View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3002_low_79 (Length: 320)

Name: NF3002_low_79
Description: NF3002
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3002_low_79
NF3002_low_79
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (12-300)||(26703626-26703917)
chr4 (12-302)||(13978825-13979119)
chr4 (12-300)||(15850865-15851156)
chr4 (12-289)||(56089460-56089741)
chr4 (11-219)||(19928594-19928802)
chr4 (83-289)||(11702733-11702943)
chr4 (83-289)||(10385713-10385913)
chr4 (125-276)||(10247625-10247780)
chr4 (83-286)||(14701669-14701875)
chr4 (84-251)||(33400514-33400687)
chr4 (83-287)||(3734077-3734284)
chr4 (83-287)||(49636671-49636878)
chr4 (83-287)||(49639964-49640171)
chr4 (83-289)||(3719642-3719851)
chr4 (83-251)||(18859540-18859709)
chr4 (85-234)||(23653045-23653197)
chr4 (85-234)||(11560578-11560727)
chr4 (85-211)||(17670181-17670308)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (12-300)||(18392085-18392376)
chr1 (8-296)||(34552823-34553114)
chr1 (42-300)||(23441419-23441681)
chr1 (12-300)||(33898017-33898309)
chr1 (12-296)||(6195510-6195797)
chr1 (42-296)||(3087864-3088128)
chr1 (83-289)||(28918136-28918347)
chr1 (83-289)||(20964220-20964429)
chr1 (83-287)||(16839081-16839288)
chr1 (83-287)||(16849011-16849218)
chr1 (83-289)||(37641629-37641840)
chr1 (83-289)||(24200390-24200598)
chr1 (83-289)||(49719617-49719827)
chr1 (83-289)||(20981123-20981332)
chr1 (83-247)||(17902979-17903142)
chr1 (83-243)||(49716134-49716293)
chr1 (169-300)||(50197094-50197230)
chr1 (12-128)||(50197227-50197342)
chr1 (167-208)||(13495711-13495752)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (12-300)||(28327135-28327427)
chr3 (12-300)||(28330460-28330752)
chr3 (12-300)||(27054563-27054854)
chr3 (12-300)||(3305541-3305833)
chr3 (12-289)||(4250077-4250358)
chr3 (83-289)||(18882976-18883186)
chr3 (83-289)||(42354557-42354767)
chr3 (12-289)||(19868674-19868955)
chr3 (85-289)||(44508573-44508781)
chr3 (83-289)||(9157751-9157961)
chr3 (84-289)||(9154579-9154788)
chr3 (83-289)||(29233732-29233941)
chr3 (83-251)||(10963170-10963338)
chr3 (83-251)||(10966679-10966847)
chr3 (83-287)||(5887130-5887337)
chr3 (83-287)||(5897114-5897321)
chr3 (83-234)||(20536782-20536932)
chr3 (86-251)||(10959666-10959831)
chr3 (83-300)||(18551431-18551652)
chr3 (87-289)||(23374874-23375079)
chr3 (83-288)||(6173498-6173706)
chr3 (83-289)||(2783883-2784094)
chr3 (87-289)||(2279764-2279969)
chr3 (165-287)||(4225999-4226125)
chr3 (83-289)||(16314734-16314942)
chr3 (83-289)||(18495728-18495936)
chr3 (159-289)||(54736276-54736410)
chr3 (129-251)||(30158219-30158341)
chr3 (83-289)||(16414900-16415108)
chr3 (83-289)||(18515874-18516082)
chr3 (60-143)||(26822544-26822625)
chr3 (186-251)||(25888656-25888727)
chr3 (42-156)||(11270782-11270894)
chr3 (169-225)||(11139032-11139088)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (12-300)||(40677907-40678199)
chr2 (12-300)||(38316182-38316473)
chr2 (83-289)||(1503579-1503789)
chr2 (83-289)||(1506783-1506993)
chr2 (84-289)||(38326417-38326626)
chr2 (88-251)||(4577620-4577782)
chr2 (87-289)||(30719543-30719747)
chr2 (83-289)||(29435514-29435723)
chr2 (84-225)||(38326133-38326274)
chr2 (83-287)||(18938658-18938865)
chr2 (129-289)||(18011759-18011923)
chr2 (83-289)||(13518066-13518277)
chr2 (83-289)||(22592278-22592486)
chr2 (83-289)||(11059561-11059772)
chr2 (83-289)||(15704116-15704325)
chr2 (83-193)||(15719470-15719579)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (15-302)||(28894614-28894904)
chr6 (12-296)||(35027272-35027560)
chr6 (42-289)||(12746527-12746778)
chr6 (42-300)||(33679324-33679585)
chr6 (83-289)||(34502105-34502315)
chr6 (83-288)||(9313932-9314141)
chr6 (84-277)||(31262534-31262731)
chr6 (83-289)||(2330392-2330602)
chr6 (83-289)||(28117602-28117812)
chr6 (91-251)||(5618497-5618656)
chr6 (56-289)||(17696324-17696562)
chr6 (83-289)||(22920292-22920501)
chr6 (88-289)||(2331049-2331254)
chr6 (83-289)||(13095844-13096053)
chr6 (83-289)||(14969431-14969640)
chr6 (150-300)||(15579050-15579204)
chr6 (83-251)||(11410528-11410695)
chr6 (82-234)||(31123191-31123343)
chr6 (83-289)||(17231619-17231828)
chr6 (83-234)||(7560380-7560531)
chr6 (12-112)||(15579209-15579308)
chr6 (196-251)||(5618402-5618457)
chr6 (204-300)||(11296273-11296373)
chr6 (16-106)||(11296380-11296469)
chr6 (168-224)||(3827018-3827074)
chr6 (81-243)||(16731133-16731295)
chr6 (83-166)||(3827089-3827173)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (12-300)||(44017927-44018219)
chr7 (12-300)||(6963979-6964270)
chr7 (12-300)||(12803400-12803690)
chr7 (12-296)||(38431085-38431372)
chr7 (12-300)||(43548885-43549176)
chr7 (12-300)||(26152843-26153134)
chr7 (12-289)||(3541314-3541593)
chr7 (81-289)||(22083589-22083800)
chr7 (83-289)||(26182065-26182274)
chr7 (83-286)||(22257019-22257227)
chr7 (81-251)||(22232815-22232986)
chr7 (81-251)||(22253753-22253924)
chr7 (83-287)||(26460229-26460436)
chr7 (83-286)||(710166-710372)
chr7 (83-251)||(20100406-20100574)
chr7 (84-289)||(748187-748397)
chr7 (83-289)||(8397606-8397817)
chr7 (83-289)||(23598909-23599117)
chr7 (86-289)||(2251638-2251843)
chr7 (83-251)||(5826896-5827064)
chr7 (85-289)||(11825501-11825710)
chr7 (134-221)||(23467349-23467437)
chr7 (129-216)||(2349281-2349368)
chr7 (55-155)||(26809014-26809114)
chr7 (43-156)||(28578198-28578309)
chr7 (81-153)||(6214541-6214613)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (12-300)||(13331781-13332072)
chr8 (12-296)||(9466820-9467107)
chr8 (42-302)||(39660090-39660354)
chr8 (12-289)||(5827718-5827999)
chr8 (83-289)||(30645236-30645446)
chr8 (88-289)||(31981116-31981321)
chr8 (112-289)||(31984781-31984962)
chr8 (83-251)||(27863742-27863911)
chr8 (83-289)||(20262319-20262528)
chr8 (83-289)||(21048949-21049158)
chr8 (83-251)||(5964018-5964187)
chr8 (83-284)||(24903635-24903839)
chr8 (83-286)||(14187763-14187971)
chr8 (83-286)||(22654024-22654232)
chr8 (83-289)||(24434795-24435004)
chr8 (83-289)||(17013178-17013387)
chr8 (83-289)||(17543814-17544023)
chr8 (83-289)||(24444841-24445050)
chr8 (83-193)||(18696171-18696281)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (12-300)||(2500143-2500434)
chr5 (12-300)||(33321059-33321350)
chr5 (12-289)||(33920833-33921114)
chr5 (42-289)||(26337704-26337955)
chr5 (83-289)||(17944413-17944623)
chr5 (44-251)||(9690486-9690693)
chr5 (83-289)||(34652901-34653111)
chr5 (83-289)||(19685930-19686142)
chr5 (83-289)||(19689313-19689525)
chr5 (82-287)||(1810556-1810766)
chr5 (85-289)||(25185150-25185359)
chr5 (83-273)||(4731993-4732188)
chr5 (83-289)||(26547855-26548066)
chr5 (83-289)||(26551414-26551625)
chr5 (112-229)||(3194950-3195067)
chr5 (83-289)||(26726710-26726918)
chr5 (83-289)||(28562505-28562716)
chr5 (83-289)||(28566073-28566284)
chr5 (129-251)||(40800104-40800226)
chr5 (55-153)||(35432762-35432859)
chr5 (83-174)||(2453099-2453186)
[»] scaffold0911 (1 HSPs)
scaffold0911 (12-251)||(4256-4493)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (42-289)||(3980-4231)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (42-289)||(52840-53091)
scaffold0083 (12-289)||(29013-29294)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (12-289)||(13283-13564)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (83-289)||(7000-7210)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (85-289)||(19822-20028)
scaffold0214 (83-289)||(13369-13579)
scaffold0214 (83-289)||(27385-27595)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (112-289)||(227139-227320)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (12-153)||(19971-20112)
scaffold0273 (228-300)||(19891-19967)
[»] scaffold0637 (2 HSPs)
scaffold0637 (152-250)||(2022-2120)
scaffold0637 (12-89)||(1951-2027)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (83-289)||(27025-27234)
scaffold0012 (83-156)||(31348-31420)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (83-287)||(28808-29015)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (83-289)||(27125-27334)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (112-289)||(1194-1374)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (83-287)||(6053-6256)
scaffold0360 (170-251)||(2298-2379)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
scaffold0062 (83-289)||(53028-53237)
scaffold0062 (83-193)||(68027-68136)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26703917 - 26703626
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26703917 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgatggtgtaatttgttaagaactctctttaacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttaa 26703819  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26703818 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcatataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 26703719  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26703718 cctgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagagataagaaattgagagttatgacttatggattaacgttctcaccatgcttc 26703626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 302
Target Start/End: Original strand, 13978825 - 13979119
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13978825 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctta 13978923  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13978924 atgcttttcttctgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgaccactaaccctagcttttaa 13979023  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttctg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13979024 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttctg 13979119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 15850865 - 15851156
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15850865 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaacatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcaaaattatttgtgcttaa 15850963  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15850964 tgcttttcttatgattgtttgtatgactaataaccctaacttctttcaatcacataaatttatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 15851063  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15851064 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagtgataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 15851156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 56089741 - 56089460
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtga-tggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  56089741 atgaaatgaatcttt-gtgatctgtgaatcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttca 56089643  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56089642 ttgcttttcgtatgattgtttgcatgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgaccactaaccctagcttttaa 56089543  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  56089542 tcttgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 56089460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 19928594 - 19928802
Alignment:
Q  11 aatgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatt 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19928594 aatgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctt 19928692  T
Q  110 aatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagctttta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19928693 aatgcttttcttctgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagctttta 19928792  T
Q  210 atcctgaaat 219  Q
    ||| ||||||    
T  19928793 atcatgaaat 19928802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11702943 - 11702733
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11702943 agtctttattcagaataatttgtgttcattgcttttcatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 11702844  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  11702843 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatga 11702744  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||| ||||    
T  11702743 attaacattct 11702733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 10385713 - 10385913
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10385713 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgcttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 10385812  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||    |||||||||||    ||||||||||||     
T  10385813 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgatatagta------tttaattcaacataggaacctagagataggaaattg----ttatgacatatga 10385902  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  10385903 attaacgttct 10385913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 276
Target Start/End: Original strand, 10247625 - 10247780
Alignment:
Q  125 attgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaa 224  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10247625 attgtttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctaacttttaatcctgaaataataa 10247724  T
Q  225 ttctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||    
T  10247725 ttctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacatat 10247780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 286
Target Start/End: Original strand, 14701669 - 14701875
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  | | | || ||||||| |||||||    
T  14701669 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgatattaggaa 14701767  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  14701768 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 14701867  T
Q  279 attaacgt 286  Q
    ||||||||    
T  14701868 attaacgt 14701875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33400687 - 33400514
Alignment:
Q  84 gtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 183  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  33400687 gtctttattcagaattatttatgttaattgcttttcatatgattgtttgcttgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttagtaat 33400588  T
Q  184 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaa------ttctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||    
T  33400587 tgaatgactactaaccctaacttttaattctgaaatagtaattttgtttttgtttaattcaacataggaaccta 33400514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Original strand, 3734077 - 3734284
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | | || |||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  3734077 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcggataactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 3734175  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  3734176 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 3734275  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  3734276 attaacgtt 3734284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49636878 - 49636671
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | |||| |||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  49636878 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcgtataactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 49636780  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  49636779 ttgaatgactcttaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 49636680  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  49636679 attaacgtt 49636671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49640171 - 49639964
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  49640171 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcggatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 49640073  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  49640072 ttgaatgactcttaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 49639973  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  49639972 attaacgtt 49639964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3719851 - 3719642
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  | | | || ||||||| |||||||    
T  3719851 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgattt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgatattaggaa 3719753  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  3719752 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 3719653  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  3719652 attaacgttct 3719642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 18859540 - 18859709
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  18859540 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcaaataattgatttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 18859639  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18859640 attgaatgactattaacactagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 18859709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Original strand, 23653045 - 23653197
Alignment:
Q  85 tctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaatt 184  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||  | ||||||||| ||| |||    
T  23653045 tctttattcagaattatttgtgttcattgcttttattatgattgtttgcatgactattaaacctaacttctttcaatcatgttaattgatctcaggtatt 23653144  T
Q  185 g---aatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaa 234  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23653145 attaattgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaa 23653197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Original strand, 11560578 - 11560727
Alignment:
Q  85 tctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaatt 184  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| | |||  | |||||| |||||| |||    
T  11560578 tctttattcaaaattatttgtgttcattgcttttattatgattgtttgcatgactattaaccctaacttcttttagtcatgttaattgaccttaggtatt 11560677  T
Q  185 gaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaa 234  Q
     | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11560678 aattgactagtaaccctatcttttaatcctaaaatagtaattatgtttaa 11560727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Original strand, 17670181 - 17670308
Alignment:
Q  85 tctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgttt-gtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 183  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | | |||||||   || ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  17670181 tctttattcaaaattacttgtgttcattgctttttaaataattgttttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaat 17670280  T
Q  184 tgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17670281 tgaatgactattaaccctaccttttaat 17670308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 18392085 - 18392376
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18392085 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttaa 18392183  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18392184 tggttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagaaattgaatgactactaaccctaacttttaat 18392283  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18392284 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 18392376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34553114 - 34552823
Alignment:
Q  8 agcaatgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtga 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  34553114 agcaatgagatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgc 34553016  T
Q  108 ttaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttt 207  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34553015 ttaatgttttttttatgattgtttgtatgactactaaccctagtttctttcaatcacataaattgatcttagtaattgaatgactattaaccctatcttt 34552916  T
Q  208 taatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34552915 taatcctgaaatagtaattctgttttattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatg 34552823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23441681 - 23441419
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 141  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23441681 tgtaatttgttaagaactctttttgacttcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 23441582  T
Q  142 taactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23441581 taaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctaggaattgaatgactactaaccctagctttttatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca 23441482  T
Q  242 taggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23441481 taggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 23441419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 33898017 - 33898309
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33898017 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctta 33898115  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33898116 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 33898215  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  33898216 tcttgaattagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagatagaaaattgagagttatgaattatgaattaacgtactcaccatgcttc 33898309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 6195510 - 6195797
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6195510 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttgttacgaacgctctttgacatcgatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttaa 6195608  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  6195609 cgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctggcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactaccaaccataacttttaat 6195708  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatg 296  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6195709 cttgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagagataggaaaatgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatg 6195797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3088128 - 3087864
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgt------ttgtat 135  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  3088128 tgtaatttgttaagaactctatttgacatcaataaaaacccagtctttattcataattatctgtgcttaatgcttttcttatgattgtgattgtttgtat 3088029  T
Q  136 gactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaat 235  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3088028 gactaataaccctaacttctttcaaccatataaattgatcttaggaattgaataactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaat 3087929  T
Q  236 tcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatg 296  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  3087928 tcaacataggaacctagagataggaaattgagagttatgacttatggattaacgttgtcatcatg 3087864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 28918136 - 28918347
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgt-ttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| || |  ||| | |||||||||| ||||||    
T  28918136 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcatataattgtgttgtatgactattaaccctagcatcatgaaattaaataaattgatattagga 28918235  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  28918236 attgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 28918335  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  28918336 aattaacgttct 28918347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 20964220 - 20964429
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  || | |||| ||||||||||| ||||  |||||||||  ||| ||||  |||||| |||||||    
T  20964220 agtctttattcagaattatttgtgttcattgctttcatt-taattgcttgtatgactattaaccatagcttcttgaaattacatgtattgatattaggaa 20964318  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacc----tataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||  | ||||||||||     
T  20964319 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaattagtaattttgtttgattcaacataggaacctagatataggaaattgagaatcatgacatatga 20964418  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  20964419 attaacgttct 20964429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16839288 - 16839081
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  16839288 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcggatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 16839190  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  16839189 ttgaatgactcttaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 16839090  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  16839089 attaacgtt 16839081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16849218 - 16849011
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  16849218 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcggatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 16849120  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  16849119 ttgaatgactcttaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 16849020  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  16849019 attaacgtt 16849011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 37641629 - 37641840
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  37641629 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 37641728  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  37641729 attgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 37641828  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  37641829 aattaacgttct 37641840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24200598 - 24200390
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  24200598 agtctttattcaaaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 24200501  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  24200500 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 24200401  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  24200400 attaacgttct 24200390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 49719617 - 49719827
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  49719617 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 49719715  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctg-aaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||    
T  49719716 ttgattgactactaaccctagcttttaatcttgaaaaaagtaatactgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatg 49719815  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||| ||||    
T  49719816 aattaacattct 49719827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 20981123 - 20981332
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||  || | ||||  |||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||| ||| |||    
T  20981123 agtctatattcagaattatttgtgttcattgctttcatt-taattgcatgtatgactattaaccctaacttcttgaaattacatgaattgatattaagaa 20981221  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  20981222 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaattaataattttgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 20981321  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  20981322 attaacgttct 20981332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17903142 - 17902979
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  17903142 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttt-catataatttcttgtatgactattaaccctagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 17903044  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaa 247  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17903043 ttgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaa 17902979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 49716134 - 49716293
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  49716134 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 49716232  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacata 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  49716233 ttgattgactactaaccctagcttttaatcttgaaatagtaatactgtttgattcaacata 49716293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50197230 - 50197094
Alignment:
Q  169 attgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct--------ataggaaatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||    
T  50197230 attgatcttaggaattgaatgactactaactctagcttttaatcttgaaatagttattctgtttaattcaacataggaacctagagatagatagaaaatt 50197131  T
Q  261 gagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50197130 gag---tatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 50197094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 50197342 - 50197227
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  50197342 atgagatgaatcttt-gtgatcagtgagcatgtaatttgttaagaactccctttgacatcaatgaaaacctagtctttatacagaattatttgtgctcaa 50197244  T
Q  112 tgcttttcttatgattg 128  Q
    |||||||||||||||||    
T  50197243 tgcttttcttatgattg 50197227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 208
Target Start/End: Original strand, 13495711 - 13495752
Alignment:
Q  167 aaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagctttt 208  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13495711 aaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctagctttt 13495752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 28327135 - 28327427
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28327135 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctta 28327233  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327234 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 28327333  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28327334 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 28327427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 28330460 - 28330752
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28330460 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctta 28330558  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330559 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 28330658  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28330659 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 28330752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 27054563 - 27054854
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27054563 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttattaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtcattattcagaattatttgtgcttaa 27054661  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27054662 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattaaatgactactaaccctagcttttaat 27054761  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27054762 cctgaaatagtaattctgtttaattcaatataggaacctagagataggaaattgatgattatgacttatgaattaacgttttcaccatgcttc 27054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 3305541 - 3305833
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3305541 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctta 3305639  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3305640 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgataatagaaattgaatgactactaaccctaacttttaa 3305739  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3305740 taatgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttcttaccatgcttc 3305833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 4250077 - 4250358
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  4250077 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagtactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttca 4250175  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250176 ttgcttttcgtatgattgtttgcatgactattaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 4250275  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  4250276 tcttgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 4250358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 18882976 - 18883186
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18882976 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttacaatcacataaattgatcttaggga 18883075  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  18883076 ttaaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacatatga 18883175  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  18883176 attaacgttct 18883186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42354767 - 42354557
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42354767 agtctttattcagaatcatttgtgttcattgcttttcatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 42354668  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  42354667 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatga 42354568  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||| ||||    
T  42354567 attaacattct 42354557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 19868674 - 19868955
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19868674 atgagatgaatctattgtgatctatgaaccatgtaatttgtttaaa-ctctccttaat-tcaatggaatcctagtctttattcagaattatttgtgtttg 19868771  T
Q  111 atgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagctttta 209  Q
     |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19868772 ttgcttttcatatgattgctttgcatgactattaaccctagcttcttccaattacataaattgatcttaggaattgaatgactattaaccctagctttta 19868871  T
Q  210 atcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  19868872 atcctgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacatatgaattaacgttct 19868955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 44508573 - 44508781
Alignment:
Q  85 tctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaatt 184  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44508573 tctttattcagaattatttgtgttcattgtttttcatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaagaatt 44508672  T
Q  185 gaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggat 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  44508673 gaatgactactaacccgagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacacaggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatgaat 44508772  T
Q  281 taacgttct 289  Q
    |||||||||    
T  44508773 taacgttct 44508781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 9157751 - 9157961
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9157751 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgtttgcatgactagtaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 9157850  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||| ||||||||  ||||||||||||     
T  9157851 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattctatttaattcaacataggaacctagagatagaaaattgagggttatgacatatga 9157950  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||| ||||    
T  9157951 attaacattct 9157961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 84 - 289
Target Start/End: Original strand, 9154579 - 9154788
Alignment:
Q  84 gtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9154579 gtctttattcagaattatttgtattcattgcttttcatatgattgtttgcatgactagtaatcctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaat 9154678  T
Q  184 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  9154679 tgaatgactactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattatatttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatgaa 9154778  T
Q  280 ttaacgttct 289  Q
    ||||| ||||    
T  9154779 ttaacattct 9154788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29233941 - 29233732
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  29233941 agtctttattcagaattatttgtgttcattgtttttcatataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 29233843  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  29233842 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 29233743  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  29233742 attaacgttct 29233732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 10963170 - 10963338
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||    
T  10963170 agtctttattcagaattacgtgtgttcattgcttttcatataattgtttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaa 10963269  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10963270 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 10963338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 10966679 - 10966847
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||    
T  10966679 agtctttattcagaattacgtgtgttcattgcttttcatataattgtttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaa 10966778  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10966779 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 10966847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5887337 - 5887130
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  5887337 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcggatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 5887239  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  5887238 ttgaatgactcttaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 5887139  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  5887138 attaacgtt 5887130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5897321 - 5897114
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  5897321 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcggatgactattaaccctagcttctta-aattatatgaattgatattaggaa 5897223  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  5897222 ttgaatgactcttaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 5897123  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  5897122 attaacgtt 5897114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20536932 - 20536782
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20536932 agtctttattcaaaattatttgtgttcattgcttttcttatgattgtttgtatgactattaaccctaacttctt-caatcatattaattgatcttaggaa 20536834  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaa 234  Q
    || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536833 ttaattgactattaaccctatcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaa 20536782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Original strand, 10959666 - 10959831
Alignment:
Q  86 ctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattg 185  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||| |||| |||||||||||  ||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  10959666 ctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcatataattgcttgtatgactatcaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaattg 10959765  T
Q  186 aatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10959766 aatgactattaaccctagcttttaattctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 10959831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 300
Target Start/End: Original strand, 18551431 - 18551652
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||   || ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||     
T  18551431 agtctttattcagaattatacatgcttattgattttcttatgattgtttgtatggctactaaccctagcttctttcaattgtattaattgatcttaggag 18551530  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||    ||||||| ||| |  ||||||| |||||    
T  18551531 ttaattgactactaaccctagctattaaacctgaaatagtgattctgtttgactttacatatgaaactagagataggaagttgcgagttatgacttatgg 18551630  T
Q  279 attaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18551631 attaacgttctcaccatgcttc 18551652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23375079 - 23374874
Alignment:
Q  87 tttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattga 186  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||||||    
T  23375079 tttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattga 23374981  T
Q  187 atgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggatta 282  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||| |||||  | |||||||||| ||||    
T  23374980 atgacttttaaccctatcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaatttgagaatcatgacatatgaatta 23374881  T
Q  283 acgttct 289  Q
    |||||||    
T  23374880 acgttct 23374874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6173706 - 6173498
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | | ||||||  || | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  6173706 agtctttattcagaatcacttgtgttcattgctttcatt-taattgtttgtatgactattaaccctagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 6173608  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  6173607 ttgaatgaccactaaccctagattttaatcctgaattagtaatcatgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 6173508  T
Q  279 attaacgttc 288  Q
    ||||||||||    
T  6173507 attaacgttc 6173498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 2783883 - 2784094
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  2783883 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaactacatgaattgatattagga 2783982  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  2783983 attgaatgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 2784082  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  2784083 aattaacgttct 2784094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2279969 - 2279764
Alignment:
Q  87 tttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattga 186  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||  || | ||||  |||||||||| ||||  |||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  2279969 tttattcagaattatttgtgttcattgctttcatt-taattgcctgtatgactattaaccttagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaattga 2279871  T
Q  187 atgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggatta 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||| ||||| ||||    
T  2279870 atgactactaaccctaacttttaatcctgaattagtaattttgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgatatatgaatta 2279771  T
Q  283 acgttct 289  Q
    |||||||    
T  2279770 acgttct 2279764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4226125 - 4225999
Alignment:
Q  165 ataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaatt 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  4226125 ataaattgatcttagaaattgaatgattgctaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaacctagagataggaaatt 4226026  T
Q  261 gagttttatgacatatggattaacgtt 287  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||    
T  4226025 gagggttatgacatatgaattaacgtt 4225999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16314942 - 16314734
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | || || ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  16314942 agtctttattcagaatcacttatgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 16314845  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  16314844 ttgaatgactattaaccctagattttaatcctgaattagtaattctgttcgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 16314745  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  16314744 attaacgttct 16314734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18495936 - 18495728
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | || || ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  18495936 agtctttattcagaatcacttatgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 18495839  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  18495838 ttgaatgactattaaccctagattttaatcctgaattagtaattctgttcgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 18495739  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  18495738 attaacgttct 18495728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 54736410 - 54736276
Alignment:
Q  159 aatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----atag 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  54736410 aatcacataaattgatcttaagaattgaatcgctactaatcctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaatataggaacctagagatag 54736311  T
Q  255 gaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  54736310 gaaattaaggattatgacatatgaattaacgttct 54736276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30158341 - 30158219
Alignment:
Q  129 tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattct 228  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30158341 tttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattatgaattgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcct 30158242  T
Q  229 gtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  30158241 gtttgattcaacataggaaccta 30158219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16415108 - 16414900
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| ||| |||    
T  16415108 agtctttattcagaatcgcttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattatgaa 16415011  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  16415010 ttaaatgactattaaccctagcttttaatcttgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 16414911  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  16414910 attaacgttct 16414900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18516082 - 18515874
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| ||| |||    
T  18516082 agtctttattcagaatcgcttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattatgaa 18515985  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  18515984 ttaaatgactattaaccctagcttttaatcttgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 18515885  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  18515884 attaacgttct 18515874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26822625 - 26822544
Alignment:
Q  60 ctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactacta 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  26822625 ctctttgacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattgtttgtgtttaatgtttttcttataat--tttgtatgactacta 26822544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25888727 - 25888656
Alignment:
Q  186 aatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatag------taattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||      |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25888727 aatgactattaaccctaccttttaatcctgaaatagaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 25888656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 156
Target Start/End: Original strand, 11270782 - 11270894
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 141  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || ||||  ||| |||||||    
T  11270782 tgtaatttattaagtactttctttgatatcaatgaaaacctattctttattcataattggttgtgtttaatgcttttcaaataattg--tgtttgactac 11270879  T
Q  142 taactctagcttctt 156  Q
    |||| ||| ||||||    
T  11270880 taaccctaacttctt 11270894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11139088 - 11139032
Alignment:
Q  169 attgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaat 225  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  11139088 attgatcatagaaattgaatggccactaaccctggcttttaactctgaaatagtaat 11139032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40678199 - 40677907
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40678199 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctta 40678101  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40678100 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 40678001  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  40678000 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 40677907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38316473 - 38316182
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38316473 atgagatgaatcttt-gtgatatgtgagcatgtaaattgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttaa 38316375  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38316374 tgtttttcttatgattgtttgtatgactactaaccgtagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 38316275  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38316274 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacttagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 38316182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1503789 - 1503579
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1503789 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgcttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 1503690  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||  ||||||||||||     
T  1503689 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagatagaaaattgagggttatgacatatga 1503590  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||| ||||    
T  1503589 attaacattct 1503579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1506993 - 1506783
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1506993 agtctttattcagaattatttgtgttcattgtttttcatatgattgcttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 1506894  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  1506893 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatga 1506794  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||| ||||    
T  1506793 attaacattct 1506783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 38326626 - 38326417
Alignment:
Q  84 gtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | |||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38326626 gtctttattcagaattatttgtgttcattacttttgatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaat 38326527  T
Q  184 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgga 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  38326526 tgaatgactaccaaccctagcttttaatcctgaaataataattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatgaa 38326427  T
Q  280 ttaacgttct 289  Q
    || |||||||    
T  38326426 ttcacgttct 38326417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Original strand, 4577620 - 4577782
Alignment:
Q  88 ttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaa 187  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4577620 ttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgtttgcatgactattaaccctatcttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaa 4577719  T
Q  188 tgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4577720 tgactactaa-cctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 4577782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 289
Target Start/End: Original strand, 30719543 - 30719747
Alignment:
Q  87 tttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattga 186  Q
    |||||||||||||||||  | | | |||||||  |||||||  ||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719543 tttattcagaattatttaagttcattgctttttatatgatt--ttgcatgactattaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattga 30719640  T
Q  187 atgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggatta 282  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  30719641 atgactactaactctaacttttaatcctaaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatgaatta 30719740  T
Q  283 acgttct 289  Q
    |||||||    
T  30719741 acgttct 30719747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 29435514 - 29435723
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  29435514 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 29435612  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  29435613 ttgattgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgtttcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 29435712  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||| ||||    
T  29435713 attaacattct 29435723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 38326133 - 38326274
Alignment:
Q  84 gtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | |||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38326133 gtctttattcagaattatttgtgttcattacttttgatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaat 38326232  T
Q  184 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38326233 tgaatgactaccaaccctagcttttaatcctgaaataataat 38326274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Original strand, 18938658 - 18938865
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  18938658 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcggatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 18938756  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  18938757 ttgaatgactcttaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 18938856  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  18938857 attaacgtt 18938865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 289
Target Start/End: Original strand, 18011759 - 18011923
Alignment:
Q  129 tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattct 228  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18011759 tttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaatagtaatcct 18011858  T
Q  229 gtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    |||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  18011859 gtttgattcaacataggaacctagagatagaaaattgaggattatgacacatgaattaacgttct 18011923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 13518066 - 13518277
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |  |||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  13518066 agtctttattcaaaattacttgtgttcatagcttttcaaataattgatttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 13518165  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  13518166 attgaatgactattaaccctagcttttaatcatgaaatagtaatcctgtttgattcaacataagaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 13518265  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  13518266 aattaacgttct 13518277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 22592278 - 22592486
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  | | | || ||||||  |||||||    
T  22592278 agtctttattcagaatcacatgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgagattaggaa 22592376  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctatag---gaaattgagttttatgacatatgga 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||   | |||||||  | |||||||||| |    
T  22592377 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcatgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacttagagataggaattgagaatcatgacatatgaa 22592476  T
Q  280 ttaacgttct 289  Q
    ||||||||||    
T  22592477 ttaacgttct 22592486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 11059561 - 11059772
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | | || |||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  11059561 agtctttattcagagttacttgtgttcattgtttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 11059660  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  11059661 attgaatgactattaacactaacttttaatcatgaaatagtaatcctgtttgattcaacataagaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 11059760  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  11059761 aattaacgttct 11059772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15704325 - 15704116
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | || |||| | || |||| ||||||||||| |||| ||| |||| |  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  15704325 agtctttatttagaattatttgtgttcattgtttttat-ataattgcttgtatgactattaaccctaacttcctgaaattacatgaattgatattaggaa 15704227  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| || |||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  15704226 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcttgaaatagtaatagtgtttgattcaatatgggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 15704127  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    ||||| |||||    
T  15704126 attaatgttct 15704116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15719579 - 15719470
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | || |||| | || |||| || |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||     
T  15719579 agtctttattcagaattacttgtgttcattgtttttat-ataattgcttatatgactattaaccctaacttcttgaaatcacatgaattgatattaggag 15719481  T
Q  183 ttgaatgacta 193  Q
    |||||||||||    
T  15719480 ttgaatgacta 15719470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28894904 - 28894614
Alignment:
Q  15 agatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgc 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28894904 agatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaataaaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttaatgc 28894806  T
Q  115 ttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28894805 ttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctaacttttaatcct 28894706  T
Q  215 gaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttctg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28894705 gaaatagtaattctgtttaattcaacatagaaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttctg 28894614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35027560 - 35027272
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35027560 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctta 35027462  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35027461 atgcttttcttatgattgtttatatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 35027362  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35027361 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgacgattatgacttatgaattaacgttctcaccatg 35027272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 12746527 - 12746778
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||     
T  12746527 tgtaatttgttaataactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcgtatgattgtttgcatgactat 12746626  T
Q  142 taactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12746627 taaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcgtgaaatagtaattctgtttaattcaaca 12746726  T
Q  242 taggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    || ||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  12746727 tatgaacctagagataggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 12746778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33679585 - 33679324
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||     
T  33679585 tgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttatttagaattatttgtgttcattgcttttcgtatgattgtttgcatgactat 33679486  T
Q  142 taactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca 241  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  33679485 taaccctaacttctttcaatcacataaatttatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattatg-ttaattcaacc 33679387  T
Q  242 taggaacc----tataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||    ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33679386 taggaacctagatatagaaaattgaaggttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 33679324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 34502105 - 34502315
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34502105 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttacaatcacataaattgatcttaggaa 34502204  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||  ||||| ||||||     
T  34502205 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcttgaagtagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagatatgaaattgaggattatggcatatga 34502304  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  34502305 attaacgttct 34502315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9314141 - 9313932
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9314141 agtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttattgcaatcacataaattgatcttaggaa 9314042  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  9314041 ttgaatgactactaaccatagctcttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatga 9313942  T
Q  279 attaacgttc 288  Q
    ||||||||||    
T  9313941 attaacgttc 9313932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 277
Target Start/End: Original strand, 31262534 - 31262731
Alignment:
Q  84 gtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31262534 gtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgtttgcatgattattaactctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaat 31262633  T
Q  184 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  31262634 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtagttctgtttaattcaacataggaacctagagatagaaaattgagggttatgacatatg 31262731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 2330392 - 2330602
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2330392 agtctttattcataattatttgtgttcattgtttttcatatgattatttgcatgactattaactctagattctttcaataacataaattgatcttagaaa 2330491  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||      
T  2330492 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctatttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatataa 2330591  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  2330592 attaacgttct 2330602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 28117602 - 28117812
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||  |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28117602 agtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattgttttcatgattattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgattttaggaa 28117701  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  28117702 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatga 28117801  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  28117802 attaacgttct 28117812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5618656 - 5618497
Alignment:
Q  91 ttcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatga 190  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5618656 ttcataattatttgtgtttattgcttttcatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgat-ttaagaattgaatga 5618558  T
Q  191 ctactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5618557 cttctaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 5618497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 289
Target Start/End: Original strand, 17696324 - 17696562
Alignment:
Q  56 aactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttct 155  Q
    |||||||||||  ||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  17696324 aactctctttattatcaatgattattcagtctttatttagaattatttgtgttcatcgcttttcatatgactgtttgtatgactattaaccctaacttct 17696423  T
Q  156 ttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca-taggaacct---- 250  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||        
T  17696424 tgcaatcacataaattgatcttagaaattgaatgactactagccctggctcttaatcctgaaattgtaattctgtttaactcaacactaggaacctagag 17696523  T
Q  251 ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  17696524 ataggaaattgagggttatgacatataaattaacgttct 17696562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 22920292 - 22920501
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  22920292 agtctttattcagagttatttgtgttcattgcttttcatataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 22920390  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  22920391 ttgaatgactattaaccctagctttttatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaattatgacatatga 22920490  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  22920491 attaacgttct 22920501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 289
Target Start/End: Original strand, 2331049 - 2331254
Alignment:
Q  88 ttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaa 187  Q
    ||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2331049 ttattcataattatttgtgttcattgcttttcatatgattgtttgcatgactattgatcctagcttctttcaataacataaattgatcttaggaattgaa 2331148  T
Q  188 tgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaa 283  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  2331149 tgactactaacaccagcttttaatcatgaaatatcaattctgtttaattcaacgtaggaacctagagataagaaattgagggttatgacctatgaattaa 2331248  T
Q  284 cgttct 289  Q
    ||||||    
T  2331249 cgttct 2331254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13096053 - 13095844
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||   |||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  13096053 agtctttattcagaattacttgt-attcattgatttcatataattgcttgtatgactattaaccctaacttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 13095955  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  13095954 ttgaatgactactaaccctaacttttaatcatgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 13095855  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  13095854 attaacgttct 13095844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 14969431 - 14969640
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  14969431 agtctttattcagaattacttgt--tcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 14969528  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  14969529 attgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 14969628  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  14969629 aattaacgttct 14969640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15579204 - 15579050
Alignment:
Q  150 gcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacc 249  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  15579204 gcttttttcaaccatataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctatattttaatcatgaaatagtaaatctatttaattcaacatatgaacc 15579105  T
Q  250 t----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |    ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15579104 tagagataagaaattgagaattatgacttatggattaacgttctcaccatgcttc 15579050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 11410528 - 11410695
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||   | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  11410528 agtctttattcagaattacttgtgtccattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 11410626  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  11410627 ttgattgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggatccta 11410695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 234
Target Start/End: Original strand, 31123191 - 31123343
Alignment:
Q  82 tagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  31123191 tagtctttattcagaattatttgttttcattgcttttattatgattgtttgcatgactattaaccctagcttctttcaatcatgttaattgatcttaggt 31123290  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaa 234  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31123291 attaattgactactttccctagcttttaatcctgaaatagtaattgtgtttaa 31123343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 17231619 - 17231828
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  17231619 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctatcttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 17231717  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||  | ||||||||||     
T  17231718 ttgaatgactattaaccctatcttttaattctgaaattgtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagatagaaaattgagaatcatgacatatga 17231817  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  17231818 attaacgttct 17231828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7560531 - 7560380
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||       
T  7560531 agtctttattcagaattatttatgttcagtgtttttcttatgattgtttgtatgacaattaaccctagcttctttcaatcatattaattgatcttagttg 7560432  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaa 234  Q
    || | ||||| ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7560431 ttaattgactcctaaccctgactattaattctgaaataataattctgattaa 7560380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15579308 - 15579209
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15579308 atgagataaatcttt-gcgatctgtgatggtgtaatttgttaagaactctctttaacatcaatgaaaccctaatctttattcataattatttgtgcttaa 15579210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5618457 - 5618402
Alignment:
Q  196 aaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5618457 aaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 5618402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11296373 - 11296273
Alignment:
Q  204 cttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgctt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||   ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  11296373 cttttaatcatgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagatgggaaattgaagattatgacttatgaattaatgttctcaccatgctt 11296274  T
Q  300 c 300  Q
    |    
T  11296273 c 11296273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11296469 - 11296380
Alignment:
Q  16 gatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtg 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  11296469 gatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctattctttattcaaaattatttgtg 11296380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3827074 - 3827018
Alignment:
Q  168 aattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaa 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3827074 aattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaa 3827018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Original strand, 16731133 - 16731295
Alignment:
Q  81 ttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagg 180  Q
    |||||||||||||| || ||||  || || ||||||||||||  || || |||||||||| |||| ||||||||| |||||  | | ||||||  |||||    
T  16731133 ttagtctttattcataactattcttgcttgatgcttttcttaatatcgtgtgtatgactattaacactagcttctatcaattgcttgaattgaatttagg 16731232  T
Q  181 aattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacata 243  Q
      |  | |||||||||||||||||| || |  | || ||||||||| || |||| ||||||||    
T  16731233 tttcaattgactactaaccctagctattgaatcggacatagtaattatgattaactcaacata 16731295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3827173 - 3827089
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||    
T  3827173 agtctttattcagaattatttgtatttattgttttttatataattgctttgtatgactattaaccctaacttcttgcaattacat 3827089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44018219 - 44017927
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  44018219 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctaatctttattcagaattatttgtgctta 44018121  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44018120 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatgctaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 44018021  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44018020 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 44017927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 6963979 - 6964270
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6963979 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattattggtgcttaa 6964077  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6964078 tgtttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctaccttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctaacttttaat 6964177  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6964178 cctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 6964270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12803690 - 12803400
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12803690 atgagatgaatcttt-gtgatttgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgtaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttaa 12803592  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12803591 tgcttttcttatgattgtttatatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactact-accctagcttttaat 12803493  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  12803492 cctgaaatagtaattttgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttgtgaattaacgttctcaccatgcttc 12803400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 38431085 - 38431372
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38431085 atgagatgaatcttt-gtgatttgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgtaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttac 38431183  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38431184 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttagaaattgaatgactaccaaccctagcttttaat 38431283  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  38431284 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaaggttctcaccatg 38431372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 43548885 - 43549176
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43548885 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttgataagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcaaaattatttgtgcttaa 43548983  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43548984 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgaacttaggaattgattgactactaaccctagcttttaat 43549083  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  43549084 catgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaatctaaagataggaaattgaggattatgacttatgaatcaacgttctcaccatgcttc 43549176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 26152843 - 26153134
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26152843 atgagatgaatcttt-gtgatctgtaagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcataattatttgtgcttaa 26152941  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
     |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26152942 cgctttttttatgattctttttatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 26153041  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  26153042 cttgaaatagtaattctgttttattcaacataggaacttagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcatcatacttc 26153134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3541593 - 3541314
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgt-gatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  3541593 atgagatgaatcttt-gtgatctgttgaccatgtaatttg--aagaactctctttaacatcaatgaaaacctagtcttcattcagaattatttgtgttca 3541497  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3541496 ttgcttttcgtatgattgtttgaatgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattaaatgactactaaccctagcttttaa 3541397  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  3541396 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 3541314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22083800 - 22083589
Alignment:
Q  81 ttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22083800 ttagtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattgtttgcatgactattaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttagg 22083701  T
Q  181 aattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatat 276  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||    
T  22083700 aattgaatgactactaa-tctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatat 22083602  T
Q  277 ggattaacgttct 289  Q
    | |||||||||||    
T  22083601 gaattaacgttct 22083589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 26182065 - 26182274
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| ||| |||    
T  26182065 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaagaa 26182163  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  26182164 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattttgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 26182263  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  26182264 attaacgttct 26182274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 286
Target Start/End: Original strand, 22257019 - 22257227
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  22257019 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 22257118  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||| |||    
T  22257119 attgaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgacacatg 22257218  T
Q  278 gattaacgt 286  Q
     ||||||||    
T  22257219 aattaacgt 22257227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22232986 - 22232815
Alignment:
Q  81 ttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgttt-gtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttag 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||    
T  22232986 ttagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgttttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattag 22232887  T
Q  180 gaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22232886 gaattaaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaattctgtttgattcaacatagaaaccta 22232815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 251
Target Start/End: Original strand, 22253753 - 22253924
Alignment:
Q  81 ttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgttt-gtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttag 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||    
T  22253753 ttagtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgttttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattag 22253852  T
Q  180 gaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22253853 gaattaaatgactattaaccctagctttcaatcctgaaatagtaattctgtttgattcaacatagaaaccta 22253924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Original strand, 26460229 - 26460436
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  26460229 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattgctcggatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 26460327  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  26460328 ttgaatgactcttaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 26460427  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  26460428 attaacgtt 26460436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 710372 - 710166
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  | | | || ||||||| |||||||    
T  710372 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgatattaggaa 710274  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  710273 ttgaatgactactaaccctagattttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 710174  T
Q  279 attaacgt 286  Q
    ||||||||    
T  710173 attaacgt 710166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 20100406 - 20100574
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| | || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |    
T  20100406 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttat-ataattgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagaa 20100504  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20100505 attgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 20100574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 748397 - 748187
Alignment:
Q  84 gtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | || ||||  ||||| || |||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||    
T  748397 gtctttattcagaattacttgtgttcattgttttttatatgactgctttgtatgacttttaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattaggaa 748298  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||    |||||||||||||  |||||| | |||     
T  748297 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacatagatacctagagataggaaattgaggattatgatacatga 748198  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  748197 attaacgttct 748187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 8397606 - 8397817
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgttt-gtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||  || ||||||| |||||| || |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  8397606 agtctttattcagaattacttgtgttcattgtttttcagataattgttttgtatgattattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 8397705  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  8397706 attgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcatgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 8397805  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  8397806 aattaacgttct 8397817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23599117 - 23598909
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| ||| || | ||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  23599117 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcctt-catataattgcttgtatgactattaaccatagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 23599020  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||| |||||  | ||||||||||     
T  23599019 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaatttgagaatcatgacatatga 23598920  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  23598919 attaacgttct 23598909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 289
Target Start/End: Original strand, 2251638 - 2251843
Alignment:
Q  86 ctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattg 185  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| ||||||||||    
T  2251638 ctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttttatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaattg 2251735  T
Q  186 aatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggatt 281  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||||||| |||    
T  2251736 aatgactattaaccctagtttttaatcctgaattactaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatgaatt 2251835  T
Q  282 aacgttct 289  Q
    ||||||||    
T  2251836 aacgttct 2251843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5827064 - 5826896
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||  || |||| |||||||||||| ||||  ||||||| | |||| |||| ||||||| ||| ||    
T  5827064 agtctttattcagaattacttgtgttcattg-ttttcaaataattgctttgtatgactattaaccatagcttcgtgcaattacatgaattgatattatga 5826966  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5826965 attgaatgactgttaaccctaacttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 5826896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11825710 - 11825501
Alignment:
Q  85 tctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttg-tatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 183  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | | ||||||  || |||||||  |||||||| |||| |||||||| | |||| ||||   | ||| | ||||||    
T  11825710 tctttattcagaattacttgtgttcattacttttcacataattgttttatatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgtctcgatatcaggaat 11825611  T
Q  184 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgga 279  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||||  | |||||  ||| |    
T  11825610 tgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacatagaaacctagagataggaaattgagaatcatgacccatgaa 11825511  T
Q  280 ttaacgttct 289  Q
    ||||||||||    
T  11825510 ttaacgttct 11825501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23467437 - 23467349
Alignment:
Q  134 atgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa-ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatag 221  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23467437 atgactattaaccctaacttcttacaatcacataaattgatcttaggaaatttaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatag 23467349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 216
Target Start/End: Original strand, 2349281 - 2349368
Alignment:
Q  129 tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctga 216  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2349281 tttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagaaattgaatgactattaaccctagcttttaatcctga 2349368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26809114 - 26809014
Alignment:
Q  55 aaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttc 154  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||  || || |||||||||| |||| |||| |||    
T  26809114 aaactctctttgatatcaatgaaaacttagtctttattcataattattcttgcttaatgcttttcttaatatcgtgtgtatgactaataacactaggttc 26809015  T
Q  155 t 155  Q
    |    
T  26809014 t 26809014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28578309 - 28578198
Alignment:
Q  43 gtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactact 142  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||  || | |||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  28578309 gtaatttgttaagtactctctttgatatcagtgaaaatctaatttttattcaaaattgtttgtatttaatgcttttcatataattg--tgtatgactact 28578212  T
Q  143 aactctagcttctt 156  Q
    | | ||| ||||||    
T  28578211 agccctaacttctt 28578198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6214613 - 6214541
Alignment:
Q  81 ttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagctt 153  Q
    |||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||  || |||||| |||||| |||| |||||||    
T  6214613 ttagtcattattcataattattcttgcttaatgcttttcttaatatcgtttgtctgactattaacactagctt 6214541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 13331781 - 13332072
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13331781 atgagatgaatcttt-gtgatctgcgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcataattatttgtgcttaa 13331879  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13331880 tgcttttcttatgattgttcgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 13331979  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13331980 tctgaaatagtaattctgtttaattcatcataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 13332072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 296
Target Start/End: Original strand, 9466820 - 9467107
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9466820 atgagatgaatcttt-gtgatctttgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaaaccagtctttattcataattatttgtgcttaa 9466918  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9466919 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 9467018  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9467019 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatggattaatgttctcaccatg 9467107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 42 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39660354 - 39660090
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39660354 tgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgcttaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 39660255  T
Q  142 taactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca 241  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39660254 taaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattttgtttaattcaaca 39660155  T
Q  242 taggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttctg 302  Q
    |||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  39660154 taggaacctacaaataggaaattgaggattatgacttatgaagtaacgttctcgccatgcttctg 39660090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 5827718 - 5827999
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    |||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  5827718 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtagtttgttaagaattctcttttacatcaaagaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttca 5827816  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5827817 ttgcttttcttatgattgtttgcttgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattaatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 5827916  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  5827917 ttctgaaagagtaattctgtttaattcaacataggaacctcgagataggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 5827999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 30645236 - 30645446
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30645236 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttgatatgattgtttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcacataaattgatcttaggaa 30645335  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  30645336 ttgaatgactactaaccctaacttttaattttgaaatagtaattctgtttaattcaacataagaacctagagataggaaattgaggattatgacatatga 30645435  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  30645436 attaacgttct 30645446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 289
Target Start/End: Original strand, 31981116 - 31981321
Alignment:
Q  88 ttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaa 187  Q
    ||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31981116 ttattcagaattatttgtgttcattgattttcatatgattgtttcaatgactattaaccatagcttcttacaatcacataaattgatattaggaattgaa 31981215  T
Q  188 tgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  31981216 tgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttgtgacatatgaattaa 31981315  T
Q  284 cgttct 289  Q
    ||||||    
T  31981316 cgttct 31981321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 112 - 289
Target Start/End: Original strand, 31984781 - 31984962
Alignment:
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31984781 tgcttttcatatgattggttgcatgactattaaccatagcttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaatcatagcttttaat 31984880  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  31984881 cctgaaataataattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttgtgacatatgaattaacgttct 31984962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27863911 - 27863742
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgttt-gtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  27863911 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatatgattgttttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatcttagga 27863812  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27863811 attgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaatagtaattctgtttgattcaacataggaaccta 27863742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 20262319 - 20262528
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  20262319 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctaacttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 20262417  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  20262418 ttgaatgactattaaccctagcttttaatccagaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 20262517  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  20262518 attaacgttct 20262528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 21048949 - 21049158
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  21048949 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctaacttcttgaaattacatgaattgatattaggaa 21049047  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  21049048 ttgaatgactattaaccctagcttttaatccagaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 21049147  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  21049148 attaacgttct 21049158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 251
Target Start/End: Original strand, 5964018 - 5964187
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  5964018 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 5964117  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5964118 attgaatgactattaacactagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 5964187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24903839 - 24903635
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  | | | || ||||||| |||||||    
T  24903839 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaatttatatgaattgatattaggaa 24903741  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  24903740 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaagctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 24903641  T
Q  279 attaac 284  Q
    ||||||    
T  24903640 attaac 24903635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 286
Target Start/End: Original strand, 14187763 - 14187971
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| ||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  14187763 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactataaaccctaacttcttgcaattacatgaattgatattagga 14187862  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||| |||    
T  14187863 attgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaagtagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgacacatg 14187962  T
Q  278 gattaacgt 286  Q
     ||||||||    
T  14187963 aattaacgt 14187971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 286
Target Start/End: Original strand, 22654024 - 22654232
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  22654024 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatattattgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 22654123  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  || ||||| |||    
T  22654124 attgaatgactattaaccccaacttttaatcctgaaatagtaatcttgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattttgacacatg 22654223  T
Q  278 gattaacgt 286  Q
     ||||||||    
T  22654224 aattaacgt 22654232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 24434795 - 24435004
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||  | ||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  24434795 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatataattactcgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 24434893  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||||| |     
T  24434894 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattaataattctgtttggttcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatagga 24434993  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  24434994 attaacgttct 24435004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17013387 - 17013178
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||  | | | || ||||||| ||| |||    
T  17013387 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttattgaatttatatgaattgatattatgaa 17013289  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  17013288 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 17013189  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    ||||| |||||    
T  17013188 attaatgttct 17013178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 17543814 - 17544023
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||  | | | || ||||||| ||| |||    
T  17543814 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttattgaatttatatgaattgatattatgaa 17543912  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  17543913 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 17544012  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    ||||| |||||    
T  17544013 attaatgttct 17544023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 24444841 - 24445050
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||| |||  | ||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  24444841 agtctttattcagaattatttgtgttcatttcttttcatataattactcgtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 24444939  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||||| |     
T  24444940 ttgaatgactattaatcctagcttttaatcctgaattaataattctgtttggttcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatagga 24445039  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  24445040 attaacgttct 24445050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18696281 - 18696171
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaa-tcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | || |||| | || |||| ||||||||||| |||| ||| |||| || || | |||| ||||||| ||||||    
T  18696281 agtctttatttagaattatttgtgttcattgtttttat-ataattgcttgtatgactattaaccctaacttccttgaaattacatgaattgatattagga 18696183  T
Q  182 attgaatgacta 193  Q
    ||||||||||||    
T  18696182 attgaatgacta 18696171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2500434 - 2500143
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2500434 atgagatgaat-ttttgtgatctgtgagcatgtagtttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctaatctttattcagaaatatttgtgcttaa 2500336  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2500335 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactattaaccctagcttttaat 2500236  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2500235 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagtgataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 2500143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33321350 - 33321059
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  33321350 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaaccgagtatttattcaaaattatttgtgcttaa 33321252  T
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33321251 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactagccctaacttttaat 33321152  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33321151 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacttatgaattaacgttctcaccatgcttc 33321059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 33920833 - 33921114
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  33920833 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttca 33920931  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33920932 ttgcttttcgtatgattgtttgcatgactattaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 33921031  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  33921032 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 33921114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 26337704 - 26337955
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||     
T  26337704 tgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgtttattgcttttcgtatgattgtatgaatgactat 26337803  T
Q  142 taactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca 241  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26337804 taaccctagtttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattctgtttaattcaaca 26337903  T
Q  242 taggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    || ||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  26337904 taagaacctagagataggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 26337955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 17944413 - 17944623
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17944413 agtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 17944512  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  17944513 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatga 17944612  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  17944613 attaacgttct 17944623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 251
Target Start/End: Original strand, 9690486 - 9690693
Alignment:
Q  44 taatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactacta 143  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  9690486 taatttgttacgaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcataattatttgtgttcattgcttttcgtacgattgtttgcatgactatta 9690585  T
Q  144 actctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacata 243  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9690586 accctagcttatttcaatcacataaattgatcttaggaattgaacgactactaaccctagtttttaatcctgaaatagtaattatgtttaattcaacata 9690685  T
Q  244 ggaaccta 251  Q
    ||||||||    
T  9690686 ggaaccta 9690693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34653111 - 34652901
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34653111 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatgattgtttgcatgactattaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaa 34653012  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  34653011 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaataataattttgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatga 34652912  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  34652911 attaacgttct 34652901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 19685930 - 19686142
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttat--gattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19685930 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttacaatcacataaattgatcttagg 19686029  T
Q  181 aattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatat 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||    
T  19686030 aattgaatgactaataaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacatat 19686129  T
Q  277 ggattaacgttct 289  Q
    | |||||||||||    
T  19686130 gaattaacgttct 19686142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 19689313 - 19689525
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttat--gattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19689313 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcatatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttacaatcacataaattgatcttagg 19689412  T
Q  181 aattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatat 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||    
T  19689413 aattgaatgactactaaccctaacttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacatat 19689512  T
Q  277 ggattaacgttct 289  Q
    | |||||||||||    
T  19689513 gaattaacgttct 19689525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1810766 - 1810556
Alignment:
Q  82 tagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgttt-gtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagg 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||     
T  1810766 tagtctttattgagaattatttgtgttcattgtttttcatatgattgttttgcatgactattaaccctaacttcttacaattacataaattgatcttaga 1810667  T
Q  181 aattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatat 276  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||    
T  1810666 aattgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaaattgtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgacatat 1810567  T
Q  277 ggattaacgtt 287  Q
    | |||||||||    
T  1810566 gaattaacgtt 1810556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 25185150 - 25185359
Alignment:
Q  85 tctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttg-tatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaat 183  Q
    |||||||| |||| || ||||| | | |||||||  |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25185150 tctttatttagaaatacttgtgttcattgctttttatatgattgttttatatgactaataaccctagcttcttgcaatcacataaattgattttaggaat 25185249  T
Q  184 tgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgga 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||  |||||| ||||| |    
T  25185250 tgaatgactattaaccctagcttttaatcctaaaatactagctctgtttaattcatcataggaacctagagataggaaaatgaggcttatgatatatgaa 25185349  T
Q  280 ttaacgttct 289  Q
    ||||||||||    
T  25185350 ttaacgttct 25185359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4732188 - 4731993
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  4732188 agtctttattcagaattacttgtgttcattgctttttatataattgctttgtatgactattaaccctagcttcttgcaattacatgaattgatattagga 4732089  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgaca 273  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||    
T  4732088 attggatgactattaaccctagcttttaatcatgaaatagtaatcatgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggattatgaca 4731993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 26547855 - 26548066
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgttt-gtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  || ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  26547855 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgttttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 26547954  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  26547955 attgaatgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 26548054  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  26548055 aattaacgttct 26548066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 26551414 - 26551625
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgttt-gtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  || ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||    
T  26551414 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgttttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattagga 26551513  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  26551514 attgaatgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 26551613  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  26551614 aattaacgttct 26551625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 3194950 - 3195067
Alignment:
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3194950 tgcttttcatatgattgtttgcatgactattaaccctaacttcttgcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccttagcttttaat 3195049  T
Q  212 cctgaaatagtaattctg 229  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  3195050 cctgaaataataattctg 3195067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 26726710 - 26726918
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  26726710 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccatagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 26726807  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  26726808 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaaatctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 26726907  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  26726908 attaacgttct 26726918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28562716 - 28562505
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  28562716 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaactacatgaattgatattagga 28562617  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  28562616 attgaatgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 28562517  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  28562516 aattaacgttct 28562505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28566284 - 28566073
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattg-tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttagga 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  || |||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||  |||| ||||||| ||||||    
T  28566284 agtctttattcagaattacttgtgttcattgcttttcagataattgctttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaactacatgaattgatattagga 28566185  T
Q  182 attgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatg 277  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||  |||    
T  28566184 attgaatgactattaacactagcttttaatcctgatatagtaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaggatcatgactcatg 28566085  T
Q  278 gattaacgttct 289  Q
     |||||||||||    
T  28566084 aattaacgttct 28566073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40800226 - 40800104
Alignment:
Q  129 tttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattct 228  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  40800226 tttgtatgactattaaccctagcttcgtgcaattacatgaattgatattaggaattgaatgactattaacactaccttttaatcctgaaatagtaatcct 40800127  T
Q  229 gtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  40800126 gtttgattcaacataggaaccta 40800104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35432859 - 35432762
Alignment:
Q  55 aaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagctt 153  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||  || || |||||||||| |||| |||||||    
T  35432859 aaactctctttgatatcaatgaaa-cttagtctttattcataattattcttgcttaatgcttttcttaatatcgtgtgtatgactattaacactagctt 35432762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 174
Target Start/End: Original strand, 2453099 - 2453186
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||     ||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  2453099 agtctttattcagaattatttgtattcattgcttttcatatgattgc----atgactattaaccctaacttcttgcaaccacataaattgat 2453186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0911 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0911
Description:

Target: scaffold0911; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4493
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  4256 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctt- 4353  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4354 -tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 4452  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4453 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 4493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 3980 - 4231
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||| ||| |||||||     
T  3980 tgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttcattggttttcgtatgattggttgcatgactat 4079  T
Q  142 taactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4080 taaccctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttcattcaaca 4179  T
Q  242 taggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    |||||||||    || ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  4180 taggaacctagagattggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 4231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 52840 - 53091
Alignment:
Q  42 tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactac 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||     
T  52840 tgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttcaaagcttttcgtatgattgtttgcatgactat 52939  T
Q  142 taactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaaca 241  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52940 taatcctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctatcttttaatcttgaaataataattctgtttaattcaaca 53039  T
Q  242 taggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    |||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  53040 taggaacctagagataggaaattgagagttatgacttatgaattaacgttct 53091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 29013 - 29294
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  29013 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttca 29111  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
    | | ||||| |||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29112 aagattttcatatgattgattgcatgactattaaacctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttat 29211  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  29212 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacctgggaacctagagataggaaattgagaattatgacttatgaattaacgttct 29294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13564
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13283 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgttca 13381  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaa 210  Q
     |||||||  ||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13382 ttgctttttgtataattgtttgcatgactattaaccctaacttctttcaatcacataaattgatcttaggaattaaatgactactaaccctagcttttaa 13481  T
Q  211 tcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  13482 tcctgaaatagtaattctatttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagagttatgacttatgaattagcgttct 13564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 7000 - 7210
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7000 agtctttattcagaattatttatgttcattgctttttatatgattgtttgcatgactattaaccctagcttcttgcaatcacataaattgatcttagaaa 7099  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||     
T  7100 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgacatatga 7199  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  7200 attaacgttct 7210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 19822 - 20028
Alignment:
Q  85 tctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaatt 184  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || |||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19822 tctttatccagaattatttgtg-ttcat-cttttcatattattgtttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcacataaattgatcttaggaatt 19919  T
Q  185 gaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta----taggaaattgagttttatgacatatggat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  19920 gaatgactactaaccctagcttttaatcatgaaatagtaattatgtttaattcaacataggaacctagaggtaggaaattgagggttatgacatatgaat 20019  T
Q  281 taacgttct 289  Q
    |||||||||    
T  20020 taacgttct 20028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 13369 - 13579
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13369 agtctttatccaaaattatttgtgttaactgcttttcatatgattttttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcacataaattgatcttaggaa 13468  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| |||||     
T  13469 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctcaaataggaattatgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgagatatga 13568  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  13569 attaacgttct 13579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 27385 - 27595
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27385 agtctttatccaaaattatttgtgttaactgcttttcatatgattttttgcatgactattaaccctaacttcttacaatcacataaattgatcttaggaa 27484  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| |||||     
T  27485 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcataaaataaaaattatgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttatgagatatga 27584  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  27585 attaacgttct 27595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 112 - 289
Target Start/End: Original strand, 227139 - 227320
Alignment:
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  227139 tgcttttcatatgattggttgcatgactattaaccatagcttcttacaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaatcatagcttttaat 227238  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  227239 cctgaaataataattctgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattgagggttgtgacatatgaattaacgttct 227320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20112 - 19971
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatgg-tgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtctttattcagaattatttgtgatta 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20112 atgagatgaatcttt-gtgatctgtgaaccatgtaatttgttaagaactctctttgacatcaatgaaaacctagtctttattcagaattatttgtgctta 20014  T
Q  111 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagctt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20013 atgcttttcttatgattgtttgtatgactactaaccctagctt 19971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19967 - 19891
Alignment:
Q  228 tgtttaattcaacataggaaccta----taggaaattgagttttatgacatatggattaacgttctcaccatgcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19967 tgtttaattcaacataggaacctagagataggaaattggggattatgacttatgaattaacgttctcaccattcttc 19891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 250
Target Start/End: Original strand, 2022 - 2120
Alignment:
Q  152 ttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2022 ttctttcaatcacataaattgatcttaggaactgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataagaacct 2120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 1951 - 2027
Alignment:
Q  12 atgagatgaatcttttgtgatctgtgatggtgtaatttgttaaaaactctctttaacatcaatgaaaacttagtcttt 89  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  1951 atgagatgaatcttta-tgatctgtgagcatgtaatttgttaagaactctctttgacataaatgaaaacctattcttt 2027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27234 - 27025
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  | | | || ||||||| |||||||    
T  27234 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctaacttcttgaatttatatgaattgatattaggaa 27136  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  27135 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 27036  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  27035 attaacgttct 27025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31420 - 31348
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctt 156  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31420 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttctt 31348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29015 - 28808
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  29015 agtctttattcagaatcacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgactattaaccctagcttcttgaaattatatgaattgatattaggaa 28917  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  28916 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcttgaattagtaatcctgtttgattcaacataggaacctaaagataggaaattgagaatcatgacatatga 28817  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    ||| |||||    
T  28816 atttacgtt 28808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Original strand, 27125 - 27334
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  || |||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||| | || ||||||| |||||||    
T  27125 agtctttattcagaattatttgtgttcattgcttttcagataattgctagtatgactattaaccctagcttcttg-aattatatgaattgatattaggaa 27223  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||   | |||||||| |     
T  27224 ttgaatgactattaaccctaacttttaatcctgaattagtaattctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgaaaatcatgacatagga 27323  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    |||||||||||    
T  27324 attaacgttct 27334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 289
Target Start/End: Original strand, 1194 - 1374
Alignment:
Q  112 tgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaat 211  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1194 tgcttttcatataattgcttgtatgactattaaccctagctt-tttgaattatatgaattgatattaggaattgaatgactattaaccctagcttttaat 1292  T
Q  212 cctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatggattaacgttct 289  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||    
T  1293 cctgaattagtaaatctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatgaattaactttct 1374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 287
Target Start/End: Original strand, 6053 - 6256
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||| |||| |||||||| || |||   |||||||    ||| |||| ||||||| |||||||    
T  6053 agtctttattcagaattacttgtgtttattgcttt-catataattgcttgtatgattattaatcatagcttc----aattacatgaattgatattaggaa 6147  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  | |||||||||      
T  6148 ttgaatgactactaactctagcttttaattctgaaataggaatcctgtttgattcaacataggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatataa 6247  T
Q  279 attaacgtt 287  Q
    |||||||||    
T  6248 attaacgtt 6256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 251
Target Start/End: Original strand, 2298 - 2379
Alignment:
Q  170 ttgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaaccta 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2298 ttgatattaggaattgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaatcctgtttgattcaacataggaaccta 2379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53237 - 53028
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | || |||| | || |||| ||||||||||| |||| ||| |||| |  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  53237 agtctttatttagaattatttgtgttcattgtttttat-ataattgcttgtatgactattaaccctaacttcctgaaattacatgaattgatattaggaa 53139  T
Q  183 ttgaatgactactaaccctagcttttaatcctgaaatagtaattctgtttaattcaacataggaacct----ataggaaattgagttttatgacatatgg 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| || |||||||    |||||||||||||  | ||||||||||     
T  53138 ttgaatgactattaaccctagcttttaatcttgaaatagtaatagtgtttgattcaatatgggaacctagagataggaaattgagaatcatgacatatga 53039  T
Q  279 attaacgttct 289  Q
    ||||| |||||    
T  53038 attaatgttct 53028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 68136 - 68027
Alignment:
Q  83 agtctttattcagaattatttgtgattaatgcttttcttatgattgtttgtatgactactaactctagcttctttcaatcacataaattgatcttaggaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | || |||| | || |||| || |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||     
T  68136 agtctttattcagaattacttgtgttcattgtttttat-ataattgcttatatgactattaaccctaacttcttgaaatcacatgaattgatattaggag 68038  T
Q  183 ttgaatgacta 193  Q
    |||||||||||    
T  68037 ttgaatgacta 68027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University