View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3010-Insertion-10 (Length: 526)

Name: NF3010-Insertion-10
Description: NF3010
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3010-Insertion-10
NF3010-Insertion-10
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (122-520)||(22767269-22767667)
chr5 (128-526)||(20204738-20205136)
chr5 (128-523)||(8387869-8388264)
chr5 (122-526)||(15988755-15989159)
chr5 (128-526)||(4267894-4268280)
chr5 (240-526)||(12660211-12660497)
chr5 (130-526)||(41940743-41941139)
chr5 (205-526)||(26597463-26597784)
chr5 (215-526)||(27292304-27292615)
chr5 (225-526)||(25730688-25730989)
chr5 (128-523)||(27532915-27533311)
chr5 (128-397)||(30222934-30223203)
chr5 (249-489)||(11375556-11375796)
chr5 (278-526)||(34652260-34652507)
chr5 (248-450)||(37448028-37448230)
chr5 (206-288)||(16074597-16074679)
chr5 (128-260)||(34653864-34653995)
chr5 (192-230)||(37447990-37448028)
chr5 (128-161)||(27292229-27292262)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (122-526)||(9328608-9329011)
chr7 (129-526)||(16731717-16732114)
chr7 (129-526)||(17709851-17710248)
chr7 (128-526)||(22289024-22289422)
chr7 (128-526)||(29200961-29201353)
chr7 (240-526)||(16098385-16098671)
chr7 (132-522)||(1581402-1581793)
chr7 (182-457)||(17877245-17877520)
chr7 (174-522)||(30493620-30493967)
chr7 (272-373)||(34578437-34578538)
chr7 (243-450)||(30824557-30824763)
chr7 (128-220)||(11745953-11746045)
chr7 (401-522)||(3275090-3275211)
chr7 (128-204)||(16098266-16098342)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (122-522)||(32577058-32577456)
chr4 (122-526)||(49119406-49119797)
chr4 (122-526)||(28425972-28426364)
chr4 (128-526)||(37245858-37246260)
chr4 (128-526)||(29655672-29656069)
chr4 (129-526)||(49951097-49951494)
chr4 (128-526)||(28537793-28538189)
chr4 (123-526)||(2064631-2065034)
chr4 (128-526)||(51259535-51259934)
chr4 (128-475)||(56065412-56065759)
chr4 (132-473)||(21321314-21321655)
chr4 (138-526)||(51734978-51735366)
chr4 (131-526)||(55734795-55735190)
chr4 (128-397)||(18442280-18442548)
chr4 (128-526)||(43840312-43840711)
chr4 (217-526)||(41835317-41835626)
chr4 (372-522)||(26422612-26422762)
chr4 (368-526)||(47226336-47226494)
chr4 (438-477)||(24989988-24990027)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (128-523)||(88342-88737)
chr2 (128-526)||(12130644-12131042)
chr2 (128-526)||(34695910-34696306)
chr2 (128-526)||(34718322-34718718)
chr2 (189-524)||(44017326-44017661)
chr2 (128-445)||(18345574-18345878)
chr2 (403-526)||(9710015-9710136)
chr2 (330-415)||(9709914-9709999)
chr2 (176-421)||(26198518-26198768)
chr2 (354-526)||(1417987-1418159)
chr2 (409-526)||(22845600-22845717)
chr2 (405-483)||(14827140-14827218)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (128-495)||(7127006-7127373)
chr8 (128-490)||(478098-478460)
chr8 (129-476)||(8451179-8451526)
chr8 (128-522)||(40588740-40589119)
chr8 (215-526)||(23853802-23854113)
chr8 (235-522)||(13414913-13415200)
chr8 (279-526)||(185597-185842)
chr8 (264-526)||(37711998-37712254)
chr8 (360-451)||(9496797-9496887)
chr8 (27-62)||(9814873-9814908)
chr8 (97-128)||(9814940-9814971)
chr8 (128-161)||(23853727-23853760)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (128-526)||(28106922-28107320)
chr6 (128-526)||(14679942-14680343)
chr6 (206-526)||(15606000-15606320)
chr6 (338-484)||(19690927-19691073)
chr6 (261-514)||(15053193-15053446)
chr6 (322-483)||(30802040-30802201)
chr6 (190-296)||(11731885-11731991)
chr6 (128-293)||(30802209-30802374)
chr6 (128-261)||(19364217-19364349)
chr6 (217-526)||(29368062-29368363)
chr6 (333-393)||(11731806-11731865)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (128-526)||(36733476-36733877)
chr1 (128-490)||(25682434-25682796)
chr1 (141-526)||(48949730-48950115)
chr1 (128-526)||(51113098-51113496)
chr1 (215-526)||(44527123-44527434)
chr1 (128-526)||(5609122-5609520)
chr1 (128-522)||(4394942-4395335)
chr1 (257-477)||(48166149-48166369)
chr1 (215-526)||(52109324-52109634)
chr1 (122-379)||(24538286-24538544)
chr1 (223-474)||(16816858-16817108)
chr1 (370-526)||(44602777-44602933)
chr1 (175-243)||(17507288-17507356)
chr1 (428-484)||(2885306-2885362)
chr1 (128-158)||(44527048-44527078)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (128-525)||(42340284-42340680)
chr3 (215-526)||(53496902-53497213)
chr3 (140-526)||(55199306-55199692)
chr3 (206-526)||(46007162-46007480)
chr3 (213-397)||(2615361-2615545)
chr3 (258-433)||(647310-647485)
chr3 (240-397)||(48227308-48227465)
chr3 (182-292)||(1070850-1070960)
chr3 (265-399)||(27941127-27941261)
chr3 (138-230)||(36310798-36310890)
chr3 (405-513)||(647182-647290)
chr3 (370-526)||(11020186-11020342)
chr3 (436-526)||(27608909-27608999)
chr3 (405-526)||(2121141-2121262)
chr3 (423-526)||(24176848-24176951)
chr3 (436-526)||(34497378-34497468)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (173-475)||(14-316)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (461-526)||(270-335)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 122 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22767667 - 22767269
Alignment:
Q  122 attaggtgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgg 221  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22767667 attagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactactggttgtgccacacggccaaaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgg 22767568  T
Q  222 gagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccagg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22767567 gagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgacagtaatcatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagattcccggg 22767468  T
Q  322 ggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgt 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22767467 ggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgactgttttggagggggaggcagtagccttactcgctgctattcactttgctgatgt 22767368  T
Q  422 aaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgt 520  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22767367 aaacagatgggaccgggttgtcttcgagtttgactctgatactctagtgcaagctctatcgtcagcgggacatggtaattcagaattctatgcgattgt 22767269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Original strand, 20204738 - 20205136
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||| ||||   || |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20204738 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaaccctcacccttggttgtgcaacacaagcaaaatagagtgtaaggtaataactcagtttgggagaaa 20204837  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||  ||| |||    
T  20204838 ccaaatgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccataaccatattacatcttttacattttgtgctagagactcccgcgggaaat 20204937  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||| |  ||  |||||    
T  20204938 ttatccaggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagtattggagggggaggcagtagccttactcgaggccattcactttgttgttgcgaacag 20205037  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||| | || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20205038 atggaaccgagttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcctctccgggtcatggtgattcaaaattctatgctattgtttctag 20205136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 523
Target Start/End: Original strand, 8387869 - 8388264
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  || |||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8387869 tgcatggcagcaatgacaggaggttcataaacaaccctcatcatcgattgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtctgggagaaa 8387968  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||    
T  8387969 ccgcgtgagacgtggttgaagtacaatgtggatgccgcgtttcatgaccgttaaaatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactctcgtgggcaat 8388068  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||   ||  |||||    
T  8388069 tcattcaggctcaaacgaaatggcaacgaacaaatatgacagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgcggttgggaacag 8388168  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttc 523  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||| || || |||| | ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  8388169 atgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccaggccatggtgattcagaattttatgctattgtttc 8388264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15989159 - 15988755
Alignment:
Q  122 attaggtgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15989159 attagatgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaaccttcactagcggttgtgcaacacgagcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgg 15989060  T
Q  222 gagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccagg 321  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||| |  |  |    
T  15989059 gagaaaccgagcgagacgttgttgaagtgaaatatggatgtcgcgttccatgaccgcaaccatattacaacttttgcgtgttatgtcagagactttcgcg 15988960  T
Q  322 ggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgt 421  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||  || |||||||| |||     
T  15988959 agcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggcagtaaccttactcgaggccctttactttgctgatgc 15988860  T
Q  422 aaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtt 521  Q
     |||| |||||| |||||||||||  |||| | ||| | ||||||||||||| ||| ||||||  | || |||| | ||||  |||||||||  ||||||    
T  15988859 gaacatatgggaccgggttgtcttcaagtccgtctcagctactctagtgcaatctctatcgtcttcaggccatggtgattcggaattctatgttattgtt 15988760  T
Q  522 tctag 526  Q
    |||||    
T  15988759 tctag 15988755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Original strand, 4267894 - 4268280
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| || | |||||| |||||| ||||||||| ||||||            |||||||||||    
T  4267894 tgcatggcagcaatggcaagaggttcataaaaatcgttcaccatcggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaag------------tttgggagaaa 4267981  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||    
T  4267982 ccgaacgagtcatggttaaagtgcaacgtggacgccgcgtttcttgattgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgtgggcaat 4268081  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||  |||||    
T  4268082 ttattcaggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactagaggcccttcactttgctgatgctaacag 4268181  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
     ||||| |||||| |||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  4268182 gtgggaccgggttttcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcatctccgggccatggtgattcggaattctatgctattgtttctag 4268280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 240 - 526
Target Start/End: Original strand, 12660211 - 12660497
Alignment:
Q  240 tggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || || ||||| ||||||||||    
T  12660211 tggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactttcatggacaatttattcgggctc 12660310  T
Q  340 aaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggt 439  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||| |||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||| |||| ||| || || ||    
T  12660311 aaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagtgttagagcgggaggcagtagtcttactcgatgtcattcactttgctaatgtgaacaaatgagaccgtgt 12660410  T
Q  440 tgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    | || | ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||| || | | ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12660411 tatcgtcgagtctgactcagctactctagtgcaagctctatcgtcttcgggccacggtgattcagaattctatgatattgtttctag 12660497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 41941139 - 41940743
Alignment:
Q  130 catggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaacc 229  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| || || | |  | |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  41941139 catgacaataatggcaagaggttcataaacaaccctcgccaccggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaaggtatcaacccaatttgggagaaacc 41941040  T
Q  230 gagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattc 329  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||  ||| ||||     
T  41941039 gagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaactatcttacatcttttgtgtgtagtgttaaagactcccgtgggaaattt 41940940  T
Q  330 attcgggctcaaacgaaatggca-acgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacaga 428  Q
    ||||| |||||||||||||| || |  |  ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||   ||  |||||||||||| |||| |||| |    
T  41940939 attcgagctcaaacgaaatgacatatagaaaaatatgacagttttggagggggagacaatagccttactcaatgtcattcactttgctcatgtgaaca-a 41940841  T
Q  429 tgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
      ||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||| ||| |||||| | ||  |||  | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41940840 ctggaccgggttgtcttcgagtccgactcaactactctagtgcaaactctatcgtctctggaccattgtgattcagaattctatgctattgtttctag 41940743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 205 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26597784 - 26597463
Alignment:
Q  205 gtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttg 304  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |||||||||| || |||||    
T  26597784 gtaacaacacagtttgggagaaatcgtgtaagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgatcatcaacatattacatctttcgcgtgttg 26597685  T
Q  305 tgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgct 404  Q
    ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  26597684 tgttagagactcccgtggacaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgagcaaatatgacaattttggagggggaggcagttgccttactcgatgcc 26597585  T
Q  405 attcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcat 504  Q
    |||||||||||   ||  || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||      
T  26597584 attcactttgcagttgggaatagatgagaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcgg 26597485  T
Q  505 aattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||| ||||  |||||||||||    
T  26597484 aattttatgttattgtttctag 26597463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 215 - 526
Target Start/End: Original strand, 27292304 - 27292615
Alignment:
Q  215 agtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagat 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  27292304 agtttgggagaaaccgaacgagtcatggttgaagtgcaatgtggatgtcacgttccatgatagtaaccatattacatattttgcatgttgtgttagagac 27292403  T
Q  315 tcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttg 414  Q
    || |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  27292404 tctcgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatattattgttttgaagggggaggcaatagccttactagatgcccttcactttg 27292503  T
Q  415 ctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgc 514  Q
    || |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||   | ||||||||||| ||| |||||| || || |||| | |||   |||| |||||    
T  27292504 ctgatgataacagatgggaccgggttgtcttcgagttcgactcatctgctctagtgcaaactctatcgtctccaggccatggtgatttggaattttatgc 27292603  T
Q  515 gattgtttctag 526  Q
     |||||||||||    
T  27292604 tattgtttctag 27292615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 225 - 526
Target Start/End: Original strand, 25730688 - 25730989
Alignment:
Q  225 aaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggc 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||  | |||||||||||||  || |  |||     
T  25730688 aaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggattccgcgttccatgaccgtaaccatattacaattttcacgtgttgtgttagagtctcacgcggga 25730787  T
Q  325 aattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaa 424  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||  ||    
T  25730788 aatttattcgagctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaa 25730887  T
Q  425 cagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttct 524  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| | ||| | |||||||||  |||||||||    
T  25730888 cagatgggactgagttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcgtctcagggtcatggtgattaagaattctatgttattgtttct 25730987  T
Q  525 ag 526  Q
    ||    
T  25730988 ag 25730989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 27533311 - 27532915
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||| |||| | ||||||| | |||||||||| |  | |||||||||||||    
T  27533311 tgcatggcaacaatgacaagaggttcataaacatccctcaccaccggttgtgcaacacagacagaatatagtgcaaggtaatagtttagtttgggagaaa 27533212  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatctttt-gcatgttgtgttagagattcccaggggcaa 326  Q
     || |||||||  |  ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  27533211 tcgcgcgagacgcgactgaagtgtaatgtggatgtcgcgttccatgatcgtaaccagtttacatctttttgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaa 27533112  T
Q  327 ttcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaaca 426  Q
    || ||||||||||||||||||||| | | || |||||  || |||||||||||||||||| |||| ||| | | ||  |||||||||||| |||| || |    
T  27533111 tttattcgggctcaaacgaaatggtagcaggaaaatataacagttttggagggggaggcaatagctttattcgatgtcattcactttgctgatgtgaata 27533012  T
Q  427 gatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttc 523  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||| || | || |||||||  ||  |||||| ||||| |||| | ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  27533011 gatgggaccgggttgttttcgagtccgactttgcttctttagtgcagactttatcgtctccgggtcatggtgattcagaattctttgctattgtttc 27532915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 128 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 30223203 - 30222934
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30223203 tgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacagccctcaccaacagttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaaggtaacaactctgtttgggagaaa 30223104  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||| ||||||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||    
T  30223103 ccgtgcgagacgtggtcaaagtgcaacatggacgtcgcgttccatgactgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagacttccatgggcaat 30223004  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttact 397  Q
    | ||||||||||||||||| | ||| |  || |||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  30223003 ttattcgggctcaaacgaatttgcagcaagcgaatttgacagttttggagagggagacagtagctttact 30222934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 249 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 11375796 - 11375556
Alignment:
Q  249 tgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaat 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |   ||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  11375796 tgcaatgtggatgctgcgttccatgaacgtaaccatattacaacttttgcatgttgtgttagagactctcgcaggtgatttattcggactcaaacgaaat 11375697  T
Q  349 ggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttga 448  Q
    |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||  |||| |||||  ||| ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  11375696 ggcagcgagtaaatatgacagttttggagggggagacagtagccttactcgaggcccttcattttgcggatgcaaatatatgggaccgggttgtctttga 11375597  T
Q  449 gtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgg 489  Q
    |||||| ||   || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  11375596 gtctgattcatctattctagtgcaagctctatcgtctccgg 11375556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34652507 - 34652260
Alignment:
Q  278 taaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggag 377  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| || ||| ||||||| ||| |||| || ||||||| ||| || ||| |     
T  34652507 taaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttatccggtctcaaacaaaa-ggcagcgagcaaatatgacagtgttgtaa 34652409  T
Q  378 ggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctc 477  Q
    ||||||  | || ||||||| | ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  34652408 ggggagataataaccttactcgatgccattcactttgccgatgtgaacagatgggatcgggttgtcttcgagcccgactcgactactctagtgcaagctc 34652309  T
Q  478 aatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
     | |||| | ||| |||| | ||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  34652308 taccgtctctgggccatggtgattcagaattatatgttattgtttctag 34652260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 450
Target Start/End: Original strand, 37448028 - 37448230
Alignment:
Q  248 gtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaa 347  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |  || ||||  |||||| ||||||| |||    
T  37448028 gtgcgatgtggatgtcgtgttccatgaccataaccatcttacatcgtttatatgttgtgttagagactctcgtggacaatgtattcggactcaaacaaaa 37448127  T
Q  348 tggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttg 447  Q
    ||||| || ||||| | ||| || ||| | |||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  37448128 tggcagcgtgcaaacatgacagtgttgaaaggggaggcggtagccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatggaaccgggttgtcttcg 37448227  T
Q  448 agt 450  Q
    |||    
T  37448228 agt 37448230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 288
Target Start/End: Original strand, 16074597 - 16074679
Alignment:
Q  206 taacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatctta 288  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16074597 taacaacttagtttaggagaaaccgtgcgagacgtggtcaaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccatctta 16074679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34653995 - 34653864
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||  |    |||||| |||||  ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  34653995 tgcatggcaacaatggcaaaagattcataaacaaccctcaacaccagttgtgcaacacgtgcagaatagagtgca-ggcaacaactaagtttgggagaaa 34653897  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggat 260  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34653896 ccgcacgagacgtggttgaagtgcaatgtggat 34653864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 37447990 - 37448028
Alignment:
Q  192 aatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccg 230  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37447990 aatagagtgcaaggtaacagctcagtttgggagaaaccg 37448028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 161
Target Start/End: Original strand, 27292229 - 27292262
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacat 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27292229 tgcatgtcaacaatggcaagaggttcataaacat 27292262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 122 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9329011 - 9328608
Alignment:
Q  122 attaggtgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgg 221  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9329011 attagatgcatggcagcaatggcaagatgttcataaacatccatcactactggttgtgccacacggctagaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgg 9328912  T
Q  222 gagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccagg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9328911 gagaaaccgagcgagacatggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcatttgcgtgttgtgttagagattccc-gg 9328813  T
Q  322 ggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgt 421  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9328812 gacaatttattcgagctcaaacgaaatggcaacgggaaaatatgactgttttggagggggaggcagtagccttactcgctgctattcactttgctgatgt 9328713  T
Q  422 aaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtt 521  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  9328712 aaacagatgggaccgggttgtcttggagtctgactctgatactctagtgcaagctctatcgtcagcgggacatggtaattcagaattctatgcgtttgtt 9328613  T
Q  522 tctag 526  Q
    |||||    
T  9328612 tctag 9328608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 129 - 526
Target Start/End: Original strand, 16731717 - 16732114
Alignment:
Q  129 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |    |||||| ||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16731717 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacactcaccaccagttgtgcaacacatgcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaac 16731816  T
Q  229 cgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaatt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16731817 cgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccatgaccgcaaccatattacatcttttgcatgttgtgttagagattcccgcgggcaatt 16731916  T
Q  329 cattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacaga 428  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| |||| |||  ||||||    
T  16731917 tattcgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatatgacagtattggagggggaggcagtagccttactcgaggccattcactctgctgatgcgaacaga 16732016  T
Q  429 tgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||| | || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  16732017 tggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagctctatcatctccgggccatggtgattcagaattctctgctattgtttctag 16732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 129 - 526
Target Start/End: Original strand, 17709851 - 17710248
Alignment:
Q  129 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |    |||||| ||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17709851 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacactcaccaccagttgtgcaacacatgcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaac 17709950  T
Q  229 cgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaatt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17709951 cgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccatgaccgcaaccatattacatcttttgcatgttgtgttagagattcccgcgggcaatt 17710050  T
Q  329 cattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacaga 428  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| |||| |||  ||||||    
T  17710051 tattcgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatatgacagtattggagggggaggcagtagccttactcgaggccattcactctgctgatgcgaacaga 17710150  T
Q  429 tgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||| | || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  17710151 tggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagctctatcatctccgggccatggtgattcagaattctctgctattgtttctag 17710248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Original strand, 22289024 - 22289422
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  || | |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  22289024 tgcatggcagcaatgacaggaggttcataaacaaccctcatcatcggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaag 22289123  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||    
T  22289124 ccgcgtgagacgtggtttaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagattcccgtgggcaat 22289223  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||| | ||| |||||||||||   ||  ||||     
T  22289224 tcattcggactcagacgaaatggcaacgagcaaatatgacagttttggagggggaggtggttgccttactcgatgccattcactttgccgttgggaacaa 22289323  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22289324 atgggaccgggctgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcagaattttatgctattgtttctag 22289422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29201353 - 29200961
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||| || | |||||| |||||| || |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29201353 tgcatgacagcaatgacaagaggttcataaacagccctcaccatcggttgtgcaacacggacaaaatacagtgcaaggtaatagctcagtttgggagaaa 29201254  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattc--ccaggggca 325  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||        |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||      || ||    
T  29201253 ccgcacgagacgtggttgaagtgcaatgttgatgccgctttccat--------ccatattatatcttttgcatgttgtattagagactcatgtgtggcca 29201162  T
Q  326 attcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaac 425  Q
     || |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||| || |   ||||| | ||  |||||||||||| |||| |||    
T  29201161 gtttattcgggctcaaacgaaatgacagcggacaaatatgacagttttggagggggaggtagcatgtttacttgatgtcattcactttgctgatgtgaac 29201062  T
Q  426 agatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttcta 525  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29201061 agatggaaacgggttgtcttcgagtctgactcagctactctagtgcaagctctatcgtctctgggccatggtgattcagaattctatgctattgtttcta 29200962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 240 - 526
Target Start/End: Original strand, 16098385 - 16098671
Alignment:
Q  240 tggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctc 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  16098385 tggttgaagtgcaatgtggacgcatcgttccatgaccgtaaccatattacttcttttgcgtgttgtgttagagactcccataggcaatttattcgggctc 16098484  T
Q  340 aaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggt 439  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||  |||| |||||| |||||    
T  16098485 aaacgaaatggaaacgaacaaatatgacaattttggagggagaggtagtagccttactagaggcccttcaatttgctgatgctaacaaatgggaccgggt 16098584  T
Q  440 tgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||| ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  16098585 tgtcttcgagtccgactcatctactctagtacaagctccatcgtctccgggccatggtgattcagaattctatgatattgtttctag 16098671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 132 - 522
Target Start/End: Original strand, 1581402 - 1581793
Alignment:
Q  132 tggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| | |||||  || | || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1581402 tggcaacaatggcaagaggttcataaacatccctcaccatcggttgtacaacacgaacaaagtatagtgcaacgtaacaactcagtttgggagaaactga 1581501  T
Q  232 gcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcat 331  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||  | || ||    
T  1581502 gcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccataaccatattacatcttttgcgtgttgtgctagagactccagcggatagtttat 1581601  T
Q  332 tcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttgga-gggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatg 430  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||  |  ||||| || |||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||  ||||||||    
T  1581602 ccgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatattatagtttttgaggggggatgcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaacagatg 1581701  T
Q  431 ggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgttt 522  Q
     ||||||||| | || |||||  ||||   ||| ||| ||||| ||| |||||| ||||  |||| | ||||  |||||||||| |||||||    
T  1581702 agatcgggttctattggagtccaactcatctacactaatgcaaactctatcgtctccggaccatggtgattcgaaattctatgccattgttt 1581793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 182 - 457
Target Start/End: Original strand, 17877245 - 17877520
Alignment:
Q  182 acacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaac 281  Q
    |||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  17877245 acacgggcataatcgagtgcaaggtaacaactcaatttgggagaaaccgagcgagacgtggttgaaatgcaatgtggatgtcgcgttccatgattgtaac 17877344  T
Q  282 catcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggaggggg 381  Q
    ||| |||||| | |||| ||| | |||| ||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  17877345 catattacatttgttgcgtgtggcgttatagactcccatgggaagttcattcgtgctcaaacgaaatcgcagcggggaaatatgacagtattggaggggg 17877444  T
Q  382 aggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactc 457  Q
    ||| ||||||||||||    ||  |||||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17877445 aggaagtagccttactcaaggcccttcactttacaaatgcgaacagatggaatcgggttgtcttcgagtctgactc 17877520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 30493967 - 30493620
Alignment:
Q  174 attgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatg 273  Q
    ||||||| ||| || || |||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  30493967 attgtgcaacatgggcataataaagtgcaagataacaacacagtttggaagaaatcgaacgaaacgtggttaaagtgcaatatggatgtcgcattccatg 30493868  T
Q  274 accgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgtttt 373  Q
    || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| | | ||| || ||| |||||    
T  30493867 actgtaaccaacttacatattttgcgtgttgtgttagaaattctcatgggcaatttactcaggctcaaacgaaatggcagcagacaagtatgacagtttt 30493768  T
Q  374 ggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaa 473  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||   ||||||| ||| || | |||||||| || | ||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||    
T  30493767 gga-ggggaggcagtagccttacttgatgtcgttcacttagctgatatgaacagatgagaccaggttgtcttcgagtccgactcaattactctagtgcaa 30493669  T
Q  474 gctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgttt 522  Q
    |||| ||||||  |||| |||| | ||||| |||| ||||| |||||||    
T  30493668 gctctatcgtcttcgggccatggtgattcagaattttatgctattgttt 30493620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34578538 - 34578437
Alignment:
Q  272 tgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgtt 371  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  34578538 tgaccgttaacatattacatcttttgcgtgttgtgttcgaaattcccgtgggcaatttattcgggctcagacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtt 34578439  T
Q  372 tt 373  Q
    ||    
T  34578438 tt 34578437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30824763 - 30824557
Alignment:
Q  243 ttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggct-caa 341  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  |   |||| |||||||||  ||    
T  30824763 ttgaagtgcaatgtggatgctacatttcatgactgtagtcatattacatcttttgcatgttgtgttagagactgccgcgaataatttattcgggctaaaa 30824664  T
Q  342 acgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttg 441  Q
    |  ||| | || |||  ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  30824663 aaaaaaagacagcggataaatatgacagttttgaa--gggaggcagtagccttactcgaggcccttcacttttctaatgcgaacagatgggatcaggttg 30824566  T
Q  442 tctttgagt 450  Q
    |||| ||||    
T  30824565 tcttcgagt 30824557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11746045 - 11745953
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttg 220  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| || |||| |  | |||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11746045 tgcatgacaataatggcaacaggtgcataaacaaccctcaccaccggttgtgcaacacagacagaatagagtgcaaagtaacaactcagtttg 11745953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 522
Target Start/End: Original strand, 3275090 - 3275211
Alignment:
Q  401 tgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataat 500  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||| || |||  |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| || |  || || ||| ||    
T  3275090 tgctattcactttgctgttgggaacatataggactgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcatctctaggccacgatgat 3275189  T
Q  501 tcataattctatgcgattgttt 522  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  3275190 tcataattttatgctattgttt 3275211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Original strand, 16098266 - 16098342
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaag 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| |  | |||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  16098266 tgcatggcatcaatggcaagaggttcctaaacatcattcaccaccggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag 16098342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 122 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 32577456 - 32577058
Alignment:
Q  122 attaggtgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgg 221  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32577456 attagatgcatggcggcaatggcaagaggttcataaacatccgtcactaccgtttgtgcaacacggccagaatatagtgcaaggtaacaactcagtttgg 32577357  T
Q  222 gagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccagg 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32577356 gagaaaccgag-gagacatggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccttaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagattccc-gg 32577259  T
Q  322 ggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgt 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  32577258 ggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgactgttttggagggggaggtactagccttactcgctgctatttactttgctgatgt 32577159  T
Q  422 aaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtt 521  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  32577158 aaacatatgggactgggttgtcttcgagtctgactctgctactctagtgcaagctcaatcgtcagcgggacatggtgattcagaattctatgcgattgtt 32577059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 122 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 49119797 - 49119406
Alignment:
Q  122 attaggtgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgg 221  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  49119797 attagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactattggttgtgccacacggccagaatagagtgtaaggtaacaacccagtttgg 49119698  T
Q  222 gagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccagg 321  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||        
T  49119697 gataaaccaagcgagacatggctgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagattcc---- 49119602  T
Q  322 ggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgt 421  Q
             |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49119601 ---------ttcgggctcaaacgaaatggcaacaggcaaatatgactgttttggagggggaggcagtagccttactcgctgctattcactttgctgatgt 49119511  T
Q  422 aaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtt 521  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||    
T  49119510 aaacagatgggaccgggttgtcttcaagtctgactctgatactctagtgccagctctatcgtcagcgggacatggtaatttagaattatatgcgattgtt 49119411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 122 - 526
Target Start/End: Original strand, 28425972 - 28426364
Alignment:
Q  122 attaggtgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactc-agtttg 220  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  28425972 attagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactattggttgtgccacacggccagaatagagtgtaaggtaacaaccccagtttg 28426071  T
Q  221 ggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccag 320  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||       
T  28426072 ggataaaccaagcgagacatggctgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagattcc--- 28426168  T
Q  321 gggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatg 420  Q
              |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28426169 ----------ttcgggctcaaacgaaatggcaacaggcaaatatgactgttttggagggggaggcagtagccttactcgctgctattcactttgctgatg 28426258  T
Q  421 taaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgt 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  28426259 taaacagatgggaccgggttgtcttcaagtctgactctgatactctagtgccagctctatcgtcagcgggacatggtaatttagaattatatgcgattgt 28426358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37246260 - 37245858
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggta----acaactcagtttggga 223  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||| | || ||||||  |||||||||    |||||| |||||||||    
T  37246260 tgcatggcagcaatggcatgaggttcataaacatccctcactaccggttgtgcaacatgaccggaatagggtgcaaggtacgtaacaacttagtttggga 37246161  T
Q  224 gaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccagggg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||    
T  37246160 gaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaatcgtcttacatcctctgcatgttgtgttagagactcccgaggg 37246061  T
Q  324 caattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaa 423  Q
     |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |    
T  37246060 aaatttattcgggcacaaacgaaatggaaacgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgatgctattcactttgcttatgtga 37245961  T
Q  424 acagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttc 523  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| | ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  37245960 acagatgggaccgggttgtcttcgagtctgactctgctactttagtgcaagctctttcgtctctgggccatggtgattcagaattctatgctattgtttc 37245861  T
Q  524 tag 526  Q
    |||    
T  37245860 tag 37245858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29656069 - 29655672
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |  ||||| ||| || || |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||    
T  29656069 tgcatggcagcaatggaaagaggttcataaacattcatcaccaccgggtgtgcaacatgggcataatagaatgcaaggtaatatctcagtttggaagaaa 29655970  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||  |||||||    
T  29655969 ccgagtgagacatggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgatcgtaaccctcttacatcttttgt-tgttgtgttagaggctcccgtgggcaat 29655871  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| |||| |||||    
T  29655870 ttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgactgttttggagggagaggcagtagccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacag 29655771  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||| | || |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||| | ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  29655770 atggaaccgtgttgtcttcgagtctgactacgctactctagtgcaagctctatcatcttcgggccatggtgattcagaattctatgttattgtttctag 29655672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 129 - 526
Target Start/End: Original strand, 49951097 - 49951494
Alignment:
Q  129 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |    |||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49951097 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacgctcaccaccagttgtgcaacacaggcataatagagtgcaaggtaacaactcagttttggagaaac 49951196  T
Q  229 cgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaatt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||    
T  49951197 cgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcattccatgaccgcaaccatattacatcttttgcatgctgtgttagagattctcgcggccaatt 49951296  T
Q  329 cattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacaga 428  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||  ||||||    
T  49951297 tattcgggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagtattggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaacaga 49951396  T
Q  429 tgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||| | || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||  ||| ||  |||| | || | ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  49951397 tggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagctttatcatcttcgggccgtggtgattcagaattctctgctattgtttctag 49951494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28538189 - 28537793
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |  |||||| | |||||| || | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28538189 tgcatgtcaacaatggcaagaggttcataaacaccactcaccaccgattgtacaacacgggcacagtagagtgcaaggtaacaattcagtttgggagaaa 28538090  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28538089 ccgaacgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgatcgtaaccatattacatattttgcgtgttgtgttagagactcccacgggcaat 28537990  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||| | |||  |||||    
T  28537989 ttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggaaaatatgatagttt--gagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgttgatgcgaacag 28537892  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||   |||| |||||||||||| |||||| | ||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28537891 atgggaccgggttgtgttcaagtccgactcatctactttagtgcaagctctatcgtctctgggccatggtgattcaaaattctatgctattgtttctag 28537793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 123 - 526
Target Start/End: Original strand, 2064631 - 2065034
Alignment:
Q  123 ttaggtgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttggg 222  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| || | |||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2064631 ttagatgcatgacaacaatggcaagaggttcgtaaacaaccttcaccatcggttgtgcaacacggacaaaatagagtgcaaggtaacaactcagtttggg 2064730  T
Q  223 agaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggg 322  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  2064731 agaaactgagcgagtcgtggttgaagtgcaatgtggacgccacgttccatgaccgtaaccatattacatcctctgcgtgttgtgttagagactcccgcgg 2064830  T
Q  323 gcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgta 422  Q
      |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||      
T  2064831 ataatttattcgggctcaaacaaaatgacagcgggcaaatatgacagtattgaagggggaggcagtagccttactcgacgcccttcactttgctgatgag 2064930  T
Q  423 aacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgttt 522  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| || || |||| | ||||  |||| ||||| |||||||    
T  2064931 aacagatggagtcgggttgtctttgagtcggactcatctactctagcccaagctctatcgtctccaggtcatggtgattcgaaattatatgctattgttt 2065030  T
Q  523 ctag 526  Q
    ||||    
T  2065031 ctag 2065034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 51259934 - 51259535
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  || ||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51259934 tgcatggcagcaatggcaggaggttcataaacaaccctcatcatcgattgcgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaa 51259835  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |  |||||||    
T  51259834 ccgcgtgagacgtggttgaactgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgtatgttgtgttagagactctcgtgggcaat 51259735  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggag-ggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaaca 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||  ||  | ||    
T  51259734 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgagcaaatatgacagttttggaggggggaggcagttgccttactcgatgtcattcactttgctgttgggatca 51259635  T
Q  427 gatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    | | ||| | ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| | ||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  51259634 gttcggaccaggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtcttcgggccatggtgattcagaattttatgttattgtttctag 51259535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 128 - 475
Target Start/End: Original strand, 56065412 - 56065759
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||   || |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56065412 tgcatggcagcaatggcaggaggttcataaacaaccctcgtcatcgattgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaa 56065511  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    | | | ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  56065512 ctgtgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgttttagagactcccgtgggcaat 56065611  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||  || |     
T  56065612 tcattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgctgttgggaatat 56065711  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagc 475  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  56065712 atgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagc 56065759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 132 - 473
Target Start/End: Original strand, 21321314 - 21321655
Alignment:
Q  132 tggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccga 231  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||| | |||||  || |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  21321314 tggcagcaatggcaagatgttcataaacatccctcactaccggttgtacaacacgagcataatagagtgcaaggcaacaacacagtttgggagaaatcga 21321413  T
Q  232 gcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcat 331  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |  ||| |||| ||    
T  21321414 gcgaaacgtggttgaagtgcaatgtggatgttgcgttccatgaccgtaaccatattacaacttttgcatgttgtattagagactctcgcgggaaatttat 21321513  T
Q  332 tcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| |  ||  |||||||| || |||  |||||||||    
T  21321514 tcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagttttggagggggagacaatagccttactcgaggcccttcacttttctgatgctaacagatgg 21321613  T
Q  432 gatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaa 473  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||    
T  21321614 gaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaa 21321655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 138 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 51735366 - 51734978
Alignment:
Q  138 caatggcaagaggttcataaacatccatcact-attgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgag 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||  | ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51735366 caatggcaagaggttcataaacatccctcccccatcgattgtgcaacataggcagaatagggtgcaatgtaacatctcagtttgggcgaaaccgagcgag 51735267  T
Q  237 acatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcggg 336  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||   | ||||| |||||||    
T  51735266 acgtggttgaagtgcaacgtggatgccgcgttccatgattgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagacttccgttgacaatttattcggg 51735167  T
Q  337 ctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcg 436  Q
    || |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||| || |||| ||| ||    
T  51735166 cttaaacgaaatgacagcgtgcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgatgccattcactttgctgatgtgaatagatagga-cg 51735068  T
Q  437 ggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
     |||||||| ||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||| | ||  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||    
T  51735067 agttgtcttcgagtcaggctcctctactctagtgcaagctctatcgtctctggaccatggtgattcataattctatgatattgtttctag 51734978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 131 - 526
Target Start/End: Original strand, 55734795 - 55735190
Alignment:
Q  131 atggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccg 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || | |||||| | || | || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55734795 atggcaacaatggcaagatgttcataaacaaccatcatcatcggttgtgcaatacagacaaaatagagtgcaaggtaacaactcggtttgggagaaaccg 55734894  T
Q  231 agcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattca 330  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||      
T  55734895 agcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgcgctccatgatctcaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactcccatgagcaatttg 55734994  T
Q  331 ttcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatg 430  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||| |  ||  |||| |||    
T  55734995 ttcgggctcaaacgaaatggaagcgagcaaatatgacagtattggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgttgttgcgaacacatg 55735094  T
Q  431 ggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    | | |||||| | || ||||| || ||   ||||||||||||||||| ||||||  |||  |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  55735095 gaaccgggttattttcgagtccgattcatctactctagtgcaagctctatcgtcttcggaccatggtgattcagaattctatgctattgtttctag 55735190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18442548 - 18442280
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  |  | |||||| | || | || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18442548 tgcatggcaacaatggcaagatgttcataaacaacc-tcatcaccggttgtgcaatacagacaaaatagagtgcaaggtaacaactctgtttgggagaaa 18442450  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18442449 ccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgcggatgtcgcgttccatgaccgcaaccatattacaacttttgcgtgttgtgttagagactcccatgggcaat 18442350  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttact 397  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18442349 ttattcgggctcaaacgaaatggaagcgggaaaatatgacagtattggagggggaggcagtagccttact 18442280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43840711 - 43840312
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| | || |||| |  |||| ||| ||||   || |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |    
T  43840711 tgcatgacaacaatgacaagagattcataaaaagccctcaccaccgattatgcaacactagcataatagagtgcaagacaacaacttagtttgggagaga 43840612  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    |||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  || ||||    
T  43840611 ccgcacgagacgtggttgaagttcaacgtggatgccgcgttctatgagcataaccatcttacatcttttgcgttttgtgttagagactcccgtggacaat 43840512  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagcc-ttactagctgctattcactttgctaatgtaaaca 426  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||| ||  | || ||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  43840511 ttattcggggtcaaacgaaatggcagcggacaaatatgacagtgttggagggggagacaacaacctttactcgatgccattcactttgctgatgtgaaca 43840412  T
Q  427 gatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
     ||| || ||| ||||||| ||||  ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||  |||  |||| | ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  43840411 aatgagaccggtttgtcttcgagttcgactcagctactctaatgcaagctctatcgtcttcggaccatggtgattcggaattctatgctattgtttctag 43840312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 217 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 41835626 - 41835317
Alignment:
Q  217 tttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattc 316  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  41835626 tttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccacgttccttgaacgtaaccatattacaacttttgcgtgttgtgttagagactc 41835527  T
Q  317 ccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgct 416  Q
     |   | ||||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   |  |||| |||||     
T  41835526 tcgcagacaatttattcgggctcaaacaaaatgacagctggcaaatatgacagttttggagggggatgcagtagccttactcgagacccttcattttgcg 41835427  T
Q  417 aatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcga 516  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||   ||||||||||||| | | |||||| ||||| |||| | ||||  ||| |||||| |    
T  41835426 gatgcaaacagatgggaccgggttgtcttcgagttcgattcatctactctagtgcaaacgctatcgtctccgggccatggtgattcggaatcctatgcta 41835327  T
Q  517 ttgtttctag 526  Q
    ||||||||||    
T  41835326 ttgtttctag 41835317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 372 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 26422762 - 26422612
Alignment:
Q  372 ttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgc 471  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26422762 ttggagagggaggcagtagccttactcgatgctatttactttgctgatgtaaacagatgggatcgggttgtcttcgagtctgactctgatactctagtgc 26422663  T
Q  472 aagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgttt 522  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  26422662 aagctctatcgtcagcgggacatagtgattcagaattctatgcgattgttt 26422612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 47226494 - 47226336
Alignment:
Q  368 tgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactcta 467  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| |  ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||   |||| ||    
T  47226494 tgttttggagggggaggtaatagtcttactcgaggcttttcactttgctgatgcgaacagatgagatcgagttgtgttcgagtccgactcatctacttta 47226395  T
Q  468 gtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    | |||||||| ||||||  | || |||| | ||||| | || ||||| |||||||||||    
T  47226394 gagcaagctctatcgtcttcaggccatggtgattcagatttatatgctattgtttctag 47226336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 438 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 24990027 - 24989988
Alignment:
Q  438 gttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctc 477  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24990027 gttgtctttgagtctgactcagctactctagtgcaagctc 24989988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 128 - 523
Target Start/End: Original strand, 88342 - 88737
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||| | |||||  || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  88342 tgcatgacaacaatggcaagatgttcataaacatccctcactaccggttgtacaacacgagcataatagagtgcaaggcaacaacacagtttgggagaaa 88441  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||    
T  88442 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccgtaaccatattacaacttttgcatgttgtgttagagactctcgcgggcaat 88541  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||| | |||  |||||    
T  88542 ttattcgggctcaaatgaaatggcaatgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgttgatgctaacag 88641  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttc 523  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| |  |  |||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  88642 atgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcgtctcaagatcatggtgattcagaattctatgctattgtttc 88737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12131042 - 12130644
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||| ||||||    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12131042 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcaatttgggagaaa 12130943  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||     
T  12130942 tcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggcaaa 12130843  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  12130842 ttattcgggctcaaacgaaatgacagcgagcaaatatgatagtgttggagggggaggcagtagccttacttgaggctcttcactttgctgatgcaaatag 12130743  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  12130742 atggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgctattatttctag 12130644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34696306 - 34695910
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||  ||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34696306 tgcatggcaacaatggcaagaggttcatacacaaccatcaccattgccggtgcatcacgaacataatagaatgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 34696207  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    | | ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  34696206 ctgcgcgagtcgtggttgaagtacaacgtggatgccacattccatgaccataagcatattacatcttttgcgtgttgcgttagagactcccgtgggcaat 34696107  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | |||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||| || ||    
T  34696106 ttattcgggctcaatcg--atggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcaaggccattcactttgctgatgtcaatag 34696009  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||   |||||| ||||| |||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  34696008 atgggaacgggttgtcttcgagtccgactccgctactctagtgcaagcgttatcgtctccgggtcatggtgattcagaattttatgctattgtttctag 34695910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34718718 - 34718322
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||   ||||  ||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34718718 tgcatggcaacaatggcaagaggttcatacacaaccatcaccattgccggtgcatcacgaacataatagaatgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 34718619  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    | | ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  34718618 ctgcgcgagtcgtggttgaagtacaacgtggatgccacattccatgaccataagcatattacatcttttgcgtgttgcgttagagactcccgtgggcaat 34718519  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | |||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||| || ||    
T  34718518 ttattcgggctcaatcg--atggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcaaggccattcactttgctgatgtcaatag 34718421  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||   |||||| ||||| |||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  34718420 atgggaacgggttgtcttcgagtccgactccgctactctagtgcaagcgttatcgtctccgggtcatggtgattcagaattttatgctattgtttctag 34718322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 44017661 - 44017326
Alignment:
Q  189 cagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatctta 288  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||| | | |||||||||    
T  44017661 cagaataaagtgcaaggtaacagctaagttttgaagaagccgagcgagacatggttgaagtgcaatgcgaattccgcgttctgtgatcatgaccatctta 44017562  T
Q  289 catcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagt 388  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||      
T  44017561 catctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaaataaaatgacaccgtgcaaatatgacagttttggagggggagacaac 44017462  T
Q  389 agccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccg 488  Q
    | ||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||| ||| || |  |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| |||    
T  44017461 aaccttactcgatgccattcacgttgctaatgtgaacatatgagaccaagttgtcttcgagtctgactccgttactttagtgcaagctctatcgtctccg 44017362  T
Q  489 ggacatgataattcataattctatgcgattgtttct 524  Q
      ||||| | ||| | |||| ||||| |||||||||    
T  44017361 aaacatggtcattaagaattatatgccattgtttct 44017326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 18345878 - 18345574
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |  | |||||| |||||| ||||||||| ||||||            ||||| |||||    
T  18345878 tgcatggcagtaatggcaagaggttcataaacatcattcaccaccggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaag------------tttggaagaaa 18345791  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||  ||| |||    
T  18345790 ccgaacgagacatggttgaagtgcaatgtggacgcaacgttccatgagcgtaaccatattacttcttttgcgtgttgtgttagagacttccgtgggtaat 18345691  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||  |||||    
T  18345690 ttatttgaactcaaacgaaatggtaacggacaaatatgacagtttt-gagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgctaacag 18345592  T
Q  428 atgggatcgggttgtctt 445  Q
    |||||||||  |||||||    
T  18345591 atgggatcgaattgtctt 18345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 403 - 526
Target Start/End: Original strand, 9710015 - 9710136
Alignment:
Q  403 ctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattc 502  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  9710015 ctattcactttgctc--gtaaatagatgggaccgggttgtcttcgagtctgactttgatactctagtgcaagctctatcgtcagcgggacatggtaattc 9710112  T
Q  503 ataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  9710113 ataattctatgcaattgtttctag 9710136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 330 - 415
Target Start/End: Original strand, 9709914 - 9709999
Alignment:
Q  330 attcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgc 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  9709914 attcaggctcaaacgaaatggcaacgaacaaatatgacagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgc 9709999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 421
Target Start/End: Original strand, 26198518 - 26198768
Alignment:
Q  176 tgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttc------ 269  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||  |  |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||          
T  26198518 tgtgcaacacgaacagaatagaatgcaaagtaacagcttagttcgggagaaattgcacgagacgtggttgaagtgtattgtggatgtcgcgttccatttt 26198617  T
Q  270 catgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactg 369  Q
    ||| ||| ||| ||| || |||||||||  || ||||||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||  |||||| | ||  |||||| ||| |    
T  26198618 cattaccataatcatattgcatcttttgtgtgctgtgttagagactcatgtgggcaatttattcgagctcaaataaaatggtagcgaacaaatatgacag 26198717  T
Q  370 ttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgt 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||    
T  26198718 ttttggagggggatgcagtagcctt-cttgatgccatttactttgctaatgt 26198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1418159 - 1417987
Alignment:
Q  354 cgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctg 453  Q
    |||||||||| ||| ||| || |||| ||| ||||||||||||| |  |  |||   |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  1418159 cgggcaaatatgacggttatgaagggagagacagtagccttactcgaggtaatttgatttgctgatgcaaacagatgggactgggttgtcttcgagtctg 1418060  T
Q  454 actctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||||   ||||||||| ||||||| || ||| | ||   ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1418059 actcatctactctagttcaagctctattgtctctggactatggtgattcagaattctatgctattgtttctag 1417987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 526
Target Start/End: Original strand, 22845600 - 22845717
Alignment:
Q  409 actttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataatt 508  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||    ||||||||||||||||| |||||| || |  |||| | ||||| ||||    
T  22845600 actttgctgatgcgaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccaactaatctactctagtgcaagctctatcgtctccagatcatggtgattcagaatt 22845699  T
Q  509 ctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||| || |||||||||||    
T  22845700 ctaggctattgtttctag 22845717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 483
Target Start/End: Original strand, 14827140 - 14827218
Alignment:
Q  405 attcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgt 483  Q
    ||||||||| || || | || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  14827140 attcactttactgatatgaatagatgagatcgagttgtctttgaatctgacttagctactctagtgcaagctctatcgt 14827218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 495
Target Start/End: Original strand, 7127006 - 7127373
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||     
T  7127006 tgcatggcagcaatggcatgaggttcataaacatccctcactaccggttgtgcaacacagccagaatagggggcaaggtaacaacttagtttgggagaag 7127105  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  7127106 ccgagcgagacatggttgaagtggaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccgtcttacatcctctgcatgttgtgttagagactctcgggggaaat 7127205  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | ||||| || |||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  7127206 ttattcgtgcacaaatgaaatggaaacgggcaaatatgaaagttttggagggggaggtagtagccttactcgatgctattcactttgctgatgtgaacag 7127305  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatg 495  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  7127306 atgggaccgggttgccttcgagtctgactatgctactttagtgcaagctctttcgtctccgggccatg 7127373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 478460 - 478098
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| | || |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  478460 tgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcaccagtggttgtgcaacacaggcaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaa 478361  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    || |||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||    
T  478360 ccaagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcaacgttccatgaccacaaccatctaacatcttttgtgtgttgtgttagagatttccatggtcaat 478261  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  478260 ttatccgggctcaaacaaaatggcaacgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatag 478161  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccggg 490  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  478160 atgggaccgggttatcttcgaatctgactctactactctagtgcaagctctatcgtctccggg 478098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8451526 - 8451179
Alignment:
Q  129 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaac 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||| ||||   || |||||| |||||||| | |  ||| ||||||||||||    
T  8451526 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacagccatcaccacaggttgtgcaacaccagcaaaatagagtgcaaggtcatagttcaatttgggagaaac 8451427  T
Q  229 cgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaatt 328  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||    || |||||    
T  8451426 cgtgcgagacgtggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccattttacatcttttggatgttgtgttagagactcttgtggacaatt 8451327  T
Q  329 cattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacaga 428  Q
     |||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||| ||| |||| ||| ||    
T  8451326 tattcgggctcaaacaaaaaggaagcgggcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagctttactcgattccattcacttcgctgatgtgaacgga 8451227  T
Q  429 tgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagct 476  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||    
T  8451226 tgggaccgggttgtcttcgagtctgactcatctactttagtgcaagct 8451179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 128 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 40589119 - 40588740
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  | |||||| |||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40589119 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacagccctcaccaccggttgtgcaacacgggcataacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 40589020  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||| |             ||  ||||||    
T  40589019 ccgagtgagacgtggttgaagtgcaacgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccatataacaacttttgcttgtag-------------ca--ggcaat 40588935  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| |  ||  |||  |||||  ||| ||||||    
T  40588934 ttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatataacagttttggagggggaggcagtagccgtactcgaggcccttcgttttgcggatgcaaacag 40588835  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgttt 522  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| || ||| |||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  40588834 atgagaccgggttgtctttgagtctgattcatctactctagtgtaaactctatcgtccccgggccatgatgattctgaattctatgctattgttt 40588740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 215 - 526
Target Start/End: Original strand, 23853802 - 23854113
Alignment:
Q  215 agtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagat 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||     
T  23853802 agtttgggagaaaccgaacgagacgtggttgaagtgcgatgtggacgccgcgttccatgaccgtaactatattacatcttttgcgtgttatgttagagac 23853901  T
Q  315 tcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttg 414  Q
    ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  23853902 tcccgtgggcaatttattcgggttcaaacgaaatgacagcggaaaaatatgacagttttggagggtgaggcagtagccttacttgaggccattcactttg 23854001  T
Q  415 ctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgc 514  Q
     | |||  |||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  23854002 ttgatgctaacagatgagactgagttgtcttcgagtccgactcatcaactctagtgcaagctctatcgtctccgggccatggtgattcagaattctatgc 23854101  T
Q  515 gattgtttctag 526  Q
     |||||||||||    
T  23854102 tattgtttctag 23854113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 522
Target Start/End: Original strand, 13414913 - 13415200
Alignment:
Q  235 agacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcg 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||| | ||||||| |  |  |||||||| |||||    
T  13414913 agacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgttccatgaacgtaaccatattacaacttttgtgtgtttttttagagactttcgcgggcaatttattcg 13415012  T
Q  335 ggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggat 434  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||  |||||  ||| |||||||||||||    
T  13415013 ggctcaaacgaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttccttttgcggatgcaaacagatgggat 13415112  T
Q  435 cgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgttt 522  Q
    || |||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |  |||||| ||||| |||| | ||||  |||| ||||| |||||||    
T  13415113 cgagttgtctttgagtccgattcttctactctagtgcaaggtatatcgtccccgggccatggtgattctgaattttatgctattgttt 13415200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 279 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 185842 - 185597
Alignment:
Q  279 aaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagg 378  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  185842 aaccgtcttacatcttctgcacgttgtgtaagagactccgaggga-aatttatctgggctcaaacgaaatggaaacgggcaaatatgacagttttggagg 185744  T
Q  379 gggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctca 478  Q
    || ||| |||||||||||| | | |||||||||||| | |||| || |||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  185743 gg-aggaagtagccttactcgatactattcactttgttgatgtgaatagatggaaccgggttgtctacgagtctgactctgctactttagtgcaagctct 185645  T
Q  479 atcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
     ||||| ||||  |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  185644 ttcgtctccggaccatggtgattcagaattctatgctattgtttctag 185597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 526
Target Start/End: Original strand, 37711998 - 37712254
Alignment:
Q  264 gcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaata 363  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    |||||||| ||| | ||| |||||||||| || |||| |||||    
T  37711998 gcgtaccatgactgtaattatcttacattttttgcgtgttgtgttagaaactcgtgtgggcaatttatttgagctaaaacgaaatgacagcgggaaaata 37712097  T
Q  364 cgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatac 463  Q
     ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||| |    || |||||||||| | |||| |||||||| |||| |||| ||||  ||| |||| ||| |||    
T  37712098 tgacagttttgaagggg-aggtagtagctttaat----gccattcactttgttgatgtgaacagatgagatcaggttatcttctagtttgaccctgctac 37712192  T
Q  464 tctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||||||| |||||| || |||  ||| ||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  37712193 tctagtgtaagctctattgtcttcgg-acatggtgattcagaatactatgctattgtttctag 37712254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Original strand, 9496797 - 9496887
Alignment:
Q  360 aatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtc 451  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||||| | |||| |||  |||||| || ||||||||||||||    
T  9496797 aatatgacagttttggagggtgaggcagtagccttacttgatgacattcactttgttgatgtgaac-tatgggaccgtgttgtctttgagtc 9496887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 62
Target Start/End: Original strand, 9814873 - 9814908
Alignment:
Q  27 gaaaaattacacaatgtgtcccgtcacttaattcta 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9814873 gaaaaattacacaatttgtcccgtcacttaattcta 9814908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 128
Target Start/End: Original strand, 9814940 - 9814971
Alignment:
Q  97 ggatttaaccttttatgttgttataattaggt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9814940 ggatttaaccttttatgttgttataattaggt 9814971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 161
Target Start/End: Original strand, 23853727 - 23853760
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacat 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23853727 tgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacat 23853760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Original strand, 28106922 - 28107320
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||   || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28106922 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatctttcaccattggttgtgcaacacatgcaaaatagagtgcaaggtaacatctcagtttgggagaaa 28107021  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    || | |||||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  || ||||    
T  28107022 ccaaacgagacgtggttgaagtgcaacgaggaagccacgttccatgatcgtaaccatcttacatctttcgtgtgttgtgttagagactcccgtggacaat 28107121  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| | || ||    
T  28107122 ttattcaggctcaaacgaaatggcagcggacagatatgacagttttggagggggaggcagtagccttacttgatgccattcactttgcaaatatgaatag 28107221  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  28107222 atgggatcacgttgtcttcgagtctaactccgctactctagtgcaagctctatcgtctccgggccatggtgattcagaattctatgttattgtttctag 28107320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Original strand, 14679942 - 14680343
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||| | |  |||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14679942 tgcatggccacaatggaaagaggttcataaacaactctcaccactagttgtgcaacacgagcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 14680041  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattccc---aggggc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||    
T  14680042 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggataccgcgttccatgaccgcaaccacattacatcttttgcatgttgtgttagagactcccgcggcgggc 14680141  T
Q  325 aattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaa 424  Q
    |||| |||  |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||| |||| ||| |||    
T  14680142 aatttattatggctcaaatgaaatggcagcgggaaaatatgacagtattggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactctgctgatgcaaa 14680241  T
Q  425 cagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttct 524  Q
    ||||||| | || ||||||||||| || |||||   ||||||| ||||||||| ||| || |||||   || | ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  14680242 cagatggaaccgagttgtctttgattccgactcgtctactctattgcaagctctatcatctccgggcagtggtgattcaaaattctctgctattgtttct 14680341  T
Q  525 ag 526  Q
    ||    
T  14680342 ag 14680343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 206 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 15606320 - 15606000
Alignment:
Q  206 taacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15606320 taacaactcagtttgggagaaaccgcacgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcatttcacgatcgtaaccatattacatctttttcgtgttgt 15606221  T
Q  306 gttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgcta 405  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15606220 gttagagactcccatgggcaacttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggaaaacatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgatgcca 15606121  T
Q  406 ttcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcata 505  Q
    ||||||||| | |||  |||| |||||| |||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |  || |||| | ||||| |    
T  15606120 ttcactttgttgatgggaacaaatgggaccgggttgtcttcaagtccgactcagctactctagtgcaagctctatcgtctctaggtcatggtgattcaga 15606021  T
Q  506 attctatgcgattgtttctag 526  Q
    |  |||||| |||||||||||    
T  15606020 acactatgctattgtttctag 15606000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 19691073 - 19690927
Alignment:
Q  338 tcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgg 437  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| | | ||  |||||||||||| |||| |||||||| || ||     
T  19691073 tcaaacgaaatgacaacggacaaatatgaccgttttggaaggggaggcaatagccttattcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatgtgaccga 19690974  T
Q  438 gttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtc 484  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  19690973 gttgtcttcgagtctgactcagctactttagtgcaagctctatcgtc 19690927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 15053446 - 15053193
Alignment:
Q  261 gccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaa 360  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |   || ||||| |||||||||||||| | ||| || |||| ||    
T  15053446 gccgcgtttcatgtcggtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagacttcagtggacaatttattcgggctcaaacaagatgacagcgggtaa 15053347  T
Q  361 atacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctga 460  Q
    ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||| | || || | ||| ||   ||||||||| ||||| ||||| |     
T  15053346 atatgatagtgttggagggggaggcagtagccttactcgatgccattcgccttgctgacgtgaaaaaatgagacaaggttgtcttcgagtccgactcagc 15053247  T
Q  461 tactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgc 514  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||| |||| | ||||  ||||||||||    
T  15053246 tactctagtgcaaacgctatcgtcttcgggccatggtgattcggaattctatgc 15053193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 322 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 30802201 - 30802040
Alignment:
Q  322 ggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgt 421  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||    
T  30802201 ggcaatttattcgggcttaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggtgggggaggcagtagccttactagatgccatttactttgcagatgt 30802102  T
Q  422 aaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgt 483  Q
     || | ||||||   ||||||||| ||||| || || | |||| |||||||||||| |||||    
T  30802101 gaaaaaatgggactaggttgtcttcgagtccgattcagctactttagtgcaagctctatcgt 30802040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11731991 - 11731885
Alignment:
Q  190 agaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttac 289  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| || ||||    
T  11731991 agaatatagtgcaaggtaacaactcagcttgggagaaactgagcgagacgtggtggaagtgcaatgtagatgacgcattccatgactgtaacaatattac 11731892  T
Q  290 atctttt 296  Q
    |||||||    
T  11731891 atctttt 11731885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30802374 - 30802209
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| || |||| |  | |||||  |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  30802374 tgcatgacaacaatggtaagacattcataaacagccctcaccaacggttgtggaacacaggcagaatagagtgcaaggtaccaactcagtttgggaaaaa 30802275  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatct 293  Q
    |  |||||||  | ||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  30802274 ctaagcgagaggtagttaaagtgcattgtggatgccgcattcaatgaatgtaaccatcttacatct 30802209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19364349 - 19364217
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| |  |  ||||| |||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364349 tgcatgacaacaatggcgagaggttcataaacaaccctcaccaacgcatgtgcaacacgagcaaaatcgagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 19364250  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatg 261  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  19364249 ctgagcgaga-gtggttaaagtgcattgtggatg 19364217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29368363 - 29368062
Alignment:
Q  217 tttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattc 316  Q
    ||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||| |||||||| || ||  | |||||||||||      || ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  29368363 tttgggagaaatcgaacgaaatgtggttgaagtgaaatgtggacgctgcagttcatgaccgtaa------taaatcttttgcgtgttgtgtttgagactc 29368270  T
Q  317 ccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgct 416  Q
     |  || ||||| |||||  |||||| ||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||| |  ||  |||||||||||    
T  29368269 tcgtggacaatttattcg--ctcaaaagaaatggcagcggataaatatgacagttttggagggggaggcaatatccttactcgaggcccttcactttgct 29368172  T
Q  417 aatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcga 516  Q
     |||  || |||||||| |    ||| || ||||| |||||   |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||  | |||| ||||||||||| |    
T  29368171 gatgctaatagatgggacctaactgttttcgagtccgactcatctactatagtgcaagctctatcgtctccgggtcatagtgattcgtaattctatgcta 29368072  T
Q  517 ttgtttctag 526  Q
    ||| ||||||    
T  29368071 ttgcttctag 29368062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11731865 - 11731806
Alignment:
Q  333 cgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagcct 393  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  11731865 cgggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttgga-ggggaggcagcagcct 11731806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Original strand, 36733476 - 36733877
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatcca-tcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaa 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36733476 tgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatcccctcactaccggttgtgcaacaaggccaaaatagaatgcaaggtaataactgagtttcggagaa 36733575  T
Q  227 accgagcgagacatggttgaagtgcaat--gtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |  || |    
T  36733576 accgagcgagacatggttgaagtgcaatatgtggatgccgcgtttcatgactataaccatcttacaccttttgtgtgttgtgttagagactctcgtggac 36733675  T
Q  325 aattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaa 424  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| |||| ||    
T  36733676 aatttattcgggctcaaacaaaatgacaacgggtaaatatggcagttttggagggggaggcagtagtcttactcaatgttattcactttgctgatgtgaa 36733775  T
Q  425 cagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttct 524  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  36733776 caaatgggaccgggttgtcttcgagtctgactctataactctagtgcaagctatatcgtctccgggccatgatgattcataattctatgttattgtttct 36733875  T
Q  525 ag 526  Q
    ||    
T  36733876 ag 36733877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 490
Target Start/End: Original strand, 25682434 - 25682796
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | |     |||||||| ||| ||  |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  25682434 tgcatggcagcaatggcaagagattcataaacaacccttatcgccgattgtgcaacatgggtagaatagagtgcaaggcaagaactcaatttgggagaaa 25682533  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  25682534 ccgtgtgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgtttcatgaacgtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaat 25682633  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25682634 ttatctgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgatgtcattcactttgctaatgtgaacag 25682733  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccggg 490  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  25682734 atgggaccgggctgtcttcgagtttgactcagctactctagtacaagctctatcgtctccggg 25682796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 141 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 48950115 - 48949730
Alignment:
Q  141 tggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacat 240  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||  || |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |    
T  48950115 tggcaggaggttcataaacaaccctcatcatcgattgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagattgggagaaaccgcgtgagacgt 48950016  T
Q  241 ggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctca 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  48950015 ggttgaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgttggcaattcattcgggctca 48949916  T
Q  341 aacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggtt 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||    
T  48949915 aacgaaatggcaacgagcaaatatgaaagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgcgattcactttgttgttgggaacagatgggaccgggtt 48949816  T
Q  441 gtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||||| ||||   |||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  48949815 gtcttcgagttcaactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgtttctag 48949730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Original strand, 51113098 - 51113496
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  || |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51113098 tgcatggcagcaatggcaggaggttcataaacagccctcatcatcgattgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaa 51113197  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
     || | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  51113198 tcgtgtgagacgtggttaaagtgcaatgtggatgccgtgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaat 51113297  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||| |  ||  |||||    
T  51113298 tcattcggactcaaacgaaatggcaacgagcaaatataaccgttttggagggggaggcagttgccttactcgatgtcattcactttgttgttgggaacag 51113397  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||| | ||| |||| | ||||  | || ||||| |||||||||||    
T  51113398 atgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctctgggccatggtgattcggagttttatgctattgtttctag 51113496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 215 - 526
Target Start/End: Original strand, 44527123 - 44527434
Alignment:
Q  215 agtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagat 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44527123 agtttgggagaaaccgaccgagtcatggttaaagtgcaatgtggacgccgcgttccatgactgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagac 44527222  T
Q  315 tcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttg 414  Q
    ||    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  44527223 tcttgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactagaggcccttcactttg 44527322  T
Q  415 ctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgc 514  Q
    || |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  ||||||||||    
T  44527323 ctgatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactcttgtgcaagctctatcatctccgggccatggtgattcggaattctatgc 44527422  T
Q  515 gattgtttctag 526  Q
     |||||||||||    
T  44527423 tattgtttctag 44527434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 128 - 526
Target Start/End: Original strand, 5609122 - 5609520
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||  |||||| | |  | | |||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5609122 tgcatggtagcaatggcaagaggttcataaacggcctccactatcggtaatacaacacaggcataatagagtgcaaggcaacaactcagtttgggagaaa 5609221  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| || || |||| |||||| || || | |||||    
T  5609222 ccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgcgttccatgactgtaaccatattacaactttcgcgtgctgtgctagagactcacacgagcaat 5609321  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | ||||||||||||||   ||| || ||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |  |   ||||||||| |  ||  |||||    
T  5609322 ttattcgggctcaaactctatgacagcggacaaatatgatagttttgaagggggaggcagtagccttactcgaggtccttcactttgatgttgcgaacag 5609421  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||| |||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5609422 atgagatcgggttgtcttcgagttcgactcatctactctagtgcaaactctatcgtctcagggtcatggtgattcagaattctatgctattgtttctag 5609520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 128 - 522
Target Start/End: Original strand, 4394942 - 4395335
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||  | |  ||| ||||   || || ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4394942 tgcatgacaacaatggcaagaggtttataaacatccctcgctaccggtaatgcaacacatgcataacagagtgcaagacaacaactcagtttgggagaaa 4395041  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| || |  |||||||    
T  4395042 ccgagcgagacgtggctgaagtgcaatgtggaagccgcgttccatgaccgtaaccatatcacaacttttgcatgctgtgttagagactctcgtgggcaat 4395141  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||||||| |||  || ||    
T  4395142 ttatccgggctcaatcgaaatggcagcgggcaaatatgagagtttt-gaaggggaggcactagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaatag 4395240  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgttt 522  Q
    |||||| | |||| |||| |||||  ||||   ||||||||||||||||| |||||| |  || |||| | ||||| |||||||| | |||||||    
T  4395241 atgggaccaggttatcttcgagtccaactcatctactctagtgcaagctctatcgtctcaaggtcatggtgattcagaattctatcctattgttt 4395335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 257 - 477
Target Start/End: Original strand, 48166149 - 48166369
Alignment:
Q  257 ggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgg 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||     
T  48166149 ggatgccacgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagactcccgtggtcaatttattcgggctcaaatgaaatggcagcga 48166248  T
Q  357 gcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgact 456  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||| | ||  |||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  48166249 gcaaatatgacagttttggagtgggagacaatagccttactcgatgtcattcactttgcttatgtgaatatatgggatcgggttgtcttcgagtctgatt 48166348  T
Q  457 ctgatactctagtgcaagctc 477  Q
    | | ||||||| |||||||||    
T  48166349 cagctactctattgcaagctc 48166369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 526
Target Start/End: Original strand, 52109324 - 52109634
Alignment:
Q  215 agtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagat 314  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  52109324 agtttgggagaaaccgacaaagacgtggttgaagtgtaatgtggacgttgtgttccatgaccgtaatcatcttatatcttttgcatgttgtgttagagac 52109423  T
Q  315 tcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttg 414  Q
    |||   || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||| |  |   |||||||||    
T  52109424 tcctgtggacaatttattcaggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgatcattttggagggggatgcagtagccttactcgaggtccttcactttg 52109523  T
Q  415 ctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgc 514  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| || ||| ||||  |||| | ||||  |||||||||     
T  52109524 ctgatgctaacagatgggat-gggttgtctttgagtgtgattcatctactctagtacaagctctattgtctccggaccatggtgattcggaattctatgt 52109622  T
Q  515 gattgtttctag 526  Q
     |||||||||||    
T  52109623 tattgtttctag 52109634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 379
Target Start/End: Original strand, 24538286 - 24538544
Alignment:
Q  122 attaggtgcatggcaacaatggcaagaggtt-cataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttg 220  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    |||||| |||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24538286 attagatgcatgacaacaatggcaagaggtttcataaacatccctcaccaccagttgtgcaacataggcagaatagagtgcaaggtaacatctcagtttg 24538385  T
Q  221 ggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccag 320  Q
     |||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||      
T  24538386 agagaaaccaagtgagacctggtcgaaatgcaatgtggatgccgcgttctataaccgtaaccaagttagatcttttgtgtgttgtgttagagactcccgt 24538485  T
Q  321 gggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggaggg 379  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  24538486 ggataatttattcgggctcaaacgaattggcagcaggcaaatacgacagttttggaggg 24538544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16817108 - 16816858
Alignment:
Q  223 agaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggg 322  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||| || |  |     
T  16817108 agaaaccgagtgagatgtggttgaagtgcaatgcggacgccgcgttccatgtctgtaaccatattacatcttttgtgtattgttttagagactctcgcgt 16817009  T
Q  323 gcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgta 422  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||  |||| |||||| ||| |    
T  16817008 gcaatttattcgagctcaatcaaaatggcagtgggcaaatatgacaattttgga-ggggaggcagtagccttactcgaggcccttcattttgctgatgca 16816910  T
Q  423 aacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaag 474  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   ||||||||| ||||    
T  16816909 aacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcgtctactctagttcaag 16816858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 526
Target Start/End: Original strand, 44602777 - 44602933
Alignment:
Q  370 ttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagt 469  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| | ||  ||||||||| || |||| |||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||    
T  44602777 ttttggagggggagacattagtcttactcgatgtcattcactttactgatgtgaacagatgagaccgggttgccttcgagtctaactccgctactctagt 44602876  T
Q  470 gcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||||| ||| || ||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44602877 gcaagctctatcatctccgggccatggtgattcaaaattctatgctattgtttctag 44602933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 243
Target Start/End: Original strand, 17507288 - 17507356
Alignment:
Q  175 ttgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggt 243  Q
    |||||| |||||  ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17507288 ttgtgcaacacgaacagaagagagtgcaaggtaatatctcagtttgggagaaaccgagcgagacatggt 17507356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 484
Target Start/End: Original strand, 2885306 - 2885362
Alignment:
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtc 484  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  2885306 atggaatcgggttgtcttcgagtcagactcagctactctagtgcaagctctatcgtc 2885362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 158
Target Start/End: Original strand, 44527048 - 44527078
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44527048 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaa 44527078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 42340680 - 42340284
Alignment:
Q  128 tgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |  | |||||| |||||  ||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  42340680 tgcatgacaacaatggcaagagattcataaacagccctcaccaccggttgtgcaacacgtgcagaatagagtctaaggcaacaactcagtttgagagaaa 42340581  T
Q  228 ccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaat 327  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  || ||||    
T  42340580 ccgtgcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgttg-gttctatgtcggcaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgtggacaat 42340482  T
Q  328 tcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacag 427  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||| |||| | ||  |||||||||||  |||| |||||    
T  42340481 ttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggcagatatgacagtgttggagggggaggcaatagccctactcgatgtcattcactttgcagatgtgaacag 42340382  T
Q  428 atgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttcta 525  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42340381 atgggaccgagttgtcttcgagtcagactcagctactttagtgcaagctctgtcgtctccgggccatggtgattcagaattctatgctattgtttcta 42340284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 215 - 526
Target Start/End: Original strand, 53496902 - 53497213
Alignment:
Q  215 agtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagat 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  53496902 agtttgggagaaaccgaccgagtcatggttaaagtgcaatgtggacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagac 53497001  T
Q  315 tcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttg 414  Q
    ||    |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  53497002 tcttgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatgacagcggacaaatgtgacagtttttgagggggaggcagtagccttactagaggcccttcactttg 53497101  T
Q  415 ctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgc 514  Q
    || |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||  ||||||||||    
T  53497102 ctgatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactcttgtgcaagctctatcgtctccgggccatggtgattcggaattctatgc 53497201  T
Q  515 gattgtttctag 526  Q
     |||||||||||    
T  53497202 tattgtttctag 53497213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 140 - 526
Target Start/End: Original strand, 55199306 - 55199692
Alignment:
Q  140 atggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagaca 239  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||  || |||||||| ||||   ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||      
T  55199306 atggcaggaggttcataaacagccctcatcatcgattgtgcaacacatgcagaataaagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaaccgcgtgagatg 55199405  T
Q  240 tggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctc 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  || |||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  55199406 tggttgacgtgcaatgtggatgccacgtttcatgaccgtcaatatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaattcattcgggctc 55199505  T
Q  340 aaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggt 439  Q
    |||||||||| || | |  ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |  || |||||||||||| |||||    
T  55199506 aaacgaaatgacagctgataaatatgacagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgttgttggaaacagatgggaccgggt 55199605  T
Q  440 tgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||||||  |||| ||||| | |||||| |||||||| | ||||||  |||| |||| | ||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  55199606 tgtcttcaagtccgactcagctactctggtgcaagcgctatcgtctacgggtcatggtgattcggaattttatgctattgtttctag 55199692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 526
Target Start/End: Original strand, 46007162 - 46007480
Alignment:
Q  206 taacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgt 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  46007162 taacaactcagtttgggaaaaacaaagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccattattgtaaccatcttatatcttttgcgtgtttt 46007261  T
Q  306 g-ttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgct 404  Q
    | ||||||| || |  ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||| | |||     
T  46007262 gtttagagactctcgtggaaaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatacgacaattttttagggggagacagtagccttacttgatgcc 46007361  T
Q  405 attcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcat 504  Q
    ||||||||||   || | ||||||||||  |||| |||||| ||||| || ||   ||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||   ||||      
T  46007362 attcactttgtcgatatgaacagatggg--cggg-tgtcttcgagtccgattcaactactctagtgcaaactatatcgtctccgggccatggcgattcgg 46007458  T
Q  505 aattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  46007459 aattttatgctattgtttctag 46007480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 397
Target Start/End: Original strand, 2615361 - 2615545
Alignment:
Q  213 tcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagag 312  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||   ||||||||||||    
T  2615361 tcagtttgggagaaatcgtgcaagacgtggttgaaatgcaatgtggataccgcgtttcatgatcataaccatattacattttttgtgcgttgtgttagag 2615460  T
Q  313 attcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttact 397  Q
      |     |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2615461 gcttttgtgggcaattcattcgggctcaaacgaattggcagcgggcaaatatgatagttttggagggggaggcagtagccttact 2615545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 647485 - 647310
Alignment:
Q  258 gatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacggg 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |    |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  647485 gatgccgcgttccatgagcgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagacttctctaggcaatttttccgggctcaaacgaaatggcagcggg 647386  T
Q  358 caaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatggga 433  Q
    | |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  647385 ctaatatgacagttatggagggggaggcagcagccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatggga 647310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 240 - 397
Target Start/End: Original strand, 48227308 - 48227465
Alignment:
Q  240 tggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctc 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||     
T  48227308 tggttgaagtacaatgtggatgccgcatttcattaccgtaaccatgttacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgcgggcaatttattcgggctt 48227407  T
Q  340 aaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttttggagggggaggcagtagccttact 397  Q
    ||||||||  |||  ||| ||| | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  48227408 aaacgaaacagcagtgggaaaacatgactgtattggagtgggatgcagtagccttact 48227465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 292
Target Start/End: Original strand, 1070850 - 1070960
Alignment:
Q  182 acacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaac 281  Q
    |||||| || ||||||  ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  1070850 acacggacataatagagagcaaggtaaaacctcagtttaggagaaaccgcgcgagacatggttgaactgcaatgtggatgttgccttccatgatcgtaac 1070949  T
Q  282 catcttacatc 292  Q
    |||||||||||    
T  1070950 catcttacatc 1070960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27941261 - 27941127
Alignment:
Q  265 cgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatac 364  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||| |||||||||| |  || ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||     
T  27941261 cgtttcatgatcgtaaccatattatattttttgcgtgttgtattagagattctcgaggacaatttattcggactcaaacaaaatggcagcggacaaatat 27941162  T
Q  365 gactgttttggagggggaggcagtagccttactag 399  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27941161 gatagttttggagggggaggcagtagccttactag 27941127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36310890 - 36310798
Alignment:
Q  138 caatggcaagaggttcataaacatccatcactattgattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  36310890 caatggcaagaggttcataaacaaccctcacaactgattgtgcaacacggccataatagagtgcaaggtgacaattcagtttgaaagaaaccg 36310798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 647290 - 647182
Alignment:
Q  405 attcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcat 504  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| || || ||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||      
T  647290 attcactttgctgatgtgaacagatgtgaccgagttatcttcgagtctgactcatctactctagtgcaagctctatcgtctccgggccatggtgattcgg 647191  T
Q  505 aattctatg 513  Q
    |||||||||    
T  647190 aattctatg 647182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11020342 - 11020186
Alignment:
Q  370 ttttggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagt 469  Q
    |||||||||||||| ||  ||| ||||| | ||||||| |||||||| |||  |||| |||| |  |||||||||| ||||||||||    ||||| |||    
T  11020342 ttttggagggggagacatcagctttactcgatgctatttactttgctgatgggaacaaatggaactgggttgtcttcgagtctgacttaactactccagt 11020243  T
Q  470 gcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    | ||| || |||||| ||||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  11020242 gtaaggtctatcgtctccgggccatggtgattcagaattctgtgctattgtttctag 11020186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27608999 - 27608909
Alignment:
Q  436 gggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  27608999 gggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgtttctag 27608909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 526
Target Start/End: Original strand, 2121141 - 2121262
Alignment:
Q  405 attcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcat 504  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    ||||||| ||||||||| || ||| |  || |||||| ||||||    
T  2121141 attcactttgctgatatgaatagatgggatcgtgttgtttttgagtccgacttaactactctaatgcaagctctattgtctctaggccatgattattcat 2121240  T
Q  505 aattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||| | ||| |||||||||||    
T  2121241 aattttgtgctattgtttctag 2121262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 526
Target Start/End: Original strand, 24176848 - 24176951
Alignment:
Q  423 aacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgttt 522  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| | ||||  ||||||| || ||||| |    
T  24176848 aacagatgagattgggttgtcttcgagtctgacacaactactctagtgcaagctctatcgtctctgggtcatggtgattcggaattctaagctattgtat 24176947  T
Q  523 ctag 526  Q
    ||||    
T  24176948 ctag 24176951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34497468 - 34497378
Alignment:
Q  436 gggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||  |||| ||||| |||||| ||||    
T  34497468 gggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgttcctag 34497378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 173 - 475
Target Start/End: Original strand, 14 - 316
Alignment:
Q  173 gattgtgccacacggccagaatagattgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccat 272  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  14 gattgtgcaacacgggcagaacagactgcaagctaacaactcagtttgggagaaactgtgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgtttcat 113  T
Q  273 gaccgtaaccatcttacatcttttgcatgttgtgttagagattcccaggggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatacgactgttt 372  Q
    |||||| | ||| |   |||||| || |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  114 gaccgtcaacatatacnatctttcgcgtgttgttttagagactcccgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagttt 213  T
Q  373 tggagggggaggcagtagccttactagctgctattcactttgctaatgtaaacagatgggatcgggttgtctttgagtctgactctgatactctagtgca 472  Q
     ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||  || | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  214 gggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgctgttgggaatatatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgca 313  T
Q  473 agc 475  Q
    |||    
T  314 agc 316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 335 - 270
Alignment:
Q  461 tactctagtgcaagctcaatcgtcaccgggacatgataattcataattctatgcgattgtttctag 526  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || || |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  335 tactctagtgcaagctctatcatctccaggtcatggtaattcagaattctatgctattgtttctag 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University