View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3011_low_20 (Length: 353)

Name: NF3011_low_20
Description: NF3011
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3011_low_20
NF3011_low_20
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (17-317)||(35218524-35218819)
chr1 (103-213)||(15203677-15203788)
chr1 (103-213)||(969909-970020)
chr1 (103-213)||(13995992-13996103)
chr1 (103-213)||(14004106-14004217)
chr1 (101-213)||(16052887-16053000)
chr1 (103-218)||(5216246-5216362)
chr1 (137-213)||(49146749-49146825)
chr1 (103-213)||(1168770-1168881)
chr1 (103-213)||(17592409-17592520)
chr1 (103-213)||(39259758-39259869)
chr1 (103-213)||(52752574-52752685)
chr1 (103-213)||(5216101-5216212)
chr1 (103-213)||(29079224-29079335)
chr1 (103-213)||(40093223-40093334)
chr1 (103-213)||(42369701-42369812)
chr1 (101-213)||(6766159-6766272)
chr1 (106-213)||(43906275-43906383)
chr1 (103-213)||(1171240-1171351)
chr1 (103-213)||(2348455-2348566)
chr1 (103-213)||(8079009-8079120)
chr1 (103-213)||(15553711-15553822)
chr1 (103-213)||(17586747-17586858)
chr1 (103-213)||(20097410-20097521)
chr1 (103-213)||(25897962-25898073)
chr1 (103-213)||(26663885-26663996)
chr1 (103-213)||(33510998-33511109)
chr1 (103-213)||(52697380-52697491)
chr1 (105-218)||(5678471-5678585)
chr1 (104-213)||(29288843-29288953)
chr1 (103-213)||(40150079-40150191)
chr1 (106-213)||(41927852-41927960)
chr1 (103-213)||(23323356-23323467)
chr1 (103-213)||(26579567-26579678)
chr1 (103-213)||(29699560-29699671)
chr1 (103-213)||(7146383-7146496)
chr1 (103-189)||(23318909-23318996)
chr1 (103-213)||(46409999-46410109)
chr1 (103-213)||(51358732-51358843)
chr1 (137-214)||(23499146-23499223)
chr1 (137-213)||(8121588-8121664)
chr1 (103-213)||(15718406-15718517)
chr1 (103-213)||(32672392-32672503)
chr1 (135-214)||(52088350-52088429)
chr1 (106-191)||(1940309-1940394)
chr1 (106-207)||(38829853-38829955)
chr1 (137-213)||(2474311-2474386)
chr1 (137-213)||(12683355-12683431)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (103-219)||(2320557-2320674)
chr8 (103-213)||(2041858-2041969)
chr8 (103-213)||(8022249-8022360)
chr8 (103-213)||(10830716-10830827)
chr8 (103-213)||(10836039-10836150)
chr8 (103-213)||(35117562-35117673)
chr8 (103-213)||(22259987-22260098)
chr8 (103-213)||(33279264-33279375)
chr8 (103-213)||(44804243-44804354)
chr8 (103-218)||(39222023-39222139)
chr8 (103-213)||(13110940-13111051)
chr8 (103-213)||(18595273-18595384)
chr8 (103-213)||(24112537-24112648)
chr8 (103-213)||(28639905-28640016)
chr8 (103-213)||(29939098-29939209)
chr8 (103-213)||(40116737-40116848)
chr8 (103-218)||(5015121-5015237)
chr8 (137-213)||(26782110-26782186)
chr8 (103-213)||(6143833-6143943)
chr8 (103-213)||(9807836-9807946)
chr8 (103-213)||(34679016-34679127)
chr8 (103-213)||(34998235-34998346)
chr8 (137-213)||(14423462-14423538)
chr8 (103-213)||(883334-883445)
chr8 (103-213)||(4036386-4036497)
chr8 (103-213)||(15730329-15730440)
chr8 (103-213)||(34841894-34842005)
chr8 (103-213)||(39207195-39207306)
chr8 (103-191)||(36494810-36494899)
chr8 (106-213)||(145016-145124)
chr8 (103-213)||(41576131-41576242)
chr8 (103-213)||(33286499-33286610)
chr8 (103-213)||(38166292-38166403)
chr8 (120-219)||(12848340-12848440)
chr8 (103-212)||(42572161-42572271)
chr8 (103-188)||(5321097-5321183)
chr8 (103-148)||(18684831-18684877)
chr8 (103-148)||(18730396-18730442)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (103-213)||(6085984-6086095)
chr6 (103-213)||(26946430-26946541)
chr6 (101-213)||(35198852-35198965)
chr6 (103-213)||(53627-53738)
chr6 (103-213)||(3346897-3347008)
chr6 (103-213)||(10550921-10551032)
chr6 (103-213)||(16306530-16306641)
chr6 (103-213)||(20727328-20727439)
chr6 (103-213)||(21894074-21894185)
chr6 (103-213)||(30692564-30692675)
chr6 (105-213)||(2838281-2838390)
chr6 (103-213)||(3955177-3955288)
chr6 (103-213)||(9460332-9460443)
chr6 (103-213)||(18614264-18614375)
chr6 (103-213)||(26703716-26703827)
chr6 (103-213)||(30692754-30692865)
chr6 (112-219)||(29734178-29734286)
chr6 (103-213)||(17260430-17260545)
chr6 (151-213)||(33465088-33465150)
chr6 (137-213)||(23073758-23073834)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (103-213)||(6687911-6688022)
chr4 (106-213)||(26088244-26088352)
chr4 (103-213)||(1756309-1756420)
chr4 (103-213)||(28031994-28032105)
chr4 (103-213)||(35490320-35490431)
chr4 (103-213)||(40428172-40428283)
chr4 (103-213)||(43289507-43289618)
chr4 (103-213)||(44784272-44784383)
chr4 (103-213)||(50053653-50053764)
chr4 (103-213)||(50354341-50354452)
chr4 (103-213)||(54413294-54413405)
chr4 (103-213)||(16701508-16701619)
chr4 (103-213)||(19164058-19164169)
chr4 (103-213)||(31970406-31970517)
chr4 (103-213)||(33704562-33704673)
chr4 (103-213)||(40679581-40679692)
chr4 (103-213)||(44377276-44377387)
chr4 (103-213)||(52139997-52140108)
chr4 (103-213)||(53408817-53408928)
chr4 (103-213)||(54190254-54190365)
chr4 (105-213)||(38055956-38056065)
chr4 (103-210)||(6610797-6610905)
chr4 (106-213)||(15669907-15670015)
chr4 (106-213)||(19912990-19913098)
chr4 (103-210)||(30423087-30423195)
chr4 (106-213)||(44378634-44378742)
chr4 (137-213)||(48748627-48748703)
chr4 (103-213)||(2480873-2480984)
chr4 (103-213)||(9595357-9595468)
chr4 (103-213)||(16704749-16704860)
chr4 (103-213)||(23702126-23702237)
chr4 (103-213)||(34617888-34617999)
chr4 (103-213)||(47632831-47632942)
chr4 (103-213)||(50055682-50055793)
chr4 (103-213)||(53716766-53716877)
chr4 (103-213)||(53876291-53876402)
chr4 (105-218)||(46035704-46035818)
chr4 (105-213)||(27535461-27535570)
chr4 (103-219)||(44547218-44547335)
chr4 (137-213)||(20877678-20877754)
chr4 (106-213)||(27583188-27583296)
chr4 (103-213)||(1617691-1617802)
chr4 (103-213)||(8590152-8590263)
chr4 (103-213)||(15240381-15240492)
chr4 (103-213)||(30172239-30172350)
chr4 (103-213)||(38070629-38070740)
chr4 (103-213)||(45423953-45424064)
chr4 (103-213)||(53353593-53353704)
chr4 (137-213)||(14988507-14988583)
chr4 (103-213)||(10687695-10687806)
chr4 (103-213)||(10901335-10901446)
chr4 (103-213)||(28361116-28361227)
chr4 (103-213)||(37968273-37968384)
chr4 (103-213)||(41852272-41852383)
chr4 (105-218)||(46256636-46256751)
chr4 (103-213)||(27488192-27488301)
chr4 (103-213)||(23775821-23775931)
chr4 (137-213)||(8931574-8931650)
chr4 (103-213)||(48910480-48910591)
chr4 (103-189)||(51780317-51780404)
chr4 (103-187)||(23261275-23261360)
chr4 (137-213)||(33704916-33704991)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (137-213)||(16736713-16736789)
chr5 (103-213)||(8373659-8373770)
chr5 (103-213)||(35419692-35419803)
chr5 (103-213)||(1165112-1165223)
chr5 (103-213)||(1579574-1579685)
chr5 (103-213)||(1605130-1605241)
chr5 (103-213)||(9007352-9007463)
chr5 (103-213)||(16070166-16070277)
chr5 (103-213)||(24105018-24105129)
chr5 (103-213)||(35419969-35420080)
chr5 (103-213)||(35782059-35782169)
chr5 (103-213)||(26602346-26602457)
chr5 (103-213)||(27421399-27421510)
chr5 (103-213)||(27678553-27678664)
chr5 (103-213)||(31883919-31884030)
chr5 (103-213)||(33490560-33490671)
chr5 (103-213)||(33991936-33992047)
chr5 (103-213)||(34708338-34708449)
chr5 (103-217)||(41818042-41818157)
chr5 (103-207)||(19360703-19360808)
chr5 (137-213)||(4121657-4121733)
chr5 (106-213)||(31413327-31413435)
chr5 (137-213)||(27025726-27025802)
chr5 (137-213)||(20988367-20988443)
chr5 (171-212)||(38597243-38597284)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (106-213)||(30266041-30266149)
chr2 (103-213)||(1481329-1481440)
chr2 (103-213)||(4231699-4231810)
chr2 (103-213)||(5734122-5734233)
chr2 (103-213)||(16065795-16065906)
chr2 (103-213)||(16588335-16588446)
chr2 (103-213)||(18806173-18806284)
chr2 (103-213)||(33905344-33905455)
chr2 (101-213)||(26322574-26322687)
chr2 (103-213)||(3872536-3872647)
chr2 (103-213)||(4016766-4016877)
chr2 (103-213)||(6174382-6174493)
chr2 (103-213)||(30419464-30419575)
chr2 (103-213)||(44947016-44947127)
chr2 (103-213)||(851633-851744)
chr2 (103-213)||(2178173-2178284)
chr2 (103-213)||(31516623-31516734)
chr2 (103-213)||(42938520-42938630)
chr2 (104-213)||(28323068-28323178)
chr2 (103-219)||(11707775-11707892)
chr2 (103-218)||(39463740-39463856)
chr2 (103-219)||(22100259-22100376)
chr2 (103-213)||(39636092-39636203)
chr2 (106-219)||(42445145-42445259)
chr2 (103-191)||(1679302-1679391)
chr2 (103-219)||(3587018-3587135)
chr2 (103-216)||(12516457-12516571)
chr2 (103-213)||(1110020-1110131)
chr2 (103-213)||(19383406-19383517)
chr2 (172-213)||(19900730-19900771)
chr2 (103-191)||(45111591-45111679)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (103-213)||(51-162)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (103-213)||(18315-18426)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (103-213)||(7164721-7164832)
chr7 (103-213)||(9453314-9453425)
chr7 (103-213)||(17754324-17754435)
chr7 (103-213)||(43407675-43407786)
chr7 (104-213)||(25749019-25749129)
chr7 (105-213)||(5281429-5281538)
chr7 (103-219)||(36847660-36847777)
chr7 (103-213)||(4476376-4476487)
chr7 (103-213)||(12097145-12097256)
chr7 (103-213)||(16893871-16893982)
chr7 (103-213)||(30180125-30180236)
chr7 (103-213)||(32042079-32042190)
chr7 (103-213)||(33358467-33358578)
chr7 (103-213)||(36890323-36890434)
chr7 (103-213)||(38867346-38867457)
chr7 (103-213)||(48866160-48866271)
chr7 (104-213)||(43021105-43021215)
chr7 (103-213)||(12100540-12100651)
chr7 (103-205)||(15648678-15648781)
chr7 (103-213)||(33845924-33846035)
chr7 (103-213)||(42964148-42964259)
chr7 (103-213)||(46133820-46133931)
chr7 (106-213)||(6395814-6395922)
chr7 (106-213)||(15656614-15656722)
chr7 (137-213)||(22649010-22649086)
chr7 (103-213)||(24791877-24791986)
chr7 (106-213)||(43157281-43157389)
chr7 (103-213)||(3512113-3512224)
chr7 (103-213)||(42205085-42205196)
chr7 (103-213)||(43067520-43067631)
chr7 (103-213)||(37004174-37004286)
chr7 (103-213)||(1803645-1803756)
chr7 (103-213)||(8631477-8631588)
chr7 (103-213)||(42674153-42674264)
chr7 (137-191)||(18120771-18120825)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (103-213)||(15517982-15518093)
chr3 (103-213)||(38856626-38856737)
chr3 (103-213)||(38934667-38934778)
chr3 (103-213)||(42307290-42307401)
chr3 (103-213)||(46451704-46451815)
chr3 (101-213)||(16355247-16355360)
chr3 (103-211)||(32360055-32360164)
chr3 (103-213)||(8043403-8043514)
chr3 (103-213)||(15521369-15521480)
chr3 (103-213)||(25493784-25493895)
chr3 (103-213)||(32244911-32245022)
chr3 (103-213)||(37697489-37697600)
chr3 (103-213)||(44689551-44689662)
chr3 (103-213)||(49129802-49129913)
chr3 (106-213)||(53028843-53028951)
chr3 (103-213)||(20699857-20699968)
chr3 (103-213)||(22175327-22175438)
chr3 (103-213)||(26000070-26000181)
chr3 (103-213)||(29784263-29784374)
chr3 (103-213)||(34700952-34701063)
chr3 (103-213)||(50528164-50528275)
chr3 (103-213)||(50529655-50529766)
chr3 (103-213)||(54533379-54533490)
chr3 (103-213)||(54869430-54869541)
chr3 (105-213)||(29785685-29785794)
chr3 (103-213)||(21581770-21581881)
chr3 (103-213)||(42103603-42103714)
chr3 (137-214)||(12117048-12117125)
chr3 (103-219)||(52922187-52922303)
chr3 (124-219)||(36787507-36787603)
chr3 (103-213)||(20841719-20841830)
chr3 (103-213)||(44608868-44608979)
chr3 (103-213)||(48924578-48924689)
chr3 (104-213)||(24835398-24835508)
chr3 (137-213)||(29446250-29446326)
chr3 (103-205)||(13697446-13697549)
chr3 (103-213)||(26123388-26123503)
chr3 (103-191)||(35227095-35227184)
[»] scaffold1827 (1 HSPs)
scaffold1827 (103-213)||(16-127)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (106-213)||(415-523)
scaffold0444 (103-213)||(1771-1882)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (137-213)||(144740-144816)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (137-213)||(10894-10970)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35218819 - 35218524
Alignment:
Q  17 ttatcaacacagttcactctcccgtttggataaatgacctatacaaatgcttattgcataggagcatatattatgagagcttacatagcttacatcataa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218819 ttatcaacacagttcactctcccgtttggata-----cctatacaaatgcttattgcataagagcatatattatgagagcttacatagcttacatcataa 35218725  T
Q  117 gcgcttatactcaataagtttttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattataaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218724 gcgcttatactcaataagtttttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattataaa 35218625  T
Q  217 atgctaatgaaattttaaaatttgatttaaaataattaaagaatcaaactatcgttattaaagtatatattaagtggcctaaatactaaaatccgagttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218624 atgctaatgaaattttaaaatttgatttaaaataattaaagaatcaaactatcgttattaaagtaaatattaagtggcctaaatactaaaatccgagttt 35218525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15203788 - 15203677
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15203788 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgttattac 15203689  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  15203688 ataagcaattat 15203677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 969909 - 970020
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  969909 agcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgatattac 970008  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  970009 ataagcaattat 970020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 13995992 - 13996103
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13995992 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgatattac 13996091  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  13996092 ataagcaattat 13996103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 14004106 - 14004217
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14004106 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgatattac 14004205  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  14004206 ataagcaattat 14004217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16053000 - 16052887
Alignment:
Q  101 atagcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttatt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16053000 atagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacatt 16052901  T
Q  200 acataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||||    
T  16052900 acataagcaattat 16052887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 218
Target Start/End: Original strand, 5216246 - 5216362
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  5216246 agcttacatcataagctcttatactcaataagctctttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacgtaaattgaagtatttggatgtgttactac 5216345  T
Q  202 ataagcaattataaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5216346 ataaacaattataaaat 5216362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49146825 - 49146749
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49146825 tttatgtttggatatgtacattaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgatattacataagcaattat 49146749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 1168770 - 1168881
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  1168770 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 1168869  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  1168870 ataagcaattat 1168881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17592520 - 17592409
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  17592520 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 17592421  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  17592420 ataagcaattat 17592409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 39259758 - 39259869
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  39259758 agcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 39259857  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  39259858 ataagcaattat 39259869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 52752574 - 52752685
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  52752574 agcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 52752673  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  52752674 ataagcaattat 52752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5216212 - 5216101
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  5216212 agcttacatcataagctcttatacttgataaggtatttatgtttggatatgtacaccaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 5216113  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  5216112 ataagcaattat 5216101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29079335 - 29079224
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  29079335 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 29079236  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  29079235 ataagcaattat 29079224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40093334 - 40093223
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  40093334 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtaacattac 40093235  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  40093234 ataagcaattat 40093223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 42369701 - 42369812
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  42369701 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatatttggatatgtacactgaaaagtacttgcataaattgaagtgtttggatgtgacattac 42369800  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  42369801 ataagcaattat 42369812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6766272 - 6766159
Alignment:
Q  101 atagcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttatt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||| ||||||| ||  |||    
T  6766272 atagcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacactaattgaagtatttggatgtgacatt 6766173  T
Q  200 acataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||||    
T  6766172 acataagcaattat 6766159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43906383 - 43906275
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  43906383 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacata 43906284  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    | |||||||    
T  43906283 aacaattat 43906275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1171351 - 1171240
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  1171351 agcttacatcatgagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataagttgaagtgtttggatgtgacattac 1171252  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  1171251 ataagcaattat 1171240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2348566 - 2348455
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  2348566 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatggttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 2348467  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  2348466 ataagcaattat 2348455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 8079009 - 8079120
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  8079009 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataagttgaagtgtttggatgtgacattac 8079108  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  8079109 ataagcaattat 8079120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 15553711 - 15553822
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  15553711 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 15553810  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  15553811 ataaacaattat 15553822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 17586747 - 17586858
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  17586747 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgcacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 17586846  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  17586847 ataagcaattat 17586858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20097521 - 20097410
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||| ||||||| ||  |||||    
T  20097521 agcttatatcataagctcttatactttataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtttttggatgtgacattac 20097422  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  20097421 ataagcaattat 20097410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25898073 - 25897962
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  25898073 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtagactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 25897974  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  25897973 ataagcaattat 25897962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26663996 - 26663885
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||||||||   ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  26663996 agcttacatcataaattcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 26663897  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  26663896 ataagcaattat 26663885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33511109 - 33510998
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  33511109 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttggatctgacattac 33511010  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||| ||||||    
T  33511009 ataagaaattat 33510998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52697491 - 52697380
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  52697491 agcttacatcataagttcttatacttgataagttatttatgtttggatatatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 52697392  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  52697391 ataagcaattat 52697380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5678585 - 5678471
Alignment:
Q  105 cttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||   |||||| |  || |||||||||||||||||| || || || |||||    
T  5678585 cttacatcataagctcttatactcaataagttctttatatttggatatgtatgctaaaaagtatttacataaattgaagtgtttgaatgtgctactacat 5678486  T
Q  204 aagcaattataaaat 218  Q
    || ||||||||||||    
T  5678485 aaacaattataaaat 5678471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29288953 - 29288843
Alignment:
Q  104 gcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattaca 202  Q
    ||||| || |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  29288953 gcttatattataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattaca 29288854  T
Q  203 taagcaattat 213  Q
    |||||||||||    
T  29288853 taagcaattat 29288843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40150191 - 40150079
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaa-tgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttatta 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||    
T  40150191 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggaagtgacatta 40150092  T
Q  201 cataagcaattat 213  Q
    |||||||||||||    
T  40150091 cataagcaattat 40150079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 41927852 - 41927960
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||   |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  41927852 ttacatcataagtttttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattatata 41927951  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  41927952 agcaattat 41927960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23323467 - 23323356
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  23323467 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttaagtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 23323368  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  23323367 ataagcaattat 23323356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 26579567 - 26579678
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| || ||||||||| ||  |||||    
T  26579567 agcttacatcataagcttttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaaatgtttggatgtgacattac 26579666  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  26579667 ataagcaattat 26579678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29699671 - 29699560
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagttttt-atgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||| | || ||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  29699671 agcttacatcataagcttttatacttgataagctattcatgtttggatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattac 29699572  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  29699571 ataagcaattat 29699560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7146496 - 7146383
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatg--cttgcataaattgaagtgtttggatatgttatt 199  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |  |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  7146496 agctttcatcataagctcttatacttaataagctatttatgtttggatatgtatacaaaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacatt 7146397  T
Q  200 acataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||||    
T  7146396 acataagcaattat 7146383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Original strand, 23318909 - 23318996
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagttt-ttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttgg 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  23318909 agcttacatcataagctcttatacttgataagttcattatgtttggatatgtgtattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgg 23318996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46410109 - 46409999
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | | | ||||||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  46410109 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacatacataaattgaagtgttt-gatgtgacattac 46410011  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  46410010 ataagcaattat 46409999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 51358732 - 51358843
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||  |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||    
T  51358732 agcttacatcataagttcttatatttgataagctatttatgtttggatatgcacactaaaaagtacttacataaattgaagtatttggatgtgacattac 51358831  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  51358832 ataagcaattat 51358843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23499223 - 23499146
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattata 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  23499223 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttagataaattgaaatgtttggatgtgacattacataagcaattata 23499146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8121664 - 8121588
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  8121664 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacctacataaattgaagtgtttggatgtgacattatataagcaattat 8121588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15718517 - 15718406
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||||| || ||||  ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||    
T  15718517 agcttacatcataagttcttatacttgataagctatttatgtttggatatatacacaaaaaagtacttacataaattaaagtgttttgatgtgacattac 15718418  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  15718417 ataagcaattat 15718406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32672503 - 32672392
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  32672503 agcttataccataagctcttatacttgataagctatttatatttggatatgtacattgaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattac 32672404  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  32672403 ataaacaattat 32672392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52088429 - 52088350
Alignment:
Q  135 tttttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattata 214  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  52088429 tttttatgtttagatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtatggatgtgacattacataagcaattata 52088350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 191
Target Start/End: Original strand, 1940309 - 1940394
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggat 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  1940309 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaag-tacttacataaattgaagtgtttggat 1940394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38829955 - 38829853
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||| | |||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  38829955 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttagatatgtacactgaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattacata 38829856  T
Q  205 agc 207  Q
    |||    
T  38829855 agc 38829853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2474386 - 2474311
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2474386 tttatgtttggatatgtacaccaaaaagtacttacataa-ttgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 2474311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12683431 - 12683355
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||    
T  12683431 tttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtaacattacataagtaattat 12683355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Original strand, 2320557 - 2320674
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||     
T  2320557 agcttacatcataagctcttatactcaataagctctttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtatcattat 2320656  T
Q  202 ataagcaattataaaatg 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  2320657 ataagcaattatgaaatg 2320674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 2041858 - 2041969
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2041858 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgatattac 2041957  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  2041958 ataagcaattat 2041969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8022360 - 8022249
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8022360 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatatgacattac 8022261  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  8022260 ataagcaattat 8022249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 10830716 - 10830827
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  10830716 agcttacatcataagctcttatacttaataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 10830815  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  10830816 ataagcaattat 10830827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 10836039 - 10836150
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  10836039 agcttacatcataagctcttatacttaataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 10836138  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  10836139 ataagcaattat 10836150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 35117562 - 35117673
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  35117562 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttgcataaattgaagtgtttggatgtgacattac 35117661  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  35117662 ataagcaattat 35117673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 22259987 - 22260098
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  22259987 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 22260086  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  22260087 ataagcaattat 22260098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33279375 - 33279264
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  33279375 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 33279276  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  33279275 ataagcaattat 33279264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 44804243 - 44804354
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  44804243 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 44804342  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  44804343 ataagcaattat 44804354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39222139 - 39222023
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  39222139 agcttacatcataagctcttatactcgataagctctttatgtttggatatgtacacttaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 39222040  T
Q  202 ataagcaattataaaat 218  Q
    | || ||||||||||||    
T  39222039 agaaacaattataaaat 39222023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13111051 - 13110940
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  13111051 agcttacgtcataagctcttatacttaataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctcacattac 13110952  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  13110951 ataagcaattat 13110940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18595384 - 18595273
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  18595384 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 18595285  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  18595284 ataagcaattat 18595273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 24112537 - 24112648
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  24112537 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 24112636  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  24112637 ataagcaattat 24112648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28640016 - 28639905
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  28640016 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 28639917  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  28639916 ataagcaattat 28639905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29939209 - 29939098
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  29939209 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttttgatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 29939110  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  29939109 ataagcaattat 29939098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 40116737 - 40116848
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  40116737 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 40116836  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  40116837 ataagcaattat 40116848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5015237 - 5015121
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5015237 agcttatatcataagtacttatactcgataaactctttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatatgacattac 5015138  T
Q  202 ataagcaattataaaat 218  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  5015137 ataagtaatcataaaat 5015121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 26782110 - 26782186
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26782110 tttatgtttggatatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 26782186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 6143833 - 6143943
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  6143833 agcttacgtcataagctcttatacttaataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatct-acattac 6143931  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  6143932 ataagcaattat 6143943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9807946 - 9807836
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  9807946 agcttacgttataagctcttatacttaataagttatttatgtttggatat-tacactaaaaaatacttacataaattgaagtgttttgatctgacattac 9807848  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  9807847 ataagcaattat 9807836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 34679016 - 34679127
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  34679016 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtactttcataaattgaattgttttgatatgacattac 34679115  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  34679116 ataagcaattat 34679127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 34998235 - 34998346
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  34998235 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgtatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatttgacattac 34998334  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||| ||||||    
T  34998335 ataagtaattat 34998346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14423538 - 14423462
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  14423538 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 14423462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 883445 - 883334
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || || | || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  883445 agcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttagatatattcactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 883346  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  883345 ataagcaattat 883334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4036497 - 4036386
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||| |||||||  |||||||  |||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  4036497 agcttacaacataagcttttatactttataacttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattat 4036398  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  4036397 ataagcaattat 4036386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15730440 - 15730329
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  15730440 agcttacatcataaactcttctacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttagatgtgacattac 15730341  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  15730340 ataaacaattat 15730329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 34841894 - 34842005
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||      
T  34841894 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatttacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattca 34841993  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  34841994 ataagcaattat 34842005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39207306 - 39207195
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||| ||  |||||    
T  39207306 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaaatgtttagatgtgacattac 39207207  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  39207206 ataagcaattat 39207195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36494899 - 36494810
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggat 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  36494899 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatctttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggat 36494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 145124 - 145016
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||    
T  145124 ttacatcataagttcttatacttaataagctatttatgtttgaatatgtacacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaatgtgatatcacata 145025  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  145024 agcaattat 145016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41576242 - 41576131
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagttttta-tgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||| | |||  || ||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  41576242 agcttacatcataagctcttatacttgataagctattaatgtttggatatgtacactaaaaagtacttagatgaattgaagtgtttggatgtgacattgc 41576143  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  41576142 ataagcaattat 41576131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 33286499 - 33286610
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| |  |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  33286499 agcttacatcataaacttttatacttgataagctatttatgtttggatatgtatacaaaaaagtacatacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 33286598  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  33286599 ataagcaattat 33286610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 38166292 - 38166403
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||  ||||| |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  38166292 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggctatgtatacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 38166391  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||| ||||    
T  38166392 ataagcagttat 38166403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 219
Target Start/End: Original strand, 12848340 - 12848440
Alignment:
Q  120 cttatactcaataagtt--tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattataaaa 217  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||| | | | | ||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||    
T  12848340 cttatactcaataagttcttttaagtttggatatgtacactaaaaagtacatacgtaaattgaagtgtttgga-ctgtcattatataagcaattatgaaa 12848438  T
Q  218 tg 219  Q
    ||    
T  12848439 tg 12848440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42572271 - 42572161
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| | || |||| |||||| | ||| |||||||| |||| |||| || ||  |||||    
T  42572271 agcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatatttgaatatttacactaaaaagtacttacataaattaaagtatttgaatgtgacattac 42572172  T
Q  202 ataagcaatta 212  Q
    |||||||||||    
T  42572171 ataagcaatta 42572161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5321183 - 5321097
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttg 188  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  5321183 agcttacatcataagttcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacatagattgaagtgtttg 5321097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18684877 - 18684831
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataag-tttttatgtttgga 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18684877 agcttacatcataagctcttatactcaataagctctttatgtttgga 18684831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18730442 - 18730396
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataag-tttttatgtttgga 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18730442 agcttacatcataagctcttatactcaataagctctttatgtttgga 18730396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 6085984 - 6086095
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  6085984 agcttatatcataagctcttatacttaataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 6086083  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  6086084 ataagcaattat 6086095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 26946430 - 26946541
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  26946430 agcttatatcataagctcttatactcaataagctatttacgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatttgacattac 26946529  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  26946530 ataagcaattat 26946541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35198965 - 35198852
Alignment:
Q  101 atagcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttatt 199  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  35198965 atagcttacatcataagctctcatacttgataagctatttatatttggatatgtacattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacatt 35198866  T
Q  200 acataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||||    
T  35198865 acataagcaattat 35198852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53738 - 53627
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  53738 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 53639  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  53638 ataagcaattat 53627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 3346897 - 3347008
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  3346897 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 3346996  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  3346997 ataagcaattat 3347008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10551032 - 10550921
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  10551032 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 10550933  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  10550932 ataagcaattat 10550921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 16306530 - 16306641
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  16306530 agcttacatcataagctcttatactagataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 16306629  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  16306630 ataagcaattat 16306641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20727439 - 20727328
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  20727439 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 20727340  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  20727339 ataaacaattat 20727328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21894185 - 21894074
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  21894185 agcttacatcataagctcttatactttataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 21894086  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  21894085 ataagcaattat 21894074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30692675 - 30692564
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30692675 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 30692576  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  30692575 ataagcaattat 30692564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2838390 - 2838281
Alignment:
Q  105 cttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacat 203  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  2838390 cttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacat 2838291  T
Q  204 aagcaattat 213  Q
    ||||||||||    
T  2838290 aagcaattat 2838281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 3955177 - 3955288
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| || |||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  3955177 agcttatatcataagctctcatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 3955276  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  3955277 ataagcaattat 3955288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9460443 - 9460332
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  9460443 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatttacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 9460344  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||||| |||||    
T  9460343 ataagcgattat 9460332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18614375 - 18614264
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  18614375 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatatttggatatgtacactgaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 18614276  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  18614275 ataagcaattat 18614264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 26703716 - 26703827
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| || |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || |||||     
T  26703716 agcttatatgataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatttgatattat 26703815  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  26703816 ataagcaattat 26703827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 30692754 - 30692865
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30692754 agcttacatcataagcttttatacttgataagttatttacgtttggatatgtacacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 30692853  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  30692854 ataagcaattat 30692865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 219
Target Start/End: Original strand, 29734178 - 29734286
Alignment:
Q  112 cataagcgcttatactcaataag-tttttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaat 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||| | |||| | |||||||||||     
T  29734178 cataagctcttatactcaataaactttttatgtttgaatatgtacattaaaaagtacttatataaattgaaatgtttgaaaatgtcactacataagcaaa 29734277  T
Q  211 tataaaatg 219  Q
    ||| |||||    
T  29734278 tatgaaatg 29734286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 17260430 - 17260545
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcata----aattgaagtgtttggatatgtta 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||    ||||||||||||||||| ||  |    
T  17260430 agcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttaaataaattaattgaagtgtttggatgtgaca 17260529  T
Q  198 ttacataagcaattat 213  Q
    ||||||||| ||||||    
T  17260530 ttacataagtaattat 17260545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33465150 - 33465088
Alignment:
Q  151 tgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  33465150 tgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 33465088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 23073758 - 23073834
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  23073758 tttatgtttggatatatacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttggatttgacattacataagcaattat 23073834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 6687911 - 6688022
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6687911 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatatgacattac 6688010  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  6688011 ataagcaattat 6688022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 26088244 - 26088352
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26088244 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttccataaattgaagtgtttggatttgttattacata 26088343  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    || ||||||    
T  26088344 agtaattat 26088352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 1756309 - 1756420
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  1756309 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 1756408  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  1756409 ataagcaattat 1756420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 28031994 - 28032105
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  28031994 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 28032093  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  28032094 ataagcaattat 28032105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 35490320 - 35490431
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  35490320 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 35490419  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  35490420 ataagcaattat 35490431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 40428172 - 40428283
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  40428172 agcttacatcataagctcttatacttgataatttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 40428271  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  40428272 ataagcaattat 40428283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 43289507 - 43289618
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  43289507 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 43289606  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  43289607 ataagcaattat 43289618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 44784272 - 44784383
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  44784272 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 44784371  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  44784372 ataagcaattat 44784383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 50053653 - 50053764
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  50053653 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 50053752  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  50053753 ataagcaattat 50053764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50354452 - 50354341
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  50354452 agcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttggatgtgacattac 50354353  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  50354352 ataagcaattat 50354341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54413405 - 54413294
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  54413405 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgatattac 54413306  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  54413305 ataagcaattat 54413294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16701619 - 16701508
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16701619 agcttacatcataagcttttatacttgataagttatttatgtttagatatgtacatcaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 16701520  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  16701519 ataagcaattat 16701508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 19164058 - 19164169
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  19164058 agcttacatcataaactcttatatttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatttgacattac 19164157  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  19164158 ataagcaattat 19164169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31970517 - 31970406
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  31970517 agcttatatcataatctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 31970418  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  31970417 ataagcaattat 31970406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33704673 - 33704562
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  33704673 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 33704574  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  33704573 ataagcaattat 33704562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 40679581 - 40679692
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  || |||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  40679581 agcttatatcataagcttttatacttaataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtatttacataaattaaagtgtttggatatgacattac 40679680  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  40679681 ataagcaattat 40679692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44377387 - 44377276
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  44377387 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 44377288  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  44377287 ataagcaattat 44377276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52140108 - 52139997
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  52140108 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactagaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 52140009  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  52140008 ataagcaattat 52139997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53408928 - 53408817
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  53408928 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 53408829  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  53408828 ataaacaattat 53408817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54190365 - 54190254
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  54190365 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 54190266  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  54190265 ataagcaattat 54190254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38056065 - 38055956
Alignment:
Q  105 cttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  38056065 cttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacat 38055966  T
Q  204 aagcaattat 213  Q
    ||||||||||    
T  38055965 aagcaattat 38055956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 6610797 - 6610905
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| |||||||||  |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  6610797 agcttatatcataagcttttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 6610896  T
Q  202 ataagcaat 210  Q
    |||||||||    
T  6610897 ataagcaat 6610905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15670015 - 15669907
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15670015 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaataagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacata 15669916  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  15669915 agcaattat 15669907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 19912990 - 19913098
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  19912990 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaataagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacata 19913089  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  19913090 agcaattat 19913098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 30423087 - 30423195
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30423087 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtatactaaaaagtgcttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 30423186  T
Q  202 ataagcaat 210  Q
    |||||||||    
T  30423187 ataagcaat 30423195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 44378634 - 44378742
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  44378634 ttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacata 44378733  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    | |||||||    
T  44378734 aacaattat 44378742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48748703 - 48748627
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48748703 tttatgtttggatatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 48748627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 2480873 - 2480984
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||     
T  2480873 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttagatgtgacattat 2480972  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  2480973 ataagcaattat 2480984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 9595357 - 9595468
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  9595357 agcttacattataagttcttatacttgataagttatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 9595456  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  9595457 ataagcaattat 9595468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16704860 - 16704749
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16704860 agcttacatcataagctcttatacttgataagtcatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattac 16704761  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||| ||||||    
T  16704760 ataagtaattat 16704749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 23702126 - 23702237
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||| || ||  |||||    
T  23702126 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttgaatgtgacattac 23702225  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  23702226 ataagcaattat 23702237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34617999 - 34617888
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  34617999 agcttacatcataagctcttatacttgataaattatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatttgacattat 34617900  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  34617899 ataagcaattat 34617888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47632942 - 47632831
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  47632942 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatatttggatttgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttgaatgtgacattac 47632843  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  47632842 ataagcaattat 47632831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50055793 - 50055682
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  50055793 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttggatctgagattac 50055694  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  50055693 ataagcaattat 50055682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 53716766 - 53716877
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||     
T  53716766 agcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacaatat 53716865  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  53716866 ataagcaattat 53716877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53876402 - 53876291
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  53876402 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattgc 53876303  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  53876302 ataagcaattat 53876291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46035818 - 46035704
Alignment:
Q  105 cttacatcataagcgcttatactcaataagtttttat-gtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| || | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||| || | ||    
T  46035818 cttacatcataagctcttatactcaataagcttttttcgtttagataagtacattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaatgtgtcatgatat 46035719  T
Q  204 aagcaattataaaat 218  Q
    ||||| |||||||||    
T  46035718 aagcatttataaaat 46035704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Original strand, 27535461 - 27535570
Alignment:
Q  105 cttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacat 203  Q
    |||||||||||||  |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  27535461 cttacatcataagttcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacat 27535560  T
Q  204 aagcaattat 213  Q
    ||||||||||    
T  27535561 aagcaattat 27535570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Original strand, 44547218 - 44547335
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | |||   ||||||||||||||| ||| | | ||||     
T  44547218 agcttacatcataagctcttatgctcaataagctctttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttatgtaaattgaagtgttttgatgtatcattat 44547317  T
Q  202 ataagcaattataaaatg 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  44547318 ataagcaattatgaaatg 44547335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20877754 - 20877678
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  20877754 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 20877678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 27583188 - 27583296
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  || |||||    
T  27583188 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttttgatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacataacata 27583287  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  27583288 agcaattat 27583296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1617802 - 1617691
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  1617802 agcttacataataaactcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 1617703  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  1617702 ataagcaattat 1617691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 8590152 - 8590263
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  8590152 agcttacattataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataagttgaagtgtttggatgtgacattac 8590251  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    | ||||||||||    
T  8590252 aaaagcaattat 8590263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 15240381 - 15240492
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||  |||| |||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  15240381 agcttacatcataagttcttaaacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 15240480  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  15240481 ataatcaattat 15240492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30172350 - 30172239
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  30172350 agcttaaatcataagctcttatacttgataagttatttatgttttgatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgttacattac 30172251  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  30172250 ataagcaattat 30172239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 38070629 - 38070740
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  38070629 agcttacatcataaactcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 38070728  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  38070729 ataaacaattat 38070740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 45423953 - 45424064
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||     
T  45423953 agcttacatcataaactcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtatggatgtgacattat 45424052  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  45424053 ataagcaattat 45424064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53353704 - 53353593
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  53353704 agcttacgtcataagctcttatacttaataacatatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttggatctgacattaa 53353605  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  53353604 ataagcaattat 53353593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14988583 - 14988507
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  14988583 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaatcgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 14988507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 10687695 - 10687806
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  10687695 agcttaaatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgtatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattac 10687794  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||| ||||||    
T  10687795 ataagtaattat 10687806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 10901335 - 10901446
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  10901335 agcttaaatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgtatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattac 10901434  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||| ||||||    
T  10901435 ataagtaattat 10901446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28361227 - 28361116
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||  |||||| |  ||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  28361227 agcttacatcataagttcttatatttgataagctatttatatttggatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 28361128  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  28361127 ataagcaattat 28361116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 37968273 - 37968384
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||  ||  |||||    
T  37968273 agcttacatcataagctcttatacttgataaacaatttatgtttggatatgtacactaaaaagtactttcataaattgaaatgtttggaagtgacattac 37968372  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  37968373 ataagcaattat 37968384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 41852272 - 41852383
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||    
T  41852272 agcttacgtcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacactac 41852371  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||| ||||    
T  41852372 ataagcagttat 41852383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Original strand, 46256636 - 46256751
Alignment:
Q  105 cttacatcataagcgcttatactcaataag-tttttatgt-ttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattaca 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||| || ||| || | |    
T  46256636 cttacatcataagctcttatactcaataagcttttttcgtgttggataagtacattaaaaagtacttacacaaattgaagtgtttgaatgtgtcatgata 46256735  T
Q  203 taagcaattataaaat 218  Q
    |||||| |||||||||    
T  46256736 taagcatttataaaat 46256751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 27488192 - 27488301
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||  |  |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  27488192 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaagta--cttaaataaattgaagtgtttggatctgacattac 27488289  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  27488290 ataagcaattat 27488301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 23775821 - 23775931
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| |||| || |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  23775821 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgt-cactaaaaagtacttacattaattgaagtgtttggatgtgacattac 23775919  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  23775920 ataatcaattat 23775931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 8931574 - 8931650
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  | ||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  8931574 tttatgtttggatatgtacactaaaaggtacttacctaaattgaagtgtttggatgtgacattacacaagcaattat 8931650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48910591 - 48910480
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||   |||||    ||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  48910591 agcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttgagtatgtatgcaaaaaagtacttatataaattgaagtgtttggatgtgacattac 48910492  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  48910491 ataagcaattat 48910480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Original strand, 51780317 - 51780404
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttgg 189  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  51780317 agcttatatcataagctcttatatttgataagctctttatgtttggatatgtgtattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgg 51780404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Original strand, 23261275 - 23261360
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgttt 187  Q
    |||||||||||||||   ||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||    
T  23261275 agcttacatcataagtttttatatttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgttt 23261360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33704991 - 33704916
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  33704991 tttatgtttggatatgtatct-aaaaagtacttacataaattgaagtgttcggatgtgatattacataagtaattat 33704916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 16736713 - 16736789
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16736713 tttatgtttggatatgtacattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatatgatattacataagcaattat 16736789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 8373659 - 8373770
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  8373659 agcttacatcataagctcttatactttataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatttgacattac 8373758  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  8373759 ataagcaattat 8373770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 35419692 - 35419803
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  35419692 agcttacatcataagctcttatacttcataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaaatgtttggatgtgacattac 35419791  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  35419792 ataagcaattat 35419803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 1165112 - 1165223
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  1165112 agcttacatcataagctcttatatttgataaattatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 1165211  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  1165212 ataagcaattat 1165223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1579685 - 1579574
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  1579685 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 1579586  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    || |||||||||    
T  1579585 atgagcaattat 1579574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 1605130 - 1605241
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  1605130 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 1605229  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    || |||||||||    
T  1605230 atgagcaattat 1605241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 9007352 - 9007463
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  9007352 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 9007451  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  9007452 ataagcaattat 9007463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16070277 - 16070166
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16070277 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 16070178  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  16070177 ataaacaattat 16070166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 24105018 - 24105129
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  24105018 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 24105117  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  24105118 ataagcaattat 24105129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 35419969 - 35420080
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  35419969 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 35420068  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||| ||||    
T  35420069 ataagcatttat 35420080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 35782059 - 35782169
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  35782059 agcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtactt-cataaattgaagtgtttggatgtgacattat 35782157  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  35782158 ataagcaattat 35782169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 26602346 - 26602457
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||| || |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  26602346 agcttacatcataagctcttatacgtgataaattatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 26602445  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  26602446 ataagcaattat 26602457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27421510 - 27421399
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||    
T  27421510 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttagatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtttttggatctgacattac 27421411  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  27421410 ataagcaattat 27421399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 27678553 - 27678664
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  27678553 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttcgatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 27678652  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  27678653 ataagcaattat 27678664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31884030 - 31883919
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  31884030 agcttaaatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaacaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 31883931  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  31883930 ataaacaattat 31883919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 33490560 - 33490671
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  33490560 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 33490659  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||| ||||||||    
T  33490660 atacgcaattat 33490671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33992047 - 33991936
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  33992047 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaatttgacattac 33991948  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  33991947 ataagcaattat 33991936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 34708338 - 34708449
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  34708338 agcttatatcacaagctcttatacttaataaactatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 34708437  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  34708438 ataagcaattat 34708449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Original strand, 41818042 - 41818157
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |  || | |||||||||||||||||||  | ||||||    
T  41818042 agcttacaacataagttcttatacttgataagctctttatgtttggatatgtacagtaaaaagtatttacttaaattgaagtgtttggatgagctattac 41818141  T
Q  202 ataagcaattataaaa 217  Q
    ||||||||||||||||    
T  41818142 ataagcaattataaaa 41818157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19360808 - 19360703
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  19360808 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 19360709  T
Q  202 ataagc 207  Q
    ||||||    
T  19360708 ataagc 19360703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4121733 - 4121657
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  4121733 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgttcggatgtgacattacataagcaattat 4121657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31413435 - 31413327
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||    
T  31413435 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttaggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaattgtttggatgtgacattgcata 31413336  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  31413335 agcaattat 31413327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27025802 - 27025726
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  27025802 tttatgtttgggtatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacatacgcaattat 27025726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 20988367 - 20988443
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||  | |||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  20988367 tttatgtttggatatgtacgctgaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 20988443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 212
Target Start/End: Original strand, 38597243 - 38597284
Alignment:
Q  171 cataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaatta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  38597243 cataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaatta 38597284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 30266041 - 30266149
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30266041 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatttgtcattacata 30266140  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  30266141 agcaattat 30266149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 1481329 - 1481440
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  1481329 agcttacatcataagctcttatacttgataaggtatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatttgacattac 1481428  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  1481429 ataagcaattat 1481440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 4231699 - 4231810
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  4231699 agcttacatcataagcccttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 4231798  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  4231799 ataagcaattat 4231810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5734233 - 5734122
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  5734233 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 5734134  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  5734133 ataagcaattat 5734122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 16065795 - 16065906
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16065795 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgaatatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 16065894  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  16065895 ataagcaattat 16065906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 16588335 - 16588446
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  16588335 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatatgacattgc 16588434  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  16588435 ataagcaattat 16588446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 18806173 - 18806284
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  18806173 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 18806272  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  18806273 ataagcaattat 18806284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 33905344 - 33905455
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  33905344 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 33905443  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  33905444 ataagcaattat 33905455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Original strand, 26322574 - 26322687
Alignment:
Q  101 atagcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttatt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  26322574 atagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttaagtttggatatgtacactaaaaactacttacataaattgaagtgtttggatgtgacatt 26322673  T
Q  200 acataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||||    
T  26322674 acataagcaattat 26322687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 3872536 - 3872647
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  3872536 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattcc 3872635  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  3872636 ataagcaattat 3872647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4016877 - 4016766
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  4016877 agcttacatcataagttcttgtacttgataagttatttatgtttgaatatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatttgacattac 4016778  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  4016777 ataagcaattat 4016766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 6174382 - 6174493
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  6174382 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtaattacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 6174481  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  6174482 ataagcaattat 6174493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 30419464 - 30419575
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30419464 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattac 30419563  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  30419564 ataagcaattat 30419575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 44947016 - 44947127
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  44947016 agcttacatcataagctcttatatttgataagttatttatgtttggatatgtacacaaaaaagtacttccataaattgaagtgtttggatgtgacattac 44947115  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  44947116 ataagcaattat 44947127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 851744 - 851633
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||    
T  851744 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgatgtgtttggatgtgacattac 851645  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  851644 ataaacaattat 851633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 2178173 - 2178284
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  2178173 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgcacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 2178272  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  2178273 ataagcaattat 2178284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 31516623 - 31516734
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||     
T  31516623 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacaatat 31516722  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  31516723 ataagcaattat 31516734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42938630 - 42938520
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||  | ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  42938630 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaag-tacttacatatattgaagtgtttggatgtgatattac 42938532  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  42938531 ataagcaattat 42938520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Original strand, 28323068 - 28323178
Alignment:
Q  104 gcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattaca 202  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  28323068 gcttatatcataagctcttatacttaataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttagatgtgacattaca 28323167  T
Q  203 taagcaattat 213  Q
    |||| ||||||    
T  28323168 taagtaattat 28323178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Original strand, 11707775 - 11707892
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagttt-ttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||| |||||||||||| | | |||||    
T  11707775 agcttacatcataagctctaatacttaataagctacttacgtttggacatgtacactaaaaagtatttgcatgaattaaagtgtttggatgtttcattac 11707874  T
Q  202 ataagcaattataaaatg 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  11707875 ataagcaattatgaaatg 11707892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39463856 - 39463740
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataag-tttttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||| | |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| | |||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||     
T  39463856 agcttacattagaagctcttgtactcaataagatttttacgtttggataagtacacttaaaagtacttacacaaattgaagtgtttggatatgtcattat 39463757  T
Q  202 ataagcaattataaaat 218  Q
    ||||||| |||||||||    
T  39463756 ataagcatttataaaat 39463740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Original strand, 22100259 - 22100376
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||| | |||| |||||||||| ||| ||| ||||     
T  22100259 agcttacattataagttcttatactcaataagttctttatgtttggatatgtacgctaaaaagtacttacgtaaaatgaagtgtttagatgtgtcattat 22100358  T
Q  202 ataagcaattataaaatg 219  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  22100359 ataagtaattattaaatg 22100376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39636203 - 39636092
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  39636203 agcttatatcataagttcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaaatgtttggatgtgacattac 39636104  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  39636103 ataaacaattat 39636092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 219
Target Start/End: Original strand, 42445145 - 42445259
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    |||||| |||||| |||| | |||||||| | |||| |||||||  |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | | |||| |||    
T  42445145 ttacattataagctcttaaattcaataagctctttaagtttggatgtgtacactaaaaaatacttacgtaaattgaagtgtttggatgtatcattatata 42445244  T
Q  205 agcaattataaaatg 219  Q
    ||||||||| |||||    
T  42445245 agcaattatgaaatg 42445259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1679391 - 1679302
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtttt-tatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggat 191  Q
    |||||||||||||||| || |||||  ||||| | | |||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||    
T  1679391 agcttacatcataagctctcatactttataagctatatatgtttggatatgtacattaaaaagtacctacataaattgaagtgtttggat 1679302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3587135 - 3587018
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataag-tttttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |  ||   |||||| || |||||| || ||| ||||     
T  3587135 agcttacatcataagctcttattctcaataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtatttatgtaaattaaaatgtttgaatgtgtcattat 3587036  T
Q  202 ataagcaattataaaatg 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  3587035 ataagcaattatgaaatg 3587018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 216
Target Start/End: Original strand, 12516457 - 12516571
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtttttat-gtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||||  | |||| ||| || | | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  12516457 agcttatatcataattgcttgtactcaataagcttttttcgtttggatgtttacactaataagtacctacataaattgaagtgtttggatgtgtcattat 12516556  T
Q  202 ataagcaattataaa 216  Q
    |||||||||||||||    
T  12516557 ataagcaattataaa 12516571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1110131 - 1110020
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||| | |||| | | ||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  1110131 agcttacattataagctcttgtacttgataagctatttatgtttggatatgtatactaaagagtacttacataaattgaagcgtttggatgtgacattac 1110032  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||| ||||||    
T  1110031 ataagtaattat 1110020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 19383406 - 19383517
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  ||||| | ||||| ||||||  |||||| |||||| | ||| || |||||||| |||||| || ||  |||||    
T  19383406 agcttacatcataagctcctatacttgataagctatttatatttggatttgtacactaaaaagtacttacagaaattgaattgtttgaatgtgacattac 19383505  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  19383506 ataagcaattat 19383517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 213
Target Start/End: Original strand, 19900730 - 19900771
Alignment:
Q  172 ataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  19900730 ataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 19900771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Original strand, 45111591 - 45111679
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataa-gtttttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggat 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||  ||||||| |||  ||||||| |||| |||||||    
T  45111591 agcttacatcataagctcttatactaaataaggtttttacgtttgaatatgtaca-caaaaaatacttaaataaattaaagtatttggat 45111679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 162 - 51
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  162 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 63  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  62 ataagcaattat 51  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 18315 - 18426
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  18315 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 18414  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  18415 ataagcaattat 18426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7164832 - 7164721
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  7164832 agcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaaatgtttggatctgacattac 7164733  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  7164732 ataagcaattat 7164721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9453425 - 9453314
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  9453425 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 9453326  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  9453325 ataagcaattat 9453314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17754435 - 17754324
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  17754435 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 17754336  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  17754335 ataagcaattat 17754324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43407786 - 43407675
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  43407786 agcttacatcataagctcttatactcaataagctatttacgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataacttgaagtgtttggatgtgacattac 43407687  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  43407686 ataagcaattat 43407675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25749129 - 25749019
Alignment:
Q  104 gcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattaca 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  25749129 gcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattaca 25749030  T
Q  203 taagcaattat 213  Q
    |||||||||||    
T  25749029 taagcaattat 25749019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5281538 - 5281429
Alignment:
Q  105 cttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  5281538 cttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacat 5281439  T
Q  204 aagcaattat 213  Q
    ||||||||||    
T  5281438 aagcaattat 5281429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Original strand, 36847660 - 36847777
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  36847660 agcttacatcataagctcttgtattcaataagctctttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacgtaaattgaagtgtttggatgtgttattat 36847759  T
Q  202 ataagcaattataaaatg 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  36847760 ataagcaattatgaaatg 36847777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 4476376 - 4476487
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  4476376 agcttacatcataagctcttatacttaataagctgtttatgtttagatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 4476475  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  4476476 ataaccaattat 4476487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 12097145 - 12097256
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  12097145 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 12097244  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||| ||||||    
T  12097245 ataagtaattat 12097256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 16893871 - 16893982
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16893871 agcttacatcataaactcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 16893970  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  16893971 ataagcaattat 16893982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 30180125 - 30180236
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30180125 agcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattac 30180224  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  30180225 ataagcaattat 30180236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32042190 - 32042079
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  32042190 agcttacatcttaagcccttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 32042091  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  32042090 ataagcaattat 32042079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 33358467 - 33358578
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  33358467 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 33358566  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  33358567 ataagcaattat 33358578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 36890323 - 36890434
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  36890323 agcttacatcataagctcttatatttgataagatatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatatgacattgc 36890422  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  36890423 ataagcaattat 36890434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38867457 - 38867346
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  38867457 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattgc 38867358  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  38867357 ataagcaattat 38867346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48866271 - 48866160
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||    
T  48866271 agcttacatcataagctcttatatttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaagtgaagtgtttggatctgacattac 48866172  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  48866171 ataagcaattat 48866160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Original strand, 43021105 - 43021215
Alignment:
Q  104 gcttacatcataagcgcttatactcaataagtttt-tatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattaca 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||    
T  43021105 gcttacatcataagctcttatacttgataagttatatatgtttggatatgtacactaaaaagtacttccataaattgaagtgtttggatgcgacattaca 43021204  T
Q  203 taagcaattat 213  Q
    |||||||||||    
T  43021205 taagcaattat 43021215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 12100540 - 12100651
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  12100540 agcttatatcataagttcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 12100639  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  12100640 ataagcaattat 12100651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 205
Target Start/End: Original strand, 15648678 - 15648781
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| || ||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15648678 agcttacatcataagctcttatactcaataagatatttacgttttgatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgtcattac 15648777  T
Q  202 ataa 205  Q
    ||||    
T  15648778 ataa 15648781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 33845924 - 33846035
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||   |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  33845924 agcttatatcataagctcttatacttgataagcaatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 33846023  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  33846024 ataagcaattat 33846035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 42964148 - 42964259
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  42964148 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttcgatgtgacattac 42964247  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  42964248 ataagcaattat 42964259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 46133820 - 46133931
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||  ||| |    
T  46133820 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttggatgtgacatttc 46133919  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  46133920 ataagcaattat 46133931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6395922 - 6395814
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  6395922 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacata 6395823  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    | |||||||    
T  6395822 accaattat 6395814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15656722 - 15656614
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||    
T  15656722 ttacatcataagttcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttagatgtgacattatata 15656623  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  15656622 agcaattat 15656614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 22649010 - 22649086
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  22649010 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 22649086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 24791877 - 24791986
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  24791877 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaagta--cttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 24791974  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  24791975 ataagcaattat 24791986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43157389 - 43157281
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  43157389 ttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttcgatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacata 43157290  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  43157289 agcaattat 43157281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3512224 - 3512113
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||  | |||||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  3512224 agcttacatcataagctcttatatttgataaactatttatgtttggatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 3512125  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  3512124 ataagcaattat 3512113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42205196 - 42205085
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||  |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  42205196 agcttacatcataagctcttatttttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttggatgtgacattac 42205097  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  42205096 ataagcaattat 42205085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 43067520 - 43067631
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| | ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  43067520 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatacgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaatctgacattac 43067619  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||| ||||    
T  43067620 ataagcagttat 43067631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 37004174 - 37004286
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagttttt--atgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttatta 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||  | ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||    
T  37004174 agctcacatcataagctcttatactcaataaactatttaacgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataacttgaagtgtttggatgtgacatta 37004273  T
Q  201 cataagcaattat 213  Q
    |||||||||||||    
T  37004274 cataagcaattat 37004286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1803756 - 1803645
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||  || ||    
T  1803756 agcttacattataagctcttatacttgataagctatttaggtttggatatgtacactaaaaagtagttacataaattgaagtgtttggatgtgacatcac 1803657  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  1803656 ataagcaattat 1803645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8631588 - 8631477
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  8631588 agcttacaacataagttcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactgaaaagtacttaaataaattgaagtgtttggatgtgacattac 8631489  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  8631488 ataagcaattat 8631477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42674264 - 42674153
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||| ||  ||  ||||     
T  42674264 agcttacatcataaactcttatatttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtactaacataaattgaagtgtttagacgtgacattat 42674165  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  42674164 ataagcaattat 42674153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 191
Target Start/End: Original strand, 18120771 - 18120825
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggat 191  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  18120771 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggat 18120825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 15517982 - 15518093
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  15517982 agcttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttggatgtgacattac 15518081  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  15518082 ataagcaattat 15518093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38856737 - 38856626
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  38856737 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 38856638  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  38856637 ataagcaattat 38856626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38934778 - 38934667
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  38934778 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 38934679  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  38934678 ataagcaattat 38934667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 42307290 - 42307401
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  42307290 agcttatatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 42307389  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  42307390 ataagcaattat 42307401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 46451704 - 46451815
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  46451704 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatctgacattac 46451803  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  46451804 ataagcaattat 46451815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16355360 - 16355247
Alignment:
Q  101 atagcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttatt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||    
T  16355360 atagcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattaaagtgtttggatgtgacatt 16355261  T
Q  200 acataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||||    
T  16355260 acataagcaattat 16355247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32360164 - 32360055
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  32360164 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 32360065  T
Q  202 ataagcaatt 211  Q
    ||||||||||    
T  32360064 ataagcaatt 32360055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8043514 - 8043403
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  8043514 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 8043415  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  8043414 ataagcaattat 8043403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15521480 - 15521369
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  15521480 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 15521381  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  15521380 ataagcaattat 15521369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 25493784 - 25493895
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  25493784 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 25493883  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  25493884 ataagcaattat 25493895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32245022 - 32244911
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  32245022 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgttcggatatgtacattaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 32244923  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  32244922 ataaacaattat 32244911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 37697489 - 37697600
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  37697489 agcttatatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 37697588  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  37697589 ataagcaattat 37697600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44689662 - 44689551
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  44689662 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 44689563  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  44689562 ataaacaattat 44689551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49129913 - 49129802
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  49129913 agcttacatcataagctcttatattcaataagctatttacgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataacttgaagtgtttggatgtgacattac 49129814  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  49129813 ataagcaattat 49129802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53028951 - 53028843
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  53028951 ttacgtcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatatgacattacata 53028852  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    |||||||||    
T  53028851 agcaattat 53028843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20699968 - 20699857
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  20699968 agctgacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 20699869  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  20699868 ataagcaattat 20699857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22175438 - 22175327
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  22175438 agcttacatcataaactcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 22175339  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  22175338 ataagcaattat 22175327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26000181 - 26000070
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  26000181 agcttatatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 26000082  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  26000081 ataagcaattat 26000070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 29784263 - 29784374
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  29784263 agcttacatcataagttcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 29784362  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  29784363 ataagcaattat 29784374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34701063 - 34700952
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  34701063 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaatgtgacattac 34700964  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  34700963 ataaacaattat 34700952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 50528164 - 50528275
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||    
T  50528164 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttaagtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggttgtgacattac 50528263  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  50528264 ataagcaattat 50528275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50529766 - 50529655
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  50529766 agcttacatcacaagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 50529667  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  50529666 ataagcaattat 50529655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 54533379 - 54533490
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  54533379 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 54533478  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  54533479 ataaccaattat 54533490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 54869430 - 54869541
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||    
T  54869430 agcttacatcataagctcttatatttgataagttatttacgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataacttgaagtgtttggatgtgacattac 54869529  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  54869530 ataagcaattat 54869541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29785794 - 29785685
Alignment:
Q  105 cttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  29785794 cttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgcttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacat 29785695  T
Q  204 aagcaattat 213  Q
    ||||||||||    
T  29785694 aagcaattat 29785685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21581881 - 21581770
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||||  | |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  21581881 agcttatatcataaactcttatacttgataagttatttatgtttggatgtatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 21581782  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  21581781 ataagcaattat 21581770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 42103603 - 42103714
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  42103603 agcttatatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 42103702  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  42103703 ataaacaattat 42103714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 12117048 - 12117125
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattata 214  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  12117048 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacataaacaattata 12117125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52922303 - 52922187
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataag-tttttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||  |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  52922303 agcttacattataagctcttatactcaataagctctttatgtttgaatatgtacgctaaaaagtacttacgtaaattgaagtgttt-gatgtgtcattat 52922205  T
Q  202 ataagcaattataaaatg 219  Q
    |||||||||||| |||||    
T  52922204 ataagcaattatgaaatg 52922187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 219
Target Start/End: Original strand, 36787507 - 36787603
Alignment:
Q  124 tactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattataaaatg 219  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| | ||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36787507 tactcaataagctatttacgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacgtaaattgaagtgtttggatgtgtcattgcataagcaattataaaatg 36787603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 20841719 - 20841830
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  20841719 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttggatatgtatactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattat 20841818  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
     |||||||||||    
T  20841819 gtaagcaattat 20841830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 44608868 - 44608979
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||| ||| ||  ||||     
T  44608868 agcttacatcataaactcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttatataaattgaagtgtttagatgtgacattat 44608967  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  44608968 ataagcaattat 44608979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 48924578 - 48924689
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  48924578 agctcacatcataagctcttatacttgataaactatttatggttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttgaatctgacattac 48924677  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  48924678 ataaacaattat 48924689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Original strand, 24835398 - 24835508
Alignment:
Q  104 gcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattaca 202  Q
    ||||| || |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||    
T  24835398 gcttatattataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaagataattacataaattgaagtgtttggatgtgacattgca 24835497  T
Q  203 taagcaattat 213  Q
    ||| |||||||    
T  24835498 taaacaattat 24835508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29446326 - 29446250
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||    
T  29446326 tttatgtttggatatatacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacaatatataagcaattat 29446250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 13697549 - 13697446
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||||| | ||||||||| ||||| || |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  13697549 agcttacatcataagctcttatatttgataagctatttatgtttagacatatatacaaaaaattacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 13697450  T
Q  202 ataa 205  Q
    ||||    
T  13697449 ataa 13697446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26123503 - 26123388
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggat----atgtta 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||| | || | || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||    ||  ||    
T  26123503 agcttacatcataagctcttatacttgataaactatttatgtttgaatatatgcactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtacattata 26123404  T
Q  198 ttacataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||||||    
T  26123403 ttacataagcaattat 26123388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35227184 - 35227095
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggat 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||   ||||| |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  35227184 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttgactatgtatacaaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggat 35227095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1827 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1827
Description:

Target: scaffold1827; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 127 - 16
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  127 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattac 28  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    |||| |||||||    
T  27 ataaacaattat 16  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 523 - 415
Alignment:
Q  106 ttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacata 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  523 ttacatcataagctcttatacttgataagttatttatgtttgaatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacata 424  T
Q  205 agcaattat 213  Q
    | |||||||    
T  423 aacaattat 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 1771 - 1882
Alignment:
Q  103 agcttacatcataagcgcttatactcaataagtt-tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattac 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  1771 agcttacatcataagctcttatacttgataagctatttatgtttggatatgtacactaaaaagtatttacataaattgaagtgtttggatgcgacattac 1870  T
Q  202 ataagcaattat 213  Q
    ||||||||||||    
T  1871 ataagcaattat 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 144740 - 144816
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  144740 tttatgtttggatatgtacactaaaaaatacttacataaattgaagtgtttggatgtgacattacataagcaattat 144816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10970 - 10894
Alignment:
Q  137 tttatgtttggacatgtacattaaaaaatgcttgcataaattgaagtgtttggatatgttattacataagcaattat 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  10970 tttatgtttggatatgtacactaaaaagtacttacataaattgaagtgtttggatgtgacatttcataagtaattat 10894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University