View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3010_low_5 (Length: 352)

Name: NF3010_low_5
Description: NF3010
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3010_low_5
NF3010_low_5
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (19-234)||(17793361-17793576)
chr5 (19-234)||(20334082-20334297)
chr5 (229-347)||(17794438-17794556)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (19-234)||(1541239-1541454)
chr4 (19-234)||(25428489-25428704)
chr4 (229-347)||(1542316-1542434)
chr4 (74-234)||(16937837-16937997)
chr4 (74-234)||(15537490-15537650)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (20-234)||(7033942-7034156)
chr6 (229-347)||(7035018-7035136)
chr6 (60-234)||(26254029-26254203)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (21-234)||(26400874-26401087)
chr1 (15-234)||(49211044-49211263)
chr1 (229-347)||(26401949-26402067)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (60-234)||(43441662-43441836)
chr8 (60-234)||(18011204-18011378)
[»] chr7 (4 HSPs)
chr7 (60-234)||(8985996-8986170)
chr7 (60-234)||(35973037-35973211)
chr7 (60-234)||(35994449-35994623)
chr7 (60-234)||(43582877-43583051)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 17793361 - 17793576
Alignment:
Q  19 agagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17793361 agagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggct 17793460  T
Q  119 gtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17793461 gtcaaaatggaagcttacctagaagctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaat 17793560  T
Q  219 tgaagtttcacaagga 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  17793561 tgaagtttcacaagga 17793576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20334297 - 20334082
Alignment:
Q  19 agagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggct 118  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||     
T  20334297 agagctctcttcttgagggacttgtgaaatggatgatgagtcaaatttttcaaaagttgcccctcctctctttgatgggaacaactatgaactttgggca 20334198  T
Q  119 gtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaat 218  Q
    || ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20334197 gtaaaaattgaggcttacctagaagctttggatgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccactgccgaataatccaactatggctcagt 20334098  T
Q  219 tgaagtttcacaagga 234  Q
    |||| | |||||||||    
T  20334097 tgaaatatcacaagga 20334082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Original strand, 17794438 - 17794556
Alignment:
Q  229 caaggaattaaggagttcaaagacctcaaaagtcagaattggcaatggacaaaatatttctgtaaagggaaaaggcaccattgcaattgtaagttgttcg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17794438 caaggaattaaggagttcaaagacctcaaaagtcagaattggcaatggacagaatatttctgtaaagggaaaaggcaccattgcaattgtaagttgttcg 17794537  T
Q  329 ggtacaaaacttatctctg 347  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17794538 ggtacaaaacttatctctg 17794556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 1541239 - 1541454
Alignment:
Q  19 agagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1541239 agagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaggtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaactatgacatttgggct 1541338  T
Q  119 gtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaat 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1541339 gtcaaaatggaggcttacctagaagctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcagt 1541438  T
Q  219 tgaagtttcacaagga 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  1541439 tgaagtttcacaagga 1541454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 25428489 - 25428704
Alignment:
Q  19 agagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggct 118  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||     
T  25428489 agagctctattcttgagggacatgtgaaatggatgatgagtcaggtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaactatgaactttgggca 25428588  T
Q  119 gtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaat 218  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  25428589 gtaaaaatggaggcttacctagaagctttggaagtttgggaagccatagaagaagattatgaagttcctccactgccgaataatccaactatgactcagt 25428688  T
Q  219 tgaagtttcacaagga 234  Q
    |||| | |||||||||    
T  25428689 tgaaatatcacaagga 25428704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Original strand, 1542316 - 1542434
Alignment:
Q  229 caaggaattaaggagttcaaagacctcaaaagtcagaattggcaatggacaaaatatttctgtaaagggaaaaggcaccattgcaattgtaagttgttcg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1542316 caaggaattaaggagttcaaagacctcaaaagtcagaattggcaatggacaaaatattgctgtaaagggaaaaggcaccattgcaattgtaagttgttcg 1542415  T
Q  329 ggtacaaaacttatctctg 347  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1542416 ggtacaaaacttatctctg 1542434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 234
Target Start/End: Original strand, 16937837 - 16937997
Alignment:
Q  74 gttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagagg 173  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| | || |||||||| ||||  || | ||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16937837 gttgctcttccaatctttgatggggagaactatgacatgtgggaagtaagaatggagtcttacctagaggctttggatgtttgggaggccattgaagagg 16937936  T
Q  174 attatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  16937937 attataatgttcctccgctgccgaataatcctaccatggctcagttaaaatatcacaagga 16937997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 234
Target Start/End: Original strand, 15537490 - 15537650
Alignment:
Q  74 gttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagagg 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||| || | ||||||  | ||| | ||  ||||||| |||||||| |   | |||||||    
T  15537490 gttgctcctcctgtctttgatggggagaactatgacctttgggcagtaagaatggagccatacttggaggctttggatgtttgggaggttgttgaagagg 15537589  T
Q  174 attatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  15537590 attatgaagttcctccgctgcagaataatcctaccatggctcagttaaaatatcacaagga 15537650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 7033942 - 7034156
Alignment:
Q  20 gagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7033942 gagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaggtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaactatgacatttgggctg 7034041  T
Q  120 tcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaatt 219  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7034042 tcaaaatggaggcttacctagaagctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcagtt 7034141  T
Q  220 gaagtttcacaagga 234  Q
    |||||||||||||||    
T  7034142 gaagtttcacaagga 7034156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Original strand, 7035018 - 7035136
Alignment:
Q  229 caaggaattaaggagttcaaagacctcaaaagtcagaattggcaatggacaaaatatttctgtaaagggaaaaggcaccattgcaattgtaagttgttcg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7035018 caaggaattaaggagttcaaagacctcaaaagtcagaattggcaatggacaaaatattgctgtaaagagaaaaggcaccattgcaattgtaagttgttcg 7035117  T
Q  329 ggtacaaaacttatctctg 347  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7035118 ggtacaaaacttatctctg 7035136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 26254029 - 26254203
Alignment:
Q  60 caagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttggga 159  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||||||| || | ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26254029 caagtttctcacatgttgctcctcccgtctttgatggggagaactatgacctttgggcagtaagaatggagtcttacctagaggctttggatgtttggga 26254128  T
Q  160 agccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
     ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | |||||||||    
T  26254129 ggccgttgaagaggattatgaagttcttccgctgccgaataatcctaccatggctcaattaaaatatcacaagga 26254203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 26400874 - 26401087
Alignment:
Q  21 agctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26400874 agctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaggtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaactatgacatttgggctgt 26400973  T
Q  121 caaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattg 220  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26400974 caaaatggaggcttacctagaagctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcagttg 26401073  T
Q  221 aagtttcacaagga 234  Q
    ||||||||||||||    
T  26401074 aagtttcacaagga 26401087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 49211044 - 49211263
Alignment:
Q  15 atctagagctctcttcttgaggggcctgtgaaatggatgatgagtcaagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||    
T  49211044 atctagagctctattcttgagggacctgtgaaatggatgatgagtcaaatttttcaaaagttgcccctcctctctttgatgagaacaactatgaactttg 49211143  T
Q  115 ggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttgggaagccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggct 214  Q
     || || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49211144 agcagtaaaaatggaggcttacctagaagctttggaagtttgggaagccatagaagaggattataaagttcctccactgccgaataatccaactatggct 49211243  T
Q  215 caattgaagtttcacaagga 234  Q
    || ||||| | |||||||||    
T  49211244 cagttgaaatatcacaagga 49211263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Original strand, 26401949 - 26402067
Alignment:
Q  229 caaggaattaaggagttcaaagacctcaaaagtcagaattggcaatggacaaaatatttctgtaaagggaaaaggcaccattgcaattgtaagttgttcg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401949 caaggaattaaggagttcaaagacctcaaaagtcagaattggcaatggacaaaatattgctgtaaagggaaaaggcaccattgcaattgtaagttgttcg 26402048  T
Q  329 ggtacaaaacttatctctg 347  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26402049 ggtacaaaacttatctctg 26402067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 43441662 - 43441836
Alignment:
Q  60 caagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttggga 159  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||||||| || | ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  43441662 caagtttgtcacatgttgctcctcccgtctttgatggggagaactatgacctttgggcagtaagaatggagtcttacctagaggctttggatgtttggga 43441761  T
Q  160 agccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
     ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | |||||||||    
T  43441762 ggccgttgaagaggattttgaagttcttccgctgccgaataatcctaccatggctcaattaaaatatcacaagga 43441836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 18011204 - 18011378
Alignment:
Q  60 caagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttggga 159  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||| || ||||||| || | ||||||  ||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  18011204 caagtttctcacaagttgctcctcctgtctttgatggggagaactataacctttgggcagtaagaatggagtcttacctggaggctttggatgtttggga 18011303  T
Q  160 agccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
     ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  18011304 ggctgttgaagaggattatgaagttcctccgctgcagaataatcctaccatggctcagttaaaatatcacaagga 18011378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 8985996 - 8986170
Alignment:
Q  60 caagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttggga 159  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||||||| || | ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8985996 caagtttctcacatgttgctcctcccgtctttgatggggagaactatgacctttgggcagtaagaatggagtcttacctagaggctttggatgtttggga 8986095  T
Q  160 agccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
     ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | |||||||||    
T  8986096 ggccgttgaagatgattatgaagttcttccgctgccgaataatcctaccatggctcaattaaaatatcacaagga 8986170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35973211 - 35973037
Alignment:
Q  60 caagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttggga 159  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||||||| || | ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  35973211 caagtttctcacatgttgctcctcccgtctttgatggggagaactatgacctttgggcagtaagaatggagtcttacctagaggctttggatgtttggga 35973112  T
Q  160 agccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
     ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | |||||||||    
T  35973111 ggccgttgaagaggattgtgaagttcttccgctgccgaataatcctaccatggctcaattaaaatatcacaagga 35973037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35994623 - 35994449
Alignment:
Q  60 caagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttggga 159  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||||||| || | ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  35994623 caagtttctcacatgttgctcctcccgtctttgatggggagaactatgacctttgggcagtaagaatggagtcttacctagaggctttggatgtttggga 35994524  T
Q  160 agccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
     ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | |||||||||    
T  35994523 ggccgttgaagaggattgtgaagttcttccgctgccgaataatcctaccatggctcaattaaaatatcacaagga 35994449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 43582877 - 43583051
Alignment:
Q  60 caagtttttcaaaagttgctcctcctctctttgatgggaacaattatgacatttgggctgtcaaaatggaagcttacctagaatctttggacgtttggga 159  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||| | || |||||| ||| ||| || | ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  43582877 caagtttctcacatgttgctcctcccgtctttgatggggagaactatgacctttaggcagtaagaatggagtcttacctagaggctttggatgtttggga 43582976  T
Q  160 agccatagaagaggattatgaagttcctccgctgccaaataatccaactatggctcaattgaagtttcacaagga 234  Q
     | | | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | |||||||||    
T  43582977 ggtcgttgaagaggattatgaagttcttccgctgccgaataatcctaccatggctcaattaaaatatcacaagga 43583051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University