffold0026 (97-130)||(63075-63108)
scaffold0026 (180-225)||(142794-142839)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (14-250)||(3131-3369)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (27-238)||(45652-45863)
[»] scaffold0348 (4 HSPs)
scaffold0348 (66-237)||(3070-3239)
scaffold0348 (116-238)||(1632-1755)
scaffold0348 (180-226)||(8465-8511)
scaffold0348 (99-233)||(15368-15503)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (15-236)||(153146-153368)
scaffold0023 (94-233)||(20402-20542)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (135-250)||(102855-102970)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (88-230)||(995-1139)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (17-230)||(61825-62036)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (70-250)||(171670-171852)
[»] scaffold1853 (1 HSPs)
scaffold1853 (27-223)||(623-817)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (17-233)||(51508-51725)
scaffold0076 (167-234)||(174-241)
[»] scaffold0326 (4 HSPs)
scaffold0326 (150-236)||(331-417)
scaffold0326 (91-169)||(5271-5349)
scaffold0326 (156-218)||(5354-5416)
scaffold0326 (180-209)||(301-330)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (180-250)||(2081-2151)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (148-236)||(8562-8650)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (17-169)||(207524-207676)
scaffold0007 (156-238)||(207691-207773)
[»] scaffold0053 (4 HSPs)
scaffold0053 (30-154)||(82093-82217)
scaffold0053 (27-217)||(72719-72911)
scaffold0053 (73-225)||(46589-46742)
scaffold0053 (180-226)||(80395-80441)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (85-233)||(146720-146867)
scaffold0021 (152-233)||(141477-141558)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (116-237)||(44341-44462)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (27-250)||(2390-2621)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (116-235)||(2282-2401)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (17-200)||(12615-12795)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (146-250)||(47755-47862)
scaffold0114 (97-233)||(42083-42220)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (53-225)||(42779-42950)
scaffold0049 (53-159)||(53474-53580)
scaffold0049 (166-225)||(45081-45140)
[»] scaffold0516 (2 HSPs)
scaffold0516 (156-250)||(6265-6360)
scaffold0516 (33-162)||(6374-6502)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (101-250)||(16995-17145)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (180-250)||(5096-5167)
scaffold0120 (29-209)||(4882-5061)
[»] scaffold1098 (1 HSPs)
scaffold1098 (27-169)||(2156-2298)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (17-250)||(55743-55984)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (101-233)||(5301-5433)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (85-238)||(13748-13902)
scaffold0244 (85-176)||(2-92)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (116-250)||(18072-18207)
scaffold0077 (116-250)||(23705-23838)
scaffold0077 (137-233)||(4547-4643)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (73-225)||(18039-18190)
scaffold0005 (152-233)||(258825-258906)
scaffold0005 (152-233)||(265251-265332)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (124-239)||(26241-26358)
scaffold0104 (124-239)||(27623-27740)
[»] scaffold1726 (2 HSPs)
scaffold1726 (17-130)||(514-627)
scaffold1726 (156-234)||(380-459)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (137-233)||(4228-4324)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (85-233)||(7402-7550)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (17-162)||(22554-22698)
scaffold0091 (17-162)||(26751-26895)
[»] scaffold0661 (2 HSPs)
scaffold0661 (156-239)||(4036-4119)
scaffold0661 (35-169)||(3891-4025)
[»] scaffold0249 (3 HSPs)
scaffold0249 (52-238)||(6623-6813)
scaffold0249 (113-239)||(7712-7838)
scaffold0249 (166-218)||(14754-14806)
[»] scaffold1469 (1 HSPs)
scaffold1469 (180-226)||(463-509)
[»] scaffold1290 (1 HSPs)
scaffold1290 (17-238)||(1067-1295)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (180-226)||(4163-4209)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (97-233)||(14384-14521)
scaffold0239 (152-233)||(7157-7238)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (181-238)||(51283-51341)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (179-232)||(17631-17683)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (85-233)||(5909-6055)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (17-225)||(2078-2286)
scaffold0266 (17-225)||(23157-23365)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (182-237)||(17042-17096)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (180-226)||(2819-2865)
scaffold0544 (180-216)||(2738-2774)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (180-230)||(11913-11962)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (184-226)||(11458-11500)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (156-233)||(41564-41641)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (180-226)||(4573-4619)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (180-226)||(92104-92150)
scaffold0029 (180-226)||(97830-97876)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (180-233)||(140-192)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (27-176)||(3603-3749)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (66-169)||(81024-81127)
scaffold0003 (52-169)||(98316-98433)
[»] scaffold2016 (1 HSPs)
scaffold2016 (52-154)||(707-809)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (183-233)||(16914-16963)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (179-233)||(47383-47436)
scaffold0067 (179-233)||(56417-56470)
scaffold0067 (179-233)||(62803-62856)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (180-233)||(10231-10283)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (165-225)||(559-619)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (180-223)||(4092-4135)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (149-227)||(10357-10435)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (178-233)||(50942-50996)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (183-233)||(392-441)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (152-233)||(14515-14596)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (180-226)||(131-177)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (189-226)||(115-152)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (180-225)||(19439-19484)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (73-133)||(4722-4782)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (167-238)||(9249-9320)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (167-238)||(26384-26455)
[»] scaffold0178 (2 HSPs)
scaffold0178 (73-133)||(25687-25747)
scaffold0178 (180-225)||(25629-25674)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (152-204)||(41373-41425)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (167-234)||(137189-137256)
[»] scaffold1336 (1 HSPs)
scaffold1336 (166-225)||(780-839)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (180-226)||(12012-12059)
[»] scaffold0669 (1 HSPs)
scaffold0669 (181-223)||(1753-1795)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (66-140)||(18146-18220)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (145-250)||(29883-29987)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (85-170)||(116-200)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (180-233)||(10494-10546)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (180-225)||(8749-8794)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (167-204)||(247162-247199)
scaffold0009 (167-204)||(253676-253713)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (167-234)||(30945-31012)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19468196 - 19467958
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19468196 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattatgatgatctgttgttgactgggatgtatgcttttatg 19468097  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19468096 taattaaatcatacatgttgatgaattatggagttgtaagttatatatacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 19467997  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaactg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19467996 cataagcataaaagcgggagggctcttgccctggaactg 19467958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19451658 - 19451422
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19451658 atattgatgtttcagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattatgatgatctgttgttgactgggatgtatgcttttatg 19451559  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19451558 taattaaatcatacatgttgatgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 19451459  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19451458 cataagtataaaagcgggagggctctttccctggaac 19451422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17414365 - 17414133
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  17414365 ttgatgtatgagcatgattatgattagttgtgcatttt-ctggaattattgaattgattatgatgatctgttgttaactgtgatgtatgattttatttaa 17414267  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17414266 ttaaatcatacatgttgttgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 17414167  T
Q  217 aagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17414166 aagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 17414133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 10582645 - 10582869
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10582645 ttgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 10582744  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10582745 attaaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagtcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 10582843  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10582844 ataagcatataaagcgggagggctct 10582869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25396361 - 25396140
Alignment:
Q  30 atgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacat 129  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||  || | || || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25396361 atgattattattaattgtgcatttttctgaaattggtggactggttttgatgatttgttgttgactgtgatgtatgcttttatttaattaaatcatacat 25396262  T
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagc 228  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25396261 gttgttgtattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgtatgtatatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagc 25396162  T
Q  229 gggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  25396161 gggagggctcttgccctggaac 25396140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24720971 - 24720735
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||  || ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  24720971 tattgatgtctgagcataattatgattaatggtgtatttttctggaattgttggattgattttaatggtctgttgatgactgtgatgtatgtttatattt 24720872  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24720871 aaataaatcatacatgttgtttaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgaaaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 24720772  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  24720771 ataagcatataaagcgagagggctcttgccctggaac 24720735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 23234731 - 23234954
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23234731 atattgatgtttaagcatgactgtgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattatgatgat-tgttgttgactgggatgtatgcttttatt 23234829  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
     | |||| || |||||| || || ||||   |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23234830 gagttaagtcttacatgatgttgcattactgagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagt 23234928  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23234929 tgcataagcataaaagcgggagggct 23234954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19819270 - 19819051
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  19819270 atattgatgtttaaacatgattatgattagttttgcatttttctggaatgattggattgatgatgatgacctgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 19819173  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaatta-tgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19819172 taattaaatcatacatggtgtttaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagttagtt 19819073  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  19819072 gcataagcacaaaagcgggagg 19819051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 14375115 - 14375351
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14375115 tattggtgtttaagcatgattatgattaaattgtgcatttt-ctggaatgattgaattgattataatggtttgttgttgactgggatgtatgcttctatt 14375213  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||| | ||| || ||||||||| | | |||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  14375214 taattaagttatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatataaatacatatacattgttggagttgtatgtagatatacactagtggagttattt 14375313  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  14375314 gcataagcttaaaagcgggagggcttcggccctggaac 14375351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 23233267 - 23233448
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23233267 attgattatgatgatttgttgttgactgtgatgtatgcttt-atttaattaaatattacatgttgttaaattgtgg-gttgtgagtcatatatacatata 23233364  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23233365 tgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtaagttgcatgagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 23233448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14724685 - 14724501
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgctttta-tttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatat 167  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | | ||    
T  14724685 attgattataatgatttgttgttgactgggatgtatgcttctaatttaattaagtcatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatataaatacat 14724586  T
Q  168 atgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14724585 atgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 14724501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25347457 - 25347221
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||||   ||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25347457 ttgatgtctgagcatggttataattaattatgcatttttctgagattattgg-ttgattatgatgatttgttgttgactgggatgtatg-ttatatttaa 25347360  T
Q  117 ttaaa-tcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatata--tacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25347359 ttaaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatacatatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattg 25347260  T
Q  214 cataagc--ataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  25347259 cacaagcatataaaagcgggagggctttttccctggaac 25347221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 14616075 - 14616312
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||  || ||||||||||||  | || ||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14616075 atattgatgtctaagcatgactattataaatggtgtatttttctggatg-attggattaattataatgatttgttgttgacttggatgtatgcttctatt 14616173  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||  ||||||||| || || |||| | ||| || ||||||||| | | ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14616174 taattacgtcatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatatagatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 14616273  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14616274 tgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 14616312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 19588387 - 19588623
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  | | ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19588387 tattggtgtttaagcatgattatgattaaattgtgcatatt-ctgggatgattgaattagttataatggtttgttgttgactgggatgtatgcttctatt 19588485  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| |  || |||| | ||  || ||||||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19588486 taattaagttatacatgatattgcattaaggagaggtgagtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagtt 19588585  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  19588586 gcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaac 19588623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Original strand, 24513754 - 24513853
Alignment:
Q  136 gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggaggg 235  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24513754 gaattatgaagtcgtatgtcatatatacacatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcgggaggg 24513853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 26418469 - 26418691
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgc-ttttattta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||  ||||||||||| |||||| || |||| |||| ||| |||||||| ||||||| |    
T  26418469 ttgatgtttaagcatgattatgattaaccatgcaattttctggaaatactgaattgactatgat-gtttgttattgattggaatgtatgctttttattga 26418567  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatat--atacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||| |||||||||  | || |||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26418568 attaagtcatacatg-ggttgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatatgcatttggtcgagttgtatgtaggtatacacaagt-gagtcagt 26418665  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  26418666 cgcatatgcataaaagcgggagggct 26418691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 5290081 - 5290167
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5290081 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcataaaagcgggagggc 5290167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 22798336 - 22798534
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||  || ||| |||||| || | ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22798336 agcatgattatgattaattgtgtatttttttggaattgttggattaattatgctgatttgttgatgattgtgatgtatgtttacatttaattaaatcata 22798435  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22798436 catgttgtttaattgtggggttgtaagtcatatatatatatatatattgtttagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacataaa 22798534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2708611 - 2708506
Alignment:
Q  145 agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccc 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||    
T  2708611 agttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtctagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataggcacaaaagcgggagggctccggccc 2708512  T
Q  245 tggaac 250  Q
    ||||||    
T  2708511 tggaac 2708506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19440001 - 19439855
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||  || |||||| ||||||||||||||||||| || ||   |||||    
T  19440001 tgttgttgactgagatgtatgcttt-atttaattaagtcatgcatgttgttgcatcgtggagttgtgagtcatatatacatatatgtatggttgagttgt 19439903  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19439902 atgtagatatacacaagtgg-gtcagttacataagcataaaagcgggag 19439855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23105511 - 23105342
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||    
T  23105511 attgattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaactaaatcatacatgttgttaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatata 23105413  T
Q  169 tgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23105412 tgcattgttcagttgtatgtagatatacataagtggagtccattgcataaacatataaagcgggagggctc 23105342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 8768033 - 8768202
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || || |||||| |||  | ||||||||| | |||||    
T  8768033 attgattataatgatttgttattgattgggatgtatgcttctatttaattaagttatacatgatgttgcattatggagtgatgagtcatatacatatata 8768132  T
Q  169 tgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8768133 tgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagctggagggct 8768202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 29416310 - 29416490
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgta 151  Q
    ||||||||| ||  || ||||| ||| ||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  29416310 ttttctggaattgttggattgactataatgatttgttgatgactgtgatgtatgattacatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgaa 29416409  T
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||  | |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  29416410 agtcatat-catatatatgcattgttgagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggag 29416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 230
Target Start/End: Original strand, 14995817 - 14995970
Alignment:
Q  77 tgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgt 176  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||  || ||| || || ||| |||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  14995817 tgatggtttgttgttgattgtgatgtatgtctatatttaatgaaatcatacataatgttgagttgtggagtcgtaagtcacatacatatatgtgcattgt 14995916  T
Q  177 caggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14995917 tgagttgtatgtagatatacacaagcggagtcagttgcataatcataaaagcgg 14995970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 18315786 - 18316005
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||  || ||| |||||| || | ||||| |||||  |||||||| || ||| |||    
T  18315786 ttgatgtatgagcatgattaagatcaattgtgtattttgctggaatttttggattaattatgttgatttgttgatgactatgatgtatgtttatatctaa 18315885  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| | |||||    | |||||||||||| |  |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  18315886 ttaaatcatacatgttgttaaattagtgggatgtaagtcatatttt-atatatgcattgtggagttgtatgtggatatacacaagtggagtccattgcat 18315984  T
Q  217 aagcataaaagcgggagggct 237  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  18315985 aaacataaaaacgggagggct 18316005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 8760286 - 8760455
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || || |||||| |||  | ||||||||| | |||||    
T  8760286 attgattataatgatttgttattgattgggatgtatgcttctatttaattaagttatacatgatgttgcattatggagtgatgagtcatatacatatata 8760385  T
Q  169 tgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||  ||   |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8760386 tgcatttggttgagttgtatgtgaatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagctggagggct 8760455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 249
Target Start/End: Original strand, 14132899 - 14133083
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||| ||||| | ||||| | |||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||| || |||||  || |||| | ||||||||| | |||||    
T  14132899 attgaatatgaggatctgtagatgactgtgatgtacgtttatatttaaataaatcatacatgctgttgaatagtggagttatgagtcatatacatatata 14132998  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa--agcgggagggctctgaccctggaa 249  Q
    ||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  14132999 tgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcataaaacagcgggagggctcttgccctggaa 14133083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18786297 - 18786202
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  18786297 atatatatatatatgcattgataagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 18786202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 21566117 - 21566212
Alignment:
Q  138 attatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  21566117 attatggagttgtaagtcatatatacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggag 21566212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 19472294 - 19472365
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  19472294 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagtgggagggctcttgccctggaac 19472365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19726895 - 19726758
Alignment:
Q  97 ggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || || |   || ||| || ||||||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  19726895 ggatgtatgcttttatttaattaagttatacatgaatgttgtaaattggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttaggttgtatgtagatat 19726796  T
Q  195 acacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19726795 acacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 19726758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18788592 - 18788511
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  18788592 agtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggag 18788511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18799572 - 18799491
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  18799572 agtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggag 18799491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4476572 - 4476526
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4476572 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 4476526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 9099973 - 9100019
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9099973 gttgtatgtagatatacactagtggagtcagttgcataagcataaaa 9100019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 20008849 - 20008895
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20008849 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 20008895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 21365437 - 21365483
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21365437 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 21365483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 23969419 - 23969465
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969419 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 23969465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29097018 - 29096972
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29097018 gttgtatgtagatatacactagtggagtcagttgcataagcataaaa 29096972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31251576 - 31251530
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31251576 gttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcataaaa 31251530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12942003 - 12941951
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12942003 gttgtatgtagatatacacaggtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 12941951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22907257 - 22907118
Alignment:
Q  94 ctgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtaga 191  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  || || ||| || ||| || ||||||||| | |||||||||| | |  |||||||||||||    
T  22907257 ctggaatgtatgcttc-atttaattaagtcatacatgaatgttgtattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtaga 22907159  T
Q  192 tatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  22907158 tatacacaagtgg-gtcagctgcataagcataacagtgggag 22907118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15457684 - 15457632
Alignment:
Q  166 atatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataa 218  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15457684 atatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtcgcataa 15457632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15464279 - 15464227
Alignment:
Q  166 atatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataa 218  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15464279 atatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtcgcataa 15464227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1592992 - 1592911
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||    
T  1592992 agtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtaggtatacacaagtgg-gtcagttgcaaaagcataacagtgggag 1592911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 19300640 - 19300689
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19300640 gttgtatgtagatatacataagtgg-gtcaattgcataagcataaaagcgg 19300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 21724704 - 21724785
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||    
T  21724704 agtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtaggtatacacaagtgg-gtcagttgcaaaagcataacagtgggag 21724785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Original strand, 17027159 - 17027204
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  17027159 gttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataagcataaa 17027204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4476652 - 4476616
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4476652 gttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcat 4476616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 221876 - 221818
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  221876 gttgtatgtagatatacacaagtggagtccatttcataa-catataaagcgggagggctc 221818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 233
Target Start/End: Original strand, 937653 - 937707
Alignment:
Q  178 aggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  937653 aggttgtatgtagatatacacgagtgg-gtcaattgcataagcatagaagtgggag 937707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21469929 - 21469886
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21469929 gttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataagcata 21469886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21476430 - 21476387
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21476430 gttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataagcata 21476387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2708733 - 2708675
Alignment:
Q  23 tttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatg 81  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | || |||| ||||||||    
T  2708733 tttaagcatgattatgataaattgtgcatttttctggaatgattggattgtttatgatg 2708675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 10470705 - 10470762
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  10470705 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaa 10470762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 28290152 - 28290233
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcagg-ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  28290152 agtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcatgagcataacagtgggag 28290233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Original strand, 12447170 - 12447207
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12447170 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 12447207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25749921 - 25749876
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  25749921 gttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 25749876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 23021323 - 23021390
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23021323 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaag-ggggtccattgcatatgcataaacagcgggagg 23021390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 19666534 - 19666772
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19666534 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattatgatgatctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 19666633  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19666634 taattaaatcatacatgttgatgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 19666733  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19666734 tgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 19666772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21664537 - 21664299
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21664537 atattgatgtttgggcatgattatgattaattgtgcacttttccggaattactgaattgattatgatgatttgttgttgactgggatgtatgcttttatt 21664438  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21664437 taattaaatcatacatgttgatgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 21664338  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21664337 tgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 21664299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 11140809 - 11141043
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgctttt-attta 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11140809 ttgatgtatgagcatgattatgattagttgtgcatttt-ctggaattattgaattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgctttttattta 11140907  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  11140908 attaaatcatacatgttgttgaattatggagttgaaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtagagttagttaca 11141007  T
Q  216 taagcat-aaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11141008 taagcataaaaagcgggagggctctggccctggaac 11141043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21732847 - 21732613
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||  |||||| ||| || || |||| |||||||| ||||| | | || ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21732847 atattgatggctaagcaagataattataaattgtgcatttt-ctggaatgattggattgattataatgatatgttgttgactaggatgtatgattttatt 21732749  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21732748 taattgagtcatacttgttgatgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 21732649  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21732648 cataagcat-aaagcgggagggctctggccctagaac 21732613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 21410501 - 21410716
Alignment:
Q  35 tatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttga 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||     
T  21410501 tatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgattatgatgatgtgttgatgactgtgaagtatgtttacatt-aattaaatcatacatgttgt 21410599  T
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggag 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21410600 tgaattacggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggag 21410699  T
Q  234 ggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||  |||||||||    
T  21410700 ggctcttgccctggaac 21410716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 15316311 - 15316546
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15316311 ttgatgtttaagcatgtttatgattaattgtgcatttttctgaaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 15316410  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15316411 attaaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 15316509  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  15316510 ataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 15316546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 16883346 - 16883581
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | | || ||||||||| |||  |||||| ||  || ||||||||  ||   |    
T  16883346 atattgatgtctaagcatgattattataaattgtgcatttttctggaatgattggattgattataatgacctgttgatgtatgtgatgtatg--ttacat 16883443  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaatta-tgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883444 taattaaatcatacatggtgttaaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 16883543  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16883544 gcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 16883581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20849395 - 20849164
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| |||   || ||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| || |||||||    
T  20849395 ttgatgtatgagtatgattatgattaattgtgcatttttctgaattgt-tggattgattataatgatctgtggatgactgtgatgtatg-ttatatttaa 20849298  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20849297 ataaatcatacatgttgtttaat-atggagttgtgagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 20849199  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  20849198 aagcatataaagcaggagggctcttgccctggaac 20849164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23631325 - 23631115
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||   || ||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23631325 ttgatgtatgagcttgattatgattaattgtgcatttttctgaattgt-tggattgattatgatgatttattgttgactgtgatgtatgcttttatttaa 23631227  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| | | || || ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23631226 ttaaatcatacatgttgttaagttgtggagttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcat 23631128  T
Q  217 aagcataaaagcg 229  Q
    || ||||||||||    
T  23631127 aaacataaaagcg 23631115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21698415 - 21698245
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||    
T  21698415 attgattatgatgatttgttgttgactgtgatgtatgcttatatttaattaaatcatacatgttgtttaattgtggggttgtaagtcatat-tatatata 21698317  T
Q  169 tgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21698316 tgcattgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcgggagggctc 21698245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 24108828 - 24109050
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcattttt--ctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| || |||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  24108828 ttgatttttaagcatgatgatgattaattgtgcatttttttctggaattactggatttataatgatgatttgttgttggttgg-atgtatgcttttattg 24108926  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24108927 aattaagtcatacatgatgttgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagtc 24109025  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24109026 gcatatgcataaaagcgggagggct 24109050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19853350 - 19853170
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||| ||  || || |||||||||||||||||    
T  19853350 attgattatgatgacctgttgttgaccgtgatgtatgctt--atttaattaaatcatacatgttcttggattgtgg-gtcgtgagtcatatatacatata 19853254  T
Q  169 tgcattgtcag--gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| |  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19853253 tgcattttttgaagttgtatgtagatatacacaattggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 19853170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19859485 - 19859305
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||| ||  || || |||||||||||||||||    
T  19859485 attgattatgatgacctgttgttgacagtaatgtatgctt--atttaattaaatcatacatgttcttggattgtgg-gtcgtgagtcatatatacatata 19859389  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19859388 tgcatttattgaagttgtatgtagatatacacaattggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 19859305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11157261 - 11157146
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11157261 tgaattatggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcatgaaagcgggagg 11157162  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||||  |||||||||    
T  11157161 gctctagccctggaac 11157146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 23195284 - 23195514
Alignment:
Q  29 catgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcataca 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||   |||||||||  || || ||| ||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23195284 catgattataattaattgtgttattttctggagctattggattaattatgatgattggttgatgactgtgatgtatgcttatatctaattaaatcataca 23195383  T
Q  129 tgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatat------gcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataag 219  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||      |||||   | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23195384 tgttgttgaattattgtggttgtaagtcatatatatatatatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacatgtggagtcagttgcataag 23195483  T
Q  220 cataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23195484 cataaaagcgggagggctcttgccctggaac 23195514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 29554251 - 29554486
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||  || |||||| |||  | | || ||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  29554251 atattgatgtctaagcatgactattataaatggtgtatttttttgggatgattggattgattatgatt---tgttattgactgggatgtatgcatctatt 29554347  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||| ||||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | | ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29554348 taattaagtcatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 29554447  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  29554448 tgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 29554486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24079927 - 24079704
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttg-ttgactgggatgtatgcttttat 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  24079927 atattgatgtttaagcatgatcatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattctgatgat-tgttgtttgact-gaaagtatgcttttat 24079830  T
Q  113 ttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcag 210  Q
    | | |||| | |||||||  | || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24079829 tgagttaagttatacatg-ggttgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtaggtatacacaagt-gagtcag 24079732  T
Q  211 ttgcataagcat-aaaagcgggagggct 237  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24079731 tcgcatatgcataaaaagcgggagggct 24079704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 20086289 - 20086508
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| |||| || |||||||| || ||  || ||| ||||||||| | ||||| |||| | |||||||| || ||| |||    
T  20086289 ttgatgtatgagcatgattaagatcaattgtgtatttttctagaattgttgcattaattatgatgatttgttgatgacagtgatgtatgtttatatctaa 20086388  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| | |||||    | |||||||||||| |  ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20086389 ttaaatcatacatgttgttaaattagtgggatgtaagtcatatttt-atatatgcagtgtggagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcat 20086487  T
Q  217 aagcataaaagcgggagggct 237  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  20086488 aaacataaaagcgggagggct 20086508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32650337 - 32650254
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32650337 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagtgggag 32650254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 236
Target Start/End: Original strand, 19778399 - 19778487
Alignment:
Q  148 tgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19778399 tgtaagtcatatgaacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggc 19778487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Original strand, 30491280 - 30491453
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgta 151  Q
    ||||||||| ||  || ||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | || | ||  ||||||    
T  30491280 ttttctggaattgttggattgattatgatgatttgttgatgattgtgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgtttaactgtggggttgta 30491379  T
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||| ||||||| ||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  30491380 agttatatatatatatatatattgtttagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacataaa 30491453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 250
Target Start/End: Original strand, 20941762 - 20941897
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||  | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20941762 attaaatcatacatgttgtttgaattgcggagttgtaagtcatatgaaaacatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgc 20941860  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  20941861 ataagcatataaagcgggaaggctcttgccctggaac 20941897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41312443 - 41312309
Alignment:
Q  91 tgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtag 190  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||   |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |     
T  41312443 tgactgtgatgtatgtttatatttaattaaatcatacatgttgtaaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttaagttgtatgaat 41312345  T
Q  191 atatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  41312344 atatacacaagtggagtccattgcataaacataaaa 41312309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16371744 - 16371698
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371744 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 16371698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Original strand, 20108326 - 20108458
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||  || ||| ||||||||| | || || |||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||    
T  20108326 agcatgattgtgattaattgtgtatttttctggaattgttggattaattatgatgatgtgctgatgactgtgatatatgtttatatctaattaaatcata 20108425  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatat 159  Q
    ||||||| ||| || ||  ||||||||||||||    
T  20108426 catgttgttgatttgtggggttgtaagtcatat 20108458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Original strand, 31927189 - 31927273
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  31927189 tgttgatgattgtgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatatatatatat 31927273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Original strand, 954950 - 955084
Alignment:
Q  94 ctgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtaga 191  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  || || ||| || ||| || ||||||||| | |||||||||| | |  |||||||||||||    
T  954950 ctggaatgtatgctttcatttaattaagtcatacatgaatgttgtattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcatgggttgggttgtatgtaga 955049  T
Q  192 tatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  955050 tatacacaagtgg-gtcagtagcatgagcataaaag 955084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 31927365 - 31927447
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31927365 atatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtcgagtccattgcataa-catataaagcgggagggctc 31927447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19961341 - 19961292
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19961341 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgg 19961292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 20852035 - 20852081
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20852035 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 20852081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 20858661 - 20858707
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20858661 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 20858707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21705429 - 21705383
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705429 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 21705383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 23066672 - 23066725
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23066672 ggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 23066725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Original strand, 19664062 - 19664154
Alignment:
Q  141 atgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||    
T  19664062 atgaagttgtatgtcatatatatacatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcattaaagtgggag 19664154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 20824266 - 20824387
Alignment:
Q  117 ttaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |  ||||| ||||||||  | | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  20824266 ttaaatcatacatgttgtttgaattgcggtgttgtgagtcatatgaaaacatatgcaatgttaagttgtatgtagatatacacaagtag-gttagttgca 20824364  T
Q  216 taagcataa-aagcgggagggct 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  20824365 taagcataataagcgggagggct 20824387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20242738 - 20242686
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20242738 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcatttgcataagcataaaagtgggag 20242686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21709961 - 21709924
Alignment:
Q  189 agatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21709961 agatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 21709924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13226917 - 13226881
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13226917 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 13226881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16371825 - 16371789
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371825 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 16371789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Original strand, 20838075 - 20838194
Alignment:
Q  117 ttaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |  ||||| ||||||||  | | ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  20838075 ttaaatcatacatgttgtttgaattgcggtgttgtgagtcatatgaaaaaatatgcattgttaatttgtatgtggatatacacaagtgg-gttagttgca 20838173  T
Q  216 taagcataa-aagcgggaggg 235  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  20838174 taagcataataagcgggaggg 20838194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 21734429 - 21734500
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  21734429 tatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaggtggagtca-ttgcataatcatataaagtgggagggctc 21734500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5380963 - 5380882
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  5380963 ttttctggagctattgaattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatgcatgttg 5380882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Original strand, 22030705 - 22030750
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22030705 gttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacataaa 22030750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Original strand, 3706736 - 3706787
Alignment:
Q  181 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  3706736 ttgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 3706787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 21745621 - 21745691
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  21745621 tatgcaatgtcgagttgtatgtagatatacacaggtggagtca-ttgcataatcatataaatgggagggctc 21745691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Original strand, 21986720 - 21986826
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  || ||| ||||||||||  | ||| || |||  ||||||  || ||||||| ||||| |||    
T  21986720 agcatgattatgattaattgtgtatttttctggaattgttggattaattatgatggattattgctggctgtaatgtatatttatatttaaataaattata 21986819  T
Q  127 catgttg 133  Q
    |||||||    
T  21986820 catgttg 21986826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 21986921 - 21986963
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21986921 tatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaggtggagtca 21986963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Original strand, 20108501 - 20108546
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  20108501 gttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcattaacataaa 20108546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24475537 - 24475476
Alignment:
Q  164 atatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  24475537 atatatgcattgttgagttgtatgttgatatacacaagtggagttcattgcataatcataaa 24475476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29535106 - 29535065
Alignment:
Q  209 agttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29535106 agttgcataatcataaaagcgggagggccctggccctggaac 29535065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32650367 - 32650338
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650367 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 32650338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49328212 - 49328175
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49328212 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 49328175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36615115 - 36615048
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  36615115 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaag-ggggtccattgcatatgcataaacagcgggagg 36615048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7013 - 6777
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7013 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattatgatgatctgttgttgattgggatgtatgcttt-att 6915  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaa-ttatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6914 taattaaatcatacatgttgatgaaattatgaggttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 6815  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6814 gcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 6777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45272 - 45044
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45272 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattatgatgatctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 45173  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45172 taattaaatcatacatgttgatgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 45073  T
Q  212 tgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45072 tgcataagcatataaagcgggagggctct 45044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9601 - 9363
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  || |||||||||  || | | |||||||||| |||||||||||||||     
T  9601 atattgatgtctaagcatgattattattaattgtgcatatttctggaattgttggattgattatactgatatcttgttgactgtgatgtatgcttttatg 9502  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| | ||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9501 taattaaatcatacatgttgttgaatagtg-ggttttgagtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggattcagt 9403  T
Q  212 tgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  9402 tgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 9363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Original strand, 43914 - 44021
Alignment:
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcg 229  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43914 gttgttgaattatgaagtcgtatgtcatatatacatatatgcattgtcgagtggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcattaaagcg 44013  T
Q  230 ggagggct 237  Q
    ||||||||    
T  44014 ggagggct 44021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Original strand, 36759 - 36836
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36759 taagtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaag 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 234 - 458
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcattttt-ctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  234 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcattttttctggaattactgaattgattatgatgatctgttgttgactgggatgtatgcttttat 333  T
Q  113 ttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  334 ttaattaaatcatacatgttgatgaattaggaggttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggggtcagtt 433  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  434 gcataagcat-aaagcgggagggctc 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 6393 - 6617
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttc-tggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6393 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcattttttatggaattaatgaattgattatgatgatctgttgttgactgggatgtatgcttttat 6492  T
Q  113 ttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6493 ttaattaaatcatacatgttgatgaattaggaggttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggggtcagtt 6592  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  6593 gcataagcat-aaagcgggagggctc 6617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 9914 - 10133
Alignment:
Q  18 tgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaat 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9914 tgatgtttaagcatgattgtgattaattgtgcacttttctggaattactgaattgattataatgat-tgttgttgattgggatgtatgcttttatttaat 10012  T
Q  118 taaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    ||||||||||| | || || |||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10013 taaatcatacacgatgttgcattacggagttgtgagtcatatacatatatatgcattgggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgca 10111  T
Q  216 taagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10112 taagcataaaagcgggagggct 10133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 17210 - 17442
Alignment:
Q  18 tgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaat 117  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17210 tgatgtttaaacatgattgtgattaattgtgcacttttctggaattactgaattgattatgatgat-tgttgttgattgggatgtatgcttttatttaat 17308  T
Q  118 taaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    ||||||||||| | || || |||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||  ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17309 taaatcatacacgatgttgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatgtattgggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttaca 17407  T
Q  216 taagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  17408 taagcataaaagcgggagggcttcggccctggaac 17442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 72435 - 72386
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  72435 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtttcataagcataaaagcgg 72386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 21690239 - 21690472
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21690239 ttgatgtatgagcatgattatgattagttgtgcatttt-ctggaattattagattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatttaa 21690337  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21690338 ttaaatcatacatgttgttgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 21690437  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  21690438 aagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 21690472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 21683496 - 21683719
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  21683496 ttgatgtctaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgattataatgacctgttgttgactgtgatgtatgtttatatttaa 21683595  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21683596 ataaatcatacatgttgttgagttatggagttgtaagtcatatacatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 21683695  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||    
T  21683696 aagcatataaagcggcagggctct 21683719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 21687845 - 21688068
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  21687845 ttgatgtctaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgattataatgacctgttgttgactgtgatgtatgtttatatttaa 21687944  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21687945 ataaatcatacatgttgttgagttatggagttgtaagtcatatacatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 21688044  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||    
T  21688045 aagcatataaagcggcagggctct 21688068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 250
Target Start/End: Original strand, 20783719 - 20783912
Alignment:
Q  62 ttactgaattgattatgatggtctgttgttgactggg--atgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatat 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  20783719 ttactgaattgattatgatgatctgttgttgactgtgtgatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgttgaattatggagttgtaagtcctat 20783818  T
Q  160 atacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||    
T  20783819 atacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaaggggagtcagttgcataagcatataaagcgggagagctcttgccctggaac 20783912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 20839729 - 20839964
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||   ||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  20839729 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcattttgctggaattactgaattgattgtaatgacatgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 20839826  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20839827 taattaaatcatacatggagtttaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 20839926  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20839927 gtataagtataaaagcgggagggccctgaccatggaac 20839964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 21300002 - 21300184
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  21300002 attgattataatgatttgttgttgactgagatgtatgcttt-atttaattaagtcatacatgttgttgcattatggagttgtaagacatataaacatata 21300100  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21300101 tgcatttgttgaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccttggaac 21300184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 250
Target Start/End: Original strand, 36445576 - 36445791
Alignment:
Q  34 ttatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |   |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36445576 ttatgattaattgtgtatttttctggactgt-tgaattgattatgatgatttgtagttgactgtgatgtatgctt--atttaattaaatcatacatgttg 36445672  T
Q  134 atgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgg 230  Q
     |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36445673 ttgaattgtgg-gttgtgagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgg 36445771  T
Q  231 gagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  36445772 gagggctcttgccctggaac 36445791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10607252 - 10607069
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||| || ||||||||| | | |||    
T  10607252 attgattataatgatttgttgttgactgggatgtatgcttctatttaattaagtcatacatgatgtggcattatggagtggtgagtcatataaatacata 10607153  T
Q  169 tgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10607152 tgcatttgtcggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 10607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23654211 - 23653993
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || | |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23654211 ttgatgtttaagcatggttatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattatactgatttgttgttgactatgatgtatgcttttattta 23654112  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23654111 attaaatcatacatggtgttgaattgtgg-gttgtgagtcatatacatatatatgcattgttaagttgtatcaagatatacacaagtggagtcaattgca 23654013  T
Q  216 taagcata-aaagcgggagg 234  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  23654012 taagcatataaagcgggagg 23653993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19859866 - 19859646
Alignment:
Q  29 catgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgatta-tgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatac 127  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| ||| ||| |||||  | |||||| ||  ||| |  ||||||||||    
T  19859866 catgattatgattaactgtgcatttttctggattgt-tggattgattaatgatgatctattgatgactatggtgtatgtttacattaa--taaatcatac 19859770  T
Q  128 atgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaa 226  Q
     ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19859769 ctgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgccgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaa 19859670  T
Q  227 gcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||  |||||||||    
T  19859669 gcgggagggctcttgccctggaac 19859646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39363855 - 39363619
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||   ||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39363855 ttgatgtctgagcatggttataattaattatgcatttttatgagattattgg-ttgattatgatgatttgttgttgactgggatgtatg-ttatatttaa 39363758  T
Q  117 ttaaa-tcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatata--tacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39363757 ttaaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatacatatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattg 39363658  T
Q  214 cataagc--ataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  39363657 cataagcatataaaagcgtgagggcttttgccctggaac 39363619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 41009264 - 41009500
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  | | ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41009264 tattggtgtttaagcatgattatgaataaattgtgcatttt-ctgggatgattgaattagttataatggtttgttgttgactgggatgtatgcttctatt 41009362  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||| | ||| || ||||||||  |   |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41009363 taattaagttatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatatgaatgcatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagtt 41009462  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  41009463 gcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaac 41009500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21669156 - 21669010
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||   |||||    
T  21669156 tgttgttgactgagatgtatg-ttttatttaattaagtcatatatgttgttgcattgtggagttgtgagtcatatatacatatatgtatggttgagttgt 21669058  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21669057 atgtatatatacacaagt-gagtcagttacataagcataaaagcgggag 21669010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16259765 - 16259652
Alignment:
Q  139 ttatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcat--aaaagcgggagggc 236  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  16259765 ttatggagttgaaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtagagttagttacataagcataaaaaagcgggagggc 16259666  T
Q  237 tctgaccctggaac 250  Q
    |||| |||||||||    
T  16259665 tctggccctggaac 16259652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22744063 - 22743867
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  || ||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22744063 agcatgattatgattaattgtgtatttt-ctggaattgttggattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcata 22743965  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||  | |||| |   |||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22743964 catgtttttaaattgttgggttgtaagtcatat-tctatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtctgttgcataaacataaa 22743867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 8728951 - 8729027
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8728951 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 8729027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21282358 - 21282212
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||   || ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| || ||   |||||    
T  21282358 tgttgttgactgagatgtatgcttt-atttaattaagtcatacatgtcattgcattgtagagttgtaagtcatatgtacatatatgtatggttgagttgt 21282260  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21282259 atgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagcgggag 21282212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Original strand, 20005512 - 20005638
Alignment:
Q  98 gatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatataca 197  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20005512 gatgtatgtttatatttaattaaatcatacatgttgttaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttaagttgtatgtagatataca 20005610  T
Q  198 caagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||    
T  20005611 caagtggagtccattgcataaacataaa 20005638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 31412315 - 31412535
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | | |||||||||||||     
T  31412315 tattgatgtttaagcatgatcatgattaatcgtgcatttttctggaattactgaattgattctgatgat-tgttgttgact-gaaagtatgcttttattg 31412412  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    | | || | |||||||  | || |||||| |||| | | |||| || | |||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  31412413 agtcaagttatacatg-ggttgcattatggagttatgattcatgtacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtggatatacacaagt-gagtcagtc 31412510  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  31412511 gcatatgcataaaagcgagagggct 31412535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 31418497 - 31418717
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | | |||||||||||||     
T  31418497 tattgatgtttaagcatgatcatgattaatcgtgcatttttctggaattactgaattgattctgatgat-tgttgttgact-gaaagtatgcttttattg 31418594  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    | | || | |||||||  | || |||||| |||| | | |||| || | |||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  31418595 agtcaagttatacatg-ggttgcattatggagttatgattcatgtacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtggatatacacaagt-gagtcagtc 31418692  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  31418693 gcatatgcataaaagcgagagggct 31418717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Original strand, 21322199 - 21322286
Alignment:
Q  148 tgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggaggg 235  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21322199 tgtaagtcatatgaacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggaggg 21322286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 250
Target Start/End: Original strand, 23652886 - 23653025
Alignment:
Q  113 ttaattaaatcatacatgttgatgaat-tatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  23652886 ttaattaaatcatacatgttgtttaaaatgcggagttgtaagtcatatataaatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacagaagtggagtccat 23652985  T
Q  212 tgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23652986 tgcataagaatataaagcgggagggctcttgccctggaac 23653025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 20973828 - 20974053
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| || |||  || ||||||||||  ||| || ||| ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  20973828 tattggtgtctaagcatgactattataaatggtgtatttttctgggattattggattaattataatgatttgttgttggttgggatgtatgcttccattt 20973927  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    |||||| | ||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  20973928 aattaagttatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatataaacaagcgg-gtcagttg 20974026  T
Q  214 cataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20974027 cataagcatataaagcgggagggctct 20974053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 236
Target Start/End: Original strand, 21326787 - 21326875
Alignment:
Q  148 tgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21326787 tgtaagtcatatgaacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggatttagttgcataaacatgaaagcgggagggc 21326875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Original strand, 22063466 - 22063611
Alignment:
Q  88 tgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtat 186  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || ||| || ||| || ||||||||| | |||||||||| |   | |||||||    
T  22063466 tgttggctggaatgtatactttcatttaattaagtcatacatgttgttgcattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgagttgtat 22063565  T
Q  187 gtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22063566 gtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 22063611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 227
Target Start/End: Original strand, 22175924 - 22176077
Alignment:
Q  74 ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcat 173  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||||| || || ||| || ||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  22175924 ttatgatgatttgttgttggctggaatgtatgctttcatttaaataagttatacatgatgttgcattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcat 22176023  T
Q  174 t-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    | ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22176024 tggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaag 22176077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 21686052 - 21686147
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  21686052 atatatatatatatgcattgttaagttgtatgtaaatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 21686147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20006452 - 20006371
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggct 237  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20006452 atatatatatatatgcattgtaag-ttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcgggagggct 20006371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Original strand, 21685900 - 21686041
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||  || |||  |||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||    
T  21685900 agcataattatgattaattatgtatttttctgggattgttggattacttatgatgatttgttgatgactgtgatgtatg-ttgcctttaattaaatcata 21685998  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  21685999 catgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatatatatatat 21686041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Original strand, 22025463 - 22025608
Alignment:
Q  88 tgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtat 186  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| || || ||| || ||| || ||||||||| | |||||||||| |   | |||||||    
T  22025463 tgttggctggaatgtatactttcatttaattaagtcatacatgatgttgcattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgagttgtat 22025562  T
Q  187 gtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22025563 gtagatatagacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 22025608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22177878 - 22177738
Alignment:
Q  94 ctgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtaga 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || || | | || ||| || ||||||||| | |||||||||| | |  |||||||||||||    
T  22177878 ctggaatgtatgcttttatttaattaagtcatacatgaatgttgtaatttggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggtttggttgtatgtaga 22177779  T
Q  192 tatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22177778 tatacacaagtgg-gtcagttgcataagcaaaaaagtgggag 22177738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 250
Target Start/End: Original strand, 19988095 - 19988230
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||| |||||  | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19988095 attaaatcatacatgttgtttgaattgcggagttgtaagccatatgaaaacatatgcattgttaagttgtatgtagatatacactagtgg-gtcagttgc 19988193  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    | |||||||  |||||||||||||||  |||||||||    
T  19988194 aaaagcatatgaagcgggagggctctttccctggaac 19988230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18613342 - 18613282
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatata 195  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18613342 tgaattatgaagtcgtaaatcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatata 18613282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 14594699 - 14594781
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  14594699 atatatatatatatgcattgataagttttatgtagatatacaaaagtggagtccattgcatagacataaaagcgggagggctc 14594781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18609987 - 18609941
Alignment:
Q  191 atatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18609987 atatacaccagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 18609941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 24321572 - 24321618
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24321572 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 24321618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Original strand, 14057540 - 14057632
Alignment:
Q  141 atgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  14057540 atgaagttgtatgtcatatatatacatatgcattagttgagttgtatgtaaatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggag 14057632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25111071 - 25110994
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  25111071 atatatatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggag 25110994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 226
Target Start/End: Original strand, 8596070 - 8596107
Alignment:
Q  189 agatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8596070 agatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 8596107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 25624680 - 25624751
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  25624680 tatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaggtggagtca-ttgcataatcatataaagtgggagggctc 25624751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33089036 - 33088965
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  33089036 tatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaggtggagtca-ttgcataatcatataaagtgggagggctc 33088965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 20012138 - 20012197
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  20012138 tatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaa 20012197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33089237 - 33089124
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  |  || ||| ||||||||||  | ||| || ||| |||||||  || ||||||| ||||| |||    
T  33089237 agcatgattatgattaattgtgtatttttctggaaatgttggattaattatgatggattattgatggctgtgatgtatatttatatttaaataaattata 33089138  T
Q  127 catgttgatgaatt 140  Q
    ||||||| ||||||    
T  33089137 catgttgttgaatt 33089124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1264342 - 1264221
Alignment:
Q  75 tatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatat-atacatatatgcat 173  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| || |||  |  |||||||||||||| | | | ||||||||    
T  1264342 tatgatgatctgtcgttgactgtgatgtatg--tttaaataattaaatcatacatgttgttggattgcggtgttgtaagtcatatgaaaaacatatgcat 1264245  T
Q  174 tgtcaggttgtatgtagatataca 197  Q
    |||   |||||||||||| |||||    
T  1264244 tgtttagttgtatgtagagataca 1264221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 29299028 - 29299095
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  29299028 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 29299095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 29305574 - 29305641
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  29305574 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 29305641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22050406 - 22050353
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||    
T  22050406 ggttgtatgtagatatactcaagtgg-gtcatttgcataagcataacagtgggag 22050353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22055924 - 22055871
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||    
T  22055924 ggttgtatgtagatatactcaagtgg-gtcatttgcataagcataacagtgggag 22055871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Original strand, 8728921 - 8728950
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8728921 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 8728950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20648443 - 20648210
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20648443 ttgatgtatgagcatgattatgattaatcgtgcatttt-ctggaattgttggattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgctttcatttaa 20648345  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20648344 ttaaatcatacatgttgttgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 20648245  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  20648244 aagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 20648210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22860663 - 22860440
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860663 agcatgattatgattagttgtgcatttt-ctggaattattagattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatttaattaaatcata 22860565  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aa 225  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22860564 catgttgttgcattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgtatgtaaatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataa 22860465  T
Q  226 agcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  22860464 agcgggagggctcttgccctggaac 22860440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 22796484 - 22796667
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22796484 attgattataatgatctgttgttgacttagatgtatgcttttatttaattaagtcatacatgttgttgcattatggagttgtaagtcatatatacatata 22796583  T
Q  169 tgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22796584 tgcatttgttgaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 22796667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23753162 - 23752927
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||| | | || ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23753162 atattaatgtctaagcatgattattataaatggtgcatttttctggaatgattggattaattataatgatatgttgttgactgggatgtatgattt-att 23753064  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| ||| |||| |||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23753063 taattgaattatacttgttgaggaatcatggagtcataagtcatatatacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttg 23752964  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23752963 cataagcacaaaagtgggagggctctggccctggaac 23752927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25267555 - 25267340
Alignment:
Q  35 tatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttga 134  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||  |  ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||     
T  25267555 tatgattaattgtgaatttttctggaattgttagattgattatgatgatctgttgatgattgtgatgtatgtttacatt-aattaaatcatacaagttgt 25267457  T
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25267456 tgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggag 25267357  T
Q  234 ggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||  |||||||||    
T  25267356 ggctcttgccctggaac 25267340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24652700 - 24652466
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  24652700 atattgatgtt-aagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattgtaatgacctgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 24652604  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24652603 taattaaatcatacatggagtttaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtctgtt 24652504  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24652503 gtataagtataaaagcgggagggctctggccctggaac 24652466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 28971081 - 28971304
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28971081 atattgatgtttaagcatgattatgagtaattgtgcatttttctggaattactaaattgattatgatgat-tgttgttgacgaggatgtatgcttttatt 28971179  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
     |||||| ||||||||| || || |||| | |||||| |||||| || | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28971180 gaattaagtcatacatgatgttgcattacggagttgtgagtcatgtacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagt 28971278  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  28971279 cgcatatgcataaaagcgggagggct 28971304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 8889775 - 8889996
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||   || ||  || ||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| || |||||||    
T  8889775 ttgatgtatgagcatgattatgattaattgtgcattttttctgaattgttggattgattataatgatctgtggatgactgtgatgtatg-ttatatttaa 8889873  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8889874 ataaatcatacatgttgtt-acttatggagttgtgagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 8889972  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  8889973 aagcatataaagcgggagggctct 8889996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 19649347 - 19649583
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19649347 atattgatgtttatgcatgattgtgactaattgtgcacttttctggaaatactgaattgattaagatgat-tgttgttgactgggatgtatgtttttatt 19649445  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| | |||||| |||||||||   ||| |||||||  ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19649446 taattaaatcatacatgatgttgcattacggagttgtgagtcatatacctataaatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagt 19649544  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19649545 tgcataagtataaaagcgggagggctttggccctggaac 19649583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23291297 - 23291062
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||  || ||| || ||| |||||| |  ||   |    
T  23291297 atattgatgtttaagcatgattatgataaattgtgcatttttctggaatgattggattgattatgatgacctattgatgcctgtgatgtagg--ttacat 23291200  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23291199 taattaaatcatacatggtgtttagttagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagttagtt 23291100  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||    
T  23291099 gcataagcacaaaagtgggagggctccggccctggaac 23291062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24659144 - 24658910
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||  || |||  | ||| ||||||||  ||   |    
T  24659144 atattgatgtt-aagcatgattatgattaattgtgcagttttctggaattactgaattgattgtaatgacctattgaagtctgtgatgtatg--ttacat 24659048  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24659047 taattaaatcatacatggagtttaattagcgaagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtaagtt 24658948  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24658947 gtataagtataaaagcgggagggctttggccctggaac 24658910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 239
Target Start/End: Original strand, 25107327 - 25107498
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25107327 attgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgcttt-atttaattaaatcatacatgttgttgaattgtgg-gttgtgagtcatatatacatata 25107424  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25107425 tgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctct 25107498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19035851 - 19035618
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||  || ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||  ||| ||    
T  19035851 ttgatgtatgagcataattatgattaattgtgtacttttctggaattgttggattgattataatgatctgttgatgactgtgatgtatgtttacatt-aa 19035753  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  19035752 ttaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatatatatatatgcattgttaacttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcat 19035653  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  19035652 aagcatataaagcgggagggcccttgccctggaac 19035618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 19703285 - 19703523
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgatta-tgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttat 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  19703285 atattgatgtttaagcatggttatgattaattgtgcacttttctggaattactgaattgattattgatgat-tgttgttggctggaatgtatgctttcat 19703383  T
Q  113 ttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcag 210  Q
    |||||||| | ||||||| || || | |||| ||| || ||||||||| | |||||| ||||   |   ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19703384 ttaattaagttatacatgatgttgcactatggagtggtgagtcatatacatatatatacatttgattgagttgtatgtagatatacaccagtggagttag 19703483  T
Q  211 ttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  19703484 ttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaac 19703523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 250
Target Start/End: Original strand, 21073867 - 21074021
Alignment:
Q  98 gatgtatgcttttatttaattaaat--catacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatata 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21073867 gatgtatgctttcatttaattaaaaaccatacatgttgttgaattctgaagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgggttgtatgtagatata 21073966  T
Q  196 cacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  21073967 cacaagtggattcaattgcataaccataaaagcgggagggcttcggccctggaac 21074021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23062802 - 23062687
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23062802 tgaattatggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 23062703  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| |||||||||    
T  23062702 gctctggccctggaac 23062687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 21133061 - 21133278
Alignment:
Q  18 tgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| |||    
T  21133061 tgatgtttaagcatgattatgattaattatgcaattttttggaattactgaattgattctgatgat-tgttgttga-ttgaatgtatgcttttattgaat 21133158  T
Q  118 taaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    ||| | |||||||  | || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21133159 taagttatacatg-ggttgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagtcgca 21133256  T
Q  216 taagcataaaagcgggagggct 237  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21133257 tatgcataaaagcgggagggct 21133278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22810248 - 22810035
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | |     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22810248 tattgatgtttaagcatgattttgattaaattgtgcatttttctggaatga-----ttgattataatggt-tgttgttgactgggatgtatgcttctatt 22810155  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22810154 taattaagttatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagtt 22810056  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  22810055 gcataagcataaaagcaggag 22810035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21907507 - 21907385
Alignment:
Q  128 atgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21907507 atgttgttgaactatgaagtcgtatgtcatatatacatatatgcattgtcgggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 21907408  T
Q  228 cgggagggctctgaccctggaac 250  Q
     |||||||||  | |||||||||    
T  21907407 tgggagggcttcggccctggaac 21907385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23264233 - 23264118
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23264233 tgaattgtgaagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgggttgtatgtagatatacaccagtggagtctgttgcataagcataaaagcgggagg 23264134  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||  | |||||||||    
T  23264133 gcttcggccctggaac 23264118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 20914141 - 20914361
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||| ||||  ||  || ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  20914141 ttgatgtatgagcatgattatgattaatggtgtatttt-ctgggattgttggattgattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttttatttaa 20914239  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  20914240 ttaaatcatacatgttgttaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtgaagtccattgcat 20914338  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    || |||| |||| ||||||||||    
T  20914339 aaacatataaagtgggagggctc 20914361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20724405 - 20724182
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  | | ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20724405 tattggtgtttaagcatgattatgaataaattgtgcatttt-ctgggatgattgaattagttataatggtttgttgttgactgggatgtatgcttctatt 20724307  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||| | ||| || ||||||||  | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20724306 taattaagtaatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatatgaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagtt 20724207  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  20724206 gcataagcaaaaaagcgggagggct 20724182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24943751 - 24943513
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| || |||  || ||||||||||  | | || ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  24943751 atattgatgtgtcagcatgactattataaatggtgtatttttctgggatgattggattgattataatgatttgttgttgactaggatgtatgtttctatt 24943652  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag--gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||| ||||||||| || || |||| | ||| || ||||||||| | | ||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24943651 taattaagtcatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatataaatacatatgcattttttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 24943552  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  24943551 tgcatacgcacaaaagtgggagggctctggccctagaac 24943513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 23089960 - 23090055
Alignment:
Q  138 attatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  23089960 attatggagttgtgagtcatatatacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggag 23090055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 23102388 - 23102483
Alignment:
Q  138 attatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  23102388 attatggagttgtaagtcatatatacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcctaaaagtgggag 23102483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 19662794 - 19662840
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662794 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 19662840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 27208614 - 27208660
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27208614 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 27208660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 27210949 - 27210995
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27210949 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 27210995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24660672 - 24660629
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24660672 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 24660629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9729 - 9683
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9729 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 9683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2105811 - 2105730
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  2105811 agtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 2105730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 25181802 - 25181848
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25181802 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 25181848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29281148 - 29281102
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29281148 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 29281102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17634049 - 17633978
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  17634049 tatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtca-ttgcataatcatataaagtgggagggctc 17633978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9241537 - 9241491
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9241537 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaag 9241491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 38931527 - 38931598
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  38931527 gttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcatgagcatataaaacgggagggctcttgccctggaac 38931598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26884359 - 26884314
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26884359 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcag-tgcataagcataaaa 26884314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20261027 - 20260975
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20261027 gttgtatgtagatatacacaggtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 20260975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 6261437 - 6261473
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6261437 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 6261473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 19662713 - 19662749
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662713 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 19662749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 6261518 - 6261563
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6261518 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc-ggtgcataagcataaaa 6261563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17634252 - 17634146
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  || ||| ||||||||||  | ||||||  || |||||||  || ||||||| ||||| |||    
T  17634252 agcatgattatgattaattgtgtatttttctggaattgttggattaattatgatggattattgttggttgtgatgtatatttatatttaaataaattata 17634153  T
Q  127 catgttg 133  Q
    |||||||    
T  17634152 catgttg 17634146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Original strand, 21123753 - 21123889
Alignment:
Q  91 tgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacata--tatgcattgtcaggttgtatgt 188  Q
    |||||| |||||||| || ||| | ||| || ||||||||||| ||| || |   |||||||| ||||| || |||  ||||||||||   |||||||||    
T  21123753 tgactgtgatgtatgtttatatctgattgaaacatacatgttgttgatttgttgggttgtaagacatatttatatacatatgcattgttgagttgtatgt 21123852  T
Q  189 agatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  21123853 agatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 21123889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23878043 - 23877991
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  23878043 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggag 23877991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 24669680 - 24669753
Alignment:
Q  66 tgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaat 139  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  24669680 tgaattaattatgatgatttgttgatgattgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgttgttgaat 24669753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Original strand, 25365784 - 25365844
Alignment:
Q  73 attatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25365784 attatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgttg 25365844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45028689 - 45028622
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45028689 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 45028622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9241743 - 9241635
Alignment:
Q  31 tgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatg 130  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||| | | || ||  ||||||||||  | |||||||||| |||||||  || ||||||| ||||| |||||||    
T  9241743 tgattatgattaattatgta-ttttctggaatcattggatcaattatgatggattattgttgactgtgatgtatatttatatttaaataaattatacatg 9241645  T
Q  131 ttgatgaatt 140  Q
    ||| ||||||    
T  9241644 ttgctgaatt 9241635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Original strand, 24669760 - 24669805
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  24669760 gttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 24669805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Original strand, 25590159 - 25590196
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25590159 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 25590196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Original strand, 32911440 - 32911477
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32911440 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 32911477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 15643247 - 15643314
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  15643247 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacgagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 15643314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 3108 - 3338
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3108 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattatgatgatctgttgttgaatgggatgtatgcttttatt 3207  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||         |||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3208 taattaaatcatacatgttgatgaattatcgagttgt--------gatacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagcggagtcagt 3299  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3300 tgcataagcataaaagcaggagggctctggccctggaac 3338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 15989 - 16149
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15989 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtacatttttatggaattactgaattgattatgatgatctgttgttgactgggatgtatgattttatt 16088  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16089 taattaaatcatacatgttgatgaattatggagttgtgagtcatatatacatatatgcatt 16149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17496490 - 17496258
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17496490 ttgatgtttaagcatgattacgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 17496391  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    |||||||||||||||||| | | ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17496390 attaaatcatacatgttgttaagtt--ggagttgaaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 17496293  T
Q  216 taagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17496292 taagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 17496258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 12362324 - 12362556
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | | || |||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12362324 atattgatgtctaagcatgattattataaattgtgcatttttctggaatgattggattgtttataatgatatgttgtcgactgggatgtatgattttatt 12362423  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12362424 taattgagtcatacttgttgatgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtgaagtggtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 12362523  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctg 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12362524 cataagcataaaagcggaagggctctggccctg 12362556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 12355775 - 12356007
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | | || |||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12355775 atattgatgtctaagcatgattattataaattgtgcatttttctggaatgattggattgtttataatgatatgttgtcgactgggatgtatgattttatt 12355874  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12355875 taattgagtcatacttgttgatgaattatggagttgtaagtcatatatacatatctgcattgtgaagtggtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 12355974  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctg 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12355975 cataagcataaaagcggaagggctctggccctg 12356007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 12479511 - 12479746
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| || ||||||||||| | | || ||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  12479511 atattgatgtctaagcatgattattataaattgtggatttttctggaatgattggattaattataatgatatgttgttcactgggatgtatgattt-att 12479609  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479610 taattgaattatacttgttgatgaatcatggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 12479709  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12479710 cataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 12479746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12153224 - 12152990
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  12153224 ttgatgtctaaccatgattatgattaattgtgcatttttatggaattgttgaattgattataacgatctgttgttgactgtgatgtatgtttatatttaa 12153125  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12153124 atagatcatacatgttgttgagttatggagttgtaagtcatatacatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacactagtgaagtcagttgcat 12153025  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  12153024 aagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 12152990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15518867 - 15518632
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||| || | | ||||| ||  ||   |    
T  15518867 atattgatgttcaagcatgattatgattaatcgtgcatttttctggaataactgaattgattataatgacctgttgatgtcggtgatgtgtg--ttacat 15518770  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15518769 taattaaatcatacatggtgtttaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 15518670  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15518669 gcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 15518632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 11305630 - 11305810
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  11305630 attgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgcttt-atttaattaattcatacatgttgttgaatggtg--gttgtgagtcttatatacatata 11305726  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11305727 tgcatttgttgaggttgtatatagatatacacaagtggagttacttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 11305810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 11644677 - 11644858
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  11644677 attgattatgatgatctgtagttgactgtgatgtatgcgt--atttaattaaatcatacatgttgttgaattgtgg-gttgtgagtcatatatacatata 11644773  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  11644774 tgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 11644858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 249
Target Start/End: Original strand, 2270149 - 2270299
Alignment:
Q  98 gatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatataca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2270149 gatgtatgcttttatttaattaagtcatacatgttgttgaatggt--agttgtgagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatataca 2270246  T
Q  198 caagtggagtcagttgcataagcat-aaaagcgggagggctctgaccctggaa 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  2270247 caagtggagtcagtttcataagcataaaaagcgggagggctttggccctggaa 2270299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13692239 - 13692059
Alignment:
Q  73 attatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat--g 170  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||  |    
T  13692239 attatgatgatatgttgttgactgtgatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgttgaatagtgg-gttgtgagtcatatacacatatatatg 13692141  T
Q  171 catt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  13692140 catttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 13692059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17512912 - 17512693
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||   ||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17512912 ttgatgtatgagcatggttataattaattatgcatttttttgagattattgg-ttgattatgatgatttgttgttgactgggatgtatg-ttatatttaa 17512815  T
Q  117 ttaaa-tcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17512814 ttaaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatacatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgca 17512715  T
Q  216 taagc--ataaaagcgggaggg 235  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  17512714 taagcatataaaagcgggaggg 17512693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14570154 - 14569936
Alignment:
Q  29 catgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttat-ttaattaaatcatac 127  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||  ||  || |||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  14570154 catgattatgattaattgtgtaattttctgggattgttggattacttatgatgatctgctgttgactgtgatgtatgcttttacattaatgaaatcatac 14570055  T
Q  128 atgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaa 226  Q
    |||||||   ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  14570054 atgttga---attgtggagttgtaagtcatata--catatatgcattgctaagttgtatgtagatatacacaagtggagtctattgcataagcatataaa 14569960  T
Q  227 gcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||  |||||||||    
T  14569959 gcgggagggctcttgccctggaac 14569936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Original strand, 17243557 - 17243708
Alignment:
Q  88 tgttgactgggatgtatgcttttatttaatt---aaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17243557 tgttgacggtgatgtatgctttcatttaaattaaaaaccatacatgttgttgaat-atgaagtcgtaagccatatatacatatatgcattgtcgggttgt 17243655  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17243656 atgtagatatacatcagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 17243708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 31690457 - 31690623
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  31690457 attgattataatgatttgttgttgactgagatgtatgcttt-atttaattaagtcatacatgttgttgcattgtggtgttgtgagtcatatatacatata 31690555  T
Q  169 tgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    || || ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31690556 tgtatggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataaacataaaagcgggagggct 31690623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12202578 - 12202429
Alignment:
Q  92 gactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgta 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||    
T  12202578 gactgtgatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgttaaattgtgg-gttgtgagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgta 12202480  T
Q  190 gatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12202479 gatatacacaagtggagtcagttgcataaacatataaagcgggagggctct 12202429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 12961206 - 12961443
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | | ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  12961206 tattggtgtataagcatgattatgattaaattgtacatttttctggaataattgaattggttataatggtttgttattgactgggatgtatgctcctatt 12961305  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12961306 taattaagttatacatgatgttgcattacggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggttgagttttatgtagatatacacaagtgg-gtcagt 12961404  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  12961405 tgcataagtataaaagcggaagggcttcggccctggaac 12961443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31943758 - 31943592
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  31943758 attgattataatgatttgttgttgactgagatgtatgcttt-atttaattaagtcatacatgttgttgcattgtggtgttgtgagtcatatatacatata 31943660  T
Q  169 tgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    || || ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31943659 tgtatggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcatgaaagcgagagggct 31943592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23174077 - 23173920
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatat 167  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | | ||   | |||||||||||||||||||||||    
T  23174077 attgattatgatgatttgttgttgactgtgatgtatgctt--agttaattaaatcatacatgttgtttggatggcggagttgtaagtcatatatacatat 23173980  T
Q  168 atgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23173979 atgcattagttaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaag 23173920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 18756766 - 18756988
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatga-ttaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttat 112  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18756766 atattgatgtataggcatgatcatgaattaattgtgcatttttctgaaattactgaattgattctgatgat-tgttgttgactgg-atgtatgcttttat 18756863  T
Q  113 ttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcag 210  Q
    | | |||| | || ||||  | || |||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18756864 tgagttaagttatgcatgg-gttgcattatggagttgtgagtcatatacatatttatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtg-agtcag 18756961  T
Q  211 ttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  18756962 tcgcatatgcataaaagcgggagggct 18756988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 250
Target Start/End: Original strand, 18129668 - 18129843
Alignment:
Q  74 ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca 172  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||  | | |||||||    
T  18129668 ttatgatgatctgttgatgactgtaatgcatg-ttatattta-ttaaatcatacatgctgattgaattgtggagttgtaagtcatatgaaaaaatatgca 18129765  T
Q  173 ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18129766 tggttaagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcatgaaagcgggagggccctggccctggaac 18129843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 11850602 - 11850688
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11850602 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagtataaaagcgggagggc 11850688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12419765 - 12419555
Alignment:
Q  16 attgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgctttt-attt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| |||| |||   |||||||||| |||     
T  12419765 attgatgtttaagcatgattatgactaattatgcaattttctggatttattgaattgactatgatgtt-tgttattgattggagggtatgctttttattg 12419667  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    |||||| |||||||||  | || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  12419666 aattaagtcatacatgg-gttgtattatggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttgatcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagtc 12419569  T
Q  213 gcataagcataaaa 226  Q
    ||||| ||||||||    
T  12419568 gcatatgcataaaa 12419555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 250
Target Start/End: Original strand, 18136222 - 18136357
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||  | | |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18136222 attaaatcatacatgttgattgaattgcggagttgtaagtcatatgaaaacatatgcatggttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 18136321  T
Q  215 ataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| |||||||||||   | |||||||||||    
T  18136322 ataagcatgaaagcgggaggttcccgaccctggaac 18136357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 15954760 - 15954911
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||   || |||  |||||||| | ||||| |||||| |||||||| || ||||| |    
T  15954760 ttgatgtctaagcataattatgattaattgtgtatttttctggattgt-tggattacttatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttatatttga 15954858  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  15954859 ttaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatatatatatat 15954911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Original strand, 13036802 - 13036992
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| | ||  || ||| | ||||||| | ||||| |||||   ||||||| || |||||||||||||| ||    
T  13036802 agcatgattatgatcaattgtgtatttttctgaaattgttggattaactatgatgatttgttgatgactataatgtatgtttatatttaattaaatcgta 13036901  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataa 218  Q
    ||||||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13036902 catgttgttaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataa 13036992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18900263 - 18900142
Alignment:
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagc 228  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18900263 gttgttgaattacgaagtcgtatgtcatatatatacatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagc 18900164  T
Q  229 gggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||  | |||||||||    
T  18900163 gggagggcttcggccctggaac 18900142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 15934937 - 15935032
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  15934937 atatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcgggagggctctttccctggaac 15935032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23174391 - 23174309
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23174391 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcaaaagcataaaagtgggag 23174309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 10597496 - 10597601
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  10597496 atattgatgttttagcatgattatgattaattgtgcatttttctgaaattactgaattgattatgatgat-tattgttgattgggatgtgtgctgttatt 10597594  T
Q  114 taattaa 120  Q
     ||||||    
T  10597595 gaattaa 10597601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 227
Target Start/End: Original strand, 34852086 - 34852227
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||  | |||||||||||||   |||||    
T  34852086 tgttgatgactctgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgaaagtcatatc-atatatatgcattgttgagttgt 34852184  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  34852185 atgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaag 34852227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12274624 - 12274473
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||  |  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  ||| ||    
T  12274624 ttgatgtctgagcataattatgattaattgtgtatttttctgggattgttagattgattatgatgatctgttgatgactgtgatgtatgtttacatt-aa 12274526  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  12274525 ttaaatcatacatgttgtttaattgtggagttgtaagtcatatatatatatat 12274473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12255426 - 12255274
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggtt 182  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | |||||||||||  ||   |||    
T  12255426 tgttgttggctggaatgtatgcttccatttaattaagttatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatatacatatatatgcatttggttgagtt 12255327  T
Q  183 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12255326 gtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagtat-aaagcgggagggct 12255274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18889224 - 18889103
Alignment:
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagc 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||    | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  18889224 gttgttgaattatgaagtcgtatgtcatatatatacatatgcattacttgagttgtatgtagatatacacaagtgcagtcggttgcacaagcataaaagc 18889125  T
Q  229 gggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||  | |||||||||    
T  18889124 gggagggcttcggccctggaac 18889103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 15934765 - 15934916
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||   || |||  |||||||| | | ||| |||||| |||||||| || ||||| |    
T  15934765 ttgatgtctgagcataattatgattaattgtgtatttttcttgattgt-tggattacttatgatgattttttgatgactgtgatgtatgtttatatttga 15934863  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  15934864 ttaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatatatatatat 15934916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12363744 - 12363592
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||| || |||  |||||||  ||   |    
T  12363744 atattgacgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattgtaatgacctgttgatgcctgtaatgtatg--ttacat 12363647  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaatta-tgaagttgtaagtcatatatacatat 167  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  12363646 taattaaatcatacatggtgtttgattagcggagttgtaagtcatatgtacatat 12363592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 15954958 - 15955053
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  15954958 atatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgaagttcattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 15955053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 11964873 - 11964943
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  11964873 gttgtaagtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 11964943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 225
Target Start/End: Original strand, 18719010 - 18719150
Alignment:
Q  86 gttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttg 183  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | |||||||||||  ||   ||||    
T  18719010 gttgttggctggaatgtatgcttccatttaattaagttatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatatacatatatatgcatttggttgagttg 18719109  T
Q  184 tatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18719110 tatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagtataaa 18719150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Original strand, 16802380 - 16802474
Alignment:
Q  139 ttatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  16802380 ttatggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagtcgcataagcataaaagtgggag 16802474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19443677 - 19443627
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19443677 gttgtatgtagatatacacaagcggagtcagttgcataagcataaaagcgg 19443627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 23371846 - 23371892
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371846 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 23371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 11939697 - 11939811
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | | || |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  11939697 atattgatgtttaagcatgattatgataaattgtgcatttttctgggatgattggattgattatgatgacctgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 11939794  T
Q  114 taattaaatcatacatg 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  11939795 taattaaatcatacatg 11939811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 14652604 - 14652740
Alignment:
Q  98 gatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  || || |   || ||| || ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  14652604 gatgtatgcttttatttaattaagttatacatgaatgttgtaaattggagtggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatata 14652703  T
Q  196 cacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  14652704 cacaagtgg-gtcagttgcataagcataatagtgggag 14652740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18914246 - 18914155
Alignment:
Q  145 agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggct 237  Q
    |||||||||||||||  | | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18914246 agttgtaagtcatatgaa-acatatgtattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcatataaagcgggagggct 18914155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 10597677 - 10597759
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10597677 atatatatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagtg-agttagtcgcataagcataaaagcgggagggct 10597759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14292988 - 14292857
Alignment:
Q  100 tgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacac 198  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||| || ||| || |||||||||||  ||||||||| |   | |||||||||||| ||| ||    
T  14292988 tgtatgctttcatttaattaagtcatacatgatgttgtattttggagtagtgagtcatatata--tatatgcataggttgagttgtatgtagaaatatac 14292891  T
Q  199 aagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14292890 aagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 14292857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 20249072 - 20249152
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcatt----gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20249072 taagtcatatatacacatatgcatttgtcgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcataaaa 20249152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 10390367 - 10390413
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10390367 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 10390413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 10415476 - 10415522
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10415476 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 10415522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 10422146 - 10422192
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10422146 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 10422192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 12034317 - 12034363
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12034317 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 12034363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 13313908 - 13313957
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13313908 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgg 13313957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 14764100 - 14764146
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764100 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 14764146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14864995 - 14864949
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14864995 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 14864949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 19235970 - 19236016
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19235970 gttgtatgtagatatacactagtggagtcagttgcataagcataaaa 19236016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51300309 - 51300263
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300309 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 51300263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 11964742 - 11964856
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  | | || |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  11964742 atattgatgtttaagcctgattatgataaattgtgcatttttctgggatgattggattgattatgatgacctgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 11964839  T
Q  114 taattaaatcatacatg 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  11964840 taattaaatcatacatg 11964856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 140
Target Start/End: Original strand, 24284248 - 24284361
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  || ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||  || ||||||| ||||| |||    
T  24284248 agcatgattatgattaattgagtatttttctggaattgttggattaattatgatggattattgttgactgtgatgtatatttatatttaaataaattata 24284347  T
Q  127 catgttgatgaatt 140  Q
    ||||||| ||||||    
T  24284348 catgttgttgaatt 24284361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12274458 - 12274382
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcggg 231  Q
    ||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12274458 atatatatatatatatattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcggg 12274382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12255871 - 12255750
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggtt 182  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||| | ||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | |||||||||||  ||   |||    
T  12255871 tgttgttggctggaatgtatgtttccatttaattaagttatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatatacatatatatgcatttggttgagtt 12255772  T
Q  183 gtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12255771 gtatgtagatatacacaagtgg 12255750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 13324820 - 13324869
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13324820 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagtataaaagcgg 13324869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 14544162 - 14544215
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14544162 ggttgtatgtagatatacacaagcgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 14544215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17130903 - 17130857
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17130903 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagatgcataagcataaaa 17130857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 38312119 - 38312168
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38312119 gttgtatgtaaatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgg 38312168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12304952 - 12304900
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12304952 gttgtatgtagatatacacaggtg-agtcagttgcataagcataaaagtgggag 12304900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17157309 - 17157213
Alignment:
Q  137 aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  17157309 aattatggagttgtatgtcatatacataaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaag-ggggttagttgcataagcataaaagtgggag 17157213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24192010 - 24191914
Alignment:
Q  137 aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  24192010 aattatggagttgtatgtcatatacataaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaag-ggggttagttgcataagcataaaagtgggag 24191914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Original strand, 14288885 - 14288973
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaatt 140  Q
    |||||||||  || |||||| |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14288885 ttttctggagctattgaattaattatggtgatttgttgatgactgtgatgtatgcttgtatctaaataaatcatacatgttgttgaatt 14288973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 14764019 - 14764055
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764019 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 14764055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 23371765 - 23371801
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371765 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 23371801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 24284449 - 24284520
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  24284449 tatgcattgtcgggttgtatgtagataaacacaggtggagtca-ttgcataatcatataatgcgggagggctc 24284520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35985019 - 35984931
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaatt 140  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  35985019 ttttctggagctattgaattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgtcgttgaatt 35984931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51300389 - 51300353
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300389 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 51300353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 13303232 - 13303281
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13303232 gttgtatgtagatatatacaagtgg-gtcagttgcataaacataaaagcgg 13303281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 1989215 - 1989276
Alignment:
Q  164 atatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  1989215 atatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataatcataaa 1989276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Original strand, 15011956 - 15012017
Alignment:
Q  164 atatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  15011956 atatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataatcataaa 15012017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Original strand, 19343999 - 19344040
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctg 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19343999 ttgatgtttaagcatgattatgaataattgtgcatttttctg 19344040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 8373912 - 8373979
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  8373912 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 8373979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Original strand, 16829952 - 16830003
Alignment:
Q  181 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  16829952 ttgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 16830003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Original strand, 16838475 - 16838526
Alignment:
Q  181 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  16838475 ttgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 16838526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42109342 - 42109271
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  42109342 tatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaggtggagtc-tttgcataatcatataaagtgggagggctc 42109271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 222
Target Start/End: Original strand, 16382851 - 16382893
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcat 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16382851 ggttgtgtgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcat 16382893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 13203510 - 13203563
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| || |||||    
T  13203510 ggttgtatgtagatatactcaagtgg-gttagttgcataagcataacagtgggag 13203563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Original strand, 11850572 - 11850601
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11850572 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 11850601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Original strand, 14288979 - 14289024
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  14288979 gttgtatgtagatatacacaagttgaatcatttgcataaacataaa 14289024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Original strand, 20249042 - 20249071
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249042 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 20249071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35984925 - 35984880
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  35984925 gttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 35984880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Original strand, 38312059 - 38312088
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38312059 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 38312088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9533219 - 9533159
Alignment:
Q  73 attatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  9533219 attatgatggattgttgttgactgtgatgtatatttatatttaaataaattatacatgttg 9533159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18961134 - 18961067
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18961134 tatgcatggtgaagttgtatgtagatatacacaagt-gagtccattgcatatgcataaacagcgggagg 18961067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 99)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3328176 - 3327955
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3328176 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcacttttctggaattactgaattgtttatgatgat-tgttgttgactgggatgtatgcttttatt 3328078  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3328077 taattaaatcatacatgatgttgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtagagtcagt 3327978  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3327977 tgcataagcataaaagcgggagg 3327955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 11857507 - 11857741
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||    
T  11857507 ttgatgtctaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgattataatgatctgttgatgactgtgatgtatgtttataattaa 11857606  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857607 ataaatcattcatgttgtttaatcatggagttgtaggtcatatatacgtatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 11857706  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  11857707 aagcatataaagcgggaggactcttgccctggaac 11857741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 16187530 - 16187764
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| |||| |||| | | || ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16187530 atattgatgtctaagcatgattattataaattgtgcactttt-tggaatgattggattaattataatgatatgttgttgactgggatgtatgattt-att 16187627  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16187628 taattgaattatacttgttgatgaattatggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaagttgtacgtagatatacacaagtggagtcagttg 16187727  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16187728 cataagcacaaaagcgggagggccctggccctggaac 16187764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 46681998 - 46682229
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   || ||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| || |||||||    
T  46681998 ttgatgtatgagcatgattatgattaattgtgcatttttctgaattgt-tggattgattataatgatctgtggatgactgtgatgtatg-ttatatttaa 46682095  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46682096 ataaatcatacatgttgtt-acttatggagttgtgagtcatatatacaaatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 46682194  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  46682195 aagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 46682229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10520199 - 10519975
Alignment:
Q  25 taagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatca 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||| | ||| | ||| | |||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  10520199 taagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgattgtaatgatatgtggatgactgtgatgtatg-ttatatttaaataaatca 10520101  T
Q  125 tacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata- 223  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  10520100 tacatgttgtt-acttatggagttgtgagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatacagatatacataagtggagtcagttgcataagcatat 10520002  T
Q  224 aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
T  10520001 aaagcgggagggctcttgccctggaac 10519975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 250
Target Start/End: Original strand, 14178882 - 14179046
Alignment:
Q  87 ttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgta 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||    
T  14178882 ttgttgactgtgatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagtcatatacatatatatgcatttgtcgagttgta 14178980  T
Q  186 tgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14178981 tgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctctggccctggaac 14179046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 81881 - 82113
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||   || ||||||||| ||| | ||||| ||||||  | ||||| ||  ||| ||    
T  81881 ttgatgtatgagcatgattatgattgattgtgcatttttctgaattgt-tggattgattataatgatttgttgatgactgttacgtatgtttacatt-aa 81978  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  81979 ttaaatcatacatgttgtttaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtcgagtcagttgcat 82078  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    || |||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  82079 aaacatataaagcgggaggactcttgccctggaac 82113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 15085724 - 15085946
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  15085724 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtacatttttctggaattattgaattgattatgatgat-tgttgttgactggaatgtatg-ttctatt 15085821  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
     |||||| ||||||||| || || |||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15085822 gaattaagtcatacatgatgttgcattacggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttgatcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagt 15085920  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
      |||| |||||||||||||||||||    
T  15085921 cccatatgcataaaagcgggagggct 15085946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 15097770 - 15098002
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||   || ||  || ||||||||| ||| | ||| | |||||| |||||||| || |||||||    
T  15097770 ttgatgtatgagcatgattatgattaattgtgaattttttctgaattgttggattgattataatgatatgtggatgactgtgatgtatg-ttatatttaa 15097868  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15097869 ataaatcatacatgttgtt-acttatggagttgtgagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgaagtcagttgcat 15097967  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  15097968 aagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 15098002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 15104147 - 15104379
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    | ||  || ||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| || |||||||    
T  15104147 ttgatgtatgagcatgattatgattaattgtgcattttttctaaattgttggattgattataatgatctgtggatgactgtgatgtatg-ttatatttaa 15104245  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15104246 ataaatcgtacatgttgtt-acttatggagttgtgagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 15104344  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  15104345 aagcatataaagcgggaggactcttgccctggaac 15104379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 16952040 - 16952273
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgc-ttttattta 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |    
T  16952040 ttgatgtttaagcatgattaagattaattgtgcaattttctagaattactgaattgactatgatggt-tgttgttgattggaatgtatgctttttattga 16952138  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| |||||||||  | || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16952139 attaagtcatacatg-ggttgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagtcg 16952236  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  16952237 catatgcataaaagcgagagggcttctaccctggaac 16952273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 46348610 - 46348790
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  46348610 attgattatgatgacatgttgttgactgtgatgtatgctt--atttaattaaatcatacatgttcttggattgtgg-gttgtgagtcatatatacatata 46348706  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46348707 tgcatttgttgaagttgtacgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggttctgaccctggaac 46348790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 14169334 - 14169525
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14169334 atattgatgtctaagcatgattattattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttat 14169433  T
Q  113 ttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14169434 ttaattaaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagtcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtgg 14169525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 18958231 - 18958448
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  18958231 atattgatgtttaagcatgatcatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattctgatgat-tgttgttgac-agaatgtatgcttttatt 18958328  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
     | |||| | |||||||  | || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18958329 gagttaagttatacatg-agttgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagt 18958426  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggag 233  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  18958427 cgcatatgcataaaagcgggag 18958448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45185816 - 45185599
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||  || ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  ||| ||    
T  45185816 ttgatgtctgagcatgattatgattgattgtgtatttt-cttgaattgttggattgattatgatgatctgttgatgactgtgatgtatgtttacatt-aa 45185719  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  45185718 ttaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatata--tatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcat 45185621  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    || |||| |||||||||||||||    
T  45185620 aa-catataaagcgggagggctc 45185599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12547546 - 12547322
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcattttt--ctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||  || ||||||| |  || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  12547546 ttgatgtctaagcatgattatgattaattgtgcatttttttctgtaattgttggattgattttactgatctgttgttgactgtgatgtatgttgttattt 12547447  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||| || |||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12547446 aattaaatcatacatgttgttgaactgtg--gttgtgagccatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttc 12547349  T
Q  214 cataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12547348 cataagcatataaagcaggagggctct 12547322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 26289572 - 26289791
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | | |||||| ||||||     
T  26289572 tattgatgtttaagcatgatcatgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattctgatgat-tgttgttgact-gaaagtatgc-tttattg 26289668  T
Q  115 aattaaatcatacatgttga-tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    | | || | |||||||  || || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26289669 agtcaagttatacatg--gattgcattatggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagt 26289765  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  26289766 cgcatatgcataaaagcgggagggct 26289791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 37244111 - 37244331
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | | |||||||||||||     
T  37244111 tattgatgtttaagcatggtcatgattaattgtgcatttttctgaaattactgaattgattctgatgat-tgttgttgact-gaaagtatgcttttattg 37244208  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    | | || | |||||||  | || |||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  37244209 agtcaagttatacatg-ggttgcattatggagttgtgagtcatatacatgtatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagtc 37244306  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  37244307 gcatatgcataaaagcgggagggct 37244331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13678581 - 13678466
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13678581 tgaattatggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacgcaagtgaagtcagttacataagcataaaagagggagg 13678482  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| |||||||||    
T  13678481 gctctggccctggaac 13678466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15142570 - 15142357
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | || || ||||| ||||| ||  || ||| | ||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||    
T  15142570 ttgatgtatgagcatgattatgatcatttgtgtatttt-ctggaattgttggattaactatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaa 15142472  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  15142471 ttaaatcatacatgttgttaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgtggagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgaat 15142373  T
Q  217 aagcataaaagcggga 232  Q
    || |||||||||||||    
T  15142372 aaacataaaagcggga 15142357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Original strand, 12801145 - 12801300
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtc------atatata 162  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||||      |||||||    
T  12801145 attgattatgatgatctgttgatgactatgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgtttaattgtggggttgtaagtcatatatatatata 12801244  T
Q  163 catatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataa 218  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12801245 tatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccgttgcataa 12801300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 14173581 - 14173701
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttat 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14173581 atattgatgtctaagcatgattattattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttat 14173680  T
Q  113 ttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14173681 ttaattaaatcatacatgttg 14173701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 16475951 - 16476147
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  || ||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  16475951 agcatgattatgattaattgtgtatttt-ctggaattgttggattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcata 16476049  T
Q  127 catgttgatgaatt-atgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||| | |||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  16476050 catgttgttaaattgatg-ggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgatgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacataaa 16476147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 11219918 - 11220153
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || || | | ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||    
T  11219918 tattggtgttaaagcatgattatgattaaattgtgcatttt-ctagaatgattgaattggttataatggtttgttgtcgactgggatgtatgctct-att 11220015  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||| | ||| || ||||| ||| | | || ||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11220016 taattaagttatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcagataaatacatgtgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagtt 11220115  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  11220116 gcagaagcataaaagtgggagggcttcggccctggaac 11220153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1612922 - 1612775
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||   || ||| |  ||||||||||||||||||| |||||| || ||   |||||    
T  1612922 tgttgttgactgagatgtatgctct-atttaactaagtcatacatgtcattgcattgtagagttgtaagtcatatatacgtatatgtatggttgagttgt 1612824  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1612823 atgtagatatacacaagtggagtcagttggataagcataaaagtgggag 1612775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 250
Target Start/End: Original strand, 14945728 - 14945907
Alignment:
Q  71 tgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatat-atacatata 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | | |||  |  |||||||||||||| | | | |||    
T  14945728 tgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgctt--agttaattaaatcatacatgttgtttggattgcggtgttgtaagtcatatgaaaaacata 14945825  T
Q  169 tgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  14945826 tgcattgtttagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataaacatataaagcgggagggctttttccctggaac 14945907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 250
Target Start/End: Original strand, 15373321 - 15373500
Alignment:
Q  71 tgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatat-atacatata 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | | |||  |  |||||||||||||| | | | |||    
T  15373321 tgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgctt--agttaattaaatcatacatgttgtttggattgcggtgttgtaagtcatatgaaaaacata 15373418  T
Q  169 tgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  15373419 tgcattgtttagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataaacatataaagcgggagggctttttccctggaac 15373500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32771760 - 32771634
Alignment:
Q  124 atacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    |||||||||  ||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32771760 atacatgtttttgagttgtggagttgtaagtcatatacatatatatgcattgtaag-ttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcata 32771662  T
Q  224 -aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||    
T  32771661 taaagcgggagggctcttgccctggaac 32771634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12694944 - 12694740
Alignment:
Q  30 atgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacat 129  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||  || ||| | ||||||| | ||||| ||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  12694944 atgattatgatcaattgtgtatttt-ctggaattgttggattaactatgatgatttgttgatgactgtaatgtatgtttacatttaattaaatcatacat 12694846  T
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagc 228  Q
    |||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  12694845 gttggtaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacatataaagc 12694747  T
Q  229 gggaggg 235  Q
    || ||||    
T  12694746 ggaaggg 12694740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 16073774 - 16073978
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || || |||||| |||| ||  || ||| | ||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||    
T  16073774 ttgatgtatgagcatgattatgattatttgtgtattttt-tggaattgttggattaactatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaa 16073872  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| ||  || ||||||||||| || ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16073873 ttaaaccatacatgttgttaaattgtggggtggtaagtcatat-tatatatatgcactgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcat 16073971  T
Q  217 aagcata 223  Q
    |||||||    
T  16073972 aagcata 16073978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 3289751 - 3289821
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3289751 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggccctggaac 3289821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11309366 - 11309161
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgat-tatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||   | | || |||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||   |  ||    
T  11309366 ttgatgattgagcataattatgattaattgtgtatttttctgagatgattggattgttatatgatgatctgctgttgactgtgatgtatgct---acata 11309270  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaat-tatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  11309269 attaaatcatacatgttgtttaaaatgcggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagtcgtatgtagatatacgcaagtggagtccattgc 11309170  T
Q  215 ataagcata 223  Q
    ||| |||||    
T  11309169 atatgcata 11309161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 227
Target Start/End: Original strand, 36305938 - 36306077
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| | ||   | ||||    
T  36305938 tgttgttgactgagatgtatgcttt-atttaattaaatcatacatgtcattgcattgtagagttgtaagtcatatgtacatatatgta-tgggtgattgt 36306035  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36306036 atgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaag 36306077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6412108 - 6411974
Alignment:
Q  99 atgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatataca 197  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  6412108 atgtatgctttcatttaattaagttatacatgatgttgcattttggagtggtaagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatataca 6412009  T
Q  198 caagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  6412008 caagagg-gttagttgcataagcataaaagcgggag 6411974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 832952 - 833022
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  832952 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggccttggaac 833022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 836995 - 837065
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  836995 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggctctggaac 837065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 1198132 - 1198202
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  1198132 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggccttggaac 1198202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 1202175 - 1202245
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  1202175 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggctctggaac 1202245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 14281532 - 14281669
Alignment:
Q  97 ggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || | | || ||| || ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  14281532 ggatgtatgcttttatttaattaagtcatacatgaatgttgtaatttggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatat 14281631  T
Q  195 acacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14281632 acacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 14281669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 15437549 - 15437631
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15437549 atatatatatatatgcattgataagttgtatgtagatatacgcaagtggagtcaattgcataaacataaaagcgggagggctc 15437631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11312547 - 11312469
Alignment:
Q  145 agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  11312547 agttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagtcgtatgtagatatacgcaagtggagtccattgcatatgcata 11312469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 35962621 - 35962761
Alignment:
Q  94 ctgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtaga 191  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  || || ||| || ||| || |||||||||   |||||||||| | |  |||||||||||||    
T  35962621 ctggaatgtatgctttcatttaattaagtcatacatgaatgttgtattttggagtggtgagtcatatacttatatatgcataggttgggttgtatgtaga 35962720  T
Q  192 tatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35962721 tatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 35962761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46625057 - 46624982
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-----aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||  |||||||||    
T  46625057 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatatatataaagcgggagggctcttgccctggaac 46624982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 147275 - 147229
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147275 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 147229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 14320535 - 14320581
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14320535 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 14320581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15166982 - 15166936
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15166982 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 15166936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 15723103 - 15723240
Alignment:
Q  97 ggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || || |   || ||| || ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  15723103 ggatgtatgcttttatttaattaagttatacatgaatgttgtaaattggagtggtgagtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatat 15723202  T
Q  195 acacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  15723203 acacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 15723240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18872073 - 18872027
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872073 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 18872027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 20907330 - 20907376
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20907330 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 20907376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Original strand, 15437387 - 15437524
Alignment:
Q  30 atgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcataca 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| || | ||  || |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15437387 atgattattattaatttgtgcatttttttgaaattgttggattggttttgatgatttgctgttgactgtgatgtatgcttttatttaattaaatcat--a 15437484  T
Q  129 tgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  15437485 tgttgttgaatt-gggagttgtaagtcatatatatatatat 15437524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2464519 - 2464473
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2464519 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 2464473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2966138 - 2966092
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2966138 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 2966092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 3858326 - 3858372
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3858326 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 3858372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 10897154 - 10897200
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897154 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 10897200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 15710935 - 15711016
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  15710935 agtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 15711016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16008291 - 16008245
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16008291 gttgtatgtagatatatacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 16008245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16090236 - 16090190
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16090236 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 16090190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19600131 - 19599994
Alignment:
Q  97 ggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  ||| || || | | || ||| || ||||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  19600131 ggatgtatgcttttatttaattaagttatatttgtatgttgtaatttggagtggtgagtcatatatatatatatgcataggtttggttgtatgtagatat 19600032  T
Q  195 acacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||    
T  19600031 acacaagtgg-gtcagttgtataagcataatagtgggag 19599994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 29182013 - 29182059
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29182013 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 29182059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Original strand, 11390259 - 11390351
Alignment:
Q  141 atgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11390259 atgaagtcgtaggtcatatttatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataatcataaaagtgggag 11390351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 11383772 - 11383863
Alignment:
Q  142 tgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11383772 tgaagtcgtaggtcatatttatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataatcataaaagtgggag 11383863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15339069 - 15338978
Alignment:
Q  142 tgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  15339069 tgaagtggtgagtcatatacacatatatgtataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 15338978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 20328182 - 20328273
Alignment:
Q  142 tgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20328182 tgaagtcgtaggtcatatttatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataatcataaaagtgggag 20328273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18607070 - 18607024
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18607070 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaag 18607024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14565915 - 14565870
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14565915 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc-gttgcataagcataaaa 14565870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16676441 - 16676344
Alignment:
Q  137 aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16676441 aattatggagttgtaagtcatatttacaaatatgcattagtttgagttgtatgtagatatacataagtgg-gttggttgcataagcataaaagtgggag 16676344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17650677 - 17650580
Alignment:
Q  137 aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  17650677 aattatggagttgtaagtcatatttacaaatatgcattagtttgagttgtatgtagatatacataagtgg-gttggttgcataagcataaaagtgggag 17650580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 21231981 - 21232058
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21231981 atatatatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatatacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 21232058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11303055 - 11303003
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11303055 gttgtatgtagatatacacaggtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 11303003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 10897073 - 10897109
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897073 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 10897109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 202
Target Start/End: Original strand, 14265843 - 14265994
Alignment:
Q  53 tttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaa 152  Q
    ||||||||  || ||||||  |||||||| |  |||| |||||| |||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||| || |   |||||||    
T  14265843 tttctggagctattgaattacttatgatgattggttgatgactgtgatgtatgtttatatctaattgaaacatacatgttgttgatttgttgggttgtaa 14265942  T
Q  153 gtcatatatacatat--atgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagt 202  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  14265943 gtcatatatatatatatatgcattgttgagttgtttgtagatatacacaagt 14265994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Original strand, 14581399 - 14581475
Alignment:
Q  164 atatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  14581399 atatatgcattgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacatataaagtgggagggctc 14581475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16008372 - 16008336
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16008372 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 16008336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18872154 - 18872118
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872154 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 18872118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19145840 - 19145729
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatat--atacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |   ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  19145840 attaaatcatacatgttgttgatttgttgggttgttagtcatatttatatatatatgcattgttgagttatatgtagatatacacaagttgagtccattg 19145741  T
Q  214 cataagcataaa 225  Q
    ||||| ||||||    
T  19145740 cataaacataaa 19145729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20745239 - 20745128
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatat--atacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |   ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  20745239 attaaatcatacatgttgttgatttgttgggttgttagtcatatttatatatatatgcattgttgagttatatgtagatatacacaagttgagtccattg 20745140  T
Q  214 cataagcataaa 225  Q
    ||||| ||||||    
T  20745139 cataaacataaa 20745128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31154587 - 31154535
Alignment:
Q  166 atatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataa 218  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31154587 atatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagtcgcataa 31154535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23442522 - 23442423
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgta 151  Q
    |||||||||  || |||||| |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  23442522 ttttctggagctattgaattaattatggtgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgtcgttgaattattgagttgta 23442423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Original strand, 14255672 - 14255734
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataa 218  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  14255672 atatatatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataa 14255734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14128374 - 14128306
Alignment:
Q  181 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||| |||||||    
T  14128374 ttgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaac 14128306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14432192 - 14432124
Alignment:
Q  181 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||| |||||||    
T  14432192 ttgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaac 14432124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19152178 - 19152097
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||| | || || |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  19152178 ttttctggagctattgaattaattatgatgatttgctgatgactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcatacatgttg 19152097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20751577 - 20751496
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||| | || || |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  20751577 ttttctggagctattgaattaattatgatgatttgctgatgactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcatacatgttg 20751496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14565996 - 14565960
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14565996 gttgtatgtagatatacacaggtggagtcagttgcat 14565960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 16575387 - 16575442
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  16575387 tatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacatgtggagtca-ttgcataatcata 16575442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16590275 - 16590220
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  16590275 tatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacatgtggagtca-ttgcataatcata 16590220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23442428 - 23442358
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg-gagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  23442428 gttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacat-aaagcggtgagggctcttgccctggaac 23442358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14038798 - 14038740
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  14038798 tatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataatcataaa 14038740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14348828 - 14348770
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  14348828 tatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataatcataaa 14348770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 23665772 - 23665853
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcagg-ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  23665772 agtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcatgagcataacagtgggag 23665853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29795962 - 29795881
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcagg-ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29795962 agtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcatgagcataacagtgggag 29795881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29799781 - 29799700
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcagg-ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29799781 agtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcatgagcataacagtgggag 29799700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46649950 - 46649893
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  46649950 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaa 46649893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Original strand, 10896987 - 10897016
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10896987 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 10897016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13019887 - 13019850
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13019887 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 13019850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15167046 - 15167017
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15167046 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 15167017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12461697 - 12461626
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagggctc 238  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12461697 tatgcatggtctagttgtatgtagatatacacgagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagggctc 12461626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 169
Target Start/End: Original strand, 14253818 - 14253934
Alignment:
Q  53 tttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaa 152  Q
    ||||||||  || ||||||  |||||||| |  |||| |||||| |||||||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||| || |   |||||||    
T  14253818 tttctggagctattgaattatttatgatgattggttgatgactgtgatgtatgtttatatctaattgaaacatacatgttgttgatttgttgggttgtaa 14253917  T
Q  153 gtcatatatacatatat 169  Q
    |||||||||| ||||||    
T  14253918 gtcatatatatatatat 14253934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23521181 - 23521114
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23521181 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacgagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 23521114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 16228927 - 16229148
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16228927 ttgatgtatgagcatgattatgattagttgtgcatttt-cttgaattattggattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatacttttatttaa 16229025  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16229026 ttaaatcatacatgttgttgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgcaatcagttgcat 16229125  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    | ||||| |||| ||||||||||    
T  16229126 aggcatataaagtgggagggctc 16229148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 18166092 - 18166327
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18166092 ttgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 18166191  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18166192 attaaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagtcatatacgtatatatgcatttgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgc 18166290  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  18166291 ataagcatataaagcgggagggctctttccctggaac 18166327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13454102 - 13453879
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13454102 atattgatgtttaagcatgactgtgattaattgtgcatttttctggaattactgaattgattatgatgat-tgttgttgactgggatgtatgcttttatt 13454004  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
     | |||| ||||||||| || || |||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13454003 gagttaagtcatacatgatgttgcattacggagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagt 13453905  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  13453904 taaataagcataaaagcgggagggct 13453879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 53905122 - 53905356
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||| || || ||||    
T  53905122 ttgatgtctaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgattataatgatatgttgatgactgtgatgtatgtttataattaa 53905221  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
     |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53905222 ataaatcatacatgttgtttaatcatggagttgtaggtcatatatacgtatatgcattgtcgagttgtatgtaaatatacacaagtggagtgagttgcat 53905321  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  53905322 aagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 53905356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17176737 - 17176516
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| | ||  || ||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17176737 atattgatgtctaagcatgattattattaatagtgcatttttctgaaattgttggattaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatt 17176638  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17176637 taattaaatcataaatgttgttgaatagtg-ggttgtgagtcatatacacatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 17176539  T
Q  213 gcataagcata-aaagcgggagg 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  17176538 gcataagcatataaagcgggagg 17176516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37881771 - 37881549
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||   |||||||| || |||||||||||||||||     
T  37881771 tattgatgtttaagcatgatgatgattaattgtgcatttttttggaattactggattgataatgatgacttgttgttggct-ggatgtatgcttttattg 37881673  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    | |||| ||||||||| || || |||||  |||||| ||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  37881672 agttaagtcatacatgatgttgcattatagagttgtgagtcatatacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtaagtc 37881574  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  37881573 gcatatgcataaaagcgggagggct 37881549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15325246 - 15325023
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15325246 tattggtgtttaagcatgattatgattaaattgtgcatttt-ctggaatgattgaattggttataatggtttgttgttgactgggatgtatgcttctgtt 15325148  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||| | ||| || ||||||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15325147 taattaagttatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagtt 15325048  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  15325047 acataagcataaaagcgggagggct 15325023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 239
Target Start/End: Original strand, 15360704 - 15360853
Alignment:
Q  92 gactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgta 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||    
T  15360704 gactgtgatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgttaaattgtgg-gttgtgagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgta 15360802  T
Q  190 gatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15360803 gatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctct 15360853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18261602 - 18261449
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18261602 tgttgatgactgtgatgtatgtttatatttaaataaatcatacatgttgtttaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgt 18261503  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18261502 atgtagatatacacaagtggagtccattgcataa-catataaagcgggagggctc 18261449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18271567 - 18271414
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18271567 tgttgatgactgtgatgtatgtttatatttaaataaatcatacatgttgtttaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgt 18271468  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18271467 atgtagatatacacaagtggagtccattgcataa-catataaagcgggagggctc 18271414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14063161 - 14063046
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    |||||||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14063161 tgaattattatggtgtaagtcatatgaacatatatgcattgtcaggttgtatgtaggtatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagcgggagg 14063062  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| |||||||||    
T  14063061 gctctggccctggaac 14063046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12932131 - 12931978
Alignment:
Q  98 gatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatata 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||   | | ||||||||||||||||    
T  12932131 gatgtatgcttttatttaattaaattatacatgttgttaaattgtgg-gttgtgagtcatatatacatatgtgcatttgttgaagttgtatgtagatata 12932033  T
Q  196 cacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||    
T  12932032 cacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagagctcttgccctggaa 12931978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 246
Target Start/End: Original strand, 41528890 - 41529121
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||| |  ||| ||||||||  ||   ||    
T  41528890 tattggtgtttaagcatgattatgataaattgtgcatttttctggaatgattggattgtttatgatgacctgttgatctctgtgatgtatg--ttacatt 41528987  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatga--agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||  | |   ||  |   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41528988 aattaaatcatacatggagttttgtttagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattttctagttatatgtagatatacacaagtggagttagtt 41529087  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctg 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41529088 gcataagcacaaaagcgggagggctctggccctg 41529121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49051321 - 49051083
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49051321 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattactggattgcttatgat-gtttgttgttgactggaatgtatgcttttatt 49051223  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtc----------------atatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatata 195  Q
     |||||| | |||||||  | || |||| | |||||| ||||                ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  49051222 gaattaagttatacatg-ggttgcattacggagttgtgagtcatatacatacatacatatatatatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatata 49051124  T
Q  196 cacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49051123 cacaagt-gagtcagtcgcatatgcataaaagcgggagggct 49051083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15407269 - 15407068
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| | | ||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  15407269 agcatgattatgattagttgtgcatttt-ctggaatgattgaatgggttatagtggtttgttgttgactgggatgtatgcttctatttaattaagttata 15407171  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||| |  || |||||| ||| || ||||||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  15407170 catgatattgcattatggagtggtgagtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataaacatgaa 15407072  T
Q  226 agcg 229  Q
    ||||    
T  15407071 agcg 15407068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 4830932 - 4831112
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgta 151  Q
    ||||||||| ||  || ||||| ||| ||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  4830932 ttttctggaattgttggattgactattatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgaa 4831031  T
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||  | |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  4831032 agtcatat-catatatatgcattgttgagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggag 4831112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 4834227 - 4834407
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgta 151  Q
    ||||||||| ||  || ||||| ||| ||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |    
T  4834227 ttttctggaattgttggattgactattatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgaa 4834326  T
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||  | |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  4834327 agtcatat-catatatatgcattgttgagttgtatgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggag 4834407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30238121 - 30237897
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcattttt--ctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattt 114  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||  || |||  |||||||| | ||||| ||  || |||||||| || |||||    
T  30238121 ttgatgtatgagcatgattatgattaattgtgtatttttttctgggattgttggattacttatgatgatttgttgatggttgtgatgtatgtttatattt 30238022  T
Q  115 aattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  ||  |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  30238021 aattaaatcatacatgttgttaaatggtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccatttc 30237923  T
Q  215 ataagcata-aaagcgg-gagggctc 238  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30237922 ataagcatataaagcggtgagggctc 30237897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14048407 - 14048337
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14048407 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggctttggccctggaac 14048337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14485803 - 14485647
Alignment:
Q  95 tgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagat 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || || |||| |  || || ||||||||| | | |||||||||   | | |||||||||||||    
T  14485803 tgggatgtatgcttctatttaattaagttatacatgatgttgcattaaggggtggtgagtcatataaatacatatgcatttgttgaagttgtatgtagat 14485704  T
Q  193 atacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  14485703 atacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaac 14485647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 2585140 - 2585210
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2585140 gttgtatgtagatatgcacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggccctggaac 2585210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16484830 - 16484748
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16484830 atatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggggtccattgcataaacataaaagcgggagggctc 16484748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14821670 - 14821519
Alignment:
Q  73 attatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca 172  Q
    ||||||||| | || || |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |   |||||||||||||| || |||||| ||    
T  14821670 attatgatgatttgctgatgactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcatacgtgttgttgaattgttgggttgtaagtcatat-tatatatattca 14821572  T
Q  173 ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  14821571 ttgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 14821519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 250
Target Start/End: Original strand, 10972858 - 10972945
Alignment:
Q  164 atatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  10972858 atatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcgagagggctcttgccctggaac 10972945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16485012 - 16484874
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||  || ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||   ||||    
T  16485012 ttgatgtctgagcataattatgattaattgtatatttttctggaattgttggattgattataatgatctgttgatgactgtgatgtatg-tttacattaa 16484914  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtca 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  16484913 ttaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtca 16484874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 250
Target Start/End: Original strand, 14556016 - 14556121
Alignment:
Q  145 agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgacc 243  Q
    |||||||||||||||  | | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  14556016 agttgtaagtcatatgaaaacatatgcattattaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagtagcataagcatataaagcgggagggctcttgcc 14556114  T
Q  244 ctggaac 250  Q
    |||||||    
T  14556115 ctggaac 14556121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Original strand, 17000056 - 17000185
Alignment:
Q  99 atgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatac 196  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||  || || ||| || ||| || ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  17000056 atgtatgctttcatttaattaagtcatacatgaatgttgtattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatatac 17000155  T
Q  197 acaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17000156 acaagtgg-gtcagttgcataagcataaaag 17000185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15546969 - 15546818
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||  || ||| | |||||||   ||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  15546969 ttgatgtctgagcaagattatgatcaattgtgtatttt-ctggatttgttggattaactatgatgaattgttgatgactgtgatgtatgtttatatttaa 15546871  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15546870 ttaaatcatacatgttgtttaattgtggggttgtaagtcatatatatatatat 15546818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14910823 - 14910742
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14910823 taagtcatatatacacatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgg 14910742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Original strand, 26077649 - 26077739
Alignment:
Q  146 gttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26077649 gttgtgagtcatatatacatatatgtagggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcaattacataagcataaaagcgggagggct 26077739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30146973 - 30146903
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  30146973 gttgtatctacatatacacaagtggagtcagttgcataatcataaaagcgggagggccctggtcctggaac 30146903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14484721 - 14484582
Alignment:
Q  94 ctgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtaga 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || || | | || ||| || ||||||||| | |||||||||| | |  |||||||||||||    
T  14484721 ctggaatgtatgcttttatttaattaagtcatacatgaatgttgtaat-tggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtaga 14484623  T
Q  192 tatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14484622 tacacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 14484582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 43284785 - 43284920
Alignment:
Q  99 atgtatgcttttatttaattaaatcatacatg-ttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcat-tgtcaggttgtatgtagatatac 196  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||| | || ||| || |||||| || | ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  43284785 atgtatgcttttatttaattaagttatacatgaatgttgaaatttggagtggtgagtcatgtacatatatatgcataggttaggttgtatgtagatatac 43284884  T
Q  197 acaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43284885 aagagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 43284920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 1651028 - 1651078
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651028 gttgtaagtagatatacacaagcggagtcagttgcataagcataaaagcgg 1651078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 16147735 - 16147781
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16147735 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 16147781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18212342 - 18212290
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18212342 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 18212290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40908790 - 40908747
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40908790 gttgtatgtagatatacacaagcggagtcagttgcataagcata 40908747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15546801 - 15546720
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggct 237  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15546801 atatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagttatacacaaatggagtccattgcataa-catataaagcgggagggct 15546720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23121805 - 23121752
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  23121805 ggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 23121752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27905417 - 27905368
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27905417 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgaataagcataaaagcgg 27905368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15533989 - 15533937
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15533989 gttgtatgtagatatacacaggtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 15533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 27849429 - 27849501
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  27849429 tatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataatcatataaagtgggagggctc 27849501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 13899583 - 13899656
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaa--gtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  13899583 gttgtatgtagatatacacaaatgtggagtccattacataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 13899656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Original strand, 15004864 - 15004986
Alignment:
Q  32 gattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt 131  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||  ||  || |||  |||||||| | ||||| ||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  15004864 gattatgatgaattgtgtatttttctgggattgttggattacttatgatgatttgttgatgattgtgatgtatgtttatatttaactaaatcatacatgt 15004963  T
Q  132 tgatgaattatgaagttgtaagt 154  Q
    |||| |||| ||  |||||||||    
T  15004964 tgattaattgtggggttgtaagt 15004986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 11171142 - 11171282
Alignment:
Q  94 ctgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtaga 191  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||  || || ||| || ||| || ||||||||| | |||||||||| |   | || ||||||| |    
T  11171142 ctggaatgtatgctttcatttaattaaggcatacatgaatgttgtattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgagtggtatgtata 11171241  T
Q  192 tatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11171242 tatacacaagtgg-gtcagttgcataaacataaaagtgggag 11171282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 232
Target Start/End: Original strand, 41404660 - 41404724
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcggga 232  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||    
T  41404660 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataacagcggga 41404724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 899723 - 899656
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  899723 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 899656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 238
Target Start/End: Original strand, 15004977 - 15005036
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  15004977 ggttgtaagtagatatacacaagtggagtctattgcataacaaataaagcgggagggctc 15005036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16156868 - 16156782
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataa-aagcgggagggct 237  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16156868 agtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacgagtgg-gtcagttgcataatcataataagtgggagggct 16156782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 42955974 - 42956031
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  42955974 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtag-gtccgttgcatatgcataaa 42956031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Original strand, 46044823 - 46044860
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46044823 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 46044860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13886876 - 13886848
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13886876 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc 13886848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13887742 - 13887714
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13887742 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc 13887714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15244309 - 15244281
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15244309 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc 15244281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20940463 - 20940412
Alignment:
Q  181 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  20940463 ttgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcatgagcataacagtgggag 20940412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42220561 - 42220494
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  42220561 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacgagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 42220494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 10)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 154504 - 154267
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  154504 atattgatgtataagcatgattatgattagttgtgcatttt-ctggaattattgaattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatt 154406  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt---gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcag 210  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154405 taattaagtcataaatgttgttgaattgcg-ggttgtgagtcatatatacatatatgcattttattgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcag 154307  T
Q  211 ttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  154306 ttgcataagcataaaagcgggaggactatggccctggaac 154267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 197245 - 197480
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  197245 atattgatgtttaagcctgattatgattaattttgcatttttctggaattactgaattgattataatgacctgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 197342  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatga-agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  197343 taattaaatcatacatggtgtttaattagcagagttgtaagtcatgtgtacatatatgcattgtcaagttgtatgaagatatacacaagtggagtcagtt 197442  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  197443 gcataagcacaaaagtgggagggctctggccctggaac 197480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 75484 - 75270
Alignment:
Q  35 tatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttga 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||   || ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  75484 tatgattaattgtgcatttttctgaattgt-tggattgattatgatgatccgt-gttgactgtgctgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgt 75387  T
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggag 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  75386 tgaattatggagttgtaagtcatatatacgtatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgcagtcagttgcataagcatataaagcgggag 75287  T
Q  234 ggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||  |||||||||    
T  75286 ggctcttgccctggaac 75270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 56583 - 56806
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   || ||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||    
T  56583 ttgatgtatgagcatgattatgattaattgtgcatttttctgaattgt-tggattgattatgatgatctgt----------gatgtatgcttttatttaa 56671  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56672 ttaaatcatatatgttgttgaattatggcgttgtaagtcatatatacgtatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgaagtcagttgcat 56771  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  56772 aagcatataaagcgagagggctcttgccctggaac 56806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 147383 - 147146
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || | |||||||||| ||| |   || |||||||||  || ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  147383 atattgatgtctaagcatgattattataaactgtgcatttttccggaatggttggattgattatactgatctattgttgactgtgatatatgcttttatt 147284  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  147283 taattaagtcatacatgttgttgaatt-gcaggttgtgagtcatatatacatatatgcatttgttgaagtagtatgtagatatacacaagtggagtcatt 147185  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  147184 tgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 147146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 252203 - 252023
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||| ||  || || |||||||||| ||||||    
T  252203 attgattatgatgacctgttgttgactgttatgtatgctt--atttaattaaatcatacatgttcttggattgtgg-gtcgtgagtcatatatgcatata 252107  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  252106 tgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 252023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 258809 - 258641
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||| ||  || || |||||||||| ||||||    
T  258809 attgattatgatgacctgttgttgactgtcatgtatgctt--atttaattaaatcatacatgttcttggattgtgg-gtcgtgagtcatatatgcatata 258713  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  258712 tgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggctc 258641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 187618 - 187732
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  187618 atattgatgtttaagcctgattatgattaattttgcatttttctggaattactgaattgattataatgacctgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 187715  T
Q  114 taattaaatcatacatg 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  187716 taattaaatcatacatg 187732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 152659 - 152513
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||   || ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| || ||   |||||    
T  152659 tgttgttgactaagatgtatgctct-atttaattaagtcatacatgtcattgcattgtagagttgtaagtcatatgtacatatatgtatggttgagttgt 152561  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  152560 atgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggag 152513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Original strand, 21720 - 21765
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  21720 gttgtatgttgatatacacaagtggagtccattgcataatcataaa 21765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 38472 - 38707
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| | | || |||| |||| ||| | | ||||||| || |||||||| |||||||    
T  38472 atattgatgtctaagcatgattattataaattgtgcatttttcaggaatgattggattgtttataatgatattttgttgaatgagatgtatgattttatt 38571  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38572 taattgagtcatacttgt-gttgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacgagtggagtcagttg 38670  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38671 cataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 38707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 136532 - 136767
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| | | || |||| |||| ||| | | ||||||| || |||||||| |||||||    
T  136532 atattgatgtctaagcatgattattataaattgtgcatttttcaggaatgattggattgtttataatgatattttgttgaatgagatgtatgattttatt 136631  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||||| | |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  136632 taattgagtcatacttgt-gttgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacgagtggagtcagttg 136730  T
Q  214 cataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  136731 cataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 136767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18865 - 18652
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18865 ttgatgtatgagcatgattatgattagttgtgcatttt-ctggaattatttgattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatttaa 18767  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18766 ttaaatcatacatgttgttgaattatgtagttgtaagtcatatatacatatat--------aagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 18675  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  18674 aagcatataaagcgggagggctc 18652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21829879 - 21829641
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||| || |||||| |||||| || |||| || ||||||||||| |   || |||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21829879 atattgaggtctaagcaagattattataaattgtgtatttttctggaatggttggattgattatactgatttgttgttgactgtgatgtatgcttttatt 21829780  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21829779 caattaagtcatacatgttgatgcattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 21829680  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21829679 tgcataagcataaaagcgggagggctctggccttggaac 21829641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 27635679 - 27635915
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635679 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttgtggaattactgaattgattatgatgat-tgttgttgactaggatgtatgcttttatt 27635777  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
     |||||| ||||||||| || || |||| | |||||| |||||| || | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27635778 gaattaagtcatacatgatgttgcattacggagttgtgagtcatgtacatatatatgcatttggtcgagttgtatgtagatatacacaagt-gagtcagt 27635876  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  27635877 cgcatatgcataaaagcgagagggcttttgccctggaac 27635915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 6404301 - 6404536
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||| || | | ||||||||  ||   |    
T  6404301 atattgatgttcaagcatgattatgattaatggtacatttttctggaataactgaattgattataatgacctgttgatgtcggtgatgtatg--ttacat 6404398  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaatta-tgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6404399 taattaaatcatacatggtgtttaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 6404498  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6404499 gcataagcacaaaagcgggagagctctggccctggaac 6404536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 427588 - 427367
Alignment:
Q  20 atgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  427588 atgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatttattt 427489  T
Q  119 aaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcata 217  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  427488 aaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtttcata 427390  T
Q  218 agcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  427389 agcatataaagcgggagggctct 427367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Original strand, 18408877 - 18409040
Alignment:
Q  88 tgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatc-atacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtat 186  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18408877 tgttgacggtgatgtatgctttcatttaattaaaaccatacatgttgttgaattatgaagtcgtaagccatatatacatatatgcattgtcgagttgtat 18408976  T
Q  187 gtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  18408977 gtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcggaagggctttggccctagaac 18409040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25013925 - 25013719
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| || ||| ||| | |||||||  |||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  25013925 ttgatgtatgagcatgattatgattgattgtgtatttt-ctggaattgctggattaaatatgatgacctgttgatgactgtgatgtatgtttatatttaa 25013827  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||| | || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25013826 ttaaatcatacatgttgttaaattgtggggttgtaagtcattt-tatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcat 25013728  T
Q  217 aagcataaa 225  Q
    || ||||||    
T  25013727 aaacataaa 25013719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18819266 - 18819070
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  || ||| |||||||||   ||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  18819266 agcatgattatgactaattttgtatttt-ctggaattgttggattaattatgatgacttgttgatgactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcata 18819168  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||| |||| |   |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  18819167 catgttgataaattgtttggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacataaa 18819070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 24668931 - 24669017
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24668931 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcataaaagcgggagggc 24669017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 24738700 - 24738786
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24738700 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcataaaagcgggagggc 24738786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 24751469 - 24751555
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24751469 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcatgagcataaaagcgggagggc 24751555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21888923 - 21888700
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  || ||||| ||||  ||  || ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| || ||| |||    
T  21888923 ttgatgtatgagcatgattatgattaatggtgtatttt-ctgggattgttggattgattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttatatctaa 21888825  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcata--tatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  21888824 ttaaatcatacatgttgttaaattattgggttgtaagtcatatatatatatatatgcattgttgagttgtatgtagatagacacaagtggagtccattgc 21888725  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||    
T  21888724 ataatcatataaagtgggagggctc 21888700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10035485 - 10035279
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||  || ||| |||||||||   ||||| |||||| |||||||| || ||| |||    
T  10035485 ttgatgtatgagcatgattatgatcaattgtgtatttt-ctggaattgttggattaattatgatgaattgttgatgactgtgatgtatgtttatatctaa 10035387  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10035386 ttaaatcatacatgttgttaaattattgggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcat 10035288  T
Q  217 aagcataaa 225  Q
    || ||||||    
T  10035287 aaacataaa 10035279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Original strand, 23112614 - 23112758
Alignment:
Q  88 tgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaat--catacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgt 184  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  23112614 tgttgacggtgatgtatgctttcatttaattaaaaaccatacatgttgttgaattctgaagtcgtaaatcatatatacatatatgcattagttgagttgt 23112713  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23112714 atgtagatatacacaagtgg-gtcatttgcataagcataaaagcgg 23112758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 250
Target Start/End: Original strand, 22232501 - 22232676
Alignment:
Q  74 ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca 172  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||  | ||| |||||||||||  | | |||||||    
T  22232501 ttatgatgatctgttgatgactgtaatgtatg-ttatattta-ttaaatcatacatgttgttcgaattgcggagtcgtaagtcatatgaaaacatatgca 22232598  T
Q  173 ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  22232599 ttgttaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 22232676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Original strand, 23561503 - 23561648
Alignment:
Q  105 gcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||  | ||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23561503 gcttttatttaattaaatcatacatattgttgcattgtgg-gatgtgagtcatatacatatatatgcatttgtcaagttgtatgtagatatacacaagtg 23561601  T
Q  204 gagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaa 249  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  23561602 gagtcaattgcataagcatataaagcgggagggcgctttccctggaa 23561648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Original strand, 21901682 - 21901889
Alignment:
Q  30 atgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacat 129  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||| ||  || ||| ||||||| | | ||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  21901682 atgattatgattaattgtgtattttt-tggaattgttggattaattatgaagatttgttggtgactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcatacat 21901780  T
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagc 228  Q
    |||| | |||| |   |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||     
T  21901781 gttgttaaattgttgggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtgaagtccattgcataaacatataaagt 21901879  T
Q  229 gggagggctc 238  Q
    ||||||||||    
T  21901880 gggagggctc 21901889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23539101 - 23538960
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||  | |||||||||||||   |||||    
T  23539101 tgttgatgactgtgatgtatgattacatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgaaagtcatat-catatatatgcattgttgagttgt 23539003  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  23539002 atgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaag 23538960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10817074 - 10816927
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||  | |||||||||||||   |||||    
T  10817074 tgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgaaagtcatat-catatatatgcattgttgagttgt 10816976  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  10816975 atgaatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggag 10816927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 238
Target Start/End: Original strand, 6728148 - 6728288
Alignment:
Q  100 tgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gttgtatgtagatataca 197  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || |||| | ||| || ||||||||| | | ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  6728148 tgtatgcttctatttaattaagtcatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatataca 6728247  T
Q  198 caagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6728248 caagtggagttagttgcataagcacaaaagcaggagggctc 6728288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 225
Target Start/End: Original strand, 21869433 - 21869564
Alignment:
Q  93 actgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagat 192  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||| |   ||| |||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||    
T  21869433 actgtgatgtatgtttttatctaattaaatcatacatgttgttaaattgttgggttataagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagat 21869531  T
Q  193 atacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  21869532 atacacaagtggagtccatttcataaacataaa 21869564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 225
Target Start/End: Original strand, 21873713 - 21873844
Alignment:
Q  93 actgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagat 192  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||| |   ||| |||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||    
T  21873713 actgtgatgtatgtttttatctaattaaatcatacatgttgttaaattgttgggttataagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagat 21873811  T
Q  193 atacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  21873812 atacacaagtggagtccatttcataaacataaa 21873844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 23561398 - 23561502
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23561398 ttgatgtttaagcttgattatgattaattgtacatttttctggaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 23561497  T
Q  116 attaa 120  Q
    |||||    
T  23561498 attaa 23561502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20843388 - 20843293
Alignment:
Q  146 gttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20843388 gttgtgagtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcatataaagcgggagggctct 20843293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 22312717 - 22312870
Alignment:
Q  97 ggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || | | || ||| || ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  22312717 ggatgtatgcttttatttaattaagtcatacatgaatgttgtaat-tggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatat 22312815  T
Q  195 acacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||    
T  22312816 acacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcgactctggaac 22312870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 15193975 - 15194070
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagca-taaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  15193975 atatatatatatatgcatttttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatttaaagcgggagggctcaggccctggaac 15194070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 23444144 - 23444239
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23444144 atatatatatatatgcattgttgagttttatgtagatatacacaagtagagtccattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 23444239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20780899 - 20780853
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20780899 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 20780853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22336314 - 22336268
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336314 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 22336268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22339852 - 22339806
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339852 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 22339806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22466933 - 22466887
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22466933 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 22466887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 37599256 - 37599302
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37599256 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 37599302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 758195 - 758276
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  758195 agtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 758276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19236054 - 19236008
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19236054 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 19236008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20772124 - 20772078
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20772124 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtcgcataagcataaaa 20772078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20819337 - 20819291
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20819337 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 20819291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20826437 - 20826391
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826437 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 20826391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20937800 - 20937747
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20937800 ggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 20937747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22749961 - 22749915
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22749961 gttgtatgtagatatccacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 22749915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 28897001 - 28897047
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28897001 gttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28897047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 28910249 - 28910295
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28910249 gttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28910295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 28931941 - 28931987
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28931941 gttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28931987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 28933444 - 28933490
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28933444 gttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28933490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 28946644 - 28946690
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28946644 gttgtatgtagatatacataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28946690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34829235 - 34829186
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34829235 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgg 34829186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22460309 - 22460263
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22460309 gttgtatgcatatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 22460263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 22509141 - 22509194
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  22509141 ggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 22509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 24930830 - 24930876
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24930830 gttgtatgtagatatacactagaggagtcagttgcataagcataaaa 24930876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 28371395 - 28371440
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28371395 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc-gttgcataagcataaaa 28371440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 28890297 - 28890343
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28890297 gttgtatgtagatataaataagtggagtcagttgcataagcataaaa 28890343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 162
Target Start/End: Original strand, 23444057 - 23444134
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatata 162  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  23444057 tgttgatgactgtgatgtatgtttatatttaaataaatcatacatgttattgaattgcggagttgtaagtcatatata 23444134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 37805289 - 37805341
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37805289 gttgtatgtagatatacacaggtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 37805341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 250
Target Start/End: Original strand, 22007864 - 22007963
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataa-aagcgggagggctctgaccctggaa 249  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||||    
T  22007864 agtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataatcataataagtgggagggcttcggccctggaa 22007962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22336395 - 22336359
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336395 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 22336359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22339933 - 22339897
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339933 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 22339897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 37599175 - 37599211
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37599175 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 37599211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 38145643 - 38145679
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38145643 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 38145679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42960368 - 42960332
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42960368 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 42960332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 238
Target Start/End: Original strand, 18941178 - 18941264
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagggctc 238  Q
    |||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18941178 agtcatatgtaaatgtatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccatagcatatgcataaacagcgggagggctc 18941264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 238
Target Start/End: Original strand, 22439669 - 22439755
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22439669 agtcatatttacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacataagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggagagctc 22439755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21624738 - 21624692
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  21624738 gttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaa 21624692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 38145724 - 38145769
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38145724 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc-ggtgcataagcataaaa 38145769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42960287 - 42960242
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42960287 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc-ggtgcataagcataaaa 42960242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 23076270 - 23076337
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23076270 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 23076337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Original strand, 23081718 - 23081785
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23081718 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 23081785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 28371314 - 28371350
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28371314 gttgtatgtagatatacacaggtggagtcagttgcat 28371350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 17022816 - 17022875
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  17022816 tatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataatcataaaa 17022875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9775699 - 9775618
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcagg-ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  9775699 agtcatatatacatatatgcttaggtgggattgtatgtagatatactcaagtgg-gtcagttgcatgagcataacagtgggag 9775618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19362778 - 19362721
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  19362778 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaa 19362721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 23544840 - 23544897
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  23544840 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaa 23544897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26753778 - 26753705
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtg--gagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  26753778 gttgtatgtagatatacacgattgttgagtccattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 26753705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Original strand, 19801864 - 19801901
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19801864 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 19801901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21495105 - 21495060
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  21495105 gttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 21495060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22750025 - 22749996
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22750025 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 22749996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Original strand, 39608852 - 39608888
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtg 203  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39608852 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtg 39608888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9703 - 9469
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| |||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||  ||| |    
T  9703 ttgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattataatgatctgttgatgactgtaatgtatgtttacatt-a 9605  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9604 attaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcttttgca 9505  T
Q  216 taagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  9504 taagcatataaagcgagagggctcttgccctggaac 9469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 46564 - 46786
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  46564 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattattgaattgattataatgacctgttgctgtctgtgatgtatg--ttacat 46661  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||   | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46662 taattaaatcatacatggtgtttaatttgcggagttgtaagtcatatgaacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 46761  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  46762 gcataagcacaaaagcgggagggct 46786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 50837 - 51059
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  50837 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattattgaattgattataatgacctgttgctgtctgtgatgtatg--ttacat 50934  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||   | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50935 taattaaatcatacatggtgtttaatttgcggagttgtaagtcatatgaacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 51034  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  51035 gcataagcacaaaagcgggagggct 51059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28806 - 28750
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggaggg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28806 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcatataaagcgggaggg 28750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36392 - 36333
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36392 gttgtatgtagatatacacaagtggagtccattggataagcatataaagcgggagggctc 36333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 774 - 539
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  774 ttgatgtttaagcatgattatgattaattatgcatttttctggaattgttggattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 675  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  674 attaaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgaatcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 576  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  575 ataagcatataaagctggagggctcttgccctggaac 539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8847 - 8612
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8847 ttgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttgcattgaattatactgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 8748  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8747 attaaatcttacatgttgtcgaattgtgg-gttgtgaatcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 8649  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  8648 ataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 8612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Original strand, 57042 - 57224
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  57042 attgattataatgatctattgttgactgagatgtatgcttt-atttaattaagtcatacatgttgttgcattagggagttgtaagtcatatatacatata 57140  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57141 tgcatttgttgaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 57224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 141591 - 141409
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  141591 attgattataatgatctattgttgactgagatgtatgcttt-atttaattaagtcatacatgttgttgcattagggagttgtaagtcatatatacatata 141493  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  141492 tgcatttgttgaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 141409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 138
Target Start/End: Original strand, 2782 - 2892
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||   ||||||||||||||    
T  2782 agcataattatgattaattgtgtatttttctggatttgttggattgattataatgatctgttgatgactgtgatgtatg-tttacattaattaaatcata 2880  T
Q  127 catgttgatgaa 138  Q
    ||||||| ||||    
T  2881 catgttgttgaa 2892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3580 - 3345
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||||  |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3580 ttgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaattgttggattgaattatactaaactgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 3481  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3480 attatatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagtcatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgc 3382  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  3381 ataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 3345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 13219 - 13445
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| || |||  || ||||||||||  ||| || ||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||  |||    
T  13219 atattgatgcctaagcatgactattataaatggtgtatttttctgggattattggattaattataatgatttgttgttggctgggatgtatgcttccatt 13318  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||||| ||| || ||||| ||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13319 taattaagttatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcacataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacacaagcgg-gtcagtt 13417  T
Q  213 gcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13418 gcataagcatataaagcgggagggctct 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25957 - 25734
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  || ||||| ||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25957 ttgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctagaattgttggattgaattatactgaactgttgttgactgtgatgtatgcttttattta 25858  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25857 attaaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 25759  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  25758 ataagcatataaagcgggagggctc 25734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 43922 - 44157
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  43922 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgttcatttttctgaaattactgaattgattgtaatgacctgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 44019  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44020 taattaaatcatacatgaagtttaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 44119  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  44120 gtataagtataaaagcgggagggccctggccttggaac 44157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 48988 - 49223
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  48988 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgttcatttttctgaaattactgaattgattgtaatgacctgttgatgtctgtgatgtatg--ttacat 49085  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49086 taattaaatcatacatgaagtttaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 49185  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  49186 gtataagtataaaagcgggagggccctggccttggaac 49223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 694 - 458
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  694 atattgatgtttatgcatgattgtgactaattgtgcacttttctggaaatactgaattgattaagatgat-tgttgttgactgggatgtatgtttttatt 596  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca--ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| | |||||| |||||||||   ||| |||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  595 taattaaatcatacatgatgttgcattacggagttgtgagtcatatacctataaatgcattttgttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagt 497  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  496 tgcataagtataaaagcgggagggctttggccctggaac 458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 932 - 743
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| || || ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  932 ttgatgtatgagcatgattatgattagttgtgcatttt-cttgaattattagattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatttaa 834  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagt 207  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  833 ttaaatcatatatgttgttgcattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgtacgtagatatacacaagtggagt 743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10743 - 10594
Alignment:
Q  92 gactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgta 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||    
T  10743 gactgtgatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgttaaattgtgg-gttgtgagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgta 10645  T
Q  190 gatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10644 gatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctct 10594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 370758 - 370523
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || ||||||||| |||  |||||| ||  || ||||||||  ||   |    
T  370758 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatttttctggaatgattggattgattataatgacctgttgatgtatgtgatgtatg--ttacat 370661  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaatta-tgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  370660 taattaagtcatacatggtgtttaattagcgaagttttaagtcatatgtacatatatgcattgtaaagttgtatgtagatatacacaagtggtgtcagtt 370561  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  370560 gcataagcacaaaagcgtgagggctctggccctggaac 370523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 96219 - 95984
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| |||  ||   |    
T  96219 atattgatgtttaagtatgattattattatatgtgcatttttctggaattactgaattgattataatgacctgttgatgtctgtgatgcatg--ttagat 96122  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatga-agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96121 taattaaatcatacatggtgtttaatttgcagagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 96022  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  96021 gcataagcataaaagtgggagggctttggcccttgaac 95984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 488351 - 488422
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  488351 gttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 488422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 493929 - 493974
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  493929 gttgtatgtagatatacacaagtggagtc-ggtgcataagcataaaa 493974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 179183 - 179116
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  179183 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacaaaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 179116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27599 - 27377
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||  || ||||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27599 agcatgattatgattaattgtgcattttttcggaattgttggattgattataatgatctgtggatgactctgatgtatg-ttatatttaaataaatcata 27501  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aa 225  Q
    ||||||| | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27500 catgttgtt-acttatggagttgcaagtcgtatatacatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataa 27402  T
Q  226 agcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  27401 agcgggagggctcttgccctggaac 27377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9614 - 9376
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9614 atattgatgtctaagcatgattattattaattgtgcatttttctggaattgttggattgattatactaatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatg 9515  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| | ||||||||| | |||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9514 taattaaatcatacatgttgttgaatagtg-ggttttgagtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggattcagt 9416  T
Q  212 tgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  9415 tgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 9376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 7833 - 8069
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | | || |||||||||||||  || ||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  7833 atattgatgtttaagcatgattatgataagttgtgcatttttctggaatgattggattgattatgatgacctattgatgtctgtgatgtatg--ttacat 7930  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7931 taattaaatcatacatggtgtttagttagcggagttgtgagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 8030  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaact 251  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8031 gcataaggacaaaagcgggagggctccggccctggaact 8069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 15853 - 16088
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | | || |||||||||||||  || ||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  15853 atattgatgtttaagcatgattatgataagttgtgcatttttctggaatgattggattgattatgatgacctattgatgcctgtgatgtatg--ttacat 15950  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951 taattaaatcatacatggtgtttagttagcggagttgtgagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 16050  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||    
T  16051 gcataagcacaaaagcaggagggctccggccctggaac 16088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 12139 - 12343
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | | || |||||||||||||  || ||| || ||| ||||||||  ||   |    
T  12139 atattgatgtttaagcatgattatgataagttgtgcatttttctggaatgattggattgattatgatgacctattgatgtctgtgatgtatg--ttacat 12236  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237 taattaaatcatacatggtgtttagttagcggagttgtgagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 12336  T
Q  213 gcataag 219  Q
    |||||||    
T  12337 gcataag 12343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30175 - 29954
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||  || ||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||| ||  ||| ||    
T  30175 ttgatgtttgagcataattatgattaattgtgtatttttctggaattgttggattgattataatgatctgttgatgattgtgatgtatgtttacatt-aa 30077  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  30076 ttaaatcatgcatgttgttgaattgtggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgtatgtagatatatacaagtggagtccattgcat 29977  T
Q  217 aagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  29976 aagcatataaagcgggagggctc 29954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44896 - 44721
Alignment:
Q  74 ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatg-aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca 172  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |  ||||  | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  44896 ttatgatgatctgttgatgactgttatgtatg-ttatattta-ttaaatcatacatgttgttttaattgcggagttgtaagtcatatttatatatatgca 44799  T
Q  173 ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  44798 ttgttaagttgtatgaagatatacacaagtggagtccgttgcataagcatataagcgggagggctcttgccctggaac 44721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38617 - 38539
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38617 atatatatatatatgcattgttaagttgtatgaagatagacacaagtggagtccgttgcataagcatataagcgggagg 38539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5865 - 5683
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| |  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  5865 attgattataatgattcgttgatgactgagatgtatgcttt-atttaattaagtcatacatgttgttgcattatggagttgtaagacgtataaacatata 5767  T
Q  169 tgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5766 tgcattagttgaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctggccctggaac 5683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 17234 - 17469
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattga-ttatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  || ||||| ||||  |  ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  17234 ttgatgtttaagcatgattaggattaattgtgtatttttctggaattgttggattgaattatactaatctgttgttgattgtgatgtatgtttttattta 17333  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca-ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17334 attaaatcatacatgttgttgaattgtg-ggttgtgagttatatacatatatatgcatttgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgc 17432  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  17433 ataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 17469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 77077 - 76866
Alignment:
Q  28 gcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatac 127  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||  || ||||||||| ||| ||| ||| ||| || |||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  77077 gcataattatgattaattgtatatttttctggaattgttggattgattataatgatctcttgatgattgtgatgtatgtttacatt-aattaaatcatac 76979  T
Q  128 atgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaa 226  Q
    |||||| |||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  76978 atgttgttgaattgtggagctgtgagtcatatatacatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaa 76879  T
Q  227 gcgggagggctct 239  Q
    |||||||||||||    
T  76878 gcgggagggctct 76866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 71390 - 71242
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttg 183  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||| || || ||| || ||| || ||||||||| | ||||||||||| ||   ||||    
T  71390 tgttgttggctggaatgtatgcttccatttaattaagttatacatgatgttgcattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcattggttgagttg 71291  T
Q  184 tatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71290 tatgtagatatacacaagt-gtgtcagttgcataagcataaaagcgggag 71242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Original strand, 15385 - 15498
Alignment:
Q  137 aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggaggg 235  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15385 aattatggagttgtatgtcatatacataaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaag-ggggttagttgcacaagcataaaagtgggagag 15483  T
Q  236 ctctgaccctggaac 250  Q
    ||  ||| |||||||    
T  15484 cttcgactctggaac 15498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 4811 - 5036
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  || ||  | |||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4811 atattgatgtctaagcatgattatcattaattgtgcatttttctggaattgttggataaaatatactgatctgttgttgactgttatgtatgcttttatt 4910  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |  ||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4911 taattaagtcatacatgttgttgactagtgg-gttgtaagtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 5009  T
Q  213 gcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||    
T  5010 gcataaacatataaagcgggagggctc 5036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8386
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  || |||||||||  || | | |||||||||| |||||||||||||||     
T  8613 atattgatgtctaagcatgattattattaattgtgcatatttctggaattgttggattgattatactgatatcttgttgactgtgatgtatgcttttatg 8514  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||    ||| | ||||||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 taattaaatcatacatgttgttgaa-tagtcggttttgagtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 8415  T
Q  212 tgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8414 tgcataagcatataaagcgggagggctct 8386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18697 - 18470
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  || |||||||||  || | | |||||||||| |||||||||||||||     
T  18697 atattgatgtctaagcatgattattattaattgtgcatatttctggaattgttggattgattatactgatatcttgttgactgtgatgtatgcttttatg 18598  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||    ||| | ||||||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18597 taattaaatcatacatgttgttgaa-tagtcggttttgagtcatatacatatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 18499  T
Q  212 tgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18498 tgcataagcatataaagcgggagggctct 18470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 239
Target Start/End: Original strand, 10532 - 10687
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  10532 tgttgatgactgtgatgtatgtttatatttaaataaatcatacaagttgtttaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgt 10631  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10632 atgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatacaaagcgggagggctct 10687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 239
Target Start/End: Original strand, 18711 - 18866
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18711 tgttgatgactgtgatgtatgtttatatttaaataaatcatacaagttgtttaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgt 18810  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18811 atgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatacaaagcgggagggctct 18866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 24473 - 24522
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24473 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgg 24522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 65226 - 65105
Alignment:
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagc 228  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  65226 gttgttgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagc 65127  T
Q  229 gggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  65126 gggagggctcttgccctggaac 65105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 1128
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcata 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1165 gttgtatgtagatatacacaagtggagtctgttacata 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35152 - 34914
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||  || ||||||||||  | | || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35152 atattgatgtttaagcatgactattataaatggtgtatttttctgggatgattggattgattataatgatttgttgttgactgggatgtatgcttctatt 35053  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    || |||| |||| |||| || || |||||| |||  | ||||||||| | | ||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35052 tagttaagtcatgcatgatgttgcattatggagtgatgagtcatataaatacatatgcatttgttggagttgcatgtagatatacacaagtggagtcagt 34953  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34952 tgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 34914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Original strand, 124785 - 124852
Alignment:
Q  66 tgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  124785 tgaattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgttg 124852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20205 - 19998
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| ||  | ||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20205 ttgatgtatgagtatgattatgattaattgtgcatttt-ctaaaattgttggattgattatgatgatctgttgttgactgtgatgtatgcttttatttaa 20107  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    |||||||| |||||||| |  |||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20106 ttaaatcaaacatgttgttaaaattgtggagttgtaagtcatgt-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgca 20008  T
Q  216 taagcataaa 225  Q
    ||| ||||||    
T  20007 taaacataaa 19998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7302 - 7075
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||   ||||| || |||           ||   |    
T  7302 atattgatgtttaagcatgattatgattaattgtgcatatttatggaattactgaattgattataatgacatgttgatgtctg-----------ttacat 7214  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattat-gaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    |||||||||||||||||    | |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7213 taattaaatcatacatggactttaattagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 7114  T
Q  213 gcataagcat-aaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    | |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7113 gtataaccataaaaagcgggagggccctggccctggaac 7075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 4868 - 5034
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  4868 attgattataatgatttgttgttgactgagatgtatacttt-atttaaataagtcatacatgttgttgcattgtggtgttgtaagtcatatatacatata 4966  T
Q  169 tgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4967 tgcatggttgtgttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagcgggagggct 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28234 - 28011
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  | | ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28234 tattggtgtttaagcatgattatgaataaattgtgcatttt-ctgggatgattgaattagttataatggtttgttgttgactgggatgtatgcttctatt 28136  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||| | ||| || ||||||||  | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28135 taattaagttatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatatgaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacaccagtggagttagtt 28036  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28035 gcataagcataaaagcgggagggct 28011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 115986 - 115871
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  115986 tgaattgtgaagtcgtaagtcatatatacatatatgtattgtcgggttgtatgtagatatacaccagtggagtctgttgcataagcataaaagcgggagg 115887  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||  |||||||||||    
T  115886 gcttcgaccctggaac 115871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 327091 - 326921
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || ||| || ||| || ||||||||| | | |||    
T  327091 attgattatgatgatttgttgttgactggagtgtatgcttctatttaattaagtcatacaagatgttgcattttggagtggtgagtcatataaatacata 326992  T
Q  169 tgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  326991 tgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaaggggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggct 326921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 321382 - 321199
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || || |||||| ||| || ||||||| | | | |||    
T  321382 attgattatgatgatttgttgttgactggagtgtatgcttctatttaattaagtcatacaagatgttgcattatggagtggtgagtcataaaaatacata 321283  T
Q  169 tgca-ttgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||| ||||  | |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||  |||||||||  | |||||||||    
T  321282 tgcatttgttggagttgtatgtagatatacacaaggggagtttgttgcataagcacaaaaatgggagggcttcggccctggaac 321199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Original strand, 129661 - 129721
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129661 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctct 129721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Original strand, 129597 - 129626
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129597 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 129626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 1160 - 1382
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  || ||| | |||| ||   ||||| |||||| |||||||| || |||| ||    
T  1160 ttgatgtgtgagcatgattatgattgattgtgcatttttctggaattgttggattaactatgctgccttgttgatgactgtgatgtatgtttatatt-aa 1258  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatat--atgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1259 ttaaatcatacatgttgcttaattatggagttgtaagtcatatatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgc 1358  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||| | || |||||||||||||||    
T  1359 ataa-cttataaagcgggagggctc 1382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Original strand, 976 - 1096
Alignment:
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcg 229  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  976 gttgttgaattatgaagtcgtatgtcatatatacatatatgcattgtcgagtggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcg 1075  T
Q  230 ggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||  | |||||||||    
T  1076 ggagggcttcggccctggaac 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Original strand, 7912 - 8032
Alignment:
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcg 229  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7912 gttgttgaattatgaagtcgtatgtcatatatacatatatgcattgtcgagtggtatgtagatatacacaagtggagtcggttgcataagcataaaagcg 8011  T
Q  230 ggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||  | |||||||||    
T  8012 ggagggcttcggccctggaac 8032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3162 - 3008
Alignment:
Q  98 gatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatata 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||    
T  3162 gatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgttagattgtgg-gttgtgagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatata 3064  T
Q  196 cacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  3063 cacaagtggagtcagttgcataagcatataaaacgggagggctcttgccctggaac 3008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 16766 - 16933
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gtt 182  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| || || ||| || ||| || ||||||||| | | ||||||||| ||  | |||    
T  16766 tgttgttgactggaatgtatgcctctatttaattaagtcatacatgatgttgcattttggagtggtgagtcatataaatacatatgcatttgttggagtt 16865  T
Q  183 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16866 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctctggccctggaac 16933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Original strand, 15923 - 16038
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15923 tgaattatggagtcgtgagtcgtatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacaaaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 16022  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||||  |||||||||    
T  16023 gctcttgccctggaac 16038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1546 - 1437
Alignment:
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagc 228  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1546 gttgttgaattatggagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtacgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcatataaagc 1447  T
Q  229 gggagggctc 238  Q
    ||||||||||    
T  1446 gggagggctc 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 56234 - 55998
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||| |   || ||||||||  ||   |    
T  56234 atattggtgtttaagcatgattatgataaattgtgcatttttctggaatgattggattgtttatgatgacctgttgatctttgtgatgtatg--ttacat 56137  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatga--agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    |||||||||||||||||  | |   ||  |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  56136 taattaaatcatacatggagttttgtttagcggagttgtaagtcatatgtacatatatgcattgtctagttgtatgtagatatacacaagtggagttagt 56037  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||    
T  56036 tgcataaacacaaaagcgggagggctccggccctggaac 55998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 5777 - 5944
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gtt 182  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | | ||||||||| ||  | |||    
T  5777 tgttattgactaggatgtatgcttctatttaattaagtcatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatataaatacatatgcatttgttggagtt 5876  T
Q  183 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  5877 gtatgaagatatacacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 5944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 474 - 359
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  474 tgaattatggagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacgcaagtgaagtcagttacataagcataaaagagggagg 375  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||||| |||||||||    
T  374 gctctggccctggaac 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 11)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 27721 - 27956
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||  || ||||| ||| ||| | ||||| ||| || |||||||| ||  ||| ||    
T  27721 ttgatgtctgagcataattatgattaattgtgtatttttctggaattgttggattgagtataatgatttgttgatgagtgtgatgtatgtttacatt-aa 27819  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatat----atgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    || |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  27820 tttaatcatacatgttgttgaattgtggaattgtaagtcatatatatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgcagtccatt 27919  T
Q  213 gcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctgga 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27920 gcataagcatataaagcgggagggctcttgccctgga 27956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 38558 - 38793
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||  || ||||| ||| ||| | ||||| ||| || |||||||| ||  ||| ||    
T  38558 ttgatgtctgagcataattatgattaattgtgtatttttctggaattgttggattgagtataatgatttgttgatgagtgtgatgtatgtttacatt-aa 38656  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatat----atgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    || |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  38657 tttaatcatacatgttgttgaattgtggaattgtaagtcatatatatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgaagtccatt 38756  T
Q  213 gcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctgga 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  38757 gcataagcatataaagcgggagggctcttgccctgga 38793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 124330 - 124499
Alignment:
Q  69 attgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || || |||||| |||  | ||||||||| | |||||    
T  124330 attgattataatgatttgttattgattgggatgtatgcttctatttaattaagttatacatgatgttgcattatggagtgatgagtcatatacaaatata 124429  T
Q  169 tgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||  ||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124430 tgcatttggtagagttgtatgtagatataaacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 124499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25114 - 24972
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   |||||||||  || |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  25114 agcatgattataattaattgtgttattttctggagctattgaattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcata 25015  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| ||||||    
T  25014 catgttgttgaattgttgggttgtaagtcatatatatatatat 24972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 110400 - 110354
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110400 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 110354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 233
Target Start/End: Original strand, 63168 - 63218
Alignment:
Q  182 tgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  63168 tgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 63218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35876 - 35783
Alignment:
Q  75 tatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatata 168  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| || |||||    
T  35876 tatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgttgttgaattgttgggttgtaagtcatatttatatata 35783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 110481 - 110445
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110481 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 110445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 12849 - 12902
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| |||| |||||    
T  12849 gttgtatgtagatatacacaggttgggttagttgcataagcatcaaagtgggag 12902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 130
Target Start/End: Original strand, 63075 - 63108
Alignment:
Q  97 ggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  63075 ggatgtatgcttttatttaattaagtcatacatg 63108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 142839 - 142794
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  142839 gttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 142794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 3131 - 3369
Alignment:
Q  14 atattgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || |||  || ||||||||||  | | || ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| || || ||||    
T  3131 atattgatgtctaagcatgactattataaatggtgtatttttctgggatgattggattgattataatgatttgttgttgactaggatgtttgtttctatt 3230  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||| | ||| || ||||||||| | | ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3231 taattaagttatacatgatgttgcattaaggagtggtgagtcatataaatacatatgtatttgttggagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 3330  T
Q  212 tgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  3331 tgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 3369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45863 - 45652
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    |||| |||| |||| |||| || ||||||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  45863 agcacgattgtgatcaattatgtatttttctggaattattggattaactatgatgatctgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaattaaatcata 45764  T
Q  127 catgttga-tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-a 224  Q
    ||| |||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  45763 catattgattaaattctggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataa-catata 45666  T
Q  225 aagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||||||||    
T  45665 aagcgggagggctc 45652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3239 - 3070
Alignment:
Q  66 tgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacat 165  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||  | ||||||||||||||| | |||    
T  3239 tgaattgattataatgaattgttgttgactgagaggtatgcttt-atttaattaagtcatacatgtcgttgcattgaggagttgtaagtcatatgtgcat 3141  T
Q  166 atatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||| || ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3140 atatgtatggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gttagttgcataagcataaaagcgggagggct 3070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Original strand, 1632 - 1755
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||  | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1632 attaaatcatacatgttgtttgaattgcggagttgtaagtcatatgaaaacatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgc 1730  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  1731 ataagcatataaagcgggagggctc 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8465
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8511 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 8465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 15368 - 15503
Alignment:
Q  99 atgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatac 196  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||  || || | | || ||| || ||||||||| | |||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  15368 atgtatgtttttatttaataaagtcatacatgaatgttgtaatttggagtggtgagtcatatacatatatatgcaaaggttaggttgtatgtagatatac 15467  T
Q  197 acaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15468 acgagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 15503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Original strand, 153146 - 153368
Alignment:
Q  15 tattgatgtttaagcatgattatgattaattt-tgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatt 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||| | || |||| ||| | |||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  153146 tattggtgtttaagcatgattatgattaaattgtacatttttctggactgactggactgtttataatgatttgttattggttgggatgtatgcttctatt 153245  T
Q  114 taattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtt 212  Q
    ||||||| | ||||||| ||  | |||||| ||| || ||||||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  153246 taattaagttatacatgatgtggtattatggagtggtgagtcatataaatacatatgcattgttggagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagtt 153344  T
Q  213 gcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||| || ||| |||||||||||||    
T  153345 gcacaaacatgaaagcgggagggc 153368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 20402 - 20542
Alignment:
Q  94 ctgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtaga 191  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  || || ||| || ||| || ||||||||| | |||||||||| |   | ||||||||||||    
T  20402 ctggaatgtatgctttcatttaattaagtcatacatgaatgttgtattttggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgagttgtatgtaga 20501  T
Q  192 tatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20502 tatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 20542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Original strand, 102855 - 102970
Alignment:
Q  135 tgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  102855 tgaattgtgaagtcgtaagtcatatatacatatatgcattgtcgggttgtatgtaggtatacaccagtggggtctgttgcataagcataaaagcgggaga 102954  T
Q  235 gctctgaccctggaac 250  Q
    |||  | |||||||||    
T  102955 gcttcggccctggaac 102970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1139 - 995
Alignment:
Q  88 tgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaat--catacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgt 184  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||   |||||    
T  1139 tgttgacggtgatgtatgctttcatttaattaaaaaccatacatgttgttgaattctgaagtcgtaattcatatttacatatatgcattagttgagttgt 1040  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1039 atgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgg 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 61825 - 62036
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| || ||| ||| |||||||||   ||||| |||||| |||||||| || |||| ||    
T  61825 ttgatgtatgagcatgattatgattgattgtgtatttt-ctggaattgctggattaattatgatgacttgttgatgactgtgatgtatgtttatatt-aa 61922  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatat-atacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgca 215  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  61923 ttaaatcatacatgatgtt-aattgtggggttgtaagtcatattatatatatatgccttgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcccttgca 62021  T
Q  216 taagcataaaagcgg 230  Q
    ||| |||||||||||    
T  62022 taaacataaaagcgg 62036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 250
Target Start/End: Original strand, 171670 - 171852
Alignment:
Q  70 ttgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    |||||||| ||| | |||| |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||   | ||||    
T  171670 ttgattataatgatttgttattgattgtgatgtatgtttctatttaattaagtcatacatgatgttgcattatggagtggtaagtcatataagtacatat 171769  T
Q  170 gcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  171770 gcatttgttggagttgtatgtagatataaacaagtggagtcagttgcataagcacaaaagcgggagggctccggccctggaac 171852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1853 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1853
Description:

Target: scaffold1853; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 623 - 817
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  || ||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  623 agcatgattatgattaattgtgtatttt-ctggaattgttggattaattatgaggatctgttgttgactgtgatgtatgtttacatttaattaaatcata 721  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    ||||||| | | ||  | ||||||||||||||| || | ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  722 catgttgttaagttgcggagttgtaagtcatat-tatacatatgcattcttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataaacata 817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 51508 - 51725
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattat-gatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||  | | || |||  || ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  51508 ttgatgtttaagcatggctttaataaatggtgtatttttctggaatgtctgaattgattattgatgat-tgttgttggctggaatgtatgctttcattta 51606  T
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttg 213  Q
    ||| | | ||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51607 attgagttatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatatacatatatatgcatttggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttg 51705  T
Q  214 cataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51706 cataagcataaaagcgggag 51725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 241 - 174
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  241 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 331 - 417
Alignment:
Q  150 taagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  331 taagtcatatatacatatatgcattgtcgagttgtatgtagatatacacaagaggagtcagttgcatgagcataaaagcggaagggc 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 169
Target Start/End: Original strand, 5271 - 5349
Alignment:
Q  91 tgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5271 tgactgtgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgtttaatggtggggttgtaagtcatatatatatatat 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Original strand, 5354 - 5416
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataa 218  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  5354 atatatatatatctgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtagagtccattgcataa 5416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 209
Target Start/End: Original strand, 301 - 330
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  301 gttgtatgtagatatacacaagtggagtca 330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2151 - 2081
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2151 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctagaac 2081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8562
Alignment:
Q  148 tgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggc 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8650 tgtaagtcatatgaacatatatgcattgtcaagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggc 8562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 207524 - 207676
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  || |||  |||||||| | ||||| |||||  |||||||| || |||||||    
T  207524 ttgatgtttcagcatgattatgattaattttgtatttttctgggattgttggattacttatgatgatttgttgatgactatgatgtatgtttatatttaa 207623  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  207624 ttaaatcatacatgttgttgaattgtcgagttgtaagtcataaatatatatat 207676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 207691 - 207773
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  207691 atatatatatatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataa-catataaagcgggagggctc 207773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Original strand, 82093 - 82217
Alignment:
Q  30 atgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacat 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||  || |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82093 atgattattattaattgtgcatttttctagaattgttggattggttttgatgatctgctgttgattgtgatgtatgcttttatttaattaaatcatacat 82192  T
Q  130 gttgatgaattatgaagttgtaagt 154  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  82193 gttgttgaattatggagtcgtaagt 82217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Original strand, 72719 - 72911
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  || ||| ||||||||| | ||||| |||||| ||| |||| || ||| ||||||||| |||    
T  72719 agcatgattatgattaattgtgtatttt-ctggaattgttggattaattatgatgatttgttgatgactgtgatatatgtttatatctaattaaataata 72817  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatat---atacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcata 217  Q
    ||||||| | |||| |   ||||||||||||||   ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  72818 catgttgttaaattgttgggttgtaagtcatattatatatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcata 72911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 46589 - 46742
Alignment:
Q  73 attatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcata-tatacatatatgc 171  Q
    ||||||||| | ||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| |   ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46589 attatgatgatttgttgatgattgtgatgtatgtttatatttaattaaatcatacatgttgttaaattgttgggttgtaagtcatattatatatatatgc 46688  T
Q  172 attgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  46689 attgttgagttgtatatagatatacataagtggagtccattgcataaacataaa 46742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 80395 - 80441
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80395 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 80441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 146867 - 146720
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||||||  | |||||||||||||   |||||    
T  146867 tgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgttgaattgtggagtggaaagtcatatc-atatatatgcattgttgagttgt 146769  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  146768 atgtatatatacacaagtggagtccattgcataatcataaaagtgggag 146720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 141558 - 141477
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  141558 agtcatatatacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 141477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44462 - 44341
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44462 attaaatcatacaagt-gttgaattatgaagtggtgagtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgc 44364  T
Q  215 ataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    ||||||| |||||||||| ||||    
T  44363 ataagcacaaaagcgggatggct 44341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2621 - 2390
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||||||||   || |||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||  ||   ||||||||||||||    
T  2621 agcataattatgattaattgtgtatctttctggattgt-tggattgtttatgatgatctgttgataactgtgatgtatg--ttacattaattaaatcata 2525  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat----------gcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||||| ||| || || |||||||||  ||||||| ||||||          ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2524 catgttgttgatttgtggagttgtaagatatatatatatatatatatataaatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcat 2425  T
Q  217 aagcat-aaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  2424 aagtataaaaagcgggagggctcttgccctggaac 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2401 - 2282
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2401 attaaatcatacaagt-gttgaattatggagtggtgagtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttagttgc 2303  T
Q  215 ataagcataaaagcgggaggg 235  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  2302 ataagcacaaaagcgggaggg 2282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12795 - 12615
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||  ||||| ||  || ||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||| || ||| |||    
T  12795 ttgatgtatgagcatgattatgatcaattgtgtattt--ctggaattgttggattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttatatctaa 12698  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaa 200  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  12697 ttaaatcatacatgttgttaaattattgggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatattcacaa 12615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 250
Target Start/End: Original strand, 47755 - 47862
Alignment:
Q  146 gttgtaagtcatatatacatatatgcattg--tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgac 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |    
T  47755 gttgtgagtcatatatacatatatgcatttgttgaagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagtgggaggactctagc 47854  T
Q  243 cctggaac 250  Q
    ||||||||    
T  47855 cctggaac 47862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42220 - 42083
Alignment:
Q  97 ggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |  || | | || ||| || |||| |||| | |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  42220 ggatgtatgcttttatttaattaagttatacatgaattttgtaatttggagtggtgagtcttatacatatatatgcataggttaggttgtatgtagatat 42121  T
Q  195 acacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42120 acacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 42083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 225
Target Start/End: Original strand, 42779 - 42950
Alignment:
Q  53 tttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaa 152  Q
    ||||||||  || ||||||  |||||||| | ||| | |||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||    
T  42779 tttctggagctattgaattatttatgatgatttgtcgatgaccgtgatgtatgtttatatctaattaaatcatacatgttgttgaattgttgggttgtaa 42878  T
Q  153 gtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  42879 gtcatat-tatatatatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 42950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Original strand, 53474 - 53580
Alignment:
Q  53 tttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaa 152  Q
    ||||||||  || ||||||  |||||||| | |||||  ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||    
T  53474 tttctggagctattgaattatttatgatgatttgttgaggactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcatacatgttgttgaattgttgggttgtaa 53573  T
Q  153 gtcatat 159  Q
    |||||||    
T  53574 gtcatat 53580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Original strand, 45081 - 45140
Alignment:
Q  166 atatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  45081 atatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 45140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6360 - 6265
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  6360 atatatatacatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 6265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6502 - 6374
Alignment:
Q  33 attatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgtt 132  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||  || ||||||||| ||| ||||||| ||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  6502 attatgattaattgtgtatttttctggaattgttggattgattataatgatctgttgatgattatgatgtatgtttacatt-aattaaatcatacatgtt 6404  T
Q  133 gatgaattatgaagttgtaagtcatatata 162  Q
    | || ||| || ||||||||||||||||||    
T  6403 gttggattgtggagttgtaagtcatatata 6374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 250
Target Start/End: Original strand, 16995 - 17145
Alignment:
Q  101 gtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcag-gttgtatgtagatatacac 198  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| || || |||||| ||| || ||||||||| | | ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  16995 gtatgcttctatttaattag-tcatacatgatgttgcattatggagtggtgagtcatataaatacatatgcatttgttggagttgtatgtagatatacac 17093  T
Q  199 aagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17094 aagtggagtcaattgcataggcacaaaatcgggagggctctggccctggaac 17145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 5096 - 5167
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  5096 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 5167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 4882 - 5061
Alignment:
Q  29 catgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgatta-tgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatac 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||  ||  ||| | |||||||||||    
T  4882 catgattatgattaattgtgcatttttctggattgt-tggattgattaatgatgatctgttgatgactgtgttgtatatttacattca-ttaaatcatac 4979  T
Q  128 atgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtca 209  Q
    |||| | ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4980 atgt-gttgaattatggagtggtgagtcatatacatatatatgcatttgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtca 5061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1098
Description:

Target: scaffold1098; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2298 - 2156
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   |||||||||  || |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  2298 agcatgattataattaattgtgttattttctggagctattgaattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcata 2199  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
    ||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| ||||||    
T  2198 catgttgttgaattgttgggttgtaagtcatatatatatatat 2156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 55743 - 55984
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||  ||| ||    
T  55743 ttgatgtctgagcataattatgactaattgtgtatttttctggattgt-tggattgattatgatgatctgttgatgactgtgatgtatatttacatt-aa 55840  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtc-atatatacatata--------tgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||  ||||| |||  |         |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55841 ttaaatcatacatgttgttgaattgtagagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagt 55940  T
Q  208 cagttgcataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  55941 ccattgcataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 55984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5433 - 5301
Alignment:
Q  101 gtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacaca 199  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||| || || ||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  5433 gtatgctttcatttaattaagttatacatgatgttgcattttggagtggtaagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacaca 5334  T
Q  200 agtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  5333 agagg-gttagttgcataagcataaaagcgggag 5301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13902 - 13748
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||    ||||    
T  13902 tgttgatgactgtaatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgttaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgttgatttgt 13804  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagc--ataaaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  13803 atgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacatataaaagtgggagggctc 13748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 92 - 2
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgt 176  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  92 tgttgatgactgtaatgtatgtttacatttaattaaatcatacatgttgttaaattgtggggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgt 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 250
Target Start/End: Original strand, 18072 - 18207
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||| | ||  | | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18072 attaaatcatacatgttgtttgaattgcggagttgtaagttagatgaaaacatatgcattgttaagttgtatatagatatacacaagtgg-gtcagttgc 18170  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  18171 ataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 18207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 250
Target Start/End: Original strand, 23705 - 23838
Alignment:
Q  116 attaaatcatacatgttgat-gaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||  | ||||||  ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23705 attaaatcatacatgttgtttgaattgcggagttgtaagtcatgaaaacatat--gcactgttaagttgtatgcagatatacacaagtgg-gtcagttgc 23801  T
Q  215 ataagcata-aaagcgggagggctctgaccctggaac 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23802 ataagcatataaagcgggagggctcttgccctggaac 23838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Original strand, 4547 - 4643
Alignment:
Q  137 aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  4547 aattatggagttgtaagtcatatatgcaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacataagtgg-gttagttgcataagcataaaagtgggag 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 18039 - 18190
Alignment:
Q  73 attatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgca 172  Q
    ||||||||| | || || |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |   |||||||||||||| || |||||| ||    
T  18039 attatgatgatttgctgatgactgtgatgtatgtttatatctaattaaatcatacgtgttgttgaattgttgggttgtaagtcatat-tatatatattca 18137  T
Q  173 ttgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  18138 ttgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 18190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 258906 - 258825
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  258906 agtcatatacacatatatgcataggttgggtggtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 258825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 265332 - 265251
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  265332 agtcatatacacatatatgcataggttgggtggtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataacagtgggag 265251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26358 - 26241
Alignment:
Q  124 atacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatata--tacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagca 221  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  26358 atacatgttgttgagttgtggagttgtaagtcatatacatatatatatgcattgtaag-ttgtatgtagatatacacaagtgaagttcattgcataagca 26260  T
Q  222 ta-aaagcgggagggctct 239  Q
    || ||||||||||||||||    
T  26259 tataaagcgggagggctct 26241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27740 - 27623
Alignment:
Q  124 atacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatata--tacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagca 221  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  27740 atacatgttgttgagttgtggagttgtaagtcatatacatatatatatgcattgtaag-ttgtatgtagatatacacaagtgaagttcattgcataagca 27642  T
Q  222 ta-aaagcgggagggctct 239  Q
    || ||||||||||||||||    
T  27641 tataaagcgggagggctct 27623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 627 - 514
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgc-ttttattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||| |||||| || |||| |||| ||| |||||||| ||||||| |    
T  627 ttgatgtttaagcatgattatgattaattatgcaattttctggaaatattgaattgactatgat-gtttgttattgattggaatgtatgctttttattga 529  T
Q  116 attaaatcatacatg 130  Q
    ||||| |||||||||    
T  528 attaagtcatacatg 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 459 - 380
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcatt--gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagg 234  Q
    ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  459 atatatatatatatgcatttggtcgagttgtatgtaggtatacacaagt-gagtaagtcgcatatgcataaaagcgggagg 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Original strand, 4228 - 4324
Alignment:
Q  137 aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  4228 aattatggagtcgtaagtcatatatacaaatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgga-ttagttgcataagcataaaagtgggag 4324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7550 - 7402
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttg 183  Q
    |||||||| |||| |||||| |||  |||||||||| | |||| || || || ||| |  ||| || ||||||||| | ||||||||||||   | ||||    
T  7550 tgttgttggctggaatgtattcttccatttaattaagttatacgtgatgttgcatttttgagtggtgagtcatatacatatatatgcattggttgagttg 7451  T
Q  184 tatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7450 tatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgggag 7402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 22554 - 22698
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||| ||||| || ||| ||| | ||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||    
T  22554 ttgatgtatgagcatgattatgatcaattgtgtatttt-ctggaattgctggattaactatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaa 22652  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatata 162  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||    
T  22653 ttaaatcatacatgttgtttaattgtggggttgtaagtcatatata 22698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 26751 - 26895
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||  || ||| | ||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||    
T  26751 ttgatgtatgagcatgattatgatcaattgtgtatttt-ctggaattgatggattaactatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttacatttaa 26849  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatata 162  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||    
T  26850 ttaaatcatacatgttgtttaattgtggggttgtaagtcatatata 26895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0661 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0661
Description:

Target: scaffold0661; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 239
Target Start/End: Original strand, 4036 - 4119
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4036 atatatatatatatgcattgtaag-ttgtatgtagatatacacaagtggagtccattacataagcatataaagcgggagggctct 4119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0661; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 169
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4025
Alignment:
Q  35 tatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg- 133  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||  || |||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||     
T  3891 tatgattaattgtgtatttttctgggattgttggattacttatgatgatctgttgatgactgtgatgtatgtttacatt-aattaaatcatacatgttgt 3989  T
Q  134 atgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatat 169  Q
     | ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  3990 ttaaattacggagttgtaggtcatatatatatatat 4025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 6623 - 6813
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgta 151  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||| || |  ||| ||     
T  6623 ttttctggagctattgaattaattatgatggtttgttgaagactgtgatgtatgcttatatctgattaaatcatacatgttcttgagttgttgagtggtg 6722  T
Q  152 agtcata--tatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgg-gagggctc 238  Q
    |||||||  |||  | |||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  6723 agtcatatttatttaaatatgcattgttgagttgtatgtaaatatacacaagttgagtcaattgcataatcatataaagcggtgagggctc 6813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 7712 - 7838
Alignment:
Q  113 ttaattaaatcatacatgttgatg-aattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||| |||||||||  | | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7712 ttaattaaatcatacatgttgttggaattgcggagttgcaagtcatatgaa-acatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaattgg-gtcagt 7809  T
Q  212 tgcataagcata-aaagcgggagggctct 239  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  7810 tgcataaacatataaagcgggaggtctct 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 14754 - 14806
Alignment:
Q  166 atatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataa 218  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14754 atatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagtcagtcgcataa 14806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1469
Description:

Target: scaffold1469; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 509 - 463
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  509 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1290
Description:

Target: scaffold1290; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 1067 - 1295
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| || ||||| || || ||  || ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  ||| ||    
T  1067 ttgatgtctgagcatgattatgattgattgtgtatttt-cttgaattgttggattgattatgatgatctgttgatgactgtgatgtatgtttacatt-aa 1164  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagt-catatatacatat--------atgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||  ||||| |||  |         |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165 ttaaatcatacatgttgttgaattgtggagttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagt 1264  T
Q  208 cagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1265 ccattgcataa-catataaagcgggagggctc 1295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 4163 - 4209
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4163 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 4209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 14384 - 14521
Alignment:
Q  97 ggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgt-tgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  || || |   || ||| || ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  14384 ggatgtatgcttttatttaattaagttatacatgaatgttgtaaattggagtggtgagtcatatacatatatatgcataggttgggttgtatgtagatat 14483  T
Q  195 acacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14484 acacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 14521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7238
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||    
T  7157 agtcatatacacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacacaagtgg-gacagttggataagcataacagtgggag 7238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51341 - 51283
Alignment:
Q  181 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51341 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcaattgcataagcatataaagcgggagggctc 51283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17683 - 17631
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcggga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17683 ggttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcggga 17631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Original strand, 5909 - 6055
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgt 184  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||   || ||| |   |||||||||||||| |||||||||| || ||   |||||    
T  5909 tgttgttgactgagatctatgctct-atttaattaagtcatacatgtcattgcattgtagtgttgtaagtcatatgtacatatatgtatggttgagttgt 6007  T
Q  185 atgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||    
T  6008 atgtagatatacataagtgg-gttagttacataagcataaaagtgggag 6055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2286 - 2078
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||  || |||||| ||||||||| |  |||| ||| || || ||||| || ||| |||    
T  2286 ttgatgtataagcttgattataattaattgtgatattttctggagctattgaattaattatgatgattcgttgatgattgtgaggtatgtttatatctaa 2187  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||| |||||||| || ||| || |   |||||||||||||| || |||||||||| ||   ||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||    
T  2186 ttaaaacatacatgatgttgatttgttgggttgtaagtcatatttatatatatgcatggttgagttgtatgtagatgtacacacgttgagtccattgcat 2087  T
Q  217 aagcataaa 225  Q
    || ||||||    
T  2086 aaacataaa 2078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23365 - 23157
Alignment:
Q  17 ttgatgtttaagcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaa 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||   |||||||||  || |||||| ||||||||| |  |||| |||||| || ||||| || ||| |||    
T  23365 ttgatgtataagcttgattataattaattgtgatattttctggagctattgaattaattatgatgattggttgatgactgtgaggtatgtttatatctaa 23266  T
Q  117 ttaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    ||||| |||||||| || ||| ||     |||||||||| ||| || |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  23265 ttaaaacatacatgatgttgatttggtgggttgtaagtcgtatttatatatatgcatggttgagttgtatgtagatatacacatgttgagtccattgcat 23166  T
Q  217 aagcataaa 225  Q
    || ||||||    
T  23165 aaacataaa 23157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17096 - 17042
Alignment:
Q  182 tgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 237  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17096 tgtatgtagatatatacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgggagggct 17042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 2819 - 2865
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2819 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 216
Target Start/End: Original strand, 2738 - 2774
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcat 2774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 11913 - 11962
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11913 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagcgg 11962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Original strand, 11458 - 11500
Alignment:
Q  184 tatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11458 tatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 41564 - 41641
Alignment:
Q  156 atatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41564 atatatatatatatgcattagttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 41641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 4573 - 4619
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4573 gttgtatgaagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 4619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 92104 - 92150
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  92104 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 92150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 97830 - 97876
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97830 gttgtatgcagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 97876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 140 - 192
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  140 gttgtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 3603 - 3749
Alignment:
Q  27 agcatgattatgattaattttgcatttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcata 126  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||  || ||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||| || |||  ||||||||||||    
T  3603 agcatgattatgattaattt-gtatttt-ctggaattgttggattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgtttatatcgaattaaatcata 3700  T
Q  127 catgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatgcattgt 176  Q
    ||||||| | |||| |   |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3701 catgttgttaaattgttgggttgtaagtcatat-tatatatatgcattgt 3749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 81024 - 81127
Alignment:
Q  66 tgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacat 165  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |   |||||||||||||| || ||    
T  81024 tgaattaattatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacacgttgttgaattgttgggttgtaagtcatatttatat 81123  T
Q  166 atat 169  Q
    ||||    
T  81124 atat 81127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 98316 - 98433
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgta 151  Q
    |||||||||  || |||||| ||| | ||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |   ||||||    
T  98316 ttttctggagctattgaattaattttaatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacacgttgttgaattgttgggttgta 98415  T
Q  152 agtcatatatacatatat 169  Q
    |||||||| || ||||||    
T  98416 agtcatatttatatatat 98433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2016 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2016
Description:

Target: scaffold2016; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 154
Target Start/End: Original strand, 707 - 809
Alignment:
Q  52 ttttctggatttactgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgta 151  Q
    |||||||||  || |||||| |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  707 ttttctggagctattgaattaattatggtgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgtcgttgaattattgagttgta 806  T
Q  152 agt 154  Q
    |||    
T  807 agt 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Original strand, 16914 - 16963
Alignment:
Q  183 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16914 gtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 16963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 47383 - 47436
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  47383 ggttgtatgtagatatacacaagcgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 47436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 56417 - 56470
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  56417 ggttgtatgtagatatacacaagagg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 56470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Original strand, 62803 - 62856
Alignment:
Q  179 ggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  62803 ggttgtatgtagatatacacaagcgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 62856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 10231 - 10283
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10231 gttgtatgtagatatacataagtgg-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 10283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 559
Alignment:
Q  165 tatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  619 tatatgcattgttaagttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataatcataaa 559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4135
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4092 gttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataagcata 4135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10435 - 10357
Alignment:
Q  149 gtaagtcatatatacatatatgcatt-gtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||    
T  10435 gtaagtcatatatacatatatgcattagttgagttgtatgtggatatacacaaatgg-gttagtcgcataagcataaaag 10357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 233
Target Start/End: Original strand, 50942 - 50996
Alignment:
Q  178 aggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50942 aggttttatgtagatatacacaagtag-gtcagttgcataagcataaaagtgggag 50996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Original strand, 392 - 441
Alignment:
Q  183 gtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  392 gtatgtagatatacacaagtgg-gtcagttgcataagcattaaagtgggag 441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 14515 - 14596
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattg-tcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||||    
T  14515 agtcatataaacatatatgcataggttgggttgtatgtagatatacataagt-gagtcagttgaataagcataacagtgggag 14596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 177 - 131
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  177 gttgtatgctgatatacacaagtggagtcagttgcattagcataaaa 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 226
Target Start/End: Original strand, 115 - 152
Alignment:
Q  189 agatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  115 agatatacacaagtggagtcaattgcataagcataaaa 152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19484 - 19439
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19484 gttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataagcataaa 19439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4782 - 4722
Alignment:
Q  73 attatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  4782 attatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgttg 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 9249 - 9320
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  9249 tatgcattgtcgaattgtatgtagatatacacaggtggagtca-ttgcataatcatataaagtgggagggctc 9320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26455 - 26384
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata-aaagcgggagggctc 238  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  26455 tatgcattgttgtgttgtatgtagatatacacaggtggagtca-ttgcataatcatataaagtgggagggctc 26384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25747 - 25687
Alignment:
Q  73 attatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttg 133  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25747 attatgatgatttgttgatgactgtgatgtatgcttatatctaaataaatcatacatgttg 25687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25674 - 25629
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  25674 gttgtatgtagatatacacaagttgagtccattgcataaacataaa 25629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41425 - 41373
Alignment:
Q  152 agtcatatatacatatatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    |||||||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41425 agtcatatgtaaatgtatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 41373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 137256 - 137189
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  137256 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 137189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Original strand, 780 - 839
Alignment:
Q  166 atatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  780 atatgcattgttgagttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataatcataaa 839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12059 - 12012
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagata-tacacaagtggagtcagttgcataagcataaaa 226  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12059 gttgtatgtagataatacactagaggagtcagttgcataagcataaaa 12012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0669 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0669
Description:

Target: scaffold0669; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Original strand, 1753 - 1795
Alignment:
Q  181 ttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  1753 ttgtatgtagatatacacaagtggagtccattgcataatcata 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18220 - 18146
Alignment:
Q  66 tgaattgattatgatggtctgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaatt 140  Q
    |||||| |||||||||   ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18220 tgaattaattatgatgaattgttgatgactgtgatgtatacttatatctaaataaatcatacatgttgttgaatt 18146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29987 - 29883
Alignment:
Q  145 agttgtaagtcatatatacatatatgcattgtcag-gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggctctgacc 243  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| ||| || |     
T  29987 agttgtgagtcatatacatatatatgcattggttgagttgtatgtagatatacacaagtgg-gt-agttgtctaagcataaaagtgggagagctttggct 29890  T
Q  244 ctggaac 250  Q
    |||||||    
T  29889 ctggaac 29883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 200 - 116
Alignment:
Q  85 tgttgttgactgggatgtatgcttttatttaattaaatcatacatgttgatgaattatgaagttgtaagtcatatatacatatatg 170  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||   || ||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  200 tgttgttgactgagatgtatgc-tctatttaattaagtcatacatgtcattgcattgtagagtcgtaagtcatatgtacatatatg 116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10494
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggag 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10546 gttgtatgtagatatacacgagtcg-gtcagttgcataatcataaaagtgggag 10494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8749
Alignment:
Q  180 gttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  8794 gttgtatgtagatatacacaagtggagttcattgcataatcataaa 8749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 247199 - 247162
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  247199 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 247162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 253713 - 253676
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtgg 204  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  253713 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacaagtgg 253676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31012 - 30945
Alignment:
Q  167 tatgcattgtcaggttgtatgtagatatacacaagtggagtcagttgcataagcataaa-agcgggagg 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31012 tatgcatggtcaagttgtatgtagatatacacgagtgg-gtccattgcatatgcataaacagcgggagg 30945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University