View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2932_high_42 (Length: 257)

Name: NF2932_high_42
Description: NF2932
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2932_high_42
NF2932_high_42
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-247)||(28979751-28979983)
chr3 (20-195)||(55293591-55293766)
chr3 (14-247)||(29528896-29529115)
chr3 (14-247)||(48519800-48520019)
chr3 (14-247)||(26776580-26776799)
chr3 (14-238)||(19893332-19893542)
chr3 (20-228)||(39094235-39094429)
chr3 (14-194)||(40821913-40822093)
chr3 (14-239)||(52842864-52843074)
chr3 (14-195)||(8526996-8527177)
chr3 (14-195)||(35855828-35856009)
chr3 (14-240)||(4137554-4137766)
chr3 (14-247)||(8396443-8396662)
chr3 (14-195)||(29529681-29529862)
chr3 (17-247)||(35860685-35860900)
chr3 (14-195)||(19368262-19368443)
chr3 (14-240)||(55290548-55290758)
chr3 (22-247)||(19360879-19361090)
chr3 (14-232)||(22521931-22522150)
chr3 (20-189)||(9373137-9373300)
chr3 (45-247)||(26100923-26101111)
chr3 (14-247)||(53802041-53802260)
chr3 (14-154)||(53801520-53801660)
chr3 (14-195)||(26101600-26101767)
chr3 (14-197)||(36006487-36006663)
chr3 (14-138)||(39093603-39093727)
chr3 (14-195)||(19361556-19361723)
chr3 (14-197)||(9373961-9374123)
chr3 (14-122)||(4138621-4138729)
chr3 (14-197)||(51656384-51656547)
chr3 (88-192)||(14555611-14555715)
chr3 (108-197)||(9373839-9373929)
chr3 (114-197)||(9373537-9373620)
chr3 (14-104)||(46489291-46489382)
chr3 (106-186)||(16040631-16040711)
chr3 (89-197)||(40822145-40822253)
chr3 (14-157)||(53521737-53521860)
chr3 (89-197)||(40822305-40822413)
chr3 (14-73)||(19367744-19367803)
chr3 (192-247)||(40817322-40817377)
chr3 (81-189)||(53521986-53522096)
chr3 (81-189)||(53522285-53522395)
chr3 (202-247)||(18688526-18688571)
chr3 (89-200)||(53927522-53927633)
chr3 (118-197)||(55369548-55369627)
chr3 (111-197)||(38362057-38362143)
chr3 (106-195)||(16046978-16047066)
chr3 (89-202)||(49067908-49068021)
chr3 (20-68)||(9373771-9373819)
chr3 (89-197)||(53927265-53927373)
chr3 (132-202)||(9374197-9374268)
chr3 (14-60)||(9373457-9373503)
chr3 (147-197)||(16062531-16062581)
chr3 (111-197)||(38362157-38362243)
chr3 (111-197)||(38362357-38362443)
chr3 (111-197)||(49453788-49453874)
chr3 (124-197)||(38362457-38362530)
chr3 (87-163)||(36946736-36946812)
chr3 (117-197)||(38362257-38362337)
chr3 (117-197)||(49453894-49453974)
chr3 (118-197)||(36946455-36946534)
chr3 (118-197)||(55369703-55369782)
chr3 (87-153)||(36946579-36946645)
chr3 (106-159)||(16036429-16036482)
chr3 (81-163)||(36006750-36006834)
chr3 (90-163)||(40822642-40822715)
chr3 (76-104)||(9374144-9374172)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (14-240)||(2182517-2182744)
chr5 (14-239)||(33704908-33705119)
chr5 (14-247)||(41692820-41693039)
chr5 (14-247)||(34719136-34719355)
chr5 (14-240)||(25695689-25695901)
chr5 (14-247)||(36884925-36885144)
chr5 (14-247)||(42975534-42975753)
chr5 (20-195)||(752999-753174)
chr5 (20-195)||(43137204-43137379)
chr5 (14-195)||(12419376-12419556)
chr5 (14-195)||(753742-753923)
chr5 (14-195)||(2181778-2181959)
chr5 (14-195)||(6304736-6304917)
chr5 (31-247)||(30181106-30181308)
chr5 (14-195)||(43137836-43138017)
chr5 (14-195)||(26601481-26601661)
chr5 (21-195)||(30180365-30180539)
chr5 (21-195)||(34717866-34718040)
chr5 (14-247)||(34725405-34725623)
chr5 (14-239)||(43136427-43136637)
chr5 (14-195)||(42976839-42977020)
chr5 (14-240)||(17636837-17637049)
chr5 (14-195)||(3087352-3087533)
chr5 (14-195)||(17637624-17637804)
chr5 (14-195)||(33705571-33705752)
chr5 (14-188)||(34726200-34726374)
chr5 (21-195)||(41691550-41691724)
chr5 (26-195)||(25696351-25696520)
chr5 (14-195)||(36885716-36885893)
chr5 (14-195)||(42976217-42976384)
chr5 (14-239)||(752208-752432)
chr5 (20-142)||(6304045-6304167)
chr5 (14-239)||(3086586-3086779)
chr5 (91-197)||(3890316-3890422)
chr5 (14-197)||(38937351-38937514)
chr5 (107-202)||(16683432-16683527)
chr5 (14-104)||(27440854-27440944)
chr5 (106-202)||(16679864-16679960)
chr5 (94-197)||(3890201-3890304)
chr5 (18-202)||(16679637-16679801)
chr5 (14-104)||(39915370-39915460)
chr5 (91-197)||(41289838-41289942)
chr5 (14-87)||(30755418-30755491)
chr5 (81-197)||(38096799-38096915)
chr5 (106-197)||(41289948-41290039)
chr5 (124-175)||(16685461-16685512)
chr5 (106-202)||(16679547-16679642)
chr5 (87-188)||(38096953-38097054)
chr5 (81-197)||(35393466-35393582)
chr5 (89-197)||(35393629-35393737)
chr5 (81-197)||(38096653-38096769)
chr5 (87-197)||(17547713-17547823)
chr5 (89-202)||(35394267-35394380)
chr5 (89-197)||(17547410-17547518)
chr5 (89-197)||(35394108-35394215)
chr5 (86-189)||(38939117-38939222)
chr5 (20-60)||(16679798-16679838)
chr5 (89-197)||(41041942-41042050)
chr5 (118-197)||(41041800-41041879)
chr5 (118-188)||(5079807-5079877)
chr5 (89-197)||(32719207-32719315)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (14-240)||(41978523-41978749)
chr8 (14-247)||(36778158-36778377)
chr8 (20-240)||(18375709-18375915)
chr8 (14-247)||(9473801-9474020)
chr8 (14-195)||(4465281-4465462)
chr8 (14-195)||(12761168-12761349)
chr8 (20-195)||(1944126-1944301)
chr8 (20-195)||(8161328-8161503)
chr8 (20-195)||(8761950-8762125)
chr8 (14-240)||(25361193-25361405)
chr8 (20-195)||(25834927-25835102)
chr8 (14-195)||(8162071-8162252)
chr8 (14-195)||(8761312-8761493)
chr8 (14-195)||(25835559-25835740)
chr8 (14-240)||(24055518-24055730)
chr8 (14-247)||(7390996-7391215)
chr8 (14-247)||(44380857-44381076)
chr8 (14-195)||(1943377-1943558)
chr8 (14-195)||(7390248-7390429)
chr8 (14-194)||(44381597-44381777)
chr8 (20-195)||(32845513-32845688)
chr8 (14-239)||(8762692-8762902)
chr8 (14-195)||(32844762-32844944)
chr8 (14-239)||(42244488-42244699)
chr8 (14-195)||(32846140-32846321)
chr8 (14-195)||(36777519-36777700)
chr8 (14-232)||(40586601-40586805)
chr8 (14-247)||(41158325-41158541)
chr8 (14-247)||(25345672-25345891)
chr8 (14-239)||(41531922-41532132)
chr8 (14-239)||(1944867-1945077)
chr8 (14-247)||(4464499-4464718)
chr8 (14-247)||(25618644-25618863)
chr8 (14-239)||(25834150-25834360)
chr8 (14-195)||(41532643-41532824)
chr8 (14-195)||(9473163-9473344)
chr8 (14-195)||(41157589-41157761)
chr8 (14-182)||(25619604-25619771)
chr8 (14-239)||(8160572-8160780)
chr8 (106-239)||(32846952-32847085)
chr8 (14-202)||(34894088-34894262)
chr8 (31-188)||(34894775-34894926)
chr8 (106-202)||(34894571-34894667)
chr8 (106-202)||(37588310-37588406)
chr8 (18-197)||(37588144-37588315)
chr8 (14-99)||(34894275-34894359)
chr8 (81-188)||(44428432-44428537)
chr8 (20-104)||(38295309-38295387)
chr8 (81-197)||(18493154-18493270)
chr8 (89-197)||(41843821-41843929)
chr8 (87-195)||(41843974-41844082)
chr8 (106-197)||(38295375-38295465)
chr8 (89-197)||(16913968-16914075)
chr8 (87-163)||(41844173-41844249)
chr8 (106-197)||(37588040-37588131)
chr8 (106-197)||(44428771-44428862)
chr8 (14-60)||(32846888-32846933)
chr8 (115-172)||(34894508-34894565)
chr8 (124-197)||(37587961-37588034)
chr8 (31-83)||(34894684-34894736)
chr8 (76-104)||(37588394-37588422)
chr8 (158-202)||(37588478-37588522)
[»] chr4 (82 HSPs)
chr4 (14-240)||(24944285-24944511)
chr4 (14-247)||(8531891-8532124)
chr4 (14-247)||(39404736-39404968)
chr4 (14-195)||(20589997-20590178)
chr4 (20-195)||(24944850-24945025)
chr4 (14-247)||(17741341-17741560)
chr4 (14-247)||(39713640-39713859)
chr4 (14-247)||(13172627-13172846)
chr4 (14-247)||(52802612-52802831)
chr4 (14-195)||(24947566-24947747)
chr4 (14-195)||(46105200-46105381)
chr4 (20-195)||(8988138-8988313)
chr4 (14-240)||(12680786-12680998)
chr4 (14-240)||(36741951-36742163)
chr4 (20-195)||(37351038-37351213)
chr4 (14-247)||(3758958-3759177)
chr4 (14-195)||(8987500-8987681)
chr4 (14-195)||(24548348-24548529)
chr4 (14-195)||(37350400-37350581)
chr4 (20-195)||(2117131-2117306)
chr4 (14-247)||(43023697-43023924)
chr4 (14-247)||(46106100-46106319)
chr4 (14-195)||(9888209-9888390)
chr4 (14-239)||(8964513-8964723)
chr4 (14-239)||(8988880-8989090)
chr4 (14-239)||(37351780-37351990)
chr4 (14-239)||(37356679-37356889)
chr4 (21-195)||(52801300-52801474)
chr4 (14-195)||(47556239-47556420)
chr4 (14-240)||(50118219-50118431)
chr4 (14-247)||(24549101-24549320)
chr4 (14-247)||(47555570-47555788)
chr4 (14-239)||(50043016-50043226)
chr4 (14-240)||(20590681-20590894)
chr4 (14-197)||(46419557-46419739)
chr4 (14-195)||(3758313-3758494)
chr4 (26-195)||(39714357-39714525)
chr4 (14-195)||(50118888-50119069)
chr4 (31-195)||(16904665-16904829)
chr4 (14-197)||(26603405-26603582)
chr4 (14-247)||(2117868-2118087)
chr4 (20-195)||(43022967-43023135)
chr4 (20-239)||(29713510-29713714)
chr4 (14-195)||(39405531-39405698)
chr4 (14-189)||(49355261-49355435)
chr4 (14-206)||(5755276-5755454)
chr4 (20-239)||(9887423-9887641)
chr4 (126-246)||(30527733-30527853)
chr4 (14-195)||(29712998-29713165)
chr4 (14-172)||(42348484-42348644)
chr4 (14-197)||(37061526-37061695)
chr4 (31-195)||(43022468-43022619)
chr4 (20-200)||(37061735-37061901)
chr4 (14-155)||(42348221-42348362)
chr4 (22-202)||(42349529-42349695)
chr4 (77-197)||(48808351-48808471)
chr4 (141-239)||(16652986-16653084)
chr4 (91-197)||(48808234-48808340)
chr4 (14-197)||(26602650-26602813)
chr4 (106-197)||(42348387-42348478)
chr4 (106-197)||(54866762-54866853)
chr4 (106-188)||(42348112-42348194)
chr4 (124-197)||(8120421-8120494)
chr4 (81-189)||(8120224-8120334)
chr4 (202-247)||(5759194-5759239)
chr4 (111-197)||(1325554-1325640)
chr4 (89-197)||(11659265-11659373)
chr4 (89-197)||(54242940-54243048)
chr4 (14-74)||(54866865-54866925)
chr4 (118-189)||(8120128-8120199)
chr4 (87-197)||(54242785-54242895)
chr4 (111-197)||(24527973-24528059)
chr4 (117-197)||(23980173-23980253)
chr4 (111-171)||(24527911-24527971)
chr4 (117-199)||(24527565-24527648)
chr4 (91-197)||(11654403-11654509)
chr4 (118-195)||(8119797-8119874)
chr4 (144-197)||(49752392-49752445)
chr4 (117-197)||(1325245-1325325)
chr4 (125-185)||(1325664-1325724)
chr4 (89-197)||(22453761-22453868)
chr4 (107-195)||(23707873-23707961)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (14-240)||(14832716-14832942)
chr6 (20-247)||(1222068-1222281)
chr6 (14-247)||(9978853-9979072)
chr6 (14-195)||(4108988-4109169)
chr6 (14-247)||(24447473-24447692)
chr6 (14-195)||(4896772-4896953)
chr6 (15-247)||(15043972-15044190)
chr6 (14-195)||(33320362-33320543)
chr6 (14-247)||(9735841-9736060)
chr6 (14-195)||(35159121-35159302)
chr6 (14-247)||(6966382-6966601)
chr6 (39-247)||(18320430-18320624)
chr6 (14-247)||(4109734-4109953)
chr6 (21-195)||(24446203-24446377)
chr6 (21-195)||(1220796-1220970)
chr6 (14-247)||(35159799-35160020)
chr6 (20-239)||(4896114-4896318)
chr6 (14-197)||(4621320-4621496)
chr6 (127-247)||(33319711-33319831)
chr6 (88-188)||(31426210-31426311)
chr6 (14-89)||(21059293-21059368)
chr6 (14-84)||(33319846-33319916)
chr6 (21-89)||(21078541-21078609)
chr6 (77-134)||(31497194-31497251)
chr6 (77-130)||(31502584-31502637)
chr6 (14-60)||(21055521-21055567)
chr6 (81-134)||(31491805-31491858)
chr6 (81-200)||(26899782-26899901)
chr6 (87-197)||(21855243-21855352)
chr6 (111-197)||(28078962-28079048)
chr6 (144-197)||(19989962-19990015)
chr6 (89-197)||(26899644-26899752)
chr6 (89-196)||(21855399-21855506)
chr6 (87-197)||(26899997-26900107)
chr6 (118-195)||(21855112-21855189)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (14-247)||(16301806-16302039)
chr1 (14-247)||(19320565-19320784)
chr1 (14-247)||(4893646-4893865)
chr1 (14-247)||(29184622-29184841)
chr1 (14-247)||(47137536-47137755)
chr1 (14-195)||(19321236-19321417)
chr1 (20-247)||(33363256-33363469)
chr1 (20-195)||(28572083-28572258)
chr1 (14-195)||(16301217-16301398)
chr1 (14-247)||(46623521-46623740)
chr1 (14-195)||(28571334-28571515)
chr1 (14-195)||(50562333-50562514)
chr1 (14-195)||(22198182-22198363)
chr1 (14-232)||(38896493-38896697)
chr1 (21-195)||(4892376-4892550)
chr1 (21-195)||(29185937-29186111)
chr1 (14-195)||(33074933-33075114)
chr1 (17-239)||(22194620-22194827)
chr1 (14-247)||(5427993-5428212)
chr1 (14-247)||(50563150-50563369)
chr1 (14-195)||(1827379-1827560)
chr1 (20-239)||(1375667-1375871)
chr1 (21-195)||(33361979-33362153)
chr1 (20-233)||(51964622-51964820)
chr1 (20-239)||(33074384-33074588)
chr1 (14-239)||(1828117-1828327)
chr1 (14-226)||(52311901-52312099)
chr1 (14-195)||(52311119-52311294)
chr1 (14-169)||(28950641-28950797)
chr1 (20-195)||(47136813-47136974)
chr1 (14-195)||(5427261-5427428)
chr1 (14-197)||(8256444-8256620)
chr1 (14-239)||(28572825-28573049)
chr1 (14-195)||(46624303-46624470)
chr1 (14-195)||(38895753-38895920)
chr1 (141-239)||(24289354-24289452)
chr1 (14-104)||(49586841-49586931)
chr1 (14-197)||(21056084-21056246)
chr1 (14-104)||(33373567-33373657)
chr1 (106-189)||(20130697-20130780)
chr1 (124-200)||(35593623-35593699)
chr1 (106-175)||(35598756-35598825)
chr1 (77-197)||(9754165-9754284)
chr1 (81-134)||(20089396-20089449)
chr1 (106-175)||(35599347-35599416)
chr1 (144-196)||(50278377-50278429)
chr1 (14-157)||(35593457-35593594)
chr1 (71-104)||(24289489-24289522)
chr1 (39-104)||(35598311-35598371)
chr1 (81-195)||(8256241-8256357)
chr1 (106-139)||(24289468-24289501)
chr1 (14-58)||(33375357-33375401)
chr1 (76-104)||(35599404-35599432)
chr1 (141-169)||(49586951-49586979)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (20-239)||(32675896-32676114)
chr2 (14-247)||(4289172-4289391)
chr2 (21-195)||(28608886-28609060)
chr2 (14-195)||(42781605-42781786)
chr2 (14-240)||(28609610-28609843)
chr2 (14-195)||(1513689-1513870)
chr2 (14-195)||(32676463-32676644)
chr2 (14-195)||(18091530-18091711)
chr2 (14-246)||(18090757-18090976)
chr2 (14-247)||(19487955-19488174)
chr2 (14-247)||(42782352-42782571)
chr2 (14-195)||(6931063-6931244)
chr2 (14-195)||(19487199-19487380)
chr2 (21-195)||(4290485-4290659)
chr2 (31-195)||(9543452-9543616)
chr2 (14-195)||(19485117-19485298)
chr2 (33-239)||(9542782-9542974)
chr2 (14-197)||(25235107-25235290)
chr2 (14-247)||(10874543-10874762)
chr2 (20-239)||(17838159-17838363)
chr2 (20-197)||(44940665-44940838)
chr2 (14-238)||(6931585-6931794)
chr2 (14-195)||(10875338-10875505)
chr2 (97-202)||(1501622-1501727)
chr2 (105-217)||(1501514-1501626)
chr2 (77-202)||(8909774-8909899)
chr2 (14-97)||(1513139-1513223)
chr2 (91-197)||(25234787-25234893)
chr2 (91-197)||(25234570-25234676)
chr2 (91-197)||(25234997-25235101)
chr2 (81-197)||(38328106-38328222)
chr2 (14-101)||(15783438-15783525)
chr2 (106-197)||(25234472-25234563)
chr2 (81-202)||(38328963-38329084)
chr2 (106-195)||(25234684-25234773)
chr2 (87-197)||(39087616-39087726)
chr2 (106-195)||(25234901-25234990)
chr2 (89-199)||(39087780-39087890)
chr2 (91-188)||(38328560-38328657)
chr2 (89-197)||(38328252-38328360)
chr2 (106-197)||(692922-693013)
chr2 (89-197)||(38328706-38328814)
chr2 (89-197)||(38327914-38328022)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (14-247)||(9151097-9151316)
chr7 (14-247)||(17172572-17172791)
chr7 (14-246)||(48527557-48527775)
chr7 (14-247)||(27733098-27733317)
chr7 (14-247)||(31896958-31897177)
chr7 (14-246)||(44806256-44806474)
chr7 (14-239)||(35155641-35155852)
chr7 (14-247)||(7855108-7855327)
chr7 (14-195)||(7855901-7856082)
chr7 (15-247)||(21669376-21669594)
chr7 (26-195)||(24683950-24684119)
chr7 (14-245)||(690966-691183)
chr7 (14-247)||(34873498-34873717)
chr7 (21-195)||(44805515-44805689)
chr7 (14-195)||(49145089-49145273)
chr7 (14-195)||(4849382-4849563)
chr7 (14-195)||(29468377-29468558)
chr7 (31-239)||(39648134-39648328)
chr7 (14-247)||(4850126-4850345)
chr7 (21-195)||(17171302-17171476)
chr7 (21-195)||(39648784-39648958)
chr7 (22-247)||(49144179-49144390)
chr7 (20-239)||(29468903-29469107)
chr7 (14-195)||(9150575-9150755)
chr7 (26-195)||(31897625-31897794)
chr7 (14-171)||(35156333-35156490)
chr7 (20-195)||(33637584-33637759)
chr7 (14-232)||(11835119-11835338)
chr7 (15-217)||(39277929-39278117)
chr7 (20-157)||(24683245-24683382)
chr7 (14-239)||(24682430-24682654)
chr7 (14-195)||(34872756-34872923)
chr7 (39-239)||(21598105-21598306)
chr7 (68-195)||(49144961-49145088)
chr7 (20-195)||(27733880-27734041)
chr7 (190-238)||(33637028-33637076)
chr7 (106-189)||(19327247-19327329)
chr7 (31-147)||(35074761-35074876)
chr7 (89-197)||(34406727-34406835)
chr7 (87-197)||(15236310-15236420)
chr7 (89-197)||(15236614-15236722)
chr7 (89-163)||(15236493-15236567)
chr7 (14-103)||(34989419-34989502)
chr7 (144-197)||(32200184-32200237)
chr7 (144-197)||(32200408-32200461)
chr7 (144-197)||(32200788-32200841)
chr7 (144-197)||(32200990-32201043)
chr7 (89-197)||(2733600-2733708)
chr7 (89-197)||(2734056-2734164)
chr7 (89-197)||(2734357-2734465)
chr7 (107-195)||(29953957-29954045)
chr7 (118-197)||(16717853-16717932)
chr7 (118-197)||(17692063-17692142)
chr7 (89-163)||(16718072-16718146)
chr7 (89-163)||(17692282-17692356)
chr7 (89-162)||(2733755-2733828)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (20-247)||(26171-26384)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (20-240)||(14332-14538)
[»] scaffold2127 (1 HSPs)
scaffold2127 (20-195)||(641-816)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (14-240)||(8327-8539)
scaffold0484 (14-195)||(8986-9171)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (14-247)||(55237-55456)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (21-195)||(232249-232423)
scaffold0009 (20-239)||(232881-233113)
scaffold0009 (124-247)||(139349-139472)
scaffold0009 (14-96)||(139267-139349)
[»] scaffold0115 (3 HSPs)
scaffold0115 (14-240)||(14690-14902)
scaffold0115 (14-195)||(3689-3856)
scaffold0115 (14-195)||(11429-11596)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (14-247)||(17545-17765)
scaffold0057 (21-195)||(18217-18391)
[»] scaffold0381 (2 HSPs)
scaffold0381 (14-195)||(10154-10335)
scaffold0381 (20-239)||(10903-11121)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (31-247)||(2989-3191)
scaffold0032 (31-195)||(3765-3929)
scaffold0032 (14-74)||(10335-10395)
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (14-195)||(9524-9705)
scaffold0079 (14-104)||(8864-8954)
scaffold0079 (117-163)||(8819-8865)
[»] scaffold0432 (2 HSPs)
scaffold0432 (77-197)||(5490-5610)
scaffold0432 (144-197)||(5616-5669)
[»] scaffold0759 (1 HSPs)
scaffold0759 (199-247)||(3569-3617)
[»] scaffold0180 (8 HSPs)
scaffold0180 (111-200)||(213-302)
scaffold0180 (111-200)||(4533-4622)
scaffold0180 (111-197)||(4217-4303)
scaffold0180 (111-200)||(4317-4407)
scaffold0180 (116-197)||(4014-4095)
scaffold0180 (117-200)||(3-87)
scaffold0180 (111-190)||(105-184)
scaffold0180 (111-190)||(4425-4504)
[»] scaffold0089 (16 HSPs)
scaffold0089 (111-200)||(249-338)
scaffold0089 (117-200)||(22141-22225)
scaffold0089 (111-190)||(21936-22015)
scaffold0089 (115-190)||(22448-22523)
scaffold0089 (111-200)||(33-123)
scaffold0089 (117-190)||(20673-20746)
scaffold0089 (111-190)||(141-220)
scaffold0089 (115-166)||(20805-20856)
scaffold0089 (115-190)||(21202-21277)
scaffold0089 (111-190)||(21520-21599)
scaffold0089 (111-197)||(20558-20644)
scaffold0089 (111-197)||(21821-21907)
scaffold0089 (111-199)||(20884-20973)
scaffold0089 (117-190)||(21628-21701)
scaffold0089 (117-173)||(21111-21167)
scaffold0089 (117-189)||(22253-22325)
[»] scaffold0090 (5 HSPs)
scaffold0090 (89-197)||(13407-13515)
scaffold0090 (89-197)||(13569-13677)
scaffold0090 (89-197)||(13717-13825)
scaffold0090 (89-197)||(13872-13979)
scaffold0090 (89-197)||(14026-14134)
[»] scaffold0368 (2 HSPs)
scaffold0368 (20-104)||(673-751)
scaffold0368 (106-154)||(739-787)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (87-197)||(9624-9734)
scaffold0246 (89-163)||(9781-9855)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (106-185)||(200930-201011)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28979983 - 28979751
Alignment:
Q  1 cttattttaagtaagtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979983 cttattttaagtaagtaagattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatag 28979884  T
Q  101 ggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatat 200  Q
    |              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979883 g--------------attaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatat 28979798  T
Q  201 tacaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  28979797 tacaatagttgttatgttattttttatgtaatgctttaagctctgtg 28979751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55293766 - 55293591
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  55293766 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaataggctta 55293667  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55293666 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatatagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 55293591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29529115 - 29528896
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  29529115 agtaaaattaaggagaaaatttagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 29529025  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29529024 -----aatacagtaaaattaagaaaagaagttaggttaaattttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 29528930  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29528929 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 29528896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48520019 - 48519800
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  48520019 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgacttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 48519929  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48519928 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttatgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 48519834  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48519833 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 48519800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26776799 - 26776580
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  26776799 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 26776709  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26776708 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggaaaaattttgcgttcggattaactttaaggaatatgatattacaatagttgtt 26776614  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  26776613 atgttattttttatgcagtgttttaggctctgtg 26776580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19893542 - 19893332
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
T  19893542 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 19893452  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  19893451 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggtcaaaattttgcattcgggttaactttaaggaataagagattacaataattgtt 19893357  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgcttta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19893356 atgttattttttatgtagtgcttta 19893332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 39094235 - 39094429
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |    
T  39094235 attaaggagaaaaattatgagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------a 39094320  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094321 atatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattacaatagttgttatgtta 39094420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40822093 - 40821913
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40822093 agtaaaattaaggtgaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaattaaata 40821994  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaata 194  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  40821993 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgcgttcgggttagctttaaggaata 40821913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 52842864 - 52843074
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                
T  52842864 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataag------------ 52842951  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52842952 --attaatacagtaaaattaagcaaagaagttaagttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattacaatagttgtt 52843049  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||    
T  52843050 atatta-tttttatgtagtgttttag 52843074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8527177 - 8526996
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8527177 agtaaaattaaagagaaaaattaggagctatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacagggttaattaaata 8527078  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  8527077 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccgcgttaactttaagaaataa 8526996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 35855828 - 35856009
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35855828 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaaagttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 35855927  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  35855928 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagtgcaaaattttgcgttcgggttaactttcaaaaataa 35856009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4137766 - 4137554
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             
T  4137766 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgatttccttaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatatggtt--------- 4137676  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4137675 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcaagggcaaaattttgcgttcggattaactttaaggaatatgatattacaatagttgtt 4137581  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4137580 atgttattttttatgtagtgctttagg 4137554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 8396443 - 8396662
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  8396443 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcaatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaattgggtt--------- 8396533  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8396534 -----aatacagtaaaattaagtaaagaagttaggttaaatctagagcaaaattttgcgtttaagttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 8396628  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8396629 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 8396662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29529862 - 29529681
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  29529862 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaatgttaacattttgatcaaattaaacagggttaattaaata 29529763  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29529762 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaaaaaataa 29529681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Original strand, 35860685 - 35860900
Alignment:
Q  17 aagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaatagga 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                
T  35860685 aagattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaactttaacattttgattaaattaaatagggtt------------ 35860771  T
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatg 216  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35860772 --aatacagtaaaattaagcaaaaaagttaagttaaatctatggcaaaattttgcgttcgggttaacttgaaggaataagagattgcaatagttgttatg 35860869  T
Q  217 ttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35860870 ttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 35860900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19368443 - 19368262
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19368443 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgataaaattaaatatggttaattaaata 19368344  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19368343 gggttaatacagtaaaattaagtaaagaagttaggttaattctagggtaaaattttgcgtctgggttaactttaagaaataa 19368262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 55290758 - 55290548
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||          
T  55290758 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttaatttccctaacaattaaccttaacattttgattaaattaaatagggttaat------ 55290665  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  55290664 ----------agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagctgtt 55290575  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  55290574 atgttattttttatgtagtgttttagg 55290548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19361090 - 19360879
Alignment:
Q  22 taaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaat 121  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              ||||||    
T  19361090 taaggagaaaaattagaagtgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataag--------------attaat 19361005  T
Q  122 acagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttatt 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19361004 acaataaaattaagcaaagaagttaggttaaatctttggcaaaattttgcgttcaggttaactttaaggaataagatattataagagttgttatgttatt 19360905  T
Q  222 ttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||    
T  19360904 ttttatgtagtgttttaggctctgtg 19360879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 22521931 - 22522150
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22521931 agtaaaattatggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatatggatgatttaata 22522030  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag---aaataagata----ttacaat 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||     || |||    
T  22522031 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttagg------ttaggacaaaattttgcgttcgggttatctttaaggaataataagataagatatataat 22522124  T
Q  207 agttgttatgttattttttatgtagt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22522125 agttgttatgttattttttatgtagt 22522150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 189
Target Start/End: Original strand, 9373137 - 9373300
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9373137 attaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttcctaaacaattaa------cattttgattaaattaaatagggttaattaaatagggtta 9373230  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag 189  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9373231 atatagtaaaattaagcaaagaagttaagttaaatttagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaag 9373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26101111 - 26100923
Alignment:
Q  45 ttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagt 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||    
T  26101111 ttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaatagggtt--------------aatacagtaaaattaagcaaagaagt 26101026  T
Q  145 taggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggttct 244  Q
    || ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  26101025 taagttaaatcttgggcaaaattttacgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgttatgttattttttatgtagtgttttaagctct 26100926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 53802041 - 53802260
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  53802041 agtaaaattaagaagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgatttccctaccaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 53802131  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53802132 -----aatacagtaatattaagcagagaagttatgttaaatctatgacaaaattttgcgttcgaattaactttaaggaataagatattaaaatagttgtt 53802226  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53802227 atgttattttttatgcagtgctttaggctctgtg 53802260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 53801520 - 53801660
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  53801520 agtaaaattaaagagaaaaattatgagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacaaggttaattaaata 53801619  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaat 154  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53801620 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaat 53801660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26101767 - 26101600
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  26101767 agtaaaattaaggagaaaaattaaaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggg----------- 26101679  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26101678 ---ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattttagagcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 26101600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 36006487 - 36006663
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36006487 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattttcataacaattaac------attttgattaaattagatagggttaattaaata 36006580  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    || | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36006581 gggt-aatatagtaaaattaagcaaagatgctaggttaaatctatgacaaatttttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 36006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 39093603 - 39093727
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39093603 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttttttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttaattaaattaaacagggttaattaaata 39093702  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39093703 ggattaatacagtaaaattaagcaa 39093727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19361723 - 19361556
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||               
T  19361723 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaatgttaacattttgattaaattaaataggg----------- 19361635  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19361634 ---ttaatatggtaaaattaagcaaagaagtttggttaattctatggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 19361556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 9373961 - 9374123
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||             
T  9373961 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccataacaattaac------attttgattaaattaaatagggtt--------- 9374045  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
         |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  9374046 -----aatataataaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttc-gattaactttaaggaataaga 9374123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4138729 - 4138621
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  4138729 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacgattaacattaacattttgattaaattaaacaggattaattaaata 4138630  T
Q  114 ggattaata 122  Q
    || ||||||    
T  4138629 gggttaata 4138621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 51656547 - 51656384
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||             
T  51656547 agtaaaattaaggagaaaaattaagagcgatttgtttattttgatttccataacaattaac------attttgattaaattaaatagggtt--------- 51656463  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
         |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||    
T  51656462 -----aatatagtaaaattaagcaaagaatttaggttaaatctagggcaaaattttgtgttcggattaactttaacgaataaga 51656384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14555715 - 14555611
Alignment:
Q  88 ttaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttta 187  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  14555715 ttaaattaaataaggttaattaaatagggttaatatagtaaaattaaacaaaaaagttaggttaaatctagaataaaattttgcgttcgggttaacttta 14555616  T
Q  188 agaaa 192  Q
    |||||    
T  14555615 agaaa 14555611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Original strand, 9373839 - 9373929
Alignment:
Q  108 taaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttc-tggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  9373839 taaatcggattaatatagtataattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcattcggggttaactttaaggaataaga 9373929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Original strand, 9373537 - 9373620
Alignment:
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9373537 ggattaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagtgaaattttttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 9373620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Original strand, 46489291 - 46489382
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgattt-gtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46489291 agtaaaattaaggagaaaaattaggagctacttagttcattttaatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaatagggtt 46489382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16040711 - 16040631
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||    
T  16040711 attaaataggattaatatagtaaaattaagtagagaaattaggttaaatttagagcaaaattttgcttacgggttaacttt 16040631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40822253 - 40822145
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||||||    
T  40822253 taaattaaataggtttaattaaacaagagtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggttaactttaa 40822154  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  40822153 taaataaga 40822145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 53521737 - 53521860
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||             
T  53521737 agtaaaattaaggaaaaaaattaggagcgatttgtttatttcgatttccataacaattaac------attttgattaaattaaatagggtt--------- 53521821  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaattta 157  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53521822 -----aatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaattta 53521860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40822413 - 40822305
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  40822413 taaattaaataggtttaattaaacaggagtaatacagtaaaagtaaacatagaatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 40822314  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  40822313 taaataaga 40822305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19367803 - 19367744
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaa 73  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19367803 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaa 19367744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40817377 - 40817322
Alignment:
Q  192 ataagatattacaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40817377 ataagagattacaatagttgttatattattttttatgtagtgctttaggctctgtg 40817322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 53521986 - 53522096
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaa--ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctgg 178  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||  |||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| || | || |||||| ||    
T  53521986 attttgattaaattaaataggattaattaaatataggggtaatacagtaaaattaagcaatagggttcggttaaatttagggtaacaattagcgttcggg 53522085  T
Q  179 ttaactttaag 189  Q
    |||||||||||    
T  53522086 ttaactttaag 53522096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 53522285 - 53522395
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaa--ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctgg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||| || | || |||||| ||    
T  53522285 attttgattaaattaaatagggttaattaaatataggggtaatacagtaaaattaagcattagggttaggttaaatctagggtaacaattagcgttcggg 53522384  T
Q  179 ttaactttaag 189  Q
    |||||||||||    
T  53522385 ttaactttaag 53522395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Original strand, 18688526 - 18688571
Alignment:
Q  202 acaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18688526 acaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 18688571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 200
Target Start/End: Original strand, 53927522 - 53927633
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| ||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || |||| | |||||||| |||    
T  53927522 taaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacaataaaagtaagcataaaatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggttaactgtaa 53927621  T
Q  189 gaaataagatat 200  Q
     |||||||||||    
T  53927622 taaataagatat 53927633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55369627 - 55369548
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | || |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  55369627 taatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccaggttaactttaataaataaga 55369548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38362143 - 38362057
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | | | ||||||||||| |||||||    
T  38362143 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatatagggcaaaatattgcttacggattaactttaagtaataaga 38362057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16047066 - 16046978
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| || || |||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  16047066 attaaatagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattaagttaaatata-ggaaaaattttgcttacaggttaactttaagtaataa 16046978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 202
Target Start/End: Original strand, 49067908 - 49068021
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  49067908 taaattcaataggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 49068007  T
Q  189 gaaataagatatta 202  Q
     |||||||| ||||    
T  49068008 taaataagagatta 49068021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Original strand, 9373771 - 9373819
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaaca 68  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9373771 attaaggagaaaaattaggagtgatttgtttattttgattttcataaca 9373819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 53927265 - 53927373
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||| |||||| | || ||| |||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  53927265 taaattaaataggtttaattaaacatggttaatacagtaaaagtaagcatataatttatgttaaaattagggcaatagttaacgtccgggttaactttaa 53927364  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  53927365 taaataaga 53927373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 9374197 - 9374268
Alignment:
Q  132 taagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaac-tttaagaaataagatatta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9374197 taagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttaaattccggttaacttttaagaaataagagatta 9374268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Original strand, 9373457 - 9373503
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattt 60  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9373457 agtaaaattaaggagaaaaattaggagtgatttgtttattttgattt 9373503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16062581 - 16062531
Alignment:
Q  147 ggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  16062581 ggttaaatttagggcaaaattttgcttacgggttaactttaagtaataaga 16062531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38362243 - 38362157
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | |  |||||||||||| |||||||    
T  38362243 atagggttaatataataaaattaagcagagaaattagggtaaatctagggcaaaatattgcttacgtgttaactttaagtaataaga 38362157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38362443 - 38362357
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||| |||| |||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  38362443 atagggttaatatagtaaaattaagcagaaaaattagggtaaatataggacaaaatattgcttacgggttaactttaagtaataaga 38362357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Original strand, 49453788 - 49453874
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  49453788 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctaggaaaaaatattgcttacgggttaactttaagtaataaga 49453874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38362530 - 38362457
Alignment:
Q  124 agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  38362530 agtagaattaagcagagaaattagggtaaatctagggcaaaatattgcttacgggttaactttaagtaataaga 38362457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 36946736 - 36946812
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||  ||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| |||||||||    
T  36946736 attaaattaaataggtttaattaaacaggggtaatatagtaaaaataagcatataatttaggttaaaattagggcaa 36946812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38362337 - 38362257
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| | |||| |||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  38362337 ttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatataggactaaatattgcttacgggttaactttaagtaataaga 38362257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Original strand, 49453894 - 49453974
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||| |||  | | ||||||||||||| |||||||    
T  49453894 ttaatatagtaaaattaaacagagaaattaggataaatttaggacaaaatattgtttacgggttaactttaagtaataaga 49453974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Original strand, 36946455 - 36946534
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||| | || |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  36946455 taatagagtaaaagtaagtatagaatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggttaactttaataaataaga 36946534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55369782 - 55369703
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || |||| | | |||||||||| ||||||||    
T  55369782 taatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccggattaactttaataaataaga 55369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 153
Target Start/End: Original strand, 36946579 - 36946645
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaa 153  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||  ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  36946579 attaaattaaataggtttaattaaacaggggtaatagagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaa 36946645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16036482 - 16036429
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagg 159  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  16036482 attaaatagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattaagttaaatctagg 16036429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 36006750 - 36006834
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaa--ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||    
T  36006750 attttaattaaattaaatagggttaattaaatataggggtaatatagtaaaattaagcattagggttaggttaaatctagggcaa 36006834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40822715 - 40822642
Alignment:
Q  90 aaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    |||||||||||| || |||||| |||  ||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  40822715 aaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacaataaaagtaagcatagaatttatgttaaaattagggcaa 40822642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 104
Target Start/End: Original strand, 9374144 - 9374172
Alignment:
Q  76 ttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9374144 ttaacattttgattaaattaaatagggtt 9374172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 2182517 - 2182744
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2182517 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagagttaattaaata 2182616  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2182617 gggttaatacaggaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcatattaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 2182716  T
Q  214 atgtta-ttttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2182717 atgttatttttttctgtagtgctttagg 2182744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33705119 - 33704908
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  33705119 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 33705029  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33705028 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 33704934  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33704933 atgttattttttatgtagtgctttag 33704908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 41692820 - 41693039
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41692820 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 41692910  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41692911 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattacaatagttgtt 41693005  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41693006 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 41693039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 34719136 - 34719355
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  34719136 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 34719226  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34719227 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 34719321  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34719322 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 34719355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25695901 - 25695689
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  25695901 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 25695811  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25695810 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 25695716  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  25695715 atattattttttatgtagtgttttagg 25695689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36885144 - 36884925
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
T  36885144 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaaccttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 36885054  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36885053 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 36884959  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36884958 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 36884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42975753 - 42975534
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  42975753 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 42975663  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42975662 -----aatacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaattttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 42975568  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  42975567 atgttattttttatgtagtattttaggctctgtg 42975534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 753174 - 752999
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  753174 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 753075  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  753074 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 752999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43137379 - 43137204
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  43137379 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 43137280  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43137279 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 43137204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12419556 - 12419376
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12419556 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaat-gggttaattaaata 12419458  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12419457 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 12419376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 753923 - 753742
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  753923 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaaagttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 753824  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  753823 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 753742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 2181778 - 2181959
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  2181778 agtaaaattaaagagaaaaattaggagtgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacaggattaattaaata 2181877  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2181878 ggattaatacattaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggcaaaattttacgttcgggttaactttaagaaataa 2181959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6304917 - 6304736
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  6304917 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacaatgttaattaaata 6304818  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6304817 tggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcggattaactttaagaaataa 6304736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 30181106 - 30181308
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||| ||||||    
T  30181106 aaattaggagcgatttgtttaatttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------aatactgtaaaa 30181191  T
Q  131 ttaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgta 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30181192 ttaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgttatgttattttttatgca 30181291  T
Q  231 gtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  30181292 gtgttttaggctctgtg 30181308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43138017 - 43137836
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  43138017 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 43137918  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43137917 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaagttttgcgttcgggttaactttaagaaataa 43137836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26601661 - 26601481
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  26601661 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccttaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacatggttaattaaata 26601562  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26601561 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaa-tttacgttcgggttaactttaagaaataa 26601481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 30180365 - 30180539
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || |||||||||| ||||    
T  30180365 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgtttaagttaaacatgattaattaaatagggttaa 30180464  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30180465 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttggggttaactttaagaaataa 30180539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 34717866 - 34718040
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  34717866 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaa 34717965  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34717966 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 34718040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34725623 - 34725405
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  34725623 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 34725533  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34725532 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctatgacaaaattttgtgttcggattaactttaaggaataagatattacaatagttgtt 34725438  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34725437 atgttat-ttttatgcagtgctttaggctctgtg 34725405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43136637 - 43136427
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  43136637 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 43136548  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  43136547 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 43136453  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43136452 atgttattttttatgtagtgctttag 43136427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42977020 - 42976839
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  42977020 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacatggttaattaaata 42976921  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  42976920 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccggtataactttaagaaataa 42976839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17637049 - 17636837
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
T  17637049 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttcccgaacaattaacattaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 17636959  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  17636958 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttatgttaaatcttgggcaaaattttgcattcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtc 17636864  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17636863 atgttattttttatgtagtgttttagg 17636837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3087533 - 3087352
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  3087533 agtaaaattaaagagaaaaattaagagtgatttgtttattttgatttccccaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacatggttaattaaata 3087434  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3087433 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattccagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 3087352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17637804 - 17637624
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  17637804 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacagggttaattaaata 17637705  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17637704 gggttaata-agtaaaattaagcaaagaagttaggttaattcaatggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 17637624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33705752 - 33705571
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||    
T  33705752 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgtttacattttgattaaattaaacatggttatttaaata 33705653  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33705652 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggtttaatctatggaaaaattttacgttcgggttaactttaagaaataa 33705571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34726374 - 34726200
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34726374 agtaaaattaaagagaaaaattagaagtgatttgtttattttgatttccctaataattaacgttaaaattttgattaaattaaacagggttaattaaata 34726275  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34726274 gggttaatacagtaaaatttagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcggtttaactttaa 34726200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 41691550 - 41691724
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||| ||||    
T  41691550 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacatgattaattaaatagggttaa 41691649  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41691650 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggtcaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 41691724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25696520 - 25696351
Alignment:
Q  26 gagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacag 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||| |||||||||    
T  25696520 gagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacatgattaattaaatagggttaatacag 25696421  T
Q  126 taaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25696420 taaaattaagcaaagaaattaggttaaatctaggacaaatttttgagttcgggttaactttaagaaataa 25696351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36885893 - 36885716
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  36885893 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttatttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgatcaaattaaacatggttaattaaata 36885794  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  36885793 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttccg----ggttaactttaagaaataa 36885716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42976384 - 42976217
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  42976384 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggg----------- 42976296  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42976295 ---ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 42976217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 752432 - 752208
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||    
T  752432 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaactaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaatgcagta 752334  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaag-caaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgt 212  Q
      |||||  ||   || ||| |  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  752333 aaattaa-gcaaataagttaggttaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttat 752235  T
Q  213 tatgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  752234 tatgttattttttatgtagtgttttag 752208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6304167 - 6304045
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  6304167 attaaagagaaaaattaggagcgatttatttattttgattttcctaacaattaacgttaatattttgattaaattaaacaggattaattaaatagggtta 6304068  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6304067 atacagtaaaattaagcaaagaa 6304045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3086779 - 3086586
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||             
T  3086779 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaac------attttgattaaattaaatagggtt--------- 3086695  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3086694 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaattt------------tgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 3086612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3890422 - 3890316
Alignment:
Q  91 aattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3890422 aattaaatagggttaattaaataaggttaaaataataaaattaagcaaagaagttaggttaaatctatgacaaaattttgcgttcgggttaactttaaga 3890323  T
Q  191 aataaga 197  Q
    |||||||    
T  3890322 aataaga 3890316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 38937351 - 38937514
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||             
T  38937351 agtaaaattaaggagaaaaattaggggcgatttgtttatttcgatttccataacaattaac------attttgattaaattaaatagggtt--------- 38937435  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
         |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38937436 -----aatatagtaaaattaagtaaagaagttaggttaaatctatggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 38937514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 202
Target Start/End: Original strand, 16683432 - 16683527
Alignment:
Q  107 ttaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16683432 ttaaatagggttaatatagtaaaattaagcaaaggagttaggttaaatctagggcaaaattatgcgttcgggttaactttaaggaataagagatta 16683527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27440944 - 27440854
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27440944 agtaaaattaaggagaaaaattaagagcgatttgttcattttgatttccctaacaattaacattaatattttgattaaattaaatagggtt 27440854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 202
Target Start/End: Original strand, 16679864 - 16679960
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16679864 attaaatagggttaatatagtaaaattaagcaaaggagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcatattaactttaaggaataagagatta 16679960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3890304 - 3890201
Alignment:
Q  94 taaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaat 193  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  3890304 taaatagggttaattaaatagggttaaaatagtaaaattaagcaaagaatttgggttaaatctagagcaaaattttgcgttcgggttaacattaaggaat 3890205  T
Q  194 aaga 197  Q
    ||||    
T  3890204 aaga 3890201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Original strand, 16679637 - 16679801
Alignment:
Q  18 agattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggat 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||      ||||||||||||||||||||||||                 
T  16679637 agattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccacatcaattaac------attttgattaaattaaatagggtt------------- 16679717  T
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
     |||| ||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16679718 -aatatagtaaaattaagcaaacgatttaggtaaaatctagggcaaaattttgcgttcggattaactttaaggaataagaaatta 16679801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Original strand, 39915370 - 39915460
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39915370 agtaaaattaagaaaaaaaattaggagcgatttgttcattttgatttccctaccaattaacattagcattttgattaaattaaatagggtt 39915460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41289942 - 41289838
Alignment:
Q  91 aattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||||| ||||| ||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41289942 aattaaat-gggttaattaaatatagttaaaatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttacgttc-ggttaactttaaga 41289845  T
Q  191 aataaga 197  Q
    |||||||    
T  41289844 aataaga 41289838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Original strand, 30755418 - 30755491
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttga 87  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30755418 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccataacaattaacgttaacattttga 30755491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Original strand, 38096799 - 38096915
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggtt 180  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | || |||| | ||||    
T  38096799 attttgattaaattaaataggtttaattaaacatgggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggtt 38096898  T
Q  181 aactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||||| ||||||    
T  38096899 aactttaagagataaga 38096915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41290039 - 41289948
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  41290039 attaaatagggttaaaatagtaaaattaagcaaagaaattaggttaaatatagggcaaaaatttgcattcgggttaactttaaagaataaga 41289948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 16685461 - 16685512
Alignment:
Q  124 agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttc 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16685461 agtaaaattaagcaaaggagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttc 16685512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 202
Target Start/End: Original strand, 16679547 - 16679642
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | | || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16679547 attaaatagggttaatatagtaaaattaagcaaatga-taagtttaaatctagggcaaaattttgcgtttgggttaactttaaggaataagagatta 16679642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 38096953 - 38097054
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||||    
T  38096953 attaaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaagcataaaatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggttaacttt 38097052  T
Q  187 aa 188  Q
    ||    
T  38097053 aa 38097054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Original strand, 35393466 - 35393582
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggtt 180  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| | |  ||||||| ||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || |||| | ||||    
T  35393466 attttgattaaattaaatatgtttaattaaacaagggtaatacaataaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggtt 35393565  T
Q  181 aactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||| ||||||||    
T  35393566 aactttaataaataaga 35393582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 35393629 - 35393737
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || |||| | |||||| |||||    
T  35393629 taaattcaataggtttaattaaataggggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggttaaatttaa 35393728  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  35393729 taaataaga 35393737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Original strand, 38096653 - 38096769
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggtt 180  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| ||||| |||||| | || |||||||||| ||| ||||| | ||  ||| | ||||    
T  38096653 attttgattaaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacattaaaagtaagcataaaatttaggttaaaattatggcaacagttaacgtccgggtt 38096752  T
Q  181 aactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||| ||||||||    
T  38096753 aactttaataaataaga 38096769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Original strand, 17547713 - 17547823
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    |||||||  |||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || | || | ||||||||||    
T  17547713 attaaatataataggtttaattaaataggggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacaattagtgtccgggttaacttt 17547812  T
Q  187 aagaaataaga 197  Q
    || ||||||||    
T  17547813 aataaataaga 17547823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 202
Target Start/End: Original strand, 35394267 - 35394380
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || |||| | |||||| | |||    
T  35394267 taaatttaataggtttaattaaacaggaataatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccaggttaaatataa 35394366  T
Q  189 gaaataagatatta 202  Q
    || |||||| ||||    
T  35394367 gagataagagatta 35394380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 17547410 - 17547518
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  17547410 taaattaaataggtttaattaaatatgggtaatatagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 17547509  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  17547510 taaataaga 17547518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 35394108 - 35394215
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||  ||||  | || |||||| ||||||||||||    
T  35394108 taaattaaataggtttaattaaataggggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttatgttaaaatt-cggcaccagttagcgttcgggttaactttaa 35394206  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  35394207 taaataaga 35394215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 189
Target Start/End: Original strand, 38939117 - 38939222
Alignment:
Q  86 gattaaattaaatagggttgattaaata--ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaac 183  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  ||  ||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |||||||    
T  38939117 gattaaattaaatagggttaatcaaatataggggtaatacagtaaaattaagcattagggttaggttaaatctagggcaacaattaccgttcgggttaac 38939216  T
Q  184 tttaag 189  Q
    ||||||    
T  38939217 tttaag 38939222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 16679798 - 16679838
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattt 60  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16679798 attaaggagaaaaattaggagcaatttgtttattttgattt 16679838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 41041942 - 41042050
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  41041942 taaattcaataggtttaattaaaaaagggtaatacagtaaaaataagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 41042041  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  41042042 taaataaga 41042050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Original strand, 41041800 - 41041879
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  41041800 taatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaataaataaga 41041879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5079877 - 5079807
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||| ||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  5079877 taatacattaaaattaaccattaaaattaggttaaatatagggcaacattttgcattctgattaactttaa 5079807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32719315 - 32719207
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  32719315 taaattcaataggtttaattaaacatgggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 32719216  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
      |||||||    
T  32719215 ttaataaga 32719207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 41978523 - 41978749
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41978523 agtaaaattaaagagaaaaattatgagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 41978622  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41978623 gggttaatacagtaaaattaagcgaagaagttaggttaaaattagggcaaaattctgtgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 41978722  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41978723 atgtaattttttatgtagtgctttagg 41978749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 36778158 - 36778377
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  36778158 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 36778248  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36778249 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 36778343  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36778344 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 36778377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18375915 - 18375709
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |    
T  18375915 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------a 18375830  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18375829 atactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgttatatta 18375730  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  18375729 ttttttatgtagtgttttagg 18375709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 9473801 - 9474020
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  9473801 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 9473891  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9473892 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgtgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 9473986  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9473987 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 9474020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4465462 - 4465281
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  4465462 agtaaaattaaagagaaaaattatgagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacatggttaattaaata 4465363  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4465362 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 4465281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 12761168 - 12761349
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12761168 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttaattaaattaaacagggttaattaaata 12761267  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12761268 gggttaatacagtaaaattaaacaaacaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 12761349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 1944126 - 1944301
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1944126 attaaagagaaaaattaagagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaattaaatagggtta 1944225  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1944226 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 1944301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8161503 - 8161328
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  8161503 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 8161404  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8161403 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 8161328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 8761950 - 8762125
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  8761950 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 8762049  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8762050 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 8762125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 25361193 - 25361405
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  25361193 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 25361283  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  25361284 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaattttgggcaaaattttgccttcgggttaactttaaggaataagatattagaacagttgtt 25361378  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25361379 atgttattttttatgtagtgttttagg 25361405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25835102 - 25834927
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  25835102 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 25835003  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25835002 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 25834927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8162252 - 8162071
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  8162252 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 8162153  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8162152 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 8162071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 8761312 - 8761493
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  8761312 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 8761411  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8761412 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 8761493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25835740 - 25835559
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  25835740 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 25835641  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25835640 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 25835559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 24055518 - 24055730
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             
T  24055518 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttaattaaattaaatagggtt--------- 24055608  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24055609 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgagttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 24055703  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24055704 atgttattttttatgtagtgttttagg 24055730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 7390996 - 7391215
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  7390996 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgatttccctaataattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 7391086  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7391087 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaagttaaatctatggcaaaattttgcgttcggattaactttaaggaataagatattacaatagttgtt 7391181  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7391182 atgttattttttatgtagtgctctaggctctgtg 7391215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44381076 - 44380857
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
T  44381076 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttagtttgatttccgtaacaattaacattaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 44380986  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44380985 -----aatacagtaaaattaagcaaaaaagttaggttaaatctagagcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 44380891  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44380890 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 44380857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 1943377 - 1943558
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  1943377 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 1943476  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1943477 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttacgttcgggttaactttaagaaataa 1943558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 7390248 - 7390429
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7390248 agtaaaattaaagagaaaaattatgagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 7390347  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  7390348 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaacttttcattcgggttaactttaagaaataa 7390429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44381777 - 44381597
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  44381777 agtaaaattaaggagaaaaattaggaccgatttgtttattttgatatccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacaggtttaattaaata 44381678  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaata 194  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44381677 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaaattaggttaaatctaaggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaata 44381597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 32845513 - 32845688
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  32845513 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttctctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 32845612  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32845613 ctacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 32845688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 8762692 - 8762902
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  8762692 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 8762781  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  8762782 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 8762876  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8762877 atgttattttttatgtagtgctttag 8762902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 32844762 - 32844944
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacatttt-gattaaattaaatagggttgattaaat 112  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||    
T  32844762 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacatttttgattaaattaaacagtgttaattaaat 32844861  T
Q  113 aggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32844862 atggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 32844944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42244699 - 42244488
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||             
T  42244699 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttgacattttgattaaattaaatagggtt--------- 42244609  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42244608 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggtaaaattttacgttccggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 42244514  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  42244513 atgttattttttatgtagtgttttag 42244488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 32846140 - 32846321
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  32846140 agtaaaattaaagaaaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 32846239  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32846240 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaaaaataa 32846321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 36777519 - 36777700
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  36777519 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacatggttaattaaata 36777618  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  36777619 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccgagttaactttaagaaataa 36777700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40586805 - 40586601
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  40586805 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgttcattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 40586715  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40586714 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgagttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 40586620  T
Q  214 atgttattttttatgtagt 232  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  40586619 atgttatttttcatgtagt 40586601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 41158325 - 41158541
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||             
T  41158325 agtaaaattaaggagaaaaattatgagcgatttgtttattttgatttccctaa-aattaacgtt--cattttgattaaattaaatagggtt--------- 41158412  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41158413 -----aatgcagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 41158507  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41158508 atgttgttttttatgtagtgctttaggctctgtg 41158541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 25345672 - 25345891
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             
T  25345672 agtaaaattaaggagaaaatttatttgcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagtgtt--------- 25345762  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25345763 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgtgttcagattaacttcaaggaatatgatattacaatagttgtt 25345857  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25345858 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 25345891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41532132 - 41531922
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||             
T  41532132 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgattt-tttatgttgatttccctaacaattaacgtttacattttaattaaattaaataaggtt--------- 41532043  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41532042 -----aatacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttcggattaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 41531948  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41531947 atgttattttttatgtagtgctttag 41531922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 1944867 - 1945077
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  1944867 agtaaaattaaggagaaaaattaggaacgattt-tttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 1944956  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  1944957 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 1945051  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1945052 atgttattttttatgtagtgctttag 1945077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4464718 - 4464499
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  4464718 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgatttccctaccaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 4464628  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4464627 -----aatacagtaaaattaagcagagaagttatgttaaatctatggcaaaattttacgttcgaattaactttaaggaataagatattacaatagttgtt 4464533  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4464532 atgttattttttatgcagtgctttaggctctgtg 4464499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25618863 - 25618644
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  25618863 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgatttccctaacaatttacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 25618773  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25618772 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcatttgaattaactttaaggaatatgatattacaatagttgtt 25618678  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25618677 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 25618644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25834360 - 25834150
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  25834360 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 25834271  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  25834270 -----aatgcagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 25834176  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25834175 atgttattttttatgtagtgctttag 25834150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41532824 - 41532643
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  41532824 agtaaaattaaagagaaaaattagaaacgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacatggttaattaaata 41532725  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41532724 gggttaatacagtaaaattaagcaaaaaagttaggttaaatctatgacaaaattttgcgttcgggttaattttaagaaataa 41532643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 9473163 - 9473344
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  9473163 agtaaaattaaagagaaaaattaggaacgatttgtttattttgatttcccgaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacatggttaattaaata 9473262  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9473263 gggttaatacaataaaattaagcaaagaagttaagttaattctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 9473344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 41157589 - 41157761
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41157589 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaattaaata 41157688  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |  |||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41157689 gagttaatacagta---------aaagaagttaggttaaatttagggtaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 41157761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25619771 - 25619604
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25619771 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattc-gattaaattaaacagggttaattaaata 25619673  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaa 182  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  25619672 gggttaatacagtaaacttaagcaaataagttaggttaaatctaaggcaaaattttgcgttcgggttaa 25619604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8160780 - 8160572
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  8160780 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaactaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 8160691  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  8160690 -----aatgc--taaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 8160598  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8160597 atgttattttttatgtagtgctttag 8160572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 32846952 - 32847085
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaa 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  32846952 attaaatagggttaatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaatttttgctttcgagttaactttaaggaataagagattgcaa 32847051  T
Q  206 tagttgttatgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32847052 tagttattatgttattttttatgtagtgctttag 32847085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 34894088 - 34894262
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |               
T  34894088 agtaaaattaaggagaaaaattatgagcgatttgttcattttgatttccctaacaattaacattaagattttgattaaattaaatagtg----------- 34894176  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
       |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  34894177 ---ttaatatagtaaatttaagcaaggaaattaggttaaatttaaggcaaaattttgcgttcggtttaactttaaggaataagagatta 34894262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Original strand, 34894775 - 34894926
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaa 130  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||      |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||     
T  34894775 aaattaggagcaatttgttcattttgatttccataacaattaa------cattttgattaaattaaatatgattaattaaatagggttaatatagtaaat 34894868  T
Q  131 ttaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  34894869 ttaaacaaagaagttaggttaaatctatggcaaaattttactttcgggttaactttaa 34894926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 202
Target Start/End: Original strand, 34894571 - 34894667
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34894571 attaaatagggttaatatagtaaatttaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttacgttcaggttaactttaaggaataagagatta 34894667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37588406 - 37588310
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37588406 attaaatagggttaatatagtaaaattaagcaaaggagttaggttaaatctagggcaaaatttggcgttcgggttaactttaaggaataagagatta 37588310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37588315 - 37588144
Alignment:
Q  18 agattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggat 117  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |  | ||||||||      |||||||| |||||||||||| || |||||||| | |    
T  37588315 agattaaggagaaaaattagg-gcgatttgttcattttgatttccacaccaattaac------attttgatcaaattaaatagg-ttaattaaatatggt 37588224  T
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  37588223 taatatagtaaaattaagaaaatgagttaggttaaatctagggtaaaattttgcgttcggattaactttaatgaataaga 37588144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 34894275 - 34894359
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaata 99  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34894275 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatt-gttcattttgatttccctaacaattaacattaaaattttgattaaattaaata 34894359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44428537 - 44428432
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggtt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||| ||| ||||    
T  44428537 attttgattaaattaaatatggttaattaaatatggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggt--aatctaggacaaaatcttgcattcgggtt 44428440  T
Q  181 aactttaa 188  Q
     |||||||    
T  44428439 gactttaa 44428432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Original strand, 38295309 - 38295387
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38295309 attaaggagaaaaattaggagcgaattgtttactttgatttccataacaa------ttaacattttgattaaattaaatagggtt 38295387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Original strand, 18493154 - 18493270
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggtt 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||| || | ||| |||| |||||| |  |    
T  18493154 attttgattagattaaatagggttaattaaacaggggtaatatagtaaaattaatcatcaaagttaggttaaatctaagacaacatttagcgttcggaat 18493253  T
Q  181 aactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18493254 aactttaaggaataaga 18493270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 41843821 - 41843929
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || |||| | |||||| |||||    
T  41843821 taaattcaataggtttaattaaataggggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggttaattttaa 41843920  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  41843921 taaataaga 41843929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 195
Target Start/End: Original strand, 41843974 - 41844082
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||   ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||    
T  41843974 attaaattaaataggtttaattaaacagaggtaatacagtaaaagtaaacatagaatttaggttaaaattagggcaacagttaccgttcgggttaacttt 41844073  T
Q  187 aagaaataa 195  Q
    || ||||||    
T  41844074 aataaataa 41844082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 38295375 - 38295465
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || |||||| | ||| |||||| |||||| |||||||    
T  38295375 attaaatagggttaatatagtaaaattcagcaaagaagttaggttaaatctaagacacaattttactttcgggttaa-tttaaggaataaga 38295465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 16913968 - 16914075
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||| | || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || ||| || ||||||||||||    
T  16913968 taaattaaatatgtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttagcg-tccggttaactttaa 16914066  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  16914067 taaataaga 16914075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 41844173 - 41844249
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  41844173 attaaattaaataggtttaattaaacatgggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttagattaaaattagggcaa 41844249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37588131 - 37588040
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||| | |||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||| || | ||||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||    
T  37588131 attaaataaggttaatataataaaattaagaaaaagagttaggttaaatctatgacaaaattttacgttcggattaactttaatgaataaga 37588040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44428862 - 44428771
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| || | |||||| || | | | ||||||||||||| |||||||    
T  44428862 attaaatagaattaatatagtaaaattaagcagagaaattaaggtaaatctaagacaaaatattacttacgggttaactttaagtaataaga 44428771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Original strand, 32846888 - 32846933
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattt 60  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32846888 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttg-ttattttgattt 32846933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 172
Target Start/End: Original strand, 34894508 - 34894565
Alignment:
Q  115 gattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcg 172  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  34894508 gattaatatagtaaatttaagcgaagaagttgggttaattgtaaggcaaaattttgcg 34894565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37588034 - 37587961
Alignment:
Q  124 agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  37588034 agtaaaattaagaaaaagagttaggttacatctaaggtaaaattttacgttcgggttaactttaatgaataaga 37587961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Original strand, 34894684 - 34894736
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacatt 83  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  34894684 aaatgaggagcaatttgttcattttgatttccataacaattaacattaacatt 34894736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 37588422 - 37588394
Alignment:
Q  76 ttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37588422 ttaacattttgattaaattaaatagggtt 37588394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37588522 - 37588478
Alignment:
Q  158 gggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  37588522 gggcaaaattttgcgttcgggttaacttcaaggaataagagatta 37588478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24944511 - 24944285
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24944511 agtaaaattaaggataaaaattaggagcgatttgcttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaattaaata 24944412  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  24944411 gggttagtactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaattaaagattacaatagttgtt 24944312  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24944311 atgttattttttatgtagtgctttagg 24944285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 8531891 - 8532124
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8531891 agtaaaattaaggagaaaaattatgagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagtgttaattaaata 8531990  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
    || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  8531991 gggttaatacaataaaattaaacaaataagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgagttaactttagggaataagagattacaatagttgtt 8532090  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8532091 atgttattttttatgtagtactttaggctctgtg 8532124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39404968 - 39404736
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404968 agtaaaattaaggagaaaaattaggaacaatttatt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaattaaata 39404870  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  39404869 gaggtaatacagtaaaattaagcaaagaaattaggttaaatctagggtaaaattttgcgttcaggttaactttaaggaataaaagattgcaatagttgtt 39404770  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39404769 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 39404736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 20589997 - 20590178
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20589997 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 20590096  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20590097 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 20590178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24945025 - 24944850
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  24945025 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 24944926  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24944925 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 24944850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 17741341 - 17741560
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  17741341 agtaaaattaagaagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 17741431  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17741432 -----aatacagtaaaattaatcaaagaagttaggttaaatttagggaaaaattttgcgttccggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 17741526  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17741527 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 17741560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39713859 - 39713640
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  39713859 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 39713769  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39713768 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggccaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 39713674  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39713673 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 39713640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 13172627 - 13172846
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  13172627 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 13172717  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13172718 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 13172812  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  13172813 atgttattttttatgtaatgttttaggctctgtg 13172846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 52802612 - 52802831
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  52802612 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 52802702  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  52802703 -----aataccgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaatttagcgtttgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 52802797  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  52802798 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 52802831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24947747 - 24947566
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24947747 agtaaaattaaagagaaaaattaggaacgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaagagggttaattaaata 24947648  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24947647 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 24947566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 46105200 - 46105381
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  46105200 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttttttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 46105299  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46105300 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 46105381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 8988138 - 8988313
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  8988138 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 8988237  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8988238 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 8988313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12680998 - 12680786
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  12680998 agtaaaattaaggagaaaaattacgtgcgatttgtttattttgatttccctaataattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 12680908  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12680907 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctatggcaaaattttgcgttcggattaactttaaggaataagatattacaatagttgtt 12680813  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12680812 atgttattttttatgtagtgctttagg 12680786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36742163 - 36741951
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  36742163 agtaaaattaaggagaaaaattagaagtgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 36742073  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36742072 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 36741978  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36741977 atgttattttttatgtagtgttttagg 36741951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 37351038 - 37351213
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  37351038 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 37351137  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37351138 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 37351213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 3758958 - 3759177
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  3758958 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 3759048  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3759049 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 3759143  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||    
T  3759144 atgttattttttatttagtgttttacgctctgtg 3759177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 8987500 - 8987681
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  8987500 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 8987599  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8987600 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 8987681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 24548348 - 24548529
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  24548348 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacagggttaattaaata 24548447  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24548448 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttagattaattctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 24548529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 37350400 - 37350581
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  37350400 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 37350499  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37350500 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 37350581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 2117131 - 2117306
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||    
T  2117131 attaaagagaaaaattatgagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacatggttaattaaatagggtta 2117230  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2117231 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 2117306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 43023697 - 43023924
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||       |||||||| |||||| ||||||||    
T  43023697 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacattaacat-------aaattaaacagggttaattaaata 43023788  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  43023789 gggttaatacagtaatattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttgtt 43023888  T
Q  214 atgtta--ttttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43023889 atgttattttttttatgtagtgttttaggctctgtg 43023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 46106100 - 46106319
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  46106100 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgtgatttgtttattttgatttccctaataattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 46106190  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  46106191 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgtgttcggattaactttaaggaatatgatattacaatagttgtt 46106285  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46106286 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 46106319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9888390 - 9888209
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  9888390 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaaagttaacattttgattaaattaaacaatgttaattaaata 9888291  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9888290 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 9888209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 8964513 - 8964723
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  8964513 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 8964602  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  8964603 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 8964697  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8964698 atgttattttttatgtagtgctttag 8964723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 8988880 - 8989090
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  8988880 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 8988969  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  8988970 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 8989064  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8989065 atgttattttttatgtagtgctttag 8989090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 37351780 - 37351990
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  37351780 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 37351869  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  37351870 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 37351964  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37351965 atgttattttttatgtagtgctttag 37351990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 37356679 - 37356889
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  37356679 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 37356768  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  37356769 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 37356863  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37356864 atgttattttttatgtagtgctttag 37356889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 52801300 - 52801474
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  52801300 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttatttaaattaaacaggattaattaaataggattaa 52801399  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  52801400 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 52801474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47556420 - 47556239
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||    
T  47556420 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaatattttgattaaattaaacatggttatttaaata 47556321  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  47556320 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggaaaaaatttacgttcgggttaactttaagaaataa 47556239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50118431 - 50118219
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||             
T  50118431 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttcattaaattaaaaagggtt--------- 50118341  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50118340 -----aatacagtaaaattaagtaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaaatttaaggaataagatattataatagttgtt 50118246  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  50118245 atgttattttttatatagtgttttagg 50118219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 24549101 - 24549320
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  24549101 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 24549191  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24549192 -----aatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggaaaaattttgcattcgggttaaatttaaggaataagatattataatagttgtt 24549286  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  24549287 atgtcatttgttatgtagtgttttaggctctgtg 24549320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47555788 - 47555570
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||             
T  47555788 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttatttt-atttcccttacaattaacgttaatattttgattaaattaaatagggtt--------- 47555699  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  47555698 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctatgacaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataaaagattacaatagttgtt 47555604  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47555603 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 47555570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 50043016 - 50043226
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  50043016 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttatt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 50043105  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  50043106 -----aatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttatt 50043200  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  50043201 atgttattttttatgtagtgctttag 50043226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 20590681 - 20590894
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||             
T  20590681 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaactttaacattttgattaaattaaatagagtt--------- 20590771  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20590772 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttacgttcgggttaattttaaggaataagatattataatagttgtt 20590866  T
Q  214 atgtta-ttttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20590867 atgttatttttttatgtagtgttttagg 20590894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46419739 - 46419557
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  46419739 agtaaaattaaggagaaagattaggagcgatttgttgattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaata-ggttaattgaata 46419641  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  46419640 ggattaatatagtaaatttaagcaaagaagttaggttaaatctagggaaaacttttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 46419557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 3758313 - 3758494
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  3758313 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccttaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacatggttaattaaata 3758412  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  3758413 gggttaatacagtaaaattaagcaaaaaatttaggttaattctagggcaaaattttacgtccgggttaactttaagaaataa 3758494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39714525 - 39714357
Alignment:
Q  26 gagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacag 125  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||    
T  39714525 gagaaaaattaggagcgatt-gtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaatacag 39714427  T
Q  126 taaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39714426 taaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 39714357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50119069 - 50118888
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  50119069 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattacacatggttaattaaata 50118970  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  50118969 gggttgatacggtaaaattaagcaaagaagttatgttaattctagggcaaaatttggcgtccgggttaactttaagaaataa 50118888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Original strand, 16904665 - 16904829
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaa 130  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  16904665 aaattaggaatgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaatattttgattaaattaaacaaggttaattaaatagggttaatacattaaaa 16904764  T
Q  131 ttaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16904765 ttaagcaaaaaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgtttgggttaactttaagaaataa 16904829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 26603405 - 26603582
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||      |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26603405 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttatttcgatttccataacaattaa------cattttgattaaattagatagggttaattaaata 26603498  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26603499 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctatggcaaaattttgcgttcaggttaactttaaggaataaga 26603582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 2117868 - 2118087
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  2117868 agtaaaattaagaagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgatttccctaccaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 2117958  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2117959 -----aatacagtaatattaagcagagaagttatgttaaatctatgacaaaattttgcgttcgaattaactttaaggaataagatattataatagttgtt 2118053  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2118054 atgttattttttatgcagtgctttaggctctgtg 2118087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 43022967 - 43023135
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||       |||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  43022967 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacat-------aaattaaacagggttaattaaatagggtta 43023059  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43023060 atacagtaatattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgagttaactttaagaaataa 43023135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 29713510 - 29713714
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |    
T  29713510 attaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggggt--------------a 29713594  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||    
T  29713595 atacaataaaattaagcaaagaagttacgttaaatctagggtaaaattttgtgttcgggttaactttaaggaataagagattgcaataattgttatttta 29713694  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  29713695 ttttttatgtagtgttttag 29713714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39405698 - 39405531
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  39405698 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggg----------- 39405610  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39405609 ---ttaatacagtaaaattaagcaaagaatttaggttaaatctagggcaagattttgcattcgggttaactttaagaaataa 39405531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 49355435 - 49355261
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||    
T  49355435 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatctgtttattttgattt-cataacaattaacattaacattttgattaaattaagttggcttaattaatta 49355337  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag 189  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  49355336 gggttaatatagtcaaattaagcaaagaagttaggttaaatctatggcaaaattttgtgttcgggttaacattaag 49355261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 5755276 - 5755454
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||               
T  5755276 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataagg----------- 5755364  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaat 206  Q
       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5755365 ---ttaatacagtaaagttaagcaaagaagttaggttaaatctagggaaaaaatttgcgttcaagttaactttaaggaataagagattacaat 5755454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9887641 - 9887423
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  ||||    
T  9887641 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaactaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaatgcagtaaaatta 9887543  T
Q  120 atacagtaaaattaagc-aaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtt 218  Q
    |   | |||  ||| |  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  9887542 agcaaataag-ttaggttaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttattatgtt 9887444  T
Q  219 attttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9887443 attttttatgtagtgctttag 9887423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 30527853 - 30527733
Alignment:
Q  126 taaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttatttttt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30527853 taaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgttatgttatttttt 30527754  T
Q  226 atgtagtgctttaggttctgt 246  Q
    |||||||| |||||| |||||    
T  30527753 atgtagtgttttaggctctgt 30527733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 29712998 - 29713165
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||               
T  29712998 agtaacattaaagtgaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacaggg----------- 29713086  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29713087 ---ttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttacatctatggcaaaattttgcgttcaggttaactttaagaaataa 29713165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 42348644 - 42348484
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgat--ttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaa 111  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  42348644 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatatttgttcattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaatatgattaattaaa 42348545  T
Q  112 taggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcg 172  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  42348544 tagggttaatagagtaaatttaagcaaataagttcggttaaatctaaggcaaaattttgcg 42348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37061695 - 37061526
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||              ||||    
T  37061695 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaatta--------------aata 37061610  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37061609 tgattaatatagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctaaggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 37061526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Original strand, 43022468 - 43022619
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgattt-gtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaa 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||              |||||||||||    
T  43022468 aaattaggagcgattttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggtt--------------aatacagtaaa 43022553  T
Q  130 attaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43022554 attaaacaaagaagttaggttacatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 43022619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37061901 - 37061735
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||              ||||||||    
T  37061901 attaaggagaaaaattaggagcgatttatttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaa--------------taggatta 37061816  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatat 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  37061815 atatagtaaaattaagcaaagaatttaggttaaatctagagtaaaattttgcgttcaggttaacttttaggaataagatat 37061735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42348362 - 42348221
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  42348362 agtaaaattaaggagaaaaattaggagctatttgttcattttgatttccctaacacttaacattaacattttgattaaattaaatatgattaattaaata 42348263  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatt 155  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42348262 gggttaatatagtaaatttaagcaaagaagttgggttaaatt 42348221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42349695 - 42349529
Alignment:
Q  22 taaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaat 121  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||              |||    
T  42349695 taaggagaaaaattatgagtgatttgttcattttgatttccctaacaattaacattaagattttgattaaattaaatagggtt--------------aat 42349610  T
Q  122 acagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42349609 atagtaaatttaagcaaagaagttaggttaaatctatggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatatta 42349529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48808471 - 48808351
Alignment:
Q  77 taacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttct 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  48808471 taacattttgattaaattaaatagggttaattaaatagggctaatacagtataattaatcattaaagttaggttaaatttagggcaacattttgcattcg 48808372  T
Q  177 ggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  48808371 ggttaactttaaggaataaga 48808351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 239
Target Start/End: Original strand, 16652986 - 16653084
Alignment:
Q  141 aagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652986 aagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttattatgttattttttatgtagtgctttag 16653084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48808340 - 48808234
Alignment:
Q  91 aattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  48808340 aattaattagggttgattaaatagggttaaaataataaaactaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcggattaactttaaaa 48808241  T
Q  191 aataaga 197  Q
    |||||||    
T  48808240 aataaga 48808234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 26602650 - 26602813
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||             
T  26602650 agtaaaattaaggagaaaaatttggagcgatttgtttattttgatttccataacaattacc------attttgattaaattaaatagggtt--------- 26602734  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
         |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26602735 -----aatataataaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaaggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 26602813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42348478 - 42348387
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42348478 attaaatagggttaatatagtaaatttaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgcgttcaggttaactttaaggaataaga 42348387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54866853 - 54866762
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  54866853 attaaataggattaatatagtaaaattaagcaaagaaattaggttaaatctaagccaaaattttgcgttcggattagctttaaggaataaga 54866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42348194 - 42348112
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42348194 attaaatagggttaatatagtaaatttaagtaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcggattaactttaa 42348112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8120494 - 8120421
Alignment:
Q  124 agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8120494 agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctatgtcaaaatcttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 8120421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8120334 - 8120224
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaata--ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctgg 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||| | || |||||| ||    
T  8120334 attttgattaaattaaacagggttaattaaatataggggtaatacagtaaaattaagcattagggttaggttaaatctagggcaacaattagcgttcggg 8120235  T
Q  179 ttaactttaag 189  Q
    |||||||||||    
T  8120234 ttaactttaag 8120224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 247
Target Start/End: Original strand, 5759194 - 5759239
Alignment:
Q  202 acaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5759194 acaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 5759239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1325640 - 1325554
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  | | ||||||||||||| |||||||    
T  1325640 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctagggcaaaatattgtttgcgggttaactttaagtaataaga 1325554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 11659265 - 11659373
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||  || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  11659265 taaattcaatagatttaattaaagaggggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 11659364  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  11659365 taaataaga 11659373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54243048 - 54242940
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || ||||||  ||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | || ||||   ||||||||||||    
T  54243048 taaattcaataggtttaattaaacgggggtaatacagtaaaaataagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtctgggttaactttaa 54242949  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  54242948 taaataaga 54242940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 54866925 - 54866865
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaac 74  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  54866925 agtaaaattaaggagaaaaattatgagtgatttgttcattttgattttcataacaattaac 54866865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8120199 - 8120128
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag 189  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  8120199 taatacagtaaaattaagcattagggttaggttaaatctagggcaacaattagcgttctggttaactttaag 8120128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54242895 - 54242785
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctg-gttaactt 185  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || ||| |||| ||||||||    
T  54242895 attaaattaaataggtttaattaaacatgggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttagcg-tctgagttaactt 54242797  T
Q  186 taagaaataaga 197  Q
    ||| ||||||||    
T  54242796 taataaataaga 54242785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24528059 - 24527973
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||| | |  |||||| ||||| |||||||    
T  24528059 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattaggttaaatctaaggcaaaatattgcttacgtgttaacattaagtaataaga 24527973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23980253 - 23980173
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||    
T  23980253 ttaatatagtaaaattaagtagagaaattagggtaaatctagggcaaaatattgcttacgggttaactttaactaataaga 23980173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24527971 - 24527911
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgc 171  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24527971 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctagggcaaaatattgc 24527911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24527648 - 24527565
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaac-tttaagaaataagata 199  Q
    |||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||| |||||||||    
T  24527648 ttaatatagtaaaattaagcagaaaaattagggtaaatctagggcaaaatattgcttacgggttaacttttaagtaataagata 24527565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Original strand, 11654403 - 11654509
Alignment:
Q  91 aattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||| |||||| || |||||||||   ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| |||||| || | || | || | |||||||||||| |    
T  11654403 aattcaataggtttaattaaatagaggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggaaacagttagggtccgggttaactttaata 11654502  T
Q  191 aataaga 197  Q
    |||||||    
T  11654503 aataaga 11654509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8119874 - 8119797
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||  |||||  ||| |||||||||| ||||||||| | ||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  8119874 taatacagtaaaagcaagcattgaatttaggttaaagttagggcaacaattaacattctggttaactttaataaataa 8119797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 49752392 - 49752445
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  49752392 ttaggttaaatctagggcaacattttacattcgggttaactttaataaataaga 49752445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1325325 - 1325245
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||| |||||||||||||| || | ||||| ||||| ||  ||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  1325325 ttaatatagtaaaattaagcagagtaattagggtaaatctaaagcaaaatattgcttacgggttaactttaagtaataaga 1325245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1325724 - 1325664
Alignment:
Q  125 gtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactt 185  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||    
T  1325724 gtaaaattaagcagagagataaggttaaatttagggcaaaatattgcttacgggttaactt 1325664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22453868 - 22453761
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||  || |||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||| ||| | ||  ||||| ||||||||||||    
T  22453868 taaattcaataggtttaattaaacaggggtagtacagtaaaagtaagcataaaatttaggttaaaattaggacaacagttaacgttc-ggttaactttaa 22453770  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  22453769 taaataaga 22453761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Original strand, 23707873 - 23707961
Alignment:
Q  107 ttaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||  |||||||||||||  |||||  ||| |||| ||||| ||||||||| | || || ||| |||||||||||| ||||||    
T  23707873 ttaaataggggtaatacagtaaaagcaagcactgaatttagcttaaaattagggcaacaattagcattcgggttaactttaataaataa 23707961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 14832716 - 14832942
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14832716 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttaatttcccaaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 14832815  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14832816 gggttaatatagtaaaattaagcaaaaaagttaggttaaatctatgtcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 14832915  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14832916 atgttattttttatgtagtgctttagg 14832942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Original strand, 1222068 - 1222281
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |    
T  1222068 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------a 1222153  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1222154 atactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgttatatta 1222253  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1222254 ttttttatgtagtgttttaggctctgtg 1222281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9979072 - 9978853
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  9979072 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 9978982  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  9978981 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaatttttcgttcgggttaactttaaggaataaaagattacaatagttgtt 9978887  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9978886 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 9978853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 4108988 - 4109169
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4108988 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 4109087  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4109088 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 4109169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 24447473 - 24447692
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             
T  24447473 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaatgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 24447563  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24447564 -----aatactgtaaaattaagtaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 24447658  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24447659 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 24447692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4896953 - 4896772
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4896953 agtaaaattaaagtgaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 4896854  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4896853 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttacatctagggcaaaattttgcgttcaggttaactttaagaaataa 4896772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15044190 - 15043972
Alignment:
Q  15 gtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaatag 114  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15044190 gtaaaattaaggagaaaaatcaggagctatttgtttattttgatttctctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt---------- 15044101  T
Q  115 gattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtta 214  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15044100 ----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatccagggcaaaattttgcgttcaggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtta 15044005  T
Q  215 tgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15044004 tgttattttttatgtagtgttttaggatctgtg 15043972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33320543 - 33320362
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  33320543 agtaaaattaaagagaaaaattaggagtgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagagttaattaaata 33320444  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33320443 gggtcaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 33320362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9736060 - 9735841
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  9736060 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 9735970  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9735969 -----aatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttagggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 9735875  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  9735874 atgttatttgttatgtagtgttttaggctctgtg 9735841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 35159121 - 35159302
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||    
T  35159121 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaaaaattaacgttaacattttgattaaattaaacagagtaaattaaata 35159220  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35159221 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggtcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 35159302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6966601 - 6966382
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||             
T  6966601 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaactttaacattttgattaaattaaatggggtt--------- 6966511  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6966510 -----aatacagtacaattaagcaaaaaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcaagttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 6966416  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6966415 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 6966382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Original strand, 18320430 - 18320624
Alignment:
Q  39 agcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||    
T  18320430 agcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------aatactgtaaaattaagcaa 18320515  T
Q  139 agaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgtagtgcttta 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18320516 agaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagaaattacaatagttgttatattattttttatgtagtgtttta 18320615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 4109734 - 4109953
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  4109734 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgtgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 4109824  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4109825 -----aatacagtaaagttaagcaatgaagttaggttaaatctaggacaaaattttgcgttcggattaactttaaggaatatgatattacaatagttgtt 4109919  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4109920 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 4109953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 24446203 - 24446377
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  24446203 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaa 24446302  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24446303 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 24446377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 1220796 - 1220970
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  1220796 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttaatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaa 1220895  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1220896 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 1220970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 35159799 - 35160020
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          
T  35159799 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttttttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttcattaaattaaatagggttgat------ 35159892  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag--aaataagatattacaatagttg 211  Q
            ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  35159893 --------acagtaaaactaagtaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgattgagttaactttaaggaatataagagattacaatagttg 35159984  T
Q  212 ttatgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  35159985 atatgttattttttatgttgtgttttaggctctgtg 35160020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4896318 - 4896114
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |    
T  4896318 attaaggagaaaaattaggagcgatctgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggggt--------------a 4896234  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4896233 atacagtaaaattaagtaaagaagttaggttaaatctaaggtaaaattttgtgttcgggttaactttaaggaataagagattgcaataattgttatgtta 4896134  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  4896133 ttttttatgtggtgctttag 4896114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4621496 - 4621320
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4621496 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccataacaattaat------attttgattaaattaaatagggttaattaaata 4621403  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4621402 gggt-aatatagtaaaattaagcaaagaagctaggttaaatctatgacaaaaatttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 4621320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33319831 - 33319711
Alignment:
Q  127 aaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttatttttta 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33319831 aaaactaagcaaagaagttaggttaaatatagggcaaaattttgcgattgagttaactttaaggaataagagattacaataattgatatgttatttttta 33319732  T
Q  227 tgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||| ||| |||||| ||||||    
T  33319731 tgttgtgttttaggctctgtg 33319711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 31426210 - 31426311
Alignment:
Q  88 ttaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagg-gcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||    
T  31426210 ttaaattaaatagggttaattaaatatgattaatatagtaaaattaagcaaagaagttatgttaaatttaggatcaaaattttgcgttcagattaatttt 31426309  T
Q  187 aa 188  Q
    ||    
T  31426310 aa 31426311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 21059293 - 21059368
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgatt 89  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  21059293 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacagtttacattaacattttgatt 21059368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 33319916 - 33319846
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattt 84  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33319916 agtaaaattaaggagaaaaattatgagcgatttatttattttgatttccctaacaattaacgttaacattt 33319846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Original strand, 21078541 - 21078609
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgatt 89  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  21078541 ttaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccttaacaatttacattaacattttgatt 21078609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31497251 - 31497194
Alignment:
Q  77 taacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31497251 taacattttgattaaattaaatagggttaattaaataggagtaatacagttaaattaa 31497194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31502637 - 31502584
Alignment:
Q  77 taacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  31502637 taacattttgattaaattaaatagggttaattaaatacgagtaatacagtaaaa 31502584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Original strand, 21055521 - 21055567
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattt 60  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21055521 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattt 21055567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31491858 - 31491805
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaa 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31491858 attttggttaaattaaatagggttaattaaataggagtaatacagttaaattaa 31491805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 200
Target Start/End: Original strand, 26899782 - 26899901
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggtt 180  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||   || |||| ||||| |||||| | || ||||| |||| ||||||||| | ||  ||||| ||||    
T  26899782 attttgattaaattaaatatgtttaattaaacagaggtagtacaataaaagtaagcataaaatttaggataaaattagggcaacacttaacgttcgggtt 26899881  T
Q  181 aactttaagaaataagatat 200  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  26899882 aactttaataaataagatat 26899901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Original strand, 21855243 - 21855352
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| ||||||||| | || |||  | ||||||||||    
T  21855243 attaaattaaataggtttaattaaacagggt-aatacagtaaaagtaagcatataatgtaggttaaaattagggcaatagttagcgaccgggttaacttt 21855341  T
Q  187 aagaaataaga 197  Q
    || ||||||||    
T  21855342 aataaataaga 21855352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Original strand, 28078962 - 28079048
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | | | ||||||||||| |||||||    
T  28078962 atagggttaatatagtaaaattaaacagagaaattagggtaaatctagggcaaaatattgcttacagattaactttaagtaataaga 28079048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 19989962 - 19990015
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  19989962 ttaggttaaatcaagggcaaaattttgcgttcagattaactttaaggaataaga 19990015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 26899644 - 26899752
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || | |||| |||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||||| | || || | | ||||||||||||    
T  26899644 taaattcaataggtttaaataaacaggtgtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggctaaaattagggcaacagttagcatccgggttaactttaa 26899743  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  26899744 taaataaga 26899752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 196
Target Start/End: Original strand, 21855399 - 21855506
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||  ||||||| ||||| |||||| | || |||||||||| ||| ||||| | ||  ||||| ||||||||||||    
T  21855399 taaattcaataggtttaattaaacaggggtaatacaataaaagtaagcataaaatttaggttaaaattatggcaacaattaacgttcgggttaactttaa 21855498  T
Q  189 gaaataag 196  Q
     |||||||    
T  21855499 taaataag 21855506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Original strand, 26899997 - 26900107
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | || |||| ||||| ||||||||| | ||  ||||| | |||| |||    
T  26899997 attaaattaaatagatttaattaaataggggtaatatagtaaaaataagcatataatttagattaaaattagggcaacagttaacgttcagattaatttt 26900096  T
Q  187 aagaaataaga 197  Q
    || ||||||||    
T  26900097 aataaataaga 26900107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 195
Target Start/End: Original strand, 21855112 - 21855189
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||| | ||  ||| | |||||||||||| ||||||    
T  21855112 taatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattaaggcaatagttaacgtccgggttaactttaataaataa 21855189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 16301806 - 16302039
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16301806 agtaaaattaaaaagaaaaatttggggcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatatggttaattaaata 16301905  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16301906 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagtttgattaaatctagggcaaaattttgcgttcggattaactttaaggaacaagatattacaatagttgtt 16302005  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16302006 atgttgttttttatgtagtgttttaggctctgtg 16302039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19320784 - 19320565
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  19320784 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 19320694  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19320693 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 19320599  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19320598 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 19320565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 4893646 - 4893865
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  4893646 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 4893736  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4893737 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 4893831  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4893832 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 4893865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29184841 - 29184622
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  29184841 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 29184751  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29184750 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 29184656  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29184655 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 29184622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 47137536 - 47137755
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  47137536 agtaaaattaaggagaaaaattaggagctatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 47137626  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  47137627 -----aatacagtaaaattaggcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttatt 47137721  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47137722 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 47137755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19321417 - 19321236
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  19321417 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacagggttaattaaata 19321318  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19321317 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 19321236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Original strand, 33363256 - 33363469
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |    
T  33363256 attaaggagataaattaggagctatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------a 33363341  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33363342 atactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgttatatta 33363441  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  33363442 ttttttatgtagtattttaggctctgtg 33363469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 28572083 - 28572258
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  28572083 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggtta 28572182  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28572183 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 28572258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 16301217 - 16301398
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16301217 agtaaaattaaaaagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 16301316  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16301317 gggttaatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctaaggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 16301398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 46623740 - 46623521
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  46623740 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatctccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagg------------ 46623653  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46623652 --attaatacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgagcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 46623555  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46623554 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 46623521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 28571334 - 28571515
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  28571334 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaaagttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaata 28571433  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28571434 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 28571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 50562333 - 50562514
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  50562333 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttaatttaccaaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacaaggttaattaaata 50562432  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50562433 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatatagggcaaaattttgtgttcgggttaactttaagaaataa 50562514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22198363 - 22198182
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22198363 agtaaaattaaagtgaaaaattaggagcgatttttttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 22198264  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22198263 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttacatctagggtaaaattttgcgttcaggttaactttaagaaataa 22198182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 38896493 - 38896697
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  38896493 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 38896583  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38896584 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgagttaattttaaggaataagatattataatagttgtt 38896678  T
Q  214 atgttattttttatgtagt 232  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  38896679 atgttatttttcatgtagt 38896697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 4892376 - 4892550
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  4892376 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaa 4892475  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4892476 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 4892550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29186111 - 29185937
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  29186111 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaa 29186012  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29186011 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 29185937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33075114 - 33074933
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33075114 agtaaaattaaagtgaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaatgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 33075015  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  33075014 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttacatctagggcaaaattttgcattcatgttaactttaagaaataa 33074933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22194827 - 22194620
Alignment:
Q  17 aagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaatagga 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                
T  22194827 aagattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggggt------------ 22194741  T
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatg 216  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22194740 --aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgtgtttgggttaactttaaggaataagagattgcaataattgttatg 22194643  T
Q  217 ttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22194642 ttattttttatgtagtgctttag 22194620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 5427993 - 5428212
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  5427993 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 5428083  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5428084 -----aatacagtaaaattaagcagagaaattatgttaaatctatggcaaaattttacgttcgaattaactttaaggaataagatattacaatagttgtt 5428178  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5428179 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 5428212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 50563150 - 50563369
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             
T  50563150 agtaaaattaaggagaaaaattaagagaaatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatatggtt--------- 50563240  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50563241 -----aatacagtaaaattaaacaaagaagttaggttaaatctaggtcaaaattttacgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 50563335  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50563336 atgttagtttttatgtagtgttttaggctctgtg 50563369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 1827379 - 1827560
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1827379 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 1827478  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  1827479 gggttaatacagtaaaattaaacaaagaagttaggttaaatctagggaaattttttggattcgggttaactttaagaaataa 1827560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 1375667 - 1375871
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |    
T  1375667 attaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggggt--------------a 1375751  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1375752 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgtgtttgggttaactttaaggaataagagattgcaataattgttatgtta 1375851  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1375852 ttttttatgtagtgctttag 1375871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 33361979 - 33362153
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || | |||||||| ||||    
T  33361979 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttaatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaactaaatagggttaa 33362078  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33362079 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 33362153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51964820 - 51964622
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||              |    
T  51964820 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattt-cctaacaattaacgttaatattttgattaaattaaatagggtt--------------a 51964736  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  51964735 atacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgccttcgggttaactttaaggaataagagattacaataattgttatgtta 51964636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33074588 - 33074384
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |              |    
T  33074588 attaaggagaaaaatttggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaaagttaacattttgattaaattaaataggggt--------------a 33074504  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  33074503 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgtgttcgggttaactttaaggaataagagattgcaataattgttatgtta 33074404  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33074403 ttttttatgtagtgctttag 33074384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 1828117 - 1828327
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
T  1828117 agtaaaattaaggataaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 1828206  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||    
T  1828207 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggaaaatttttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattgcaataattatt 1828301  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1828302 atgttattttttatgcagtgctttag 1828327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 52311901 - 52312099
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             
T  52311901 agtaaaattaaggagaaaaattaggtgcgatttgtttattttgatttccttaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataaggtt--------- 52311991  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  52311992 -----aatacaggaaaattaagcaaagaagttagtttaaatctagggcaaaattttgcatttgggttaactttaaagaataagaaattacaatagttgtt 52312086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 52311119 - 52311294
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  52311119 agtaaaattaaagagaaagattaggagcgatttgtttattttgatttccctaa------acgttaatatattgattaaattaaacagggttaattaaata 52311212  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52311213 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttacgttcgggttaactttaagaaataa 52311294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Original strand, 28950641 - 28950797
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28950641 agtaaaattaaggaaaacaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaactttaacattttgattaaattaagtagggttaattaaata 28950740  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaag-aagttaggttaaatttagggcaaaatttt 169  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28950741 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaaagttatgttaaatttaaggcaaaatttt 28950797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 47136813 - 47136974
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |    
T  47136813 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttatattgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------a 47136898  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47136899 atacagtaaaattaagcaaagaagttatgttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 47136974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 5427261 - 5427428
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||               
T  5427261 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacaggg----------- 5427349  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5427350 ---ttaatacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 5427428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8256620 - 8256444
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8256620 agtaaaattaaagggaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccataacaattaac------attttgattaaattaaatagggttaattaaata 8256527  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8256526 gggt-aatatagtaaaattaagcaaagaagctaggttaaatatatggcaaaattttgcgttcggattaactttaagaaataaga 8256444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 28572825 - 28573049
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||    
T  28572825 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaactaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaatgcagta 28572923  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaag-caaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgt 212  Q
      |||||  ||   || ||| |  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  28572924 aaattaa-gcaaataagttaggttaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttat 28573022  T
Q  213 tatgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28573023 tatgttattttttatgtagtgttttag 28573049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46624470 - 46624303
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  46624470 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggg----------- 46624382  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46624381 ---ttaacacggtaaaattaagcaaagaagttagattaattctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 46624303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 38895753 - 38895920
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |               
T  38895753 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgttcattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagtg----------- 38895841  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  38895842 ---ttaatacaataaaattaagtaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtctgggttaactttaagaaataa 38895920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24289452 - 24289354
Alignment:
Q  141 aagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24289452 aagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttattatgttattttttatgtagtgctttag 24289354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Original strand, 49586841 - 49586931
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49586841 agtaaaattaaagagaaaaactaggaacgatttgtttattttgatttctctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 49586931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21056246 - 21056084
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||      ||||||||||||||||||||||||||               
T  21056246 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccataacaat------taacattttgattaaattaaataggg----------- 21056164  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  21056163 ----taatatagtaaaattaagcaaagaagctaggttaaatctatggtaaaattttgcgttcgggttaattgtaaggaataaga 21056084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 33373657 - 33373567
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  33373657 agtaaaattaaggagaaaaattaagaacgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttcattaaattaagtagggtt 33373567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 20130697 - 20130780
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20130697 attaaataggattaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatccaacgcaaaattttgcgtttgggttaactttaag 20130780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35593699 - 35593623
Alignment:
Q  124 agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  35593699 agtaaaattaaggaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgcgttcggattaactttaaggaataagatat 35593623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 35598825 - 35598756
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttc 175  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  35598825 attaaatagggttaatatagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctaagacaaaattttgtgttc 35598756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9754284 - 9754165
Alignment:
Q  77 taacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttct 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||     
T  9754284 taacattttgattaaat-aaatagggttaattaaataggggtaatatagtaaaattaatcattaaatttaggttaaatctaggacaacattctgcattcg 9754186  T
Q  177 ggttaactttaagaaataaga 197  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  9754185 gattaaccttaaggaataaga 9754165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 134
Target Start/End: Original strand, 20089396 - 20089449
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20089396 attttgattaaattaaatagggttaattaaacagggataatacagtaaaattaa 20089449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 35599416 - 35599347
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttc 175  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  35599416 attaaatagggttaatataataaaattaagcaaagaaattaggttaaatctaatgtaaaattttgcgttc 35599347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50278429 - 50278377
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataag 196  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50278429 ttaggttaaatctagggcaacattttgcgttcgggttaactttaataaataag 50278377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35593594 - 35593457
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35593594 agtaaaattaaggaga-aaattaggagctatttatttattttaatttccataacaattaat------attttgattaaattagatagggttaattaaata 35593502  T
Q  114 ggatta--atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaattta 157  Q
     |  ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  35593501 tggctaatatatagtaaaattaaggaaa-aagttaggttaacttta 35593457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24289522 - 24289489
Alignment:
Q  71 taacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24289522 taacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 24289489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35598371 - 35598311
Alignment:
Q  39 agcgatttgttt-attttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||    
T  35598371 agcgatttgttttattttgattttcataacaattaac------attttgattaaattaaatagggtt 35598311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8256357 - 8256241
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaa--ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctgg 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||  ||||| ||||||||||||||     ||||| |||||| || ||||| | || || ||| ||    
T  8256357 attttgattaaattaaatagagttaattaaatataggggtaatatagtaaaattaagcattagggttagattaaatctaaggcaacaattagcattcggg 8256258  T
Q  179 ttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||| ||||||    
T  8256257 ttaactttaataaataa 8256241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24289501 - 24289468
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24289501 attaaatagggttaatacagtaaaattaagcaaa 24289468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33375401 - 33375357
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgat 58  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33375401 agtaaaattaagcagaaaaattaggagtgatttgtttattttgat 33375357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35599432 - 35599404
Alignment:
Q  76 ttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35599432 ttaacattttgattaaattaaatagggtt 35599404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 169
Target Start/End: Original strand, 49586951 - 49586979
Alignment:
Q  141 aagttaggttaaatttagggcaaaatttt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49586951 aagttaggttaaatttagggcaaaatttt 49586979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32676114 - 32675896
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  32676114 attaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttaatttccctaacaattaacgttaatattttgattaaattaaatagggtttattaaataggggta 32676016  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32676015 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatgtaaggtaaaattttgtgttcgggttaactttaaggaataagatattgcaataattgttatgtta 32675916  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32675915 ttttttatgtagtgctttag 32675896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4289391 - 4289172
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  4289391 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 4289301  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4289300 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 4289206  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4289205 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 4289172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 28608886 - 28609060
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  28608886 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaataattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggttaa 28608985  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28608986 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggtttactttaagaaataa 28609060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 42781605 - 42781786
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  42781605 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacagggttaattaaata 42781704  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42781705 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattatagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 42781786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 28609610 - 28609843
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  28609610 agtaaaattaaagagaaaaattagaagcaatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggataattaaata 28609709  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag---aaataagata----ttacaat 206  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||     || |||    
T  28609710 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataataagataagatatataat 28609809  T
Q  207 agttgttatgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28609810 agtggttatgttattttttatgtagtgctttagg 28609843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1513870 - 1513689
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  1513870 agtaaaattaaagagaaaaattaggaccgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacatggttaattaaata 1513771  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1513770 gggttaatacagtaaaattaagcaaataagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 1513689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32676644 - 32676463
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32676644 agtaaaattaaagtgaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 32676545  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32676544 gggttaatacagtaaaattaaacaaagaagttaggttacatctagggcaaaattttgcgttcaggttaactttaagaaataa 32676463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18091711 - 18091530
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18091711 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaatattttgattaaattaaacagggttaattaaata 18091612  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18091611 gggttaatacagtaaaattaagaaaagaagttatgttaaatctagggcaaaattttgcattcgggttaactttaagaaataa 18091530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18090976 - 18090757
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  18090976 agtaaaattaaagagaaaaattaaaagagatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 18090886  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttaggg-caaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgt 212  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18090885 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgt 18090791  T
Q  213 tatgttattttttatgtagtgctttaggttctgt 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18090790 tatgttattttttatgtagtactttaggctctgt 18090757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 19487955 - 19488174
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  19487955 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 19488045  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19488046 -----aatacagtaaaattaagaaaagaagttaggttaaattttgggcaaaattttacgtttgggttaactttaaggaataagctattataatagttgtt 19488140  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  19488141 atgttattttttatgtattgttttaggctctgtg 19488174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 42782352 - 42782571
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  42782352 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 42782442  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  42782443 -----aatacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggtaaaattttgcgttcgggttaactttatggaataagatattataatagttgtt 42782537  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  42782538 atgttatttgttatgtagtgttttaggctctgtg 42782571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 6931063 - 6931244
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  6931063 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacaaagttaattaaata 6931162  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6931163 gagttaatacattaaaattaagcaaaaaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 6931244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 19487199 - 19487380
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19487199 agtaaaattaaagataaaaattaggagcgatttatttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacagggttgattaaata 19487298  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19487299 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaaaaaataa 19487380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4290659 - 4290485
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  4290659 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaa 4290560  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4290559 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 4290485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9543616 - 9543452
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  9543616 aaattaggagcgatttgtttattttgatttcactaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaatacattaaaa 9543517  T
Q  131 ttaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9543516 ttaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 9543452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19485298 - 19485117
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  19485298 agtaaaattaaagagaaaaattagcagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacatggttaattaaata 19485199  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  19485198 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggaaaaattttgcgtccggtataactttaagaaataa 19485117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9542974 - 9542782
Alignment:
Q  33 attaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||              ||||| ||||||||    
T  9542974 attaggagcgatttgtttattttgatttccctaaaaattaatgtgaacattttgattaaattaaatagggtt--------------aataccgtaaaatt 9542889  T
Q  133 aagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgtagt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9542888 aagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgttatattattttttatgtagt 9542789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25235290 - 25235107
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25235290 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttttttatttttatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaagtagggttaattaaata 25235191  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25235190 gggttaatatagtaaaattaaacaaagaagttaagttaaatctaggacaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataaga 25235107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10874762 - 10874543
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             
T  10874762 agtaaaattaaggagaaaaattagaaacgatttgtttattttgatctccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggctt--------- 10874672  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10874671 -----aatacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgagcaaaaatttgtgtttgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 10874577  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10874576 atgttattttttatgtagtgttttaggttctgtg 10874543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 17838159 - 17838363
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |    
T  17838159 attaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggggt--------------a 17838243  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  17838244 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagcgtaaaattttgtgttcgggttaactttaacgaataagagactgcaataattgttatgtta 17838343  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17838344 ttttttatgtagtgctttag 17838363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44940838 - 44940665
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  44940838 attaaagagaaaagttaggaacgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaataaggttaattaaatagggtta 44940739  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||    
T  44940738 atatcgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctatggcaaaattttgcg----ggttaactttaaggaataaga 44940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 6931585 - 6931794
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||               
T  6931585 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaaagttaacattttgattaaattaaatatgg----------- 6931673  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  6931674 ---ttaatacagtcaaattaagcaaagaagttaggttaaatcaatgactaaattttgcattcgggttaactttaaggaataagagatta-aataattgtt 6931769  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgcttta 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  6931770 atgttattttttatgtagtacttta 6931794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10875505 - 10875338
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  10875505 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggg----------- 10875417  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10875416 ---ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggtgaattctagggcaaaattttgcgtccggattaactttaagaaataa 10875338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1501727 - 1501622
Alignment:
Q  97 atagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataag 196  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1501727 atagggttaattaaatagggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttatgttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataag 1501628  T
Q  197 atatta 202  Q
    | ||||    
T  1501627 agatta 1501622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1501626 - 1501514
Alignment:
Q  105 gattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattaca 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  1501626 gattaaatagggttaatacagtaaaattaagcaaaaaagttaagttaaatctagggcaaaattttgcattcgggttaactttaaggaataagagattgca 1501527  T
Q  205 atagttgttatgt 217  Q
    |||||||||||||    
T  1501526 atagttgttatgt 1501514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 202
Target Start/End: Original strand, 8909774 - 8909899
Alignment:
Q  77 taacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttct 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||     
T  8909774 taacattttgattaaattaaatagggttaattaaataggggtaatacaataaaattaatcattaaagttaggttaaatctagagcaacattttgcgttcg 8909873  T
Q  177 ggttaactttaagaaataagatatta 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8909874 ggttaactttaaggaataagatatta 8909899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1513223 - 1513139
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcc-taacaattaacgttaacattttgattaaattaaa 97  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1513223 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttcccttaacaattaacgttaacattttgattaaattaaa 1513139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25234893 - 25234787
Alignment:
Q  91 aattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  25234893 aattaaatagggttaattaaatatggttaaaatagtaaaatgaagaaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaag 25234794  T
Q  191 aataaga 197  Q
    |||||||    
T  25234793 aataaga 25234787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25234676 - 25234570
Alignment:
Q  91 aattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||      
T  25234676 aattaaatagggttaattaaatatggttaaaatagtaaaatgaagaaaagaagttaggttaaatttaggacaaaattttgcattcaggttaactttaaag 25234577  T
Q  191 aataaga 197  Q
    |||||||    
T  25234576 aataaga 25234570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25235101 - 25234997
Alignment:
Q  91 aattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25235101 aattaaatagggttaattaaataaggttaaaatagtaaa-ttaagcaaagaagttaggttaaatctatagcaaaattttgcgttc-ggttaactttaagg 25235004  T
Q  191 aataaga 197  Q
    |||||||    
T  25235003 aataaga 25234997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38328222 - 38328106
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggtt 180  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | || |||| | ||||    
T  38328222 attttgattaaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacagtgaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttagcgtccgggtt 38328123  T
Q  181 aactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||| ||||||||    
T  38328122 aactttaataaataaga 38328106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 15783438 - 15783525
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagg 101  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15783438 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcaatttgttcattttgatttccctaataattaacattaatattttgattaaattaaatagg 15783525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25234563 - 25234472
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25234563 attaaatagggttaaaatagtaaaattaagcaaataaattacgttaaatctaggacaaaattttgcgttcaggttaactttaaggaataaga 25234472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38329084 - 38328963
Alignment:
Q  81 attttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggtt 180  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||    
T  38329084 attttgattaaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggtt 38328985  T
Q  181 aactttaagaaataagatatta 202  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  38328984 aactttaataaataagagatta 38328963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25234773 - 25234684
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  25234773 attaaatagggttaaaatagtaaaattcaggaaagaagttaggttaaatctatgacaaaattttgcgttcggattaactttaaggaataa 25234684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Original strand, 39087616 - 39087726
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    |||||||| |||||| || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||    
T  39087616 attaaattcaataggtttaattaaacatgggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttaacgttcgggttaacttt 39087715  T
Q  187 aagaaataaga 197  Q
    || ||||||||    
T  39087716 aataaataaga 39087726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25234990 - 25234901
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  25234990 attaaatagggttaaaatagtaaaattcaacaaagaagttaggttaaatctatgataaaattttgcgttcggattaactttaaggaataa 25234901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 199
Target Start/End: Original strand, 39087780 - 39087890
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| ||||| | ||   || | ||||||||||||    
T  39087780 taaattaaataggtttaattaaataggggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttatgttaaaattaaggcaacagttaatgtccgggttaactttaa 39087879  T
Q  189 gaaataagata 199  Q
     ||||||||||    
T  39087880 taaataagata 39087890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38328657 - 38328560
Alignment:
Q  91 aattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  38328657 aattaaataggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 38328560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38328360 - 38328252
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  38328360 taaattaaataggtttaattaaacatgggtaatacagtaaaagtaagcacataatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 38328261  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  38328260 caaataaga 38328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 692922 - 693013
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||| ||||  ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  692922 attaaataggggtaatacagtaaaattaatcattaaaattaggttaaatctagggcaacatttaacgttcagattaactttaaggaataaga 693013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38328814 - 38328706
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||  |||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  38328814 taaattaaataggtttaattaaattggggtaatacaataaaagtaagcatagaatttaggttaaaattaaagcaacagttaacgtccgggttaactttaa 38328715  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  38328714 taaataaga 38328706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38328022 - 38327914
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| | |  |||||| |||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  38328022 taaattcaataggtttaattaaacaagggtaatactgtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacaattaacgtccgggttaactttaa 38327923  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  38327922 taaataaga 38327914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 9151097 - 9151316
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||             
T  9151097 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaataaacgttaacattttgattaaattaaatagagtt--------- 9151187  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9151188 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagtattaagatattacaatagttgtt 9151282  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9151283 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 9151316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 17172572 - 17172791
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  17172572 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 17172662  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17172663 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 17172757  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17172758 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 17172791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48527775 - 48527557
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             
T  48527775 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaatgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 48527685  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48527684 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcggattaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 48527590  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgt 246  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  48527589 atattattttttatgtagtgttttaggctctgt 48527557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27733317 - 27733098
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  27733317 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttaatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 27733227  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  27733226 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataaaagattacaatagttgtt 27733132  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27733131 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 27733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31897177 - 31896958
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  31897177 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 31897087  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31897086 -----actactgtaaaattaagcaaaaaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 31896992  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31896991 atattattttttatgtagtgttttaggctctgtg 31896958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 44806256 - 44806474
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             
T  44806256 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaatgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 44806346  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44806347 -----aatacattaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataagatattataatagttgtt 44806441  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgt 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  44806442 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgt 44806474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35155852 - 35155641
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  35155852 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 35155762  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35155761 -----aatacagtaaaattaaccaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 35155667  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  35155666 atgttattttttatgtagtgttttag 35155641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7855327 - 7855108
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  7855327 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 7855237  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7855236 -----aatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgagcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 7855142  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  7855141 atgttatttgttatgtagtgttttaggctctgtg 7855108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7856082 - 7855901
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||    
T  7856082 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacaatgttaattaaata 7855983  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7855982 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccaggttaactttaagaaataa 7855901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21669594 - 21669376
Alignment:
Q  15 gtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaatag 114  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  21669594 gtaaaattaaggagaaaaatcaggagctatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt---------- 21669505  T
Q  115 gattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtta 214  Q
        |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21669504 ----aatacaataaaattaagaaaagaagttaggttaaatccagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtta 21669409  T
Q  215 tgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21669408 tgttattttttatgtagtgttttaggatctgtg 21669376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24684119 - 24683950
Alignment:
Q  26 gagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacag 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||||    
T  24684119 gagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagtgttaattaaatatggttaatacag 24684020  T
Q  126 taaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24684019 taagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 24683950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 690966 - 691183
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  690966 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcaatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaattgggtt--------- 691056  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  691057 -----aatacagtaaaattaagtaaagaagttaggttaaatctaaggcaaaattttgcgttcaagttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 691151  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  691152 atgttattttttatgtagtgctttaggctctg 691183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 34873498 - 34873717
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             
T  34873498 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttgttttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatatggtt--------- 34873588  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34873589 -----aatacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgagcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgtt 34873683  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34873684 atgttattttttatgtagtgttttaggctctgtg 34873717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 44805515 - 44805689
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  44805515 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacagggttaattaaatagggttaa 44805614  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  44805615 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaaaaaataa 44805689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49145273 - 49145089
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggt---tgattaa 110  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   | |||||    
T  49145273 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccgtaacaattaacattaacattttgattaaattaaacagggtaattaattaa 49145174  T
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49145173 atagggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 49145089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 4849382 - 4849563
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4849382 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 4849481  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4849482 gggttaatactaaaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgtttgggttaactttaagaaataa 4849563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 29468377 - 29468558
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29468377 agtaaaattaaagtgaaaaattaggagcgatttttttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 29468476  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29468477 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagttaggttacatctagggtaaaattttgcgttcaggttaactttaagaaataa 29468558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39648328 - 39648134
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||              ||||| ||||||    
T  39648328 aaattaggagcgatttgtttaatttgatttccctaacaattaactttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------aatactgtaaaa 39648243  T
Q  131 ttaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgta 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39648242 ttaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgttatgttattttttatgta 39648143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 4850126 - 4850345
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
T  4850126 agtaaaattaaggagaaaatttatgtgcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 4850216  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||    
T  4850217 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatatagggcaaaattttgcgttcggattaactttagggaatatgatattacaatagttatt 4850311  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4850312 atgttattttttatgtagtactttaggctctgtg 4850345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 17171302 - 17171476
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  17171302 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaa 17171401  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17171402 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 17171476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39648958 - 39648784
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || |||||||||| ||||    
T  39648958 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaataattaacgttaacattttgtttaagttaaacatgattaattaaatagggttaa 39648859  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39648858 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 39648784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49144390 - 49144179
Alignment:
Q  22 taaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaat 121  Q
    |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||    
T  49144390 taaggagaaaaattatgtgtgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------aat 49144305  T
Q  122 acagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttatt 221  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49144304 acagtaaaattaagcaaataaattaggttaaatctagggtaaaattttgcgttcggattaactttaaggaatatgatattacaatagttgttatgttatt 49144205  T
Q  222 ttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  49144204 ttttatgtagtgctttaggctctgtg 49144179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 29468903 - 29469107
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |    
T  29468903 attaaggagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggggt--------------a 29468987  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  29468988 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggtaaaattttgtgttcgggttaactttaaggaataagagattgcaataattgttatgtta 29469087  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttag 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29469088 ttttttatgtagtgctttag 29469107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 9150575 - 9150755
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9150575 agtaaaattaaagagaaaaattaggagtgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaata 9150674  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9150675 gggttaatatagtaaaattaagcaaagaagtta-tttaaatctagggtaaaattttgcgtttgggttaactttaagaaataa 9150755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31897794 - 31897625
Alignment:
Q  26 gagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacag 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||| |||||||||    
T  31897794 gagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacatgattaattaaatagggttaatacag 31897695  T
Q  126 taaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31897694 taaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 31897625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35156490 - 35156333
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  35156490 agtaaaattaaagagaaaaattaggatcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacagggttaattaaata 35156391  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgc 171  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35156390 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgc 35156333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33637759 - 33637584
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttatttt-gattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatt 118  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  33637759 attaaagagaaaaattaggagc-atttgtttatttttgatttccctaaaaattaacgttaatattttgattaaattaaacagagttaattaaatagggtt 33637661  T
Q  119 aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33637660 aatacagtaaaattaaacaaagaaattaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 33637584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11835338 - 11835119
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  11835338 agtaaaattatggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttaattaaattaaatatggatgatttaata 11835239  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag---aaataagata----ttacaat 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||    |||||||||     || |||    
T  11835238 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttagg------ttaggacaaaattttgcgttcgggttatcgttaaggaataataagataagatatataat 11835145  T
Q  207 agttgttatgttattttttatgtagt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11835144 agttgttatgttattttttatgtagt 11835119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 39277929 - 39278117
Alignment:
Q  15 gtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaatag 114  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  39277929 gtaaaattaaggagaaaaatcaggagctatttgtttattttgatttctctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt---------- 39278018  T
Q  115 gattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtta 214  Q
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  39278019 ----aatacagtaaaattaagaaaagaagttaggttaaatccagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttttta 39278114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24683382 - 24683245
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24683382 attaaagagaaaaattaagagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaattaaatagggtta 24683283  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaattta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  24683282 atacagtaaaattaagcaaagaaataaggttaatttta 24683245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24682654 - 24682430
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||    
T  24682654 agtaaaattaaggagaaaaattaggaacgattt-tttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaatacagta 24682556  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagc-aaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgt 212  Q
      |||||   | |||  ||| |  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  24682555 aaattaagcaaataag-ttaggttaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttat 24682457  T
Q  213 tatgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24682456 tatgttattttttatgtagtgctttag 24682430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 34872756 - 34872923
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||               
T  34872756 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaacttaaataggg----------- 34872844  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34872845 ---ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctagggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 34872923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21598306 - 21598105
Alignment:
Q  39 agcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21598306 agcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttaattaaattaaatatggatgatttaatagggttaatacagtaaaattaagcaa 21598207  T
Q  139 agaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag---aaataagata----ttacaatagttgttatgttattttttatgtag 231  Q
    ||||||||||      ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||    |||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21598206 agaagttagg------ttaggacaaaattttgcgttcgggttatcgttaaggaataataagataagatatataatagttgttatgttattttttatgtag 21598113  T
Q  232 tgctttag 239  Q
    || |||||    
T  21598112 tgttttag 21598105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49145088 - 49144961
Alignment:
Q  68 aattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaatt 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  49145088 aattaacattaacattttgattaaattaaacatggttaattaaatagggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaaggcaaaatt 49144989  T
Q  168 ttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  49144988 ttgcgttcgggttaactttaagaaataa 49144961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27734041 - 27733880
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||              |    
T  27734041 attaaagagaaaaattaggagagatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgaataaattaaacagggtt--------------a 27733956  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27733955 atacagtaaaattaagcaaaaaagttaggttaaatatatggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 27733880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33637076 - 33637028
Alignment:
Q  190 aaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgtagtgcttta 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33637076 aaataagagattacaatagttgttatgttattttttatgtagtgcttta 33637028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19327329 - 19327247
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag 189  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19327329 attaaatagggttaaaatactaaaattaagcaaaaaaattagcttaaatttatggcaaaattttgcgttc-ggttaactttaag 19327247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35074876 - 35074761
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaatagga--ttaatacagtaa 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||   || |||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||    
T  35074876 aaattaggagcgattgatttattttgattttcataacaattaacattttgat---gagtaaattcaatagggttaattaaataagagattaatatagtaa 35074780  T
Q  129 aattaagcaaagaagttag 147  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  35074779 aattaagcaaagaaattag 35074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 34406727 - 34406835
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||  ||| |  |||||||||||    
T  34406727 taaattaaataggtttaattaaacagagttaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgagttaactttaa 34406826  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  34406827 taaataaga 34406835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15236420 - 15236310
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    |||||||  |||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | || | || | ||||||||||    
T  15236420 attaaatataataggtttaattaaataggggtaatacagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacaattagtgtccgggttaacttt 15236321  T
Q  187 aagaaataaga 197  Q
    || ||||||||    
T  15236320 aataaataaga 15236310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15236722 - 15236614
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  15236722 taaattaaataggtttaattaaatatgggtaatatagtaaaagtaagcatataatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 15236623  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  15236622 taaataaga 15236614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15236567 - 15236493
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  15236567 taaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaagcatagattttaggttaaaattagggcaa 15236493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 34989419 - 34989502
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggt 103  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||| |      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34989419 agtaaaattaaggagaaaaattaagagcaatttgtttattttaatttccgtaacta------ttaacattttgattaaattaaatagggt 34989502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32200237 - 32200184
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32200237 ttaggttaaatctagcgcaacattttgcgttcgggttaactttaataaataaga 32200184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32200461 - 32200408
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  32200461 ttaggttaaatctagggcaacattttgcattcgggttaactttaataaataaga 32200408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32200841 - 32200788
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  32200841 ttaggttaaatatagggcaacattttgcgttcgggttaactttaatacataaga 32200788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32201043 - 32200990
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32201043 ttagattaaatctagggcaacattttgcgttcgggttaactttaataaataaga 32200990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 2733600 - 2733708
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||  |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||| ||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  2733600 taaattcaataggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaaacaagcatagaatttaggttaaaattaaggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 2733699  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  2733700 taaataaga 2733708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 2734056 - 2734164
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| ||   ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  2734056 taaattcaataggtttaattaaacagaggtaatacagtaaaagtaagcataaaatttaggttaaaattagggcaatagttaacgtccgggttaactttaa 2734155  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  2734156 taaataaga 2734164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 2734357 - 2734465
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||||| | ||  ||| | ||||||||||||    
T  2734357 taaattcaataggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaagcataaaatttaggttaaaattagggcaacagttaacgtccgggttaactttaa 2734456  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     || |||||    
T  2734457 taagtaaga 2734465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29954045 - 29953957
Alignment:
Q  107 ttaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||  |||||||||||||  |||||  ||| |||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||||| ||||||    
T  29954045 ttaaatagggataatacagtaaaagcaagcactgaatttaggttaaaattagggcaacaattagccttctgattaactttaataaataa 29953957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16717932 - 16717853
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||| | ||  ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  16717932 taatacagtaaaagtaagcatagaatttagattaaaattagggcaacaattaacgtccgggttaactttaataaataaga 16717853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17692142 - 17692063
Alignment:
Q  118 taatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||| | ||  ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  17692142 taatacagtaaaagtaagcatagaatttagattaaaattagggcaacaattaacgtccgggttaactttaataaataaga 17692063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16718146 - 16718072
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    |||||| |||||| || |||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  16718146 taaattcaataggtttaattaaacagacgtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaa 16718072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17692356 - 17692282
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    |||||| |||||| || |||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  17692356 taaattcaataggtttaattaaacagacgtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaa 17692282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 162
Target Start/End: Original strand, 2733755 - 2733828
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggca 162  Q
    ||||||||||||| || || ||| | |  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  2733755 taaattaaataggtttaataaaacatgggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggca 2733828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26384 - 26171
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |    
T  26384 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------a 26299  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  26298 atactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgttatatta 26199  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26198 ttttttatgtagtgttttaggctctgtg 26171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 14332 - 14538
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |    
T  14332 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------a 14417  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtta 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14418 atactgtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgttatatta 14517  T
Q  220 ttttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  14518 ttttttatgtagtgttttagg 14538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2127 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold2127
Description:

Target: scaffold2127; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 641 - 816
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||    
T  641 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtttatattgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacatggttaattaaatagggtta 740  T
Q  120 atacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  741 atacagtaaaattaagcaaagaagttatgttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8539 - 8327
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||             
T  8539 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaatttaatagggtt--------- 8449  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8448 -----aatacaataaaattaagcaaagaagttaggttaaattttgggcaaaattttgccttcgggttaactttaagaaataagatattataacagttgtt 8354  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8353 atgttattttttatgtagtgttttagg 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9171 - 8986
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaataggg----ttgatta 109  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    || ||||    
T  9171 agtaaaattaaagagaaaaattaggagatatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgatcaaattaaacatggttaattaatta 9072  T
Q  110 aataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9071 aataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaattctaaggcaaaattttgcgtccgggttaactttaagaaataa 8986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 55237 - 55456
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  55237 agtaaaattaaggagaaaaattatgtgtgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 55327  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  55328 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgcgttcggattaactttaaggaatattatattacaatagttgtt 55422  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55423 atgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 55456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 232249 - 232423
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  232249 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggttaa 232348  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  232349 tacagtcaaattaagcaaggaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcaggtttactttaagaaataa 232423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 232881 - 233113
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacatttt-gattaaattaaatagggttgattaaataggatt 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  232881 attatggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttctctaacaattaacattaacatttttgattaaattaaatagggataatttaatagggtt 232980  T
Q  119 aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag---aaataagata---------ttacaat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||    |||||||||          || |||    
T  232981 aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctagagaaaatttttgcgttcgggttaactttaaggaataataagataagataagatatataat 233080  T
Q  207 agttgttatgttattttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  233081 agttgttatgttattttttatgtagtgctttag 233113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Original strand, 139349 - 139472
Alignment:
Q  124 agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttatttt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  139349 agtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcttgggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagatattataatagttgttatgttatttt 139448  T
Q  224 ttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||| |||||| ||||||    
T  139449 ttatgtagtgttttaggctctgtg 139472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Original strand, 139267 - 139349
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaa 96  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139267 agtaaaattaaggagaaaaattagaagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaa 139349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 14690 - 14902
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  14690 agtaaaattaaggagaaaaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 14780  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  14781 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttagcttaaatctagggaaaatttttacgtttgggttaactttaaggaataagagataacaatagttgtt 14875  T
Q  214 atgttattttttatgtagtgctttagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14876 atgttattttttatgtagtgctatagg 14902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 3689 - 3856
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||             
T  3689 agtaaaattaaacagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgtttaaattaaacagggtt--------- 3779  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3780 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggaaaaattttgcgttcgggttaaccttaagaaataa 3856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 11429 - 11596
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||             
T  11429 agtaaaattaaacagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgtttaaattaaacagggtt--------- 11519  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11520 -----aatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggaaaaattttgcgttcgggttaaccttaagaaataa 11596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17545
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  17765 agtaaaattaaggagataaattaggagcgatttgtctattttgatttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------- 17675  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgtt 213  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17674 -----aatactgtaaaattaagcaaagaagttagattaaatctatggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaggaataagagattacaatagttgtt 17580  T
Q  214 atgtta-ttttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17579 atattatttttttatgtagtgttttaggctctgtg 17545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18391 - 18217
Alignment:
Q  21 ttaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaa 120  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  18391 ttaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacgttaacattttatttaaattaaacaggattaattaaatagggttaa 18292  T
Q  121 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18291 tacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatctaggacaaaattttgagttcgggttaactttaagaaataa 18217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 10154 - 10335
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  10154 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaaagttaacattttgattaaattaaacaatgttaattaaata 10253  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10254 tggttaatacagtaagattaagcaaagaagttaggttaaatctagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaagaaataa 10335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 10903 - 11121
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggatta 119  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  ||||    
T  10903 attaaagagaaaaattaggagcgatttgtt-attttgatttccctaacaactaacgttaacattttgattaaattaaatagggttaatgcagtaaaatta 11001  T
Q  120 atacagtaaaattaagc-aaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgtt 218  Q
    |   | |||  ||| |  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  11002 agcaaataag-ttaggttaaataagttaggttaaatctagggaaaaattttgctttcgggttaactttaaggaataagagattgcaatagttattatgtt 11100  T
Q  219 attttttatgtagtgctttag 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11101 attttttatgtagtgctttag 11121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3191 - 2989
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||| |||||    
T  3191 aaattaggagcgatttgtttattttgatttccgtagcaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt--------------aatacaataaaa 3106  T
Q  131 ttaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatattacaatagttgttatgttattttttatgta 230  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3105 ttaagcatagaaattaggttaaatttagggcaaaattttgcgttcgggttaactttaaagaataagagattacaatagttgttatgttattttttatgta 3006  T
Q  231 gtgctttaggttctgtg 247  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  3005 gtgttttaggctctgtg 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3929 - 3765
Alignment:
Q  31 aaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  3929 aaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaacattaacattttgattaaattaaacagggttaattaaatagggttaatatagtaaaa 3830  T
Q  131 ttaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3829 ttaagcaaagaagttaggttaaatctagcacaaaattttgcgttcgggttaactttatgaaataa 3765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 10395 - 10335
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaac 74  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10395 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttattttgatttccctaacaattaac 10335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9705 - 9524
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggttgattaaata 113  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||    
T  9705 agtaaaattaaagagaaaaattaggagcgatttgtttatttatttttccctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaacatggataattaaata 9606  T
Q  114 ggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataa 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9605 gggttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatcctgggaaaatttttgcattcaggttaactttaagaaataa 9524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8954 - 8864
Alignment:
Q  14 agtaagattaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8954 agtaaaattaaggagaaaaattaggagtgatttgtttattttgatttctctaacaattaacattaacattttgattaaattaaatagggtt 8864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8865 - 8819
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  8865 ttaatacagtaaaattatgcaaagaaattaggtcaaatctagggcaa 8819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0432
Description:

Target: scaffold0432; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 197
Target Start/End: Original strand, 5490 - 5610
Alignment:
Q  77 taacattttgattaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttct 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  5490 taacattttgattaaattaattagggttaattaaatatgggtaatacagtaaaattaatcattaaagttaggttaaatctagggcaatattttgcgttcg 5589  T
Q  177 ggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  5590 ggttaactttaaggaataaga 5610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0432; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 5616 - 5669
Alignment:
Q  144 ttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  5616 ttagattaaatctagggcaacattttgcgttcgagttaactttaaggaataaga 5669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0759 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0759
Description:

Target: scaffold0759; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3617 - 3569
Alignment:
Q  199 attacaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggttctgtg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3617 attacaatagttgttatgttattttttatgtagtgctttaggctctgtg 3569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 8)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Original strand, 213 - 302
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatat 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||||||    
T  213 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctatggcaaaatattgcgtacgggttaattttaagtaataagatat 302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Original strand, 4533 - 4622
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatat 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||||||    
T  4533 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctatggcaaaatattgcgtacgggttaattttaagtaataagatat 4622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Original strand, 4217 - 4303
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  4217 atagggttaatatagtaaaattaaacagagaaattagggtaaatctatggcaaaatattgcgtacgggttaattttaagtaataaga 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Original strand, 4317 - 4407
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga-aataagatat 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||  | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  4317 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctagggaaaaatattggttacgggttaactttaagataataagatat 4407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Original strand, 4014 - 4095
Alignment:
Q  116 attaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  4014 attaatatagttaaattaagcagagaaattaaggtaaatctagggcaaaatattgcttacaggttaactttaagtaataaga 4095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 3 - 87
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga-aataagatat 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||  | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  3 ttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctagggaaaaatattggttacgggttaactttaagataataagatat 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 190
Target Start/End: Original strand, 105 - 184
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  105 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattatggtaaatctagggcaaaatattgctgacgggttaactttaaga 184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 190
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4504
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  4425 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattatggtaaatctagggcaaaatattgctgacgggttaactttaaga 4504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 16)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Original strand, 249 - 338
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataagatat 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||||||    
T  249 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctatggcaaaatattgcgtacgggttaattttaagtaataagatat 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22225 - 22141
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga-aataagatat 200  Q
    |||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  22225 ttaatatagtataattaagcagataaattaggttaaatctagggcaaaatattgcttacaggttaactttaagataataagatat 22141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22015 - 21936
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  22015 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattatggtaaatctagggcaaaatattgcttacaggttaactttaaga 21936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22523 - 22448
Alignment:
Q  115 gattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  22523 gattaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctagggcaaaatattgctaacaggttaactttaaga 22448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Original strand, 33 - 123
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga-aataagatat 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||  | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  33 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctagggaaaaatattggttacgggttaactttaagataataagatat 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20746 - 20673
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  20746 ttaatatagtaaaattaagcagagaaattatggtaaatctagggcaaaatattgcttacaggttaactttaaga 20673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 190
Target Start/End: Original strand, 141 - 220
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  141 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattatggtaaatctagggcaaaatattgctgacgggttaactttaaga 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20856 - 20805
Alignment:
Q  115 gattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaat 166  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20856 gattaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctagggcaaaat 20805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21277 - 21202
Alignment:
Q  115 gattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | |  |||||||||||||    
T  21277 gattaatatagtaaaattaaacagagaaattagggtaaatctagggcaaaatgttgcttacatgttaactttaaga 21202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21599 - 21520
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| |||| | |  |||||||||||||    
T  21599 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattatggtaaatctagggcaaaatattgcttacatgttaactttaaga 21520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20644 - 20558
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||    
T  20644 atagggttaatatagtaaaattaagcagcgaaattagggtaaatctatggcaaaatattgcgtacgagttaattttaagtaataaga 20558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21907 - 21821
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaagaaataaga 197  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || | |||||| ||| || | |||||| |||||| |||||||    
T  21907 atagggttaatatagtaaaattaagcagagaaattagggtaaatctatgccaaaatattgtgtacgggttaattttaagtaataaga 21821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20973 - 20884
Alignment:
Q  111 ataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga-aataagata 199  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| | |  ||||||||||||| |||||||||    
T  20973 atagggttaatatagtataattaagcagataaattaggttaaatctagggaaaaatattgcttacgagttaactttaagataataagata 20884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21701 - 21628
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaaga 190  Q
    |||||| |||| ||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  21701 ttaatatagtataataaagcagataaattaggttaaatctagggcaaaatattgcttacaggttaactttaaga 21628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21167 - 21111
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgt 173  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21167 ttaatatagtaaaattaagcagagaaattagagtaaatctagggcaaaatattgcgt 21111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22325 - 22253
Alignment:
Q  117 ttaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaag 189  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||| || | |||||| ||||||    
T  22325 ttaatatagtaaaattaagcagagaaattagagtaaatctagggcaaaatattgtgtacgggttaattttaag 22253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 13407 - 13515
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||| ||| || |||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | || ||||   ||||||||||||    
T  13407 taaattaaaaaggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaatagttagcgtctgggttaactttaa 13506  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  13507 taaataaga 13515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 13569 - 13677
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||| | ||| | || |||| | ||||||||||||    
T  13569 taaattaaataggtttaattaaataggggtaatacagtaaaagtaagcataaaatttaggttaaaattaagacaacagttagcgtccgggttaactttaa 13668  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  13669 taaataaga 13677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 13717 - 13825
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||   ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||| ||| | || | || | ||||||||||||    
T  13717 taaattaaataggtttaattaaacagaggtaatacagtaaaagtaagcataaaatttaggttaaaattaggacaacagttagtgtccgggttaactttaa 13816  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  13817 taaataaga 13825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 13872 - 13979
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||  |||  ||||||||||||| |||||| | || |||| ||||| ||||||||| | || ||||   ||||||||||||    
T  13872 taaattaaataggtttaattaac-aggggtaatacagtaaaagtaagcataaaatttagtttaaaattagggcaacagttagcgtctgggttaactttaa 13970  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  13971 taaataaga 13979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Original strand, 14026 - 14134
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactttaa 188  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||| |||| | | || |||||||||| ||| ||||| | |  |||| | ||||| ||||||    
T  14026 taaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacagtaaaagtaaggatataatttaggttaaaattaaggcaacagtcagcgtccgggttatctttaa 14125  T
Q  189 gaaataaga 197  Q
     ||||||||    
T  14126 taaataaga 14134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Original strand, 673 - 751
Alignment:
Q  20 attaaggagataaattaggagcgatttgtttattttgattttcctaacaattaacgttaacattttgattaaattaaatagggtt 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||      |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  673 attaaggagaaaaattaggagcgaattgtttactttgatttccataacaa------ttaacattttgattaaattaaatanggtt 751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 154
Target Start/End: Original strand, 739 - 787
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaat 154  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  739 attaaatanggttaatatagtaaaattcagcaaagaagttaagttaaat 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Original strand, 9624 - 9734
Alignment:
Q  87 attaaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaaaattttgcgttctggttaacttt 186  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| | | | ||  ||| | ||||||||||    
T  9624 attaaattaaataggtttaattaaacaggggtaatacattaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattaggactacagttaacgtccgggttaacttt 9723  T
Q  187 aagaaataaga 197  Q
    || ||||||||    
T  9724 aataaataaga 9734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Original strand, 9781 - 9855
Alignment:
Q  89 taaattaaatagggttgattaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggttaaatttagggcaa 163  Q
    ||||||||||||| || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  9781 taaattaaataggtttaattaaacacggctaatacagtaaaagtaagcatagaatttaggttaaaattagggcaa 9855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 185
Target Start/End: Original strand, 200930 - 201011
Alignment:
Q  106 attaaataggattaatacagtaaaattaagcaaagaagttaggtt--aaatttagggcaaaattttgcgttctggttaactt 185  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| |||| | | |||||||||    
T  200930 attaaatagggttaatatagtaaaattaagcaaagaaattaagttaaaaatttagggtaaaatattgcttacgggttaactt 201011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University