View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3006_high_7 (Length: 370)

Name: NF3006_high_7
Description: NF3006
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3006_high_7
NF3006_high_7
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (5-269)||(29518838-29519102)
chr6 (20-247)||(2378059-2378286)
chr6 (79-268)||(29518495-29518684)
chr6 (79-268)||(32741171-32741360)
chr6 (21-268)||(16454838-16455088)
chr6 (38-246)||(3409611-3409819)
chr6 (42-268)||(2578420-2578647)
chr6 (17-245)||(10073991-10074219)
chr6 (79-235)||(3409251-3409407)
chr6 (79-245)||(35210196-35210362)
chr6 (47-256)||(10074352-10074560)
chr6 (79-255)||(14748332-14748504)
chr6 (78-256)||(3415449-3415629)
chr6 (80-268)||(1846741-1846928)
chr6 (79-246)||(3058218-3058385)
chr6 (89-268)||(16454577-16454756)
chr6 (87-245)||(2579872-2580030)
chr6 (16-244)||(16107990-16108208)
chr6 (15-258)||(2579479-2579722)
chr6 (16-269)||(10073592-10073843)
chr6 (89-247)||(2377756-2377914)
chr6 (79-235)||(26544041-26544197)
chr6 (93-268)||(2843560-2843736)
chr6 (17-268)||(2579087-2579339)
chr6 (89-236)||(16107680-16107827)
chr6 (62-261)||(2578819-2579016)
chr6 (87-258)||(593694-593867)
chr6 (79-245)||(1127352-1127518)
chr6 (89-266)||(5832007-5832182)
chr6 (90-230)||(1950200-1950340)
chr6 (90-242)||(6999799-6999951)
chr6 (92-195)||(32460630-32460733)
chr6 (21-212)||(6071064-6071257)
chr6 (93-212)||(9062383-9062501)
chr6 (87-241)||(10911565-10911720)
chr6 (49-206)||(8481888-8482045)
chr6 (87-261)||(12071675-12071849)
chr6 (87-245)||(12092482-12092640)
chr6 (82-207)||(5958641-5958766)
chr6 (17-203)||(2975482-2975668)
chr6 (87-261)||(12085018-12085191)
chr6 (47-160)||(35210449-35210551)
chr6 (17-146)||(33605906-33606034)
chr6 (91-246)||(17135068-17135223)
chr6 (87-242)||(31714671-31714823)
chr6 (155-199)||(22605301-22605345)
chr6 (191-238)||(3409405-3409452)
chr6 (155-206)||(11637760-11637811)
chr6 (21-78)||(12092201-12092261)
chr6 (124-170)||(14789279-14789325)
chr6 (155-199)||(21130103-21130147)
chr6 (218-268)||(2975036-2975086)
chr6 (94-206)||(30618656-30618766)
chr6 (163-205)||(11638053-11638095)
[»] chr1 (78 HSPs)
chr1 (14-255)||(44290448-44290690)
chr1 (10-242)||(48588491-48588724)
chr1 (77-255)||(44290814-44290993)
chr1 (10-246)||(26661521-26661760)
chr1 (17-237)||(34364852-34365075)
chr1 (37-244)||(41157323-41157532)
chr1 (20-256)||(22077484-22077719)
chr1 (17-236)||(37556038-37556260)
chr1 (21-166)||(3537226-3537372)
chr1 (79-245)||(3537599-3537765)
chr1 (79-245)||(41759475-41759641)
chr1 (89-257)||(17294579-17294748)
chr1 (87-247)||(41142372-41142533)
chr1 (60-247)||(11977251-11977440)
chr1 (79-241)||(3550712-3550871)
chr1 (87-246)||(41156991-41157150)
chr1 (87-268)||(31767138-31767319)
chr1 (79-268)||(50052001-50052189)
chr1 (95-247)||(14318875-14319027)
chr1 (87-255)||(34364507-34364675)
chr1 (88-255)||(40082408-40082574)
chr1 (81-214)||(32594747-32594880)
chr1 (87-246)||(29798199-29798358)
chr1 (87-261)||(3875315-3875489)
chr1 (89-247)||(34649440-34649598)
chr1 (87-268)||(45084382-45084557)
chr1 (20-256)||(66078-66314)
chr1 (87-267)||(37850579-37850758)
chr1 (78-246)||(45493973-45494146)
chr1 (17-246)||(22077109-22077349)
chr1 (79-245)||(32168698-32168853)
chr1 (87-245)||(5319965-5320123)
chr1 (84-230)||(38804370-38804516)
chr1 (91-245)||(9955911-9956067)
chr1 (87-268)||(66449-66630)
chr1 (89-266)||(26661877-26662054)
chr1 (17-235)||(30630648-30630866)
chr1 (90-236)||(37555733-37555878)
chr1 (87-247)||(24600312-24600472)
chr1 (87-246)||(39066200-39066358)
chr1 (87-268)||(41184383-41184583)
chr1 (78-207)||(44043810-44043944)
chr1 (87-268)||(24131965-24132143)
chr1 (14-119)||(50051777-50051883)
chr1 (93-246)||(5575110-5575261)
chr1 (97-237)||(5528762-5528902)
chr1 (87-256)||(22077818-22077986)
chr1 (88-239)||(22793279-22793431)
chr1 (87-266)||(19283434-19283613)
chr1 (89-235)||(45839629-45839779)
chr1 (158-253)||(11977015-11977110)
chr1 (17-139)||(47379891-47380012)
chr1 (87-235)||(44685456-44685605)
chr1 (87-168)||(21378118-21378199)
chr1 (21-205)||(24448212-24448395)
chr1 (18-146)||(50469180-50469306)
chr1 (157-268)||(50051666-50051776)
chr1 (87-205)||(1188628-1188746)
chr1 (21-72)||(41184198-41184249)
chr1 (114-215)||(4956218-4956321)
chr1 (129-205)||(10351202-10351278)
chr1 (87-205)||(1187404-1187522)
chr1 (186-255)||(21378049-21378118)
chr1 (7-72)||(3537495-3537562)
chr1 (87-134)||(35154150-35154197)
chr1 (17-83)||(1188392-1188457)
chr1 (87-153)||(4878803-4878869)
chr1 (102-244)||(44091909-44092051)
chr1 (136-181)||(41184152-41184197)
chr1 (142-202)||(35154046-35154106)
chr1 (79-152)||(4266875-4266948)
chr1 (186-245)||(4266798-4266855)
chr1 (169-205)||(12466365-12466401)
chr1 (96-155)||(30630912-30630972)
chr1 (41-105)||(47380258-47380323)
chr1 (160-206)||(9956212-9956258)
chr1 (158-195)||(47380217-47380254)
chr1 (169-205)||(31973375-31973411)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (14-268)||(5542602-5542857)
chr2 (55-243)||(37106156-37106344)
chr2 (78-254)||(36178596-36178772)
chr2 (21-242)||(40679632-40679852)
chr2 (83-256)||(37105920-37106093)
chr2 (79-255)||(14745657-14745833)
chr2 (77-268)||(5542975-5543166)
chr2 (89-268)||(6421387-6421566)
chr2 (79-258)||(41283462-41283641)
chr2 (15-238)||(14745300-14745524)
chr2 (59-253)||(15880233-15880429)
chr2 (26-246)||(6422055-6422269)
chr2 (87-268)||(962598-962778)
chr2 (87-268)||(42514649-42514830)
chr2 (21-240)||(7598543-7598754)
chr2 (17-243)||(28531316-28531540)
chr2 (105-268)||(36178148-36178311)
chr2 (20-246)||(40733813-40734041)
chr2 (54-194)||(36178320-36178460)
chr2 (87-246)||(35580723-35580881)
chr2 (89-268)||(6712978-6713159)
chr2 (44-246)||(40733472-40733676)
chr2 (94-245)||(15511495-15511646)
chr2 (89-255)||(36005870-36006035)
chr2 (37-244)||(29676851-29677065)
chr2 (92-243)||(33731653-33731804)
chr2 (17-144)||(36785664-36785793)
chr2 (100-268)||(23346250-23346417)
chr2 (87-244)||(38796619-38796778)
chr2 (10-255)||(3673005-3673236)
chr2 (79-268)||(1769884-1770073)
chr2 (91-226)||(28254258-28254391)
chr2 (21-268)||(30313110-30313358)
chr2 (87-269)||(7598228-7598410)
chr2 (87-240)||(37632602-37632755)
chr2 (17-165)||(38796298-38796450)
chr2 (21-204)||(30323396-30323581)
chr2 (98-268)||(40163349-40163520)
chr2 (89-231)||(5367457-5367599)
chr2 (149-267)||(6421793-6421911)
chr2 (67-195)||(31468800-31468926)
chr2 (21-205)||(33561491-33561675)
chr2 (87-194)||(16542449-16542556)
chr2 (87-235)||(12529038-12529186)
chr2 (95-245)||(29676543-29676687)
chr2 (17-149)||(42514943-42515078)
chr2 (21-195)||(33953821-33953994)
chr2 (87-258)||(16590888-16591054)
chr2 (90-175)||(31899496-31899581)
chr2 (21-194)||(41678419-41678593)
chr2 (47-205)||(37894732-37894889)
chr2 (89-246)||(29874022-29874179)
chr2 (95-199)||(37895107-37895211)
chr2 (90-203)||(31259658-31259774)
chr2 (51-205)||(29873577-29873732)
chr2 (159-255)||(3672773-3672869)
chr2 (149-246)||(6421688-6421785)
chr2 (90-245)||(9231252-9231407)
chr2 (103-192)||(28254165-28254254)
chr2 (140-232)||(36784273-36784365)
chr2 (88-203)||(31385738-31385853)
chr2 (177-268)||(31899080-31899170)
chr2 (90-194)||(12910231-12910335)
chr2 (151-270)||(35580412-35580534)
chr2 (42-109)||(40734231-40734300)
chr2 (129-268)||(30312831-30312971)
chr2 (89-135)||(6421306-6421352)
chr2 (90-243)||(3594180-3594333)
chr2 (141-200)||(25390313-25390372)
chr2 (154-205)||(28226404-28226455)
chr2 (87-205)||(33954302-33954419)
chr2 (30-83)||(34481588-34481642)
chr2 (129-186)||(2336666-2336723)
chr2 (17-98)||(35580532-35580616)
chr2 (157-205)||(8904498-8904546)
chr2 (158-205)||(28226726-28226772)
chr2 (21-60)||(33954064-33954103)
chr2 (154-203)||(13792536-13792585)
chr2 (87-123)||(3672719-3672755)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (14-246)||(22304495-22304728)
chr3 (10-258)||(37990626-37990875)
chr3 (21-255)||(54017806-54018042)
chr3 (41-243)||(42342092-42342296)
chr3 (89-260)||(43346775-43346947)
chr3 (24-268)||(15773127-15773375)
chr3 (87-268)||(32589704-32589884)
chr3 (89-246)||(35946524-35946681)
chr3 (17-268)||(32462536-32462790)
chr3 (10-228)||(4823578-4823796)
chr3 (17-246)||(21832344-21832570)
chr3 (87-257)||(29644890-29645060)
chr3 (37-268)||(29644558-29644792)
chr3 (21-246)||(41359764-41359987)
chr3 (87-256)||(42342377-42342546)
chr3 (89-268)||(37990953-37991133)
chr3 (87-246)||(12114561-12114720)
chr3 (25-216)||(3135102-3135293)
chr3 (87-243)||(15772854-15773010)
chr3 (87-246)||(33803251-33803410)
chr3 (78-237)||(39934963-39935124)
chr3 (89-255)||(52634678-52634843)
chr3 (79-236)||(39389062-39389219)
chr3 (87-246)||(25739424-25739583)
chr3 (87-246)||(54018197-54018356)
chr3 (89-242)||(32462903-32463057)
chr3 (52-246)||(22303954-22304143)
chr3 (89-261)||(25755396-25755568)
chr3 (17-238)||(9240079-9240300)
chr3 (10-253)||(11661871-11662117)
chr3 (79-246)||(50612446-50612618)
chr3 (89-267)||(3135432-3135617)
chr3 (87-245)||(31190017-31190167)
chr3 (87-247)||(53577364-53577524)
chr3 (87-242)||(45395656-45395811)
chr3 (49-142)||(22304208-22304301)
chr3 (87-258)||(1634302-1634473)
chr3 (87-234)||(39914252-39914399)
chr3 (89-245)||(45901715-45901872)
chr3 (87-205)||(8327904-8328022)
chr3 (88-246)||(53117974-53118131)
chr3 (89-237)||(49336694-49336843)
chr3 (87-246)||(44160546-44160702)
chr3 (79-247)||(37726496-37726656)
chr3 (145-242)||(22303662-22303759)
chr3 (89-258)||(33175646-33175820)
chr3 (79-241)||(51886553-51886709)
chr3 (97-240)||(42584829-42584970)
chr3 (68-205)||(47964558-47964694)
chr3 (76-194)||(3384317-3384435)
chr3 (113-211)||(33362327-33362425)
chr3 (161-246)||(41359490-41359575)
chr3 (87-268)||(39336208-39336387)
chr3 (90-179)||(7767380-7767469)
chr3 (89-205)||(11661537-11661638)
chr3 (90-195)||(46546375-46546480)
chr3 (157-246)||(54017547-54017636)
chr3 (87-143)||(43346650-43346706)
chr3 (87-246)||(47964914-47965073)
chr3 (129-213)||(39336002-39336086)
chr3 (137-197)||(52634990-52635050)
chr3 (196-246)||(22304302-22304352)
chr3 (89-205)||(25991405-25991521)
chr3 (191-258)||(8328374-8328441)
chr3 (154-205)||(53596027-53596078)
chr3 (154-205)||(53596342-53596393)
chr3 (129-234)||(12749211-12749316)
chr3 (142-199)||(17731950-17732007)
chr3 (142-199)||(19033181-19033238)
chr3 (17-76)||(8328308-8328368)
chr3 (220-268)||(9239946-9239994)
chr3 (90-205)||(25317161-25317276)
chr3 (154-205)||(53596542-53596593)
chr3 (167-254)||(43978856-43978947)
chr3 (21-119)||(12747878-12747977)
chr3 (154-201)||(48127859-48127906)
chr3 (41-83)||(52634889-52634931)
chr3 (42-111)||(2299930-2300000)
chr3 (155-199)||(16871005-16871049)
chr3 (155-199)||(17735037-17735081)
chr3 (155-199)||(19036306-19036350)
chr3 (218-257)||(41360125-41360164)
chr3 (169-246)||(7766782-7766857)
chr3 (154-199)||(16143505-16143550)
chr3 (158-199)||(16869843-16869884)
chr3 (92-153)||(36986040-36986101)
chr3 (92-153)||(37011479-37011540)
chr3 (150-186)||(50329391-50329427)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (10-241)||(3669982-3670214)
chr8 (10-237)||(1013879-1014107)
chr8 (78-267)||(3669678-3669867)
chr8 (17-243)||(40518512-40518738)
chr8 (77-268)||(30441071-30441266)
chr8 (38-255)||(34835160-34835377)
chr8 (89-254)||(3038281-3038446)
chr8 (37-255)||(9309303-9309522)
chr8 (20-241)||(30359539-30359763)
chr8 (42-255)||(34835427-34835643)
chr8 (42-255)||(34835693-34835909)
chr8 (17-241)||(9482608-9482829)
chr8 (17-246)||(45122933-45123165)
chr8 (17-246)||(45122560-45122783)
chr8 (17-245)||(8918764-8918994)
chr8 (39-237)||(6731856-6732045)
chr8 (79-255)||(1014234-1014411)
chr8 (89-254)||(34834878-34835043)
chr8 (79-268)||(20870550-20870741)
chr8 (21-268)||(18371637-18371881)
chr8 (87-235)||(45122067-45122215)
chr8 (89-267)||(37544469-37544646)
chr8 (87-255)||(6876852-6877021)
chr8 (89-255)||(40518071-40518239)
chr8 (90-246)||(147454-147610)
chr8 (17-235)||(147757-147968)
chr8 (112-258)||(9483174-9483320)
chr8 (87-245)||(9608745-9608903)
chr8 (24-238)||(45121663-45121878)
chr8 (97-268)||(18371970-18372142)
chr8 (89-244)||(33113368-33113523)
chr8 (89-258)||(30359273-30359443)
chr8 (87-257)||(45121898-45122068)
chr8 (89-246)||(1513914-1514071)
chr8 (89-245)||(25561815-25561972)
chr8 (81-261)||(40579490-40579670)
chr8 (87-245)||(5915872-5916025)
chr8 (21-159)||(18372342-18372481)
chr8 (94-247)||(70272-70425)
chr8 (58-246)||(6651476-6651653)
chr8 (87-268)||(41972158-41972341)
chr8 (87-243)||(5420651-5420807)
chr8 (21-191)||(18372988-18373157)
chr8 (87-255)||(9308977-9309149)
chr8 (36-159)||(18372785-18372907)
chr8 (91-244)||(18380020-18380171)
chr8 (90-261)||(32640515-32640682)
chr8 (81-246)||(32305478-32305636)
chr8 (269-355)||(39498971-39499057)
chr8 (21-131)||(18372485-18372596)
chr8 (162-256)||(40579258-40579352)
chr8 (79-165)||(41416251-41416335)
chr8 (87-268)||(4154645-4154824)
chr8 (90-200)||(43274824-43274934)
chr8 (21-205)||(4154321-4154506)
chr8 (89-205)||(8794113-8794229)
chr8 (87-238)||(9507777-9507933)
chr8 (110-224)||(9609108-9609222)
chr8 (87-267)||(9620656-9620834)
chr8 (89-195)||(18372656-18372758)
chr8 (165-260)||(41129066-41129161)
chr8 (90-177)||(3037776-3037865)
chr8 (91-236)||(43398077-43398225)
chr8 (169-246)||(8919143-8919220)
chr8 (87-236)||(12283873-12284021)
chr8 (97-160)||(25561729-25561792)
chr8 (92-192)||(20130454-20130553)
chr8 (17-75)||(3038099-3038157)
chr8 (87-213)||(5274775-5274901)
chr8 (181-254)||(43274626-43274699)
chr8 (187-266)||(18372262-18372342)
chr8 (164-278)||(20995383-20995497)
chr8 (123-179)||(18373236-18373292)
chr8 (90-186)||(40991756-40991852)
chr8 (198-255)||(3037959-3038016)
chr8 (37-113)||(43274699-43274777)
chr8 (158-195)||(12156708-12156745)
chr8 (168-213)||(16524446-16524491)
chr8 (87-144)||(20995502-20995559)
chr8 (87-164)||(33831978-33832055)
chr8 (141-205)||(40417756-40417820)
chr8 (145-186)||(11442911-11442952)
chr8 (223-255)||(3038042-3038074)
chr8 (87-119)||(18645713-18645745)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (7-213)||(7553943-7554151)
chr7 (54-268)||(37532988-37533201)
chr7 (10-242)||(14681431-14681663)
chr7 (87-268)||(1085593-1085774)
chr7 (24-256)||(30244204-30244439)
chr7 (79-268)||(37533341-37533530)
chr7 (36-268)||(30245024-30245254)
chr7 (87-254)||(23368-23535)
chr7 (24-254)||(45434572-45434803)
chr7 (94-255)||(11845198-11845359)
chr7 (87-258)||(7517580-7517751)
chr7 (87-258)||(22567026-22567196)
chr7 (24-206)||(22566702-22566885)
chr7 (81-242)||(29157559-29157720)
chr7 (87-247)||(40094772-40094932)
chr7 (89-257)||(45433243-45433411)
chr7 (89-252)||(6054562-6054725)
chr7 (87-237)||(36939741-36939891)
chr7 (87-246)||(24177435-24177594)
chr7 (93-268)||(34218011-34218186)
chr7 (89-268)||(47129097-47129275)
chr7 (89-234)||(45754718-45754862)
chr7 (95-235)||(19122740-19122879)
chr7 (92-255)||(30032572-30032735)
chr7 (87-258)||(8128428-8128599)
chr7 (17-213)||(1085280-1085482)
chr7 (87-267)||(36622960-36623140)
chr7 (87-245)||(118299-118459)
chr7 (90-243)||(9901648-9901799)
chr7 (87-207)||(16569196-16569316)
chr7 (87-207)||(16596346-16596466)
chr7 (17-157)||(30244628-30244771)
chr7 (108-255)||(37167808-37167949)
chr7 (17-160)||(30245421-30245567)
chr7 (87-246)||(40230290-40230449)
chr7 (87-246)||(41854635-41854793)
chr7 (90-222)||(24838724-24838857)
chr7 (129-266)||(30253534-30253667)
chr7 (58-160)||(30255308-30255412)
chr7 (87-204)||(36534825-36534942)
chr7 (168-268)||(47129450-47129549)
chr7 (90-242)||(20599317-20599471)
chr7 (87-208)||(43241495-43241616)
chr7 (175-267)||(37532729-37532821)
chr7 (17-137)||(40094502-40094621)
chr7 (87-175)||(28301613-28301701)
chr7 (17-205)||(37345846-37346036)
chr7 (90-182)||(41910657-41910749)
chr7 (133-243)||(28300255-28300366)
chr7 (87-155)||(36109007-36109075)
chr7 (92-192)||(44361517-44361616)
chr7 (170-244)||(28300569-28300644)
chr7 (41-205)||(4124128-4124293)
chr7 (154-205)||(21416181-21416232)
chr7 (17-106)||(45697841-45697929)
chr7 (156-204)||(23569043-23569091)
chr7 (188-268)||(30244453-30244533)
chr7 (188-268)||(30253671-30253751)
chr7 (17-83)||(48243241-48243308)
chr7 (21-100)||(10342192-10342271)
chr7 (188-268)||(30245256-30245336)
chr7 (81-124)||(14681281-14681324)
chr7 (154-199)||(21619091-21619136)
chr7 (89-139)||(36967335-36967385)
chr7 (155-199)||(27391815-27391859)
chr7 (155-234)||(40094424-40094503)
chr7 (182-236)||(4719305-4719359)
chr7 (25-80)||(28300365-28300422)
chr7 (170-232)||(45755010-45755072)
chr7 (208-269)||(5825561-5825621)
chr7 (129-266)||(15902342-15902478)
chr7 (142-247)||(37393114-37393218)
chr7 (154-194)||(27598052-27598092)
[»] chr5 (79 HSPs)
chr5 (14-258)||(6500749-6500993)
chr5 (17-267)||(3294993-3295246)
chr5 (18-255)||(624128-624364)
chr5 (79-258)||(6500443-6500621)
chr5 (17-231)||(13415774-13415990)
chr5 (87-268)||(40296292-40296473)
chr5 (79-268)||(27502013-27502202)
chr5 (90-267)||(3295323-3295498)
chr5 (87-255)||(15370099-15370267)
chr5 (79-267)||(32487386-32487573)
chr5 (17-236)||(26074539-26074761)
chr5 (79-241)||(18603124-18603286)
chr5 (80-246)||(41170627-41170793)
chr5 (84-244)||(36492218-36492378)
chr5 (78-266)||(9498634-9498821)
chr5 (90-258)||(25327938-25328106)
chr5 (89-255)||(42405588-42405752)
chr5 (24-244)||(24489207-24489424)
chr5 (87-246)||(41632782-41632941)
chr5 (88-261)||(299490-299664)
chr5 (60-236)||(26074155-26074330)
chr5 (94-252)||(11416970-11417128)
chr5 (89-258)||(1028504-1028673)
chr5 (89-257)||(6224198-6224366)
chr5 (36-208)||(26074818-26074993)
chr5 (97-241)||(34753029-34753173)
chr5 (87-258)||(36568556-36568725)
chr5 (87-246)||(12662651-12662810)
chr5 (79-253)||(623810-623984)
chr5 (89-238)||(26075168-26075318)
chr5 (113-269)||(15370428-15370584)
chr5 (99-241)||(33747783-33747925)
chr5 (87-245)||(35150007-35150164)
chr5 (21-195)||(36521946-36522120)
chr5 (17-237)||(38427486-38427697)
chr5 (79-225)||(5723811-5723957)
chr5 (24-219)||(36522263-36522459)
chr5 (84-210)||(29549290-29549416)
chr5 (21-205)||(31509555-31509742)
chr5 (89-268)||(300961-301132)
chr5 (87-246)||(26590909-26591068)
chr5 (89-246)||(35167837-35167994)
chr5 (90-256)||(2411010-2411176)
chr5 (79-162)||(7768842-7768925)
chr5 (90-268)||(35914852-35915029)
chr5 (89-182)||(42508614-42508707)
chr5 (173-268)||(26899995-26900089)
chr5 (89-167)||(26074320-26074398)
chr5 (174-268)||(38427306-38427401)
chr5 (17-122)||(13785732-13785837)
chr5 (90-268)||(41635170-41635346)
chr5 (101-212)||(31509745-31509857)
chr5 (154-205)||(13042606-13042657)
chr5 (89-168)||(39309686-39309764)
chr5 (14-82)||(9498411-9498480)
chr5 (89-205)||(13786041-13786157)
chr5 (171-223)||(795254-795306)
chr5 (144-223)||(36527117-36527196)
chr5 (89-182)||(42524719-42524811)
chr5 (145-205)||(32445943-32446003)
chr5 (154-201)||(13112604-13112651)
chr5 (90-147)||(6225047-6225104)
chr5 (79-127)||(5660290-5660338)
chr5 (145-245)||(13785632-13785732)
chr5 (124-212)||(19275566-19275653)
chr5 (158-225)||(9498343-9498410)
chr5 (167-205)||(13042784-13042822)
chr5 (167-205)||(13112782-13112820)
chr5 (87-129)||(35150747-35150789)
chr5 (87-129)||(35151038-35151080)
chr5 (189-241)||(24489583-24489635)
chr5 (55-99)||(15370380-15370426)
chr5 (154-205)||(36389016-36389067)
chr5 (169-199)||(5963765-5963795)
chr5 (79-136)||(22298956-22299014)
chr5 (158-199)||(34103625-34103666)
chr5 (24-76)||(35150666-35150719)
chr5 (30-78)||(31865902-31865950)
chr5 (155-199)||(41341523-41341567)
[»] chr4 (107 HSPs)
chr4 (21-266)||(44620592-44620838)
chr4 (22-258)||(36629172-36629408)
chr4 (17-244)||(39404327-39404555)
chr4 (17-235)||(54108845-54109060)
chr4 (77-258)||(50630740-50630921)
chr4 (79-246)||(55933121-55933288)
chr4 (87-255)||(25483336-25483504)
chr4 (79-247)||(41370349-41370517)
chr4 (20-247)||(18932745-18932983)
chr4 (84-247)||(50002423-50002586)
chr4 (14-196)||(2740997-2741180)
chr4 (17-240)||(20826147-20826370)
chr4 (87-255)||(54017583-54017751)
chr4 (87-235)||(52884695-52884844)
chr4 (87-255)||(3340807-3340975)
chr4 (89-261)||(39792842-39793014)
chr4 (56-268)||(22027936-22028150)
chr4 (87-257)||(10245920-10246089)
chr4 (87-269)||(36608635-36608817)
chr4 (87-244)||(1731646-1731803)
chr4 (89-258)||(39404020-39404189)
chr4 (96-268)||(44621011-44621180)
chr4 (17-255)||(49076439-49076679)
chr4 (57-235)||(52884856-52885038)
chr4 (89-245)||(36572021-36572177)
chr4 (79-207)||(49880152-49880280)
chr4 (87-246)||(22183261-22183420)
chr4 (96-268)||(44620362-44620531)
chr4 (87-228)||(4955332-4955473)
chr4 (87-268)||(49076807-49076986)
chr4 (97-247)||(54343004-54343147)
chr4 (89-244)||(34646648-34646803)
chr4 (90-244)||(50459724-50459878)
chr4 (106-255)||(54936215-54936363)
chr4 (87-258)||(2740700-2740869)
chr4 (93-268)||(20825842-20826018)
chr4 (87-238)||(32941128-32941279)
chr4 (87-246)||(22028366-22028527)
chr4 (90-245)||(49302907-49303064)
chr4 (36-245)||(3244449-3244657)
chr4 (88-245)||(16888814-16888971)
chr4 (88-268)||(16889511-16889691)
chr4 (87-242)||(4390102-4390257)
chr4 (102-213)||(45496820-45496931)
chr4 (86-246)||(54108537-54108695)
chr4 (87-268)||(34004560-34004739)
chr4 (17-244)||(45489331-45489561)
chr4 (21-153)||(44621358-44621492)
chr4 (44-246)||(3341083-3341287)
chr4 (89-205)||(41707503-41707618)
chr4 (79-210)||(6975489-6975620)
chr4 (63-241)||(43174480-43174661)
chr4 (141-246)||(23817678-23817783)
chr4 (127-258)||(43827480-43827610)
chr4 (87-205)||(54741216-54741334)
chr4 (138-268)||(31691203-31691335)
chr4 (87-268)||(51768035-51768216)
chr4 (89-233)||(19504707-19504842)
chr4 (133-268)||(18879852-18879987)
chr4 (100-195)||(54017750-54017845)
chr4 (87-247)||(3700365-3700517)
chr4 (87-246)||(28034229-28034388)
chr4 (59-176)||(10246317-10246436)
chr4 (89-224)||(40067045-40067181)
chr4 (108-247)||(48111694-48111833)
chr4 (92-205)||(760194-760306)
chr4 (109-246)||(3271806-3271948)
chr4 (79-139)||(50788087-50788147)
chr4 (95-153)||(44620304-44620362)
chr4 (129-228)||(15841383-15841482)
chr4 (21-205)||(15841023-15841208)
chr4 (179-255)||(43174233-43174309)
chr4 (154-205)||(11197293-11197344)
chr4 (21-83)||(16889315-16889378)
chr4 (90-205)||(34544107-34544225)
chr4 (112-268)||(39698919-39699077)
chr4 (87-213)||(23556896-23557022)
chr4 (71-153)||(44620926-44621011)
chr4 (93-246)||(45489711-45489864)
chr4 (201-261)||(11702281-11702341)
chr4 (58-124)||(41370673-41370738)
chr4 (87-175)||(11348396-11348484)
chr4 (154-205)||(10396198-10396249)
chr4 (154-205)||(10396483-10396534)
chr4 (150-268)||(11783528-11783646)
chr4 (154-206)||(922485-922537)
chr4 (17-68)||(41707340-41707392)
chr4 (155-194)||(1868119-1868158)
chr4 (197-236)||(19895406-19895445)
chr4 (145-203)||(11706584-11706641)
chr4 (167-241)||(41370738-41370812)
chr4 (153-199)||(51681604-51681650)
chr4 (141-201)||(2891864-2891924)
chr4 (87-135)||(45050601-45050649)
chr4 (154-205)||(11197003-11197054)
chr4 (79-110)||(18933103-18933134)
chr4 (17-67)||(22028163-22028214)
chr4 (142-185)||(45484774-45484817)
chr4 (44-74)||(5882092-5882122)
chr4 (131-205)||(31249896-31249970)
chr4 (163-205)||(41707279-41707321)
chr4 (165-203)||(50788034-50788072)
chr4 (87-128)||(11706636-11706677)
chr4 (200-241)||(23817457-23817498)
chr4 (150-183)||(29802604-29802637)
chr4 (169-205)||(34946151-34946187)
chr4 (212-256)||(45496675-45496719)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (7-236)||(5695-5931)
scaffold0734 (87-236)||(5396-5546)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (14-207)||(5281-5477)
scaffold0078 (87-238)||(4982-5133)
[»] scaffold0391 (4 HSPs)
scaffold0391 (17-255)||(1096-1337)
scaffold0391 (17-138)||(3092-3216)
scaffold0391 (134-205)||(1731-1802)
scaffold0391 (36-81)||(1464-1509)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (20-247)||(145-367)
scaffold0702 (89-247)||(512-670)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (40-203)||(17496-17663)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (87-246)||(47360-47519)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (21-212)||(39771-39963)
scaffold0113 (89-213)||(39459-39582)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (89-164)||(10192-10267)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (81-165)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (125-165)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Original strand, 29518838 - 29519102
Alignment:
Q  5 gagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518838 gagacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat 29518937  T
Q  105 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518938 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 29519037  T
Q  205 ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29519038 ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaacac 29519102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Original strand, 2378059 - 2378286
Alignment:
Q  20 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378059 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 2378157  T
Q  119 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || |    
T  2378158 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggtt 2378257  T
Q  219 gttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378258 gttctagcctcgatgtggacggtcccccg 2378286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518684
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 29518684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741360
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 32741360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Original strand, 16454838 - 16455088
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  16454838 aagagcttccgcttgaagggggagcatgctgaattgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcaga 16454937  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggc 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16454938 taaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggt 16455037  T
Q  218 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16455038 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcataatccaaca 16455088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 38 - 246
Target Start/End: Original strand, 3409611 - 3409819
Alignment:
Q  38 ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 137  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3409611 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaac 3409710  T
Q  138 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3409711 atcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 3409810  T
Q  238 cggtccccc 246  Q
    |||||||||    
T  3409811 cggtccccc 3409819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2578647 - 2578420
Alignment:
Q  42 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 139  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2578647 agcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacac 2578549  T
Q  140 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacg 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2578548 tttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 2578449  T
Q  240 gtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||  || |||||||||| ||||||    
T  2578448 gtccccctagcccccctcatgacccaaca 2578420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10074219 - 10073991
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10074219 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttg-tgtgcaagggtgagttatatatcccacatcg 10074121  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 215  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |    
T  10074120 gatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttg 10074021  T
Q  216 gctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10074020 gttgttctagcctcgacgtggacggtcccc 10073991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210362
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccc 35210362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10074560 - 10074352
Alignment:
Q  47 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10074560 gatgaattgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 10074462  T
Q  147 gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10074461 gtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtccccc 10074362  T
Q  247 gcgctcccct 256  Q
      ||||||||    
T  10074361 aggctcccct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748332
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 14748332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415629
Alignment:
Q  78 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  178 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgt--tctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 268
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846928
Alignment:
Q  80 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 179  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  180 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagcttccc-catgacccaaca 1846928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 246
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058385
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtccccc 3058385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454756
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 16454756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579872
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2579872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 16107990 - 16108208
Alignment:
Q  16 aaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  16107990 aaagtaagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacat 16108089  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  16108090 cagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtg 16108177  T
Q  214 cggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
     || |||| || |||||||||||||||||||    
T  16108178 gggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2579722 - 2579479
Alignment:
Q  15 caaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2579722 caaagtaagagctttcgcttgaagggggaccatgatgaatagacggactcacacttgagggagagtgttg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacat 2579624  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    |||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2579623 cggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtg 2579524  T
Q  214 cggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
     || ||||||| |||||||||||| ||| || |  ||||||||||    
T  2579523 tggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctca 2579479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10073843 - 10073592
Alignment:
Q  16 aaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10073843 aaagtaagaccttccgcttgaagggggaacatgatgaattgatggactcacacttaagagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatc 10073745  T
Q  115 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgc 214  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||     
T  10073744 ggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgt 10073647  T
Q  215 ggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 269  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||| |||||||    
T  10073646 ggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctcgtgacccaacac 10073592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 247
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377914
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccg 2377914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 79 - 235
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 268
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843736
Alignment:
Q  93 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 191  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  192 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctaactcccctcatgatccaaca 2843736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2579339 - 2579087
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgag-ggggagcac---gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2579339 aagtaagagcttccgcttgaaaggggagcaacatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtccca 2579240  T
Q  111 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 210  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  2579239 catcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctc 2579144  T
Q  211 gtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2579143 gtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggt-ccccgagctcccctcatgacccaaca 2579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578819
Alignment:
Q  62 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  162 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 261  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcatga 2578819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  187 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    || |||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127518
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || || |||| |||||||||||  |||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtcccc 1127518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 266  Q
     ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtccccag-gctcccctcatgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcg 230  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    ||||||| ||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  92 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  192 tgtg 195  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 6071064 - 6071257
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6071064 aagagcttccgtttaaggggtgagcatgatgaattgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaa 6071162  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6071163 tagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgt 6071257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  93 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  193 gtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Original strand, 8481888 - 8482045
Alignment:
Q  49 tgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  8481888 tgaattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataa 8481985  T
Q  147 gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 206  Q
     | ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481986 atgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071675
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 261  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctcatga 12071675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092482
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| || || ||| |||| |||||||  |||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtcccc 12092482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958641
Alignment:
Q  82 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 181  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  182 tgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctctcttg 5958641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 203
Target Start/End: Original strand, 2975482 - 2975668
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || |||||||||||    
T  2975482 aagtaagagcttccgcttaaagggggaacatgatgaatagatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacat 2975578  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 203  Q
    |  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975579 caaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085018
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 261  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||   |||||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctcatga 12085018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 35210449 - 35210551
Alignment:
Q  47 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35210449 gatggattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgc-----------cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaa 35210537  T
Q  147 gtaagaggacccat 160  Q
    ||||||||||||||    
T  35210538 gtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 146
Target Start/End: Original strand, 33605906 - 33606034
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 116  Q
    ||||||||||||||||| || |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  33605906 aagtaagagcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcga 33606004  T
Q  117 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 146  Q
    ||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  33606005 atagaaaagtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135068
Alignment:
Q  91 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  191 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||  | |||| | |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtccccc 17135068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714823
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    |||||||||| || | | | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtc 31714823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  191 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 206  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12092261 - 12092201
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgaggggg---agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag 78  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092261 aagagcttccgctagaggggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggag 12092201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  124 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 268
Target Start/End: Original strand, 2975036 - 2975086
Alignment:
Q  218 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2975036 tgttctagcctcgatgtggcaggtcccacgcgctcctctcatgatccaaca 2975086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618656
Alignment:
Q  94 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 193  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  194 tggtgtctctctt 206  Q
    |||||||||||||    
T  30618668 tggtgtctctctt 30618656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  163 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 78)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44290690 - 44290448
Alignment:
Q  14 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290690 gcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 44290591  T
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44290590 tcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgt 44290491  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44290490 acggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 44290448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48588724 - 48588491
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48588724 acatgcaaaataagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtcc 48588625  T
Q  109 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  48588624 gacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttac 48588525  T
Q  209 ttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48588524 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 48588491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290814
Alignment:
Q  77 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  177 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 44290814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26661760 - 26661521
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  26661760 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgt 26661661  T
Q  107 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 206  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26661660 cccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 26661561  T
Q  207 gcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26661560 gcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtccccc 26661521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 34364852 - 34365075
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34364852 aagtaagagcttccgattgagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacat 34364951  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  34364952 cggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatg 34365051  T
Q  214 cggctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
    | | || |||| ||||||||||||    
T  34365052 cagttgctctaacctcgatgtgga 34365075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 41157323 - 41157532
Alignment:
Q  37 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41157323 gggggagcacgataaattgatggactcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttg 41157422  T
Q  135 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41157423 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 41157522  T
Q  235 ggacggtccc 244  Q
    || |||||||    
T  41157523 gggcggtccc 41157532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22077719 - 22077484
Alignment:
Q  20 taagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22077719 taagagcttccgcttgatggggagcatgatgaatacatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 22077621  T
Q  120 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctg 219  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||    
T  22077620 gaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttg 22077521  T
Q  220 ttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  22077520 ttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccct 22077484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Original strand, 37556038 - 37556260
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37556038 aagtaagagctttagcttgaagggggggcaggataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacat 37556137  T
Q  114 cggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556138 cggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 37556236  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    | || ||||| |||||||||||||    
T  37556237 gtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3537372 - 3537226
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537372 aagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 3537273  T
Q  120 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537272 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537599
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3537599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294748
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgc-ggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 257  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtcgcccgagctcccctc 17294748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142533
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  187 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 41142533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 247
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977440
Alignment:
Q  60 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 11977440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157150
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 41157150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767138
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctcatgacccaaca 31767138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052001
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 50052001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 247
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319027
Alignment:
Q  95 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 194  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  195 ggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccg 14319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364675
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc 34364675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 255
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082574
Alignment:
Q  88 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtggatagtcctccgagctcccc 40082574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594747
Alignment:
Q  81 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  181 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgc 32594747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798358
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtccccc 29798358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875315
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 261  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccctcatga 3875315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 247
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649598
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 34649598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctcatgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 66314 - 66078
Alignment:
Q  20 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcgga 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  66314 taagagcttccgcttgatgggggaacatgatgaatagatggactcacacttgaggggaagtgttg-tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcgga 66216  T
Q  118 taaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 216  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||  ||    
T  66215 tagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatgg 66118  T
Q  217 ctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
     |||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  66117 ttgttctggcctcgatgtagacaatcccccgagctcccct 66078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850579
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggt-cccctagctcccctcatgatccaac 37850579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493973
Alignment:
Q  78 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  173 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccc 45493973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22077349 - 22077109
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 116  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077349 aagtaagagctttcgcttgatagcgagcatgatgaatagatggacacacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 22077251  T
Q  117 ata--aaat----------agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 204  Q
    |||  ||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  22077250 atagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccc 22077151  T
Q  205 ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077150 tcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccc 22077109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168698
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 32168698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  84 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 183  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  184 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 245
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956067
Alignment:
Q  91 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccc 9956067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66449
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||  ||||||||||||| ||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctcatgacccaaca 66449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661877
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||| ||| |||| |||  ||||||||| ||| ||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaatccttgatgcggatggtctccctagctcccctcgtgacccaa 26661877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30630866 - 30630648
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30630866 aagtaagtgcttcctcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcg 30630768  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 215  Q
    ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| || |    
T  30630767 gataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtg 30630668  T
Q  216 gctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  30630667 gttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600312
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggacagttccccg 24600312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066200
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtccccc 39066200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184383
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  178 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt-cccccgcgctcccctca-tgatccaac 267  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  268 a 268  Q
    |    
T  41184383 a 41184383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  78 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  172 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131965
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |  ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||| |||| || || | || |||||||||| ||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctcatgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 50051883 - 50051777
Alignment:
Q  14 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051883 gcaaagtaagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 50051784  T
Q  113 tcggata 119  Q
    |||||||    
T  50051783 tcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575261
Alignment:
Q  93 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  193 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtccccc 5575261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  97 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  197 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
     |||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  88 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacg 239  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| || |||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 266  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||    |||||||||||| ||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctcatgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 235
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  184 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977110
Alignment:
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 253  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 11977110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 47380012 - 47379891
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47380012 aagtaagaacttccgcttgaggggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttg--atgcaagtgtgagttatatatcccacatcg 47379915  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacac 139  Q
    |||| || |||  |||||||||||    
T  47379914 gatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggct-gttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||| ||||||  |||| |||  |||||| || | |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378118
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaacccat 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 24448212 - 24448395
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 120  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | |     
T  24448212 aagagctttcgcttgagggaaagcacgatgaattgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaag 24448310  T
Q  121 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    || |||  | ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||    
T  24448311 aaaagtggaagttgaacattttataagtgagagggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctct 24448395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 50469306 - 50469180
Alignment:
Q  18 agtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50469306 agtaagagcttctgcttgaggaggagtatgatgaatagataaactgacact-gagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaga 50469209  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataa 146  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469208 taataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051666
Alignment:
Q  157 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctagcatcgatgtggacggtccccctagctcccct 50051678  T
Q  257 catgatccaaca 268  Q
    | ||| ||||||    
T  50051677 cgtgacccaaca 50051666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188628
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctct 205  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctct 1188628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 41184249 - 41184198
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41184249 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttgag 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956321
Alignment:
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 211  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  212 tgcg 215  Q
    ||||    
T  4956318 tgcg 4956321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  129 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187404
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctct 205  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctct 1187404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21378118 - 21378049
Alignment:
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21378118 taagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc 21378049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3537562 - 3537495
Alignment:
Q  7 gacacatgcaaagtaa-gagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgag 72  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3537562 gacacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1188457 - 1188392
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 83  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1188457 aagtaagagcttccacttgaaggg-agcatgatgaattgatggactcacacttgaggatgagtgttg 1188392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 153
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  102 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 201  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  202 ctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
     |||  |||||   | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  136 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 181  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  142 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 152  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 205
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  169 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  96 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 155  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 47380323 - 47380258
Alignment:
Q  41 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg--gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||||    
T  47380323 gagcatgatgaattgatggattcacacttgaggggaagattgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatg 47380258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  160 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 206  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380217
Alignment:
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 195  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 47380217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  169 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5542857 - 5542602
Alignment:
Q  14 gcaaagtaagagcttccgcttgaggggga-gcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5542857 gcaaagttagagcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccata 5542758  T
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542757 tcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 5542658  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5542657 gcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccccgagctccccccatgatccaaca 5542602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  55 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178596
Alignment:
Q  78 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  178 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccccgcgctccc 36178596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40679852 - 40679632
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  40679852 aagagcttccgcttgagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatag 40679754  T
Q  121 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgt 220  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||    
T  40679753 aaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgt 40679654  T
Q  221 tctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  40679653 tctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 256
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106093
Alignment:
Q  83 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  183 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccct 37106093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745657
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc 14745657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5542975
Alignment:
Q  77 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  177 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtaccttgagctccccccatgatccaaca 5542975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421566
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 6421566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283462
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctca 41283462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14745524 - 14745300
Alignment:
Q  15 caaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14745524 caaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgagggg-agtgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacat 14745426  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt- 212  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||     
T  14745425 cgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtg 14745326  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  14745325 gtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 253
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880429
Alignment:
Q  59 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 156  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  157 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacgttcctccgagctcc 15880429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 6422055 - 6422269
Alignment:
Q  26 cttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 124  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| |    
T  6422055 cttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaa 6422147  T
Q  125 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttcta 224  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6422148 gtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 6422247  T
Q  225 gcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  6422248 gcctcgatgtggactgtccccc 6422269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962778
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctcccgaactcccc-catgatccaaca 962778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514830
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 42514830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 7598543 - 7598754
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7598543 aagagcttccgcttgaaggggggcatgatgaatagatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataa 7598642  T
Q  121 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgt 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  7598643 aaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgt 7598734  T
Q  221 tctagcctcgatgtggacgg 240  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  7598735 tcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28531540 - 28531316
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 116  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531540 aagtaatagcttccacttgaaggg-agcatgatgaactgatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 28531443  T
Q  117 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 216  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||| |    
T  28531442 atagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcag 28531343  T
Q  217 ctgttctagcctcgatgtggacggtcc 243  Q
     || ||||||||||||||||| |||||    
T  28531342 ttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178148
Alignment:
Q  105 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  205 ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccccgcgctcccctcgtgacccaaca 36178148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 246
Target Start/End: Original strand, 40733813 - 40734041
Alignment:
Q  20 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  40733813 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcga 40733912  T
Q  117 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 216  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  40733913 ataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcat-aacctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtgg 40734011  T
Q  217 ctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40734012 ttgttcaagtctcgatgtggacggtccccc 40734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36178460 - 36178320
Alignment:
Q  54 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36178460 tgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggg 36178361  T
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 194  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36178360 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580723
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35580723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713159
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca-tgatccaaca 268  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccctcactgatccaaca 6713159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 40733472 - 40733676
Alignment:
Q  44 cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  40733472 cacgatgaattgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacacct 40733571  T
Q  142 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||||| |||    
T  40733572 tataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggt 40733671  T
Q  242 ccccc 246  Q
    |||||    
T  40733672 ccccc 40733676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  94 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 193  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  194 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005870
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacagtctctcgagctcccc 36005870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 244
Target Start/End: Original strand, 29676851 - 29677065
Alignment:
Q  37 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 134  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29676851 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttt 29676950  T
Q  135 aacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctc 229  Q
    ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | ||||    
T  29676951 aacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctc 29677050  T
Q  230 gatgtggacggtccc 244  Q
    |||||||| ||||||    
T  29677051 gatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 243
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731804
Alignment:
Q  92 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 191  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  192 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36785793 - 36785664
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785793 aagtaagagcttccgcttgagggggagcatgatgaattgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 36785694  T
Q  115 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785693 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  100 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  200 ctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctcatgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  187 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Original strand, 3673005 - 3673236
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaagagcttccgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  3673005 acatgcaaagtaaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgt 3673104  T
Q  107 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 206  Q
    ||||||| |||||||||                 ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3673105 cccacattggataaaat-----------------ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctctt 3673187  T
Q  207 gcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
     || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3673188 actagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc 3673236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770073
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||  |||| ||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgaacgatcctcctagctcccccaatgacccaaca 1770073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  91 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  191 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagc 226  Q
    |||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Original strand, 30313110 - 30313358
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  30313110 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgttggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcgga 30313208  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggc 217  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||     
T  30313209 tagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggt 30313307  T
Q  218 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    || ||| |||| ||| | |||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  30313308 tgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctcctcgtgacccaaca 30313358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 269
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598410
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 269  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccctgatctcccctcgtgacccaacac 7598410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632602
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 240  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg 37632602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38796450 - 38796298
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 112  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38796450 aagtaagatcttccgcttgaagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccaca 38796351  T
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 165  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796350 tcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Original strand, 30323396 - 30323581
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  30323396 aagagcatccgcttgagggatgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcaga 30323494  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 204  Q
    || || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323495 tagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163349
Alignment:
Q  98 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg-ccttaaggttttgggtaagagtgtgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || | |||||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  197 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||| || | |||||||  |||| ||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctccccctatgacccaaca 40163349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcga 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 267
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  149 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgc 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  249 gctcccctcatgatccaac 267  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  6421893 gctcccctcatgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  67 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 164  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaac 31468831  T
Q  165 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33561675 - 33561491
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33561675 aagaacttccccttgaggggggagtgcgatgaattgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagata 33561577  T
Q  120 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
     || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561576 gaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  187 aagagtgt 194  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 245
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  95 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 194  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||      ||||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcc------ttttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  195 ggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 149
Target Start/End: Original strand, 42514943 - 42515078
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtta----tatgtcccaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    |||||||||||    
T  42514943 aagtaagagcttccgcttgagagggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgtt-gtgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccaca 42515041  T
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 149  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515042 tcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33953994 - 33953821
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||   |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||     
T  33953994 aagagcttcctcttgagggggagcacgatgaattaacatactcaattttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatag 33953896  T
Q  121 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 195  Q
    || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953895 aaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591054
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctca 16591054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41678593 - 41678419
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagt--tatatgtcccacatcgga 117  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||| ||    
T  41678593 aagagcttccgcttgaggagagagcattatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcaga 41678495  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 194  Q
    || || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41678494 tagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37894889 - 37894732
Alignment:
Q  47 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 146  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || |||||||||    
T  37894889 gatgaatagatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataa 37894791  T
Q  147 gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894790 gtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874022
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||| |||| ||   ||||||||| || | | |||| ||||||| |||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtccccc 29874022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  95 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  195 ggtgt 199  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  187 aagagtgtggtgtctct 203  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29873732 - 29873577
Alignment:
Q  51 aattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  29873732 aattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagt 29873634  T
Q  149 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
      |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  29873633 gggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctct 29873577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672869
Alignment:
Q  159 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccc 3672869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421785
Alignment:
Q  149 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggtacccc 6421785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    ||||| || |||||||  ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  103 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 192  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  140 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgat 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 203
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385853
Alignment:
Q  88 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  188 agagtgtggtgtctct 203  Q
      ||||||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctct 31385853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899080
Alignment:
Q  177 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggt-ccccaagctcccctcatgatccaaca 31899080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 194
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  190 agtgt 194  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580412
Alignment:
Q  151 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccg 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | || |  |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggttcccccg 35580436  T
Q  248 cgctcccc-tcatgatccaacaca 270  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  35580435 agctccccttcatgacccaacaca 35580412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 40734231 - 40734300
Alignment:
Q  42 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734231 agcacgatgaattgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 268
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312971
Alignment:
Q  129 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct-tgcttgtgcggctgttctagcc 227  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    |||||||| || ||| |||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctctcaatttgtgcggttgctctggcc 30312930  T
Q  228 tcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |  ||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  30312931 tgaatgtgggtggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 30312971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 135
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 243  Q
    |||||| | |||||| | || ||| |  | ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  141 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 200  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954302
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctct 33954302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 34481588 - 34481642
Alignment:
Q  30 cgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 83  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34481588 cgcttgaggcgggagcgtgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttg 34481642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 186
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  129 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35580616 - 35580532
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgag 98  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||    
T  35580616 aagtaaaagcttccccttgaaggaggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggagagtgctgttgtgtgcaagtgtgag 35580532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  157 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33954103 - 33954064
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatgga 60  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33954103 aagagcttccgtttcagggggagcacgatgaattgatgga 33954064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 203  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 22304495 - 22304728
Alignment:
Q  14 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22304495 gcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccaca 22304594  T
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304595 tcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 22304694  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22304695 gcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccc 22304728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37990875 - 37990626
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtc 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||     
T  37990875 acatgcaaagtaaaagcttccgcttgaggggg-gcatgatgaattgatggactcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtt 37990777  T
Q  108 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990776 ccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37990677  T
Q  208 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37990676 cttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctca 37990626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 54018042 - 54017806
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54018042 aagagcttccgcttgagggggaacatgatgaaaagatggactcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggat 54017943  T
Q  119 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggct 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  54017942 aaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggtt 54017843  T
Q  219 gttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  54017842 gttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccc 54017806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42342296 - 42342092
Alignment:
Q  41 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||      
T  42342296 gagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatg 42342197  T
Q  139 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42342196 ccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 42342097  T
Q  239 ggtcc 243  Q
    |||||    
T  42342096 ggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346775
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg-cgctcccctcatg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcctccgaagctcccctcatg 43346775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 268
Target Start/End: Original strand, 15773127 - 15773375
Alignment:
Q  24 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 121  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15773127 agcttccgctcttgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaa 15773226  T
Q  122 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgcggctg 219  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||    
T  15773227 agagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttg 15773326  T
Q  220 ttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||    
T  15773327 ttctaacctcgatgtggacgatcctcctaactcccctcatgatccaaca 15773375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589884
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtccccctcgctcccttcatgatccaaca 32589884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946681
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35946681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32462790 - 32462536
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32462790 aagtaagagctttcgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacat 32462691  T
Q  114 cggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32462690 cgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgt 32462591  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    | |  |||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  32462590 gggattgttttagcctcgatgtagacgg-cccccaaactcccctcatgatccaaca 32462536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 4823578 - 4823796
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaaga-gcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4823578 acatgcaaagtaaaaagcttccgctctagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtct 4823676  T
Q  109 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4823677 cacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgc 4823776  T
Q  209 ttgtgcggctgttctagcct 228  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  4823777 ttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21832570 - 21832344
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 116  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21832570 aagtatgagcttccatttgatggggagcatgatgaatagatggactcacacttgaggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgg 21832472  T
Q  117 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 216  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||    
T  21832471 atagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctgg 21832374  T
Q  217 ctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21832373 ttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 21832344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29644792 - 29644558
Alignment:
Q  37 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 133  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29644792 gggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggtt 29644693  T
Q  134 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatg 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  29644692 gaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatg 29644593  T
Q  234 tggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||    
T  29644592 tggatggtcccccaaactcccctcgtgacccaaca 29644558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41359987 - 41359764
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  41359987 aagagcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcgga 41359893  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggc 217  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||     
T  41359892 tacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggt 41359793  T
Q  218 tgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41359792 tgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 41359764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342377
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctcccct 42342377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990953
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgct-cccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctccccctcatgacccaaca 37990953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114561
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtccccc 12114561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3135293 - 3135102
Alignment:
Q  25 gcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135293 gcttccgctagagggggagcacgatgaattgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaat 3135195  T
Q  124 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135194 agtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 3135102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773010
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 15773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803251
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 33803251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  78 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 175  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  176 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 255
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634843
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccc 52634843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 236
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739424
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtccccc 25739424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018197
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 54018197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22304143 - 22303954
Alignment:
Q  52 attgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||    
T  22304143 attgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagta 22304051  T
Q  150 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22304050 agcggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggattgtccccc 22303954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 261
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755568
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 261  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccgaactcccctcatga 25755568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 238
Target Start/End: Original strand, 9240079 - 9240300
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9240079 aagtaagagtttccgcttgaggggagagcataacgaatggatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcg 9240177  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 215  Q
    |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | |||||    
T  9240178 gatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcg 9240277  T
Q  216 gctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    | | |||||||||||||||||||    
T  9240278 gttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Original strand, 11661871 - 11662117
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaaga-gcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||  || || |||||||||||| |||     
T  11661871 acatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttgttgtatgtaagtgtgagttaaatgc 11661970  T
Q  107 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  11661971 cccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaagagtgaggtgtctctc- 11662069  T
Q  206 tgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 253  Q
    |  ||||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  11662070 tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtcccacgagctcc 11662117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612446
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  174 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtccccc 50612446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135432
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  182 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctgactctcctcatgacccaac 3135432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190167
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccc 31190167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577524
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccccg 53577524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 142
Target Start/End: Original strand, 22304208 - 22304301
Alignment:
Q  49 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304208 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634302
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | |  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca 1634302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 234
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914399
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 245
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901872
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccc 45901872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328022
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctct 8328022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117974
Alignment:
Q  88 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtccccc 53117974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  189 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160546
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 44160546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 247
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726656
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 37726656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  145 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175646
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 185  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  186 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctca 33175646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886709
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||| |  |||||||  ||||||||| |||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggt 51886709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584829
Alignment:
Q  97 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  197 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 240  Q
    |||  ||||| ||| ||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacgg 42584829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964558
Alignment:
Q  68 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 167  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  168 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctct 47964558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  76 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 175  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  176 aggttttgggtaagagtgt 194  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359490
Alignment:
Q  161 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 41359490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336208
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc-gcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctcgtgatccaaca 39336208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  189 gagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  190 agtgtg 195  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017547
Alignment:
Q  157 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |  |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccc 54017547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 143
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964914
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  |  |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttccccc 47964914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336002
Alignment:
Q  129 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 39336002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  137 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 246
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304352
Alignment:
Q  196 gtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22304352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  189 gagtgtggtgtctctct 205  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328441
Alignment:
Q  191 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtcccacgaactcccctca 8328441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 234
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  129 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 228  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| || || |||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  229 cgatgt 234  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  142 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  142 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 8328308 - 8328368
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggg 76  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8328308 aagtaagagcttccgcttgaagggggagatcgatgcattgatggactcacacttgaggggg 8328368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 268
Target Start/End: Original strand, 9239946 - 9239994
Alignment:
Q  220 ttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9239946 ttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaaca 9239994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 205
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317276
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  190 agtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||| |||| |||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctct 25317276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978856
Alignment:
Q  167 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccccgagctccc 43978856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12747977 - 12747878
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 118  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747977 aagagctttcgtttgaggggtgagcatgatgaatttacggactcacgcttgagaggatattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 12747879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 201  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 83
Target Start/End: Original strand, 52634889 - 52634931
Alignment:
Q  41 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 83  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52634889 gagcacgatgaattgattgactcacacttgagggagagtgttg 52634931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Original strand, 2299930 - 2300000
Alignment:
Q  42 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299930 agcatgataaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41360164 - 41360125
Alignment:
Q  218 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41360164 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctc 41360125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766782
Alignment:
Q  169 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   |||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctc--acttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtccccc 7766782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  92 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  92 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  150 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 3669982 - 3670214
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669982 acatgcaaagtaagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 3670081  T
Q  109 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670082 cacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 3670181  T
Q  209 ttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3670182 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3670214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1014107 - 1013879
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1014107 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgttc 1014008  T
Q  109 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  1014007 cacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaagagtgtgttgtctcttttac 1013908  T
Q  209 ttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1013907 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 78 - 267
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669867
Alignment:
Q  78 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  178 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccctagctcccctcgtgacccaac 3669867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 40518512 - 40518738
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||     
T  40518512 aagtaagagcttccacttgaggggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatca 40518610  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 215  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |    
T  40518611 gatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtg 40518710  T
Q  216 gctgttctagcctcgatgtggacggtcc 243  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  40518711 gttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 268
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441266
Alignment:
Q  77 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  173 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||| ||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctcgtgacccaaca 30441266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Original strand, 34835160 - 34835377
Alignment:
Q  38 ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 135  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34835160 ggggggcatgatgaattgatggactcac--ttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttga 34835257  T
Q  136 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||     
T  34835258 acaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgta 34835357  T
Q  236 gacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  34835358 gacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038281
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 254  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 3038281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 9309303 - 9309522
Alignment:
Q  37 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 134  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9309303 gggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttg 9309402  T
Q  135 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   | || || |||||||||||||||||    
T  9309403 aacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgt 9309501  T
Q  235 ggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  9309502 ggacggtcccccgagctcccc 9309522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 30359539 - 30359763
Alignment:
Q  20 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgg 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  30359539 taagagcttccgcttgaagggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcag 30359638  T
Q  117 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 216  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30359639 ataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcgg 30359738  T
Q  217 ctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
     ||||||| | ||||||||||||||    
T  30359739 ttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Original strand, 34835427 - 34835643
Alignment:
Q  42 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaaca 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34835427 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835526  T
Q  139 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  34835527 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagac 34835626  T
Q  239 ggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||  |||||||    
T  34835627 ggtccccctggctcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Original strand, 34835693 - 34835909
Alignment:
Q  42 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaaca 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34835693 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835792  T
Q  139 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||    
T  34835793 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagac 34835892  T
Q  239 ggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||  |||||||    
T  34835893 ggtccccctggctcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9482829 - 9482608
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | || |   ||||||||||||| |||||| ||    
T  9482829 aagtaagagcttccgcttgaagggg-gcacagtgaattgttggactcac--ttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgagttatatgttccacatggg 9482733  T
Q  117 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9482732 ataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcgg 9482633  T
Q  217 ctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  9482632 ttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 45122933 - 45123165
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45122933 aagtaagagcttccgcttgaagggggaacatgatgaatagatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 45123032  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttg 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  45123033 cggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttg 45123130  T
Q  212 tgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    || || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45123131 tggggttgttctaatctcgatgtggacggtccccc 45123165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 246
Target Start/End: Original strand, 45122560 - 45122783
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| |||||    
T  45122560 aagtaagagcttccgctggaagggggagcatgatgaatagaagaactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcg 45122652  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  45122653 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtg 45122752  T
Q  216 gctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45122753 gttgttcaagcctcgatgtggaaggtccccc 45122783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8918994 - 8918764
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 114  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8918994 aagttagagcttccgcttaaagggggacatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatc 8918895  T
Q  115 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgc 214  Q
     ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||     
T  8918894 agatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgt 8918795  T
Q  215 ggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918794 ggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 237
Target Start/End: Original strand, 6731856 - 6732045
Alignment:
Q  39 gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 138  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  6731856 gggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga--- 6731952  T
Q  139 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
          ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6731953 ------aagtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtgga 6732045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014234
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggttcccccgagctcccc 1014234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835043
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgatcccttgcgctccc 34835043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  177 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctcatgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18371881 - 18371637
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | || |   |||||||||||||| |||||||||||    
T  18371881 aagagcttccgcttgaagggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggata 18371782  T
Q  120 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctg 219  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||    
T  18371781 aaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttg 18371687  T
Q  220 ttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  18371686 ctctagcttcgatgtggacggttcccccgagctctcctcatgacccaaca 18371637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544469
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgat-ccccgagttcccctcatgacccaac 37544469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876852
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 6876852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 255
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518239
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctcccc 40518239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147610
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtccccc 147610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 147757 - 147968
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  147757 aagtaagagcttccgcttaaagggggagct-gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 147855  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| | ||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  147856 ctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatata---------acccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 147946  T
Q  214 cggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    | | |||||||||||| |||||    
T  147947 cagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  112 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  212 tgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608903
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccc 9608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45121878 - 45121663
Alignment:
Q  24 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 121  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45121878 agcttccgctctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaa 45121780  T
Q  122 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgtt 221  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || || ||||    
T  45121779 agagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggttgtt 45121680  T
Q  222 ctagcctcgatgtggac 238  Q
    |||||||||||||||||    
T  45121679 ctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371970
Alignment:
Q  97 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 196  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  197 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctcatgacccaaca 18371970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359443
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||| ||||||| || |||| || ||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctca 30359443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 257  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513914
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
     |||||||| |||||||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtccccc 1513914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561815
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccc 25561815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579490
Alignment:
Q  81 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 180  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  181 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 261  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacgatcctccatgctccccacatga 40579490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18372481 - 18372342
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18372481 aagagcttccccttgaagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18372382  T
Q  120 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372381 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70272
Alignment:
Q  94 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  194 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||  |||| ||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtctcccg 70272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 246
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651653
Alignment:
Q  58 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 157  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||    
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtccccc 6651653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972341
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  184 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| || ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtctcccgaactcccc-catgacccaaca 41972341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 243  Q
    |||||||||  ||||| ||  |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18373157 - 18372988
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggat 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18373157 aagagcttccccttgatgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggat 18373058  T
Q  119 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18373057 aaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309149
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  185 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 9309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18372907 - 18372785
Alignment:
Q  36 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 135  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18372907 agggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag-agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttga 18372809  T
Q  136 acaccttataagtaagaggaccca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18372808 acaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  91 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  191 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    ||||||||   ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640515
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc-cccgcgctcccctcatga 261  Q
    ||||| | ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtccgccagagctcccctcatga 32640515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305636
Alignment:
Q  81 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  181 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtccccc 32305636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 269 - 355
Target Start/End: Original strand, 39498971 - 39499057
Alignment:
Q  269 cagcatggttcatgagacttggtcttgaagacatagcttcacctggtaaaattgagtttcttccaattttgcgtttattaccaaacc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39498971 cagcatggttcatgagacttggtcttgaagacatagcttcacctggtaaaattgagtttcttccacttttgcgtttattaccaaacc 39499057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18372596 - 18372485
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgaggggga-gcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372596 aagagcttccccttgaaggggaagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 18372497  T
Q  120 aaatagtaaagg 131  Q
    ||||||||||||    
T  18372496 aaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579258
Alignment:
Q  162 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccccgagctcccct 40579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 165  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154645
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| || || ||| |||| ||||||   |||||| ||  ||||| |||||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtgagtggtccctcggactcccttcatgacccaaca 4154645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  190 agtgtggtgtc 200  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4154506 - 4154321
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  4154506 aagagcttctgcttgaggggtgagcatgaagttttgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcaga 4154408  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    || || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4154407 tagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctct 4154321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  189 gagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 181  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  182 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  110 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 209  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  210 tgtgcggctgttcta 224  Q
     ||| || |||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620656
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    |||||| || |||||||||  |||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctcgtgacccaac 9620656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  189 gagtgtg 195  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129161
Alignment:
Q  165 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcatg 41129161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 177  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  91 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    ||| ||||| || ||| || || |||||| || |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919143
Alignment:
Q  169 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtccccc 8919143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  97 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 192
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  92 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 191  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 3038157 - 3038099
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3038157 aagtaagagcttccgcttgagggggagctcgatgaattgatggactcacactttagggg 3038099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274901
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtg 5274901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274626
Alignment:
Q  181 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccccgagctccc 43274626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372262
Alignment:
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaa 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggttcccccgagctcccctcatgacccaa 18372262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995383
Alignment:
Q  164 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || || ||| |||| ||| |||  |||||| |  ||||||||| ||| |    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctcgtgacc 20995398  T
Q  264 caacacagcatggtt 278  Q
    ||||| | |||||||    
T  20995397 caacatatcatggtt 20995383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  123 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991852
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggt 40991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037959
Alignment:
Q  198 gtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 3037959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43274777 - 43274699
Alignment:
Q  37 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274777 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524491
Alignment:
Q  168 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 16524491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417756
Alignment:
Q  141 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctct 40417756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 186
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  145 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3038074 - 3038042
Alignment:
Q  223 tagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3038074 tagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 3038042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Original strand, 7553943 - 7554151
Alignment:
Q  7 gacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  7553943 gacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatat 7554042  T
Q  105 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554043 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 7554142  T
Q  205 ttgcttgtg 213  Q
    | |||||||    
T  7554143 tcgcttgtg 7554151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37533201 - 37532988
Alignment:
Q  54 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533201 tgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 37533102  T
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533101 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 37533003  T
Q  254 cctcatgatccaaca 268  Q
    | || ||| ||||||    
T  37533002 catcgtgacccaaca 37532988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 14681431 - 14681663
Alignment:
Q  10 acatgcaaagtaagagcttccgcttga--gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14681431 acatgcaaagtaagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaagttatatgtc 14681530  T
Q  108 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  14681531 ccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc--a 14681628  T
Q  208 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    |  ||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  14681629 caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085593
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctcatgacccaaca 1085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 30244204 - 30244439
Alignment:
Q  24 agcttccgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 120  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244204 agcttccgcttgaagagggagcatgatgactagatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 30244303  T
Q  121 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgt 220  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  30244304 aagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgt 30244403  T
Q  221 tctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30244404 tcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccct 30244439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533341
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcgtgacccaaca 37533341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 268
Target Start/End: Original strand, 30245024 - 30245254
Alignment:
Q  36 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 133  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30245024 agggggagcatgatgattagatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggtt 30245123  T
Q  134 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatg 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  30245124 gaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatg 30245219  T
Q  234 tggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  30245220 tggatggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 30245254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23368
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 254  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccccgagctccc 23368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 254
Target Start/End: Original strand, 45434572 - 45434803
Alignment:
Q  24 agcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  | || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45434572 agcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaa 45434671  T
Q  123 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttc 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||    
T  45434672 aagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttc 45434771  T
Q  223 tagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 254  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  45434772 tagcctcgatgtgatcggtccccctcgctccc 45434803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 255
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845359
Alignment:
Q  94 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  194 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc 11845359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517751
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctca 7517751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567026
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctca 22567026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22566885 - 22566702
Alignment:
Q  24 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 121  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22566885 agcttccgctctggggggagcacgataaagtgatagactaacatttgagggggagtgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaa 22566786  T
Q  122 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22566785 agagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 242
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157720
Alignment:
Q  81 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  181 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||| || |||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtc 29157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094772
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccccg 40094772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054725
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 252  Q
    |||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctc 6054725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177594
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtccccc 24177594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 93 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218011
Alignment:
Q  93 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  193 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 34218011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129275
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggt-ccccgagctcccctcatgatccaaca 47129275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 234
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  95 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  195 ggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 255
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032735
Alignment:
Q  92 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  192 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 30032735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128428
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctca 8128428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1085482 - 1085280
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggac--tcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtccca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||    
T  1085482 aagtaagagcttccccttgaaggggtagcatgatgaaaagatggacactcacacttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtccca 1085383  T
Q  111 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 210  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1085382 tatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttcctt 1085283  T
Q  211 gtg 213  Q
    |||    
T  1085282 gtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 267
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||| |  ||||||  ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctcatgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118299
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  187 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc 118299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 243
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 30244628 - 30244771
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244628 aagtaagagcttccgcttcaaggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 30244727  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 157  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244728 tggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167949
Alignment:
Q  108 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  208 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccc 37167949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 30245421 - 30245567
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30245421 aagtaagagcttccgcttgagggggagcatgatgaaaaagacggacacacacttgagggggactgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 30245520  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 160  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245521 cagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230290
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||  | | ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggttcccc 40230290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854793
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtccccc 41854793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag-aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttc 222  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 266
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253667
Alignment:
Q  129 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| || ||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  229 cgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccccgagctcccctcgtgacccaa 30253667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 160
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255412
Alignment:
Q  58 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30255407  T
Q  156 cccat 160  Q
    |||||    
T  30255408 cccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534825
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctc 204  Q
    |||||||||| |||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc 36534825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 168 - 268
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129549
Alignment:
Q  168 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggt-ccccgagctcccctcatgacccaac 47129548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 242
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgc 208  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532729
Alignment:
Q  175 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccctcgtgatccaac 37532729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40094621 - 40094502
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40094621 aagtaagagcttccgcttgagggagagcgtgatgaatagatggactcacactttaggaggagtgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcag 40094523  T
Q  117 ataaaatagtaaaggttgaac 137  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  40094522 ataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 175  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 37345846 - 37346036
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacat 113  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||  | ||    
T  37345846 aagtaaaagcttccacttgacgggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatat 37345944  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    | |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37345945 ctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910657
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttt 41910657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300255
Alignment:
Q  133 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcga 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  232 tgtggacggtcc 243  Q
    ||||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcc 28300255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 155  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  92 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 191  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  170 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4124293 - 4124128
Alignment:
Q  41 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt-tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 139  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  ||||    
T  4124293 gagcatgatgaattgatgggctcacacttgatgtgaagtttgttgtgtgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacac 4124194  T
Q  140 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
     |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4124193 tttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggataaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 106
Target Start/End: Original strand, 45697841 - 45697929
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  45697841 aagtaagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaatagataaactcacacttgaggaggagtgtt-gtgtgcaagtgtcatttatatgt 45697929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  156 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 268
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctcatgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 268
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctcatgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 48243308 - 48243241
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 83  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48243308 aagtaagaacttccacttgaagggggagcatgatgaattgatggattcacacttgagggggagtgttg 48243241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Original strand, 10342192 - 10342271
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtt 100  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10342192 aagagcttccacttgagggggcagcatgatgaattggcggactcatacttgagggggagtg-tggtgtgcaagtgtgagtt 10342271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 268
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245336
Alignment:
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctccccttatgacccaaca 30245336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 124
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  81 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgt 234  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| || || |||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  182 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28300422 - 28300365
Alignment:
Q  25 gcttccgcttga--gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtg 80  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28300422 gcttccgcttgaaaggaggagcatgatgaatagatggactcacacttgagagggagtg 28300365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  170 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgat 232  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5825621 - 5825561
Alignment:
Q  208 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 269  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||    
T  5825621 cttgtgcggttgttctagccttgatgtggacggtctcccaagct-ccctcatgacccaacac 5825561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 266
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902478
Alignment:
Q  129 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 228  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |  |||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  229 cgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 266  Q
     |||||||  |||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccccggactcccctcgtgacccaa 15902478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393218
Alignment:
Q  142 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| || || || |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  242 cccccg 247  Q
    ||||||    
T  37393213 cccccg 37393218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 194
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 79)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Original strand, 6500749 - 6500993
Alignment:
Q  14 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6500749 gcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-aca 6500847  T
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6500848 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgt 6500947  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6500948 gcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 6500993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3295246 - 3294993
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg----gtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3295246 aagtaagagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccaca 3295148  T
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3295147 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttggttgt 3295048  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    | || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3295047 gtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctcatgatccaac 3294993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Original strand, 624128 - 624364
Alignment:
Q  18 agtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  624128 agtaagagcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgta 624226  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggc 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  624227 taaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggt 624326  T
Q  218 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  624327 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctcccc 624364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 79 - 258
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500621
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 6500621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13415990 - 13415774
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13415990 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgctgaatagatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 13415892  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13415891 cggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtg 13415792  T
Q  214 cggctgttctagcctcga 231  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13415791 cggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctcatgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcatgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295323
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctcactcccctcatgatccaac 3295323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370267
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 15370267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 267
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487573
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 267  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccaagcttcccccatgacccaac 32487573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Original strand, 26074539 - 26074761
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  26074539 aagtaagagcttccacttgaaggagtagcatgatcaattgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatat 26074638  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  26074639 cggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtg 26074738  T
Q  214 cggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
     || || |||| |||||||||||    
T  26074739 tggttgctctaacctcgatgtgg 26074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 246
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170793
Alignment:
Q  80 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 179  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  180 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtccccc 41170793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  84 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  184 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498634
Alignment:
Q  78 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  178 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 266  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgctggtctagcctcaatgtggacggtccccctagctcccctcgtgacccaa 9498634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 90 - 258
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328106
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctca 25328106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405588
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 42405588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24489424 - 24489207
Alignment:
Q  24 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 123  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  24489424 agcttctggttgaggggtagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaa 24489326  T
Q  124 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttct 223  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||    
T  24489325 agaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttct 24489228  T
Q  224 agcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  24489227 agtctcgatgtgggcggtccc 24489207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632941
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccc 41632941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 261
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299664
Alignment:
Q  88 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc-gcgctcccctcatga 261  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccccggagctcccctcatga 299664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074155
Alignment:
Q  60 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  160 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || || |||| |||||||||||    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416970
Alignment:
Q  94 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  194 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 252  Q
    || | ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtccccctcgctc 11416970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028504
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca 1028504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 257  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26074993 - 26074818
Alignment:
Q  36 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 133  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26074993 agggggagcttgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtt 26074894  T
Q  134 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgc 208  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26074893 gaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgc 26074818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  97 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  197 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568556
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctca 36568556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662651
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtccccc 12662651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 253
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623984
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 253  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccccgagctcc 623984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 187  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 269
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370584
Alignment:
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 269  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctcatgtcccaacac 15370584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 241
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  99 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  199 tctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150164
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccc 35150164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36522120 - 36521946
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36522120 aagagcttccgcttgaggtgggataacgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagata 36522022  T
Q  120 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 195  Q
     || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522021 gaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 36521946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 38427486 - 38427697
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgag-ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |    
T  38427486 aagtaagagcttcctcttgaaaggggtgcatcatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttg---------tgtgagttatatgtcccacattg 38427576  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 215  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  38427577 gatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgcg 38427675  T
Q  216 gctgttctagcctcgatgtgga 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||    
T  38427676 gttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctag 225  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36522459 - 36522263
Alignment:
Q  24 agcttccgcttgagggg--gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 121  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  36522459 agcttccgcttgaggggaggaacacgatgaattgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggataga 36522361  T
Q  122 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctg 219  Q
    | | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36522360 aaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggctg 36522263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549290
Alignment:
Q  84 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  184 ggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 210  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgctt 29549290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 31509555 - 31509742
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31509555 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgga 31509653  T
Q  118 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    || || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509654 tagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 268
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301132
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcctccgaactcccctaatgacccaaca 301132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590909
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttcccc 26590909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167837
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtccccc 35167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    ||||| || ||||| || ||||   |  ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 162
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 268
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915029
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    | |||||| |||||||||||| |  |  || || | |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtccccc-agctccgctcatgacccaaca 35915029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 182
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 182  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26899995
Alignment:
Q  173 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc-catgacccaaca 26899995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 167
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 268
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427401
Alignment:
Q  174 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-atgatccaaca 268  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccccgagctcccttcgatgatccaaca 38427401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13785837 - 13785732
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggag-cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13785837 aagtaagagcttccgcttgaaggggaaacatgatgaatagatagactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcg 13785739  T
Q  116 gataaaa 122  Q
    |||||||    
T  13785738 gataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635170
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||| || ||||| || |||||  || || |||| | |  |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctctatctttaatgtggactgt--ccctcactcccctcatgatccaaca 41635170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  101 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  200 ctctcttgcttgt 212  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9498480 - 9498411
Alignment:
Q  14 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtt 82  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9498480 gcaaagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggtgtgtt 9498411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786041
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  188 agagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctct 13786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  171 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttct 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  144 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttct 223  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 182
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 182  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  145 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 201
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 147
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 147  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 127
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785632
Alignment:
Q  145 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | ||||  || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  245 c 245  Q
    |    
T  13785632 c 13785632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  124 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctag 225  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 205
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  167 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 205
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  167 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 129
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 129
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 99
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  55 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 199
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  169 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 136  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 199
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  158 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Original strand, 35150666 - 35150719
Alignment:
Q  24 agcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggg 76  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35150666 agcttccgctttgggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttggggggg 35150719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 31865950 - 31865902
Alignment:
Q  30 cgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag 78  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31865950 cgcttgaggaggagcacaataaattgatggactcacatttgaggaggag 31865902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 107)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 266
Target Start/End: Original strand, 44620592 - 44620838
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620592 aagagcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 44620691  T
Q  119 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggct 218  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  44620692 gaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacc-ataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggtt 44620790  T
Q  219 gttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 266  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44620791 gttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaa 44620838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 258
Target Start/End: Original strand, 36629172 - 36629408
Alignment:
Q  22 agagcttccgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 120  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36629172 agagcttccgcttgaaggtggagcatgatgaattgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatag 36629270  T
Q  121 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgt 220  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  36629271 aaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 36629370  T
Q  221 tctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  36629371 tctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctca 36629408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Original strand, 39404327 - 39404555
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39404327 aagtaagagcttccgcttgagggagagcacgatgaattgatggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatc 39404425  T
Q  115 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgc 214  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  39404426 agataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgt 39404525  T
Q  215 ggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404526 ggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Original strand, 54108845 - 54109060
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  54108845 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattaatagactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcg 54108941  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108942 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 54109040  T
Q  216 gctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  54109041 gttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630740
Alignment:
Q  77 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  177 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctagctcccctca 50630740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933121
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 55933121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483504
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc 25483504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 247
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370517
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 41370517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18932983 - 18932745
Alignment:
Q  20 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg-- 116  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  18932983 taagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcggtc 18932885  T
Q  117 ---------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
             |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18932884 ctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctctta 18932785  T
Q  208 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18932784 cttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccccg 18932745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 247
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002586
Alignment:
Q  84 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  184 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccg 50002586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 2740997 - 2741180
Alignment:
Q  14 gcaaagtaagagcttccgcttgagggggag--cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  2740997 gcaaagtaagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccac 2741095  T
Q  112 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 196  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741096 atcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Original strand, 20826147 - 20826370
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 115  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | | || |||||||||||||||||||||||    
T  20826147 aagtaatagcgtccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaa-tgtgagttatatgtcccacatcg 20826245  T
Q  116 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  20826246 gataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcg 20826345  T
Q  216 gctgttctagcctcgatgtggacgg 240  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  20826346 attgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017583
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctagctcccc 54017583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340975
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc 3340975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792842
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctcatga 39792842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027936
Alignment:
Q  56 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 253  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || || |||| ||| |||||||||||| ||||| |  |||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcc 22027951  T
Q  254 cctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||| ||||||    
T  22027950 cctcatgacccaaca 22027936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246089
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctc 10246089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608635
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 269  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcgtgacccaacac 36608635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404189
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 39404189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621180
Alignment:
Q  96 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 195  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  196 gtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtccc---cgctcctctcatgatccaaca 44621180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 49076679 - 49076439
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaat--tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 111  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| |||     
T  49076679 aagtaagagtttccgcttgaagggggaacatgatgaaaagtgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccat 49076580  T
Q  112 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| ||||     
T  49076579 atcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgctta 49076483  T
Q  212 tgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49076482 tgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 49076439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  57 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  155 acccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 245
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880280
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttg 49880280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183261
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22183261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620531
Alignment:
Q  96 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  196 gtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
     ||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtccc---cgctcctctcatgatccaaca 44620531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 228  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076807
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccctgagct-ccctcatgacccaaca 49076807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343004
Alignment:
Q  97 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  197 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccg 54343004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  190 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936363
Alignment:
Q  106 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  206 tgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
      | | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc 54936363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcacttgt--ggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 268
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826018
Alignment:
Q  93 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  193 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-atgatccaaca 268  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaaca 20826018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028366
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 184  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  185 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 22028366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303064
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccc 49303064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3244657 - 3244449
Alignment:
Q  36 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 135  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3244657 agggggaacatgatgaatagatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttga 3244559  T
Q  136 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||  || ||||| ||||||||||||    
T  3244558 acatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtg 3244459  T
Q  236 gacggtcccc 245  Q
    | | ||||||    
T  3244458 ggcagtcccc 3244449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888814
Alignment:
Q  88 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 245  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccc 16888814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889511
Alignment:
Q  88 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccctcgagctccccacgtgacccaaca 16889511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 242  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496931
Alignment:
Q  102 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  202 ctcttgcttgtg 213  Q
    ||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtg 45496931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 246
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108695
Alignment:
Q  86 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  185 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtccccc 54108695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004560
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtctcccgagctcctctcatgacccaaca 34004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45489561 - 45489331
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccaca 112  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  45489561 aagtaagagcttccgcttgaagaggagcatgatgaaaacgatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcaca 45489462  T
Q  113 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  45489461 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagt 45489363  T
Q  213 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 244  Q
    | |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489362 gtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 44621358 - 44621492
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44621358 aagagcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggat 44621457  T
Q  119 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621458 aaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341287
Alignment:
Q  44 cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 141  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  142 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || || | || || ||||||||| ||||||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  242 ccccc 246  Q
    |||||    
T  3341283 ccccc 3341287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  189 gagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 178  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174661
Alignment:
Q  63 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 159  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  160 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || |  || |||| |||||| ||||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggt 43174661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817678
Alignment:
Q  141 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 240  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  241 tccccc 246  Q
    ||||||    
T  23817683 tccccc 23817678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827610
Alignment:
Q  127 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagc 226  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  227 ctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccccgagcttccctca 43827610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741216
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||| || |||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct 54741216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 268
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691335
Alignment:
Q  138 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  236 gacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    |||| |||  || |||||||  |||| ||||||    
T  31691303 gacgatccttcgagctcccccaatgacccaaca 31691335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768035
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || |  ||||||| ||||||||||||||||| |||   || ||||||||| ||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtctcccaaacttccctcatgacccaaca 51768035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatg 233  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 268
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879987
Alignment:
Q  133 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgat 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  233 gtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||    
T  18879952 gtggacggtcctccgagctcccccaatgacccaaca 18879987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  100 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700517
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |||||| || |||||||||   ||||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtctcccg 3700517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034388
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtccccc 28034388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 176
Target Start/End: Original strand, 10246317 - 10246436
Alignment:
Q  59 gactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 156  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10246317 gactcacgcttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggac 10246416  T
Q  157 ccataaacccattgccttaa 176  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  10246417 ccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 187  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  188 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttcta 224  Q
    | |||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111694
Alignment:
Q  108 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  208 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |   || || | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccccg 48111694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 205
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760306
Alignment:
Q  92 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  192 tgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctct 760306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 246
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271948
Alignment:
Q  109 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 204  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  205 -ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
     ||  || || || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 3271948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  95 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  129 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 228  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || || ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15841208 - 15841023
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag-tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 118  Q
    ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  15841208 aagagcttccgcttgagtggtgagaatgatgaattgatggagtcacacttgacgaggagatcgttgtgtacaaatgtgaattatatgtcccatatcagat 15841109  T
Q  119 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    | || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15841108 agaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagtgtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 255
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174309
Alignment:
Q  179 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccccgagctcccc 43174309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16889378 - 16889315
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaat-tgatggactcacacttgagggggagtgttg 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889378 aagagcttccgcttgagggggagcacgattaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 205
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  90 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698919
Alignment:
Q  112 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 209  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  210 tgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 268  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||| ||||   | |||| |||||| ||||||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcctatgagctctcctcatcatccaaca 39698919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556896
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtg 23556896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 153
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621011
Alignment:
Q  71 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 153  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489711
Alignment:
Q  93 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 192  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  193 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    ||||||||||||| |||||   || |||||||| |||||||||| || ||||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatccccc 45489711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702281
Alignment:
Q  201 tctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctcatga 11702281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 124
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  58 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 175  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783528
Alignment:
Q  150 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcg 249  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||   | || |||||||| |||||||  ||||||||  |    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  250 ctcccctcatgatccaaca 268  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  11783546 cacccctcatgacccaaca 11783528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 206
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 41707392 - 41707340
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacact 68  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41707392 aagtaagagcttccccttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacact 41707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 194
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  155 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 236
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  197 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  145 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 203  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 241
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  167 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  153 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  141 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 135
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 205
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  154 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  79 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22028214 - 22028163
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacac 67  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22028214 aagtaagagctttcgcttgaagggggagcacgatgaaaagatggactcacac 22028163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 185
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  142 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 185  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 74
Target Start/End: Original strand, 5882092 - 5882122
Alignment:
Q  44 cacgatgaattgatggactcacacttgaggg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882092 cacgatgaattgatggactcacacttgaggg 5882122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  131 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  163 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50788034
Alignment:
Q  165 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 203  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctct 50788034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 128  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817457
Alignment:
Q  200 ctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 241  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 183
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  150 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  169 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 256
Target Start/End: Original strand, 45496675 - 45496719
Alignment:
Q  212 tgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  45496675 tgcggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctcccct 45496719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 5695 - 5931
Alignment:
Q  7 gacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  5695 gacacatgcaaagtaagagcttccgcttgagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatat 5794  T
Q  105 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttttgggtaagagtgtggtgt 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||    
T  5795 gtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagtgtggtgt 5894  T
Q  200 ctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    |||| || |||||| || ||||| | | |||||||||    
T  5895 ctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  186 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 5281 - 5477
Alignment:
Q  14 gcaaagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtccca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  5281 gcaaagtaagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttcca 5380  T
Q  111 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 207  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5381 catcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1337 - 1096
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1337 aagtaagagcttccgctcgaagggggagcatgatcaaaagatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacat 1238  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  1237 tggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatg 1138  T
Q  214 cggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 255  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  1137 tggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3216 - 3092
Alignment:
Q  17 aagtaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3216 aagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgagttgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacat 3117  T
Q  114 cggataaaatagtaaaggttgaaca 138  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  3116 cggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  134 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1509 - 1464
Alignment:
Q  36 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt 81  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1509 agggggagcatgatgaatcgattgactcacacttgagggggagtgt 1464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 367 - 145
Alignment:
Q  20 taagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  367 taagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 269  T
Q  119 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || |    
T  268 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggtt 174  T
Q  219 gttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  173 gttctagcctcgatgtggacggtcccccg 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 512
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  189 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccg 512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17663 - 17496
Alignment:
Q  40 ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 137  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17663 ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaac 17564  T
Q  138 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17563 accttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47519
Alignment:
Q  87 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 186  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  187 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 246  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtccccc 47519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 39771 - 39963
Alignment:
Q  21 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39771 aagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 39870  T
Q  120 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 212  Q
     || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39871 gaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 213
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39582
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaa-gttttgggtaa 39556  T
Q  189 gagtg-tggtgtctctcttgcttgtg 213  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtg 39582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  89 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 165
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  81 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 165  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  125 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 165  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University