View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2979_low_9 (Length: 278)

Name: NF2979_low_9
Description: NF2979
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2979_low_9
NF2979_low_9
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (16-276)||(18681476-18681736)
chr8 (16-276)||(31567785-31568045)
chr8 (16-276)||(31573006-31573266)
chr8 (16-276)||(36799343-36799603)
chr8 (16-276)||(1804441-1804701)
chr8 (16-277)||(9273133-9273394)
chr8 (67-243)||(44476236-44476414)
chr8 (67-243)||(44479498-44479676)
chr8 (70-278)||(22055682-22055893)
chr8 (42-278)||(22177549-22177787)
chr8 (85-243)||(19902945-19903105)
chr8 (70-278)||(22050164-22050375)
chr8 (67-243)||(23865434-23865611)
chr8 (67-243)||(23825124-23825301)
chr8 (42-243)||(17053597-17053799)
chr8 (67-243)||(25409554-25409731)
chr8 (85-243)||(30766966-30767126)
chr8 (31-270)||(22025548-22025791)
chr8 (31-270)||(22063551-22063794)
chr8 (66-243)||(14057606-14057784)
chr8 (42-269)||(41009433-41009658)
chr8 (68-243)||(18609793-18609969)
chr8 (42-173)||(25110911-25111043)
chr8 (79-198)||(21668901-21669023)
chr8 (42-268)||(21326822-21327047)
chr8 (33-200)||(21282101-21282270)
chr8 (161-269)||(20974118-20974228)
chr8 (159-269)||(10606904-10607016)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (16-276)||(14033109-14033369)
chr6 (16-273)||(28359805-28360062)
chr6 (16-276)||(23835024-23835284)
chr6 (19-276)||(33682157-33682413)
chr6 (16-276)||(27562488-27562747)
chr6 (42-243)||(12941800-12942000)
chr6 (68-243)||(28290209-28290384)
chr6 (79-278)||(1592722-1592924)
chr6 (42-278)||(22906928-22907167)
chr6 (42-278)||(19726569-19726807)
chr6 (79-278)||(21724772-21724974)
chr6 (85-243)||(25470708-25470868)
chr6 (42-243)||(12167237-12167439)
chr6 (42-243)||(19286146-19286348)
chr6 (67-243)||(29615199-29615376)
chr6 (67-243)||(34647652-34647829)
chr6 (42-224)||(21566163-21566346)
chr6 (42-243)||(19877330-19877532)
chr6 (42-243)||(19883106-19883308)
chr6 (67-243)||(24562282-24562459)
chr6 (67-243)||(23837580-23837758)
chr6 (67-243)||(34640978-34641155)
chr6 (42-243)||(19786847-19787050)
chr6 (85-278)||(937700-937896)
chr6 (70-204)||(29416468-29416605)
chr6 (42-155)||(18788448-18788560)
chr6 (42-155)||(18799428-18799540)
chr6 (67-169)||(11289602-11289705)
chr6 (42-269)||(19588556-19588781)
chr6 (159-270)||(14581950-14582056)
chr6 (33-155)||(19439792-19439913)
chr6 (104-270)||(19300705-19300868)
chr6 (205-243)||(11283984-11284022)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (16-276)||(27785662-27785922)
chr2 (16-276)||(27790883-27791143)
chr2 (16-276)||(12578760-12579020)
chr2 (16-276)||(12572278-12572538)
chr2 (16-277)||(27295955-27296215)
chr2 (16-243)||(10685574-10685801)
chr2 (42-243)||(20260824-20261024)
chr2 (42-278)||(2105540-2105779)
chr2 (67-243)||(6482321-6482499)
chr2 (67-243)||(6485788-6485966)
chr2 (85-243)||(5707031-5707191)
chr2 (42-243)||(23090006-23090207)
chr2 (42-243)||(23102434-23102635)
chr2 (67-243)||(26582675-26582852)
chr2 (67-243)||(200641-200818)
chr2 (67-243)||(23169298-23169475)
chr2 (67-243)||(23580555-23580732)
chr2 (85-243)||(27367600-27367760)
chr2 (42-243)||(9241333-9241534)
chr2 (67-243)||(43693401-43693578)
chr2 (67-243)||(6744324-6744501)
chr2 (42-243)||(23877838-23878040)
chr2 (33-223)||(22809901-22810093)
chr2 (69-241)||(23263985-23264158)
chr2 (42-198)||(19703456-19703615)
chr2 (42-269)||(20724011-20724236)
chr2 (68-200)||(21907291-21907426)
chr2 (42-200)||(21073954-21074114)
chr2 (159-200)||(24943419-24943460)
chr2 (165-241)||(23269201-23269276)
chr2 (165-241)||(23276070-23276145)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (16-276)||(806947-807207)
chr7 (16-276)||(11631890-11632150)
chr7 (16-276)||(18055659-18055919)
chr7 (16-276)||(18049180-18049440)
chr7 (16-276)||(20579891-20580151)
chr7 (16-276)||(23201453-23201712)
chr7 (16-276)||(23507580-23507839)
chr7 (68-243)||(23665829-23666004)
chr7 (42-243)||(11302852-11303052)
chr7 (23-278)||(15338789-15339046)
chr7 (42-278)||(15723191-15723429)
chr7 (68-243)||(29795730-29795905)
chr7 (68-243)||(29799549-29799724)
chr7 (42-278)||(35962712-35962951)
chr7 (42-275)||(15710967-15711202)
chr7 (68-278)||(14431952-14432165)
chr7 (85-243)||(12591652-12591812)
chr7 (67-243)||(14421354-14421532)
chr7 (79-278)||(1612586-1612788)
chr7 (67-243)||(13123971-13124148)
chr7 (42-278)||(19599805-19600043)
chr7 (42-243)||(13006306-13006508)
chr7 (85-243)||(12710917-12711077)
chr7 (42-243)||(14281620-14281822)
chr7 (67-243)||(4279963-4280140)
chr7 (67-243)||(19616295-19616472)
chr7 (67-243)||(13742505-13742682)
chr7 (69-243)||(16676192-16676367)
chr7 (68-244)||(16109067-16109244)
chr7 (69-243)||(17650429-17650603)
chr7 (33-270)||(6411792-6412032)
chr7 (42-243)||(20328224-20328425)
chr7 (42-212)||(11390302-11390473)
chr7 (68-170)||(14128244-14128347)
chr7 (42-212)||(11383814-11383985)
chr7 (42-212)||(18606896-18607067)
chr7 (68-198)||(21232034-21232167)
chr7 (42-269)||(11220086-11220311)
chr7 (42-130)||(36306034-36306121)
chr7 (159-243)||(37244401-37244484)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (16-276)||(41799901-41800161)
chr4 (16-276)||(42701193-42701453)
chr4 (16-276)||(51602022-51602282)
chr4 (16-276)||(51607903-51608163)
chr4 (16-276)||(53748700-53748960)
chr4 (16-277)||(635713-635974)
chr4 (42-243)||(15533786-15533986)
chr4 (42-278)||(23121562-23121801)
chr4 (68-278)||(20940223-20940436)
chr4 (67-243)||(11847053-11847230)
chr4 (42-243)||(18212138-18212339)
chr4 (85-243)||(8046914-8047074)
chr4 (68-278)||(14484392-14484606)
chr4 (42-278)||(43284871-43285109)
chr4 (42-278)||(17000142-17000381)
chr4 (70-270)||(4831090-4831293)
chr4 (70-270)||(4834385-4834588)
chr4 (31-270)||(11171222-11171464)
chr4 (42-198)||(15406955-15407113)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (16-276)||(44775168-44775428)
chr3 (16-276)||(44780352-44780612)
chr3 (16-276)||(4677131-4677391)
chr3 (16-276)||(41175444-41175704)
chr3 (16-276)||(41180582-41180842)
chr3 (16-276)||(8742859-8743119)
chr3 (16-276)||(8761029-8761289)
chr3 (19-276)||(13909496-13909751)
chr3 (19-276)||(13946441-13946696)
chr3 (31-276)||(13939955-13940198)
chr3 (16-277)||(12200169-12200429)
chr3 (68-228)||(12304763-12304924)
chr3 (68-278)||(16382880-16383093)
chr3 (42-278)||(14652691-14652929)
chr3 (67-243)||(9532849-9533027)
chr3 (68-278)||(16838502-16838714)
chr3 (42-224)||(17157079-17157262)
chr3 (66-269)||(13203537-13203743)
chr3 (42-243)||(41456123-41456325)
chr3 (42-221)||(24191783-24191963)
chr3 (67-243)||(8583294-8583471)
chr3 (67-243)||(14084531-14084708)
chr3 (67-243)||(14089932-14090109)
chr3 (67-243)||(49399473-49399650)
chr3 (42-243)||(16802425-16802626)
chr3 (67-243)||(24123203-24123380)
chr3 (85-243)||(13968850-13969010)
chr3 (85-243)||(13974325-13974485)
chr3 (42-266)||(14544166-14544394)
chr3 (88-243)||(17190836-17190992)
chr3 (70-270)||(34852211-34852414)
chr3 (68-277)||(14292667-14292881)
chr3 (120-278)||(16830055-16830215)
chr3 (42-212)||(23174189-23174358)
chr3 (68-154)||(16829979-16830065)
chr3 (83-200)||(17199056-17199175)
chr3 (42-201)||(17243654-17243815)
chr3 (33-132)||(31690561-31690659)
chr3 (94-243)||(12961428-12961580)
chr3 (181-269)||(18719250-18719339)
chr3 (42-130)||(23173876-23173963)
chr3 (182-243)||(11850780-11850840)
chr3 (79-200)||(18889009-18889133)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (16-276)||(21678216-21678475)
chr5 (16-277)||(22174980-22175241)
chr5 (16-277)||(17264745-17265005)
chr5 (16-277)||(17271227-17271487)
chr5 (68-243)||(9775467-9775642)
chr5 (42-243)||(37805292-37805492)
chr5 (42-278)||(758227-758464)
chr5 (67-243)||(19510999-19511177)
chr5 (23-278)||(22509126-22509382)
chr5 (42-278)||(22312804-22313042)
chr5 (42-243)||(23527448-23527651)
chr5 (42-278)||(20937557-20937796)
chr5 (67-243)||(21675471-21675648)
chr5 (66-243)||(22439724-22439902)
chr5 (85-243)||(1857520-1857680)
chr5 (70-270)||(10816746-10816949)
chr5 (70-270)||(23538773-23538976)
chr5 (115-243)||(23112785-23112914)
chr5 (159-244)||(19362597-19362678)
chr5 (159-243)||(19801964-19802044)
chr5 (182-243)||(24751647-24751707)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (16-277)||(27280158-27280418)
chr1 (68-278)||(3706763-3706976)
chr1 (67-243)||(20438531-20438709)
chr1 (16-278)||(23066650-23066915)
chr1 (67-243)||(21542056-21542233)
chr1 (67-243)||(42095903-42096080)
chr1 (88-243)||(20045899-20046056)
chr1 (65-270)||(22448270-22448469)
chr1 (31-270)||(20242503-20242746)
chr1 (42-243)||(41110814-41111016)
chr1 (42-243)||(19664105-19664306)
chr1 (68-270)||(32650074-32650278)
chr1 (144-278)||(955118-955256)
chr1 (42-243)||(19778434-19778639)
chr1 (159-243)||(36614935-36615015)
chr1 (88-269)||(29554465-29554645)
chr1 (42-130)||(955041-955128)
chr1 (159-243)||(24079551-24079634)
chr1 (159-243)||(24109120-24109203)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (16-194)||(40549-40728)
scaffold0124 (42-243)||(36793-36994)
scaffold0124 (198-276)||(8493-8571)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (42-278)||(14472-14710)
scaffold0239 (79-208)||(7225-7356)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (42-278)||(41894-42132)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (42-278)||(63169-63407)
scaffold0026 (66-243)||(12876-13054)
scaffold0026 (42-270)||(124446-124677)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (42-270)||(141297-141526)
scaffold0021 (70-198)||(146611-146742)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (31-278)||(265063-265311)
scaffold0005 (31-278)||(258637-258885)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (33-278)||(5997-6245)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (68-278)||(50972-51185)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (33-278)||(152324-152571)
scaffold0011 (67-243)||(174561-174738)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (67-243)||(110758-110935)
scaffold0029 (175-243)||(116793-116861)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (42-224)||(4275-4458)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (85-243)||(9649-9809)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (68-277)||(10305-10518)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (66-243)||(4617-4795)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (67-243)||(174561-174739)
scaffold0001 (67-243)||(489127-489304)
scaffold0001 (159-244)||(179002-179083)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (68-243)||(10259-10435)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (42-278)||(13971-14209)
scaffold0063 (66-278)||(24172-24387)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (67-243)||(38401-38578)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (67-243)||(35546-35723)
scaffold0076 (85-243)||(30162-30322)
scaffold0076 (33-222)||(51667-51858)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (67-243)||(46979-47156)
scaffold0028 (67-243)||(52384-52561)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (79-273)||(14583-14779)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (42-224)||(15432-15615)
scaffold0025 (68-177)||(71155-71266)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (67-243)||(2566-2743)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (79-243)||(29748-29913)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (114-278)||(15511-15678)
scaffold0348 (33-132)||(3034-3132)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (42-266)||(47387-47615)
scaffold0067 (42-266)||(62807-63035)
scaffold0067 (42-266)||(56421-56649)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (33-277)||(5112-5359)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (66-224)||(10217-10377)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (42-212)||(143-314)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (85-224)||(1-132)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (115-243)||(1-131)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (31-177)||(20482-20629)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (66-152)||(1-87)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (42-274)||(4981-5218)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (42-270)||(17447-17679)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (182-278)||(3621-3718)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (42-198)||(41592-41750)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (69-200)||(102930-103063)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (81-243)||(27781-27945)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (42-243)||(8410-8615)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (33-198)||(7293-7460)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (42-198)||(326816-326975)
scaffold0004 (42-269)||(321040-321266)
scaffold0004 (69-200)||(115778-115911)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (42-269)||(27840-28065)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (155-269)||(13504-13620)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (42-198)||(392-550)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (42-198)||(16914-17072)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (229-278)||(78538-78589)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (159-266)||(16141-16250)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (229-270)||(16913-16955)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 18681476 - 18681736
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681476 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 18681575  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681576 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 18681675  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18681676 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 18681736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 31567785 - 31568045
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31567785 atatatgtatatgtctaggttggttggtatatagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 31567884  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31567885 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 31567984  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31567985 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 31568045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 31573006 - 31573266
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573006 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 31573105  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573106 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 31573205  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31573206 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 31573266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36799603 - 36799343
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799603 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 36799504  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799503 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 36799404  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36799403 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 36799343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 1804441 - 1804701
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804441 atatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 1804540  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804541 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 1804640  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1804641 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 1804701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 9273133 - 9273394
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  9273133 atatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttgg 9273231  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273232 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgttctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 9273331  T
Q  215 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9273332 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatg 9273394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44476414 - 44476236
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||  |||||  || ||||||    
T  44476414 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaacggtgtggagcggtgag 44476315  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44476314 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 44476236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44479676 - 44479498
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||  |||||  || ||||||    
T  44479676 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaacggtgtggagcggtgag 44479577  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44479576 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 44479498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22055893 - 22055682
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggact 168  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||| |    
T  22055893 ttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgcttaaagtggtgttagtggtgaggatt 22055794  T
Q  169 tatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagt 265  Q
    || ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22055793 taggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagt 22055695  T
Q  266 ggagtagtgatga 278  Q
    ||||| |||||||    
T  22055694 ggagtggtgatga 22055682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22177787 - 22177549
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||    
T  22177787 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcaaaaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcacaagtt 22177689  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  22177688 gctcaaagtggtgttagtggtgaagacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 22177590  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22177589 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 22177549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 19902945 - 19903105
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgag 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  19902945 agtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgag 19903044  T
Q  183 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19903045 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 19903105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22050375 - 22050164
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggact 168  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22050375 ttgcataagcataacagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgcttaaagtggtgttagtggtgaggact 22050276  T
Q  169 tatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagt 265  Q
    || ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22050275 taggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagt 22050177  T
Q  266 ggagtagtgatga 278  Q
    ||| | |||||||    
T  22050176 ggaatggtgatga 22050164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23865611 - 23865434
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23865611 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 23865513  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  23865512 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccatttgacagcggtgtgggtcatggccctggattatggtaccacatgcat 23865434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23825301 - 23825124
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  23825301 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 23825203  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23825202 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 23825124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17053799 - 17053597
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  17053799 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcagctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaaaactagtt 17053701  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  17053700 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcggcagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacat 17053601  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  17053600 gcat 17053597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25409731 - 25409554
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||     
T  25409731 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggatcgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgat 25409632  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  25409631 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatggtaccacatgcat 25409554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 30766966 - 30767126
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||  |||    
T  30766966 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtccttatga 30767065  T
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30767066 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 30767126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 22025548 - 22025791
Alignment:
Q  31 taggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  22025548 taggttgagttgtatgtagatataga-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 22025646  T
Q  131 gagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatt 226  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| |    
T  22025647 gaacactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctga-t 22025745  T
Q  227 tttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 270  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22025746 tatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagaggagt 22025791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 22063551 - 22063794
Alignment:
Q  31 taggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||    
T  22063551 taggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctccggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 22063649  T
Q  131 gagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatt 226  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||| |    
T  22063650 gagcactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcgaccctga-t 22063748  T
Q  227 tttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 270  Q
    | |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22063749 tatggtactaaatgcatgggtgttgttagaggagtcttagaggagt 22063794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Original strand, 14057606 - 14057784
Alignment:
Q  66 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtga 163  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||    
T  14057606 ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtga 14057705  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||  | |||||||||||||||    
T  14057706 ggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgcat 14057784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Original strand, 41009433 - 41009658
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  |||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  41009433 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 41009532  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 237  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||    
T  41009533 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggtttcggccctga-ttatggtaccac 41009631  T
Q  238 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 269  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  41009632 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 41009658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18609969 - 18609793
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 165  Q
    |||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  18609969 agttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaatgccttgtcgttgaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 18609870  T
Q  166 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||  | |||||||||||||||    
T  18609869 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcagtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgcat 18609793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25111043 - 25110911
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  25111043 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaatgtcttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 25110945  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgt 173  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  25110944 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgt 25110911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21669023 - 21668901
Alignment:
Q  79 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcct 176  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  21669023 cataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcct 21668924  T
Q  177 gttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
    |   | |||||||||||||||||    
T  21668923 gaaaatgaatgctttaaccattc 21668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Original strand, 21326822 - 21327047
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggatt-agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 140  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||| | || ||||| || ||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  21326822 gtatgtagatataca-caagtggatttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 21326920  T
Q  141 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacc 235  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||    
T  21326921 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtacc 21327019  T
Q  236 acatgcatgggtgtttagaggagtcttagtgga 268  Q
    ||||||||     | ||||||||||||||||||    
T  21327020 acatgcat-----tgtagaggagtcttagtgga 21327047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21282270 - 21282101
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||  ||||||    
T  21282270 ggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaaacggtgga 21282172  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga 200  Q
      ||| |||  |||||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  21282171 acacttgttgttcaaagcggtgtatagcggtgacgactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcga 21282101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 269
Target Start/End: Original strand, 20974118 - 20974228
Alignment:
Q  161 tgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagagga 257  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  20974118 tgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattctattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtgttgtagaaga 20974216  T
Q  258 gtcttagtggag 269  Q
    ||||||||||||    
T  20974217 gtcttagtggag 20974228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10607016 - 10606904
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagag 255  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  10607016 ggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtgttgtagaa 10606918  T
Q  256 gagtcttagtggag 269  Q
    | ||||||||||||    
T  10606917 gggtcttagtggag 10606904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14033369 - 14033109
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033369 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 14033270  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033269 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 14033170  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14033169 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 14033109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 28359805 - 28360062
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28359805 atatatatatatgtctaggtgggttggtatgtagatatacaacaaggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 28359904  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28359905 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacaaaggtgtgggtca 28360004  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360005 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagt 28360062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23835284 - 23835024
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835284 atatatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 23835185  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835184 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 23835085  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23835084 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgat 23835024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 33682157 - 33682413
Alignment:
Q  19 tatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcg 118  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33682157 tatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagctttggctctggaatgcttagtcg 33682255  T
Q  119 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33682256 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 33682355  T
Q  219 ccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33682356 ccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 33682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 27562488 - 27562747
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27562488 atatatgtatatgtctaggttgggtagtatgtagatatactcaatggggattagttgcattaacataacagcgggagagcttcggctctggaatgcttag 27562587  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27562588 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 27562687  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  27562688 cggccctgattcttggtaccacatgcatgggtg-ttagaggagttttagtggagtggtgat 27562747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12942000 - 12941800
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12942000 gtatgtagatataca-caggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 12941902  T
Q  142 actcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 240  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12941901 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatg 12941803  T
Q  241 cat 243  Q
    |||    
T  12941802 cat 12941800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Original strand, 28290209 - 28290384
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  28290209 agttgcatgagcataacagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtgatgttagtggtgagga 28290308  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28290309 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 28290384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1592924 - 1592722
Alignment:
Q  79 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1592924 cataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttctcgttcaaagtggtggagtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctg 1592825  T
Q  178 ttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtg 274  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  1592824 aaaatgaatgctttaaccattcgacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcataggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtg 1592726  T
Q  275 atga 278  Q
    ||||    
T  1592725 atga 1592722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22907167 - 22906928
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22907167 gtatgtagatataca-caagtgggtcagctgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 22907069  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||    
T  22907068 gctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccaca 22906970  T
Q  239 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22906969 tacatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 22906928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19726807 - 19726569
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19726807 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 19726709  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  19726708 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 19726610  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19726609 gcatgggtgttgttagaggagtcttggtggagtggtgatga 19726569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 278
Target Start/End: Original strand, 21724772 - 21724974
Alignment:
Q  79 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggt-gtagtggtgaggacttatgtcctg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21724772 cataacagtgggagagcttcggctctggaacgcctaatagatcaaagtggtggagtactagttgctcaaagtggtattagtggtgaggacttatgtcctg 21724871  T
Q  178 ttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtg 274  Q
       | ||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  21724872 aaaatgaatgctttaaccattctatagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgtatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtg 21724970  T
Q  275 atga 278  Q
    ||||    
T  21724971 atga 21724974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 25470708 - 25470868
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||    
T  25470708 agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagaggtgaggacttaggtcctgctgag 25470807  T
Q  183 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25470808 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 25470868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12167439 - 12167237
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  12167439 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 12167341  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12167340 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacat 12167241  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  12167240 gcat 12167237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19286348 - 19286146
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  19286348 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 19286250  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  19286249 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacat 19286150  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  19286149 gcat 19286146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 29615199 - 29615376
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  29615199 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 29615298  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  29615299 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatggtaccacatgcat 29615376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 34647652 - 34647829
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  34647652 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 34647750  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  34647751 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 34647829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 21566163 - 21566346
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  21566163 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 21566261  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 224  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21566262 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcatgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga 21566346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19877532 - 19877330
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||  |||||||    
T  19877532 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagtt 19877434  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  19877433 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacat 19877334  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  19877333 gcat 19877330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19883308 - 19883106
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||  |||||||    
T  19883308 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagtt 19883210  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  19883209 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacat 19883110  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  19883109 gcat 19883106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24562459 - 24562282
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  24562459 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 24562361  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24562360 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 24562282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23837758 - 23837580
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23837758 tagttccataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaaacggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 23837659  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23837658 aacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 23837580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 34640978 - 34641155
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  34640978 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgccgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 34641076  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  34641077 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 34641155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 19786847 - 19787050
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaa-cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 140  Q
    ||||||||||||||| || | ||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  19786847 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcattaaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 19786945  T
Q  141 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
    |  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||    
T  19786946 tgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtaatggccctgaattatggtaccaca 19787045  T
Q  239 tgcat 243  Q
    |||||    
T  19787046 tgcat 19787050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 278
Target Start/End: Original strand, 937700 - 937896
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-g 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | |    
T  937700 agtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcgttgctcaaagtggtgttagaggtgaggacttatgtcctgaaaatg 937799  T
Q  183 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||  | || | ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  937800 aatgctttaaccattctacagaggtgagggctaaggtcatga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 937896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 204
Target Start/End: Original strand, 29416468 - 29416605
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 167  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  29416468 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggagcaccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 29416567  T
Q  168 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagc 204  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  29416568 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagc 29416605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18788560 - 18788448
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  18788560 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 18788462  T
Q  142 actcaaagtggtgt 155  Q
      |||||| |||||    
T  18788461 gttcaaagcggtgt 18788448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18799540 - 18799428
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  18799540 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 18799442  T
Q  142 actcaaagtggtgt 155  Q
      |||||| |||||    
T  18799441 gttcaaagcggtgt 18799428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 169
Target Start/End: Original strand, 11289602 - 11289705
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  11289602 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 11289700  T
Q  165 gactt 169  Q
    |||||    
T  11289701 gactt 11289705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Original strand, 19588556 - 19588781
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  |||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||| || |  |||||||||| ||||||  |||||||    
T  19588556 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttatcgttcaaagcggtggaacactagtt 19588655  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 237  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||    
T  19588656 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcatgaaaatgaatactttaaccattcaattagcggtgagggattcggccctga-ttatggtaccac 19588754  T
Q  238 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 269  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  19588755 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 19588781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 270
Target Start/End: Original strand, 14581950 - 14582056
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagagg 256  Q
    |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||  || |||||||||||||||     | ||||||    
T  14581950 ggtgaggactcatgtcctgatgaaagaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccctg--ttatggtaccacatgcat-----tatagagg 14582042  T
Q  257 agtcttagtggagt 270  Q
    ||||||||||||||    
T  14582043 agtcttagtggagt 14582056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19439913 - 19439792
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || | |||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  19439913 ggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttacataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 19439815  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtgt 155  Q
      |||||||  |||||| |||||    
T  19439814 acactagttgttcaaagcggtgt 19439792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 270
Target Start/End: Original strand, 19300705 - 19300868
Alignment:
Q  104 tggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtacta-gttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgtt--gagaatgctttaaccattcg 199  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||  |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||     
T  19300705 tggaacgctttgtcgttcaaagtggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttagcggtgaggactcatgtcctgataaaagaatgctttaaccattct 19300804  T
Q  200 acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagt 270  Q
    | ||||||| |||   ||| |||||  | |||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||    
T  19300805 atagcggtgagggcttcggtcctga--tatggtaccacatgcat-----tgtagaggagtcttagtggagt 19300868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 243
Target Start/End: Original strand, 11283984 - 11284022
Alignment:
Q  205 ggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11283984 ggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 11284022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27785922 - 27785662
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785922 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 27785823  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785822 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 27785723  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27785722 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 27785662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27791143 - 27790883
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27791143 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 27791044  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27791043 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 27790944  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27790943 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 27790883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12579020 - 12578760
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12579020 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 12578921  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578920 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 12578821  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12578820 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 12578760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12572538 - 12572278
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572538 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 12572439  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572438 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 12572339  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12572338 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagcggagtggtgat 12572278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 27295955 - 27296215
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  27295955 atatatgtatatgt-tagattggttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgctcgg 27296052  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296053 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 27296152  T
Q  215 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27296153 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatg 27296215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 10685574 - 10685801
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685574 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 10685673  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685674 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 10685773  T
Q  215 acggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10685774 acggccctga-ttttggtaccacatgcat 10685801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20261024 - 20260824
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20261024 gtatgtagatataca-caggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 20260926  T
Q  142 actcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 240  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20260925 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatg 20260827  T
Q  241 cat 243  Q
    |||    
T  20260826 cat 20260824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2105779 - 2105540
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2105779 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 2105681  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  2105680 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctgaattatggtaccacat 2105581  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2105580 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 2105540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6482499 - 6482321
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  6482499 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 6482400  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6482399 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 6482321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6485966 - 6485788
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  6485966 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 6485867  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6485866 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 6485788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 5707031 - 5707191
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  5707031 agtgggagagcttcggctctggaacgcttcgtcgttcaaagcggtggagcactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgag 5707130  T
Q  183 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5707131 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattacggtaccacatgcat 5707191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 23090006 - 23090207
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||  |||||||    
T  23090006 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttaaaagcggtggaacactagtt 23090104  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
    | |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  23090105 attcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctga-atatggtaccacat 23090203  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  23090204 gcat 23090207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 23102434 - 23102635
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23102434 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcctaaaagtgggagagcttcggctctggaactccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 23102532  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  23102533 tttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacat 23102631  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  23102632 gcat 23102635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26582852 - 26582675
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  26582852 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 26582753  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  26582752 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-gttatggtaccacatgcat 26582675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 200818 - 200641
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  200818 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 200720  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  200719 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 200641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 23169298 - 23169475
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23169298 tagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 23169397  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23169398 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 23169475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 23580555 - 23580732
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  23580555 tagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 23580654  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23580655 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 23580732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 27367600 - 27367760
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  27367600 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 27367699  T
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27367700 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 27367760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9241534 - 9241333
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  | |||||    
T  9241534 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtggaagaacttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacattagtt 9241436  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  9241435 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctga-ttatggtaccacat 9241337  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  9241336 gcat 9241333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43693578 - 43693401
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  43693578 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 43693480  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43693479 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 43693401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 6744324 - 6744501
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  ||| |||  ||||| | |||||  || |||||    
T  6744324 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactggttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 6744422  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6744423 ggacttaggtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 6744501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23878040 - 23877838
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  23878040 gtatgtagatataca-caagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttgtagttcaaagcggtggaacactagtt 23877942  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  23877941 gttcaaagcggtgttgagcggtgaagacttatgtcctgatgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctgaaatatggtaccacat 23877842  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  23877841 gcat 23877838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22810093 - 22809901
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  22810093 ggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagcaggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 22809995  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg 223  Q
      |||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||    
T  22809994 acactagttgttcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccctg 22809901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23264158 - 23263985
Alignment:
Q  69 gttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagga 166  Q
    ||||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  23264158 gttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 23264059  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgc 241  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||| || |||| |||   |||||||||  | |||||||||||||    
T  23264058 cttatgtcctgaaaagaatgctttaatcattcgatagtggtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgc 23263985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 19703456 - 19703615
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  |||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| ||||||  |||||||    
T  19703456 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtt 19703555  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
      |||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  19703556 gttcaaagcggtgtttatcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 19703615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20724236 - 20724011
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  |||||||||| | || || || ||||| |||||||| || ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20724236 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcaaaaaagcgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 20724137  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 237  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||    
T  20724136 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccac 20724038  T
Q  238 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 269  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  20724037 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 20724011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21907426 - 21907291
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtac-tagttactcaaagtggtg--tagtggtgag 164  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  || | |||  |||||| ||||  | | ||||||    
T  21907426 agttgcataagcataaaagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttgttgttcaaagcggtgttttgcggtgag 21907327  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 200  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  21907326 gacttatgtcctgaaaagaatgttttaaccattcga 21907291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 21073954 - 21074114
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggatt-agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 140  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| | |||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  21073954 gtatgtagatataca-caagtggattcaattgcataaccataaaagcgggagggcttcggccctggaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacacttgt 21074052  T
Q  141 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 200  Q
    |  |||||| |||||  || |||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21074053 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacccatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 21074114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24943460 - 24943419
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 200  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24943460 ggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 24943419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23269276 - 23269201
Alignment:
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgc 241  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||  | |||||||||||||    
T  23269276 gacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgc 23269201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23276145 - 23276070
Alignment:
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgc 241  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||  | |||||||||||||    
T  23276145 gacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgatagcggtgagggctccggccctga-atatggtaccacatgc 23276070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 806947 - 807207
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  806947 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 807046  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807047 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 807146  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  807147 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 807207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 11631890 - 11632150
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631890 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 11631989  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631990 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 11632089  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11632090 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 11632150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 18055659 - 18055919
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055659 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 18055758  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055759 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 18055858  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18055859 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 18055919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 18049180 - 18049440
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049180 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 18049279  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049280 tcgttcaaagaggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 18049379  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18049380 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 18049440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 20579891 - 20580151
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579891 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 20579990  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579991 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 20580090  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20580091 cggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgat 20580151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 23201453 - 23201712
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23201453 atatatgtatatgtttaggttggttggtatgtggatatact-caaggggattagttgcataaacataaaagtgagagagcttcggctctggaatgcttag 23201551  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23201552 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 23201651  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23201652 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 23201712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 23507580 - 23507839
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23507580 atatatgtatatgtttaggttggttggtatgtggatatact-caaggggattagttgcataaacataaaagtgagagagcttcggctctggaatgcttag 23507678  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507679 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 23507778  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23507779 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 23507839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Original strand, 23665829 - 23666004
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23665829 agttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 23665928  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665929 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcat 23666004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11303052 - 11302852
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11303052 gtatgtagatataca-caggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagtactagtt 11302954  T
Q  142 actcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 240  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11302953 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaaaggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatg 11302855  T
Q  241 cat 243  Q
    |||    
T  11302854 cat 11302852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15339046 - 15338789
Alignment:
Q  23 tatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttca 122  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  15339046 tatatgtataggttgggttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttca 15338948  T
Q  123 aagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggcc 220  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |    
T  15338947 aagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtc 15338848  T
Q  221 ctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15338847 ctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 15338789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 15723191 - 15723429
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15723191 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 15723289  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  15723290 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacat 15723388  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15723389 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 15723429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29795905 - 29795730
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29795905 agttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 29795806  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29795805 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtatgggtcacggccctg-gttttggtaccacatgcat 29795730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29799724 - 29799549
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29799724 agttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 29799625  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29799624 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtatgggtcacggccctg-gttttggtaccacatgcat 29799549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 35962712 - 35962951
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35962712 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 35962810  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  35962811 gctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccaca 35962909  T
Q  239 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35962910 tgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 35962951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 275
Target Start/End: Original strand, 15710967 - 15711202
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15710967 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggatctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagtactagtt 15711065  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  15711066 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgatttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacat 15711164  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtga 275  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15711165 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtga 15711202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14432165 - 14431952
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14432165 agttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 14432066  T
Q  167 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 263  Q
    |||| ||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  14432065 cttaggtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggggtctta 14431967  T
Q  264 gtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||| |||||||    
T  14431966 gtggagtggtgatga 14431952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 12591652 - 12591812
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||    
T  12591652 agtgggagagcttcggctctggaacgcttcgtcgttcaaagcggtggagcactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgag 12591751  T
Q  183 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12591752 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 12591812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14421532 - 14421354
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||   ||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  14421532 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacgctagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 14421433  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14421432 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 14421354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1612788 - 1612586
Alignment:
Q  79 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctg 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1612788 cataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactatttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctg 1612689  T
Q  178 ttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtg 274  Q
       | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  1612688 aaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgggggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtg 1612590  T
Q  275 atga 278  Q
    ||||    
T  1612589 atga 1612586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 13123971 - 13124148
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  13123971 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 13124069  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  13124070 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggattatggtaccacatgcat 13124148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19600043 - 19599805
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | ||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  19600043 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgtataagcataatagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggatcactagtt 19599945  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  19599944 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaataaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 19599846  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19599845 gcgtgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 19599805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13006508 - 13006306
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  13006508 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 13006410  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  13006409 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacat 13006310  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  13006309 gcat 13006306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 12710917 - 12711077
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgag 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  12710917 agtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgag 12711016  T
Q  183 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  12711017 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctggattatggtaccacatgcat 12711077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 14281620 - 14281822
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14281620 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaatgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 14281718  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||    
T  14281719 gctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-ttatggtaccaca 14281817  T
Q  239 tgcat 243  Q
    |||||    
T  14281818 tgcat 14281822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4280140 - 4279963
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  4280140 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 4280042  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4280041 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 4279963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19616472 - 19616295
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  19616472 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 19616374  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19616373 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 19616295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13742682 - 13742505
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  13742682 tagttgcataaacatca-agtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 13742584  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  13742583 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtaacggccctaaattatggtaccacatgcat 13742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16676367 - 16676192
Alignment:
Q  69 gttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 166  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  16676367 gttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtcgagcggtgagga 16676268  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  16676267 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcctta-atatggtaccacatgcat 16676192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 244
Target Start/End: Original strand, 16109067 - 16109244
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16109067 agttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 16109166  T
Q  167 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatg 244  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16109167 cttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatg 16109244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17650603 - 17650429
Alignment:
Q  69 gttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 166  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  17650603 gttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaa-gcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtcgagcggtgagga 17650505  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||    
T  17650504 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcct-aaatatggtaccacatgcat 17650429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6412032 - 6411792
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  6412032 ggttgagttgtatgtagatataca-caagagggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgcattgtcgttcaaagcggtgga 6411934  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttt 229  Q
      |||||||  ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||| ||||||||| |||   ||||||||| || |    
T  6411933 acactagttgttcaaagcagtgtatagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaacaattctacagcggtgagggcttcggccctga-ttat 6411835  T
Q  230 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 270  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  6411834 ggtaccacatgcatgagtgttgttagaggagtcttagtggagt 6411792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 20328224 - 20328425
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20328224 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 20328322  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | | |||||||||||    
T  20328323 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggctacggtcctg-tatatggtaccacat 20328421  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  20328422 gcat 20328425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Original strand, 11390302 - 11390473
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  11390302 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 11390400  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 212  Q
      |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11390401 gttcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggagtggg 11390473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14128347 - 14128244
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14128347 agttgcataagcataacagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 14128248  T
Q  167 ctta 170  Q
    ||||    
T  14128247 ctta 14128244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Original strand, 11383814 - 11383985
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||  ||||||     
T  11383814 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgttgttcaaagcggtggaacactagtg 11383912  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 212  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11383913 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttaagtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggagtggg 11383985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18607067 - 18606896
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||| || | || |||||||| ||||||  ||||||     
T  18607067 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcgactctggaacgccttgtggttcaaagcggtggaacactagtg 18606969  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 212  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606968 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgttctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 18606896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Original strand, 21232034 - 21232167
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 165  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  21232034 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 21232133  T
Q  166 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  21232134 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 21232167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Original strand, 11220086 - 11220311
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  |||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  11220086 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcagaagcataaaagtgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 11220185  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc-gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 237  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||  | ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||    
T  11220186 gttcaaagcggtgttaagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaaatagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccac 11220284  T
Q  238 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 269  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  11220285 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 11220311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 130
Target Start/End: Original strand, 36306034 - 36306121
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  36306034 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 36306121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Original strand, 37244401 - 37244484
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||    
T  37244401 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat 37244484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 41799901 - 41800161
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41799901 atatacgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 41800000  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800001 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 41800100  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41800101 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 41800161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42701453 - 42701193
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701453 atatacgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 42701354  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701353 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 42701254  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42701253 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 42701193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 51602022 - 51602282
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602022 atatacgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 51602121  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602122 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 51602221  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51602222 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 51602282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 51607903 - 51608163
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51607903 atatacgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 51608002  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608003 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 51608102  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51608103 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 51608163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 53748700 - 53748960
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748700 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 53748799  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748800 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 53748899  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53748900 cggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgat 53748960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 635713 - 635974
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  635713 atatatgtatatgtttaggttggttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttgg 635811  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  635812 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 635911  T
Q  215 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  635912 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatg 635974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15533986 - 15533786
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15533986 gtatgtagatataca-caggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 15533888  T
Q  142 actcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 240  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15533887 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatg 15533789  T
Q  241 cat 243  Q
    |||    
T  15533788 cat 15533786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23121801 - 23121562
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23121801 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaatgcctcgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 23121703  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  23121702 gctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccaca 23121604  T
Q  239 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23121603 tgcatgagtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 23121562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20940436 - 20940223
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20940436 agttgcatgagcataacagtgggagagcttcagctctggaacgccttgttgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 20940337  T
Q  167 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 263  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20940336 cttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacaacggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 20940238  T
Q  264 gtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||| |||||||    
T  20940237 gtggagtggtgatga 20940223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11847230 - 11847053
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  11847230 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 11847131  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11847130 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctg-tttatggtaccacatgcat 11847053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18212339 - 18212138
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  18212339 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 18212241  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  18212240 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacat 18212142  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  18212141 gcat 18212138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 8046914 - 8047074
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtg--gtgaggacttatgtcctgttgag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||| | |  ||||||||||| |||||||||||    
T  8046914 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcagtgaggacttaggtcctgttgag 8047013  T
Q  183 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8047014 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 8047074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14484606 - 14484392
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 165  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  14484606 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgagg 14484507  T
Q  166 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctt 262  Q
    ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  14484506 acttatgtcctgaaaatgaatgttttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgtatgggtgttgttagtggagtctt 14484408  T
Q  263 agtggagtagtgatga 278  Q
    |||||||| |||||||    
T  14484407 agtggagtggtgatga 14484392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 43284871 - 43285109
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    |||||||||||||||| |  ||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||| |||||||    
T  43284871 gtatgtagatatacaagagtggg-tcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgttgttcaaagtggtggagcactagtt 43284969  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||| || | |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  43284970 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgatttaaccattctacagaggagagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 43285068  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43285069 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 43285109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 17000142 - 17000381
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17000142 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcggctctggaacaccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 17000240  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||||||||| ||   |||| ||||| |||||||||||||    
T  17000241 gctcaaagtggtgtttagtggtgagaacttatgtcctgaaaatgaatgttttaaccattttacagcggtgaggactacggtcctga-ttttggtaccaca 17000339  T
Q  239 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17000340 tgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 17000381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Original strand, 4831090 - 4831293
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 167  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4831090 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 4831189  T
Q  168 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 265  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  4831190 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 4831288  T
Q  266 ggagt 270  Q
    |||||    
T  4831289 ggagt 4831293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Original strand, 4834385 - 4834588
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 167  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4834385 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 4834484  T
Q  168 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 265  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  4834485 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 4834583  T
Q  266 ggagt 270  Q
    |||||    
T  4834584 ggagt 4834588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Original strand, 11171222 - 11171464
Alignment:
Q  31 taggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || | || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||||||    
T  11171222 taggttgagtggtatgtatatataca-caagtgggtcagttgcataaacataaaagtgggagagcttcggctttggaacgccttatcgtttaaagtggtg 11171320  T
Q  131 gagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattt 227  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| || |||||| |||  ||| |||||| ||    
T  11171321 gagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacggcggtgagggctacgaccctga-tt 11171419  T
Q  228 ttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 270  Q
     |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11171420 atggtactacatgcatggttgttattagaggagtcttagtggagt 11171464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15407113 - 15406955
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| ||||| | || | ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  15407113 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataaacatgaaagcgagagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 15407015  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15407014 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 15406955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44775428 - 44775168
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775428 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 44775329  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775328 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 44775229  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44775228 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 44775168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44780612 - 44780352
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780612 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatgaggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 44780513  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780512 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 44780413  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44780412 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 44780352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4677391 - 4677131
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677391 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 4677292  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677291 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 4677192  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4677191 cggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgat 4677131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41175704 - 41175444
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175704 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 41175605  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175604 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 41175505  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41175504 cggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgat 41175444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41180842 - 41180582
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180842 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 41180743  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180742 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 41180643  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41180642 cggccctgatttatggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgat 41180582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 8742859 - 8743119
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8742859 atatatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 8742958  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8742959 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 8743058  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8743059 cggccctgaattttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgat 8743119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 8761029 - 8761289
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761029 atatatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 8761128  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761129 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 8761228  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8761229 cggccctgaattttggtaccacatgcatgggagtttagaggagtcttagtggagtggtgat 8761289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13909751 - 13909496
Alignment:
Q  19 tatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcg 118  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13909751 tatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatact-caagggg-ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcg 13909654  T
Q  119 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13909653 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 13909554  T
Q  219 ccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13909553 ccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 13909496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13946696 - 13946441
Alignment:
Q  19 tatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcg 118  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13946696 tatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatact-caagggg-ttagttgcattaacataacagtgggagagtttcggctctggaatgcttagtcg 13946599  T
Q  119 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946598 ttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgg 13946499  T
Q  219 ccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13946498 ccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 13946441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13940198 - 13939955
Alignment:
Q  31 taggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13940198 taggttggttggtatgtagatatact-caagggg-ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 13940101  T
Q  131 gagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13940100 gagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttg 13940001  T
Q  231 gtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13940000 gtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgat 13939955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12200429 - 12200169
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||  || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    | |    
T  12200429 atatacgtatatgcttaggttggttggtatgtagatatact-caagtgggtaagttgcataagcataacagtgggagagcttcagctctggaacaacttg 12200331  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12200330 tcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagaacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 12200231  T
Q  215 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12200230 acggccctga-ttttggtaccacatgcatgggtgtttacaggagtcttagtggagtggtgatg 12200169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 68 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12304924 - 12304763
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 166  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12304924 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 12304825  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12304824 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgatttt 12304763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Original strand, 16382880 - 16383093
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16382880 agttgcataagcattacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 16382979  T
Q  167 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 263  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16382980 cttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 16383078  T
Q  264 gtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||| |||||||    
T  16383079 gtggagtggtgatga 16383093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 14652691 - 14652929
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14652691 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataatagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 14652789  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  14652790 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 14652888  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14652889 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 14652929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9533027 - 9532849
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||  || ||||||    
T  9533027 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagtggtgtggagcggtgag 9532928  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9532927 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 9532849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Original strand, 16838502 - 16838714
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16838502 agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 16838601  T
Q  167 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 263  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16838602 cttatgtcctggaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaggct-acggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 16838699  T
Q  264 gtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||  |||||||    
T  16838700 gtggagaggtgatga 16838714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17157262 - 17157079
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  17157262 gtatgtagatataca-caagggggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 17157164  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 224  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157163 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 17157079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 269
Target Start/End: Original strand, 13203537 - 13203743
Alignment:
Q  66 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgag 164  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13203537 ttagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgag 13203636  T
Q  165 gacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtct 261  Q
    |||||| ||||||   | |||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13203637 gacttaggtcctgaaaatgaatgctttaactattctacagcggtgagggctacggtcctg-tttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtct 13203735  T
Q  262 tagtggag 269  Q
    ||||||||    
T  13203736 tagtggag 13203743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 41456123 - 41456325
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  41456123 gtatgtagatataca-caggtgggatagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 41456221  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  41456222 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccacat 41456321  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  41456322 gcat 41456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24191963 - 24191783
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  24191963 gtatgtagatataca-caagggggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 24191865  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 221  Q
      |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24191864 gttcaaagcggtgttgagcggtgagaacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccc 24191783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 8583294 - 8583471
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  8583294 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 8583392  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8583393 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 8583471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14084708 - 14084531
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  14084708 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 14084610  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14084609 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 14084531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14090109 - 14089932
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  14090109 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 14090011  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14090010 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 14089932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49399650 - 49399473
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  49399650 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 49399552  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  49399551 ggacttaggtcctggtgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 49399473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 16802425 - 16802626
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||  |||||||    
T  16802425 gtatgtagatataca-caagtgggttagtcgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacactagtt 16802523  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  16802524 gttcaaagcggtgttgagcggtgatgacttatgtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacat 16802622  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  16802623 gcat 16802626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 24123203 - 24123380
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  24123203 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 24123301  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  24123302 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacgtgcat 24123380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 13968850 - 13969010
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  13968850 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 13968949  T
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13968950 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 13969010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 13974325 - 13974485
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  13974325 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 13974424  T
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13974425 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 13974485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 266
Target Start/End: Original strand, 14544166 - 14544394
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  14544166 gtatgtagatataca-caagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagtt 14544264  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||    
T  14544265 gctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccaca 14544363  T
Q  239 tgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 266  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14544364 tgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 14544394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17190992 - 17190836
Alignment:
Q  88 gggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagt--ggtgaggacttatgtcctgttgagaat 185  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17190992 gggagagcttcggctctggaacgccttgtctttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgatcggtgaggacttatgtcctgatgagaat 17190893  T
Q  186 gctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17190892 gctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga-atttggtaccacatgcat 17190836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Original strand, 34852211 - 34852414
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 167  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  34852211 ttgcataatcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 34852310  T
Q  168 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 265  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  34852311 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacaacggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 34852409  T
Q  266 ggagt 270  Q
    |||||    
T  34852410 ggagt 34852414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14292881 - 14292667
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 165  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||    
T  14292881 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcgttggagcactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgagg 14292782  T
Q  166 acttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtct 261  Q
    |||||||||||    |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  14292781 acttatgtcctaaaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgtatggatgttgttagaggagtct 14292683  T
Q  262 tagtggagtagtgatg 277  Q
    ||||||||| ||||||    
T  14292682 tagtggagtggtgatg 14292667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 278
Target Start/End: Original strand, 16830055 - 16830215
Alignment:
Q  120 tcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacg 217  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||    
T  16830055 tcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctggaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaggct-acg 16830153  T
Q  218 gccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16830154 gtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagaggtgatga 16830215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23174358 - 23174189
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23174358 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcaaaagcataaaagtgggagagcttcggctcttgaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 23174260  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 212  Q
      |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23174259 gttcaaagcggtgttagcggtgaggacttatgtcctg-aaaaaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 23174189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Original strand, 16829979 - 16830065
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg 154  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16829979 agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtg 16830065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 200
Target Start/End: Original strand, 17199056 - 17199175
Alignment:
Q  83 acagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgt-tg 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||       
T  17199056 acagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttagcggtgaggacttaggtcctgtaaa 17199155  T
Q  181 agaatgctttaaccattcga 200  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17199156 agaatgctttaaccattcga 17199175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 201
Target Start/End: Original strand, 17243654 - 17243815
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  | |||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || ||| |  | ||||||||||| ||||||  ||| |||    
T  17243654 gtatgtagatatacatcagtggagtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctagaacgtcttgtcgttcaaagcggtggaacacttgtt 17243753  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgac 201  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  17243754 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgac 17243815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 132
Target Start/End: Original strand, 31690561 - 31690659
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || | |||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  31690561 ggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataaacataaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 31690659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 243
Target Start/End: Original strand, 12961428 - 12961580
Alignment:
Q  94 gcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgcttt 190  Q
    |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||   | |||||||||    
T  12961428 gcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgcttt 12961527  T
Q  191 aaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  12961528 aaccattcaattagcggtgagggtttcggccctga-ttatggtaccacatgcat 12961580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 269
Target Start/End: Original strand, 18719250 - 18719339
Alignment:
Q  181 agaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggag 269  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  18719250 agaatgctttaaccattcgataagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtgttgtagaagagtcttagtggag 18719339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23173963 - 23173876
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  23173963 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 23173876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 243
Target Start/End: Original strand, 11850780 - 11850840
Alignment:
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  11850780 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcat 11850840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18889133 - 18889009
Alignment:
Q  79 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactag-ttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcc 175  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||   ||  |||||| |||||  |||| |||||||||||||||    
T  18889133 cataaaagcgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactttattgttcaaagcggtgttcagtgatgaggacttatgtcc 18889034  T
Q  176 tgttgagaatgctttaaccattcga 200  Q
    ||   ||||||||||||||||||||    
T  18889033 tgaaaagaatgctttaaccattcga 18889009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 21678216 - 21678475
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678216 atatatgtatatgtctaggttggttggtatgtagatatactcaatggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 21678315  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678316 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtca 21678415  T
Q  216 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21678416 cggccctgatttttggtaccacatgcatgggt-attagaggagtcttagtggagtggtgat 21678475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22175241 - 22174980
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaa-cataacagtgggagagcttcggctctggaatgctta 114  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22175241 atatatgtatatgt-tagattggttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgcttg 22175144  T
Q  115 gtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175143 gtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggttaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggt 22175044  T
Q  214 cacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22175043 cacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatg 22174980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 17264745 - 17265005
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  17264745 atataagtatatgt-tagattggttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaacatcacagtgggagagcttcggctctggaacgctcgg 17264842  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17264843 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 17264942  T
Q  215 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17264943 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatg 17265005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Original strand, 17271227 - 17271487
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  17271227 atataagtatatgt-tagattggttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaacatcacagtgggagagcttcggctctggaacgctcgg 17271324  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17271325 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcaacagcggtgtgggtc 17271424  T
Q  215 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17271425 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatg 17271487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9775642 - 9775467
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgagga 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9775642 agttgcatgagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 9775543  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9775542 cttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagtggtgtgggtcacggccctga-ttttggtaccacatgcat 9775467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 37805292 - 37805492
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37805292 gtatgtagatataca-caggtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctgtaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 37805390  T
Q  142 actcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 240  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37805391 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacgaccctga-ttttggtaccacatg 37805489  T
Q  241 cat 243  Q
    |||    
T  37805490 cat 37805492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 758227 - 758464
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  758227 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 758325  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 240  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||||    
T  758326 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttacgtcctgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatg 758424  T
Q  241 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  758425 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 758464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19511177 - 19510999
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  19511177 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 19511078  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19511077 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 19510999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Original strand, 22509126 - 22509382
Alignment:
Q  23 tatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttca 122  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  22509126 tatatgtataggttgggttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggatctggaacgccttgtcgttca 22509224  T
Q  123 aagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggcc 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |    
T  22509225 aagtggtggagtactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtc 22509324  T
Q  221 ctgatttttggtaccacatgcatgg-gtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22509325 ttga-ttttggtaccacatgcatggtgttgttagaggagtcttagttgagtggtgatga 22509382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 22312804 - 22313042
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22312804 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 22312902  T
Q  142 actcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  22312903 gctcaaagtggtgtcagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 22313001  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22313002 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagaggtgatga 22313042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23527651 - 23527448
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaa-cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 140  Q
    ||||||||||||||| || | ||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  23527651 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcattaaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 23527553  T
Q  141 tactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
    |  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  23527552 tgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctgaattatggtaccaca 23527453  T
Q  239 tgcat 243  Q
    |||||    
T  23527452 tgcat 23527448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20937796 - 20937557
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20937796 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctgtggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 20937698  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||    
T  20937697 gctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcttgaaaatgaatgctttaaccattctacatcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccaca 20937599  T
Q  239 tgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||    
T  20937598 tgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggggtggtgatga 20937557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 21675471 - 21675648
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  21675471 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 21675569  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21675570 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 21675648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Original strand, 22439724 - 22439902
Alignment:
Q  66 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 163  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||| |||| |  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  22439724 ttagttgcataagcataaaagtgggagagctccggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtgaaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 22439823  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22439824 ggacttatgtcctgatgagaatgttttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 22439902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 1857520 - 1857680
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  1857520 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 1857619  T
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  1857620 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 1857680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10816949 - 10816746
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 167  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10816949 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaattggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 10816850  T
Q  168 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 265  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  10816849 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacgacactga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 10816751  T
Q  266 ggagt 270  Q
    |||||    
T  10816750 ggagt 10816746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23538976 - 23538773
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggac 167  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  23538976 ttgcataatcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgacttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggac 23538877  T
Q  168 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagt 265  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||    
T  23538876 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccatactacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttagt 23538778  T
Q  266 ggagt 270  Q
    |||||    
T  23538777 ggagt 23538773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 23112785 - 23112914
Alignment:
Q  115 gtcgttcaaagtggtggagtacta-gttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 212  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23112785 gtcgttcaaagcggtggaacactatgttgttcaaagcggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgaggg 23112884  T
Q  213 tcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23112885 tcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 23112914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19362678 - 19362597
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatg 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  19362678 ggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg--ttttggtaccacatgcatg 19362597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Original strand, 19801964 - 19802044
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  19801964 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg--ttttggtaccacatgcat 19802044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 243
Target Start/End: Original strand, 24751647 - 24751707
Alignment:
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  24751647 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcat 24751707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27280418 - 27280158
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  27280418 atatatgtatatgt-tagattggttggtatgtagatatact-caaggggattagttgcataaacataacagtgggagagcttcggctctggaacgctcgg 27280321  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt-agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280320 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtc 27280221  T
Q  215 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27280220 acggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtggtgatg 27280158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Original strand, 3706763 - 3706976
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  3706763 agttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactaattgctcaaagtggtgttagtggtgagga 3706862  T
Q  167 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 263  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3706863 cttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 3706961  T
Q  264 gtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||  |||||||    
T  3706962 gtggagcggtgatga 3706976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 20438531 - 20438709
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  20438531 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 20438630  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20438631 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 20438709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 278
Target Start/End: Original strand, 23066650 - 23066915
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttag 115  Q
    |||||| ||||||  |||||||  | ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |    
T  23066650 atatatatatatgcataggttgggttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttg 23066748  T
Q  116 tcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  23066749 tcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgatgacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggagaggg 23066848  T
Q  213 tcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
      |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  23066849 ctacgatcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagagttgtcttagtggagtggtgatga 23066915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21542233 - 21542056
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  21542233 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 21542135  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21542134 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 21542056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 42095903 - 42096080
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  42095903 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 42096001  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  42096002 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 42096080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 243
Target Start/End: Original strand, 20045899 - 20046056
Alignment:
Q  88 gggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaat 185  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||| |||||||    
T  20045899 gggagagcttcggctctggaacgcctcgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgctgagaat 20045998  T
Q  186 gctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20045999 gctttaaccattctacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 20046056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 270
Target Start/End: Original strand, 22448270 - 22448469
Alignment:
Q  65 attagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgag 164  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        ||    
T  22448270 attaattgcataagcataaaagtagaagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtg--------ag 22448361  T
Q  165 gacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtct 261  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22448362 gacttatgtcctgtaaatgaatgctttaaccattcaacagcggtgagggctacggccctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtct 22448460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20242746 - 20242503
Alignment:
Q  31 taggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || | || | | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  20242746 taggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggtcatttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtg 20242648  T
Q  131 gagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga--gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatt 226  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   |  |||||| |||| ||||| ||||||||  |||   ||||| ||| |    
T  20242647 gagcactagttgctcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaatgaatgccttaatcattctacagcggttagggcttcggccttga-t 20242549  T
Q  227 tttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20242548 tttggtaccacatgcatgggtgttgttagagaagtcttagtggagt 20242503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41111016 - 41110814
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||     
T  41111016 gtatgtagatataca-caggtggggtagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtc 41110918  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||    
T  41110917 gttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcatgctgagaatgctttaaccattcgacaatggtgtgggtcatgaccctgaattatggtatcacat 41110818  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  41110817 gcat 41110814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 19664105 - 19664306
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  19664105 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcattaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 19664203  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||  | |||||||||||    
T  19664204 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgatagcagtgagggctccggccctga-atatggtaccacat 19664302  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  19664303 gcat 19664306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32650278 - 32650074
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 165  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  | |||||  |||||| ||||  ||| ||||| |    
T  32650278 agttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacattagttgttcaaagcggtgtttagcggtgatg 32650179  T
Q  166 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttag 264  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||  | |||||||||||||||| |  || | ||||||||||||    
T  32650178 acttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggctacggtcctga-atatggtaccacatgcatgcgcattgttgaggagtcttag 32650080  T
Q  265 tggagt 270  Q
    ||||||    
T  32650079 tggagt 32650074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Original strand, 955118 - 955256
Alignment:
Q  144 tcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 240  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  955118 tcaaagtggtgtttagtggtgagggcttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagtggtgagggctacggtcctgatttt-ggtaccacatg 955216  T
Q  241 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  955217 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 955256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 19778434 - 19778639
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatgggga-ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 140  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||| | || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  19778434 gtatgtagatataca-caagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 19778532  T
Q  141 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacc 235  Q
    |  ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||| || |||||||    
T  19778533 tgttcaaagctgtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgaacagcggtgagggctgcgaccctga-ttatggtacc 19778631  T
Q  236 acatgcat 243  Q
    ||||||||    
T  19778632 acatgcat 19778639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36615015 - 36614935
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36615015 ggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggtttcggccctg--ttttggtaccacatgcat 36614935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 269
Target Start/End: Original strand, 29554465 - 29554645
Alignment:
Q  88 gggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaa 184  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||    
T  29554465 gggagggctccggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaa 29554564  T
Q  185 tgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 269  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||| |||   ||||||||| || ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||    
T  29554565 tgctttaaccattcaattagcagtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcattgg----tagaggagtcttagtggag 29554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 130
Target Start/End: Original strand, 955041 - 955128
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    ||||||||||||||| || | || | ||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  955041 gtatgtagatataca-caagtgggtcagtagcatgagcataaaagtggaagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtg 955128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24079634 - 24079551
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||    
T  24079634 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat 24079551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Original strand, 24109120 - 24109203
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattc--gacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||    
T  24109120 ggtgaggacttatgtcctgat--gaatgctttaaccattcaaaacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcat 24109203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40728 - 40549
Alignment:
Q  16 atatatgtatatgtctaggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaa-cataacagtgggagagcttcggctctggaatgctta 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  40728 atatatgtatatgtataggttggttggtatgtagatatactctatggggattagttgcattaaacataacagtggaagagcttcggctctggaatgcttg 40629  T
Q  115 gtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaacc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40628 gtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaacc 40549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Original strand, 36793 - 36994
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  36793 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgagagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 36891  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  36892 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgataagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcatggccctga-ttatggtaccacat 36990  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  36991 gcat 36994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 276
Target Start/End: Original strand, 8493 - 8571
Alignment:
Q  198 cgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtttagaggagtcttagtggagtagtgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8493 cgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggggtttagaggagtcttagtggagtggtgat 8571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 14472 - 14710
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14472 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 14570  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  14571 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 14669  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14670 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 14710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Original strand, 7225 - 7356
Alignment:
Q  79 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggt-gtagtggtgaggacttatgtcctg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7225 cataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtattagtggtgaggacttatgtcctg 7324  T
Q  178 ttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtg 208  Q
       | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7325 aaaatgaatgctttaaccattctacagcggtg 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42132 - 41894
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42132 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 42034  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  42033 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 41935  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41934 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 41894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 63169 - 63407
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  63169 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttatcgttcaaagtggtggagcactagtt 63267  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  63268 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacat 63366  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  63367 gcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 63407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Original strand, 12876 - 13054
Alignment:
Q  66 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtg--gtga 163  Q
    |||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  || ||||  |||||| ||||||| |  ||||    
T  12876 ttagttgcataagcatcaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacaagttgttcaaagcggtgtagagcggtga 12975  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12976 ggacttaggtcctgataagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggacctga-ttatggtaccacatgcat 13054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 270
Target Start/End: Original strand, 124446 - 124677
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||| |||| | || | |||||||| | ||||| || ||||| ||||| |  |||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  124446 gtatgtagatata-aacaagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagggcttctgacctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagtt 124544  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 237  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||    
T  124545 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgataagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccac 124643  T
Q  238 atgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggagt 270  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  124644 atgcatgagtattgtagaggagtcttagtggagt 124677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 141526 - 141297
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  141526 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 141428  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatg 240  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||| || ||||||||||||    
T  141427 gctcaaagtggtgttagtggtgaggacttacgtcctgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggtcctga-ttatggtaccacatg 141329  T
Q  241 catgggtgt--ttagaggagtcttagtggagt 270  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  141328 catgggtgttgttagaggagtcttagtggagt 141297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 146742 - 146611
Alignment:
Q  70 ttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtgg--tgtagtggtgaggac 167  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  146742 ttgcataatcataaaagtgggagagcttcgtctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtttttagtggtgaggac 146643  T
Q  168 ttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  146642 ttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 265311 - 265063
Alignment:
Q  31 taggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  265311 taggttgggtggtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtg 265213  T
Q  131 gagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttt 229  Q
    | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||| || |    
T  265212 gggcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcatgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaaggctacggtcctga-ttat 265114  T
Q  230 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  265113 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaagagtcttagtggagtggtgatga 265063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 258885 - 258637
Alignment:
Q  31 taggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  258885 taggttgggtggtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataacagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtg 258787  T
Q  131 gagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttt 229  Q
    | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||| || |    
T  258786 gggcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacatatgtcatgaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgaaggctacggtcctga-ttat 258688  T
Q  230 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  258687 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaagagtcttagtggagtggtgatga 258637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Original strand, 5997 - 6245
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |  ||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  5997 ggttgagttgtatgtagatatacataagtggg-ttagttacataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 6095  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttt 229  Q
    | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |    
T  6096 gcactagttgctcaaagtggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttat 6194  T
Q  230 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6195 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggaatggtgatga 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 278
Target Start/End: Original strand, 50972 - 51185
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgagga 166  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  50972 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttatcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgagga 51071  T
Q  167 cttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctta 263  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  51072 cttatgtcctgaaaacgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctta 51170  T
Q  264 gtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||| |||||||    
T  51171 gtggagtggtgatga 51185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 152571 - 152324
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  152571 ggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtgga 152473  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttg 230  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||||| |||| | || |||  |||| ||||| || ||    
T  152472 gcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgattgctttaaccattctacagtgttgagggctacggtcctga-ttatg 152374  T
Q  231 gtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  152373 gtaccacatgcatggttgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 152324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 174561 - 174738
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  174561 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 174659  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  174660 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 174738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 110935 - 110758
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||| | |||||  || ||||||    
T  110935 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaatgcggtgtggagcggtgag 110837  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  110836 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 110758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 116861 - 116793
Alignment:
Q  175 ctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  116861 ctgttaagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 116793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 4275 - 4458
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||| ||    
T  4275 gtatgtagatataca-caagtggattagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactaatt 4373  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 224  Q
      ||| || |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 gttcacagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 4458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 9649 - 9809
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| ||||| |||||    
T  9649 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctattgag 9748  T
Q  183 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9749 aatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgaattatggtaccacatgcat 9809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10518 - 10305
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtg--gtgtagtggtgagg 165  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  || ||||| |||||    
T  10518 agttgcataatcataaaagtgggagagcttcggctctgggacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactggttgctcaaagtgatgtttagtgatgagg 10419  T
Q  166 acttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtctt 262  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10418 acttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggccctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtctt 10320  T
Q  263 agtggagtagtgatg 277  Q
    |||||||| ||||||    
T  10319 agtggagtggtgatg 10305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Original strand, 4617 - 4795
Alignment:
Q  66 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 163  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  4617 ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 4716  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  4717 ggacttatgtcctgatgagaatgctttaacaattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 174561 - 174739
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  | |||| |||||  || ||||||    
T  174561 tagttgcataaacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttaaaagcggtgtggagcggtgag 174660  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  174661 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccaagaattatggtaccacatgcat 174739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 489304 - 489127
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  489304 tagttgcataaacatca-agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgag 489206  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  489205 gacttaggtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagtgttgtgggtcatggccctgaattatggtaccacatgcat 489127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 179083 - 179002
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatg 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||| |||   ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  179083 ggtgaggacttatgtcctgatga--atgctttaaccattcaaaagcggtgagggcttcggtcctg--ttttggtaccacatgcatg 179002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Original strand, 10259 - 10435
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagg 165  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||    
T  10259 agttgcataagcataaaagtgggagagcttcagctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtgagg 10358  T
Q  166 acttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  10359 acttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-atatggtaccacatgcat 10435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14209 - 13971
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14209 gtatgtagatataca-caagggggttagttgcataaacatagaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcgtt 14111  T
Q  142 actcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacat 239  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| || | |||| |||  |||| ||||| ||| | ||||||||    
T  14110 gctcaaagtggtgttagtggcgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctaccgaggtgagggctacggtcctga-tttcgataccacat 14012  T
Q  240 gcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14011 gcatgggtgttgttagcggagtcttagtggagtggtgatga 13971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24387 - 24172
Alignment:
Q  66 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgag 164  Q
    |||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  24387 ttagttgcataagcatagaagtggaagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactcattcctcaaagtggtgttagtggcgag 24288  T
Q  165 gacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtct 261  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  24287 gacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagaggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccagatgcatgggtgttgttagcggagtct 24189  T
Q  262 tagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24188 tagtggagtggtgatga 24172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38578 - 38401
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  38578 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 38480  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38479 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 38401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 35546 - 35723
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  35546 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 35644  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35645 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 35723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 30162 - 30322
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||||||||| |||||| |||    
T  30162 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtgaggacttaggtcctgatga 30261  T
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30262 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 30322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Original strand, 51667 - 51858
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  51667 ggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctttggaacgccttgtcattcaaagcggtgga 51765  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccct 222  Q
      | |||||  |||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||||| ||| | |||||||    
T  51766 acagtagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagggcttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctatagcggtgagggcctcggccct 51858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 46979 - 47156
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  46979 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 47077  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47078 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 47156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 52384 - 52561
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaa-gtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||  || |||||    
T  52384 tagttgcat-aacatcaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaaagcggtgttgagcggtga 52482  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52483 ggacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 52561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 14583 - 14779
Alignment:
Q  79 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14583 cataacagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctg 14682  T
Q  178 ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagt 273  Q
        ||||| ||||||||||| |||||| ||  ||  |||| |||||  | || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14683 aaatgaatgttttaaccattctacagcgatgatggctacggtcctga-atatgataccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtagt 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 15432 - 15615
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  15432 gtatgtagatataca-caagggggttagttgcacaagcataaaagtgggagagcttcgactctggaacgccttgtcattcaaagcggtggaacactagtt 15530  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 224  Q
      |||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15531 gttcaaagcggtgttgagcggtgaggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggtcacggccctga 15615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 71266 - 71155
Alignment:
Q  68 agttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgagg 165  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||    
T  71266 agttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagg 71167  T
Q  166 acttatgtcctg 177  Q
    ||||||||||||    
T  71166 acttatgtcctg 71155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2743 - 2566
Alignment:
Q  67 tagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgag 164  Q
    ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||  || ||||  |||||| |||||  || ||||||    
T  2743 tagttgcataagcatcaaagtgggagagcttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacaccagttgttcaaagcggtgttgagcggtgag 2644  T
Q  165 gacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2643 gacttaggtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga-ttatggtaccacatgcat 2566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29913 - 29748
Alignment:
Q  79 cataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcct 176  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29913 cataaaagtgggagagctttggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacttgttgttcaaagtggtgttgagcggtgaggacttatgtcct 29814  T
Q  177 gttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  29813 gatgagaatgctttaaccattcgacaacggtgtgggttacggccctga-ttatggtaccacatgcat 29748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 278
Target Start/End: Original strand, 15511 - 15678
Alignment:
Q  114 agtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgg 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  15511 agtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtggtgttagtggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaacgattctacagcggtgagg 15610  T
Q  212 gtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    |  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15611 gctacggtcctga-ttatggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 15678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3132 - 3034
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||    
T  3132 ggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggctctggaacgccttatcgttcaaagcggtgga 3034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 266
Target Start/End: Original strand, 47387 - 47615
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  47387 gtatgtagatataca-caagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 47485  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||    
T  47486 gctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccaca 47584  T
Q  239 tgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 266  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  47585 tgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 47615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 266
Target Start/End: Original strand, 62807 - 63035
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  62807 gtatgtagatataca-caagcgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagtttcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggagcactagtt 62905  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||    
T  62906 gctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccaca 63004  T
Q  239 tgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 266  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  63005 tgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 63035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 266
Target Start/End: Original strand, 56421 - 56649
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  56421 gtatgtagatataca-caagagggtcagttgcataagcataaaagtgggagagattcggctctagaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagtt 56519  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
     ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||    
T  56520 gctcaaagcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattcgacaacggtgagggctacggtcctga-ttatggtaccaca 56618  T
Q  239 tgca-tgggtgt--ttagaggagtcttagtg 266  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  56619 tgcattgggtgttgttagaggagtcttagtg 56649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5359 - 5112
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  5359 ggttgagttgtatgtagatataca-caagagggttagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgga 5261  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgattttt 229  Q
      |||||||  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||    |||||| | || |    
T  5260 acactagttgttcaaagcggtgtatagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggctttggccct-aattat 5162  T
Q  230 ggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatg 277  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5161 ggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatg 5112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10377 - 10217
Alignment:
Q  66 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtga 163  Q
    ||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||  |||||||  |||||| |||||  || |||||    
T  10377 ttagtcgcataagcataaaagtgtgagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtagaacactagttgttcaaagcggtgttgagcggtga 10278  T
Q  164 ggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10277 ggacttatgtcctgatgagaatgctttaaccattcgacagcggagtgggtcacggccctga 10217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Original strand, 143 - 314
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  143 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 241  T
Q  142 actcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 212  Q
      |||||| |||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  242 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 1
Alignment:
Q  85 agtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttgagaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||        |||||||| |||||||||||||    
T  132 agtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagtggtggaacactagttgttcaaagcggtg--------aggacttaggtcctgttgagaa 41  T
Q  185 tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40 tgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggtcctga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 1 - 131
Alignment:
Q  115 gtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcgacagcggtgtggg 212  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1 gtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtggagcggtgaggacttaggtcctgttgataatgctttaaccattcgacagcggtgtgga 100  T
Q  213 tcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  101 tcacggccctggattatggtaccacatgcat 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Original strand, 20482 - 20629
Alignment:
Q  31 taggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtg 130  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  20482 taggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtg 20580  T
Q  131 gagtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg 177  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20581 gagtactagttgctcaacgcggtgtttagtggtgaggacttatgtcctg 20629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 1
Alignment:
Q  66 ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtgg 152  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  87 ttagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgctttgtcgttcaaagtggtggagcactagttgctcaaagtgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 274
Target Start/End: Original strand, 4981 - 5218
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtac-tagt 140  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| || | ||    
T  4981 gtatgtagatataca-caagtgggttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggagcactttgt 5079  T
Q  141 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 237  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| || |||||||||    
T  5080 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccac 5178  T
Q  238 atgcat---gggtgtttagaggagtcttagtggagtagtg 274  Q
    ||||||   || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  5179 atgcatgagggttgattagaggaatcttagtggagtagtg 5218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17679 - 17447
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17679 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggaaagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggagcactagtt 17581  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccaca 238  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||| || |||   |||||| || || ||||||||||    
T  17580 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattctacagcgatgagggcttcggccccga-ttatggtaccaca 17482  T
Q  239 tgcat---gggtgtttagaggagtcttagtggagt 270  Q
    |||||   || || ||||| |||||||||||||||    
T  17481 tgcatgagggttgattagaagagtcttagtggagt 17447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3718 - 3621
Alignment:
Q  182 gaatgctttaaccattcgacagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgt--ttagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3718 gaatgctttaaccattctacagcggtgagggctacggtcctga-ttttggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 3621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 41592 - 41750
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||  |||||||    
T  41592 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttaaaagcggtggaacactagtt 41690  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  41691 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 41750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 200
Target Start/End: Original strand, 102930 - 103063
Alignment:
Q  69 gttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 166  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  102930 gttgcataagcataaaagcgggagagcttcggccctggaacgagttgtcgttcaaagcggtggaacactagttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 103029  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 200  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  103030 cttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 103063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Original strand, 27781 - 27945
Alignment:
Q  81 taacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtg-tagtggtgaggacttatgtcctgt- 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||  || ||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||| |     
T  27781 taacagcgggagagcttcggctctggaacggcttgtcgttcaaagtggtggaacacgagttgttcaaagcggtgttagcgatgaggacttatgtcctata 27880  T
Q  179 tgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcat 243  Q
      ||||||||||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||    
T  27881 aaagaatgctttaaccattcgaatagcggtgagggctccggccctga-ttatggtaccacatgcat 27945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8615 - 8410
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatgggga-ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 140  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||| | || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  8615 gtatgtagatataca-caagtggagttagttgcataaacatgaaagcgggagggcctcggccctggaatgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 8517  T
Q  141 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctg--ttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacc 235  Q
    |  ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   || |||||| || |||||||    
T  8516 tgttcaaagctgtgtttagcggtgaggacttatgtcctggaaaaagaatgctttaaccattcgaacagcggtgagggctgcgaccctga-ttatggtacc 8418  T
Q  236 acatgcat 243  Q
    ||||||||    
T  8417 acatgcat 8410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7460 - 7293
Alignment:
Q  33 ggttgattggtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtgga 132  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||| || ||||||    
T  7460 ggttgagttgtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagcgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcatagcggtgga 7362  T
Q  133 gtactagttactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
      ||||| || |||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||   | |||||||||||||||||    
T  7361 acactagatattcaaagcggtgtttagtggtaaggacttatatcctgaaaatgaatgctttaaccattc 7293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 326975 - 326816
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatgggga-ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 140  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | || || |||||||| |||||||| || ||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  326975 gtatgtagatataca-caaggggagttagttgcataagcacaaaagtgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 326877  T
Q  141 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  326876 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 326816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 321266 - 321040
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatgggga-ttagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagt 140  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || ||||||| | || || | |||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||    
T  321266 gtatgtagatataca-caaggggagtttgttgcataagcacaaaaatgggagggcttcggccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagt 321168  T
Q  141 tactcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtacca 236  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || ||||||||    
T  321167 tgttcaaagcggtgtttagcggtgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggctccggccctga-ttatggtacca 321069  T
Q  237 catgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 269  Q
    ||||||    | | |||||||||||||||||||    
T  321068 catgca----tttgtagaggagtcttagtggag 321040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 115911 - 115778
Alignment:
Q  69 gttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagttactcaaagtggtgt--agtggtgagga 166  Q
    ||||||| | ||||| || ||||| |||||| | |||||| || | ||||||||||| ||||||  ||  |||  |||||| |||||  || ||||||||    
T  115911 gttgcataagcataaaagcgggagggcttcgaccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacacccgttgttcaaagcggtgtttagcggtgagga 115812  T
Q  167 cttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcga 200  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  115811 cttatgtcctgaaaagaatgctttaaccattcga 115778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28065 - 27840
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| ||  ||  |||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || ||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  28065 gtatgtagatatacaccagtggagttagttgcataagcataaaagcgggagggcttcggccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtggaacactagtt 27966  T
Q  142 actcaaagtggtg--tagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccac 237  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||    
T  27965 gttcaaagcggtgtttagcggtgaggactcatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattcaattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccac 27867  T
Q  238 atgcatgggtgtttagaggagtcttagtggag 269  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||    
T  27866 atgcat-----tgtagaggagtcttagtggag 27840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 269
Target Start/End: Original strand, 13504 - 13620
Alignment:
Q  155 tagtggtgaggacttatgtcctg-ttgagaatgctttaaccattcga-cagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatgggtgtt-t 251  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |  ||||||| |||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  13504 tagtggtgaggacttatgtcctgaaaaagaatgctttaaccattctattagcggtgagggcttcggccctga-ttatggtaccacatgcatgagtgttgt 13602  T
Q  252 agaggagtcttagtggag 269  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13603 agaagagtcttagtggag 13620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 392 - 550
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||  ||||||  |||||||    
T  392 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcattaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaatcggtggaacactagtt 490  T
Q  142 actcaaagtg--gtgtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
      |||||| |  || ||| | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  491 gttcaaagcggagtttagcgatgaggacttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 16914 - 17072
Alignment:
Q  42 gtatgtagatatacaacatggggattagttgcattaacataacagtgggagagcttcggctctggaatgcttagtcgttcaaagtggtggagtactagtt 141  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||  |||||||    
T  16914 gtatgtagatataca-caagtgggtcagttgcataagcataaaagtgggagagcttcggctctggaacgccttgtcgttcaaagcagtggaacactagtt 17012  T
Q  142 actcaaa--gtggtgtagtggtgaggacttatgtcctgttga-gaatgctttaaccattc 198  Q
      |||||  |  || ||| ||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  17013 gttcaaaacggagtttagcggtgaggccttatgtcctgaaaatgaatgctttaaccattc 17072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 278
Target Start/End: Original strand, 78538 - 78589
Alignment:
Q  229 tggtaccacatgcatgggtgtt--tagaggagtcttagtggagtagtgatga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  78538 tggtaccacatgcatgggtgttgttagaggagtcttagtggagtggtgatga 78589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Original strand, 16141 - 16250
Alignment:
Q  159 ggtgaggacttatgtcctgttgagaatgctttaaccattcg-acagcggtgtgggtcacggccctgatttttggtaccacatgcatggg--tgtttagag 255  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | ||||||| |||  ||||||||||  | |||||||||||||||| |  | | |||||    
T  16141 ggtgaggacttatgtcctgaaaagaatgctttaagcattcgaatagcggtgagggctacggccctga-atatggtaccacatgcatgagcatttgtagag 16239  T
Q  256 gagtcttagtg 266  Q
    |||||||||||    
T  16240 gagtcttagtg 16250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16955 - 16913
Alignment:
Q  229 tggtaccacatgcatgggtgtt-tagaggagtcttagtggagt 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16955 tggtaccacatgcatgagtgttgtagaggagtcttagtggagt 16913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University