View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2966-Insertion-3 (Length: 903)

Name: NF2966-Insertion-3
Description: NF2966
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2966-Insertion-3
NF2966-Insertion-3
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (107-896)||(40379678-40380465)
chr5 (104-896)||(40381886-40382676)
chr5 (106-896)||(25077705-25078495)
chr5 (106-896)||(25135674-25136464)
chr5 (107-903)||(10592844-10593639)
chr5 (104-887)||(16546213-16546998)
chr5 (106-887)||(16543993-16544776)
chr5 (107-888)||(22536100-22536852)
chr5 (236-884)||(29750969-29751615)
chr5 (115-883)||(29719974-29720721)
chr5 (330-883)||(29722332-29722881)
chr5 (115-858)||(9789061-9789800)
chr5 (115-856)||(18441483-18442224)
chr5 (119-790)||(26177479-26178150)
chr5 (119-743)||(26170370-26170983)
chr5 (119-810)||(16409090-16409764)
chr5 (404-709)||(25412638-25412947)
chr5 (107-365)||(27450152-27450409)
chr5 (104-365)||(27445309-27445569)
chr5 (404-790)||(30182465-30182852)
chr5 (107-365)||(43599060-43599318)
chr5 (107-365)||(43604552-43604810)
chr5 (107-365)||(43610044-43610302)
chr5 (404-693)||(13342937-13343232)
chr5 (120-383)||(24136207-24136470)
chr5 (404-709)||(36074024-36074336)
chr5 (450-798)||(13239674-13240025)
chr5 (539-709)||(37439161-37439328)
chr5 (520-686)||(213465-213630)
chr5 (520-790)||(32636824-32637088)
chr5 (255-388)||(35388016-35388150)
chr5 (520-686)||(40147261-40147425)
chr5 (520-701)||(28278316-28278494)
chr5 (104-291)||(28807073-28807260)
chr5 (404-684)||(13488079-13488365)
chr5 (215-365)||(43592615-43592764)
chr5 (106-322)||(1456637-1456852)
chr5 (107-291)||(30631764-30631948)
chr5 (520-693)||(42428427-42428598)
chr5 (107-291)||(15045096-15045279)
chr5 (115-285)||(29722161-29722332)
chr5 (437-682)||(30682930-30683178)
chr5 (404-684)||(28750661-28750947)
chr5 (520-686)||(5058047-5058209)
chr5 (437-709)||(33831590-33831866)
chr5 (520-706)||(533769-533952)
chr5 (523-712)||(8565926-8566111)
chr5 (450-709)||(16452003-16452266)
chr5 (404-693)||(39468546-39468841)
chr5 (119-325)||(16407654-16407862)
chr5 (104-290)||(37560944-37561130)
chr5 (114-291)||(2785778-2785955)
chr5 (114-291)||(33768587-33768764)
chr5 (114-291)||(33791719-33791896)
chr5 (207-388)||(38219752-38219929)
chr5 (520-666)||(13695713-13695859)
chr5 (107-285)||(29402550-29402728)
chr5 (119-290)||(37556137-37556308)
chr5 (520-669)||(42426255-42426403)
chr5 (520-686)||(27637616-27637781)
chr5 (523-682)||(538028-538185)
chr5 (115-231)||(29752265-29752381)
chr5 (412-709)||(31182857-31183157)
chr5 (524-684)||(38747009-38747167)
chr5 (520-686)||(27015531-27015687)
chr5 (215-365)||(31180591-31180741)
chr5 (534-668)||(16640961-16641091)
chr5 (119-388)||(9352820-9353089)
chr5 (523-678)||(9049354-9049506)
chr5 (526-680)||(316769-316922)
chr5 (114-291)||(31396497-31396674)
chr5 (523-709)||(3075640-3075823)
chr5 (621-693)||(19806463-19806534)
chr5 (114-291)||(31401354-31401531)
chr5 (119-230)||(15465001-15465112)
chr5 (115-213)||(29751617-29751715)
chr5 (574-684)||(33906035-33906144)
chr5 (311-388)||(15464876-15464952)
chr5 (574-651)||(42309973-42310048)
chr5 (624-684)||(4160702-4160762)
chr5 (104-164)||(43592797-43592857)
chr5 (106-164)||(31180773-31180831)
chr5 (574-623)||(42926922-42926970)
chr5 (104-141)||(43625614-43625651)
[»] chr1 (94 HSPs)
chr1 (107-896)||(44203218-44204006)
chr1 (106-858)||(9036002-9036751)
chr1 (115-858)||(40281967-40282711)
chr1 (115-858)||(20622072-20622812)
chr1 (107-884)||(21053540-21054314)
chr1 (115-884)||(9986794-9987558)
chr1 (123-810)||(51765007-51765684)
chr1 (519-693)||(13316348-13316521)
chr1 (523-807)||(8550670-8550952)
chr1 (404-709)||(20762548-20762859)
chr1 (104-291)||(44023374-44023561)
chr1 (8-107)||(15037900-15037999)
chr1 (404-709)||(3189207-3189517)
chr1 (404-709)||(3198024-3198334)
chr1 (404-709)||(3206863-3207173)
chr1 (106-291)||(1054513-1054698)
chr1 (107-291)||(39445898-39446082)
chr1 (404-708)||(3156742-3157050)
chr1 (8-107)||(15011881-15011980)
chr1 (119-388)||(19365781-19366051)
chr1 (114-291)||(25439406-25439583)
chr1 (520-707)||(28220210-28220394)
chr1 (520-686)||(37168297-37168462)
chr1 (520-686)||(13547093-13547257)
chr1 (8-107)||(15017996-15018095)
chr1 (236-388)||(24202360-24202513)
chr1 (520-709)||(28265536-28265722)
chr1 (520-701)||(42297963-42298143)
chr1 (168-365)||(24793708-24793904)
chr1 (367-684)||(44454997-44455322)
chr1 (523-709)||(834149-834332)
chr1 (520-686)||(13549004-13549168)
chr1 (8-108)||(15033332-15033432)
chr1 (15-107)||(15041468-15041560)
chr1 (520-686)||(29136247-29136412)
chr1 (520-686)||(47255343-47255508)
chr1 (8-107)||(14521756-14521855)
chr1 (8-107)||(15002988-15003087)
chr1 (104-291)||(25444589-25444776)
chr1 (104-291)||(41391002-41391188)
chr1 (520-708)||(49918350-49918535)
chr1 (520-686)||(11348698-11348862)
chr1 (185-365)||(24786904-24787082)
chr1 (520-709)||(4552619-4552805)
chr1 (8-107)||(14531877-14531976)
chr1 (520-707)||(28223405-28223589)
chr1 (520-686)||(31925711-31925875)
chr1 (404-693)||(31659114-31659409)
chr1 (119-325)||(19360925-19361133)
chr1 (520-686)||(7482234-7482399)
chr1 (520-693)||(37033068-37033241)
chr1 (520-693)||(45644351-45644523)
chr1 (520-709)||(50167157-50167343)
chr1 (520-709)||(50169192-50169378)
chr1 (520-686)||(47115171-47115337)
chr1 (523-709)||(3847103-3847286)
chr1 (523-709)||(13659318-13659501)
chr1 (520-684)||(19754494-19754657)
chr1 (520-708)||(37503540-37503722)
chr1 (520-708)||(37559850-37560037)
chr1 (520-686)||(193611-193775)
chr1 (520-666)||(1833522-1833667)
chr1 (520-685)||(34603576-34603740)
chr1 (520-669)||(23555286-23555433)
chr1 (523-709)||(46064921-46065104)
chr1 (520-709)||(41360914-41361101)
chr1 (168-291)||(41398657-41398779)
chr1 (437-682)||(196915-197166)
chr1 (520-708)||(30476429-30476614)
chr1 (520-693)||(19752685-19752857)
chr1 (525-665)||(22079322-22079461)
chr1 (606-686)||(28242391-28242469)
chr1 (525-621)||(12318589-12318685)
chr1 (541-684)||(927982-928123)
chr1 (538-669)||(15820326-15820455)
chr1 (574-650)||(16455676-16455750)
chr1 (119-230)||(24202264-24202375)
chr1 (574-693)||(13137973-13138089)
chr1 (523-709)||(40122178-40122363)
chr1 (114-291)||(43987956-43988133)
chr1 (534-601)||(3460710-3460778)
chr1 (574-649)||(6808507-6808581)
chr1 (43-106)||(14468685-14468748)
chr1 (606-709)||(36683766-36683866)
chr1 (534-652)||(37282728-37282846)
chr1 (115-345)||(13604104-13604334)
chr1 (525-639)||(13938143-13938256)
chr1 (588-686)||(37876770-37876865)
chr1 (45-106)||(14483633-14483694)
chr1 (331-388)||(19358530-19358587)
chr1 (520-592)||(37879006-37879079)
chr1 (539-591)||(6378603-6378655)
chr1 (45-106)||(14504864-14504925)
chr1 (542-607)||(48382441-48382505)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (106-897)||(5858-6650)
[»] chr3 (104 HSPs)
chr3 (107-903)||(25637013-25637811)
chr3 (106-896)||(3617033-3617824)
chr3 (104-896)||(4598317-4599110)
chr3 (107-896)||(4600538-4601328)
chr3 (104-903)||(10210975-10211777)
chr3 (115-887)||(10055813-10056584)
chr3 (104-887)||(10058024-10058806)
chr3 (104-887)||(10060246-10061028)
chr3 (104-887)||(10062468-10063250)
chr3 (104-887)||(10064690-10065472)
chr3 (107-862)||(54634710-54635462)
chr3 (107-857)||(6716085-6716834)
chr3 (168-885)||(45282627-45283345)
chr3 (107-903)||(10208778-10209557)
chr3 (104-623)||(10066912-10067431)
chr3 (115-811)||(800694-801376)
chr3 (168-554)||(6718330-6718718)
chr3 (119-810)||(23200020-23200716)
chr3 (119-808)||(23197823-23198517)
chr3 (483-856)||(7779842-7780208)
chr3 (650-887)||(10067435-10067671)
chr3 (107-381)||(8477729-8478002)
chr3 (368-709)||(9636106-9636457)
chr3 (119-709)||(37408049-37408645)
chr3 (368-709)||(45095004-45095350)
chr3 (404-709)||(5258125-5258436)
chr3 (404-709)||(5260304-5260615)
chr3 (107-389)||(40372256-40372538)
chr3 (523-807)||(19683774-19684054)
chr3 (404-693)||(7762142-7762437)
chr3 (107-389)||(7167600-7167882)
chr3 (404-807)||(7764344-7764747)
chr3 (123-390)||(27352097-27352364)
chr3 (437-693)||(9581193-9581454)
chr3 (520-709)||(29196368-29196555)
chr3 (520-708)||(34491212-34491397)
chr3 (520-701)||(49199457-49199638)
chr3 (104-345)||(22172659-22172899)
chr3 (404-708)||(40735259-40735568)
chr3 (104-365)||(28503316-28503577)
chr3 (520-684)||(4569952-4570115)
chr3 (157-325)||(2671115-2671283)
chr3 (412-693)||(39153358-39153645)
chr3 (185-365)||(8738602-8738780)
chr3 (185-365)||(9090840-9091018)
chr3 (520-701)||(43401789-43401970)
chr3 (255-462)||(7782375-7782584)
chr3 (437-709)||(760757-761033)
chr3 (367-708)||(5236440-5236787)
chr3 (523-682)||(22835010-22835167)
chr3 (107-365)||(28501152-28501410)
chr3 (524-701)||(30236129-30236304)
chr3 (520-693)||(40734498-40734669)
chr3 (520-693)||(44331545-44331716)
chr3 (522-709)||(31314447-31314631)
chr3 (520-686)||(6095603-6095767)
chr3 (520-686)||(41819526-41819691)
chr3 (437-693)||(29682269-29682530)
chr3 (119-343)||(1306366-1306591)
chr3 (119-291)||(2672431-2672603)
chr3 (520-697)||(43403736-43403913)
chr3 (520-686)||(54593704-54593868)
chr3 (520-693)||(29813063-29813234)
chr3 (412-709)||(32744418-32744710)
chr3 (524-708)||(51398818-51398999)
chr3 (107-291)||(18656844-18657029)
chr3 (520-678)||(46860474-46860631)
chr3 (574-709)||(16499084-16499215)
chr3 (520-669)||(29810868-29811016)
chr3 (578-701)||(40913352-40913472)
chr3 (520-693)||(44700476-44700646)
chr3 (539-701)||(46173377-46173536)
chr3 (119-291)||(2676587-2676759)
chr3 (168-388)||(32143664-32143885)
chr3 (520-682)||(53921511-53921671)
chr3 (520-709)||(23391891-23392077)
chr3 (522-682)||(32891105-32891264)
chr3 (119-384)||(27453303-27453568)
chr3 (119-388)||(33386150-33386419)
chr3 (523-709)||(9666448-9666632)
chr3 (523-701)||(47304254-47304430)
chr3 (104-291)||(8512643-8512830)
chr3 (119-325)||(26928093-26928301)
chr3 (520-607)||(5433956-5434046)
chr3 (212-291)||(8517523-8517602)
chr3 (525-709)||(4055745-4055926)
chr3 (580-686)||(55301975-55302079)
chr3 (114-291)||(24968520-24968697)
chr3 (104-164)||(6718285-6718345)
chr3 (520-656)||(36018852-36018987)
chr3 (212-291)||(32475887-32475966)
chr3 (212-291)||(32480745-32480824)
chr3 (107-164)||(45282585-45282642)
chr3 (119-230)||(7782588-7782699)
chr3 (574-709)||(23410311-23410442)
chr3 (622-681)||(27305719-27305777)
chr3 (119-345)||(37726060-37726286)
chr3 (540-608)||(4386875-4386942)
chr3 (525-648)||(35138746-35138868)
chr3 (525-639)||(1313854-1313968)
chr3 (520-650)||(51352150-51352278)
chr3 (534-607)||(5373247-5373321)
chr3 (532-601)||(28253353-28253423)
chr3 (520-623)||(31340266-31340369)
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (107-896)||(18391990-18392780)
chr7 (104-896)||(6592134-6592924)
chr7 (107-896)||(6594352-6595137)
chr7 (206-896)||(18388554-18389245)
chr7 (107-896)||(32060116-32060888)
chr7 (107-859)||(20343500-20344232)
chr7 (115-756)||(24789435-24790074)
chr7 (107-590)||(1562103-1562587)
chr7 (598-896)||(1560459-1560757)
chr7 (119-858)||(43503991-43504708)
chr7 (119-810)||(39730946-39731656)
chr7 (163-709)||(25766940-25767489)
chr7 (437-709)||(35853825-35854102)
chr7 (107-407)||(2058304-2058604)
chr7 (331-709)||(48408605-48408992)
chr7 (404-709)||(29990931-29991240)
chr7 (107-388)||(21646360-21646643)
chr7 (104-326)||(21640204-21640426)
chr7 (450-807)||(25615785-25616137)
chr7 (520-807)||(23555039-23555323)
chr7 (520-693)||(34310712-34310884)
chr7 (157-407)||(1532954-1533204)
chr7 (107-326)||(20357028-20357247)
chr7 (520-708)||(22269973-22270158)
chr7 (520-707)||(14069817-14070001)
chr7 (520-707)||(14379845-14380029)
chr7 (520-709)||(41317416-41317602)
chr7 (437-806)||(4178685-4179054)
chr7 (437-709)||(19502088-19502365)
chr7 (119-388)||(18409116-18409386)
chr7 (119-291)||(21811751-21811923)
chr7 (520-790)||(27347817-27348081)
chr7 (367-669)||(48491416-48491727)
chr7 (119-388)||(18413992-18414262)
chr7 (107-345)||(12406619-12406857)
chr7 (523-709)||(41648993-41649175)
chr7 (520-682)||(30024740-30024900)
chr7 (520-708)||(18126644-18126829)
chr7 (520-686)||(8359319-8359485)
chr7 (538-701)||(2390301-2390461)
chr7 (107-345)||(4873483-4873721)
chr7 (520-686)||(29608737-29608901)
chr7 (574-686)||(32358058-32358167)
chr7 (368-708)||(47676119-47676465)
chr7 (520-685)||(6431971-6432134)
chr7 (520-708)||(48489431-48489616)
chr7 (450-681)||(47673953-47674189)
chr7 (520-693)||(8153342-8153513)
chr7 (520-693)||(31732966-31733137)
chr7 (520-709)||(36146390-36146576)
chr7 (412-709)||(38671204-38671506)
chr7 (520-684)||(2360978-2361140)
chr7 (520-709)||(4253510-4253697)
chr7 (520-684)||(4586161-4586323)
chr7 (520-708)||(26417316-26417501)
chr7 (520-686)||(3258995-3259159)
chr7 (520-686)||(4508710-4508874)
chr7 (520-686)||(48599338-48599502)
chr7 (104-345)||(31109067-31109309)
chr7 (520-684)||(43864244-43864406)
chr7 (368-709)||(1113495-1113843)
chr7 (106-291)||(24023818-24024003)
chr7 (119-325)||(48408411-48408619)
chr7 (523-709)||(495965-496148)
chr7 (752-858)||(24790230-24790333)
chr7 (574-701)||(6359941-6360065)
chr7 (523-684)||(31105399-31105558)
chr7 (539-682)||(23565069-23565210)
chr7 (104-291)||(24265674-24265861)
chr7 (520-679)||(23343975-23344130)
chr7 (545-680)||(2759207-2759339)
chr7 (574-686)||(4510552-4510661)
chr7 (574-686)||(4512394-4512503)
chr7 (525-684)||(22328395-22328556)
chr7 (520-709)||(12097849-12098027)
chr7 (232-345)||(12397267-12397380)
chr7 (104-182)||(12397417-12397495)
chr7 (212-291)||(24260926-24261005)
chr7 (606-709)||(24525484-24525584)
chr7 (520-591)||(24525992-24526065)
chr7 (582-682)||(31518965-31519063)
chr7 (520-684)||(36574522-36574683)
chr7 (119-271)||(47264102-47264254)
chr7 (621-684)||(30814536-30814598)
chr7 (524-597)||(1360243-1360316)
chr7 (368-522)||(24514934-24515089)
chr7 (119-180)||(1532897-1532958)
chr7 (168-209)||(18390479-18390520)
chr7 (212-291)||(16880476-16880555)
chr7 (212-291)||(16885331-16885410)
chr7 (104-163)||(18390506-18390565)
chr7 (621-684)||(18396418-18396481)
chr7 (520-621)||(31518795-31518896)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (107-896)||(2398-3185)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (107-896)||(12647180-12647967)
chr2 (115-858)||(6266283-6267023)
chr2 (500-903)||(13655816-13656220)
chr2 (119-810)||(4484211-4484910)
chr2 (119-810)||(32289161-32289853)
chr2 (119-810)||(30832934-30833633)
chr2 (107-382)||(9295862-9296137)
chr2 (404-809)||(4503017-4503424)
chr2 (404-709)||(45099631-45099941)
chr2 (404-709)||(5723237-5723546)
chr2 (404-807)||(36987961-36988367)
chr2 (404-709)||(36205646-36205955)
chr2 (404-709)||(2334399-2334709)
chr2 (107-388)||(14291844-14292125)
chr2 (119-388)||(25409983-25410253)
chr2 (107-407)||(11098387-11098687)
chr2 (119-388)||(3492094-3492364)
chr2 (520-709)||(6594987-6595175)
chr2 (523-709)||(34139752-34139936)
chr2 (520-790)||(29867869-29868133)
chr2 (538-709)||(723726-723893)
chr2 (523-709)||(14633807-14633991)
chr2 (520-686)||(45726929-45727093)
chr2 (520-693)||(38312240-38312411)
chr2 (412-669)||(42362236-42362500)
chr2 (520-686)||(35446888-35447052)
chr2 (520-709)||(11151573-11151759)
chr2 (520-709)||(36773562-36773748)
chr2 (520-686)||(1631736-1631900)
chr2 (525-684)||(33648176-33648335)
chr2 (107-230)||(32247229-32247352)
chr2 (520-709)||(36317991-36318177)
chr2 (520-708)||(17057352-17057537)
chr2 (520-708)||(17085335-17085520)
chr2 (520-701)||(24398055-24398238)
chr2 (119-384)||(40739178-40739444)
chr2 (107-345)||(39811477-39811715)
chr2 (520-709)||(11067305-11067491)
chr2 (520-709)||(33162432-33162618)
chr2 (523-682)||(11690504-11690661)
chr2 (520-684)||(42288117-42288278)
chr2 (114-291)||(19344825-19345002)
chr2 (520-684)||(26353184-26353346)
chr2 (120-291)||(19349683-19349854)
chr2 (574-684)||(17490154-17490261)
chr2 (520-639)||(7815323-7815441)
chr2 (520-655)||(13121769-13121901)
chr2 (106-182)||(44310470-44310546)
chr2 (520-684)||(11049550-11049716)
chr2 (621-693)||(39284936-39285007)
chr2 (574-686)||(7451173-7451281)
chr2 (578-678)||(28671989-28672088)
chr2 (621-693)||(17450678-17450748)
chr2 (188-345)||(28258733-28258889)
chr2 (528-621)||(24885669-24885762)
chr2 (529-595)||(24197906-24197974)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (104-871)||(3545-4313)
[»] chr4 (82 HSPs)
chr4 (115-896)||(7122275-7123057)
chr4 (104-903)||(8395188-8395985)
chr4 (107-903)||(8392982-8393776)
chr4 (104-903)||(5137872-5138673)
chr4 (107-903)||(5135649-5136448)
chr4 (403-896)||(7124784-7125276)
chr4 (115-858)||(31495143-31495893)
chr4 (119-709)||(13992274-13992866)
chr4 (404-686)||(29999809-30000097)
chr4 (104-299)||(7124486-7124681)
chr4 (107-407)||(24742277-24742577)
chr4 (404-709)||(56178618-56178928)
chr4 (104-291)||(18856125-18856312)
chr4 (107-365)||(51520793-51521050)
chr4 (404-709)||(48142918-48143230)
chr4 (520-709)||(52095344-52095530)
chr4 (105-345)||(56141509-56141750)
chr4 (539-807)||(5369968-5370232)
chr4 (404-708)||(9927441-9927749)
chr4 (524-701)||(2209717-2209894)
chr4 (114-291)||(45347324-45347501)
chr4 (520-708)||(12739533-12739718)
chr4 (168-325)||(29761040-29761197)
chr4 (520-686)||(41964415-41964580)
chr4 (520-701)||(26364236-26364415)
chr4 (520-701)||(54883020-54883199)
chr4 (539-708)||(12743908-12744073)
chr4 (539-708)||(12745297-12745462)
chr4 (520-708)||(26175619-26175804)
chr4 (404-708)||(34570397-34570706)
chr4 (104-345)||(9228683-9228924)
chr4 (520-693)||(36463386-36463557)
chr4 (107-324)||(9223899-9224115)
chr4 (119-345)||(28467990-28468217)
chr4 (520-684)||(36994524-36994686)
chr4 (404-681)||(37740502-37740784)
chr4 (522-709)||(46147373-46147557)
chr4 (520-686)||(46703500-46703666)
chr4 (520-686)||(41639426-41639590)
chr4 (520-669)||(8665408-8665556)
chr4 (520-709)||(45687164-45687351)
chr4 (520-684)||(4587958-4588121)
chr4 (107-225)||(18860403-18860521)
chr4 (520-709)||(48893620-48893810)
chr4 (523-682)||(379383-379541)
chr4 (522-701)||(12119540-12119719)
chr4 (520-686)||(8648139-8648303)
chr4 (520-686)||(12073392-12073557)
chr4 (520-693)||(5429679-5429850)
chr4 (520-681)||(27416974-27417133)
chr4 (574-701)||(50262689-50262814)
chr4 (520-669)||(54199926-54200074)
chr4 (520-684)||(40632445-40632607)
chr4 (107-291)||(5733062-5733247)
chr4 (538-686)||(6655975-6656120)
chr4 (520-706)||(5871820-5872003)
chr4 (574-686)||(50673851-50673960)
chr4 (523-709)||(52467336-52467519)
chr4 (520-680)||(37229731-37229890)
chr4 (520-709)||(47038393-47038577)
chr4 (520-709)||(6542161-6542349)
chr4 (520-651)||(12747794-12747924)
chr4 (539-658)||(12744078-12744195)
chr4 (520-658)||(12745467-12745604)
chr4 (527-684)||(5207848-5208003)
chr4 (107-291)||(3814422-3814605)
chr4 (170-291)||(45356861-45356982)
chr4 (520-709)||(52082645-52082825)
chr4 (520-709)||(31474150-31474337)
chr4 (236-388)||(31985236-31985389)
chr4 (574-681)||(35662496-35662600)
chr4 (535-684)||(26699447-26699596)
chr4 (148-287)||(18712296-18712435)
chr4 (520-684)||(51337064-51337226)
chr4 (578-708)||(29254553-29254679)
chr4 (520-639)||(24969112-24969230)
chr4 (581-669)||(13009464-13009550)
chr4 (574-651)||(3913503-3913578)
chr4 (520-609)||(41639263-41639353)
chr4 (524-621)||(48142444-48142542)
chr4 (534-607)||(1983252-1983324)
chr4 (574-663)||(33089933-33090021)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (105-903)||(6026832-6027627)
chr6 (215-896)||(25421000-25421680)
chr6 (107-903)||(33341889-33342688)
chr6 (104-896)||(34166663-34167454)
chr6 (104-862)||(16554451-16555207)
chr6 (104-862)||(16631007-16631763)
chr6 (107-862)||(16578348-16579101)
chr6 (107-862)||(16616279-16617032)
chr6 (115-887)||(34164452-34165223)
chr6 (168-862)||(16652758-16653450)
chr6 (115-859)||(27647476-27648188)
chr6 (115-790)||(411694-412369)
chr6 (115-858)||(3072596-3073334)
chr6 (500-887)||(13153893-13154280)
chr6 (107-412)||(6136241-6136547)
chr6 (120-709)||(2171512-2172090)
chr6 (331-859)||(6097285-6097800)
chr6 (107-344)||(25420797-25421034)
chr6 (404-709)||(31404656-31404966)
chr6 (404-709)||(5406181-5406490)
chr6 (404-709)||(5410506-5410815)
chr6 (119-407)||(5674242-5674530)
chr6 (115-327)||(13150857-13151070)
chr6 (441-709)||(16452310-16452583)
chr6 (437-709)||(30834517-30834794)
chr6 (406-709)||(5413376-5413682)
chr6 (777-903)||(6136090-6136216)
chr6 (119-388)||(22709362-22709632)
chr6 (400-790)||(33160254-33160652)
chr6 (107-291)||(6438899-6439083)
chr6 (520-686)||(21588931-21589095)
chr6 (520-686)||(21593664-21593828)
chr6 (104-345)||(11857330-11857570)
chr6 (520-698)||(3808699-3808877)
chr6 (520-707)||(9183015-9183199)
chr6 (107-274)||(30125018-30125185)
chr6 (168-326)||(5266453-5266611)
chr6 (523-686)||(17758026-17758188)
chr6 (520-686)||(2972943-2973107)
chr6 (106-345)||(22010188-22010427)
chr6 (114-345)||(16839092-16839323)
chr6 (520-686)||(17762990-17763155)
chr6 (437-709)||(16568953-16569208)
chr6 (168-345)||(28155132-28155309)
chr6 (589-709)||(5409051-5409167)
chr6 (104-287)||(14741923-14742106)
chr6 (520-678)||(28137420-28137576)
chr6 (522-686)||(26830127-26830289)
chr6 (802-887)||(13159051-13159136)
chr6 (114-291)||(33329940-33330117)
chr6 (520-686)||(22424829-22424995)
chr6 (523-686)||(5043630-5043792)
chr6 (114-291)||(33335437-33335614)
chr6 (520-666)||(3038926-3039071)
chr6 (574-697)||(603081-603201)
chr6 (523-693)||(26954283-26954450)
chr6 (520-693)||(33211182-33211353)
chr6 (114-291)||(6005822-6005999)
chr6 (574-682)||(26800642-26800748)
chr6 (520-639)||(4045423-4045542)
chr6 (115-230)||(6097862-6097977)
chr6 (212-291)||(5343880-5343959)
chr6 (215-287)||(14737174-14737246)
chr6 (104-164)||(16652713-16652773)
chr6 (255-310)||(6097803-6097858)
chr6 (115-210)||(34151836-34151931)
chr6 (119-182)||(23896881-23896944)
chr6 (115-182)||(26253598-26253665)
chr6 (107-164)||(14737085-14737142)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (106-887)||(42575128-42575910)
chr8 (168-885)||(25689603-25690313)
chr8 (104-885)||(3439085-3439861)
chr8 (107-903)||(15290143-15290906)
chr8 (107-903)||(15470512-15471275)
chr8 (119-810)||(2627331-2628024)
chr8 (404-709)||(34254312-34254620)
chr8 (404-709)||(17982529-17982840)
chr8 (404-809)||(31218133-31218541)
chr8 (412-709)||(34256488-34256788)
chr8 (404-790)||(42498070-42498459)
chr8 (107-345)||(4759534-4759771)
chr8 (107-381)||(36979741-36980014)
chr8 (437-709)||(44303764-44304042)
chr8 (107-365)||(30656025-30656282)
chr8 (104-326)||(33037284-33037506)
chr8 (107-365)||(18852627-18852884)
chr8 (120-407)||(1261428-1261717)
chr8 (107-291)||(39784325-39784509)
chr8 (437-709)||(19945340-19945618)
chr8 (534-709)||(1746200-1746371)
chr8 (104-346)||(18870018-18870259)
chr8 (520-708)||(15212786-15212971)
chr8 (119-388)||(26288234-26288504)
chr8 (119-388)||(26301491-26301761)
chr8 (119-388)||(26313485-26313755)
chr8 (404-708)||(43036299-43036608)
chr8 (114-326)||(6311717-6311928)
chr8 (107-291)||(10683739-10683923)
chr8 (520-686)||(42434995-42435159)
chr8 (520-693)||(33352150-33352321)
chr8 (520-686)||(4283524-4283688)
chr8 (520-693)||(27811278-27811449)
chr8 (534-785)||(12702542-12702787)
chr8 (522-693)||(40321082-40321251)
chr8 (520-686)||(18655400-18655564)
chr8 (520-684)||(40221745-40221907)
chr8 (520-709)||(3303652-3303838)
chr8 (520-708)||(4731658-4731843)
chr8 (107-345)||(7289427-7289666)
chr8 (520-683)||(18141821-18141981)
chr8 (522-701)||(10930188-10930365)
chr8 (526-669)||(30143346-30143488)
chr8 (523-693)||(6598975-6599143)
chr8 (523-693)||(6674428-6674596)
chr8 (574-693)||(5689326-5689442)
chr8 (520-684)||(8965697-8965859)
chr8 (520-639)||(9765745-9765863)
chr8 (114-291)||(35745794-35745971)
chr8 (520-681)||(30291606-30291767)
chr8 (523-663)||(40328782-40328922)
chr8 (107-287)||(25327664-25327844)
chr8 (523-709)||(1345353-1345536)
chr8 (520-709)||(19491680-19491867)
chr8 (168-391)||(10688660-10688884)
chr8 (523-651)||(44353796-44353923)
chr8 (520-683)||(1292471-1292631)
chr8 (596-709)||(4743196-4743306)
chr8 (574-683)||(41366622-41366727)
chr8 (524-686)||(11383989-11384149)
chr8 (574-684)||(18106087-18106191)
chr8 (574-709)||(10015136-10015265)
chr8 (119-271)||(7412787-7412939)
chr8 (119-230)||(31042921-31043032)
chr8 (538-684)||(4162516-4162658)
chr8 (606-684)||(4733792-4733868)
chr8 (310-388)||(31043112-31043189)
chr8 (525-680)||(29796329-29796485)
chr8 (525-602)||(1822297-1822375)
chr8 (525-602)||(1856742-1856820)
chr8 (525-682)||(7597619-7597776)
chr8 (236-343)||(31043017-31043125)
chr8 (579-684)||(3073880-3073981)
chr8 (574-678)||(8153813-8153914)
chr8 (104-164)||(10688615-10688675)
chr8 (54-106)||(17028722-17028774)
chr8 (54-106)||(17559158-17559210)
chr8 (107-141)||(25689561-25689595)
chr8 (574-651)||(11712038-11712114)
chr8 (747-784)||(32902096-32902133)
chr8 (533-601)||(41266982-41267051)
chr8 (524-607)||(41364927-41365011)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (119-810)||(11042-11740)
scaffold0491 (119-810)||(8616-9295)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (659-871)||(3-214)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (148-693)||(524-1087)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (404-790)||(434409-434798)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (520-709)||(11557-11745)
scaffold0286 (120-470)||(21953-22286)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (107-291)||(761-945)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (520-693)||(114602-114774)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (119-325)||(17444-17652)
scaffold0188 (350-388)||(17657-17695)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (520-686)||(18007-18171)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (520-790)||(20319-20583)
[»] scaffold0400 (2 HSPs)
scaffold0400 (8-107)||(13669-13768)
scaffold0400 (45-106)||(7370-7431)
[»] scaffold0365 (2 HSPs)
scaffold0365 (8-107)||(14312-14411)
scaffold0365 (45-106)||(8014-8075)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (520-686)||(7327-7491)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (107-345)||(3337-3575)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (523-709)||(149079-149262)
scaffold0006 (115-345)||(132761-132991)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (104-345)||(1736-1977)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (576-684)||(10546-10651)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (114-345)||(148451-148682)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (114-324)||(18671-18880)
scaffold0197 (104-291)||(13781-13968)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (107-324)||(34554-34770)
[»] scaffold1455 (1 HSPs)
scaffold1455 (107-182)||(1709-1784)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (114-291)||(176457-176634)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (524-620)||(80351-80447)
[»] scaffold0665 (2 HSPs)
scaffold0665 (215-287)||(8112-8184)
scaffold0665 (107-164)||(8216-8273)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (525-678)||(27453-27606)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (119-230)||(7924-8035)
[»] scaffold0510 (1 HSPs)
scaffold0510 (119-182)||(1096-1159)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 615; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 896
Target Start/End: Original strand, 40379678 - 40380465
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40379678 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgc 40379777  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 306  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379778 agggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 40379877  T
Q  307 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttggaag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40379878 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttggaag 40379977  T
Q  406 agagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 505  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  40379978 agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagag 40380075  T
Q  506 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccct 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40380076 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaa-cctcttgtatccct 40380174  T
Q  606 tttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat- 703  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  40380175 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgttta 40380274  T
Q  704 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttg 803  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380275 ttgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttg 40380372  T
Q  804 cttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  40380373 cttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 40380465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 610; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 896
Target Start/End: Original strand, 40381886 - 40382676
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40381886 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 40381985  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 303  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40381986 tgcagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 40382085  T
Q  304 ggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttgg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40382086 ggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttgg 40382185  T
Q  403 aagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  40382186 aagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--aga 40382283  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40382284 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatc 40382382  T
Q  603 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40382383 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgt 40382482  T
Q  702 at-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 800  Q
     | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382483 ttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 40382580  T
Q  801 ttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  40382581 ttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgccgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 40382676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 896
Target Start/End: Original strand, 25077705 - 25078495
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25077705 atgttgagtttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacgcgattggaggtgccgtgagctagggttg 25077804  T
Q  206 caggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25077805 taggggtgcaaa-tcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 25077903  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttgga 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25077904 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggagaggttgga 25078003  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078004 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 25078103  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25078104 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcc 25078202  T
Q  604 cttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  25078203 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtt 25078302  T
Q  703 t-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078303 tattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 25078400  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  25078401 tgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 25078495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 896
Target Start/End: Original strand, 25135674 - 25136464
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25135674 atgttgagtttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacgcgattggaggtgccgtgagctagggttg 25135773  T
Q  206 caggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135774 taggggtgcaaa-tcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 25135872  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttgga 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25135873 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggagaggttgga 25135972  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135973 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 25136072  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25136073 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcc 25136171  T
Q  604 cttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  25136172 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtt 25136271  T
Q  703 t-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136272 tattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 25136369  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  25136370 tgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 25136464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 903
Target Start/End: Original strand, 10592844 - 10593639
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||| || |    
T  10592844 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattccgggtgccgtgagatagg-ttgc 10592942  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  | |    
T  10592943 agggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcgtttcttcggtggta 10593042  T
Q  307 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaaga 406  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  10593043 cgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtatgtaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaaga 10593142  T
Q  407 g--agagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 504  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593143 gagagagacttgggaaatcaaagggggaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 10593242  T
Q  505 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10593243 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatccc 10593341  T
Q  605 ttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10593342 ttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatt 10593441  T
Q  705 tgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgc 804  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10593442 tgttttctacttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgc 10593540  T
Q  805 ttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggagatccggg 903  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10593541 ttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgatcttggagatacggg 10593639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 887
Target Start/End: Original strand, 16546213 - 16546998
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546213 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 16546312  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 303  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546313 tgcagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 16546412  T
Q  304 ggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--aggaggttg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  16546413 ggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggcaagaggttg 16546512  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16546513 gaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 16546610  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16546611 agagaatcattgagtgtcttggtgagattaggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgta 16546709  T
Q  601 tcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16546710 tcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgt 16546809  T
Q  700 gtat-ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 796  Q
    || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16546810 gtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgttttgttg 16546907  T
Q  797 tttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16546908 tttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttatcactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 16546998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 887
Target Start/End: Original strand, 16543993 - 16544776
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16543993 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgctgtgagctagggtta 16544092  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544093 cagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 16544192  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag--aggaggttgga 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  16544193 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggcaagaggttgga 16544292  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16544293 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agag 16544390  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  16544391 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataa-cctcttgtatc 16544489  T
Q  603 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16544490 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 16544589  T
Q  702 at-ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16544590 ttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtt 16544687  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16544688 tcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 16544776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 22536852 - 22536100
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||     
T  22536852 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttg 22536754  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  22536753 cagggtgcaaaatcgtggcacaattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggt 22536654  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga-- 403  Q
    || || ||||||||||||||       ||             |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||      
T  22536653 acacagatcgtgacacgatt-------tc-------------aacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaag 22536575  T
Q  404 --agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaa 500  Q
      ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |    
T  22536574 agagagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctg--ca 22536477  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22536476 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgta 22536378  T
Q  601 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtg 700  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22536377 tcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtg 22536279  T
Q  701 tatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 800  Q
      ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||     
T  22536278 cttttgttttcttcttccctcccct--tttatcttgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggt-gttttttgttgattg 22536183  T
Q  801 ttgcttgcacaatactctttg-tttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccga 888  Q
    ||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22536182 ttgcttgc---atacactttgctttggtggttaccgctctccgtcgctccacacatc---attctttgtattggtgtggttcgatccga 22536100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 236 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 29751615 - 29750969
Alignment:
Q  236 aaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcg 335  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29751615 aaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacacgatttggaaaatcg 29751516  T
Q  336 tgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga--cttggggaatcaaaggg-ga 431  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |     
T  29751515 tgacacgattgctttagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaaggagag-ttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagc 29751417  T
Q  432 agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 531  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29751416 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattg 29751317  T
Q  532 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtgg 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29751316 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtgg 29751219  T
Q  631 attggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt-atttgttttcttcttccctctccttgtt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  29751218 attggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcct--tt 29751121  T
Q  730 tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtgg 829  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| | || | |||||||||||    
T  29751120 tatcttgtgattg-tgtactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacacattgtttggtgg 29751023  T
Q  830 ttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgat 884  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  29751022 ttaccactctcctttgctccacacatca-tatttcttgtattggtgtggttcgat 29750969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 883
Target Start/End: Original strand, 29719974 - 29720721
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  |  ||||||||    
T  29719974 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagtctg-cagggtgc 29720072  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 312  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||      
T  29720073 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacc 29720172  T
Q  313 tcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga 412  Q
                      |||||||||||||||  | ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  29720173 ------------------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcaaatttgaaggagag-ttggaagagagaga 29720253  T
Q  413 --cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 509  Q
      |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29720254 aacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatc 29720353  T
Q  510 attgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatccctttt 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29720354 attgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatccctttt 29720452  T
Q  609 gtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29720453 gtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 29720551  T
Q  709 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 808  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  29720552 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgt 29720648  T
Q  809 acaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcga 883  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||  ||||||||| |||| ||||    
T  29720649 ac-acacactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacaaca-tatttcttgtattggtgtggttcga 29720721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 330 - 883
Target Start/End: Original strand, 29722332 - 29722881
Alignment:
Q  330 aaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga--cttggggaatcaaag 427  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  29722332 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggagag-ttggaaaagagagaaacttgggaaatcaaag 29722430  T
Q  428 gg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtga 526  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29722431 ggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtga 29722530  T
Q  527 gattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29722531 gattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgat 29722628  T
Q  626 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcct 725  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29722629 agtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcttcttccctctcct 29722728  T
Q  726 tgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttg 825  Q
      ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | || |||||||||    
T  29722729 --tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtac-acacactttgtttg 29722824  T
Q  826 gtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcga 883  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| || ||||  ||||||||| |||| ||||    
T  29722825 gtggttaccactctactttgctccacacacca-tatttcttgtattggtgtggttcga 29722881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 115 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 9789800 - 9789061
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||||| || || ||||||||    
T  9789800 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 9789702  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  |    
T  9789701 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgcgacgaacgcacca 9789602  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagag 411  Q
     |||||||||||    ||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9789601 ttcgtgacacga-cctgaaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggaga-gttggaagagagag 9789504  T
Q  412 --acttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 507  Q
      ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||   || || ||    
T  9789503 aaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagag-tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaa 9789405  T
Q  508 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatccctt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9789404 tcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattaagg-ttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 9789306  T
Q  607 ttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtattt 705  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  9789305 ttgtaagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtcttt 9789207  T
Q  706 gttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgct 805  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  9789206 gttttcctcttccctctcc--gtttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgatttttgct 9789110  T
Q  806 tgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
    |||||   || ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  9789109 tgcac---acactttg-ttggtggttactactttcctttgctccacacatcat 9789061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 115 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 18442224 - 18441483
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggagg-tgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||||||    
T  18442224 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 18442126  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  18442125 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgggacgaacgcacca 18442026  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagag 411  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||||||||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  18442025 atcgtgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggagag-ttggaagagagag 18441928  T
Q  412 a--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 507  Q
    |  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||   || || ||    
T  18441927 aaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaa 18441829  T
Q  508 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatccctt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18441828 tcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 18441730  T
Q  607 ttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtattt 705  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  18441729 ttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtcttt 18441631  T
Q  706 gttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtg----tttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||    |||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  18441630 gttttcctcttccctctcc--gtttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattat 18441534  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatc 856  Q
    |||||||||   || ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  18441533 tgcttgcac---acactttg-ttggtggttactactttcctttgctccacacatc 18441483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 119 - 790
Target Start/End: Original strand, 26177479 - 26178150
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  26177479 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26177577  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26177578 tcgtgacacgatcatgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacggacgcaccaatcg 26177677  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga-- 412  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||      
T  26177678 tgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgcgcagattttgaagaga--gttggaagagagagaaa 26177774  T
Q  413 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 510  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || |||||    
T  26177775 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 26177873  T
Q  511 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttg 609  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26177874 ttgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 26177971  T
Q  610 taagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgtt 708  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  26177972 taagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 26178070  T
Q  709 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26178071 ttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 26178150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 119 - 743
Target Start/End: Original strand, 26170370 - 26170983
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  26170370 cttcaaatttatggtatggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26170468  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26170469 tcgtgacacgatcgtgggaaatcgtgacataatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacggacgcaccaatcg 26170568  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcaga-tttgaagaggaggttggaagagagag--a 412  Q
    ||||||||   || | ||||||||||||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||  |    
T  26170569 tgacacgacctgg-atatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagag--agttggaagagagagaaa 26170665  T
Q  413 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 510  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||   || || |||||    
T  26170666 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagag-tctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 26170764  T
Q  511 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttg 609  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||           | ||||||    
T  26170765 ttgagtgtcttggtgagatt-ggaaaagggtagaaatta-ggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-----------ctcttttg 26170851  T
Q  610 taagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgtt 708  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  26170852 taagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 26170950  T
Q  709 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt 743  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26170951 ttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt 26170983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Original strand, 16409090 - 16409764
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | || |||||||| || || || ||||| |||    
T  16409090 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgtcgtgagct-ggtttgcaaggtgccaaa 16409188  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 317  Q
    | ||| ||||||  || | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||       
T  16409189 ttgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacattgggacgtacgc---tcc-- 16409283  T
Q  318 acacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga--ct 414  Q
                 |||||||||||||||  |  || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||  ||    
T  16409284 -------------aatcgtgacacgattttattagtggagagctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaga--gttggaagagagagaaact 16409368  T
Q  415 tggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 512  Q
    |||| |||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   || || |||||||    
T  16409369 tgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcatt 16409467  T
Q  513 gagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgta 611  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16409468 gagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgta 16409566  T
Q  612 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgtttt 710  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16409567 agaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtttt 16409665  T
Q  711 cttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgc 808  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  16409666 cctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgc 16409762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 25412638 - 25412947
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  25412638 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaacattagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 25412735  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc 593  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25412736 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 25412834  T
Q  594 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25412835 ttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct 25412932  T
Q  694 cttggtgtatttgttt 709  Q
     ||||||| |||||||    
T  25412933 -ttggtgtgtttgttt 25412947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27450409 - 27450152
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||  ||     
T  27450409 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt-ttg 27450311  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  27450310 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcag 27450212  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  27450211 acgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagta 27450152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27445569 - 27445309
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||      
T  27445569 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctagaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt- 27445471  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||     
T  27445470 ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggt 27445372  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  27445371 cagacgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagta 27445309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 404 - 790
Target Start/End: Original strand, 30182465 - 30182852
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  30182465 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgag 30182562  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 592  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30182563 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 30182661  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30182662 cttttctatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatc 30182759  T
Q  693 tcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
    | ||||||| |||||||   ||||  |||||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30182760 t-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 30182852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43599318 - 43599060
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga--ggtgccgtgagctagggtt 204  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||  |||||||||||||  |  || ||||||||||||  ||    
T  43599318 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagt-tt 43599220  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |     
T  43599219 gcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtca 43599121  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43599120 gacgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagta 43599060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43604810 - 43604552
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga--ggtgccgtgagctagggtt 204  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||  |||||||||||||  |  || ||||||||||||  ||    
T  43604810 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagt-tt 43604712  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |     
T  43604711 gcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtca 43604613  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43604612 gacgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagta 43604552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43610302 - 43610044
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga--ggtgccgtgagctagggtt 204  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||  |||||||||||||  |  || ||||||||||||  ||    
T  43610302 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagt-tt 43610204  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |     
T  43610203 gcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtca 43610105  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43610104 gacgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagta 43610044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 404 - 693
Target Start/End: Original strand, 13342937 - 13343232
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  13342937 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 13343034  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13343035 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaat 13343133  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13343134 ccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaat 13343230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24136470 - 24136207
Alignment:
Q  120 ttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   ||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||  | | |||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  24136470 ttcaaatttgtggtctggaagaacacagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacaatttcgtgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaat 24136372  T
Q  219 cgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtga 318  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  24136371 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgcaaatcgtga 24136272  T
Q  319 cacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta-cttaagtgttcttgtgca 383  Q
    ||||||  || |||||||| |||||||| | |||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  24136271 cacgatctgg-aaatcgtggcacgattgtatcagaggaaagctagtatataaagtgttcttgtgca 24136207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 36074336 - 36074024
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  36074336 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 36074239  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa----gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgta 589  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36074238 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgta 36074140  T
Q  590 acccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 689  Q
    || |||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  36074139 actcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaaca 36074043  T
Q  690 atctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  36074042 atct-ttggtgtgtttgttt 36074024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 450 - 798
Target Start/End: Original strand, 13239674 - 13240025
Alignment:
Q  450 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-gg 540  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||| ||||  ||    
T  13239674 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg 13239772  T
Q  541 tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 639  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13239773 tagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagag 13239869  T
Q  640 tacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtga 739  Q
      |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||   ||||  |||||||  |||||||| ||     
T  13239870 atcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaat-ttttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttttgc 13239964  T
Q  740 ttgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtt 798  Q
    |||| | |||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13239965 ttgtggttttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgttattgttgtt 13240025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 539 - 709
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439328
Alignment:
Q  539 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 637  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 37439257  T
Q  638 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  37439258 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 37439328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213630
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 213562  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  213563 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 213630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 520 - 790
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32637088
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 32636921  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 717  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||   |||||    
T  32636922 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttc 32637018  T
Q  718 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
    |||| |    ||||||||||| ||||   |||| ||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  32637019 cctccc----tttatcttgtgcttgtgattttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 32637088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 255 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35388150 - 35388016
Alignment:
Q  255 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  | |||    
T  35388150 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgttcaaatcgtgacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcag 35388052  T
Q  353 aggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35388051 aggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 35388016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147425
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 40147358  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147359 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 40147425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 520 - 701
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278494
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 28278413  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28278414 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat-tcttggtgt 28278494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 28807073 - 28807260
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||   |||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| | | |    
T  28807073 aaatgttggaattggcttcaaatttatggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcaatcgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagtt 28807172  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28807173 tgcagggtgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtc 28807260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 404 - 684
Target Start/End: Original strand, 13488079 - 13488365
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-a 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    |    
T  13488079 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtga 13488176  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
    | || ||| |||||||||||||       || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13488177 gtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 13488275  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13488276 ccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43592764 - 43592615
Alignment:
Q  215 aaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 314  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  43592764 aaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatc 43592666  T
Q  315 gtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  43592665 gtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattgcttcggaggaaggctagta 43592615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 322
Target Start/End: Original strand, 1456637 - 1456852
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtt 204  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||| | ||    
T  1456637 atgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagcta-gttt 1456735  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |     
T  1456736 acaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgcttgttaagtatccctgataaggacttgtc-taccttgggtca 1456834  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacg 322  Q
    || |||||||||||||||    
T  1456835 gatgcaaatcgtgacacg 1456852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30631948 - 30631764
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||     
T  30631948 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagccagt-ttg 30631850  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30631849 caggacgccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtc 30631764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428427
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42428501  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  42428500 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15045279 - 15045096
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || ||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | || |    
T  15045279 tgttgatattggcttcaaatttgtagtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagcca-gtttgc 15045181  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    |||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  15045180 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtc 15045096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 285
Target Start/End: Original strand, 29722161 - 29722332
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||  |  || |||||    
T  29722161 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgctgtgagctagtctg-catggtgc 29722259  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataagga 285  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29722260 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataagga 29722332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 437 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 30683178 - 30682930
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 528  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  30683178 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaga 30683081  T
Q  529 ttgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaa--ctcatttga 624  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||| ||    
T  30683080 ttgggaaaaagggtagaaattagggttcttt----gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcatt-ga 30682987  T
Q  625 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30682986 tagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 404 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 28750947 - 28750661
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  28750947 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtga 28750850  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||  ||| ||||||| ||||||    
T  28750849 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaac 28750751  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28750750 ccatttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 5058047 - 5058209
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||| |||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5058047 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttct--gtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt-gtaagaact 5058142  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058143 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 5058209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 437 - 709
Target Start/End: Original strand, 33831590 - 33831866
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 527  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||||        |||||    
T  33831590 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgag 33831687  T
Q  528 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 625  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  33831688 attggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgat 33831784  T
Q  626 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  33831785 agtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct-ttggtgtttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 706
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533952
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 533866  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg 706  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  533867 catt-gatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtctttg 533952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 523 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 8566111 - 8565926
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8566111 gtgagattgagaaaatgggtagaacttagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctct-gtaagaactcat 8566014  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttct 712  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||  ||||||||| ||||||||||    
T  8566013 t-gatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa--tcttggtgtgtttgttttct 8565926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 709
Target Start/End: Original strand, 16452003 - 16452266
Alignment:
Q  450 tctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa-ggg 540  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |       |||||||| |||| |||    
T  16452003 tctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatggg 16452101  T
Q  541 tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 639  Q
    ||||||||| | ||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16452102 tagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttcatagtggattggagag 16452198  T
Q  640 tacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
       ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  16452199 ataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 16452266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 404 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 39468841 - 39468546
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  39468841 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttcattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtga 39468744  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39468743 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 39468645  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||| ||  |||||| ||||||||| | ||||    
T  39468644 ccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaa-attggactgaactgggtcaacaat 39468548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Original strand, 16407654 - 16407862
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16407654 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 16407752  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  || | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||  | |||||    
T  16407753 tcgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaccggtcgtaccttgggacgtacgctccaatcg 16407852  T
Q  316 tgacacgatt 325  Q
    ||||||||||    
T  16407853 tgacacgatt 16407862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 290
Target Start/End: Original strand, 37560944 - 37561130
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||   ||||||||||||||  ||| |||||||||| | | |    
T  37560944 aaatgttgaatttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagtaatcgtgacacgatttgataatcgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagtt 37561043  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggt 290  Q
    || | || |  |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37561044 ttgatggaggcaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggt 37561130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2785955 - 2785778
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||| || | |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | | || | ||  ||    
T  2785955 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagc 2785856  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2785855 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 2785778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33768764 - 33768587
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||| || | |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | | || | ||  ||    
T  33768764 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagc 33768665  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33768664 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33768587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33791896 - 33791719
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||| || | |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | | || | ||  ||    
T  33791896 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagc 33791797  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33791796 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33791719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38219929 - 38219752
Alignment:
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 306  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  38219929 agggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaattgtgacacgattttcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgta 38219830  T
Q  307 cg--caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    ||  | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||  | |||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  38219829 cgttccaatcgtgacacgatttgg-aaatcgtgacacaattttatcagaggaaggctagt-----agtgttcttgtgcagattt 38219752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695713
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactc 13695760  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaa 666  Q
    | || |||||||||| |||||   | ||||||||||| | ||||||||    
T  13695759 a-ttaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 285
Target Start/End: Original strand, 29402550 - 29402728
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggt-gccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||  | || ||| ||||||| | ||     
T  29402550 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtggcacgatttcaagtggccatgagcta-gtttg 29402648  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataagga 285  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29402649 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataagga 29402728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 290
Target Start/End: Original strand, 37556137 - 37556308
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || |||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||| | | ||| | || |  ||||    
T  37556137 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagtaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagttttgatggaggcaaat 37556236  T
Q  219 cgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggt 290  Q
    |||||||||||  |||||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37556237 cgtggcacgatcttgggaaattgtgacacgatctagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggt 37556308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 42426403 - 42426255
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42426403 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42426306  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||    
T  42426305 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaagtt 42426255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637616
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 27637684  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  27637683 tcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 27637616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 682
Target Start/End: Original strand, 538028 - 538185
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||     
T  538028 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca- 538124  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  538125 ttgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29752381 - 29752265
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  29752381 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgctgccgtgagcta-ggttgcagggtgc 29752283  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattg 231  Q
     |||||||||||||||||    
T  29752282 caaatcgtggcacgattg 29752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 709
Target Start/End: Original strand, 31182857 - 31183157
Alignment:
Q  412 acttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaat 508  Q
    ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| |   || || |||    
T  31182857 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaat 31182954  T
Q  509 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| | ||||  ||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  31182955 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccattt-gta 31183052  T
Q  601 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtg 700  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||||||    
T  31183053 tcccttt-gtaagaactcatt-gatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacattct-ttggtg 31183148  T
Q  701 tatttgttt 709  Q
    | |||||||    
T  31183149 tgtttgttt 31183157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 524 - 684
Target Start/End: Original strand, 38747009 - 38747167
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||| |    
T  38747009 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttggaaaaactca-t 38747105  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  38747106 tgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaag-ttggaccaaactgggt 38747167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 27015531 - 27015687
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||        |||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27015531 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaat--------acccatttgtatctcttt-gtaagaact 27015620  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27015621 catt-gatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtga 27015687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31180741 - 31180591
Alignment:
Q  215 aaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 314  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  31180741 aaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagagactttctcgttaagtatcactgataaggactggtc-aaccttgggtcagacgcaaatc 31180643  T
Q  315 gtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    |||||| ||| | || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  31180642 gtgacatgatcttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 31180591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 534 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 16641091 - 16640961
Alignment:
Q  534 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 632  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||    
T  16641091 aaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctcttt-gtaagaact----tgatagtggat 16640997  T
Q  633 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagt 668  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16640996 tggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Original strand, 9352820 - 9353089
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||  ||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||  |   ||||||||||| || || |||||||  |||    
T  9352820 cttcaaatttgtggtttgaaagaacagagaaatcgtgacgcgattgtggcatcgtgacacgattttgtaatgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 9352918  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||||| || ||  |  |||||    
T  9352919 tcgtggcacgattctgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacatatcaatcg 9353017  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    || ||||||| |||||| |||| |||||||  | |||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9353018 tggcacgatttggaaaa-cgtggcacgattttatcagctgaagactggtatttaagtgttcttgtgcagattt 9353089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 523 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 9049506 - 9049354
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||  || ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  9049506 gtgagtttgggaaaatgatagaaattagtgtttgtttttg-tgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctc-tttgtaagaactca-t 9049410  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 678  Q
    ||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  9049409 tgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtgaag-ttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 680
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316922
Alignment:
Q  526 agattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 624  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactca-ttga 316866  T
Q  625 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaact 680  Q
    || ||||| |||| |  |||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||    
T  316867 taatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaact 316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Original strand, 31396497 - 31396674
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||   |||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||  || |||||||| | || | ||  ||    
T  31396497 attggcttcaaatttgtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgatttggcaatcgtgacacgatcggagaggcagtgagctaagtttgctggaagc 31396596  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   || ||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  31396597 aaaatcgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagacacttgttggttaagtttctctgataaggactggtc 31396674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 3075823 - 3075640
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| | |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||      
T  3075823 gtgagattgagaaaataggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaagaattc-g 3075727  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  3075726 ttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccaaattgggtgaac-atttcttggtgtgtttgttt 3075640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 621 - 693
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806534
Alignment:
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Original strand, 31401354 - 31401531
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||   |||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||  || |||||||| | || | ||  ||    
T  31401354 attggcttcaaatttgtggtttgggagaatagaggaatcgtgtcacgatttggcaatcgtgacacgatcggagaggcagtgagctaagtttgctggaagc 31401453  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||   ||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||    
T  31401454 aaaatcgtgccacgatcttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctgcttaagtttctctgataaggactggtc 31401531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15465112 - 15465001
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15465112 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 15465014  T
Q  218 tcgtggcacgatt 230  Q
    ||||| |||||||    
T  15465013 tcgtgacacgatt 15465001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29751715 - 29751617
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || || ||||| |||  ||||||| || | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29751715 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgaatttggcatcacgacacgatttcgtggtgccgtgagcta-ggttgcagggtgc 29751617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 33906144 - 33906035
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||| | | ||| ||||||||  |||||    
T  33906144 aagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactca-ttgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttgga 33906046  T
Q  674 ccgaactgggt 684  Q
    |||| ||||||    
T  33906045 ccgagctgggt 33906035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15464952 - 15464876
Alignment:
Q  311 aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | |||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15464952 aatcgtgacacgatttggaaa-tcgtggcacgattttatcagtagaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 15464876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 42310048 - 42309973
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 651  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  42310048 aagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgtaagaactta-ttgatagtggattagcgagatcaatctctcc 42309973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 624 - 684
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  624 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43592857 - 43592797
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattt 164  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  43592857 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 43592797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31180831 - 31180773
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattt 164  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  31180831 atgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 31180773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 623
Target Start/End: Original strand, 42926922 - 42926970
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 623  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42926922 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactcatttg 42926970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43625651 - 43625614
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaaga 141  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43625651 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaaga 43625614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 605; Significance: 0; HSPs: 94)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 605; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 896
Target Start/End: Original strand, 44203218 - 44204006
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44203218 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgc 44203317  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203318 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 44203416  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gag-gttgga 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  44203417 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggtgagagttgga 44203516  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44203517 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agag 44203614  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  44203615 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcc 44203713  T
Q  604 cttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  44203714 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtt 44203813  T
Q  703 t-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203814 tattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 44203911  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  44203912 tgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgaccttggag 44204006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 858
Target Start/End: Original strand, 9036002 - 9036751
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtt 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||    
T  9036002 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-tt 9036100  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     ||||||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  9036101 gcagggtgcaaattcgtgtcactattttgttaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtgt 9036200  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaa 404  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9036201 tacgcagatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagaggagtttgaaa 9036299  T
Q  405 gag--agagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036300 gagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 9036399  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9036400 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatc 9036498  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9036499 ccttttgtaagaactc-tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgta 9036597  T
Q  703 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9036598 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgtt 9036696  T
Q  803 gcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9036697 gcttgcacaa-acactttgtttggtggttaccactctccttagctccacacatcat 9036751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 858
Target Start/End: Original strand, 40281967 - 40282711
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||    
T  40281967 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaatagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttagtggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgc 40282065  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca-- 310  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||      
T  40282066 caaatcgtgacacgattgtggtaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacc 40282165  T
Q  311 aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagaga 410  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  40282166 aatcgtgacacgatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagagaga 40282264  T
Q  411 ga--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 507  Q
    ||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  40282265 gaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaa 40282364  T
Q  508 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatccctt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40282365 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatccctt 40282463  T
Q  607 ttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg 706  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40282464 ttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttg 40282562  T
Q  707 ttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgctt 806  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40282563 ttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgctt 40282659  T
Q  807 gcacaatactctttg-tttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
    |||| | || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40282660 gcac-acacactttgttttggtggttaccactctcctttgctccacacatcat 40282711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 20622812 - 20622072
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  |  ||||||||    
T  20622812 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagtctg-cagggtgc 20622714  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 313  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||    
T  20622713 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtggtacgcaaat 20622614  T
Q  314 cgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga 412  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  20622613 cgtggcatgatttggaaaatcgtgacacaattgcttcagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaagggg-ggttggaagagagaga 20622515  T
Q  413 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 511  Q
    |||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  20622514 cttgggaaatcaaatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcat 20622415  T
Q  512 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatccc--tttt 608  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  20622414 tgactgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatccctttttt 20622317  T
Q  609 gtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20622316 gtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 20622218  T
Q  709 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 808  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20622217 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 20622121  T
Q  809 acaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
    || | || ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  20622120 ac-acacactttgtttggtggttactactttcctttgctccacacatcat 20622072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 884
Target Start/End: Original strand, 21053540 - 21054314
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||  |      
T  21053540 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgcagtgagctagaatg- 21053638  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21053639 caaggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgagacg 21053738  T
Q  305 gacgca--aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgg 402  Q
    || |||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  21053739 gatgcaccaatcgtgacacgatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagttgg 21053837  T
Q  403 aagagagaga--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaa 499  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21053838 aagagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtag 21053937  T
Q  500 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttg 598  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  21053938 agaaaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaa-ccttttg 21054036  T
Q  599 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttgg 698  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054037 tatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttgg 21054135  T
Q  699 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21054136 tgtatttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgat 21054232  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgat 884  Q
    | ||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  21054233 tattgcttgcac---acacttagtttggtggttaccactctcctttgctccacacatca-tatttcttgtattggtgtggttcgat 21054314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 884
Target Start/End: Original strand, 9986794 - 9987558
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||  | ||| ||||    
T  9986794 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttgacatcgtaacacgatttcgtggtgccgtgagct-ggtctgcagtgtgc 9986892  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |||  |    
T  9986893 caaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccataataaggactggtcataccttgggacggatgcacca 9986992  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagaga- 410  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||  | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||     
T  9986993 atcgtgacacgatctggaaa-tcgtgacacaattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggtgag-ttggaagagagat 9987090  T
Q  411 -gacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaat 508  Q
     |||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  9987091 agacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaat 9987190  T
Q  509 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9987191 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaa-ccttttgtatcccttt 9987288  T
Q  608 tgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt-atttg 706  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  9987289 tgcaagaactca-ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttg 9987387  T
Q  707 ttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgctt 806  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9987388 ttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtatagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgctt 9987484  T
Q  807 gcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgat 884  Q
    ||||   || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||    
T  9987485 gcac---acactttgattggtggttaccactctcctttgctccacacatca-tatttttcgtattggtgtggttcgat 9987558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 123 - 810
Target Start/End: Original strand, 51765007 - 51765684
Alignment:
Q  123 aaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  51765007 aaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaatcgt 51765105  T
Q  222 ggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacac 321  Q
    | ||||||  || | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |               
T  51765106 gacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgtgacgtacgtacc--------- 51765196  T
Q  322 gattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga--cttggg 418  Q
             |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||  ||||||    
T  51765197 ---------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-ggag-ttggaagagtgagaaacttggg 51765285  T
Q  419 gaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtg 517  Q
     |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||   || |  ||||||||||||    
T  51765286 aaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtg 51765384  T
Q  518 tcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttt 607  Q
    |||||      ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51765385 tcttgttcttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttt 51765484  T
Q  608 tgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 707  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  51765485 tgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtctttgt 51765582  T
Q  708 tttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgct 805  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  51765583 tttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgct 51765679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 519 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316348
Alignment:
Q  519 cttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 13316424  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13316423 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 13316348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 523 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550670
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcat 8550855  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttct-tcttccc 719  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| |     
T  8550854 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttttctctctt-ct 8550758  T
Q  720 tctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttg 807  Q
    ||||  | ||||||||||| ||||   |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  8550757 tctc--tctttatcttgtgcttgtgattttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 8550670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 20762548 - 20762859
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  20762548 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 20762645  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || ||||||||||| |||||       ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20762646 tgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 20762744  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20762745 ccttttgtatctcttc-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaat 20762842  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || ||||||| |||||||    
T  20762843 ct-ttggtgtgtttgttt 20762859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 44023374 - 44023561
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  44023374 aaatgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtt 44023473  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    | | || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  44023474 tgctggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 44023561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15037999 - 15037900
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15037999 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttagaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 15037900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 3189207 - 3189517
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  3189207 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3189304  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || ||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3189305 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3189403  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3189404 cttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 3189501  T
Q  693 tcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||| |||||||    
T  3189502 t-ttggtgtgtttgttt 3189517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 3198024 - 3198334
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  3198024 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3198121  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || ||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3198122 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3198220  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3198221 cttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 3198318  T
Q  693 tcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||| |||||||    
T  3198319 t-ttggtgtgtttgttt 3198334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 3206863 - 3207173
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  3206863 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3206960  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || ||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3206961 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3207059  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3207060 cttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 3207157  T
Q  693 tcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||| |||||||    
T  3207158 t-ttggtgtgtttgttt 3207173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 291
Target Start/End: Original strand, 1054513 - 1054698
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||     
T  1054513 atgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgtcacgattttggaatcgtgatacgattggaggtgccgtgagccaagtttg 1054612  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1054613 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctagttaagtatcactgataaggactggtc 1054698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39446082 - 39445898
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | || |    
T  39446082 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgc 39445983  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    |||  || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39445982 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcatgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtc 39445898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 404 - 708
Target Start/End: Original strand, 3156742 - 3157050
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||   ||    
T  3156742 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgag 3156839  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3156840 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 3156938  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  3156939 catttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatc 3157035  T
Q  693 tcttggtgtatttgtt 708  Q
    | ||||||| ||||||    
T  3157036 t-ttggtgtgtttgtt 3157050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15011980 - 15011881
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15011980 caaaggtgcctgcaaaagaagtcatattggatgaattgggatttagaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccaaatccaaaat 15011881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Original strand, 19365781 - 19366051
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  19365781 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 19365879  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||| | ||| |||| |||  | |||||    
T  19365880 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaattttccaggataaggacaggtcgtacattgtgacgtacgtaccaatcg 19365979  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19365980 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 19366051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Original strand, 25439406 - 25439583
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| | | || |||| |||    
T  25439406 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgcaggatgc 25439505  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  25439506 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 25439583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 520 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 28220394 - 28220210
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28220394 ttggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28220297  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 707  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  28220296 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 28220210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168462
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 37168394  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168395 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 37168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547093
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13547160  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547159 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13547093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15018095 - 15017996
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15018095 caaaggtgcctgcaaaagaagtcatattggatgaattgggatttagaaacttagatgttccaaaatctgagacatgagctacatattccaaatccaaaat 15017996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 388
Target Start/End: Original strand, 24202360 - 24202513
Alignment:
Q  236 aaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaat 333  Q
    |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||| |    
T  24202360 aaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatatcttgggacgcacgttcaaatcgtgacacgatctggaaa-t 24202458  T
Q  334 cgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24202459 cgtgacacgattgtatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcatattt 24202513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 28265722 - 28265536
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28265722 ttggcgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28265625  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  28265624 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 28265536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 520 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297963
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 42298046  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42298045 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 42297963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 365
Target Start/End: Original strand, 24793708 - 24793904
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgt 266  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  24793708 aatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgt 24793806  T
Q  267 taagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  24793807 taagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 24793904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 367 - 684
Target Start/End: Original strand, 44454997 - 44455322
Alignment:
Q  367 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagt 463  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44454997 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagagagaaacttggtaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 44455095  T
Q  464 atctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggt 553  Q
     | ||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || || ||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44455096 tt-tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt 44455194  T
Q  554 ttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcct 652  Q
    | |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||     
T  44455195 t-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccc 44455291  T
Q  653 ccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44455292 ccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834149
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca- 834236  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  834235 ttgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 834149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549004
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || | ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13549071  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549070 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13549004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15033432 - 15033332
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15033432 caaaagtgcctgcaaaagaagtcatattggatgaattgggattgagaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccaaatccaaaat 15033333  T
Q  108 g 108  Q
    |    
T  15033332 g 15033332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15041560 - 15041468
Alignment:
Q  15 gcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15041560 gcctgcaaaagaagtcatattggatgaattgggatttaaaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccaaatccaaaat 15041468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136412
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 29136344  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29136345 catt-gatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 29136412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255343
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47255411  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  47255410 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47255343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Original strand, 14521756 - 14521855
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14521756 caaaggtgcctgcaaaagaagtcatattcgatgaattgggatttagaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacacattccaaatccaaaat 14521855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15003087 - 15002988
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15003087 caaaggtgcctgcaaaagaagtcatattggacgaattgggatttagaaacttagatgttccaaaatctgagacatgagctacatattccaaatccaaaat 15002988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 25444589 - 25444776
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| | | |    
T  25444589 aaatgttggaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtt 25444688  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  25444689 tgtaggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtc 25444776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41391188 - 41391002
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | |    
T  41391188 aaatgttgattttggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagcca-gtt 41391090  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    | ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||   ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  41391089 tgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtc 41391002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918535
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 49918447  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  49918448 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 49918535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348862
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc-taagaact 11348795  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11348796 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 11348862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 24786904 - 24787082
Alignment:
Q  185 aggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataagg 284  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24786904 aggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataagg 24787002  T
Q  285 actggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    |||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  24787003 actggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 24787082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552619
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatccc-tttgtaagaact 4552708  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  4552707 ca-ttgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 4552619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Original strand, 14531877 - 14531976
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14531877 caaaggtgcctgcaaaagaagtcatattggatgagttgggattcagaaacttggatgttccgaagtctgagacatgagctacgtattccaaatccaaaat 14531976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 520 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 28223589 - 28223405
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || |  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28223589 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28223492  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 707  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  28223491 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 28223405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 31925875 - 31925711
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31925875 ttggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31925778  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31925777 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 31925711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 693
Target Start/End: Original strand, 31659114 - 31659409
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaa-a 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    |    
T  31659114 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtga 31659211  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  31659212 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggct-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 31659310  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    || |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  31659311 ccatttgtatctcttt-gtaagaacttatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 31659407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Original strand, 19360925 - 19361133
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  19360925 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 19361023  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  19361024 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 19361123  T
Q  316 tgacacgatt 325  Q
    ||||||||||    
T  19361124 tgacacgatt 19361133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482234
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 7482302  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7482301 tcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 7482234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033068
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaac 37033144  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  37033143 tcatt-gatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 45644425  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  45644424 catt-gatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167157
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 50167246  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  50167245 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 50167157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169192
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagtact 50169281  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||    
T  50169280 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 50169192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115337
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaac 47115268  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
     |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  47115269 ccatt-gatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47115337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 3847286 - 3847103
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847286 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 3847189  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||||||||||||||||  | |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  3847188 t-gatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3847103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 13659501 - 13659318
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | || | |||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  13659501 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 13659404  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  13659403 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttgttt 13659318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754657
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19754591  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  19754592 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggt 19754657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503540
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctcttt-gtaagaact 37503628  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  37503627 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 37503540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 37560037 - 37559850
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc--aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  37560037 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaac 37559940  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctcc-agaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    ||  ||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  37559939 tc-gttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 37559850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 193611 - 193775
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |  | | |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  193611 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 193708  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  193709 catt-gatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtga 193775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 666
Target Start/End: Original strand, 1833522 - 1833667
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||  | ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  1833522 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1833619  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaa 666  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1833620 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 685
Target Start/End: Original strand, 34603576 - 34603740
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  34603576 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaagaac 34603673  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtg 685  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603674 tcatt-gatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 520 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaagaact 23555336  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  23555335 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Original strand, 46064921 - 46065104
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| | |||| || ||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||    
T  46064921 gtgagattgggaaaatggataaaaattagg-tttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctcttt-gtaagaactcat 46065018  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  46065019 tc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgttt 46065104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Original strand, 41360914 - 41361101
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  41360914 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 41361011  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |  |||||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| | |||||| |  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  41361012 c-gttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 41361101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41398779 - 41398657
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgtt 267  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||    
T  41398779 aatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcatt 41398681  T
Q  268 aagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  41398680 aagtatcattgataaggactggtc 41398657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 437 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 197166 - 196915
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 527  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  197166 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 197069  T
Q  528 attgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 625  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  197068 attgagaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatccc-tttgtaagaactca-ttgat 196972  T
Q  626 agtggattggagagtacaatctct-cctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    ||||||||||||||    |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  196971 agtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 196915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 30476614 - 30476429
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  30476614 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattaggg-ttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 30476517  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    || |||||| ||||||||| ||  |||||||| | ||| |  |||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  30476516 ca-ttgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 30476429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 19752685 - 19752857
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  19752685 ttggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctc-tttgtaagaac 19752782  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  19752783 tca-ttgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 525 - 665
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 623  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactca-ttg 22079419  T
Q  624 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtca 665  Q
    ||| ||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||||    
T  22079420 atattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 606 - 686
Target Start/End: Original strand, 28242391 - 28242469
Alignment:
Q  606 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  28242391 tttgtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 28242469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 525 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318589
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcatt 12318589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 541 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 927982
Alignment:
Q  541 tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagag 639  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctc-tttgtaaaaactca-ttaatagtggattagagag 928026  T
Q  640 tacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
      ||| |||| | |||   ||||||||| || |||||||||||||    
T  928025 accaacctcttccccaaggtaggtcaag-ttagaccgaactgggt 927982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 538 - 669
Target Start/End: Original strand, 15820326 - 15820455
Alignment:
Q  538 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 636  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |    
T  15820326 gggtaaaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttt-taagaactca-ttgatagtgcattgaa 15820422  T
Q  637 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    |||   |||||||| |||||| |||||||||||    
T  15820423 gagataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 574 - 650
Target Start/End: Original strand, 16455676 - 16455750
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 650  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16455676 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tgtgtaagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 24202264 - 24202375
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24202264 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 24202362  T
Q  218 tcgtggcacgatt 230  Q
    ||||| |||||||    
T  24202363 tcgtgacacgatt 24202375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 13138089 - 13137973
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||||| |  |||||    
T  13138089 aagctaatttcttgtaacccatttgcatctc-tttgtaagaacaca-ttgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattgga 13137993  T
Q  674 ccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  13137992 ccgaactgggtcaacaatct 13137973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 40122363 - 40122178
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  40122363 gtgagattggaaaaatgggtcgaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcacttt-gtaagaactc-t 40122267  T
Q  621 ttgata--gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40122266 ttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 40122178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Original strand, 43987956 - 43988133
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||   |||| || | |||||| | ||||||||||||||  |||  || |||||| | | || | ||  ||    
T  43987956 attggcttcaaatttgtggtttgggagagcagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcagagaggcagtgagccaagtttgctggaagc 43988055  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  43988056 aaaatcgtgccacgatcttggtaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 43988133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 601
Target Start/End: Original strand, 3460710 - 3460778
Alignment:
Q  534 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtat 601  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3460710 aaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtat 3460778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 574 - 649
Target Start/End: Original strand, 6808507 - 6808581
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctct 649  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  6808507 aagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctct 6808581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14468748 - 14468685
Alignment:
Q  43 ttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaa 106  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14468748 ttgggattgagaaacttagctgttccgaaatctgagacatgagccacatattccaaatccaaaa 14468685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 606 - 709
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683866
Alignment:
Q  606 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtattt 705  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| || | | |||||||||||| |||    
T  36683766 tttgtaagaactcatt-gatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactgagtaaac-atctcttggtgtgttt 36683862  T
Q  706 gttt 709  Q
    ||||    
T  36683863 gttt 36683866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 534 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 37282846 - 37282728
Alignment:
Q  534 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 632  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||   ||||||||||| | ||||||||    
T  37282846 aaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattag-tagtggat 37282748  T
Q  633 tggagagtacaatctctcct 652  Q
    |||||||   ||||||||||    
T  37282747 tggagagataaatctctcct 37282728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 345
Target Start/End: Original strand, 13604104 - 13604334
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||||| ||| |||||| ||||| || | | || |||||||| || || ||| |||     
T  13604104 ttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggtatcgtggcacgattttgtgatgtcgtgagct-ggtttgcagtgtgt 13604202  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| ||||||| || | ||||| |||| |||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||||| || ||| |  |    
T  13604203 caaatcgtgacacgattttgtggaatcgtgacatgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacgtatca 13604301  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  13604302 atcgtgacacgatttggaaaa-cgtggcacgatt 13604334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 525 - 639
Target Start/End: Original strand, 13938143 - 13938256
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacc-cttttgtatcccttttgtaag-aactcatt 621  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  13938143 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctc-tttgtaagaaactca-t 13938238  T
Q  622 tgatagtggattggagag 639  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13938239 tgatagtggattggagag 13938256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 37876865 - 37876770
Alignment:
Q  588 taacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  37876865 taacccatttgtatctcttt-gtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtga 37876770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14483694 - 14483633
Alignment:
Q  45 gggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaa 106  Q
    |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14483694 gggattaagaaacttagctgttccgaaatctgagacatgagccacatattccaaatccaaaa 14483633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 331 - 388
Target Start/End: Original strand, 19358530 - 19358587
Alignment:
Q  331 aatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19358530 aatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 19358587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 37879079 - 37879006
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  37879079 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 37879006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 539 - 591
Target Start/End: Original strand, 6378603 - 6378655
Alignment:
Q  539 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaac 591  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  6378603 ggtagaaattagggtttgttcatgttgaacattgt-aagctaattttttgtaac 6378655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14504925 - 14504864
Alignment:
Q  45 gggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaa 106  Q
    |||||| | |||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14504925 gggattaagaaacttagctgttccgaaatccgagacatgagccacatattccaaatccaaaa 14504864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 607
Target Start/End: Original strand, 48382441 - 48382505
Alignment:
Q  542 agaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 607  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  48382441 agaaattagggtttgatctttgtgaacttgt-aagttaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 48382505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 599; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 897
Target Start/End: Original strand, 5858 - 6650
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5858 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggagtcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttg 5957  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5958 cagggtgcaaattcgtgtcacgattgtggcaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 6057  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga- 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  6058 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaga-gaggttggaa 6156  T
Q  404 -agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6157 gagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--aga 6254  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  6255 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcc-cttgtatc 6353  T
Q  603 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6354 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 6453  T
Q  702 atttgttttcttcttccctctccttg-tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 800  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6454 tattgttttcttcttccctctccttgttttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattgttgtttc 6553  T
Q  801 ttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggaga 897  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  6554 ttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacatatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggtcttggaga 6650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 598; Significance: 0; HSPs: 104)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 903
Target Start/End: Original strand, 25637013 - 25637811
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||     
T  25637013 tgttgagattgtctttaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcgaggtgc-gagagctagggttg 25637111  T
Q  206 caggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637112 caggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 25637210  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga- 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25637211 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaa 25637310  T
Q  404 -agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25637311 gagagagagacttgggaaatcaaaggggtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--aga 25637408  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25637409 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatc 25637507  T
Q  603 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtg 700  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25637508 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtg 25637607  T
Q  701 tatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-ttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 799  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637608 cttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 25637707  T
Q  800 cttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggagatc 899  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||    
T  25637708 cctgcttgcacaatacactttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgaccttggaggtc 25637807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 896
Target Start/End: Original strand, 3617033 - 3617824
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||     
T  3617033 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttg 3617132  T
Q  206 caggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3617133 caggggtgcaaa-tcgtgtcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataacggctggtcgttccttgggacg 3617231  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag--gaggttgg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3617232 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagtagaggttgg 3617331  T
Q  403 aagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617332 aagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 3617431  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3617432 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatc 3617530  T
Q  603 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3617531 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgt 3617630  T
Q  702 at-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 800  Q
     | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617631 ttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 3617728  T
Q  801 ttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  3617729 ttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattcttatttgtattggtgtggttcgatccgaccttggag 3617824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 4599110 - 4598317
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  4599110 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacacgatttcggatgccgtgagctagggt 4599011  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattg-tgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4599010 tgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 4598912  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag---g 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |    
T  4598911 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattgaaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaa-aggagagag 4598813  T
Q  399 ttggaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4598812 ttggaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgt- 4598714  T
Q  499 aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccctttt 597  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4598713 -agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctctt 4598616  T
Q  598 gtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 696  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598615 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 4598516  T
Q  697 ggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 795  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4598515 tgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttatt 4598418  T
Q  796 gtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttgga 895  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  4598417 gtttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgaccttgga 4598318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 4601328 - 4600538
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  4601328 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 4601229  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattg-tgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4601228 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 4601130  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag---gttg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||    
T  4601129 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaa-aggaaagagttg 4601031  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4601030 gaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--g 4600933  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4600932 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgta 4600834  T
Q  601 tcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4600833 ttccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgt 4600734  T
Q  700 gtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4600733 gtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgatttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtt 4600636  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4600635 tctggcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgaccttggag 4600538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 903
Target Start/End: Original strand, 10210975 - 10211777
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||    
T  10210975 aaatgttgagattgtctttaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttaggatgccgtgagttagggt 10211074  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211075 tgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgattttgggaaaatcatgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 10211173  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag---aggagg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||    
T  10211174 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtaaaagagg 10211273  T
Q  399 ttggaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10211274 ttggaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt- 10211372  T
Q  499 aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccctttt 597  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  10211373 -agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctctt 10211470  T
Q  598 gtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 696  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211471 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 10211570  T
Q  697 ggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 795  Q
     |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10211571 tgtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgtt 10211668  T
Q  796 gtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatcc-gatcttgg 894  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  10211669 gtttcttgcttgctcaataagctttgattggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctctgtattggtgtggttcgatccgggtcttgg 10211768  T
Q  895 agatccggg 903  Q
    || ||||||    
T  10211769 aggtccggg 10211777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 887
Target Start/End: Original strand, 10055813 - 10056584
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcaggg-tgc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  10055813 ttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc 10055912  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 312  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10055913 aaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 10056011  T
Q  313 tcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  10056012 tcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagggttgaaagagagaga 10056111  T
Q  413 cttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 512  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10056112 cttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcatt 10056209  T
Q  513 gagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt- 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||     
T  10056210 gagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgta 10056308  T
Q  611 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttt 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  10056309 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttt 10056408  T
Q  710 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10056409 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10056505  T
Q  809 acaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10056506 tcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 10056584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 887
Target Start/End: Original strand, 10058024 - 10058806
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||    
T  10058024 aaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggt 10058123  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058124 tgcaggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 10058222  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttg 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10058223 acgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagggttg 10058322  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10058323 aaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 10058420  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10058421 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgta 10058519  T
Q  601 tcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10058520 ttccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgt 10058619  T
Q  700 gtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 797  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10058620 gtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgt 10058716  T
Q  798 ttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10058717 ttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 10058806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 887
Target Start/End: Original strand, 10060246 - 10061028
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||    
T  10060246 aaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggt 10060345  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060346 tgcaggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 10060444  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttg 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10060445 acgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagggttg 10060544  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10060545 aaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 10060642  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10060643 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgta 10060741  T
Q  601 tcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10060742 ttccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgt 10060841  T
Q  700 gtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 797  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10060842 gtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgt 10060938  T
Q  798 ttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10060939 ttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 10061028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 887
Target Start/End: Original strand, 10062468 - 10063250
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||    
T  10062468 aaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggt 10062567  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062568 tgcaggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 10062666  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttg 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10062667 acgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagggttg 10062766  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10062767 aaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 10062864  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10062865 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgta 10062963  T
Q  601 tcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10062964 ttccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgt 10063063  T
Q  700 gtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 797  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10063064 gtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgt 10063160  T
Q  798 ttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10063161 ttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 10063250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 887
Target Start/End: Original strand, 10064690 - 10065472
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||    
T  10064690 aaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggt 10064789  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10064790 tgcaggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 10064888  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttg 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10064889 acgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagggttg 10064988  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10064989 aaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 10065086  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10065087 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgta 10065185  T
Q  601 tcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10065186 ttccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgt 10065285  T
Q  700 gtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 797  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10065286 gtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgt 10065382  T
Q  798 ttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10065383 ttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 10065472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 862
Target Start/End: Original strand, 54634710 - 54635462
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| | ||     
T  54634710 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggcattgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaag-ttg 54634808  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |     
T  54634809 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcttttcttgggtggt 54634908  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaag 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54634909 acgcaaatcatgacacgattgggaaaatcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagggagttggaag 54635007  T
Q  406 agagaga--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635008 agagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 54635107  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54635108 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatc 54635206  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgt 701  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  54635207 ccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 54635305  T
Q  702 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  54635306 ttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattat 54635402  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatt 862  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54635403 tgcttgcac-acacactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcattatt 54635462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 857
Target Start/End: Original strand, 6716085 - 6716834
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||     
T  6716085 tgttgagattgtcttgaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttg 6716183  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  6716184 cagggtgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggt 6716283  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaag 405  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  6716284 acgcggatcgtgacacgatttggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagaaagggttggaag 6716382  T
Q  406 agagaga--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716383 agagagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 6716482  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6716483 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatc 6716581  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgt 701  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  6716582 ccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 6716680  T
Q  702 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt-gttgtttc 800  Q
     ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  6716681 ttttgttttcttcttccctcccct--tttatcttgtgattgtatttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttggttgatta 6716778  T
Q  801 ttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 857  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  6716779 ttgcttgcac-acacactttgtttggtggttaccgctttccgttgctccacacatca 6716834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 885
Target Start/End: Original strand, 45282627 - 45283345
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgt 266  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45282627 aatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgt 45282725  T
Q  267 taagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtac 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  45282726 taagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta- 45282824  T
Q  367 ttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga----agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattaga 461  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282825 taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagagagagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattaga 45282924  T
Q  462 gtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcat 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282925 gtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcat 45283024  T
Q  562 ggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccc---ttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaa 658  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45283025 agtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagag 45283123  T
Q  659 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcac 758  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |    
T  45283124 taggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctcttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctc 45283222  T
Q  759 acttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  45283223 actagtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaa-acactttgtttggtggttaccgctctccgtcgctccacacatc-- 45283319  T
Q  859 tattctttgtattggcgtgggtcgatc 885  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||    
T  45283320 -attctttgtattggtgtggttcgatc 45283345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 903
Target Start/End: Original strand, 10208778 - 10209557
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||| |    
T  10208778 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcatgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgc 10208877  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10208878 aggggtgcaaa-tcgtggcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaaatatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 10208976  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag---aggaggttg 401  Q
    ||||||||||                    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  10208977 gacgcaaatc--------------------gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtaaaagaggttg 10209056  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10209057 gaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--g 10209154  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  10209155 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgta 10209253  T
Q  601 tcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10209254 gtccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctttgt 10209353  T
Q  700 gtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10209354 gtttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtt 10209451  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatcc-gatcttggaga 897  Q
    |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||     
T  10209452 tcttgcttgctcaataagctttgattggtggttaccactctccgtcactccacacatcattattctctgtattggtgtggttcgatccgggtcttggagg 10209551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 623
Target Start/End: Original strand, 10066912 - 10067431
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||    
T  10066912 aaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggt 10067011  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067012 tgcaggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 10067110  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10067111 acggacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagggttg 10067210  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10067211 aaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 10067308  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10067309 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgta 10067407  T
Q  601 tcccttttgt-aagaactcatttg 623  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  10067408 ttccttttgtaaagaactcatttg 10067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 115 - 811
Target Start/End: Original strand, 800694 - 801376
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || | ||||||    
T  800694 ttgtcttcgaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcggggtgc 800792  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |    
T  800793 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaatggtcgtttcttgggacgaacgcacca 800892  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagag 411  Q
    |||||||||||    ||||| |||||||||||||  | |||  || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||           |||||||     
T  800893 atcgtgacacggcctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtagagggctaatatttaagtgttcttgtgcatatttgaagg----------agagagaa 800981  T
Q  412 acttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 509  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  800982 acttgggaaatcaaaggaagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatc 801080  T
Q  510 attgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttt 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  801081 attgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttt 801179  T
Q  608 tgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 707  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  801180 tgtaagaactcatt-gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgt 801278  T
Q  708 tttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtg--gtgttttgttgtttcttgct 805  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||   ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||    
T  801279 tttcttcttccctctcct--tttatcttgtg--tattg---tgtttttc-cacttgtttcctagattagatctaggtgctgttttttgttgattattgct 801370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 168 - 554
Target Start/End: Original strand, 6718330 - 6718718
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgt 266  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6718330 aatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgt 6718428  T
Q  267 taagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtac 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  6718429 taagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcggatcgtgacacgatttgaaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta- 6718527  T
Q  367 ttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagt 463  Q
    | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718528 taaagtgttcttgtgcagatttgaagaaagggttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagt 6718627  T
Q  464 atctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718628 atctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 23200716 - 23200020
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  23200716 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgctgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 23200618  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| |||||||  | | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||  ||| |  |||||    
T  23200617 tcgtgacacgatttggaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttgtgacttacgtaccaatcg 23200518  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga-- 412  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||      
T  23200517 tgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactggtatttaagtgtttttgtgcagattttgaagaga--gttggaagagagagaaa 23200421  T
Q  413 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 510  Q
    |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  23200420 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 23200322  T
Q  511 ttgagtgtcttg------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23200321 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 23200223  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
      ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  23200222 t-ttttgtaagaactcatt-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtc 23200126  T
Q  703 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcaca-cttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| || |||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| || |    
T  23200125 tttgttttcttcttccctctcct--tttatcttatgcttg-tggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtgttttattgttgattat 23200029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 23198517 - 23197823
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  23198517 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 23198419  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| |||||||  | | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  23198418 tcgtgacacgatttggaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 23198319  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga-- 412  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||      
T  23198318 tgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaga--gttggaagagagagaaa 23198222  T
Q  413 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 510  Q
    |||||  |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  23198221 cttggaaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 23198123  T
Q  511 ttgagtgtcttg------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23198122 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 23198024  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
      ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  23198023 t-ttttgtaagaactcatt-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtc 23197927  T
Q  703 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcaca-cttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||| || |    
T  23197926 tttgttttcctcttctctctcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctatgtgttttattgttgattat 23197830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 483 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779842
Alignment:
Q  483 tgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaat 581  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  582 ttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 681  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  7780109 ttcttgtaacc-ttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtg 7780012  T
Q  682 ggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtg-tttcacacttggttcctagattagatct 780  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7780011 ggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatct 7779915  T
Q  781 aggtggtg-ttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatc 856  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7779914 aggtgctgtttttgttgattattgcttgcac---acactttg-ttggtggttaccactctcctttgctccacacatc 7779842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 650 - 887
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067671
Alignment:
Q  650 cctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgct 747  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgct 10067534  T
Q  748 ttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgct 847  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10067535 ttgt--ttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt-gttgtttcttgcttgctcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgct 10067631  T
Q  848 ccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10067632 ccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 10067671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8478002 - 8477729
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||     
T  8478002 tgttgacattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaattgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttg 8477904  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    | || ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |     
T  8477903 ctggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgt 8477804  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtg 381  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8477803 acgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtg 8477729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 368 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 9636457 - 9636106
Alignment:
Q  368 taagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagt 463  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636457 taagtgttctt-tgcagattttgaagagtgagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt 9636360  T
Q  464 atctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattggga--aaagggtagaaattagggt 553  Q
     ||||||||||||  ||| || | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||       ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9636359 ctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggt 9636260  T
Q  554 ttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcct 652  Q
    | |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9636259 t-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcct 9636163  T
Q  653 ccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9636162 ccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 9636106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 709
Target Start/End: Original strand, 37408049 - 37408645
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||   ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  |  |||||||||||| || || |||||||  |||    
T  37408049 cttcaaatttgtggtttggaagaacaaagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgattttgtagtgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 37408147  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | ||||||| | ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||||| || ||| |  |||||    
T  37408148 tcgtggcacgattgtgt-aaatcgtgacacgattttcaaacttgttggttaagttttcaggataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgtatcaatcg 37408245  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-agagagagac 413  Q
    || ||||||| ||||| |||| ||| ||||  | | |  |||| || |||  |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||| | ||||||| ||    
T  37408246 tggcacgatttggaaa-tcgtaacaagattttatctgctgaagactggtatataagtgttcttgtgaagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaac 37408344  T
Q  414 ttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 511  Q
    ||||| ||||||||| || | || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||    || || ||| ||    
T  37408345 ttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgagtgaaaattat 37408442  T
Q  512 tgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37408443 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 37408541  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||     
T  37408542 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatct-ttggtgtg 37408638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 368 - 709
Target Start/End: Original strand, 45095004 - 45095350
Alignment:
Q  368 taagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagta 464  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||| | || | || ||||||||||||| |||||||||||||     
T  45095004 taagtgttctt-tgcagattttgaagatgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 45095100  T
Q  465 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttg 556  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45095101 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-g 45095199  T
Q  557 ttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctcca 655  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  45095200 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcta 45095297  T
Q  656 gaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  45095298 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggcgtatttgttt 45095350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 5258436 - 5258125
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5258436 agagagaaacttgagaaatcaaagggagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5258339  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5258338 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 5258240  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5258239 ccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaat 5258142  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || ||||||| |||||||    
T  5258141 ct-ttggtgtgtttgttt 5258125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 5260615 - 5260304
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5260615 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5260518  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || |||||||||||||||||||       |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5260517 tgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 5260419  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5260418 ccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaat 5260321  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || ||||||| |||||||    
T  5260320 ct-ttggtgtgtttgttt 5260304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 389
Target Start/End: Original strand, 40372256 - 40372538
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||     
T  40372256 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttg 40372354  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  40372355 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacctgggaacgg 40372454  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactta-agtgttcttgtgcagatttg 389  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  40372455 acgcaaatcgtgccacgatctgg-aaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 40372538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 523 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683774
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19683957  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccct 720  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  ||    
T  19683956 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ct 19683861  T
Q  721 ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttg 807  Q
    |||||  |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  19683860 ctcct--tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcacttttattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 19683774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 404 - 693
Target Start/End: Original strand, 7762142 - 7762437
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |  |||||||||   ||    
T  7762142 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttggtgag 7762239  T
Q  502 agagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || ||||||||||||||||       |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  7762240 tgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaact 7762338  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7762339 cttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 7762436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7167882 - 7167600
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||  ||     
T  7167882 tgttgatattggcttcaaatttgtgttctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacaatttcaaggtgccgtgagctagt-ttg 7167784  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  7167783 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcag 7167684  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactta-agtgttcttgtgcagatttg 389  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    ||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  7167683 acgcaaatcgtgacacgatt-tgaaaatcatggcacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 7167600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 404 - 807
Target Start/End: Original strand, 7764344 - 7764747
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||    
T  7764344 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggt-ctttgattagatt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggtgag 7764441  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc 593  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  7764442 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactc 7764538  T
Q  594 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7764539 ttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatct 7764636  T
Q  694 cttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-t 791  Q
     ||||||| |||||||   ||||  |||||||  |||||||| || |||| | |||||| ||  ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |    
T  7764637 -ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattccaagattagatctaggtgctgttat 7764731  T
Q  792 tgttgtttcttgcttg 807  Q
    ||||| || |||||||    
T  7764732 tgttgattattgcttg 7764747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 390
Target Start/End: Original strand, 27352097 - 27352364
Alignment:
Q  123 aaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |  || |||    | |||||||    
T  27352097 aaatttgtggtctcgaagaacagaaaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagcttgt-ttgcagaacaccaaatcgt 27352195  T
Q  222 ggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacac 321  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27352196 ggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaattatcactgataaggactggtcataccttgggacggacgcaaatcgtgacac 27352295  T
Q  322 gattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactta-agtgttcttgtgcagatttga 390  Q
    |||| || |||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  27352296 gatttgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctaatatatattgtgttcttgtgcagatttga 27352364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 437 - 693
Target Start/End: Original strand, 9581193 - 9581454
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 527  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||| |    
T  9581193 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtggg 9581290  T
Q  528 attgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 626  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9581291 attcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gata 9581387  T
Q  627 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9581388 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9581454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196368
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29196457  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29196456 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 29196368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491397
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 34491309  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  34491310 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 34491397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 520 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199457
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 49199541  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49199540 tcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 49199457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 345
Target Start/End: Original strand, 22172659 - 22172899
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| | |     
T  22172659 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagcca-gt 22172757  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   ||||||      
T  22172758 ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaaggatctctgataaggactggtc-aaccttggtt 22172856  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    | |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  22172857 ccgttgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgatt 22172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 404 - 708
Target Start/End: Original strand, 40735259 - 40735568
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaa- 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||     
T  40735259 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaa 40735356  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  40735357 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaac 40735455  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    |  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  40735456 cagtttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaat 40735552  T
Q  692 ctcttggtgtatttgtt 708  Q
    || ||||||||||||||    
T  40735553 ct-ttggtgtatttgtt 40735568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 365
Target Start/End: Original strand, 28503316 - 28503577
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||      
T  28503316 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggcctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt- 28503414  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || | ||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||     
T  28503415 ttgctggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacaattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-aaccttgggt 28503513  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    | |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  28503514 cagacgcaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 28503577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570115
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 4570049  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570050 catt-gatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggt 4570115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 325
Target Start/End: Original strand, 2671115 - 2671283
Alignment:
Q  157 cacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtga 255  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||    
T  2671115 cacgattttggcatcgtgacatgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgcaggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttaga 2671213  T
Q  256 aacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgatt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  2671214 aacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacacgatt 2671283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 412 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 39153645 - 39153358
Alignment:
Q  412 acttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttg--taaagagagaa 507  Q
    ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  | ||  || ||    
T  39153645 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaat-gaaaa 39153549  T
Q  508 tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttg 598  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||    
T  39153548 tcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttg 39153450  T
Q  599 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  39153449 tatcccttta-taagaactcatt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 8738602 - 8738780
Alignment:
Q  185 aggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataagg 284  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8738602 aggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgctaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataagg 8738700  T
Q  285 actggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  8738701 actggtcataccttggaacggacgcaaatcgtgacatgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagtctagta 8738780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Original strand, 9090840 - 9091018
Alignment:
Q  185 aggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataagg 284  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9090840 aggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgctaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataagg 9090938  T
Q  285 actggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  9090939 actggtcataccttggaacggacgcaaatcgtgacatgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagtctagta 9091018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 520 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401789
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaac 43401873  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43401872 tcatt-gatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 43401789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 255 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7782584 - 7782375
Alignment:
Q  255 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacag 352  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  | |||    
T  7782584 aaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtgccttgggacgaacgtaccaatcgtgacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcag 7782486  T
Q  353 aggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagag--acttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggt 449  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||| |     
T  7782485 tggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag-gacagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctaggttttagag- 7782388  T
Q  450 tctttgattagag 462  Q
    |||||||||||||    
T  7782387 tctttgattagag 7782375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 437 - 709
Target Start/End: Original strand, 760757 - 761033
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 527  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||| |  || || |||||||||||||||||       |||||    
T  760757 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgag 760854  T
Q  528 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 625  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  760855 attgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gat 760951  T
Q  626 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  760952 agtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaaatgggttaacaatct-ttggtgtgtttgttt 761033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 5236787 - 5236440
Alignment:
Q  367 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagt 463  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | ||| | ||||||| ||||||| |||| |||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5236787 ttaagtgttcttgtgcagattttgaagtggggcttgaagagagagaaacttgggaaatcgaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 5236689  T
Q  464 atctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggt 553  Q
     ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5236688 -tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt 5236590  T
Q  554 ttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcct 652  Q
    | |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||| |||     
T  5236589 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgataatggattcgagagatcaatctttcc- 5236494  T
Q  653 ccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  5236493 ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 5236440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835010
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca- 22835071  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835070 ttgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Original strand, 28501152 - 28501410
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||  ||     
T  28501152 tgttgatattggcttcaaatttgtggcctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt-ttg 28501250  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||   | |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |    
T  28501251 caggacaccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-aaccttgggtcag 28501349  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  28501350 acgcaaatcatgacacgatcttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 28501410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 524 - 701
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236304
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 30236226  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  30236227 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgt 30236304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 40734498 - 40734669
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  40734498 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt-gtaagaact 40734595  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40734596 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaagaact 44331642  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  44331643 tatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 522 - 709
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314631
Alignment:
Q  522 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 619  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactc- 31314543  T
Q  620 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||    
T  31314544 tttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 31314631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095603
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | || ||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6095670  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6095669 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtga 6095603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819526
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 41819594  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||    
T  41819593 tcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtga 41819526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 437 - 693
Target Start/End: Original strand, 29682269 - 29682530
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 527  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  29682269 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgag 29682366  T
Q  528 attgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 625  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29682367 attgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatccc-tttgtaagaactca-ttgat 29682463  T
Q  626 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29682464 agtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1306591 - 1306366
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || || || ||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  1306591 cttcaaatttatggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgtcgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 1306493  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  1306492 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattctcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 1306393  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacga 343  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||    
T  1306392 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacga 1306366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 2672431 - 2672603
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| | | || | ||  |||||||    
T  2672431 cttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgtaatcgtgacacgatcggagatgccgggagccaagtttgctggaagcaaaat 2672530  T
Q  219 cgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2672531 cgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 2672603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 43403913 - 43403736
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| | |||| |||| | ||||| |||||||||||| | | || |||| | |||||||||||    
T  43403913 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-ggcttgttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctc-tttgtaagaac 43403816  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttg 697  Q
    ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43403815 tca-ttgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttg 43403736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593868
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54593801  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  54593802 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtga 54593868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 29813063 - 29813234
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  29813063 ttggtgagattggaaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctc-tttgtaagaact 29813160  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  29813161 cattt-atagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 32744710 - 32744418
Alignment:
Q  412 acttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 509  Q
    ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   || || ||||    
T  32744710 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatc 32744613  T
Q  510 attgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 607  Q
    ||||||| | ||| ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  32744612 attgagtattttg-tgagattgaaaaaatgggtagaaattag--tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt 32744516  T
Q  608 tgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 707  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  32744515 -gtaagaactc-tttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 32744420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 524 - 708
Target Start/End: Original strand, 51398818 - 51398999
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |    
T  51398818 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-t 51398914  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  51398915 tgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 51398999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18657029 - 18656844
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||   | | ||     
T  18657029 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgaagcaagtttg 18656930  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||  || |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18656929 caggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 18656844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 678
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860631
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataact 46860571  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 678  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  46860572 catt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 46860631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 574 - 709
Target Start/End: Original strand, 16499084 - 16499215
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  16499084 aagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttgga 16499180  T
Q  674 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  16499181 ccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttgttt 16499215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 669
Target Start/End: Original strand, 29810868 - 29811016
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29810868 ttggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29810965  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29810966 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 578 - 701
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913472
Alignment:
Q  578 taatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccga 677  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccga 40913448  T
Q  678 actgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  40913449 actgggtcaacaatctcttggtgt 40913472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700476
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 44700549  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  44700548 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 539 - 701
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173536
Alignment:
Q  539 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 637  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46173377 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggag 46173473  T
Q  638 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | | | |||| |||||||||    
T  46173474 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactagatcaacaatttcttggtgt 46173536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 2676587 - 2676759
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| || || |||| | | || | ||  |||||||    
T  2676587 cttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgtaatcgtgacacgatcggagatgtcgggagccaagtttgctggaagcaaaat 2676686  T
Q  219 cgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||    
T  2676687 cgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagaatctctgataaggactggtc 2676759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 32143885 - 32143664
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgt 266  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||  || | ||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  32143885 aatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgt 32143787  T
Q  267 taagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagt 364  Q
    ||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | |||  |||| || ||    
T  32143786 taagttttcaagataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcgtgacacgatttgg-aaatcgtgacacgattttatcagttgaagacttgt 32143688  T
Q  365 acttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  32143687 atttaagtgttcttgtgcagattt 32143664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaagaact 53921574  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||    
T  53921573 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 23392077 - 23391891
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  23392077 ttggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gcaagaact 23391980  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  23391979 c-tttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 23391891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 522 - 682
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891264
Alignment:
Q  522 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 619  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||     
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactc- 32891202  T
Q  620 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||    
T  32891203 gttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27453568 - 27453303
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||  || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||||| || ||  ||||||| |||    
T  27453568 cttcaaatttgtggtctgaaagagcagagaaattgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgtagggtgccaaa 27453470  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| || ||||||| | ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  27453469 tcgtgacatgattgtgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcg 27453371  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcag 384  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||  | |||  |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  27453370 tgacacgatttgg-aaatcgtggcacgattttatcagttgaagactagtttttaagtgttcttgtgcag 27453303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Original strand, 33386150 - 33386419
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  33386150 cttcaaatttgtggtccgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 33386248  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||| || | ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  |||||||  |||||| || ||| |  |||||    
T  33386249 tcgtgacacgattttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtatcttgggtcgtacgtatcaatcg 33386347  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||||| || |||| ||| |||||||  | |||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33386348 tgacacgatttgg-aaattgtggcacgattttatcagctgaagactggtatttaagtgttcttgtgcagattt 33386419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 9666632 - 9666448
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||| || | |||| ||||||| || |    
T  9666632 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctcttt-gtaagaattc-t 9666535  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  9666534 ttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 9666448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 523 - 701
Target Start/End: Original strand, 47304254 - 47304430
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  ||| |||| ||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||    
T  47304254 gtgagattgagaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttc-gtaagaactcat 47304351  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||    
T  47304352 t-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatttattggtgt 47304430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8512830 - 8512643
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||   |||| || |||||||||| | ||||||||||||  | |  || |||||||| | |    
T  8512830 aaatgttggaattgacttcaaattagtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagtcgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtt 8512731  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8512730 tgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 8512643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Original strand, 26928093 - 26928301
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || |   ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  26928093 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgttatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26928191  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||| ||  || | ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| |||  ||| |  |||||    
T  26928192 tcgtgacacaatcttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcaggataaggacaggtcgtaccttgtgacttacgtatcaatcg 26928291  T
Q  316 tgacacgatt 325  Q
    ||||||||||    
T  26928292 tgacacgatt 26928301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433956
Alignment:
Q  520 ttggtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 607  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctcttt 5433956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8517602 - 8517523
Alignment:
Q  212 gcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8517602 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 8517523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 525 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055745
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacc-cttttgtatcccttttgtaag-aactcatt 621  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactca-t 4055831  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga-ataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||||| ||||  |  ||||||| |||||  |||||||   |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4055830 tgatagtggattgaagagatc--tctctcccccagatgtaggtcattgttgggccgaactgggtaaccaa-atcttggtgtatttgttt 4055745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 580 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301975
Alignment:
Q  580 atttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaac 679  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||   |||||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaac 55301982  T
Q  680 tgggtga 686  Q
    | |||||    
T  55301981 ttggtga 55301975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24968697 - 24968520
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||    |||| || |||||||| | |||||||||||||| || |  || |||||| | | || | ||  ||    
T  24968697 attgacttcaaattagtggtttggaagaacaaaggaatcgtgtcacgatttggcaatcgtgacacgatcggggaggcagtgagccaagtttgctggaagc 24968598  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  24968597 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc 24968520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 164
Target Start/End: Original strand, 6718285 - 6718345
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattt 164  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  6718285 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 6718345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 656
Target Start/End: Original strand, 36018852 - 36018987
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  36018852 ttggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaac 36018949  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccag 656  Q
    |||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  36018950 tcatt--atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32475966 - 32475887
Alignment:
Q  212 gcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  32475966 gcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 32475887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32480824 - 32480745
Alignment:
Q  212 gcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  32480824 gcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 32480745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Original strand, 45282585 - 45282642
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattt 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  45282585 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 45282642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7782699 - 7782588
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  7782699 cttcaaatttgtggtctagaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgcggtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 7782601  T
Q  218 tcgtggcacgatt 230  Q
    ||||| |||||||    
T  7782600 tcgtgacacgatt 7782588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 574 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 23410442 - 23410311
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  23410442 aagctaatttcgtataacccatttgtatcacttt-gtaagaactc-ttagataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttgga 23410346  T
Q  674 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
     |||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  23410345 acgaattgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 23410311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 622 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 681  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37726286 - 37726060
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||| ||||  |||||||||||| || | | ||||||||||| || || |||||||  |||    
T  37726286 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgatatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 37726188  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||| || | ||||| ||||||||  | ||||||| | ||||||| | |  |||||||  ||||||| | ||||| || ||| |  |||||    
T  37726187 tcgtgacacgattttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgttggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtacattgggtcgtacgtatcaatcg 37726089  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  37726088 tgacacgatttggaaaa-cgtggcacgatt 37726060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 608
Target Start/End: Original strand, 4386875 - 4386942
Alignment:
Q  540 gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccctttt 608  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4386875 gtagaaattaggttttgttctttgtgagctttt-aagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttt 4386942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 525 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 35138868 - 35138746
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 623  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  35138868 gagattgagaaatgggtagaaattatg-tttgttcttggtgagtttgttgaagttaatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactca-ttg 35138771  T
Q  624 atagtggattggagagtacaatctc 648  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||    
T  35138770 atagtggatggaagagaacaatctc 35138746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 525 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 1313968 - 1313854
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 623  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||| || ||||| || |||||||||||| || ||||||||||  ||||   ||||||||| |||    
T  1313968 gagattgagaaaagggtaaaaattatgttttgttcttggagagcttgttaaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactca-ttg 1313870  T
Q  624 atagtggattggagag 639  Q
    ||| |||||| |||||    
T  1313869 atattggattagagag 1313854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352150
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| | || | ||| ||||||||||||| || |||||||  | ||||||| |||||    
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaa-ccatttgtatttc-tttgtaataactc 51352181  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctc 650  Q
    | |||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  51352180 a-ttgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 534 - 607
Target Start/End: Original strand, 5373247 - 5373321
Alignment:
Q  534 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 607  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  5373247 aaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttatatctcttt 5373321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 532 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253353
Alignment:
Q  532 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtat 601  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28253423 ggaaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacgattttgtat 28253353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 31340369 - 31340266
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||| | |||| |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  31340369 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattgaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 31340272  T
Q  618 catttg 623  Q
    ||||||    
T  31340271 catttg 31340266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 597; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 597; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 18392780 - 18391990
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18392780 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgc 18392681  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 306  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392680 agggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 18392581  T
Q  307 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag----gttgg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     |||||    
T  18392580 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagagtaaaggagttgg 18392481  T
Q  403 aagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18392480 aagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--ga 18392383  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18392382 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtatc 18392284  T
Q  603 ccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18392283 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgt 18392184  T
Q  702 at-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 800  Q
     | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392183 ttattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 18392086  T
Q  801 ttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  18392085 ttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctctgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 18391990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 6592924 - 6592134
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  6592924 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggt 6592825  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592824 tgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 6592726  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6592725 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttg 6592626  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6592625 gaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 6592528  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6592527 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtat 6592429  T
Q  602 cccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtg 700  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6592428 cccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtg 6592329  T
Q  701 tat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 799  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592328 tttattgttttcttcttcc--ctccttgtttttcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 6592231  T
Q  800 cttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  6592230 cttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 6592134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 6595137 - 6594352
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  6595137 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaaaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 6595038  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595037 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 6594939  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6594938 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-aggttggaag 6594840  T
Q  406 agagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 505  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6594839 agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gagag 6594742  T
Q  506 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccct 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6594741 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtatccct 6594643  T
Q  606 tttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat- 703  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
T  6594642 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgttta 6594543  T
Q  704 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttg 803  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594542 ttgttttcttcttccctc--cttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttg 6594445  T
Q  804 cttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  6594444 cttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 6594352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 18389245 - 18388554
Alignment:
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389245 cagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 18389146  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag----gttg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     ||||    
T  18389145 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagagtaaaggagttg 18389046  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18389045 gaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--g 18388948  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18388947 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat 18388849  T
Q  602 cccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtg 700  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18388848 cccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtg 18388749  T
Q  701 tat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 799  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388748 tttattgttttcttcttccctctctttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 18388651  T
Q  800 cttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  18388650 cttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 18388554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 32060888 - 32060116
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  32060888 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 32060789  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060788 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 32060690  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag--gaggttgga 403  Q
    |||||||||                    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  32060689 acgcaaatc--------------------gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggaagaggttgga 32060610  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060609 agagagagacttgggaaatcaaagggtaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 32060510  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32060509 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcc 32060411  T
Q  604 c--ttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtg 700  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  32060410 cctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctctttgtg 32060311  T
Q  701 tat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 799  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060310 tttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 32060213  T
Q  800 cttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  32060212 cttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttatattggtgtggttcgatccggccttggag 32060116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 859
Target Start/End: Original strand, 20343500 - 20344232
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||     
T  20343500 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacgcgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttg 20343598  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  20343599 ccggatgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggt 20343698  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gag-gttgga 403  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||             ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  20343699 acgcagatcgtgacacgatt-------tc-------------aacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttttgga 20343777  T
Q  404 --agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaa 500  Q
      |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343778 agagagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaa 20343877  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20343878 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgta 20343976  T
Q  601 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20343977 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 20344075  T
Q  700 gtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctagg---tggtgttttgttg 796  Q
    |  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||| |    
T  20344076 gcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtgctggttttttgtcg 20344172  T
Q  797 tttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcatt 859  Q
     || ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20344173 attgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcatt 20344232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 756
Target Start/End: Original strand, 24789435 - 24790074
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  || ||||||||    
T  24789435 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagt-ttgcagggtgc 24789533  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 313  Q
     |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||    
T  24789534 caaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaat 24789633  T
Q  314 cgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga 412  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  24789634 cttgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaaggagaggttggaagagagaga 24789732  T
Q  413 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 511  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24789733 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 24789832  T
Q  512 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt 610  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24789833 tgagtgtcttggtaagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa-cattttgtatcccttttgt 24789931  T
Q  611 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg-ttt 709  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  24789932 aaaaactc-tttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtttt 24790030  T
Q  710 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttc 756  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24790031 tcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgcattgtgtttc 24790074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 107 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 1562587 - 1562103
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    ||  | |    |  | |||     
T  1562587 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgtgtttctttttttttgttttt 1562488  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 306  Q
     ||||   |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1562487 tgggttttaaatcgtgtcacgattttggtaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgtgacgga 1562388  T
Q  307 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttgga-- 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      
T  1562387 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtatttatgtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttggaag 1562288  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1562287 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agag 1562190  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562189 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 598 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560459
Alignment:
Q  598 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttg 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttg 1560658  T
Q  698 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560657 gtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 1560558  T
Q  798 ttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  1560557 ttcttgcttgcacaatatactctgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgaccttggag 1560459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 119 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 43504708 - 43503991
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  43504708 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 43504610  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 317  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||           
T  43504609 tcgtgacacgatcgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacagatgcacc----- 43504515  T
Q  318 acacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga--ctt 415  Q
                 |||||||||||||||  | ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||    
T  43504514 -------------aatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcctgtgcagatttgaagaag-ggttggaagagagagaaactt 43504429  T
Q  416 ggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattg 513  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  43504428 gggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcg 43504330  T
Q  514 agtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttgta 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  43504329 agtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgta 43504231  T
Q  612 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttc 711  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43504230 agaactcatt-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttc 43504132  T
Q  712 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcac 810  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||   |||||||| || ||||||||||    
T  43504131 ctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctagctg--tttttgttgattattgcttgcac 43504037  T
Q  811 aatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43504036 -acacactttg-ttggtggttaccactctcctttgctccacacatcat 43503991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Original strand, 39730946 - 39731656
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  39730946 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 39731044  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||  || | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||    
T  39731045 tcgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgtaccaatcg 39731144  T
Q  316 tgacacgat-tgg-----------------gaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagagga 396  Q
    ||||||||| |||                 ||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      
T  39731145 tgacacgatctggaaatcgtgacacgatctgaaaatcgtgacacgattttatcaatggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaga- 39731243  T
Q  397 ggttggaagagagaga--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 492  Q
     |||||||||||||||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  39731244 -gttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 39731341  T
Q  493 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 591  Q
    ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39731342 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaac 39731440  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39731441 tcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 39731539  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39731540 ct-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgtt 39731635  T
Q  791 -ttgttgtttcttgcttgcac 810  Q
     |||||| || ||||||||||    
T  39731636 attgttgattattgcttgcac 39731656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 163 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 25767489 - 25766940
Alignment:
Q  163 tttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttg 261  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||    
T  25767489 tttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttg 25767391  T
Q  262 ctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagg 359  Q
    |||||||||| ||   ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  | ||  |||||     
T  25767390 ctcgttaagtttctaggataaggacaggtcgtgccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgacttggaaa-tcgtgacacgattttatcaatggaaga 25767292  T
Q  360 ctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgat 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    ||||||| ||||| | |||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  25767291 ctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagagctgaagagagagaaacttgagaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgat 25767193  T
Q  458 tagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----gtgagattgg-gaaaagggtagaaattaggg 552  Q
    |||||| |||||| ||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||     |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25767192 tagagtttctctttggg---aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgagattggaaaaaagggtagaaattaggg 25767096  T
Q  553 tttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 650  Q
     |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25767095 -ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctc 25766999  T
Q  651 ctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25766998 ctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 25766940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 437 - 709
Target Start/End: Original strand, 35853825 - 35854102
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 528  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  35853825 tagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 35853922  T
Q  529 ttgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 626  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  35853923 ttgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gata 35854019  T
Q  627 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35854020 gtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgttt 35854102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2058604 - 2058304
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || |    
T  2058604 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttgaggtgccgtgagctagt-ttgc 2058506  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 306  Q
    |||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |    
T  2058505 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgta 2058406  T
Q  307 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactta-agtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttggaa 404  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  2058405 cgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagtatatattgtgttcttgtgcagatttgaaaagagagcttggaa 2058307  T
Q  405 gag 407  Q
    |||    
T  2058306 gag 2058304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 331 - 709
Target Start/End: Original strand, 48408605 - 48408992
Alignment:
Q  331 aatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga--cttggggaatcaaag 427  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  48408605 aatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagag-agc--ggaagagagagaaacttgggaaatcaaag 48408701  T
Q  428 gg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg--- 522  Q
    || | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       
T  48408702 ggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 48408800  T
Q  523 ----gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaa 615  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||    
T  48408801 attggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataa 48408899  T
Q  616 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  48408900 ctcatt-gatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgtgtttgttt 48408992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 29990931 - 29991240
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  29990931 agagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 29991028  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc 593  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29991029 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 29991127  T
Q  594 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29991128 ttttgtatctctttc-taataactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 29991225  T
Q  694 cttggtgtatttgttt 709  Q
     ||||||| |||||||    
T  29991226 -ttggtgtgtttgttt 29991240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21646643 - 21646360
Alignment:
Q  107 tgttgacatt-gtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtt 204  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || ||    
T  21646643 tgttgacatttggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacaaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggttt 21646545  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     |||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21646544 gcagggtgccaaatcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataagaactggtcataccttgggacg 21646445  T
Q  305 gacg--caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
     |||  ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21646444 tacgttcaaatcgtgccacgatctgg-aaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 21646360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21640426 - 21640204
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||      
T  21640426 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt- 21640328  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||  || |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |    
T  21640327 ttgcaggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtcatgccttggaa 21640228  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21640227 cggacgcaaatcgtgacacgattg 21640204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 450 - 807
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616137
Alignment:
Q  450 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaa 546  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  547 ttagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaat 645  Q
    ||||| |||||||   |||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatca-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaat 25615977  T
Q  646 ctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt---tcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg 742  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||   |||||||| |||      ||||||||||| |||    
T  25615978 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctcttcttctctc------tttatcttgtgcttg 25616070  T
Q  743 ttgctttgtgtttcacactt-ggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttg 807  Q
    | | |||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  25616071 tggttttgtgcttttcacttcgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 25616137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 520 - 807
Target Start/End: Original strand, 23555039 - 23555323
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  23555039 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctcttt-gtaagaac 23555136  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttctt 716  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||   ||||    
T  23555137 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttgatgtgtttgtttctctctt 23555234  T
Q  717 ccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttg 807  Q
      |||||||  |||||||| || |||| |  ||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  23555235 --ctctcct--tttatcttttgcttgtggtattgtgttttttactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 23555323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaagaact 34310787  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34310786 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 407
Target Start/End: Original strand, 1532954 - 1533204
Alignment:
Q  157 cacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtga 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  1532954 cacgaatttggcatcgtgacatgattttgaggtgccatgagctagt-ttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtga 1533052  T
Q  256 aacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagagg 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  || ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||   ||||||    
T  1533053 aacttactcgttaagtatccttgataaggactggttataccttgggacatacacaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagagg 1533151  T
Q  356 aaggctagtactta-agtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagag 407  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||    
T  1533152 aaggctagtatatatagtgttcttgtacagatttgagggagagcttggaagag 1533204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 326
Target Start/End: Original strand, 20357028 - 20357247
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||     
T  20357028 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttg 20357126  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |    
T  20357127 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcaaaccttgggtcag 20357226  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattg 326  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  20357227 acgcaaatcgtggcacgattg 20357247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270158
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 22270070  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22270071 gatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaac-atctcttggtgtgtttgtt 22270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 520 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069817
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14069904  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 707  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  14069903 catt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 14069817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 520 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379845
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 14379932  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 707  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  14379931 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 14379845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317416
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaagaact 41317505  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  41317504 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 41317416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 437 - 806
Target Start/End: Original strand, 4178685 - 4179054
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  4178685 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 4178782  T
Q  529 ttgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 626  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||    
T  4178783 ttgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gata 4178878  T
Q  627 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctcctt 726  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||     
T  4178879 gtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct- 4178974  T
Q  727 gtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgctt 806  Q
     ||||| || || ||| || |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  4178975 -tttatattttgcttg-tggtttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgctt 4179054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 437 - 709
Target Start/End: Original strand, 19502088 - 19502365
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 528  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||       ||||||    
T  19502088 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgaga 19502185  T
Q  529 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 625  Q
    ||| |||||  || ||||||||| |||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  19502186 ttgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt-gttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gat 19502282  T
Q  626 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  19502283 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 19502365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18409386 - 18409116
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  18409386 cttcaaatttgtgttctggaagaacagagaaatcgtaacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtggtgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 18409288  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    || || ||||||  || ||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  18409287 tcatgacacgatcttgagaaatcgtgacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 18409188  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18409187 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttctcgtgcagattt 18409116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 21811751 - 21811923
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||| | | || |||||||||||||    
T  21811751 cttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgccatcgtgacacgatctgagatgccgtgagcaatgtttgcagggtgcaaaat 21811850  T
Q  219 cgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21811851 cgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctagttaagtatctctgataaggactggtc 21811923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 520 - 790
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27348081
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 27347914  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 717  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    |||||    
T  27347915 catt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttc 27348011  T
Q  718 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
     ||| |    |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27348012 tctcac----tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 27348081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 367 - 669
Target Start/End: Original strand, 48491416 - 48491727
Alignment:
Q  367 ttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagt 463  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||   ||||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48491416 ttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgataaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 48491514  T
Q  464 atctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggt 553  Q
     ||||||||||||  |||||| | |||||| |||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48491515 -tctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt 48491613  T
Q  554 ttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcct 652  Q
    | |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||     
T  48491614 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gaaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccc 48491710  T
Q  653 ccagaataggtcaagtt 669  Q
    ||||| |||||||||||    
T  48491711 ccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18414262 - 18413992
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||| || || ||||| || |||    
T  18414262 cttcaaatttatggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtggcacgattttgtggtgccgtgagct-ggtttgcagggcgccaaa 18414164  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||  |||||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  18414163 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtaacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 18414064  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||  | ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18414063 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacaattttatcattggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 18413992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12406857 - 12406619
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtg-ccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||  ||     
T  12406857 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagt-ttg 12406759  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    || |  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |    
T  12406758 caagacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccg 12406660  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacga-ttgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
      |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12406659 ttgcaaatcgtgacacgatttggggaaatcgtggcacgatt 12406619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 41649175 - 41648993
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  41649175 gtgagattggaaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca-t 41649079  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  41649078 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 41648993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 520 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 30024900 - 30024740
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  30024900 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30024803  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30024802 c-tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126829
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 18126741  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    || |||||||||||||||||    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  18126742 ca-ttgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 18126829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359319
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 8359388  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  8359387 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 8359319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 538 - 701
Target Start/End: Original strand, 2390301 - 2390461
Alignment:
Q  538 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 636  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  2390301 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataactcatat-atagtggattgga 2390397  T
Q  637 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  2390398 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgt 2390461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4873721 - 4873483
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtg-ccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| || |||  ||     
T  4873721 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtaagatagt-ttg 4873623  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | |    
T  4873622 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacaattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-ttccttgggtccg 4873524  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
      ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  4873523 ttgcaaatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatt 4873483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608901
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 29608834  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29608835 catt-gatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 29608901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 574 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358058
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 32358071  T
Q  674 ccgaactgggtga 686  Q
    |||||||||||||    
T  32358070 ccgaactgggtga 32358058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 368 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 47676465 - 47676119
Alignment:
Q  368 taagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-agagagagacttggggaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagta 464  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  47676465 taagtgttctt-tgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 47676369  T
Q  465 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 554  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || ||||| |||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47676368 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt 47676269  T
Q  555 tgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctc 653  Q
     |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||| |    
T  47676268 -gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-atgatagtggaatggagagatcaatctctcccc 47676172  T
Q  654 cagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||    
T  47676171 catattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 47676119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 685
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432134
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6432068  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtg 685  Q
    | || |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432069 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Original strand, 48489431 - 48489616
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |  |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||    
T  48489431 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gcaataact 48489528  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  48489529 cattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgtt 48489616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 450 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673953
Alignment:
Q  450 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 539  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||    
T  47674189 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgg 47674091  T
Q  540 gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggaga 638  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47674090 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggaga 47673994  T
Q  639 gtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 681  Q
    |  |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  47673993 gatcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153513
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 8153439  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  8153440 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 31733137 - 31732966
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  31733137 ttggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 31733040  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    || |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  31733039 ca-ttgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146390
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36146479  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36146478 catt-gatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36146390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 38671506 - 38671204
Alignment:
Q  412 acttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 508  Q
    ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  38671506 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaat 38671409  T
Q  509 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgt 599  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||    
T  38671408 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgt 38671310  T
Q  600 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  38671309 atcacttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggt 38671214  T
Q  700 gtatttgttt 709  Q
    || |||||||    
T  38671213 gtgtttgttt 38671204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 2361043  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361042 catt-gatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253510
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactc 4253598  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||||||    
T  4253597 a-ttgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 4253510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586323
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctcttt-gtaagaact 4586258  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||||||||    
T  4586259 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Original strand, 26417316 - 26417501
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26417316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26417413  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  26417414 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgtt 26417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259159
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||| |||     
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaaaaacc 3259092  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3259093 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtga 3259159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508710
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 4508777  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    || |||| ||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4508776 ca-ttgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 4508710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599338
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| ||    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg-aagagct 48599405  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  48599404 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtga 48599338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 345
Target Start/End: Original strand, 31109067 - 31109309
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgcc-gtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||  | ||||| || ||||| |     
T  31109067 aaatgttgaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtggcacgatttcaagtgcctgtaagctaagt 31109166  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||| | |||||||     
T  31109167 ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtataactgataaggacttgtc-tgccttgggg 31109265  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    | |  ||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  31109266 ccgttgcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatt 31109309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 43864244 - 43864406
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  43864244 ttggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 43864341  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43864342 aatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 43864406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 368 - 709
Target Start/End: Original strand, 1113495 - 1113843
Alignment:
Q  368 taagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagta 464  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  1113495 taagtgtttctgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 1113592  T
Q  465 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtt 554  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  1113593 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggtt 1113692  T
Q  555 tgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctc 653  Q
     |||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| |    
T  1113693 -gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtagattggagagatcaatctctcccc 1113789  T
Q  654 cagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || | |||||||||||| ||||||| || || | |||||| ||||||| |||||||    
T  1113790 catattaggtcaagttt-gaccgaattgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 1113843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 291
Target Start/End: Original strand, 24023818 - 24024003
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgcc-gtgagctagggtt 204  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||  | ||| | | |||||||  ||    
T  24023818 atgttgatattagcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtggcacgatttcaagtggcagagagctagt-tt 24023916  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
     ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24023917 gcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtc 24024003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Original strand, 48408411 - 48408619
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  48408411 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 48408509  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  || ||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||  ||| |||  | |||||    
T  48408510 tcgtgacacgatcttgagaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctaggataaggactggtcgtaccttgtaacgtacgtaccaatcg 48408609  T
Q  316 tgacacgatt 325  Q
    ||||||||||    
T  48408610 tgacacgatt 48408619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 496148 - 495965
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  496148 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggta-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttta-taagaactcat 496051  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| | | | ||||||||| |||||| |||| |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  496050 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaag-ttggacagaaccgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 495965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 752 - 858
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790333
Alignment:
Q  752 gtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccac 851  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattacttgcac---gcactttgtttggtggttaccactttccgttgctccac 24790326  T
Q  852 acatcat 858  Q
    |||||||    
T  24790327 acatcat 24790333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 574 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359941
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| | ||||||||| |||||    
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttgga 6359969  T
Q  674 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
     |||||||||| | |||| |||||||||    
T  6359968 tcgaactgggtcaacaatttcttggtgt 6359941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 523 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 31105558 - 31105399
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||     
T  31105558 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaagaactca- 31105462  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31105461 ttgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggt 31105399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 539 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565069
Alignment:
Q  539 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 637  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 23565113  T
Q  638 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    ||  |||||||||  | ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  23565112 agatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 24265674 - 24265861
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||   |||| || |||||||||| | ||||||||||||  | |  || |||||||| | |    
T  24265674 aaatgttggaattgacttcaaattagtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagtcgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtt 24265773  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24265774 tgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 24265861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 520 - 679
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344130
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttagtatatc-tttgtgagaactc 23344073  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaac 679  Q
    | |||||| | |||||||||    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23344074 a-ttgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagtaggtcaag-ttggaccgaac 23344130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 545 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759207
Alignment:
Q  545 aattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtaca 643  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  2759339 aattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagatatca 2759243  T
Q  644 atctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaact 680  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2759242 atctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 2759207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 574 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 4510661 - 4510552
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  4510661 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttataagaactca-ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttgga 4510565  T
Q  674 ccgaactgggtga 686  Q
    ||| |||||||||    
T  4510564 ccgtactgggtga 4510552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 574 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 4512503 - 4512394
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  4512503 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttataagaactca-ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttgga 4512407  T
Q  674 ccgaactgggtga 686  Q
    ||| |||||||||    
T  4512406 ccgtactgggtga 4512394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 525 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 22328556 - 22328395
Alignment:
Q  525 gagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||| ||| |    
T  22328556 gagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtca-t 22328458  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    | |||||||||| |||||  |||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  22328457 taatagtggatttgagagatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 12098027 - 12097849
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||        ||||    
T  12098027 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct--------aact 12097937  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  12097936 c-tttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 12097849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12397380 - 12397267
Alignment:
Q  232 tgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacga-ttgggaa 330  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |    
T  12397380 tgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgttgcaaatcgtgacacgatttgggga 12397282  T
Q  331 aatcgtgacacgatt 345  Q
    ||||||| |||||||    
T  12397281 aatcgtggcacgatt 12397267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12397495 - 12397417
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgatt 182  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12397495 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgcgacacgattttggtatcgtgacacgatt 12397417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 24260926 - 24261005
Alignment:
Q  212 gcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24260926 gcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 24261005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 606 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 24525584 - 24525484
Alignment:
Q  606 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtattt 705  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||| ||||||| |||    
T  24525584 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggtcaataatct-ttggtgtgttt 24525488  T
Q  706 gttt 709  Q
    ||||    
T  24525487 gttt 24525484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 582 - 682
Target Start/End: Original strand, 31518965 - 31519063
Alignment:
Q  582 ttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctccagaataggtcaagtttggaccgaact 680  Q
    |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31518965 ttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaact 31519061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 36574683 - 36574522
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||    
T  36574683 ttggagagattggggaaagg-tagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactc 36574585  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    | |||||||||| ||||||||  |||||  ||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  36574584 a-ttgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-tttggaccaaactgggt 36574522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47264254 - 47264102
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||| || |   || |||||||| || ||  ||||||  |||    
T  47264254 cttcaaatttgtggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattttgtaatgtcgtgagct-ggtttgtagggtgtcaaa 47264156  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 271  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  47264155 tcgtggcacaattgtgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagt 47264102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 621 - 684
Target Start/End: Original strand, 30814536 - 30814598
Alignment:
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30814536 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 30814598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 1360316 - 1360243
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccctttt 597  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  1360316 tgagattgggaaaaaggtagaaattaggttttg-tcttggagaacttgttgaagcgaatttcttgtaaccctttt 1360243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24515089 - 24514934
Alignment:
Q  368 taagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagta 464  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| |||||||||||||     
T  24515089 taagtgttctt-tgcagattttgaaggggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 24514993  T
Q  465 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 522  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||    
T  24514992 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 24514934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 180
Target Start/End: Original strand, 1532897 - 1532958
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  1532897 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacga 1532958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18390520 - 18390479
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagg 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18390520 aatcgtgccacgattggaggtgccgtgagctagggttgcagg 18390479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16880555 - 16880476
Alignment:
Q  212 gcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||   |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16880555 gcaaaatcgtgtcacgatcttgggaaattgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc 16880476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16885410 - 16885331
Alignment:
Q  212 gcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||   |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16885410 gcaaaatcgtgtcacgatcttgggaaattgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc 16885331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18390565 - 18390506
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgatt 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| || |||||||    
T  18390565 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttagaagaacagggaaatcgtgccacgatt 18390506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 621 - 684
Target Start/End: Original strand, 18396418 - 18396481
Alignment:
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  18396418 ttgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggt 18396481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 621
Target Start/End: Original strand, 31518795 - 31518896
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaactt-gtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||| |||  | |||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31518795 ttggtgagattgggaaaataggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31518892  T
Q  618 catt 621  Q
    ||||    
T  31518893 catt 31518896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 592; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 3185 - 2398
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  3185 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 3086  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3085 aggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtattcttgataaggactggtcgttccttgggacgg 2987  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttggaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  2986 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttggaa 2887  T
Q  405 gagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2886 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 2789  T
Q  505 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2788 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatccc 2690  T
Q  605 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat 703  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |    
T  2689 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttttgtgttt 2590  T
Q  704 -ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 802  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2589 attgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 2492  T
Q  803 gcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  2491 gcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgaccttggag 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 12647967 - 12647180
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  12647967 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 12647868  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647867 aggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccataaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 12647769  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttggaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  12647768 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttggaa 12647669  T
Q  405 gagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12647668 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 12647571  T
Q  505 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatccc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12647570 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatccc 12647472  T
Q  605 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat 703  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  12647471 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgttt 12647372  T
Q  704 -ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 802  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647371 attgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 12647274  T
Q  803 gcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  12647273 gcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 12647180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 858
Target Start/End: Original strand, 6266283 - 6267023
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||  |||||||||| |||  | | ||||||||||| || || ||||||||    
T  6266283 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacatggaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacaatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 6266381  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |    
T  6266382 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttactcgttaagtttccatgataaggaatggtcgtttcttgggacgaacgcacca 6266481  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga--agagag 409  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||||||||||  | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||  ||||||    
T  6266482 atcgtgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggaga-gtgggaagagagag 6266579  T
Q  410 agacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaat 508  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6266580 agacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaat 6266679  T
Q  509 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6266680 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttt 6266778  T
Q  608 tgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt-atttg 706  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  6266779 tgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttg 6266877  T
Q  707 ttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgctt 806  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  6266878 ttttcttcttccctctcc--gtttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgttttgttgatttttgctt 6266974  T
Q  807 gcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
     |||   || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6266975 acac---acactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatcat 6267023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 500 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 13656220 - 13655816
Alignment:
Q  500 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgt 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13656220 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgt 13656122  T
Q  600 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt-gg 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13656121 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgg 13656022  T
Q  699 tgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 797  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656021 tgtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 13655922  T
Q  798 ttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggaga 897  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||     
T  13655921 ttcttgcttgcacaatatactctgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgaccttggagg 13655822  T
Q  898 tccggg 903  Q
    ||||||    
T  13655821 tccggg 13655816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4484910 - 4484211
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggagg-tgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||  || |||||||| |||    
T  4484910 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaa 4484812  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |  | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||    
T  4484811 tcgtgacacgatcttaaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgtaccaatcg 4484712  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga--c 413  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||  |    
T  4484711 tgacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaagagag-ttggaagagagagaaac 4484614  T
Q  414 ttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 511  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || |  ||||||    
T  4484613 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcat 4484515  T
Q  512 tgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||      |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4484514 tgagtgtcttgttcttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 4484416  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||     
T  4484415 tcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatct-ttggtgtc 4484318  T
Q  703 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttg-ctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttc 800  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |  ||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||     
T  4484317 tttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtggtttttgcttttcac-tttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgatta 4484221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Original strand, 32289161 - 32289853
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  32289161 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 32289259  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    || || ||||||  || | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||    
T  32289260 tcttgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgctccaatcg 32289359  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga-- 412  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||  | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||      
T  32289360 tgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-ggagat-ggaagagagagaaa 32289456  T
Q  413 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 510  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||   || || |||||    
T  32289457 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 32289555  T
Q  511 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttg 609  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32289556 ttgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 32289653  T
Q  610 taagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgtt 708  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  32289654 taagaactcatt-gatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgtt 32289752  T
Q  709 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgctt 806  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  32289753 ttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgctt 32289849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Original strand, 30832934 - 30833633
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || || || ||||  ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  30832934 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttgacatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 30833032  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  30833033 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 30833132  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga--c 413  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||  |    
T  30833133 tgacacgacttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggtgagct-ggaagagaaagaaac 30833230  T
Q  414 ttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 511  Q
    ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||| | |||||| |||   || |  ||||||    
T  30833231 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatcat 30833329  T
Q  512 tgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30833330 tgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatc 30833428  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||     
T  30833429 tcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtc 30833526  T
Q  703 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttc 800  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||     
T  30833527 tttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgatta 30833623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 107 - 382
Target Start/End: Original strand, 9295862 - 9296137
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||     
T  9295862 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttg 9295960  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  9295961 caggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtcgg 9296060  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactt-aagtgttcttgtgc 382  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  9296061 acgcaaatcgtgacacga-tctgaaaatcgtgacacgattgcttcagaggaagactagtatttaaagtgttcttgtgc 9296137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 404 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 4503424 - 4503017
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  4503424 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 4503327  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || ||||||||||||||||| |       |||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4503326 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 4503228  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
     |||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4503227 tcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 4503131  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
    || ||||||| |||||||   ||||  |||||||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4503130 ct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgtt 4503037  T
Q  791 -ttgttgtttcttgcttgca 809  Q
     |||||| || |||||||||    
T  4503036 attgttgattattgcttgca 4503017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 45099631 - 45099941
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  45099631 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 45099728  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45099729 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 45099827  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
     |||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45099828 tcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 45099924  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || ||||||| |||||||    
T  45099925 ct-ttggtgtgtttgttt 45099941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 5723546 - 5723237
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5723546 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5723449  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc 593  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  5723448 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacct 5723350  T
Q  594 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5723349 ttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 5723252  T
Q  694 cttggtgtatttgttt 709  Q
     ||||||| |||||||    
T  5723251 -ttggtgtgtttgttt 5723237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 404 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 36988367 - 36987961
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  36988367 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgag 36988270  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc 592  Q
     || |||||||||||||||||       ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||  |||||||||||||||     
T  36988269 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaact 36988171  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36988170 cttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 36988073  T
Q  693 tcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt- 790  Q
    | ||||||| |||||||   ||||  |||||||  |||||||| || |||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  36988072 t-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtta 36987978  T
Q  791 ttgttgtttcttgcttg 807  Q
    |||||| || |||||||    
T  36987977 ttgttgattattgcttg 36987961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 36205955 - 36205646
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   ||    
T  36205955 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgag 36205858  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 592  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36205857 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaact 36205759  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36205758 cttttgtatctctttg--aagaactcatt-gacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 36205662  T
Q  693 tcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||| |||||||    
T  36205661 t-ttggtgtgtttgttt 36205646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 2334709 - 2334399
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  2334709 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggta-tttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 2334612  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||| |||||     
T  2334611 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaact 2334513  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2334512 cttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatc 2334415  T
Q  693 tcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||| |||||||    
T  2334414 t-ttggtgtgtttgttt 2334399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14292125 - 14291844
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgat-tggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||     
T  14292125 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatctcgaggtgccgtgagctagt-ttg 14292027  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||  |     
T  14292026 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtaccactgataaggactggtcataccttgggttgt 14291927  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactta-agtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    ||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  14291926 acgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagattt 14291844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25410253 - 25409983
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||| | || || |||||||| |||    
T  25410253 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagat-ggtttgcagggtgccaaa 25410155  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  25410154 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaatggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 25410055  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||  | |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  25410054 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacaattttatcagaggaaggatgatatttaagtgttcttgtgcagattt 25409983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 407
Target Start/End: Original strand, 11098387 - 11098687
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||  ||     
T  11098387 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatagtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttg 11098485  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||  |     
T  11098486 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcaaaccttgggttgt 11098585  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactta-agtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaa 404  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||    ||||||||| |||| |  ||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  11098586 acgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagcatatattgtgttcttgtgcagatttgtagaagagcttggaa 11098684  T
Q  405 gag 407  Q
    |||    
T  11098685 gag 11098687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3492364 - 3492094
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  3492364 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 3492266  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  3492265 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattctgaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 3492166  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3492165 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacaattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 3492094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 6595175 - 6594987
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  6595175 ttggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaagaac 6595078  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  6595077 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 6594987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 34139936 - 34139752
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  34139936 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactca- 34139839  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  34139838 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 34139752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 520 - 790
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868133
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29867966  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 717  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||   ||||     
T  29867967 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct-ttgatgtgtttgtttctctctt- 29868062  T
Q  718 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
     ||||||  |||||||||||| |||| | |||| ||||  ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  29868063 -ctctcc--gtttatcttgtgcttgtggttttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 29868133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 538 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 723893 - 723726
Alignment:
Q  538 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 636  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  723893 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 723797  T
Q  637 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  723796 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 723726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 14633991 - 14633807
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14633991 gtgagattggtaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactca- 14633894  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||    
T  14633893 tagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 14633807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727093
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 45727026  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45727027 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 45727093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 38312240 - 38312411
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||    
T  38312240 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagatct 38312337  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  38312338 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38312411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 412 - 669
Target Start/End: Original strand, 42362236 - 42362500
Alignment:
Q  412 acttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 508  Q
    ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  42362236 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 42362333  T
Q  509 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgt 599  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  42362334 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 42362432  T
Q  600 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362433 atccc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 35447052 - 35446888
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  35447052 ttggtgagattggtaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 35446955  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35446954 catt-gatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 35446888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151573
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 11151662  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  11151661 c-ttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 11151573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773748
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 36773659  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36773660 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36773748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631736
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 1631803  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1631802 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 1631736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 525 - 684
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648335
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 623  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| |    
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcatt-g 33648274  T
Q  624 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  33648275 atagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 33648335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32247352 - 32247229
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | || |    
T  32247352 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgc 32247253  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgatt 230  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  32247252 tggatgcaaaatcgtggcacgatt 32247229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36317991
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36318080  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  36318079 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 36317991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 17057537 - 17057352
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17057537 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17057440  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  17057439 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 17057352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 17085520 - 17085335
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  17085520 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 17085423  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  17085422 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 17085335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 520 - 701
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398238
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaac 24398154  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  24398155 tca-ttgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaattacttggtgt 24398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40739444 - 40739178
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  40739444 cttcaaatttgtggtctggaagaacagacaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgttatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 40739346  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||  || | ||| | ||||| ||  | ||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  40739345 tcgtgacacgatcttgtggaattgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagttttcaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcg 40739246  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcag 384  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||  |||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  40739245 tgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattttatcagttgaagacttgtatttaagtgttcttgtgcag 40739178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 345
Target Start/End: Original strand, 39811477 - 39811715
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtg-ccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||| | | ||     
T  39811477 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtgaccgtaagc-aagtttg 39811575  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |    
T  39811576 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggacttgtc-tgccttggggccg 39811674  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
      ||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  39811675 ttgcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatt 39811715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Original strand, 11067305 - 11067491
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || | | |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  11067305 ttggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgtt-gtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 11067402  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  11067403 cattt-ataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 11067491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 33162618 - 33162432
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  33162618 ttggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctct-gtaagaact 33162521  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  33162520 catt-gatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 33162432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 682
Target Start/End: Original strand, 11690504 - 11690661
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||      
T  11690504 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaaatc-g 11690600  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  11690601 ttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactgg 11690661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 42288278 - 42288117
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||| ||    
T  42288278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttcttt-gtaagagct 42288181  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288180 catt-gataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 42288117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19345002 - 19344825
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||| || | |||||| | |||||||| ||||| |||| |||||||||| | | || | ||  ||    
T  19345002 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgatacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagc 19344903  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  19344902 aaaatcatggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 19344825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353346
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtat-ctttttgtaagtactc 26353282  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    | |||||||||||||||||||  || |||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26353283 a-ttgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggt 26353346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19349854 - 19349683
Alignment:
Q  120 ttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatc 219  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||   |||| || | | |||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | | || | ||  ||||||||    
T  19349854 ttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcaatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagcaaaatc 19349755  T
Q  220 gtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  19349754 gtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtc 19349683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 574 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17490261 - 17490154
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  17490261 aagctaatttcttgtaactcttttgtaactc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttgga 17490165  T
Q  674 ccgaactgggt 684  Q
    |||||||||||    
T  17490164 ccgaactgggt 17490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 520 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 7815441 - 7815323
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |    | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  7815441 ttggtgagattgagaaaaaggttgaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgtaagaactc 7815343  T
Q  619 atttgatagtggattggagag 639  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  7815342 attt-atagtggattggagag 7815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 520 - 655
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121901
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||||  |||||    
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc--tttgtatctc-tttgtagaaactc 13121865  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctcca 655  Q
    | |||||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  13121866 a-ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Original strand, 44310470 - 44310546
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgatt 182  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44310470 atgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatt 44310546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 11049550 - 11049716
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttca---tggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttgtaaga 614  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    | |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||    
T  11049550 ttggtgagattaggaaaatggtataaattagggtttgttctaatttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctc-tttgtaaga 11049648  T
Q  615 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||  ||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  11049649 actca-ttgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataataggtcaa-attggactgaactgggt 11049716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 621 - 693
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39285007
Alignment:
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 686
Target Start/End: Original strand, 7451173 - 7451281
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| | | ||||||||| |||||    
T  7451173 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga 7451269  T
Q  674 ccgaactgggtga 686  Q
     ||||||||||||    
T  7451270 -cgaactgggtga 7451281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 678
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  578 taatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccga 677  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcact-gacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccga 28672087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 621 - 693
Target Start/End: Original strand, 17450678 - 17450748
Alignment:
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  17450678 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 345
Target Start/End: Original strand, 28258733 - 28258889
Alignment:
Q  188 tgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 287  Q
    ||||||||||| || || |||||||  |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  |    
T  28258733 tgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaatcgtggcacaattttgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-tt 28258830  T
Q  288 ggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    |||||| ||||||| || |||||  ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  28258831 ggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatcgtggcacgatttggaaaa-cgtggcacgatt 28258889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 621
Target Start/End: Original strand, 24885669 - 24885762
Alignment:
Q  528 attgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  24885669 attgggaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta-cccctctgtaagaactcatt 24885762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 595
Target Start/End: Original strand, 24197906 - 24197974
Alignment:
Q  529 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgt--caagctaatttcttgtaaccctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  24197906 ttgggaaaagggtagaaattaaagttttttcttggagaacttgttgaaggctaatttcttgtaaccctt 24197974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 575; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 4313 - 3545
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4313 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattttaggtgccgtgagctagggt 4214  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4213 tgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 4115  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag---gag-g 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||| |    
T  4114 cggacgcaaatcgtgacacaattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcctgtgcagatttgaagtgagagagag 4015  T
Q  399 ttggaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta 498  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4014 ttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta 3915  T
Q  499 aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttg 598  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3914 --gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttg 3818  T
Q  599 tatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttg 697  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3817 tattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 3718  T
Q  698 gtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 796  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3717 gtgtttattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 3620  T
Q  797 tttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtatt 871  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3619 tttcttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtatt 3545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 565; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 896
Target Start/End: Original strand, 7122275 - 7123057
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcaggg-tgc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7122275 ttgtcttcaaatttgtggtgtggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcaggggtgc 7122374  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122375 aaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 7122473  T
Q  314 cgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagg--aggttggaagagagag 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  7122474 cgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaaggttgaaagagagag 7122573  T
Q  412 acttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 511  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122574 acttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 7122673  T
Q  512 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt- 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||     
T  7122674 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgta 7122772  T
Q  611 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttt 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    ||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  7122773 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttctttgtgtttattgttt 7122872  T
Q  710 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgca 809  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122873 tcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgca 7122970  T
Q  810 caatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  7122971 caataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 7123057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 903
Target Start/End: Original strand, 8395188 - 8395985
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8395188 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggt 8395287  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    | ||||| |||||| |||| ||||||||  || |||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  8395288 tgcaggggtgcaaa-tcgtagcacgatttgggaaaatcgtgacacaatccagaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcgtttcttgggt 8395386  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gagg-tt 400  Q
     | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  8395387 ggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagggtt 8395485  T
Q  401 ggaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaa 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8395486 ggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta-- 8395583  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8395584 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgta 8395682  T
Q  601 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtg 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8395683 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtg 8395782  T
Q  701 tat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 799  Q
    | | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395783 tttattgttttcttcttccctctccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 8395881  T
Q  800 cttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggagatc 899  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||    
T  8395882 tttgcttgcacaataaactttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggtcttggaggtc 8395981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 903
Target Start/End: Original strand, 8392982 - 8393776
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  8392982 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 8393081  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |     
T  8393082 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcttttcttgggtggt 8393180  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gagg-ttgga 403  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8393181 acgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagggttgga 8393279  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  8393280 agagagagacctgggaaatcaaaggggaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gag 8393377  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcc 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8393378 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcc 8393476  T
Q  604 cttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  8393477 cttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgttt 8393576  T
Q  704 -ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 802  Q
     ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393577 attgttttcttcttccctctccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 8393675  T
Q  803 gcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggagatccgg 902  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  8393676 gcttgcacaataaacttcgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggtctttgaggtccgg 8393775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 903
Target Start/End: Original strand, 5137872 - 5138673
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||    
T  5137872 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggt 5137971  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5137972 tgcaggggtgcaaa-tcgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttggg 5138070  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5138071 acggacgcaaatcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggtt 5138170  T
Q  401 ggaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaa 500  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  5138171 ggaagagagaaacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgt--a 5138268  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5138269 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgt 5138367  T
Q  600 atcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttgg 698  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5138368 attccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg 5138467  T
Q  699 tgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 795  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5138468 tgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgtt 5138564  T
Q  796 gtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatcc-gatcttgg 894  Q
    || |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  5138565 gtctcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgggtcttgg 5138664  T
Q  895 agatccggg 903  Q
    || ||||||    
T  5138665 aggtccggg 5138673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 903
Target Start/End: Original strand, 5135649 - 5136448
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||| |    
T  5135649 tgttgagattgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgc 5135748  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5135749 aggggtgcaaa-tcgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttgggacg 5135847  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttgga 403  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5135848 gacgcaaatcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttgga 5135947  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||    
T  5135948 agagagaaacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgt--aga 5136045  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtat 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5136046 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtat 5136144  T
Q  602 cccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtg 700  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5136145 tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtg 5136244  T
Q  701 tat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 797  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5136245 tttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttgt 5136341  T
Q  798 ttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatcc-gatcttggag 896  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  5136342 ctcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgggtcttggag 5136441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 403 - 896
Target Start/End: Original strand, 7124784 - 7125276
Alignment:
Q  403 aagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124784 aagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 7124883  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||     
T  7124884 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaa-cctcttgtatt 7124982  T
Q  603 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7124983 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctctttgtgt 7125082  T
Q  702 at-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 800  Q
     | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125083 ttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 7125180  T
Q  801 ttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  7125181 ttgcttgcacaataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttatattggtgtggttcgatccggccttggag 7125276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 115 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 31495893 - 31495143
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||||| || || ||||||||    
T  31495893 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 31495795  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  31495794 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgggacgaacgcacca 31495695  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagag 411  Q
    |||||||||| |   || ||||||||||||||||  | ||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  31495694 atcgtgacacaacctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctaatatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggaga-gttggaagagagag 31495597  T
Q  412 --acttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 507  Q
      ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  31495596 aaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatag-tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaa 31495498  T
Q  508 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ccttttgtatccct 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  31495497 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatta-ggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctct 31495399  T
Q  606 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtattt 705  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31495398 tttgtaagaactca-ttgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttt 31495300  T
Q  706 gttttcttcttccctctcctt------gtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
    |||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||| || ||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31495299 gttttcctcttccctctccttttatccttttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttttgttgat 31495201  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
    | |||||||||| | || ||||| ||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  31495200 tattgcttgcac-acacactttg-ttgatggttactactttcctttgctccacacatcat 31495143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 13992866 - 13992274
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | || |||||||| || || |||||||| |||    
T  13992866 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgtcgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 13992768  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |  |||||    
T  13992767 tcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcatgataaggactggtcataccttgtgacgtacgtatcaatcg 13992668  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttgga-agagagagac 413  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | ||||||| ||    
T  13992667 tgacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagcttgaagagagagaaac 13992569  T
Q  414 ttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 511  Q
    ||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||    
T  13992568 ttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 13992470  T
Q  512 tgagtgtcttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatccctttt 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  13992469 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt-- 13992373  T
Q  609 gtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  13992372 gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 13992275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 404 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 30000097 - 29999809
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||    
T  30000097 agagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgag 30000000  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc 593  Q
     || |||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  29999999 tgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactc 29999901  T
Q  594 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999900 ttttgtatcttttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 29999809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 299
Target Start/End: Original strand, 7124486 - 7124681
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  7124486 aaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtgtggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggt 7124585  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttg 299  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124586 tgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttg 7124681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24742577 - 24742277
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||     
T  24742577 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttg 24742479  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  24742478 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacctgggaacgg 24742379  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactta-agtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaa 404  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  24742378 acgcaaatcgtgccacgatctgg-aaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttgtaggagagcttggaa 24742280  T
Q  405 gag 407  Q
    |||    
T  24742279 gag 24742277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 56178928 - 56178618
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  56178928 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 56178831  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  56178830 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 56178732  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56178731 cttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 56178634  T
Q  693 tcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||| |||||||    
T  56178633 t-ttggtgtgtttgttt 56178618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18856312 - 18856125
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  18856312 aaatgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtt 18856213  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    | | || ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18856212 tgctggatgcaaaatcgtggcaagatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 18856125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51521050 - 51520793
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||| | ||     
T  51521050 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagcta-gtttg 51520952  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| | |    
T  51520951 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcatgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactgatc-taccttgggtcag 51520853  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||    
T  51520852 acgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacaattgcttcagaggaaggctagta 51520793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 48142918 - 48143230
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  48142918 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 48143015  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa 590  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48143016 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 48143114  T
Q  591 cccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 690  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  48143115 cccttttgtatctcttca-taagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaa 48143212  T
Q  691 tctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  48143213 tct-ttggtgtgtttgttt 48143230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 52095530 - 52095344
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |    
T  52095530 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaat 52095433  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  52095432 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaat-ttttggtgtgtttgttt 52095344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 345
Target Start/End: Original strand, 56141509 - 56141750
Alignment:
Q  105 aatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgatt-ggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |    
T  56141509 aatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttggaggggtcgtgagctagt-t 56141607  T
Q  204 ttcagggtgc-aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    | ||||  || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||     
T  56141608 tgcaggacgccaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggt 56141706  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    | || ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  56141707 cagatgcaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtggcacgatt 56141750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 539 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 5370232 - 5369968
Alignment:
Q  539 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 636  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  5370232 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggactaga 5370136  T
Q  637 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttg 736  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||   ||||  |||||||  ||||||||     
T  5370135 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct-ttgatgtgtttgtttatctctt--ctctcct--tttatcttt 5370041  T
Q  737 tgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttg 807  Q
    || |||| | |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  5370040 tgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 5369968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 404 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 9927749 - 9927441
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  9927749 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 9927652  T
Q  502 agagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || ||||| ||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9927651 tgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 9927553  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 692  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |||||    
T  9927552 catttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatc 9927456  T
Q  693 tcttggtgtatttgtt 708  Q
    | ||||||| ||||||    
T  9927455 t-ttggtgtgtttgtt 9927441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 524 - 701
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209894
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcat 2209814  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    | |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209815 t-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 2209894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Original strand, 45347324 - 45347501
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | || | || |||    
T  45347324 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacaaagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattagagatgccgtgagccaagtttgctggatgc 45347423  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  45347424 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 45347501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739533
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtatgaact 12739621  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12739620 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12739533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29761197 - 29761040
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgt 266  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  29761197 aatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgt 29761099  T
Q  267 taagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgatt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29761098 taagtatccttgataaggactggtcataccttggtacggacgcaaatcgtggcacgatt 29761040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaac 41964512  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964513 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 520 - 701
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364415
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 26364333  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||    
T  26364334 catta-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttcttggtgt 26364415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 520 - 701
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883199
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54883117  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  54883118 catt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 54883199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 539 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743908
Alignment:
Q  539 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 637  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12743977  T
Q  638 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12743976 agatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12743908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 539 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745297
Alignment:
Q  539 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 637  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12745366  T
Q  638 agtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  12745365 agatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 12745297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175619
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26175707  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  26175706 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 26175619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 404 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 34570706 - 34570397
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||    |    
T  34570706 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtagctttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtga 34570609  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34570608 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 34570510  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||    
T  34570509 ccaattgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaat 34570413  T
Q  692 ctcttggtgtatttgtt 708  Q
    || ||||||| ||||||    
T  34570412 ct-ttggtgtgtttgtt 34570397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 345
Target Start/End: Original strand, 9228683 - 9228924
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggt-gccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||  |     
T  9228683 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagct-cgt 9228781  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||     
T  9228782 ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggt 9228880  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    | |  ||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  9228881 ccgttgcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatt 9228924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36463460  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36463459 c-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 324
Target Start/End: Original strand, 9223899 - 9224115
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggt-gccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| | ||     
T  9223899 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagcta-gtttg 9223997  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |    
T  9223998 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccg 9224096  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgat 324  Q
      ||| |||||||||||||    
T  9224097 ttgcagatcgtgacacgat 9224115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Original strand, 28467990 - 28468217
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  28467990 cttcaaatttgtggtatggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtaacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 28468088  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||    
T  28468089 tcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtacaaatcg 28468188  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  28468189 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacgatt 28468217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994686
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaact 36994621  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36994622 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggt 36994686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 404 - 681
Target Start/End: Original strand, 37740502 - 37740784
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || |  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  37740502 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaagtttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 37740599  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 592  Q
     || ||||| |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37740600 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 37740698  T
Q  593 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 681  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37740699 catttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactg 37740784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 522 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147373
Alignment:
Q  522 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 619  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||     
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactc- 46147461  T
Q  620 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  46147460 tttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 46147373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703666
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 46703597  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||    
T  46703598 tcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtga 46703666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639590
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 41639523  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41639524 catc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 41639590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 669
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8665505  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8665506 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687164
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctattt-gtaagaact 45687253  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  45687252 catt-gatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 45687164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 4587958 - 4588121
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||| | || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4587958 ttggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 4588056  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  4588057 catt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaag-ttggaccaaactgggt 4588121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18860521 - 18860403
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  18860521 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgc 18860422  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggca 225  Q
     || |||||||||||||||    
T  18860421 tggatgcaaaatcgtggca 18860403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 48893810 - 48893620
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggt----gaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaag 613  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  48893810 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaag 48893713  T
Q  614 aactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  48893712 aactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 48893620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 523 - 682
Target Start/End: Original strand, 379383 - 379541
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  379383 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaagaactaat 379480  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  379481 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgg 379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 522 - 701
Target Start/End: Original strand, 12119540 - 12119719
Alignment:
Q  522 ggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 619  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||    
T  12119540 ggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactca 12119639  T
Q  620 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||   |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  12119640 ttt-atagtggattggagagatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtgt 12119719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648303
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8648236  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8648237 catt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 8648303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073557
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 12073489  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||| |||||    
T  12073490 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtga 12073557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 5429679 - 5429850
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  5429679 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 5429776  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5429777 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416974
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 27417036  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 681  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27417035 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 27416974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 574 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 50262814 - 50262689
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||| ||||||||| |||||||   |||||    
T  50262814 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttgga 50262717  T
Q  674 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50262716 ccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 50262689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54199926
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 54199977  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    || ||||||||| ||| |||||  || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54199976 ca-ttgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagtt 54199926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632607
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 40632542  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||    
T  40632543 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggt 40632607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5733247 - 5733062
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||   | | ||     
T  5733247 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgaagcaagtttg 5733148  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||  || |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  5733147 caggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 5733062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 538 - 686
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656120
Alignment:
Q  538 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 636  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 6656071  T
Q  637 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6656072 gagatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtga 6656120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 706
Target Start/End: Original strand, 5871820 - 5872003
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||    
T  5871820 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcacttt-gcaagaact 5871917  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg 706  Q
    | |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  5871918 c-tttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg 5872003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 574 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 50673960 - 50673851
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50673960 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 50673864  T
Q  674 ccgaactgggtga 686  Q
    ||||||| |||||    
T  50673863 ccgaactaggtga 50673851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 52467519 - 52467336
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||  |    
T  52467519 gtgaggttgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaataactt-t 52467423  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  52467422 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 52467336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229731
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctc-tttgtaagaact 37229792  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaact 680  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||    
T  37229791 cattt-atagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaact 37229731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038393
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||  | ||||||| |  |||||||| ||||    
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-tcatttgtat-ctgtttgtaaggactc 47038481  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  47038480 a-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 47038393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 6542349 - 6542161
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6542349 ttggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctcttt-gtaagaac 6542251  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  6542250 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atttcttggtgtgtttgttt 6542161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 12747924 - 12747794
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| |||||    
T  12747924 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtatgaact 12747827  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcc 651  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12747826 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 539 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744078
Alignment:
Q  539 ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 637  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggag 12744099  T
Q  638 agtacaatctctcctccagaa 658  Q
    ||  |||||||| | ||||||    
T  12744098 agatcaatctcttccccagaa 12744078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 12745604 - 12745467
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  12745604 ttggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 12745507  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaa 658  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  12745506 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctcttccccagaa 12745467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 527 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207848
Alignment:
Q  527 gattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 625  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | ||| |  |||||||||||||| |||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatat-ctatttgtaagaactca-ttgat 5207906  T
Q  626 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  5207905 agtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggt 5207848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3814605 - 3814422
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtg-ccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||| | | ||     
T  3814605 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtgaccgtaagc-aagtttg 3814507  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    || |  || |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3814506 caagacgccaaatcgtgtcacgatt-tgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 3814422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 291
Target Start/End: Original strand, 45356861 - 45356982
Alignment:
Q  170 tcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaa 269  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | | || | || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||    
T  45356861 tcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgctggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 45356960  T
Q  270 gtatccttgataaggactggtc 291  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  45356961 gtatcactgataaggactggtc 45356982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 52082825 - 52082645
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  52082825 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaaat 52082728  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | ||||||||||       |||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  52082727 c-tttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 52082645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Original strand, 31474150 - 31474337
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |  |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31474150 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31474248  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || |||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||    
T  31474249 ca-ttgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaac-atatcttggtgtgtttgttt 31474337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 388
Target Start/End: Original strand, 31985236 - 31985389
Alignment:
Q  236 aaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaat 333  Q
    |||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  31985236 aaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgcatcaatcgtgacacgatttgg-aaat 31985334  T
Q  334 cgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||| |||||||  | |||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31985335 cgtggcacgattttatcagttgaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 31985389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 574 - 681
Target Start/End: Original strand, 35662496 - 35662600
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  35662496 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttgga 35662592  T
Q  674 ccgaactg 681  Q
    ||||||||    
T  35662593 ccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 535 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 26699596 - 26699447
Alignment:
Q  535 aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 633  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  26699596 aaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattt-ataatggatt 26699498  T
Q  634 ggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||||||  ||||||||   ||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  26699497 ggagagatcaatctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 287
Target Start/End: Original strand, 18712296 - 18712435
Alignment:
Q  148 aaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtg-ccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgaca 246  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  18712296 aaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgaca 18712394  T
Q  247 cgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 287  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18712395 cgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 18712435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 51337064 - 51337226
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggg-tttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | |||| ||| | ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51337064 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttctttgtgagctttt-aagataatttattataacccttttgtatctctttt-taagaact 51337161  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    || ||||||||| ||| |||||  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  51337162 ca-ttgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 51337226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 578 - 708
Target Start/End: Original strand, 29254553 - 29254679
Alignment:
Q  578 taatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccga 677  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||    
T  29254553 taatttcttgcaacccatttgtgtctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccga 29254649  T
Q  678 actgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  29254650 actgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 29254679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 639
Target Start/End: Original strand, 24969112 - 24969230
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  24969112 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 24969209  T
Q  618 catttgatagtggattggagag 639  Q
     | |||||||||||||||||||    
T  24969210 -aattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 581 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 13009550 - 13009464
Alignment:
Q  581 tttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||    
T  13009550 tttcttgtaaaacatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagtt 13009464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 574 - 651
Target Start/End: Original strand, 3913503 - 3913578
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 651  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3913503 aagctaatttcttttaacccatttgtatatcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 3913578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 520 - 609
Target Start/End: Original strand, 41639263 - 41639353
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttg 609  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41639263 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttttg 41639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142444
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||   |||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaactcatt 48142444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 607
Target Start/End: Original strand, 1983252 - 1983324
Alignment:
Q  534 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 607  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1983252 aaaaggatagaaattatgttttgttctttgtgagcttg-caagctaatttcttgtaacccctttgtatcacttt 1983324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 663
Target Start/End: Original strand, 33089933 - 33090021
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggt 663  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  33089933 aagctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 550; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 105 - 903
Target Start/End: Original strand, 6026832 - 6027627
Alignment:
Q  105 aatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| || |||||||  || || |||||||||||  ||||||| | ||||||||||    
T  6026832 aatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaatagggaaatcgtgacacgattgcggcattgtgacacgatttcgaggtgc-gagagctagggt 6026930  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6026931 tgcaggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttggga 6027029  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6027030 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttg 6027129  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6027130 gaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--g 6027227  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6027228 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat 6027326  T
Q  602 cccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtg 700  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6027327 cccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtg 6027426  T
Q  701 tat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 799  Q
    | | ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027427 tttattgttttcttcttccctc--cat-tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttt 6027523  T
Q  800 cttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggagatc 899  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  6027524 cttgcttgcacaatacaccttgttaggtggttacccctctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccagtcttggagatc 6027623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 215 - 896
Target Start/End: Original strand, 25421000 - 25421680
Alignment:
Q  215 aaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 314  Q
    |||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421000 aaatcgtgacatgattg-ggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatc 25421098  T
Q  315 gtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttggaagagagagac 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25421099 gtgacatgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaaagaggttggaagagagagac 25421198  T
Q  414 ttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattg 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421199 ttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattg 25421298  T
Q  514 agtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt-aa 612  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  25421299 agtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaa 25421397  T
Q  613 gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttc 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  25421398 gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttc 25421497  T
Q  712 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 811  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421498 ttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 25421595  T
Q  812 atactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  25421596 ataaactttgttcggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccggccttggag 25421680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 33342688 - 33341889
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||   | ||||||||||||||||| |    
T  33342688 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacatggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacgcgatttcggatgccgtgagctagggttgc 33342589  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattg-tgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342588 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 33342490  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gaggttgga 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  33342489 gacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaatttgga 33342390  T
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33342389 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agag 33342292  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  33342291 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtact 33342193  T
Q  603 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33342192 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 33342093  T
Q  702 at-ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342092 ttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 33341995  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatcc-gatcttggaga 897  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||     
T  33341994 tcttgcttgcacaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgggtcttggagg 33341895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 896
Target Start/End: Original strand, 34166663 - 34167454
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||    
T  34166663 aaatgttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggt 34166762  T
Q  204 ttcaggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 301  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34166763 tgcaggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggg 34166861  T
Q  302 acggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttg 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  34166862 acgtacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagggttg 34166961  T
Q  402 gaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34166962 aaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 34167059  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgta 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34167060 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgta 34167158  T
Q  601 tcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggt 699  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  34167159 ttccttttgtaaagaacttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgt 34167258  T
Q  700 gtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34167259 gtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgttgtt 34167356  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccgatcttggag 896  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  34167357 ttttgcttgctcaatattttttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgaccttggag 34167454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 862
Target Start/End: Original strand, 16554451 - 16555207
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||     
T  16554451 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg- 16554549  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16554550 ttacagggtgcaaaattgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggt 16554649  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttg 401  Q
     | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16554650 ggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagaagagttg 16554748  T
Q  402 gaag--agagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaa 499  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554749 gaagtgagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaa 16554848  T
Q  500 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16554849 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgt 16554947  T
Q  600 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttgg 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16554948 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgg 16555047  T
Q  699 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555048 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 16555146  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatt 862  Q
    | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16555147 tgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatt 16555207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 862
Target Start/End: Original strand, 16631007 - 16631763
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||     
T  16631007 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg- 16631105  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16631106 ttacagggtgcaaaattgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggt 16631205  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttg 401  Q
     | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16631206 ggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagaagagttg 16631304  T
Q  402 gaag--agagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaa 499  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631305 gaagtgagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaa 16631404  T
Q  500 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16631405 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgt 16631503  T
Q  600 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttgg 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16631504 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgg 16631603  T
Q  699 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 798  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631604 tgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 16631702  T
Q  799 tcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatt 862  Q
    | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16631703 tgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatt 16631763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 16579101 - 16578348
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||     
T  16579101 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttg 16579003  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  16579002 cagggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggt 16578903  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttggaa 404  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  16578902 acgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagggtagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagaggagttggaa 16578804  T
Q  405 g--agagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16578803 gtgagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaaga 16578704  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16578703 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatc 16578605  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgt 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16578604 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgt 16578505  T
Q  702 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16578504 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgt 16578406  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatt 862  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16578405 tgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatt 16578348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 862
Target Start/End: Original strand, 16616279 - 16617032
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||     
T  16616279 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttg 16616377  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  16616378 cagggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggt 16616477  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttggaa 404  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  16616478 acgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagggtagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagaggagttggaa 16616576  T
Q  405 g--agagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16616577 gtgagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaaga 16616676  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16616677 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatc 16616775  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgt 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16616776 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgt 16616875  T
Q  702 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16616876 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgt 16616974  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatt 862  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16616975 tgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatt 16617032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 887
Target Start/End: Original strand, 34164452 - 34165223
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcaggg-tgc 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  34164452 ttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattctgggatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc 34164551  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 312  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164552 aaa-tcgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 34164650  T
Q  313 tcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga 412  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  34164651 tcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagggttgaaagagagaga 34164750  T
Q  413 cttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 512  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34164751 cttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagagaatcatt 34164848  T
Q  513 gagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt- 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||     
T  34164849 gagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgta 34164947  T
Q  611 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttt 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  34164948 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttt 34165047  T
Q  710 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34165048 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 34165144  T
Q  809 acaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
     |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34165145 tcaataagcttggtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 34165223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 862
Target Start/End: Original strand, 16652758 - 16653450
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgt 266  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16652758 aatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaggttgt-agggtgcaaagtcgtggaacgatttgggaaaatcgtgacacaatcgtgaaacttgctcgt 16652856  T
Q  267 taagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtac 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  16652857 taagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta- 16652955  T
Q  367 ttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttggaag--agagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagt 463  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652956 taaattgttcttgtgcagatttgaagagaagagttggaagtgagagagacttggagaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 16653055  T
Q  464 atctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatgg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16653056 atctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattg 16653155  T
Q  564 tgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggt 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  16653156 tgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggt 16653254  T
Q  664 caagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacactt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16653255 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacactt 16653353  T
Q  763 ggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatt 862  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16653354 gtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccactctccttggctccacacatcattatt 16653450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 859
Target Start/End: Original strand, 27647476 - 27648188
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||    
T  27647476 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgc 27647574  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  | ||||| ||    
T  27647575 aaaatcgtggcacgattgtgagaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgatattgactggtcgtttcttgggtggtacgcagat 27647674  T
Q  314 cgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga--agagagag 411  Q
    ||||||||                    ||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||    
T  27647675 cgtgacac--------------------gattgcaatagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagagagagag 27647753  T
Q  412 acttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 510  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  27647754 acttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgt--agagagaatca 27647851  T
Q  511 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27647852 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgt 27647950  T
Q  611 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtttt 710  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  27647951 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgcttttgtttt 27648049  T
Q  711 cttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcac 810  Q
    |||||||||||||||  |||||||||       ||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27648050 cttcttccctctcct--tttatcttg-------tgtattgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac 27648140  T
Q  811 aatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcatt 859  Q
     | || ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27648141 -acacactttgttcggtggttaccactctcctttgctccacacatcatt 27648188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 115 - 790
Target Start/End: Original strand, 411694 - 412369
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||| |||  | |||||||||||||||  |  ||||||||    
T  411694 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaatagggaaatcgtgacacgaatttggcattgtgacacaatttcgtggtgccgtgagctagtctg-cagggtgc 411792  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtg-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca-- 310  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||      
T  411793 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacc 411892  T
Q  311 aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagaga 410  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  411893 aatcgtgacacaatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaag-ggag-ttggaagagaga 411989  T
Q  411 ga--cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 507  Q
    ||  |||| | |||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  411990 gaaacttgagaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaa 412088  T
Q  508 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ccttttgtatccct 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  412089 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctct 412187  T
Q  606 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatt 704  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  412188 tttgtaagaactca-ttgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatt 412286  T
Q  705 tgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  412287 tgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgtt 412369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 115 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 3073334 - 3072596
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| ||  | ||||||||    
T  3073334 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacaggaaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtctacagggtgc 3073236  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||  |    
T  3073235 caaatcgtgacacgattgttggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggatggatgcacta 3073136  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttggaagagaga 410  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||  | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  3073135 atcgttacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttg--gaagagagttggaagagaga 3073039  T
Q  411 gacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaat 508  Q
     ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  3073038 aacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaat 3072940  T
Q  509 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatccctt 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  3072939 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctctt 3072841  T
Q  607 ttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg 706  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3072840 ttgtaagaactcatt-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttg 3072742  T
Q  707 ttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggt-gttttgttgtttcttgct 805  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| || ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||| || |||||    
T  3072741 ttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctatgtgctatttttgttgattattgct 3072645  T
Q  806 tgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcat 858  Q
    |||||   || ||||| || |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  3072644 tgcac---acactttg-ttagtggttactactttcctttgctccacacatcat 3072596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 500 - 887
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13154280
Alignment:
Q  500 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttg 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13153893 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttg 13153991  T
Q  599 tatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttg 697  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13153992 tattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 13154091  T
Q  698 gtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 796  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13154092 gtgtttattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttg 13154189  T
Q  797 tttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13154190 tttcttgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 13154280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 107 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6136547 - 6136241
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  6136547 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggaatcgagacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 6136448  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 306  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136447 aggggtgaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 6136348  T
Q  307 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag--gaggttggaa 404  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6136347 agcaaatcgtgacacaattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtatttaagt-ttcttgtgcagatttgaagagaagaggttggaa 6136249  T
Q  405 gagagaga 412  Q
    ||||||||    
T  6136248 gagagaga 6136241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 120 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 2172090 - 2171512
Alignment:
Q  120 ttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||  | || || ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  2172090 ttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgggacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaat 2171992  T
Q  219 cgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtga 318  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |            
T  2171991 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtttccaagataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtacc------ 2171898  T
Q  319 cacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga-agagagagacttgg 417  Q
                |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | | | ||||||| ||||||    
T  2171897 ------------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggtgagctagaagagagagaaacttgg 2171810  T
Q  418 ggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgag 515  Q
    | |||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||    
T  2171809 gaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgag 2171711  T
Q  516 tgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatccctt 606  Q
    |||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2171710 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttt-gtatctctt 2171613  T
Q  607 ttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttg 706  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2171612 t-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttg 2171515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 331 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 6097800 - 6097285
Alignment:
Q  331 aatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga-agagagagacttggggaatcaaaggg 429  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   | | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6097800 aatcgtgacacgattttatcaggggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggtgagagagtagagagagaaacttgggaaatcaaaggg 6097701  T
Q  430 -gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgag 527  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||| ||||||||    
T  6097700 agcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttggtgag 6097601  T
Q  528 attgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 626  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           |||||||||| ||||    
T  6097600 attggaaaaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgta-----------agaactcatt-gata 6097514  T
Q  627 gtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttcttcttccctctcct 725  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6097513 gtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct 6097414  T
Q  726 tgtttatcttgtgattgttgctttgtg-tttcacacttggttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtt 823  Q
    ||  ||||||||||||| ||  ||||| |||  |||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||||||||   || ||||| |    
T  6097413 tg--tatcttgtgattg-tgtattgtgtttttccacttgttacctagattagatcaaggtgctgtttttgttgattatagcttgcac---acactttg-t 6097321  T
Q  824 tggtggttaccactctccgtcgctccacacatcatt 859  Q
    | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  6097320 tagtggttactactttccgttgctccacacatcatt 6097285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 107 - 344
Target Start/End: Original strand, 25420797 - 25421034
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| | ||||||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  25420797 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacaattttgggaccgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgc 25420896  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25420897 aggggtgcaaa-tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 25420995  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgat 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25420996 acgcaaatcgtgacatgattgggaaaatcgtgacacgat 25421034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 31404966 - 31404656
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||    
T  31404966 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgag 31404868  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc 593  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31404867 tgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 31404769  T
Q  594 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31404768 ttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 31404671  T
Q  694 cttggtgtatttgttt 709  Q
     ||||||| |||||||    
T  31404670 -ttggtgtgtttgttt 31404656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 5406490 - 5406181
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5406490 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5406393  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc 593  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5406392 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 5406294  T
Q  594 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5406293 ttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 5406196  T
Q  694 cttggtgtatttgttt 709  Q
     ||||||| |||||||    
T  5406195 -ttggtgtgtttgttt 5406181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 5410815 - 5410506
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5410815 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5410718  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccc 593  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5410717 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 5410619  T
Q  594 ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5410618 ttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 5410521  T
Q  694 cttggtgtatttgttt 709  Q
     ||||||| |||||||    
T  5410520 -ttggtgtgtttgttt 5410506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 407
Target Start/End: Original strand, 5674242 - 5674530
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || || || ||||| ||||||||| ||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  5674242 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 5674340  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 317  Q
    ||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  5674341 tcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacgattttgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcataccttgggacgtacgcaaatcgtg 5674440  T
Q  318 acacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactt-aagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagag 407  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  5674441 acacgatctgg-aaatcgtgacacgattgtatcagaggaaggctagtatttaaagtgttcttgtgcagatttggaggagagcttggaagag 5674530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 115 - 327
Target Start/End: Original strand, 13150857 - 13151070
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcaggg-tgc 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  13150857 ttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc 13150956  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 312  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150957 aaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 13151055  T
Q  313 tcgtgacacgattgg 327  Q
    |||||||||||||||    
T  13151056 tcgtgacacgattgg 13151070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 441 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 16452583 - 16452310
Alignment:
Q  441 gtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgg 532  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||    
T  16452583 gtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg 16452486  T
Q  533 gaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtg 629  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  16452485 gaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttgg-aagaactcatt-gatagtg 16452389  T
Q  630 gattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  16452388 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 16452310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 437 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 30834794 - 30834517
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 528  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  30834794 tagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 30834697  T
Q  529 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 625  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  30834696 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gat 30834600  T
Q  626 agtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  30834599 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatct-ttggtgtgtttgttt 30834517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 5413682 - 5413376
Alignment:
Q  406 agagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagag 503  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | |||||| |||   || |    
T  5413682 agagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtg 5413585  T
Q  504 agaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccctt 595  Q
    | |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5413584 aaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctt 5413486  T
Q  596 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 695  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  5413485 ttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatct-t 5413390  T
Q  696 tggtgtatttgttt 709  Q
    |||||| |||||||    
T  5413389 tggtgtgtttgttt 5413376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 777 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 6136216 - 6136090
Alignment:
Q  777 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6136216 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacactttgtttggtggttaccactctccgttgctccacacatcattattctttgtattggtat 6136117  T
Q  877 gggtcgatccgatcttggagatccggg 903  Q
    || ||||||||  ||||||| ||||||    
T  6136116 ggttcgatccggccttggaggtccggg 6136090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22709632 - 22709362
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||  | | |||| |||||| || || |||||||| |||    
T  22709632 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcatgacacgaatttggcaacgtgacacgattttgtgatgccatgagct-ggtttgcagggtgccaaa 22709534  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac--gcaaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||   |||||||    
T  22709533 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacatacaaatcg 22709434  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||  |  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709433 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacgattttattagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 22709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 400 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 33160652 - 33160254
Alignment:
Q  400 tggaagagagaga---cttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacct 494  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| || | || ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  33160652 tggaagagagagaaaacttggggaatcaaaggaggtaactttagggttgagagt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacct 33160555  T
Q  495 tgtaaagagagaa-tcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaattt 583  Q
    ||   || || || ||||||||||||||       ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  33160554 tggtgagtgaaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaattt 33160456  T
Q  584 cttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactggg 683  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  33160455 cttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactggg 33160358  T
Q  684 tgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctag 782  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||   ||||  |||||||| |||||||| || |||| | |||||| ||  ||| ||| || |||||||||||||||    
T  33160357 tgaacaatct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcctt-tttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattactagattagatctag 33160262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6439083 - 6438899
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  6439083 tgttgaaattggcttcaaatttatggtctggaagaacatagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgc 6438984  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
     || |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6438983 tggatgcataatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctagttaagtatcactgataaggactggtc 6438899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589095
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21589028  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589029 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21589095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593828
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21593761  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593762 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21593828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 11857570 - 11857330
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggt-gccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| |     
T  11857570 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagcta-gt 11857472  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||   |||||||     
T  11857471 ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtaacactgataaggacttgtc-aaccttgggt 11857373  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    | |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  11857372 ccgttgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgatt 11857330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 520 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808699
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaac 616  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 3808780  T
Q  617 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttgg 698  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3808779 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctcttgg 3808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 520 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 9183199 - 9183015
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9183199 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9183102  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgt 707  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    
T  9183101 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgt 9183015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Original strand, 30125018 - 30125185
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||     
T  30125018 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagcta-gtttg 30125116  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatc 274  Q
    ||||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  30125117 caggacgccaaatcgtggcacgattttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatc 30125185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 168 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5266611 - 5266453
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgt 266  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||| |    
T  5266611 aatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcat 5266513  T
Q  267 taagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5266512 taagtatccttgataaggactggtcataccttgaaacggacgcaaatcgtgacacgattg 5266453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 686
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758188
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 17758123  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17758124 t-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtga 17758188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972943
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 2973010  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||||    
T  2973009 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtga 2972943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Original strand, 22010188 - 22010427
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtg-ccgtgagctagggtt 204  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||| || |||  ||    
T  22010188 atgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtaagttagt-tt 22010286  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| |     
T  22010287 gcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtcc 22010385  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    |  ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  22010386 gttgcaaatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatt 22010427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16839323 - 16839092
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||| || | |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | | || | ||  ||    
T  16839323 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagc 16839224  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 313  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |  ||| ||    
T  16839223 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc-aaccttgggaccgttgcagat 16839125  T
Q  314 cgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  16839124 cgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 16839092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763155
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttggaagaact 17763087  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17763088 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtga 17763155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 437 - 709
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569208
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgta-aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 534  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  535 aaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 632  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||             |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacc-------------tttgtaagaactcatt-gatagtggat 16569133  T
Q  633 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  16569134 tggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 16569208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 345
Target Start/End: Original strand, 28155132 - 28155309
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgtt 267  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  28155132 aatcgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagtttgcagggtgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggtt 28155231  T
Q  268 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    |||||||  |||||||||||||||   ||| ||||| |  ||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  28155232 aagtatctctgataaggactggtc-aacctggggaccgttgcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 28155309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 589 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 5409167 - 5409051
Alignment:
Q  589 aacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgacc 688  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5409167 aacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaac 5409071  T
Q  689 aatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  5409070 aatct-ttggtgtgtttgttt 5409051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Original strand, 14741923 - 14742106
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggt-gccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | || | ||||||||| |     
T  14741923 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggtcgtgagcta-gt 14742021  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 287  Q
    || ||||  || |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14742022 ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 14742106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137420
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 28137479  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 678  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28137478 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 28137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 522 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830127
Alignment:
Q  522 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 619  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||    
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctcttt-gtaagaactca 26830192  T
Q  620 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26830191 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtga 26830127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 802 - 887
Target Start/End: Original strand, 13159051 - 13159136
Alignment:
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13159051 tgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccg 13159136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Original strand, 33329940 - 33330117
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||| || | |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | | || | ||  ||    
T  33329940 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagc 33330039  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33330040 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33330117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424829
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc--ttttgtatcccttttgtaagaa 615  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaa 22424898  T
Q  616 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||   |||||||| |||||||||    
T  22424897 ctcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtga 22424829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 686
Target Start/End: Original strand, 5043630 - 5043792
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  5043630 gtgagattgagaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 5043727  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    | |||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||    
T  5043728 t-gatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 5043792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Original strand, 33335437 - 33335614
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||| |  | |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | | || | ||  ||    
T  33335437 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtttcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgctggaagc 33335536  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33335537 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33335614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038926
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 3038974  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaa 666  Q
    | ||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3038973 c-tttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 574 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 603201 - 603081
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  603201 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactc-gttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttgga 603105  T
Q  674 ccgaactgggtgaccaatctcttg 697  Q
    ||||||||||| | ||||||||||    
T  603104 ccgaactgggtcaacaatctcttg 603081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 523 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954283
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||    
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctcttt-gtaagaactcatt 26954353  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  26954352 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 33211353 - 33211182
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||    
T  33211353 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctcttt-gtaagaact 33211256  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33211255 cattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6005999 - 6005822
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | |||   |||| || | |||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | || | ||  ||    
T  6005999 attggcttcaaatttgtggtttggaaaaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccatgagccaagtttgctggaagc 6005900  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6005899 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 6005822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 574 - 682
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800748
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgg 672  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctcttt-gtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgg 26800738  T
Q  673 accgaactgg 682  Q
    ||||||||||    
T  26800739 accgaactgg 26800748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 520 - 639
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||   || |||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactc 4045522  T
Q  619 atttgatagtggattggagag 639  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  4045523 a-ttgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6097977 - 6097862
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||||| || || ||||||||    
T  6097977 ttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcctgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 6097879  T
Q  214 aaaatcgtggcacgatt 230  Q
     |||||||| |||||||    
T  6097878 taaatcgtgacacgatt 6097862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5343959 - 5343880
Alignment:
Q  212 gcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  5343959 gcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 5343880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Original strand, 14737174 - 14737246
Alignment:
Q  215 aaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 287  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14737174 aaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 14737246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 164
Target Start/End: Original strand, 16652713 - 16652773
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattt 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||    
T  16652713 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagggaaatcgtgacacgattt 16652773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6097858 - 6097803
Alignment:
Q  255 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca 310  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  6097858 aaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacctggggacgtacgca 6097803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Original strand, 34151836 - 34151931
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcaggg 210  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||   | ||||||||| ||||||| |||||    
T  34151836 ttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattctgggatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggg 34151931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23896944 - 23896881
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgatt 182  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23896944 cttcaaatttgtggtttgaaagaacagaaaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatt 23896881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 182
Target Start/End: Original strand, 26253598 - 26253665
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgatt 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26253598 ttgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacaagatt 26253665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Original strand, 14737085 - 14737142
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattt 164  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  14737085 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 14737142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 42575910 - 42575128
Alignment:
Q  106 atgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||   | ||||||||| |||||||     
T  42575910 atgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttg 42575811  T
Q  206 caggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 303  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42575810 caggggtgcaaa-tcgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtctttccttgggac 42575712  T
Q  304 ggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gag--gtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  42575711 ggacgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggagtt 42575612  T
Q  401 ggaagagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaa 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  42575611 ggaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--a 42575514  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgt 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42575513 gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgt 42575415  T
Q  600 atcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttgg 698  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42575414 attccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg 42575315  T
Q  699 tgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 796  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42575314 tgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgtttggttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttg 42575219  T
Q  797 tttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatccg 887  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  42575218 tttcttgcttgctcaataagctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattatagtttgtattggtgtggttcgatccg 42575128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 885
Target Start/End: Original strand, 25689603 - 25690313
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgtt 267  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25689603 aatcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtcacacgatcgtgaaacttgctcgtt 25689701  T
Q  268 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtact 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  25689702 aagtatccttgataaggactggtcgttccttggtttgtacacaaatcgtgacacgattgagaaaatcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagtatt 25689801  T
Q  368 taagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatc 466  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689802 taagtgttcttgtgcatctttgaagaagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatc 25689901  T
Q  467 tcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtga 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25689902 tcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtga 25690001  T
Q  567 acttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaa 666  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25690002 acttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaa 25690099  T
Q  667 gtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgg 764  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || || |||||||||| ||||||     
T  25690100 gtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctcccct--tttatcttgtgagtg-tgttttgtgtttctcacttgt 25690196  T
Q  765 ttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattct 864  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||    
T  25690197 ttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattcttgcttgcac-acacactttgtttggtggttaccactctcctttgctccacacatc---attct 25690292  T
Q  865 ttgtattggcgtgggtcgatc 885  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  25690293 ttgtattggtgtggttcgatc 25690313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 885
Target Start/End: Original strand, 3439085 - 3439861
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||     
T  3439085 aaatgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg- 3439183  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3439184 ttgcagggtgcaaaatcgtgacacgatt-tgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggt 3439282  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgg 402  Q
     | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  3439283 ggtacgcatatcgtggcacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttgg 3439381  T
Q  403 a----agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 497  Q
    |    ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439382 aagagagagagagacttgagaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 3439481  T
Q  498 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccctttt 597  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3439482 aaagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaa-cctttt 3439580  T
Q  598 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-tt 696  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  3439581 gtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctcttt 3439679  T
Q  697 ggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 796  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439680 ggtgcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 3439776  T
Q  797 tttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatc 885  Q
     || ||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||    
T  3439777 attgttgcttgcac---acactttgtttggtggttaccgctctccgtcgctccacacatcatt-tttttagtattggtgtggttcgatc 3439861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 903
Target Start/End: Original strand, 15290143 - 15290906
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||   | ||||||||| ||||||| |    
T  15290143 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggattgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttgc 15290242  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15290243 aggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtagttccttgggacg 15290341  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaa 404  Q
    ||||||||||                    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15290342 gacgcaaatc--------------------gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag---------- 15290411  T
Q  405 gagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 504  Q
       ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15290412 ---agagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gaga 15290506  T
Q  505 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcc 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  15290507 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattc 15290605  T
Q  604 cttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  15290606 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtt 15290705  T
Q  703 t-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15290706 tattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttct 15290803  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatcc-gatcttggagatcc 900  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| |||    
T  15290804 tgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgggtcttggaggtcc 15290903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 903
Target Start/End: Original strand, 15470512 - 15471275
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || | |||||||||   | ||||||||| ||||||| |    
T  15470512 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggattgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttgc 15470611  T
Q  207 aggg-tgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaa-tcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15470612 aggggtgcaaa-tcgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtagttccttgggacg 15470710  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaa 404  Q
    ||||||||||                    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15470711 gacgcaaatc--------------------gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagag---------- 15470780  T
Q  405 gagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 504  Q
       ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15470781 ---agagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gaga 15470875  T
Q  505 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcc 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  15470876 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtattc 15470974  T
Q  604 cttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  15470975 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtt 15471074  T
Q  703 t-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttct 801  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15471075 tattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttct 15471172  T
Q  802 tgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggcgtgggtcgatcc-gatcttggagatcc 900  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| |||    
T  15471173 tgcttgctcaataagctttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatcattattctttgtattggtgtggttcgatccgggtcttggaggtcc 15471272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Original strand, 2627331 - 2628024
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | | ||||||||| || || || ||||| |||    
T  2627331 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgattccgtgagct-ggtttgcatggtgccaaa 2627429  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  | | |    
T  2627430 tcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggattggtcgtttcttgtgacgtacgcaccatttg 2627529  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagagagaga--c 413  Q
    |||||||||  | ||| |||||||||||||  | |   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |    
T  2627530 tgacacgatctgtaaa-tcgtgacacgattttatcgttggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggagag-ttggaagagagagaaac 2627627  T
Q  414 ttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 511  Q
    ||||| |||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  2627628 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcat 2627726  T
Q  512 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccctttt-gtatcccttttg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||    
T  2627727 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtg 2627825  T
Q  610 taagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  2627826 taagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtctttgttt 2627924  T
Q  710 tcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttg-tttcttgcttg 807  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||    
T  2627925 tcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattttttgcttg 2628021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 34254620 - 34254312
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 502  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||   ||     
T  34254620 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagt 34254523  T
Q  503 gagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccct 594  Q
    || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34254522 gaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaaccct 34254424  T
Q  595 tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc 694  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34254423 tttgtatctcttt-gtaagaacttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct- 34254327  T
Q  695 ttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||| |||||||    
T  34254326 ttggtgtgtttgttt 34254312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 404 - 709
Target Start/End: Original strand, 17982529 - 17982840
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  17982529 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 17982626  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17982627 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaac 17982725  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17982726 ccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 17982823  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttt 709  Q
    || ||||||| |||||||    
T  17982824 ct-ttggtgtgtttgttt 17982840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 404 - 809
Target Start/End: Original strand, 31218133 - 31218541
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  31218133 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 31218230  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31218231 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 31218329  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31218330 ccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 31218427  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
    || ||||||| |||||||   ||||  |||||||  ||||||||||| ||  || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31218428 ct-ttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttgtgctt-atgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgtt 31218521  T
Q  791 -ttgttgtttcttgcttgca 809  Q
     |||||| || |||||||||    
T  31218522 attgttgattattgcttgca 31218541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 412 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 34256788 - 34256488
Alignment:
Q  412 acttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 510  Q
    ||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    | || |||||    
T  34256788 acttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatca 34256691  T
Q  511 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    ||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34256690 ttgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatc 34256592  T
Q  603 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgta 702  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  34256591 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtg 34256495  T
Q  703 tttgttt 709  Q
    |||||||    
T  34256494 tttgttt 34256488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 404 - 790
Target Start/End: Original strand, 42498070 - 42498459
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| | | ||||||||||   ||    
T  42498070 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacgttgtaaacaccttggtgag 42498167  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42498168 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 42498266  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42498267 ccttttgtatttcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 42498364  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
    || ||||||| ||||||| | ||||  |||||||  |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42498365 ct-ttggtgtgtttgtttccctctt--ctctcct--tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgtt 42498459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 345
Target Start/End: Original strand, 4759534 - 4759771
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||     
T  4759534 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttgacatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttg 4759632  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4759633 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggaacgg 4759732  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  4759733 acgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtgacacgatt 4759771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 36980014 - 36979741
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||     
T  36980014 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttg 36979916  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||  |     
T  36979915 caggacgccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtcataccttgggttgt 36979816  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtg 381  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36979815 acgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtg 36979741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 437 - 709
Target Start/End: Original strand, 44303764 - 44304042
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  44303764 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 44303861  T
Q  529 ttgggaaaa---gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 624  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  44303862 ttgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttt-taagaactcatt-ga 44303958  T
Q  625 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  44303959 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 44304042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30656282 - 30656025
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||     
T  30656282 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttg 30656184  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |    
T  30656183 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcag 30656084  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  30656083 acgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 30656025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 326
Target Start/End: Original strand, 33037284 - 33037506
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||      
T  33037284 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt- 33037382  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||  || |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |    
T  33037383 ttgcaggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtcatgccttggaa 33037482  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33037483 cggacgcaaatcgtgacacgattg 33037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Original strand, 18852627 - 18852884
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||     
T  18852627 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgatacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttg 18852725  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  18852726 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcag 18852825  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  18852826 acgcagatcgtgacacgatttgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 18852884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 407
Target Start/End: Original strand, 1261428 - 1261717
Alignment:
Q  120 ttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaat 218  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||   |||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  1261428 ttcaaatttgtggtttggaagaacacagaaatcgcgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaat 1261526  T
Q  219 cgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 316  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||  ||||||||    
T  1261527 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacatacgttcaaatcgt 1261626  T
Q  317 gacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtactt-aagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttggaagag 407  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||  ||| |||||||||    
T  1261627 gacacgatctgg-aaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaaagtgttcttgtgcttttttgaaggagagcttggaagag 1261717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Original strand, 39784325 - 39784509
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  39784325 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgc 39784424  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  39784425 tggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgttggttaagtatcactgataaggactggtc 39784509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 437 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 19945618 - 19945340
Alignment:
Q  437 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 528  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||    
T  19945618 tagggtttagagt-ctttgattagagt-tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 19945521  T
Q  529 ttgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 624  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  19945520 ttgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttgg-aagaactcatt-ga 19945424  T
Q  625 tagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  19945423 tagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgttt 19945340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 534 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 1746371 - 1746200
Alignment:
Q  534 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 632  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  1746371 aaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggat 1746276  T
Q  633 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  1746275 tggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc-gttggtgtgtttgttt 1746200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 346
Target Start/End: Original strand, 18870018 - 18870259
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggagg-tgccgtgagctaggg 202  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | | || ||||||||||      
T  18870018 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagatgtcgtgagctagt- 18870116  T
Q  203 tttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggga 302  Q
    || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||||     
T  18870117 ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggactggtcataccttgggt 18870216  T
Q  303 cggacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattg 346  Q
    | |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  18870217 cagacgcagatcgtgacacgatt-tgaaaatcgtggcacgattg 18870259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15212971
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 15212883  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  15212884 catt-gataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 15212971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26288504 - 26288234
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  26288504 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26288406  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||| ||  |||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| |    
T  26288405 tcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatag 26288306  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    || |||||   || ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26288305 tgtcacgacctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26288234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26301761 - 26301491
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  26301761 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26301663  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||| ||  |||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| |    
T  26301662 tcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatag 26301563  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    || |||||   || ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26301562 tgtcacgacctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26301491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26313755 - 26313485
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  26313755 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26313657  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||| ||  |||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| |    
T  26313656 tcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatag 26313557  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    || |||||   || ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26313556 tgtcacgacctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26313485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 404 - 708
Target Start/End: Original strand, 43036299 - 43036608
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 500  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  43036299 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 43036396  T
Q  501 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 591  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||     
T  43036397 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaat 43036495  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
     | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  43036496 tcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 43036592  T
Q  692 ctcttggtgtatttgtt 708  Q
    || ||||||| ||||||    
T  43036593 ct-ttggtgtgtttgtt 43036608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6311928 - 6311717
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtg 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| | || ||||  |    
T  6311928 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagcta-gtttgcaggacg 6311830  T
Q  213 caaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 312  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||   ||||||| | || |||||    
T  6311829 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggacttgtc-aaccttgggtcagatgcaaa 6311731  T
Q  313 tcgtgacacgattg 326  Q
    ||||||||||||||    
T  6311730 tcgtgacacgattg 6311717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Original strand, 10683739 - 10683923
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||     
T  10683739 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttg 10683837  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10683838 caggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtc 10683923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434995
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42435062  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42435061 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 42434995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352321
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 33352247  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33352248 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283688
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4283621  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283622 catt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 4283688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811449
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaacc 27811375  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  27811376 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 534 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 12702787 - 12702542
Alignment:
Q  534 aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 632  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||    
T  12702787 aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctc-tttgtaagaactca-ttgatattggat 12702691  T
Q  633 tggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttat 732  Q
    |||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||   ||||| ||| |    |||||    
T  12702690 tggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtatgtttgtttctctcttctctccc----tttat 12702597  T
Q  733 cttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgg--ttcctagattagatctaggtg 785  Q
    |||||| |||| | |||||||||  ||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  12702596 cttgtgcttgtggttttgtgtttttcactttgattttctagattagatctaggtg 12702542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 522 - 693
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  522 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 619  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||     
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaaaactc- 40321178  T
Q  620 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40321179 tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655564
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18655497  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18655498 catt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 18655564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221907
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 40221842  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221843 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40221907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303652
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 3303741  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  3303740 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct-ttggtgtgtttgttt 3303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 708
Target Start/End: Original strand, 4731658 - 4731843
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4731658 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4731755  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 708  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  4731756 catt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 4731843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 345
Target Start/End: Original strand, 7289427 - 7289666
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattgga--ggtgccgtgagctagggtt 204  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||  |  || ||| ||||||||  ||    
T  7289427 tgttgatattgacttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatagtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagggagccatgagctagt-tt 7289525  T
Q  205 tcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 304  Q
     ||||  || |||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||  |     
T  7289526 gcaggacgccaaatcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-taccttggatca 7289624  T
Q  305 gacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    || ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  7289625 gatgcaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtggcacgatt 7289666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 520 - 683
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 18141917  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactggg 683  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141918 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 522 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 10930365 - 10930188
Alignment:
Q  522 ggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactca 619  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| | || | |||| || ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||    
T  10930365 ggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctcttt-gtaagaacaca 10930268  T
Q  620 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10930267 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgt 10930188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 526 - 669
Target Start/End: Original strand, 30143346 - 30143488
Alignment:
Q  526 agattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 623  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  30143346 agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-g 30143442  T
Q  624 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtt 669  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30143443 atagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagtt 30143488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 693
Target Start/End: Original strand, 6598975 - 6599143
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6598975 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6599072  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    | ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6599073 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 693
Target Start/End: Original strand, 6674428 - 6674596
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6674428 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6674525  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    | ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6674526 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 574 - 693
Target Start/End: Original strand, 5689326 - 5689442
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  5689326 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttgga 5689422  T
Q  674 ccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  5689423 ccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965697
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactc 618  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||  ||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctcttt-gtaagaactc 8965761  T
Q  619 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||| ||||||| || ||||||   ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8965760 att-gatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 8965697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 520 - 639
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765863
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 9765842  T
Q  618 catttgatagtggattggagag 639  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  9765843 ca-ttgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35745971 - 35745794
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||   |||| || | |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||   ||  ||    
T  35745971 attggcttcaaatttgtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagatgccgtgagccaagtttgttggaagc 35745872  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35745871 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctatgataaggactggtc 35745794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 681
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291767
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaatt 30291704  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctct-cctccagaataggtcaagtttggaccgaactg 681  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  30291705 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaag-ttggaccgaactg 30291767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 523 - 663
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactca 40328879  T
Q  620 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggt 663  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  40328880 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 287
Target Start/End: Original strand, 25327664 - 25327844
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgcc-gtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||  ||||| |||||||  | ||| | |||||||||  ||     
T  25327664 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcttcgtggcacgatttcaagtggctgtgagctagt-ttg 25327762  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 287  Q
    ||||  || ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25327763 caggacgccaaatcatggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 25327844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 1345536 - 1345353
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||  || |  |||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||    
T  1345536 gtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctcttt-gaaagaactcat 1345439  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  1345438 t-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactaggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttt 1345353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 19491867 - 19491680
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  19491867 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 19491770  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |  |||||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| | |||||| |  |||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  19491769 c-gttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgttt 19491680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 391
Target Start/End: Original strand, 10688660 - 10688884
Alignment:
Q  168 aatcgtgacacgattgga-ggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgt 266  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||  || ||||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  10688660 aatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgt 10688758  T
Q  267 taagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattg-ggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagta 365  Q
    ||||||||  | ||||||||| |||   ||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||    ||||||||| ||||||    
T  10688759 taagtatcactaataaggacttgtc-aaccttgggtcagatgcaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtggcacaatttcttcagaggaagactagta 10688857  T
Q  366 ctta-agtgttcttgtgcagatttgaa 391  Q
      ||  |||||||||||||| ||||||    
T  10688858 tatattgtgttcttgtgcagttttgaa 10688884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 651
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353923
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||     
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctc-tttgtaagaactca- 44353892  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcc 651  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  44353893 ttgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 520 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292471
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 1292534  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactggg 683  Q
    || ||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1292533 ca-ttgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 596 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 4743306 - 4743196
Alignment:
Q  596 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 695  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |    
T  4743306 ttgtaacccatttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-t 4743210  T
Q  696 tggtgtatttgttt 709  Q
    |||||| |||||||    
T  4743209 tggtgtgtttgttt 4743196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 574 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 41366727 - 41366622
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||    
T  41366727 aagctaatttcttttaacctatttgtatccc-tttgtaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttgga 41366632  T
Q  674 ccgaactggg 683  Q
    ||||||||||    
T  41366631 ccgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 524 - 686
Target Start/End: Original strand, 11383989 - 11384149
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| || |    
T  11383989 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaaccca-t 11384085  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    ||||| |||||||||||   | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11384086 tgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 11384149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 574 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 18106191 - 18106087
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18106191 aagctaatttcttgtaactcatttgtat--cttttgtaagaactca-ttgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaag-ttgga 18106098  T
Q  674 ccgaactgggt 684  Q
    |||||||||||    
T  18106097 ccgaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 574 - 709
Target Start/End: Original strand, 10015136 - 10015265
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  10015136 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt--taggaactca-ttgatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttgga 10015230  T
Q  674 ccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    ||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  10015231 ccgaactgggtaatc-atttcttggtgtatttgttt 10015265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7412939 - 7412787
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgatt-ggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||| || || |||||||  |||    
T  7412939 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattctgtaatgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 7412841  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagt 271  Q
    |||||| || ||| || ||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  7412840 tcgtggtacaattttgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagt 7412787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 31042921 - 31043032
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  31042921 cttcaaatttgtggtctggaagaatagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 31043019  T
Q  218 tcgtggcacgatt 230  Q
    ||||| |||||||    
T  31043020 tcgtgacacgatt 31043032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 538 - 684
Target Start/End: Original strand, 4162516 - 4162658
Alignment:
Q  538 gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 636  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4162516 gggtagaagttagg-tttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatag-ggattgga 4162611  T
Q  637 gagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    ||   |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  4162612 gatatcaatctctccccaagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggt 4162658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 684
Target Start/End: Original strand, 4733792 - 4733868
Alignment:
Q  606 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggt 684  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4733792 tttgtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 4733868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 388
Target Start/End: Original strand, 31043112 - 31043189
Alignment:
Q  310 aaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31043112 aaatcgtgacacgacttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 31043189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 525 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 29796485 - 29796329
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgt--aagaactcatt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||| ||  |||||  || ||||||||    
T  29796485 gagattgggaaaagagtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttttgta-cctatttgtaaaaaaactcatt 29796387  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaact 680  Q
    | ||| ||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||   ||||||||||||    
T  29796386 t-ataatggattggagagatcaatctctcccccaatgtaggtcattgttggaccgaact 29796329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 525 - 602
Target Start/End: Original strand, 1822297 - 1822375
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1822297 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatc 1822375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 525 - 602
Target Start/End: Original strand, 1856742 - 1856820
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatc 602  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1856742 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatc 1856820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 525 - 682
Target Start/End: Original strand, 7597619 - 7597776
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 623  Q
    |||||||| ||||| | | |||| ||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||   |||||  |||| |    
T  7597619 gagattggaaaaagagaataaatcaggttttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcatt-g 7597717  T
Q  624 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgg 682  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||   || |||||||||||    
T  7597718 atagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttagaccgaactgg 7597776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 343
Target Start/End: Original strand, 31043017 - 31043125
Alignment:
Q  236 aaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacacgattgggaaaat 333  Q
    |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | ||||||||||||| | || ||||    
T  31043017 aaatcgtgacacgattctcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgacttgg-aaat 31043115  T
Q  334 cgtgacacga 343  Q
    ||||||||||    
T  31043116 cgtgacacga 31043125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073880
Alignment:
Q  579 aatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 678  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaag-ttgggccgaa 3073886  T
Q  679 ctgggt 684  Q
    ||||||    
T  3073885 ctgggt 3073880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 574 - 678
Target Start/End: Original strand, 8153813 - 8153914
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttgga 673  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |  |||| ||||||||| |||||    
T  8153813 aagctaaattcgtgtaactcttttgtatatcttt-gtaagaactcatt-gatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttgga 8153909  T
Q  674 ccgaa 678  Q
    |||||    
T  8153910 ccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 164
Target Start/End: Original strand, 10688615 - 10688675
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattt 164  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  10688615 aaatgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 10688675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17028774 - 17028722
Alignment:
Q  54 aaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaa 106  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17028774 aaacttagctgttccgaaatctgagacatgagcaacatattccaaatccaaaa 17028722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17559210 - 17559158
Alignment:
Q  54 aaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaa 106  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17559210 aaacttagctgttccgaaatctgagacatgagcaacatattccaaatccaaaa 17559158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 141
Target Start/End: Original strand, 25689561 - 25689595
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaaga 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689561 tgttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga 25689595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 11712114 - 11712038
Alignment:
Q  574 aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcc 651  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   || |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  11712114 aagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactca-ttgatagtggattgaagagatcaatctctcc 11712038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 747 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 32902133 - 32902096
Alignment:
Q  747 tttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggt 784  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32902133 tttgtgtttttcacttggttcctagattagatctaggt 32902096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 533 - 601
Target Start/End: Original strand, 41266982 - 41267051
Alignment:
Q  533 gaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtat 601  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  41266982 gaaaatggtagaaattaggttttgttcttagagaacttgttgagactaatttcttgtaactcttttgtat 41267051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 41365011 - 41364927
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttt 607  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41365011 tgagattgggaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt 41364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11740 - 11042
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggagg-tgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  11740 cttcaaaattgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 11642  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 315  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  11641 tcgtgacacgatt-tgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgcaccaatcg 11543  T
Q  316 tgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga-- 412  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||      
T  11542 tgacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaga--gttggaagagagagaaa 11446  T
Q  413 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 510  Q
    |||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || |  |||||    
T  11445 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatca 11347  T
Q  511 ttgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtat 601  Q
    ||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11346 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtat 11248  T
Q  602 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgt 701  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11247 ctcttttgtaagaactcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgt 11150  T
Q  702 atttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgttt 799  Q
     ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  11149 ctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgtttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgatt 11053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 119 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 9295 - 8616
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  9295 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 9197  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 317  Q
    ||||| || |||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||           
T  9196 tcgtgacatgatt-tgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgcacc----- 9103  T
Q  318 acacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttggaagagagaga--ct 414  Q
                 |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||  ||    
T  9102 -------------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagaga--gttggaagagagagaaact 9018  T
Q  415 tggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcatt 512  Q
    |||| |||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||   || |  || ||||    
T  9017 tgggaaatcaaagggagtaactctaggctttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaagaccttggtgagtgtaaaccatt 8919  T
Q  513 gagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatcc 603  Q
    ||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  8918 gagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatct 8820  T
Q  604 cttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat 703  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  8819 cttttgtaagaactcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct 8722  T
Q  704 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttct 801  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  8721 ttgttttcctcttccctcttct--tttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattat 8625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 659 - 871
Target Start/End: Original strand, 3 - 214
Alignment:
Q  659 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttca 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtttca 100  T
Q  758 cacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatactctttgtttggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 857  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 cacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaataaactttgttaggtggttaccactctccgtcgctccacacatca 200  T
Q  858 ttattctttgtatt 871  Q
    ||||||||||||||    
T  201 ttattctttgtatt 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 693
Target Start/End: Original strand, 524 - 1087
Alignment:
Q  148 aaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgaca 246  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||  || | ||||| ||||    
T  524 aaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgaggaatcgtgaca 622  T
Q  247 cgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgat 344  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  623 cgattttcaaatttgctcgttaagtttccaggatagggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaattgtgacacgatttggaaa-tcgtgacacgat 721  T
Q  345 tggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt-gaagaggaggttgga-----------agagagagacttggggaatcaaaggg-ga 431  Q
    |  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||           ||||||| ||||||| |||||||||  |     
T  722 tttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttggatgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggcagc 821  T
Q  432 agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gt 524  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||      ||    
T  822 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggt 919  T
Q  525 gagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 621  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   || ||||||||    
T  920 gagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aacaactcatt 1016  T
Q  622 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1017 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 404 - 790
Target Start/End: Original strand, 434409 - 434798
Alignment:
Q  404 agagagagacttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaag 501  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||   ||    
T  434409 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgag 434506  T
Q  502 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggg--aaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 591  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  434507 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 434605  T
Q  592 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 691  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  434606 ccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 434703  T
Q  692 ctcttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
     | ||||||| |||||||   ||||| ||| |||  ||||||||||| ||| || |||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  434704 at-ttggtgtgtttgtttctctcttctctc-cct--tttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 434798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 520 - 709
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11745
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 11654  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11655 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgttt 11745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Original strand, 21953 - 22286
Alignment:
Q  120 ttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||  | || || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||  || ||||    
T  21953 ttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgggacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaat 22051  T
Q  219 cgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtga 318  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |            
T  22052 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtacc------ 22145  T
Q  319 cacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggaggttgga-agagagagacttgg 417  Q
                |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | | | ||||||| ||||||    
T  22146 ------------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggtgagctagaagagagagaaacttgg 22233  T
Q  418 ggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctt 470  Q
    | |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22234 gaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt 22286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 945 - 761
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttc 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  945 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtatggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgc 846  T
Q  207 agggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
     || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  845 tggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 520 - 693
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114774
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt-gtaagaact 114699  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 693  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  114700 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct 114774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17652
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattg-gaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  17444 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 17542  T
Q  218 tcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  17543 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacatgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggattggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatcg 17642  T
Q  316 tgacacgatt 325  Q
    ||||||||||    
T  17643 tgacacgatt 17652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Original strand, 17657 - 17695
Alignment:
Q  350 cagaggaaggctagtacttaagtgttcttgtgcagattt 388  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17657 cagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 17695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 18171 - 18007
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  18171 ttggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-aact 18075  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18074 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtga 18007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 520 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20319
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 20486  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttttcttcttc 717  Q
    | ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||    |||||    
T  20485 c-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat-ttttggtgtgtttgttcctctcttc 20389  T
Q  718 cctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacac-ttggttcctagattagatctaggtggtgtt 790  Q
     ||| |    |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20388 tctccc----tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgtt 20319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13768 - 13669
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13768 caaaggtgcctgcaaaagaagtcatgttggatgaattgggatttaggaacttggatgttccgaagtctgagacatgagctacatattccaaatccaaaat 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7431 - 7370
Alignment:
Q  45 gggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaa 106  Q
    |||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7431 gggattaagaaacttggctgttccgaagtctgagacatgagccacatattccaaatccaaaa 7370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14411 - 14312
Alignment:
Q  8 caaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14411 caaaggtgcctgcaaaagaagtcatgttggatgaattgggatttaggaacttggatgttccgaagtctgagacatgagctacatattccaaatccaaaat 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8075 - 8014
Alignment:
Q  45 gggatttacaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctacatattccatatccaaaa 106  Q
    |||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8075 gggattaagaaacttggctgttccgaagtctgagacatgagccacatattccaaatccaaaa 8014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 520 - 686
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7491
Alignment:
Q  520 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaact 617  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 7424  T
Q  618 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtga 686  Q
    || |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7425 ca-ttgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 345
Target Start/End: Original strand, 3337 - 3575
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtg-ccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||  | ||| |||||||||||  ||     
T  3337 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaaaagagaaatcgtgacacgattttgacatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagt-ttg 3435  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
     |||  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||   ||| ||||| |    
T  3436 aaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcaatgataaggactagtc-aacctggggaccg 3534  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
      ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3535 ttgcagatcgtgacacgatctaggaaaatcgtgacacgatt 3575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 149262 - 149079
Alignment:
Q  523 gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | || | |||||  ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  149262 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 149165  T
Q  621 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgttt 709  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  149164 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtatttgttt 149079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 345
Target Start/End: Original strand, 132761 - 132991
Alignment:
Q  115 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || ||||||| ||| |||||| ||||| || | | || |||||||| || || ||| |||     
T  132761 ttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggtatcgtggcacgattttgtgatgtcgtgagct-ggtttgcagtgtgt 132859  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 311  Q
     |||||||| ||||||| || | ||||| |||| |||  | ||||||||| ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||||| || ||| |  |    
T  132860 caaatcgtgacacgattttgtggaatcgtgacatgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtaccttgggtcgtacgtatca 132958  T
Q  312 atcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  132959 atcgtgacacgatttggaaaa-cgtggcacgatt 132991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 345
Target Start/End: Original strand, 1736 - 1977
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||   |||| || |||||||| | |||||||||||||| || |  || |||||| | | |    
T  1736 aaatgttggaattgacttcaaattagtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcacgatttggcaatcgtgacacgatcggggaggcagtgagccaagtt 1835  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggac 303  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||   |||||||||    
T  1836 tgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc-aaccttgggac 1934  T
Q  304 ggacgcaaatcgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
     |  ||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  1935 cgttgcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 576 - 684
Target Start/End: Original strand, 10546 - 10651
Alignment:
Q  576 gctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggacc 675  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10546 gctaatttattgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggacc 10642  T
Q  676 gaactgggt 684  Q
    |||||||||    
T  10643 gaactgggt 10651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 345
Target Start/End: Original strand, 148451 - 148682
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||   |||| || |||||||| | |||||||||||||| || |  || |||||| | | || | ||  ||    
T  148451 attgacttcaaattagtggtttggaagaacagaggaatcgtgtcacgatttggcaatcgtgacacgatcggggaggcagtgagccaagtttgctggaagc 148550  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 313  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||   ||||||||| |  ||| ||    
T  148551 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc-aaccttgggaccgttgcagat 148649  T
Q  314 cgtgacacgat-tgggaaaatcgtgacacgatt 345  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  148650 cgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 148682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 324
Target Start/End: Original strand, 18671 - 18880
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||   |||| || | |||||| | |||||||||||||| ||||  || |||||||| | || | ||  ||    
T  18671 attggcttcaaatttgtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcgcgatttggcaatcgtgacacgatcggagaggcagtgagctaagtttgctggaagc 18770  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 313  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| |  ||||||    
T  18771 aaaatcgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaagactggtc-atcctggggaccgttgcaaat 18869  T
Q  314 cgtgacacgat 324  Q
    |||||||||||    
T  18870 cgtgacacgat 18880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 13781 - 13968
Alignment:
Q  104 aaatgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggt 203  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||   |||| || |||||||||| | ||||||||||||  | |  || |||||||| | |    
T  13781 aaatgttggaattgacttcaaattagtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagtcgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtt 13880  T
Q  204 ttcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  13881 tgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 13968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 324
Target Start/End: Original strand, 34554 - 34770
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtg-ccgtgagctagggttt 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||  | ||| |||| || | |  ||     
T  34554 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacactatttcaagtggccgttagtttgt-ttg 34652  T
Q  206 cagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgg 305  Q
    || |  || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |    
T  34653 catgacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccg 34751  T
Q  306 acgcaaatcgtgacacgat 324  Q
      ||| |||||||||||||    
T  34752 ttgcagatcgtgacacgat 34770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1455 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1455
Description:

Target: scaffold1455; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 182
Target Start/End: Original strand, 1709 - 1784
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgatt 182  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1709 tgttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatt 1784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Original strand, 176457 - 176634
Alignment:
Q  114 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgc 213  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||   |||| || |||||||||| | ||||||||||||  | |  || |||||||| | || | ||  ||    
T  176457 attgacttcaaattagtggtttgggagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcagtcgtgacacgatcagggaggcagtgagctaagtttgctggaagc 176556  T
Q  214 aaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 291  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  176557 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 176634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 524 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 80447 - 80351
Alignment:
Q  524 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcat 620  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  80447 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtat-ctttttgtaagaactcat 80351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8184 - 8112
Alignment:
Q  215 aaatcgtggcacgattgtgggaaatcgcgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 287  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8184 aaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 8112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8273 - 8216
Alignment:
Q  107 tgttgacattgtcttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattt 164  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  8273 tgttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattt 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 525 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 27606 - 27453
Alignment:
Q  525 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatggtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacccttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 623  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||  || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||   || |||| ||| |    
T  27606 gagattgtgaaaagagtagaaattatgtattgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttatt-g 27508  T
Q  624 atagtggattggagagtacaatctctcctccagaataggtcaagtttggaccgaa 678  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||   ||||||||||    
T  27507 atagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaa 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 7924 - 8035
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacga-ttggaggtgccgtgagctagggtttcagggtgcaaaa 217  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || | | ||||||||| | || || |||||||| |||    
T  7924 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgag-ttggtttgcagggtgccaaa 8022  T
Q  218 tcgtggcacgatt 230  Q
    ||||| |||||||    
T  8023 tcgtgacacgatt 8035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 182
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1159
Alignment:
Q  119 cttcaaatttgtggtctggaagaccaggtaaatcatggcacgattttggaatcgtgacacgatt 182  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1096 cttcaaatttgtggtttgaaagaacagaaaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatt 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University