View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2966-Insertion-28 (Length: 332)

Name: NF2966-Insertion-28
Description: NF2966
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2966-Insertion-28
NF2966-Insertion-28
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (8-332)||(18214636-18214960)
chr4 (8-332)||(3515413-3515737)
chr4 (8-332)||(52313160-52313484)
chr4 (8-332)||(14970139-14970463)
chr4 (14-332)||(52872511-52872829)
chr4 (8-332)||(362779-363103)
chr4 (8-331)||(19617499-19617822)
chr4 (14-332)||(19857984-19858302)
chr4 (8-252)||(11880-12124)
chr4 (86-332)||(52312967-52313213)
chr4 (86-332)||(362586-362832)
chr4 (86-332)||(14746022-14746268)
chr4 (120-332)||(15495718-15495930)
chr4 (88-251)||(15534475-15534638)
chr4 (142-331)||(14185542-14185731)
chr4 (8-160)||(12778309-12778460)
chr4 (86-252)||(14970410-14970576)
chr4 (86-252)||(52872776-52872942)
chr4 (88-244)||(49547479-49547635)
chr4 (88-251)||(36038164-36038327)
chr4 (86-252)||(3515300-3515466)
chr4 (86-252)||(15118056-15118222)
chr4 (86-252)||(44772787-44772953)
chr4 (182-332)||(14745925-14746075)
chr4 (86-252)||(29267646-29267812)
chr4 (7-131)||(14745807-14745931)
chr4 (8-144)||(15489581-15489717)
chr4 (86-252)||(14746215-14746381)
chr4 (94-252)||(19857871-19858029)
chr4 (86-252)||(50222043-50222209)
chr4 (86-252)||(52312855-52313020)
chr4 (88-252)||(362473-362637)
chr4 (88-252)||(19617772-19617936)
chr4 (86-244)||(1837223-1837381)
chr4 (86-244)||(19243001-19243159)
chr4 (89-252)||(15495880-15496043)
chr4 (86-252)||(7640890-7641056)
chr4 (86-252)||(44615581-44615747)
chr4 (134-332)||(22725284-22725481)
chr4 (88-251)||(14048871-14049034)
chr4 (213-332)||(15117990-15118109)
chr4 (213-332)||(7640824-7640943)
chr4 (213-332)||(1837157-1837276)
chr4 (14-110)||(15354956-15355052)
chr4 (215-332)||(44772723-44772840)
chr4 (86-252)||(30147208-30147374)
chr4 (214-332)||(29267759-29267877)
chr4 (248-332)||(50222012-50222096)
chr4 (248-332)||(15534587-15534671)
chr4 (246-332)||(49547444-49547530)
chr4 (248-332)||(36038276-36038360)
chr4 (248-329)||(19243109-19243190)
chr4 (248-332)||(30147321-30147405)
chr4 (248-332)||(44615694-44615778)
chr4 (248-332)||(14048983-14049067)
chr4 (85-173)||(14185507-14185595)
chr4 (248-302)||(12033446-12033500)
chr4 (122-232)||(14951270-14951380)
chr4 (122-232)||(14995644-14995754)
chr4 (86-144)||(18214907-18214965)
chr4 (134-232)||(25120046-25120144)
chr4 (89-152)||(22725431-22725494)
chr4 (206-252)||(18214992-18215038)
chr4 (122-232)||(18247739-18247849)
chr4 (134-232)||(18293667-18293765)
chr4 (280-332)||(12778387-12778439)
chr4 (122-230)||(15287858-15287966)
chr4 (122-230)||(15294968-15295076)
chr4 (134-230)||(55377197-55377293)
chr4 (134-232)||(5683367-5683465)
chr4 (130-244)||(9198544-9198658)
chr4 (134-232)||(22355071-22355169)
chr4 (122-232)||(47357183-47357293)
chr4 (131-232)||(43281694-43281795)
chr4 (280-332)||(11959-12011)
chr4 (280-332)||(15489660-15489712)
chr4 (280-332)||(19617578-19617630)
chr4 (122-232)||(10643746-10643856)
chr4 (122-232)||(17146279-17146389)
chr4 (122-232)||(19020009-19020119)
chr4 (163-232)||(18168293-18168362)
chr4 (280-320)||(15355029-15355069)
chr4 (213-256)||(18239250-18239293)
chr4 (122-232)||(8374040-8374150)
chr4 (122-220)||(16731688-16731786)
chr4 (135-201)||(18218875-18218941)
chr4 (182-232)||(19698032-19698082)
chr4 (182-232)||(19708617-19708667)
chr4 (134-178)||(8808350-8808394)
chr4 (134-178)||(11557892-11557936)
[»] chr3 (110 HSPs)
chr3 (8-332)||(38961270-38961594)
chr3 (8-332)||(20629624-20629948)
chr3 (8-332)||(16282190-16282514)
chr3 (8-332)||(55318736-55319060)
chr3 (8-332)||(8499926-8500250)
chr3 (8-332)||(41124345-41124669)
chr3 (8-332)||(46822667-46822991)
chr3 (8-328)||(27165662-27165982)
chr3 (8-332)||(53300936-53301260)
chr3 (14-332)||(10557314-10557633)
chr3 (8-332)||(17444195-17444520)
chr3 (8-309)||(13937406-13937706)
chr3 (8-252)||(24513969-24514213)
chr3 (8-252)||(10379620-10379869)
chr3 (42-252)||(12119313-12119523)
chr3 (142-332)||(16358234-16358424)
chr3 (89-264)||(55319010-55319185)
chr3 (121-320)||(14567430-14567629)
chr3 (86-273)||(15465425-15465613)
chr3 (88-251)||(54521116-54521279)
chr3 (14-152)||(8899418-8899556)
chr3 (86-252)||(20629895-20630061)
chr3 (131-332)||(36528368-36528569)
chr3 (86-273)||(5223654-5223842)
chr3 (88-251)||(29544547-29544710)
chr3 (86-252)||(17463470-17463636)
chr3 (86-252)||(34159618-34159784)
chr3 (86-273)||(26054968-26055156)
chr3 (86-252)||(15977825-15977991)
chr3 (86-252)||(16282461-16282627)
chr3 (86-252)||(46822554-46822720)
chr3 (86-252)||(53301207-53301373)
chr3 (86-252)||(28848325-28848491)
chr3 (86-252)||(41124232-41124398)
chr3 (86-252)||(45606610-45606776)
chr3 (86-252)||(38961541-38961708)
chr3 (86-252)||(6468838-6469004)
chr3 (86-252)||(7781050-7781216)
chr3 (86-244)||(10247427-10247585)
chr3 (86-252)||(12567852-12568018)
chr3 (86-252)||(13153959-13154125)
chr3 (86-252)||(13436592-13436758)
chr3 (86-252)||(13544317-13544482)
chr3 (86-252)||(27165545-27165711)
chr3 (86-252)||(55476783-55476949)
chr3 (86-245)||(10557208-10557367)
chr3 (86-252)||(16453984-16454151)
chr3 (86-252)||(8499813-8499979)
chr3 (86-252)||(13151494-13151660)
chr3 (92-246)||(15412730-15412884)
chr3 (186-332)||(15007905-15008054)
chr3 (86-244)||(17444467-17444625)
chr3 (145-331)||(3264323-3264509)
chr3 (86-252)||(25237136-25237302)
chr3 (213-332)||(17463583-17463702)
chr3 (213-332)||(34159731-34159850)
chr3 (72-276)||(17393176-17393382)
chr3 (213-332)||(6468772-6468891)
chr3 (213-332)||(55476896-55477015)
chr3 (86-252)||(25229549-25229715)
chr3 (213-329)||(15412840-15412955)
chr3 (213-332)||(13153893-13154012)
chr3 (213-332)||(45606544-45606663)
chr3 (9-114)||(45220313-45220418)
chr3 (216-332)||(10247364-10247480)
chr3 (213-332)||(13151428-13151547)
chr3 (248-332)||(7781019-7781103)
chr3 (248-332)||(15977938-15978022)
chr3 (122-332)||(15465560-15465770)
chr3 (85-167)||(36528340-36528422)
chr3 (252-332)||(16453957-16454037)
chr3 (248-332)||(28848294-28848378)
chr3 (250-332)||(25229662-25229744)
chr3 (250-332)||(25237249-25237331)
chr3 (174-251)||(12305439-12305516)
chr3 (248-332)||(5223789-5223873)
chr3 (248-332)||(12305528-12305612)
chr3 (248-332)||(29544514-29544598)
chr3 (248-332)||(54521228-54521312)
chr3 (86-173)||(16358371-16358458)
chr3 (248-332)||(26054937-26055021)
chr3 (86-176)||(15007868-15007961)
chr3 (248-329)||(13436708-13436789)
chr3 (122-244)||(25058286-25058408)
chr3 (136-232)||(16934824-16934920)
chr3 (88-167)||(3264459-3264538)
chr3 (274-332)||(12567965-12568023)
chr3 (274-332)||(13544429-13544487)
chr3 (85-151)||(14567587-14567653)
chr3 (134-232)||(49231768-49231866)
chr3 (162-232)||(51158683-51158753)
chr3 (122-232)||(1468613-1468723)
chr3 (122-232)||(8276473-8276583)
chr3 (88-142)||(12305525-12305579)
chr3 (122-232)||(30152450-30152560)
chr3 (280-332)||(10379733-10379785)
chr3 (280-332)||(24514082-24514134)
chr3 (145-236)||(21026092-21026183)
chr3 (163-230)||(54039167-54039234)
chr3 (122-232)||(8269362-8269472)
chr3 (107-153)||(10555766-10555812)
chr3 (122-232)||(12808505-12808615)
chr3 (122-232)||(14528624-14528734)
chr3 (280-332)||(8899431-8899483)
chr3 (280-332)||(12119358-12119410)
chr3 (280-332)||(27165851-27165903)
chr3 (134-232)||(28557370-28557468)
chr3 (163-232)||(17956869-17956938)
chr3 (200-232)||(14263640-14263672)
chr3 (139-231)||(17959673-17959765)
[»] chr2 (95 HSPs)
chr2 (8-332)||(41523312-41523636)
chr2 (8-332)||(24368232-24368556)
chr2 (8-332)||(6726453-6726777)
chr2 (8-332)||(21154247-21154571)
chr2 (8-332)||(22105871-22106195)
chr2 (8-332)||(24918546-24918870)
chr2 (8-332)||(24528979-24529303)
chr2 (8-332)||(24671431-24671755)
chr2 (8-332)||(24681850-24682174)
chr2 (8-332)||(45027332-45027661)
chr2 (8-332)||(23706458-23706781)
chr2 (8-332)||(23931866-23932190)
chr2 (8-332)||(32214362-32214687)
chr2 (86-328)||(21154518-21154760)
chr2 (87-332)||(41523584-41523829)
chr2 (86-332)||(23709043-23709289)
chr2 (86-332)||(23706728-23706973)
chr2 (88-251)||(20261513-20261676)
chr2 (86-252)||(22105758-22105924)
chr2 (86-252)||(18809235-18809401)
chr2 (86-252)||(23706920-23707086)
chr2 (86-252)||(23711717-23711883)
chr2 (86-252)||(24368119-24368285)
chr2 (86-252)||(28577391-28577557)
chr2 (86-252)||(32214634-32214800)
chr2 (86-252)||(39682606-39682772)
chr2 (88-251)||(10684468-10684631)
chr2 (86-252)||(21154711-21154877)
chr2 (86-252)||(24671318-24671484)
chr2 (86-252)||(24918433-24918599)
chr2 (86-244)||(45027608-45027766)
chr2 (92-252)||(23131155-23131315)
chr2 (92-252)||(23133622-23133782)
chr2 (88-252)||(24681737-24681901)
chr2 (92-252)||(34402231-34402391)
chr2 (86-252)||(571690-571856)
chr2 (86-252)||(23135872-23136038)
chr2 (86-252)||(24897899-24898065)
chr2 (86-252)||(24900382-24900548)
chr2 (86-252)||(24902859-24903025)
chr2 (86-252)||(24905336-24905502)
chr2 (86-252)||(26505671-26505837)
chr2 (86-252)||(26508149-26508315)
chr2 (86-244)||(41523776-41523934)
chr2 (86-251)||(23709236-23709401)
chr2 (86-252)||(24642452-24642618)
chr2 (86-252)||(24907811-24907977)
chr2 (86-230)||(23931775-23931919)
chr2 (86-252)||(6726340-6726506)
chr2 (86-252)||(32039202-32039368)
chr2 (200-332)||(24642373-24642505)
chr2 (213-332)||(18809348-18809467)
chr2 (213-332)||(23711651-23711770)
chr2 (213-332)||(26505784-26505903)
chr2 (213-332)||(28577504-28577623)
chr2 (87-252)||(38967772-38967937)
chr2 (89-252)||(24529253-24529416)
chr2 (213-332)||(26508262-26508381)
chr2 (213-332)||(39682719-39682838)
chr2 (145-252)||(25616474-25616581)
chr2 (213-332)||(32039136-32039255)
chr2 (213-332)||(571803-571922)
chr2 (213-329)||(23131271-23131386)
chr2 (213-329)||(34402160-34402275)
chr2 (213-329)||(23133738-23133853)
chr2 (216-332)||(23708980-23709096)
chr2 (250-332)||(31345585-31345667)
chr2 (248-332)||(38967885-38967969)
chr2 (248-332)||(10684435-10684519)
chr2 (248-332)||(20261625-20261709)
chr2 (248-332)||(23135985-23136069)
chr2 (188-273)||(31345467-31345553)
chr2 (248-332)||(24897868-24897952)
chr2 (248-332)||(24900351-24900435)
chr2 (248-332)||(24902828-24902912)
chr2 (248-332)||(24905305-24905389)
chr2 (248-332)||(24907780-24907864)
chr2 (86-154)||(31345570-31345638)
chr2 (213-264)||(27920402-27920453)
chr2 (122-232)||(24686597-24686707)
chr2 (163-244)||(16900803-16900884)
chr2 (163-244)||(16994194-16994275)
chr2 (122-232)||(19887274-19887384)
chr2 (163-232)||(34823750-34823819)
chr2 (136-232)||(12727711-12727807)
chr2 (122-232)||(11232212-11232322)
chr2 (122-232)||(22514059-22514169)
chr2 (122-232)||(28776661-28776771)
chr2 (131-232)||(67339-67440)
chr2 (122-232)||(27261332-27261442)
chr2 (164-232)||(22274022-22274090)
chr2 (134-178)||(24788042-24788086)
chr2 (134-178)||(44584588-44584632)
chr2 (134-177)||(34135059-34135102)
chr2 (164-232)||(22283255-22283323)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (8-332)||(29298647-29298971)
chr1 (14-332)||(31612964-31613282)
chr1 (8-332)||(22122446-22122771)
chr1 (8-332)||(16274685-16275012)
chr1 (14-332)||(29777146-29777465)
chr1 (8-332)||(15859427-15859765)
chr1 (8-252)||(22050462-22050706)
chr1 (9-305)||(16401354-16401651)
chr1 (8-245)||(9044630-9044867)
chr1 (8-242)||(40129387-40129621)
chr1 (88-332)||(27161099-27161343)
chr1 (88-332)||(31612771-31613015)
chr1 (8-177)||(43543269-43543438)
chr1 (86-252)||(22122718-22122884)
chr1 (88-252)||(27161292-27161456)
chr1 (86-252)||(13989158-13989324)
chr1 (86-252)||(13227156-13227322)
chr1 (86-252)||(21922995-21923161)
chr1 (86-252)||(29777033-29777199)
chr1 (86-252)||(15859712-15859878)
chr1 (86-252)||(21841059-21841225)
chr1 (86-252)||(16362211-16362377)
chr1 (86-244)||(31612666-31612824)
chr1 (87-252)||(29298534-29298699)
chr1 (9-138)||(43630215-43630344)
chr1 (86-252)||(16274959-16275126)
chr1 (86-252)||(21474790-21474956)
chr1 (86-252)||(29535344-29535510)
chr1 (86-252)||(23593437-23593603)
chr1 (213-332)||(13989271-13989390)
chr1 (182-332)||(10812612-10812762)
chr1 (213-332)||(21474724-21474843)
chr1 (122-332)||(13227269-13227479)
chr1 (248-332)||(21841172-21841256)
chr1 (248-332)||(21922964-21923048)
chr1 (248-332)||(16362324-16362408)
chr1 (248-329)||(29535460-29535541)
chr1 (8-62)||(41231052-41231106)
chr1 (214-332)||(23593372-23593490)
chr1 (248-302)||(41372907-41372961)
chr1 (280-332)||(43543307-43543359)
chr1 (134-232)||(21858592-21858690)
chr1 (122-232)||(17003909-17004019)
chr1 (134-232)||(44035830-44035928)
chr1 (86-155)||(10812709-10812778)
chr1 (280-332)||(16401520-16401572)
chr1 (136-232)||(21650883-21650979)
chr1 (125-232)||(18060577-18060684)
chr1 (8-40)||(22122279-22122311)
chr1 (280-332)||(40129490-40129542)
chr1 (280-331)||(43630293-43630344)
chr1 (282-332)||(9044711-9044761)
chr1 (282-332)||(22050543-22050593)
chr1 (122-232)||(22366527-22366637)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (8-332)||(16214090-16214414)
chr7 (8-332)||(15081274-15081598)
chr7 (8-332)||(14269196-14269520)
chr7 (8-332)||(8940881-8941204)
chr7 (8-258)||(38897660-38897910)
chr7 (8-332)||(21189037-21189352)
chr7 (8-252)||(8469028-8469272)
chr7 (8-252)||(11972841-11973085)
chr7 (86-332)||(14269467-14269713)
chr7 (86-332)||(8940689-8940934)
chr7 (39-329)||(14156545-14156832)
chr7 (86-273)||(25926833-25927021)
chr7 (86-252)||(15376417-15376583)
chr7 (86-252)||(16410351-16410517)
chr7 (86-252)||(20384827-20384993)
chr7 (88-251)||(11303541-11303704)
chr7 (88-251)||(23664658-23664821)
chr7 (86-252)||(14948826-14948992)
chr7 (86-252)||(16213977-16214143)
chr7 (86-252)||(24702521-24702687)
chr7 (86-252)||(24704968-24705134)
chr7 (86-252)||(27217153-27217319)
chr7 (134-329)||(45847213-45847408)
chr7 (86-252)||(456614-456780)
chr7 (86-252)||(14269660-14269826)
chr7 (86-252)||(32125783-32125949)
chr7 (86-273)||(13918106-13918295)
chr7 (86-243)||(15081545-15081702)
chr7 (86-273)||(1856933-1857120)
chr7 (88-251)||(16108394-16108557)
chr7 (88-251)||(29796904-29797067)
chr7 (88-251)||(29800723-29800886)
chr7 (86-252)||(16232813-16232979)
chr7 (86-252)||(41523210-41523376)
chr7 (86-252)||(41525672-41525838)
chr7 (86-252)||(8940572-8940742)
chr7 (86-259)||(10501097-10501270)
chr7 (92-252)||(13869641-13869801)
chr7 (89-252)||(21189302-21189465)
chr7 (86-252)||(18627858-18628024)
chr7 (86-252)||(18640564-18640730)
chr7 (86-252)||(26355685-26355851)
chr7 (86-252)||(26358137-26358303)
chr7 (86-240)||(18431016-18431170)
chr7 (8-114)||(45846877-45846983)
chr7 (86-259)||(14156782-14156951)
chr7 (213-332)||(15376351-15376470)
chr7 (213-332)||(16410464-16410583)
chr7 (213-332)||(20384761-20384880)
chr7 (90-276)||(17985092-17985279)
chr7 (213-332)||(27217266-27217385)
chr7 (39-219)||(10500887-10501064)
chr7 (86-252)||(45847358-45847524)
chr7 (213-332)||(456727-456846)
chr7 (213-331)||(26355619-26355737)
chr7 (213-331)||(26358071-26358189)
chr7 (213-329)||(13869757-13869872)
chr7 (213-332)||(16232926-16233045)
chr7 (213-332)||(18627971-18628090)
chr7 (213-332)||(18640677-18640796)
chr7 (165-331)||(11310162-11310327)
chr7 (213-316)||(11392937-11393040)
chr7 (137-244)||(11393041-11393148)
chr7 (153-252)||(13841347-13841446)
chr7 (122-332)||(25926676-25926886)
chr7 (82-155)||(23461791-23461864)
chr7 (248-332)||(32125896-32125980)
chr7 (248-332)||(41523323-41523407)
chr7 (248-332)||(41525785-41525869)
chr7 (248-332)||(14948795-14948879)
chr7 (248-332)||(18431117-18431201)
chr7 (248-332)||(24702634-24702718)
chr7 (248-332)||(24705081-24705165)
chr7 (248-332)||(29797016-29797100)
chr7 (248-332)||(29800835-29800919)
chr7 (246-332)||(10501064-10501150)
chr7 (122-332)||(23664499-23664709)
chr7 (248-325)||(13918075-13918152)
chr7 (248-332)||(16108361-16108445)
chr7 (122-332)||(1856776-1856986)
chr7 (248-332)||(11303653-11303737)
chr7 (10-69)||(14317629-14317688)
chr7 (8-56)||(23461745-23461793)
chr7 (122-232)||(7822013-7822123)
chr7 (122-232)||(7829324-7829434)
chr7 (85-167)||(11310133-11310214)
chr7 (122-232)||(27102511-27102621)
chr7 (122-232)||(27109859-27109969)
chr7 (122-232)||(27175705-27175815)
chr7 (122-232)||(38784603-38784713)
chr7 (135-232)||(11286976-11287073)
chr7 (136-232)||(15951607-15951703)
chr7 (122-232)||(125965-126075)
chr7 (122-232)||(15760738-15760848)
chr7 (134-232)||(32495062-32495160)
chr7 (134-214)||(10000996-10001076)
chr7 (123-155)||(20110747-20110779)
chr7 (282-332)||(38897741-38897791)
chr7 (283-332)||(17985092-17985141)
chr7 (280-332)||(8469141-8469193)
chr7 (282-330)||(10500934-10500982)
chr7 (134-178)||(13475728-13475772)
chr7 (282-330)||(14156592-14156640)
chr7 (280-332)||(23461796-23461848)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (8-332)||(501470-501794)
scaffold0001 (87-252)||(501358-501522)
scaffold0001 (134-178)||(139589-139633)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (8-332)||(15202418-15202742)
chr8 (8-332)||(19896920-19897244)
chr8 (8-332)||(32122134-32122458)
chr8 (8-329)||(38549245-38549565)
chr8 (8-332)||(24049016-24049340)
chr8 (8-332)||(27471849-27472173)
chr8 (8-332)||(20403685-20404009)
chr8 (8-329)||(15070969-15071290)
chr8 (14-332)||(19936347-19936664)
chr8 (8-332)||(16412747-16413072)
chr8 (8-252)||(1326557-1326801)
chr8 (86-332)||(16401243-16401488)
chr8 (86-332)||(19896727-19896973)
chr8 (86-332)||(15202689-15202935)
chr8 (8-230)||(11361024-11361247)
chr8 (88-332)||(16401437-16401681)
chr8 (86-329)||(38549515-38549758)
chr8 (14-178)||(32810263-32810427)
chr8 (86-252)||(1484694-1484860)
chr8 (86-252)||(14409148-14409314)
chr8 (86-252)||(14824067-14824233)
chr8 (86-252)||(16198187-16198353)
chr8 (86-261)||(14397444-14397619)
chr8 (86-252)||(5852996-5853162)
chr8 (86-252)||(24485747-24485913)
chr8 (86-252)||(15202882-15203048)
chr8 (86-252)||(16413019-16413185)
chr8 (86-252)||(18677768-18677934)
chr8 (86-252)||(27472120-27472286)
chr8 (86-252)||(32122021-32122187)
chr8 (86-252)||(38549708-38549874)
chr8 (86-252)||(19936611-19936777)
chr8 (92-252)||(4483573-4483733)
chr8 (86-252)||(4542077-4542243)
chr8 (86-244)||(15070861-15071019)
chr8 (86-252)||(24048904-24049069)
chr8 (86-244)||(20045899-20046057)
chr8 (86-252)||(20403572-20403738)
chr8 (86-252)||(22002045-22002211)
chr8 (87-224)||(45290252-45290389)
chr8 (86-252)||(19896614-19896780)
chr8 (122-252)||(25657892-25658022)
chr8 (126-240)||(45290385-45290499)
chr8 (213-332)||(1484807-1484926)
chr8 (213-332)||(5852930-5853049)
chr8 (213-332)||(14409082-14409201)
chr8 (86-252)||(16401628-16401794)
chr8 (213-332)||(20045833-20045952)
chr8 (213-332)||(14824180-14824299)
chr8 (8-111)||(37609834-37609936)
chr8 (213-329)||(4483689-4483804)
chr8 (214-332)||(45290186-45290304)
chr8 (222-320)||(16401186-16401284)
chr8 (248-332)||(4542046-4542130)
chr8 (248-332)||(24485716-24485800)
chr8 (254-332)||(14397419-14397497)
chr8 (248-332)||(22002158-22002242)
chr8 (122-332)||(16198300-16198510)
chr8 (248-329)||(18677737-18677818)
chr8 (8-62)||(20457354-20457408)
chr8 (122-232)||(15319988-15320098)
chr8 (122-232)||(15500357-15500467)
chr8 (134-232)||(24717722-24717820)
chr8 (134-232)||(22007097-22007195)
chr8 (163-232)||(13663129-13663198)
chr8 (122-232)||(223304-223414)
chr8 (122-232)||(272163-272273)
chr8 (122-232)||(643576-643686)
chr8 (122-232)||(688075-688185)
chr8 (122-232)||(736927-737037)
chr8 (122-232)||(829382-829492)
chr8 (122-232)||(860822-860932)
chr8 (122-232)||(22089372-22089482)
chr8 (163-232)||(29759429-29759498)
chr8 (280-332)||(1326636-1326688)
chr8 (280-332)||(38549324-38549376)
chr8 (122-232)||(17150615-17150725)
chr8 (225-269)||(11360953-11360997)
chr8 (136-232)||(39114415-39114511)
chr8 (222-276)||(3844554-3844609)
chr8 (145-232)||(21493050-21493137)
chr8 (182-232)||(18611952-18612002)
chr8 (122-232)||(22146977-22147087)
chr8 (163-232)||(18618830-18618899)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (8-332)||(2154064-2154388)
chr5 (8-332)||(20917279-20917603)
chr5 (14-332)||(29330388-29330706)
chr5 (9-330)||(32028433-32028754)
chr5 (8-332)||(295707-296031)
chr5 (8-332)||(17516402-17516727)
chr5 (28-332)||(20901373-20901677)
chr5 (86-332)||(32028044-32028291)
chr5 (86-332)||(17516674-17516920)
chr5 (86-332)||(32027851-32028097)
chr5 (86-332)||(32028238-32028484)
chr5 (88-252)||(17516869-17517033)
chr5 (86-254)||(295978-296146)
chr5 (86-252)||(2154335-2154501)
chr5 (86-245)||(20901624-20901783)
chr5 (86-245)||(20917550-20917709)
chr5 (86-245)||(32027745-32027904)
chr5 (86-252)||(264472-264638)
chr5 (86-244)||(20909312-20909470)
chr5 (86-252)||(10732644-10732810)
chr5 (86-244)||(29346280-29346438)
chr5 (89-251)||(37804609-37804771)
chr5 (86-251)||(29330276-29330441)
chr5 (92-252)||(39363677-39363837)
chr5 (86-252)||(23064806-23064972)
chr5 (86-244)||(29348753-29348911)
chr5 (86-244)||(29351226-29351384)
chr5 (86-252)||(39245428-39245594)
chr5 (92-252)||(38619729-38619889)
chr5 (86-252)||(42245069-42245235)
chr5 (213-332)||(264406-264525)
chr5 (213-332)||(20909417-20909536)
chr5 (213-332)||(29346385-29346504)
chr5 (213-332)||(29348858-29348977)
chr5 (213-332)||(29351331-29351450)
chr5 (213-332)||(39245541-39245660)
chr5 (213-327)||(23064924-23065038)
chr5 (213-329)||(39363793-39363908)
chr5 (122-251)||(9776652-9776781)
chr5 (213-329)||(38619845-38619960)
chr5 (214-332)||(42245004-42245122)
chr5 (248-332)||(10732613-10732697)
chr5 (122-332)||(37804449-37804659)
chr5 (122-232)||(22883903-22884013)
chr5 (122-232)||(43444008-43444118)
chr5 (122-232)||(11903-12013)
chr5 (122-232)||(25426177-25426287)
chr5 (134-232)||(27183180-27183278)
chr5 (163-232)||(1220384-1220453)
chr5 (163-232)||(10778832-10778901)
chr5 (122-230)||(7424879-7424987)
chr5 (122-232)||(11342190-11342300)
chr5 (122-232)||(21933242-21933352)
chr5 (122-232)||(21939412-21939522)
chr5 (122-232)||(22367094-22367204)
chr5 (122-232)||(35581340-35581450)
chr5 (122-232)||(36990638-36990748)
chr5 (122-232)||(18778605-18778715)
chr5 (122-232)||(21074208-21074318)
chr5 (163-232)||(11212734-11212803)
chr5 (164-232)||(23511127-23511195)
chr5 (134-173)||(22755231-22755270)
chr5 (134-232)||(19499428-19499526)
chr5 (162-232)||(32950213-32950283)
chr5 (134-232)||(35791736-35791834)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (12-332)||(6857-7177)
scaffold0574 (86-244)||(6752-6910)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (8-332)||(6369-6692)
scaffold0317 (86-252)||(6639-6805)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (8-317)||(18358-18667)
scaffold0322 (280-332)||(18536-18588)
[»] chr6 (94 HSPs)
chr6 (8-329)||(1598658-1598979)
chr6 (8-332)||(19847404-19847728)
chr6 (8-332)||(19005557-19005881)
chr6 (8-332)||(31629973-31630297)
chr6 (8-332)||(18914531-18914855)
chr6 (8-332)||(30676151-30676466)
chr6 (8-252)||(23992715-23992959)
chr6 (8-252)||(34963666-34963910)
chr6 (8-244)||(25535708-25535945)
chr6 (89-332)||(8830-9073)
chr6 (86-332)||(1598462-1598708)
chr6 (86-332)||(26924151-26924397)
chr6 (86-332)||(25688908-25689154)
chr6 (86-328)||(18914342-18914584)
chr6 (89-286)||(1871-2068)
chr6 (118-332)||(25689101-25689315)
chr6 (133-332)||(25737048-25737247)
chr6 (157-320)||(22981321-22981484)
chr6 (157-320)||(23806924-23807087)
chr6 (86-252)||(1598349-1598515)
chr6 (89-288)||(79-278)
chr6 (86-252)||(18334296-18334462)
chr6 (86-252)||(24422839-24423005)
chr6 (86-252)||(33862086-33862252)
chr6 (86-252)||(33864570-33864736)
chr6 (86-273)||(23415235-23415423)
chr6 (86-244)||(26924344-26924502)
chr6 (86-252)||(30676413-30676579)
chr6 (86-273)||(27556993-27557181)
chr6 (88-251)||(28289042-28289205)
chr6 (86-252)||(1540615-1540781)
chr6 (86-252)||(2290884-2291050)
chr6 (86-252)||(8055322-8055488)
chr6 (86-252)||(12742610-12742776)
chr6 (86-252)||(31630244-31630410)
chr6 (86-244)||(19005452-19005610)
chr6 (111-252)||(17377576-17377717)
chr6 (86-252)||(19847675-19847837)
chr6 (86-244)||(18914233-18914391)
chr6 (86-252)||(25688795-25688961)
chr6 (86-252)||(22782519-22782685)
chr6 (86-252)||(19858626-19858789)
chr6 (213-332)||(18334230-18334349)
chr6 (213-332)||(24422952-24423071)
chr6 (213-332)||(33864683-33864802)
chr6 (213-332)||(2290818-2290937)
chr6 (8-102)||(17027976-17028070)
chr6 (213-332)||(8055435-8055554)
chr6 (86-205)||(15892112-15892231)
chr6 (213-332)||(22782632-22782751)
chr6 (213-319)||(26924085-26924191)
chr6 (88-251)||(12942495-12942646)
chr6 (88-186)||(17883203-17883301)
chr6 (248-332)||(19858595-19858679)
chr6 (248-332)||(33862199-33862283)
chr6 (248-332)||(12742723-12742807)
chr6 (248-332)||(23415370-23415454)
chr6 (248-332)||(1540584-1540668)
chr6 (248-332)||(12942595-12942679)
chr6 (248-332)||(15892081-15892165)
chr6 (248-332)||(17883170-17883254)
chr6 (248-332)||(27557128-27557212)
chr6 (86-159)||(25737028-25737101)
chr6 (248-332)||(28289009-28289093)
chr6 (122-232)||(16240296-16240406)
chr6 (122-232)||(16556944-16557054)
chr6 (122-232)||(16633500-16633610)
chr6 (122-232)||(16650174-16650284)
chr6 (86-151)||(9020-9085)
chr6 (280-332)||(34963779-34963831)
chr6 (8-51)||(25689320-25689363)
chr6 (122-232)||(25904474-25904585)
chr6 (8-50)||(16198293-16198335)
chr6 (134-232)||(19984130-19984228)
chr6 (122-232)||(27654596-27654706)
chr6 (134-232)||(35016015-35016113)
chr6 (280-332)||(25535813-25535865)
chr6 (134-232)||(22226580-22226679)
chr6 (282-332)||(1871-1921)
chr6 (122-232)||(10487971-10488081)
chr6 (122-232)||(16377247-16377357)
chr6 (122-232)||(16384571-16384681)
chr6 (122-232)||(16826367-16826477)
chr6 (134-232)||(21776107-21776205)
chr6 (209-246)||(15875700-15875737)
chr6 (134-178)||(10905416-10905460)
chr6 (122-230)||(19609582-19609690)
chr6 (122-232)||(1555527-1555637)
chr6 (122-232)||(33315075-33315185)
chr6 (86-129)||(22981443-22981486)
chr6 (86-129)||(23806922-23806965)
chr6 (122-232)||(22593581-22593691)
chr6 (122-232)||(25175112-25175222)
chr6 (280-332)||(23992828-23992880)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (8-332)||(43145-43468)
scaffold0040 (86-252)||(43032-43198)
scaffold0040 (135-252)||(13379-13496)
scaffold0040 (8-80)||(20502-20574)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (8-332)||(1660-1984)
scaffold1296 (86-165)||(1634-1713)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (8-332)||(10772-11096)
scaffold0306 (8-302)||(15348-15641)
scaffold0306 (86-252)||(11043-11209)
scaffold0306 (120-244)||(15223-15347)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (8-332)||(5100-5424)
scaffold0716 (86-244)||(4995-5153)
[»] scaffold0043 (3 HSPs)
scaffold0043 (10-331)||(10391-10712)
scaffold0043 (88-332)||(10197-10441)
scaffold0043 (88-252)||(10084-10248)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (8-332)||(30425-30749)
scaffold0149 (86-252)||(30312-30478)
scaffold0149 (8-80)||(34154-34226)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (8-332)||(16872-17196)
scaffold0023 (86-252)||(94703-94869)
scaffold0023 (86-252)||(17143-17309)
scaffold0023 (213-332)||(94816-94935)
scaffold0023 (163-232)||(154892-154961)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (8-332)||(8338-8662)
scaffold0278 (86-332)||(8145-8391)
scaffold0278 (88-244)||(8040-8196)
[»] scaffold1792 (5 HSPs)
scaffold1792 (8-320)||(785-1088)
scaffold1792 (89-252)||(500-663)
scaffold1792 (166-332)||(613-779)
scaffold1792 (280-332)||(966-1018)
scaffold1792 (86-130)||(782-826)
[»] scaffold0230 (8 HSPs)
scaffold0230 (8-320)||(22812-23115)
scaffold0230 (86-252)||(14240-14406)
scaffold0230 (89-252)||(23237-23400)
scaffold0230 (166-332)||(23121-23287)
scaffold0230 (8-136)||(20636-20764)
scaffold0230 (248-332)||(14353-14437)
scaffold0230 (280-332)||(22882-22934)
scaffold0230 (86-130)||(23074-23118)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (8-252)||(148-393)
scaffold0494 (280-332)||(228-280)
[»] scaffold0747 (3 HSPs)
scaffold0747 (8-222)||(1225-1438)
scaffold0747 (104-328)||(999-1223)
scaffold0747 (86-244)||(890-1048)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (86-332)||(3813-4059)
scaffold0741 (86-330)||(3620-3864)
scaffold0741 (86-252)||(4006-4172)
scaffold0741 (199-332)||(3540-3673)
[»] scaffold0711 (4 HSPs)
scaffold0711 (87-314)||(7395-7621)
scaffold0711 (86-332)||(7201-7446)
scaffold0711 (157-332)||(7079-7254)
scaffold0711 (8-78)||(7009-7079)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (8-233)||(38281-38506)
[»] scaffold0151 (3 HSPs)
scaffold0151 (89-294)||(36905-37110)
scaffold0151 (126-309)||(36749-36932)
scaffold0151 (8-37)||(36711-36740)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (8-166)||(398-556)
scaffold0021 (280-332)||(425-477)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (86-273)||(31474-31662)
scaffold0051 (248-332)||(31609-31693)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (88-273)||(17924-18110)
scaffold0200 (248-332)||(18059-18143)
[»] scaffold0695 (2 HSPs)
scaffold0695 (86-252)||(6239-6405)
scaffold0695 (246-332)||(6352-6438)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (88-245)||(33471-33628)
scaffold0138 (248-332)||(33577-33661)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (86-252)||(38114-38280)
scaffold0134 (213-332)||(38227-38346)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (88-251)||(3317-3480)
scaffold0422 (248-332)||(3429-3513)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (86-252)||(9534-9700)
scaffold0363 (248-332)||(9647-9731)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (86-251)||(39626-39791)
scaffold0117 (248-332)||(39738-39822)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (86-252)||(21040-21207)
scaffold0254 (248-332)||(21153-21238)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (86-252)||(13685-13851)
scaffold0444 (212-332)||(13798-13918)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (86-252)||(68254-68420)
scaffold0064 (248-332)||(68367-68451)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (86-244)||(40700-40858)
scaffold0044 (212-332)||(40805-40925)
scaffold0044 (122-244)||(37848-37969)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (86-259)||(8304-8477)
scaffold0436 (248-332)||(8424-8508)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (86-273)||(19792-19980)
scaffold0293 (248-332)||(19761-19845)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (88-246)||(11588-11746)
scaffold0029 (248-332)||(11695-11779)
[»] scaffold0028 (10 HSPs)
scaffold0028 (86-252)||(134503-134669)
scaffold0028 (86-252)||(136972-137138)
scaffold0028 (86-252)||(139441-139607)
scaffold0028 (86-252)||(141910-142076)
scaffold0028 (86-252)||(144379-144545)
scaffold0028 (248-332)||(134616-134700)
scaffold0028 (248-332)||(137085-137169)
scaffold0028 (248-332)||(139554-139638)
scaffold0028 (248-332)||(142023-142107)
scaffold0028 (248-332)||(144492-144576)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (123-252)||(53612-53741)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (142-251)||(1722-1831)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (8-99)||(60575-60666)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (8-105)||(107108-107205)
scaffold0035 (122-232)||(110064-110174)
scaffold0035 (122-232)||(118565-118675)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (9-276)||(113284-113550)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (8-102)||(7420-7514)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (8-87)||(43280-43359)
scaffold0042 (86-167)||(75608-75689)
scaffold0042 (280-332)||(75609-75661)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (161-252)||(57774-57865)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (122-232)||(725-835)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (248-309)||(5-66)
scaffold0454 (175-252)||(11065-11142)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (122-232)||(30470-30580)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (122-261)||(1347-1485)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (122-232)||(6195-6305)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (134-232)||(6941-7039)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (122-232)||(8566-8676)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (134-232)||(32118-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (134-232)||(40628-40726)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (200-252)||(28134-28186)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (122-232)||(18205-18315)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (122-232)||(28469-28579)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (122-232)||(38375-38485)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (134-232)||(19911-20009)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (161-232)||(12519-12590)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (162-232)||(868-938)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (130-244)||(1219-1333)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (212-258)||(233-279)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (162-232)||(79003-79073)
scaffold0034 (162-232)||(39965-40035)
scaffold0034 (162-232)||(45448-45518)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (134-230)||(15780-15876)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (137-232)||(8097-8192)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (134-173)||(53939-53978)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (134-232)||(53946-54044)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (163-232)||(1296-1365)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (122-230)||(912-1020)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 18214636 - 18214960
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18214636 atgattgtgatgattttgaaggaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctgg 18214735  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18214736 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 18214835  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214836 gaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 18214935  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  18214936 tggtacagaattggtcttaggtgta 18214960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3515737 - 3515413
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3515737 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgttttttctgatttttcttttcatctctaccctgaatttgaaatgaaatctgg 3515638  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3515637 tattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaaaacgatttata 3515538  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515537 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 3515438  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
     | |||| ||||| |||||||||||    
T  3515437 cggtacaaaattggtcttaggtgta 3515413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52313484 - 52313160
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313484 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttaaataatatggggtgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 52313385  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52313384 tattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 52313285  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52313284 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgat 52313185  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
     | | ||||||||||||||||||||    
T  52313184 aggtccagaattgatcttaggtgta 52313160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 14970139 - 14970463
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14970139 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 14970238  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||  || || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970239 tattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 14970338  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970339 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 14970438  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || || ||||||| |||||||||||    
T  14970439 tggtatagaattggtcttaggtgta 14970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Original strand, 52872511 - 52872829
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52872511 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattga 52872610  T
Q  114 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaactt 213  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52872611 ttggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactt 52872710  T
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52872711 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 52872810  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  52872811 ataattggtcttaggtgta 52872829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 363103 - 362779
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  363103 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatatgttgctttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatgtgg 363004  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  363003 tattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttata 362904  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  362903 gaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 362804  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  362803 tggtacagaattggtcttaggtgta 362779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Original strand, 19617499 - 19617822
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617499 atgattttgatgatttcgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttctatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 19617598  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  19617599 tattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaaaatgatttatt 19617698  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19617699 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgat 19617798  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgt 331  Q
    || |||||| ||| ||||||||||    
T  19617799 tggtacagagttggtcttaggtgt 19617822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19858302 - 19857984
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19858302 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctaccccgaatttgaaatgaaaaatggtattga 19858203  T
Q  114 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaactt 213  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19858202 ttggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactt 19858103  T
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19858102 gagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgagaaatgaaaactggtattgattggtac 19858003  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  19858002 aaaattggtcttaggtgta 19857984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 11880 - 12124
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11880 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttctttttatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 11979  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  11980 tattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttata 12079  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12080 gaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 12124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52313213 - 52312967
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52313213 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttgg 52313114  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  52313113 tatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaagtttgtccgaatt 52313014  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52313013 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 52312967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 362832 - 362586
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362832 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 362733  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  362732 tctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgattttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatt 362633  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  362632 tgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgta 362586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 14746022 - 14746268
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14746022 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 14746121  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14746122 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 14746221  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  14746222 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgta 14746268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 120 - 332
Target Start/End: Original strand, 15495718 - 15495930
Alignment:
Q  120 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15495718 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagtta 15495817  T
Q  220 tggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaatt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15495818 tggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcctaatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaatt 15495917  T
Q  320 gatcttaggtgta 332  Q
    | |||||||||||    
T  15495918 ggtcttaggtgta 15495930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15534638 - 15534475
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15534638 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 15534539  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15534538 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15534475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185542
Alignment:
Q  142 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  242 tcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgt 331  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaatctttaggaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgt 14185542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 12778309 - 12778460
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778309 atgattgtgataattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttt-cttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 12778407  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 160  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778408 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 14970410 - 14970576
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970410 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 14970509  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14970510 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 14970576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 52872776 - 52872942
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52872776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 52872875  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52872876 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 244
Target Start/End: Original strand, 49547479 - 49547635
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49547479 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 49547578  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547579 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 49547635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36038327 - 36038164
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  36038327 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtt 36038228  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36038227 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 36038164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3515466 - 3515300
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515466 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 3515367  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3515366 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 15118056 - 15118222
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15118056 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15118155  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15118156 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15118222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 44772787 - 44772953
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44772787 ccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 44772886  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772887 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 44772953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 332
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14746075
Alignment:
Q  182 ttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcg 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaatttttatgaatttcagcacaactttgtccg 14746024  T
Q  282 aatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14746025 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 14746075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29267812 - 29267646
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29267812 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttgg 29267713  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29267712 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 29267646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 14745807 - 14745931
Alignment:
Q  7 aatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14745807 aatgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatttg 14745906  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14745907 gtattgataggtccagaattggtct 14745931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 144
Target Start/End: Original strand, 15489581 - 15489717
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15489581 atgattgtgaagattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaagtctgg 15489680  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacac 144  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  15489681 tattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 14746215 - 14746381
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14746215 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 14746314  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14746315 tttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14746381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19858029 - 19857871
Alignment:
Q  94 gaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  19858029 gaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgactt 19857930  T
Q  194 caaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19857929 caaaataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19857871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 50222043 - 50222209
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50222043 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 50222142  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50222143 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 50222209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 52313020 - 52312855
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52313020 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 52312921  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  52312920 ttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaat 52312855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 362637 - 362473
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  362637 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtt 362538  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362537 tgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Original strand, 19617772 - 19617936
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  19617772 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtg 19617871  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19617872 tgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 1837223 - 1837381
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1837223 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1837322  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1837323 tttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 1837381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19243159 - 19243001
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19243159 ccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttgg 19243060  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19243059 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtca 19243001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 15495880 - 15496043
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15495880 aatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 15495979  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15495980 aaattcgaaaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 15496043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 7640890 - 7641056
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  7640890 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattgg 7640989  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7640990 tttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaat 7641056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44615747 - 44615581
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44615747 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 44615648  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44615647 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44615581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 332
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725481
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  234 cacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaatctttatgaatttcagcacaacttttcccaaatttgaaatgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgta 22725481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14049034 - 14048871
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14049034 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtt 14048935  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14048934 tgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 14048871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 15117990 - 15118109
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15117990 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 15118089  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15118090 cagaattggtcttaggtgta 15118109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 7640824 - 7640943
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7640824 tgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 7640923  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  7640924 cagaattggtcttaggtgta 7640943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 1837157 - 1837276
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1837157 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 1837256  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  1837257 cagaattggtcttaggtgta 1837276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 110
Target Start/End: Original strand, 15354956 - 15355052
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15354956 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataacataggttgctttttctgatttttctttccatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtat 15355052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 332
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772840
Alignment:
Q  215 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctaca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgtccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtaga 44772822  T
Q  315 gaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||| |||||||||||    
T  44772823 gaattggtcttaggtgta 44772840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30147374 - 30147208
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |  ||   |||| | ||||    
T  30147374 ccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattgg 30147275  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  30147274 tatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaat 30147208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29267877 - 29267759
Alignment:
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    |||||||| | ||| |||| || | ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29267877 gagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 29267778  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  29267777 agaattggtcttaggtgta 29267759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 50222012 - 50222096
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  50222012 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 50222096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15534671 - 15534587
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15534671 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 15534587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 332
Target Start/End: Original strand, 49547444 - 49547530
Alignment:
Q  246 aatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  49547444 aatgaatttttatgaatttcagcacaaatttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 49547530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36038360 - 36038276
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  36038360 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgta 36038276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19243190 - 19243109
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  19243190 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggt 19243109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30147405 - 30147321
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  30147405 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgta 30147321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44615778 - 44615694
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  44615778 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgta 44615694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14049067 - 14048983
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  14049067 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgta 14048983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14185595 - 14185507
Alignment:
Q  85 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 173  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |  |||||||||||    
T  14185595 cccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtagataagtgtgttagctttc 14185507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 12033446 - 12033500
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggta 302  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12033446 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggta 12033500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14951380 - 14951270
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14951380 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatg 14951281  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  14951280 atcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14995754 - 14995644
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14995754 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatg 14995655  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  14995654 atcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Original strand, 18214907 - 18214965
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacac 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18214907 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 18214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Original strand, 22725431 - 22725494
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 152  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22725431 aatttgaaatgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 252
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215038
Alignment:
Q  206 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18215038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18247849 - 18247739
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18247849 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18247750  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  18247749 attaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 18293667 - 18293765
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18293667 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18293765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 12778387 - 12778439
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12778387 cgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 12778439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 15287858 - 15287966
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15287858 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15287957  T
Q  222 gtcaaatta 230  Q
     ||||||||    
T  15287958 atcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Original strand, 15294968 - 15295076
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15294968 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15295067  T
Q  222 gtcaaatta 230  Q
     ||||||||    
T  15295068 atcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Original strand, 55377197 - 55377293
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 230  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55377197 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683465
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| ||||   ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198544
Alignment:
Q  130 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatt 229  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T
Q  230 actgcacgtaggtca 244  Q
    | | |||||| ||||    
T  9198558 aatacacgtatgtca 9198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355169
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47357293 - 47357183
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  47357293 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 47357194  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  47357193 attaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 232
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  131 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 230  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||| | || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  231 ct 232  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 11959 - 12011
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  11959 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgta 12011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 15489660 - 15489712
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15489660 cgaatttgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgta 15489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 19617578 - 19617630
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  19617578 cgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 19617630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10643856 - 10643746
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||   ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  10643856 gaattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 10643757  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  10643756 attaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 17146279 - 17146389
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  17146279 gaattggactttgatgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 17146378  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  17146379 attaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19020119 - 19020009
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19020119 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19020020  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  19020019 attaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168293
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 320
Target Start/End: Original strand, 15355029 - 15355069
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15355029 cgaatttgaaatgaaaactggtatcgattgctacataattg 15355069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239293
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaattttt 256  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaattttt 18239293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8374150 - 8374040
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8374150 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttctaatggctttgattttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8374051  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  8374050 attaaattact 8374040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16731786 - 16731688
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttat 220  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| | |||||||||||||    
T  16731786 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 201
Target Start/End: Original strand, 18218875 - 18218941
Alignment:
Q  135 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaaga 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||| || |||| ||||    
T  18218875 gtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttacaatggctttggtctcacctcaagaaga 18218941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 232
Target Start/End: Original strand, 19698032 - 19698082
Alignment:
Q  182 ttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698032 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19698082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 232
Target Start/End: Original strand, 19708617 - 19708667
Alignment:
Q  182 ttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19708617 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8808394 - 8808350
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 178  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8808394 ggtgtaaacatgaaaattgtaggtatggatgttatctttccaatg 8808350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11557936 - 11557892
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 178  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11557936 ggtgtaaacattcaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 11557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 110)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 38961270 - 38961594
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38961270 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatatgttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatgg 38961369  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38961370 tattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 38961469  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961470 gaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 38961569  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  38961570 tgatacagaattggtcttaggtgta 38961594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 20629624 - 20629948
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629624 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 20629723  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||    
T  20629724 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaaagcgatttata 20629823  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20629824 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgat 20629923  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  20629924 tggtacagaattggtcttaggtgta 20629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 16282190 - 16282514
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16282190 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaaaatgaaatctgg 16282289  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  16282290 tattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaaaacgatttata 16282389  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16282390 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgat 16282489  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  16282490 tggtacagaattggtcttaggtgta 16282514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 55318736 - 55319060
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55318736 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttattttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctgg 55318835  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  55318836 tattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacgatttata 55318935  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  55318936 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaattggtattgat 55319035  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  55319036 tggtacagaattggtcttaggtgta 55319060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8500250 - 8499926
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8500250 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctcttccccgaatttgaaataaaaactgg 8500151  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8500150 tattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 8500051  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8500050 gaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgtatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 8499951  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  8499950 tggtacataattggtcttaggtgta 8499926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41124669 - 41124345
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41124669 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgtttttttttatttttctttttatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 41124570  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41124569 tattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 41124470  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41124469 gaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaactggtattgat 41124370  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  41124369 tggtacagaattggtcttaggtgta 41124345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 46822991 - 46822667
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  46822991 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctgtgccccgaatttgaaatgaaaactgg 46822892  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46822891 tattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 46822792  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46822791 aaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaagtggtattgat 46822692  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || || | ||||| |||||||||||    
T  46822691 tggtaaacaattggtcttaggtgta 46822667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27165982 - 27165662
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  27165982 atgattgtgatgattttgaataaaagtgaagttgaatagtatagattgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaataaaaactag 27165883  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27165882 tattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 27165783  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27165782 gaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgat 27165683  T
Q  308 tgctacagaattgatcttagg 328  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  27165682 tggtacagaattggtcttagg 27165662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 53300936 - 53301260
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |    
T  53300936 atgattgtgatgattttgaataaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttgaaataaaaacaag 53301035  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53301036 tattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 53301135  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53301136 gaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgaccgaatttgaaataaaaactggtattgat 53301235  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  53301236 tggtacagaattggtcttaggtgta 53301260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10557633 - 10557314
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttt-cttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10557633 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttcttattttttcttttcatctctgccccgaatttgaaacgaaatatggtattg 10557534  T
Q  113 ataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaact 212  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10557533 attggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaact 10557434  T
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10557433 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 10557334  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
     | ||||| |||||||||||    
T  10557333 aataattggtcttaggtgta 10557314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 17444195 - 17444520
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctg-atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444195 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttttttatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 17444294  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17444295 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttat 17444394  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattga 306  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17444395 acaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattga 17444494  T
Q  307 ttgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||    
T  17444495 ttggtacagaattggtcttaagtgta 17444520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 309
Target Start/End: Original strand, 13937406 - 13937706
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13937406 atgattgtgatgattttggatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttt-ctgatttttcttttcatctttgccctgaatttgaaatgaaatctgg 13937504  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13937505 tattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 13937604  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13937605 gaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgat 13937704  T
Q  308 tg 309  Q
    ||    
T  13937705 tg 13937706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24514213 - 24513969
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514213 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 24514114  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24514113 tattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 24514014  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24514013 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 24513969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10379869 - 10379620
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgcttttt-----ctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10379869 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggtttttttttttcttctgatttttcttttcatctctgccccgaatatgaaataaaa 10379770  T
Q  103 tctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagat 202  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  10379769 actggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaat 10379670  T
Q  203 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10379669 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10379620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 252
Target Start/End: Original strand, 12119313 - 12119523
Alignment:
Q  42 aataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  12119313 aataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaa 12119412  T
Q  142 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12119413 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtagg 12119512  T
Q  242 tcacaatgaat 252  Q
    ||||| |||||    
T  12119513 tcacagtgaat 12119523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358424
Alignment:
Q  142 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  242 tcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16358334 tcacattgaatttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 16358424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 264
Target Start/End: Original strand, 55319010 - 55319185
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55319010 aatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 55319109  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaattt 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  55319110 gacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaatttttatgaattt 55319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 14567430 - 14567629
Alignment:
Q  121 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14567430 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttat 14567529  T
Q  221 ggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattg 320  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  14567530 agtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattg 14567629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15465613 - 15465425
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15465613 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattgg 15465514  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  15465513 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 15465425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54521279 - 54521116
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54521279 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 54521180  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54521179 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 54521116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8899556 - 8899418
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899556 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 8899457  T
Q  114 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899456 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 20629895 - 20630061
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629895 ccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 20629994  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20629995 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20630061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 131 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528368
Alignment:
Q  131 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  231 ctgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtg 330  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaatatttatgaatttcagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatg 36528370  T
Q  331 ta 332  Q
    ||    
T  36528369 ta 36528368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5223842 - 5223654
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5223842 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattgg 5223743  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  5223742 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 5223654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 29544547 - 29544710
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29544547 gaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29544646  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544647 tgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 29544710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17463636 - 17463470
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17463636 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 17463537  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17463536 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34159784 - 34159618
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34159784 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 34159685  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34159684 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34159618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Original strand, 26054968 - 26055156
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26054968 ccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttgg 26055067  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  26055068 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 26055156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15977991 - 15977825
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15977991 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15977892  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15977891 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15977825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 16282461 - 16282627
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16282461 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattgg 16282560  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282561 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 46822720 - 46822554
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822720 ccgattttgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 46822621  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46822620 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 46822554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 53301207 - 53301373
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53301207 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttgg 53301306  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  53301307 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 53301373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 28848325 - 28848491
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28848325 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 28848424  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28848425 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 28848491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41124398 - 41124232
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  41124398 ccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttga 41124299  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41124298 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 41124232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 45606610 - 45606776
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45606610 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 45606709  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  45606710 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaat 45606776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 38961541 - 38961708
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat-gccgttg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  38961541 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttg 38961640  T
Q  185 gtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38961641 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38961708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 6468838 - 6469004
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6468838 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 6468937  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6468938 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6469004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 7781050 - 7781216
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7781050 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttgg 7781149  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  7781150 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaat 7781216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 10247427 - 10247585
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10247427 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 10247526  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10247527 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtca 10247585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12568018 - 12567852
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12568018 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 12567919  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  12567918 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaat 12567852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 13153959 - 13154125
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  13153959 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 13154058  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13154059 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 13154125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13436758 - 13436592
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436758 ccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 13436659  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13436658 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13436592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13544482 - 13544317
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13544482 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 13544383  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  13544382 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaat 13544317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27165711 - 27165545
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27165711 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttag 27165612  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27165611 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 27165545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 55476949 - 55476783
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  55476949 ccgaatttgaaattaaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 55476850  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55476849 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10557367 - 10557208
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10557367 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttag 10557268  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 245  Q
    | | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10557267 ttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcac 10557208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 16453984 - 16454151
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16453984 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16454083  T
Q  186 tctgacgtcaaaa-agatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16454084 tttgacttcaaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16454151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8499979 - 8499813
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8499979 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttgg 8499880  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||    
T  8499879 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaat 8499813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 13151494 - 13151660
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  13151494 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 13151593  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13151594 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 13151660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15412884 - 15412730
Alignment:
Q  92 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15412884 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 15412785  T
Q  192 gtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 246  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15412784 ttcaaaaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcaca 15412730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15008054 - 15007905
Alignment:
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15008054 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 15007955  T
Q  286 tgaaatgaaa---actggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  15007954 tgaaatgaaaagtactggtattgattggtacaaaattggttttaggtgta 15007905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 17444467 - 17444625
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17444467 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 17444566  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  17444567 tttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtca 17444625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 331
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264509
Alignment:
Q  145 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  245 caatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgt 331  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  3264423 cagtgaatatttatgaatttcagcacaacctttcctgaatttgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgt 3264509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25237302 - 25237136
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  25237302 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtg 25237203  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25237202 tttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 25237136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463583
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 17463603  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  17463602 cagaattggtcttaggtgta 17463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34159850 - 34159731
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34159850 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 34159751  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  34159750 cagaattggtcttaggtgta 34159731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17393382 - 17393176
Alignment:
Q  72 ttttcatctctgcccc-gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagct 170  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17393382 ttttcatctctgcccccgaatttcaaatgaactcttctattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacct 17393283  T
Q  171 ttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagca 269  Q
    ||| |||| ||||||| ||||  ||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  17393282 ttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaatttttatgaaatttcagca 17393183  T
Q  270 taacttt 276  Q
     ||||||    
T  17393182 caacttt 17393176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 6468772 - 6468891
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6468772 tgagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 6468871  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  6468872 cagaattggtcttagctgta 6468891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476896
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgactggta 55476916  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  55476915 cagaattggtcttaggtgta 55476896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25229715 - 25229549
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  25229715 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtg 25229616  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||    
T  25229615 tttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaat 25229549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15412955 - 15412840
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15412955 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 15412857  T
Q  313 cagaattgatcttaggt 329  Q
    || ||||| ||||||||    
T  15412856 cataattggtcttaggt 15412840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13154012
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13153893 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 13153992  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  13153993 cagaattggtcataggtgta 13154012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 45606544 - 45606663
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45606544 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 45606643  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  45606644 cagaattggtcttaggtgta 45606663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Original strand, 45220313 - 45220418
Alignment:
Q  9 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggt 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45220313 tgattatgatgattttgaatgaaagtgaagttaaataatataggttgctttttcttatttttcttttcatctctgcccagaatttgaaatgaaatatggt 45220412  T
Q  109 attgat 114  Q
    ||||||    
T  45220413 attgat 45220418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 216 - 332
Target Start/End: Original strand, 10247364 - 10247480
Alignment:
Q  216 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacag 315  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10247364 gttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacag 10247463  T
Q  316 aattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||| |||||||||||    
T  10247464 aattggtcttaggtgta 10247480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 13151428 - 13151547
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13151428 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaa 13151527  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  13151528 cagaattggtcataggtgta 13151547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 7781019 - 7781103
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7781019 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 7781103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15978022 - 15977938
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15978022 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 15977938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15465770 - 15465560
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || | ||||| |||| | |||| ||||| | |   ||||| ||||    
T  15465770 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatg 15465671  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattga 321  Q
     | ||| |||| || | |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  15465670 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattgg 15465571  T
Q  322 tcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||    
T  15465570 tcttaggtgta 15465560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36528422 - 36528340
Alignment:
Q  85 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528422 cccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 332
Target Start/End: Original strand, 16453957 - 16454037
Alignment:
Q  252 tttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16453957 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 16454037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 28848294 - 28848378
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  28848294 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgta 28848378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25229744 - 25229662
Alignment:
Q  250 aatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25229744 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgta 25229662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25237331 - 25237249
Alignment:
Q  250 aatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25237331 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgta 25237249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305439
Alignment:
Q  174 taatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 12305439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5223873 - 5223789
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  5223873 tgaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgta 5223789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12305612 - 12305528
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12305612 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgta 12305528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 29544514 - 29544598
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29544514 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgta 29544598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 54521312 - 54521228
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54521312 tgaatttttatggatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 54521228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 173
Target Start/End: Original strand, 16358371 - 16358458
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358371 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 26054937 - 26055021
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  26054937 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 26055021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15007961 - 15007868
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaat---ctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 176  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007961 ccgaatttgaaatgaaaagtactggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13436789 - 13436708
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  13436789 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggt 13436708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25058408 - 25058286
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25058408 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatg 25058309  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  25058308 atcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Original strand, 16934824 - 16934920
Alignment:
Q  136 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934824 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 167
Target Start/End: Original strand, 3264459 - 3264538
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 167  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  3264459 gaatttgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtatggatgtta 3264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12568023 - 12567965
Alignment:
Q  274 tttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12568023 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 12567965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13544487 - 13544429
Alignment:
Q  274 tttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13544487 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 13544429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 151
Target Start/End: Original strand, 14567587 - 14567653
Alignment:
Q  85 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14567587 cccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49231866 - 49231768
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49231866 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 232
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  162 atgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 1468613 - 1468723
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  1468613 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 1468712  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  1468713 atcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 8276473 - 8276583
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8276473 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatg 8276572  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  8276573 attaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12305579 - 12305525
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaac 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12305579 gaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30152560 - 30152450
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  30152560 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatg 30152461  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  30152460 atcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10379785 - 10379733
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10379785 cgaatatgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgta 10379733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24514134 - 24514082
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  24514134 cgaatttgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgta 24514082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21026183 - 21026092
Alignment:
Q  145 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||| |||| || ||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21026183 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcac 21026092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 230  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 8269362 - 8269472
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | | ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8269362 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8269461  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  8269462 attaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 153  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12808615 - 12808505
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||| || | | ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12808615 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttagtttcaggtccaaacgatttttagaacttgagatatg 12808516  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  12808515 attaaattact 12808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 14528624 - 14528734
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||| |||| || ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14528624 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatg 14528723  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  14528724 attaaattact 14528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8899483 - 8899431
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  8899483 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgta 8899431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 12119358 - 12119410
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  12119358 cgaatttgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgta 12119410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27165903 - 27165851
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  27165903 cgaatttgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgta 27165851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28557468 - 28557370
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||| | ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28557468 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttgatttgaagtccaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 28557370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956938
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||| || ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14263672 - 14263640
Alignment:
Q  200 gatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263672 gatttctagaacttgagttatggtcaaattact 14263640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 17959673 - 17959765
Alignment:
Q  139 aaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattac 231  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| | ||||| | || ||||  |||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  17959673 aaacatgaaagttttaggtatgtgtgttagctttccaatgactttggtttcacctcaaccagacctctacaacttgagttatggtcaaattac 17959765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 95)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 41523312 - 41523636
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523312 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttttttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 41523411  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523412 tattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttata 41523511  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41523512 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaatttttatgaatttcagcacaactttgtacgaatttgaaataaaaactggtattgat 41523611  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  41523612 tggtacagaattggtcttaggtgta 41523636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24368556 - 24368232
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368556 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 24368457  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24368456 tattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttata 24368357  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368356 gaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 24368257  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  24368256 tggtacagaattggtcttaggtgta 24368232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6726777 - 6726453
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6726777 atgattgtgatgattttgaatgaaattgaagttgaaaaatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctca 6726678  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6726677 tattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 6726578  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726577 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 6726478  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| || || |||||||||||    
T  6726477 tgatacataagtggtcttaggtgta 6726453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 21154247 - 21154571
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21154247 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctag 21154346  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21154347 tattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttata 21154446  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154447 gaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcagaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 21154546  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || || ||||||| || ||||||||    
T  21154547 tgttatagaattggtcctaggtgta 21154571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22106195 - 22105871
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22106195 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttattttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 22106096  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22106095 tattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttata 22105996  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105995 gaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 22105896  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || | |||||||| |||||||||||    
T  22105895 tggtgcagaattggtcttaggtgta 22105871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24918870 - 24918546
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24918870 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgccttttcggatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaatctgg 24918771  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24918770 tattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaaaatgatttata 24918671  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24918670 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgat 24918571  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || || ||||||| ||||| |||||    
T  24918570 tggtagagaattggtcttaagtgta 24918546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 24528979 - 24529303
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24528979 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttaaataatatagattgctttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttgaaatgaaatctgg 24529078  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24529079 tattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttata 24529178  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24529179 gaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttaaaatgaaaacttgtattgat 24529278  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  24529279 tggtacaaaattggtcttaggtgta 24529303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24671755 - 24671431
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24671755 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttggaatgaaatctgg 24671656  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||| |||||||    
T  24671655 tattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaaaaatatttata 24671556  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24671555 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtatttat 24671456  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  24671455 tggtacagaattggtcttaggtgta 24671431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24682174 - 24681850
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24682174 atgattgtgataattttgaataaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctcccccgaatttgaaatgaaatctgg 24682075  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24682074 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaaaaagatttata 24681975  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24681974 gagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattggt 24681875  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||| ||||    
T  24681874 tggtacagaattggtcttagctgta 24681850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 45027332 - 45027661
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttt-----tcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  45027332 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgattttttttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatggaa 45027431  T
Q  103 tctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  45027432 tctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgat 45027531  T
Q  203 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggta 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45027532 ttatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgattttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggta 45027631  T
Q  303 ttgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45027632 ttgattggtacagaattggtcttaggtgta 45027661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 23706458 - 23706781
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23706458 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttaaataatctaggttgctttttctgatttttcttttcatctctggcccgaatttgaaatgaaatctgg 23706557  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   | |||||||  |||||||    
T  23706558 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaaaacaatttata 23706657  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  23706658 gaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatttgaaatgaaaacggctattgat 23706756  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  23706757 tggtacagaattggtcttaggtgta 23706781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23932190 - 23931866
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23932190 atgattttgatgagtttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaagctgg 23932091  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23932090 tattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 23931991  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931990 gaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtgtatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 23931891  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  23931890 tggtacataattggtcttaggtgta 23931866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 32214362 - 32214687
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32214362 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatagattgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaaaatgaaaactgg 32214461  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  32214462 tattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttata 32214561  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatga-atttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattga 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32214562 gaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgatttttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattga 32214661  T
Q  307 ttgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  32214662 ttggtacaaaattgttcttaggtgta 32214687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 328
Target Start/End: Original strand, 21154518 - 21154760
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154518 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 21154617  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21154618 tctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 21154717  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttagg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  21154718 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttagg 21154760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 41523584 - 41523829
Alignment:
Q  87 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 186  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  41523584 cgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggt 41523683  T
Q  187 ctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaattt 286  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41523684 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 41523783  T
Q  287 gaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  41523784 gaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgta 41523829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 23709043 - 23709289
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23709043 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttgg 23709142  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23709143 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 23709242  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  23709243 tgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 23709289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 23706728 - 23706973
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23706728 ccgaatttgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtagg 23706827  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  23706828 tctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagctaatatttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatt 23706926  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23706927 tgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgta 23706973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20261676 - 20261513
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20261676 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 20261577  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20261576 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 20261513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22105924 - 22105758
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105924 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 22105825  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22105824 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 22105758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18809401 - 18809235
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18809401 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18809302  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18809301 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18809235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 23706920 - 23707086
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23706920 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 23707019  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23707020 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23707086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 23711717 - 23711883
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23711717 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 23711816  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23711817 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24368285 - 24368119
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24368285 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 24368186  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24368185 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28577557 - 28577391
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28577557 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 28577458  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28577457 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 28577391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 32214634 - 32214800
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32214634 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 32214733  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32214734 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32214800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39682772 - 39682606
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39682772 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 39682673  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39682672 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 39682606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 10684468 - 10684631
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10684468 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 10684567  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10684568 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaa 10684631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 21154711 - 21154877
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21154711 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 21154810  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21154811 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 21154877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24671484 - 24671318
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24671484 ccgaatttgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttgg 24671385  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671384 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24918599 - 24918433
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24918599 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 24918500  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24918499 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 45027608 - 45027766
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45027608 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattgg 45027707  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45027708 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtca 45027766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23131315 - 23131155
Alignment:
Q  92 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23131315 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 23131216  T
Q  192 gtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23131215 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 23131155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23133782 - 23133622
Alignment:
Q  92 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23133782 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 23133683  T
Q  192 gtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23133682 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 23133622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24681901 - 24681737
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24681901 gaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 24681802  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     | | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681801 gggcttccaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24681737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Original strand, 34402231 - 34402391
Alignment:
Q  92 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34402231 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 34402330  T
Q  192 gtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34402331 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 34402391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 571856 - 571690
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  571856 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 571757  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  571756 tttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 571690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23136038 - 23135872
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23136038 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttgg 23135939  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23135938 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23135872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 24897899 - 24898065
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24897899 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24897998  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24897999 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24898065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 24900382 - 24900548
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24900382 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24900481  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24900482 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24900548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 24902859 - 24903025
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24902859 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24902958  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24902959 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24903025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 24905336 - 24905502
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24905336 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24905435  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24905436 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24905502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26505837 - 26505671
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26505837 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 26505738  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26505737 tttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26508315 - 26508149
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  26508315 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttag 26508216  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26508215 tttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 41523776 - 41523934
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  41523776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttgg 41523875  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41523876 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 41523934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Original strand, 23709236 - 23709401
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23709236 ccgaatttgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttgg 23709335  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709336 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 23709401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 24642452 - 24642618
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24642452 ccgaatttgaaaagaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24642551  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24642552 tttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 24642618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 24907811 - 24907977
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24907811 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24907910  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24907911 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 24907977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23931919 - 23931775
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23931919 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttgg 23931820  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 230  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931819 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6726506 - 6726340
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6726506 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 6726407  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6726406 tttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 6726340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 32039202 - 32039368
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  32039202 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttgg 32039301  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32039302 tttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 32039368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642505
Alignment:
Q  200 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaagaaaactg 24642472  T
Q  300 gtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24642473 gtattgattggtacagaattgctcttaggtgta 24642505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18809467 - 18809348
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18809467 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 18809368  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18809367 cagaattggtcttaggtgta 18809348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711770
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 23711750  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  23711751 cagaattggtcttaggtgta 23711770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505784
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26505804  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26505803 cagaattgatcttaggtgta 26505784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28577623 - 28577504
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28577623 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggta 28577524  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  28577523 cagaattggtcttaggtgta 28577504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38967937 - 38967772
Alignment:
Q  87 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38967937 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggt 38967838  T
Q  187 ctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||| ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  38967837 ttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaat 38967772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 24529253 - 24529416
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  24529253 aatttaaaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggttt 24529352  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  24529353 gacttcaaaaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaat 24529416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508262
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26508282  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  26508281 cagaattggtcttaggtgta 26508262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39682838 - 39682719
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39682838 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 39682739  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  39682738 cagaattggtcttaggtgta 39682719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616474
Alignment:
Q  145 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  245 caatgaat 252  Q
    ||||||||    
T  25616481 caatgaat 25616474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039255
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 32039235  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
     || |||| |||||||||||    
T  32039236 aaggattggtcttaggtgta 32039255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 571922 - 571803
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  571922 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 571823  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  571822 cataattggtcttaggtgta 571803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131271
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 23131288  T
Q  313 cagaattgatcttaggt 329  Q
    || ||||| ||||||||    
T  23131287 cataattggtcttaggt 23131271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402275
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 34402258  T
Q  313 cagaattgatcttaggt 329  Q
    || ||||| ||||||||    
T  34402259 cataattggtcttaggt 34402275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23133853 - 23133738
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23133853 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 23133755  T
Q  313 cagaattgatcttaggt 329  Q
    || ||||| ||||||||    
T  23133754 cataattggtcttaggt 23133738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 216 - 332
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709096
Alignment:
Q  216 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacag 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacag 23709079  T
Q  316 aattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||  || ||||||||    
T  23709080 aattcgtcctaggtgta 23709096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31345667 - 31345585
Alignment:
Q  250 aatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31345667 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgta 31345585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38967969 - 38967885
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  38967969 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 38967885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 10684435 - 10684519
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10684435 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgta 10684519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20261709 - 20261625
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20261709 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 20261625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23136069 - 23135985
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  23136069 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgta 23135985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31345553 - 31345467
Alignment:
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  31345553 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 31345467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 24897868 - 24897952
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  24897868 tgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgta 24897952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 24900351 - 24900435
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  24900351 tgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgta 24900435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 24902828 - 24902912
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  24902828 tgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgta 24902912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 24905305 - 24905389
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  24905305 tgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgta 24905389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 24907780 - 24907864
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  24907780 tgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgta 24907864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31345638 - 31345570
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31345638 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 264
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920453
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaattt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaattt 27920453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 24686597 - 24686707
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  24686597 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatg 24686696  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  24686697 atcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 19887274 - 19887384
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19887274 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19887373  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  19887374 attaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12727807 - 12727711
Alignment:
Q  136 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12727807 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 11232212 - 11232322
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  11232212 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 11232311  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  11232312 atcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 22514059 - 22514169
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22514059 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 22514158  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  22514159 atcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 28776661 - 28776771
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28776661 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 28776760  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  28776761 atcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 67440 - 67339
Alignment:
Q  131 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 230  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||   |||||||| ||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  67440 ttagttgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 67341  T
Q  231 ct 232  Q
    ||    
T  67340 ct 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27261442 - 27261332
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||  |||| || |||||||||||||    
T  27261442 gaattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatg 27261343  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  27261342 atcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  164 gttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 177
Target Start/End: Original strand, 34135059 - 34135102
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 177  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34135059 ggtgtacacatgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaat 34135102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22283323 - 22283255
Alignment:
Q  164 gttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22283323 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattact 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29298971 - 29298647
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29298971 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttatgatttttcttttcatctctgcaccgaatttgaaatgaaatctgg 29298872  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29298871 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaaaacgatttata 29298772  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298771 aaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 29298672  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  29298671 tggtacataattggtcttaggtgta 29298647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31613282 - 31612964
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31613282 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattga 31613183  T
Q  114 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaactt 213  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31613182 taggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactt 31613083  T
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  31613082 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaactgaaaactggtattgattggtat 31612983  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31612982 agaattggtcttaggtgta 31612964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 22122446 - 22122771
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122446 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 22122545  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacac-gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |    
T  22122546 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgatttgt 22122645  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22122646 agaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattga 22122745  T
Q  307 ttgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    | | | |||||||| |||||||||||    
T  22122746 taggtccagaattggtcttaggtgta 22122771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 16274685 - 16275012
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttt---tcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16274685 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatggaatc 16274784  T
Q  105 tggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagattt 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||    
T  16274785 tggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactattt 16274884  T
Q  205 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtatt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16274885 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatgtttatgaattttagcacaactctgtccgaattggaaatgaaaactggtatt 16274984  T
Q  305 gattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16274985 gattggtacataattggtcttaggtgta 16275012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29777465 - 29777146
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgcttttt-ctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattg 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29777465 gtgatgattttgaataaaagtgaagtggaataatataggttccttttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaataaaaactggtattg 29777366  T
Q  113 ataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaact 212  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29777365 atcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaact 29777266  T
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29777265 tgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29777166  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  29777165 cataattggtcttaggtgta 29777146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 15859427 - 15859765
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttt-tcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||    
T  15859427 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttttcttttcatctctatcccgaatttgaaataaaaactg 15859526  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||    
T  15859527 gtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaactatttat 15859626  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag-------------gtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatga 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15859627 agaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatga 15859726  T
Q  294 aaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15859727 aaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 15859765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 22050462 - 22050706
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22050462 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctgg 22050561  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||| ||||||||    
T  22050562 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttata 22050661  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22050662 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16401651 - 16401354
Alignment:
Q  9 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttct-gatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  16401651 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatagattgctttttcccgatttttcttttcatctctgctccgaatttgaaataaaaactgg 16401552  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  16401551 tattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttata 16401452  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattg 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  16401451 taacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattg 16401354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 245
Target Start/End: Original strand, 9044630 - 9044867
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  9044630 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgttttttcttttcatctctgccccaaatttgaaataaaaactgg 9044729  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9044730 tattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaacgatttata 9044829  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9044830 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40129621 - 40129387
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40129621 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatgg 40129522  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  40129521 tattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgatttata 40129422  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40129421 gaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Original strand, 27161099 - 27161343
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27161099 gaatttgaaatggaatatagtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtc 27161198  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttg 287  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  27161199 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttg 27161298  T
Q  288 aaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  27161299 aaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgta 27161343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31613015 - 31612771
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  31613015 gaatttgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtt 31612916  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttg 287  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31612915 tgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 31612816  T
Q  288 aaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  31612815 aaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgta 31612771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43543438 - 43543269
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43543438 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgatttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 43543339  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 177  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543338 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 22122718 - 22122884
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22122718 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 22122817  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22122818 tttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22122884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Original strand, 27161292 - 27161456
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27161292 gaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 27161391  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161392 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 27161456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13989324 - 13989158
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13989324 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 13989225  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13989224 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13989158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13227322 - 13227156
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13227322 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttgg 13227223  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13227222 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 13227156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 21922995 - 21923161
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21922995 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 21923094  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21923095 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21923161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29777199 - 29777033
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29777199 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 29777100  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
      |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29777099 gttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29777033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 15859712 - 15859878
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15859712 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttgg 15859811  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15859812 tttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaat 15859878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21841225 - 21841059
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21841225 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 21841126  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  21841125 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaat 21841059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16362377 - 16362211
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16362377 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttgg 16362278  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16362277 tttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 16362211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31612824 - 31612666
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  31612824 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttgg 31612725  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31612724 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 31612666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29298699 - 29298534
Alignment:
Q  87 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29298699 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggt 29298600  T
Q  187 ctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  29298599 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaat 29298534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Original strand, 43630215 - 43630344
Alignment:
Q  9 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43630215 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatggt 43630314  T
Q  109 attgataggtccagaattggtcttaggtgt 138  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  43630315 attgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 16274959 - 16275126
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-aatgccgttg 184  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  16274959 ccgaattggaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattg 16275058  T
Q  185 gtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    || | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16275059 gtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16275126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 21474790 - 21474956
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21474790 ccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 21474889  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  21474890 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaat 21474956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29535510 - 29535344
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29535510 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttgg 29535411  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29535410 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 29535344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 23593437 - 23593603
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593437 ccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttgg 23593536  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23593537 tctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 23593603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13989390 - 13989271
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13989390 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 13989291  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  13989290 cagaattggtcttaggtgta 13989271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 332
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812762
Alignment:
Q  182 ttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcg 281  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttctatgaatttcagcacaactttctccg 10812711  T
Q  282 aatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  10812712 aatttgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgta 10812762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 21474724 - 21474843
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21474724 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggta 21474823  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  21474824 cagaattggtcttaggtgta 21474843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13227479 - 13227269
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | ||||| | || | |||| ||||| |||   ||||| ||||    
T  13227479 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatg 13227380  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattga 321  Q
     |  || |||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13227379 atggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 13227280  T
Q  322 tcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||    
T  13227279 tcttaggtgta 13227269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21841256 - 21841172
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21841256 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 21841172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 21922964 - 21923048
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21922964 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 21923048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16362408 - 16362324
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  16362408 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgta 16362324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29535541 - 29535460
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  29535541 tgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggt 29535460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 62
Target Start/End: Original strand, 41231052 - 41231106
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41231052 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc 41231106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Original strand, 23593372 - 23593490
Alignment:
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    |||||||| | |||||||| || | |||||  | |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23593372 gagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaattttcacgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtgc 23593471  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    | ||||  |||||||||||    
T  23593472 ataattagtcttaggtgta 23593490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41372961 - 41372907
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggta 302  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41372961 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggta 41372907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43543359 - 43543307
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43543359 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 43543307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21858690 - 21858592
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21858690 ggtgtaaacatgaaagttttagatagttatgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17004019 - 17003909
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  17004019 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 17003920  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  17003919 atcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035928
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 10812709 - 10812778
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10812709 ccgaatttgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtag 10812778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16401572 - 16401520
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  16401572 cgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgta 16401520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Original strand, 21650883 - 21650979
Alignment:
Q  136 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  21650883 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060684
Alignment:
Q  125 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtc 224  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||  | |||||||| |||| |     
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgatt 18060676  T
Q  225 aaattact 232  Q
    ||||||||    
T  18060677 aaattact 18060684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 40
Target Start/End: Original strand, 22122279 - 22122311
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagtt 40  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122279 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagtt 22122311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40129542 - 40129490
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  40129542 cgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgta 40129490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 331
Target Start/End: Original strand, 43630293 - 43630344
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgt 331  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  43630293 cgaatttgaaatgaaatatggtattgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 332
Target Start/End: Original strand, 9044711 - 9044761
Alignment:
Q  282 aatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  9044711 aatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgta 9044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 332
Target Start/End: Original strand, 22050543 - 22050593
Alignment:
Q  282 aatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  22050543 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgta 22050593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22366637 - 22366527
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||  |    |||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22366637 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagaaaattttgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatg 22366538  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  22366537 attaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16214414 - 16214090
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16214414 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgatgttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatttgg 16214315  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16214314 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagatttata 16214215  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214214 gaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 16214115  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| ||||| |||||    
T  16214114 tgatacagaattggtcttacgtgta 16214090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 15081274 - 15081598
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15081274 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctatgccccgaatttgaaatgaaatatgg 15081373  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15081374 tattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 15081473  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15081474 gaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacaattaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgat 15081573  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  15081574 tggtacagaattggtcttaggtgta 15081598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 14269196 - 14269520
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14269196 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatagggtgctttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaatctgg 14269295  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  14269296 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaaaacgatttata 14269395  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269396 gaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 14269495  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  14269496 tggtacagaattggtcttaggtgta 14269520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8941204 - 8940881
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8941204 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgcttt--ctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 8941107  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8941106 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaaaatgatttata 8941007  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa-tttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattga 306  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8941006 gaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaattttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattga 8940907  T
Q  307 ttgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  8940906 ttgatacataattggtcttaggtgta 8940881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 38897660 - 38897910
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38897660 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctgg 38897759  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38897760 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttata 38897859  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38897860 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttat 38897910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 21189037 - 21189352
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189037 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttt---------tcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 21189127  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21189128 tattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaaaacaatttata 21189227  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21189228 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaatttttatgaatttccgcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttat 21189327  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||| ||| |||||||||||    
T  21189328 tggtacagagttggtcttaggtgta 21189352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8469272 - 8469028
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469272 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 8469173  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  8469172 tattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttata 8469073  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8469072 gaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 8469028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11973085 - 11972841
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11973085 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaacttaaaatgaaatctgg 11972986  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  11972985 tattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatctata 11972886  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11972885 gaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaat 11972841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 14269467 - 14269713
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14269467 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttgg 14269566  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14269567 tatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 14269666  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14269667 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 14269713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8940934 - 8940689
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940934 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 8940836  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  8940835 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttaagcacaactttgtccgaatt 8940736  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  8940735 tgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgta 8940689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Original strand, 14156545 - 14156832
Alignment:
Q  39 ttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgt 138  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   || |||| | | |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  14156545 ttgaataatataagttgtttttcctgatttttctt---atttctgtctcaaatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtga 14156641  T
Q  139 aaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgt 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  14156642 taacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgt 14156741  T
Q  239 aggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  14156742 aggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt 14156832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Original strand, 25926833 - 25927021
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25926833 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattgg 25926932  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  25926933 tctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 25927021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 15376417 - 15376583
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15376417 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15376516  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15376517 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15376583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16410517 - 16410351
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16410517 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16410418  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16410417 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 20384827 - 20384993
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20384827 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 20384926  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20384927 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20384993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11303704 - 11303541
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11303704 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 11303605  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11303604 tgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 11303541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 23664658 - 23664821
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23664658 gaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 23664757  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  23664758 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaa 23664821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 14948826 - 14948992
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14948826 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14948925  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14948926 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14948992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16214143 - 16213977
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214143 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16214044  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16214043 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaat 16213977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24702687 - 24702521
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24702687 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24702588  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24702587 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24702521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24705134 - 24704968
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24705134 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24705035  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24705034 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24704968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27217319 - 27217153
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27217319 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 27217220  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27217219 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 27217153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847408
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  234 cacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggt 45847408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 456780 - 456614
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  456780 ccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 456681  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  456680 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 456614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 14269660 - 14269826
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14269660 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 14269759  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  14269760 ttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaat 14269826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 32125949 - 32125783
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  32125949 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttgg 32125850  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32125849 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32125783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Original strand, 13918106 - 13918295
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtctt-aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  13918106 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattg 13918205  T
Q  185 gtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| || |||||||||||    
T  13918206 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 13918295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Original strand, 15081545 - 15081702
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15081545 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 15081644  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 243  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081645 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 15081702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Original strand, 1856933 - 1857120
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  1856933 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattgg 1857031  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  1857032 tctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 1857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 16108394 - 16108557
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  16108394 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtt 16108493  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  16108494 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaa 16108557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29797067 - 29796904
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29797067 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29796968  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29796967 tgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaa 29796904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29800886 - 29800723
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29800886 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29800787  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29800786 tgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaa 29800723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16232979 - 16232813
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16232979 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16232880  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16232879 tttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 16232813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41523376 - 41523210
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41523376 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 41523277  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41523276 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 41523210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41525838 - 41525672
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41525838 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 41525739  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41525738 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 41525672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8940742 - 8940572
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacac----gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccg 181  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8940742 ccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccg 8940643  T
Q  182 ttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8940642 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 259
Target Start/End: Original strand, 10501097 - 10501270
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10501097 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttgg 10501196  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg 259  Q
    | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10501197 tttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaatttttatg 10501270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13869801 - 13869641
Alignment:
Q  92 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13869801 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 13869702  T
Q  192 gtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13869701 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13869641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 21189302 - 21189465
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21189302 aatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggttt 21189401  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21189402 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21189465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18628024 - 18627858
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18628024 ccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18627925  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18627924 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18627858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18640730 - 18640564
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18640730 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttgg 18640631  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18640630 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 26355685 - 26355851
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26355685 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 26355784  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26355785 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 26355851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 26358137 - 26358303
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26358137 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 26358236  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26358237 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 26358303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18431170 - 18431016
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  18431170 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttgg 18431071  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 240  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18431070 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtag 18431016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 45846877 - 45846983
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45846877 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 45846976  T
Q  108 tattgat 114  Q
    |||||||    
T  45846977 tattgat 45846983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 259
Target Start/End: Original strand, 14156782 - 14156951
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14156782 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 14156877  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg 259  Q
    | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14156878 tttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatg 14156951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 15376351 - 15376470
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15376351 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 15376450  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15376451 cagaattggtcttaggtgta 15376470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410464
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 16410484  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  16410483 cagaattggtcttaggtgta 16410464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 20384761 - 20384880
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20384761 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 20384860  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  20384861 cagaattggtcttaggtgta 20384880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 276
Target Start/End: Original strand, 17985092 - 17985279
Alignment:
Q  90 atttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctg 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||| ||    
T  17985092 atttcaaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttg 17985191  T
Q  190 acgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataacttt 276  Q
    |   ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17985192 attccaaaatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaatttttatgaaatttcagcacaacttt 17985279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27217385 - 27217266
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27217385 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 27217286  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  27217285 cagaattggtcttaggtgta 27217266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 10500887 - 10501064
Alignment:
Q  39 ttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgt 138  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   || |||| | | |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  10500887 ttgaataatataagttgtttttcctgatttttctt---atttctgtctctaatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtga 10500983  T
Q  139 aaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtta 219  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10500984 taacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 45847358 - 45847524
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  45847358 ccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttag 45847457  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45847458 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 45847524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 456846 - 456727
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  456846 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacattgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggta 456747  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  456746 cagaattggtcttaggtgta 456727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355737
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 26355718  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgt 331  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  26355719 cagaattggtcttatgtgt 26355737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358189
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 26358170  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgt 331  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  26358171 cagaattggtcttatgtgt 26358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13869872 - 13869757
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13869872 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 13869774  T
Q  313 cagaattgatcttaggt 329  Q
    || ||||| ||||||||    
T  13869773 cataattggtcttaggt 13869757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16233045 - 16232926
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16233045 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 16232946  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  16232945 cagaattggtcttaggtgta 16232926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18627971
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggca 18627991  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18627990 cagaattggtcttaggtgta 18627971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640677
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggca 18640697  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18640696 cagaattggtcttaggtgta 18640677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310162
Alignment:
Q  165 ttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaattt 264  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaatatttatgaattt 11310228  T
Q  265 cagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgt 331  Q
    ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  11310227 cagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaact-gtattgataagtacataattggtcttaggtgt 11310162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 316
Target Start/End: Original strand, 11392937 - 11393040
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11392937 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcaccgtgaatttttatgaatttcagcataactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 11393036  T
Q  313 caga 316  Q
    ||||    
T  11393037 caga 11393040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 244
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393148
Alignment:
Q  137 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  237 gtaggtca 244  Q
    ||||||||    
T  11393141 gtaggtca 11393148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841347
Alignment:
Q  153 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 332
Target Start/End: Original strand, 25926676 - 25926886
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | || || |||| | |||| ||||| | |   ||||| ||||    
T  25926676 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatg 25926775  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattga 321  Q
     | ||| |||| || | |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  25926776 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgg 25926875  T
Q  322 tcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||    
T  25926876 tcttaggtgta 25926886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Original strand, 23461791 - 23461864
Alignment:
Q  82 tgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461791 tgccccgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32125980 - 32125896
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32125980 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 32125896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41523407 - 41523323
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41523407 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 41523323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41525869 - 41525785
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41525869 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 41525785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 14948795 - 14948879
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14948795 tgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 14948879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18431201 - 18431117
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  18431201 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgta 18431117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24702718 - 24702634
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  24702718 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgta 24702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24705165 - 24705081
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  24705165 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgta 24705081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29797100 - 29797016
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29797100 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgta 29797016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29800919 - 29800835
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29800919 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgta 29800835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 332
Target Start/End: Original strand, 10501064 - 10501150
Alignment:
Q  246 aatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  10501064 aatgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgta 10501150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 332
Target Start/End: Original strand, 23664499 - 23664709
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | || || ||||   |||| ||||| | |    |||| ||||    
T  23664499 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatg 23664598  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattga 321  Q
     | ||| |||| || | |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  23664599 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattgg 23664698  T
Q  322 tcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||    
T  23664699 tcttaggtgta 23664709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 13918075 - 13918152
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatctt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13918075 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctt 13918152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 16108361 - 16108445
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16108361 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 16108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 332
Target Start/End: Original strand, 1856776 - 1856986
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || | ||||| |||| | |||| ||||| | |   ||||| ||||    
T  1856776 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatg 1856875  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattga 321  Q
     | ||| |||| || | |||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  1856876 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattgg 1856975  T
Q  322 tcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||    
T  1856976 tcttaggtgta 1856986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11303737 - 11303653
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  11303737 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgta 11303653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 14317629 - 14317688
Alignment:
Q  10 gattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttt 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14317629 gattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgttttttctgatttt 14317688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 56
Target Start/End: Original strand, 23461745 - 23461793
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgc 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461745 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgc 23461793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7822123 - 7822013
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7822123 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7822024  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  7822023 atcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7829434 - 7829324
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7829434 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7829335  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  7829334 atcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11310214 - 11310133
Alignment:
Q  85 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 167  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  11310214 cccgaatttgaaatgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 27102511 - 27102621
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27102511 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27102610  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  27102611 atcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 27109859 - 27109969
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27109859 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27109958  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  27109959 atcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27175815 - 27175705
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27175815 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27175716  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  27175715 atcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 38784603 - 38784713
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  38784603 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38784702  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  38784703 atcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11287073 - 11286976
Alignment:
Q  135 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| || | || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11287073 gtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Original strand, 15951607 - 15951703
Alignment:
Q  136 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||| ||| ||    || ||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15951607 tgtaaacacgaaagttttagataattttggtagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 126075 - 125965
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| || || ||||||||||||||||    
T  126075 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatg 125976  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  125975 atcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 15760738 - 15760848
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||  ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15760738 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttataaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15760837  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  15760838 attaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 32495062 - 32495160
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | |||| |||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32495062 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattact 32495160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001076
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttg 214  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  123 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 332
Target Start/End: Original strand, 38897741 - 38897791
Alignment:
Q  282 aatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  38897741 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgta 38897791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 332
Target Start/End: Original strand, 17985092 - 17985141
Alignment:
Q  283 atttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  17985092 atttcaaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgta 17985141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8469193 - 8469141
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||    
T  8469193 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgta 8469141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 330
Target Start/End: Original strand, 10500934 - 10500982
Alignment:
Q  282 aatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtg 330  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  10500934 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtg 10500982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 13475728 - 13475772
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13475728 ggtgtaaacacaaaggttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 13475772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 330
Target Start/End: Original strand, 14156592 - 14156640
Alignment:
Q  282 aatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtg 330  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  14156592 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtg 14156640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 23461796 - 23461848
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  23461796 cgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgta 23461848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 501794 - 501470
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501794 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 501695  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  501694 tattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttata 501595  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  501594 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgtgcgaatttgaaatgaaaagtgatattgat 501495  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| ||||| |||||    
T  501494 tgttacagaattggtcttatgtgta 501470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 501522 - 501358
Alignment:
Q  87 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 186  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  501522 cgaatttgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggt 501424  T
Q  187 ctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  501423 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139633
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 178  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatg 139633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 15202418 - 15202742
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15202418 atgattgtgattatttagaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctaccccgaatttgaaatgaaatctgg 15202517  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202518 tattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 15202617  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15202618 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaacgttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgat 15202717  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  15202718 tggtacagaattggtcttaggtgta 15202742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19897244 - 19896920
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19897244 atgattgttatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 19897145  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19897144 tattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 19897045  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19897044 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgat 19896945  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  19896944 tggtacaaaattggtcttaggtgta 19896920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32122458 - 32122134
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32122458 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 32122359  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32122358 tattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttata 32122259  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32122258 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgtaaactgatattgat 32122159  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  32122158 tggtacagaattgttcttaggtgta 32122134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 329
Target Start/End: Original strand, 38549245 - 38549565
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38549245 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctcccccgaatttgaaatgaaatctgg 38549344  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38549345 tattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttata 38549444  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38549445 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactggtattgat 38549543  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  38549544 tggtacagaattgatcttaggt 38549565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24049340 - 24049016
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24049340 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgttttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatgg 24049241  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24049240 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 24049141  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24049140 aaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaaaataaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgat 24049041  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  24049040 tggtacataattggtcttaggtgta 24049016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 27471849 - 27472173
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27471849 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactga 27471948  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27471949 tattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 27472048  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27472049 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgat 27472148  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||| ||||    
T  27472149 tggtacataattggtcttagctgta 27472173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20404009 - 20403685
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20404009 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatagattgctttttcttatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 20403910  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20403909 tattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaggatttata 20403810  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403809 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 20403710  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  20403709 tgatacagaattggtcttaggtgta 20403685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15071290 - 15070969
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15071290 atgattgtgatgattttgaataaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaataaaaactgg 15071191  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071190 tattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 15071091  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071090 gaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 15070991  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    || |||| ||||| ||||||||    
T  15070990 tggtacataattggtcttaggt 15070969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Original strand, 19936347 - 19936664
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936347 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttta-ctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 19936445  T
Q  114 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaactt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  19936446 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaactt 19936545  T
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19936546 gagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 19936645  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19936646 agaattggtcttaggtgta 19936664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 16412747 - 16413072
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttt-tctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  16412747 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgcttttttctgatttttcttttcatctctgccgcgaatttgaaatgaaaattg 16412846  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16412847 gtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttat 16412946  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16412947 agaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattga 16413046  T
Q  307 ttgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16413047 ttggtacataattggtcttaggtgta 16413072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 1326557 - 1326801
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1326557 atgattgtgatgattttgaatgaaagtaaaattgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttgaaatgaaatctgg 1326656  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1326657 tattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 1326756  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1326757 aaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1326801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 16401243 - 16401488
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401243 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16401341  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||  |||||    
T  16401342 tttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcaatacaactttgtcagaatt 16401441  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  16401442 tgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgta 16401488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19896973 - 19896727
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896973 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 19896874  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19896873 tttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 19896774  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    | |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  19896773 ttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgta 19896727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 15202689 - 15202935
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15202689 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattgg 15202788  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15202789 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatatttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 15202888  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15202889 tgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 15202935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11361247 - 11361024
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttc-atctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11361247 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgattttttttttccatctctgccccgaatttgaaatgaaatcta 11361148  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  11361147 gtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttat 11361048  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaatta 230  Q
    ||||||| |||||| || ||||||    
T  11361047 agaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Original strand, 16401437 - 16401681
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  16401437 gaatttgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtt 16401536  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttg 287  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16401537 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttg 16401636  T
Q  288 aaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16401637 aaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgta 16401681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 329
Target Start/End: Original strand, 38549515 - 38549758
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38549515 ccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttgg 38549614  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  38549615 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatt 38549714  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  38549715 tgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggt 38549758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32810427 - 32810263
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  32810427 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctaatattga 32810328  T
Q  114 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32810327 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1484860 - 1484694
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1484860 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1484761  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1484760 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1484694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 14409148 - 14409314
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14409148 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14409247  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14409248 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14824233 - 14824067
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14824233 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 14824134  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14824133 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14824067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16198353 - 16198187
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16198353 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttgg 16198254  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16198253 tttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16198187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 261
Target Start/End: Original strand, 14397444 - 14397619
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14397444 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 14397543  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaa 261  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  14397544 tttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaa 14397619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 5852996 - 5853162
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5852996 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 5853095  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5853096 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5853162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 24485747 - 24485913
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24485747 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 24485846  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24485847 tttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24485913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 15202882 - 15203048
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15202882 ccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 15202981  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15202982 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15203048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 16413019 - 16413185
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16413019 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttgg 16413118  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  16413119 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaat 16413185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 18677768 - 18677934
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18677768 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 18677867  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18677868 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18677934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 27472120 - 27472286
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27472120 ccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttgg 27472219  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27472220 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 32122187 - 32122021
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32122187 ccgaatttgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttag 32122088  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32122087 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 38549708 - 38549874
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38549708 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttgg 38549807  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  38549808 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaat 38549874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 19936611 - 19936777
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||    
T  19936611 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattgg 19936710  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19936711 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19936777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4483733 - 4483573
Alignment:
Q  92 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgac 191  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4483733 ttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 4483634  T
Q  192 gtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4483633 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaat 4483573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 4542077 - 4542243
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  4542077 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcg 4542176  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
      |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4542177 cttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 4542243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15071019 - 15070861
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15071019 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 15070920  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070919 tttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 15070861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24049069 - 24048904
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24049069 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24048970  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24048969 tttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaat 24048904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 20045899 - 20046057
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  20045899 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 20045998  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | | || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20045999 tttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtca 20046057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20403738 - 20403572
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  20403738 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttgg 20403639  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20403638 tttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaat 20403572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22002211 - 22002045
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22002211 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 22002112  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22002111 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaat 22002045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Original strand, 45290252 - 45290389
Alignment:
Q  87 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290252 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 45290351  T
Q  187 ctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtc 224  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45290352 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19896780 - 19896614
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||    
T  19896780 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttgg 19896681  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19896680 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19896614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 252
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658022
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 25658022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290499
Alignment:
Q  126 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  226 aattactgcacgtag 240  Q
    |||||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtag 45290499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1484926 - 1484807
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1484926 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 1484827  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  1484826 cagaattggtcttaggtgta 1484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5853049
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 5853029  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  5853030 cagaattggtcttaggtgta 5853049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409201
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 14409181  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14409182 cagaattggtcttaggtgta 14409201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 16401628 - 16401794
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16401628 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttgg 16401727  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  16401728 tttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaat 16401794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 20045833 - 20045952
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20045833 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 20045932  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  20045933 cagaattggtcttaggtgta 20045952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14824180
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 14824200  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  14824199 tagaattggtcttaggtgta 14824180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Original strand, 37609834 - 37609936
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37609834 atgattgtgatgattttgaataagagtgaagttgaataatataggttgctttttcttatttttcttttcatctctg-cccgaatttgaaatgaaatctgg 37609932  T
Q  108 tatt 111  Q
    ||||    
T  37609933 tatt 37609936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4483804 - 4483689
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4483804 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtatttattggta 4483706  T
Q  313 cagaattgatcttaggt 329  Q
    || ||||| ||||||||    
T  4483705 cataattggtcttaggt 4483689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Original strand, 45290186 - 45290304
Alignment:
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    |||||||| | ||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45290186 gagttatgatgaaaatactcaacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 45290285  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  45290286 aaaattggtcttaggtgta 45290304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 320
Target Start/End: Original strand, 16401186 - 16401284
Alignment:
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  16401186 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattg 16401284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 4542046 - 4542130
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4542046 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 4542130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 24485716 - 24485800
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  24485716 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgta 24485800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 254 - 332
Target Start/End: Original strand, 14397419 - 14397497
Alignment:
Q  254 tttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14397419 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 14397497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22002242 - 22002158
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22002242 tgaatttgtatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgta 22002158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16198510 - 16198300
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||    ||||||||||| | || | ||||| |||| | |||| ||||| | |   ||||| ||||    
T  16198510 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatg 16198411  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattga 321  Q
     | ||| |||| |||| |||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16198410 attaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaatttcaccacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattgg 16198311  T
Q  322 tcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||    
T  16198310 tcttaggtgta 16198300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 329
Target Start/End: Original strand, 18677737 - 18677818
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18677737 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggt 18677818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20457408 - 20457354
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20457408 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc 20457354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 15319988 - 15320098
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15319988 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15320087  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  15320088 atcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 15500357 - 15500467
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15500357 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15500456  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  15500457 atcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 22007097 - 22007195
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007097 ggtgtaaacatgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 223304 - 223414
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  223304 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 223403  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  223404 attaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 272163 - 272273
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  272163 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 272262  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  272263 atcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 643686 - 643576
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  643686 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 643587  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  643586 atcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 688075 - 688185
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  688075 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 688174  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  688175 attaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 736927 - 737037
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  736927 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 737026  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  737027 attaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 829492 - 829382
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  829492 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 829393  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  829392 atcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 860822 - 860932
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  860822 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 860921  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  860922 attaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 22089372 - 22089482
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||    
T  22089372 gaattggcctttggtttaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatg 22089471  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  22089472 atcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 1326636 - 1326688
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  1326636 cgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgta 1326688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 38549324 - 38549376
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  38549324 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgta 38549376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 17150615 - 17150725
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||||| | |||||  ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17150615 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatg 17150714  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  17150715 attaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11360997 - 11360953
Alignment:
Q  225 aaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagca 269  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11360997 aaattactgcacgtagatcatagtgaatttttatgaatttcagca 11360953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39114511 - 39114415
Alignment:
Q  136 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39114511 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 276
Target Start/End: Original strand, 3844554 - 3844609
Alignment:
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataacttt 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3844554 gtcaaattactacacgtaggtcatagtgaatttttatgaaatttcagcacaacttt 3844609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 232
Target Start/End: Original strand, 21493050 - 21493137
Alignment:
Q  145 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||   |||| |||||  ||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21493050 gaaagttgaagatatggatgttagctttcatttgccattggttggacttcatttagatttatagaacttgagttatgatcaaaatact 21493137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18612002 - 18611952
Alignment:
Q  182 ttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18612002 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18611952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22147087 - 22146977
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||  || | ||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  22147087 gaattggactttggtataaacatgaaagttttagataattgtgttagctttcttttggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatg 22146988  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  22146987 atcaaattact 22146977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18618899 - 18618830
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18618899 tgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 2154064 - 2154388
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2154064 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctgg 2154163  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2154164 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 2154263  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154264 gaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 2154363  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  2154364 tggtacagaattggtcttaggtgta 2154388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 20917279 - 20917603
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20917279 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatgggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatcagg 20917378  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  20917379 tattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaatcatttata 20917478  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20917479 aaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattcgaaatgaaaactggtattgat 20917578  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  20917579 tggtacagaattggtcttaggtgta 20917603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29330706 - 29330388
Alignment:
Q  14 gtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330706 gtgatgattttgaatgaaagtaaagttgaataatataggttactttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattga 29330607  T
Q  114 taggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaactt 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330606 taggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactt 29330507  T
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  29330506 gagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtac 29330407  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  29330406 agaattggtcttaggtgta 29330388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32028754 - 32028433
Alignment:
Q  9 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32028754 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaatctggt 32028655  T
Q  109 attgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatag 208  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32028654 attgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaaaacgatttatag 32028555  T
Q  209 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgatt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028554 agcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgatt 32028455  T
Q  309 gctacagaattgatcttaggtg 330  Q
    | |||||||||| | |||||||    
T  32028454 ggtacagaattggttttaggtg 32028433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 295707 - 296031
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  295707 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataagttgctttttctgatttttcttttcatctctgtcccgaatttgaaatgaaatctgg 295806  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  295807 tattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaaaacgatttata 295906  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  295907 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgat 296006  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  296007 tggtacagaattggtcttaggtgta 296031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 17516402 - 17516727
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttc-tgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17516402 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttcctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaaccg 17516501  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17516502 gtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttat 17516601  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  17516602 agaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgatttttaaatgaaaaatggtattga 17516701  T
Q  307 ttgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||  ||||||||| || ||||||||    
T  17516702 ttggcacagaattggtcctaggtgta 17516727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Original strand, 20901373 - 20901677
Alignment:
Q  28 tgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||    
T  20901373 tgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattg 20901472  T
Q  128 gtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaa 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20901473 gtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaa 20901572  T
Q  228 ttactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttag 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20901573 ttactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttag 20901672  T
Q  328 gtgta 332  Q
    |||||    
T  20901673 gtgta 20901677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32028291 - 32028044
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028291 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 32028192  T
Q  186 tct-gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaat 284  Q
    | | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32028191 ttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaat 32028092  T
Q  285 ttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32028091 ttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgta 32028044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 17516674 - 17516920
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17516674 ccgatttttaaatgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 17516773  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  17516774 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatt 17516873  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17516874 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 17516920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32028097 - 32027851
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32028097 ccgaatttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattgg 32027998  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32027997 tcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 32027898  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32027897 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 32027851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32028484 - 32028238
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  32028484 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttgg 32028385  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32028384 tctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 32028285  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||    
T  32028284 tgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgta 32028238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Original strand, 17516869 - 17517033
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17516869 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 17516968  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17516969 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17517033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296146
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  295978 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 296077  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaattt 254  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  296078 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaattt 296146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 2154335 - 2154501
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2154335 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttgg 2154434  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2154435 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2154501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Original strand, 20901624 - 20901783
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20901624 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttgg 20901723  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 245  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901724 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 20901783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Original strand, 20917550 - 20917709
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20917550 ccgaattcgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 20917649  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 245  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20917650 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcac 20917709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32027904 - 32027745
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32027904 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttgg 32027805  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 245  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32027804 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcac 32027745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 264472 - 264638
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  264472 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 264571  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  264572 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20909470 - 20909312
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20909470 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 20909371  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20909370 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 20909312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 10732644 - 10732810
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10732644 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 10732743  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10732744 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 10732810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29346438 - 29346280
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29346438 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 29346339  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29346338 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtca 29346280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 251
Target Start/End: Original strand, 37804609 - 37804771
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  37804609 aatttgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttt 37804708  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37804709 gacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaa 37804771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29330441 - 29330276
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29330441 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttgg 29330342  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    | |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29330341 tttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa 29330276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39363837 - 39363677
Alignment:
Q  92 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  39363837 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgac 39363738  T
Q  192 gtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39363737 ttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaat 39363677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23064972 - 23064806
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  23064972 ccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcg 23064873  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23064872 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 23064806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29348911 - 29348753
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  29348911 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttgg 29348812  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29348811 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtca 29348753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29351384 - 29351226
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  29351384 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttgg 29351285  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29351284 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtca 29351226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39245594 - 39245428
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39245594 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 39245495  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39245494 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38619889 - 38619729
Alignment:
Q  92 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgac 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  38619889 ttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgac 38619790  T
Q  192 gtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38619789 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 38619729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 42245069 - 42245235
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  42245069 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 42245168  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42245169 tttgacttcaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 42245235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 264406 - 264525
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  264406 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 264505  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  264506 cagaattggtcttaggtgta 264525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909417
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 20909437  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  20909436 cataattggtcttaggtgta 20909417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29346504 - 29346385
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29346504 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29346405  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  29346404 cagaattggtcttaggtgta 29346385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29348977 - 29348858
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29348977 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29348878  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  29348877 cagaattggtcttaggtgta 29348858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29351450 - 29351331
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29351450 tgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 29351351  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  29351350 cagaattggtcttaggtgta 29351331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245541
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttgagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 39245561  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  39245560 cataattggtcttatgtgta 39245541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23065038 - 23064924
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23065038 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggta 23064939  T
Q  313 cagaattgatcttag 327  Q
    |||||||| ||||||    
T  23064938 cagaattggtcttag 23064924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363793
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaatgaaaactggtattgattggta 39363810  T
Q  313 cagaattgatcttaggt 329  Q
    || ||||| ||||||||    
T  39363809 cataattggtcttaggt 39363793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776652
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 9776652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38619960 - 38619845
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  38619960 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaa-ttgaaataaaaactggtattgattggta 38619862  T
Q  313 cagaattgatcttaggt 329  Q
    || ||||| ||||||||    
T  38619861 cataattggtcttaggt 38619845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Original strand, 42245004 - 42245122
Alignment:
Q  214 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctac 313  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42245004 gagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatac 42245103  T
Q  314 agaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  42245104 agaattggtcttaggtgta 42245122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 10732613 - 10732697
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  10732613 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 10732697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 332
Target Start/End: Original strand, 37804449 - 37804659
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| | || || ||||   |||| ||||| | |    |||| ||||    
T  37804449 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatg 37804548  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattga 321  Q
     | ||| |||| || | |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||     
T  37804549 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcataatttgaaatgaaaactggcattgattggtacataattgg 37804648  T
Q  322 tcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||    
T  37804649 tcttaggtgta 37804659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 22883903 - 22884013
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22883903 gaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatg 22884002  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  22884003 atcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 43444008 - 43444118
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43444008 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 43444107  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  43444108 attaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12013 - 11903
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12013 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11914  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  11913 attaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25426287 - 25426177
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  25426287 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 25426188  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  25426187 attaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 27183180 - 27183278
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27183180 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7424987 - 7424879
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7424987 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 7424888  T
Q  222 gtcaaatta 230  Q
     ||||||||    
T  7424887 atcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11342300 - 11342190
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  11342300 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11342201  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  11342200 attaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 21933242 - 21933352
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21933242 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21933341  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  21933342 atcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 21939412 - 21939522
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21939412 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21939511  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  21939512 atcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 22367094 - 22367204
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||    
T  22367094 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatg 22367193  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  22367194 attaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35581450 - 35581340
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35581450 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 35581351  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  35581350 atcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 36990638 - 36990748
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  36990638 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 36990737  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  36990738 atcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 18778605 - 18778715
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18778605 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18778704  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  18778705 attaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 21074208 - 21074318
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  21074208 gaattggactttggtgtaaaaatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 21074307  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  21074308 attaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23511195 - 23511127
Alignment:
Q  164 gttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23511195 gttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22755270 - 22755231
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 173  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22755270 ggtgtaaacatgaaagttgtagatatggatgttagctttc 22755231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19499526 - 19499428
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  19499526 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatagctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagatatgattaaattact 19499428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32950283 - 32950213
Alignment:
Q  162 atgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32950283 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattact 32950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 35791736 - 35791834
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||  |||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35791736 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7177 - 6857
Alignment:
Q  12 ttgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||    
T  7177 ttgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgtcccgaatatgaaatgaaaattgctatt 7078  T
Q  112 gataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaac 211  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7077 gattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaac 6978  T
Q  212 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6977 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggt 6878  T
Q  312 acagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  6877 acagaattggtcttaggtgta 6857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6910 - 6752
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6910 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 6811  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6810 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 6752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 6369 - 6692
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6369 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgaatttt-ttttcatctccgccccgaatttgaaatgaaatgtgg 6467  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6468 tattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttata 6567  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6568 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttaatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgat 6667  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  6668 tggtacagaattggtcttaggtgta 6692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 6639 - 6805
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6639 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttgg 6738  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6739 tccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18667 - 18358
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18667 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 18568  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18567 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttata 18468  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18467 gaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggcattgat 18368  T
Q  308 tgctacagaa 317  Q
    || |||||||    
T  18367 tggtacagaa 18358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18588 - 18536
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18588 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 18536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 94)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1598979 - 1598658
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1598979 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctaccccgaatttgaaatgaaaactgg 1598880  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1598879 tattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaaaacgatttata 1598780  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598779 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 1598680  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggt 329  Q
    || |||| || || ||||||||    
T  1598679 tggtacataaatggtcttaggt 1598658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 19847404 - 19847728
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19847404 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaaactgg 19847503  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19847504 tattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttata 19847603  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847604 gaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 19847703  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  19847704 tggtacaaaattggtcttaggtgta 19847728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19005881 - 19005557
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19005881 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatttgg 19005782  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19005781 tattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgatttata 19005682  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005681 gaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacatctttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 19005582  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||  |||||||||||    
T  19005581 tggtacataattagtcttaggtgta 19005557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 31629973 - 31630297
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31629973 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaaaatgaaatctgg 31630072  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31630073 tattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 31630172  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630173 gaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaatttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 31630272  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||||||||||    
T  31630273 tggtacagaattggtcttaggtgta 31630297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18914855 - 18914531
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914855 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 18914756  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18914755 tattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttata 18914656  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  18914655 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaacttttatgaattttagcacaacttagaccgaattttaaattaatactggtattgat 18914556  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  18914555 tggtacataattggtcttaggtgta 18914531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 30676151 - 30676466
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30676151 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttt---------tcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 30676241  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30676242 tattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaaaacgatttata 30676341  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676342 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 30676441  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  30676442 tggtacataattggtcttaggtgta 30676466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23992959 - 23992715
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23992959 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaatagtataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatccgg 23992860  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23992859 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttata 23992760  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23992759 gaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaat 23992715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34963910 - 34963666
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34963910 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatatgttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgg 34963811  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  34963810 tattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttata 34963711  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  34963710 gaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 34963666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25535945 - 25535708
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgcttttt-ctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25535945 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgcttttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttgaaatgaaaactg 25535846  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  25535845 gtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttat 25535746  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25535745 agaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtca 25535708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 89 - 332
Target Start/End: Original strand, 8830 - 9073
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8830 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 8929  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttga 288  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  8930 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttta 9029  T
Q  289 aatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9030 aatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgta 9073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1598708 - 1598462
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598708 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 1598609  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1598608 tatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 1598509  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1598508 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 1598462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 26924151 - 26924397
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26924151 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 26924250  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26924251 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 26924350  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26924351 tgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgta 26924397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25689154 - 25688908
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689154 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 25689055  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  25689054 tcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatt 25688955  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||    
T  25688954 tgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgta 25688908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18914584 - 18914342
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18914584 ccgaattttaaattaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttgg 18914485  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18914484 tctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagtcaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 18914385  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttagg 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18914384 tgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttagg 18914342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 89 - 286
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2068
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 1970  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaattt 286  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1971 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 2068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 118 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25689315 - 25689101
Alignment:
Q  118 tccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  25689315 tccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagt 25689216  T
Q  218 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25689215 tatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaa 25689116  T
Q  318 ttgatcttaggtgta 332  Q
    ||| |||||||||||    
T  25689115 ttggtcttaggtgta 25689101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737048
Alignment:
Q  133 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  233 gcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgta 25737048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 157 - 320
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981484
Alignment:
Q  157 tatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaattttt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 22981420  T
Q  257 atgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattg 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22981421 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattg 22981484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 157 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806924
Alignment:
Q  157 tatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaattttt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttt 23806988  T
Q  257 atgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattg 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23806987 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattg 23806924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1598515 - 1598349
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598515 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 1598416  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1598415 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 89 - 288
Target Start/End: Original strand, 79 - 278
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  79 aatttaaaatgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtct 178  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttga 288  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  179 gacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaatttttgtgaatttcagcacaactttgttcgaatttga 278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 18334296 - 18334462
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18334296 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18334395  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18334396 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18334462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24423005 - 24422839
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24423005 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24422906  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24422905 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24422839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33862252 - 33862086
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33862252 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 33862153  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33862152 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33862086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33864736 - 33864570
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33864736 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 33864637  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33864636 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23415423 - 23415235
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23415423 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattgg 23415324  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||| || |||||||||||    
T  23415323 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaaatcttatgaaaattcagcataac 23415235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 26924344 - 26924502
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924344 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 26924443  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26924444 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtca 26924502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 30676413 - 30676579
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676413 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 30676512  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30676513 tttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 30676579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27557181 - 27556993
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27557181 ccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 27557082  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| || |||||||||||    
T  27557081 tctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 27556993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 28289042 - 28289205
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28289042 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 28289141  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28289142 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 28289205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 1540615 - 1540781
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1540615 ccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1540714  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1540715 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1540781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 2290884 - 2291050
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2290884 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttgg 2290983  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2290984 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2291050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8055488 - 8055322
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  8055488 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttgg 8055389  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8055388 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaat 8055322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12742776 - 12742610
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12742776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 12742677  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12742676 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 12742610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 31630244 - 31630410
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  31630244 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttag 31630343  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31630344 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaat 31630410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19005610 - 19005452
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19005610 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19005511  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19005510 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtca 19005452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 252
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377717
Alignment:
Q  111 tgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaa 210  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  211 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17377717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 19847675 - 19847837
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||    
T  19847675 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttgg 19847770  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19847771 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18914391 - 18914233
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18914391 ccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttgg 18914292  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914291 tttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 18914233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25688961 - 25688795
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25688961 ccgaatttgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttgg 25688862  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25688861 tttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaat 25688795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22782685 - 22782519
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782685 ccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 22782586  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22782585 tttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 22782519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 19858626 - 19858789
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  19858626 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttgg 19858722  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19858723 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 19858789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 18334230 - 18334349
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18334230 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 18334329  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18334330 cagaattggtcttaggtgta 18334349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24423071 - 24422952
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24423071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 24422972  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  24422971 cagaattggtcttaggtgta 24422952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864683
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 33864703  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  33864702 cagaattggtcttaggtgta 33864683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Original strand, 2290818 - 2290937
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2290818 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 2290917  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  2290918 cagaattggtcttaggtgta 2290937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Original strand, 17027976 - 17028070
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17027976 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 17028070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8055554 - 8055435
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8055554 tgagttaaggtcaaattactgcacataggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 8055455  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  8055454 cagaattggtcttaggtgta 8055435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 205
Target Start/End: Original strand, 15892112 - 15892231
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15892112 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 15892211  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagattta 205  Q
    | |||| |||||| ||||||    
T  15892212 tttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22782751 - 22782632
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  22782751 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggta 22782652  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  22782651 cagaattggtcttaggtgta 22782632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 319
Target Start/End: Original strand, 26924085 - 26924191
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26924085 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 26924184  T
Q  313 cagaatt 319  Q
    |||||||    
T  26924185 cagaatt 26924191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12942646 - 12942495
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||     
T  12942646 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtt 12942559  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12942558 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaa 12942495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Original strand, 17883203 - 17883301
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17883203 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggt 17883301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 19858595 - 19858679
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19858595 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgta 19858679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33862283 - 33862199
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33862283 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 33862199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12742807 - 12742723
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  12742807 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgta 12742723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23415454 - 23415370
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  23415454 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgta 23415370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 1540584 - 1540668
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  1540584 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgta 1540668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12942679 - 12942595
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  12942679 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 12942595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 15892081 - 15892165
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  15892081 tgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 15892165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 17883170 - 17883254
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  17883170 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgta 17883254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27557212 - 27557128
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  27557212 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgta 27557128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25737101 - 25737028
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25737101 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 28289009 - 28289093
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  28289009 tgaatttttatgaattttagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgta 28289093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16240406 - 16240296
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16240406 gaattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatg 16240307  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  16240306 atcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 16556944 - 16557054
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16556944 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16557043  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  16557044 atcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 16633500 - 16633610
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16633500 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16633599  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  16633600 atcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 16650174 - 16650284
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  16650174 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatg 16650273  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  16650274 atcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Original strand, 9020 - 9085
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 151  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020 ccgaattttaaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34963831 - 34963779
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34963831 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 34963779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 25689363 - 25689320
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatag 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689363 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatag 25689320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25904585 - 25904474
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaaga-tttatagaacttgagttat 220  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||    
T  25904585 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttat 25904486  T
Q  221 ggtcaaattact 232  Q
    | ||||||||||    
T  25904485 gatcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16198335 - 16198293
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatata 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198335 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatata 16198293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984228
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 27654596 - 27654706
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27654596 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 27654695  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  27654696 attaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 35016015 - 35016113
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35016015 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25535865 - 25535813
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  25535865 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgta 25535813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 22226580 - 22226679
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaaga-tttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226580 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 332
Target Start/End: Original strand, 1871 - 1921
Alignment:
Q  282 aatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 1921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10488081 - 10487971
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10488081 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 10487982  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  10487981 atcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 16377247 - 16377357
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16377247 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16377346  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  16377347 atcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 16384571 - 16384681
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16384571 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16384670  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  16384671 atcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 16826367 - 16826477
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16826367 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 16826466  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  16826467 attaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776205
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875700
Alignment:
Q  209 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 15875700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19609690 - 19609582
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | ||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||    
T  19609690 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatg 19609591  T
Q  222 gtcaaatta 230  Q
     ||||||||    
T  19609590 atcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1555637 - 1555527
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||  ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1555637 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttttaaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 1555538  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  1555537 attaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 33315075 - 33315185
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  33315075 gaattggcctttcgtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatg 33315174  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  33315175 atcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 129
Target Start/End: Original strand, 22981443 - 22981486
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22981443 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23806965 - 23806922
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23806965 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 22593581 - 22593691
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    |||||||  |||||||| ||||  ||| ||||||||   ||||||||||||||||||   || || |||| || ||| ||||| || |||||||||||||    
T  22593581 gaattgggtttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatg 22593680  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  22593681 atcaaattact 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25175222 - 25175112
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  25175222 gaattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatg 25175123  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     | ||||||||    
T  25175122 attaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23992880 - 23992828
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  23992880 cgaatttgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgta 23992828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43468 - 43145
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43468 atgattgtgatgattttgaatgaaagtggagttgaataatatgggttgcttttt-tgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 43370  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43369 tattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttata 43270  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43269 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 43170  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || ||||   ||| |||||||||||    
T  43169 tggtacatttttggtcttaggtgta 43145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43198 - 43032
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43198 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 43099  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43098 tttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaat 43032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13496
Alignment:
Q  135 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  235 acgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaat 13496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20574 - 20502
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatct 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatct 20502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1984 - 1660
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaa-gttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1984 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaaagttgaataatataggttgctttt-ctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaatctg 1886  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1885 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttat 1786  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattga 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1785 agaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattga 1686  T
Q  307 ttgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1685 ttggtacaaaattggtcttaggtgta 1660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1713 - 1634
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 165  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1713 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 10772 - 11096
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccg-aatttgaaatgaaatctg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  10772 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgaatttt-ttttcatctccgccccggaatttgaaatgaaatgtg 10870  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10871 gtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttat 10970  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10971 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaattttcctgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattga 11070  T
Q  307 ttgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  11071 ttggtacagaattggtcttaggtgta 11096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15641 - 15348
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15641 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 15542  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  15541 tattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaatttata 15443  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggta 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15442 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggta 15348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11209
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11043 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttgg 11142  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11143 tccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 11209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 120 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15347 - 15223
Alignment:
Q  120 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagtta 219  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15347 cagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagtta 15248  T
Q  220 tggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15247 tggtcaaattactgcacgtaggtca 15223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5424 - 5100
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5424 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttctattcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactga 5325  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5324 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatata 5225  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5224 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttggccgaatttgaaatgaaaactggtattgat 5125  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| ||||| |||||||||||    
T  5124 tggtacataattggtcttaggtgta 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5153 - 4995
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  5153 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatgg 5054  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5053 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtca 4995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10712 - 10391
Alignment:
Q  10 gattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10712 gattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgttttttcttatttttcttttcatgtttgccccaaatttgaactgaaatctggta 10613  T
Q  110 ttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttataga 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10612 ttgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttataga 10513  T
Q  210 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattg 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10512 acttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaatttttgtgaatttcagcacaactttatctgaatttaaaatgaaaactggtattgattg 10413  T
Q  310 ctacagaattgatcttaggtgt 331  Q
     |||| ||||| ||||| ||||    
T  10412 gtacataattggtcttatgtgt 10391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10441 - 10197
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10441 gaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtc 10342  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttg 287  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  10341 tgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgactgaatttg 10242  T
Q  288 aaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  10241 aaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgta 10197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10084
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  10248 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtt 10149  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||    
T  10148 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaat 10084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30749 - 30425
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30749 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttcatatttttcttttcatctctgctccgaatttgaaatgaaaactgg 30650  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30649 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttata 30550  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30549 aaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgat 30450  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||||||||| |||| ||||||    
T  30449 tggtacagaattggtcttcggtgta 30425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30478 - 30312
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30478 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttgg 30379  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | | || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30378 tttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 34226 - 34154
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatct 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34226 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatct 34154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 16872 - 17196
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16872 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaaactgg 16971  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||    
T  16972 tattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttata 17071  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17072 gaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgat 17171  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || || ||||||| |||||||||||    
T  17172 tggtatagaattggtcttaggtgta 17196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 94869 - 94703
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  94869 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 94770  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  94769 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 94703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 17143 - 17309
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  17143 ccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttgg 17242  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17243 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 94935 - 94816
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  94935 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 94836  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  94835 cagaattggtcttaggtgta 94816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8662 - 8338
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8662 atgattgtgatgattttgaatgaatgtgaagttgaataatataggttgctttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatggaaactgg 8563  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8562 tattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaagatttata 8463  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8462 caacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtgcatttttatgattttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaactggtattgat 8363  T
Q  308 tgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    || |||| || || |||||||||||    
T  8362 tggtacataactggtcttaggtgta 8338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8391 - 8145
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8391 ccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttgg 8292  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  8291 tttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatt 8192  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  8191 tgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgta 8145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8196 - 8040
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8196 gaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtt 8097  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8096 tgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtca 8040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1088 - 785
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1088 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgcataatataggttt---------atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 998  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  997 tattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 898  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  897 gaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatgaaatctggtattgat 798  T
Q  308 tgctacagaattg 320  Q
    || |||| |||||    
T  797 tggtacaaaattg 785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 663 - 500
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |  |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  663 aatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggttt 564  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  563 gacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 613
Alignment:
Q  166 tagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttc 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttgtatgaatttc 680  T
Q  266 agcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||    
T  679 agcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgta 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1018 - 966
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1018 cgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgta 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 826 - 782
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  826 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 8)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 320
Target Start/End: Original strand, 22812 - 23115
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22812 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgcataatataggttt---------atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 22902  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22903 tattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttata 23002  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgat 307  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23003 gaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatgaaatctggtattgat 23102  T
Q  308 tgctacagaattg 320  Q
    || |||| |||||    
T  23103 tggtacaaaattg 23115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14406 - 14240
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14406 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14307  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14306 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 14240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 23237 - 23400
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |  |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23237 aatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggttt 23336  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23337 gacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 23400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 332
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23287
Alignment:
Q  166 tagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttc 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttgtatgaatttc 23220  T
Q  266 agcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||| |||||||    
T  23221 agcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgta 23287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Original strand, 20636 - 20764
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  20636 atgattgtgatgattttgaatcaaagtgaagttgaataatataggttgttttttctgatttttcttttcatctctgccccgaattggaaatgaaatctga 20735  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggt 136  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20736 tattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14437 - 14353
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  14437 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgta 14353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 22882 - 22934
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22882 cgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgta 22934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Original strand, 23074 - 23118
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  23074 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 23118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 148 - 393
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttt-tcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  148 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctaattttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactg 247  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  248 gtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttat 347  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  348 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 228 - 280
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  228 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgta 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1438 - 1225
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1438 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatatatgttgctttttctgatttttcatttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctca 1339  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1338 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttata 1240  T
Q  208 gaacttgagttatgg 222  Q
    |||||||||||||||    
T  1239 gaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 104 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1223 - 999
Alignment:
Q  104 ctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatt 203  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1223 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatt 1124  T
Q  204 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1123 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtat 1024  T
Q  304 tgattgctacagaattgatcttagg 328  Q
    |||||| ||||| |||  |||||||    
T  1023 tgattggtacagcattcgtcttagg 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 890
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 949  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  948 tttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 3813 - 4059
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3813 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttgg 3912  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3913 tctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 4012  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  4013 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgta 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 3620 - 3864
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3620 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 3719  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    | ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3720 tatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt 3819  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3820 tgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtg 3864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Original strand, 4006 - 4172
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4006 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 4105  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4106 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaat 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 332
Target Start/End: Original strand, 3540 - 3673
Alignment:
Q  199 agatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaact 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  3540 agatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaatttttatgaatttcaacacaagtttgtccgaatttgaaatgaaaact 3639  T
Q  299 ggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  3640 ggtattgattggtacagaattggtcttagctgta 3673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 7395 - 7621
Alignment:
Q  87 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7395 cgaatttgaaatgaaa-ctggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggt 7493  T
Q  187 ctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaattt 286  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7494 ctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 7593  T
Q  287 gaaatgaaaactggtattgattgctaca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7594 gaaatgaaaactggtattgattggtaca 7621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Original strand, 7201 - 7446
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||    
T  7201 ccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttgg 7300  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatt 285  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7301 tctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgttcgaatt 7400  T
Q  286 tgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  7401 tgaaatg-aaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgta 7446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 157 - 332
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7254
Alignment:
Q  157 tatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaattttt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgacttttt 7178  T
Q  257 atgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||   |||||||||||    
T  7179 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgta 7254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Original strand, 7009 - 7079
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcat 78  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7009 atgattgtgatgattttgaataaaagtgaaattgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcat 7079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Original strand, 38281 - 38506
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |    
T  38281 atgattgtgatgattttgaataaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttctcttttcatctctgccccgaatttgaaataaaaattag 38380  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttata 207  Q
    |||||||  ||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  38381 tattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttata 38480  T
Q  208 gaacttgagttatggtcaaattactg 233  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  38481 gaatttgagttatgttcaaattactg 38506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Original strand, 36905 - 37110
Alignment:
Q  89 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 188  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||   | |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36905 aatttgaaatgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 37004  T
Q  189 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37005 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttga 37104  T
Q  289 aatgaa 294  Q
    ||||||    
T  37105 aatgaa 37110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 126 - 309
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36932
Alignment:
Q  126 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  226 aattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||  |||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatcaaaatttgaaatgaaaactaatattgattg 36932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 36711 - 36740
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaa 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaa 36740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 556 - 398
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctgg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  556 atgattgtgattattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctcatttttcttttcatctatgccccgaatttgaaataaaatctgg 457  T
Q  108 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  456 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 477 - 425
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  477 cgaatttgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgta 425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31662 - 31474
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  31662 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattgg 31563  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  31562 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 31474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31609
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31693 tgaatttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 31609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18110 - 17924
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18110 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtc 18011  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||    
T  18010 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 17924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18143 - 18059
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18143 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 18059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6405 - 6239
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6405 ccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 6306  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6305 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6438 - 6352
Alignment:
Q  246 aatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  6438 aatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgta 6352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33628 - 33471
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33628 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtc 33529  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 245  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33528 tgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 33471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33661 - 33577
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33661 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 33577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38280 - 38114
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38280 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 38181  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38180 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 38114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38346 - 38227
Alignment:
Q  213 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgcta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38346 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 38247  T
Q  313 cagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  38246 cagaattggtcttaggtgta 38227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3480 - 3317
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3480 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 3381  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3380 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3513 - 3429
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  3513 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgta 3429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9700 - 9534
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9700 ccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttgg 9601  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9600 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaat 9534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9731 - 9647
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  9731 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgta 9647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39791 - 39626
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39791 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattgg 39692  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 251  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  39691 tctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39822 - 39738
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39822 tgaacttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgta 39738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21207 - 21040
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaat-gaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 184  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21207 ccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 21108  T
Q  185 gtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21107 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 21040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21238 - 21153
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaat-gaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21238 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgta 21153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13851 - 13685
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  13851 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttgg 13752  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13751 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13798
Alignment:
Q  212 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggt 13819  T
Q  312 acagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  13818 acagaattggtcttaggtgta 13798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 68420 - 68254
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  68420 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattgg 68321  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  68320 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 68254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 68451 - 68367
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  68451 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgta 68367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40858 - 40700
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40858 ccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttgg 40759  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40758 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 40700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40805
Alignment:
Q  212 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggt 40826  T
Q  312 acagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  40825 acagaattggtcttaggtgta 40805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37969 - 37848
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37969 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatg 37871  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtca 244  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  37870 atcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8477 - 8304
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8477 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattgg 8378  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg 259  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8377 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaatttttatg 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8508 - 8424
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  8508 tgaatttttatgaatttcagcacagctttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgta 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 273
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19980
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19792 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 19891  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatg-aatttcagcataac 273  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||| || |||||||||||    
T  19892 tctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 19761 - 19845
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  19761 tgaatttttatgaatttcagcaaaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgta 19845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11746 - 11588
Alignment:
Q  88 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  11746 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggt 11647  T
Q  188 tgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 246  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11646 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaca 11588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11779 - 11695
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  11779 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcggaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgta 11695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 10)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 134669 - 134503
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  134669 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 134570  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  134569 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 134503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 137138 - 136972
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  137138 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 137039  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  137038 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 136972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 139607 - 139441
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  139607 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 139508  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  139507 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 139441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 142076 - 141910
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  142076 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 141977  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  141976 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 141910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 144545 - 144379
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  144545 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 144446  T
Q  186 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  144445 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 144379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 134700 - 134616
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  134700 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgta 134616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 137169 - 137085
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  137169 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgta 137085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 139638 - 139554
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  139638 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgta 139554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 142107 - 142023
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  142107 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgta 142023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 144576 - 144492
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  144576 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgta 144492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 252
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53741
Alignment:
Q  123 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  223 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 53741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1722
Alignment:
Q  142 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  242 tcacaatgaa 251  Q
    ||||| ||||    
T  1731 tcacagtgaa 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 60666 - 60575
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60666 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatg 60575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 107205 - 107108
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatct 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107205 atgattgtggtgattttgaatgaaagtgaaattgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatct 107108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 110064 - 110174
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| | |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  110064 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 110163  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  110164 atcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 118565 - 118675
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| | |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  118565 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 118664  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  118665 atcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 113550 - 113284
Alignment:
Q  9 tgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagtt-gaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgcccc-gaatttgaaatgaaatctg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||| ||| ||||    |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||    
T  113550 tgattgtgatgattttgaatgaatgtgaagtttgaataagttaagttgctttttttgactttt----tcatctctacccccgaatttgaaataaaaactg 113455  T
Q  107 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttat 206  Q
    |||||||| ||| | || |||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||| || || |    
T  113454 gtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagtttt 113355  T
Q  207 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttat-gaatttcagcataacttt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | || ||||||  |||||||||| ||||||    
T  113354 agaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcatagtaaagttttataaaatttcagcacaacttt 113284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 7514 - 7420
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7514 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgagtaatataggttgctatttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 43280 - 43359
Alignment:
Q  8 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgcccc 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43280 atgattgtgatgattttgaatgaaagtgaagttgaataatataggttgctttttctgatttttcttttcatctctgcccc 43359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 167
Target Start/End: Original strand, 75608 - 75689
Alignment:
Q  86 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75608 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 332
Target Start/End: Original strand, 75609 - 75661
Alignment:
Q  280 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacagaattgatcttaggtgta 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  75609 cgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgta 75661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57774
Alignment:
Q  161 gatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 57774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 725
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  835 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 736  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  735 atcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 66 - 5
Alignment:
Q  248 tgaatttttatgaatttcagcataactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattg 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66 tgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattg 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 11065
Alignment:
Q  175 aatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaat 11065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30580 - 30470
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30580 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 30481  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  30480 atcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1347
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  1485 gaattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatg 1386  T
Q  222 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttatgaa 261  Q
     |||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||    
T  1385 atcaaattactacacatgggtca-tatgaatttttatgaa 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Original strand, 6195 - 6305
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6195 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatg 6294  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  6295 atcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7039
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6941 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8566
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||| |||| || | | ||||| ||||||||||||||||    
T  8676 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatg 8577  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  8576 atcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32216
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40628
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28186 - 28134
Alignment:
Q  200 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28186 gatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 28134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18315 - 18205
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  18315 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatg 18216  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  18215 atcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28579 - 28469
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  28579 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatg 28480  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  28479 atcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38485 - 38375
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  38485 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38386  T
Q  222 gtcaaattact 232  Q
     ||||||||||    
T  38385 atcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 19911 - 20009
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19911 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 232
Target Start/End: Original strand, 12519 - 12590
Alignment:
Q  161 gatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12519 gatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 868
Alignment:
Q  162 atgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattact 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1219
Alignment:
Q  130 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatt 229  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||||| || |||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1333 cttagatgtaaacataaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaatt 1234  T
Q  230 actgcacgtaggtca 244  Q
    ||| ||| |||||||    
T  1233 actacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 258
Target Start/End: Original strand, 233 - 279
Alignment:
Q  212 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaatttttat 258  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  233 ttgatttatggtcaaactactacacgtaggtcacaatgaatttttat 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  162 atgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  162 atgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| | || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  162 atgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | || || |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15876 - 15780
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 230  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||| ||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15876 ggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 232
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8192
Alignment:
Q  137 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||| |||||||||||  |   ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8097 gtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 53978 - 53939
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53978 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggacgttagctttc 53939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54044 - 53946
Alignment:
Q  134 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||| |||||||||| | ||||| |||| |  ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  54044 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 232
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1365
Alignment:
Q  163 tgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattact 232  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1296 tgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1020 - 912
Alignment:
Q  122 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 221  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| || ||||||| |||||    
T  1020 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatg 921  T
Q  222 gtcaaatta 230  Q
     ||||||||    
T  920 atcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University