View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2966_low_18 (Length: 305)

Name: NF2966_low_18
Description: NF2966
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2966_low_18
NF2966_low_18
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (19-293)||(28990476-28990751)
chr1 (19-208)||(39277759-39277950)
chr1 (19-209)||(10394128-10394320)
chr1 (19-207)||(45822963-45823154)
chr1 (78-204)||(39277585-39277712)
chr1 (22-209)||(47422039-47422230)
chr1 (25-203)||(27334349-27334529)
chr1 (22-210)||(36076882-36077072)
chr1 (78-209)||(19920503-19920635)
chr1 (78-209)||(45822785-45822917)
chr1 (78-207)||(28990299-28990429)
chr1 (24-208)||(49185999-49186185)
chr1 (20-164)||(52285098-52285241)
chr1 (83-209)||(47421889-47422016)
chr1 (78-206)||(10394367-10394496)
chr1 (20-206)||(16959016-16959204)
chr1 (20-206)||(30050093-30050281)
chr1 (79-208)||(52285290-52285420)
chr1 (78-186)||(7714193-7714302)
chr1 (22-208)||(10719355-10719543)
chr1 (78-204)||(30049918-30050045)
chr1 (208-293)||(6162158-6162244)
chr1 (78-163)||(10719561-10719646)
chr1 (79-163)||(35814325-35814409)
chr1 (108-207)||(36077121-36077221)
chr1 (78-189)||(15158341-15158453)
chr1 (78-188)||(16958861-16958968)
chr1 (34-150)||(7714365-7714480)
chr1 (34-163)||(35814133-35814262)
chr1 (22-127)||(15158470-15158576)
chr1 (34-135)||(5682959-5683060)
chr1 (22-62)||(45822934-45822975)
chr1 (25-62)||(28990450-28990488)
chr1 (22-62)||(19920653-19920694)
chr1 (22-62)||(39277730-39277771)
chr1 (34-62)||(10394308-10394336)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (19-208)||(12701926-12702116)
chr2 (19-207)||(12261001-12261191)
chr2 (78-208)||(12702163-12702294)
chr2 (19-163)||(16203621-16203765)
chr2 (78-209)||(21304326-21304457)
chr2 (19-163)||(36065391-36065536)
chr2 (83-208)||(2217849-2217974)
chr2 (19-163)||(10373192-10373337)
chr2 (78-156)||(16581389-16581467)
chr2 (78-163)||(25945871-25945956)
chr2 (19-163)||(25946003-25946148)
chr2 (78-155)||(36065267-36065344)
chr2 (78-163)||(38978852-38978937)
chr2 (78-153)||(16203499-16203574)
chr2 (34-115)||(2217699-2217780)
chr2 (78-209)||(3568500-3568632)
chr2 (139-208)||(2217621-2217691)
chr2 (82-128)||(45115028-45115074)
chr2 (22-62)||(36065362-36065403)
chr2 (22-69)||(16581486-16581534)
chr2 (22-69)||(38978787-38978835)
chr2 (78-157)||(10373066-10373145)
chr2 (25-62)||(12702104-12702142)
chr2 (93-147)||(38978713-38978767)
chr2 (22-62)||(25945974-25946015)
chr2 (34-62)||(10373176-10373204)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (22-209)||(6000477-6000666)
chr7 (78-209)||(4133074-4133206)
chr7 (19-208)||(26041506-26041697)
chr7 (78-207)||(43392298-43392428)
chr7 (22-163)||(472643-472785)
chr7 (19-163)||(30284093-30284238)
chr7 (79-206)||(32389680-32389809)
chr7 (20-184)||(37691718-37691884)
chr7 (78-205)||(6000684-6000812)
chr7 (78-209)||(8462845-8462977)
chr7 (208-293)||(21494199-21494285)
chr7 (20-188)||(32871628-32871799)
chr7 (79-207)||(18417454-18417583)
chr7 (79-163)||(24846289-24846373)
chr7 (19-206)||(4132836-4133027)
chr7 (78-163)||(472803-472888)
chr7 (78-163)||(30283963-30284047)
chr7 (19-163)||(16963389-16963534)
chr7 (108-211)||(25731914-25732018)
chr7 (22-163)||(8462995-8463137)
chr7 (78-163)||(16962889-16962974)
chr7 (26-163)||(24846396-24846534)
chr7 (79-163)||(24485773-24485857)
chr7 (22-205)||(16833457-16833632)
chr7 (78-163)||(26041744-26041828)
chr7 (78-194)||(7685228-7685343)
chr7 (22-163)||(24485614-24485755)
chr7 (22-62)||(30284065-30284105)
chr7 (78-127)||(37691932-37691981)
chr7 (79-192)||(32871849-32871960)
chr7 (22-62)||(26041685-26041726)
chr7 (24-62)||(16963362-16963401)
chr7 (108-204)||(32389560-32389647)
chr7 (34-62)||(43392459-43392487)
chr7 (19-54)||(43392475-43392511)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (19-208)||(13557317-13557507)
chr8 (34-209)||(36194625-36194801)
chr8 (19-203)||(12654878-12655064)
chr8 (34-209)||(31933465-31933640)
chr8 (78-208)||(18847366-18847496)
chr8 (19-163)||(10134785-10134930)
chr8 (78-205)||(12654703-12654831)
chr8 (25-210)||(18847517-18847704)
chr8 (78-163)||(10134653-10134738)
chr8 (82-209)||(36194868-36194996)
chr8 (78-207)||(13557140-13557270)
chr8 (79-208)||(31933272-31933402)
chr8 (22-163)||(40832286-40832428)
chr8 (19-163)||(21014977-21015122)
chr8 (212-281)||(45333546-45333616)
chr8 (78-163)||(40832181-40832266)
chr8 (78-163)||(21015169-21015254)
chr8 (22-62)||(10134756-10134797)
chr8 (22-62)||(21015110-21015151)
chr8 (34-62)||(12654862-12654890)
chr8 (34-62)||(13557301-13557329)
chr8 (22-57)||(31933420-31933456)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (24-205)||(1113212-1113395)
chr4 (34-205)||(8607778-8607950)
chr4 (78-207)||(36215649-36215779)
chr4 (78-210)||(55620190-55620323)
chr4 (78-210)||(55627494-55627627)
chr4 (78-209)||(17254683-17254815)
chr4 (78-207)||(1113414-1113544)
chr4 (22-209)||(29429937-29430124)
chr4 (19-207)||(24039250-24039439)
chr4 (34-191)||(51024464-51024621)
chr4 (19-163)||(14251373-14251518)
chr4 (19-163)||(44304027-44304172)
chr4 (78-208)||(24039486-24039617)
chr4 (208-293)||(52630769-52630855)
chr4 (19-163)||(51399393-51399538)
chr4 (78-192)||(29430142-29430257)
chr4 (19-157)||(35016741-35016879)
chr4 (78-163)||(44304219-44304304)
chr4 (78-209)||(48018608-48018740)
chr4 (79-163)||(49905773-49905857)
chr4 (78-163)||(14251241-14251326)
chr4 (78-163)||(35016926-35017011)
chr4 (78-163)||(51399261-51399346)
chr4 (26-163)||(36215801-36215939)
chr4 (22-159)||(49905876-49906015)
chr4 (79-204)||(55561022-55561148)
chr4 (19-206)||(17254444-17254636)
chr4 (79-209)||(43099327-43099452)
chr4 (19-134)||(17728728-17728844)
chr4 (34-68)||(43099485-43099519)
chr4 (24-62)||(44304160-44304199)
chr4 (22-62)||(51399364-51399405)
chr4 (79-136)||(55561222-55561279)
chr4 (22-61)||(24039428-24039468)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (78-209)||(11047215-11047347)
chr3 (25-208)||(49220113-49220298)
chr3 (78-209)||(52856974-52857106)
chr3 (78-207)||(28253677-28253807)
chr3 (78-204)||(49220319-49220446)
chr3 (24-209)||(31070947-31071132)
chr3 (20-209)||(28253441-28253631)
chr3 (78-209)||(31071151-31071283)
chr3 (25-192)||(18733957-18734124)
chr3 (79-208)||(26988804-26988934)
chr3 (19-163)||(43464989-43465134)
chr3 (19-163)||(46452920-46453064)
chr3 (19-163)||(26247045-26247192)
chr3 (19-163)||(52857153-52857298)
chr3 (78-163)||(13301884-13301969)
chr3 (78-163)||(13312540-13312625)
chr3 (78-163)||(26246913-26246998)
chr3 (19-163)||(24244510-24244655)
chr3 (79-156)||(24244702-24244779)
chr3 (78-163)||(43464857-43464941)
chr3 (80-185)||(11046990-11047095)
chr3 (78-163)||(6276103-6276188)
chr3 (78-163)||(46453111-46453196)
chr3 (19-163)||(4953169-4953314)
chr3 (78-163)||(4953361-4953446)
chr3 (155-209)||(11046925-11046980)
chr3 (20-70)||(11047116-11047167)
chr3 (22-62)||(43464960-43465001)
chr3 (22-62)||(46453052-46453093)
chr3 (122-205)||(18734149-18734233)
chr3 (22-62)||(11047156-11047197)
chr3 (22-62)||(26247016-26247057)
chr3 (22-62)||(52857124-52857165)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (19-205)||(8417561-8417749)
chr5 (19-163)||(17115496-17115641)
chr5 (78-204)||(9989959-9990085)
chr5 (34-209)||(18968700-18968871)
chr5 (26-163)||(14662408-14662545)
chr5 (78-163)||(18508759-18508844)
chr5 (78-209)||(18968507-18968639)
chr5 (78-163)||(1983486-1983571)
chr5 (78-163)||(14662599-14662684)
chr5 (78-163)||(35463800-35463885)
chr5 (22-205)||(9990103-9990292)
chr5 (25-163)||(18508569-18508706)
chr5 (19-163)||(35463607-35463753)
chr5 (78-209)||(36207413-36207546)
chr5 (78-127)||(8417796-8417845)
chr5 (22-62)||(35463741-35463782)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (39-193)||(1211593-1211748)
chr6 (19-159)||(959058-959199)
chr6 (79-163)||(959246-959330)
chr6 (79-209)||(1211392-1211523)
chr6 (22-62)||(959187-959228)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (18-163)||(26139-26285)
scaffold0220 (78-163)||(26008-26093)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (79-204)||(25490-25617)
scaffold0130 (19-127)||(25334-25442)
scaffold0130 (168-207)||(25313-25352)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (81-184)||(233672-233776)
scaffold0009 (78-184)||(233556-233663)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 28990476 - 28990751
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaactatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28990476 ttaagggaccaaactatactaattaaataagttaatggaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttaaatg 28990575  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaacga-tacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcctagattcctc 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28990576 aagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaaccaatacttgaaatcaagttaagggaccaattgaatatttaagcctagattcctc 28990675  T
Q  218 aattttcagcagctgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatttaaaatcatcaattgcttc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28990676 aattttcagcagctgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatttaaaatcatcaattgcttc 28990751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 39277759 - 39277950
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39277759 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagagaccaaaatttaacatttttttaaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttaaat 39277858  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39277859 aaagttaagggacctaaacggactttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 39277950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10394320 - 10394128
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10394320 ttaagggaccaaactaatattaattaaataagttaaggaagcaaaatttaacatttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttaaat 10394221  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
     ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394220 aaagttaagggatctaaacgaaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 10394128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 45822963 - 45823154
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaa-ttaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45822963 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacattttttttaaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttaaa 45823062  T
Q  117 tgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45823063 taaagttaagggacctaaacggactttttattacttatgggaccaaaccaatatttgaaatcaagttaagggatcaattgaacatttaagcc 45823154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39277712 - 39277585
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39277712 gaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttaaataaagttaagggacctaaacggactttttattacttatgggaccaaactgatacttgaaat 39277613  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  39277612 taagttaagggaccaattgagcatttaa 39277585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 47422039 - 47422230
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnnga--attaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||        |  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||     
T  47422039 agggatcaaactactactaattaaataagttaagggattaaaatttaacgttttttttataattaaattaacagaaatgaccaaaccgatactttaaata 47422138  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47422139 aagttaagggacctaaacagacctcttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 47422230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27334529 - 27334349
Alignment:
Q  25 gaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtt 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||| |||||    
T  27334529 gaccaaactaatactaattaaataagttaaagaaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaagggaccaaaccattactttaaataaagtt 27334430  T
Q  124 aaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcattta 203  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27334429 aagggacctaaacggatcttttattacttatgagaccaaatcgatacttgaaatcaagttaagggactaattgagcattta 27334349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36077072 - 36076882
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||    
T  36077072 agggaccaaactaatactaattaattaagttaagggaccaaaatttaacgtttttttaaattatattaacagaagagaccaaaccgatactttaaataaa 36076973  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaa-acgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcctag 210  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  36076972 gttaagggacctaaacgaaccttttattacttatgggatcaagccgatacttgaaatcaagttaagggaacaattaaacatttaagcctag 36076882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19920635 - 19920503
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19920635 gaattaaattaacataagagaccaaactgatactttaaataaagttaagggacctaaacggatcttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaat 19920536  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19920535 caagttaagggatcaattgagcatttaagccta 19920503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45822917 - 45822785
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45822917 gaattaaattaacagaaaggactaagctgatactttaaataaagttaaggaacctaaacggactttttattacttatgggaccaaattgatacttgaaat 45822818  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45822817 taagttaagggaccaattgagcacttaagccta 45822785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28990429 - 28990299
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28990429 gaattaaattaacaaaaaggaccagaccgatactttaaataaagttaagggacctaagcggaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaat 28990330  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28990329 caagttaagggaccaattaagcatttaagcc 28990299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49186185 - 49185999
Alignment:
Q  24 ggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagt 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||  || |||||   |||||||||| ||||    
T  49186185 ggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccacaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaagtgaccaaaccattactttaaataaagt 49186086  T
Q  123 taaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49186085 taaaggacgtaaacggaccttttattacttataagaccaaactgatacttgaaatcaagttaaggaactaattgagcatttaagcct 49185999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 52285241 - 52285098
Alignment:
Q  20 taagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52285241 taagagaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaac-attttttgaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaata 52285143  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac 164  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52285142 aagttaagg-acctaaacggactttttattacttatgagaccaaac 52285098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47422016 - 47421889
Alignment:
Q  83 aaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagt 181  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47422016 aaattaacataaaggaccaaactgataatttaaataaagttaagggacctaaacagacattttattacttatgggaccaaaccgatatttgaaatcaagt 47421917  T
Q  182 taagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47421916 taagggaccaattgagcatgtaagccta 47421889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 206
Target Start/End: Original strand, 10394367 - 10394496
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggacc-aaacgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||    
T  10394367 gaattaaattaacaaaagggaccaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttaatatttatgggaccaaaacaatacttgaaat 10394466  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10394467 caagttaaggaaccaattgagcatttaagc 10394496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 16959016 - 16959204
Alignment:
Q  20 taagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  16959016 taagggacaaaactaatactattaaaataagttaagagaccaaaatttaacgttcttttgaattaaattgacataaaggatcaaactgatgctttaaata 16959115  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagc 206  Q
    ||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||    
T  16959116 aagttaagggacctaaacataatttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagtcaaaggatcaaaagagcatttaagc 16959204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 30050093 - 30050281
Alignment:
Q  20 taagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||     
T  30050093 taagggaccaaactaatactaattaaataagttaatggaccaaaatttaactttctttttaattaaattaacagaaatgaccaaattgatactttaaata 30050192  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagc 206  Q
    ||||||||  || ||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  30050193 aagttaagagacataatcggactttttattacttgtgcgaccaaaccgatacttgaaatcaagttaatggaccaaaagaacatttaagc 30050281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Original strand, 52285290 - 52285420
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatc 177  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  52285290 aattaaattaacagaaatgaccaaacggatactttaaataaagttaagggacctaaacagaccttttattacttataggaccaaattgatacttaaaatc 52285389  T
Q  178 aagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  52285390 aagttaagggaccaaaagaacatttaagcct 52285420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7714302 - 7714193
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7714302 gaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttaaataaagttaagggacctagacagactttttattacttatgggaccaaaccgatacttaaaat 7714203  T
Q  177 caagttaagg 186  Q
    ||||||||||    
T  7714202 caagttaagg 7714193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10719543 - 10719355
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||       |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||    
T  10719543 agggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacaaaaaggaccaaaccgatacttttaataaa 10719444  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | |   | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10719443 gttaaggggccaaaacggaccttttattatttatgggaccaaagcgatactaaataaatacttaagggaccaaaagagcatttaagcct 10719355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30050045 - 30049918
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  30050045 gaattaaattaacagaaaagaccaaactgatactttaaataaagttaagggactcaaacggactttttattacatatgagaccaaaccgatacttgaaat 30049946  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaa 204  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||    
T  30049945 aaagttaagggaccaaaagagcatttaa 30049918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Original strand, 6162158 - 6162244
Alignment:
Q  208 tagattcctcaat-tttcagcagctgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatttaaaatcatcaattgcttc 293  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6162158 tagattcctcaatctttcagcatctgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatctaaaatcatcaattgcttc 6162244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 10719561 - 10719646
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10719561 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatggaaccaaa 10719646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 35814325 - 35814409
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35814325 aattaaattatcagaaaggatcaaactgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttaagggaccaaa 35814409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 207
Target Start/End: Original strand, 36077121 - 36077221
Alignment:
Q  108 tactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagc 206  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36077121 tactttaaataaagttaatgaacctaaacagaccttttattacttatgggagcaaaccgatacttgaaatcaagttaaggaactaattgagcatttaagc 36077220  T
Q  207 c 207  Q
    |    
T  36077221 c 36077221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15158453 - 15158341
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15158453 gaattaaattaatagaacggaccaaaccgatacttgaaataaatttaagggacctaaacgaaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaat 15158354  T
Q  177 caagttaagggac 189  Q
    ||||| |||||||    
T  15158353 caagtaaagggac 15158341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16958968 - 16958861
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16958968 gaattaaattaacagaac----caaactgataatttaaataaagttaagggacctaaatggaccttttattatttatgggaccaaaccgacacttgaaat 16958873  T
Q  177 caagttaaggga 188  Q
    ||||||||||||    
T  16958872 caagttaaggga 16958861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Original strand, 7714365 - 7714480
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaaccta 133  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  7714365 atactaattaaataagttatgtgatcaaaatttaacgtttttttaaattaaattaacagaaaggaccaaactgata-tttaaataaacttaagggaccta 7714463  T
Q  134 aacggaccttttattac 150  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7714464 aacggactttttattac 7714480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35814262 - 35814133
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaaccta 133  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||        |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | | ||||||||| | | |    
T  35814262 ataccaattaaataagataagagaccaaaatttaacttttatttgaattaaattaatagaaaggaccaaaccgacactttcactaaagttaagggagcaa 35814163  T
Q  134 aacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35814162 aacggaccttttattacttatggaaccaaa 35814133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 15158470 - 15158576
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||        || |||||||||||||||||| |||| | || |||||||| ||    
T  15158470 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggatcaaaacttaacatttttttgacttaaattaacagaaaggaccaaattaatgctttaaataaa 15158569  T
Q  121 gttaagg 127  Q
    |||||||    
T  15158570 gttaagg 15158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5683060 - 5682959
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaaccta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||        ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| | |||||    
T  5683060 atactaattaaataagttaagggactaaaaattaacgttttttttaattaaattaatagaaaggaccaaaacgatactttaaataacgttaaaggaccta 5682961  T
Q  134 aa 135  Q
    ||    
T  5682960 aa 5682959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 45822934 - 45822975
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45822934 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 45822975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 28990450 - 28990488
Alignment:
Q  25 gaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28990450 gaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 28990488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 19920653 - 19920694
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920653 agggaccaaacaaatactaattaaataagttaagggaccaaa 19920694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 39277730 - 39277771
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39277730 agggaccaaattaatactaattaaataagttaagggaccaaa 39277771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 10394336 - 10394308
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394336 atactaattaaataagttaagggaccaaa 10394308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12702116 - 12701926
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaactatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  12702116 ttaagggaccaaactatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacatttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccaatactttaaatg 12702017  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12702016 aagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaaaggaccaattgagcatttaagcct 12701926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 12261001 - 12261191
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaactata-ctaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||    
T  12261001 ttaagggaccaaactaaaactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaaaagaaaggaccaagccgacactttaaat 12261100  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12261101 aaagttaagggagctaaacggaccttttattgcttatgtgaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgaacatttaagcc 12261191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 208
Target Start/End: Original strand, 12702163 - 12702294
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||| ||||||||| |||||| || || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  12702163 gaatgaaattaacaaaaaggaccagaccgatattttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgatat 12702262  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12702263 caagttaagggactaattgagcatttaagcct 12702294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 16203621 - 16203765
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16203621 ttaaaggaccaaactaatactaattaaataagataaaggaccaaaatttaac-attttttgaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttcaat 16203719  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16203720 aaagttaagggaccaaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 16203765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21304457 - 21304326
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21304457 gaattaaattaacagaaaggactaaactgata-tttaaataaagttaagcgatctaaacgaacattttattacttatgggaccaaaccgatatttgaaat 21304359  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21304358 caagttaagggatcaattgagcatttaagccta 21304326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 36065391 - 36065536
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  36065391 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagagatcaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttcaat 36065490  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36065491 aaagttaagggaccaaaacggaccttttattacttatgagaccaaa 36065536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 208
Target Start/End: Original strand, 2217849 - 2217974
Alignment:
Q  83 aaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaacga-tacttgaaatcaagt 181  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2217849 aaattaacagaaatgatcaaattgatactttaaataaagttaagggacataaacggacattttattacttatgggaccaaaccattacttgaaatcaagt 2217948  T
Q  182 taagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    ||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  2217949 taa-ggaccaaaagagcattaaagcct 2217974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 10373192 - 10373337
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| |       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  10373192 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagagatcaaaatttaatgtttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttcaat 10373291  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10373292 aaagttaagggaccaaaacggatcttttattacttaggggaccaaa 10373337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16581467 - 16581389
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16581467 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgg 16581389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25945956 - 25945871
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25945956 gaattaaattaactgaaaggatcaaactgatactttaaataaagttaagggacctaaacagatcttttattacttatgggaccaaa 25945871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 25946003 - 25946148
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||  ||    
T  25946003 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggaccaaaatttaacatttttttgaattaaattaaccgaaaggaccaaaccaatactttctat 25946102  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25946103 aaagttaagggaccaaaacagaccttttattacttatggaaccaaa 25946148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36065344 - 36065267
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36065344 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggatcttttattacttatg 36065267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 38978852 - 38978937
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  38978852 gaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttaaataaagttaagggacccaaacgaactttttattacatatgggaccaaa 38978937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16203574 - 16203499
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattactta 153  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16203574 gaattaaattaatagaaatgatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacttaaacggaccttttattactta 16203499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2217780 - 2217699
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaa 115  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2217780 atactaattaaataagttaatgtaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacataaaggatcaaattgatactttaa 2217699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 3568500 - 3568632
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||   |||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  3568500 gaattaaaataacacaaaggaccaaagccatacttaaaataaagttaataaacttaaatggaccttttattatttatgggatcaaaccgatacttgaaat 3568599  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||| | | ||||||||| | ||||||| ||||    
T  3568600 caagatgaaggaccaatttaacatttaatccta 3568632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2217691 - 2217621
Alignment:
Q  139 accttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  2217691 accttttattacttatggaaccaaaccgatatctgaaatcaagttaagggatcagaagagcatttaagcct 2217621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45115074 - 45115028
Alignment:
Q  82 taaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaagga 128  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45115074 taaattaacagaaaagatcaaaccgatactttaaataaagttaagga 45115028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 36065362 - 36065403
Alignment:
Q  22 agggaccaaact-atactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36065362 agggaccaaacttatactaattaaataagttaagggaccaaa 36065403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Original strand, 16581486 - 16581534
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaac 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16581486 agggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaaatttaac 16581534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38978835 - 38978787
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaac 69  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38978835 agggatcaaactaatactaattaaataagttaacggaccaaaatttaac 38978787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10373145 - 10373066
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatggg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||  || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  10373145 gaattaaatcaacagaaaggatcaaaacaatactttaaatacagttaagccacataaacagatcttttattatttatggg 10373066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 12702142 - 12702104
Alignment:
Q  25 gaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12702142 gaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 12702104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38978767 - 38978713
Alignment:
Q  93 aaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttat 147  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38978767 aaaggaccaaaccgttactttaaataaagttaagggaccaaaacggaccttttat 38978713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 25945974 - 25946015
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25945974 agggaccaaactaatattaattaaataagttaagggaccaaa 25946015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 62
Target Start/End: Original strand, 10373176 - 10373204
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10373176 atactaattaaataagttaagggaccaaa 10373204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6000666 - 6000477
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6000666 agggaccaaactaatactaattaaataagttaatggaccaaaatttaacgtttttttaaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttaaataaa 6000567  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6000566 gttaagggacctaaatggactttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 6000477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 4133074 - 4133206
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  4133074 gaattaaattaacagaaaggaccaaactgacactttaaataaagttaagggacctaaacggacattttattacttatgagatcaaaccaatacttgaaat 4133173  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4133174 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 4133206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26041697 - 26041506
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  26041697 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttcaat 26041598  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |   | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26041597 aaagttaagggaccaaaacggaccttttattacttatgggaccaaagcgatactgaataaatacttaagggaccaaaagagcatttaagcct 26041506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43392428 - 43392298
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  43392428 gaattaaattaacaaaagggaccaaaccgatattttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttaatatttatgggaccaaaccaatacttgaaat 43392329  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43392328 caagttaagggaccaattgagcatttaagcc 43392298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 472785 - 472643
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  472785 agggaccaaactaatactaattaaataagataagggaccaaaatttaacatttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttcaataaa 472686  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  472685 gttaagggacctaaacgcaccttttattacttatgagaccaaa 472643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 30284093 - 30284238
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  30284093 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaatgaccaaaccgatactttcaat 30284192  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30284193 aaagttaagggacctaaacggacattttattacttatgagaccaaa 30284238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Original strand, 32389680 - 32389809
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatc 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32389680 aattaaattaacaaaaaggatcaaactgatactttaaataaagttaagggacttaaacagacattttattacttattggaccaaactgatacttgaaatc 32389779  T
Q  178 -aagttaagggaccaattgagcatttaagc 206  Q
     |||| || ||||||||||| |||||||||    
T  32389780 aaagtcaaaggaccaattgaacatttaagc 32389809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37691884 - 37691718
Alignment:
Q  20 taagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||     
T  37691884 taagagaccaaactaatactaattaaataagttaatggaccaaaatttaacttttttttgaattaaattaacagaaaagaccaaagtgatactttaaata 37691785  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaa 184  Q
    || |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  37691784 aaattaagggacttaatcggactttttattacttatggaatcaaaccgatacttgaaatcaagttaa 37691718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 205
Target Start/End: Original strand, 6000684 - 6000812
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6000684 gaattaaattaagagaaaggacctaacggatactttaaataaagttaagggacctaaacggactttttattacttataggaccaaactgatacttgaaat 6000783  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaag 205  Q
     || ||||||||  |||||||||||||||    
T  6000784 taaattaagggattaattgagcatttaag 6000812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8462977 - 8462845
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  8462977 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccaatactttaaataaagttaaaggacctaaacagacattttattatttatgggaccaaactgatatttgaaat 8462878  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  8462877 caagttaagggataaattgaacattcaagccta 8462845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Original strand, 21494199 - 21494285
Alignment:
Q  208 tagattcctcaat-tttcagcagctgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatttaaaatcatcaattgcttc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21494199 tagattcctcaatctttcagcagctcaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaggggtatatttaaaatcatcaattgcttc 21494285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32871799 - 32871628
Alignment:
Q  20 taagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||     
T  32871799 taagagaccaaactaatactaatgaaataagttaagggaccaaaacttaacgtttttttgaattaaattaacataaagaaccaaactcatactttaaata 32871700  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacgga-ccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaaggga 188  Q
    ||||||||| |||||||| ||   |||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  32871699 aagttaagggacctaaacagatttttttattatttatgggaccaaaccaatacttaaaatcaagttaaggga 32871628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 18417454 - 18417583
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatc 177  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||     
T  18417454 aattaaattaatggaaaggaccaaattgatactttaaataaagttaagggacctaaatggaccttttattatttataggatcaaaccgatacttgaaata 18417553  T
Q  178 aagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  18417554 aagttaagggaccaaaaaagcatttaagcc 18417583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24846373 - 24846289
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24846373 aattaaattaacataaatgatcaaactgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgagaccaaa 24846289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4133027 - 4132836
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnn--gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaa 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  4133027 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacttctttttttgcattaaattaacataagggatcaaaccgatacttgaa 4132928  T
Q  116 atgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagc 206  Q
    || ||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||| ||| |  | |||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4132927 ataaagttaagggaccaaaataaaccttttattacttatgagactagcctgataattaaaatcaagttaagggaccaattcaacatttaagc 4132836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 472803 - 472888
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  472803 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggacagttcattacttatgggaccaaa 472888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30284047 - 30283963
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30284047 gaattaaattaacaaaaaggatcaaaccgatactttaaatgaagttaaggga-ctaaacggaccttttattacttatgagaccaaa 30283963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 16963389 - 16963534
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||       | |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  16963389 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagagaagggatcaaaatttaacgtttttttgcattaaattaacagaaaagaccaaaccgatactttcaat 16963488  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16963489 aaagttaagggaccaaaatggacattttattacttatgggaacaaa 16963534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25732018 - 25731914
Alignment:
Q  108 tactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagc 206  Q
    ||||| |||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25732018 tacttgaaatcaagttaagggatctaagcagaccttttattacttatgggactaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccaaaagagcatttaagc 25731919  T
Q  207 ctaga 211  Q
    |||||    
T  25731918 ctaga 25731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 8462995 - 8463137
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| ||    
T  8462995 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaaagaccaaaatttaacgttgttttgaattaaattaacagaagagaccaaactgttactttaaataaa 8463094  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||| ||| |||| ||||    
T  8463095 gttaagggatctaaacggaatttttattatttaagggatcaaa 8463137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16962974 - 16962889
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16962974 gaattaaattaacataaagaatcaaaatgatactttaaataaagttaatggacctaaacggaccttttattacttatgagaccaaa 16962889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 163
Target Start/End: Original strand, 24846396 - 24846534
Alignment:
Q  26 accaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtta 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||    
T  24846396 accaaactaatactaattaaataagataagggatcaaaatttaacatttttttaaattaaattaacagaaaggaccaaaccaatactttcaataaagtta 24846495  T
Q  125 aggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24846496 agggactaaaacggaccttttattatttatggaaccaaa 24846534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 24485773 - 24485857
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24485773 aattaaattaatagaaaggaccaaaccgacactttaaataaagttaagggacttaaacggactttttattacttatgggaccaaa 24485857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16833632 - 16833457
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||| || ||| |||||  |||||| |||| ||    
T  16833632 agggaccaaactaataccaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgtttttttgcattaaattaacataagggaacaaaccaatacttgaaataaa 16833533  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaacga-tacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaag 205  Q
    ||| ||           ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  16833532 gtttaga----------gaccttttattacttataggaccaaaccaatacttgaaatcaagttaagggatcaattaaacatttaag 16833457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 26041744 - 26041828
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  26041744 gaattaaattaacataaag-atcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacaaaccttttattacttataggaccaaa 26041828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7685343 - 7685228
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||    
T  7685343 gaattaaattaacagaaag-atcaaaccga-actttaaataaagttatggaacttaaacagatattttattacttataagattaaaccgatacttgaaat 7685246  T
Q  177 caagttaagggaccaatt 194  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  7685245 caaattaagggaccaatt 7685228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24485755 - 24485614
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||        ||||||||||| |||| ||| |||||   |||||||||| ||    
T  24485755 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagaaaccaaaatttaacgtttttta-aattaaattaatagaagggaccaaaccattactttaaataaa 24485657  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||| ||  || ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  24485656 gttaagggactaaatcggacattttattacttaaaggaccaaa 24485614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 30284065 - 30284105
Alignment:
Q  22 agggaccaaactatactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30284065 agggaccaaactatactaattaaataagttaagggaccaaa 30284105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 127
Target Start/End: Original strand, 37691932 - 37691981
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaagg 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37691932 gaattaaattaactgaaaggaccaaactgatactttaaataaagttaagg 37691981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 192
Target Start/End: Original strand, 32871849 - 32871960
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggacctttt-attacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||     |||||  |||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32871849 aattaaattaataaaaaggatcaaactaataccttaaaa----ttaagtgacctaaacggatttttttattatttatgggaccaaatcgatacttgaaat 32871944  T
Q  177 caagttaagggaccaa 192  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  32871945 caaattaagagaccaa 32871960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26041726 - 26041685
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26041726 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 26041685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Original strand, 16963362 - 16963401
Alignment:
Q  24 ggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963362 ggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 16963401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32389647 - 32389560
Alignment:
Q  108 tactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaacgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaa 204  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||      ||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  32389647 tactttaaataaagttaagggacttaaacgaaccttttattactta------ca---gatacttgaaattaaattaagggactaattgagcatttaa 32389560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 62
Target Start/End: Original strand, 43392459 - 43392487
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43392459 atactaattaaataagttaagggaccaaa 43392487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 54
Target Start/End: Original strand, 43392475 - 43392511
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaag 54  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43392475 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaag 43392511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 13557317 - 13557507
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaactatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnn-gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||        |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  13557317 ttaagggaccaaactatactaattaaataagttaaaggatcaaaatttaacgttttttttgaattaaattaacataaaagaccaaac-gatactttaaat 13557415  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13557416 gaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccagttgaacatttaagcct 13557507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36194801 - 36194625
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaaccta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  36194801 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacctttttttgaattaaattaatagaaaggatcaaactgatactttaaataaagttaagggatcta 36194702  T
Q  134 aacggaccttttattacttatgggacc-aaacgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  36194701 aacagactttttattacttatgggaccaaaacgatacttgaaatcaagttaagggactaaaagagcatttaagccta 36194625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 12654878 - 12655064
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12654878 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagagaccaaaatttaacgttcttttgaattaaattgacataaaggaccaaacagatactttaaat 12654977  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcattta 203  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  12654978 aaagttaagggacctaaacggaacttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggatcaaaagagcattta 12655064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Original strand, 31933465 - 31933640
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaaccta 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  | | |||    
T  31933465 atactaattaaataagttaagagaccaaaatttaacgtttttt-gaattaaattaagagaaaggaccaaattgatactttaaataaagttagcggatcta 31933563  T
Q  134 aacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31933564 aatggactttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccaaaagagcatttaagccta 31933640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18847496 - 18847366
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaacgatacttgaaatc 177  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18847496 gaattaaattaacataagggaccaaaccgatactttaaataaagttaagggacataaacaaaccttttattacttatgagaccaatcgatacttgaaatc 18847397  T
Q  178 aagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847396 aagttaagggaccaattgagcatttaagcct 18847366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 10134785 - 10134930
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  10134785 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttcaat 10134884  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10134885 aaagttaagggaccaaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 10134930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12654831 - 12654703
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12654831 gaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttaaataaagttaaggaaactaaatggaccttttattatttatgggaccaaaccgacacttgaaat 12654732  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaag 205  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||    
T  12654731 aaagttaagggaccaaaagagcatttaag 12654703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Original strand, 18847517 - 18847704
Alignment:
Q  25 gaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtt 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||| || ||| ||||| | ||| |||||  |||||    
T  18847517 gaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgtttctttgaattgaattaacataagggaccaaaccgttaccttaaacaaagtt 18847616  T
Q  124 aaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcctag 210  Q
    |||| || ||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18847617 aagggacttaaatagactttttattacttatgggacaaaactgatacttgaaatcaagttaagggactaattaagcatttaagcctag 18847704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10134738 - 10134653
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10134738 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 10134653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Original strand, 36194868 - 36194996
Alignment:
Q  82 taaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaag 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36194868 taaattaacagaaaggaccaaactgatactttaaataaagttaaaggacctaaacggatttttgattatttatgggaccaaaccgatacttaaaatcaag 36194967  T
Q  181 ttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  36194968 ttaagggactaaaagagcatttaagccta 36194996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13557270 - 13557140
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaa-ggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaa 175  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13557270 gaattaaattaacaaaaaaggatcagaccgatactttaa-taaagttatgggacctaaacgaaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaa 13557172  T
Q  176 tcaagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13557171 tcaagttaagggaccgattgaacatttaagcc 13557140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31933402 - 31933272
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatc 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  31933402 aattaaattaacagaaaggaccaaagtgatactttaaataaagttaagggatctaaatagaccttttattacttatgggaccaaaccaatacttaaaatc 31933303  T
Q  178 aagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    || ||||||||||||  || |||||||||||    
T  31933302 aaattaagggaccaaaagaacatttaagcct 31933272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 40832286 - 40832428
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||    
T  40832286 agggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatacttttaataaa 40832385  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40832386 gttaaggggacaaaacggatcttttattacttatgggaccaaa 40832428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21015122 - 21014977
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  21015122 ttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacttttttttgaattaaattaacagaagggaccaaaccgttactttaaat 21015023  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  21015022 aaagttaagggaccaaaacaaaccttttattacttaaaggaccaaa 21014977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45333616 - 45333546
Alignment:
Q  212 ttcctcaat-tttcagcagctgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatttaaaatc 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45333616 ttcctcaatctttcagcagctgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatttaaaatc 45333546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40832266 - 40832181
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40832266 gaattaaattaacataaaggatcaaaccgatactttaaataaaattaagggacctaaacggaccttttattacttatgggatcaaa 40832181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 21015169 - 21015254
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21015169 gaattaaattaaaagaaaggaccaaaccgatactttaaataaagttaagggacccaaacagactttttattacttatgggaccaaa 21015254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 10134756 - 10134797
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10134756 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 10134797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21015151 - 21015110
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21015151 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaggaaccaaa 21015110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 62
Target Start/End: Original strand, 12654862 - 12654890
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12654862 atactaattaaataagttaagggaccaaa 12654890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 62
Target Start/End: Original strand, 13557301 - 13557329
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557301 atactaattaaataagttaagggaccaaa 13557329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 31933420 - 31933456
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaaggga 57  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31933420 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaggga 31933456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1113395 - 1113212
Alignment:
Q  24 ggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagt 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  1113395 ggaccaaactaatactaattaaataagttaaaggatcaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaacgaccaaactgatactttaaataaagt 1113296  T
Q  123 taaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaa-acgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaag 205  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1113295 taagggacctaaacagactttttattacttatgggaccaacccgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaag 1113212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8607950 - 8607778
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaaccta 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||    
T  8607950 atactaattaaataagttaaaggatcaaaatttaacgtttttttggattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggactta 8607851  T
Q  134 aacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaag 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8607850 aacggaccttttattacttatgggatcaaaccgatacttgaaatcaagttaagagaccaattgagcatttaag 8607778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36215779 - 36215649
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36215779 gaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttaaataaagttaaggaatctaaacggaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaat 36215680  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36215679 taagttaagggaccaattgagcatttaagcc 36215649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 55620323 - 55620190
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55620323 gaattaaattaacagaaaggaccaaactgatacttttaataaagttaagggacctaaacagactttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaat 55620224  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcctag 210  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  55620223 caagttaagggaccaaaagagcatttaagcctag 55620190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 55627627 - 55627494
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55627627 gaattaaattaacagaaaggaccaaactgatacttttaataaagttaagggacctaaacagactttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaat 55627528  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcctag 210  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  55627527 caagttaagggaccaaaagagcatttaagcctag 55627494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 17254683 - 17254815
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  17254683 gaattaaattaacagaaaagaccaaactgacactttaaataaagttaagggacctaaacggacattttattacttatgagatcaaaccaatacttgaaat 17254782  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17254783 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 17254815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 1113414 - 1113544
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  1113414 gaattaaattaacaaaagggaccaaaccgatactttaaatgaagttaagggacctaaacagaccttttaatatttatgggaccaaatcaatacttgaaat 1113513  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1113514 caagttaagggaccaattgagcatttaagcc 1113544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29430124 - 29429937
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||    
T  29430124 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaagagaaaagaccaaattgatactttaaataaa 29430025  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||| || | |||||||||| |||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  29430024 gttaggggatctaaacggactttttcttactta--ggaccaaaccgatatttgaaatcaagttaagggaccaaaagagcatttaatccta 29429937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24039439 - 24039250
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaactat-actaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||       |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24039439 ttaagggaccaatctaacactaattaaataagttaagggaccaaaacttgccgtttttt-gaattaaattaatagaaaagatcaaaccgatactttaaat 24039341  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
     || |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24039340 aaaattaaaggacctaaacgaactttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaatcaagttaagggatcaattgaacatttaagcc 24039250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 51024621 - 51024464
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaaccta 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  51024621 atactaattaaataaattaagggaccaaaatttaacgttttttttaattaaattaacagaaaggactaaactgatactttaaataatgttaaggaactta 51024522  T
Q  134 aacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggacca 191  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  51024521 aacgaaacttttattacttatgggaccaaatcaatacttgaaatc-agttaagggacca 51024464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 14251373 - 14251518
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14251373 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggaccaaaatttaacatttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttcaat 14251472  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14251473 aaagttaaaggaccaatacggaccttttattacttatgggaccaaa 14251518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44304172 - 44304027
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  44304172 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaaatttaacttttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttcaat 44304073  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44304072 aaagttaagggaccaaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 44304027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 208
Target Start/End: Original strand, 24039486 - 24039617
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24039486 gaattaaattaacataaatgattaaaccgatacttaaaataaagttaagggacctaaacgaaccttttattacttatgagaccaaaccaatacttgaaat 24039585  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24039586 caagttaagggaccaattaagcatttaagcct 24039617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 52630855 - 52630769
Alignment:
Q  208 tagattcctcaat-tttcagcagctgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatttaaaatcatcaattgcttc 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52630855 tagattcctcaatctttcagcagttgaagcagcccttttgttggttggctcaagtacaagggcatatttaaaatcaacaattgcttc 52630769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 51399393 - 51399538
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||| |    
T  51399393 ttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacatttttttgaattaaattaacataagggaccaaaccgttactttaact 51399492  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51399493 aaagttaagggaccaaaacggaccttttattacttaagggaccaaa 51399538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Original strand, 29430142 - 29430257
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  29430142 gaattaaattaacagaaaggaccgaactgatactttaaataaaattaagggatctaaacataccttttattacttatgggaccaaaccaatacttaaaat 29430241  T
Q  177 caagttaagggaccaa 192  Q
    ||||||||||||||||    
T  29430242 caagttaagggaccaa 29430257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35016879 - 35016741
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  35016879 ttaagagaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaac-attttttgaattaaattaaccgaaaggaccaaaccgatactttcaat 35016781  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatggg 157  Q
     ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35016780 aaagttaagggaccaaaacggactttttattacttatggg 35016741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 44304219 - 44304304
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44304219 gaattaaattaacataaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatggcaccaaa 44304304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48018740 - 48018608
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| || |||||| | |||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||    
T  48018740 gaattaaattaatagaaatgatcaaatcgatactttaaataaaattaagggatctaaacagatattttattacttttgggaccaaaccgatattttaaat 48018641  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48018640 caagttaagagaccaattgagcatttaagccta 48018608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49905857 - 49905773
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49905857 aattaaattaacagaaatgatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgagaccaaa 49905773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14251326 - 14251241
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14251326 gaattaaattaatagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttagaggaccaaa 14251241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 35016926 - 35017011
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  35016926 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaataaagttaagagacctaaatggacctttaattatttatgggaccaaa 35017011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51399346 - 51399261
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51399346 gaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacagactttttattacttatgggaccaaa 51399261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 163
Target Start/End: Original strand, 36215801 - 36215939
Alignment:
Q  26 accaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtta 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||  | |||||| ||| ||||||    
T  36215801 accaaactaatactaattaaataagttaagggactaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaagggaccaaatcgttactttcaataaagtta 36215900  T
Q  125 aggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||  | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  36215901 agcgaactaaacggactttttattatttaagggaccaaa 36215939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Original strand, 49905876 - 49906015
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnn-gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatga 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  49905876 agggaccaaactaatactaattaaataagataagagatcaaaatttaatgttttttttgaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatagttttaataa 49905975  T
Q  120 agttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggac 159  Q
    ||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  49905976 agttaaggggtcaaaacggacattttattacttatgggac 49906015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55561148 - 55561022
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatc 177  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |  || ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  55561148 aattaaattaacagaaataacaaaactgatactttaaataaagttaagagaccttagcaaactttttattacttatggaaccaaactgatgtttgaaatc 55561049  T
Q  178 aagttaagggaccaattgagcatttaa 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  55561048 aagttaagggatcaatcgagcatttaa 55561022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17254636 - 17254444
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaac---gnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatacttta 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |    
T  17254636 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaactttttttttttgcattaaattaacataagggatcaaaccgatacttga 17254537  T
Q  115 aatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagc 206  Q
    ||| ||||||||| ||| |||   || |||||||||||||| |||||  | |||| || |||||||||||| |||  |||| | |||||||||    
T  17254536 aataaagttaagggaccaaaataaacattttattacttatgagaccagcctgataattaaaatcaagttaaaggatgaattcaacatttaagc 17254444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43099452 - 43099327
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatc 177  Q
    |||||||| || ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || |||      
T  43099452 aattaaatcaatagaaatgaccaaaacgatactttaaataaagttaagga-cctaaacggaccttttattacttatggaatcaaaccgatatttaaaa-- 43099356  T
Q  178 aagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43099355 ---ttaagagaccaattgagcatttaagccta 43099327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17728844 - 17728728
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||       ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  17728844 ttaagggaccaaactaatactaattatataaattaagggaccaaaatataacgtttttttgaattaaataaatagaaatgaccaaactgataccttaaat 17728745  T
Q  118 gaagttaaggaacctaa 134  Q
     || |||||| ||||||    
T  17728744 aaaattaagggacctaa 17728728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 68
Target Start/End: Original strand, 43099485 - 43099519
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43099485 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaa 43099519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 44304199 - 44304160
Alignment:
Q  24 ggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44304199 ggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 44304160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 51399364 - 51399405
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51399364 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaggaaccaaa 51399405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Original strand, 55561222 - 55561279
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaac 136  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  55561222 aattaaattaataaaaaagataaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaac 55561279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24039468 - 24039428
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaa 61  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24039468 agggacgaaactaatactaattaaataagttaagggaccaa 24039428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 11047215 - 11047347
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11047215 gaattaaattaacagaaatgaccaaactaatactttaaataaagttaagggacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaat 11047314  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11047315 caagttaagggaccaattgaacatttaagccta 11047347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49220298 - 49220113
Alignment:
Q  25 gaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtt 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||    
T  49220298 gaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaagcaccaaaccgataatttaaataaagtt 49220199  T
Q  124 aaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    || | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49220198 aaaggacctaaacggactttttattatttatgggactaaaccgatacttaaaatcaagttaagggaccaattaagcatttaagcct 49220113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52857106 - 52856974
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52857106 gaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttaaataaagttaaggtatctaaacggaccttttattacttatgggaccaaaccgatacttgaaat 52857007  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52857006 taagttaagggaccaattgagcgtttaagccta 52856974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Original strand, 28253677 - 28253807
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaa-acgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  28253677 gaattaaattaacagaaatgatcaaactgatactttaaataaagttaagggacttaatcagaccttttattatttatgggaccaatccgatacttgaaat 28253776  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28253777 caagttaagggaccaattgagcatttaagcc 28253807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Original strand, 49220319 - 49220446
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49220319 gaattaaattaacagaaaggaccaagctgatactttaaataaagttaagggacctaaacagactttttattatttatgggaccaaaccgatacttgaaat 49220418  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  49220419 taagttaagggaccaattgagcatttaa 49220446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31071132 - 31070947
Alignment:
Q  24 ggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagt 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  31071132 ggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaattttaac-attttttgaattgaattaacaaaaaggaccaaactgatactt-aaataaagt 31071035  T
Q  123 taaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  31071034 taagggacttaaacggatcttttattacttatgggaccaaactgatacttaaaatcaagttaagggaccaaaagaacatttaagccta 31070947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28253631 - 28253441
Alignment:
Q  20 taagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatg 118  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||     
T  28253631 taagggaccaaaataatactgattaaataagttaagggaccaaaatttaacgttttttc-aattaaattaacagaagggaccaaaccgatacttgaaata 28253533  T
Q  119 aagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28253532 aagttaagggacttaaacgaactttttattacttttgggaccaatctgatacttgaaatcatgttaagggaccaattgaacatttaaaccta 28253441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 31071151 - 31071283
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  31071151 gaattaaattaacagaaatgaccaaactgatactttaaataaagttaagggacctaaacagaccttttattatttatgggatcaaaccgatacttgaaat 31071250  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  31071251 caagttaagggaagaaaagagcatttaagccta 31071283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18734124 - 18733957
Alignment:
Q  25 gaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtt 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  18734124 gaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaac-tttctttgaattaaattaacagaaagaacgaaactgatactttaaataaagtt 18734026  T
Q  124 aaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaa 192  Q
    |||| || ||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18734025 aagggacttaaacagactttttacta-ttatgggaccaaactgatacttgaaatcaagttaagagaccaa 18733957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26988934 - 26988804
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatc 177  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  26988934 aattaaattaactgaagggaccaaacccatactttaaataaagttaagggacctaaaaggacattttattacttatgggacaaaactgatacttgaaata 26988835  T
Q  178 aagttaagggaccaattgagcatttaagcct 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26988834 aagttaagggaccaattaagcatttaagcct 26988804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 43464989 - 43465134
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||    
T  43464989 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggaccaaaatttaatgtttttatgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgataatttcaat 43465088  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43465089 aaagttaatggaccaaaacggacattttattacttatgggaccaaa 43465134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46453064 - 46452920
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  46453064 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagagaccaaaatttaacgtattttt-aattaaattaacagaagggaccaaactgttactttaaat 46452966  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46452965 aaagttaagggatcaaaacggaccttttattacttaagggaccaaa 46452920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 26247045 - 26247192
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnng--aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaa 115  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26247045 ttaaaggaccaaactaatactaattaaataagataagggaccaaaatttaacgttttttttttaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttca 26247144  T
Q  116 atgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26247145 ataaagttaagagaccaaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 26247192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 52857153 - 52857298
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  52857153 ttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaagggaccaaaccgttactttaaat 52857252  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||    
T  52857253 aaagttaagggacctaaacgaacttttttttatttaagggaccaaa 52857298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 13301884 - 13301969
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13301884 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggatcttttattacttacgggaccaaa 13301969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 13312540 - 13312625
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13312540 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggatcttttattacttacgggaccaaa 13312625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26246998 - 26246913
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26246998 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggacattttattacttacgggaccaaa 26246913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24244655 - 24244510
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||       |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||    
T  24244655 ttaaggcaccaaactaatactaattaaataagataagagaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaatataaaggaccaaaccgatactttcaat 24244556  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  24244555 aaagttaagggaccaaaacagatcttttattacttatgggatcaaa 24244510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Original strand, 24244702 - 24244779
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24244702 aattaaattaacagaaatgatcaaaccgatactttaaataaagttaagggatctaaacggaccttttattacttatgg 24244779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43464941 - 43464857
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43464941 gaattaaattaacagaaaggatcaacc-gatactttaaatatagttaagggacctaaccggaccttttattacttatgggaccaaa 43464857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11047095 - 11046990
Alignment:
Q  80 attaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatca 178  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11047095 attaaattaacagaagggaccaaaccgatacttgaaataaagttaaaga-cctaaagggaccttttatttcttatgggaccaaaccgatacatgaaatca 11046997  T
Q  179 agttaag 185  Q
    |||||||    
T  11046996 agttaag 11046990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6276188 - 6276103
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6276188 gaattaaattaaccgaaaggatcaaactgatactttaaataaagttttgggatctaaacggaccttttattacttattggatcaaa 6276103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 46453111 - 46453196
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  46453111 gaattaaattaacataaaggactaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggactttttattacttatgagaccaaa 46453196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4953314 - 4953169
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||         |||||||||||||||| ||| |||||   ||||||||||    
T  4953314 ttaagggatcaaactaatactaattaaataatttaaggggccaaaatttaacatattttttaattaaattaacagaagggaccaaaccattactttaaat 4953215  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4953214 aaagttaagggaccaaattggaccttttattacttaagggaccaaa 4953169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 4953361 - 4953446
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4953361 gaattaagttaacggaaaggaccaaaccgacactttaaataaagttaagggacttaaacagactttttattacttatgggaccaaa 4953446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11046980 - 11046925
Alignment:
Q  155 gggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11046980 gggaccaaaccgatacatgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 11046925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11047167 - 11047116
Alignment:
Q  20 taagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacg 70  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11047167 taagggaccaaattaatactaattaaataagttaagcgaccaaaatttaacg 11047116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 43464960 - 43465001
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43464960 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 43465001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 46453093 - 46453052
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46453093 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 46453052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 205
Target Start/End: Original strand, 18734149 - 18734233
Alignment:
Q  122 ttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaa-acgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaag 205  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  18734149 ttaagggacctaaacagactttttattacttaagggaccaagccgatacttaaaataaagttaatggatcaaaagagcatttaag 18734233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11047197 - 11047156
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11047197 agggaccaaactaatactaattaaataagctaagggaccaaa 11047156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 26247016 - 26247057
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26247016 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaaggaccaaa 26247057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Original strand, 52857124 - 52857165
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52857124 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaggaaccaaa 52857165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8417749 - 8417561
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  8417749 ttaaaggaccaaactaatactaattaaataagttaagagaccaaaatttaacgttcttttgaattaaattaacagaaatgaccagactgatactttaaat 8417650  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaag 205  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8417649 aaagttaagggacctaaacggaacttttattacttgtgagatcaaaccgatacttgaaatcaagttaagggaccaaaagagcatttaag 8417561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 17115496 - 17115641
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17115496 ttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaaatttaacgtttgtttgaattaaattaacagaaaggaccaaactgatactttcaat 17115595  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
     ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17115596 caagttaagggaccaaaacgaaccttttattacttatgggaccaaa 17115641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9990085 - 9989959
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  9990085 gaattaaattaacagaagggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacataccttttattaattatgg-accaaaccgattcttaaaat 9989987  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaa 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9989986 caagttaagggaccaattgaacatttaa 9989959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Original strand, 18968700 - 18968871
Alignment:
Q  34 atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaaccta 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| || ||||    ||||||| || ||||||||| | | |    
T  18968700 atactaattaaatcagttaagggaccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacataaatga-caaa----tactttatataaagttaagggatcca 18968794  T
Q  134 aacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  18968795 aacataccttttattatttatgggatcaaaccgatacttgaaatcaagttaaggaatcaattgagcatttaaaccta 18968871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14662545 - 14662408
Alignment:
Q  26 accaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtta 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  14662545 accaaactaatactaattaaataagttaaggggccaaaatttaacgtttttttgaattaaattaatagaagggaccaaaccgttactttaaataaagtta 14662446  T
Q  125 aggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14662445 agg-accaaaacgaaccttttattacttaagggaccaaa 14662408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 18508759 - 18508844
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  18508759 gaattaaattaacagaaaagatcaaaccgatactttaaataaagttaaggaacctaaacagactttttattatttatgggaccaaa 18508844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18968639 - 18968507
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||| | |||||||||||    
T  18968639 gaattaaatcaacaaaagggaccaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggatcttttattgattatgaaaccaaaccaatacttgaaat 18968540  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  18968539 caagttaagggattaatttagcatttaagccta 18968507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 1983486 - 1983571
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1983486 gaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatacttttaataaagttaaggggccaaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 1983571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 14662599 - 14662684
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  14662599 gaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttaaataaagttaagggacctaaacggtttttttattacttatgggaccaaa 14662684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Original strand, 35463800 - 35463885
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35463800 gaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttaaataaagttaagggaccgaaacagactttttattacttatgggaccaaa 35463885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Original strand, 9990103 - 9990292
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaa 120  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||    
T  9990103 agggaccaaattaatactaattaaataagttaagcgatcaaaatttaacgttttttttaattaaattaacataaaggaccaatccgatactttaaataaa 9990202  T
Q  121 gttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatc----aagttaagggaccaattgagcatttaag 205  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||| |||||  | ||||| ||||||| |||||    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9990203 gttaagggacctaaacagatctttcattatttatgaaatcaaactgatacttaaaatcaatgaagttaagggactaattgaacatttaag 9990292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18508706 - 18508569
Alignment:
Q  25 gaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtt 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||| |    
T  18508706 gaccaaactagtactaattaaataagataagg-accaaaatttaac-cttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccaatactttcaataaagct 18508609  T
Q  124 aaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18508608 aaggaaccaaaatggaccttttattacttatgggatcaaa 18508569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35463753 - 35463607
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaa-tttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaa 116  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||     
T  35463753 ttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaaaatttaacatttttttgaattaaattaacagaagggaccaaaccgttactttaac 35463654  T
Q  117 tgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    | ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  35463653 taaagttaagggaccaaaacagacattttattacttaagggatcaaa 35463607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Original strand, 36207413 - 36207546
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| || |||| | | || |||| |  |||||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  36207413 gaattaaattaaccgaaaggactaaaccgatactttaaataaaattaacggatcttaacgaattttttattacttatgtgatcaaaccggtacttgaaat 36207512  T
Q  177 caagttaaggg-accaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  36207513 caagttatgggtatcaattgaacatttaagccta 36207546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 127
Target Start/End: Original strand, 8417796 - 8417845
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaagg 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  8417796 gaattaaattaactgaaaggaccaaactaatactttaaataaaattaagg 8417845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 35463782 - 35463741
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35463782 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaggaaccaaa 35463741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 1211593 - 1211748
Alignment:
Q  39 aattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacgg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| || ||| || ||  ||||||||||| ||||||||| | |||||| |    
T  1211593 aattaaataagttaagggaccaaaatttaacgttttttttaattaaattaacaaaatggaccataccaatactttaaataaagttaagggatctaaacag 1211692  T
Q  139 accttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatcaagttaagggaccaat 193  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1211693 atcttttattacttatgagaccaaacagatacttgaaatcaagttaagggaccaat 1211748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 959199 - 959058
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  959199 ttaagggaccaaactaatattaattaaataagataagggaccaaaatttaacgttttttttaattaaatcaagagaaaggatcaaaccgatactttcaat 959100  T
Q  118 gaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggac 159  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  959099 aaagttaagggaccaaaacggaccttttattacttatgggac 959058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Original strand, 959246 - 959330
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  959246 aattaaattaacagaaaggattaaactgatactttaaataaagttaagggacctaaacgaaccttttattacttatgggaccaaa 959330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1211523 - 1211392
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaatc 177  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  1211523 aattaaattaacaaaagggaccaaaccgatactttaaataaaattaaatgacctaaacggaccttttattacatatgggatcaaactgatacttcaaatc 1211424  T
Q  178 aagttaagggaccaattgagcatttaagccta 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1211423 aagttaagggatcaattgagcatttaaaccta 1211392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 959228 - 959187
Alignment:
Q  22 agggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaa 62  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  959228 agggaccaaattaatactaattaaataagttaagggaccaaa 959187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Original strand, 26139 - 26285
Alignment:
Q  18 attaagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaa 116  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  26139 attaagggacaaaactaatactaattaaataagataaaagatcaaaatttaacgtttttttgaattaaattaacagaaaggaccaaaccgatactttcaa 26238  T
Q  117 tgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239 taaagttaagggaccaaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 26285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26093 - 26008
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  26093 gaattaaattaacagaaaggatcaaaccgatactttaaataaagttaagggacttaaacaaactttttattacttatgggaccaaa 26008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Original strand, 25490 - 25617
Alignment:
Q  79 aattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagtt-aaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaac-gatacttgaaat 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  25490 aattaaattaacagaagggatcaaaccgatactttaaacaaagttaaaaggacctaaacggatcatttattacttatgagatcaaactgatacttgaaat 25589  T
Q  177 caagttaagggaccaattgagcatttaa 204  Q
    ||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  25590 caatttatggaaccaattgagtatttaa 25617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 25442 - 25334
Alignment:
Q  19 ttaagggaccaaact-atactaattaaataagttaagggaccaaaatttaacgnnnnnnngaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaat 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||| | ||||| |||||| || |||| ||||    
T  25442 ttaagggaccaaacttataataattaaataagttaa-ggaccaaaatttaacatttttttgaattaaattaagaaaaaggttcaaaccgaaacttgaaat 25344  T
Q  118 gaagttaagg 127  Q
     |||||||||    
T  25343 caagttaagg 25334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25352 - 25313
Alignment:
Q  168 acttgaaatcaagttaagggaccaattgagcatttaagcc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25352 acttgaaatcaagttaagggaccgattgaacatttaagcc 25313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 184
Target Start/End: Original strand, 233672 - 233776
Alignment:
Q  81 ttaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaatcaa 179  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||    
T  233672 ttaaattaatagaaaaaaccaaactgatactttaaataaagttaagggatctaaacggatcttttattacttatggaaccaaaccgaagattgaaatcaa 233771  T
Q  180 gttaa 184  Q
    |||||    
T  233772 gttaa 233776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 233663 - 233556
Alignment:
Q  78 gaattaaattaacagaaaggatcaaactgatactttaaatgaagttaaggaacctaaacggaccttttattacttatgggaccaaa-cgatacttgaaat 176  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  233663 gaattaagttaacaaaaataatcaaactgatgttttaaataaagttaagggatctaaacggatcttttattacttatagaactaaaccgatacttgaaat 233564  T
Q  177 caagttaa 184  Q
    ||||||||    
T  233563 caagttaa 233556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University