View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2981_high_1 (Length: 1130)

Name: NF2981_high_1
Description: NF2981
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2981_high_1
NF2981_high_1
[»] chr3 (152 HSPs)
chr3 (292-1043)||(54634710-54635482)
chr3 (316-1044)||(6716084-6716834)
chr3 (299-756)||(45282875-45283337)
chr3 (315-756)||(25637321-25637766)
chr3 (315-756)||(3617342-3617786)
chr3 (271-756)||(800983-801463)
chr3 (315-756)||(4600576-4601019)
chr3 (315-756)||(4598355-4598798)
chr3 (315-756)||(10211288-10211731)
chr3 (299-685)||(7779824-7780208)
chr3 (315-756)||(10209068-10209511)
chr3 (315-756)||(10056112-10056555)
chr3 (315-756)||(10058334-10058777)
chr3 (315-756)||(10060556-10060999)
chr3 (315-756)||(10062778-10063221)
chr3 (315-756)||(10065000-10065443)
chr3 (299-756)||(23199960-23200420)
chr3 (364-756)||(23197823-23198221)
chr3 (614-980)||(6718331-6718718)
chr3 (296-756)||(5257964-5258427)
chr3 (298-756)||(9635946-9636410)
chr3 (296-756)||(5260143-5260606)
chr3 (831-1030)||(8477790-8477990)
chr3 (557-756)||(10067222-10067419)
chr3 (365-756)||(19683774-19684172)
chr3 (296-756)||(37408344-37408807)
chr3 (365-756)||(45095050-45095445)
chr3 (782-996)||(2671111-2671328)
chr3 (853-1030)||(40372268-40372446)
chr3 (300-756)||(7762151-7762610)
chr3 (365-756)||(7764353-7764747)
chr3 (831-1044)||(25637012-25637225)
chr3 (831-1043)||(3617034-3617246)
chr3 (831-1030)||(7167670-7167870)
chr3 (859-1043)||(800685-800870)
chr3 (365-756)||(9581168-9581565)
chr3 (831-980)||(45282628-45282778)
chr3 (851-1043)||(1306411-1306604)
chr3 (831-1043)||(4598894-4599107)
chr3 (831-1043)||(4601115-4601328)
chr3 (831-1035)||(10058034-10058240)
chr3 (831-1035)||(10060256-10060462)
chr3 (831-1035)||(10062478-10062684)
chr3 (831-1035)||(10064700-10064906)
chr3 (831-1035)||(10055812-10056018)
chr3 (831-1035)||(10066922-10067128)
chr3 (858-1030)||(22172674-22172847)
chr3 (851-1043)||(23198337-23198530)
chr3 (851-1043)||(23200536-23200729)
chr3 (781-1043)||(10208778-10209042)
chr3 (831-1030)||(28503331-28503530)
chr3 (831-1043)||(6718288-6718481)
chr3 (831-1026)||(27352097-27352293)
chr3 (831-1030)||(28501164-28501363)
chr3 (851-1045)||(26928078-26928273)
chr3 (858-1030)||(18656843-18657017)
chr3 (477-756)||(39153358-39153644)
chr3 (477-648)||(34491212-34491383)
chr3 (831-1043)||(10210978-10211191)
chr3 (917-1043)||(7782586-7782712)
chr3 (879-1043)||(33386137-33386302)
chr3 (298-756)||(760732-761190)
chr3 (474-648)||(49199462-49199638)
chr3 (481-648)||(4569952-4570120)
chr3 (365-756)||(5236343-5236739)
chr3 (315-520)||(10067435-10067642)
chr3 (477-648)||(29196383-29196555)
chr3 (477-756)||(40734383-40734669)
chr3 (298-756)||(40735268-40735728)
chr3 (477-756)||(32744433-32744709)
chr3 (826-980)||(8738585-8738740)
chr3 (826-980)||(9090823-9090978)
chr3 (474-648)||(43401794-43401970)
chr3 (842-1043)||(37408036-37408236)
chr3 (477-715)||(44331470-44331716)
chr3 (488-756)||(22835010-22835285)
chr3 (879-1044)||(37726134-37726300)
chr3 (879-1043)||(27453416-27453581)
chr3 (477-756)||(29682244-29682530)
chr3 (474-644)||(30236129-30236299)
chr3 (367-756)||(51398699-51399094)
chr3 (474-648)||(43403737-43403913)
chr3 (481-648)||(6095600-6095767)
chr3 (477-648)||(44700476-44700646)
chr3 (477-646)||(31314447-31314616)
chr3 (481-648)||(41819523-41819691)
chr3 (365-756)||(29810753-29811150)
chr3 (481-648)||(54593704-54593871)
chr3 (858-1045)||(2672416-2672604)
chr3 (477-756)||(16498915-16499200)
chr3 (481-648)||(46860474-46860642)
chr3 (488-648)||(53921511-53921671)
chr3 (477-648)||(29813063-29813234)
chr3 (488-646)||(32891105-32891264)
chr3 (858-1036)||(2676581-2676760)
chr3 (851-980)||(32143754-32143884)
chr3 (474-590)||(40913352-40913467)
chr3 (490-629)||(46173377-46173515)
chr3 (477-665)||(9666463-9666659)
chr3 (477-648)||(23391906-23392077)
chr3 (985-1045)||(45282583-45282642)
chr3 (481-588)||(55301972-55302079)
chr3 (858-1030)||(8512642-8512815)
chr3 (857-937)||(32475885-32475966)
chr3 (857-937)||(32480743-32480824)
chr3 (479-645)||(47304254-47304420)
chr3 (983-1043)||(32143868-32143928)
chr3 (858-1030)||(8517522-8517695)
chr3 (879-980)||(27986001-27986103)
chr3 (520-648)||(51352150-51352278)
chr3 (858-1030)||(24968519-24968692)
chr3 (983-1043)||(27974433-27974493)
chr3 (576-681)||(5433971-5434086)
chr3 (477-703)||(23410326-23410561)
chr3 (983-1043)||(27985957-27986017)
chr3 (966-1030)||(36029640-36029704)
chr3 (985-1033)||(40734084-40734132)
chr3 (489-548)||(27305719-27305777)
chr3 (514-648)||(36018852-36018987)
chr3 (984-1043)||(40845220-40845279)
chr3 (985-1030)||(16264896-16264941)
chr3 (985-1030)||(21711768-21711813)
chr3 (985-1030)||(27027273-27027318)
chr3 (985-1030)||(30709271-30709316)
chr3 (991-1030)||(8738554-8738593)
chr3 (991-1030)||(9090792-9090831)
chr3 (965-1044)||(27038588-27038667)
chr3 (781-820)||(45282809-45282848)
chr3 (531-643)||(4055813-4055926)
chr3 (968-1030)||(32475997-32476059)
chr3 (968-1030)||(32480855-32480917)
chr3 (296-346)||(37406987-37407037)
chr3 (985-1043)||(39032017-39032075)
chr3 (887-1033)||(40735015-40735161)
chr3 (481-549)||(2075076-2075143)
chr3 (298-346)||(22834829-22834877)
chr3 (577-636)||(28253363-28253423)
chr3 (298-346)||(29196212-29196260)
chr3 (298-346)||(29811166-29811214)
chr3 (298-346)||(39153187-39153235)
chr3 (298-346)||(40734795-40734843)
chr3 (531-590)||(4075520-4075581)
chr3 (365-407)||(9634707-9634750)
chr3 (992-1030)||(1730921-1730959)
chr3 (706-756)||(7782375-7782424)
chr3 (849-895)||(7782538-7782584)
chr3 (900-934)||(22172864-22172898)
chr3 (575-628)||(25517069-25517121)
chr3 (298-343)||(29682657-29682702)
chr3 (985-1030)||(35926057-35926101)
chr3 (985-1030)||(40592257-40592302)
chr3 (985-1026)||(48438782-48438823)
[»] chr6 (99 HSPs)
chr6 (315-1043)||(27647467-27648187)
chr6 (299-756)||(16554762-16555220)
chr6 (299-756)||(16631318-16631776)
chr6 (299-749)||(16653012-16653463)
chr6 (299-756)||(16578335-16578793)
chr6 (299-756)||(16616587-16617045)
chr6 (315-756)||(25421198-25421642)
chr6 (269-756)||(3072550-3073036)
chr6 (315-756)||(6027141-6027582)
chr6 (315-756)||(34166973-34167416)
chr6 (315-756)||(33341935-33342380)
chr6 (299-756)||(411994-412434)
chr6 (315-756)||(34164751-34165194)
chr6 (315-756)||(6097286-6097717)
chr6 (296-756)||(2171347-2171814)
chr6 (315-677)||(13153886-13154251)
chr6 (831-1044)||(16578889-16579102)
chr6 (831-1044)||(16616278-16616491)
chr6 (365-756)||(31404561-31404957)
chr6 (298-756)||(30834356-30834819)
chr6 (296-756)||(5413215-5413675)
chr6 (271-756)||(16452127-16452612)
chr6 (831-1043)||(16554454-16554666)
chr6 (831-1043)||(16631010-16631222)
chr6 (387-756)||(5406109-5406481)
chr6 (387-756)||(5410434-5410806)
chr6 (849-1045)||(411683-411881)
chr6 (831-1045)||(5674227-5674442)
chr6 (824-1043)||(25420797-25421016)
chr6 (849-1043)||(3073148-3073343)
chr6 (781-1043)||(2171838-2172104)
chr6 (831-1045)||(6136335-6136549)
chr6 (851-1043)||(22709452-22709645)
chr6 (831-1035)||(34166673-34166879)
chr6 (876-1030)||(30125030-30125185)
chr6 (831-1035)||(13150856-13151062)
chr6 (831-1043)||(33342475-33342688)
chr6 (831-1047)||(34164440-34164657)
chr6 (831-1043)||(6026834-6027046)
chr6 (848-1030)||(11857373-11857555)
chr6 (296-577)||(5408890-5409164)
chr6 (831-980)||(16652759-16652909)
chr6 (382-756)||(33160254-33160636)
chr6 (917-1045)||(6097860-6097988)
chr6 (848-1030)||(14741938-14742120)
chr6 (848-1030)||(22010201-22010383)
chr6 (803-980)||(5266432-5266610)
chr6 (365-756)||(9182917-9183314)
chr6 (481-648)||(21588931-21589098)
chr6 (481-648)||(21593664-21593831)
chr6 (474-648)||(3808701-3808877)
chr6 (477-756)||(16568928-16569193)
chr6 (481-645)||(17758026-17758191)
chr6 (481-648)||(2972940-2973107)
chr6 (858-1030)||(6438898-6439071)
chr6 (481-648)||(17762990-17763158)
chr6 (918-1043)||(26253589-26253714)
chr6 (481-736)||(28137409-28137671)
chr6 (824-934)||(25421000-25421110)
chr6 (481-646)||(26830124-26830289)
chr6 (477-756)||(26954283-26954568)
chr6 (481-645)||(5043630-5043795)
chr6 (481-648)||(22424826-22424995)
chr6 (477-648)||(33211182-33211353)
chr6 (879-1043)||(23896792-23896957)
chr6 (504-648)||(3038926-3039071)
chr6 (474-614)||(603082-603222)
chr6 (849-1043)||(16839137-16839331)
chr6 (315-395)||(6136135-6136216)
chr6 (858-946)||(28155167-28155256)
chr6 (858-1043)||(33329932-33330118)
chr6 (963-1047)||(34151824-34151907)
chr6 (848-980)||(14737128-14737260)
chr6 (858-1043)||(33335429-33335615)
chr6 (481-594)||(26800642-26800755)
chr6 (858-1044)||(6005821-6006008)
chr6 (858-937)||(5343879-5343959)
chr6 (531-648)||(4045423-4045542)
chr6 (985-1043)||(16652716-16652773)
chr6 (581-756)||(16567091-16567265)
chr6 (879-1044)||(5756950-5757116)
chr6 (985-1030)||(5266596-5266641)
chr6 (985-1030)||(14737097-14737142)
chr6 (968-1030)||(5343990-5344052)
chr6 (781-895)||(6097741-6097858)
chr6 (987-1030)||(28155102-28155145)
chr6 (985-1030)||(5016981-5017026)
chr6 (985-1030)||(31085958-31086003)
chr6 (900-932)||(16554659-16554691)
chr6 (900-932)||(16578864-16578896)
chr6 (900-932)||(16616484-16616516)
chr6 (900-932)||(16631215-16631247)
chr6 (900-932)||(16652902-16652934)
chr6 (985-1036)||(5571755-5571806)
chr6 (781-820)||(16554697-16554736)
chr6 (781-820)||(16631253-16631292)
chr6 (781-820)||(16652940-16652979)
chr6 (900-934)||(11857331-11857365)
chr6 (315-356)||(13159066-13159107)
[»] chr1 (105 HSPs)
chr1 (315-1043)||(9036003-9036751)
chr1 (299-756)||(40282269-40282727)
chr1 (271-756)||(21053850-21054335)
chr1 (271-756)||(9987094-9987579)
chr1 (314-756)||(20622071-20622514)
chr1 (315-756)||(44203526-44203968)
chr1 (299-756)||(51765280-51765744)
chr1 (833-1043)||(20622610-20622821)
chr1 (298-649)||(13316174-13316521)
chr1 (298-756)||(8550606-8551070)
chr1 (849-1043)||(40281958-40282154)
chr1 (298-756)||(20762557-20763014)
chr1 (851-1043)||(21053540-21053733)
chr1 (849-1043)||(9986785-9986980)
chr1 (831-1044)||(44203217-44203430)
chr1 (783-1045)||(51764988-51765254)
chr1 (387-756)||(3189216-3189590)
chr1 (387-756)||(3198033-3198407)
chr1 (387-756)||(3206872-3207246)
chr1 (365-756)||(3156751-3157147)
chr1 (851-1043)||(19360912-19361105)
chr1 (859-1043)||(19365768-19365953)
chr1 (918-1043)||(24202251-24202376)
chr1 (477-756)||(28220223-28220509)
chr1 (481-648)||(37168297-37168465)
chr1 (831-980)||(24793709-24793859)
chr1 (858-1030)||(39445897-39446070)
chr1 (858-1035)||(41391001-41391178)
chr1 (858-1030)||(44023389-44023562)
chr1 (477-756)||(834164-834450)
chr1 (298-648)||(49918350-49918696)
chr1 (481-648)||(13547090-13547257)
chr1 (858-1030)||(25439411-25439584)
chr1 (365-756)||(31659123-31659520)
chr1 (369-756)||(44455045-44455438)
chr1 (474-648)||(42297968-42298143)
chr1 (481-648)||(13549001-13549168)
chr1 (477-648)||(28265551-28265722)
chr1 (481-648)||(29136247-29136415)
chr1 (481-648)||(47255340-47255508)
chr1 (477-756)||(28223418-28223704)
chr1 (858-1030)||(1054526-1054699)
chr1 (481-648)||(11348698-11348865)
chr1 (858-1030)||(25444604-25444777)
chr1 (365-756)||(37503443-37503837)
chr1 (477-756)||(4552634-4552920)
chr1 (481-648)||(7482231-7482399)
chr1 (831-962)||(24786905-24787037)
chr1 (477-648)||(37033068-37033241)
chr1 (842-1043)||(13604095-13604296)
chr1 (481-648)||(31925708-31925875)
chr1 (477-756)||(3847118-3847404)
chr1 (481-648)||(47115171-47115340)
chr1 (365-718)||(37559751-37560115)
chr1 (477-648)||(45644351-45644523)
chr1 (477-756)||(13659333-13659619)
chr1 (481-648)||(193611-193778)
chr1 (477-756)||(196904-197191)
chr1 (479-648)||(19754494-19754664)
chr1 (477-648)||(50169207-50169378)
chr1 (485-648)||(34603576-34603740)
chr1 (504-756)||(1833407-1833667)
chr1 (501-648)||(23555286-23555433)
chr1 (477-648)||(50167172-50167343)
chr1 (477-697)||(46064861-46065089)
chr1 (858-980)||(41398656-41398778)
chr1 (477-756)||(13137973-13138257)
chr1 (501-756)||(15820192-15820455)
chr1 (474-648)||(41360914-41361088)
chr1 (477-648)||(19752685-19752857)
chr1 (505-643)||(22079322-22079461)
chr1 (481-563)||(28242391-28242472)
chr1 (477-648)||(30476443-30476614)
chr1 (477-645)||(40122193-40122363)
chr1 (481-627)||(927977-928123)
chr1 (477-756)||(10925108-10925397)
chr1 (966-1036)||(21536119-21536189)
chr1 (849-895)||(24202379-24202425)
chr1 (481-563)||(37876767-37876848)
chr1 (985-1030)||(24793678-24793723)
chr1 (858-937)||(43988054-43988134)
chr1 (900-1026)||(26644390-26644517)
chr1 (985-1047)||(3282273-3282335)
chr1 (501-563)||(36683766-36683828)
chr1 (985-1035)||(41398764-41398814)
chr1 (672-756)||(13316518-13316601)
chr1 (985-1030)||(13598967-13599012)
chr1 (985-1029)||(37070334-37070378)
chr1 (520-594)||(16455676-16455750)
chr1 (575-648)||(37879005-37879079)
chr1 (576-645)||(8871143-8871213)
chr1 (490-634)||(37282701-37282846)
chr1 (531-634)||(3460710-3460815)
chr1 (509-594)||(5459961-5460046)
chr1 (544-643)||(12318585-12318685)
chr1 (562-626)||(48382441-48382505)
chr1 (298-346)||(833992-834040)
chr1 (507-594)||(6808507-6808595)
chr1 (298-346)||(13137803-13137851)
chr1 (567-630)||(32736952-32737015)
chr1 (567-630)||(35109493-35109556)
chr1 (492-549)||(8871074-8871130)
chr1 (480-525)||(15916626-15916671)
chr1 (985-1026)||(16124197-16124238)
chr1 (480-525)||(31422862-31422906)
[»] chr5 (112 HSPs)
chr5 (271-756)||(29720256-29720743)
chr5 (270-756)||(29722416-29722904)
chr5 (271-756)||(29750948-29751436)
chr5 (299-756)||(22536111-22536563)
chr5 (315-756)||(10593151-10593594)
chr5 (315-756)||(25078013-25078457)
chr5 (315-756)||(25135982-25136426)
chr5 (271-756)||(9789021-9789500)
chr5 (315-756)||(40379985-40380427)
chr5 (315-756)||(40382196-40382638)
chr5 (271-756)||(18441441-18441924)
chr5 (298-756)||(16409367-16409825)
chr5 (315-756)||(16544302-16544747)
chr5 (315-756)||(16546524-16546969)
chr5 (271-756)||(26177775-26178255)
chr5 (299-756)||(26170666-26171111)
chr5 (781-1044)||(22536590-22536853)
chr5 (298-756)||(30182474-30182934)
chr5 (296-756)||(13342946-13343408)
chr5 (298-756)||(25412647-25413106)
chr5 (299-756)||(36073866-36074327)
chr5 (849-1043)||(29719965-29720161)
chr5 (831-1044)||(24136271-24136485)
chr5 (831-1043)||(10592844-10593055)
chr5 (831-1045)||(40379676-40379890)
chr5 (831-1043)||(16546216-16546428)
chr5 (831-1043)||(40381889-40382101)
chr5 (859-1043)||(9789624-9789809)
chr5 (849-1043)||(26177466-26177661)
chr5 (831-1043)||(16543994-16544206)
chr5 (859-1043)||(18442048-18442233)
chr5 (865-1043)||(29722152-29722332)
chr5 (831-1030)||(27450198-27450397)
chr5 (831-1043)||(29751532-29751724)
chr5 (382-718)||(13239674-13240016)
chr5 (858-1030)||(30631763-30631936)
chr5 (831-1030)||(27445355-27445554)
chr5 (831-1030)||(43599106-43599306)
chr5 (831-1030)||(43604598-43604798)
chr5 (831-1030)||(43610090-43610290)
chr5 (831-1035)||(25077713-25077918)
chr5 (831-1035)||(25135682-25135887)
chr5 (849-1043)||(16407641-16407836)
chr5 (831-1030)||(1456650-1456849)
chr5 (382-756)||(32636709-32637088)
chr5 (919-1043)||(29752266-29752390)
chr5 (849-1043)||(26170357-26170552)
chr5 (477-629)||(37439161-37439313)
chr5 (849-1043)||(16409077-16409272)
chr5 (298-756)||(30682745-30683203)
chr5 (481-648)||(213465-213633)
chr5 (865-1030)||(29402562-29402728)
chr5 (477-756)||(13488088-13488374)
chr5 (481-648)||(40147261-40147428)
chr5 (858-1030)||(15045095-15045267)
chr5 (479-648)||(28278316-28278485)
chr5 (477-756)||(42428427-42428713)
chr5 (918-1043)||(15465000-15465125)
chr5 (300-756)||(39468373-39468832)
chr5 (481-756)||(31182858-31183138)
chr5 (858-1030)||(28807088-28807261)
chr5 (879-1043)||(9352807-9352972)
chr5 (477-756)||(28750652-28750938)
chr5 (460-756)||(33831565-33831866)
chr5 (918-1043)||(36931843-36931968)
chr5 (477-755)||(533655-533940)
chr5 (481-648)||(5058047-5058212)
chr5 (477-718)||(8565943-8566192)
chr5 (831-980)||(43592661-43592811)
chr5 (481-756)||(16451966-16452247)
chr5 (477-756)||(537910-538196)
chr5 (477-756)||(42426232-42426518)
chr5 (826-980)||(31180633-31180787)
chr5 (504-648)||(13695713-13695859)
chr5 (483-648)||(27637615-27637781)
chr5 (860-1036)||(37556131-37556308)
chr5 (860-1036)||(37560953-37561130)
chr5 (858-1043)||(2785777-2785963)
chr5 (858-1043)||(33768586-33768772)
chr5 (858-1043)||(33791718-33791904)
chr5 (851-960)||(38219837-38219947)
chr5 (481-752)||(3075659-3075937)
chr5 (481-634)||(16640941-16641091)
chr5 (492-645)||(9049354-9049506)
chr5 (481-648)||(27015531-27015690)
chr5 (831-914)||(35388084-35388169)
chr5 (477-644)||(38747009-38747176)
chr5 (477-558)||(19806454-19806534)
chr5 (479-642)||(316769-316933)
chr5 (858-1044)||(31396488-31396675)
chr5 (993-1043)||(35388196-35388246)
chr5 (985-1030)||(31180773-31180818)
chr5 (985-1030)||(43592797-43592842)
chr5 (479-594)||(33906028-33906144)
chr5 (985-1044)||(14520796-14520855)
chr5 (477-756)||(42309932-42310218)
chr5 (858-1043)||(31401346-31401532)
chr5 (486-546)||(4160702-4160762)
chr5 (900-934)||(43592636-43592670)
chr5 (900-934)||(43599081-43599115)
chr5 (900-934)||(43604573-43604607)
chr5 (900-934)||(43610065-43610099)
chr5 (900-932)||(10593048-10593080)
chr5 (298-346)||(42428253-42428301)
chr5 (532-594)||(10054867-10054929)
chr5 (985-1035)||(11916452-11916502)
chr5 (900-934)||(27445330-27445364)
chr5 (900-934)||(27450173-27450207)
chr5 (900-934)||(29751507-29751541)
chr5 (985-1026)||(12083667-12083708)
chr5 (302-347)||(16649661-16649706)
chr5 (480-525)||(38882340-38882384)
[»] chr8 (93 HSPs)
chr8 (299-756)||(25689847-25690305)
chr8 (299-756)||(3439396-3439853)
chr8 (315-756)||(42575157-42575599)
chr8 (315-756)||(15290417-15290860)
chr8 (315-756)||(15470786-15471229)
chr8 (271-756)||(2627627-2628108)
chr8 (298-756)||(31218142-31218603)
chr8 (833-1043)||(3439088-3439297)
chr8 (271-756)||(17982538-17983021)
chr8 (299-756)||(34254154-34254611)
chr8 (299-756)||(34256330-34256787)
chr8 (298-756)||(19945181-19945643)
chr8 (298-756)||(44303739-44304201)
chr8 (298-756)||(42498079-42498541)
chr8 (831-1030)||(36979802-36980002)
chr8 (789-1030)||(33037299-33037543)
chr8 (831-1030)||(4759546-4759746)
chr8 (831-1030)||(30656070-30656270)
chr8 (849-1043)||(1261414-1261609)
chr8 (298-756)||(1746041-1746501)
chr8 (831-1030)||(18852639-18852839)
chr8 (859-1043)||(2627318-2627503)
chr8 (858-1030)||(10683751-10683924)
chr8 (781-1043)||(15290143-15290407)
chr8 (781-1043)||(15470512-15470776)
chr8 (831-1030)||(18870033-18870233)
chr8 (851-1046)||(26288324-26288520)
chr8 (851-1046)||(26301581-26301777)
chr8 (851-1046)||(26313575-26313771)
chr8 (831-980)||(25689604-25689753)
chr8 (831-1043)||(42575696-42575909)
chr8 (831-1030)||(6311724-6311923)
chr8 (850-1030)||(7289439-7289620)
chr8 (298-756)||(15212671-15213132)
chr8 (477-756)||(43036308-43036594)
chr8 (919-1043)||(31042908-31043032)
chr8 (365-756)||(33352035-33352432)
chr8 (848-1030)||(25327676-25327858)
chr8 (387-756)||(12702542-12702921)
chr8 (858-1030)||(39784337-39784510)
chr8 (365-755)||(27811164-27811560)
chr8 (481-648)||(42434992-42435159)
chr8 (369-750)||(4731549-4731936)
chr8 (481-648)||(4283524-4283691)
chr8 (477-646)||(40321082-40321251)
chr8 (477-756)||(6598857-6599143)
chr8 (477-756)||(6674310-6674596)
chr8 (481-648)||(18655400-18655567)
chr8 (298-756)||(30143227-30143686)
chr8 (477-756)||(3303667-3303953)
chr8 (879-1043)||(7412787-7412952)
chr8 (477-648)||(40221745-40221916)
chr8 (487-648)||(18141821-18141981)
chr8 (477-753)||(5689159-5689442)
chr8 (489-648)||(30291606-30291767)
chr8 (507-645)||(40328782-40328922)
chr8 (831-980)||(10688661-10688810)
chr8 (478-648)||(9765745-9765914)
chr8 (474-646)||(10930193-10930365)
chr8 (481-644)||(11383989-11384152)
chr8 (477-756)||(1345368-1345654)
chr8 (481-648)||(8965692-8965859)
chr8 (487-648)||(1292471-1292631)
chr8 (477-573)||(4743211-4743306)
chr8 (477-644)||(41366612-41366778)
chr8 (481-736)||(4162405-4162663)
chr8 (474-648)||(19491693-19491867)
chr8 (858-1043)||(35745793-35745979)
chr8 (519-645)||(44353796-44353923)
chr8 (985-1046)||(25689558-25689618)
chr8 (481-563)||(4733792-4733873)
chr8 (486-594)||(10015136-10015241)
chr8 (486-594)||(18106087-18106191)
chr8 (985-1030)||(10688630-10688675)
chr8 (577-756)||(10929686-10929871)
chr8 (481-589)||(3073875-3073981)
chr8 (985-1030)||(5701964-5702009)
chr8 (298-346)||(3303493-3303541)
chr8 (488-648)||(3772192-3772352)
chr8 (488-594)||(7597669-7597776)
chr8 (492-563)||(8153844-8153914)
chr8 (985-1035)||(4456575-4456625)
chr8 (576-643)||(1822297-1822365)
chr8 (576-643)||(1856742-1856810)
chr8 (298-346)||(4743050-4743098)
chr8 (298-346)||(5689565-5689613)
chr8 (562-736)||(41364927-41365110)
chr8 (298-346)||(41366440-41366488)
chr8 (298-346)||(43036720-43036768)
chr8 (781-820)||(3439330-3439369)
chr8 (966-1000)||(11383406-11383440)
chr8 (505-594)||(32902197-32902287)
chr8 (505-624)||(11712024-11712145)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (314-756)||(6266583-6267024)
chr2 (315-756)||(12647218-12647660)
chr2 (315-668)||(13655861-13656220)
chr2 (271-756)||(32289457-32289937)
chr2 (298-756)||(4484150-4484614)
chr2 (298-756)||(30833230-30833694)
chr2 (298-756)||(4502955-4503415)
chr2 (298-756)||(45099640-45100100)
chr2 (298-756)||(36205487-36205946)
chr2 (831-1030)||(9295874-9296074)
chr2 (298-756)||(5723078-5723537)
chr2 (831-1030)||(14291913-14292113)
chr2 (365-756)||(36987961-36988358)
chr2 (831-1030)||(11098399-11098599)
chr2 (851-1044)||(25410073-25410267)
chr2 (831-1044)||(12647755-12647968)
chr2 (477-756)||(2334414-2334700)
chr2 (851-1044)||(3492184-3492378)
chr2 (851-1043)||(30832921-30833114)
chr2 (849-1043)||(32289148-32289343)
chr2 (859-1043)||(6266274-6266459)
chr2 (849-1044)||(4484728-4484924)
chr2 (365-648)||(6594890-6595175)
chr2 (382-718)||(29867791-29868133)
chr2 (365-755)||(38312126-38312522)
chr2 (477-718)||(34139767-34140017)
chr2 (481-648)||(45726929-45727096)
chr2 (477-756)||(723741-724027)
chr2 (851-1043)||(40739264-40739457)
chr2 (477-756)||(14633822-14634109)
chr2 (501-756)||(42362237-42362500)
chr2 (863-1030)||(39811489-39811657)
chr2 (477-756)||(11151588-11151874)
chr2 (298-718)||(17057191-17057615)
chr2 (298-718)||(17085174-17085598)
chr2 (477-756)||(11690386-11690672)
chr2 (481-648)||(35446885-35447052)
chr2 (477-648)||(36773562-36773733)
chr2 (483-648)||(1631735-1631900)
chr2 (481-643)||(33648176-33648340)
chr2 (479-648)||(24398055-24398228)
chr2 (477-648)||(36318006-36318177)
chr2 (481-648)||(26353184-26353351)
chr2 (919-1047)||(32247229-32247356)
chr2 (965-1030)||(44310483-44310548)
chr2 (477-648)||(33162447-33162618)
chr2 (477-648)||(11067305-11067476)
chr2 (515-648)||(13121769-13121901)
chr2 (481-594)||(17490149-17490261)
chr2 (486-648)||(42288117-42288278)
chr2 (858-1043)||(19344824-19345010)
chr2 (531-648)||(7815323-7815441)
chr2 (858-1029)||(19349682-19349854)
chr2 (477-555)||(39284930-39285007)
chr2 (477-556)||(17450671-17450748)
chr2 (481-594)||(7451173-7451284)
chr2 (983-1044)||(28258668-28258729)
chr2 (492-590)||(28671989-28672088)
chr2 (985-1030)||(8389636-8389681)
chr2 (840-980)||(28258713-28258853)
chr2 (983-1030)||(36757430-36757477)
chr2 (985-1047)||(33528093-33528155)
chr2 (614-756)||(39284770-39284920)
chr2 (985-1030)||(10706738-10706783)
chr2 (985-1030)||(21630511-21630556)
chr2 (985-1030)||(39483443-39483488)
chr2 (298-346)||(723569-723617)
chr2 (519-644)||(14202450-14202569)
chr2 (989-1045)||(33118696-33118752)
chr2 (298-346)||(34139595-34139643)
chr2 (298-346)||(36987897-36987945)
chr2 (298-346)||(42362643-42362691)
chr2 (991-1030)||(20522794-20522833)
chr2 (298-344)||(11690787-11690833)
chr2 (900-933)||(7450869-7450902)
chr2 (985-1030)||(23077957-23078002)
chr2 (480-525)||(42064725-42064770)
chr2 (504-549)||(42412118-42412162)
[»] chr7 (120 HSPs)
chr7 (315-1044)||(32060154-32060889)
chr7 (315-756)||(20343789-20344231)
chr7 (315-756)||(18388592-18389034)
chr7 (315-756)||(18392028-18392470)
chr7 (315-756)||(6594390-6594832)
chr7 (271-756)||(43503947-43504431)
chr7 (315-756)||(6592172-6592614)
chr7 (415-756)||(24789733-24790075)
chr7 (362-756)||(39731261-39731656)
chr7 (831-1043)||(24789426-24789639)
chr7 (781-1043)||(20343500-20343762)
chr7 (298-756)||(48408687-48409153)
chr7 (298-756)||(25766779-25767237)
chr7 (369-752)||(35853804-35854194)
chr7 (315-571)||(1560497-1560757)
chr7 (578-756)||(1562103-1562278)
chr7 (296-756)||(29990940-29991401)
chr7 (831-1030)||(2058393-2058592)
chr7 (298-756)||(4178660-4179119)
chr7 (789-1030)||(21640167-21640411)
chr7 (298-756)||(23554925-23555387)
chr7 (831-1043)||(18392568-18392780)
chr7 (789-1030)||(20357040-20357284)
chr7 (831-1043)||(6592709-6592921)
chr7 (849-1043)||(21646448-21646643)
chr7 (849-1043)||(43504526-43504721)
chr7 (831-1044)||(6594925-6595138)
chr7 (365-718)||(25615785-25616137)
chr7 (849-1043)||(39730933-39731128)
chr7 (851-1043)||(18409206-18409399)
chr7 (851-1043)||(18414082-18414275)
chr7 (851-1044)||(48408397-48408591)
chr7 (831-999)||(1532947-1533116)
chr7 (477-648)||(34310712-34310884)
chr7 (848-1030)||(12406663-12406845)
chr7 (831-1047)||(1562375-1562591)
chr7 (477-756)||(14069830-14070116)
chr7 (477-756)||(14379858-14380144)
chr7 (382-736)||(19502083-19502443)
chr7 (477-756)||(30024729-30025015)
chr7 (858-1036)||(21811745-21811924)
chr7 (858-1030)||(24023831-24024004)
chr7 (863-1030)||(4873541-4873709)
chr7 (369-648)||(27347817-27348095)
chr7 (481-648)||(22269973-22270140)
chr7 (477-648)||(41317431-41317602)
chr7 (879-1046)||(25767381-25767543)
chr7 (831-944)||(18389132-18389246)
chr7 (298-756)||(48489316-48489777)
chr7 (365-756)||(18126529-18126928)
chr7 (481-648)||(8359316-8359485)
chr7 (477-756)||(41649008-41649292)
chr7 (299-420)||(24790230-24790349)
chr7 (477-756)||(38671219-38671505)
chr7 (483-648)||(29608737-29608902)
chr7 (501-750)||(48491470-48491727)
chr7 (485-648)||(6431971-6432134)
chr7 (298-756)||(43864129-43864590)
chr7 (477-718)||(31732966-31733215)
chr7 (489-718)||(47673953-47674189)
chr7 (481-648)||(3258995-3259162)
chr7 (365-756)||(4586046-4586443)
chr7 (477-648)||(8153342-8153513)
chr7 (481-594)||(32358055-32358167)
chr7 (477-756)||(47676133-47676419)
chr7 (481-648)||(48599335-48599502)
chr7 (477-756)||(1113542-1113828)
chr7 (879-1043)||(47264102-47264267)
chr7 (840-1043)||(2479757-2479960)
chr7 (474-630)||(2390301-2390456)
chr7 (481-648)||(4508707-4508874)
chr7 (863-1030)||(31109082-31109251)
chr7 (486-648)||(2360978-2361140)
chr7 (481-648)||(4253529-4253697)
chr7 (365-756)||(26417201-26417598)
chr7 (477-648)||(36146405-36146576)
chr7 (481-756)||(31105394-31105676)
chr7 (848-1030)||(12397311-12397480)
chr7 (969-1043)||(1532884-1532958)
chr7 (477-645)||(495980-496148)
chr7 (488-629)||(23565069-23565210)
chr7 (966-1045)||(44847617-44847696)
chr7 (478-623)||(2759195-2759339)
chr7 (646-756)||(24514934-24515043)
chr7 (481-648)||(4510549-4510716)
chr7 (481-648)||(4512391-4512558)
chr7 (858-1030)||(16880475-16880648)
chr7 (858-1030)||(16885330-16885503)
chr7 (486-643)||(22328395-22328556)
chr7 (858-1030)||(24265689-24265862)
chr7 (491-648)||(23343975-23344130)
chr7 (858-937)||(24260926-24261006)
chr7 (937-1043)||(21983761-21983867)
chr7 (474-594)||(6359946-6360065)
chr7 (477-648)||(12097864-12098027)
chr7 (900-1044)||(21989388-21989532)
chr7 (481-583)||(18396384-18396486)
chr7 (477-563)||(24525499-24525584)
chr7 (577-648)||(24525992-24526065)
chr7 (481-648)||(36574517-36574683)
chr7 (479-555)||(30814530-30814605)
chr7 (488-563)||(31518988-31519063)
chr7 (986-1043)||(18390506-18390562)
chr7 (968-1030)||(24260833-24260895)
chr7 (985-1030)||(79955-80000)
chr7 (539-648)||(31518795-31518905)
chr7 (298-346)||(47675959-47676007)
chr7 (298-344)||(1113952-1113998)
chr7 (781-828)||(2058322-2058371)
chr7 (966-1000)||(4509335-4509369)
chr7 (966-1000)||(4511177-4511211)
chr7 (966-1000)||(6431467-6431501)
chr7 (298-344)||(14069656-14069702)
chr7 (966-1000)||(14070348-14070382)
chr7 (298-344)||(14379684-14379730)
chr7 (966-1000)||(14380376-14380410)
chr7 (298-344)||(41648836-41648882)
chr7 (481-558)||(5513668-5513743)
chr7 (576-629)||(28617182-28617234)
chr7 (984-1029)||(49092237-49092282)
[»] chr4 (116 HSPs)
chr4 (315-1043)||(8395191-8395940)
chr4 (315-1043)||(8392982-8393731)
chr4 (270-756)||(31495098-31495593)
chr4 (315-756)||(7124794-7125238)
chr4 (315-756)||(7122575-7123019)
chr4 (315-756)||(5138183-5138627)
chr4 (315-756)||(5135957-5136402)
chr4 (2-272)||(44882187-44882458)
chr4 (298-756)||(13992113-13992569)
chr4 (298-756)||(56178458-56178919)
chr4 (387-756)||(29999719-30000088)
chr4 (853-1030)||(24742387-24742565)
chr4 (859-1043)||(31495717-31495902)
chr4 (851-1043)||(13992686-13992879)
chr4 (298-756)||(48142927-48143394)
chr4 (831-1035)||(7122274-7122479)
chr4 (365-756)||(52095248-52095645)
chr4 (831-1030)||(51520839-51521038)
chr4 (859-1035)||(7124496-7124673)
chr4 (365-756)||(5369968-5370369)
chr4 (851-1043)||(28467977-28468170)
chr4 (831-1030)||(56141523-56141723)
chr4 (848-1030)||(9223911-9224093)
chr4 (782-980)||(29760995-29761196)
chr4 (365-756)||(9927345-9927740)
chr4 (848-1030)||(9228698-9228880)
chr4 (831-1044)||(5135648-5135862)
chr4 (858-1030)||(5733061-5733235)
chr4 (831-1043)||(5137875-5138088)
chr4 (858-1047)||(3814421-3814609)
chr4 (474-644)||(2209717-2209889)
chr4 (858-1030)||(18856124-18856297)
chr4 (369-756)||(34570304-34570697)
chr4 (477-756)||(12739547-12739833)
chr4 (484-648)||(41964415-41964580)
chr4 (479-756)||(37740511-37740794)
chr4 (858-1030)||(45347329-45347502)
chr4 (477-756)||(5429564-5429850)
chr4 (477-753)||(47038408-47038689)
chr4 (848-1002)||(18712295-18712449)
chr4 (918-1044)||(31985126-31985252)
chr4 (477-648)||(36463386-36463557)
chr4 (477-756)||(5871705-5871991)
chr4 (477-756)||(26175633-26175919)
chr4 (474-648)||(26364236-26364410)
chr4 (477-646)||(46147388-46147557)
chr4 (481-648)||(46703500-46703669)
chr4 (365-756)||(52082549-52082940)
chr4 (481-648)||(12073392-12073560)
chr4 (477-629)||(12743922-12744073)
chr4 (477-629)||(12745311-12745462)
chr4 (481-648)||(40632445-40632612)
chr4 (481-648)||(41639426-41639593)
chr4 (477-648)||(48893635-48893810)
chr4 (474-648)||(54883020-54883194)
chr4 (479-648)||(36994524-36994693)
chr4 (481-645)||(379383-379548)
chr4 (481-630)||(6655975-6656123)
chr4 (479-752)||(54199906-54200185)
chr4 (481-648)||(8648139-8648306)
chr4 (501-648)||(8665408-8665556)
chr4 (477-648)||(45687179-45687351)
chr4 (481-648)||(6542180-6542349)
chr4 (1044-1120)||(44882117-44882193)
chr4 (477-648)||(27416962-27417133)
chr4 (481-594)||(50673848-50673960)
chr4 (481-648)||(37229722-37229890)
chr4 (474-644)||(50262694-50262865)
chr4 (477-665)||(52467351-52467546)
chr4 (474-646)||(12119540-12119714)
chr4 (519-756)||(12747794-12748039)
chr4 (481-648)||(4587958-4588126)
chr4 (481-641)||(5207843-5208003)
chr4 (481-648)||(31474150-31474318)
chr4 (489-648)||(35662441-35662600)
chr4 (927-1030)||(18860406-18860509)
chr4 (521-629)||(12744087-12744195)
chr4 (521-648)||(12745476-12745604)
chr4 (486-633)||(26699447-26699596)
chr4 (918-1044)||(5148177-5148303)
chr4 (382-563)||(29254580-29254758)
chr4 (481-703)||(51337000-51337231)
chr4 (858-979)||(45356861-45356983)
chr4 (477-574)||(13009441-13009536)
chr4 (985-1046)||(29761182-29761242)
chr4 (531-648)||(24969112-24969230)
chr4 (1059-1115)||(44864243-44864299)
chr4 (505-594)||(33989899-33989989)
chr4 (2-80)||(44838593-44838671)
chr4 (983-1043)||(5143807-5143867)
chr4 (982-1030)||(8689049-8689097)
chr4 (1063-1115)||(44849988-44850040)
chr4 (1-53)||(44864477-44864529)
chr4 (985-1030)||(16628358-16628403)
chr4 (985-1030)||(38151923-38151968)
chr4 (986-1030)||(3778116-3778160)
chr4 (477-665)||(3913424-3913618)
chr4 (646-685)||(35369614-35369653)
chr4 (481-643)||(44967829-44967992)
chr4 (984-1030)||(5268704-5268750)
chr4 (985-1030)||(6742901-6742946)
chr4 (985-1030)||(10047932-10047977)
chr4 (985-1026)||(16622783-16622824)
chr4 (576-644)||(48142473-48142542)
chr4 (646-756)||(13009604-13009714)
chr4 (298-346)||(26175459-26175507)
chr4 (298-346)||(29999651-29999699)
chr4 (507-594)||(33089933-33090021)
chr4 (298-346)||(48893465-48893513)
chr4 (298-346)||(52467180-52467228)
chr4 (560-648)||(41639263-41639353)
chr4 (576-634)||(1983252-1983309)
chr4 (501-646)||(21688250-21688397)
chr4 (985-1030)||(36314716-36314761)
chr4 (985-1030)||(36328925-36328970)
chr4 (985-1030)||(54867745-54867790)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (315-756)||(2436-2878)
scaffold0565 (831-1043)||(2973-3185)
[»] scaffold0674 (2 HSPs)
scaffold0674 (315-756)||(3558-4000)
scaffold0674 (831-1043)||(4098-4310)
[»] scaffold0137 (2 HSPs)
scaffold0137 (315-756)||(6167-6611)
scaffold0137 (831-1043)||(5859-6072)
[»] scaffold0491 (4 HSPs)
scaffold0491 (299-756)||(10982-11445)
scaffold0491 (299-756)||(8556-9019)
scaffold0491 (783-1043)||(9045-9308)
scaffold0491 (840-1047)||(11550-11757)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (296-756)||(434418-434882)
[»] scaffold1519 (2 HSPs)
scaffold1519 (296-756)||(802-1264)
scaffold1519 (851-1002)||(523-675)
[»] scaffold0286 (3 HSPs)
scaffold0286 (296-690)||(11508-11914)
scaffold0286 (781-1043)||(21939-22205)
scaffold0286 (698-756)||(22229-22286)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (783-1044)||(17430-17695)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (315-513)||(1-201)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (369-703)||(114539-114881)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (858-1030)||(3349-3522)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (858-1030)||(760-933)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (848-1030)||(34566-34748)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (365-648)||(20301-20583)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (918-1043)||(7911-8036)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (481-648)||(18004-18171)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (842-1043)||(132752-132953)
scaffold0006 (477-756)||(149094-149380)
scaffold0006 (985-1030)||(6252-6297)
scaffold0006 (985-1030)||(3060-3105)
[»] scaffold0466 (2 HSPs)
scaffold0466 (481-648)||(7327-7494)
scaffold0466 (966-1000)||(6750-6784)
[»] scaffold0510 (1 HSPs)
scaffold0510 (879-1043)||(1083-1248)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (481-624)||(10515-10656)
[»] scaffold1455 (1 HSPs)
scaffold1455 (967-1030)||(1721-1784)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (879-1036)||(43441-43599)
scaffold0087 (983-1045)||(36322-36384)
[»] scaffold0665 (2 HSPs)
scaffold0665 (848-980)||(8098-8230)
scaffold0665 (985-1030)||(8216-8261)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (858-1030)||(13796-13969)
scaffold0197 (857-1043)||(18663-18850)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (858-1030)||(176462-176635)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (849-1030)||(1751-1932)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (849-1030)||(148456-148637)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (983-1044)||(45744-45805)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (492-594)||(27453-27556)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (536-644)||(80338-80447)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 545; Significance: 0; HSPs: 152)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 292 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 54635482 - 54634710
Alignment:
Q  292 atcgagtcacaccaatactaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635482 atcgagtcacaccaatactaaataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacc 54635383  T
Q  391 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccca 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635382 tagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccca 54635283  T
Q  491 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaatta 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635282 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaatta 54635183  T
Q  591 gcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  54635182 gcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 54635083  T
Q  691 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                        ||||||||||    
T  54635082 tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaactccctcttcaaatctgc 54634983  T
Q  791 acaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcac--------------------gatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtcctta 870  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||                    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  54634982 acaagaacactttatactagccttcctctgttgcaatcgtgtcacgattttcccaatcgtgtcatgatttgcgtaccacccaagaaaagaccagtcctta 54634883  T
Q  871 tcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaat 969  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  54634882 tcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgattttgcaccctgcaacttagctcacggcaccccgaaat 54634783  T
Q  970 cgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54634782 cgtgtcacaatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 54634710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 316 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 6716834 - 6716084
Alignment:
Q  316 tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaac-aaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 414  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716834 tgatgtgtggagcaacggaaagcggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaaccaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 6716735  T
Q  415 agaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 513  Q
     ||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716734 tgaaactcaaaaatacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 6716635  T
Q  514 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaaca 613  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716634 ctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaaca 6716535  T
Q  614 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716534 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6716435  T
Q  714 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcct 813  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6716434 aaagaaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtctctctctcttccaaccctttcttcaaatctgcacaagaacactttatactagtct 6716335  T
Q  814 ccctctgaagcaatcacgtcacgattt--------------------gcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagt 893  Q
     ||||||  | ||||  ||||||||||                    |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716334 tcctctgttgaaatcgtgtcacgattttccaaatcgtgtcacgatccgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagt 6716235  T
Q  894 ttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtg 992  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6716234 ttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtg 6716135  T
Q  993 tcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6716134 tcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttcaagac-aatctcaacaa 6716084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 45283337 - 45282875
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatcta 398  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283337 cacaccaatacaaagaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatcta 45283238  T
Q  399 atctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45283237 atctaggaaactagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcactcagttcgg 45283139  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaa---gggatacaaaaggttacaagaaattagc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283138 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagc 45283039  T
Q  593 ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc 692  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45283038 ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgtttcccatgttttc 45282939  T
Q  693 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45282938 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgattccccaag 45282875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 25637766 - 25637321
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637766 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtgtattgtgcaagcaggaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 25637667  T
Q  414 gagaaacacaataca--caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 509  Q
    | |||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25637666 gtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacc 25637567  T
Q  510 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaa 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25637566 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcacta 25637467  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637466 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 25637369  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25637368 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagatac-ccctttgatttcccaag 25637321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3617786 - 3617342
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617786 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 3617687  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617686 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 3617588  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3617587 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 3617488  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617487 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 3617388  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3617387 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 3617342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 801463 - 800983
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||   |||||||||||||    
T  801463 tgttgtgaattccgatctcaaaacgtgtcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaataaa---gtgtgtgcaagca 801367  T
Q  371 ataatcaacaaaacac--cacctagatctaatctaggaaacaagtg-agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaa 467  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||     
T  801366 ataatcaacaaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtggaaaaacacaatacacaa------gataaaaggagagggaagaagaaaacaaag 801273  T
Q  468 gcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 567  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  801272 acaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagag 801174  T
Q  568 atacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatttt 664  Q
    ||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801173 atacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatttt 801075  T
Q  665 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  801074 ctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttcttcctttgatttcccaag 800983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 4600576 - 4601019
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | | |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4600576 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagccagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagt 4600675  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4600676 gtgaaaca-aatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 4600773  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4600774 actctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 4600873  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600874 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 4600971  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4600972 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 4601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 4598355 - 4598798
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4598355 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaataaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagt 4598454  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4598455 gtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 4598552  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4598553 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 4598652  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598653 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 4598750  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4598751 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 4598798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10211731 - 10211288
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  | | | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10211731 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagt 10211632  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10211631 gtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 10211534  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10211533 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 10211434  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10211433 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtact 10211336  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10211335 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 10211288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 299 - 685
Target Start/End: Original strand, 7779824 - 7780208
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaa-caccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7779824 cacaccaatacgaagtaagatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaacaaaaacagcacctagatct 7779920  T
Q  398 aatctaggaaacaagtgagaaa-cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| || ||    
T  7779921 aatctaggaaacaagtgaaaaaacacaatacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccactttgg 7780019  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttg 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7780020 tccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaattagatttg 7780119  T
Q  596 acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 685  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7780120 acaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10209511 - 10209068
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||  | | | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10209511 atgatgtgtggagtgacggagagtggtaaccaccaatcaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagt 10209412  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  | ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10209411 gtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacct 10209314  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10209313 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 10209214  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10209213 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtact 10209116  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10209115 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 10209068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10056555 - 10056112
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | | |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10056555 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagt 10056457  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10056456 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 10056358  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10056357 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 10056258  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10056257 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtact 10056160  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10056159 ctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10056112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10058777 - 10058334
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | | |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10058777 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagt 10058679  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10058678 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 10058580  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10058579 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 10058480  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10058479 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtact 10058382  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10058381 ctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10058334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10060999 - 10060556
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | | |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10060999 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagt 10060901  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10060900 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 10060802  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10060801 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 10060702  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10060701 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtact 10060604  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10060603 ctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10060556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10063221 - 10062778
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | | |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10063221 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagt 10063123  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10063122 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 10063024  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10063023 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 10062924  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10062923 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtact 10062826  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10062825 ctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10062778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10065443 - 10065000
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | | |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10065443 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagt 10065345  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10065344 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 10065246  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10065245 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 10065146  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10065145 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtact 10065048  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10065047 ctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 10065000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Original strand, 23199960 - 23200420
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatcta 398  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  23199960 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaacca-ataacaaa--gtgagtgcaagcaataatcaacaataaaacacctagatcta 23200056  T
Q  399 atctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggt 497  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23200057 atctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa--agattgttcacccagttcggt 23200154  T
Q  498 ccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttg 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23200155 ccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttg 23200253  T
Q  596 acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgt 688  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||    
T  23200254 acaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgt 23200352  T
Q  689 tt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23200353 ttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 23200420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 364 - 756
Target Start/End: Original strand, 23197823 - 23198221
Alignment:
Q  364 gcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag-tgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 462  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23197823 gcaagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaa 23197922  T
Q  463 caaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 562  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23197923 caaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaa 23198020  T
Q  563 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacac 653  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      ||||||||    
T  23198021 aa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacac 23198118  T
Q  654 tcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 752  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  23198119 tcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgattttc 23198217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 614 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718331
Alignment:
Q  614 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  714 aaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcct 813  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaagtctctctctcttccaaccctttcttcaaatctgcacaagaacactttatactagtct 6718519  T
Q  814 ccctctgaagcaatcacgtcacgattt--------------------gcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagt 893  Q
     ||||||  | ||||  ||||||||||                    |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718518 tcctctgttgaaatcgtgtcacgatttttcaaatcgtgtcacgatccgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagt 6718419  T
Q  894 ttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718418 ttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 6718331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Original strand, 5257964 - 5258427
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5257964 agtcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctaga 5258060  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||    
T  5258061 tctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcaccaagtt 5258156  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5258157 cggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagc 5258255  T
Q  593 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttc 682  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||     
T  5258256 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 5258354  T
Q  683 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5258355 caatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttctccctttgatttctcaag 5258427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 9635946 - 9636410
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9635946 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 9636042  T
Q  397 taatctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| | |||||| || || ||  ||||| |||||||||||||| ||| | |||   |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9636043 taatctaggaatcaaagtgaaaagcataaatcacaagcacaagataaaagg-gagagcagagagaaacaaacacacc-aagagattgttcacccagttcg 9636140  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-ct 593  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  9636141 gttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagttt 9636239  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctc-------accaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |     
T  9636240 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 9636338  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9636339 atatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttcttcctttgatttcccaag 9636410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Original strand, 5260143 - 5260606
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5260143 agtcaaaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca-ataacaaa--gtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctaga 5260239  T
Q  395 tctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    |||||| |||||| | |||||| || |||||  ||||| || || |||||||||||  |||||   |||||||  ||||||  |||||||||||| ||||    
T  5260240 tctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggaga--gaagagagaaacaaacacaccaa--agattgttcaccaagtt 5260335  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 592  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5260336 cggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagc 5260434  T
Q  593 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttc 682  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||     
T  5260435 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 5260533  T
Q  683 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5260534 caatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5260606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 8477790 - 8477990
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8477790 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctcaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 8477889  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8477890 gatttggcatccagcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacaatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 8477989  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  8477990 g 8477990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 557 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10067419 - 10067222
Alignment:
Q  557 ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 655  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10067419 ttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 10067320  T
Q  656 aatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaa 755  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10067319 aatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaa 10067223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 19683774 - 19684172
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa-acaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  19683774 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 19683871  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  19683872 acaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 19683968  T
Q  562 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  19683969 aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagac 19684067  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    | |||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    |||||||||    
T  19684068 attcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatt 19684165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 37408807 - 37408344
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |   ||   ||| |  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37408807 agtcacatcaatacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaa---gtgagcacaaacaataatcaacaataacagcacctaga 37408711  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagt 492  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || ||| | | ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  37408710 tctaatctaggaatcaaagtgaaaagcactaaatcacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagt 37408615  T
Q  493 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag 591  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37408614 tcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattag 37408516  T
Q  592 c-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttc 682  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||| |||||| |||   |||||||||     
T  37408515 ctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcactaaggtgttta 37408417  T
Q  683 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  37408416 caatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 37408344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 45095445 - 45095050
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 462  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||| | |  ||||||||  ||||| || |||||||||||||||   |||   |||    
T  45095445 caagcaataatcaacaataacagcacatagatctaatctatgaatcaaagagtaaaacacaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagag--aaa 45095348  T
Q  463 caaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 562  Q
    ||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  45095347 caaatacgccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 45095251  T
Q  563 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacac 653  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||    
T  45095250 aagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacac 45095152  T
Q  654 tcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 752  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  | ||||||||||    
T  45095151 tcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcttttgatttcc 45095054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 782 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 2671328 - 2671111
Alignment:
Q  782 caaatctgcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 879  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671328 caaatctgcacaagaacacaatatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 2671229  T
Q  880 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacg 978  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2671228 cttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcatcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcatgtcacg 2671129  T
Q  979 atgccaaaatcgtgtcac 996  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2671128 atgccaaaatcgtgtcac 2671111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 853 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 40372446 - 40372268
Alignment:
Q  853 aggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||    
T  40372446 aggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag 40372347  T
Q  952 ctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40372346 ctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 40372268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 300 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 7762610 - 7762151
Alignment:
Q  300 acaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatcta 398  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7762610 acaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagtaataatcaacaataacaacacctagatcta 7762514  T
Q  399 atctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    || |||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  || || |||  |||||||||||||||||    
T  7762513 atttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacatcataga--ttgttcacccagttcgg 7762418  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt- 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  7762417 tccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttc 7762319  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 686  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||| |||  |||||||||  | ||    
T  7762318 aacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttcacaat 7762220  T
Q  687 gttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  7762219 atttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 7762151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 7764747 - 7764353
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  7764747 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaa 7764650  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7764649 acaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 7764553  T
Q  562 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagaca 652  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||       |||||||    
T  7764552 aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc--tctcaccaatgaacaagaca 7764456  T
Q  653 ctcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttc 751  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |  |||||||||||    
T  7764455 ctcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-aatctaatcaaag-accctcaactctaaagttacctcctttgatttc 7764358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 831 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 25637225 - 25637012
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25637225 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 25637126  T
Q  930 gattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    || |||||| ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25637125 ga-tttgcacccctgcaaccctagctctc-gcacctcgaaatcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattta 25637028  T
Q  1028 aagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25637027 aagac-aatctcaacaa 25637012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 3617246 - 3617034
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3617246 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagccgttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgacac 3617147  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617146 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 3617049  T
Q  1028 aagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3617048 aagac-aatctcaaca 3617034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 7167670 - 7167870
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7167670 gtcacgatttgcgtctgacccaaggtatgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 7167769  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7167770 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaattgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaacacaaatttgaa 7167869  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  7167870 g 7167870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 859 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 800870 - 800685
Alignment:
Q  859 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 957  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  800870 gaccattccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccccgcaaaccagctcacg 800771  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  800770 gcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattcgaagacaaatctcaaca 800685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9581565 - 9581168
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||| || |||| ||||| ||||| ||||||  ||||   ||    
T  9581565 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaaaataaagggagag--aagagagaa 9581468  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9581467 acaaacacatcaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 9581371  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagaca 652  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       |||||||    
T  9581370 aaagggatacaaatgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagaca 9581272  T
Q  653 ctcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 750  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||    
T  9581271 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgattt 9581174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 831 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 45282778 - 45282628
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45282778 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 45282679  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282678 gaatttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 45282628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Original strand, 1306411 - 1306604
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  1306411 caaggtacgacctgtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgagaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 1306510  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1306511 agctcacgacaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccataaatttgaagccaaatctcaaca 1306604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 4598894 - 4599107
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  4598894 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgcca 4598993  T
Q  929 cgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4598994 cga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcgcgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 4599091  T
Q  1027 gaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||| ||||||||||    
T  4599092 gaagac-aatctcaaca 4599107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 4601115 - 4601328
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  4601115 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgcca 4601214  T
Q  929 cgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4601215 cga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcgcgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 4601312  T
Q  1027 gaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||| ||||||||||    
T  4601313 gaagac-aatctcaaca 4601328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 10058240 - 10058034
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10058240 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10058141  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10058140 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10058043  T
Q  1027 gaagacaaa 1035  Q
    |||||||||    
T  10058042 gaagacaaa 10058034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 10060462 - 10060256
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10060462 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10060363  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10060362 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10060265  T
Q  1027 gaagacaaa 1035  Q
    |||||||||    
T  10060264 gaagacaaa 10060256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 10062684 - 10062478
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10062684 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10062585  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10062584 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10062487  T
Q  1027 gaagacaaa 1035  Q
    |||||||||    
T  10062486 gaagacaaa 10062478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 10064906 - 10064700
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10064906 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10064807  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10064806 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10064709  T
Q  1027 gaagacaaa 1035  Q
    |||||||||    
T  10064708 gaagacaaa 10064700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 10056018 - 10055812
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10056018 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10055919  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10055918 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10055821  T
Q  1027 gaagacaaa 1035  Q
    |||||||||    
T  10055820 gaagacaaa 10055812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 10067128 - 10066922
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10067128 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 10067029  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10067028 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10066931  T
Q  1027 gaagacaaa 1035  Q
    |||||||||    
T  10066930 gaagacaaa 10066922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 22172847 - 22172674
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 956  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  22172847 tgaccagtccttatcagagatccttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 22172748  T
Q  957 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22172747 ggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 22172674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Original strand, 23198337 - 23198530
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttc-ccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  23198337 caaggtacgaccagtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctccaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 23198436  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23198437 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 23198530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Original strand, 23200536 - 23200729
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttc-ccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  23200536 caaggtacgaccagtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctccaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 23200635  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23200636 agctcacagcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 23200729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 781 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 10209042 - 10208778
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 879  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10209042 tcaaatctgcacaagaacacttaagtactagtcttcctctgttccaatcgtgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggata 10208943  T
Q  880 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtcacgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtc 975  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||    
T  10208942 tttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgccacgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtc 10208845  T
Q  976 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10208844 acgataccaaaatcgtgtcatgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 10208778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 28503530 - 28503331
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28503530 gtcacgatttgcgtctgacccaaggt-tgacaagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaattgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 28503432  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28503431 gatttggcgtccagcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaggccacaaatttgaa 28503332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 6718481 - 6718288
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    ||||||||  |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6718481 gtcacgatccgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacac 6718382  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718381 gattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgt-------------------gtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 6718301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 831 - 1026
Target Start/End: Complemental strand, 27352293 - 27352097
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27352293 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggtatgaccagtccttatcagtgataattaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 27352194  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    ||||| |    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  27352193 gatttggtgttctgcaaacaagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttttctgttcttcgagaccacaaattt 27352097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 28501363 - 28501164
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||| |||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  28501363 gtcatgatttgcgtctgacccaaggt-tgacaagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccac 28501265  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| |   ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28501264 gatttggtgtcctgcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaggccacaaatttgaa 28501165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 851 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 26928273 - 26928078
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  26928273 caaggtacgacctgtccttatcctgaaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 26928174  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26928173 agctcacggcataacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaacaat 26928078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 18656843 - 18657017
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagct-ca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| ||    
T  18656843 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaacttgcttca 18656942  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18656943 cggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaag 18657017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153644
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagggatacaaatg 39153455  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  39153456 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttca 39153554  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  39153555 ttcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 39153644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 34491383 - 34491212
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  34491383 agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 34491286  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34491285 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 10211191 - 10210978
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||  |||||||| ||    
T  10211191 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcatgattttcccaaaatcgtgcca 10211092  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10211091 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcct-aaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 10210994  T
Q  1027 gaagacaaatctcaaca 1043  Q
     ||||| ||||||||||    
T  10210993 aaagac-aatctcaaca 10210978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 917 - 1043
Target Start/End: Original strand, 7782586 - 7782712
Alignment:
Q  917 caaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaga 1016  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7782586 caaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcaccgcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttctaga 7782685  T
Q  1017 ccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7782686 ccacaaatttgaagccaaatctcaaca 7782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 879 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 33386302 - 33386137
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  33386302 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcac 33386203  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33386202 gatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcggaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 33386137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 761190 - 760732
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaa-caccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||      |||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  761190 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaa-aatcaaagtgaact--caagcaataa-caacaatagcagcacctagatc 761095  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| |||| || | ||| || |||| || ||||||||    ||| |||||   |||||||  |||||||||  ||||| ||||| |||    
T  761094 taatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaa----gagagaagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttaacccatttc 761001  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagct 593  Q
     |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  761000 agtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagct 760903  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcc 683  Q
    |  ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||      
T  760902 taaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttat 760804  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  760803 aatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 760732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Original strand, 49199462 - 49199638
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49199462 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 49199560  T
Q  574 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199561 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569952
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 4570022  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4570021 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 5236343 - 5236739
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||||||||||   ||| |||     
T  5236343 caagcaataatcaacaataagagctcctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa- 5236441  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||     
T  5236442 -caaacacaccaaaga--ttgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttac- 5236535  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  5236536 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 5236634  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||| ||||    
T  5236635 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctccttcgatt 5236732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10067642 - 10067435
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | | |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10067642 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagt 10067544  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10067543 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 10067445  T
Q  511 actctggagg 520  Q
    ||||||||||    
T  10067444 actctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 29196383 - 29196555
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  29196383 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 29196480  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196481 ggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734383
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 40734572  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  40734571 tgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 40734473  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  40734472 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgattttccaag 40734383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40735728 - 40735268
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40735728 tcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caaacaataatcaacaataacagcacctagatc 40735632  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    |||| |||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||| | |||||||||    
T  40735631 taatataggaaccaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaa-ggagagaagagaggaa--caaatacaccaaaga--ttgctgacccagttc 40735537  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  40735536 ggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaactggttacaataaattagct 40735439  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc-tctacaaggtgtttcc 683  Q
    |  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |    
T  40735438 tcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaaggtgtttac 40735340  T
Q  684 catgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  40735339 aatgtttcctaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 40735268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 32744433 - 32744709
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  32744433 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 32744530  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctaca 673  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| |||  ||    
T  32744531 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactcaatgattttcactcacca 32744627  T
Q  674 aggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  32744628 atgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 32744709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 826 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 8738740 - 8738585
Alignment:
Q  826 atcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgt 924  Q
    |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  8738740 atcatgtcacgatttgcgtccgttccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgt 8738641  T
Q  925 gtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    | |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  8738640 gccacgatttagcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcatgtcacgat 8738585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 826 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 9090978 - 9090823
Alignment:
Q  826 atcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgt 924  Q
    |||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  9090978 atcatgtcacgatttgcgtccgttccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgt 9090879  T
Q  925 gtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    | |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  9090878 gccacgatttagcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcatgtcacgat 9090823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Original strand, 43401794 - 43401970
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||    
T  43401794 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaaa 43401892  T
Q  574 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43401893 aatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 842 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 37408236 - 37408036
Alignment:
Q  842 cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccc 941  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||  |||||    
T  37408236 cgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccaacaagtttgaaaatcgtgtcacgatttacacaatcgtgccacgatttgacaccc 37408138  T
Q  942 tgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaa 1041  Q
    ||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37408137 tgcaaaccagctcacggcactacaaaatcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttctttgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatctcaa 37408038  T
Q  1042 ca 1043  Q
    ||    
T  37408037 ca 37408036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331470
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |    
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaatg 44331619  T
Q  577 g-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  44331618 gcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 44331520  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaa 715  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  44331519 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaa 44331470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 488 - 756
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835285
Alignment:
Q  488 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 586  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaa 22835107  T
Q  587 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaagg 676  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  22835108 attagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 22835206  T
Q  677 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    || || | ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  22835207 tgattacaatgtttcccaacacaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaag 22835285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 879 - 1044
Target Start/End: Original strand, 37726134 - 37726300
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| | ||||||| |  |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  37726134 acttaaccaacaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttgacaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcac 37726233  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37726234 gatatcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 37726300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 879 - 1043
Target Start/End: Original strand, 27453416 - 27453581
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  27453416 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacacaatcatgtcacgatttggcaccctacaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcac 27453515  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27453516 gatgccaaattcgtgtcacaatttctctgctctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 27453581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682244
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 29682433  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  29682432 ggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttca 29682334  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||    ||||||||||||||||    
T  29682333 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaatttaactcctttgatttcccaag 29682244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 474 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236129
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 30236202  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 644  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30236201 ataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 367 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 51399094 - 51398699
Alignment:
Q  367 agcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaac 463  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  |    
T  51399094 agcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--c 51398997  T
Q  464 aaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    |||  |||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  51398996 aaacacaccaaaga--ttgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aa 51398901  T
Q  564 agggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacac 653  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||    
T  51398900 agagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacac 51398802  T
Q  654 tcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttc 751  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||| | || |||  |||||||||| | ||||||||||||| || || ||||||| |||| |  |||||||||||    
T  51398801 tcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaatatttcccaacccaaga-aaactctaatcaaag-actctcaaccctaaagttacctcctttgatttc 51398704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Original strand, 43403737 - 43403913
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||    
T  43403737 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaaa 43403835  T
Q  574 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     |   |||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403836 catgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaac-aagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43403913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095767
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 6095697  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6095698 acaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaata 44700572  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44700573 ggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 31314616 - 31314447
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||      
T  31314616 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaa-agatacaaatg 31314519  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 646  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31314518 ggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819691
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 578  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 41819620  T
Q  579 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41819621 tacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 29811150 - 29810753
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  29811150 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagatgaa- 29811052  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  |||||||||  ||||| ||||| ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29811051 -caaacacaccaaaga--ttgttgacccaattcggtttaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 29810957  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc-------aagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||       |||||    
T  29810956 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacatattttcctaatctcaccaatgaataagac 29810858  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    | |||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  |||||||||    
T  29810857 attcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaaattacctcctttgatt 29810760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593704
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 54593774  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  54593773 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 858 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 2672604 - 2672416
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| || | |||     
T  2672604 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttggctcc 2672505  T
Q  956 cggcacc-ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
    ||||| | ||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  2672504 cggcatctccga--tcgtgtcacgattacaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaattccaacaat 2672416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16499200 - 16498915
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  16499200 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 16499103  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  16499102 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaa--aaacaaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 16499005  T
Q  667 ct-ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    || |  |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||   |||| |  ||||||||||||||||    
T  16499004 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaag 16498915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860474
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  ||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgggtt 46860544  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46860543 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 488 - 648
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  488 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 586  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaagaa 53921608  T
Q  587 attagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||| || ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  53921609 attagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813063
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||      
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatgcaaatg 29813137  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29813136 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaa 29813063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 488 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  488 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 586  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaa 32891167  T
Q  587 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 646  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32891166 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 2676760 - 2676581
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| || | |||     
T  2676760 tgaccagtccttatcagagattcttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttggctcc 2676661  T
Q  956 cggcacc-ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 1036  Q
    || || | ||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2676660 cgacatctccga--tcgtgtcacgattacaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaat 2676581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 851 - 980
Target Start/End: Original strand, 32143754 - 32143884
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32143754 caaggtacgacctgtccttatcttgaaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaact 32143853  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  32143854 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgat 32143884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 40913467 - 40913352
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||    
T  40913467 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaagagatacaa 40913370  T
Q  574 aag-gttacaagaaatta 590  Q
    | | ||||||||||||||    
T  40913369 atgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 490 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173377
Alignment:
Q  490 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaat 588  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  46173515 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaat 46173418  T
Q  589 tagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 629  Q
    ||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46173417 tagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 665
Target Start/End: Original strand, 9666463 - 9666659
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||| |    
T  9666463 agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagagg-tataaatg 9666560  T
Q  577 -gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 665  Q
     |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  9666561 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 9666659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 23391906 - 23392077
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||      
T  23391906 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgc-aaagtgatacaaatg 23392003  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23392004 ggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctactcattttcccaaactcaccaa 23392077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 985 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 45282642 - 45282583
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45282642 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaacaat 45282583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 481 - 588
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302079
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaataggtt 55302070  T
Q  580 acaagaaat 588  Q
    |||||||||    
T  55302071 acaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 8512642 - 8512815
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  8512642 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 8512741  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  8512742 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaag 8512815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 857 - 937
Target Start/End: Original strand, 32475885 - 32475966
Alignment:
Q  857 atgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 937  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32475885 atgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgc 32475966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 857 - 937
Target Start/End: Original strand, 32480743 - 32480824
Alignment:
Q  857 atgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 937  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32480743 atgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgc 32480824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 479 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 47304420 - 47304254
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaagg 577  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |  ||    
T  47304420 attgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-gaagagatacagatggg 47304323  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 645  Q
    |||||||| |||| |||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  47304322 ttacaagatattaacttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttctcaatctcac 47304254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 983 - 1043
Target Start/End: Original strand, 32143868 - 32143928
Alignment:
Q  983 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32143868 caaaatcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 32143928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 8517522 - 8517695
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  8517522 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 8517621  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| | | ||||| |||||||||    
T  8517622 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcctaaaccactaatttgaag 8517695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 879 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 27986103 - 27986001
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  27986103 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattccacacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcac 27986004  T
Q  978 gat 980  Q
    |||    
T  27986003 gat 27986001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 520 - 648
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352278
Alignment:
Q  520 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatgaacaaaccc 618  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaa-gaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  619 taatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  51352249 taacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 24968519 - 24968692
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  24968519 tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 24968618  T
Q  956 c-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | | | |||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  24968619 ctgcctccccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctttgttcttccaaaccactaatttgaag 24968692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 983 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 27974493 - 27974433
Alignment:
Q  983 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27974493 caaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatttcaaca 27974433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 576 - 681
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434086
Alignment:
Q  576 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 665  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5434070  T
Q  666 tctctacaaggtgttt 681  Q
     |||  ||||||||||    
T  5434071 actcaccaaggtgttt 5434086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 703
Target Start/End: Original strand, 23410326 - 23410561
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||      
T  23410326 agattgttgacccaattcgttccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 23410423  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||| |||||| ||| ||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||       ||||||||||||||||||||     
T  23410424 ggttatacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaa-cataatttctacccattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttca 23410522  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagaga 703  Q
    |||   |||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  23410523 ctcactcaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga 23410561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 983 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 27986017 - 27985957
Alignment:
Q  983 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27986017 caaaatcgtgtcacgatttctctgttattccaaaccacaaatttgaaatcaaatctcaaca 27985957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1030
Target Start/End: Original strand, 36029640 - 36029704
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36029640 aaatcgtgacacgttgataaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 36029704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1033
Target Start/End: Complemental strand, 40734132 - 40734084
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagaca 1033  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40734132 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagaca 40734084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 548
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  489 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatca 548  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 514 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018852
Alignment:
Q  514 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatga 610  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaaga 36018890  T
Q  611 acaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36018889 ac-aaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaa 36018852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 984 - 1043
Target Start/End: Original strand, 40845220 - 40845279
Alignment:
Q  984 aaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  40845220 aaaatcgtgtcacgatttctctgttctcccaaaacataaatttgaagacaaatctcaaca 40845279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 16264896 - 16264941
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16264896 aaatcgtgtcacgatttcgctgttcttccaaaccacaaatttgaag 16264941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 21711768 - 21711813
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21711768 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 21711813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 27027273 - 27027318
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27027273 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 27027318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 30709316 - 30709271
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30709316 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 30709271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 991 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 8738593 - 8738554
Alignment:
Q  991 tgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8738593 tgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 8738554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 991 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 9090831 - 9090792
Alignment:
Q  991 tgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9090831 tgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 9090792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 965 - 1044
Target Start/End: Original strand, 27038588 - 27038667
Alignment:
Q  965 gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  27038588 gaaatcgtgtcacgttgatgaaatcgtgtcacgatttctctgtttttccaaaccacaaacttgaagccaattttcaacaa 27038667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 781 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 45282848 - 45282809
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 820  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45282848 tcaaatctgcacaagaacactttatactagccttcctctg 45282809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 531 - 643
Target Start/End: Original strand, 4055813 - 4055926
Alignment:
Q  531 ctctccaatccactatcaaagagtt-cttacaaaagggatacaaaag--gttacaagaaattagcttg-acaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 626  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||||  ||||||||||    
T  4055813 ctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaa-gagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttct 4055909  T
Q  627 acccttttcccaatctc 643  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4055910 acccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 968 - 1030
Target Start/End: Original strand, 32475997 - 32476059
Alignment:
Q  968 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32475997 atcgtgtcacgatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaag 32476059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 968 - 1030
Target Start/End: Original strand, 32480855 - 32480917
Alignment:
Q  968 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32480855 atcgtgtcacgatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaag 32480917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37407037 - 37406987
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37407037 agtcacaccactacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 37406987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 39032075 - 39032017
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||    
T  39032075 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacaacaaatttgaagccaattttcaaca 39032017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 887 - 1033
Target Start/End: Complemental strand, 40735161 - 40735015
Alignment:
Q  887 agcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatcta-gctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgcca 984  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| | | |||||| ||     ||||||||| |||| ||       
T  40735161 agcaagtttgaaaatcgtgtcacgttttcccaaaatcgtgacacgattgagcaccctgcaaaccatgctcactgcttg--gaaatcgtgacacgttgatg 40735064  T
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagaca 1033  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40735063 aaatcgtgtcacgatttatctgttcatccaaaccacaaatttgaagaca 40735015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 549
Target Start/End: Original strand, 2075076 - 2075143
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 549  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2075076 tgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 22834829 - 22834877
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22834829 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 22834877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 577 - 636
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253423
Alignment:
Q  577 gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 636  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctaccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 29196212 - 29196260
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29196212 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 29196260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29811214 - 29811166
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  29811214 tcacaccaatacaaaatatgatttgtggagcaaaggaaagtagtaacca 29811166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 39153187 - 39153235
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39153187 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 39153235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40734843 - 40734795
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40734843 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 40734795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 531 - 590
Target Start/End: Original strand, 4075520 - 4075581
Alignment:
Q  531 ctctccaatccactatcaaagag-ttcttacaaaagggatacaaa--aggttacaagaaatta 590  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  4075520 ctctccaatccactatcaaagagtttcttac-aaagtgatacaaaagaggttacaagaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 407
Target Start/End: Original strand, 9634707 - 9634750
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa 407  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9634707 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa 9634750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 992 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 1730959 - 1730921
Alignment:
Q  992 gtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1730959 gtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 1730921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 706 - 756
Target Start/End: Original strand, 7782375 - 7782424
Alignment:
Q  706 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7782375 ctctaatcaaaga-ctctaaaacctagagttactccctttgatttcccaag 7782424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 849 - 895
Target Start/End: Original strand, 7782538 - 7782584
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt 895  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7782538 cccaaggcacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagttt 7782584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 22172898 - 22172864
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172898 atcgtgccacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 22172864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 628
Target Start/End: Original strand, 25517069 - 25517121
Alignment:
Q  575 aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 628  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25517069 aggttataagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaccctaatttctac 25517121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29682702 - 29682657
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaa 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29682702 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaa 29682657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 35926057 - 35926101
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35926057 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacc-caaatttgaag 35926101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 40592302 - 40592257
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  40592302 aaatcatgtcacgatttctccgttcttccaaaccacaaatttgaag 40592257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1026
Target Start/End: Original strand, 48438782 - 48438823
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  48438782 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttacaaaccacaaattt 48438823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 512; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 27648187 - 27647467
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27648187 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccgaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 27648088  T
Q  415 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactc 514  Q
    |||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27648087 agaaactcaatacacaa------gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactc 27647995  T
Q  515 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaa 614  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647994 tggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaa 27647895  T
Q  615 accctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatca 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647894 accctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacatggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatca 27647797  T
Q  715 aagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcctc 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27647796 aagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagtctctctctcttccaactctctcttcaaatctgcacaagaacactttatactagtctt 27647697  T
Q  815 cctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt 914  Q
    |||||   ||||||  |||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647696 cctctattgcaatcgtgtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtcaatatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt 27647597  T
Q  915 ccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttcc 1013  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647596 ctcacaatcgtgccacgattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttccctgttcttcc 27647497  T
Q  1014 agaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27647496 agaccacaaatttgaagacaaaactcaaca 27647467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16555220 - 16554762
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16555220 cacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatct 16555123  T
Q  398 aatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16555122 aatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcg 16555023  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 594  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555022 gtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 16554923  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16554922 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaa 16554823  T
Q  695 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16554822 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgattccccaag 16554762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16631776 - 16631318
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16631776 cacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatct 16631679  T
Q  398 aatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16631678 aatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcg 16631579  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 594  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631578 gtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 16631479  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16631478 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaa 16631379  T
Q  695 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16631378 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgattccccaag 16631318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 16653463 - 16653012
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16653463 cacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatct 16653366  T
Q  398 aatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16653365 aatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcg 16653266  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653265 gtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 16653166  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaa 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16653165 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaa 16653066  T
Q  695 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16653065 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgatt 16653012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Original strand, 16578335 - 16578793
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16578335 cacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatct 16578432  T
Q  398 aatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16578433 aatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcg 16578532  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578533 gtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 16578632  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaa 694  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16578633 gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaa 16578732  T
Q  695 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16578733 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgattccccaag 16578793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16617045 - 16616587
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16617045 cacaccaatactaaataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaaacaacaaaacaccacctagatct 16616948  T
Q  398 aatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16616947 aatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcg 16616848  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616847 gtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 16616748  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaa 694  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16616747 gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcccatgttttcaa 16616648  T
Q  695 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  16616647 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgattccccaag 16616587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 25421642 - 25421198
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25421642 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 25421543  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421542 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 25421444  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25421443 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 25421344  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421343 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 25421244  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25421243 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 25421198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 269 - 756
Target Start/End: Original strand, 3072550 - 3073036
Alignment:
Q  269 aatgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaag 368  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||    
T  3072550 aatgttgtgaattccgatctcaaatcgtgtcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caag 3072646  T
Q  369 caataatcaacaaaac-accacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaa 467  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  3072647 caataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaag 3072746  T
Q  468 gcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 567  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3072747 acaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagag 3072845  T
Q  568 atacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatttt 664  Q
    ||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3072846 atacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgatttt 3072944  T
Q  665 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3072945 ctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 3073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6027582 - 6027141
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6027582 atgatgtgtggagcgacggagaggggtaaccacctaacaaggtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 6027483  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6027482 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaatg-gagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacata 6027385  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6027384 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 6027285  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027284 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 6027187  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6027186 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 6027141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 34167416 - 34166973
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   | | | |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34167416 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaaaaatattgagcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatcaaatctaggaaccaagt 34167317  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167316 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 34167218  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaat 608  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34167217 ctctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactat 34167118  T
Q  609 gaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 708  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34167117 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactc 34167020  T
Q  709 taatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34167019 taatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 34166973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 33341935 - 33342380
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33341935 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 33342034  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 509  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33342035 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacc 33342133  T
Q  510 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcaca 606  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  33342134 tactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcact 33342233  T
Q  607 atgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 706  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342234 atgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 33342331  T
Q  707 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33342332 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 33342380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 412434 - 411994
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatcta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||                   |||| ||||||||||||    
T  412434 cacaccaataccaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgtgc------------------aacagcacctagatcta 412353  T
Q  399 atctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtc 498  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412352 atctaggtaacaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtc 412253  T
Q  499 caaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttg 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||  |||    
T  412252 caaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttg 412153  T
Q  596 acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaac 695  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  412152 ataagttcacaatgaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgttttcaac 412054  T
Q  696 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  412053 ccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttctcaag 411994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 34165194 - 34164751
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | | | |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34165194 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagt 34165096  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34165095 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 34164997  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaa 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34164996 actctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcacta 34164897  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34164896 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtact 34164799  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34164798 ctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc-ccctttgatttcccaag 34164751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 6097286 - 6097717
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6097286 atgatgtgtggagcaacggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagctataatcaacaaaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaagt 6097382  T
Q  414 g-agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 512  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097383 ggaaaaacacaatacacaatcacaagatacaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 6097482  T
Q  513 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaa 611  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  6097483 tctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaa 6097572  T
Q  612 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactcta 710  Q
    | || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  6097573 c-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagatactcta 6097671  T
Q  711 atcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6097672 atcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 6097717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Original strand, 2171347 - 2171814
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2171347 agtcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaacaataacagcacctaga 2171443  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaa---cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccca 490  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||   || || |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2171444 tctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagataaacaaatacaccaa-gagattgttcaccca 2171541  T
Q  491 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaatta 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2171542 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaagggttacaagaaatta 2171640  T
Q  591 gc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgttt 681  Q
    || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2171641 gctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttt 2171739  T
Q  682 cccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2171740 acaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 2171814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 315 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 13154251 - 13153886
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | | | |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13154251 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagt 13154152  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154151 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgaccta 13154053  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaat 608  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13154052 ctctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactat 13153953  T
Q  609 gaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggt 677  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13153952 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggt 13153886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 831 - 1044
Target Start/End: Original strand, 16578889 - 16579102
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16578889 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 16578988  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578989 gattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 16579088  T
Q  1030 gacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||| |||||||||||    
T  16579089 gac-aatctcaacaa 16579102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 831 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 16616491 - 16616278
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16616491 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 16616392  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616391 gattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 16616292  T
Q  1030 gacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||| |||||||||||    
T  16616291 gac-aatctcaacaa 16616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 31404561 - 31404957
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaa-cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaa 462  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    |||| |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||    
T  31404561 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaa 31404658  T
Q  463 caaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaa 562  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31404659 caaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-a 31404755  T
Q  563 aagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacac 653  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||    
T  31404756 aagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacac 31404854  T
Q  654 tcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 752  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  31404855 tcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcc 31404953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 30834356 - 30834819
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30834356 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaaatagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 30834452  T
Q  397 taatctaggaaac-aagtg--agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    ||||||| ||| | |||||  | ||||||||  ||||| || || |||||||||||  |||||   |||||||  ||||||  ||||| |||||||||||    
T  30834453 taatctatgaatcaaagtgaaaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggaga--gaagagataaacaaacacaccaa--agattattcacccagtt 30834548  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30834549 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagc 30834647  T
Q  593 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttc 682  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  | ||||||||     
T  30834648 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccgaggtgttta 30834746  T
Q  683 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  30834747 caatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaaccctaaagttgcttcctttgatttctcaag 30834819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Original strand, 5413215 - 5413675
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  ||||||| |    ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5413215 agtcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgagca--caagcaataatcaacaataacaacacctaga 5413311  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||    
T  5413312 tctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacc-agtt 5413406  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5413407 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagc 5413505  T
Q  593 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
     ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| |     
T  5413506 tttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaatgtgtttaca 5413604  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5413605 atgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5413675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Original strand, 16452127 - 16452612
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||     |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||  || |||||||  |   ||||||    
T  16452127 tgttgtgaattccgatctcaaaa----tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaata--caagca 16452219  T
Q  371 ataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaag-ataaaaggagagggaagaagaaaacaaaa 467  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || ||  ||||||||||||  ||||   |||||||     
T  16452220 ataatcaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaac 16452317  T
Q  468 gcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 567  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  16452318 acaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagag 16452414  T
Q  568 ata-caaaaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactca 656  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||    
T  16452415 atatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 16452513  T
Q  657 atgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaa 755  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  16452514 atgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaactctaaagttgcttactttgatttcccaa 16452611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 16554666 - 16554454
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16554666 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 16554567  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554566 aattttgcaccctgtaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcatgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 16554467  T
Q  1030 gacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| ||||||||||    
T  16554466 gac-aatctcaaca 16554454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 16631222 - 16631010
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16631222 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 16631123  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631122 aattttgcaccctgtaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcatgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 16631023  T
Q  1030 gacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| ||||||||||    
T  16631022 gac-aatctcaaca 16631010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 387 - 756
Target Start/End: Original strand, 5406109 - 5406481
Alignment:
Q  387 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 485  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||    
T  5406109 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttc 5406204  T
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaag 584  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  5406205 acccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaag 5406303  T
Q  585 aaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaagg 676  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  5406304 aaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 5406402  T
Q  677 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5406403 tgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5406481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 387 - 756
Target Start/End: Original strand, 5410434 - 5410806
Alignment:
Q  387 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 485  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||    
T  5410434 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttc 5410529  T
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaag 584  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  5410530 acccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaag 5410628  T
Q  585 aaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaagg 676  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  5410629 aaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 5410727  T
Q  677 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5410728 tgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5410806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 849 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 411881 - 411683
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  411881 cccaaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcag 411782  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  411781 actagctcacggcaccacgaaattgtgtcacaatgccaaattcgtgtcacgatttccctattcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 411683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 831 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 5674442 - 5674227
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5674442 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggtatgaccagtccttatcacggatacttaacgagcaagtttcaaaatcgtgtcacgatttcccaagattgtgtcac 5674343  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5674342 gatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcatgtcacgatgccaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 5674243  T
Q  1030 gacaaatctcaacaat 1045  Q
    | ||| | ||||||||    
T  5674242 gccaactatcaacaat 5674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 824 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 25421016 - 25420797
Alignment:
Q  824 caatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatc 922  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25421016 caatcatgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatc 25420917  T
Q  923 gtgtcacgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccac 1020  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25420916 gtgccacga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcacggtcccaaaattgtgtcacgatttccctgttcttccagaccac 25420819  T
Q  1021 aaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  25420818 aaatttgaagac-aatctcaaca 25420797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Original strand, 3073148 - 3073343
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |      
T  3073148 cccaaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttccaacaatcgtgtcacgatttggcaccctgtaga 3073247  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3073248 ccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgattttcctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 3073343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 781 - 1043
Target Start/End: Original strand, 2171838 - 2172104
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaagga 877  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  ||||||||| |  |||||  | ||||||| |||| |||||||||  |||    
T  2171838 tcaaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtacgacctgtccttatcttgga 2171937  T
Q  878 tacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 976  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  2171938 aacttaacgagcaagttttacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtca 2172037  T
Q  977 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2172038 cgatgccaaattcatgtcccgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaaaccaaatctcaaca 2172104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 831 - 1045
Target Start/End: Original strand, 6136335 - 6136549
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6136335 gtcacgatttgcttccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 6136434  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    ||||||   |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6136435 gattttcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtctcgattccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttga 6136533  T
Q  1029 agacaaatctcaacaat 1045  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6136534 agac-aatctcaacaat 6136549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Original strand, 22709452 - 22709645
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  22709452 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 22709551  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22709552 agctcatggcatcacaaaatcgtgtcacgttgccaaattcgtgtcatgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 22709645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 34166879 - 34166673
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  34166879 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 34166780  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34166779 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 34166682  T
Q  1027 gaagacaaa 1035  Q
    |||||||||    
T  34166681 gaagacaaa 34166673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 876 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 30125185 - 30125030
Alignment:
Q  876 gatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgt 974  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30125185 gatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgt 30125086  T
Q  975 cacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30125085 cacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 30125030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 13151062 - 13150856
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  13151062 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtca 13150963  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13150962 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaattt 13150865  T
Q  1027 gaagacaaa 1035  Q
    |||||||||    
T  13150864 gaagacaaa 13150856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 33342475 - 33342688
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  33342475 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgatttcccagaaatcgtgcca 33342574  T
Q  929 cgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33342575 cga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgcgtcgcgatcccaaaatcgtgtcacgatttccatgttcttccaaaccacaaattt 33342672  T
Q  1027 gaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||| ||||||||||    
T  33342673 gaagac-aatctcaaca 33342688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 831 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 34164657 - 34164440
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt--cccaaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  34164657 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgaca 34164558  T
Q  929 cgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    ||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34164557 cga-tttgcacccctgcaaccctaactcacggca-tccgaaatcgcgtcacgatcccagaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaattt 34164460  T
Q  1027 gaagacaaatctcaacaataa 1047  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  34164459 gaagacaaa-ctcaacaataa 34164440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 6027046 - 6026834
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6027046 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccggtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 6026947  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||| || |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6026946 gattt-gcacccctgcaaccctagctctcg-cacctcgaaatcgtgtcacaatgccgcaatcgtgtcacgatttccctattcttccaaaccacaaatttg 6026849  T
Q  1028 aagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6026848 aagac-aatctcaaca 6026834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Original strand, 11857373 - 11857555
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  11857373 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgttacttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 11857471  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11857472 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 11857555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 296 - 577
Target Start/End: Original strand, 5408890 - 5409164
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  ||||||| |    ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5408890 agtcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgagca--caagcaataatcaacaataacaacacctaga 5408986  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    ||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||    
T  5408987 tctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacc-agtt 5409081  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  5409082 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagg 5409164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 831 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 16652909 - 16652759
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||    
T  16652909 gtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgattgtgtcacgattttcccaaatcgttccac 16652810  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652809 gactttgcaccctacaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 16652759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 382 - 756
Target Start/End: Original strand, 33160254 - 33160636
Alignment:
Q  382 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 479  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||| || ||||| | ||||| || ||||||||| | ||| |||||   |||||||  ||||||  |||    
T  33160254 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaaaag-gagagaagagagaaacaaacacaccaa--aga 33160350  T
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 578  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  33160351 ttgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagt 33160449  T
Q  579 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcacc-------aagacactcaatga-ttttctc 667  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||| |    
T  33160450 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcac 33160548  T
Q  668 tctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| |||| |  ||||||||| ||||||    
T  33160549 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-actctcaaccctaaagttacctcctttgattccccaag 33160636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 917 - 1045
Target Start/End: Original strand, 6097860 - 6097988
Alignment:
Q  917 caaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaga 1016  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  6097860 caaatcgtgtcacgatttagcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcaggatttccctgttcttccaaa 6097959  T
Q  1017 ccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097960 ccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 6097988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 14742120 - 14741938
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  14742120 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 14742022  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14742021 actagctcacgaccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 14741938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 22010383 - 22010201
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  22010383 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 22010285  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     ||| || |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22010284 actaacttacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 22010201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 803 - 980
Target Start/End: Original strand, 5266432 - 5266610
Alignment:
Q  803 tatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatc 902  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  5266432 tatactagtcttcctctgaagcaatcgtgtcacgatttgcgtccgtttcaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaatgagcaagtttctgaatc 5266531  T
Q  903 gtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5266532 gtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgat 5266610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 9182917 - 9183314
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| | |     
T  9182917 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggga- 9183015  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9183016 -caaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 9183110  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||    
T  9183111 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagac 9183209  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  9183210 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaggaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatt 9183307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588931
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21589001  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589000 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593664
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21593734  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593733 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Original strand, 3808701 - 3808877
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  3808701 aagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 3808799  T
Q  574 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3808800 aatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16569193 - 16568928
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||            ||||    
T  16569193 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac------------aaag 16569107  T
Q  577 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcta--c 672  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||| || ||  |    
T  16569106 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaatgattttcact-taccc 16569011  T
Q  673 aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||  | ||||||||||||||||    
T  16569010 aaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaatttaattcctttgatttcccaag 16568928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 481 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758026
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 17758093  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 645  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17758092 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973107
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 2973037  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2973038 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 6438898 - 6439071
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||| || | ||||    
T  6438898 tgaccagtccttatcagtgatacttaactagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattatgcatccagcaaacttggctca 6438997  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6438998 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctatgttcttccagaccataaatttgaag 6439071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762990
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagtt 17763060  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17763059 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 918 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 26253714 - 26253589
Alignment:
Q  918 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 1017  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| | | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26253714 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgctaactatctcacggtatcacaaaatcttgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagac 26253615  T
Q  1018 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26253614 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 26253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 736
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137671
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 28137506  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc- 669  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  28137507 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactca 28137605  T
Q  670 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 736  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  28137606 cccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 28137671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 824 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 25421110 - 25421000
Alignment:
Q  824 caatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcg 923  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  25421110 caatcatgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaatca 25421011  T
Q  924 tgtcacgattt 934  Q
    |||||||||||    
T  25421010 tgtcacgattt 25421000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 481 - 646
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830289
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 579  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggatt 26830221  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 646  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26830222 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954568
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |    
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacagatg 26954380  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 667  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  26954381 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcac 26954479  T
Q  668 tctac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||  | ||||||||| | ||||||  ||||| |||| | ||||||||||||| || || ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26954480 tccccaaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagata-actctaatcaaag-actctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 26954568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043630
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 5043697  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 645  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  5043696 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctactcattttctcaatctcac 5043630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22424995
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa---gg 577  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatggg 22424923  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22424924 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211353
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||| |    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 33211279  T
Q  577 -gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
     | |||||||||||| ||| | |||| |||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33211280 agctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaac-aaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaa 33211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 879 - 1043
Target Start/End: Original strand, 23896792 - 23896957
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  |||||||||| | | ||||||  |   | ||||||||||||    
T  23896792 acttaaccagcaagtttaaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgatttgacaccctgcaaaccaactcacgatattacaaaatcgtgtcac 23896891  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23896892 gatgccaaaatcgtgtcacgatttttctgttctttcaaaccacaaatttgaaggcaaatttcaaca 23896957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 504 - 648
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  504 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 601  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||     
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagc 3039024  T
Q  602 tcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3039025 tcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 474 - 614
Target Start/End: Original strand, 603082 - 603222
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  603082 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaa 603179  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaa 614  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  603180 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Original strand, 16839137 - 16839331
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||||     
T  16839137 cccaaggt-tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaa 16839235  T
Q  948 c-tagctcacggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | | |||||||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  16839236 cttggctcacggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 16839331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 395
Target Start/End: Original strand, 6136135 - 6136216
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-gtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagat 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6136135 atgatgtgtggagcaacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 28155256 - 28155167
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28155256 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaa 28155167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 33330118 - 33329932
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  33330118 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 33330019  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33330018 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 33329932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 963 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 34151907 - 34151824
Alignment:
Q  963 ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 1047  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34151907 ccgaaatcgcgtcacgatcccagaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaatttgaagacaaa-ctcaacaataa 34151824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 848 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 14737260 - 14737128
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  14737260 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 14737162  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
     ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  14737161 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgat 14737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 858 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 33335615 - 33335429
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  33335615 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 33335516  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| |  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33335515 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgaaacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 33335429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 481 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 578  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaattagt 26800658  T
Q  579 tacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||||||||||||    
T  26800657 tacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 858 - 1044
Target Start/End: Original strand, 6005821 - 6006008
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  6005821 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 6005920  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
     |||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  6005921 tggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgtttttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacaa 6006008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 858 - 937
Target Start/End: Original strand, 5343879 - 5343959
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 937  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5343879 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgc 5343959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 531 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  531 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 628  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctac 4045443  T
Q  629 ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  4045442 cattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 985 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 16652773 - 16652716
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16652773 aaatcgtgtcacgatttccctgttctttcagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 16652716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 581 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567091
Alignment:
Q  581 caagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctc-tacaaggt 677  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctca---agacactcaatgattttcactcacccaaggt 16567169  T
Q  678 gtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  16567168 gtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 16567091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 879 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 5757116 - 5756950
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  |||||||||| | | |||||| ||   | |||| |||||||    
T  5757116 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgatttgacaccctgcaaaccaactcacgacattacaaaattgtgtcac 5757017  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | |||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  5757016 gatgccacaatcgtgtcacaatttctctattcttttaaaccataaatttaaagccaaatttcaacaa 5756950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 5266596 - 5266641
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5266596 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 5266641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 14737142 - 14737097
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14737142 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 14737097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 968 - 1030
Target Start/End: Original strand, 5343990 - 5344052
Alignment:
Q  968 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5343990 atcgtgtcacgatgaccaaatcgtgacacgatttctctgttctcccaaaccacaaatttgaag 5344052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 781 - 895
Target Start/End: Original strand, 6097741 - 6097858
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaagga 877  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||   ||||  |||||||||  |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  6097741 tcaaatctgcacaagaacacttaaatactagtcttcccctgataaaatcgtgtcacgattggtgcgtacgtccccaggtacgaccagtccttatcatgga 6097840  T
Q  878 tacttaacgagcaagttt 895  Q
     |||||||||||||||||    
T  6097841 aacttaacgagcaagttt 6097858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 987 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 28155145 - 28155102
Alignment:
Q  987 atcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28155145 atcgtgtcacgattgctctgttcttccagaccacaaatttgaag 28155102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 5017026 - 5016981
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5017026 aaatcgtgtcacgatttttctgttcttccaaaccacaaatttgaag 5016981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 31086003 - 31085958
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  31086003 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttctaaaccacaaatttgaag 31085958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 900 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 16554691 - 16554659
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554691 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16554659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 900 - 932
Target Start/End: Original strand, 16578864 - 16578896
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578864 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16578896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 900 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 16616516 - 16616484
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616516 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16616484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 900 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 16631247 - 16631215
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631247 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16631215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 900 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 16652934 - 16652902
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652934 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 16652902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 5571806 - 5571755
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 1036  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  5571806 aaatcgtgtcacgatttctctattctcccaaaacacaaatttgaagacaaat 5571755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 781 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 16554736 - 16554697
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 820  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16554736 tcaaatctgcacaagaacaatttatactagccttcctctg 16554697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 781 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 16631292 - 16631253
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 820  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16631292 tcaaatctgcacaagaacaatttatactagccttcctctg 16631253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 781 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 16652979 - 16652940
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 820  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16652979 tcaaatctgcacaagaacaatttatactagccttcctctg 16652940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Original strand, 11857331 - 11857365
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857331 atcgtgccacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 11857365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13159107 - 13159066
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaag 356  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  13159107 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaag 13159066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 105)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 9036751 - 9036003
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 414  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036751 atgatgtgtggagctaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtttgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtg 9036652  T
Q  415 agaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 512  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036651 tgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 9036553  T
Q  513 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaac 612  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036552 tctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaac 9036453  T
Q  613 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036452 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 9036353  T
Q  713 caaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatactagcc 812  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9036352 caaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgatttcccaagtctctctctctttcaaactcctcttcaaatctgcacaagaacactttatactagtc 9036254  T
Q  813 tccctctgaagcaatcacgtcacgatt--------------------tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaag 892  Q
    | ||||||  | ||||  |||||||||                    ||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036253 ttcctctgttgaaatcgtgtcacgattttcccaatcgtgtcacgatctgcgtaacacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaag 9036154  T
Q  893 tttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgt 991  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9036153 tttcacgatcgtgtcacgatttaacaaaatagtgacacgaatttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgt 9036054  T
Q  992 gtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9036053 gtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 9036003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40282727 - 40282269
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaa-caaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282727 cacaccaatgcaaactatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 40282628  T
Q  398 aatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggt 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40282627 aatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggt 40282529  T
Q  498 ccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-ga 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  40282528 ccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattaga 40282429  T
Q  597 caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacc 696  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282428 caagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacc 40282329  T
Q  697 caagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40282328 caagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 40282269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 21054335 - 21053850
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatacta--aatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaag 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  21054335 tgttgtgaattccgatctcaaatcgaaccacaccaatacaagaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaactaagtgtgtg--caag 21054238  T
Q  369 caataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21054237 caataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaata 21054138  T
Q  469 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 568  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054137 caccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 21054039  T
Q  569 tacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctc 667  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21054038 tacaaaaggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttc 21053939  T
Q  668 tctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21053938 tctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 21053850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9987579 - 9987094
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaa--tatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaag 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  9987579 tgttgtgaattccgatctcaaatcgaaccacaccaatacgaaaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaatcaaagtgtgtg--caag 9987482  T
Q  369 caataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987481 caataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 9987382  T
Q  469 -caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 567  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9987381 acaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaaggg 9987283  T
Q  568 atacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987282 atacaaaaggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 9987184  T
Q  667 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9987183 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 9987094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 314 - 756
Target Start/End: Original strand, 20622071 - 20622514
Alignment:
Q  314 tatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622071 tatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 20622170  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622171 gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacacc-aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 20622269  T
Q  514 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttac--aaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatga 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20622270 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatga 20622369  T
Q  611 acaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 710  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622370 ac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 20622468  T
Q  711 atcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20622469 atcaaagaaccctaaaccctagagttgctccatttgatttcccaag 20622514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 44203968 - 44203526
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203968 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 44203869  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203868 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 44203770  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44203769 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 44203670  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203669 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 44203572  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44203571 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 44203526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 51765744 - 51765280
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||   ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51765744 cacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaattaa---gtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatct 51765648  T
Q  398 aatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  51765647 aatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcgg 51765550  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  51765549 tccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctt 51765450  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 685  Q
    |||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| | |    
T  51765449 tgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaa 51765350  T
Q  686 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51765349 tgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 51765280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 833 - 1043
Target Start/End: Original strand, 20622610 - 20622821
Alignment:
Q  833 cacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacga 931  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20622610 cacgatttgcgtaccacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacga 20622709  T
Q  932 ttttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaaga 1031  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622710 tttggcaccctgcagactagctcacggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaaga 20622809  T
Q  1032 caaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||    
T  20622810 caaatctcaaca 20622821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 298 - 649
Target Start/End: Original strand, 13316174 - 13316521
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13316174 tcacaccaatacgaaatataatgtgtggagcaaaggaaagtagtaatcaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 13316270  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13316271 taatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaactcactaaaga--ttgttcacccagttcg 13316366  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13316367 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 13316465  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaag 649  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13316466 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 8550606 - 8551070
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8550606 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacaacacctagatc 8550702  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaaga-agaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||  |||| | |||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  8550703 taatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaag-aagagagaaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagtt 8550799  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8550800 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattagc 8550898  T
Q  593 tt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttc 682  Q
    ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   ||| ||||||     
T  8550899 ttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgttta 8550997  T
Q  683 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  8550998 caatgtttcttaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 8551070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 40282154 - 40281958
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40282154 cccaaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttaccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaa 40282055  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282054 cctagctcacggcaccactaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctattcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 40281958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 20763014 - 20762557
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |  |||||||  |   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20763014 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtattaaccaatat-caaagtgaatt--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 20762918  T
Q  397 taatctaggaaacaagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    |||||||||||    |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  20762917 taatctaggaa----gtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttggtcacctagttcg 20762826  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20762825 gtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-gaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 20762727  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |     
T  20762726 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 20762628  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  20762627 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 20762557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 21053733 - 21053540
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc 948  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  21053733 caaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccttgcattc 21053634  T
Q  949 tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21053633 tagctcactgcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 21053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 9986980 - 9986785
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||      
T  9986980 cccaaggtatgaccagtccttattatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcacactgcaga 9986881  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9986880 ccagctcacggcaccacgaaatcgtgttacgatgtcaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 9986785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 44203430 - 44203217
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44203430 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 44203331  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203330 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 44203233  T
Q  1028 aagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||| |||||||||||    
T  44203232 aagac-aatctcaacaa 44203217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 783 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 51765254 - 51764988
Alignment:
Q  783 aaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 879  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  ||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51765254 aaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtatgaccagtccttatcatggaaa 51765155  T
Q  880 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacg 978  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  51765154 cttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacg 51765055  T
Q  979 atgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51765054 atgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttaaagccaaatctcaacaat 51764988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 387 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3189590 - 3189216
Alignment:
Q  387 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 484  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||    
T  3189590 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgtt 3189495  T
Q  485 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaa 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  3189494 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacag 3189396  T
Q  584 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaa 674  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  3189395 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaa 3189297  T
Q  675 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3189296 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3189216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 387 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3198407 - 3198033
Alignment:
Q  387 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 484  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||    
T  3198407 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgtt 3198312  T
Q  485 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaa 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  3198311 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacag 3198213  T
Q  584 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaa 674  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  3198212 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaa 3198114  T
Q  675 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3198113 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3198033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 387 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3207246 - 3206872
Alignment:
Q  387 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 484  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||    
T  3207246 cacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgtt 3207151  T
Q  485 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaa 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  3207150 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagagttacag 3207052  T
Q  584 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaa 674  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  3207051 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaa 3206953  T
Q  675 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3206952 ggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3206872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3157147 - 3156751
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  3157147 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 3157049  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3157048 -caaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 3156954  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||    
T  3156953 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagac 3156855  T
Q  652 actcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 750  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  3156854 actcaatgattttcactcaccagggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 3156757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 19361105 - 19360912
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  19361105 caaggtacgacctgtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 19361006  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19361005 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgataccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 19360912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 859 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 19365953 - 19365768
Alignment:
Q  859 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 957  Q
    |||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  19365953 gacctgtccttatcctggaaaattaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 19365854  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19365853 gcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagtcaaatctcaaca 19365768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 918 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 24202376 - 24202251
Alignment:
Q  918 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 1017  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24202376 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagac 24202277  T
Q  1018 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24202276 cacaaatttgaagccaaatctcaaca 24202251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 28220223 - 28220509
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  28220223 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 28220320  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||       |||||||||||||||||||     
T  28220321 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttca 28220419  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  28220420 ctcacccaaggtgttttcaatgcttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 28220509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168297
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 578  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 37168368  T
Q  579 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168367 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 831 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 24793859 - 24793709
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24793859 gtcacgatttgcgtctgacccaaggtttgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 24793760  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24793759 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgat 24793709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 39445897 - 39446070
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || | ||||    
T  39445897 tgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcatgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttggctca 39445996  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39445997 cggcatctc-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 39446070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 858 - 1035
Target Start/End: Original strand, 41391001 - 41391178
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 956  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  41391001 tgaccagtccttatcagtgatacttaatgagcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 41391100  T
Q  957 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 1035  Q
    |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41391101 ggcatctc-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaa 41391178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 44023562 - 44023389
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  44023562 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 44023463  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44023462 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 44023389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 834164 - 834450
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  834164 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 834261  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  834262 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 834360  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  834361 cgcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 834450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 298 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 49918696 - 49918350
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  49918696 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacagcacctatatc 49918600  T
Q  397 taatctaggaaacaag-tgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| |||  ||| || ||||| | ||||| || |||||||||||||||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||||| ||| |||||    
T  49918599 taatctaggaatcaaaatgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttgacctagttc 49918504  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  49918503 ggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagct 49918406  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49918405 tcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547257
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13547187  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547188 acaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 25439584 - 25439411
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  25439584 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatcctgcaaacttggctca 25439485  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||| | | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25439484 cggcatctc-aaatcgtgtcacgattaccaaatcgtgtcacgattgctctgttcttccagaccacaaatttgaag 25439411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 31659520 - 31659123
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| || | || ||||| || | || || |||||||||||||||  |||| |||     
T  31659520 caagcaataatcaacaataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagtaaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaaaggagagaaaagaggaat 31659421  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    | | |  |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||     
T  31659420 aaaca--caccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac- 31659327  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||    
T  31659326 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagac 31659228  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  31659227 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatt 31659130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 44455438 - 44455045
Alignment:
Q  369 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 465  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || | || || |||||||| | ||||   ||| |||  |||    
T  44455438 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccaaaagcaaaagataaaggaagagaagagaggaa--caa 44455341  T
Q  466 aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaag 565  Q
    |  |||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44455340 acacaccaaaga--tcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa- 44455245  T
Q  566 ggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactc 655  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||    
T  44455244 agatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 44455146  T
Q  656 aatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttccc 753  Q
    |||| ||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| ||    
T  44455145 aatggttttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaga-aaactctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttacc 44455048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Original strand, 42297968 - 42298143
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  42297968 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 42298066  T
Q  574 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42298067 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549168
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13549098  T
Q  580 acaagaaatta-gcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||| ||||||| | || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549099 acatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 28265551 - 28265722
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  28265551 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 28265648  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  28265649 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaa 28265722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136247
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 29136317  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29136316 ccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255508
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 47255438  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47255439 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 28223418 - 28223704
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  28223418 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 28223515  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  28223516 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 28223614  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||| | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  28223615 ctcacccaaggtgtcttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 28223704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 1054699 - 1054526
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || | ||||    
T  1054699 tgaccagtccttatcagtgatacttaactagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttggctca 1054600  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1054599 cggcacctccaa-tcgtatcacgattccaaaatcgtgacacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 1054526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348698
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-gaaagagatacaaatgggtt 11348768  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11348767 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 25444777 - 25444604
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| || | ||||    
T  25444777 tgaccagtccttatcagagatacttaaccaacaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatcctacaaacttggctca 25444678  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||| | | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25444677 cggcatctc-aaatcgtgtcacgattaccaaatcgtgtcacgattgctctgttcttccagaccacaaatttgaag 25444604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 37503443 - 37503837
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  || |||| || ||||| ||  ||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  37503443 caagcaataatcaacaatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 37503541  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  |||||||||  ||||| ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  37503542 -caaacacaccaaaga--ttgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 37503636  T
Q  562 aaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagaca 652  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||       |||||||    
T  37503637 aaagagatac--aaggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 37503733  T
Q  653 ctcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 750  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||| | || |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||  |  ||||||||||    
T  37503734 ctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatattttccaacccaataga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtcacctcctttgattt 37503831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 4552634 - 4552920
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  4552634 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaagggatacaaagg 4552731  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  4552732 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcc 4552830  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  4552831 ctcacccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctc-aattaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttaatttcccaag 4552920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482399
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 578  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 7482328  T
Q  579 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482329 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 831 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 24787037 - 24786905
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24787037 gtcacgatttgcgtctgacccaaggtttgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 24786938  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcacc 962  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  24786937 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacc 24786905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||     
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatgcaaaat 37033166  T
Q  576 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37033167 ggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 842 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 13604296 - 13604095
Alignment:
Q  842 cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcacc 940  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||     
T  13604296 cgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccagcaagtttgaaaatcatgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttgacaca 13604198  T
Q  941 ctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctca 1040  Q
    |||||| | |||||||| || | | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13604197 ctgcaaaccagctcacgacatcacaaaatcgtgccacgataccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaatctca 13604098  T
Q  1041 aca 1043  Q
    |||    
T  13604097 aca 13604095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925875
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 31925805  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  31925806 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctacccatttttccactctcaccaa 31925875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 3847118 - 3847404
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 3847215  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||| || |||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  3847216 ggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 3847314  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3847315 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcgaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 3847404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115171
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 578  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||  |||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaaatgggt 47115242  T
Q  579 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47115241 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 365 - 718
Target Start/End: Original strand, 37559751 - 37560115
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaa-tctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaa 460  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| || ||| |||||        
T  37559751 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaggg-gagagaagagagg 37559849  T
Q  461 aacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctta 559  Q
    ||||||  |||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  37559850 aacaaacacaccaaaga--ttgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttctta 37559946  T
Q  560 caaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt--gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caa 648  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||       |||    
T  37559947 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcctaatctcaccaatgaacaa 37560044  T
Q  649 gacactcaatgattttctctctac-aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
    ||||||||||||||||| |||  | || |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37560045 gacactcaatgattttcactcacctaatgtgtttacaatgttttcaaacccaagaga-actctaatcaaaga 37560115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 45644448  T
Q  577 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 648  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45644449 agttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 13659333 - 13659619
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  13659333 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 13659430  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  13659431 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 13659529  T
Q  667 ct-ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    || |  |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||   |||| |  ||||||||||||||||    
T  13659530 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaag 13659619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193611
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgagtt 193681  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| | | || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  193680 acaagaaattagcttcaacaagctaataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 193611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197191
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 575  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaat 197001  T
Q  576 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 665  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  197002 gagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 197100  T
Q  666 tctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  197101 actcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaag 197191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 479 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19754664 - 19754494
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 577  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  19754664 attgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatcgg 19754567  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19754566 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 50169207 - 50169378
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  50169207 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttac-aaagagatacaaatg 50169304  T
Q  577 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50169305 agttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 485 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603576
Alignment:
Q  485 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttaca 582  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||  |||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagataaaaaatgggttaca 34603643  T
Q  583 agaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34603642 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 34603576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 504 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833407
Alignment:
Q  504 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgacaag-t 601  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  || |    
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagat 1833569  T
Q  602 tcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-t 691  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||      
T  1833568 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcc 1833470  T
Q  692 caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  1833469 caatccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccttaaagttatct-cctttgatttcccaag 1833407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 648
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  501 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 598  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||| ||  |||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaaca 23555383  T
Q  599 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23555384 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 50167172 - 50167343
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  50167172 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 50167269  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  50167270 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 477 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 46065089 - 46064861
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| | |    
T  46065089 agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttac-aaagagatacacatg 46064992  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
     ||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  46064991 agttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaa-cctaatttttatccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 46064893  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttttcaaccc 697  Q
    |||   |||||||||| | |||||||| ||||    
T  46064892 ctcacccaaggtgtttacaatgttttccaccc 46064861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 858 - 980
Target Start/End: Original strand, 41398656 - 41398778
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 956  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  41398656 tgaccagtccttatcaatgatacttaatgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 41398755  T
Q  957 ggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    |||| | | |||||||||||||||    
T  41398756 ggcatctc-aaatcgtgtcacgat 41398778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138257
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||      
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagatgcaaatg 13138070  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 667  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |  ||||||||||| || |||  |||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  13138071 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga--cctaatttctatccatttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 13138168  T
Q  668 tc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  || ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  13138169 tcacccaaggtgtttacaatgtttcccaccccaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 13138257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820192
Alignment:
Q  501 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 598  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaaca 15820357  T
Q  599 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtt 689  Q
    || |||||| ||||||| |||||||| ||||| | || ||||| ||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||||    
T  15820356 agctcacaaagaacaaa-cctaatttttacccatctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 15820258  T
Q  690 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  | ||||||||||||||    
T  15820257 tcccaactcaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcttttgatttcccaag 15820192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41361088 - 41360914
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  41361088 aagatattgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaa 41360991  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41360990 atgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatc 19752760  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  19752759 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 505 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  505 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagtt 602  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  603 cacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 643  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22079361 cacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 481 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242391
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 30476443 - 30476614
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| | ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  30476443 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 30476540  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30476541 ggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 477 - 645
Target Start/End: Original strand, 40122193 - 40122363
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac--tatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 574  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40122193 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaa 40122290  T
Q  575 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 645  Q
     | |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  40122291 tgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttcgacccatttttccaatctcac 40122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 481 - 627
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928123
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 579  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| |||  ||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||| ||||||| ||    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaa-gagatccaaaagggtt 928074  T
Q  580 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 627  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  928075 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10925397 - 10925108
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt---acaaaagggatacaa 573  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||   ||||| | |||||||    
T  10925397 agattgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaa-gagatacaa 10925300  T
Q  574 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattt 663  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||||| || ||||  |||||||||       ||||||||||||||||||    
T  10925299 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctatccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 10925201  T
Q  664 tctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    || |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  10925200 tcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actataatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaag 10925108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 966 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 21536189 - 21536119
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 1036  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21536189 aaatcgtgtcacgttgatgaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaat 21536119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 849 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 24202425 - 24202379
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202425 cccaagatatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt 24202379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 563
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876848
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 24793723 - 24793678
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24793723 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 24793678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 858 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 43988134 - 43988054
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 937  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  43988134 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttaccaagatcgtggcacgattttgc 43988054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 1026
Target Start/End: Complemental strand, 26644517 - 26644390
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacga 998  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  |||| ||||| | |||||| | ||   | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  26644517 atcgtgtcacgttttcacaaaatcgtgccacgatttgacaccgtgcaaaccagctcatgacattacaaaatcgtgttacgatgacaaaatcgtatcacga 26644418  T
Q  999 tttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||    
T  26644417 ttcctctgttcttccaaaccacaaattt 26644390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1047
Target Start/End: Original strand, 3282273 - 3282335
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 1047  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3282273 aaatcgtgtcacgatttttctgttcttcctaaccacaaatttgaagccaaatttcaacaataa 3282335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 36683828 - 36683766
Alignment:
Q  501 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36683828 aacttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttacaaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1035
Target Start/End: Original strand, 41398764 - 41398814
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 1035  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41398764 aaatcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaa 41398814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 672 - 756
Target Start/End: Original strand, 13316518 - 13316601
Alignment:
Q  672 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  13316518 caaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctaaaccctaaagttgctacctttgatttcccaag 13316601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 13598967 - 13599012
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13598967 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 13599012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1029
Target Start/End: Original strand, 37070334 - 37070378
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37070334 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaa 37070378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 16455750 - 16455676
Alignment:
Q  520 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 594  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455750 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-acagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 648
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879079
Alignment:
Q  575 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 37879079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Original strand, 8871143 - 8871213
Alignment:
Q  576 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 645  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8871143 ggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcac 8871213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 490 - 634
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282846
Alignment:
Q  490 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaat 588  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||   |||||||||||||||  || ||||||||   |||| ||| ||||||| |||| | ||||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaat 37282799  T
Q  589 tagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 634  Q
    |||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  37282800 tagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccatttt 37282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 3460815 - 3460710
Alignment:
Q  531 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 628  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||   ||||  |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  3460815 ctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctac 3460716  T
Q  629 cctttt 634  Q
    ||||||    
T  3460715 cctttt 3460710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  509 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 643
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318685
Alignment:
Q  544 tatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 641  Q
    |||||| ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatc 12318683  T
Q  642 tc 643  Q
    ||    
T  12318684 tc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 48382505 - 48382441
Alignment:
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttct 626  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48382505 aaagtgatacaaataggttacaagaaattaactt-acaagttcacaaagatcaaaccctaatttct 48382441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 833992 - 834040
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  833992 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 834040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 507 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808507
Alignment:
Q  507 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 13137803 - 13137851
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13137803 tcacaccaatacaaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 13137851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 567 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 32737015 - 32736952
Alignment:
Q  567 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 630  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32737015 gatacaaagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 567 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 35109556 - 35109493
Alignment:
Q  567 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 630  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35109556 gatacaaataggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccc 35109493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 492 - 549
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871130
Alignment:
Q  492 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 549  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 480 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15916671 - 15916626
Alignment:
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 525  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15916671 ttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagaga 15916626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1026
Target Start/End: Complemental strand, 16124238 - 16124197
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16124238 aaatcgtatcacgatttctctgttcttccaaaccacaaattt 16124197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 480 - 525
Target Start/End: Original strand, 31422862 - 31422906
Alignment:
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 525  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31422862 ttgttcacccagctcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 31422906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 112)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 29720743 - 29720256
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatacta--aatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaag 368  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29720743 tgttgtgaattccgatctcaagtcgaaccacaccaatacaagaaatatgttgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtacaag 29720644  T
Q  369 caataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29720643 caataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaga 29720544  T
Q  469 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 568  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720543 caccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 29720445  T
Q  569 tacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctc 667  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720444 tacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctc 29720345  T
Q  668 tctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29720344 tctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 29720256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 29722904 - 29722416
Alignment:
Q  270 atgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatacta--aatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaa 367  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29722904 atgttgtgaattccgatctcaagtcgaaccacaccaatacaagaaatatggtgtgtggagcaaagtagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtacaa 29722805  T
Q  368 gcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaa 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29722804 gcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaag 29722705  T
Q  468 gcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 567  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722704 acaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 29722606  T
Q  568 atacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722605 atacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 29722506  T
Q  667 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29722505 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 29722416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Original strand, 29750948 - 29751436
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatacta--aatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaag 368  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29750948 tgttgtgaattccaatcttaaatcgaaccacaccaatacaagaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaatgtgtgtgtgcaag 29751047  T
Q  369 caataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751048 caataatcaacaaaacaccacctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 29751147  T
Q  469 -caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 567  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751148 acacc-aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggg 29751246  T
Q  568 atacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751247 atacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 29751346  T
Q  667 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29751347 ctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 29751436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Original strand, 22536111 - 22536563
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaa-caaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  22536111 cacaccaatacaaagaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaagcaaagtgtatg--caagcaacaatcaacaaaaaac-acctagatct 22536207  T
Q  398 aatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22536208 aatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacccagttcggt 22536306  T
Q  498 ccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgac 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536307 ccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgac 22536406  T
Q  598 aagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaaccc 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22536407 aagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctgcagggtgtttcccatgttttcaaccc 22536504  T
Q  698 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22536505 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttgatttcccaag 22536563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10593594 - 10593151
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593594 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtattgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 10593495  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593494 gtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagtagaaaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 10593396  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatga 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10593395 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatga 10593296  T
Q  611 acaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 710  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10593295 acaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactcta 10593196  T
Q  711 atcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10593195 atcaaagaaccctaaaccctagag-ttccccctttgatttcccaag 10593151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 25078457 - 25078013
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078457 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 25078358  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078357 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 25078259  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25078258 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 25078159  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078158 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 25078059  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25078058 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 25078013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 25136426 - 25135982
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136426 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 25136327  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136326 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 25136228  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25136227 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 25136128  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136127 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 25136028  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25136027 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 25135982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Original strand, 9789021 - 9789500
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    ||||||||||||||||||| || |    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  9789021 tgttgtgaattccgatctcaaaac----cacaccaatacaaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgt--gtgcaagca 9789113  T
Q  371 ataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagca 470  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||    
T  9789114 aaaatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagaca 9789213  T
Q  471 ccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggata 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9789214 ccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagata 9789313  T
Q  571 caaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctct 668  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9789314 caaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcact 9789412  T
Q  669 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9789413 caccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 9789500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40380427 - 40379985
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40380427 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 40380328  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380327 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 40380229  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  40380228 ctctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatg 40380129  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40380128 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactct 40380031  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40380030 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 40379985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40382638 - 40382196
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40382638 atgatgtgtggagcggcggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 40382539  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382538 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 40382440  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40382439 ctctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 40382340  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40382339 aacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactct 40382242  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40382241 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 40382196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Original strand, 18441441 - 18441924
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    ||||||||||||||||||| || |    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  18441441 tgttgtgaattccgatctcaaaac----cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaa-caaagtgtgtg--caagca 18441533  T
Q  371 ataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaa----cacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaa 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18441534 ataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaa 18441633  T
Q  467 agcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 566  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18441634 gacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaga 18441733  T
Q  567 gatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatttt 664  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18441734 gatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgatttt 18441832  T
Q  665 ctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18441833 cactcaccaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 18441924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16409825 - 16409367
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16409825 tcacaccaatacaaagtatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtg--caagcaataatcaacaataacaacacctagatc 16409729  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16409728 taatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcg 16409629  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-ct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |    
T  16409628 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatt 16409529  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tc 692  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||  |    
T  16409528 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttccc 16409430  T
Q  693 aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16409429 aacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 16409367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16544747 - 16544302
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16544747 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagt 16544648  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 509  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16544647 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacc 16544549  T
Q  510 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcaca 606  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||     
T  16544548 tactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcact 16544449  T
Q  607 atgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 706  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544448 atgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 16544351  T
Q  707 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16544350 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 16544302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16546969 - 16546524
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  | | | |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16546969 atgatgtgtggagcgacggagagtgataaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctaaatccaatctaggaaacaagt 16546870  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaa---aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 509  Q
    | |||||| |  |   || |||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16546869 gtgaaacaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacc 16546771  T
Q  510 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcaca 606  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16546770 tactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcact 16546671  T
Q  607 atgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 706  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546670 atgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 16546573  T
Q  707 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16546572 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 16546524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 26178255 - 26177775
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    ||||||||||||||||||| || |    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  26178255 tgttgtgaattccgatctcaaaac----cacaccaatacgaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagca 26178163  T
Q  371 ataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 468  Q
    ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  26178162 ataatcaatgataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaaga 26178063  T
Q  469 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26178062 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagaga 26177963  T
Q  569 tacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26177962 tacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttca 26177865  T
Q  667 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26177864 ctcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 26177775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 26171111 - 26170666
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||| |  | |||| |||||||||||    
T  26171111 cacaccaatacgaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaagcactaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcgatgataacaacacctagatct 26171015  T
Q  398 aatctaggaaacaag-tgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||| |||  ||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26171014 aatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcgg 26170915  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttg 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||  |||    
T  26170914 tccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttg 26170825  T
Q  596 acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaa 694  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||  |||    
T  26170824 acaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaa 26170727  T
Q  695 cccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26170726 cccaagagaagctgtaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 26170666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 781 - 1044
Target Start/End: Original strand, 22536590 - 22536853
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatac 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22536590 tcaaatctgcacaagaacactttatactagccttcctctgttgaaatcgtgtcacgatctgtgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatac 22536689  T
Q  881 ttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 979  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536690 ttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaattgtgccacgattttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 22536789  T
Q  980 tgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22536790 tgccacaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaacaa 22536853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 30182934 - 30182474
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30182934 tcacaccaaaacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caaacaataatcaacaataacaacacctagatc 30182838  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  30182837 taatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcatccagttcg 30182742  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  30182741 gtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctt 30182643  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 685  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |    
T  30182642 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttgcaa 30182544  T
Q  686 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  30182543 tgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 30182474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 13343408 - 13342946
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13343408 agtcacactaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacaacacctaga 13343312  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  || ||||||  ||||||||||||||    
T  13343311 tctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacatcaaaga--ttgttcacccagtt 13343216  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc 592  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13343215 cggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaaggattacaagaaattagc 13343118  T
Q  593 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttc 682  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||     
T  13343117 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 13343019  T
Q  683 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  13343018 caatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 13342946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 25413106 - 25412647
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||| ||  |  |||   ||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  25413106 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaattagtaatcaatatccaa---gtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctatatc 25413010  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||||||     
T  25413009 taatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttca 25412914  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25412913 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 25412815  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 686  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||    
T  25412814 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaat 25412716  T
Q  687 gttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||    
T  25412715 gtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaatgttgcctcctttgatttcccaag 25412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Original strand, 36073866 - 36074327
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  ||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36073866 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtaataaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatct 36073962  T
Q  398 aatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  36073963 aatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaacataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcatccagttcgg 36074058  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-tt 594  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  36074059 tccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttt 36074156  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc----ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcc 683  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  36074157 gacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 36074255  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  36074256 aatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 36074327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 29720161 - 29719965
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  29720161 cccaaggtatgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcag 29720062  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720061 actagctcacggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 29719965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 831 - 1044
Target Start/End: Original strand, 24136271 - 24136485
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24136271 gtcacgatttgcgtacgtcccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcac 24136370  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24136371 gatttggcaccctgcaaactagctcacggcatcacgaaattgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctgtgttcttccagaccacaaatttgaa 24136470  T
Q  1030 gacaaatctcaacaa 1044  Q
      ||||| |||||||    
T  24136471 accaaatatcaacaa 24136485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 10593055 - 10592844
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10593055 gtcacgatctgcgtaccaccgaagaaacgaccagtccttatcacggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 10592956  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10592955 gattttgcaccctgcaacctatctcacggcacccggaa-tcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 10592857  T
Q  1030 gacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| ||||||||||    
T  10592856 gac-aatctcaaca 10592844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 831 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 40379890 - 40379676
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40379890 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 40379791  T
Q  930 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379790 gaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 40379692  T
Q  1029 agacaaatctcaacaat 1045  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40379691 agac-aatctcaacaat 40379676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 16546428 - 16546216
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16546428 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 16546329  T
Q  930 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16546328 gaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttga 16546230  T
Q  1029 agacaaatctcaaca 1043  Q
    |||| ||||||||||    
T  16546229 agac-aatctcaaca 16546216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 40382101 - 40381889
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40382101 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 40382002  T
Q  930 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40382001 gaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttctttcagaccacaaatttga 40381903  T
Q  1029 agacaaatctcaaca 1043  Q
    |||| ||||||||||    
T  40381902 agac-aatctcaaca 40381889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 859 - 1043
Target Start/End: Original strand, 9789624 - 9789809
Alignment:
Q  859 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 957  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  9789624 gaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagttttcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 9789723  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9789724 gcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 9789809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 26177661 - 26177466
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  26177661 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccatgatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 26177562  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26177561 ccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 26177466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 16544206 - 16543994
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16544206 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 16544107  T
Q  930 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    || ||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16544106 gaatttgcaccctgtaaccctagctcacagcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttga 16544008  T
Q  1029 agacaaatctcaaca 1043  Q
    |||| ||||||||||    
T  16544007 agac-aatctcaaca 16543994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 859 - 1043
Target Start/End: Original strand, 18442048 - 18442233
Alignment:
Q  859 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 957  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  18442048 gaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 18442147  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18442148 gcatcatgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 18442233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 865 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 29722332 - 29722152
Alignment:
Q  865 tccttatcaaggatacttaacgagcaagttt-cacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcacc 962  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  29722332 tccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcacaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccatgcagactagctcacagcacc 29722233  T
Q  963 ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722232 acgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 29722152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 27450198 - 27450397
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27450198 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 27450296  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27450297 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 27450396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 29751532 - 29751724
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacg 930  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||    
T  29751532 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcac--------------------aatcgtgtcacg 29751611  T
Q  931 attttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751612 atttggcaccctgcaacctagctcacggcaccacgaaatcgtgtcgtgatgccaaattcatgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 29751711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 382 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 13240016 - 13239674
Alignment:
Q  382 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 479  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  ||||||| |      
T  13240016 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaaa-- 13239921  T
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  13239920 ttgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagt 13239822  T
Q  579 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 669  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  13239821 tacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 13239723  T
Q  670 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
      |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239722 accaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 30631763 - 30631936
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 956  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  30631763 tgaccagtccttatcagagatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 30631862  T
Q  957 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30631863 ggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 30631936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 27445355 - 27445554
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27445355 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 27445453  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27445454 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttctagaccacaaatttgaa 27445553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 43599106 - 43599306
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43599106 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 43599204  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcacccc-gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43599205 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcccccttgaaatcgtgtcacgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttga 43599304  T
Q  1029 ag 1030  Q
    ||    
T  43599305 ag 43599306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 43604598 - 43604798
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43604598 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 43604696  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcacccc-gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43604697 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcccccttgaaatcgtgtcacgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttga 43604796  T
Q  1029 ag 1030  Q
    ||    
T  43604797 ag 43604798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 43610090 - 43610290
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43610090 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 43610188  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcacccc-gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43610189 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcccccttgaaatcgtgtcacgacgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttga 43610288  T
Q  1029 ag 1030  Q
    ||    
T  43610289 ag 43610290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 25077918 - 25077713
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25077918 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacac 25077819  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25077818 gattt-gcacccctacaaccctagctcacggcacctccaa-tcgcgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 25077721  T
Q  1028 aagacaaa 1035  Q
    ||||||||    
T  25077720 aagacaaa 25077713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 25135887 - 25135682
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25135887 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacac 25135788  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135787 gattt-gcacccctacaaccctagctcacggcacctccaa-tcgcgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 25135690  T
Q  1028 aagacaaa 1035  Q
    ||||||||    
T  25135689 aagacaaa 25135682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 16407836 - 16407641
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  16407836 cccaaggtacgaccggtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 16407737  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16407736 ccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgtcaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 16407641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 1456849 - 1456650
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1456849 gtcacgatttgcatctgacccaaggta-gacaagtccttatcagggatacttaacaagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 1456751  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1456750 gatttggcgtcctgtaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 1456651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 382 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 32637088 - 32636709
Alignment:
Q  382 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 479  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||||   |||||||  |||||||||      
T  32637088 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaagggag--ggaagagagaaacaaacacaccaaaga-- 32636993  T
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 578  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggt 32636895  T
Q  579 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagacactcaatgattttctctc 669  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||    
T  32636894 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactc 32636796  T
Q  670 -tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
       |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  32636795 acccaaggtgtttacaatgtttcactacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 32636709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 919 - 1043
Target Start/End: Original strand, 29752266 - 29752390
Alignment:
Q  919 aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagacc 1018  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29752266 aatcgtgccacgatttggcaccctgcaacctagctcacggcagcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagacc 29752365  T
Q  1019 acaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29752366 acaaatttgaagacaaatctcaaca 29752390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 26170552 - 26170357
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  26170552 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaattatgtcacgatttcccacgatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 26170453  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  26170452 ccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgataccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccataccataaatttgaagccaaaactcaaca 26170357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 37439313 - 37439161
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  37439313 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 37439215  T
Q  577 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 629  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37439214 agttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 16409272 - 16409077
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||| |||||     
T  16409272 cccaatgtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacaatttggcaccttgcaaa 16409173  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | |||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16409172 ccagctcacgacatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 16409077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 30682745 - 30683203
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30682745 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacaacacctagatc 30682841  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||||||||||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||||| ||| |||||    
T  30682842 taatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaattcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttgacc-agttc 30682936  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagag--ttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag 591  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  30682937 ggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagggttacaagaaattag 30683034  T
Q  592 ctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttc 682  Q
    |||  |||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||     
T  30683035 cttcaacaagttcacaaag----aaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 30683130  T
Q  683 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||| ||||||||||||    
T  30683131 caatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaaattacctcctctgatttcccaag 30683203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213465
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 213535  T
Q  580 acaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  213534 acaagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 865 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 29402728 - 29402562
Alignment:
Q  865 tccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccc 963  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| |||  |     
T  29402728 tccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcatggccact 29402629  T
Q  964 cgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29402628 tgaaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 29402562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488088
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 13488277  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||||||||| ||||||     
T  13488276 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttca 13488178  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  13488177 ctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 13488088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147261
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 40147331  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147330 acaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 15045095 - 15045267
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 956  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  15045095 tgaccagtccttatcagtgatacttaatgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactggctcac 15045194  T
Q  957 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  15045195 ggcatctc-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaactacaaatttgaag 15045267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 479 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28278485 - 28278316
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 577  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  28278485 attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatggg 28278388  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28278387 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428713
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 42428524  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  42428525 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 42428623  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  42428624 ctcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaag 42428713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 918 - 1043
Target Start/End: Original strand, 15465000 - 15465125
Alignment:
Q  918 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 1017  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15465000 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgataccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagac 15465099  T
Q  1018 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15465100 cacaaatttgaagccaaatctcaaca 15465125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 300 - 756
Target Start/End: Original strand, 39468373 - 39468832
Alignment:
Q  300 acaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatcta 398  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39468373 acaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caaacaataatcaacaataacagcacctagatcta 39468469  T
Q  399 atctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||| || ||| |||| || ||||| || || | ||||||||||| ||||||   ||| |||  ||||  ||| |||||  ||||| ||||||||| |    
T  39468470 atctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacgagcacaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacactaaaga--ttgttgacccagttcag 39468565  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt- 594  Q
    |||||  || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  39468566 tccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttc 39468663  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttccca 685  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |    
T  39468664 aacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaa 39468762  T
Q  686 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  39468763 tgtttcccaacccaagaga-actctaatgaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 39468832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 481 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31182858
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 580  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatggtta 31183041  T
Q  581 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctac 672  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |    
T  31183040 caagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31182942  T
Q  673 -aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  31182941 taaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 31182858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 28807261 - 28807088
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | ||||    
T  28807261 tgaccagtccttatcagagatacttaaccaacaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaaacttggctca 28807162  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||| | | | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28807161 cggcatctc-agatcgtgtcacgattgcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccataaatttgaag 28807088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 879 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 9352972 - 9352807
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||    
T  9352972 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacagaatcgtgccacgatttgacaccctgcaaaccagctcacggcattacaaaatcgtgtcac 9352873  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9352872 gatgccacaatcgcgtcacgatttctctgttctttcaaaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 9352807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 28750652 - 28750938
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||      
T  28750652 agattattgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 28750749  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  28750750 ggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 28750848  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  28750849 ctcacccaaggtgttttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 28750938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 460 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831565
Alignment:
Q  460 aaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctta 559  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaaaga--ttgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttctta 33831770  T
Q  560 caaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caag 649  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||        |||    
T  33831769 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataag 33831672  T
Q  650 acactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttga 747  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||    |||||||    
T  33831671 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaaattaactcctttga 33831574  T
Q  748 tttcccaag 756  Q
    |||||||||    
T  33831573 tttcccaag 33831565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 918 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 36931968 - 36931843
Alignment:
Q  918 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 1017  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36931968 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacgacatcacaaaatcgtgccacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccaaac 36931869  T
Q  1018 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  36931868 cacaaatttgaagcgaaatctcaaca 36931843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 533940 - 533655
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  533940 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 533843  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||| |||||||||||     
T  533842 ggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttca 533744  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaa 755  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  533743 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccccaaccctaaagttacctcctttgatttcccaa 533655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058047
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  || |    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggat 5058115  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058114 acaagaaaatagcttcaacaagctcaca--gaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 718
Target Start/End: Original strand, 8565943 - 8566192
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||      
T  8565943 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-agagggatacaaatg 8566040  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  8566041 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 8566139  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
    |||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8566140 ctcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaaga 8566192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 831 - 980
Target Start/End: Original strand, 43592661 - 43592811
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43592661 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 43592759  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccc-cgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  43592760 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcccccttgaaatcgtgtcacgat 43592811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 16452247 - 16451966
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 16452150  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttctctct 670  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||||||||||| || ||      
T  16452149 acaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcactta 16452051  T
Q  671 acaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  16452050 ccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaag-atcctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 16451966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 537910
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 538099  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||| |||||||||||     
T  538098 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttca 538000  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  537999 ctcacccaaggtgtttacgatgtttcccaagccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattttccaag 537910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 42426232 - 42426518
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  42426232 agattgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 42426329  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||     
T  42426330 ggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttca 42426428  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  ||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  42426429 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatctaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 42426518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 826 - 980
Target Start/End: Original strand, 31180633 - 31180787
Alignment:
Q  826 atcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgt 924  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  31180633 atcatgtcacgatttgcgtctgacccaaggt-tgaccagtccttatcagtgatacttaacgagaaagtctctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgt 31180731  T
Q  925 gtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    | |||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  31180732 gccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacgacaccttgaaatcgtgtcacgat 31180787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 504 - 648
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  504 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 601  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| || ||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||     
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagc 13695812  T
Q  602 tcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13695813 tcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 483 - 648
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637781
Alignment:
Q  483 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggtta 580  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggtta 27637712  T
Q  581 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27637713 caagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 860 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 37556308 - 37556131
Alignment:
Q  860 accagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctcacg 957  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  | || |  || || | ||||||    
T  37556308 accagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctagatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgccacgatttgcctccatcaaaacttggctcacg 37556209  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 1036  Q
    ||| | | | |||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37556208 gcatctc-agatcgtgtcacgattaccaaatcgtgtcacgattactctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaat 37556131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 860 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 37561130 - 37560953
Alignment:
Q  860 accagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctcacg 957  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | || |  || | | |||||||    
T  37561130 accagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttgcctccatcaaaacttggctcacg 37561031  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 1036  Q
    ||| | | | |||||||||||||    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37561030 gcatctc-agatcgtgtcacgattatcaaatcgtgtcacgattactctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaat 37560953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 1043
Target Start/End: Original strand, 2785777 - 2785963
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  2785777 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 2785876  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  2785877 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 2785963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 1043
Target Start/End: Original strand, 33768586 - 33768772
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  33768586 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 33768685  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33768686 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 33768772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 1043
Target Start/End: Original strand, 33791718 - 33791904
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  33791718 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 33791817  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33791818 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 33791904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 851 - 960
Target Start/End: Original strand, 38219837 - 38219947
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |     
T  38219837 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacaagcaagtttgaaaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctacaaacc 38219936  T
Q  950 agctcacggca 960  Q
    |||||||||||    
T  38219937 agctcacggca 38219947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 481 - 752
Target Start/End: Original strand, 3075659 - 3075937
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  3075659 tgttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaa-agatacaaatgggtt 3075756  T
Q  580 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc- 669  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||       | |||||||||||||||||| |||     
T  3075757 acaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactca 3075855  T
Q  670 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 752  Q
    |  ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  3075856 tcaaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcc 3075937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 481 - 634
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641091
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  16640941 tgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttac-aaagagatacaaaagagtt 16641035  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 634  Q
    |  |||||| |||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16641036 atcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttt 16641091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 645
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049506
Alignment:
Q  492 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 590  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaatta 9049451  T
Q  591 gctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 645  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9049452 gcttcaacaagctcacaa-aaacaaacactaatttctatcattttcccaaactcac 9049506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015531
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 580  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |     
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt- 27015594  T
Q  581 caagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
          ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27015593 ------attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 27015531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 831 - 914
Target Start/End: Original strand, 35388084 - 35388169
Alignment:
Q  831 gtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt 914  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  35388084 gtcacgatttgaacgtacgtcccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacaattt 35388169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 477 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 38747176 - 38747009
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||||||||      
T  38747176 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtt-tttccaaagagatacaaatg 38747079  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 644  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38747078 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 477 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806454
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt 558  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt 19806454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 479 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316769
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg- 577  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||| |||||| ||||||||   |||| |||||||||||     
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 316834  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 642  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  316833 ttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 858 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 31396675 - 31396488
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct-agctca 955  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| || ||||||    
T  31396675 tgaccagtccttatcagagaaacttaaccaacaagtgtctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctca 31396576  T
Q  956 cggcacc-ccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    | ||  | ||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  31396575 ctgcctctccga--tcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacaa 31396488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 993 - 1043
Target Start/End: Original strand, 35388196 - 35388246
Alignment:
Q  993 tcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35388196 tcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaaatctcaaca 35388246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 31180773 - 31180818
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31180773 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 31180818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 43592797 - 43592842
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43592797 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 43592842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 594
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906144
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg- 577  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| | | ||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||     
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 33906127  T
Q  578 ttacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||||| |||||||    
T  33906128 ttacaagaagttagctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1044
Target Start/End: Original strand, 14520796 - 14520855
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  14520796 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacaa 14520855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 42309932 - 42310218
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  42309932 agattgtttatccaattcggtc-aaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaaag 42310029  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| || |||| | | ||||||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  42310030 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagatcaaa-cttgatttctacccaatttctcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttca 42310128  T
Q  667 ctcta--caaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    || ||  |||  ||||| | ||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  42310129 ct-tacccaaaatgtttacaatgttttccaaccaaagaga-accctaatcaaag-accataaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 42310218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 858 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 31401532 - 31401346
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  31401532 tgaccagtccttatcagagaaacttaagcagcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctca 31401433  T
Q  956 c-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | | | | |||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  31401432 ctgcctctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctctattctcccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 31401346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 486 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 546  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Original strand, 43592636 - 43592670
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592636 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 43592670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Original strand, 43599081 - 43599115
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43599081 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 43599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Original strand, 43604573 - 43604607
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604573 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 43604607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Original strand, 43610065 - 43610099
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43610065 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 43610099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 900 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 10593080 - 10593048
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593080 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 10593048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 42428253 - 42428301
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42428253 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 42428301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 532 - 594
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054929
Alignment:
Q  532 tctccaatccactatcaaagagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 594  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10054867 tctccaatacactatcaatgagttcattacaaa-gagatacaaaaggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 11916502 - 11916452
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 1035  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11916502 aaattgtgtcacgatttctctgttctttcaaaccacaaatttgaagccaaa 11916452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Original strand, 27445330 - 27445364
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445330 atcgtgccacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 27445364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Original strand, 27450173 - 27450207
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450173 atcgtgccacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 27450207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 900 - 934
Target Start/End: Original strand, 29751507 - 29751541
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattt 934  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29751507 atcgtgtcacgattttccaaatcgtgtcacgattt 29751541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1026
Target Start/End: Complemental strand, 12083708 - 12083667
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12083708 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccataaattt 12083667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 347
Target Start/End: Original strand, 16649661 - 16649706
Alignment:
Q  302 accaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccac 347  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16649661 accaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccac 16649706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 480 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 38882384 - 38882340
Alignment:
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 525  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38882384 ttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 38882340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 25690305 - 25689847
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatcta 398  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25690305 cacaccaatacaaagaatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaagaatcaacaaaacaccacctagatcta 25690206  T
Q  399 atctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggt 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690205 atctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacactcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgttcacccagttcggt 25690106  T
Q  498 ccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgac 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690105 ccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgac 25690006  T
Q  598 aagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaaccc 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690005 aagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaaccc 25689906  T
Q  698 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25689905 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttgatttcccaag 25689847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 3439853 - 3439396
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaata--tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatc 396  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3439853 cacaccaatactaaaaaaatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaatcaacaaaacaccacctagatc 3439756  T
Q  397 taatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3439755 taatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcatccagttcgg 3439656  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3439655 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgc 3439556  T
Q  597 caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacc 696  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3439555 caagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacc 3439456  T
Q  697 caagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3439455 caagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttctcaag 3439396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 42575157 - 42575599
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42575157 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagt 42575256  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 512  Q
    | |||||| |  |  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575257 gtgaaacaaagcaaccaaacacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctac 42575355  T
Q  513 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaatg 609  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  42575356 tctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatg 42575455  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42575456 aacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactct 42575553  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42575554 aatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 42575599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15290860 - 15290417
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | | | |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15290860 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagt 15290761  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15290760 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggacacccagttcggtccaaacttgaccta 15290662  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaat 608  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15290661 ctctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactat 15290562  T
Q  609 gaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 708  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15290561 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactc 15290464  T
Q  709 taatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15290463 taatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 15290417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15471229 - 15470786
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  | | | |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15471229 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagcttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagt 15471130  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15471129 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggacacccagttcggtccaaacttgaccta 15471031  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcacaat 608  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15471030 ctctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactat 15470931  T
Q  609 gaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 708  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15470930 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactc 15470833  T
Q  709 taatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15470832 taatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttgatttcccaag 15470786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 2628108 - 2627627
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    |||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||    
T  2628108 tgttgtgaattccgatctcgaaac----cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtg--caagca 2628016  T
Q  371 ataa-tcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 468  Q
    | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  2628015 aaaaatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaaga 2627916  T
Q  469 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 568  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  2627915 caccaa-gagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagaga 2627817  T
Q  569 tacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 665  Q
    |||||||   ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2627816 tacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttc 2627718  T
Q  666 tctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2627717 tctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 2627627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 31218603 - 31218142
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31218603 tcacaccaatataaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 31218507  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  31218506 taatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacataagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcg 31218411  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31218410 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 31218312  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |     
T  31218311 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 31218213  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31218212 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 31218142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 833 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 3439297 - 3439088
Alignment:
Q  833 cacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 932  Q
    |||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439297 cacgatatgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgat 3439198  T
Q  933 tttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac 1032  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3439197 tttgcaccctgcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagac 3439098  T
Q  1033 aaatctcaaca 1043  Q
     ||||||||||    
T  3439097 -aatctcaaca 3439088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 17983021 - 17982538
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||     |||||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||  || |||||||      ||||||    
T  17983021 tgttgtgaattccgatctcaaatc-----acaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaacgtagtaaccaataa-caaagtgaaca--caagca 17982930  T
Q  371 ataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 468  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||      
T  17982929 ataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaaca 17982832  T
Q  469 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 568  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||    
T  17982831 caccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagaga 17982735  T
Q  569 tacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaa 657  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||    
T  17982734 tacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaa 17982636  T
Q  658 tgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  17982635 tgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 17982538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Original strand, 34254154 - 34254611
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  ||||||| |    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34254154 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgagca--caagcaataatcaacaataacagcacctagatct 34254250  T
Q  398 aatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  34254251 aatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcgg 34254346  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-tt 594  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  34254347 tccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttt 34254445  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 687  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||    
T  34254446 gacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatg 34254544  T
Q  688 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  34254545 tctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 34254611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Original strand, 34256330 - 34256787
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |   ||   ||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34256330 cacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaa---gtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatct 34256426  T
Q  398 aatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  34256427 aatctaggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcgg 34256522  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-tt 594  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  34256523 tccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttt 34256621  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 687  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| | |||    
T  34256622 gacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacacaccaaggtgtttacaatg 34256720  T
Q  688 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  34256721 tttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 34256787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 19945181 - 19945643
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19945181 tcacaccaatacaaactttgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 19945277  T
Q  397 taatctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  19945278 taatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcg 19945373  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc- 592  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||     
T  19945374 gttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagct 19945472  T
Q  593 ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcc 683  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  19945473 ttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 19945571  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  19945572 aatgtttcccgacccaagaga-actctaatcaaag-actctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 19945643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 44304201 - 44303739
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |   ||   ||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44304201 tcacaccaatacatactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaa---gtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatc 44304105  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    |||||||| || ||| |||| || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  44304104 taatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacctagttcg 44304009  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagc-t 593  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  44304008 atccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 44303910  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc---ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcc 683  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  44303909 tgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 44303811  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||    
T  44303810 aatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtttcctttgatttctcaag 44303739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 42498541 - 42498079
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |  |||||||      ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  42498541 tcacaccaatacaaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagcaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataattaacaataacaacacctagatc 42498445  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||  |||| | |||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  42498444 taatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagggaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttc 42498349  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  42498348 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaaagggttacaagaaattagct 42498250  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcc 683  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  42498249 tcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 42498151  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     | ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  42498150 aacgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 42498079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 36979802 - 36980002
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  36979802 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcagagatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccac 36979901  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36979902 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 36980001  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  36980002 g 36980002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 789 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 33037543 - 33037299
Alignment:
Q  789 gcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacg 886  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  33037543 gcacaagaacacaatatatactagtctccttctgaagcaatcgtgtcacgatttgcgtccgttccaaggcatgaccagtccttatcagtgatacttaatg 33037444  T
Q  887 agcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaa 985  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33037443 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaa 33037344  T
Q  986 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33037343 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 33037299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 4759746 - 4759546
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4759746 gtcacgatttgcgtccgttccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 4759647  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4759646 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgtcaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 4759547  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  4759546 g 4759546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 30656070 - 30656270
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30656070 gtcacgatttgcgtctgacccaaggtttgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 30656169  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30656170 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 30656269  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  30656270 g 30656270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 1261609 - 1261414
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  1261609 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 1261510  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  1261509 ctagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcgcgatttctgtgttcttccaaaccacaaatttgaaaccaaatatcaaca 1261414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 1746041 - 1746501
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||  || |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1746041 tcacaccaatacgaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 1746137  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| ||| || | || | |||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1746138 taatctaggaatcaaagtcaaaagcgcaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaacga--ttgttcacccagttcg 1746233  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1746234 gtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 1746331  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||  |||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |     
T  1746332 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 1746430  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  1746431 atgtttcccaaccaaagaga-actctaatc-aaggaccctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 1746501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 18852839 - 18852639
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18852839 gtcacgatctgcgtctgacccaaggtatgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 18852740  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18852739 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtatcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 18852640  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  18852639 g 18852639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 859 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 2627503 - 2627318
Alignment:
Q  859 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 957  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  2627503 gaccaatccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcaccatgcaaaccagctcacg 2627404  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2627403 gaatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 2627318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 10683924 - 10683751
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 956  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  10683924 tgaccagtccttatcagagatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcac 10683825  T
Q  957 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10683824 ggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 10683751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 781 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 15290407 - 15290143
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 879  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15290407 tcaaatctgcacaagaacacttaagtactagtcttcctctgttccaatcgtgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaactaccagtccttatcaaggata 15290308  T
Q  880 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtcacgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtc 975  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || |||||||||||    
T  15290307 cttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgtgtc 15290210  T
Q  976 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15290209 gcaatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 15290143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 781 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 15470776 - 15470512
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 879  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15470776 tcaaatctgcacaagaacacttaagtactagtcttcctctgttccaatcgtgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaactaccagtccttatcaaggata 15470677  T
Q  880 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtcacgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtc 975  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || |||||||||||    
T  15470676 cttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgtcacgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgtgtc 15470579  T
Q  976 acgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15470578 gcaatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 15470512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 18870233 - 18870033
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18870233 gtcacgatctgcgtctgacccaaggtatgaccagtccttattagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 18870134  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18870133 gatttggcgtcctgcaaactagctcacgacatcttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 18870034  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  18870033 g 18870033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 851 - 1046
Target Start/End: Original strand, 26288324 - 26288520
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  26288324 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 26288423  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 1046  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26288424 agctcacggcatcacaaaatcatgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaagtctcaacaata 26288520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 851 - 1046
Target Start/End: Original strand, 26301581 - 26301777
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  26301581 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 26301680  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 1046  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26301681 agctcacggcatcacaaaatcatgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaagtctcaacaata 26301777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 851 - 1046
Target Start/End: Original strand, 26313575 - 26313771
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |     
T  26313575 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacgatttcccaagattgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 26313674  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 1046  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26313675 agctcacggcatcacaaaatcatgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtcaagtctcaacaata 26313771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 831 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 25689753 - 25689604
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  25689753 gtcacgatttgtgtacaaaccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtgacgatttcccacaatcgtgccac 25689654  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25689653 gattttgcaccctgcaacctagctcacggca-cccgaaatcgtgtcacgat 25689604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 42575696 - 42575909
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  42575696 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaaagaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgaca 42575795  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42575796 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgtgtcgcgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaaaccacaaattt 42575893  T
Q  1027 gaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||| ||||||||||    
T  42575894 gaagac-aatctcaaca 42575909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 6311724 - 6311923
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6311724 gtcacgatttgcatctgacccaaggt-tgacaagtccttattagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 6311822  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6311823 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 6311922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 850 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 7289620 - 7289439
Alignment:
Q  850 ccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc 948  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  7289620 ccaaggta-gacaagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaac 7289522  T
Q  949 tagctcacggcacccc-gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7289521 tagctcatggctcccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcactatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 7289439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 15213132 - 15212671
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  15213132 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caaacaataatcaacaataacagcaccttgatc 15213036  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||  | |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  15213035 taatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttgacccagttc 15212940  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15212939 ggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagct 15212842  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcc 683  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| |||||||||||| |||   |||||||||| |    
T  15212841 tcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 15212743  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  | ||||||||||||||    
T  15212742 aatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcatttgatttcccaag 15212671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 43036594 - 43036308
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  43036594 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 43036497  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
      |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  43036496 aattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 43036398  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  43036397 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 43036308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 919 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 31043032 - 31042908
Alignment:
Q  919 aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagacc 1018  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31043032 aatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctattcttccagacc 31042933  T
Q  1019 acaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  31042932 acaaatttgaagtcaaatctcaaca 31042908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 33352432 - 33352035
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||    ||| |||     
T  33352432 caagcaataatcaacaataacaacacctaaatctaatctagaaatcaaagtgaaaaacacaaatccacaagcaaaagataaaaggagataagagaggaa- 33352334  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  || ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  33352333 -caaacacatcaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 33352239  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  33352238 aaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 33352140  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    ||||||||||||||  ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |   ||||||||    
T  33352139 actcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttaccttctttgatt 33352042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 25327858 - 25327676
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||  |||||||    
T  25327858 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccatgatttggcgtcctgcaa 25327760  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     ||||||||| ||  |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25327759 actagctcacagccacttgaaatcgtgccacgaagccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 25327676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 387 - 756
Target Start/End: Original strand, 12702542 - 12702921
Alignment:
Q  387 cacctagatctaatctaggaaac--aagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgt 483  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||   ||||||||  ||||    
T  12702542 cacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaagggagag--aagagagaaacaaacataccaaaga--ttgt 12702637  T
Q  484 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttaca 582  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  12702638 tgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagacacaaaagggttaca 12702735  T
Q  583 agaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc------ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 668  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||    
T  12702736 agaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcact 12702834  T
Q  669 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||    
T  12702835 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaatttacctcctttgatttcccaag 12702921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 39784510 - 39784337
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  39784510 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccaacaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 39784411  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39784410 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 39784337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 365 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27811560 - 27811164
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || ||||||||   ||||  |||| |  |    
T  27811560 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaagcaagag--aagagggga 27811463  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    | |||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||     
T  27811462 aaaaacacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttac- 27811367  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  27811366 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 27811268  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  |||||||||    
T  27811267 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaatttacctcctttgatt 27811170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435159
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 42435089  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42435090 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 369 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 4731936 - 4731549
Alignment:
Q  369 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 465  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  |||    
T  4731936 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caa 4731839  T
Q  466 aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaag 565  Q
    |  |||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4731838 acacaccaaaga--ttgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaag 4731743  T
Q  566 ggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactc 655  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||    
T  4731742 agatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 4731644  T
Q  656 aatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 750  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  4731643 aatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 4731549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283524
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4283594  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283593 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 477 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaa 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttac-aaagagatactaatg 40321154  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 646  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40321153 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598857
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatg 6599046  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||     
T  6599045 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttca 6598947  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  6598946 ctcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaag 6598857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674310
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatg 6674499  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||     
T  6674498 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttca 6674400  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  6674399 ctcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaag 6674310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655400
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 18655470  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18655469 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 30143686 - 30143227
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30143686 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacaacacctagatc 30143590  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| |||| || | ||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||||| || ||||||    
T  30143589 taatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttgactcagttc 30143494  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagct 593  Q
     || ||| ||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30143493 agttcaa-cttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagct 30143396  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa-----gacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttccca 685  Q
    |  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||      | || ||||||||||| |||   ||| |||||| | |    
T  30143395 tcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctggccaatgaacaagacacaatgattttcactcacccaatgtgtttacaa 30143297  T
Q  686 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  30143296 tgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 30143227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 3303667 - 3303953
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  3303667 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 3303764  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||     
T  3303765 agttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttca 3303863  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||||    
T  3303864 ctcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccgtaaagttacctcctttgatttcccaag 3303953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 879 - 1043
Target Start/End: Original strand, 7412787 - 7412952
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||   |  |||||||||||    
T  7412787 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaattgtaccacgatttgacaccctgcaaaccagctcacggcattacagaatcgtgtcac 7412886  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7412887 gatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagtcaaatttcaaca 7412952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 40221916 - 40221745
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  40221916 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatg 40221819  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40221818 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 487 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  487 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 585  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaaga 18141884  T
Q  586 aattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18141883 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689159
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 5689345  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||||||||||||||     
T  5689344 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagcac-caccttaatttctacccatttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttca 5689246  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttccc 753  Q
    |||   |||||||||| | |||||| | ||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  5689245 ctcacccaaggtgtttacaatgtttccaaactcaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttccc 5689159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 489 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 30291767 - 30291606
Alignment:
Q  489 cagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 586  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  30291767 cagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttac-aaagtgatacaaatgagttacaagaa 30291670  T
Q  587 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30291669 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 507 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  507 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctc 40328824  T
Q  604 acaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 645  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40328823 acaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 831 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 10688810 - 10688661
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10688810 gtcacgatttgcatctgacccaaggt-tgacaagtccttattagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 10688712  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10688711 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgat 10688661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 478 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765745
Alignment:
Q  478 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgta-ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagaga--gcagctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 9765819  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9765818 ggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 474 - 646
Target Start/End: Original strand, 10930193 - 10930365
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||    
T  10930193 aagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagatataa 10930290  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcacc 646  Q
    |  |||||||||||||||||||  || || |||||| || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10930291 atgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagc-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacc 10930365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 481 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383989
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttac-aaagagatacaaatgagtt 11384055  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 644  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11384054 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 11383989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 1345368 - 1345654
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaa 575  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |      
T  1345368 agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacatatg 1345465  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  | ||  |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||     
T  1345466 ggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttca 1345564  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | || |||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  1345565 ctcacccaaggtgtttacaatatttcccaactcaagaga-actctaatcaaa-aaccctcaaccctaaagttacatcctttgattttccaag 1345654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965859
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 579  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaa-gagatataaaagggtt 8965789  T
Q  580 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    | ||||||||| ||| | |||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8965790 ataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 487 - 648
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292631
Alignment:
Q  487 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaaga 585  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaga 1292567  T
Q  586 aattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1292568 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 477 - 573
Target Start/End: Original strand, 4743211 - 4743306
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  4743211 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgggttacaa 4743306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 644
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366778
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |    
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagggatacaaata 41366708  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 644  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| | |||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41366709 ggttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaa-cataatttctacccattttctcaatctca 41366778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 481 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162405
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 4162567  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-t 670  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||||       |||||||||||||||||||| |||      
T  4162566 acaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctacccattttcc--tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgc 4162470  T
Q  671 acaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 736  Q
     |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  4162469 tcaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-accctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 4162405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Original strand, 19491693 - 19491867
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  19491693 aagatattgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaa 19491790  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19491791 atgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 858 - 1043
Target Start/End: Original strand, 35745793 - 35745979
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||  ||| | | |||||    
T  35745793 tgaccagtccttatcatagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccaacaaacttggctca 35745892  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  35745893 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 35745979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 519 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  519 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaac 616  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aac 44353826  T
Q  617 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 645  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44353825 cctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 985 - 1046
Target Start/End: Complemental strand, 25689618 - 25689558
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 1046  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25689618 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaacaata 25689558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733792
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 4733792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 486 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015136
Alignment:
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 584  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||| | ||||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttcct--aaaagagatacaaatgagttacaag 10015146  T
Q  585 aaattagctt 594  Q
    ||||||||||    
T  10015145 aaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 486 - 594
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106191
Alignment:
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 584  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaaa--gatacaaatgagttacaag 18106181  T
Q  585 aaattagctt 594  Q
    ||||||||||    
T  18106182 aaattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 10688675 - 10688630
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10688675 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 10688630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 577 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 10929871 - 10929686
Alignment:
Q  577 gttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttccca-atctcaccaa-------gacactcaatgattttctc 667  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  10929871 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaca-taatttctacccattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcac 10929773  T
Q  668 t-ctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |  | |||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  10929772 taatccaaggtgtttacaatgttcccaacccaagaga-actctaatcaaagacccc--aaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 10929686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 589
Target Start/End: Original strand, 3073875 - 3073981
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaaggtt 579  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||| |||    
T  3073875 tgtttacccagttcggcccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgtt 3073971  T
Q  580 acaagaaatt 589  Q
    ||||||||||    
T  3073972 acaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 5702009 - 5701964
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5702009 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 5701964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 3303493 - 3303541
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3303493 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaacca 3303541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772192
Alignment:
Q  488 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 586  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  3772352 ccagtttggtccaa-cttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttac-aaagatatacaaatgagttacaagaa 3772255  T
Q  587 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||  | ||| |||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  3772254 attagcttaaataagctcacaaagaacaaa-cctaatttctatcaattttctcaatctcaccaa 3772192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597669
Alignment:
Q  488 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaa 586  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||   |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaa 7597677  T
Q  587 attagctt 594  Q
    ||||||||    
T  7597676 attagctt 7597669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  492 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1035
Target Start/End: Original strand, 4456575 - 4456625
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 1035  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4456575 aaatcgtgtcacgatttctttgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaa 4456625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 576 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 1822365 - 1822297
Alignment:
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 643  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1822365 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1822297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 576 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 1856810 - 1856742
Alignment:
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 643  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1856810 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1856742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 4743050 - 4743098
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4743050 tcacaccaatacaaactataatgtgtggagcaaaggaaagtggtaacca 4743098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5689613 - 5689565
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5689613 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 5689565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 562 - 736
Target Start/End: Original strand, 41364927 - 41365110
Alignment:
Q  562 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctc-------accaagac 651  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||       | ||||||    
T  41364927 aaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 736  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 41365110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 41366440 - 41366488
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  41366440 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 41366488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43036768 - 43036720
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43036768 tcacaccaatacaaaaaatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 43036720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 781 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 3439369 - 3439330
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctg 820  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3439369 tcaaatctgcacaagaacactttatactagtcttcctctg 3439330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 11383440 - 11383406
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 1000  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11383440 aaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 11383406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 594
Target Start/End: Original strand, 32902197 - 32902287
Alignment:
Q  505 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 594  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || |||||   |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32902197 tgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagctt 32902287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 624
Target Start/End: Original strand, 11712024 - 11712145
Alignment:
Q  505 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagtt 602  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  11712024 tgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagct 11712123  T
Q  603 cacaatgaacaaaccctaattt 624  Q
    | ||| ||||||| ||||||||    
T  11712124 ctcaaggaacaaaacctaattt 11712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 314 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6267024 - 6266583
Alignment:
Q  314 tatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6267024 tatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgt--aagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagt 6266927  T
Q  414 gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 512  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266926 gaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 6266828  T
Q  513 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaa 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6266827 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaa 6266728  T
Q  612 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaa 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266727 caaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaa 6266628  T
Q  712 tcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6266627 tcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 6266583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 12647218 - 12647660
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647218 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 12647317  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647318 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 12647416  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12647417 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 12647516  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647517 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 12647614  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12647615 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 12647660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 315 - 668
Target Start/End: Original strand, 13655861 - 13656220
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655861 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 13655960  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 509  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13655961 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacc 13656060  T
Q  510 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaat 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13656061 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactat 13656160  T
Q  609 gaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctct 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13656161 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 32289937 - 32289457
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    ||||||||||||||||||| || |    ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||    
T  32289937 tgttgtgaattccgatctcaaaac----cacaccaatacaaagtaagatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgggtg--caagca 32289845  T
Q  371 ataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag 468  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  32289844 ataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaagga 32289745  T
Q  469 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaggga 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  32289744 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagaga 32289645  T
Q  569 tacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32289644 tacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttca 32289547  T
Q  667 ctctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32289546 ctcaccaaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 32289457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 4484150 - 4484614
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4484150 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca-ataacaaa--gtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatc 4484246  T
Q  397 taatctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||     
T  4484247 taatctaggaaacaaagtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa--agattgttcacccagttct 4484344  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4484345 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 4484444  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 685  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| | |    
T  4484445 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaa 4484543  T
Q  686 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4484544 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 4484614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 30833694 - 30833230
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  |   |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30833694 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattaatta---tgtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatc 30833598  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||     
T  30833597 taatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttca 30833500  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  30833499 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactt 30833400  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 685  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| | |    
T  30833399 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaagtgtttacaa 30833301  T
Q  686 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30833300 tgtttcccaacccaagataagctctaatcaaa-aaccctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 30833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 4502955 - 4503415
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4502955 tcacaccaatacaaactataatgtgtggagtaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 4503051  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4503052 taatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcg 4503147  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-t 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4503148 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 4503245  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |     
T  4503246 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 4503344  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  4503345 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 4503415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 45100100 - 45099640
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45100100 tcacaccaatacgaattatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 45100004  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  45100003 taatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcg 45099908  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-t 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45099907 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 45099810  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |     
T  45099809 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 45099711  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  45099710 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 45099640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 36205487 - 36205946
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36205487 tcacactaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 36205583  T
Q  397 taatctaggaaac-aagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| | |||||| || || ||  ||||| || || |||||||||||  |||||   |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36205584 taatctaggaatcaaagtgaaaagcagaaaccacaagcaaaatataaaaggaga--gaagagagaaacaaacacaccaa--agattgttcacccagttcg 36205679  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-t 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36205680 gtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 36205777  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 685  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||    
T  36205778 tgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacca 36205876  T
Q  686 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  36205877 tgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 36205946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 9296074 - 9295874
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9296074 gtcacgatttgcgtccgacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaatgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 9295975  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9295974 gatttggcatcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 9295875  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  9295874 g 9295874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 5723078 - 5723537
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |  ||||||| |    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5723078 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagtaaagtagtaaccaatat-caaagtgagca--caaacaataatcaacaataacaacacctagatc 5723174  T
Q  397 taatctaggaaacaagt-gagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| |||   || || |||||  ||||| || |||||||||||||||   |||   |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  5723175 taatctaggaatcaaaaagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaatagag--aaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcg 5723270  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaaggttacaagaaattagc-t 593  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5723271 gtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctt 5723369  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 686  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||    
T  5723370 tgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaat 5723468  T
Q  687 gttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5723469 gtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaaccctaaagttgcctcctttgatttcccaag 5723537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 14291913 - 14292113
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14291913 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcagtggtacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 14292012  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14292013 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgagatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 14292112  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  14292113 g 14292113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988358
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  | |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaa 36988058  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  36988059 acaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 36988155  T
Q  562 aaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||       ||||||    
T  36988156 aaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagac 36988254  T
Q  652 actcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 750  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  36988255 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 36988352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 11098599 - 11098399
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11098599 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtttgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 11098500  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11098499 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcactatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 11098400  T
Q  1030 g 1030  Q
    |    
T  11098399 g 11098399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 851 - 1044
Target Start/End: Original strand, 25410073 - 25410267
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  25410073 caaggtacgaccattccttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 25410172  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25410173 atctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaaactcaacaa 25410267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1044
Target Start/End: Original strand, 12647755 - 12647968
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12647755 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttatggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 12647854  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647855 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 12647952  T
Q  1028 aagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||| |||||||||||    
T  12647953 aagac-aatctcaacaa 12647968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 2334414 - 2334700
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  2334414 agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 2334512  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  2334513 agttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 2334611  T
Q  667 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  2334612 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaa-taccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 2334700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 851 - 1044
Target Start/End: Original strand, 3492184 - 3492378
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  3492184 caaggtacgacctgtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttcagaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 3492283  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3492284 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacaatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 3492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 30833114 - 30832921
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  30833114 caaggtacgacctgtccttatcctggaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 30833015  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30833014 agctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgtcaaattcatgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 30832921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 32289343 - 32289148
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||     
T  32289343 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagttttcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcaagatttggcaccctgcaaa 32289244  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32289243 ccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 32289148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 859 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 6266459 - 6266274
Alignment:
Q  859 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 957  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6266459 gaccattccttatcatggaaacttaacgagtaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 6266360  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266359 gcatcacgaaattgtgtcacgatgtcaaattcgtgtcacgatttccatgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 6266274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 849 - 1044
Target Start/End: Original strand, 4484728 - 4484924
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||    |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||     
T  4484728 cccaaggtacgaccagtccttatcatagaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattccttaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 4484827  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4484828 ctagctcacggcatcatgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagtaaaatctcaacaa 4484924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 365 - 648
Target Start/End: Original strand, 6594890 - 6595175
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || ||||||||||| ||| |||||   ||    
T  6594890 caagtaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaagg-gagagaagagagaa 6594988  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  6594989 acaaacacaccaaaga--ttgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac- 6595085  T
Q  562 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  6595086 aaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaa 6595175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 382 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 29868133 - 29867791
Alignment:
Q  382 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 479  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||| || |||| ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||  || ||||||      
T  29868133 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaacggagag--aagagagaaacaaacacatcaaaga-- 29868038  T
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggt 578  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||    
T  29868037 ttattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggt 29867940  T
Q  579 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc 669  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||    
T  29867939 tacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactc 29867841  T
Q  670 -tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29867840 acccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 29867791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 38312522 - 38312126
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  38312522 caagcaacaatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 38312424  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  || ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  38312423 -caaacacatcaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttac- 38312329  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  38312328 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 38312230  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||| | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  38312229 actcaatgattttcactcacacaaggtgtatacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctcaaccctaaagttacctcctttgatt 38312132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 718
Target Start/End: Original strand, 34139767 - 34140017
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaa 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      
T  34139767 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatg 34139865  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  34139866 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 34139964  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34139965 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 34140017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726929
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 45726999  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45726998 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 723741 - 724027
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  723741 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 723838  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  723839 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 723937  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  723938 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 724027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Original strand, 40739264 - 40739457
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||| |  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  40739264 caaggtacgacctgtccttatcctgaaaacttaacgagcaagtttgaaaattgtgtcacaattccacaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 40739363  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40739364 agctcacggcataacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttgtctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 40739457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 14633822 - 14634109
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||      
T  14633822 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatg 14633920  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  14633921 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 14634019  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  14634020 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaaga-actctaatcaaa-aaccctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaag 14634109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 501 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362237
Alignment:
Q  501 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 598  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaca 42362402  T
Q  599 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtt 689  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||||    
T  42362401 agctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 42362303  T
Q  690 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  42362302 tcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 42362237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 863 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 39811657 - 39811489
Alignment:
Q  863 agtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcac 961  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||| ||||       
T  39811657 agtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttgcttacggtca 39811558  T
Q  962 cccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39811557 cttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 39811489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 11151588 - 11151874
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||      
T  11151588 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 11151685  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||       ||||| ||||||||||||||     
T  11151686 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttca 11151784  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  11151785 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 11151874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 298 - 718
Target Start/End: Original strand, 17057191 - 17057615
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17057191 tcacaccaatacaaaatatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 17057287  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    |||||||||||  || |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  17057288 taatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttgacccagttc 17057383  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  17057384 ggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaaaaattagct 17057481  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcc 683  Q
    |  ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |    
T  17057482 tcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 17057580  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
     || |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17057581 aatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 17057615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 298 - 718
Target Start/End: Original strand, 17085174 - 17085598
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17085174 tcacaccaatacaaaatatgatgtgtagagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 17085270  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    |||||||||||  || |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  17085271 taatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgttgacccagttc 17085366  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  17085367 ggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaaaaattagct 17085464  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcc 683  Q
    |  ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |    
T  17085465 tcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 17085563  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
     || |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17085564 aatatttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 17085598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690386
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||      
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttac-aaagggatacaaatg 11690575  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  11690574 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 11690476  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  11690475 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actataatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 11690386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447052
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 35446982  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35446983 acaagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaa 35447052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36773733 - 36773562
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  36773733 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 36773636  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  36773635 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 483 - 648
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631900
Alignment:
Q  483 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttac 581  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 1631832  T
Q  582 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1631833 aagatattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648176
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 579  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||||||| ||||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 643  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 479 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24398055
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 577  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||    
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggg 24398129  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24398128 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 36318006 - 36318177
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  36318006 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 36318103  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36318104 ggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353184
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaa-agatacaaaagtgtt 26353254  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26353253 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 919 - 1047
Target Start/End: Original strand, 32247229 - 32247356
Alignment:
Q  919 aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 1017  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| || | ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32247229 aatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcatctc-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagac 32247327  T
Q  1018 cacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 1047  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  32247328 cacaaatttgaag-ccaatatcaacaataa 32247356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 965 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 44310548 - 44310483
Alignment:
Q  965 gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44310548 gaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 44310483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 33162447 - 33162618
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||      
T  33162447 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-agagagatacaaatg 33162544  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  33162545 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaa 33162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 11067476 - 11067305
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||      
T  11067476 agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 11067379  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  11067378 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctacccatttttccaatttcaccaa 11067305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 515 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  515 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaaca 613  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaa-gagatacaaa-ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaaca 13121804  T
Q  614 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13121803 aaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 481 - 594
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490261
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagttacaaaagagtt 17490246  T
Q  580 acaagaaattagctt 594  Q
    |||||||||||||||    
T  17490247 acaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 486 - 648
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288278
Alignment:
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaag 584  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||  |||||||  ||||||||     
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttac-aaagaaatacaaatgggttacaat 42288213  T
Q  585 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42288214 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 42288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 858 - 1043
Target Start/End: Original strand, 19344824 - 19345010
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  || |||| | | |||||    
T  19344824 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccatgattttgcttccagcaaacttggctca 19344923  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| | |||  ||||| |||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  19344924 cggcatctccg--atcgtatcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 19345010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 531 - 648
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  531 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 628  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |   || ||||||||||||||||| ||    
T  7815323 ctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaac 7815421  T
Q  629 ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  7815422 ctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 858 - 1029
Target Start/End: Original strand, 19349682 - 19349854
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | | |||||    
T  19349682 tgaccagtccttatcagagatacttaaccaacaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttggctca 19349781  T
Q  956 cggca-ccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| | |||  |||||||||||||  | |||| | | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19349782 cggcatctccg--atcgtgtcacgattgccaaattgcgacacgattcctctgttcttccaaaccacaaatttgaa 19349854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 477 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284930
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 555  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450671
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttc 556  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 17450671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451173
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |  ||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgaatt 7451188  T
Q  580 acaagaaattagctt 594  Q
    |||||||||||||||    
T  7451187 acaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 983 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 28258729 - 28258668
Alignment:
Q  983 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28258729 caaaatcgtgtcacgatttctctgtttttccaaaccacaaatttgaagccaaatttcaacaa 28258668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 492 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28671989
Alignment:
Q  492 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 590  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 8389681 - 8389636
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8389681 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 8389636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 840 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28258853 - 28258713
Alignment:
Q  840 tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgca 938  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||  ||    
T  28258853 tgcgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacaaaattgtgccacgatttgaca 28258755  T
Q  939 ccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
    |||||||| | |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  28258754 ccctgcaaaccagctcacggcattacaaaatcgtgtcacgat 28258713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 983 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 36757477 - 36757430
Alignment:
Q  983 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36757477 caaaatcgtgtcacgatttttctgttcttccaaaccacaaatttgaag 36757430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 33528155 - 33528093
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 1047  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  33528155 aaattgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattaacaacaataa 33528093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 614 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 39284920 - 39284770
Alignment:
Q  614 aaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa-------gacactcaatgattttctctctac-aaggtgtttcccatgttttc-aacccaagaga 703  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||       || |||||||||||||| |||  | ||||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  39284920 aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 39284821  T
Q  704 tactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  39284820 -actctaatcaaaga-ccctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 39284770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 10706783 - 10706738
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  10706783 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaacaacaaatttgaag 10706738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 21630511 - 21630556
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  21630511 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaactacaaatttgaag 21630556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 39483443 - 39483488
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39483443 aaatcgtgtcacaatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 39483488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 723569 - 723617
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  723569 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 723617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 519 - 644
Target Start/End: Original strand, 14202450 - 14202569
Alignment:
Q  519 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaacc 617  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||       ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |    
T  14202450 ggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaa--ggatga-----gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-c 14202541  T
Q  618 ctaatttctaccc-ttttcccaatctca 644  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14202542 ataatttctacccattttcccaatctca 14202569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 989 - 1045
Target Start/End: Original strand, 33118696 - 33118752
Alignment:
Q  989 cgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33118696 cgtgtcacgatttctctattctcccaaaacacaaatttgaagacaaatttcaacaat 33118752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 34139595 - 34139643
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34139595 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 34139643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 36987897 - 36987945
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36987897 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 36987945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42362691 - 42362643
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42362691 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 42362643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 991 - 1030
Target Start/End: Original strand, 20522794 - 20522833
Alignment:
Q  991 tgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20522794 tgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 20522833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11690833 - 11690787
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 344  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11690833 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 11690787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 900 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 7450902 - 7450869
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgatt 933  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7450902 atcgtgtcacgttttcccaaatcgtgtcacgatt 7450869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 23078002 - 23077957
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  23078002 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccaaaattttgaag 23077957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 480 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 42064770 - 42064725
Alignment:
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 525  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  42064770 ttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagaga 42064725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 504 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412118
Alignment:
Q  504 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 549  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 1044
Target Start/End: Original strand, 32060154 - 32060889
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32060154 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 32060253  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32060254 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgaccta 32060352  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaa--gggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaa 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32060353 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcacta 32060452  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060453 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 32060552  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacacttta-ta 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||| | ||    
T  32060553 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-accctttgatttcccaagtctctctcttccaacctcttcccttcaaatctgcacaagaacacttaagta 32060651  T
Q  807 ctagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgt 906  Q
    |||| || ||||||   |||||  |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32060652 ctagtcttcctctgttccaatcgtgtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgt 32060751  T
Q  907 cacga-tttcccaaatcgtgtcacgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttcc 1003  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32060752 cacgattttcccaaatcgtgccacga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttcc 32060849  T
Q  1004 ctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32060850 ctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaacaa 32060889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 20344231 - 20343789
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacacca---cctagatctaatctaggaaacaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20344231 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtg--caagcaacaatcgacaaaaaaccagcacctagatctaatctaggaaacaa 20344134  T
Q  412 gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20344133 gtgagaaacacaaaacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaa-cttgaccta 20344035  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatga 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344034 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatga 20343935  T
Q  611 acaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343934 acaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 20343835  T
Q  711 atcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20343834 atcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgattccccaag 20343789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 18388592 - 18389034
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388592 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 18388691  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388692 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaagagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 18388790  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18388791 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 18388890  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388891 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 18388988  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18388989 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 18389034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 18392028 - 18392470
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392028 atgatgtgtggagcgacagagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 18392127  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392128 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 18392226  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18392227 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 18392326  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392327 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 18392424  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18392425 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 18392470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 6594390 - 6594832
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6594390 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 6594489  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594490 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 6594588  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6594589 ctctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 6594688  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594689 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 6594786  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6594787 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 6594832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 271 - 756
Target Start/End: Original strand, 43503947 - 43504431
Alignment:
Q  271 tgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagca 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43503947 tgttgtgaattccgatctcaaatcgtgtcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaa-caaagtgtgtgtgcaagca 43504045  T
Q  371 ataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagc 469  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  43504046 ataatcaacaaaaa--cagctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagac 43504143  T
Q  470 accaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggat 569  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  43504144 accaa-gagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagat 43504242  T
Q  570 acaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43504243 acaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttct 43504341  T
Q  667 ctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43504342 ctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 43504431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 6592172 - 6592614
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6592172 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 6592271  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||| |||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592272 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 6592370  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6592371 ctctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 6592470  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592471 aacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 6592568  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6592569 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 6592614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 415 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24790075 - 24789733
Alignment:
Q  415 agaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790075 agaaacacaatgcacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctact 24789977  T
Q  514 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaac 612  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24789976 ctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaac 24789877  T
Q  613 aaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789876 aaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaat 24789777  T
Q  713 caaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24789776 caaagaaccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 24789733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 362 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 39731656 - 39731261
Alignment:
Q  362 gtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaaga 459  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  39731656 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagagga 39731557  T
Q  460 aaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctta 559  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39731556 aaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta 39731459  T
Q  560 caaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaa 657  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39731458 caaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaa 39731360  T
Q  658 tgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39731359 tgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttgatttcccaag 39731261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 24789639 - 24789426
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24789639 gtcaagatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 24789540  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789539 gatttggcaccctgcaaactagctcacggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 24789440  T
Q  1030 gacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||    
T  24789439 gacaaatctcaaca 24789426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 781 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 20343762 - 20343500
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacactttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatac 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||  |||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  20343762 tcaaatctgcacaagaacactttatactagtcttcctctgttgaaatcgtgtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcaaggatac 20343663  T
Q  881 ttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 979  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343662 ttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgacacgattttgcatccggcaacctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 20343563  T
Q  980 tgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20343562 tgccacaatcgcgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 20343500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 48409153 - 48408687
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48409153 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 48409057  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||| | ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||| || ||||||||||||||||    
T  48409056 taatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-gaaattgttcacccagttc 48408959  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagc 592  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  48408958 ggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagc 48408859  T
Q  593 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcc 683  Q
     |||||||||| |||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  48408858 tttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 48408760  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48408759 aatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 48408687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 25766779 - 25767237
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  || ||||||| | |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25766779 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaataa-caaagtgagcg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 25766875  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||||||| ||| ||| |   |||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  25766876 taatctaggtatcaaagtgaaaaacacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaatagagaaacaaacacaccaa-gagattgttcacccagttc 25766973  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg--ttacaagaaattagc 592  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  25766974 ggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagc 25767072  T
Q  593 tt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttc-ccaatctcac----caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 686  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||    
T  25767073 tttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaat 25767171  T
Q  687 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||| | |   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25767172 gtttccca---aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttgatttctcaag 25767237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 369 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 35854194 - 35853804
Alignment:
Q  369 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaa 466  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || || || |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||    
T  35854194 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaa 35854096  T
Q  467 agcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagg 566  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  35854095 cacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaaga 35853998  T
Q  567 gatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactca 656  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||    
T  35853997 gatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactca 35853899  T
Q  657 atgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 752  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  35853898 atgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctacctttgatttcc 35853804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 315 - 571
Target Start/End: Original strand, 1560497 - 1560757
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1560497 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagtatattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 1560596  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1560597 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggttacccagttcggtccaaacttgacct 1560695  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1560696 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 578 - 756
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562278
Alignment:
Q  578 ttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggt 1562200  T
Q  678 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgattccccaag 1562278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 29991401 - 29990940
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| |||||||  |  ||||||| |    |||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  29991401 agtcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaagaaaagtagtaaccaatat-caaagtgagca--caagtaataatcaacaataacaacacctaga 29991305  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    |||||| |||||| ||| | || || |||||  ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  29991304 tctaatataggaatcaaagagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagtt 29991209  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29991208 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttatta-gaaagagatacaaaagggttacaagaaattagc 29991110  T
Q  593 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
     |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |     
T  29991109 tttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 29991011  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  29991010 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-cctttgatttcccaag 29990940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 2058393 - 2058592
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2058393 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 2058492  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2058493 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctc-aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 2058591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 4179119 - 4178660
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4179119 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgaatgt--aagcaataatcaacaataacagcacctagatc 4179023  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcg 495  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||| |||| |    
T  4179022 taatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacctagtttg 4178927  T
Q  496 gtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-t 593  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4178926 gttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctt 4178829  T
Q  594 tgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 685  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |    
T  4178828 tcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaa 4178730  T
Q  686 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  4178729 tgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttctcaag 4178660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 789 - 1030
Target Start/End: Original strand, 21640167 - 21640411
Alignment:
Q  789 gcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacg 886  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  21640167 gcacaagaacacaatatatactagtctccttctgaagcaatcgtgtcacgatttgcgtccgttccaaggcatgaccagtccttatcagtgatacttaatg 21640266  T
Q  887 agcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaa 985  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21640267 agcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaa 21640366  T
Q  986 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21640367 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 21640411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 23555387 - 23554925
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23555387 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacaacacctagatc 23555291  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  || ||||||  |||||||||||||||    
T  23555290 taatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacatcaaaga--ttgttcacccagttc 23555195  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  23555194 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaggtacaaaagtgttacaagaaattagct 23555096  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcc 683  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  23555095 tcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 23554997  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||  |||| |  ||||||||||||||||    
T  23554996 aatgtttcccaactcaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctgaagttacctcctttgatttcccaag 23554925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 18392568 - 18392780
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18392568 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 18392667  T
Q  930 gattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18392668 gaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccaaaccacaaatttga 18392766  T
Q  1029 agacaaatctcaaca 1043  Q
    |||| ||||||||||    
T  18392767 agac-aatctcaaca 18392780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 789 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 20357284 - 20357040
Alignment:
Q  789 gcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacg 886  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20357284 gcacaagaacacaatatatactagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttgcgtctgacccaaggtttgaccggtccttatcaaggatacttaacg 20357185  T
Q  887 agcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaa 985  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20357184 agcaagtttctgaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcaccttgaaatcgtgtcacgatgccaa 20357085  T
Q  986 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20357084 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 20357040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 6592709 - 6592921
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6592709 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 6592808  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592809 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 6592906  T
Q  1028 aagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6592907 aagac-aatctcaaca 6592921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Original strand, 21646448 - 21646643
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  21646448 cccaaggtatgaccagttcttatcaaggatacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 21646547  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21646548 ccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaatttgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatgtcaaca 21646643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Original strand, 43504526 - 43504721
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  43504526 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacgatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 43504625  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43504626 ccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagctaaatctcaaca 43504721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1044
Target Start/End: Original strand, 6594925 - 6595138
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt-cccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6594925 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccac 6595024  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6595025 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgtttttccagaccacaaatttg 6595122  T
Q  1028 aagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6595123 aagac-aatctcaacaa 6595138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 365 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 25616137 - 25615785
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || |||| |||||||||||  |||| | ||||   ||    
T  25616137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaagagagaag-aagagagaa 25616039  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25616038 acaaacacaccaaaga--ttgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttaca 25615941  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaat 658  Q
    |||  ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  25615940 aaa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactcaat 25615846  T
Q  659 gattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
    |||||||||||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615845 gattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 849 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 39731128 - 39730933
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  39731128 cccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaa 39731029  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39731028 ccagctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 39730933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Original strand, 18409206 - 18409399
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |     
T  18409206 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacaagcaagtttgagaatcgtgtcacgatttctcaagatcgtgtcatgatttggcaccctgcaaacc 18409305  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409306 agctcacggcaccacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgttacgatttctctgttcttccagaacacaaatttgaagccaaatctcaaca 18409399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Original strand, 18414082 - 18414275
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |     
T  18414082 caaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacaagcaagtttgagaatcgtgttacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgccctgcaaacc 18414181  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18414182 agctcacggcaccacaaaatcgtgccacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccataaatttgaagccaaatctcaaca 18414275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 851 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 48408591 - 48408397
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  48408591 caaggtacgaccagtccttatcctagaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 48408492  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48408491 agctcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 48408397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 831 - 999
Target Start/End: Complemental strand, 1533116 - 1532947
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1533116 gtcacgatttgtgtatgtcccaaggtataaccagtccttatcaaggatacttaacgagtaagtttcacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcac 1533017  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgat 999  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1533016 gatttggcaccctgcaaactagctcatggcacctcaaaatcatgtcacgatgccaaattcgtgtcacgat 1532947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 34310810  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34310811 tgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Original strand, 12406663 - 12406845
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  | |||||    
T  12406663 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcttgcaa 12406761  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12406762 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 12406845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 831 - 1047
Target Start/End: Original strand, 1562375 - 1562591
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  1562375 gtcacgatttgcgtccgtcacaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttaccaaaatcgtgacac 1562474  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    |||||   ||||   || | |    |  | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562475 gatttaaaacccaaaaaacaaaaaaaaagaaacacgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1562574  T
Q  1030 gacaaatctcaacaataa 1047  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  1562575 gac-aatctcaacaataa 1562591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 14069830 - 14070116
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  14069830 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 14069927  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  14069928 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 14070026  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgtt-ttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  14070027 ctcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcagccctaaagttacctcctttgatttcccaag 14070116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 14379858 - 14380144
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  14379858 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 14379955  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  14379956 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 14380054  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgtt-ttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | |||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  14380055 ctcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcagccctaaagttacctcctttgatttcccaag 14380144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 382 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 19502443 - 19502083
Alignment:
Q  382 aacaccacctagatctaatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 479  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||  |||||   |||||||  ||||||  |||    
T  19502443 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaaaataaagggaga--gaagagagaaacaaacacaccaa--aga 19502348  T
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gt 578  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  19502347 ttgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagt 19502249  T
Q  579 tacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 668  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  19502248 tacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcact 19502150  T
Q  669 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt 736  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  19502149 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagtt 19502083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30025015
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 30024826  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  30024827 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 30024925  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | | | ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  30024926 ctcacccaaggtgtttacaacgtttttcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 30025015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 858 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 21811924 - 21811745
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  21811924 tgaccagtccttatcagagatacttaactagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcaccctgcaaacattgctca 21811825  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 1036  Q
    ||||| | | | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21811824 cggcatctc-agatcgtgtcacgatggcaaaatcgtgacacgattcctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaat 21811745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 24024004 - 24023831
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 956  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| |    
T  24024004 tgaccagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctctc 24023905  T
Q  957 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     ||  |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24023904 tgccacttgaaatcgtgccacgatgccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 24023831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 863 - 1030
Target Start/End: Original strand, 4873541 - 4873709
Alignment:
Q  863 agtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcac 961  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||| || |||||      
T  4873541 agtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaattgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactatcttacggcca 4873640  T
Q  962 cccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4873641 cttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 4873709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 27348095 - 27347817
Alignment:
Q  369 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 465  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || ||||||||  |||||   ||| |||  |||    
T  27348095 caataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagtgagagaagagaggaa--caa 27347998  T
Q  466 aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaag 565  Q
    |  |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27347997 acacaccaaaga--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttac-aaag 27347902  T
Q  566 ggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347901 agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 22270140 - 22269973
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  22270140 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 22270043  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270042 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 41317431 - 41317602
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  41317431 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 41317528  T
Q  577 g-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41317529 gattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 879 - 1046
Target Start/End: Original strand, 25767381 - 25767543
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25767381 acttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcac 25767480  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 1046  Q
    ||||||||| | |||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25767481 gatgccaaatttgtgtcacgatttc------tttccagaccacaaatttgaagccaaatatcaacaata 25767543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 831 - 944
Target Start/End: Original strand, 18389132 - 18389246
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18389132 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgtcac 18389231  T
Q  930 gattttgcaccctgc 944  Q
    || ||||||||||||    
T  18389232 gaatttgcaccctgc 18389246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 48489777 - 48489316
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||    ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48489777 tcacaccaataccaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaacatg--agcaataatcaacaataacaacacctagatc 48489681  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| || |||   ||| |||  ||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  48489680 taatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggcgagaagagaggaa--caaacacaccaaaga--ttgtttacccagttc 48489585  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| || | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48489584 ggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagct 48489487  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcc 683  Q
    |  |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| | |||||||||| |||   |||||||||| |    
T  48489486 tcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcacccaaggtgtttac 48489388  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  48489387 aatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accatcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 48489316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18126928 - 18126529
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||  || |    |    
T  18126928 caagcaataatcaagaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaaaatagagga 18126829  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  |||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  18126828 acaaacacaccaaaga--ttgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttac- 18126733  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttg-acaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||       ||| ||    
T  18126732 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaatgaacaaaac 18126634  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||| |||   |||| ||||| | ||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  18126633 actcaatgattttcactcacccaagttgtttacaatgtttcccaacccatgaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatt 18126536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359485
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 578  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 8359414  T
Q  579 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8359415 tacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 41649008 - 41649292
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  41649008 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 41649105  T
Q  576 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctc 667  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |    
T  41649106 ggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 41649204  T
Q  668 tcta--caaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  41649205 t-tacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaataaaaga--ccttaaccctaaagttaactcctttgatttcccaag 41649292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 299 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24790349 - 24790230
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatcta 398  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790349 cacaccaatgcaaagtatgatgtgtggagcaacggaaagtggtaaccaccaaacaaagtgcgtg--caagtaataatcaacaaaacaccacctagatcta 24790252  T
Q  399 atctaggaaacaagtgagaaac 420  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  24790251 atctaggaaacaggtgagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 38671219 - 38671505
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||   |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  38671219 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagtgatacaaatg 38671316  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  38671317 tgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcg 38671415  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  38671416 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 38671505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 483 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608737
Alignment:
Q  483 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttac 581  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttac 29608805  T
Q  582 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29608804 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 501 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491470
Alignment:
Q  501 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 598  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 48491629  T
Q  599 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgtt 689  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   ||| |||||| | |||||    
T  48491628 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtt 48491530  T
Q  690 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 750  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  48491529 tcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 48491470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 485 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  485 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 583  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 6432037  T
Q  584 gaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6432036 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 43864590 - 43864129
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| ||   | ||||  |||    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43864590 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagtaaaggaaagtggtaatca-atatcaaa--gtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatc 43864494  T
Q  397 taatctaggaaac-aagtgagaaacacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||||| | ||||| || |||||||| |||||  |||||    ||||||  ||||  |   |||||| |||||||||    
T  43864493 taatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaagggaga--gaagagaggaacaaacacacc--atctattgttgacccagttc 43864398  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagct 593  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43864397 ggtcc-aacttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaggaaattagct 43864300  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcc 683  Q
    |  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |    
T  43864299 tcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttac 43864201  T
Q  684 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
     ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  43864200 aatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 43864129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 718
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733215
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 31733063  T
Q  576 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||       ||||||||||||||||||||     
T  31733064 ggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 31733162  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31733163 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 31733215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 489 - 718
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674189
Alignment:
Q  489 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaa 587  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47673953 cagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaa 47674049  T
Q  588 ttagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggt 677  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  47674050 ttagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 47674148  T
Q  678 gtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 718  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47674149 gtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258995
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaatgagtt 3259065  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3259064 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 4586443 - 4586046
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  4586443 caagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaagggagagaagagaggaa- 4586345  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  ||| |||||  ||||  ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4586344 -caaacacacgaaaga--ttgtcgacccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 4586250  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| |||| |||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  4586249 aaagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 4586151  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||| | |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  4586150 actcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-agcctcaaccctaaagttacatcctttgatt 4586053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |    
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatg 8153416  T
Q  577 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8153415 agttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 594
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358167
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 32358152  T
Q  580 acaagaaattagctt 594  Q
    |||||||||||||||    
T  32358153 acaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 47676133 - 47676419
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||      
T  47676133 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttac-aaagagatacaaatg 47676230  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||| ||||||||     
T  47676231 ggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttca 47676329  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  47676330 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttatct-cctttgatttcccaag 47676419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599502
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||| | |||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagtt 48599432  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48599433 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 1113828 - 1113542
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  1113828 agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 1113731  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  1113730 ggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 1113632  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||| ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  1113631 ctcacccaagttgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacttcctttgatttcccaag 1113542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 879 - 1043
Target Start/End: Original strand, 47264102 - 47264267
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||| ||   | ||||||||||||    
T  47264102 acttaaccagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcacacaattgtgccacgatttgacaccctacaaaccagctcacgacattacaaaatcgtgtcac 47264201  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47264202 gatgccaaaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaaccacaaatttgaagccaaatttcaaca 47264267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 840 - 1043
Target Start/End: Original strand, 2479757 - 2479960
Alignment:
Q  840 tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgca 938  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| | ||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||  ||    
T  2479757 tgcgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccaacaagtttgaaaatcgtgtaacgatttcacaaaatcgtgacacgatttgaca 2479855  T
Q  939 ccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatct 1038  Q
    |||||||| | |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |    
T  2479856 ccctgcaaaccagctcacggcattagaaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacaatttctctgttcttacaaaccacaaatttgaagccaaattt 2479955  T
Q  1039 caaca 1043  Q
    |||||    
T  2479956 caaca 2479960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 474 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 2390456 - 2390301
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| |||||||    
T  2390456 aagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattac-aaagagatacaa 2390359  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 630  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2390358 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508874
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4508804  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4508805 acaagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 863 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 31109251 - 31109082
Alignment:
Q  863 agtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct-agctcac-ggc 959  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || |||| || |||    
T  31109251 agtccttatcagttatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaacttagcttacaggc 31109152  T
Q  960 accccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31109151 actt-gaaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 31109082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 486 - 648
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 584  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaag 2361075  T
Q  585 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2361076 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 4253529 - 4253697
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 579  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||| | |||| |||| |||||| ||    
T  4253529 tgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggtt 4253627  T
Q  580 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  4253628 acatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 26417598 - 26417201
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| || | ||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  26417598 caagcaataatcaacaataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 26417500  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  |||||| || |||||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26417499 -caaacacaccaa-gaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac- 26417405  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  26417404 aaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 26417306  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||| | |   |||||||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  26417305 actcaatgattttcacccgctcaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatt 26417208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 36146405 - 36146576
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  36146405 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 36146502  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146503 ggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 481 - 756
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105676
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggtt 31105491  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc- 669  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||     
T  31105492 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactca 31105590  T
Q  670 tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
      |||||||||| | |||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  31105591 cccaaggtgtttacaatgtttctcaccccaagata-actataatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 31105676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Original strand, 12397311 - 12397480
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||          |||  ||   |||||||     
T  12397311 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaa----------gatcatgg--cctgcaaa 12397397  T
Q  948 ctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12397398 ctagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgataccaaaatcgtgtcgcgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 12397480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 969 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 1532958 - 1532884
Alignment:
Q  969 tcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1532958 tcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatatcaaca 1532884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 645
Target Start/End: Original strand, 495980 - 496148
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||      
T  495980 agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatg 496077  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 645  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  496078 ggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 488 - 629
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  488 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 586  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaa 23565166  T
Q  587 attagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 629  Q
    ||||| ||  ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23565167 attagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 966 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 44847696 - 44847617
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44847696 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttttaaaccacaaatttgaagccaaatttcaacaat 44847617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 478 - 623
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759339
Alignment:
Q  478 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag- 576  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |     
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatga 2759292  T
Q  577 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatt 623  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2759293 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 646 - 756
Target Start/End: Original strand, 24514934 - 24515043
Alignment:
Q  646 caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctt 744  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  24514934 caagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga-ccctaaaccctaaagttgcttcctt 24515031  T
Q  745 tgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||    
T  24515032 tgatttcccaag 24515043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510716
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4510646  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4510647 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaa 4510716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512558
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4512488  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4512489 acaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttccaaatctcaccaa 4512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 16880475 - 16880648
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatcta-gctca 955  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||| |||||    
T  16880475 tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgacacgattttgcttccagcaaactaggctca 16880574  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | || | ||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16880575 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgatggcaaaatcgtgacacgattcctctgctcttccaaaccactaatttgaag 16880648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 16885330 - 16885503
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatcta-gctca 955  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||| |||||    
T  16885330 tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacaatttcccaagatcgtgacacgattttgcttccagcaaactaggctca 16885429  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | || | ||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16885430 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgatggcaaaatcgtgacacgattcctctgctcttccaaaccactaatttgaag 16885503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 486 - 643
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328556
Alignment:
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 584  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| || || ||| |   |||| |||||||||| ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  585 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctc 643  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 24265862 - 24265689
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  24265862 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 24265763  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  24265762 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaag 24265689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 491 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23344130 - 23343975
Alignment:
Q  491 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaatt 589  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||||||    
T  23344130 gttcggtccaa-cttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaa-gatatactaaagggttacaagaaatt 23344035  T
Q  590 agcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||| | |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344034 agcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 858 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 24261006 - 24260926
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgc 937  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24261006 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgattttgc 24260926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 937 - 1043
Target Start/End: Original strand, 21983761 - 21983867
Alignment:
Q  937 caccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 1036  Q
    |||||||||| | |||||||| ||   | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  21983761 caccctgcaaaccagctcacgacattgcaaaatcgtgtcacgatgatgaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaatt 21983860  T
Q  1037 ctcaaca 1043  Q
     ||||||    
T  21983861 ttcaaca 21983867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 474 - 594
Target Start/End: Original strand, 6359946 - 6360065
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  6359946 aagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 6360043  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt 594  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  6360044 atgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 12097864 - 12098027
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||        || ||||||||      
T  12097864 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt--------agagatacaaatg 12097953  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12097954 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 12098027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 900 - 1044
Target Start/End: Original strand, 21989388 - 21989532
Alignment:
Q  900 atcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgat 999  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||   | |||||||| | |||||||| ||   | ||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  21989388 atcgtgtcacgtttcacaaaatcgtgccacgattggtcgccctgcaaaccagctcacgacattgcaaaatcgtgtcacgatgatgaaatcttgtcacgat 21989487  T
Q  1000 ttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21989488 ttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaactttcaacaa 21989532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396384
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 580  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||   |||| ||||||||| ||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaaatgtta 18396387  T
Q  581 caa 583  Q
    |||    
T  18396386 caa 18396384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 477 - 563
Target Start/End: Original strand, 24525499 - 24525584
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24525499 agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 648
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  577 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 36574517 - 36574683
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 579  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||  |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||   |||| |||| |||||| ||    
T  36574517 tgtttacccagtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtt 36574614  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36574615 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttccccaatctctccaa 36574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814530
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 555  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 488 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518988
Alignment:
Q  488 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 986 - 1043
Target Start/End: Original strand, 18390506 - 18390562
Alignment:
Q  986 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18390506 aatcgtggcacgatttccctgttcttctaaaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 18390562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 968 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 24260895 - 24260833
Alignment:
Q  968 atcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24260895 atcgtgtcacgatggccaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaag 24260833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 79955 - 80000
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  79955 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaatcacaaatttgaag 80000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 539 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518795
Alignment:
Q  539 tccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgac-aagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttc 635  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||| |  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacc-taatttctacctattttc 31518808  T
Q  636 ccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||    
T  31518807 ccaatctcaccaa 31518795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 47675959 - 47676007
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47675959 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 47676007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1113998 - 1113952
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 344  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1113998 tcacatcaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtggtaac 1113952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 781 - 828
Target Start/End: Original strand, 2058322 - 2058371
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatc 828  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2058322 tcaaatctgcacaagaacacaatatatactagccttcctctgaagcaatc 2058371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1000
Target Start/End: Original strand, 4509335 - 4509369
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 1000  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4509335 aaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatt 4509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1000
Target Start/End: Original strand, 4511177 - 4511211
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 1000  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4511177 aaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatt 4511211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 6431501 - 6431467
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 1000  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6431501 aaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatt 6431467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Original strand, 14069656 - 14069702
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 344  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14069656 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 14069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1000
Target Start/End: Original strand, 14070348 - 14070382
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 1000  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14070348 aaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 14070382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Original strand, 14379684 - 14379730
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 344  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14379684 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 14379730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1000
Target Start/End: Original strand, 14380376 - 14380410
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 1000  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14380376 aaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 14380410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 344
Target Start/End: Original strand, 41648836 - 41648882
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaac 344  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  41648836 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaac 41648882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 558
Target Start/End: Original strand, 5513668 - 5513743
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt 558  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || | |||| ||||||||    
T  5513668 tgtttacccagttcagtccaaa-ttgacctactctggaggtgagattg-attctccaattcagtgtcaatgagttctt 5513743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 28617234 - 28617182
Alignment:
Q  576 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 629  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28617234 ggttacaagaaattagcttaa-aagctcacaaagaacaaaacctaatttctacc 28617182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 984 - 1029
Target Start/End: Original strand, 49092237 - 49092282
Alignment:
Q  984 aaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  49092237 aaaatcgtgtcacaatttctctgttcttccaaactacaaatttgaa 49092282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 116)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 8395940 - 8395191
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8395940 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 8395841  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaa-ggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395840 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 8395742  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8395741 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatg 8395642  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395641 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 8395544  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatacta 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395543 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaagtctctctcttccaaccctctctcttcaaatctgcacaagaacactttatacta 8395445  T
Q  810 gcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--------------------tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagc 889  Q
    |||| ||||||  | ||||  |||||||||                    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8395444 gccttcctctgttgaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgatctgcgtaccacccaagaaacgaccagtccttatcacggatacttaacgagc 8395345  T
Q  890 aagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcacgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaa 986  Q
    |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  8395344 aagtttctggattgtgtcacgattttcccaaatcgtgctacga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcacgataccaaa 8395247  T
Q  987 atcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8395246 atcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 8395191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 315 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 8393731 - 8392982
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8393731 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacgaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 8393632  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaa-ggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 510  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393631 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 8393533  T
Q  511 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8393532 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatg 8393433  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393432 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgatt--ctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 8393335  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaaatctgcacaagaacactttatacta 809  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |                        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393334 aatcaaagaaccataaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaggtctctctcttccaaccctctctcttcaaatctgcacaagaacactttatacta 8393236  T
Q  810 gcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--------------------tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagc 889  Q
    |||| ||||||  | ||||  |||||||||                    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8393235 gccttcctctgttgaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgatctgcgtaccacccaagaaaagaccagtccttatcacggatacttaacgagc 8393136  T
Q  890 aagtttcacgatcgtgtcacga-tttcccaaatcgtgtcacgattttgca-ccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaa 986  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  8393135 aagtttctggatcgtgtcacgattttcccaaatcgtgccacga-tttgcacccctgcaaccctagctcacggca-tccgaaatcgtgtcacgataccaaa 8393038  T
Q  987 atcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8393037 atcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagac-aatctcaaca 8392982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 270 - 756
Target Start/End: Original strand, 31495098 - 31495593
Alignment:
Q  270 atgttgtgaattccgatctcgaatcgagtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagc 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31495098 atgttgtgaattccgatctcaaatcgtgtcataccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccatcaa-caaagtgtgtgtgcaagc 31495196  T
Q  370 aataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaagga--------gagggaagaagaa 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || || |||||| |||||||||||||||        ||||||||| |||    
T  31495197 aataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaa 31495296  T
Q  461 aacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 560  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31495297 aacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttac 31495395  T
Q  561 aaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaa 657  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495396 aaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaa 31495494  T
Q  658 tgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31495495 tgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actataaaccctagagttactccctttgatttcccaag 31495593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 7125238 - 7124794
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7125238 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 7125139  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  7125138 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttcacccagttcggtctttgcttgaccta 7125040  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  7125039 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatg 7124940  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124939 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 7124840  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7124839 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 7124794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 7123019 - 7122575
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7123019 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 7122920  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  7122919 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgaccta 7122821  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  7122820 ctatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatg 7122721  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122720 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 7122621  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7122620 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 7122575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5138627 - 5138183
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5138627 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagt 5138529  T
Q  414 gagaaacacaatacacaat-cacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 509  Q
    | |||||| |  |  |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5138528 gtgaaacaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacc 5138430  T
Q  510 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcaca 606  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  5138429 tactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcact 5138330  T
Q  607 atgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatac 706  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138329 atgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtatttcccatgttttcaacccaagagatac 5138232  T
Q  707 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5138231 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 5138183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5136402 - 5135957
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5136402 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagcttattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagt 5136304  T
Q  414 gagaaacacaatacacaat-cacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 509  Q
    | |||||| |  |  |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5136303 gtgaaacaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacc 5136205  T
Q  510 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcaca 606  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  5136204 tactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcact 5136105  T
Q  607 atgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagata 705  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5136104 atgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtatttcccatgtttttcaacccaagagata 5136007  T
Q  706 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5136006 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 5135957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44882458 - 44882187
Alignment:
Q  2 caccttctccctcttaagacaaaaagaagaaagcatttaatacattatgcatgaaagtacgccacacctagcaaaccaannnnnnnnn--aaattatttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||    
T  44882458 caccttctccctcttaagacaaaaagaagaaagcatttaatacattatgcatgaaagtacgccacacctagcaaaccaattttttttttaaaattatttt 44882359  T
Q  100 gctattggtctagtgcgcaacacagtcaaataaacacagacacacatggagggttgctattggcctattggcctgatgttccgaaaaaaggaaaagattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44882358 gctattggtctagtgcgcaacacagtcaaataaacacagacacacatggagggttgctattggcctattggcctgatgttccga-aaaaggaaaagattg 44882260  T
Q  200 ttaccaaaaggaaagttacttggttctcaagtagaacccatagctatcccaagttattggtgttttataaatg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44882259 ttaccaaaaggaaagttacttggttctcaagtagaacccatagctatcccaagttattggtgttttataaatg 44882187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 13992113 - 13992569
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13992113 tcacaccaatacgaaatatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaataa-caaagtgagtg--caagcaataatcaacaataacagcacctagatc 13992209  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaa-gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    ||||||||| | ||| |||| || |||||  ||||| || || ||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||||||  ||||||||| |||||    
T  13992210 taatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaatcacaagcaaaaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacctagttc 13992306  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattag-c 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||      
T  13992307 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac--aagagatacaaaagagttacaagaaattagat 13992404  T
Q  593 ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt 690  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||    
T  13992405 ttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttt 13992503  T
Q  691 -tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
      |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  13992504 cccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctacctttgatttcccaag 13992569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Original strand, 56178458 - 56178919
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  56178458 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataataaacaataacaacacctagatc 56178554  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttc 494  Q
    |||||||||||  || |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  56178555 taatctaggaatgaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcacccagttc 56178650  T
Q  495 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56178651 ggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagct 56178749  T
Q  594 t-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 684  Q
    |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |     
T  56178750 tcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaca 56178848  T
Q  685 atgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  56178849 atgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accttcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 56178919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 387 - 756
Target Start/End: Original strand, 29999719 - 30000088
Alignment:
Q  387 cacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 485  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||||| || |||| ||||||||||  ||||   |||||||  ||||||      |||||    
T  29999719 cacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaaacacaaaccacaagcaaaagacaaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa------tgttc 29999810  T
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29999811 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaag 29999910  T
Q  585 aaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaagg 676  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| ||||||| |||  |||||    
T  29999911 aaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcaccaagg 30000009  T
Q  677 tgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  30000010 tgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-cctttgatttcccaag 30000088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 853 - 1030
Target Start/End: Original strand, 24742387 - 24742565
Alignment:
Q  853 aggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||    
T  24742387 aggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactag 24742486  T
Q  952 ctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24742487 ctcacggcacctcgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 24742565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 859 - 1043
Target Start/End: Original strand, 31495717 - 31495902
Alignment:
Q  859 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 957  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  31495717 gaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacg 31495816  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495817 gcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 31495902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Original strand, 13992686 - 13992879
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  13992686 caaggtatgaccagtccttatcatgaaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgatttcccaaaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 13992785  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13992786 agctcacgacatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 13992879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 298 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 48143394 - 48142927
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatc 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48143394 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatat-caaagtgaaca--caagcaataatcaacaataacaacacctagatc 48143298  T
Q  397 taatctaggaaacaa-gtgagaaa----cacaata-cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccca 490  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||    ||||| | ||||| || |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  48143297 taatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcaccca 48143202  T
Q  491 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatt 589  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  48143201 gtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-tgaagagatacaaaagggttacaagaaatt 48143103  T
Q  590 agctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtg 678  Q
    |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  48143102 agcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtg 48143004  T
Q  679 tttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  48143003 tttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 48142927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 7122479 - 7122274
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7122479 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 7122380  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7122379 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccacaccacaaatttg 7122282  T
Q  1028 aagacaaa 1035  Q
    ||||||||    
T  7122281 aagacaaa 7122274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 52095248 - 52095645
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| | || || ||||| || ||||  | |||||||||||||||  ||||   ||    
T  52095248 caagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggagtcaaagagaaaagcacaaaaccacaaggaaaagataaaaggagag--aagagagaa 52095345  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  52095346 acaaacacaccaaaaa--ttgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttac- 52095441  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  52095442 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 52095540  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  52095541 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-tccctcaaccctaaagttacctcctttgatt 52095638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Original strand, 51520839 - 51521038
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  51520839 gtcacgatttgcgtctgacccaaggta-gatcagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcatgatttcccaagatcgtgccac 51520937  T
Q  930 gattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaa 1029  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51520938 gatttggcgtcctgcaaactagctcacggccccttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaa 51521037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 859 - 1035
Target Start/End: Complemental strand, 7124673 - 7124496
Alignment:
Q  859 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcacgattttgcaccc-tgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  7124673 gaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccacgattt-gcacccctgcaaccctagctca 7124575  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaa 1035  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7124574 cggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccacaccacaaatttgaagacaaa 7124496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 5369968 - 5370369
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  5369968 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagataa 5370065  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||     
T  5370066 acaaacacatcaaaga--ttgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttac- 5370162  T
Q  562 aaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc----cttttcccaatctcac-------ca 647  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     |||| ||||||||||       ||    
T  5370163 aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttttttttccaatctcaccaatgaaca 5370261  T
Q  648 agacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtt-tctcccttt 745  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||| |||||| | ||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  5370262 agacactcaatgattttcactcaccaaagtgtttacaatgtttcccagcccaagaga-actataatcaaag-accctaaaccctaaagttgtct-ccttt 5370358  T
Q  746 gatttcccaag 756  Q
    |||||| ||||    
T  5370359 gatttctcaag 5370369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 851 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 28468170 - 28467977
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  28468170 caaggtacgaccagtccttatcatagaaacttaacgagcaagtttgaaaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaacc 28468071  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28468070 agctcacggcatcacaaaatcgtgttacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccataccacaaatttgaagccaaatctcaaca 28467977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 831 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 56141723 - 56141523
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  56141723 gtcacgatttgcatctgacccaaggta-gaccagtccttatcagggatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccac 56141625  T
Q  930 gattttg-caccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttga 1028  Q
    ||||||| |  ||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56141624 gattttggcgtcctgcaaactagctcacgacccctccaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttga 56141525  T
Q  1029 ag 1030  Q
    ||    
T  56141524 ag 56141523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 9224093 - 9223911
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  9224093 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 9223995  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9223994 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 9223911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 782 - 980
Target Start/End: Original strand, 29760995 - 29761196
Alignment:
Q  782 caaatctgcacaagaacac--tttatactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 879  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||| ||||  | |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760995 caaatctgcacaagaacacaatatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttgcgtccgtaccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 29761094  T
Q  880 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacg 978  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29761095 cttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtcacg 29761194  T
Q  979 at 980  Q
    ||    
T  29761195 at 29761196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 9927345 - 9927740
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaa-tacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  9927345 caagcaataatcaacaataacagcacctagatttaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagcaaaagataaa-ggagagaatagaggaa- 9927442  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  |||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9927443 -caaacacaccaaaga--ttgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac- 9927537  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc-------aagac 651  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||    
T  9927538 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaataagac 9927636  T
Q  652 actcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgattt 750  Q
    ||||| |||||||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||    
T  9927637 actcagtgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgattt 9927734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 9228880 - 9228698
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  9228880 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 9228782  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     | ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9228781 acgagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 9228698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 831 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 5135862 - 5135648
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  5135862 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccggtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgaca 5135763  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5135762 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaattt 5135665  T
Q  1027 gaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5135664 gaagac-aatctcaacaa 5135648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 5733061 - 5733235
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagct-ca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| ||    
T  5733061 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaacttgcttca 5733160  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5733161 cggcaccacgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcatgatttctctgttctttcagaccacaaatttgaag 5733235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 5138088 - 5137875
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccc--aaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  5138088 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccggtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcttgatcgtgtcacgattttcccaaaatcgtgaca 5137989  T
Q  929 cgattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||| |||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5137988 cgattt-gcacccctgcaaccctaactcacggcatcc-gaaatcgcgtcacgataccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccaagccacaaattt 5137891  T
Q  1027 gaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||| ||||||||||    
T  5137890 gaagac-aatctcaaca 5137875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 858 - 1047
Target Start/End: Original strand, 3814421 - 3814609
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacg 957  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| || ||| |||    
T  3814421 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgacacgatttggcgtcttgcaaacttgcttacg 3814520  T
Q  958 gcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaataa 1047  Q
    |   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  3814521 gtcacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag-ccaatatcaacaataa 3814609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 474 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 2209889 - 2209717
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  2209889 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 2209791  T
Q  574 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 644  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209790 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 18856124 - 18856297
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  18856124 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcttgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 18856223  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18856224 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 18856297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 756
Target Start/End: Original strand, 34570304 - 34570697
Alignment:
Q  369 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 465  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||| || |||| || |||||||||||||||   ||| |||  |||    
T  34570304 caataatcaacaataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaa--caa 34570401  T
Q  466 aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaag 565  Q
    |  |||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34570402 acacaccaaaga--ttgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaag 34570497  T
Q  566 ggatacaa-aaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactc 655  Q
     |||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||    
T  34570498 agatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 34570596  T
Q  656 aatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttccc 753  Q
    |||||||||| |||   |||| ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || | |  |||||||||||||    
T  34570597 aatgattttcactcacccaagatgttttcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagctacctcctttgatttccc 34570694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 12739547 - 12739833
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||      
T  12739547 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatg 12739644  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||||||||| |     
T  12739645 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttcca 12739743  T
Q  667 ctctac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||  | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  12739744 ctcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 12739833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 484 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  484 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttac 581  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggttac 41964483  T
Q  582 aagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41964482 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 479 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 37740794 - 37740511
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 577  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  37740794 attgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggg 37740697  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 668  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| |||||||| ||    
T  37740696 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcact 37740598  T
Q  669 ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||||||||||||||||    
T  37740597 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaacttacctcctttgatttcccaag 37740511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 45347502 - 45347329
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  45347502 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 45347403  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45347402 cggcatctctaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctttgttcttccagaccacaaatttgaag 45347329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429564
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||      
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatagatacaaatg 5429753  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  5429752 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5429654  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5429653 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacttcctttgatttcccaag 5429564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 753
Target Start/End: Original strand, 47038408 - 47038689
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| |    
T  47038408 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttac-aaacagatacaaatg 47038505  T
Q  577 gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 668  Q
     |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  47038506 attacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 47038604  T
Q  669 c-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttccc 753  Q
    |   ||||||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    |||||||||||||    
T  47038605 cacccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttaactcctttgatttccc 47038689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 848 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 18712449 - 18712295
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  18712449 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 18712351  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttc 1002  Q
     ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712350 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttc 18712295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 918 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 31985252 - 31985126
Alignment:
Q  918 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 1017  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  31985252 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgctaactagctcacggtatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagat 31985153  T
Q  1018 cacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31985152 cacaaatttgaagccaaatctcaacaa 31985126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 36463483  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36463484 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 5871991 - 5871705
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||      
T  5871991 agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgc-aaagtgataaaaatg 5871894  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  5871893 ggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 5871795  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  5871794 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccataaccctaaagttacctcctttgatttcccaag 5871705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 26175633 - 26175919
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  26175633 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 26175730  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  26175731 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 26175829  T
Q  667 ctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||   |||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26175830 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaacaga-actttaatcaaag-accctcaactctaaagttacctcctttgatttcccaag 26175919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 26364410 - 26364236
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||    
T  26364410 aagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttac-aaagagatacaa 26364313  T
Q  574 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    | | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364312 atgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 477 - 646
Target Start/End: Original strand, 46147388 - 46147557
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  46147388 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 46147485  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 646  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46147486 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703500
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 578  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 46703571  T
Q  579 tacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46703570 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 365 - 756
Target Start/End: Original strand, 52082549 - 52082940
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaagt-gagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||   || || || || || |||| || |||||||||||||||  ||||   ||    
T  52082549 caagcaataatcaacaataacagcacctagatcttatctaggaatcaaaaagaaaagcataaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagataa 52082646  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||       |||||||||||| |||||||     
T  52082647 acaaacacaccaaaga--ttgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttac- 52082736  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagac 651  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||       ||||||    
T  52082737 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagac 52082835  T
Q  652 actcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatt 749  Q
    | |||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||    
T  52082836 agtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatt 52082933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073392
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 12073462  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12073461 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 629
Target Start/End: Original strand, 12743922 - 12744073
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  12743922 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 12744019  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12744020 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 629
Target Start/End: Original strand, 12745311 - 12745462
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  12745311 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 12745408  T
Q  576 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc 629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12745409 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632445
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 40632515  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40632514 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639426
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||  ||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaatagatacaaatgggtt 41639496  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639495 acaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 48893635 - 48893810
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  48893635 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 48893732  T
Q  577 -gttacaagaaattagctt-gacaagttc----acaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48893733 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 48893810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 474 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 54883194 - 54883020
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  54883194 aagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 54883097  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54883096 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 479 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994524
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 577  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatggg 36994596  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36994595 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379383
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagcgatacaaatgggtt 379450  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 645  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  379449 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcac 379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655975
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 6656026  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc 630  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  6656025 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 479 - 752
Target Start/End: Original strand, 54199906 - 54200185
Alignment:
Q  479 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 577  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  54199906 attgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggg 54200002  T
Q  578 ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctct 668  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||    
T  54200003 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 54200101  T
Q  669 c-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcc 752  Q
    |   ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  54200102 cacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttcc 54200185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648139
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 8648209  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    | |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8648208 ataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 501 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  501 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 8665458  T
Q  599 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    || || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8665457 agctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 45687179 - 45687351
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 576  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |    
T  45687179 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatagatacaaatg 45687276  T
Q  577 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45687277 agttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 6542180 - 6542349
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 579  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |     
T  6542180 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaaggcta 6542277  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  6542278 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaa 6542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1044 - 1120
Target Start/End: Complemental strand, 44882193 - 44882117
Alignment:
Q  1044 ataaatgataccaatactcctcactgaggtggcacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatgatgtcc 1120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44882193 ataaatgataccactactcctcactgaggtggcacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatgacgtcc 44882117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 648
Target Start/End: Original strand, 27416962 - 27417133
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  27416962 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 27417059  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27417060 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 481 - 594
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673960
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 50673945  T
Q  580 acaagaaattagctt 594  Q
    |||||||||||||||    
T  50673946 acaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229890
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa-agggatacaaaaggtt 579  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||| ||||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggtt 37229820  T
Q  580 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||| ||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37229821 acaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 474 - 644
Target Start/End: Original strand, 50262694 - 50262865
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  50262694 aagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 50262792  T
Q  574 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctca 644  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||    
T  50262793 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccgtaatttcgatccattttcccaatctca 50262865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 665
Target Start/End: Original strand, 52467351 - 52467546
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||      
T  52467351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattac-aaagtgatacaaatg 52467448  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 665  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||       ||||||||||||||||||||    
T  52467449 ggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 52467546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 474 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119540
Alignment:
Q  474 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 573  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||    
T  12119714 aagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaa 12119616  T
Q  574 aa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc 646  Q
    || |||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12119615 aagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacc 12119540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 519 - 756
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12748039
Alignment:
Q  519 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaac 616  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 12747891  T
Q  617 cctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatac 706  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||       |||||||||||||||||| | |||  | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-ac 12747990  T
Q  707 tctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||    
T  12747991 tctaatcaaag-accctcaaccctaaagttacctcctttgatttctcaag 12748039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 4588126 - 4587958
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 579  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4588126 tgtttacccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 4588029  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4588028 acaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaa 4587958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 641
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208003
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa-agggatacaaaaggtt 579  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||  ||||    
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaag-ggtt 5207940  T
Q  580 acaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 641  Q
     ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5207941 gcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31474318 - 31474150
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  31474318 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 31474221  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||| || ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31474220 acaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 31474150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 489 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662441
Alignment:
Q  489 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaa 587  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaa 35662503  T
Q  588 ttagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||  ||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35662502 ttagcttcaacaaactcataaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 35662441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 927 - 1030
Target Start/End: Original strand, 18860406 - 18860509
Alignment:
Q  927 cacgattttgcaccctgcaatctag-ctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatt 1025  Q
    |||||||||||| || |||| || | ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18860406 cacgattttgcatccagcaaacttggctcacggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatt 18860504  T
Q  1026 tgaag 1030  Q
    |||||    
T  18860505 tgaag 18860509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 521 - 629
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  521 agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccc 618  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12744184  T
Q  619 taatttctacc 629  Q
    |||||||||||    
T  12744185 taatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 521 - 648
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745604
Alignment:
Q  521 agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcacaatgaacaaaccc 618  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12745573  T
Q  619 taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  12745574 taatttctacccattttcctaatctcgccaa 12745604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 486 - 633
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699596
Alignment:
Q  486 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 584  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||   |||| |||||||||| ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  585 aaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt 633  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctatacccttt 26699596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 918 - 1044
Target Start/End: Original strand, 5148177 - 5148303
Alignment:
Q  918 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 1017  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||| ||   | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  5148177 aaatcgtgccacgattggtcaccctgcaaactagctcacgacattgcaaaatcgtgtcacggtgataaaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaac 5148276  T
Q  1018 cacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  5148277 cacaaatttgaagccaattttcaacaa 5148303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 382 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 29254758 - 29254580
Alignment:
Q  382 aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 479  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||  ||||  |||||||||      
T  29254758 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaatggagagaatagaggaa--caaacacaccaaaga-- 29254663  T
Q  480 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 563  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29254662 ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaa 29254580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 481 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337000
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 579  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaaagggtt 51337134  T
Q  580 acaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaa-ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa-------gacactcaatgattttctctc- 669  Q
    | || |||||| ||| | ||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||     
T  51337133 ataataaattatctt-aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactca 51337035  T
Q  670 tacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagaga 703  Q
      |||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  51337034 cccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga 51337000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 858 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 45356983 - 45356861
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| | | |||||    
T  45356983 tgaccagtccttatcagtgatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 45356884  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacga 979  Q
    ||||| | | ||||||||||||||    
T  45356883 cggcatctc-aaatcgtgtcacga 45356861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 574
Target Start/End: Original strand, 13009441 - 13009536
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 574  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13009441 agattgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaa 13009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 985 - 1046
Target Start/End: Original strand, 29761182 - 29761242
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaata 1046  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29761182 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag-caaatatcaacaata 29761242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 531 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969112
Alignment:
Q  531 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 628  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctac 24969133  T
Q  629 cc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  24969132 ccatttttccaatctcaccaa 24969112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1059 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 44864299 - 44864243
Alignment:
Q  1059 actcctcactgaggtggcacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatga 1115  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44864299 actcctcactcaggtaacacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatga 44864243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 505 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  505 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 44838671 - 44838593
Alignment:
Q  2 caccttctccctcttaagacaaaaagaagaaagcatttaatacattatgcatgaaagtacgccacacctagcaaaccaa 80  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  | |||||||||    
T  44838671 caccttctccctcttgagacagaaagaagaacgcatttaatacattaagcatgtaagtaagccacatgtggcaaaccaa 44838593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 983 - 1043
Target Start/End: Original strand, 5143807 - 5143867
Alignment:
Q  983 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  5143807 caaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 5143867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 982 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 8689097 - 8689049
Alignment:
Q  982 ccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8689097 ccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 8689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1063 - 1115
Target Start/End: Complemental strand, 44850040 - 44849988
Alignment:
Q  1063 ctcactgaggtggcacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatga 1115  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44850040 ctcaccgaggtgatacatttattcaatacacataaagctcacctcttggatga 44849988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 44864529 - 44864477
Alignment:
Q  1 ccaccttctccctcttaagacaaaaagaagaaagcatttaatacattatgcat 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  44864529 ccaccttctccctcttaagacaagaaaaagaaatcatttaatacattatgcat 44864477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 16628403 - 16628358
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16628403 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 16628358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 38151968 - 38151923
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38151968 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 38151923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 986 - 1030
Target Start/End: Original strand, 3778116 - 3778160
Alignment:
Q  986 aatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3778116 aatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 3778160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 3913618 - 3913424
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||      
T  3913618 agattgttgacccagttcgatacaa-ctttacatactctag-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagatatacaaatg 3913522  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttc 665  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||  |||||| |||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  3913521 ggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-agctctaatttctactcattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 3913424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 646 - 685
Target Start/End: Original strand, 35369614 - 35369653
Alignment:
Q  646 caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccca 685  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35369614 caagacactcaatgattttcactctacaaggtgtttccca 35369653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 643
Target Start/End: Original strand, 44967829 - 44967992
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 580  Q
    |||| |||||| |||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  | ||| |||| ||| |||| ||||| ||   |||| |||||||| |||||    
T  44967829 tgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagatacaaatggtta 44967928  T
Q  581 caagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 643  Q
    ||||||||| |||| | |||| || | | || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44967929 caagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctaccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 984 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 5268750 - 5268704
Alignment:
Q  984 aaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5268750 aaaatcctgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 5268704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 6742946 - 6742901
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6742946 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccataaatttgaag 6742901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 10047932 - 10047977
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10047932 aaatcgtgtcacgatttatctgttcttccaaaccacaaatttgaag 10047977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1026
Target Start/End: Complemental strand, 16622824 - 16622783
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaattt 1026  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16622824 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaattt 16622783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 644
Target Start/End: Original strand, 48142473 - 48142542
Alignment:
Q  576 ggttacaagaaattagcttga-caagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 644  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  48142473 ggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctca 48142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 646 - 756
Target Start/End: Original strand, 13009604 - 13009714
Alignment:
Q  646 caagacactcaatgattttctctc-tacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccct 743  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  | |    
T  13009604 caagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaaccctaaagttacctcat 13009701  T
Q  744 ttgatttcccaag 756  Q
    |||||||||||||    
T  13009702 ttgatttcccaag 13009714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 26175459 - 26175507
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26175459 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 26175507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 29999651 - 29999699
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29999651 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 29999699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 507 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089933
Alignment:
Q  507 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt 594  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||   | || ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagctt 33089933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 48893465 - 48893513
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  48893465 tcacaccaatacaaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaacca 48893513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 52467180 - 52467228
Alignment:
Q  298 tcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaacca 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  52467180 tcacaccaatacaaactatgatgtgtgaagcaaaggaaagtggtaacca 52467228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 560 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41639353 - 41639263
Alignment:
Q  560 caaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639353 caaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1983309 - 1983252
Alignment:
Q  576 ggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt 634  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1983309 ggttacaagaaattagcttg-caagctcacaaagaacaaaacataatttctatcctttt 1983252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21688397 - 21688250
Alignment:
Q  501 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 598  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||||||| || |||||| |||||||| |  ||| |||||||| | ||||||| ||||||| ||  |||    
T  21688397 aacttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttctt-ccgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagtttcaaca 21688299  T
Q  599 agttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcacc 646  Q
    || |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21688298 agctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcacc 21688250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 36314761 - 36314716
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  36314761 aaatcgtgtcacgatttctctattcttcgaaaccacaaatttgaag 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 36328970 - 36328925
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  36328970 aaatcgtgtcacgatttctctattcttcgaaaccacaaatttgaag 36328925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 54867745 - 54867790
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  54867745 aaatcgtgtcacgacttctctattcttccaaaccacaaatttgaag 54867790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 2436 - 2878
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2436 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 2535  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2536 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 2634  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2635 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatg 2734  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2735 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 2832  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2833 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 2878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 2973 - 3185
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2973 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaagaatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 3072  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3073 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcatcc-gaaatcgtgtcacgatcccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 3170  T
Q  1028 aagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3171 aagac-aatctcaaca 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Original strand, 3558 - 4000
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3558 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 3657  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3658 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgaccta 3756  T
Q  512 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaatg 609  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3757 ctctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatg 3856  T
Q  610 aacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3857 aacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactct 3954  T
Q  710 aatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3955 aatcaaagaaccctaaaccctagagcttc-ccctttgatttcccaag 4000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Original strand, 4098 - 4310
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttccca-aatcgtgtcac 929  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4098 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttctggatcgtgtcacgatttcccacaatcgtgccac 4197  T
Q  930 gattttgcaccc-tgcaatc-tagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4198 gattt-gcacccctgcaaccctagctcacggcaccta-aaatcgtgtcacgattccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 4295  T
Q  1028 aagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| ||||||||||    
T  4296 aagac-aatctcaaca 4310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 284; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 315 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 6611 - 6167
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6611 atgatatgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatccaatctaggaaacaagt 6512  T
Q  414 gagaaacacaataca-caatcacaagataaaa---ggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacc 509  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6511 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagagggaagaagaaaacaataacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacc 6413  T
Q  510 tactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcacaa 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6412 tactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttacaagaaattagcttgacaagttcacta 6313  T
Q  608 tgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 707  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6312 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatga--ttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 6215  T
Q  708 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6214 ctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgc-ccctttgatttcccaag 6167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 831 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 6072 - 5859
Alignment:
Q  831 gtcacgatttgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattt--cccaaatcgtgtca 928  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||    
T  6072 gtcacgatttgcgtccgtcccaaggaacgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgattttgccacaatcgtgaca 5973  T
Q  929 cgattttgcaccctgcaa-tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 1027  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5972 cgaatttgcaccctgcaaccctagctcacggcacctc-caatcgtgtcacgactccaaaatcgtggcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttg 5874  T
Q  1028 aagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||| ||||||||||    
T  5873 aagac-aatctcaaca 5859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 212; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Original strand, 10982 - 11445
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||   |  ||   ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10982 cacaccaatacaaagtatgatatgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatgactaa---gtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatct 11078  T
Q  398 aatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  11079 aatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcgg 11176  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-ctt 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  11177 tccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattt 11276  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 686  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| | ||    
T  11277 tacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaat 11375  T
Q  687 gttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11376 gtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagagttactccctttgatttcccaag 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 299 - 756
Target Start/End: Original strand, 8556 - 9019
Alignment:
Q  299 cacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctagatct 397  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||   |  ||   ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8556 cacaccaatacaaagtatgatacgtggagcaaaggaaagtagtaaccaatgactaa---gtgggtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatct 8652  T
Q  398 aatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcgg 496  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  8653 aatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcacccagttcgg 8750  T
Q  497 tccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag-ctt 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8751 tccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattt 8850  T
Q  595 gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 686  Q
     | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||| ||| | |||  |||||| ||| | ||    
T  8851 tataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatggtttacactcaccaaggtctttacaat 8949  T
Q  687 gttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8950 gtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaagcctagagttactccctttgatttcccaag 9019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 783 - 1043
Target Start/End: Original strand, 9045 - 9308
Alignment:
Q  783 aaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatt--tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 879  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  |||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  9045 aaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggtgcgtacgtcccaaggtacgaccagtccttatcatggaaa 9144  T
Q  880 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacga 979  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9145 cttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaatcatgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacga 9244  T
Q  980 tgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9245 tgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaaca 9308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 840 - 1047
Target Start/End: Original strand, 11550 - 11757
Alignment:
Q  840 tgcgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgattttgcac 939  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11550 tgcgtacgtcccaaggtacgaccagtccttatcatggaaacttaacgagcaagtttgcaaatcgtgtcacgatttcccaaatcgtgtcacgatttggcac 11649  T
Q  940 cctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctc 1039  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11650 cctgcaaaccagctcacggcatcatgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaattttgaagccaaatctc 11749  T
Q  1040 aacaataa 1047  Q
    ||||||||    
T  11750 aacaataa 11757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 185; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 434882 - 434418
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |   ||   |||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  434882 agtcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccattattaaa---gtgttttcaatcaataatcaacaataacagcacctaga 434786  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagtt 493  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  ||||||| |  ||||||||||||||    
T  434785 tctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagagaaacaaacacaccaaata--ttgttcacccagtt 434689  T
Q  494 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  434688 cggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagc 434590  T
Q  593 -ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccctttt--cccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttc 682  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||     
T  434589 tttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtattta 434491  T
Q  683 ccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  434490 ccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgcttcctttgatttcccaag 434418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 162; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 296 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 1264 - 802
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   |  | | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1264 agtcacaccaatacgaactatgatgtgtggaacaaaggatagtagtaacca---atgacaatgtgaatgcaagcaataatcaacaataacaccacctaga 1168  T
Q  395 tctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcacccagt 492  Q
    ||||||||||| | ||| |||| || |||||  ||||| || |  ||||||||||||  ||||   ||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  1167 tctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaaccacaagcaaagtataaaaggagag--aagagagaaacaaaacacaccaaaga--ttgttcacccagt 1072  T
Q  493 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattag 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1071 tcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt--caaagagatacaaaagggttacaagaaattag 974  T
Q  592 c-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac------caagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttc 682  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||     
T  973 ctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttta 875  T
Q  683 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  874 caatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagttgctgcctttgatttcccaag 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 851 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 675 - 523
Alignment:
Q  851 caaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatct 949  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  675 caaggtacgaccagtccctatcctggaaacttaacgagcaaatttgaaaatcgtgtcacgattcctcaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaact 576  T
Q  950 agctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttc 1002  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  575 agctcacggcatcacgaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttc 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 296 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 11914 - 11508
Alignment:
Q  296 agtcacaccaatactaaatatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgtgtgcaagcaataatcaacaa-aacaccacctaga 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11914 agtcacaccaatacgaactatgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccactaa-caaagtgtgtg--caagcaataatcaacaataacagcacctaga 11818  T
Q  395 t-ctaatctaggaa-acaa-gtg--agaaacacaata---cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 486  Q
    | |||||||||||| |||| |||  | ||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  |||||| |||||||||||    
T  11817 tactaatctaggaatacaaagtggaaaaaaaacaataaaacacaagcacaagataaaagg-gagagaagagataaacaaatacaccaa-gagattgttca 11720  T
Q  487 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaaga 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  11719 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaga 11621  T
Q  586 aattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttctctctacaagg 676  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  11620 aattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 11522  T
Q  677 tgtttcccatgttt 690  Q
    ||||| | ||||||    
T  11521 tgtttacaatgttt 11508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 781 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 22205 - 21939
Alignment:
Q  781 tcaaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaagga 877  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  ||||||||| |  |||||  | ||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  22205 tcaaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggtacgtacgtcacaaggtacgacctgtccttatcagtga 22106  T
Q  878 tacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtca 976  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22105 tacttaacgagcaagttttacaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcgtcctgcaaactagctcacggcacctcgaaatcgtgtca 22006  T
Q  977 cgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22005 cgatgccaaattcatgtcccgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaaaccaaatctcaaca 21939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 698 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 22286 - 22229
Alignment:
Q  698 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22286 aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttgatttcccaag 22229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 135; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 783 - 1044
Target Start/End: Complemental strand, 17695 - 17430
Alignment:
Q  783 aaatctgcacaagaacacttta-tactagcctccctctgaagcaatcacgtcacgatttg--cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggata 879  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||   ||||  ||||||||| |  |||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17695 aaatctgcacaagaacacttaaatactagccttccactgataaaatcgtgtcacgattggaacgtacgtcacaaggtacgaccaatccttatcaaggata 17596  T
Q  880 cttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacg 978  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17595 cttaacgagcaagtttgaaaatcatgtcacgatttcccaagatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccagctcacggcatcacgaaatcgtgtcacg 17496  T
Q  979 atgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17495 atgccaaattcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 17430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 315 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 1
Alignment:
Q  315 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 102  T
Q  414 gagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 511  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaaca-caaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgaccta 3  T
Q  512 ct 513  Q
    ||    
T  2 ct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 109; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 369 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 114881 - 114539
Alignment:
Q  369 caataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaataca-caatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaa 465  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||| |||  | |||||||||||||||  ||||   ||||||    
T  114881 caataatcaacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacaacaagaaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaa 114784  T
Q  466 aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaag 565  Q
       |||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  114783 gcacaccaaaga--ttgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaag 114687  T
Q  566 ggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactc 655  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||    
T  114686 agatacaaaagcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactc 114588  T
Q  656 aatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagaga 703  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  114587 aatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 114539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 90; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 3522 - 3349
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcac 956  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||||    
T  3522 tgactagtccttatcattgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtccttcaaactagctcac 3423  T
Q  957 ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3422 ggccacttgaaatcgtgtcacgatgtcaaaatcgtgtcacgatttctcttttcttccagaccacaaatttgaag 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 87; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Original strand, 760 - 933
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctag-ctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || | ||||    
T  760 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcatccagcaaacttggctca 859  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  860 cggcacctccaa-tcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccataccacaaatttgaag 933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 848 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 34748 - 34566
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  | |||||    
T  34748 acccaaggta-gacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgatttggcgtcatgcaa 34650  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
     | | || |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34649 acaaactaacggccacttgaaatagtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 34566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 365 - 648
Target Start/End: Original strand, 20301 - 20583
Alignment:
Q  365 caagcaataatcaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaacaa-gtgagaaacacaatac-acaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaa 461  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |||| || |||||||| ||||||   ||| |||     
T  20301 caagcaataattaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaa- 20399  T
Q  462 acaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttaca 561  Q
     ||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20400 -caaacacaccaaaaa--ttgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttac- 20494  T
Q  562 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20495 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 82; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 918 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 8036 - 7911
Alignment:
Q  918 aaatcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagac 1017  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8036 aaatcgtgtcacgatttggcaccctgcaaaccaactcacggcatcacaaaatcgtgtcacgatgccaaattcgtgtcacgatttctctgttctttcagac 7937  T
Q  1018 cacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7936 cacaaatttgaagccaaatctcaaca 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18171
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 579  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagtt 18101  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18102 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaa 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 75; Significance: 6e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 842 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 132953 - 132752
Alignment:
Q  842 cgtacaacccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcacc 940  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||  | | ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||     
T  132953 cgtacgacccaaggtacgaccaa-ccttatcctgaaaacttaaccagcaagtttgaaaatcatgtcacgattccacaaaatcgtgtcacgatttgacaca 132855  T
Q  941 ctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctca 1040  Q
    |||||| | |||||||| || | | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  132854 ctgcaaaccagctcacgacatcacaaaatcgtgccacgataccacaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagacaaatctca 132755  T
Q  1041 aca 1043  Q
    |||    
T  132754 aca 132752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 756
Target Start/End: Original strand, 149094 - 149380
Alignment:
Q  477 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  149094 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 149191  T
Q  576 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttct 666  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  149192 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 149290  T
Q  667 ct-ctacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttgatttcccaag 756  Q
    || |  |||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||   |||| |  ||||||||||||||||    
T  149291 ctaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccacaagttacctcctttgatttcccaag 149380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 6252 - 6297
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6252 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 6297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 3060 - 3105
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3060 aaatcgtgtcatgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaag 3105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7327
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 7397  T
Q  580 acaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 648  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7396 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 966 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 6784 - 6750
Alignment:
Q  966 aaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 1000  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6784 aaatcgtgccacgatgccaaaatcgtgtcacgatt 6750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 879 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 1248 - 1083
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  |||||||||| | | ||||||  |   | ||||||||||||    
T  1248 acttaaccagcaagtttaaaaatcgtgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgatttgacaccctgcaaaccaactcacgatattacaaaatcgtgtcac 1149  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1148 gatgccaaaatcgtgtcacgatttttctgttctttcaaaccacaaatttgaaggcaaatttcaaca 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 481 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10515
Alignment:
Q  481 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 579  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaatggtt 10559  T
Q  580 acaagaaattagcttgaca--agttcacaatgaacaaaccctaattt 624  Q
    |||| ||||||||   |||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  10558 acaataaattagc---acaagagctcacaaagaacaaaccctaattt 10515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1455 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1455
Description:

Target: scaffold1455; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 967 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 1784 - 1721
Alignment:
Q  967 aatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1784 aatcgtgtcacgattccaaaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 55; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 879 - 1036
Target Start/End: Complemental strand, 43599 - 43441
Alignment:
Q  879 acttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaaa-tcgtgtcacgattttgcaccctgcaatctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcac 977  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||||| || | |||||||| ||   | ||||||||||||    
T  43599 acttaaccagcaagtttgaaaatcatgtcacgatttcacaaaatcgtaccacgatttgacaccctgtaaaccagctcacgacattacaaaatcgtgtcac 43500  T
Q  978 gatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaat 1036  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  43499 gatgccacaatcgtgtcacgatttctctattcttccaaaccataaatttgaagccaaat 43441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 983 - 1045
Target Start/End: Complemental strand, 36384 - 36322
Alignment:
Q  983 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaat 1045  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  36384 caaaatcgtatcatgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaattttcaacaat 36322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 848 - 980
Target Start/End: Original strand, 8098 - 8230
Alignment:
Q  848 acccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaa 946  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||    
T  8098 acccaaggt-tgacaagtccttatcagtgatacttaacgagcaagtttctgaatcgtgtcacgattttccaagatcgtgccacgatttggcgtcctgcaa 8196  T
Q  947 tctagctcacggcaccccgaaatcgtgtcacgat 980  Q
     ||||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  8197 actagctcacggccacttgaaatcgtgtcacgat 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1030
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8261
Alignment:
Q  985 aaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8216 aaatcgtgtcacgatttctctgttcttccagaccacaaatttgaag 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 13969 - 13796
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  13969 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 13870  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  13869 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaag 13796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 857 - 1043
Target Start/End: Complemental strand, 18850 - 18663
Alignment:
Q  857 atgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctc 954  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | ||||||    
T  18850 atgaccagtctttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtggcacgattttgcttccagcaaacttagctc 18751  T
Q  955 ac-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaaca 1043  Q
    || | | | |||  |||||||||||||  | |||||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  18750 actgcctctccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgcgacacgattcctctgttctcccaaaccacaaatttgaagccaattttcaaca 18663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 858 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 176635 - 176462
Alignment:
Q  858 tgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaatc-tagctca 955  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||| | |||||||    
T  176635 tgaccagtccttatcagagatacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaacttagctca 176536  T
Q  956 cggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | || | ||   ||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  176535 ctgc-ctccctgatcgtgtcacgactgcaaaatcgtgacacgattcctctgttctcccaaaccactaatttgaag 176462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 50; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 849 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 1932 - 1751
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||||     
T  1932 cccaaggt-tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaa 1834  T
Q  948 c-tagctcac-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | | |||||| | | |||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1833 cttggctcactgcctccccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccactaatttgaag 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 50; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 849 - 1030
Target Start/End: Complemental strand, 148637 - 148456
Alignment:
Q  849 cccaaggtatgaccagtccttatcaaggatacttaacgagcaagtttcacgatcgtgtcacgatttcccaa-atcgtgtcacgattttgcaccctgcaat 947  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||||     
T  148637 cccaaggt-tgaccagtccttatcagagaaacttaaccagcaagtttctgaatcgtgtcacgatttcccaagatcgtgccacgattttgcttccagcaaa 148539  T
Q  948 c-tagctcac-ggcaccccgaaatcgtgtcacgatgccaaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaag 1030  Q
    | | |||||| | | |||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  148538 cttggctcactgcctccccg--atcgtgtcacgattgccaaatcgtgacacgattcctctgttcttccaaaccactaatttgaag 148456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 983 - 1044
Target Start/End: Original strand, 45744 - 45805
Alignment:
Q  983 caaaatcgtgtcacgatttccctgttcttccagaccacaaatttgaagacaaatctcaacaa 1044  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45744 caaaattgtgtcacgatttctctgttcttccaaaccacaaatttgaagccaaatctcaacaa 45805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 594
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27556
Alignment:
Q  492 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 590  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||   |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 27552  T
Q  591 gctt 594  Q
    ||||    
T  27553 gctt 27556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 644
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80447
Alignment:
Q  536 caatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-tt 632  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt 80435  T
Q  633 ttcccaatctca 644  Q
    ||||||||||||    
T  80436 ttcccaatctca 80447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University