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Alignment Overview

Query: NF2993_high_3 (Length: 757)

Name: NF2993_high_3
Description: NF2993
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2993_high_3
NF2993_high_3
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (17-414)||(24793383-24793780)
chr4 (17-437)||(17892294-17892714)
chr4 (17-406)||(36943746-36944141)
chr4 (17-416)||(3108957-3109356)
chr4 (17-421)||(2586398-2586781)
chr4 (18-270)||(52721567-52721819)
chr4 (18-335)||(44521699-44522016)
chr4 (18-270)||(24784585-24784837)
chr4 (18-270)||(24823429-24823681)
chr4 (18-406)||(42630131-42630526)
chr4 (18-406)||(31945902-31946267)
chr4 (18-270)||(39957901-39958153)
chr4 (43-418)||(55900826-55901192)
chr4 (18-415)||(40694138-40694513)
chr4 (18-208)||(47607354-47607544)
chr4 (67-345)||(49470419-49470692)
chr4 (19-219)||(51675031-51675230)
chr4 (18-211)||(51859045-51859238)
chr4 (18-211)||(14614754-14614940)
chr4 (183-430)||(754224-754470)
chr4 (22-211)||(1177227-1177417)
chr4 (18-190)||(30683335-30683507)
chr4 (53-211)||(258779-258938)
chr4 (21-181)||(7952789-7952949)
chr4 (22-420)||(36511609-36511989)
chr4 (53-220)||(5835206-5835384)
chr4 (53-253)||(41146349-41146559)
chr4 (175-311)||(722440-722576)
chr4 (53-159)||(43509600-43509706)
chr4 (224-415)||(46431792-46431983)
chr4 (53-150)||(52573044-52573141)
chr4 (52-144)||(5325180-5325272)
chr4 (52-150)||(14795866-14795964)
chr4 (57-220)||(28377273-28377449)
chr4 (225-415)||(37992394-37992583)
chr4 (93-253)||(53323084-53323255)
chr4 (79-253)||(3402762-3402948)
chr4 (18-94)||(46431614-46431690)
chr4 (240-358)||(1177102-1177220)
chr4 (53-253)||(8063260-8063471)
chr4 (114-196)||(37992305-37992387)
chr4 (240-351)||(51858927-51859038)
chr4 (79-148)||(31227201-31227270)
chr4 (340-475)||(19738704-19738840)
chr4 (340-475)||(52122844-52122980)
chr4 (79-253)||(38491965-38492136)
chr4 (18-78)||(10258433-10258493)
chr4 (381-475)||(1176988-1177083)
chr4 (340-414)||(21637734-21637808)
chr4 (305-361)||(726496-726552)
chr4 (162-253)||(14795751-14795841)
chr4 (340-417)||(39957630-39957707)
chr4 (369-475)||(5834837-5834944)
chr4 (340-475)||(8064084-8064220)
chr4 (160-242)||(31227092-31227176)
chr4 (369-470)||(52721276-52721378)
chr4 (53-95)||(53324587-53324629)
chr4 (343-437)||(5325699-5325793)
chr4 (69-142)||(22492895-22492968)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (17-437)||(28968556-28968977)
chr3 (17-417)||(47642072-47642472)
chr3 (17-425)||(7899371-7899779)
chr3 (18-406)||(19878756-19879144)
chr3 (18-437)||(25700806-25701228)
chr3 (18-346)||(45056954-45057282)
chr3 (39-383)||(20509830-20510174)
chr3 (18-270)||(52684540-52684792)
chr3 (18-270)||(2566923-2567174)
chr3 (18-415)||(19421484-19421877)
chr3 (18-270)||(21006016-21006268)
chr3 (46-361)||(13352876-13353191)
chr3 (18-360)||(38888750-38889081)
chr3 (154-412)||(30787350-30787609)
chr3 (26-430)||(983247-983627)
chr3 (18-219)||(29916034-29916236)
chr3 (18-219)||(29965187-29965389)
chr3 (176-436)||(21157539-21157800)
chr3 (18-415)||(22289397-22289771)
chr3 (43-211)||(48333212-48333380)
chr3 (46-420)||(2122770-2123124)
chr3 (22-219)||(2122951-2123148)
chr3 (18-167)||(212810-212959)
chr3 (18-211)||(28548296-28548489)
chr3 (53-220)||(22311106-22311284)
chr3 (18-141)||(21157413-21157536)
chr3 (53-220)||(35390126-35390301)
chr3 (18-181)||(25322170-25322333)
chr3 (22-136)||(13748177-13748291)
chr3 (52-158)||(42464302-42464408)
chr3 (22-128)||(45347907-45348013)
chr3 (43-211)||(48334155-48334323)
chr3 (54-220)||(50286911-50287088)
chr3 (203-415)||(55268854-55269066)
chr3 (54-253)||(25936242-25936452)
chr3 (53-220)||(28882243-28882421)
chr3 (240-475)||(45347306-45347541)
chr3 (52-150)||(10224321-10224419)
chr3 (63-190)||(47750631-47750758)
chr3 (19-110)||(41741821-41741912)
chr3 (56-150)||(48123683-48123777)
chr3 (53-253)||(22610440-22610650)
chr3 (53-129)||(30787274-30787350)
chr3 (240-437)||(41741947-41742144)
chr3 (53-253)||(52504986-52505198)
chr3 (225-415)||(6134242-6134432)
chr3 (240-437)||(42229720-42229907)
chr3 (53-253)||(45532226-45532436)
chr3 (53-158)||(52121613-52121718)
chr3 (22-219)||(39664657-39664857)
chr3 (44-219)||(19349300-19349480)
chr3 (53-170)||(33241166-33241288)
chr3 (52-158)||(1678846-1678948)
chr3 (52-158)||(28705591-28705693)
chr3 (240-437)||(13748323-13748519)
chr3 (79-157)||(1528881-1528959)
chr3 (160-253)||(7327968-7328060)
chr3 (160-253)||(37996573-37996665)
chr3 (152-211)||(42229914-42229973)
chr3 (187-319)||(212670-212802)
chr3 (178-253)||(1678980-1679055)
chr3 (245-349)||(29915926-29916030)
chr3 (245-349)||(29965079-29965183)
chr3 (313-361)||(48334076-48334124)
chr3 (369-475)||(35389757-35389864)
chr3 (340-475)||(40497337-40497473)
chr3 (342-453)||(1679675-1679786)
chr3 (158-220)||(10224440-10224501)
chr3 (342-475)||(7327719-7327853)
chr3 (313-415)||(48333079-48333181)
chr3 (160-243)||(28705493-28705576)
chr3 (187-219)||(41741916-41741948)
chr3 (342-426)||(45532957-45533041)
chr3 (369-475)||(52121187-52121294)
chr3 (369-415)||(3983765-3983811)
chr3 (369-470)||(30226432-30226534)
chr3 (303-357)||(39664082-39664136)
chr3 (342-437)||(42464884-42464979)
chr3 (160-253)||(48123568-48123660)
chr3 (342-475)||(48122832-48122966)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (17-475)||(35342324-35342783)
chr2 (18-415)||(31235839-31236236)
chr2 (54-426)||(34146237-34146609)
chr2 (18-416)||(1005579-1005955)
chr2 (17-415)||(3545233-3545631)
chr2 (17-426)||(21104539-21104938)
chr2 (18-415)||(2319343-2319737)
chr2 (17-437)||(4561834-4562233)
chr2 (18-405)||(14824216-14824582)
chr2 (39-270)||(45158850-45159081)
chr2 (18-415)||(3563908-3564282)
chr2 (19-218)||(4355555-4355754)
chr2 (18-415)||(44156665-44157040)
chr2 (18-345)||(10573632-10573948)
chr2 (44-219)||(24585777-24585953)
chr2 (22-221)||(28746339-28746539)
chr2 (18-219)||(5588280-5588481)
chr2 (73-437)||(8482647-8482989)
chr2 (18-170)||(35996822-35996974)
chr2 (46-181)||(12206267-12206402)
chr2 (61-200)||(40431740-40431879)
chr2 (53-216)||(18301362-18301529)
chr2 (18-180)||(40536498-40536660)
chr2 (57-253)||(40308004-40308212)
chr2 (52-253)||(22485011-22485224)
chr2 (53-220)||(5371338-5371516)
chr2 (56-220)||(12819578-12819753)
chr2 (53-149)||(6125031-6125127)
chr2 (18-110)||(14216910-14217002)
chr2 (18-190)||(9293655-9293831)
chr2 (52-253)||(7807022-7807231)
chr2 (53-208)||(20537114-20537282)
chr2 (52-253)||(4169684-4169896)
chr2 (57-253)||(6496840-6497046)
chr2 (242-359)||(14217027-14217144)
chr2 (340-475)||(33324825-33324961)
chr2 (244-345)||(5588176-5588277)
chr2 (330-475)||(38602287-38602433)
chr2 (243-335)||(12206172-12206264)
chr2 (243-450)||(28746539-28746737)
chr2 (242-317)||(4355478-4355553)
chr2 (340-475)||(7876721-7876857)
chr2 (340-475)||(40308872-40309008)
chr2 (240-406)||(1776311-1776477)
chr2 (224-335)||(9293253-9293364)
chr2 (369-470)||(37134302-37134404)
chr2 (342-475)||(4170479-4170613)
chr2 (342-475)||(22484274-22484408)
chr2 (240-341)||(40431896-40431997)
chr2 (177-220)||(6124948-6124991)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (17-335)||(15878076-15878394)
chr7 (45-360)||(1399949-1400263)
chr7 (18-346)||(23078762-23079090)
chr7 (53-450)||(33454100-33454497)
chr7 (18-475)||(35159869-35160328)
chr7 (18-439)||(44269767-44270182)
chr7 (18-270)||(9283514-9283766)
chr7 (18-270)||(25969717-25969969)
chr7 (18-358)||(36757665-36758009)
chr7 (18-358)||(36767189-36767533)
chr7 (18-333)||(36763445-36763764)
chr7 (18-270)||(9249964-9250215)
chr7 (17-438)||(21409433-21409830)
chr7 (18-405)||(554565-554930)
chr7 (18-405)||(21179911-21180280)
chr7 (18-219)||(36413609-36413809)
chr7 (18-219)||(48153784-48153984)
chr7 (43-415)||(38064731-38065107)
chr7 (18-220)||(19820651-19820853)
chr7 (574-736)||(24929244-24929420)
chr7 (53-426)||(23969840-23970187)
chr7 (18-196)||(44958990-44959168)
chr7 (203-468)||(40041390-40041655)
chr7 (240-470)||(24956260-24956491)
chr7 (22-219)||(26973296-26973497)
chr7 (54-220)||(16563919-16564096)
chr7 (54-220)||(16601566-16601743)
chr7 (18-206)||(24956501-24956687)
chr7 (224-475)||(44959994-44960246)
chr7 (57-220)||(1042747-1042923)
chr7 (53-220)||(19510888-19511059)
chr7 (52-158)||(39521413-39521519)
chr7 (18-170)||(35136317-35136469)
chr7 (53-207)||(4291946-4292111)
chr7 (18-165)||(11058729-11058876)
chr7 (60-174)||(40053575-40053689)
chr7 (52-243)||(47237913-47238116)
chr7 (53-158)||(8029147-8029252)
chr7 (54-158)||(26773257-26773361)
chr7 (67-253)||(36661208-36661405)
chr7 (66-149)||(47719856-47719939)
chr7 (53-150)||(27397282-27397378)
chr7 (53-253)||(11830432-11830642)
chr7 (160-253)||(27555129-27555221)
chr7 (53-253)||(16851046-16851254)
chr7 (488-534)||(24929465-24929511)
chr7 (53-253)||(40096401-40096612)
chr7 (160-253)||(48163671-48163763)
chr7 (18-86)||(47719764-47719832)
chr7 (240-335)||(48153690-48153785)
chr7 (224-270)||(11058658-11058704)
chr7 (160-253)||(27354184-27354276)
chr7 (369-465)||(23311736-23311833)
chr7 (229-270)||(47719952-47719993)
chr7 (369-437)||(18113943-18114011)
chr7 (369-437)||(26773716-26773784)
chr7 (340-453)||(48163435-48163548)
chr7 (340-475)||(11829693-11829829)
chr7 (340-475)||(27353925-27354061)
chr7 (370-415)||(26973118-26973163)
chr7 (369-417)||(19820868-19820916)
chr7 (160-220)||(26773376-26773436)
chr7 (369-475)||(25969401-25969508)
chr7 (340-475)||(40095654-40095790)
chr7 (369-470)||(9250426-9250528)
chr7 (369-470)||(34122621-34122723)
chr7 (372-430)||(38064645-38064703)
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[»] chr8 (56 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 414
Target Start/End: Original strand, 24793383 - 24793780
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24793383 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcgtaggctcgcagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 24793482  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24793483 agatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcagtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 24793582  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  24793583 atatttaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcgaggtagttactggtgtaggataatgatcgg 24793682  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtat 414  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24793683 atactctcctgatacgtattgggaagtatcagataattatttttttaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcgaaaagtat 24793780  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 17892714 - 17892294
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17892714 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcataggcttgcagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagacaatt 17892615  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17892614 acatacacaatataaaccaaaaagagcatcatcagtgttatactatattcaaaaggaacattgttagtgttatactatatcaatctaaaaaagaaacact 17892515  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17892514 atattcaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttatttttgttaacattaattgggaagtatcggggcagatactggtgtaggataatgattgg 17892415  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17892414 atactctcctgatacgtattgggaagtatcatataattatttttttttaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacatatcgggaagtatcg 17892315  T
Q  417 ggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||| |||| ||||| ||||    
T  17892314 ggcaggtatcggtgtatgata 17892294  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36944141 - 36943746
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaata------atattgacgattaagagagtgattattag 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36944141 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcataggctcgcaacacatcaacataaatataaatataaataatattgacgattaagagattgattattag 36944042  T
Q  111 ccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaaga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36944041 ccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcagtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtattatactatatcgatctaaaaaaga 36943942  T
Q  211 aacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataat 310  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36943941 aacactatattcaaaaaagaacacatcactactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcagggcagataccggtgtaggataat 36943842  T
Q  311 gatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcg 406  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36943841 gatcagatactctcctgatacgtatcaggaagtatcagataattatttttaaaaaaaataaattttaatcttcggatactcttctgatacgtatcg 36943746  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 416
Target Start/End: Original strand, 3108957 - 3109356
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3108957 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcataggctcgtagcaaatcaacataaatataaataatattgacgattaaaagagtgattattagccaatt 3109056  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3109057 acatacacaatatatcccaaaaagagcaccatctgtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 3109156  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3109157 atattcaaaaaataacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagataccggtgtaggataatgattgg 3109256  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    |||| |||  |||||||||   |||||||| ||||||||||| ||       ||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||| || |||||    
T  3109257 atactctccggatacgtatcgagaagtatcggataattatttgtttaaaaaataaaatttaatcttcgattaatcttctgatacgtatcgaaaaatatcg 3109356  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2586781 - 2586398
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2586781 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcataggctcgcagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 2586682  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||              
T  2586681 acatacacaatata-cctcaaaagagcatcatcagtgttatattatatccaaaaggaacattgttaatgttatactatatcgatctaaaa---------- 2586593  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
              |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2586592 ----------aagaacacatcagtcctgaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagataccggtgtaggataatgatcag 2586503  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    |||| ||| || || ||||  ||||||||  ||||||||||||||        ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  2586502 atactctcctggtatgtatcgggaagtataggataattattttttaaaaaaacaaattttaatcttcggatactcttctgatacgtattggaaagtatcg 2586403  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52721819 - 52721567
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  52721819 aaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 52721720  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52721719 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcaatgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaagcacta 52721620  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52721619 tatcgaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacat 52721567  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Original strand, 44521699 - 44522016
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44521699 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagttatacgctcgtaacacatctacataaatataaataacattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 44521798  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||| ||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  44521799 catacacaaaatatctcaaaaaaagcaccattagtgctatactatatccaaaaggaacattgttaatgttatactatatcgatccaaaaaagaagcatta 44521898  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  44521899 tattcaaaaaagaacacattagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattggaaagtatcggggcagatatcaatgaaggataattatcgga 44521998  T
Q  318 tacgctcttgatacgtat 335  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  44521999 tactctcctgatacgtat 44522016  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24784837 - 24784585
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  24784837 aaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 24784738  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24784737 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgatagtgctatactatatcaatctaaaaaagaagcacta 24784638  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24784637 tatcgaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacat 24784585  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 24823429 - 24823681
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  24823429 aaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 24823528  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24823529 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgatagtgctatactatatcaatctaaaaaagaagcacta 24823628  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24823629 tatcgaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacat 24823681  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 42630131 - 42630526
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42630131 aaatatattaacaaacaaaaggaaacagtcatagacacgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 42630230  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| || ||    
T  42630231 catacacaatatatccaaaaaaaagcatcatcagtgttatactctatccaaaaggaacattgttagtgttatactacatcgattcaaaaaagaagcatta 42630330  T
Q  218 tat------tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatg 311  Q
    |||       | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || || |||| ||||| ||||||| | ||| | ||||||     
T  42630331 tatccaaaaaaaaaaaagaacacataagtactgaagagttcagttattttagttaacattaattgtgaagtatcggagcagatatcagtgcaagataatt 42630430  T
Q  312 atcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatt-ttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcg 406  Q
    ||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  42630431 atcggatactcacctgatacgtatcaggaagtatcggataattattatttttttaaaataaaatttaatcttcggatattctcctgatacgtatcg 42630526  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 31945902 - 31946267
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31945902 aaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 31946001  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  31946002 catacacaatatatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatctaaaaggaacattgttagtgctatac-atatcgatccaaaaaagaagcacta 31946100  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||  | |  |||||||| ||||||    
T  31946101 t----------------------actcaagagttaagttattttaattaacattaattgggaagtattggggcagatattgttacaggataattatcgga 31946178  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcg 406  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31946179 tactctcctgatacgtatcgggaagtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcg 31946267  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39958153 - 39957901
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  39958153 aaatatattaacaaacacaagaaatcaatcataggctcgtaacacatcgacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 39958054  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39958053 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcggtgttatactatatctaaaaagaacattgttagtgctatactatatcgatctaaaaaagaagcacta 39957954  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39957953 tatcgaaaaaagaacacatcagtattcaagaattaagttattttagttaacat 39957901  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 43 - 418
Target Start/End: Original strand, 55900826 - 55901192
Alignment:
Q  43 cagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagag 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55900826 cagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaattatactcacgattacgagaatgatgattagtcaattacatacacaatatataccaaaaagag 55900925  T
Q  143 catcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtac 242  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    ||||||||||||||||||    
T  55900926 catcatcagtgctatattatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcattatatccataaaagaacacatcagtac 55901025  T
Q  243 tcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggca-gataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaa 341  Q
    |||||||||||||| ||||| | | ||| || ||||||  || |||||| | || |||||||||||||  |||| |||| ||  ||||          ||    
T  55901026 tcaagagttaagtttttttagtcaccattaattgggaaatattggggcagggtatcggtgtaggataactatcgaatactcttctgat----------aa 55901115  T
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcggg 418  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  55901116 gtatcagataattattttttttaaaaataaaatttaatcttcggatattttcctgatacgtatcgagaagtatcggg 55901192  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40694513 - 40694138
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40694513 aaatatattaacaaacaaaggaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatatcgacaattaagagagtgatgattagtcaatta 40694414  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| || ||    
T  40694413 catacgtaatatatcccaaaaagagcatcataagtgatatattatatccaaaagaaacattgttagtactatactatatcgattcaaaaaagaagcatta 40694314  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| || |||||||||| | ||| |||||||| || |||    
T  40694313 t----------------------actcaagagttaagttattttagttaatattaattgggaagtattggggcagatatcagtgcaggataattattgga 40694236  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    ||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  40694235 tactctcctcatacgtatcgggaagtatcagataattattttataaaaaaataaaatttaatcttcagatactctcctgatacgtatcgggaagtatc 40694138  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47607544 - 47607354
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  47607544 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagatagtgataattagtcaatta 47607445  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  47607444 catacacaatatatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaaaagaaacattgttggtgctatattatatcgatccaaaaaa 47607354  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 49470692 - 49470419
Alignment:
Q  67 acataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatcc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||| |||||||    
T  49470692 acataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattaatcaattacatacacaatattttccaaaaagtgcatcatcaatgctatactatatcc 49470593  T
Q  167 aaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaatta 266  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||||||  ||||||| ||||||  |||   ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49470592 aaaaggaacattgttagtgacatactatatcga--taaaaaaaaaacac--tatccaaaaaagtttacatgagtactcaagagttaagttattttagtta 49470497  T
Q  267 acatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtat 345  Q
    |||| || | ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  49470496 acattaa-ttggaagtatcggggcagatatcagtgcaggataattatcagatactctcctgatacgtatcgggaagtat 49470419  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51675230 - 51675031
Alignment:
Q  19 aatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattac 118  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  51675230 aatatattaacaaacaaaataaacaagtcatatgctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattaatcaattac 51675131  T
Q  119 atacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactat 218  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  51675130 atatacaatatat-ccaaaaagagaatcataagtgttatactatattagaaaggaatattgttagtgatatactatatctatccaaaaaagaagcactat 51675032  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 51859238 - 51859045
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||  | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  51859238 aaatatattaacaaacaaaagaaacaaatcataaactcgtaccacatcaacataaatataaataatattgacgattaagtgggtgatgattagtcaatta 51859139  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51859138 ctttcacaatatatcacaaaaagagcatcataagtgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaa 51859045  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14614940 - 14614754
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||||||    
T  14614940 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaa-------atgattagtcaatta 14614848  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  14614847 catatacagtatatcccaaaaagaacatcataaatgttatgttatatccaaaagaaatattgttagtgctatattatattgatctaaaaaagaa 14614754  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 754470 - 754224
Alignment:
Q  183 gtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaagg 282  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||     
T  754470 gtgtcatactatatctatccaaaaaagaaacactatattcaaaaaataacacatcaatacacaagagttaagttagtttagttaacattaaatggtaagt 754371  T
Q  283 atcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatctt 382  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||       ||||| ||||||||    
T  754370 atcggggcggatatcggtgtaggataatgatcggatactctcctgatacgtatcaggaagtatatgataattattttttaaaatgataaaa-ttaatctt 754272  T
Q  383 cggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtg 430  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||   || |||||||||| || |||||    
T  754271 cggatactgttctgatacgtatcagaaattatcgggcaggtaacagtg 754224  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1177417 - 1177227
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  1177417 atattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagaacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacata 1177318  T
Q  122 cacaatatatcccaaaaaga-gcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||| | || |||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  1177317 cacaatatatcccaaaaaaaagtaccataagtgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactatatcaatccaaaaaagaa 1177227  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 30683335 - 30683507
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  30683335 aaatatattaacaaacacaagaaaccagccatagactcgtagcatatcaacataaatataaataatatcgacgattaagagagtgatgattaatcaatta 30683434  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttata 190  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  30683435 catatataatatatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatattcaaaaggaacattgttagtgctata 30683507  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 211
Target Start/End: Original strand, 258779 - 258938
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |    
T  258779 ctcgtagcaaatcaacttaaatataaataatagtgacgattaagagagtgataattagtcaattacatacacaatatatctcaaaaagagtaccataagt 258878  T
Q  153 gttatattatatccaaaa-ggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||| |||| |||||||||    
T  258879 gttatactatatccaaaacggaacattgttactgctatactatattgatccaaaaaagaa 258938  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 7952789 - 7952949
Alignment:
Q  21 tatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacat 120  Q
    |||||||||||| |  | ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  7952789 tatattaacaaacacaagaaaccagtcatacactcgtagcatatcaacataaatataagtaatattgacgattaaaagagtgatgattaatcaattacat 7952888  T
Q  121 acacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgtt 181  Q
    | | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7952889 atataatatatcccaaaaggagcgtcatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgtt 7952949  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 420
Target Start/End: Original strand, 36511609 - 36511989
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  36511609 atattaacaaacaaaagaaaccggtcataggctcgtagcacatcaatacaaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacata 36511708  T
Q  122 cacaatatatc---ccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactat 218  Q
    || ||||||||     ||||| | || ||| | || |||| |||||||||||| || ||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36511709 caaaatatatcaaaaaaaaaaaaacaccataagtgctatactatatccaaaagaaacattcttagtgctatattatatcgatccaaaaaagaagcactat 36511808  T
Q  219 attagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggat 318  Q
                          |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||  || ||||||| ||   ||  |||||||| |||||||    
T  36511809 ----------------------actcaagagttaagttattttatttaacgttaattgggaattattggggcaggtataagttcaggataattatcggat 36511886  T
Q  319 acgctcttgatacgtattaggaagtatcagataatta-ttttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    ||  || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  36511887 actttcctgatacgtatcaggaagtatcggataattatttttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcggaaagtatcgg 36511986  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5835384 - 5835206
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |    
T  5835384 ctcgtaacacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatatatcaaaaagagcaccatcaat 5835285  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||           ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5835284 gttatatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttaatgctatactatatcgatcaaaaaaagaagcactatat 5835206  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41146559 - 41146349
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  41146559 ctcgtagcacataaacataaatataaataatattgacaattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatat-acaaaaagagcaccatcagt 41146461  T
Q  153 gttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcag 239  Q
    | |||             | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  41146460 gctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgttatactatatcgattcaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcag 41146362  T
Q  240 tactcaagagttaa 253  Q
    |||| |||||||||    
T  41146361 tact-aagagttaa 41146349  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 311
Target Start/End: Original strand, 722440 - 722576
Alignment:
Q  175 tattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaac 274  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||     
T  722440 tattgttagtgtcatactatatctatccaaaaaagaaacactatattcaaaaaataacacatcaatacacaagagttaagttagtttagttaacattaaa 722539  T
Q  275 tgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatg 311  Q
    ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  722540 tggtaagtatcggggcggatatcggtgtaggataatg 722576  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Original strand, 43509600 - 43509706
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  43509600 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagt 43509699  T
Q  153 gttatat 159  Q
     ||||||    
T  43509700 attatat 43509706  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 415
Target Start/End: Original strand, 46431792 - 46431983
Alignment:
Q  224 aaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgct 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||  ||| |||||| || ||||| | |||||| ||||||||| ||    
T  46431792 aaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgtgaaatatcagggcaggtatcggtgcatgataattatcggatactct 46431891  T
Q  324 cttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    | |||||| |||    ||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  46431892 cctgatacatatcgaaaagtatcggataattatttttttttaaaataaaatttaatctttggatactctcttgatacgtatcgggaagtatc 46431983  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 52573141 - 52573044
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||    
T  52573141 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcagtatataccaaaaagagcaccatca 52573044  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Original strand, 5325180 - 5325272
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 144  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5325180 gctcgtaacacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtgatcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagca 5325272  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14795964 - 14795866
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  14795964 gctcgtagcacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatatatcaaaaagagcaccatca 14795866  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28377449 - 28377273
Alignment:
Q  57 tagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgt-- 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||      
T  28377449 tagcacattaacataaatataaataatattggcaattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataacaaaaagagcaccatcagtgtta 28377350  T
Q  155 -----------tatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
               |||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28377349 tacatcaatgctatattatatccaaaaagaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 28377273  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 415
Target Start/End: Original strand, 37992394 - 37992583
Alignment:
Q  225 aaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctc 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | || || |||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| |||    
T  37992394 aaaagaacacatcggtactcaagagttaagttattttagttaa--ttaattgagaaatatcggggcagatatcggtgcagaataatcatcagatactctc 37992491  T
Q  325 ttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnn-taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
     ||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||        |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  37992492 ctgatatgtatcgggaattatcggataattatttttttaaaaaaataaaatttaatctttggatactcttctgatacgtatcggaaagtatc 37992583  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 53323255 - 53323084
Alignment:
Q  93 taagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatat-------------tatatccaaaaggaatattg 179  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||              |||||||||||||||  |||    
T  53323255 taagagagtggtcattagtcaattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaac-ttg 53323157  T
Q  180 ttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53323156 ttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactgtatccaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 53323084  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 253
Target Start/End: Original strand, 3402762 - 3402948
Alignment:
Q  79 ataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatat-------------tatatc 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || | |||||||              ||||||    
T  3402762 ataatattgatgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcacaataagtgttatacatcaatgctacactatatc 3402861  T
Q  166 caaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3402862 caaaaggaac-ttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 3402948  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 46431614 - 46431690
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgatta 94  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46431614 aaatatattaacaaacaaaataaatgagtcatgggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgatta 46431690  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1177220 - 1177102
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||  || ||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||  || ||||||||||  ||    
T  1177220 tactcaagagttaagttattttatttaacgttaattgggaattattggggcaggtataggtgcaggataattatcggatactttcctgatacgtatcggg 1177121  T
Q  340 aagtatcagataattattt 358  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1177120 aagtatcggataattattt 1177102  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 8063260 - 8063471
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaa---aagagcatcatc 149  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||    
T  8063260 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaattaagagcaccatc 8063355  T
Q  150 actgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacaca 235  Q
    | ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  8063356 agtgttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacaca 8063454  T
Q  236 tcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||| |||||||||    
T  8063455 tcagtact-aagagttaa 8063471  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 37992305 - 37992387
Alignment:
Q  114 attacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatat 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  37992305 attacatacccaatatatcccaaaaagagcaccattagtgctatattatatccaaaaggaacattgttagtcctatactatat 37992387  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 51859038 - 51858927
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | ||||| || | ||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||    
T  51859038 tactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtattgaggcaggtatcagtgcaagataattatcggatactctcctgatacgtatcggg 51858939  T
Q  340 aagtatcagata 351  Q
    ||||||| ||||    
T  51858938 aagtatcggata 51858927  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31227270 - 31227201
Alignment:
Q  79 ataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||    
T  31227270 ataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatgcgcaatacataccaaaaagagcatcat 31227201  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19738840 - 19738704
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  19738840 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 19738741  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  19738740 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 19738704  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 52122844 - 52122980
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  52122844 aagtatcagataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 52122943  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      |||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||    
T  52122944 caggggatacagtacgtcatccattttgaagtatcgg 52122980  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 253
Target Start/End: Original strand, 38491965 - 38492136
Alignment:
Q  79 ataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatca------tcactgttatattatatccaaaagg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| |        |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||      ||| || || | |||||||||||||    
T  38491965 ataatattgacgattaagagagtggt--------aattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccagatacatcaatgctacactatatccaaaagg 38492056  T
Q  173 aatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    ||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38492057 aac-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatccctatatccaaaaaaagaacacatcattact-aagagttaa 38492136  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10258493 - 10258433
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataa 78  Q
    |||||||||| |||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10258493 aaatatattatcaaacaaaagaaaccagtcataagcttgtagcacatcaacataaatataa 10258433  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1177083 - 1176988
Alignment:
Q  381 ttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||| |||||| || ||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||    
T  1177083 ttcggatactcttctgatacatatcggaaagtatcgggcaggtatgggtgcaggatacgtaggggatacgatacgtcaactattttgaagtatcgg 1176988  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21637808 - 21637734
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtat 414  Q
    ||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21637808 aagtatcagataattgttttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagtat 21637734  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 361
Target Start/End: Original strand, 726496 - 726552
Alignment:
Q  305 gataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatttttt 361  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  726496 gataatgatcggatactctcctgatacgtatcaggaagtatatgataattacttttt 726552  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14795841 - 14795751
Alignment:
Q  162 tatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14795841 tatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccgaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcaatact-aagagttaa 14795751  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39957707 - 39957630
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  39957707 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatattcggatactctccggatacgtatcgagaagtatcgg 39957630  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 5834944 - 5834837
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  5834944 taaaatttaatatttggatactctcccgatacgtatcgggaagcatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacggtacgtcatccattttga 5834845  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  5834844 agtatcgg 5834837  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 8064084 - 8064220
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||  || ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  8064084 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttagatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 8064183  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  8064184 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 8064220  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31227176 - 31227092
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat---tagaaaaagaacacatcagtac 242  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||    | |||||||||||||||||||    
T  31227176 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaattactatataaaaaaaaaaagaacacatcagtac 31227092  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 52721378 - 52721276
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| |  |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  52721378 taaaatttaatatttggatactctccgaatacgtatcgggaagtatcaggcagatatcggtgcaggatacgcaggggatacgatacgtcatctattttga 52721279  T
Q  468 agt 470  Q
    |||    
T  52721278 agt 52721276  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 53324629 - 53324587
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaa 95  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53324629 ctcgtagtacattaacataaatataaataatattgatgattaa 53324587  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 437
Target Start/End: Original strand, 5325699 - 5325793
Alignment:
Q  343 tatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    |||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  5325699 tatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccagatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggata 5325793  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 142
Target Start/End: Original strand, 22492895 - 22492968
Alignment:
Q  69 ataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagag 142  Q
    |||||||||| |||||||||  || |||| |||||  ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22492895 ataaatataagtaatattgataataaagaaagtgacaattagtcaattacatatatgatatatcccaaaaagag 22492968  T

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Target: chr3 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 17 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28968977 - 28968556
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28968977 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcataggctcgtagcacatcaatataaatataaataatattgacaattaatagagtgattattaaccaatt 28968878  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28968877 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcaatgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttatattatatcgatctaaaaaagaaacact 28968778  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28968777 atattcaaaaaagaacacatcattactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagataccgatgtaggataatgatcgg 28968678  T
Q  317 a-tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    | ||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28968677 attactctcctgatacgtatcgggaagtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcgggaagtatc 28968578  T
Q  416 gggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    |||||| |||| ||| ||||||    
T  28968577 gggcaggtatcggtgcaggata 28968556  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 47642472 - 47642072
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47642472 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcatagactcgcaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 47642373  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47642372 acatacacaatatatcacaaaaagagcatcatcaatgttatactatatccaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacgct 47642273  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47642272 atattcaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattggaaagtatcggggcagatacttgtgtaggataatgatcgg 47642173  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  47642172 atactctcctgatacgtatcgggaagtatcagataattatttttttataaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtattgggaagtatcg 47642073  T
Q  417 g 417  Q
    |    
T  47642072 g 47642072  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 425
Target Start/End: Original strand, 7899371 - 7899779
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7899371 aaaatatattaaaaaacaacataaaccagtcataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 7899470  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  7899471 acatacacaatatatcccaaaaagagcaccatcagtgttatactacatccaaaagaaacattgctagtgctatactatatcgatccaaacgagaagcact 7899570  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  7899571 atatta-aaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagatatcagtataggataatgatcag 7899669  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttt-tnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||| |||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  7899670 atactctcccgatacgtatcgggaagtatcggataattatttttgtaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcgggaaatatc 7899769  T
Q  416 gggcagatat 425  Q
      ||||||||    
T  7899770 aagcagatat 7899779  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Original strand, 19878756 - 19879144
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||| ||| || | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19878756 aaatatattaataaacaaaagaaaccagtcataagttcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 19878855  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  19878856 catacacaatatatcc-aaaaagagcaccaccagtgctataatatatccaaaaggaatattgttagtgatatattatatcgatccaaaaaagaaacatta 19878954  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatc-ggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| |||||||  | ||||| |||||||| ||||     
T  19878955 tatcaaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaactatcgggggcaggcagcggtgcaggataattatcga 19879054  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcg 406  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||       ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  19879055 atactctcatgatacgtatcgggaagtatcggataattatttttttaaaaaataaaattgaatcttcggatactctccttatacatatcg 19879144  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25701228 - 25700806
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25701228 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaggacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 25701129  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaa-aagaaacact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  25701128 caaacacaatatatcccaaaaagagcaccgtcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgataaaaaataaaaaacact 25701029  T
Q  217 atat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcg 315  Q
    ||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||| | | ||| |||||||| ||||    
T  25701028 atataaaaaaaaaaaacacataagtactcaagagttaagttattttagtaaacattaattgggaagtatcggggcagacatcagtgcaggataattatcg 25700929  T
Q  316 gatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatttt-ttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtat 414  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||   |||||||    
T  25700928 gatactctcctgatacgtatcgggaagtatcggataattattttaaaaataaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtattaggaagtat 25700829  T
Q  415 cgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    | ||||| |||| ||| ||||||    
T  25700828 caggcaggtatcggtgcaggata 25700806  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 45056954 - 45057282
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45056954 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcttaggctcgtagcgcatcaacataaatataaataatatcaacaattaagagagtgatgattagtcaatta 45057053  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || || |||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||    
T  45057054 catacacaatatatcctaaaaagagcaccagcagtgctatactatatacaaaagaaacattgttagtgttgtactatatcgatccaaaaaataagcatta 45057153  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |    
T  45057154 tatccaaaaaagaacacattagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaaatatcagggcagatatctgtgtaggataattatcgaa 45057253  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatc 346  Q
    ||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  45057254 tactctcatgatacgtatcgggaagtatc 45057282  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 383
Target Start/End: Original strand, 20509830 - 20510174
Alignment:
Q  39 aaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaa 138  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20509830 aaatcaatcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgatgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatatatcccaaaa 20509929  T
Q  139 agagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatca 238  Q
     ||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    ||||||| ||||||    
T  20509930 ggagcaccatcaatgatatactatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatgtcgatccaaaaaagaagcactatatccataaaagaatacatca 20510029  T
Q  239 gtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattag 338  Q
     || |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||  || ||||||| || || || |||||||| |||| ||||  |  ||||| ||||  |    
T  20510030 ctattcaagagttaagttattttagtcaacattaattgggaaatattggggcaggtatcgatgcaggataattatcgaatacttttctgataagtatcgg 20510129  T
Q  339 gaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  20510130 gaagtatcagataattattttttttaaaaataaaatttaatcttc 20510174  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52684792 - 52684540
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  52684792 aaatatattaacaaacacaagaaaccagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaaaagagtggtgattagtcaatta 52684693  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52684692 catacacaatatataccaaaaagagcaccatcggtgttatactatatccaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaagcacta 52684593  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  52684592 tatcgaaaaaagaacacattagtactcaatagttgagttattttagttaacat 52684540  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 2566923 - 2567174
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  2566923 aaatatattaacaaacacaagaaat-agtcacaagctcctagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 2567021  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||  ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2567022 catacacaatatataccaaaaagagcaccatcggtgctatgctatatccaaaaagaacattgtatgtgttatactatatcgatctaaaaaggaagcacta 2567121  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2567122 tatcgaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacat 2567174  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19421877 - 19421484
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19421877 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaa----------attgatgcttaagagagtgatgattagtcaatta 19421788  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatc------caaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||       || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19421787 catacacaatatatcccaaaaagagcaccattagtgctatattatatttatattcataaggaacattgttagtgttatactatatcgattcaaaaaagaa 19421688  T
Q  212 acactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatg 311  Q
     ||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||  ||| |||||| || ||||| ||||||||     
T  19421687 gcactatatccaaaaaagaatacatcagtgctcaagagttaagttattttggttaacattaattgggaaatatcagggcaggtatcggtgcaggataatt 19421588  T
Q  312 atcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaag 411  Q
    |||  |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  19421587 atcatatacgctcctgatacgtatcgggaagtatcggataattactttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaag 19421488  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 21006016 - 21006268
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  21006016 aaatatattaacaaacacaagaaaccagtcacaggttcgtagcacatcaacatgaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 21006115  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21006116 catacacaatatataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaagcatta 21006215  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||   ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21006216 tatcgaaaaaagaacacatcgatactcaatagttaagttattttatttaacat 21006268  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 361
Target Start/End: Original strand, 13352876 - 13353191
Alignment:
Q  46 tcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcat 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||     
T  13352876 tcataggctcgtagcacatcaacatagatataaataatattgaggattaaaagtatgataattagtcaattacatacacaatatatcctaaaaacaacac 13352975  T
Q  146 catcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactca 245  Q
    ||| | || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13352976 cattaatgatatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactgtgtcgatccaaaaaagaagcactatatcaaaaaaagaacacatcagtactca 13353075  T
Q  246 agagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtat 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||| ||||| |  | || || || ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  13353076 agagttaagttattttagttaacattaattccgaagtatcggagtcgctatcgatgcaggattattatcggatactctcctgatacgtatcgggaagtat 13353175  T
Q  346 cagataattatttttt 361  Q
    ||||||| | ||||||    
T  13353176 cagataaatttttttt 13353191  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 360
Target Start/End: Original strand, 38888750 - 38889081
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  38888750 aaatacattaacaaacaaaagaaatcagtcatgggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagacagtgatgattagtcaatta 38888849  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||            ||||| ||| |||||| |||| ||| |||||| || |||||    
T  38888850 catacacaatatatctcaaaaagagcatcatcaatgttatactacat------------ttgttagtgctatactttatcaatccaaaaaataagcacta 38888937  T
Q  218 tattagaaaaag-aacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||  |||||||||| ||   | | |||||||| |||||    
T  38888938 tatccaaaaaagaaacacaccagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgagaaatatcggggcaggtattagagcaggataattatcgg 38889037  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttt 360  Q
    |||| ||| ||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  38889038 atactctcctgatacgcatcgggaagtatcaaataattattttt 38889081  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 412
Target Start/End: Original strand, 30787350 - 30787609
Alignment:
Q  154 ttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30787350 ttatactatatctaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaataacacatcagtactcaagagttaa 30787449  T
Q  254 gttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataat 353  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||  ||||||    
T  30787450 gttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagatatcagtgcatgataattatcggatactctcctgatatgtatcgggaagtataggataat 30787549  T
Q  354 tatt-ttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagt 412  Q
    |||| ||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  30787550 tattatttttttaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgagaagt 30787609  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 983627 - 983247
Alignment:
Q  26 taacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacaca 125  Q
    ||||||| || | |||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  983627 taacaaacaaaagaaattagtcatagtctcgtagtacatcaacgtaaatataaataatattgacgaataagagagtgatgattaatcaattacatacaca 983528  T
Q  126 atatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaa 225  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||                |||||||| ||  ||||||||||||||||||   ||    
T  983527 atatatcataaaaagagcaccatcagtgctatactatgtccaaaagga----------------actatatccattcaaaaaagaaacactatatccaaa 983444  T
Q  226 aaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctct 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||         
T  983443 aaagaacacataagtactcaagagttaagttgttttagttaacattaattgggaactatcggggcagatagcggtgcaggataattattggatac----- 983349  T
Q  326 tgatacgtattaggaagtatcagataatta-ttttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagata 424  Q
        ||||||| |||| |||| |||||||| ||||||       |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  983348 ----acgtattgggaaatatcggataattatttttttttttaaataaaatttaatctttggatactctcctgatacgtatcgggaagtatcagacagata 983253  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29916236 - 29916034
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatt-attagccaatt 116  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| | |||    
T  29916236 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcatagactcgtagcatatcaacataaatataaataatattgtcgatcaagagagtgatggattagtcgatt 29916137  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29916136 acataaacaatatatcccaaaaagaacaccatcagtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaacagaagcact 29916037  T
Q  217 ata 219  Q
    |||    
T  29916036 ata 29916034  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29965389 - 29965187
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatt-attagccaatt 116  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| | |||    
T  29965389 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcatagactcgtagcatatcaacataaatataaataatattgtcgatcaagagagtgatggattagtcgatt 29965290  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29965289 acataaacaatatatcccaaaaagaacaccatcagtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaacagaagcact 29965190  T
Q  217 ata 219  Q
    |||    
T  29965189 ata 29965187  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 176 - 436
Target Start/End: Original strand, 21157539 - 21157800
Alignment:
Q  176 attgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatatt-agaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaac 274  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21157539 attgttagtgctatactatatcaatcaaaaaaagaagcactatatccaaaaaaagaacacatcaatactcgagagttaagttattttaattaacattaat 21157638  T
Q  275 tgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaat 374  Q
    ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||       ||||||    
T  21157639 tgggaactatcggggcaggtagcggtgcaggataattatcagatactctcctgatacgtatcaggaagtatcggataattattttttaaaaaaataaaat 21157738  T
Q  375 ttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggat 436  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21157739 ttaatcttcggatactctcctggtacgtatcagaaagtatcgggcagttatcaatgcaggat 21157800  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 22289397 - 22289771
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  22289397 aaatatattaacaaacaaaagaaaccattcataggctcgtagtacatcaacgtaaatataaataatattgacgattaatagagtgatgattattcaatta 22289496  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||  ||||||||||||||| | || ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22289497 cataccgaatatatcccaaaaaaa-caccataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttgtactatatcgatccaaaaaagaagcacta 22289595  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      || ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||  |||||| || ||||  | |||||| ||| ||    
T  22289596 t----------------------acccaaaagttaagttattttagttaacattaattgggaagtattagggcaggtatcggtacatgataattatcaga 22289673  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  22289674 tactctcctgatacgtattagaaagtatcagatgattattttttaaagaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcaggaagtatc 22289771  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 48333380 - 48333212
Alignment:
Q  43 cagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagag 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   | || ||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  48333380 cagtcataggctcgtagcacatcaacataaatatatataatattgacaattaagagagtgacggtcagtcaactacatacacaatatatcccgaaaagaa 48333281  T
Q  143 catcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48333280 caccatcagtgttatactatatccaaaaggaatattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaa 48333212  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2123124 - 2122770
Alignment:
Q  46 tcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcat 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2123124 tcataagctcgtagaacatcaacataaatataaataatattgacgattaagtgggtgatgattagtcaattactttcacaatatatcccaaaaagagcat 2123025  T
Q  146 catcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactca 245  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| | |||  |||| |||| ||||||                      |||||    
T  2123024 cataagtgttatattatatccaaaagaaagattgttagtcttatactattttgattaaaaatagaagcactat----------------------actca 2122947  T
Q  246 agagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtat 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| || | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  ||  ||||||||||   |||||||    
T  2122946 agagttaagttattttagttaacattaattggaaagtattgaggcaggtaccagtgcaggataattatcggatagtctactgatacgtatcgcgaagtat 2122847  T
Q  346 cagataat--tattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggca 420  Q
    ||||||||  | ||||||       ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2122846 cagataattctttttttttttaaaataaaatttaatcttcggattctctcctgatacgtatcgggaagtatcaggca 2122770  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2123148 - 2122951
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |     
T  2123148 atattaacaaacaaaagaaacaaatcataagctcgtagaacatcaacataaatataaataatattgacgattaagtgggtgatgattagtcaattacttt 2123049  T
Q  122 cacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| | |||  |||| |||| |||||||    
T  2123048 cacaatatatcccaaaaagagcatcataagtgttatattatatccaaaagaaagattgttagtcttatactattttgattaaaaatagaagcactata 2122951  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 212959 - 212810
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  212959 aaatatattaacaaacaaaagaaattagtcataggctcgtaccacatcaacgtaaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagtcaatta 212860  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatcca 167  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| | || |||| ||||||||    
T  212859 catacataatatatctcaaaaagagcaacatgagtgctatactatatcca 212810  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28548489 - 28548296
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28548489 aaatatattaacaaacataagaaactagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattaccgattaagagagtgataattagtcaatta 28548390  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    |||| ||| |||| | ||||||||||| ||||| || |||  ||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  28548389 catatacactataactcaaaaagagcaacatcagtgatatgctatattcaaaaagaacattgttagtgctatgctatatcgatccaaaaaagaa 28548296  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22311284 - 22311106
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  22311284 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaagatataccaaaaagagcaccatcagt 22311185  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||           ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22311184 gttatatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttaatgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 22311106  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 21157413 - 21157536
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21157413 aaatatattaacaagtaaaagaaaccagtcatatgctcttagcacatcaacataaatatgaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 21157512  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaaga 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21157513 catacacaatatatccccaaaaga 21157536  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35390301 - 35390126
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatc------ 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| |          
T  35390301 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagaatgatgattagtcaattacatacgtaaaatataccaaaaagagcaccagtgtc 35390202  T
Q  147 --atcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
      |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35390201 atatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttaatgttatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 35390126  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 25322170 - 25322333
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| || ||| | |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25322170 aaatatattaacaaacacaagaaaccaatcacaggctcatagcatatctacataaatataagtaatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 25322269  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgtt 181  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25322270 catatataatatatcccaaaaagagcactatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgtt 25322333  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 13748177 - 13748291
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  13748177 atattaacaaacaaaataaaccagttataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacata 13748276  T
Q  122 cacaatatatcccaa 136  Q
    |||||||||||||||    
T  13748277 cacaatatatcccaa 13748291  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Original strand, 42464302 - 42464408
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  42464302 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcatcatcag 42464401  T
Q  152 tgttata 158  Q
    |||||||    
T  42464402 tgttata 42464408  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45348013 - 45347907
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  45348013 atattaacaaacaaaagaaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacaaa 45347914  T
Q  122 cacaata 128  Q
    |||||||    
T  45347913 cacaata 45347907  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 48334323 - 48334155
Alignment:
Q  43 cagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagag 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |   | || |||  |||| ||||||||||||| ||||||     
T  48334323 cagtcataggctcgtagcacatcaacataaatatatataatattgacgattaagagggtaacggtcagtcaacgacatgcacaatatatcccgaaaagaa 48334224  T
Q  143 catcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    || ||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48334223 caccatccgtgttatactatatccaaaaagaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaa 48334155  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Original strand, 50286911 - 50287088
Alignment:
Q  54 tcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactg 153  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  50286911 tcgtagtacattaacataaatataaataatattaacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagtg 50287010  T
Q  154 ttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||||           ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50287011 ttatatcaatgttatactatatccaaaaggaacattattgatgctatactatatcgatccaaaaaagaaacactatat 50287088  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 415
Target Start/End: Original strand, 55268854 - 55269066
Alignment:
Q  203 aaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgt 302  Q
    |||||||||  |||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||  |||||||| |  ||     
T  55268854 aaaaaagaagaactatatccaaaaaataacacatcagtactcaagacttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcatggcagatatcaatgc 55268953  T
Q  303 aggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacat 402  Q
    |||||||| |||||||||  || |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  55268954 aggataattatcggatactatcctgatgcgtatcgggaagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgt 55269053  T
Q  403 atcgagaagtatc 415  Q
    |||| ||||||||    
T  55269054 atcgggaagtatc 55269066  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 25936242 - 25936452
Alignment:
Q  54 tcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca--------- 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||             
T  25936242 tcgtagcacattaacataaatataaacaatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccattagtg 25936341  T
Q  145 ----tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagt 240  Q
         ||||| || || | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  25936342 ctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcagt 25936440  T
Q  241 actcaagagttaa 253  Q
    ||| |||||||||    
T  25936441 act-aagagttaa 25936452  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Original strand, 28882243 - 28882421
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  28882243 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagt 28882342  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||           |||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  28882343 gttatatcaatgttatactatatccaaaagaaacattgttaatgctatactatatcgatcataaaaagaagcactatat 28882421  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 45347541 - 45347306
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| | || || |||  || ||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||  || |||||||||| |||    
T  45347541 tactcaagatttaagttattttatttaacgttaattgagaattattggggcagatataggtgcaggataattatcagatactttcctgatacgtatcagg 45347442  T
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnn-taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatat 438  Q
    ||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  45347441 aagtatcggataattattttttaaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttcggatacgtatcgaaaagtatcgggcaggtatcagtgcaggata- 45347343  T
Q  439 gttggggatacggtaatcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    |  ||||||||| || ||| | |||||||||| ||||    
T  45347342 gcaggggatacgatagtcaaccattttgaagtatcgg 45347306  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 10224321 - 10224419
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10224321 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacaattaagagagtgctcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcatcatca 10224419  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 190
Target Start/End: Original strand, 47750631 - 47750758
Alignment:
Q  63 atcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcatcatcactgttatatta 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  47750631 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatccc-aaaagagcaccatcaatattatacta 47750729  T
Q  162 tatccaaaaggaatattgttggtgttata 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47750730 tatccaaaaggaatattgttagtgttata 47750758  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 110
Target Start/End: Original strand, 41741821 - 41741912
Alignment:
Q  19 aatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattag 110  Q
    |||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41741821 aatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattag 41741912  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 48123777 - 48123683
Alignment:
Q  56 gtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  48123777 gtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatca 48123683  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 22610440 - 22610650
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||| |    
T  22610440 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattgagagagtggtcattagtcaattacatacgaaatatat-acaaaaagagcactatcagt 22610538  T
Q  153 gttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcag 239  Q
    |||||             | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  22610539 gttatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcag 22610637  T
Q  240 tactcaagagttaa 253  Q
    |||| |||||||||    
T  22610638 tact-aagagttaa 22610650  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 129
Target Start/End: Original strand, 30787274 - 30787350
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30787274 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattaacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatat 30787350  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 240 - 437
Target Start/End: Original strand, 41741947 - 41742144
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||  || | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||    
T  41741947 tactcaagagttaagttattttacttaacattaattgggaagtattggggcatgtatcagtgcaggataattatcggatactctcctgatacgtatcggg 41742046  T
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||| | ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||||    
T  41742047 aagtaccggataattattttttttaaaaataaaatttaatcttcggatactctccagatatgtatcgggaagtatcaggaaggtatcggtgcaggata 41742144  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 52504986 - 52505198
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca-------- 144  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||            
T  52504986 ctcgtaacacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatatactaaaaagagcaccattagt 52505085  T
Q  145 -----tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatca 238  Q
          ||||| || || | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | |||||||||||||||    
T  52505086 gctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcattatatccaaaaaaagaacacatca 52505184  T
Q  239 gtactcaagagttaa 253  Q
    ||||| |||||||||    
T  52505185 gtact-aagagttaa 52505198  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 415
Target Start/End: Original strand, 6134242 - 6134432
Alignment:
Q  225 aaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctc 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||  | | |||||  || || || |||||||| |||| |||| |||    
T  6134242 aaaaaaacacatcagtactcaagagttaagttattttagtcaacattaattgggaaataacagggcatgtatcgatgcaggataattatcgaatactctc 6134341  T
Q  325 ttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
     |||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||       ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6134342 ctgataaatatcgggaagtatcggataattatttttttaaaaaataatatttaatcttcggatactctcctgatacatatcgggaagtatc 6134432  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 42229907 - 42229720
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||            
T  42229907 tactcaagagttaagttattttaattaacattaattgggaagtattggggcaggtattggtgcaggataattatcggatactctcctgatac-------- 42229816  T
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
      ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  42229815 --gtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaattttcggatactcttctgatacgtatcaggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggata 42229720  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 45532226 - 45532436
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  45532226 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagggtggtcattagtcaattacatacgcaatatat-acaaaaagagcaccatcagt 45532324  T
Q  153 gttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcag 239  Q
    | |||             | |||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  45532325 gctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatattatatcaatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcag 45532423  T
Q  240 tactcaagagttaa 253  Q
    |||| |||||||||    
T  45532424 tact-aagagttaa 45532436  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 52121718 - 52121613
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  52121718 ctcgtagcacattaacataaatataaatattatttacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatatatcaaaaagagcaccatcact 52121619  T
Q  153 gttata 158  Q
    ||||||    
T  52121618 gttata 52121613  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39664857 - 39664657
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||| |||    
T  39664857 atattaacaaacaaaagaaatcaggcataggctcgtagcacgtcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgacgatttgtcaattatata 39664758  T
Q  122 cacaatatatcc----caaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
     |||||||||||     ||||| |  | ||| | || |||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  39664757 -acaatatatccaaaaaaaaaaaaataccataagtgctatactatatccaaaagaaacattgtcagtgttatactatatcaatacaaaaaagaagcacta 39664659  T
Q  218 ta 219  Q
    ||    
T  39664658 ta 39664657  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Original strand, 19349300 - 19349480
Alignment:
Q  44 agtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaat-----atatcccaaaa 138  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||     | ||   | ||    
T  19349300 agtcataggctcataacacatcaacataaatataaattatattgacgattaagagagcgacgattagtcaattacatacacaatacataaaataaaataa 19349399  T
Q  139 agagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
    | | || ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19349400 aaaacaccataagtgttatactatatccaaaagaaacattgtcagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactata 19349480  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33241288 - 33241166
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatc-----a 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||   |||||||||| |     |    
T  33241288 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatatgcaaaatatataaaaaagagcaccgttata 33241189  T
Q  148 tcactgttatattatatccaaaa 170  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  33241188 tcaatgttatattatatccaaaa 33241166  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Original strand, 1678846 - 1678948
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||     
T  1678846 gctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatcag 1678941  T
Q  152 tgttata 158  Q
    |||||||    
T  1678942 tgttata 1678948  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28705693 - 28705591
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||     
T  28705693 gctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagacaattacatatgcaatatataccaaaaagagcaccatcaa 28705598  T
Q  152 tgttata 158  Q
    |||||||    
T  28705597 tgttata 28705591  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 437
Target Start/End: Original strand, 13748323 - 13748519
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||| ||  || ||||||| ||  |||  | |||||| |||||||||  |  ||||||||||  ||    
T  13748323 tactcaagagttaaattattttatttaacgttaattggaaattattggggcaggtataggtacatgataattatcggatacttttctgatacgtatcggg 13748422  T
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  13748423 aagtatcagataattatttta-aaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggata 13748519  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1528959 - 1528881
Alignment:
Q  79 ataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||    
T  1528959 ataatattgacgattaagagagtggtcattaggtaattacatacacaatatataccaaaaagagcaccagcagtgttat 1528881  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7328060 - 7327968
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7328060 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 7327968  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Original strand, 37996573 - 37996665
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37996573 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 37996665  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42229973 - 42229914
Alignment:
Q  152 tgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  42229973 tgttatactatatccaaaaggaatattgttagtgctatactatatcgattcaaaaaagaa 42229914  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 212802 - 212670
Alignment:
Q  187 tatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcg 286  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || | |||   ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || |||| || ||  ||  | ||    
T  212802 tatactttatcgatcaaaaaaagaagcattttatccaaaaaagaacacatcaatactcaagagttaaataattttagttgacattaattgaaaaataccg 212703  T
Q  287 gggcagataccggtgtaggataatgatcggata 319  Q
    |||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  212702 gggcagatatatgtgtaggataattatcggata 212670  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 253
Target Start/End: Original strand, 1678980 - 1679055
Alignment:
Q  178 tgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1678980 tgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 1679055  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29916030 - 29915926
Alignment:
Q  245 aagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagta 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||  || || || |||||||| ||| |||||  || ||||||||||  |||||||    
T  29916030 aagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtattggggcatgtatcgatgcaggataattatcagatactatcctgatacgtatcgggaagta 29915931  T
Q  345 tcaga 349  Q
    |||||    
T  29915930 tcaga 29915926  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29965183 - 29965079
Alignment:
Q  245 aagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagta 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||  || || || |||||||| ||| |||||  || ||||||||||  |||||||    
T  29965183 aagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtattggggcatgtatcgatgcaggataattatcagatactatcctgatacgtatcgggaagta 29965084  T
Q  345 tcaga 349  Q
    |||||    
T  29965083 tcaga 29965079  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48334124 - 48334076
Alignment:
Q  313 tcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatttttt 361  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48334124 tcggatactttcttgatacgtatcaggaagtatcagataattatttttt 48334076  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 35389864 - 35389757
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  35389864 taaaatttaatatttggatactctcccgatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacggtacgtcatccattttga 35389765  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  35389764 agtatcgg 35389757  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 40497473 - 40497337
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| |    
T  40497473 aagtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaagtatcggtgcaggatacg 40497374  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  40497373 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 40497337  T

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Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 453
Target Start/End: Original strand, 1679675 - 1679786
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||      
T  1679675 gtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatatgca 1679774  T
Q  442 ggggatacggta 453  Q
    | ||||||||||    
T  1679775 gtggatacggta 1679786  T

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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Original strand, 10224440 - 10224501
Alignment:
Q  158 attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10224440 attatatccaaaaggaac-ttgttagtgttatactaaatcgatccaaaaaagaatcactatat 10224501  T

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Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7327853 - 7327719
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||| | | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |      
T  7327853 gtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactatccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgca 7327754  T
Q  442 ggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  7327753 ggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 7327719  T

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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48333181 - 48333079
Alignment:
Q  313 tcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagt 412  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||| |    
T  48333181 tcggatactttcctgatacgtatcaggaagtatcaaataattatttttttttaatataaaatttaatcttcgaatactcttttaatatatatcgggaaat 48333082  T
Q  413 atc 415  Q
    |||    
T  48333081 atc 48333079  T

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Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28705576 - 28705493
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatatt-agaaaaagaacacatcagtact 243  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  28705576 tatatccaaaatgaac-ttgttagtgatattctatatcgatccaaaaaagaatcactatattcaaaaaaagaacacatccgtact 28705493  T

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Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 219
Target Start/End: Original strand, 41741916 - 41741948
Alignment:
Q  187 tatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41741916 tatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 41741948  T

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Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 426
Target Start/End: Original strand, 45532957 - 45533041
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatc 426  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  45532957 gtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactcttcggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatc 45533041  T

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Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 52121294 - 52121187
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||  ||||| |||||||    
T  52121294 taaaatttaatatttggatactctcccgatacgtatcgagaagtatcggacaggtattagtgcaggatacgcaggggatacgatacgtcatccattttga 52121195  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  52121194 agtatcgg 52121187  T

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Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3983811 - 3983765
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  3983811 taaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatc 3983765  T

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Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30226534 - 30226432
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggtaa-tcatctattttga 467  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  30226534 taaaatttaatcttcggatactctcttgatacgtatcagaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcagaggatacgataagtcatccattttga 30226435  T
Q  468 agt 470  Q
    |||    
T  30226434 agt 30226432  T

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Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39664136 - 39664082
Alignment:
Q  303 aggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatt 357  Q
    |||||||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39664136 aggataattatcggatactttcctgatacgtatcgggaagtatcagataattatt 39664082  T

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Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 437
Target Start/End: Original strand, 42464884 - 42464979
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  42464884 gtatcggataattattttttaaaacaataaaaattaatatttggatactcttcggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggata 42464979  T

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Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48123660 - 48123568
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||  | |||| || |||||||||||| |||||||||    
T  48123660 tatatccaaaaggaac-ttgtttgtgttatactatgtcgattcaaaaaagaatcactatatccaaaaaatgaccacatcagtact-aagagttaa 48123568  T

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Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 48122966 - 48122832
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| |||||   ||||| ||||| ||| |||||||||  |||| ||| ||||||||      
T  48122966 gtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctctggatacgtatcgggaaatatcgggcatgtatcggtgcaggatatgca 48122867  T
Q  442 ggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  48122866 ggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 48122832  T

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Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 35342783 - 35342324
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35342783 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcatcggcttgtagcacatcaaaataaatataaataatattgacgattaagagattgattattagccaatt 35342684  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35342683 acatacacaatatatcctaaaaagagcatcatcagtgttatattatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 35342584  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35342583 atatta-aaaaagaacacatcagtaatcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcagggcagatacctgtgtaggataatgatcgg 35342485  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnn-taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  35342484 atactctcctgatacgtatcgggaagtatcagataattatttttttttaaaaataaaatttaatcttcggatactcttttgatacgtatcgggaagtatc 35342385  T
Q  416 gggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
     || || |||| ||| |||||| |   |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  35342384 aggtaggtatcggtgcaggatacgcaagggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 35342324  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 31235839 - 31236236
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31235839 aaatatattaacaaacaaaagaaactagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgatgattagtcaatta 31235938  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31235939 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcaatgatatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaagcacta 31236038  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||  |||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||    
T  31236039 tatccaaaaaaaaacacatcagtactgaagagttaagttattttagttaacatttactgtgaaatatcgaggcagatatcgatgtaggataattatcaga 31236138  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  31236139 tactctcctgatacgtatcgggaagtatcggctgattattttttaaaaaattaaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaaatatc 31236236  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 34146609 - 34146237
Alignment:
Q  54 tcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactg 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34146609 tcgtagcatatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacctacacaatatatcccaaaaagagcatcatcaatg 34146510  T
Q  154 ttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||| || || |||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34146509 ttatactatatccaaaaggaacactgttagtgctatactatatcaatctaaaaaataagcattatatccaaaaaagaacaaatcaatactcaagagttaa 34146410  T
Q  254 gttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataat 353  Q
     |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34146409 attattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagatatcagtgcagaataattatcggatactctcctgatacgtatcaggaagtatcggataat 34146310  T
Q  354 tattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatc 426  Q
    ||||||||       |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  34146309 tattttttttaaaaataaaatttaatctttggatactctcctgatacgtatcgggaagtatcaggcagatatc 34146237  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1005955 - 1005579
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1005955 aaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 1005856  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1005855 catacacaatatatcctaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaaaaggaatattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaaacacta 1005756  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||    
T  1005755 t----------------------actcaagagttaagttattttaattaacattaattgggaagtattggggcagatattggtgcaggataattatcaga 1005678  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  1005677 tactcttctgatacgtatcaggaagtatcagataattatttaaaaaataaataaaatttaatcttcagatactcttctaatacgtatcgggaagtatcg 1005579  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 415
Target Start/End: Original strand, 3545233 - 3545631
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||| | || | ||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  3545233 aaaatatattaacatacaaaagaaaccgatcataggctcgtagtacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgataattaatcaatt 3545332  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||  ||| || || ||||    
T  3545333 acatacacaatatatcctaaaaggagcatcatcagtggtatactatatccaaaagaaatattattagtgctatactatatcgat-aaaataaaaagcact 3545431  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||  | |||| ||||| | ||| | |||||| ||| |    
T  3545432 atatccaaaaaagaacacatcagtactcaagaattaagttattttaattaacattaattaggaagttttggggaagatatcagtgcatgataattatcag 3545531  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatt-ttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||| ||||       ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3545532 atactctcttgatatgtatcgggaagcatctgataattattatttttttaaaataaaatttaatcttcggatgctctcctgatacatatcgagaagtatc 3545631  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21104938 - 21104539
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21104938 aaaatatattaacaaataacagacaccagtcataggctcgtaatacatcaacataaacataaataatattgacgattaagagagtgattataa-ccaatt 21104840  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||            ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  21104839 acatacacaatatatcccaaaaacaatatcatcagc----------atccaaaaggaatattgttagtgatatactatatcgatacaaaaatgaagcact 21104750  T
Q  217 atatt-agaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcg 315  Q
    ||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21104749 atattcaaaaaaagtacacatcaatactcaaaagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagatatcggtgtaggataatgatcg 21104650  T
Q  316 gatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||||  || ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||        || ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||    
T  21104649 gatactttcctgatacgtatagggaaatatcggataattatttttaaaaaaagtataatttaatcttcggatactcctttgatacgtatcgggaaatatc 21104550  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2319737 - 2319343
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  2319737 aaatatattaacaaataaaagaaaccagtcag--gctcgtagcacatccacattaatataaataatattgacgattaaaagaatgatgattagtcaatta 2319640  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
      || | |||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  2319639 attagaaaatatatcccaaaaagagca-catcatggatatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcaatccaaaaaagaagcacta 2319541  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |||    |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |  |  |||||||| ||||||    
T  2319540 tatccataaaaaaatgcatcagtactcaatagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcagggcagatatcaatccaggataattatcgga 2319441  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2319440 tactctcctgatacgtatcgggacgtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcaggaagtatc 2319343  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4562233 - 4561834
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4562233 aaaatatactaacaaacaaaataaaccagtcataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatt 4562134  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  4562133 acatacacaatatatcccaaaaagagtaccataagtactatactatatccaaaaggaacattgttagtgatatactatatcaatccaaaaaagaagcact 4562034  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    ||                      ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || ||| ||| ||  |||| | |||||| |||||    
T  4562033 at----------------------actcaagagttaagttattttaagtaacattaattgggaagtattgggacaggtattggtgcatgataattatcgg 4561956  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataatta-ttttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  4561955 atactctcctgatacgtatcgggaagtatcagataattatttttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatatgtatcgggaagtatc 4561856  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14824582 - 14824216
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14824582 aaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 14824483  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  14824482 catacacaatatatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcatta 14824383  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| || ||  |||| |||||||| ||||||    
T  14824382 t----------------------actcaagagttaagttattttaattaacattaattgggaagtattggggaaggtattggtgcaggataattatcgga 14824305  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataatta-ttttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatc 405  Q
    ||| ||| ||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14824304 tactctcctgatacgtatcgggaaatatcggataattattttttttttaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatc 14824216  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 270
Target Start/End: Original strand, 45158850 - 45159081
Alignment:
Q  39 aaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaa 138  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45158850 aaatcagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaatatataccaaaa 45158949  T
Q  139 agagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatca 238  Q
    |||||| ||||  || |||| ||||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |    
T  45158950 agagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacatttttagtgctatactatatcgatctaaaaaagaagcactatatcgaaaaaagaacacataa 45159049  T
Q  239 gtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||    
T  45159050 gtactgaagagttgaattattttagttaacat 45159081  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3564282 - 3563908
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  3564282 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataa-taatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattg 3564184  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||  || |||||||||  |||| ||||||||  |||||    
T  3564183 catacacaatatatcccaaaaagagcatcataactgttatactatatccaaaagaagcattgttaatgctatactataatgatccaaaaaagagtcacta 3564084  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | ||||| || || || |||||||| ||||||    
T  3564083 t----------------------actcaagagttaagttattttacttaacattaattgggaagtattgtggcaggtatcgatgcaggataattatcgga 3564006  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    ||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  3564005 tactcttctgatacgtatcgggaagtatcagataattattttttaaagaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatc 3563908  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4355754 - 4355555
Alignment:
Q  19 aatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattac 118  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  4355754 aatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggttcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgactaagagagtgatgattagtcaattac 4355655  T
Q  119 atacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactat 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||| | || |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4355654 atacataatatatcccaaaaagagccccataagtgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcactat 4355555  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 44157040 - 44156665
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  44157040 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaaaagagtgatgattagtcaatta 44156941  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||| ||| || |||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  44156940 catacacaacata-cccaaaaagagcaccacaagtgttatactatatccagaagaaacattgttagttctatattatatcgatccaaaaaagaagcatta 44156842  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||| ||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  44156841 t----------------------actcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtattgggtcaggtatcggtgcaggataattatcgga 44156764  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatttttt-nnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||  || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  44156763 taccatcctgatacgtatcaggaagtatcggataattattttttaaaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatc 44156665  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10573948 - 10573632
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataa-tattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  10573948 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataaatattgacgattaagtgagtgatgattagtcaatt 10573849  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||            ||| |||||||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  10573848 acatatacaatatatctcaaaaagagcaccaccaatgatatactatatcc------------gttagtgttatactttatcgatccaaaaaataagcact 10573761  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    ||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || |||  |||||| ||  || || || || ||||| |||||    
T  10573760 atatccaaaaaagaacacatcactactcaatagttaagttattttggttaacattaattgagaaatatcgggacatgtatcgatgcagaataattatcgg 10573661  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtat 345  Q
    |||| |||  |||||||||  ||||||||    
T  10573660 atactctccagatacgtatatggaagtat 10573632  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24585953 - 24585777
Alignment:
Q  44 agtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagc 143  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  24585953 agtcatatgctcgtagcacataaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgaagattagtcaattacatacagaatatatcccaaaaagagt 24585854  T
Q  144 atcatcactgttatattatatcc-aaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
    | ||| | || |||| ||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24585853 accataagtgctatactatatccaaaaagaaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactata 24585777  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 28746339 - 28746539
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  28746339 atattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtatcacatcagcataaatataaataatattgatgattaagagagtgacgattagtcaattacata 28746438  T
Q  122 cacaatatatcc-caaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  28746439 cacaatatatccaaaaaaaaagcaccataagtgctatactatatccaaaagaaacattgttattgttatactatatcgatccaaaaaagaagaactatat 28746538  T
Q  221 t 221  Q
    |    
T  28746539 t 28746539  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5588481 - 5588280
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  5588481 aaatatattaacaaacaaaagaaatcaatcatagactcgtaacacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagaatgatgattagtcaatta 5588382  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| | || |||| | ||| |||||| || |||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||    
T  5588381 catacacaatatatcccgaagagagcaccataagtgatatactgtatgcaaaagaaacattgttagtgttatattatatcgatccaaaaaataagcacta 5588282  T
Q  218 ta 219  Q
    ||    
T  5588281 ta 5588280  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 437
Target Start/End: Original strand, 8482647 - 8482989
Alignment:
Q  73 atataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaagg 172  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| |||||||||||||    
T  8482647 atatagataatattgtcgattaagagagtgattattggtcaattacaaacacaatatatcccaaaacgagcaccatcggtgctatactatatccaaaagg 8482746  T
Q  173 aatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatca 272  Q
    || ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||                      ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8482747 aacattgttaatgttatattatatcgatccaaaaaagaagcattat----------------------actcaagagttaagttattttaattaacattg 8482824  T
Q  273 actgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaa 372  Q
    | ||||||| || | ||||| || ||||| |||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||       ||||    
T  8482825 attgggaagtattgaggcaggtatcggtgcaggataattatcggatgctcttctgatatgtatcgcgaagtatcggataattattttttaaaaaaataaa 8482924  T
Q  373 atttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||| ||| ||||||    
T  8482925 atttaatcttcggatactcttctgatacgtatcggaaagtatcagacagatatcggtgcaggata 8482989  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35996974 - 35996822
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  35996974 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattaatcaatta 35996875  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaa 170  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  35996874 catgcacaatatatcccaaaaggagcaccataagtgttatactatatccaaaa 35996822  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12206402 - 12206267
Alignment:
Q  46 tcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcat 145  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  12206402 tcataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaaatacatacaaaatatatccgaaaaaaagcac 12206303  T
Q  146 catcactgttatattatatccaaaaggaatattgtt 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12206302 catcaatgttatattatatccaaaaggaacattgtt 12206267  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 200
Target Start/End: Original strand, 40431740 - 40431879
Alignment:
Q  61 acatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatatt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||| |    
T  40431740 acatcaacataaatacaaataatattgatgattaacagagtgatgcttagtcaattacatacacaaaatatcctaaaaagagcaccatcggtgttatact 40431839  T
Q  161 atatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgat 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40431840 atatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgat 40431879  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18301529 - 18301362
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca----tcat 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||     |||    
T  18301529 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacaattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatacat 18301430  T
Q  149 cactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  18301429 caatgttatattatatccaaaaggaacattgctagtgctatattatatcgatccaaaaaagaagcact 18301362  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40536660 - 40536498
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  40536660 aaatatattaacaaacacaagaaaccaatcataggctcgtaaaatatcaacataaatataagtaatattgacgattaaaagagtgatgattagtcaatta 40536561  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgt 180  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40536560 catatacaatatattccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgt 40536498  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 253
Target Start/End: Original strand, 40308004 - 40308212
Alignment:
Q  57 tagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgtta 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  40308004 tagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatactcaatatataccgaaaagagcatcatcaatgtta 40308103  T
Q  157 t-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtac 242  Q
    |             | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  40308104 tacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtac 40308202  T
Q  243 tcaagagttaa 253  Q
    | |||||||||    
T  40308203 t-aagagttaa 40308212  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22485224 - 22485011
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagc-------- 143  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||            
T  22485224 gctcgtagcacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacacaatatataccaaaaagagcaacatcaa 22485125  T
Q  144 -----atcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
         | ||||| || || | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  22485124 agataaacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 22485026  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  22485025 agtact-aagagttaa 22485011  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5371516 - 5371338
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| | || ||||| |    
T  5371516 ctcgtagtacattaacataaatatacataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaaaaacaccatcagt 5371417  T
Q  153 gttata-----------ttatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||||           |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5371416 gttatatgaatgctattttatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 5371338  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12819753 - 12819578
Alignment:
Q  56 gtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgtt 155  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| || || ||||    
T  12819753 gtagcagattaacataaatataaataatattgacgattaatagagtggtgattagtcaattacatacgtaaaatataccaaaaagagcaccaccagtgtt 12819654  T
Q  156 atat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||           ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12819653 atatcaatgctatactatatccaaaaggaatattgttaatgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 12819578  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6125127 - 6125031
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatc 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6125127 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaaaagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatc 6125031  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Original strand, 14216910 - 14217002
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattag 110  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14216910 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcatatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattag 14217002  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9293831 - 9293655
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattga----cgattaagagagtgattattagcca 113  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    | | | |||||||||| ||||| ||    
T  9293831 aaatatattaacaaacaaaagaaatcattcataggctcgtagcacatcagtgtaaatataaataatattgattgtcaagtgagagagtgatgattagtca 9293732  T
Q  114 attacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttata 190  Q
    |||| || || | |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  9293731 attaaatgcatattatatcccaaaaagagcaccattaatgttatactatatccaaaaagaacattgttagtgctata 9293655  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 7807022 - 7807231
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||     
T  7807022 gctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagaaaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccagcaa 7807117  T
Q  152 tgttatat-------------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
    |||||||              ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  7807118 tgttatacatcaatgctacactatattcaaaaggaat-ttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 7807216  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  7807217 agtact-aagagttaa 7807231  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20537282 - 20537114
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca-------- 144  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||||            
T  20537282 ctcgtaacacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacataagcaaaatatatcaaaaagagcacaatcagt 20537183  T
Q  145 -----tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaa 208  Q
          ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20537182 gttatacatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaa 20537114  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 4169684 - 4169896
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||     
T  4169684 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtagtcattagtcaattacatacgcaatatgt-acaaaaagagcaccatcag 4169782  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
    || |||             | |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  4169783 tgctatacaccaatgctaaactatatcaaaaaggaa-cttgttagtgttatactatatcgatccaaaaatgaagcattatatccaaaaaaagaacacatc 4169881  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  4169882 agtact-aagagttaa 4169896  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 253
Target Start/End: Original strand, 6496840 - 6497046
Alignment:
Q  57 tagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgtta 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||| |||||    
T  6496840 tagcacattaacataaatataaataatattgacgattgaaagagtggtcattagtcaattacatacgaaatatat-acaaaaagagcactatcagtgtta 6496938  T
Q  157 t-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtact 243  Q
    |             | |||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6496939 tacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtcctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcagtact 6497037  T
Q  244 caagagttaa 253  Q
     |||||||||    
T  6497038 -aagagttaa 6497046  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 359
Target Start/End: Original strand, 14217027 - 14217144
Alignment:
Q  242 ctcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaa 341  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| || ||||||  || | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||    
T  14217027 ctcaagagttaagtcattttacttaacattaattgggaagtattggggcatgtatcagtgcaggataattatcggatactctcctgatacgtatcgggaa 14217126  T
Q  342 gtatcagataattatttt 359  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  14217127 gtatcggataattatttt 14217144  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 33324961 - 33324825
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  33324961 aagtatcagataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 33324862  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  33324861 caggggatacggtacatcatccattttgaagtatcgg 33324825  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5588277 - 5588176
Alignment:
Q  244 caagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagt 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  | ||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||| |||||||    
T  5588277 caagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtgttggggcaggtatcggtgtaggataattattggatactctcatgatatgtatcaggaagt 5588178  T
Q  344 at 345  Q
    ||    
T  5588177 at 5588176  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 475
Target Start/End: Original strand, 38602287 - 38602433
Alignment:
Q  330 acgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagt 429  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  38602287 acgtattggaaagtatcagataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggt 38602386  T
Q  430 gtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    | |||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  38602387 gcaggatacgcaggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 38602433  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12206264 - 12206172
Alignment:
Q  243 tcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtat 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  12206264 tcaagagttaagttattttagttaccattaattgggaagtatcggggcatatatcagtgcaggataattatcggatactctcatgatacgtat 12206172  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 450
Target Start/End: Original strand, 28746539 - 28746737
Alignment:
Q  243 tcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||  || ||||||| ||  ||||||     || |||||||||  |||||||||||||  |||||    
T  28746539 tcaagagttaagttattttatttaacgttaattgggaattattggggcaggtataggtgta-----attatcggatactttcttgatacgtatcgggaag 28746633  T
Q  343 tatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttg 442  Q
    |||| |||||||||||           |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |    
T  28746634 tatcggataattattt----aaaaaaaaaaaattaatcttcggatactcttctgatacgtatcgaaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcag 28746729  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4355553 - 4355478
Alignment:
Q  242 ctcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  4355553 ctcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtattggggcaggtatcagtgtaggataattatcgga 4355478  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7876857 - 7876721
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  7876857 aagtatcggataattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 7876758  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  7876757 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 7876721  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 40308872 - 40309008
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  40308872 aagtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 40308971  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
       |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  40308972 catgggatacggtacgtcatctattttgaagtatcgg 40309008  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 406
Target Start/End: Original strand, 1776311 - 1776477
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | || ||| ||  || ||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||  |  ||||||||||  ||    
T  1776311 tactcaagagttaagttattttatttaatgttaattggaaattattggggcaggtataggtgcaggataattatcagatacttttctgatacgtatcggg 1776410  T
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcg 406  Q
    |||||||  || ||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1776411 aagtatcgaatgattttttttttaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcg 1776477  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9293364 - 9293253
Alignment:
Q  224 aaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgct 323  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||| ||   | ||||| | || ||||| || ||||||||| ||||| ||    
T  9293364 aaaaagaacacatcggtactcaatagttgagttattttagttaacattaattggaaaatcttggggcgggtatcggtgcagaataatgatcagatactct 9293265  T
Q  324 cttgatacgtat 335  Q
    | ||||||||||    
T  9293264 cctgatacgtat 9293253  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 470
Target Start/End: Original strand, 37134302 - 37134404
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    |||||||||||||||  | |||||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||    
T  37134302 taaaatttaatcttcatatactctcttgatacgtatcgggaagtatcaagcagatatcagtgcaggatacgcagaggatacggtacgtcatctattttga 37134401  T
Q  468 agt 470  Q
    |||    
T  37134402 agt 37134404  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Original strand, 4170479 - 4170613
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||| |      
T  4170479 gtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcaggcaggtatcggtgcaggatacgca 4170578  T
Q  442 ggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  4170579 ggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 4170613  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22484408 - 22484274
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||  || |||||| |      
T  22484408 gtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcggacagatatcgatgcaggatacgca 22484309  T
Q  442 ggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  22484308 gggaatacggtacatcatccattttgaagtatcgg 22484274  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Original strand, 40431896 - 40431997
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||  ||| || ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||| |||    
T  40431896 tactcaatagttaagttattttagtaaacattaattgaaaagtattggggcaggtaacggtgcaggataattatcggatactgtcctgatacgtatcagg 40431995  T
Q  340 aa 341  Q
    ||    
T  40431996 aa 40431997  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6124991 - 6124948
Alignment:
Q  177 ttgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6124991 ttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcactatat 6124948  T

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Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 335
Target Start/End: Original strand, 15878076 - 15878394
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15878076 aaaatatattaacaaacaacataaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 15878175  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15878176 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcagtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 15878275  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15878276 atattaaaaaaagaacacatcaatactcaagagttaagttattttagttaatattaattgggaagtatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 15878375  T
Q  317 atacgctcttgatacgtat 335  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  15878376 atactctcctgatacgtat 15878394  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 45 - 360
Target Start/End: Original strand, 1399949 - 1400263
Alignment:
Q  45 gtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 144  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1399949 gtcataggctcgtagtacatcaa-ataaatataaataatattgacgattaagatagtgattattagtcaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 1400047  T
Q  145 tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactc 244  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||     
T  1400048 tcatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattcaaaaaataacacatcaatactt 1400147  T
Q  245 aagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  1400148 aagagttaagttattttaattaacattaattgggaagtatcggggcagatacatgtgtaggataatgatcggatactctcctgatacgtatcgggaagta 1400247  T
Q  345 tcagataattattttt 360  Q
    ||||||||||||||||    
T  1400248 tcagataattattttt 1400263  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 23078762 - 23079090
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  23078762 aaatatattaacaaacaaaagaaaccaatcataggctcatagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattactcaatta 23078861  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23078862 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcagtgctatactatatcaaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcacta 23078961  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||| || ||||  |||||||  ||||||    
T  23078962 tatccaaaaaagaacacatcagtacttaagagttaagttattttaattaacattaattgggaaatatcgggacaggtatcggtacaggataactatcgga 23079061  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatc 346  Q
    ||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  23079062 tactctcctgatacgtatcgggaagtatc 23079090  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 53 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33454497 - 33454100
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33454497 ctcgtagcatatcaacataaatataaattataccgacgattaagagaatgatgattagtcgattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagt 33454398  T
Q  153 gttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagtta 252  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33454397 gctatattatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccataaaagaacacataagtactcaagagtta 33454298  T
Q  253 agttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataa 352  Q
    |||| ||||| | ||||| || ||||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||| |||| ||  | ||| ||||| ||||||||||| |||    
T  33454297 agtttttttagtcaacattaattgggaaatatcggggcaagtatcggtgtaggataattatcgaatactcttctaataagtattgggaagtatcagctaa 33454198  T
Q  353 ttattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacg 450  Q
    |||||||||       |||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  33454197 ttatttttttaaaaaataaaatttaatcttcggatactttcctgatacgtatcgagaagtatctgacatatatcagtgcaggatacgcaggggatacg 33454100  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 35160328 - 35159869
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35160328 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagttatagactcgtagcacatcaacataaatataaataacattaataattaagagagtgatgattagtcaatta 35160229  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttg----gtgttatactatatcgatctaaaaaagaaac 213  Q
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T  35160228 catacacaatatatcccaaaaaaagcaccattagtgctatactatatccaaaaggaacattgttaattagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagc 35160129  T
Q  214 actatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgat 313  Q
    ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| | ||| | ||| || ||    
T  35160128 actatctaa--aaaagaacacatcagtactcaagagttaaattattttaattaacattaattgagaagtatcggggcagatatcagtgaaagat-attat 35160032  T
Q  314 cggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagta 413  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  35160031 cggatactcttctgatatgtatcgggaactatcagataattatttttttttaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagta 35159932  T
Q  414 tcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    |  | ||  |||| ||| || |||||  ||||||||| || |||||| |||||||||| ||||    
T  35159931 ttagacaagtatcggtgcagaatatgcaggggatacgatacatcatccattttgaagtatcgg 35159869  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 44270182 - 44269767
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44270182 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgatgattagtcaatta 44270083  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  44270082 cataaacaatatatcccaaaaagagcaccattaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgataaaaaaaagaagcacca 44269983  T
Q  218 tat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||  | ||||| || ||||  ||      |||||||||||||||| |||||||  | || |||  |||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |    
T  44269982 tatcaaaaaaaaaaatacatgggt------gagttaagttattttagttaacatttattgtgaaatatcgaggcagatatcgatgtagaataattatcag 44269889  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    ||||  |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||     
T  44269888 atactttcttgatacgtatcgggaagtatcggttaattatttttttaaaaattaaaatttaatcttcagatactctactgatacgtatcgaaaagtatca 44269789  T
Q  417 ggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    | ||||||| |||| ||||||||    
T  44269788 gacagatat-agtgcaggatatg 44269767  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 9283514 - 9283766
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  9283514 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 9283613  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9283614 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaataagcacta 9283713  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9283714 tatcaaaaaaagaacacataattactcaagagttaaattattttagttaacat 9283766  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25969969 - 25969717
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  25969969 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 25969870  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25969869 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaataagcacta 25969770  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25969769 tatcaaaaaaagaacacataattactcaagagttaaattattttagttaacat 25969717  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 36757665 - 36758009
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36757665 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagttataggctcgtagcacatcaacataaatataaataacattgatgattaagagagtgatgattagtcaatta 36757764  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgtt----ggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaac 213  Q
    |||||| |||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  36757765 catacataatatatcccaagaaaagcaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttaatcagtgttatactatatcgatccaaaaaataagc 36757864  T
Q  214 actatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgat 313  Q
    |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| | ||| | |||||| ||    
T  36757865 actatatacaaaaaatgacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcagggcagatatcagtgaaagataattat 36757964  T
Q  314 cggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattt 358  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  36757965 cggatactctcctgatacgtatcgggaagtattggataattattt 36758009  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 36767189 - 36767533
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36767189 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagttataggctcgtagcacatcaacataaatataaataacattgatgattaagagagtgatgattagtcaatta 36767288  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgtt----ggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaac 213  Q
    |||||| |||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  36767289 catacataatatatcccaagaaaagcaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttaatcagtgttatactatatcgatccaaaaaataagc 36767388  T
Q  214 actatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgat 313  Q
    |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| | ||| | |||||| ||    
T  36767389 actatatacaaaaaatgacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcagggcagatatcagtgaaagataattat 36767488  T
Q  314 cggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattt 358  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  36767489 cggatactctcctgatacgtatcgggaagtattggataattattt 36767533  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 333
Target Start/End: Original strand, 36763445 - 36763764
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36763445 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagttataggctcgtagcacatcaacataaatataaataacattgatgattaagagagtgatgattagtcaatta 36763544  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttg----gtgttatactatatcgatctaaaaaagaaac 213  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  36763545 catacacaatatatccaaaaaa-agcaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttaattagtgttatactatatcgatccaaaaaagaggc 36763643  T
Q  214 actatatt-agaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatga 312  Q
    |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||| |    
T  36763644 actatatccaaaaaaaggacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagatatcagtgaaagataatta 36763743  T
Q  313 tcggatacgctcttgatacgt 333  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  36763744 tcggatactctcctgatacgt 36763764  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 9249964 - 9250215
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  9249964 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 9250063  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9250064 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaataagcacta 9250163  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||| | |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9250164 tatcaaaaaaag-acacataattactcaagagttaaattattttagttaacat 9250215  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21409830 - 21409433
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  21409830 aaaatatattaacaaacaaaagaaa-cagtcataggctcatagcacatcaacataaatgtaaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatt 21409732  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  21409731 acatacacaatatattccaaaaagagcaacataagtgctatactatatccaaaagaaatattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcatt 21409632  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    ||                      |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| || ||||||| || |||||||||||||| ||| |    
T  21409631 at----------------------actcaagagttaagttattttagttaacattaattggaaagtattggggcaggtatcggtgtaggataattatcag 21409554  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||       |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||     
T  21409553 atactctcctgatacgtattaggaagtatccgataatta-tttttaaaaaaataaaatttaatctttggatactctcctgatacgtatcgggatgtatca 21409455  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Original strand, 554565 - 554930
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  554565 aaatatattaacaaacaaaagaaagcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataagtaatattaacgattaagagagtgatgattagtcaatta 554664  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  554665 catacacaatatatcccaaaaagagcatcataagtgatatactatatctaaaagatacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcacta 554764  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| || ||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  554765 t----------------------actcaagagttaagttattttagttaacattgattgggaagtattggggcaggtatcggtgcaggataattatcgga 554842  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatc 405  Q
    ||| ||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  554843 tactctcctgatacttatcgggaagtatcggataattatttttaaaaaaaataaaatttaatcttcgaatactctcctgatacgtatc 554930  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21180280 - 21179911
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21180280 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 21180181  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||            |||| ||| |      |||||||| |||||| || |||||    
T  21180180 gatatacaatatatcccaaaaagaacatcatcagtgttatactatatc------------tgttagtgct------tatcgatccaaaaaataagcacta 21180099  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||  || ||||||| ||  | || | |||||| ||| ||    
T  21180098 tatccaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttatcattagctgggaaatattggggcaggtattgatgcatgataattatcaga 21179999  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatc 405  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21179998 tactctcctgatacgtatcgggaagtatcggataattattattttttaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacatatc 21179911  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36413809 - 36413609
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||  ||||||    
T  36413809 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagtgagtgatgcttaatcaatta 36413710  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36413709 catacacaatatatcctaaaaagagcatcatcggtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatc-aaaaaagaagcacta 36413611  T
Q  218 ta 219  Q
    ||    
T  36413610 ta 36413609  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48153984 - 48153784
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48153984 aaatatattaacaaacaaaaaaaa-cagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatggtgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 48153886  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48153885 catacacaatatatcccaaaaagagcatcataagtgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcacta 48153786  T
Q  218 ta 219  Q
    ||    
T  48153785 ta 48153784  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 38065107 - 38064731
Alignment:
Q  43 cagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagag 142  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38065107 cagtcataggctcgaagcacatcaacataaatataaacaatattgatgattaagatagtcatgattagtcaattacatacgcaatatatcccaaaaagag 38065008  T
Q  143 catcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgat-ctaaaaaagaaacactatat-taga---aaaagaacacatc 237  Q
    || ||| | || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||  | |   |||| |||||||     
T  38065007 caccat-agtgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatattatatcgatccaaaaaaagaagcactatatccacacacaaaaaaacacatt 38064909  T
Q  238 agtactcaagagttaagttatttta-attaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtatt 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| || || ||||||  | ||||| || ||  |||| |||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||    
T  38064908 agtactcaaaagttaagttattttagtttaatattaattgggaaataacggggtaggtattggtgcaggataattatcagataccctccagatacgtatt 38064809  T
Q  337 aggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
     |||| |||| ||||||| || |||       |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  38064808 gggaaatatctgataatttttattttaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcttgatacgtatcg-gaagtatc 38064731  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 19820651 - 19820853
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  19820651 aaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggttcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaaaatagtgatgattagtcaatta 19820750  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  19820751 catgcacaatatatctcaaaaagagcaccatcagtattatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgattcgaaaaagaagcacta 19820850  T
Q  218 tat 220  Q
    |||    
T  19820851 tat 19820853  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 574 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 24929420 - 24929244
Alignment:
Q  574 tctataaatcttttatt---tttgaatgtgtttcttgtcttccatttcaaacatttgaatgccaacaagacaaagtttcacatttcatatgaaactgcag 670  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24929420 tctataaatcttttattattttttaatgtgtttcttgtcttccgtttcaaacatttgaatgccaacaagacaaagtttcacatatcaaatgaaactgcag 24929321  T
Q  671 ct---------tcaaacca--attcatcaatcatcatttcctcaaaattatcgaacaaaaacaccactcagctacct 736  Q
    ||         ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24929320 cttctaccttgtcaaaccaatattcatcaatcatcatttcctcaaaattatcgaacaaaaacaccactcagctacct 24929244  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 426
Target Start/End: Original strand, 23969840 - 23970187
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |    
T  23969840 ctcgtagcacatcaacataaatataa----tagtgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatttatcccaaaaagagcaccataagt 23969935  T
Q  153 gttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagtta 252  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||                      ||||||||||||    
T  23969936 gctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactat----------------------actcaagagtta 23970013  T
Q  253 agttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataa 352  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| ||  |||||  ||  |||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||    
T  23970014 agttattttaattaacattaattgagaagtattagggcatgtattggtgcaggataattatcggatactctcctgatacgtatcggaaagtatcgggtaa 23970113  T
Q  353 ttattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatc 426  Q
    |||||||||       ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||  |||||||| | ||||||||    
T  23970114 ttattttttaagaaaataaaatttaatcttcagatactcttctaatacgtatcaggaagtatcagacagatatc 23970187  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 44958990 - 44959168
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||| | || | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44958990 aaatatattaacagacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcatatccatataaacataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 44959089  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatat 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  || | |||| || ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  44959090 catacacaatatatctcaaaaagagcactatgagtgttgtactatatccaaaaggaacattgctagtgctatactatat 44959168  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 40041655 - 40041390
Alignment:
Q  203 aaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgt 302  Q
    ||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||| || | |||     
T  40041655 aaaaaagaagcattatatctaaaaaagaacacatcagtactcaatagttaaattattttagttaacattaattgggaaatatcggggcaggtatcagtgc 40041556  T
Q  303 aggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacat 402  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  40041555 aggataattatcggatactctcctgatacgtatcgggaaatatcggataattatttttt-ttaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgt 40041457  T
Q  403 atcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaa 468  Q
    ||| ||||||||| | ||  |||||||  |||||| || || |||||| || |||||||||||||||    
T  40041456 atcaagaagtatcagacatgtatcagtacaggatacgtaggagatacgatacatcatctattttgaa 40041390  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24956491 - 24956260
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | ||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24956491 tactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtattgtggcaggtatcggtgcaggataattatcagatactctcttgatacgtattagg 24956392  T
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||| || | ||||||    
T  24956391 aagtatcggataattatttttctttaaaataaaatttaatcttcggatactctcttgatacgtatcggaaagtatcaggcatgtatcaatgcatgatatg 24956292  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
    | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  24956291 taggggatacgatacgtcatcaattttgaagt 24956260  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26973497 - 26973296
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  26973497 atattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacaattactcaattacata 26973398  T
Q  122 cacaatatatcccaaaaagagc----atcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
      ||||||||   ||||||  |    | ||| | |||| || |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26973397 tccaatatataaaaaaaagcacttataccataagtgttgtactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcacta 26973298  T
Q  218 ta 219  Q
    ||    
T  26973297 ta 26973296  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Original strand, 16563919 - 16564096
Alignment:
Q  54 tcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16563919 tcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagtg 16564018  T
Q  154 ttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||||           ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16564019 ttatatcaatactatactatatccaaaaggaacattgttaatgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 16564096  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16601743 - 16601566
Alignment:
Q  54 tcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16601743 tcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagtg 16601644  T
Q  154 ttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||||           ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16601643 ttatatcaatactatactatatccaaaaggaacattgttaatgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 16601566  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24956687 - 24956501
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    |||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  24956687 aaatatattagcaaacaaaagaaatcagtcatatgctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacaattaatagagtgatgattagtcaatta 24956588  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcat-cactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaa 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||  | || |||| |   |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  24956587 catacataatatatcccaaagagagcaccataaagtgctatact---tccaaaagaaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaa 24956501  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 475
Target Start/End: Original strand, 44959994 - 44960246
Alignment:
Q  224 aaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgct 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  | ||||| || || | ||| || ||||| ||||||||| |     
T  44959994 aaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaaataccggggtaggtatcagtgcagaataattatcggatactcc 44960093  T
Q  324 cttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagat 423  Q
    | ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |    
T  44960094 cctgatatgtatcgggaagtatccgataattatttttacaaaaaataaaatttaatctttggatactcttctgatacatatcgggaagtatcagacaggt 44960193  T
Q  424 atcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
     |||||| |||||| |  ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  44960194 gtcagtgcaggatacgcaggggatacgatacgtcatccattttgaagtatcgg 44960246  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Original strand, 1042747 - 1042923
Alignment:
Q  57 tagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgt-- 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||      
T  1042747 tagcacattaacataaatataaataatattgacaattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagtgtta 1042846  T
Q  155 -----------tatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
               |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1042847 tacatcaatgctatattatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 1042923  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19511059 - 19510888
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca----tcat 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||     |||    
T  19511059 ctcgtagcacattaacaaaaatataaataatattgacaattaagagagtggtgattagtcaattacatactcaaaatatacaaaaaagagcaccatacat 19510960  T
Q  149 cactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||    
T  19510959 caatgttatactatatccaaaaggaacattgctagtgttatattatatcgatccaagaaagaagcactatat 19510888  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39521519 - 39521413
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  39521519 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattaatcaattacatacgcaatatatacaaaaaagagcatcatcac 39521420  T
Q  152 tgttata 158  Q
    |||||||    
T  39521419 tgttata 39521413  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35136469 - 35136317
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  35136469 aaatatattaacaaacacaataaaccagtcatagactcgtagcatatcaacataaatataagtaatattggcaattaagagaatgatgattagtcaatta 35136370  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaa 170  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||    
T  35136369 catatacaatatatctcaaaaagagcatcattaatgctataatatattcaaaa 35136317  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4292111 - 4291946
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  4292111 ctcgtagcacattaacataaatataaatactattaacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcatcatcagt 4292012  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaa 207  Q
    |||||||           ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  4292011 gttatatcaatgctatactatatccaaaaggaacattgttaatgttatactatatcgatccaaaaa 4291946  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11058876 - 11058729
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||    
T  11058876 aaatatattaacaaacacaagaaactagtcatagtctggtagcacatcaacataaatataagtaatattgacgattaagagaatgatgatttgtcaatta 11058777  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatc 165  Q
    |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11058776 catatataatatatcccaaaaagagcaccatcagtgttacattatatc 11058729  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40053689 - 40053575
Alignment:
Q  60 cacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||     
T  40053689 cacatcaacataaatataaataatattgatgactaagagagtgatgattagtcaattacatatgcaatatacctcaaaaagagcaccatcagtgttatac 40053590  T
Q  160 tatatccaaaaggaa 174  Q
    |||||||||||||||    
T  40053589 tatatccaaaaggaa 40053575  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 47237913 - 47238116
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || ||     
T  47237913 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagaaagtgatgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccaccag 47238012  T
Q  152 tgttat------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcag 239  Q
    || |||            | || |||||||||| | ||||||  || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  47238013 tgctatacatcaatgctaactacatccaaaagggacattgttaatgctatactatatcgattcaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcag 47238112  T
Q  240 tact 243  Q
    ||||    
T  47238113 tact 47238116  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8029252 - 8029147
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  8029252 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcacttacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagt 8029153  T
Q  153 gttata 158  Q
    ||||||    
T  8029152 gttata 8029147  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Original strand, 26773257 - 26773361
Alignment:
Q  54 tcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| | ||    
T  26773257 tcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccattagtg 26773356  T
Q  154 ttata 158  Q
    |||||    
T  26773357 ttata 26773361  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36661405 - 36661208
Alignment:
Q  67 acataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttat--------- 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| || |||             
T  36661405 acataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgtaatatataccaaaaagagcaccatcagtgctatacatcaatg 36661306  T
Q  158 ----attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
        | |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36661305 ctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgttatactttatcgatccaaaaaagaagcactgtatccaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 36661208  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 149
Target Start/End: Original strand, 47719856 - 47719939
Alignment:
Q  66 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatc 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  47719856 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacataatatataccaaaaagagcaccatc 47719939  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Original strand, 27397282 - 27397378
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  27397282 ctcgtagcacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatat-acaaaaagagcaccatca 27397378  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11830642 - 11830432
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  11830642 ctcgtaacacattaacataaatataaataatattgacaattaagatagtggtcattggtcaattacatacgcaatatat-acaaaaagagcaccatcagt 11830544  T
Q  153 gttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcag 239  Q
    | |||             |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||   ||||||||||| ||||    
T  11830543 gctatacatcaatgctacattatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcattatatccaaaaaagaacacgtcag 11830445  T
Q  240 tactcaagagttaa 253  Q
    |||| |||||||||    
T  11830444 tact-aagagttaa 11830432  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Original strand, 27555129 - 27555221
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27555129 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 27555221  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16851254 - 16851046
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca-------- 144  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||            
T  16851254 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagataattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccagcagt 16851159  T
Q  145 -----tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatca 238  Q
          ||||| || || | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  16851158 attatacatcaatgctacactatatccaaaa-gaaacttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatca 16851060  T
Q  239 gtactcaagagttaa 253  Q
    ||||| |||||||||    
T  16851059 gtact-aagagttaa 16851046  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 24929511 - 24929465
Alignment:
Q  488 gcaaaacaaataaacaaaccgcaagaattgaattcaaatctcttgtt 534  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24929511 gcaaaacaaataaataaaccgcaagaattgaattcaaatctcttgtt 24929465  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40096612 - 40096401
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaa---aagagcatcatc 149  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||    
T  40096612 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaattaagagcaccatc 40096517  T
Q  150 actgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacaca 235  Q
    | ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||  | ||||||||||||    
T  40096516 agtgttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaaaaatcactatatccaaaaaaagaacaca 40096418  T
Q  236 tcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40096417 tcagtact-aagagttaa 40096401  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48163763 - 48163671
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48163763 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 48163671  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 47719764 - 47719832
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatatt 86  Q
    |||||||| |||||| |  | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47719764 aaatatatcaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatatt 47719832  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48153785 - 48153690
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||  |||| | |||||| |||| |||| || | |||||||||    
T  48153785 tactcaagagttaagttattttaattaacattaattgggaagtattggggcaggtattggtgcaagataattatcgaatactctttggatacgtat 48153690  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11058704 - 11058658
Alignment:
Q  224 aaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11058704 aaaaagaacacatcagtacacaagagttaagttattttagttaacat 11058658  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27354276 - 27354184
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatatt-agaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27354276 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgctatattatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 27354184  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23311833 - 23311736
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctatttt 465  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||| ||||||     ||||||||||| ||||||||||||    
T  23311833 taaaatttaatcttcggatactctcctgatacatatcgggaagtatcagacatatatcggtgcaggatacacatgggatacggtacatcatctatttt 23311736  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Original strand, 47719952 - 47719993
Alignment:
Q  229 gaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47719952 gaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacat 47719993  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 437
Target Start/End: Original strand, 18113943 - 18114011
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18113943 taaaatttaatcttcagatactctcctgatacatatcaggaagtatcaggcagatatcggtgcaggata 18114011  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 437
Target Start/End: Original strand, 26773716 - 26773784
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26773716 taaaatttaatatttggatactctcccgatacgtatcgagaagtatcgggcagatatcggtgcaggata 26773784  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 48163548 - 48163435
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  48163548 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 48163449  T
Q  440 ttggggatacggta 453  Q
      ||||||||||||    
T  48163448 caggggatacggta 48163435  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 11829829 - 11829693
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||| |    
T  11829829 aagtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtattgggaagtatcaggcagatatcggtgcaggatacg 11829730  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  11829729 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 11829693  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27354061 - 27353925
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  27354061 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 27353962  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  27353961 cagggaatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 27353925  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26973163 - 26973118
Alignment:
Q  370 aaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26973163 aaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcgaaaagtatc 26973118  T

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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 417
Target Start/End: Original strand, 19820868 - 19820916
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  19820868 taaaatttaatcttcggatactctcctgatacatatcggaaagtatcgg 19820916  T

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Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 220
Target Start/End: Original strand, 26773376 - 26773436
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  26773376 tatatccaaacggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcattatat 26773436  T

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Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25969508 - 25969401
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||| ||  ||||| |||||||    
T  25969508 taaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacgatacgtcatccattttga 25969409  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  25969408 agtatcgg 25969401  T

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Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 40095790 - 40095654
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||  || ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  40095790 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttagatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 40095691  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  40095690 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 40095654  T

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Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 470
Target Start/End: Original strand, 9250426 - 9250528
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||| ||  ||||| |||||||    
T  9250426 taaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacgatacgtcatccattttga 9250525  T
Q  468 agt 470  Q
    |||    
T  9250526 agt 9250528  T

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Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 470
Target Start/End: Original strand, 34122621 - 34122723
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  | ||||||||||  ||||| |||||||    
T  34122621 taaaatttaatatttggatactctccagatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcagaggatacggtacgtcatccattttga 34122720  T
Q  468 agt 470  Q
    |||    
T  34122721 agt 34122723  T

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Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 38064703 - 38064645
Alignment:
Q  372 aatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtg 430  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  38064703 aatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcggaaagtatcggtcaggtatcagtg 38064645  T

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Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 38263139 - 38263053
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  38263139 aagtatcagataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatc 38263053  T

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Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36551849 - 36551535
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36551849 aaaatatattaacaaacaacataaatcaatcataggctcgtaggacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattgttagccaatt 36551750  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551749 acatacacaatatatcccaaaaagagcat-atcagtgttatattatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 36551651  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  36551650 atattcaaaaaagaacacatcactactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcagatatcgatataggataatgatcgg 36551551  T
Q  317 atacgctcttgatacg 332  Q
    |||| ||| |||||||    
T  36551550 atactctcctgatacg 36551535  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 383
Target Start/End: Original strand, 24589782 - 24590142
Alignment:
Q  23 tattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatac 122  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  24589782 tattaacaaacaacaaaaactagtcataggctcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattac-tac 24589880  T
Q  123 acaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatatta 222  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24589881 acaatatatcttaaaaagagcttcatcaattatatattatattcaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaaacactatattc 24589980  T
Q  223 gaaaaagaa-cacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacg 321  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||     
T  24589981 aaaaaagaagcacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcgggacatgtatcggtgtaggataatgatcggatact 24590080  T
Q  322 ctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttc 383  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  24590081 ctcttgatatgtatcgggaagtatcagataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttc 24590142  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24851935 - 24851565
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24851935 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcattggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 24851836  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   || |||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24851835 catacacaatatatcccaaaaagagcaccatttgtgctatactatatccaaaacgaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcacta 24851736  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||  |||||||||| ||  |||    |||||| ||||||    
T  24851735 tatcaaaaaaagaacacatcattactcaagagttaagttattttagttaacattaattggaaaatatcggggcaggtatgggt----gataattatcgga 24851640  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactct 392  Q
    ||| ||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||| ||| |||||    
T  24851639 tactctcctgatgcgtatcgggaagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatctttggatactct 24851565  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 136 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 38218728 - 38218449
Alignment:
Q  136 aaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacaca 235  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  38218728 aaaagggcgtcatcagtgttatattatatccaaaagtaacattgttagtgttatattatatcgatctaaaaaa--aacactatattaaaaaaagaacaca 38218631  T
Q  236 tcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtat 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||    
T  38218630 tcaatactcaagagttaagttattttagctaatattaattgggaagtatcggggcagatactggtgtaggataatgatcggatactctcctaatatgtat 38218531  T
Q  336 taggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
      |||||||||  |||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38218530 cgggaagtatcgaataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcaagaagtatcgg 38218449  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Original strand, 32380733 - 32381009
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  32380733 aaatatattaacaaacaaaagaaatcggtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcgatta 32380832  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||| || ||    
T  32380833 catacataatatatcccaaaaagagcaccattagtgttatactatattcaaaaggaacattgttagtgttatactatatttattcaaaaaagaagcatta 32380932  T
Q  218 tat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcaga 293  Q
    |||  | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  32380933 tatccaaaaaaaaaaaacatcagtgctctagagttaagttattttagttaacattaaatgggaagtatcagggcaga 32381009  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 118 - 426
Target Start/End: Original strand, 41675743 - 41676050
Alignment:
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||  | |    |||| ||    
T  41675743 catacacaatatatttcaaaaagagcatcatcaatgttatactatatctaaaagcaacattgttaatgttatactatatcgatcatatagtataacatta 41675842  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41675843 tattcaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacattaattggga-gtatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 41675941  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    ||| ||| ||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||   ||||||||||    
T  41675942 tactctcctgataagtatcgggaagtattggataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttccaatacatattaggaagtatcgg 41676041  T
Q  418 gcagatatc 426  Q
     ||| ||||    
T  41676042 acaggtatc 41676050  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 93 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47655054 - 47654789
Alignment:
Q  93 taagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatact 192  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  47655054 taagagaatgatgattagtcaattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgctatattatatccaaaatgaacattgttagtgttatact 47654955  T
Q  193 atatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcag 292  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||| ||  ||||||||||    
T  47654954 atatcgatccaaaaaagaagcactatatccgtaaaagaacacatcagtactcaagagttaagtttttttagtcaacattaattggaaaatatcggggcag 47654855  T
Q  293 ataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattt 358  Q
     || |||||||||||||| |||| ||||  |  ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||    
T  47654854 gtatcggtgtaggataattatcgaatactattctgataagtatgaggatgtatcggataattattt 47654789  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 9528519 - 9528720
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||| ||| || | |||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9528519 aaatatattaataaacaaaagaaactagtcatatgctcgtagtacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 9528618  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||| |||||||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9528619 catacacaatatatcccaaaaaggacatcataagtgctatactatatccaaaagaaacatcgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcacta 9528718  T
Q  218 ta 219  Q
    ||    
T  9528719 ta 9528720  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14167512 - 14167319
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  14167512 aaatatattaataaacaaaataaattagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaatta 14167413  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14167412 catacacaatatatcccaaaaagagcaccataagagctatactatatccaaaagatacattgttagtgttatactatatcgatccaagaaagaa 14167319  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9782083 - 9781675
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  9782083 atattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgacgattagtcaattacgta 9781984  T
Q  122 cacaatatatccca--aaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||       
T  9781983 cacaatatatcccaaaaaaaaagcaccataagtgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactgtatcgatccaaaaaagaagcact--- 9781887  T
Q  220 ttagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggata 319  Q
                       |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||  || ||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||    
T  9781886 -------------------gtactcaagagttaagttattttatttaacgttaattgggaattattggggcaggtataggtgcaggataattatcggata 9781806  T
Q  320 cgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggc 419  Q
    |  || ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||          |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  9781805 ctttcctgatacgtatcgggaagtatcggataattattttaaaaaaaaaaaaaaattaatcttcggatactcttctgatacgtatcggaaagtatcgggc 9781706  T
Q  420 agatatcagtgtaggatatgttggggatacg 450  Q
    || |||| ||| |||||| |  |||||||||    
T  9781705 aggtatcggtgcaggatacgcaggggatacg 9781675  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29168390 - 29167993
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    |||||||||| |||| || | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29168390 aaatatattagcaaacaaaagaaaccagccataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatatcgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 29168291  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||| || |||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  29168290 catacacaatatatccaaaaaagagcatcataagtgatatactatatccaaaagaaacattgttagtactatactatattgatccaaaaaagaagcatta 29168191  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||| || |||| || || | ||| |||||||| || ||     
T  29168190 t----------------------actcaatagttaagttattttagttaatattaattgggaagtattggggtaggtatcagtgcaggataattattggg 29168113  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    ||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||      
T  29168112 tactctcctcatacgtatcgggaagtatcagataattattttttaaaaaaattaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtaacgggaagtatcat 29168013  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10822837 - 10822644
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10822837 aaatatattaacaaacaaaagaaaaccgtcataggctcgtagtacatgaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 10822738  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | | || |||| |||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  10822737 catacacaatatatcccaaaaagagcaccgtaagtgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgatatattatatcgatccaaaaaagaa 10822644  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Original strand, 34432118 - 34432291
Alignment:
Q  46 tcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcat 145  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  34432118 tcataggctcttagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaatatatctcaaaaagaacac 34432217  T
Q  146 catcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
    ||| | |  |||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34432218 cataagtactatactatatcccaaagaaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcactata 34432291  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 262
Target Start/End: Original strand, 3707976 - 3708183
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Q  44 agtcataagctcgt-agcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagag 142  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3707976 agtcataggctcgttagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatatatcccaaaaagag 3708075  T
Q  143 catcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtac 242  Q
     | || || || |||| |||||||            ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| || |||||   |||||||||||||| ||||    
T  3708076 gaccaccagtgctatactatatcc------------gttagtgctatactttatcgatccaaaaaagaagcattatatctaaaaaagaacacatcggtac 3708163  T
Q  243 tcaagagttaagttatttta 262  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3708164 tcaagagttaagttatttta 3708183  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37922654 - 37922465
Alignment:
Q  21 tatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacat 120  Q
    |||||||||||| |  | ||| || ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |  |||||||||    
T  37922654 tatattaacaaacacaagaaaccattcataggctcatatcacatcaacataaatataaataatattggcgattaagagagttataatcaatcaattacat 37922555  T
Q  121 acacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaaga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  37922554 acacaatatatcccaaaaagagcaccatcaatgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactatatctatctaagaaaga 37922465  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29862239 - 29862039
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  29862239 atattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacata 29862140  T
Q  122 cacaatatatccca---aaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactat 218  Q
    ||||||||||||||   |||| | ||  || | || |||| |||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  29862139 cacaatatatcccaaaaaaaaaaacactataagtgatatactatatccaaaagaaacattgttagtggtatactttatcaatccaaaaaagaagcactat 29862040  T
Q  219 a 219  Q
    |    
T  29862039 a 29862039  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 34096231 - 34096429
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |  ||||||||||    
T  34096231 atattaacaaacaaaagaaaccattcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgacgatcaatcaattacata 34096330  T
Q  122 cacaatatatcccaaaaagag-catcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||| | | || |||| |||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34096331 cacaatatgtcccaaaaaaaaacatcgtaagtgctatactatatctaaaagaaacattgttagtgctatactatatcgatctaaaaaagaagcactata 34096429  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32797631 - 32797462
Alignment:
Q  21 tatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacat 120  Q
    |||||||||||| |  | ||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32797631 tatattaacaaacacaagaaaccaatcataggctcgtagcatatcaacataaatataagtaatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacat 32797532  T
Q  121 acacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttata 190  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  32797531 atataatatatcccaaaaagagcaccatcaatgatatactatatccaaaatgaacattattagtgttata 32797462  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 28948370 - 28948583
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca------- 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           
T  28948370 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacacaatatataccaaaaagagcaccatcat 28948469  T
Q  145 ------tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
           ||||| || || | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  28948470 agctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 28948568  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  28948569 agtact-aagagttaa 28948583  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Original strand, 13012560 - 13012731
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca----tcat 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||     |||    
T  13012560 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacaattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatacat 13012659  T
Q  149 cactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    || ||||||| |||||| |||||||| |||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13012660 caatgttatactatatctaaaaggaacattgctagtgctatattatatcgatccaaaaaagaagcactatat 13012731  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Original strand, 31652979 - 31653157
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  31652979 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccataagt 31653078  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||           ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31653079 gttatatcaatgctatactatatccaaaaggaaaattgttaatgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 31653157  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5985130 - 5984919
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||     
T  5985130 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtaaattacatacgcaatatat-acaaaaagagcaccatcag 5985032  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatca 238  Q
    ||||||             | |||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  5985031 tgttatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgtcagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatca 5984933  T
Q  239 gtactcaagagttaa 253  Q
    ||||| |||||||||    
T  5984932 gtact-aagagttaa 5984919  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Original strand, 28658564 - 28658768
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatc--atc 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || |  |||    
T  28658564 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatatgcaatatataccaaaaagaacaccatatc 28658663  T
Q  150 actgttat------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatc 237  Q
    | || |||            | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  28658664 agtgctatacatcatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatcaaaaaaagaacacatc 28658762  T
Q  238 agtact 243  Q
    ||||||    
T  28658763 agtact 28658768  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14334712 - 14334534
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| ||||| |    
T  14334712 ctcgtagtacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgttgattagtcaattacatacgtaaaatataccaaaaagagcaccatcagt 14334613  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||           |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  14334612 gttatatcaatgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcaccatat 14334534  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43190200 - 43190020
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca-------- 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||            
T  43190200 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaaatacatacgcaaaatatacaaaaaagagcacgagcagt 43190101  T
Q  145 -----tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
          ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43190100 gttatacatcaatgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 43190020  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25257558 - 25257349
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||     
T  25257558 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggt--ttagtcaattacatacgcaatatat-acaaaaagagcaccatcag 25257462  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatca 238  Q
    || |||             | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  25257461 tgctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatca 25257363  T
Q  239 gtactcaagagttaa 253  Q
    ||||| |||||||||    
T  25257362 gtact-aagagttaa 25257349  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3427800 - 3427704
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatc 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  3427800 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaaaagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatc 3427704  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30324665 - 30324452
Alignment:
Q  50 aagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatc 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||  |||    
T  30324665 aagctcgtagcacattaacataaatataaataatattggcgaataagagagtggtcattagtcaattacgtacgcaatatatac-aaaaagatcactatc 30324567  T
Q  150 actgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacat 236  Q
    | ||||||             | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  30324566 agtgttatgcatcaatgctacactatatccaaaaggaat-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacat 30324468  T
Q  237 cagtactcaagagttaa 253  Q
    ||||||| |||||||||    
T  30324467 cagtact-aagagttaa 30324452  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8133123 - 8132914
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8133123 gctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagccaattacatatgcaatatataccaaaaagagcaccatcac 8133028  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatatt-agaaaaagaacacatc 237  Q
    ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  8133027 tgttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatattctatatcgatccaaaaaagaatcactatattcaaaaaaagaacacatc 8132929  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  8132928 agtact-aagagttaa 8132914  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 437
Target Start/End: Original strand, 48715135 - 48715297
Alignment:
Q  275 tgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaat 374  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||  | |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||       ||||||    
T  48715135 tgggaagtatcggggaagatatcagtacatgataattatcagatactctcttgatatgtatcgggaagtatctgataattattttttaaaacaataaaat 48715234  T
Q  375 ttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  48715235 ttaatcttcggacactctcctgatacgtatcgggaagtatcgggccggtatcggtgtaggata 48715297  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33040822 - 33040711
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  33040822 aaatatattaacaaacaaaagaaacgagtcataggtttgtagcatatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattattcaa-ta 33040724  T
Q  118 catacacaatata 130  Q
    |||||||||||||    
T  33040723 catacacaatata 33040711  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Original strand, 37346520 - 37346609
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  37346520 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaaaata--ccaaaaagagca 37346609  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 38218808 - 38218733
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgat 92  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38218808 aaaatatattaacaaacaacataaaccagtcataggctcgtagtacatcaacataaatataaataatattgacgat 38218733  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 348
Target Start/End: Original strand, 2472681 - 2472906
Alignment:
Q  111 ccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaaga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| |||||             |||| ||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  2472681 ccaattacatacacaatatatcctaaaaagagcaccatcagtgctatactatata------------tgttagtgctatactttatcgatcagaaaaaga 2472768  T
Q  211 aacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataat 310  Q
    | ||||||||   ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||| |  | |||  |||||||    
T  2472769 agcactatatccaaaaaataacacattcgtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaaatatcggggcaggtgtcagtgctggataat 2472868  T
Q  311 gatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcag 348  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||    
T  2472869 tatcggatactctcctgatacgtatcggaaagtatcag 2472906  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15418012 - 15417927
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtga 103  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418012 aaatatattaacaaacacaagaaaccggtcataggctcgtatcatatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtga 15417927  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 655 - 730
Target Start/End: Original strand, 31868565 - 31868641
Alignment:
Q  655 tcatatgaaactgcagcttcaaacca-attcatcaatcatcatttcctcaaaattatcgaacaaaaacaccactcag 730  Q
    |||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31868565 tcatatgaaactgcagcttccaccaatattcatcaatcatcatttcctcaaacttatcgaacataaacaccactcag 31868641  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1043370 - 1043234
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  1043370 aagtatcagataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 1043271  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  1043270 caggggatacggtacatcatccattttgaagtatcgg 1043234  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 6916027 - 6916238
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaa---aagagcatcatc 149  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||    
T  6916027 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaattaagagcaccatc 6916122  T
Q  150 actgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacaca 235  Q
    | ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  6916123 agtgttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacaca 6916221  T
Q  236 tcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6916222 tcagtact-aagagttaa 6916238  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15417771 - 15417689
Alignment:
Q  106 attagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgtta 188  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  15417771 attagtcaattacatatacaatatatcccaaaaagaggaccatcaatgttatactatatcaaaaaggaacattgttagtgtta 15417689  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33039891 - 33039813
Alignment:
Q  203 aaaaaagaaacactatattagaaaaa-gaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaa 280  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  33039891 aaaaaaaaaacactatattccaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaa 33039813  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37104591 - 37104382
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||     
T  37104591 gctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattaggtaattacatacgcaatatataccaaaaatagcaccaacag 37104496  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
    ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  37104495 tgttatacatcaatgctacactatatccaaaa-gaaacttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 37104397  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  37104396 agtact-aagagttaa 37104382  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38331392 - 38331181
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaa---aagagcatcatc 149  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||    
T  38331392 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaattaagagcaccatc 38331297  T
Q  150 actgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacaca 235  Q
    | ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  38331296 agtgttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacaca 38331198  T
Q  236 tcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||| |||||||||    
T  38331197 tcagtact-aagagttaa 38331181  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 43189768 - 43189662
Alignment:
Q  370 aaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaa 468  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43189768 aaaatttaatatttggatactctcctgatacgtatcgagaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacggtacatcatccattttgaa 43189669  T
Q  469 gtttcgg 475  Q
    || ||||    
T  43189668 gtatcgg 43189662  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47656117 - 47656062
Alignment:
Q  43 cagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagag 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47656117 cagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaattatactgacgattaagag 47656062  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Original strand, 36367462 - 36367554
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36367462 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 36367554  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 360
Target Start/End: Original strand, 9528726 - 9528838
Alignment:
Q  248 agttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatca 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  |||| || ||||||| || | ||| || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  9528726 agttaagttattttagttaacattaattaagaagtattggggcaggtatctgtgcagaataattatcggatactctcctaatacgtatcgggaagtatca 9528825  T
Q  348 gataattattttt 360  Q
    |||||||||||||    
T  9528826 gataattattttt 9528838  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Original strand, 52894866 - 52894947
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaa 138  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  52894866 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaa 52894947  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10764009 - 10763903
Alignment:
Q  107 ttagccaattacatacacaatatatcccaaaaaga--gcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaa 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||| | || |||  |||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  10764009 ttagtcaattacatacacaatatattccaaaaaaaaagcaccataagtgatattctatatccaaaagaaacatttttagtgctatactatatcgatctaa 10763910  T
Q  205 aaaagaa 211  Q
    |||||||    
T  10763909 aaaagaa 10763903  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10822637 - 10822558
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggata 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| || || |  |||||||| ||||||||    
T  10822637 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaattgagaagtattggggcaggtatcgatcaaggataattatcggata 10822558  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1036602 - 1036471
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  1036602 aagtatcagataattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 1036503  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
      ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  1036502 caggggatacggtacgtcatccattttgaagt 1036471  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14167198 - 14167096
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggtaa-tcatctattttga 467  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||| ||| |||||| |  || |||||| ||| ||||| |||||||    
T  14167198 taaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcaggaagtatcagacagatatcggtgcaggatacgcaggtgatacgataagtcatccattttga 14167099  T
Q  468 agt 470  Q
    |||    
T  14167098 agt 14167096  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29862040 - 29861922
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||  || ||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||  || ||||||||||   |    
T  29862040 tactcaagagttaagttattttatttaacgttaattgggaattattgggacaggtataggtgcaggataattatcggatactttcctgatacgtatcgag 29861941  T
Q  340 aagtatcagataattattt 358  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  29861940 aagtatcggataattattt 29861922  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Original strand, 20409531 - 20409665
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |      
T  20409531 gtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgca 20409630  T
Q  442 ggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  20409631 ggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 20409665  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30323829 - 30323761
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30323829 taaaatttaatatttggatactctccagatacgtatcgggaagtatcgggcagatatcagtgcaggata 30323761  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 38948846 - 38948762
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta 453  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||    
T  38948846 taaaatttaatatttggatattcttcggatacgtatcgagaagtattgggcagatatcggtgcaggatacgcaggggatacggta 38948762  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 28949216 - 28949352
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  28949216 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcaggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 28949315  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  28949316 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 28949352  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 358
Target Start/End: Original strand, 34096428 - 34096546
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| | || || |||  || ||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||  || ||||||||||  ||    
T  34096428 tactcgagagttaagttattttatttaacgttaattgagaattattggggcaggtataggtgcaggataattattggatactttcctgatacgtatcggg 34096527  T
Q  340 aagtatcagataattattt 358  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  34096528 aagtatcggataattattt 34096546  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Original strand, 52894985 - 52895077
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52894985 tatatccaaaatgaac-ttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaaaaatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 52895077  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2364791 - 2364734
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatc 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||    
T  2364791 taaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcggaaagtattgggcaggtatc 2364734  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 430
Target Start/End: Original strand, 34432387 - 34432448
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtg 430  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  34432387 taaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcaggaagtatcaggcagataccagtg 34432448  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 220
Target Start/End: Original strand, 36363338 - 36363397
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36363338 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatat 36363397  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 40776109 - 40776053
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatat 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  40776109 taaaatttaatcttcggatactcgcctgatacgtatcgagaagtatcatgcagatat 40776053  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3427664 - 3427621
Alignment:
Q  177 ttgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3427664 ttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcactatat 3427621  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 6916849 - 6916985
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||  || ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  6916849 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttagatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 6916948  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  6916949 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 6916985  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10763772 - 10763717
Alignment:
Q  370 aaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatat 425  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  10763772 aaaaattaatcttcggatactcttctgatacgtatcaaaaaatatcgggcagatat 10763717  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 475
Target Start/End: Original strand, 32381042 - 32381170
Alignment:
Q  348 gataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggat 447  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||| | || ||||  ||| | ||||||  ||||||    
T  32381042 gataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtattgggaagtatcagacaaatattggtgcatgatatgcaggggat 32381141  T
Q  448 acggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  32381142 acggtatatcatccattttaaagtatcgg 32381170  T

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Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 37104263 - 37104127
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  37104263 aagtatcggataattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcaggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 37104164  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  37104163 caggggatacgatacgtcatccattttgaagtatcgg 37104127  T

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Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Original strand, 37346852 - 37346959
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  37346852 taaaatttaatatttggatactcccccgatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacggtacgtcatccattttga 37346951  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  37346952 agtatcgg 37346959  T

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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 38330570 - 38330434
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||  || ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  38330570 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttagatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 38330471  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  38330470 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 38330434  T

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Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 52895688 - 52895824
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||  || ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  52895688 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttagatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 52895787  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  52895788 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 52895824  T

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Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 475
Target Start/End: Original strand, 3708219 - 3708390
Alignment:
Q  305 gataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatat 404  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||  |||||||| ||||        |||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||    
T  3708219 gataattattggatactctcctgatacgtatcgagaagtatcgaataattatattttaaaaaataaaaatttaatattcgaatactctcctgatacgtat 3708318  T
Q  405 cgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||  | ||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  3708319 cgaaaagtatcgggcatgtattggtgtaggatatgcagaggatacgatacgtcatccattttgaagtatcgg 3708390  T

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Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8132324 - 8132190
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||  ||  |||| ||| |||||| |      
T  8132324 gtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgaacatgtatcggtgcaggatacgca 8132225  T
Q  442 ggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  8132224 ggggatacggtacgtcatctattttgaagtatcgg 8132190  T

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Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10764049 - 10764020
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataa 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10764049 ctcgtagcacatcaacataaatataaataa 10764020  T

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Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 430
Target Start/End: Original strand, 13012996 - 13013057
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtg 430  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13012996 taaaatttaatatttggatactctcccgatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcagtg 13013057  T

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Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 426
Target Start/End: Original strand, 31653406 - 31653463
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatc 426  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31653406 taaaatttaatatttggatactctcccgatacgtatcgggaagtatcgggcagatatc 31653463  T

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Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26692082 - 26691623
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26692082 aaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtaccacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 26691983  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  26691982 catacacaatatatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactctatcgatccaaaaaagaagcacta 26691883  T
Q  218 tat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |  || |||||||| ||||     
T  26691882 tatccaaaaaaataacacatcagtactcaaaacttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggagcagatatcaatgcaggataattatcgc 26691783  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    ||||  || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||     
T  26691782 atactatcctgatacgtatcgggaagtatcggataattatttttaaaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcttgatacgtatcgggaagtatca 26691683  T
Q  417 ggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    | ||| |||| ||| || ||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  26691682 gacaggtatcggtgcagaatacgcaggggatacgatacgtcatctattttgaagtatcgg 26691623  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26961814 - 26961355
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26961814 aaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtaccacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 26961715  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  26961714 catacacaatatatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactctatcgatccaaaaaagaagcacta 26961615  T
Q  218 tat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||  | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |  || |||||||| ||||     
T  26961614 tatccaaaaaaataacacatcagtactcaaaacttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggagcagatatcaatgcaggataattatcgc 26961515  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcg 416  Q
    ||||  || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||     
T  26961514 atactatcctgatacgtatcgggaagtatcggataattatttttaaaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcttgatacgtatcgggaagtatca 26961415  T
Q  417 ggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    | ||| |||| ||| || ||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  26961414 gacaggtatcggtgcagaatacgcaggggatacgatacgtcatctattttgaagtatcgg 26961355  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 475
Target Start/End: Original strand, 17137945 - 17138364
Alignment:
Q  54 tcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactg 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  17137945 tcgtagcacatcaacataa-tataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaaatatatacacaatatatcccaaaa-gagcaccatcaatg 17138042  T
Q  154 ttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17138043 ctatattatatgcaaaaggaacattgttagtgctatattatatcaatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcaatactcaagagttaa 17138142  T
Q  254 gttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataat 353  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17138143 gttattttagttaacattaattgggaaatatcagggcagatatcagtgcaggataattatcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatcagataat 17138242  T
Q  354 tattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta 453  Q
    || |||||       |||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||  |||| ||| |||||| |  ||||||||        
T  17138243 tactttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatattctcctgatacgtatcgggaagtatcaggcaattatcggtgcaggatacgcaggggatacatac 17138342  T
Q  454 atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  17138343 gtcatctattttgaagtatcgg 17138364  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26716716 - 26716285
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26716716 aaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 26716617  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26716616 catacacaatatatcccaaaaagagcaccataggtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcacta 26716517  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || | ||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  26716516 t----------------------actcaagagttaagttattttaactaacattaattgggaagtattgaggcaggtattggtgcaggataattatcgga 26716439  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  26716438 tactctcctgatacgtatcgggaagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcgggaagtatcag 26716339  T
Q  418 gcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
    |||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  26716338 gcaggtatcggtgtaggatacgcaggggatacgatacgtcatccattttgaagt 26716285  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26986456 - 26986025
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26986456 aaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 26986357  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26986356 catacacaatatatcccaaaaagagcaccataggtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcacta 26986257  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || | ||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  26986256 t----------------------actcaagagttaagttattttaactaacattaattgggaagtattgaggcaggtattggtgcaggataattatcgga 26986179  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  26986178 tactctcctgatacgtatcgggaagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcgggaagtatcag 26986079  T
Q  418 gcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
    |||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  26986078 gcaggtatcggtgtaggatacgcaggggatacgatacgtcatccattttgaagt 26986025  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 30777063 - 30777315
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  30777063 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 30777162  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30777163 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaataagcacta 30777262  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30777263 tatcaaaaaaagaacacataattactcaagagttaaattattttagttaacat 30777315  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Original strand, 30284253 - 30284718
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||  || | ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30284253 aaatatattaacaagcaaaagaaaccggtcataggctcctagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 30284352  T
Q  118 catacacaatatatccc-------aaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaaga 210  Q
     | |||||||||||||        ||||| | || ||| | || |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||      
T  30284353 gaaacacaatatatccacaaaaaaaaaaaaaacaccattagtgctatactatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaa-- 30284450  T
Q  211 aacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataat 310  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  30284451 agcactatattcaaaaaagaacacatcactactcaggagttaagttattttagttaacattaattgggaaatatcagggcagatatcggtgcagaataat 30284550  T
Q  311 gatcggatacgctcttgatac--gtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgag 408  Q
     || | |||| ||| || |||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |    
T  30284551 tattgaatactctcctggtacgtgtatcgggaagtatcggataattatttttttttaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcggg 30284650  T
Q  409 aagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  30284651 aagtatcaggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 30284718  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27938602 - 27938242
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27938602 aaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcatatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgataattagtcaatta 27938503  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   || |||| ||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27938502 catacacaatatatcccaaaaagagcaccatacgtgctatactatatccaaaaggaacactgttagtgctacactatatcgatccaaaaaagaagcacta 27938403  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      ||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||  ||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27938402 t----------------------acttaagagttaagttattttaattaatattaattgagaagtattagggtagatattggtgtaggataattatcgga 27938325  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatac 400  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27938324 tactctcctgatacgtattgggaagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatac 27938242  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11907750 - 11907504
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11907750 aaatatattaacaaacacaagaaaccagtcgtaggctcgtagcacatcaacataaata------atattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 11907657  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  11907656 catacacaatatataccaaaaagagcaccatcagtgttatactatatccaaaaggtacattgttggtgttataatatatcgatccaaaaaagaagcacta 11907557  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11907556 tatcaaaaaaagaatacatcagtactcaggagttaagttattttagttaacat 11907504  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27085817 - 27085486
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaata----taaataatattgacgattaagagagtgattattagcca 113  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||    
T  27085817 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtaataggctcgtagcacatcaacataaataattataaataatattgatgattaagaaagtgataattagtca 27085718  T
Q  114 attacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaac 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | || |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |    
T  27085717 attacatacacaatatatcc-aaaaagagcaccacgagtgctatactatattcaaaatgaacattgttagtgctatattatatcgatccaaaaaagaagc 27085619  T
Q  214 actatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgat 313  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||  ||||||| || || ||||  |||||||| ||    
T  27085618 actatatccaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacattaattggcaaatatcgggggagctatcggttcaggataattat 27085519  T
Q  314 cggatacgctcttgatacgtattaggaagtatc 346  Q
    | ||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  27085518 cagatactcttctgatacgtattgggaagtatc 27085486  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5722403 - 5722020
Alignment:
Q  57 tagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgtta 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  5722403 tagcacaccaacataaatataaattatactgacgattaagagaatgatgattagtcgattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgcta 5722304  T
Q  157 tattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagtt 256  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5722303 tattatatccaaaataaacattgttagtgttatcctatatcgattcaaaaaagaagcactatatccataaaagaacacataagtactcaagagttaagtt 5722204  T
Q  257 attttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattat 356  Q
     ||||| | ||||| || ||||||  |||||||||  ||   |||||||||||| |||| |||| ||  ||||          |||||||||||||||||    
T  5722203 tttttagtcaacattaattgggaaatatcggggcaagtatttgtgtaggataattatcgaatactcttctgat----------aagtatcagataattat 5722114  T
Q  357 tttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacg 450  Q
    |||||       |||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||||||||    
T  5722113 tttttttaaaaataaaatttaatcttcggatactttcctgatatgtattgagaagtatcgggcatgtatcagtgcaggatacgcaggggatacg 5722020  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22738296 - 22737962
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattat---tagccaa 114  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| ||     
T  22738296 aaatatattaacaaacaaaagaaactagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattaacgattaagagagtgatgatatttagtcag 22738197  T
Q  115 ttacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaaca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22738196 ttacatacacaatatatcccaaaaagaa---------tgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagca 22738106  T
Q  215 ctatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatc 314  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||| |||| ||||| || | ||| |||||||| |||    
T  22738105 ctata-tccaaaaagaacacatcagtgctcaagagttaaattattttagttaacattaattgagaagtatcgaggcaggtatcagtgcaggataattatc 22738007  T
Q  315 ggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttt 360  Q
     ||||| ||  |||||||||| || || |||| |||||||||||||    
T  22738006 agatactcttctgatacgtatcagaaattatc-gataattattttt 22737962  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25750049 - 25749731
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25750049 aaatatattaacaaacaaaataaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 25749950  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || || | ||||||||||| ||| |||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  25749949 catacacaatatatctcaaaaagagcaccataagtgctacactatatccaaaatgaacattgttagtgctatattacatcgatccaaaaaagaagcacta 25749850  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||| ||||||    
T  25749849 t----------------------actcaaaagttaagttattttaattaacattaattgggaagtattggggcaggtattggtgcaggataattatcgga 25749772  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattt 358  Q
    ||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  25749771 tactctcctgatacgtatcggaaagtatcagataattattt 25749731  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 3934462 - 3934838
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3934462 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatgaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 3934561  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  3934562 catacacaatatatctcaaaaagatcatcataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttatattatatcgatccaaaaaagaagcatta 3934661  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||   ||||| || || || |||||||| ||||||    
T  3934662 t----------------------actcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatttaggcaggtatcgatgcaggataattatcgga 3934739  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatt-ttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    ||| ||| ||||||||||  | ||||||  |||||||||| ||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  3934740 tactctcatgatacgtatcggaaagtattggataattattatttttaaaaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcggtaagtatc 3934838  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Original strand, 18001631 - 18002014
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  ||||||    
T  18001631 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggcttgtagcccatcaacataaatataaataatattgacaagtaagagagtgatgattaatcaatta 18001730  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||            || ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  18001731 catatccaatatatcccaaaaagagcaccatcagtgctatactatatcca------------ttagtgctatactttatcgatccaaaaaagaagcacta 18001818  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || || |||  || || |||| || ||||| | |||||| ||||||    
T  18001819 tattcaaaaaagaacacatcagtactcaataattaagttattttagttaacattaattgagaa-tattggagcaggtatcggtgcatgataattatcgga 18001917  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtat 414  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||  | ||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  18001918 tactctcttgatacgtatcggaaagtatcagataattatttttaaaaaaaataaaatttaatcttcaaatactctcctgatatgtatcgggaagtat 18002014  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3701528 - 3701331
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3701528 aaatatattaacaaacataagaaatcagttataggctcgtagcgcatcaacataaatataaaaaatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 3701429  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3701428 catgcacaatatat-ccaaaaagagcaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcact 3701331  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1921226 - 1921022
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  1921226 aaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtatatta 1921127  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgtt-atactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  1921126 catgcaaaatatatcccaaaaagagcatcatcagtgatatactatatccaaaaggatcattgttagtgttaatattatatcgatccaaaaaagaagcact 1921027  T
Q  217 atatt 221  Q
    |||||    
T  1921026 atatt 1921022  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1795833 - 1795635
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  1795833 atattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacata 1795734  T
Q  122 cacaatatatccca-aaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
     ||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1795733 tacaatatatcccaaaaaaaagcaccataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactata 1795635  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7629490 - 7629296
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    ||||||||||||| || || | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  7629490 aaaatatattaactaacaaaagaaatcattcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattggcgattaagagagtgatgattagtcaatg 7629391  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7629390 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcattagtgctatactatatccaaaagatacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaa 7629296  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34032811 - 34032437
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  34032811 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaatataaatataa----tattgacgattaagagagtgatgattaatcaatta 34032716  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||            ||| ||| |||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  34032715 catacacaatatatcccaaaaagagcaccatcagtgctatactatatcc------------gttagtgctatactttatcgatccaaaaaataagcacta 34032628  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatca--actgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcg 315  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |  | ||| ||  ||||||| || || || || || ||||| ||||    
T  34032627 tattaaaaaaagaacacattagtactcaaaagttaaattattttagttaacattaatattggaaaatatcggggtaggtatcgatgcagaataattatcg 34032528  T
Q  316 gatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  34032527 gatac---------tcgtattgggaagtatcagataattatttttttaaaaaataaaaattaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatc 34032437  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 220
Target Start/End: Original strand, 6242683 - 6242887
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6242683 aaatatattaacaaacacaagaaaccagtcatagactcatagcacatcaacattaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 6242782  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatac--tatatcgatctaaaaaagaaacac 215  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  6242783 catacacaatatataccaaaaaaagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgttatactatatatcgatctaaaaaagaagcac 6242882  T
Q  216 tatat 220  Q
    |||||    
T  6242883 tatat 6242887  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21251927 - 21251734
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||| ||| |  | ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21251927 aaatatattaataaacacaagaaaccagtcaaaggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 21251828  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  21251827 catacacaatatatcgcaaaaagaacaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttaatgctatactatatcgatccaaaaaagaa 21251734  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 176 - 436
Target Start/End: Original strand, 5612252 - 5612513
Alignment:
Q  176 attgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatatt-agaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaac 274  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  5612252 attgttagtgctatactatatcaatcaaaaaaagaagcactatatccaaaaaaagaacacatcaatactcgagagttaagttattttaattaacattaat 5612351  T
Q  275 tgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaat 374  Q
    ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||       ||||||    
T  5612352 tgggaactatcggggcaggtagcggtgcaggataattatcagatactctcctgatacgtatcaggaagtatcggataattattttttaaaaaaataaaat 5612451  T
Q  375 ttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggat 436  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  5612452 ttaatcttcggatactctcctggtacgtatcagaaagtatcgggcagttatcaatgcaggat 5612513  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 42365775 - 42365971
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  42365775 aaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaacagagtgatgattagtcaatt 42365874  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactg-----ttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaa 208  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||     ||||| ||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  42365875 agatgcacaatatatcccaaaaagagcaccatgagtgtaatattatactatatccaaaaggaagattcttagttatatactatatcgatccaaaaaa 42365971  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 41233760 - 41233444
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  41233760 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagcgtgatgattagtcaatta 41233661  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgat-ctaaaaaagaaacact 216  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||            | ||| ||| |||||| |||| || | |||||||||  |||    
T  41233660 catatacgatatataccaaaaagagcatcaggagtgctatattatat------------tcgttagtgctatactttatcaatccaaaaaaagaaggact 41233573  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    ||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||  || ||||||| || ||    | |||||| ||| |    
T  41233572 atatccaaaaaagaacacattagtactcaacagttaagttattttagttaacattaattgggaaatattggggcaggtatcg----atgataattatcag 41233477  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcaga 349  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  41233476 atactctcctgatacgtatcgggaagtatcaga 41233444  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14836742 - 14836574
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaa-aaagagcatcatca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| |    
T  14836742 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacggttaagagagtgacgattagtcaattacatacaaaatatatctcaataaaaagcaccataa 14836643  T
Q  151 ctgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
     ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14836642 gtgttatactatatccaaaagaaactttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaagcactata 14836574  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15066598 - 15066454
Alignment:
Q  76 taaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||     
T  15066598 taaataatattgacgattaagagagtaatgattagtcaattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccatcagtgctatactatatccgaaaggaac 15066499  T
Q  176 attgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  15066498 attgttagtgttatactatattgatccaaaaaagaagcattatat 15066454  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 437
Target Start/End: Original strand, 43357439 - 43357831
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||    
T  43357439 atattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgat--gtcaattacata 43357536  T
Q  122 cacaatatatcccaaaaaga-gcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    || ||||||||||||||| | ||| ||| | |  |||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||      
T  43357537 cataatatatcccaaaaaaaagcaccataagtactatactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactatatcgattcaaaaaagaagcactat-- 43357634  T
Q  221 tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatac 320  Q
                        |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||  || | ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||    
T  43357635 --------------------actcaagagttaagttattttatttaacgttaattgggaattattgaggcaggtataggtgcaggataattatcagatac 43357714  T
Q  321 gctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggca 420  Q
      || ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||  ||||||| | ||    
T  43357715 tttcctgatacgtatcgggaagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttttaatacgtatcggaaagtatcagaca 43357814  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 5612126 - 5612249
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5612126 aaatatattaacaagtaaaagaaaccagtcatatgctcttagcacatcaacataaatatgaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 5612225  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaaga 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  5612226 catacacaatatatccccaaaaga 5612249  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 39689892 - 39690105
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca------- 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||           
T  39689892 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacacaatatataccaaaaagagcaccatcat 39689991  T
Q  145 ------tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
           ||||| || || | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  39689992 agctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 39690090  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  39690091 agtact-aagagttaa 39690105  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 39796619 - 39796782
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| || ||||| |  |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39796619 aaatatattaacaaacacaagaaaccactcatatgtgcgtatcatatcaacataaatataagtaatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 39796718  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgtt 181  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  39796719 catatacaatatatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatctaaaaggaacattgtt 39796782  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 30919101 - 30918995
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  30919101 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcatcatcag 30919002  T
Q  152 tgttata 158  Q
    |||||||    
T  30919001 tgttata 30918995  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Original strand, 5985640 - 5985745
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  5985640 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcatcatcagt 5985739  T
Q  153 gttata 158  Q
    ||||||    
T  5985740 gttata 5985745  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 9728063 - 9728176
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9728063 aaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagaacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgatgattagtcaatta 9728162  T
Q  118 catacacaatatat 131  Q
    | ||||||||||||    
T  9728163 cgtacacaatatat 9728176  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 26794163 - 26794261
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26794163 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacaattaagagagtgctcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcatcatca 26794261  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9654193 - 9654025
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | |||| ||||| |||||     
T  9654193 aaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggcttgtggcatatcaacataaatataagtaatattaacaattaagaaaatgatgattagtcaattg 9654094  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgt 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9654093 catacacaatatatcacaaaaagagcaccattgatgttataatatatccataaggaatattgttagtgt 9654025  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10657400 - 10657296
Alignment:
Q  54 tcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| | ||    
T  10657400 tcgtagcacatgaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccattagtg 10657301  T
Q  154 ttata 158  Q
    |||||    
T  10657300 ttata 10657296  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Original strand, 35746069 - 35746161
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattag 110  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35746069 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacaattaagagagtgatgattag 35746161  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11694460 - 11694328
Alignment:
Q  224 aaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgct 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  || ||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||  ||    
T  11694460 aaaaagaacacatcagtact-aagagttaagttatttta-ttaacattaattgggaactattggggcaggtagcggtgcaggataattatcagatattct 11694363  T
Q  324 cttgatacgtattaggaagtatcagataattattt 358  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11694362 cttgatacgtatcgggaagtatcagataattattt 11694328  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9793248 - 9793040
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  9793248 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatcagt 9793153  T
Q  153 gttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatca 238  Q
    |||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  9793152 gttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatca 9793054  T
Q  239 gtactcaagagttaa 253  Q
    ||||| |||||||||    
T  9793053 gtact-aagagttaa 9793040  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 1638954 - 1639163
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca------- 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||           
T  1638954 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgatta--agagtggtcattagtcaattacatacgcaatatat-acaaaaagagcaccgtcag 1639050  T
Q  145 ------tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatca 238  Q
           ||||| || || ||||||||||||| |||  ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  1639051 tgatatacatcaatgctacattatatccaaaatgaa-cttgttagtgctatattatatcgatccaaaaaagaagcactatatcctaaaaagaacacatca 1639149  T
Q  239 gtactcaagagttaa 253  Q
    ||||| |||||||||    
T  1639150 gtact-aagagttaa 1639163  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11694530 - 11694466
Alignment:
Q  45 gtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattatta 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11694530 gtcataggctcgtagcacatcaacataagtataaataatattcacgattaagagagtgatgatta 11694466  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1795636 - 1795425
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||  ||  || ||| ||   ||| |||||||| |||||||||  |  ||||||||||  ||    
T  1795636 tactcaagagttaagttattttatttaacgttagttgggaattatttggacaggtatatgtgcaggataattatcggatacttttctgatacgtatcggg 1795537  T
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnn-taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatat 438  Q
    ||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||     
T  1795536 aagtatcggataattatttttaaaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatac 1795437  T
Q  439 gttggggatacg 450  Q
    |  |||||||||    
T  1795436 ggaggggatacg 1795425  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 470
Target Start/End: Original strand, 42365982 - 42366209
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||   ||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  ||    
T  42365982 tactcaaaagttaagttatttcagttaacattaattgggaagtatttaggcaggtaacggtgcaggataattatcggatactctcctgatacatatcggg 42366081  T
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||  |||||||||||          ||| | |||||||||||| | ||| ||||||  ||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||| |    
T  42366082 aagtattggataattattt----aaaaaataataattaatcttcggatattctcctgataggtattgggaaatatcgggcaggtatcagtgcaggatacg 42366177  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
      |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42366178 caggggatacagtacatcatctattttgaagt 42366209  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 32707806 - 32707942
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  32707806 aagtatcagataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 32707905  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  32707906 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 32707942  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 470
Target Start/End: Original strand, 41392687 - 41392818
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||||||| ||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  41392687 aagtatcagattattatttttttttaaaataaaatttaatatttggatactccccggatacatatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 41392786  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
      ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  41392787 caggggatacggtacgtcatccattttgaagt 41392818  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 267
Target Start/End: Original strand, 9729397 - 9729534
Alignment:
Q  126 atatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaa 225  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||   | ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||    |||| ||| |||||| || ||    
T  9729397 atatatctcaaaaagagcaccatcagtgtcgcagtatatccaaaaggaacattgttaatgctatactatatcgat----aaaaaaaaaactata-taaaa 9729491  T
Q  226 aaagaacacatcagtac-tcaagagttaagttattttaattaa 267  Q
    ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  9729492 aaaaaacacattagtacttaaagagttaagttattttagttaa 9729534  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 35746161 - 35746197
Alignment:
Q  183 gtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35746161 gtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactata 35746197  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Original strand, 1639786 - 1639893
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||||| |||  ||||| |||||||    
T  1639786 taaaatttaatatttggatactcttcggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacagtacgtcatccattttga 1639885  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  1639886 agtatcgg 1639893  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33830593 - 33830505
Alignment:
Q  163 atccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33830593 atccaaaaggaac-ttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaa-aatcactatatccaaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 33830505  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 39690738 - 39690874
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  39690738 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcaggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 39690837  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  39690838 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 39690874  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Original strand, 26794282 - 26794343
Alignment:
Q  158 attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26794282 attatatccaaaaggaac-ttgttagtgttatactaaatcgatccaaaaaagaatcactatat 26794343  T

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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10657281 - 10657221
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  10657281 tatatccaaacggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcattatat 10657221  T

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Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11906332 - 11906264
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  11906332 taaaatttaatattcggatactctccggatacgtatcgggaagtatcggacagatatcggtgcaggata 11906264  T

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Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12190499 - 12190431
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    |||||||||||||  | | ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12190499 taaaatttaatctctgaatactctcctgatacgtatcaagaagtatcggacagatatcagtgcaggata 12190431  T

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Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19321487 - 19321441
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  19321487 taaaatttaatcttcggatactcttctgatacacatcgggatgtatc 19321441  T

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Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 438
Target Start/End: Original strand, 19102469 - 19102538
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatat 438  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19102469 taaaatttaattgtcgtatactcttctgatacgtatcgggacatatcggacagatatcaatgtaggatat 19102538  T

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Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 32625020 - 32624934
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatc 426  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  32625020 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactcttcgaatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatc 32624934  T

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Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 281
Target Start/End: Original strand, 35746196 - 35746237
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaag 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  35746196 tactcaagagttaagttattttacttaacattaattgggaag 35746237  T

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Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11105753 - 11105364
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11105753 aaaatatattaacaaacaacagaaaccagtcgtaggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggttattagccaatt 11105654  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  11105653 acatacataatatatcccaaaaagagcaccatcagtgttattttatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatatcaatccaaaagagaagcact 11105554  T
Q  217 atatt-agaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcg 315  Q
     |||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| || || |||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||    
T  11105553 gtattaaaaaaaagaacatatcaatactcaagaattaatttattttatttaacattaattgagaagtatcggagaagatatcgttgtaggataatgatcg 11105454  T
Q  316 gatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatc 405  Q
    ||||| || |||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||       |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  11105453 gatactcttttgatatgtatacggaagtatcgaataattattttttaaaaaaataaaatttaatcttcgaatattcttctgatacgtatc 11105364  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3213034 - 3212782
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  3213034 aaatatattaacaaacaaaataaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 3212935  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3212934 catacacaatatataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatactatatcgatctaaaaaataagcacta 3212835  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3212834 tatcaaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacat 3212782  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7255383 - 7254997
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7255383 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcatagactcgtagcacatcaacattaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 7255284  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatatt-gttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
    ||    |||||||||||| ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7255283 ca----caatatatcccacaaagagcacaatcagtgctatactatatccaaaaggaacatttgttaatgttatactatatcgatccaaaaaagaagcact 7255188  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||  |||||||||| || ||||| | |||| | |||||    
T  7255187 atatcaaaaaaataacacatcagtactcaagagttaagttatttaagttaacattaattggaaaatatcggggcaggtatcggtgcatgatacttatcgg 7255088  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatt-ttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcg 406  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7255087 atactctcctgatacgtatcgggaagtatcagataattattattatttttaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcg 7254997  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 355
Target Start/End: Original strand, 10894194 - 10894509
Alignment:
Q  41 atcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaa-taatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaa 139  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10894194 atcagtcataggctcgaagcacatcagcataaatataaaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatatatcacaaaaa 10894293  T
Q  140 gagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcag 239  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   | |||||||||||||     
T  10894294 gaacaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaacaaagaacacatcaa 10894393  T
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattagg 339  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10894394 tactcgagagttaagtaattttagttaacattaattgggaaatatcggggtaggtatcggtgcaggataattatcggatactctcctgatacgtattagg 10894493  T
Q  340 aagtatcagataatta 355  Q
    |||||||  |||||||    
T  10894494 aagtatcgaataatta 10894509  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32018561 - 32018309
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  32018561 aaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 32018462  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32018461 catacacaatatataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgttatactatatcaatctaaaaaagaaacacta 32018362  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatc 271  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32018361 tatcgaaaaaagaacacat-agtactcaagagttaagttattttagttaacatc 32018309  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 404
Target Start/End: Original strand, 6707714 - 6708080
Alignment:
Q  39 aaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaa 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6707714 aaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattaatcaattacatacacaatacatcccaaaa 6707813  T
Q  139 agagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgat-ctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatc 237  Q
     ||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||||    |||||||||||||    
T  6707814 ggagcaccatcaatgctatactatatccaaaatgaacattgttagtgttatactatattgatccaaaaaaagaagcattatatccataaaagaacacatc 6707913  T
Q  238 agtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtatta 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||| |  | |||||||| || |||||  || |||| |||| |||| ||  ||||| ||||      
T  6707914 aatactcaagagttaagttattttagtcaacattaattggggaataacggggcaggtatcggtgctgggtaattatcgaatactcttctgataagtatcg 6708013  T
Q  338 ggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatat 404  Q
    ||||||||| ||||||||||||||       ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6708014 ggaagtatcggataattatttttttttaaaataatatttaatcttcggatactctcctgatacatat 6708080  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 13045035 - 13045357
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13045035 aaatatattaacaaacaaaagaaacaaatcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagccaatta 13045134  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||    
T  13045135 catacacaatatatcctaaaaa-agcaccatcagtgcaatactatatccaaaaggaagatcgttagtgttatactatatcaatccaaaaaagaaatgcta 13045233  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |||   ||||| ||     |||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||  || |||||||||| ||||| |||||| | ||| ||    
T  13045234 tatccaaaaaataa-----cagtactcaagagttaagttattttagttgacattaattgggaaatattggggcagatatcggtgcaggatagttatcaga 13045328  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatc 346  Q
    ||  ||| |||||| ||| || |||||||    
T  13045329 tattctcctgatacttatcagaaagtatc 13045357  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19128593 - 19128217
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  19128593 atattaacaaacaaaagaaatcggtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatgttgacgattaagagagtgacgattagtcaattacata 19128494  T
Q  122 cacaatatatcc-caaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  19128493 cacaatatatccaaaaaaaaagcaccataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactat-- 19128396  T
Q  221 tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatac 320  Q
                        |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||  ||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||    
T  19128395 --------------------actcaagagttaagttattttatttaacgttaattgggaattatcggggcagacataggtgaaggataattatcggatac 19128316  T
Q  321 gctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggc 419  Q
      || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19128315 tttcctgatacgtatcgggaagtatcggataattatttttaaaaaaaataaaatttaatcttcggatactcttctgatacgtatcggaaagtatcgggc 19128217  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27084416 - 27084216
Alignment:
Q  19 aatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattac 118  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  27084416 aatatattaacaaacaaaagaaaccagccataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacaattaagagagtgatggttagtcaattac 27084317  T
Q  119 atacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  27084316 atacacaatatatcccaaaaagagcatcataagtgttatactatatccgaaaggaacattgttagttctatactatatcgattcaaaaaagaagcactat 27084217  T
Q  219 a 219  Q
    |    
T  27084216 a 27084216  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 13607430 - 13607778
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataa----atataaataatattgacgattaagagagtgattattagcca 113  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  13607430 aaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtaacacttcaacataagtatatataaacaatattgatgattaagagagtgatgattagtca 13607529  T
Q  114 attacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  13607530 attacatacacaatatatcccaaaaagaacatcat---tgttatattatattcaaaagaaaaattgtaagtgttatactaaatcgatccaaaaaagaagc 13607626  T
Q  214 actat-------attagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtagga 306  Q
    |||||       |  | ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||  ||  || ||||||| || ||||||||||    
T  13607627 actataaaaaaaaaaaaaaaaaaaacacatcaatactcaagaattaagttattttagttaacattaattgaaaaatattggggcaggtatcggtgtagga 13607726  T
Q  307 taatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattt 358  Q
    |||| |||  ||||  || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  13607727 taattatcatatactatcctgatacgtatcgggaagtatcatataattattt 13607778  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Original strand, 13061028 - 13061289
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||| ||| || | |||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13061028 aaatatattaataaacaaaagaaacaagtgataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 13061127  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  13061128 catacacaatatatcccaaaaa-aacagcatcagtgttatactatacccaagaggaagatcattagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcgcta 13061226  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaa 280  Q
    |||   ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  13061227 tatccaaaaaataacacatcaatactcaaaaattaagttattttagttaatattaattgggaa 13061289  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26327736 - 26327524
Alignment:
Q  42 tcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26327736 tcagtcataggctcgtagcacatcaacattaatataaataattatgacgattaagagagtgatgattagtcagttacatagacaatatatctcaaaaaga 26327637  T
Q  142 gcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagta 241  Q
    |||  || | ||||||| |||||| |||| | | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||    
T  26327636 gcacaattagtgttatactatatctaaaatgtacattgttagtgttatactatattgatccaaaaaagaagcactatatccataaaagaacacatcggta 26327537  T
Q  242 ctcaagagttaag 254  Q
    ||| |||||||||    
T  26327536 ctccagagttaag 26327524  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3299502 - 3299339
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  3299502 aaatatattaacaaacacaataaaccaatcataggctcgtaccacatcaacatgaatataaataacattaacgattaagagagtaatgattagtcaatta 3299403  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgtt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3299402 catacacaatatatcccaaaaagagcaccatcagtgctataatatatccaaaaggaacattgtt 3299339  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 7187940 - 7188154
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  7187940 gctcgtagcacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtgatcattagttaattacatacacaatatataccaaaaagagcaccatcag 7188039  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat--tagaaaaagaacacat 236  Q
    || |||             | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   | |||||||||||||    
T  7188040 tgctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaaagaacacat 7188138  T
Q  237 cagtactcaagagttaa 253  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7188139 cagtact-aagagttaa 7188154  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 234754 - 234551
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    ||||||||||| || | |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  234754 atattaacaaacaaaagaaactagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaactacata 234655  T
Q  122 cacaatatat------cccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacac 215  Q
    ||||||||||         ||||| | || ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  234654 cacaatatataaaaaaaaaaaaaaaaacaccataagtgttatactatatccaaaagaaacattgtcagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcac 234555  T
Q  216 tata 219  Q
    ||||    
T  234554 tata 234551  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Original strand, 32130222 - 32130400
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  32130222 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagt 32130321  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||           | ||||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  32130322 gttatataaatgttatactttatccaaaaggaacattgttaatgctatactatattgatccaaaaaagaagcactatat 32130400  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31079889 - 31079667
Alignment:
Q  193 atatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcag 292  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||   ||| ||||||  ||||| ||||    
T  31079889 atatcaatccaaaaaagaaacactatatccaaaaaagaacacatcagtattcaagatttaagttattttagttaa---caattgggaaatatcggagcag 31079793  T
Q  293 ataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttt-tnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactc 391  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||  || |||     
T  31079792 gtatcggtgcatgataatcatcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatcagataattatttttaaaataaaataaaatttaatcttaagatacta 31079693  T
Q  392 ttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  31079692 tcctgatacttatcgagaagtatcgg 31079667  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 4153215 - 4153325
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||    
T  4153215 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcatagcacatcaacataaatataaataatattaacgattaagagagtgatgatcactcaatta 4153314  T
Q  118 catacacaata 128  Q
    | |||||||||    
T  4153315 cttacacaata 4153325  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 211
Target Start/End: Original strand, 22988838 - 22988972
Alignment:
Q  74 tataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaagga 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22988838 tataagtaatattgacgattaagcgagtgatgattagtcaaa---atacacaatatatcccaaaaggaacaccatcagtgttatactgtatccaaaagga 22988934  T
Q  174 atattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22988935 acattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaa 22988972  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23799558 - 23799424
Alignment:
Q  74 tataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaagga 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  23799558 tataagtaatattgacgattaagcgagtgatgattagtcaaa---atacacaatatatcccaaaaggaacaccatcagtgttatactgtatccaaaagga 23799462  T
Q  174 atattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23799461 acattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaa 23799424  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8357835 - 8357739
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  8357835 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatat-acaaaaagagcaccatca 8357739  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 220
Target Start/End: Original strand, 31740483 - 31740557
Alignment:
Q  146 catcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31740483 catcaatgttatattatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 31740557  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 1035979 - 1036190
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaa---aagagcatcatc 149  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||    
T  1035979 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaattaagagcaccatc 1036074  T
Q  150 actgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacaca 235  Q
    | ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  1036075 agtgttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacaca 1036173  T
Q  236 tcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||| |||||||||    
T  1036174 tcagtact-aagagttaa 1036190  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 26327354 - 26327201
Alignment:
Q  283 atcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatctt 382  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||| ||   |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||    
T  26327354 atcggggcaggtatcggtgcaggataatcatcgaatactcttcagataagtatcgggaagtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatctt 26327255  T
Q  383 cggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    |||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  26327254 cggatactc-tcttatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggata 26327201  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8357101 - 8356970
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| |    
T  8357101 aagtatcggataattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactcttcggatacgtatcgggaagtatcggacaggtatcggtgcaggatacg 8357002  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
      ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  8357001 caggggatacggtacgtcatccattttgaagt 8356970  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Original strand, 31195633 - 31195725
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31195633 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacaacagtact-aagagttaa 31195725  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 234419 - 234352
Alignment:
Q  370 aaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  234419 aaaagttaatcttcggatactcttctgatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggata 234352  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 470
Target Start/End: Original strand, 31195844 - 31195975
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  31195844 aagtatcggataattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactctccagatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 31195943  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
      ||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  31195944 caggggatacgatacgtcatccattttgaagt 31195975  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3212591 - 3212523
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3212591 taaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcagatatcggtgcaggata 3212523  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27084217 - 27084165
Alignment:
Q  240 tactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcag 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||    
T  27084217 tactcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatgggggcag 27084165  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 1036801 - 1036937
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||  || ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  1036801 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttagatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 1036900  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  1036901 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 1036937  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Original strand, 31195551 - 31195618
Alignment:
Q  91 attaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttata 158  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  31195551 attaagagagtggtcattaggtaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccagcagtgttata 31195618  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8357689 - 8357624
Alignment:
Q  187 tatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8357689 tatattatattgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 8357624  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 144
Target Start/End: Original strand, 31740394 - 31740468
Alignment:
Q  70 taaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| || || ||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  31740394 taaatataaataatattgacgataaagagagtggggattagtcatttgcatacgcaaaatataccaaaaatagca 31740468  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Original strand, 7188756 - 7188887
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| |      
T  7188756 gtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcaggaagtatcaggcaggtatcggtgcaggatacgca 7188855  T
Q  442 ggggatacggtaatcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||    
T  7188856 ggggatacggta--catccattttgaagtatcgg 7188887  T

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Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 84 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 32425316 - 32424928
Alignment:
Q  84 attgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaa---tattgt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||   ||||||    
T  32425316 attgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatccccaaaatagcatcatcaatgttatactatattcaaaaagaacattattgt 32425217  T
Q  181 tggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaa 280  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||    
T  32425216 tagtgttatactatatcaatctaaaaaagaaacactatattcaaaaaagaacaca-------tcaagagttaagttattttagttaacattaattggaaa 32425124  T
Q  281 ggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatc 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||||    
T  32425123 gtatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatactctcctgatacatatcgggaagtatcggataattattttttttaaaaataaaatttaatc 32425024  T
Q  381 ttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||| ||| |||||| |   |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  32425023 ttcggatactcttctgatacgtatcgtgaagtatcagacaggtatcggtgcaggatacgcaagggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 32424928  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20182832 - 20182418
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20182832 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgatgattagtcaatta 20182733  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  20182732 cataaacaatatatcccaaaaagagcaccattaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgataaaaaaaagaagcacca 20182633  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    ||| | ||||| || ||||  ||      |||||||||||||||| |||||||  | || |||  |||| |||||||| || ||||| ||||| ||| ||    
T  20182632 tatcaaaaaaaaaatacatgggt------gagttaagttattttagttaacatttattgtgaaatatcgaggcagatatcgatgtagaataattatcaga 20182539  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgg 417  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  20182538 tactttcttgatacgtatcgggaagtatcggttaattatttttttaaaaattaaaatttaatcttcagatactctactgatacgtatcgaaaagtatcag 20182439  T
Q  418 gcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
     ||||||| |||| ||||||||    
T  20182438 acagatat-agtgcaggatatg 20182418  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7412068 - 7411726
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  7412068 aaaatatattaacaaacaacataaaccaatcataggctcgtagcacataaacataaatgtaaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatt 7411969  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacact 216  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||    
T  7411968 gcataaacaatatatcccaaaaatagcaccatcaatgctatattatatctaaaataaacattgttagtgttatactatatcgatccaaaaagaaagcact 7411869  T
Q  217 atattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgg 316  Q
    || ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  7411868 atgttcaaaaaagaacacatcggttctcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcggggcatgtatcaatgtaggataatgatcgg 7411769  T
Q  317 atacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatttt 359  Q
    |||| ||| ||||| ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  7411768 atactctcctgatatgtatcgagaagtatcggataattatttt 7411726  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27968550 - 27968147
Alignment:
Q  25 ttaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacac 124  Q
    |||||||| || | ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27968550 ttaacaaacaaaagaaatcggtcatagactcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacac 27968451  T
Q  125 aatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattaga 224  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   |    
T  27968450 aatatatcacaaaaagagcaccatcagtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttatactatatcgat---aaaaaaaaacactatatccaa 27968354  T
Q  225 aaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctc 324  Q
    |||||||||||||          ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| |||    
T  27968353 aaaagaacacatc----------agttaagttattttagttaacattaattgggaagtatcagggcagatatcagtgcaagataattatcggatactctc 27968264  T
Q  325 ttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacac--tcttctgatacatatcgagaagtatcgggcaga 422  Q
     ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||| | |||     
T  27968263 ctgatatgtatcgagaagtatcagataattatttttttaaaaaataaactttaatcttcggatacgatctcctgatacgtatcgggaagtatcagccagg 27968164  T
Q  423 tatcagtgtaggatatg 439  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  27968163 tatcggtgcaggatatg 27968147  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40413008 - 40412756
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  40413008 aaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 40412909  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40412908 catacacaatatataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaagagaacattgttagtgctatactatatcgatctaaaaaaaaagcacta 40412809  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40412808 tatcaaaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttagttaacat 40412756  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27886615 - 27886258
Alignment:
Q  45 gtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 144  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27886615 gtcataggctcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgatcaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatatatcacaaaaagagcc 27886516  T
Q  145 tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactc 244  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||           
T  27886515 ccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttatactatatcgat---aaaaaaaaacactatatccaaaaaataacacatc------- 27886426  T
Q  245 aagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagta 344  Q
       ||||||||||||||  ||||||| || || |||| ||| ||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||    
T  27886425 ---agttaagttattttcgttaacattaattgtgaagtatcagggcagatatcagtgcaagataattatcggatactctcctgatatgtattgagaagta 27886329  T
Q  345 tcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||||||| ||||||||       |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  27886328 tcagataactattttttttaaaaataaactttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatc 27886258  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27945273 - 27944916
Alignment:
Q  45 gtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 144  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27945273 gtcataggctcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgatcaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatatatcacaaaaagagcc 27945174  T
Q  145 tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactc 244  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||           
T  27945173 ccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttatactatatcgat---aaaaaaaaacactatatccaaaaaataacacatc------- 27945084  T
Q  245 aagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagta 344  Q
       ||||||||||||||  ||||||| || || |||| ||| ||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||    
T  27945083 ---agttaagttattttcgttaacattaattgtgaagtatcagggcagatatcagtgcaagataattatcggatactctcctgatatgtattgagaagta 27944987  T
Q  345 tcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    |||||||| ||||||||       |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  27944986 tcagataactattttttttaaaaataaactttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatc 27944916  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28025516 - 28025133
Alignment:
Q  45 gtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 144  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28025516 gtcataggctcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgatcaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatatatcacaaaaagagcc 28025417  T
Q  145 tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactc 244  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||           
T  28025416 ccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttatactatatcgat---aaaaaaaaacactatatccaaaaaataacacatc------- 28025327  T
Q  245 aagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagta 344  Q
       ||||||||||||||  ||||||| || || |||| ||| ||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||    
T  28025326 ---agttaagttattttcgttaacattaattgtgaagtatcagggcagatatcagtgcaagataattatcggatactctcctgatatgtatcgagaagta 28025230  T
Q  345 tcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacac--tcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    |||||||||||||||||       |||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||| | ||| |||| ||| ||||||||    
T  28025229 tcagataattatttttttaaaaaataaactttaatcttcggatacgatctcctgatacgtatcgggaagtatcagccaggtatcggtgcaggatatg 28025133  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 270
Target Start/End: Original strand, 27108876 - 27109100
Alignment:
Q  46 tcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcat 145  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27108876 tcataggctcgtaacacatcaacataactataaataatattgacaattaagagagtgatgattagtcaattacatacataatatatcccaaaaagagcac 27108975  T
Q  146 catcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactca 245  Q
     || | || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||| |    
T  27108976 aataagtgctatactatatccaaaaggaaaattgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcggtactta 27109075  T
Q  246 agagttaagttattttaattaacat 270  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  27109076 acagttaagttattttagttaacat 27109100  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3892407 - 3892089
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  3892407 aaatatattaaataacaaaataaaccagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagcgatgattagtcaatta 3892308  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  3892307 catacacaatatatcctaaaaagagcaccataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgctatactatatcaatccaaaaaagaagcacta 3892208  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcgga 317  Q
    |                      |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  3892207 t----------------------actcaagagttaagttattttagttaacattaattgggaagtattggggcaggtatcggtgcaggataattatcgga 3892130  T
Q  318 tacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattt 358  Q
    ||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3892129 tactctcctgatacgtatcgagaagtatcagataattattt 3892089  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 8170759 - 8171011
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    |||||||||| |||| |  | ||| |||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  8170759 aaatatattaccaaacacaagaaaccagtcatgggcttgtagcatatcaacgtaaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaatta 8170858  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacacta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8170859 catacacaatatataccaaaaagagcaccatcagtgctatacaatatccaaaaagaacattggtagtgctatactatatcgatctaaaaaagaagcacta 8170958  T
Q  218 tattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacat 270  Q
    |||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8170959 tatcgaaaaaagagcatatcagtactcaagagttaagttattttagttaacat 8171011  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 38389054 - 38388713
Alignment:
Q  94 aagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatacta 193  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | || |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  38389054 aagagaatgatgattagtcaattacatacacaatatataccaaa--gagcatcatgagtgctatattttatccaaaatgaacattgttagtgttatacta 38388957  T
Q  194 tatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcaga 293  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||  ||||||||||     
T  38388956 tatcgattcaaaaaagaaactctacatccataaaagaacacatcagtactcgagagttaagtttttttagtcaacattaattgggaaatatcggggcagg 38388857  T
Q  294 taccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactctt 393  Q
    || |||||||||||||| |||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||| |     
T  38388856 tatcggtgtaggataattatcgaatactcttctgataagtatcaggaagtattggataattgttttttaaaaaaataaaatttaatcttcggatactttc 38388757  T
Q  394 ctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  38388756 ctgacacgtatcgagaagtatcggacaggtatcggtgcaggata 38388713  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 254
Target Start/End: Original strand, 41098644 - 41098856
Alignment:
Q  42 tcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaaga 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41098644 tcagtcataggctcgtagcacatcaacattaatataaataattatgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatatatctcaaaaaga 41098743  T
Q  142 gcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagta 241  Q
    |||  || | ||||||| |||||| |||| | | ||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    ||||||||||||| |||    
T  41098744 gcacaattagtgttatactatatctaaaatgtacattgttaatgttatactatattgatccaaacaagaaacactatatccataaaagaacacatcggta 41098843  T
Q  242 ctcaagagttaag 254  Q
    ||| ||| |||||    
T  41098844 ctccagaattaag 41098856  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33044 - 32855
Alignment:
Q  22 atattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacata 121  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  33044 atattaacaaataaaagaaaccagtcatatgctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacata 32945  T
Q  122 cacaatatatcccaaaaagag---catcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaa 208  Q
     ||||||||||| ||||| |    |||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  32944 tacaatatatccaaaaaaaaaaaacatcataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttatactatattgatccaaaaaa 32855  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37372653 - 37372305
Alignment:
Q  60 cacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||     
T  37372653 cacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagaatgatgattagtcaattacatacacaatatatcccaaaaagagcaccataagtgctatac 37372554  T
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaagttatt 259  Q
    |||||||||||| ||        ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||                      ||||||| ||||||||||    
T  37372553 tatatccaaaagaaa--------gtgctatattatatcgatccaaaaaagaagcactata----------------------ctcaagaattaagttatt 37372484  T
Q  260 ttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgtattaggaagtatcagataattatt-t 358  Q
    ||| ||||||| || ||||||| || ||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  37372483 ttagttaacattaattgggaagtattggggcaggtatcggtgcaaaataattatcggatactctcctgatacgtattgggaagtatcgaataattattat 37372384  T
Q  359 tttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    | |       |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  37372383 tatttttaaataaaatttaatcttcggatactctcctgatacgtatcgggaagtatcagacaggtatcagtgcaggata 37372305  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 5818006 - 5818199
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||| ||    
T  5818006 aaatatattaacaaacaaaataaatcagtcataggctcgtagcatatcaacataaatataaataatattgtccattaagaaagtgatgattagtcaacta 5818105  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatc-actgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || |||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  5818106 catacacaatatatccc-aaaagagcaccatcaaatgctatactatattcaaaaggaacattgttagtgctatactacatcaatccaaaacagaa 5818199  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28737964 - 28737780
Alignment:
Q  17 aaaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28737964 aaaatatattaacaaataaaagaatctagtcataggctcgtagaacatcaacataaatataaataacattgacgattaaaagagtgatgattagtcaatt 28737865  T
Q  117 acatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  || | || |||| |||||||||||| || ||| ||  || |||| ||||||||||    
T  28737864 acatacacaatatatcccaaaaaaagcacaataagtgctatactatatccaaaagaaacattattaatggtatattatatcgatc 28737780  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5540377 - 5540164
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5540377 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgttcattagtttattacatacacaatatataccaaaaagagcatcatcag 5540278  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
    ||||||             | |||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  5540277 tgttatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatattatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 5540179  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  5540178 agtact-aagagttaa 5540164  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 28875728 - 28875941
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcat------ 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||          
T  28875728 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcatcatcag 28875827  T
Q  146 -------catcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
           ||||| || || | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  28875828 gaataaacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 28875926  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  28875927 agtact-aagagttaa 28875941  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19436806 - 19436628
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagag---catc--- 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||||       
T  19436806 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagtaccatcagg 19436707  T
Q  147 -----atcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
         |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19436706 gttatatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttaatgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 19436628  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19572955 - 19572777
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagag---catc--- 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||||       
T  19572955 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagtaccatcagg 19572856  T
Q  147 -----atcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
         |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19572855 gttatatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttaatgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 19572777  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32878011 - 32877831
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  32878011 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaatagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagt 32877912  T
Q  153 gt-------------tatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||             |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32877911 gttatacatcaacgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 32877831  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 45216383 - 45216596
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||     
T  45216383 gctcgtaacacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatcat 45216482  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
    || |||             | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  45216483 tgctatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcattatatccaaaaaaagaacacatc 45216581  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  45216582 agtact-aagagttaa 45216596  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 158
Target Start/End: Original strand, 43770868 - 43770973
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  43770868 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaaaagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatcagt 43770967  T
Q  153 gttata 158  Q
    ||||||    
T  43770968 gttata 43770973  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25022708 - 25022530
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| |    
T  25022708 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatatgcaaaatataccaaaaagagcaccatcagt 25022609  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||           ||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25022608 gttatatcaatgctacactatatccaaaaagaacattgataatgctatactatattgatccaaaaaagaaacactatat 25022530  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42949623 - 42949517
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |    
T  42949623 ctcgtagcacattaacataaatatacataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatataccaaaaagagcatcatcggt 42949524  T
Q  153 gttatat 159  Q
    |||||||    
T  42949523 gttatat 42949517  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32760308 - 32760098
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||| |    
T  32760308 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattgagagagtggtcattagtcaattacatacgaaatatat-acaaaaagagcactatcagt 32760210  T
Q  153 gttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcag 239  Q
    |||||             | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  32760209 gttatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcag 32760111  T
Q  240 tactcaagagttaa 253  Q
    |||| |||||||||    
T  32760110 tact-aagagttaa 32760098  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6029046 - 6028866
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca-------- 144  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||            
T  6029046 ctcgcagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaaaatatacaaaaaagagcacgagcagt 6028947  T
Q  145 -----tcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
          ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6028946 gttatacatcaatgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 6028866  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Original strand, 32638391 - 32638589
Alignment:
Q  66 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatat------ 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||           
T  32638391 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatcagtgctatacatcgat 32638490  T
Q  160 -------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagtta 252  Q
           ||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32638491 gctacactatattcaaaaggaac-ttgttagtgctatacaatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatgagtact-aagagtta 32638588  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36484377 - 36484176
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||||  |||| |    
T  36484377 ctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattgagagagtggtcattagtcaattacatacgaaatatat-ataaaaagagcactatcagt 36484279  T
Q  153 gttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcag 239  Q
    |||||             | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  36484278 gttatacatcaatgctacactatatccaaaaggaa-cttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcag 36484180  T
Q  240 tact 243  Q
    ||||    
T  36484179 tact 36484176  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4246880 - 4246671
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||     
T  4246880 gctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcaccatcat 4246785  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
    ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  4246784 tgttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 4246686  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  4246685 agtact-aagagttaa 4246671  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Original strand, 19947542 - 19947717
Alignment:
Q  56 gtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatc--------- 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||| |             
T  19947542 gtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaacacagtggtgattagtcaattacatacgcaaaacataccaaaaagagcaccaccagtgtt 19947641  T
Q  147 --atcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
      |||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19947642 atatcaatgttatactatacccaaaagaaacattgttaatgttatactatatcgatccaaaaaagaagcactatat 19947717  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 122
Target Start/End: Original strand, 12579693 - 12579762
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatac 122  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  12579693 ctcgtagcatattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgttcattagtcaattacatac 12579762  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4246081 - 4245953
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||      
T  4246081 gtatcggataattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactcttcggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatatgca 4245982  T
Q  442 ggggatacggta-atcatctattttgaag 469  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4245981 ggggatacggtacgtcatctattttgaag 4245953  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 34900534 - 34900745
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaa---aagagcatcatc 149  Q
    |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||    
T  34900534 ctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaattaagagcaccatc 34900629  T
Q  150 actgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacaca 235  Q
    | ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  34900630 agtgttatacatcaatgctacactatatccaaaatgaa-cttgttagtgatatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacaca 34900728  T
Q  236 tcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||| |||||||||    
T  34900729 tcagtact-aagagttaa 34900745  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Original strand, 12579820 - 12579911
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12579820 tatatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 12579911  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37669523 - 37669432
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagca 144  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  37669523 gctcgtactacattaacataaatataaataatattgacgattgagagagtggtcattagtcaattacatacgaaatatat-acaaaaagagca 37669432  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 22200985 - 22201194
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||     
T  22200985 gctcgtagcacattaatataaatataa----tattgacgattaagagagtggtcattaggtaattacatacgcaatatataccaaaaatagcaccaacag 22201080  T
Q  152 tgttat-------------attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatc 237  Q
    ||||||             | ||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  22201081 tgttatacatcaatgctacactatatccaaaa-gaaacttgttagtactatactatatcgatccaaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatc 22201179  T
Q  238 agtactcaagagttaa 253  Q
    |||||| |||||||||    
T  22201180 agtact-aagagttaa 22201194  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29355967 - 29355691
Alignment:
Q  134 caaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaaca 233  Q
    |||||| |||| ||| | || |||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  29355967 caaaaatagcaccatgagtgctatactatattcaaaagaaacattgttagtgttatactatattaataaaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaaca 29355868  T
Q  234 catcagtactcaagagttaagttattttaattaacatcaactgggaaggatcggggcagataccggtgtaggataatgatcggatacgctcttgatacgt 333  Q
    |||      | ||||||||||||||| || |||||||  | || |||  |||| |||||||| ||  |||||||||| ||| |||||  || | ||||||    
T  29355867 cat------tgaagagttaagttattgtagttaacatttattgtgaaatatcgaggcagatatcgacgtaggataattatcagatactttccttatacgt 29355774  T
Q  334 attaggaagtatcagataatta-ttttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatc 415  Q
    ||  |||||||||   |||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  29355773 atcgggaagtatcgactaattactttttttaaaaattaaaatttaatcttcggatactctcctgctacgtatcgggaagtatc 29355691  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16384760 - 16384624
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||      
T  16384760 aagtatcggataattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactcttcggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatact 16384661  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  16384660 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 16384624  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32759516 - 32759385
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  32759516 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccagatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 32759417  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagt 470  Q
      ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  32759416 caggggatacggtacgtcatccattttgaagt 32759385  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 36483576 - 36483442
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgtt 441  Q
    ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |      
T  36483576 gtatcggataattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactcttcggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgca 36483477  T
Q  442 ggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  36483476 ggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 36483442  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 12580528 - 12580664
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||| | ||| |||| ||| |||||| |    
T  12580528 aagtatcagataattatattttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcagacagttatcggtgcaggatacg 12580627  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12580628 caggagatacggtacatcatctattttgaagtatcgg 12580664  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 437
Target Start/End: Original strand, 5818288 - 5818383
Alignment:
Q  342 gtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||| |||| ||| ||||||    
T  5818288 gtatcagataattattttttttaaaaataaaatttaatcttcagatactctcctgatacatatcgggaaatatcatgcaggtatcggtgcaggata 5818383  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 32877589 - 32877444
Alignment:
Q  331 cgtattaggaagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtg 430  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  32877589 cgtatcaggatgtatcggaaaattatttttttaaaaaataaaatttaatatttggatactctcccgatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtg 32877490  T
Q  431 taggatatgttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
     |||||| |  ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  32877489 caggatacgcaggggatacgatacgtcatccattttgaagtatcgg 32877444  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Original strand, 2872914 - 2873021
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    |||||||| || || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  2872914 taaaatttcatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacggtacgtcatccattttga 2873013  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  2873014 agtatcgg 2873021  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6028601 - 6028494
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  6028601 taaaatttaatatttggatactctcccgatatgtatcggaaagtatcgggcagatatcggtgcaggatacgcaggggatacggtacgtcatccattttga 6028502  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  6028501 agtatcgg 6028494  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13422322 - 13422215
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13422322 taaaatttaatatttggatactctccgtatacgtatcgggaagtatcaggcaggtatcggtgcaggatatgcaggggatacggtacgtcatccattttga 13422223  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  13422222 agtatcgg 13422215  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 22201312 - 22201448
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  22201312 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 22201411  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  22201412 caggggatacgatacgtcatccattttgaagtatcgg 22201448  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 475
Target Start/End: Original strand, 28876570 - 28876677
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta-atcatctattttga 467  Q
    ||||||||||| || ||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |  |||||||| |||  ||||| |||||||    
T  28876570 taaaatttaatatttggatactctctggatacgtatcgagaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacagtacgtcatccattttga 28876669  T
Q  468 agtttcgg 475  Q
    ||| ||||    
T  28876670 agtatcgg 28876677  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 34901357 - 34901493
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||  || ||||| | ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  34901357 aagtatcggataattattttttaaaaaaataaaatttaatatttagatactctccggatacgtatcggaaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 34901456  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  34901457 caggggatacggtacgtcatccattttgaagtatcgg 34901493  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 220
Target Start/End: Original strand, 43771004 - 43771047
Alignment:
Q  177 ttgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43771004 ttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaatcactatat 43771047  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 38389087 - 38389053
Alignment:
Q  39 aaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaa 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38389087 aaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaa 38389053  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32825 - 32792
Alignment:
Q  327 gatacgtattaggaagtatcagataattattttt 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32825 gatacgtatcaggaagtatcagataattattttt 32792  T

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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 406
Target Start/End: Original strand, 24100197 - 24100234
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcg 406  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24100197 taaaatttaatcttcggatactctcctgatacatatcg 24100234  T

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Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37669403 - 37669312
Alignment:
Q  160 tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  37669403 tatatccaaaagaaac-ttgttagtgctatattatattgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcaatact-aagagttaa 37669312  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Original strand, 202436 - 202622
Alignment:
Q  18 aaatatattaacaaataacataaatcagtcataagctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 117  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||||||    
T  202436 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaa-------atgattagtcaatta 202528  T
Q  118 catacacaatatatcccaaaaagagcatcatcactgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaa 211  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  202529 catatacagtatatcccaaaaagaacatcataaatgttatgttatatccaaaagaaatattgttagtgctatattatattgatctaaaaaagaa 202622  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 43767 - 43865
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  43767 gctcgtagcacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatatatcaaaaagagcaccatca 43865  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 43890 - 43980
Alignment:
Q  162 tatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat-tagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43890 tatccaaaaggaac-ttgttagtgctatactatatcgatccgaaaaagaatcactatatccaaaaaaagaacacatcaatact-aagagttaa 43980  T

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Target: scaffold0285 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13808 - 13607
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcac 151  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||  || |     
T  13808 gctcatagcacataaacattaatataaataattatgacgattaagagagtgatgattagtcaatgacatacacaatatatatcaaaaagagcacaattag 13709  T
Q  152 tgttatattatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagtt 251  Q
    ||||||| |||||| |||| | | ||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13708 tgttatactatatctaaaatgtacattgttactgttatactatattgatc-caaaaagaagcactatatccataaaagaacacatcggtactccagagtt 13610  T
Q  252 aag 254  Q
    |||    
T  13609 aag 13607  T

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Target: scaffold0060 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 29806 - 29904
Alignment:
Q  52 gctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatca 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29806 gctcgtagcacattaacataaatataaataatattaacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaatatataccaaaaagagcatcatca 29904  T

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Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 437
Target Start/End: Original strand, 30419 - 30516
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggata 437  Q
    ||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30419 aagtatcggataattatttttttttaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcaggaagtatcgggcaggtatcggtgtaggata 30516  T

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Target: scaffold0250 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6083 - 5907
Alignment:
Q  53 ctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatatatcccaaaaagagcatcatcact 152  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||  |    
T  6083 ctcgtatcatattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaaaata--ccaaaaagagcaccatcggt 5986  T
Q  153 gttatat-----------tatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatat 220  Q
    |||||||           |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  5985 gttatatcaatgctatactatatcaaaaaggaacattgttaatgttatactatatcaatcaaaaaaagaagcactatat 5907  T

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Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5626 - 5542
Alignment:
Q  369 taaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatgttggggatacggta 453  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||||    
T  5626 taaaatttaatatttggatactctcccgatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacgcaggggatacggta 5542  T

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Target: scaffold0112 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Original strand, 41365 - 41458
Alignment:
Q  158 attatatccaaaaggaatattgttggtgttatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
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T  41365 attatatccaaaaggaac-ttgttagtgttatactatatcgatccaaaaaagaagcactatatccaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 41458  T

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Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 123
Target Start/End: Original strand, 41276 - 41331
Alignment:
Q  68 cataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacataca 123  Q
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T  41276 cataaatataaataatattaacgattaagagagtggtcattagtcaattacataca 41331  T

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Target: scaffold0640 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 475
Target Start/End: Original strand, 8067 - 8203
Alignment:
Q  340 aagtatcagataattattttttnnnnnnntaaaatttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggcagatatcagtgtaggatatg 439  Q
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T  8067 aagtatcagataattattttttttaaaaataaaatttaatatttggatactctccggatacgtatcgggaagtatcgggcaggtatcggtgcaggatacg 8166  T
Q  440 ttggggatacggta-atcatctattttgaagtttcgg 475  Q
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T  8167 caggggatacggtacatcatccattttgaagtatcgg 8203  T

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Target: scaffold0037 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 253
Target Start/End: Original strand, 27095 - 27160
Alignment:
Q  187 tatactatatcgatctaaaaaagaaacactatattagaaaaagaacacatcagtactcaagagttaa 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27095 tatactatatcgatccaaaaaagaagcaccatatccaaaaaagaacacatcagtact-aagagttaa 27160  T

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Target: scaffold0240 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10710 - 10663
Alignment:
Q  373 atttaatcttcggacactcttctgatacatatcgagaagtatcgggca 420  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10710 atttaatcttctgatactctcctgatacgtatcgagaagtatcgggca 10663  T

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