View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3021_low_59 (Length: 248)

Name: NF3021_low_59
Description: NF3021
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3021_low_59
NF3021_low_59
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (16-230)||(3152-3366)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (16-230)||(15458825-15459039)
chr3 (16-230)||(17498208-17498422)
chr3 (16-228)||(11861871-11862083)
chr3 (16-218)||(14577820-14578022)
chr3 (11-218)||(14872980-14873186)
chr3 (16-219)||(12890234-12890437)
chr3 (16-219)||(15585794-15585997)
chr3 (16-230)||(15712458-15712672)
chr3 (16-197)||(23078409-23078590)
chr3 (11-219)||(6597580-6597788)
chr3 (16-212)||(15263156-15263352)
chr3 (16-212)||(15263968-15264164)
chr3 (16-219)||(20058456-20058659)
chr3 (11-219)||(3689468-3689676)
chr3 (11-219)||(13249569-13249777)
chr3 (11-219)||(13256215-13256423)
chr3 (11-219)||(15398916-15399124)
chr3 (11-219)||(16753098-16753306)
chr3 (16-219)||(5421332-5421535)
chr3 (16-219)||(6604260-6604463)
chr3 (16-219)||(16639298-16639501)
chr3 (11-230)||(23414184-23414403)
chr3 (16-219)||(43166200-43166403)
chr3 (16-213)||(26789815-26790012)
chr3 (16-230)||(15066585-15066793)
chr3 (16-219)||(53381421-53381624)
chr3 (16-218)||(5107941-5108143)
chr3 (11-197)||(15359597-15359783)
chr3 (16-219)||(10909735-10909938)
chr3 (14-213)||(15231147-15231346)
chr3 (14-213)||(15237015-15237214)
chr3 (16-219)||(48428972-48429175)
chr3 (16-218)||(5109811-5110013)
chr3 (13-219)||(35983719-35983922)
chr3 (14-209)||(12507951-12508146)
chr3 (16-219)||(15344647-15344850)
chr3 (23-230)||(16695681-16695888)
chr3 (137-212)||(19728294-19728369)
chr3 (16-219)||(10009125-10009328)
chr3 (133-212)||(12842627-12842706)
chr3 (11-103)||(24186794-24186886)
chr3 (16-162)||(12502482-12502622)
chr3 (13-230)||(12856901-12857115)
chr3 (16-86)||(12273410-12273480)
chr3 (16-81)||(16490725-16490790)
chr3 (13-73)||(15011361-15011421)
chr3 (16-83)||(2036303-2036370)
chr3 (16-83)||(2040044-2040111)
chr3 (16-83)||(14040417-14040484)
chr3 (13-86)||(15937775-15937848)
chr3 (14-74)||(8743785-8743845)
chr3 (68-204)||(13027811-13027947)
chr3 (14-74)||(13945698-13945758)
chr3 (14-74)||(41179846-41179906)
chr3 (118-209)||(10409516-10409607)
chr3 (13-219)||(14289919-14290123)
chr3 (13-80)||(15935925-15935992)
chr3 (28-86)||(10416454-10416512)
chr3 (13-86)||(16824667-16824740)
chr3 (14-74)||(16383767-16383827)
chr3 (31-173)||(31691591-31691730)
chr3 (31-86)||(16803370-16803425)
chr3 (31-74)||(31942583-31942626)
chr3 (13-197)||(17495210-17495391)
chr3 (16-62)||(19728433-19728479)
chr3 (31-92)||(13304193-13304254)
chr3 (118-219)||(16824769-16824870)
chr3 (118-219)||(28757857-28757958)
chr3 (118-219)||(47127482-47127583)
chr3 (14-74)||(16830917-16830977)
chr3 (117-197)||(24190863-24190943)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (12-228)||(39756-39972)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (12-212)||(18404237-18404437)
chr6 (16-230)||(23082185-23082399)
chr6 (16-213)||(5835536-5835733)
chr6 (11-219)||(21765585-21765793)
chr6 (16-212)||(19667226-19667410)
chr6 (11-175)||(19872005-19872169)
chr6 (16-219)||(16575660-16575863)
chr6 (16-219)||(16619517-16619720)
chr6 (16-219)||(28259505-28259708)
chr6 (16-219)||(28286208-28286411)
chr6 (16-219)||(28313400-28313603)
chr6 (16-219)||(28338254-28338457)
chr6 (16-219)||(29588747-29588950)
chr6 (16-219)||(2871110-2871313)
chr6 (16-219)||(24292089-24292292)
chr6 (16-219)||(27206392-27206595)
chr6 (16-219)||(27242633-27242836)
chr6 (14-204)||(25958056-25958246)
chr6 (14-206)||(22437655-22437841)
chr6 (14-219)||(23084128-23084333)
chr6 (56-230)||(25755955-25756129)
chr6 (16-219)||(25116330-25116533)
chr6 (14-204)||(18660695-18660885)
chr6 (14-203)||(30675276-30675459)
chr6 (14-203)||(18326646-18326835)
chr6 (16-80)||(25607537-25607601)
chr6 (13-219)||(25771617-25771823)
chr6 (13-219)||(21475306-21475518)
chr6 (16-103)||(18178750-18178837)
chr6 (11-103)||(27554595-27554687)
chr6 (142-228)||(27558247-27558333)
chr6 (163-219)||(18181839-18181895)
chr6 (16-83)||(8720013-8720080)
chr6 (28-87)||(15463232-15463291)
chr6 (17-83)||(16828615-16828679)
chr6 (31-89)||(19438902-19438960)
chr6 (28-86)||(20009827-20009885)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (12-230)||(18880256-18880474)
chr8 (16-212)||(21672497-21672693)
chr8 (16-212)||(22420496-22420692)
chr8 (16-230)||(6518334-6518548)
chr8 (11-230)||(19981931-19982150)
chr8 (12-219)||(21390491-21390698)
chr8 (12-219)||(21779817-21780024)
chr8 (11-219)||(17354502-17354704)
chr8 (11-218)||(30309742-30309949)
chr8 (23-219)||(21163140-21163336)
chr8 (16-212)||(22524395-22524591)
chr8 (11-213)||(17829568-17829770)
chr8 (13-212)||(20392068-20392267)
chr8 (11-230)||(32604109-32604328)
chr8 (11-219)||(19116372-19116580)
chr8 (16-219)||(19480679-19480882)
chr8 (16-219)||(19497287-19497490)
chr8 (16-219)||(20014869-20015072)
chr8 (16-213)||(22125565-22125762)
chr8 (16-219)||(15537358-15537561)
chr8 (11-230)||(22043782-22044001)
chr8 (16-213)||(17670628-17670825)
chr8 (16-212)||(22994660-22994861)
chr8 (11-219)||(18860549-18860757)
chr8 (16-219)||(22116781-22116984)
chr8 (137-203)||(20384242-20384308)
chr8 (13-212)||(19986110-19986306)
chr8 (14-213)||(22114012-22114205)
chr8 (137-230)||(21968838-21968931)
chr8 (13-219)||(21929403-21929606)
chr8 (127-230)||(22242163-22242266)
chr8 (13-83)||(21981557-21981627)
chr8 (13-83)||(21986476-21986546)
chr8 (16-81)||(6606075-6606140)
chr8 (137-230)||(21330533-21330626)
chr8 (137-230)||(21981678-21981771)
chr8 (137-230)||(21986597-21986690)
chr8 (13-74)||(22003684-22003745)
chr8 (137-230)||(22003805-22003898)
chr8 (14-74)||(22026884-22026944)
chr8 (14-86)||(22049444-22049516)
chr8 (31-74)||(22176895-22176938)
chr8 (13-83)||(21968717-21968787)
chr8 (117-173)||(22026983-22027039)
chr8 (14-74)||(22054974-22055034)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (12-230)||(16241006-16241224)
chr4 (16-212)||(14937-15133)
chr4 (12-230)||(15143845-15144063)
chr4 (16-215)||(14163383-14163582)
chr4 (16-212)||(16220104-16220300)
chr4 (11-230)||(16247571-16247790)
chr4 (11-230)||(18223369-18223588)
chr4 (11-219)||(8390318-8390526)
chr4 (16-219)||(14299882-14300085)
chr4 (14-219)||(14700368-14700567)
chr4 (11-219)||(12480506-12480714)
chr4 (11-219)||(13514259-13514467)
chr4 (13-209)||(13880028-13880224)
chr4 (13-212)||(8709592-8709785)
chr4 (11-219)||(17091047-17091255)
chr4 (19-213)||(8049529-8049723)
chr4 (11-155)||(16349697-16349841)
chr4 (16-219)||(23959653-23959856)
chr4 (11-219)||(16232890-16233098)
chr4 (16-230)||(18603725-18603933)
chr4 (11-112)||(14684178-14684279)
chr4 (16-77)||(17332225-17332286)
chr4 (13-219)||(14992543-14992746)
chr4 (14-74)||(27904435-27904495)
chr4 (67-219)||(40476946-40477098)
chr4 (14-74)||(51602959-51603019)
chr4 (14-74)||(53749637-53749697)
chr4 (118-209)||(3261056-3261147)
chr4 (118-209)||(29449799-29449890)
chr4 (13-86)||(16151675-16151748)
chr4 (13-86)||(16155821-16155894)
chr4 (13-85)||(18260476-18260548)
chr4 (13-85)||(18270439-18270511)
chr4 (13-92)||(16230038-16230117)
chr4 (118-209)||(44658128-44658219)
chr4 (13-86)||(15267816-15267889)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (12-212)||(25430268-25430468)
chr5 (16-212)||(26733836-26734032)
chr5 (16-212)||(21331331-21331527)
chr5 (16-228)||(23536557-23536769)
chr5 (20-219)||(21883618-21883817)
chr5 (16-212)||(23475042-23475238)
chr5 (11-230)||(18782944-18783163)
chr5 (16-219)||(20804438-20804641)
chr5 (16-219)||(22351757-22351960)
chr5 (16-221)||(27664848-27665053)
chr5 (11-219)||(27522244-27522452)
chr5 (16-219)||(16360340-16360543)
chr5 (16-219)||(19773798-19774001)
chr5 (13-212)||(21560367-21560566)
chr5 (16-219)||(22329232-22329435)
chr5 (16-219)||(34570332-34570535)
chr5 (16-212)||(22138513-22138709)
chr5 (11-219)||(27614194-27614402)
chr5 (16-219)||(27681745-27681948)
chr5 (16-218)||(29472418-29472620)
chr5 (16-200)||(23670474-23670658)
chr5 (16-219)||(41774681-41774884)
chr5 (16-219)||(23461745-23461942)
chr5 (11-219)||(40712618-40712826)
chr5 (16-219)||(37287841-37288044)
chr5 (13-200)||(43123309-43123496)
chr5 (67-219)||(14996135-14996287)
chr5 (25-92)||(23562523-23562590)
chr5 (16-83)||(22591100-22591167)
chr5 (16-83)||(22594655-22594722)
chr5 (14-92)||(30614915-30614993)
chr5 (14-74)||(17265684-17265744)
chr5 (16-83)||(16257381-16257448)
chr5 (28-87)||(20825402-20825461)
chr5 (14-77)||(21619901-21619964)
chr5 (28-86)||(28891305-28891363)
chr5 (28-86)||(28911209-28911267)
chr5 (28-86)||(28926477-28926535)
chr5 (16-64)||(41768262-41768310)
chr5 (28-86)||(22465897-22465955)
chr5 (13-91)||(30609275-30609353)
chr5 (28-85)||(20771086-20771143)
chr5 (67-212)||(21981885-21982030)
chr5 (125-218)||(30609154-30609247)
chr5 (16-92)||(21411100-21411176)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (16-212)||(12208-12404)
scaffold0120 (12-212)||(15029-15229)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (12-212)||(41170-41370)
scaffold0023 (127-231)||(29848-29952)
scaffold0023 (19-75)||(29792-29848)
scaffold0023 (14-74)||(157683-157743)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (12-212)||(23065922-23066122)
chr2 (12-212)||(23075372-23075572)
chr2 (11-230)||(22741661-22741880)
chr2 (12-230)||(22732470-22732688)
chr2 (11-230)||(23028157-23028376)
chr2 (14-219)||(23030301-23030506)
chr2 (12-219)||(24679027-24679234)
chr2 (12-219)||(20321520-20321734)
chr2 (16-230)||(22462181-22462395)
chr2 (11-205)||(23104427-23104616)
chr2 (11-230)||(21319698-21319917)
chr2 (14-219)||(24816537-24816742)
chr2 (11-219)||(17002537-17002745)
chr2 (13-213)||(21902083-21902283)
chr2 (16-219)||(9487753-9487956)
chr2 (11-230)||(24656353-24656572)
chr2 (11-213)||(10872393-10872595)
chr2 (16-213)||(23115759-23115956)
chr2 (11-219)||(16932044-16932252)
chr2 (16-219)||(9339119-9339322)
chr2 (16-219)||(27374806-27375009)
chr2 (43-171)||(23039347-23039475)
chr2 (16-219)||(16984777-16984980)
chr2 (16-219)||(24873454-24873656)
chr2 (16-219)||(22322045-22322248)
chr2 (16-219)||(24713571-24713774)
chr2 (116-230)||(24704282-24704396)
chr2 (16-219)||(24265907-24266110)
chr2 (16-219)||(41605786-41605989)
chr2 (16-219)||(44382271-44382474)
chr2 (16-77)||(23003763-23003824)
chr2 (16-83)||(28351548-28351615)
chr2 (14-74)||(12578029-12578089)
chr2 (14-74)||(12571547-12571607)
chr2 (16-92)||(45535175-45535251)
chr2 (31-74)||(23275275-23275318)
chr2 (67-100)||(24704245-24704278)
chr2 (14-74)||(19715719-19715779)
chr2 (14-74)||(19720282-19720342)
[»] scaffold0490 (3 HSPs)
scaffold0490 (12-230)||(818-1036)
scaffold0490 (13-91)||(3899-3977)
scaffold0490 (127-219)||(3803-3895)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (12-230)||(2639-2857)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (12-230)||(9874-10092)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (12-219)||(6161-6368)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (12-230)||(9150-9368)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (19-212)||(3713-3906)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (16-218)||(4490-4692)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (16-206)||(20885-21075)
scaffold0080 (11-219)||(32817-33025)
scaffold0080 (74-219)||(55575-55721)
scaffold0080 (11-91)||(9442-9522)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (12-230)||(15145088-15145306)
chr7 (16-212)||(14043600-14043796)
chr7 (16-212)||(14353630-14353826)
chr7 (16-212)||(11526526-11526722)
chr7 (11-219)||(8711500-8711708)
chr7 (11-219)||(11549269-11549477)
chr7 (11-219)||(18586338-18586546)
chr7 (16-219)||(13689936-13690139)
chr7 (16-219)||(44787523-44787726)
chr7 (16-219)||(15157229-15157432)
chr7 (16-228)||(9592253-9592465)
chr7 (11-219)||(11233380-11233588)
chr7 (16-218)||(10874348-10874550)
chr7 (11-219)||(14958403-14958611)
chr7 (12-230)||(16725621-16725833)
chr7 (12-230)||(17702635-17702847)
chr7 (13-219)||(20750309-20750512)
chr7 (11-218)||(12691397-12691604)
chr7 (16-123)||(14336362-14336469)
chr7 (11-100)||(18181744-18181833)
chr7 (13-92)||(19151034-19151113)
chr7 (133-203)||(15628438-15628508)
chr7 (13-86)||(12801411-12801484)
chr7 (13-74)||(14256717-14256778)
chr7 (13-73)||(12693800-12693860)
chr7 (14-74)||(14282522-14282582)
chr7 (137-213)||(15115058-15115134)
chr7 (67-219)||(12202998-12203150)
chr7 (14-74)||(18050107-18050167)
chr7 (31-86)||(12711834-12711889)
chr7 (118-209)||(26091047-26091138)
chr7 (13-83)||(15115185-15115255)
chr7 (14-86)||(14145684-14145756)
chr7 (31-86)||(13677469-13677524)
chr7 (13-92)||(15098871-15098950)
chr7 (21-62)||(11769955-11769996)
chr7 (118-219)||(49156200-49156301)
chr7 (13-53)||(12202956-12202996)
chr7 (117-173)||(14145606-14145662)
chr7 (14-62)||(48810310-48810358)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (16-212)||(962-1158)
scaffold0621 (16-212)||(5379-5575)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (16-212)||(7315-7511)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (11-219)||(22459307-22459515)
chr1 (11-219)||(22469736-22469944)
chr1 (12-206)||(20247155-20247349)
chr1 (11-230)||(22832386-22832605)
chr1 (14-219)||(21044384-21044589)
chr1 (70-206)||(21752954-21753090)
chr1 (16-212)||(18273729-18273925)
chr1 (16-212)||(22117645-22117841)
chr1 (11-219)||(19110290-19110498)
chr1 (11-219)||(16346824-16347032)
chr1 (11-219)||(16353473-16353681)
chr1 (11-219)||(21843133-21843341)
chr1 (20-218)||(16380019-16380218)
chr1 (16-219)||(41349904-41350107)
chr1 (11-230)||(22434982-22435189)
chr1 (16-219)||(21834223-21834426)
chr1 (11-213)||(17041243-17041445)
chr1 (16-219)||(33387264-33387467)
chr1 (16-228)||(21177282-21177488)
chr1 (11-219)||(51329722-51329930)
chr1 (16-230)||(24784094-24784308)
chr1 (13-219)||(21738268-21738471)
chr1 (117-219)||(21741885-21741987)
chr1 (154-219)||(22401241-22401306)
chr1 (28-86)||(16670219-16670277)
chr1 (118-197)||(48426850-48426929)
chr1 (28-86)||(20853013-20853071)
chr1 (125-207)||(20922375-20922457)
chr1 (118-219)||(36213045-36213146)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (16-219)||(121331-121534)
scaffold0034 (14-74)||(71452-71512)
scaffold0034 (14-89)||(11259-11334)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (12-230)||(10039-10257)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (16-212)||(54635-54831)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (16-212)||(15775-15971)
scaffold0008 (11-213)||(793-995)
scaffold0008 (11-213)||(138757-138959)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (12-230)||(33931-34149)
scaffold0022 (16-212)||(42577-42773)
scaffold0022 (16-212)||(76297-76493)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (16-212)||(1176-1372)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (16-212)||(4040-4236)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (12-230)||(30158-30376)
scaffold0090 (16-111)||(1779-1874)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (16-230)||(9141-9355)
scaffold0029 (11-230)||(106935-107154)
scaffold0029 (28-191)||(93078-93232)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (16-197)||(255-436)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (12-228)||(791-1007)
[»] scaffold0261 (5 HSPs)
scaffold0261 (14-230)||(166-382)
scaffold0261 (13-92)||(11577-11656)
scaffold0261 (13-92)||(19757-19836)
scaffold0261 (136-219)||(11697-11780)
scaffold0261 (136-219)||(19877-19960)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (12-219)||(780-987)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (11-230)||(358-577)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (12-230)||(23885-24103)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (12-230)||(31214-31432)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (16-212)||(105140-105336)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (11-230)||(49503-49722)
scaffold0102 (13-74)||(43777-43838)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (16-175)||(22587-22746)
scaffold0081 (16-175)||(38011-38170)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (12-230)||(9338-9556)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (16-230)||(23389-23603)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (11-197)||(9384-9570)
scaffold0273 (138-230)||(958-1050)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (16-212)||(17141-17336)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (16-212)||(16355-16551)
scaffold0293 (14-219)||(9268-9473)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (11-219)||(35978-36186)
scaffold0042 (14-205)||(27304-27489)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (31-230)||(16527-16726)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (16-218)||(675-877)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (16-206)||(11717-11907)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (12-230)||(15838-16056)
scaffold0403 (11-230)||(495-714)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (16-212)||(56818-57014)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-230)||(65688-65907)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (16-212)||(12761-12957)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (11-230)||(14746-14965)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (13-212)||(30220-30419)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (11-219)||(11588-11790)
scaffold0297 (128-230)||(6932-7034)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (14-219)||(8511-8716)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (11-230)||(194026-194245)
scaffold0017 (16-218)||(16229-16431)
scaffold0017 (16-218)||(20751-20953)
scaffold0017 (13-74)||(3617-3678)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (16-219)||(442590-442793)
scaffold0001 (137-213)||(167468-167544)
scaffold0001 (13-66)||(164302-164355)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (11-219)||(425237-425445)
scaffold0003 (11-230)||(138613-138832)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (11-230)||(13188-13407)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (16-219)||(11302-11505)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (40-211)||(4488-4659)
[»] scaffold0010 (5 HSPs)
scaffold0010 (11-230)||(15351-15570)
scaffold0010 (11-230)||(22115-22334)
scaffold0010 (16-212)||(5860-6056)
scaffold0010 (28-86)||(180023-180081)
scaffold0010 (14-74)||(38499-38559)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (16-125)||(104723-104832)
scaffold0040 (14-167)||(21123-21276)
scaffold0040 (172-219)||(18783-18830)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (59-174)||(20079-20194)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (16-219)||(18098-18301)
scaffold0044 (169-219)||(6930-6980)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (16-219)||(12387-12590)
scaffold0028 (16-219)||(21915-22118)
scaffold0028 (16-230)||(55928-56142)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (14-219)||(555-754)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-206)||(229016-229205)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (13-219)||(71046-71249)
scaffold0046 (14-218)||(868-1072)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (16-230)||(3782-3996)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (13-209)||(8505-8701)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (118-218)||(7050-7150)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (97-212)||(15767-15882)
scaffold0395 (16-73)||(15713-15770)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (16-218)||(727-923)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (16-212)||(35390-35574)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (13-219)||(16875-17078)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (11-219)||(42090-42298)
scaffold0109 (11-72)||(12290-12351)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (11-155)||(37440-37584)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (32-230)||(49589-49787)
scaffold0007 (19-219)||(162174-162374)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (68-212)||(13480-13624)
scaffold0342 (16-51)||(13440-13475)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (16-212)||(22696-22892)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (16-218)||(1042-1238)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (16-230)||(14210-14418)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (14-203)||(17520-17709)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (13-173)||(33543-33703)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (11-228)||(236-447)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (70-144)||(5758-5832)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (16-218)||(14166-14368)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (13-212)||(147-343)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (13-219)||(61935-62138)
scaffold0053 (28-83)||(64500-64555)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (14-203)||(3886-4069)
[»] scaffold1600 (1 HSPs)
scaffold1600 (14-209)||(1005-1195)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (14-219)||(17575-17774)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (16-97)||(28154-28235)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (118-230)||(1068-1180)
scaffold0410 (16-100)||(1186-1270)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (13-203)||(11077-11261)
[»] scaffold1336 (2 HSPs)
scaffold1336 (13-92)||(1746-1825)
scaffold1336 (117-230)||(1832-1945)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (13-92)||(4379-4458)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (68-203)||(26835-26970)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-92)||(43873-43952)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (13-219)||(6118-6318)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (59-213)||(1740-1894)
scaffold0371 (13-63)||(4494-4544)
[»] scaffold0848 (2 HSPs)
scaffold0848 (136-213)||(4294-4371)
scaffold0848 (14-83)||(4175-4244)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (118-230)||(35-147)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (133-209)||(702-778)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (14-74)||(16373-16433)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (118-230)||(7044-7156)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (14-74)||(23202-23262)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (13-219)||(52590-52793)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (118-230)||(172046-172158)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (40-197)||(5-159)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (14-189)||(6064-6239)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (16-139)||(23359-23481)
scaffold0243 (14-74)||(8940-9000)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (13-92)||(46-125)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (76-230)||(5925-6078)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (13-63)||(28931-28981)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (11-72)||(956-1017)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (118-203)||(2704-2789)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (13-86)||(5065-5138)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (13-86)||(116692-116765)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-197)||(320203-320383)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (14-74)||(8963-9023)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (14-74)||(48344-48404)
scaffold0067 (14-74)||(57378-57438)
scaffold0067 (14-74)||(63766-63826)
scaffold0067 (13-209)||(30572-30765)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (13-92)||(35-114)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (16-83)||(635-702)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (13-92)||(7130-7209)
scaffold0148 (127-213)||(7015-7101)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (84-219)||(23182-23317)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (84-219)||(8171-8306)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (14-204)||(36736-36926)
[»] scaffold1979 (1 HSPs)
scaffold1979 (13-74)||(237-298)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (118-219)||(6375-6476)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (13-74)||(177058-177119)
scaffold0020 (13-74)||(97770-97831)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (14-74)||(400-460)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (13-211)||(2662-2857)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (14-86)||(3247-3319)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-74)||(264306-264366)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (14-68)||(5427-5481)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (28-85)||(526-583)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (13-86)||(62702-62775)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (169-221)||(42735-42787)
scaffold0104 (13-92)||(42582-42661)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (118-209)||(12352-12443)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (31-86)||(3688-3743)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (25-92)||(1152-1219)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (117-212)||(30471-30566)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (31-92)||(467-528)
[»] scaffold0947 (1 HSPs)
scaffold0947 (13-74)||(712-773)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (31-80)||(16980-17029)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (14-74)||(52587-52647)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (14-74)||(55127-55187)


Alignment Details
Target: scaffold0071 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3366 - 3152
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3366 atggctggaagaaacgatgttgtgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgttggacatcagcctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgaag 3267  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266 cgaggatgctagagacctttcggaggaatcatcctcctactctcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgagagggt 3167  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| ||||||||||    
T  3166 tttccgcgtgatgca 3152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 15458825 - 15459039
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15458825 atggctggaagaaacgatgttgtgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgttggacatcagcctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgaag 15458924  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15458925 cgaggatgctagagacctttcggaggaatcatcctcctactctcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgagagggt 15459024  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| ||||||||||    
T  15459025 tttccgcgtgatgca 15459039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17498422 - 17498208
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  17498422 atggctggaagaaacgacactgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagttgtgggacgacagcctaatgcgaatgctggtggaagtgttgaag 17498323  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  17498322 ggaggatgctagagacctttctgagggatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagatttagaaggt 17498223  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||||||||||||||    
T  17498222 tttctgcgtgatgca 17498208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11862083 - 11861871
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||||       
T  11862083 atggctggaagaaacgatgatgtgttagctgctgcactacaagccgtagcccaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggagtgaatgctgaga 11861984  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  11861983 cgaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatcgagcccagacgtggcttaaggagatcgagaggat 11861884  T
Q  216 tttctgcgtgatg 228  Q
    |||| | ||||||    
T  11861883 tttccgtgtgatg 11861871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 14577820 - 14578022
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  |    
T  14577820 atggctggtagaaacgacgctacgattgctgctgcactggaagctgttgctcaagctgtgggacaacagcctaatgctaatgcgggtgcaaatgctgatg 14577919  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |   ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  14577920 tgaggatgctagagacttttttgaggaatcatcctcttgtgttcaaaggaaggtatgaccctgatgtagctcaaacgtggctcaaggagatcgagaggat 14578019  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  14578020 ttt 14578022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 14872980 - 14873186
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||    
T  14872980 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcattagctgctaaactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcaaatgctggtgtgaatgc 14873079  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  14873080 tgagacgaggatgcttgaga-ctttacgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgag 14873178  T
Q  211 agggtttt 218  Q
    || |||||    
T  14873179 agagtttt 14873186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12890437 - 12890234
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||    
T  12890437 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaag 12890338  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  12890337 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 12890238  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  12890237 tttc 12890234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 15585794 - 15585997
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  15585794 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 15585893  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15585894 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 15585993  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  15585994 tttc 15585997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 15712458 - 15712672
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  15712458 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 15712557  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15712558 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctcctactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 15712657  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||||| || |||||    
T  15712658 tttctgggttatgca 15712672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 23078409 - 23078590
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||       
T  23078409 atgggtggaagaaatgatgttgcgttagctgctgcactataagccgtagcacaagtcgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgctgaga 23078508  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  23078509 cgaggatgcttgagacttttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggct 23078590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6597788 - 6597580
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  6597788 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 6597689  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | |||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  6597688 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 6597589  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  6597588 aggattttc 6597580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15263352 - 15263156
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||   ||||||||||||||| || |||||| | || || ||||| | |||||  |    
T  15263352 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattggaagttgtgtttcaagctgtgggacatcagcctaatactaacgcgggtgctaatgctgagg 15263253  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15263252 ttaggatgttggagacttttctgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtacgaccctgatggagctcagacgtggctgaaagagattgagag 15263156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15264164 - 15263968
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||   ||||||||||||||| || |||||| | || || ||||| | |||||  |    
T  15264164 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattggaagttgtgtttcaagctgtgggacatcagcctaatactaacgcgggtgctaatgctgagg 15264065  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15264064 ttaggatgttggagacttttctgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtacgaccctgatggagctcagacgtggctgaaagagattgagag 15263968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 20058456 - 20058659
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  20058456 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 20058555  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  20058556 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 20058655  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  20058656 tttc 20058659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3689676 - 3689468
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  3689676 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcaaatgc 3689577  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  3689576 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatggag 3689477  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  3689476 aggattttc 3689468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13249777 - 13249569
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  13249777 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 13249678  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13249677 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 13249578  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  13249577 aggattttc 13249569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13256423 - 13256215
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  13256423 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 13256324  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13256323 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 13256224  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  13256223 aggattttc 13256215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 15398916 - 15399124
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  15398916 cagaaatggctggcagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgc 15399015  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15399016 tgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggctgaaagagactgag 15399115  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  15399116 aggattttc 15399124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 16753098 - 16753306
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  16753098 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgc 16753197  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | |||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16753198 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 16753297  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  16753298 aggattttc 16753306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 5421332 - 5421535
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  5421332 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 5421431  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  5421432 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 5421531  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  5421532 tttc 5421535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6604463 - 6604260
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  6604463 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagttgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 6604364  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | |||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  6604363 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 6604264  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  6604263 tttc 6604260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16639501 - 16639298
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  16639501 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 16639402  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16639401 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 16639302  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  16639301 tttc 16639298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 23414184 - 23414403
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||    
T  23414184 cagaaatggctagatggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccatgctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgtgaatgc 23414283  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  23414284 tgagaccaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccaatggagcccagacgtggctaaaagagattgaa 23414383  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  23414384 aggattttccgtgtgatgca 23414403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43166403 - 43166200
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  43166403 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 43166304  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  43166303 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 43166204  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  43166203 tttc 43166200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 26789815 - 26790012
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  26789815 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 26789914  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  26789915 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagagg 26790012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15066793 - 15066585
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| || ||||||||      |||||  | |||||       
T  15066793 atggctggaaggaacgatgctgctattgctgctgcactagaaactgtagcacaagctattggacatcagcctaatgc------tggtgtgaatgctgaga 15066700  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||    
T  15066699 cgaggatgcttgagactttcatgaggaatcatcctcctaccttcaaggggagatatgatccagatggagctcagacgtggcttaaggtgattgagagagt 15066600  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| | ||||||||    
T  15066599 tttccgtgtgatgca 15066585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 53381421 - 53381624
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  53381421 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 53381520  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | || ||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| | |||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  53381521 ctagaatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgattttcaaaggacgctatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 53381620  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  53381621 tttc 53381624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 5107941 - 5108143
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  5107941 atggctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 5108040  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  5108041 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 5108140  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  5108141 ttt 5108143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15359783 - 15359597
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  15359783 cagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgc 15359684  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15359683 tgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagttatgaccctgatggagcccagacgtggct 15359597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10909938 - 10909735
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || |||||| || | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  10909938 atggctggaaggaatgatgctacgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 10909839  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  10909838 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 10909739  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  10909738 tttc 10909735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15231346 - 15231147
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||   |||||||||||  | ||     
T  15231346 agatggctggaaggaacgatgctgctattgctgctgcactgcaagctgtagctcaagctgtaggacagcaacggaatgctggtgctggtgcaaacgatgg 15231247  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    || |||| || | || || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  15231246 agtgaggttgttggaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcaaaggtagatatgatcctggtggagctcagaagtggctcaaagaagttgagagg 15231147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15237214 - 15237015
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||   |||||||||||  | ||     
T  15237214 agatggctggaaggaacgatgctgctattgctgctgcactgcaagctgtagctcaagctgtaggacagcaacggaatgctggtgctggtgcaaacgatgg 15237115  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    || |||| || | || || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  15237114 agtgaggttgttggaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcaaaggtagatatgatcctggtggagctcagaagtggctcaaagaagttgagagg 15237015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48429175 - 48428972
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  48429175 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctcttcaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 48429076  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  48429075 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 48428976  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  48428975 tttc 48428972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 5109811 - 5110013
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  5109811 atggctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 5109910  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |    
T  5109911 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcctagacgtggcttaaggagattgagaggat 5110010  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  5110011 ttt 5110013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35983922 - 35983719
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||   |||||||   | || ||    
T  35983922 gagatggctgggagaaacgatgcagctattgctgctgcacttgaagctgttgctcaagctataggacagcaaccgaatgctgttgctggt---aatgatg 35983826  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||  || || || || || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35983825 gtgtgaggatgttggagacctttctgaggaaccatccaccaacatttaaagggaggtatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 35983726  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  35983725 gattttc 35983719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 12507951 - 12508146
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||| ||     
T  12507951 agatggctggaagaaatgacgctgctattgctgctgcattggaagttgtggctcaagttgtggggcaacagcctaatgctggtgctggtgctagtggtga 12508050  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
     |  || ||| | || || ||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12508051 ggttagaatgttggaaacttttttgagaaatcatccacctactttcaaaggaaggtgtgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagaggttga 12508146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 15344647 - 15344850
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  15344647 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcggaag 15344746  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| || ||||| |||   ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15344747 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgaccttcaaaggacattatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 15344846  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  15344847 tttc 15344850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16695888 - 16695681
Alignment:
Q  23 gaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggat 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||   | |||||    
T  16695888 gaagaaacgatgctgcgttaggtgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgtgaatgctgagaccaggat 16695789  T
Q  123 gctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgc 222  Q
    | | ||||||||  |||||||||||| ||  |||||||| || | ||||||||  || ||||||||||| ||| | || ||||| |||||| ||||| |     
T  16695788 gttggagaccttcatgaggaatcatcctctaactttcaaagggatatatgaccccgacggagctcagacttggattaaggagatggagaggattttccgt 16695689  T
Q  223 gtgatgca 230  Q
    ||||||||    
T  16695688 gtgatgca 16695681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19728369 - 19728294
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19728369 tgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 19728294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10009328 - 10009125
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  10009328 atggctggaaggaatgatgctgcattagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcggaag 10009229  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| || ||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  10009228 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgaccttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagcttgagaggat 10009129  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  10009128 tttc 10009125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 12842627 - 12842706
Alignment:
Q  133 tttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12842627 tttctgaggaaccatcctcatactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcatggagattgagag 12842706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24186886 - 24186794
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtg 103  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24186886 cagaaatggctggaaggaactatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtggaacaacaacctaacgcgaatgctggtg 24186794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12502622 - 12502482
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| | ||||| || |||      ||||||||||  | |||||       
T  12502622 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactatatactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgctggtgtgaatgctgaga 12502529  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaag 162  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  12502528 cgaggatgcttgagactttcatgaggaatcatcctcctactttcaag 12502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 12856901 - 12857115
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||   |||||||   |  | ||    
T  12856901 gagatggttgggagaaatgatgctgttattgttgctgcactggaagctgttgctcaagctgtaggacaacagccgaatgctggtgctggt---aacgatg 12856997  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||| ||||| || |||||||||||||||||||  || || ||||| || || ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||| |||||||    
T  12856998 gtgtgagaatgctggaaacctttctgaggaatcatccaccaacattcaaagggaggtatgaccttgatggagcccaaaagtggctcaaggaggttgagag 12857097  T
Q  213 ggttttctgcgtgatgca 230  Q
      ||||| | ||||||||    
T  12857098 aattttcagggtgatgca 12857115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12273480 - 12273410
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12273480 atggctggtagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacatcaacc 12273410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 16490725 - 16490790
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  16490725 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaa 16490790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 15011361 - 15011421
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctg 73  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  15011361 gagatggctggaagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggatgtagctcaagctg 15011421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 2036303 - 2036370
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2036303 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctgtagctcaagctgtaggacaaca 2036370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 2040044 - 2040111
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2040044 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctgtagctcaagctgtaggacaaca 2040111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14040484 - 14040417
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14040484 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctgtagctcaagctgtaggacaaca 14040417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 15937775 - 15937848
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15937775 gagatggctggtagaaatgatgctgctatcgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 15937848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 8743785 - 8743845
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8743785 agatggctggtagaaacgacgctgctattgctgctgcacttgaggccgtagctcaagctgt 8743845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 204
Target Start/End: Original strand, 13027811 - 13027947
Alignment:
Q  68 aagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaag 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||  | ||||| || ||||||| || | || ||| |||||||||| |  ||||||||||| || ||    
T  13027811 aagctgtggggcaacaacctaatgctggtgctggtgttaatgctgaagtgaggatgttataaacttttttgaggaatcacccgcctactttcaaagggag 13027910  T
Q  168 atatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagag 204  Q
     ||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  13027911 gtatgatccagatggagctcaatcgtggctcaaagag 13027947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13945758 - 13945698
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13945758 agatggctggtaggaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggccgtagctcaagctgt 13945698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 41179906 - 41179846
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  41179906 agatggctggtaggaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggccgtagctcaagctgt 41179846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10409607 - 10409516
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  10409607 aggatgctagagactttcctgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgatggtgctcagaaatggctaaaggagattga 10409516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 14289919 - 14290123
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagt---g 109  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||| || | |||||| ||||||||   |||||||||     |||||||||||||  ||   |    
T  14289919 gagatggctgggagaaatgatgatgctcttgctgctgcacttgaggttgtagcccaagctgtacaacaacaacc-----cgaatgctggtgctggtaatg 14290013  T
Q  110 ctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
     ||  | ||||||| | |||||||||| ||| || ||||  || || ||||| || || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  14290014 atggtgtgaggatgttggagacctttcggagaaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgatggagctcaggagtggctcaaagaggttga 14290113  T
Q  210 gagggttttc 219  Q
    |||| |||||    
T  14290114 gaggattttc 14290123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Original strand, 15935925 - 15935992
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggaca 80  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15935925 gagatggctggtagaaatgatgctgcaatcgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggaca 15935992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 10416454 - 10416512
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  10416454 aacgatgctgcaattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 10416512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 16824667 - 16824740
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16824667 gagatggttggtagaaacgacgttgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 16824740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 16383767 - 16383827
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  16383767 agatggctggtaggaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggccctagctcaagctgt 16383827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 31691591 - 31691730
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagaga 130  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||| ||||| || ||   ||||| ||  | || || || ||||||||| ||||    
T  31691591 gatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtacaacagcaaccgaacgc---tgctgctggtaatggtgaagtgaggatgctggaga 31691687  T
Q  131 cctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatga 173  Q
    ||||| ||||||||||||  ||  | ||||||||||| |||||    
T  31691688 cctttttgaggaatcatccaccagcattcaagggaaggtatga 31691730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Original strand, 16803370 - 16803425
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16803370 gatgctgccatcgctgctgcacttgaggctgtggctcaagctgtaggacaacaacc 16803425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 31942626 - 31942583
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31942626 gatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 31942583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17495391 - 17495210
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||| | ||||| ||||  |||||   |||||||   |  | ||    
T  17495391 gagatggctggtagaaatgacgctgctattgctgctgcacttgagactgttgctcaagctataggacagcaacaaaatgctggtgctggt---aacgatg 17495295  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
     || |||| || | ||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||| ||||||    
T  17495294 gagtgaggttgttggagacctttttgaggaatcatccaccaactttcaaaggaaggtatgatcctgatggcgcccagaagtggct 17495210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19728479 - 19728433
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgt 62  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  19728479 atggctggaagaaacgacgctgtgattgctgctgcattggaagctgt 19728433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Original strand, 13304193 - 13304254
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13304193 gatgctgctatcgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 13304254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Original strand, 16824769 - 16824870
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||   || ||||| || || || ||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||    
T  16824769 aggatgttggagacctttctgaggaaccattcaccaacttttaaagggaggtatgaccctaacggagctcagaagtggctcaaggaggttgagaggattt 16824868  T
Q  218 tc 219  Q
    ||    
T  16824869 tc 16824870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28757958 - 28757857
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||| |||||| || || ||||| ||| |||    
T  28757958 aggatgcttgagactttcctgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgacggtgctcagaagtggctgaaggaaattgaaaggattt 28757859  T
Q  218 tc 219  Q
    ||    
T  28757858 tc 28757857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47127583 - 47127482
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||| |||||| || || ||||| ||| |||    
T  47127583 aggatgcttgagactttcctgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgacggtgctcagaagtggctgaaggaaattgaaaggattt 47127484  T
Q  218 tc 219  Q
    ||    
T  47127483 tc 47127482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 16830917 - 16830977
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  16830917 agatggctggtagaaacgatgttgtagttgctgctgcacttgaggatgtagctcaagctgt 16830977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24190943 - 24190863
Alignment:
Q  117 gaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || || ||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||    
T  24190943 gaggatgctggagaccttcttgaggaaccatcccccaacattcaagggaaggtatgaccccgatggtgcccagacgtggct 24190863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 39756 - 39972
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  | | ||||||||||||||||||    
T  39756 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgatgcactagaagctgtagctcaagctgttggacatcagcctggttcaaatgctggtgcaagtgct 39855  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856 gaagcgaggatgctagagacctttctaaggaatcatcctcctactttcaagggaatatatgacccttatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 39955  T
Q  212 gggttttctgcgtgatg 228  Q
    |||||||| ||||||||    
T  39956 gggttttccgcgtgatg 39972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 18404237 - 18404437
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18404237 agagatggctggaagaaacgatgttgcgattgctgctgcactagaagttgtagctcaagctgttggacatcagcctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 18404336  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18404337 gaagcgaggatgctagagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctaatggagcccagacgtggctcaaagagattgaga 18404436  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  18404437 g 18404437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23082399 - 23082185
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || || |||||||| |||| |||||| | | ||| ||    
T  23082399 atggttggaagaaacaacgctgcgattgctgctgcactggaagctgtggctcaagttgtggggcatcagcctaatgcaaatgttggtgctaattctgaag 23082300  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  23082299 tgaggatgttggagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggcttaaagagattgagagagt 23082200  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
     ||| | ||||||||    
T  23082199 gttccgtgtgatgca 23082185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 5835536 - 5835733
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||       
T  5835536 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctttacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgtgaacgctgaga 5835635  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5835636 cgaggatgttggagactttcatgaggaatcatcctccaactttcaagggaagatatgaccccgatggagctcagacttggctcaaggagattgagagg 5835733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21765793 - 21765585
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  | ||     
T  21765793 cagaaatggctagaagtaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctatgaggcaacaacctaatgcgaatgctggtgtgaatgt 21765694  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  21765693 tgagtctaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgag 21765594  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  21765593 aggattttc 21765585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19667410 - 19667226
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||            | || || ||||| ||    
T  19667410 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattagaagctgtagctcaagctgtgggacatcagcct------------gctgtaaatgctgaag 19667323  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     || ||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19667322 tgacgatgctagaaaattttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtgcctcaaggagattgagag 19667226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19872169 - 19872005
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| | ||     
T  19872169 cagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaaaccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgttggtgcgaatgt 19872070  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgacc 175  Q
    ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19872069 tgagtcgaggatgcttgagaccttcttgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacc 19872005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16575863 - 16575660
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  16575863 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaggctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 16575764  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16575763 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 16575664  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  16575663 tttc 16575660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 16619517 - 16619720
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  16619517 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaggctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 16619616  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16619617 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 16619716  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  16619717 tttc 16619720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 28259505 - 28259708
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  28259505 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 28259604  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  28259605 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagatagagaggat 28259704  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  28259705 tttc 28259708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28286411 - 28286208
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  28286411 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 28286312  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  28286311 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagatagagaggat 28286212  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  28286211 tttc 28286208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28313603 - 28313400
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  28313603 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 28313504  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  28313503 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagatagagaggat 28313404  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  28313403 tttc 28313400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 28338254 - 28338457
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  28338254 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 28338353  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  28338354 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagatagagaggat 28338453  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  28338454 tttc 28338457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 29588747 - 29588950
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  29588747 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctcttcaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 29588846  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  29588847 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 29588946  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  29588947 tttc 29588950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 2871110 - 2871313
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||    
T  2871110 atggccggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgctggtgcgaacgctgaag 2871209  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  2871210 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 2871309  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  2871310 tttc 2871313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 24292089 - 24292292
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  24292089 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcggaag 24292188  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  24292189 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 24292288  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  24292289 tttc 24292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27206595 - 27206392
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    
T  27206595 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgagg 27206496  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | |||  ||||||| |||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27206495 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccagctttcaaaggacattatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagattgagaggat 27206396  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  27206395 tttc 27206392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 27242633 - 27242836
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |    
T  27242633 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgagg 27242732  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | |||  ||||||| |||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27242733 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccagctttcaaaggacattatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagattgagaggat 27242832  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  27242833 tttc 27242836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 25958056 - 25958246
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||     
T  25958056 agatggctggaagaaacgatgttgctattgctgctgcattggaatatgtggctcaagctatgggacaacagcctaatgctagtgctggtgttaatgctga 25958155  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagag 204  Q
    || ||||||| | || || ||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  25958156 agtgaggatgttggaaacttttatgaggaatcatccgcctattttcaaaggaaggtatgatccagatggagctcaatcgtggctcaaagag 25958246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22437841 - 22437655
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || || |||| |||||||||| |||  ||||||| ||||||||      |||||| | |||||     
T  22437841 agatgactggaagaaacgatgctgcgctagctgctacaatataagccgtagctcaagttgtttgacaacagcctaatgc------tggtgcgaatgctga 22437748  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagat 206  Q
      |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  22437747 gtcgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccgaacgtggcttaaggagat 22437655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 23084128 - 23084333
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||   | |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||     
T  23084128 agatggctggaagaaatgacgccgctattgctgctgggttggaagttgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgctgatgctggtgctaatgctga 23084227  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
     |  || ||| | ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23084228 tgttagaatgttggagacttttctgaggaataatccacctactttcaaaggaaggtatgatccagatggagctcagacgtggctcaaagaggtagagagg 23084327  T
Q  214 gttttc 219  Q
     |||||    
T  23084328 attttc 23084333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Original strand, 25755955 - 25756129
Alignment:
Q  56 aagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctac 155  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||  | |||||   |||| ||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |     
T  25755955 aagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacatgaatgatggtgtgaatgctgagacgagaatgttagagaccttcatgaggaatcatcctccaaa 25756054  T
Q  156 tttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
     ||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  25756055 cttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagatgtggctcaaagagattgagaggattttccgtgtgatgca 25756129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25116533 - 25116330
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||  |    
T  25116533 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgctctacaagctgttgtccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgatg 25116434  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | |||||  |  ||| |||  | | ||| ||| || | ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25116433 ctaggatgttggagactatcatgaagaagaaccgtccaactctctaaggacgttatgaccgtgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagaggat 25116334  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  25116333 tttc 25116330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18660885 - 18660695
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||| |||| ||     
T  18660885 agatggttggaagaattgacgctgctattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgttggtgctggtgctagtggtga 18660786  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagag 204  Q
     |  || ||| | || ||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18660785 ggttagaatgttggaaactcttctgagaaatcatccacctactttcaagggaaggtatgaccctgatggagctcagtcgtggctcaaagag 18660695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 30675276 - 30675459
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||      |||||  | |   |     
T  30675276 agatggctagaaggaatgatgctgctattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtagggcaacaacctaatgc------tggtggtaataacga 30675369  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
    ||  |||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30675370 agttaggatgttagaaacttttctgaggaatcatccacctactttcaagggaaggtatgatcctgatggagctcagacgtggctcaaaga 30675459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18326835 - 18326646
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| || | ||  |     
T  18326835 agatggctggaaggaatgatgttgttattgctgctgcattggaagttgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgctggtgctggcgctaatgacgg 18326736  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
    ||  |||||| | || || ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18326735 agttaggatgttggaaacttttctgaggaatcgtccacctgctttcaagggaaggcatgatcctgatggagctcagacgtggctcaaaga 18326646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Original strand, 25607537 - 25607601
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggaca 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25607537 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagcccaagctgttggaca 25607601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25771823 - 25771617
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||| ||  |    
T  25771823 gagatggctgggagaaatgatgttgctattgctgctgcactgcaagctgtagctcaagctgtaggacagcaaccgaatgctggtgctggtgcaaatgacg 25771724  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    ||| |||| || | || |  ||| |||| ||||||   || |||||||| || |||||| | | |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25771723 tagtgaggttgttggaaatttttttgagaaatcatgcaccaactttcaaaggtagatataatcctgatggagcatagaagtggctcaaagaggttgagag 25771624  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  25771623 gattttc 25771617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21475518 - 21475306
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaa------tgcgaatgctggtgcaa 106  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||      |||  ||||||||||||    
T  21475518 gagatggctgggagaaatgatgctgccattgctgctgcattgcaagctgttgctgaagctgtaggacaacaaccaaatgttggtgctgatgctggtgcaa 21475419  T
Q  107 gtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagat 206  Q
     ||  | || |||| || | || || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  21475418 ttgacggagtgaggttgttggaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcaaaggtagatataatcctgatggagcacagaagtggctcaaagaggt 21475319  T
Q  207 tgagagggttttc 219  Q
    ||||||| |||||    
T  21475318 tgagaggattttc 21475306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 18178750 - 18178837
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtg 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  18178750 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattgaaagttgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgctaatgttggtg 18178837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 27554595 - 27554687
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtg 103  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27554595 cagaaatggctggaggaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaacgctggtg 27554687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 228
Target Start/End: Original strand, 27558247 - 27558333
Alignment:
Q  142 aatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatg 228  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  27558247 aatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccttgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggattttccgtgtgatg 27558333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 18181839 - 18181895
Alignment:
Q  163 ggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    ||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18181839 ggaaggtacgaccctgatgaagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 18181895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 8720013 - 8720080
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8720013 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctgtagctcaagctgtaggacaaca 8720080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15463291 - 15463232
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacct 87  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15463291 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtggctcaagctgtaggacagcaacct 15463232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16828679 - 16828615
Alignment:
Q  17 tggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16828679 tggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcgag--gctgtagctcaagctgtgggacaaca 16828615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19438960 - 19438902
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaa 89  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  19438960 gatgctgctattgctgctgtacttgaggctgtagctcaagctgtactacaacaacctaa 19438902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 20009827 - 20009885
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20009827 aacgatgctgctatcgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 20009885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 18880256 - 18880474
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18880256 agagatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagttgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcaagtgct 18880355  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18880356 gaagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcatactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgaga 18880455  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || |||  |||||||||    
T  18880456 gagtgttccacgtgatgca 18880474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21672693 - 21672497
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| || | |||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || || ||    
T  21672693 atggctggaagaaaggacgatgcgttagctgctgcactacaagttgtggctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgatgaag 21672594  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21672593 tgaggatgctagagacttttatgaggaatcatcctcctattttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 21672497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 22420496 - 22420692
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| | |||||  |    
T  22420496 atggctggaagaaacgacgttgcaattgctgttgcactagaagttgtggctcaagctgtggggcatcagcctaatgctaatgctggtgctaatgctgagg 22420595  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22420596 tgaggatgttggagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 22420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6518548 - 6518334
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6518548 atggctagaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccgtggctcaagctgtgggacagcagcctaatgcgaatgctggtgcaaatgctgaag 6518449  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||    
T  6518448 cgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctgctttcaagggtagatatgttcctgatggagctcagacgaggctcaaggagatagagagagt 6518349  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
     ||| | ||||||||    
T  6518348 gttccgtgtgatgca 6518334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19982150 - 19981931
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | |||    
T  19982150 cagagatggctggaagaaacgatgttgcgttaggtgctgcactaccagccgtagctcaagctgtggggcaatagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgc 19982051  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19982050 tgagtcgaggatgctggaaacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgagggagcccagacgtggcttaaggagattgag 19981951  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || |||||| | ||||||||    
T  19981950 agagttttccgtgtgatgca 19981931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 21390491 - 21390698
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||    
T  21390491 agagatggatgggagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgatggtgcgaatgct 21390590  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21390591 gagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcaccctcttactttcaagggaagatacgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagattgaga 21390690  T
Q  212 gggttttc 219  Q
    | ||||||    
T  21390691 gagttttc 21390698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 21779817 - 21780024
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||    
T  21779817 agagatggatgggagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgatggtgcgaatgct 21779916  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21779917 gagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcaccctcttactttcaagggaagatacgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagattgaga 21780016  T
Q  212 gggttttc 219  Q
    | ||||||    
T  21780017 gagttttc 21780024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 17354502 - 17354704
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||      ||||||||||| | |||    
T  17354502 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagcacaagctgttggacatcagcct------aatgctggtgcgaatgc 17354595  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||     
T  17354596 tgagtcgaggatgcttaagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgaa 17354695  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    || ||||||    
T  17354696 agagttttc 17354704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 30309742 - 30309949
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  30309742 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgtgaatgc 30309841  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30309842 tgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctaaaagagattgag 30309941  T
Q  211 agggtttt 218  Q
    ||| ||||    
T  30309942 aggatttt 30309949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 21163140 - 21163336
Alignment:
Q  23 gaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggat 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||   |||||||    
T  21163140 gaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactgcaagccgtagctcaagctatggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgagacgaggat 21163239  T
Q  123 gctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| || ||||| || || ||||||    
T  21163240 gcttgagacctttatgaggaatcattctcctactttcaagggaagatattaccccgatggagcccaggcgtggcttaaggagatcgacagagttttc 21163336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22524591 - 22524395
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||   |||| | ||||| ||    
T  22524591 atggctggaagaaacgacgctgcgatttctgctgaattggaagctgtggctcaagctgtggggcatcaacctaatgctaatgtgagtgctaatgctgaag 22524492  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | ||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22524491 tgaggatgttggagacttttatgaagtatcatcctcctaccttcaaaggaagatatgaccctgatgaagctcagacgtggctcaaagagatagagag 22524395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 17829568 - 17829770
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||    
T  17829568 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgctggtgtgactgc 17829667  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||    
T  17829668 tgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctcgaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggcgattgag 17829767  T
Q  211 agg 213  Q
    |||    
T  17829768 agg 17829770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20392267 - 20392068
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||   ||||||||| | || ||    
T  20392267 gagatggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagctgtagcccaagctgtgaaacaacagccgaatgcaggtgctggtgcgaatgatg 20392168  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     || ||||||| |  | || |||||||| |||||||  || |||||||| ||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20392167 gagtgaggatgttgaaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcaatggaaggtacgatcctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 20392068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32604328 - 32604109
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||    
T  32604328 cagaaatggcgggaagaaacgatgctgtgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgttggtgtgactgc 32604229  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  32604228 tgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctaatggaggccagacgtggcttaaggagattgag 32604129  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| | ||| | ||||||||    
T  32604128 aggatattccgtgtgatgca 32604109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19116580 - 19116372
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  19116580 cagaaatggctgggaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 19116481  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19116480 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 19116381  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  19116380 aggattttc 19116372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 19480679 - 19480882
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  19480679 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctattgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 19480778  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  19480779 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 19480878  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  19480879 tttc 19480882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19497490 - 19497287
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  19497490 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctattgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 19497391  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  19497390 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 19497291  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  19497290 tttc 19497287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 20014869 - 20015072
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  20014869 atggctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 20014968  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  20014969 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 20015068  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  20015069 tttc 20015072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 22125565 - 22125762
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||    
T  22125565 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaag 22125664  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22125665 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgacccttatggagcccagacgtggcttaaagagactgagagg 22125762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15537561 - 15537358
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  | |||||       
T  15537561 atggctggaaggaactttgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgttggagtgaatgctgaga 15537462  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  15537461 ctaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgagaggat 15537362  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  15537361 tttc 15537358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22044001 - 22043782
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||| || ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||  |  |     
T  22044001 cagaaatggctggaaggaacgatgatgcgttagctgcagctctacaagctgttgcccaggctgtgggacaacaacctaacgcaaatgttggtgtgaacgt 22043902  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | || ||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  22043901 tgagactagaatgttagagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgacccagatggagcccagacgtggcttaaagagatggag 22043802  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  22043801 aggattttcagagtgatgca 22043782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 17670628 - 17670825
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  17670628 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcggaag 17670727  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| || ||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  17670728 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgaccttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagagg 17670825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22994861 - 22994660
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| || || |||||||| || || ||| | | ||||| ||    
T  22994861 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagttgtggggcatcagcctaatgctaacgcgggtactaatgctgaag 22994762  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctacttt-----caagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
      |||||| | || || ||  |||||||||||   ||||||||     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22994761 ttaggatgttggaaactttcttgaggaatcattcgcctactttaatttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 22994662  T
Q  211 ag 212  Q
    ||    
T  22994661 ag 22994660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18860757 - 18860549
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  18860757 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctactgctctacaagctgttgcccaagctatgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgc 18860658  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  | | |||  |   ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18860657 tgaagctaggatgttggagacgttcataaagaagaactgtccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 18860558  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  18860557 aggattttc 18860549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 22116781 - 22116984
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||    
T  22116781 atggctggaagaaacgatgttgctttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaag 22116880  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||| |    
T  22116881 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcctagacatggcttaaagagactgagaggat 22116980  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  22116981 tttc 22116984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 203
Target Start/End: Original strand, 20384242 - 20384308
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20384242 tgaggaatcatccacctactttcaagggaaggtatgatcctgatggagctcagacgtggctcaaaga 20384308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19986306 - 19986110
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||   ||||||||| |||||   |||||||   | || ||    
T  19986306 gagatggctgggagaaatgatgatgctcttgctgctgcacttgaggttgtagctcaagctgtacaacaacaaccgaatgctggtgctggt---aatgatg 19986210  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||||||||  || ||||||||||| || ||||  || || ||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19986209 gtgtgaggatgccggaaacctttctgagaaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 19986110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 22114012 - 22114205
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || | ||||| || ||||||||      |||||  | ||| |     
T  22114012 agatggctggaaggaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtggcacaatctattggacatcagcctaatgc------tggtgtgactgccga 22114105  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
      | |||||| | ||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  22114106 gactaggatgttggagactttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatagagagg 22114205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 21968838 - 21968931
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||    
T  21968838 tgaggaatcatccaccaacattcaagggaaggtacgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagagactgagaggatcttcagagtgatgca 21968931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21929606 - 21929403
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    |||||||   | || ||    
T  21929606 gagatggctggtagaaatgatgatgctattgctgttgcacttgaggcagttgctcaagctgtaggacatcaaccgaatgttgctgctggt---aatgatg 21929510  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||    
T  21929509 gagtaaggatgttggagacctttctgaggaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgatcctgatggagctcagaagtggctcaaggaagttgagag 21929410  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  21929409 gattttc 21929403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22242266 - 22242163
Alignment:
Q  127 gagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtga 226  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| || |    
T  22242266 gagacttttctgaggaatcattcacctacgttcaaaggaaggtatgaccctgattgagctcaaacgtggctcaaagaggttgaaagaattttctgggtca 22242167  T
Q  227 tgca 230  Q
    ||||    
T  22242166 tgca 22242163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 21981557 - 21981627
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||    
T  21981557 gagatggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcgagctgtagaacaaca 21981627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 21986476 - 21986546
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||    
T  21986476 gagatggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcgagctgtagaacaaca 21986546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Original strand, 6606075 - 6606140
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaa 81  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  6606075 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctgtagctcaagctgtaggacaa 6606140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21330626 - 21330533
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||||||||||||  || || ||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  21330626 tgaggaatcatccaccaacattcaacggaaggtacgaccctgatggagctcagaagtggcttaaagagattgagaggatcttcagagtgatgca 21330533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 21981678 - 21981771
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | ||| | ||||||||    
T  21981678 tgaggaatcatccaccaacattcaagggaaggtacgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaaactgagaggatcttcagagtgatgca 21981771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 21986597 - 21986690
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | ||| | ||||||||    
T  21986597 tgaggaatcatccaccaacattcaagggaaggtacgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaaactgagaggatcttcagagtgatgca 21986690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 22003684 - 22003745
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22003684 gagatggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcgagctgt 22003745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 22003805 - 22003898
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | ||| | ||||||||    
T  22003805 tgaggaatcatccaccaacattcaagggaaggtacgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaaactgagaggatcttcagagtgatgca 22003898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 22026884 - 22026944
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||||||    
T  22026884 agatggctggtagaaacgatgctgctattgttactgcacttgaggctgtagctcaagctgt 22026944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22049516 - 22049444
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  22049516 agatggctggtagaaccgatgctgctatcgctgctgcacttgaggctattgctcaagctgtaggacagcaacc 22049444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Original strand, 22176895 - 22176938
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22176895 gatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 22176938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 21968717 - 21968787
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| | ||||||    
T  21968717 gagatggctaggagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctatagctcgagctgtagaacaaca 21968787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Original strand, 22026983 - 22027039
Alignment:
Q  117 gaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatga 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || || ||||||||||| |||||    
T  22026983 gaggatgctggagacctttttgaggaatcatcccccaacattcaagggaaggtatga 22027039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22055034 - 22054974
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| || ||| | |||||||||||    
T  22055034 agatggctggtagaaacgatgctgctatcgctggtgcacttgaggctattgctcaagctgt 22054974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 16241006 - 16241224
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16241006 agagatggttggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctgatgcaaatgctggtgcaagtgct 16241105  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16241106 gaagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagatgtggctcaaagagattgaga 16241205  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    |||||||| || |||||||    
T  16241206 gggttttccgcatgatgca 16241224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 14937 - 15133
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  14937 atggctggaagaaatgatgttgtgattgctgttgcactagaagttgtagctcaagttgtgggacatcagcctgctgcaaatgctggtgctaatgctgaag 15036  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15037 tgaggatgctagaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaggagattgagag 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 15143845 - 15144063
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | ||||    
T  15143845 agagatggctggaagaaacgacgctgcgttagttgctgcactacaagctgtagatcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgct 15143944  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  15143945 gagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggaggttgaga 15144044  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | |||||| | ||||||||    
T  15144045 gagttttccgtgtgatgca 15144063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14163582 - 14163383
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||    
T  14163582 atggctgggagaaacgacgttgcgatcgctgctgcactgcaagctgttgctcaagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgtgggtgctaatgctgaag 14163483  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
     ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14163482 tgaggatgctggaaacttttctgaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagatcgaaagggt 14163383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16220300 - 16220104
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| | |||| |||  |||||| |||||| || || |||||||| || || ||||| | ||||| ||    
T  16220300 atggctggaagaaacgacgttgcgattgctactgcattggaagttgtgactcaagatgtggggcatcagcctaatgctaacgcgggtgctaatgctgaag 16220201  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16220200 tgaggatgttggagacttttctgaggaatcatcctcctaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcgaagagattgagag 16220104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 16247571 - 16247790
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||    
T  16247571 cagaaatggctggaaggaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaccctaacgcaaatgctggtgtaaatgc 16247670  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16247671 tgggactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 16247770  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  16247771 aggattttccgtgtgatgca 16247790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 18223369 - 18223588
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||    
T  18223369 cagaaatggctggaaagaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgtaaatgc 18223468  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  18223469 tgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcgaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctaaaagagatttag 18223568  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  18223569 aggattttccgtgtgatgca 18223588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8390526 - 8390318
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  8390526 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 8390427  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8390426 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 8390327  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  8390326 aggattttc 8390318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 14299882 - 14300085
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||    
T  14299882 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaag 14299981  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  14299982 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 14300081  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  14300082 tttc 14300085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14700567 - 14700368
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    |||||||| |      |     
T  14700567 agatggctggaagaaacgacgctgctattgctgctgcattggaagttgtggctcaagttgtggggcaacaacctaatgttggtgctggtgga------ga 14700474  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14700473 agttaggatgttggagacctttttgaggaatcatccacctacttttaaagtaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaga 14700374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12480714 - 12480506
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  12480714 cagaaatggctggaaggaacgatgatgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcaaatgc 12480615  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  12480614 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 12480515  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  12480514 aggattttc 12480506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13514467 - 13514259
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  | ||     
T  13514467 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaccaacctaacgcgaatgctggagtgaatgt 13514368  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | | |||| | ||||||||  || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13514367 tgagaccatgatgttggagaccttcatggggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 13514268  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  13514267 aggattttc 13514259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13880224 - 13880028
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    ||||||||||| |||||    
T  13880224 gagatggctggaagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtaggacaacaatcgaatgttggtgctggtgcaaatgctg 13880125  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
     ||  |||||| ||||||| ||| |||| |||||||  || |||||||| || |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13880124 aagttaggatgttagagacttttttgagaaatcatccaccaactttcaaaggtagatatgatcctgatgtagctcagaagtggctcaaggaggttga 13880028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8709785 - 8709592
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||| | || ||    
T  8709785 gagatggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagttgttgctcaagttgtgggacaacaac------cgaatgctggtgcgaatgatg 8709692  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     || ||||||| | || || |||||||| |||||||  || ||||| |||||||| || || | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8709691 gagtgaggatgttggaaacttttctgagaaatcatccaccaacttttaagggaaggtacgatcctggtggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 8709592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 17091047 - 17091255
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  17091047 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 17091146  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| | |||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  17091147 tgaagctacgatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 17091246  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  17091247 aggattttc 17091255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 8049529 - 8049723
Alignment:
Q  19 gctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcga 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||| |    
T  8049529 gctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaagcta 8049628  T
Q  119 ggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  8049629 ggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagagg 8049723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 16349697 - 16349841
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  | |||    
T  16349697 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgaactacaagccgtagctcaagctgtggggcaataacctaatgcgaatgttggtgtgaatgc 16349796  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctac 155  Q
    ||   |||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  16349797 tgagacgaggatgctcgagactttcatgaggaatcatcctcctac 16349841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23959856 - 23959653
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  23959856 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcggaag 23959757  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |    
T  23959756 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggaaattgagaggat 23959657  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  23959656 tttc 23959653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 16232890 - 16233098
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||| |||| || ||||||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  16232890 cagaaatggctagaaggaatgatgctgcgttagccgctgctctacaagctgttgcccaagctgtggggcaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 16232989  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | | ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16232990 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttgtgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 16233089  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  16233090 aggattttc 16233098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 18603725 - 18603933
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| | | ||||| || ||||||||      ||| |  | |||||       
T  18603725 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagagactatagcacaagttattggacatcagcctaatgc------tggagtgactgctgaga 18603818  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  18603819 ctaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 18603918  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
     ||| | ||||||||    
T  18603919 attccgtgtgatgca 18603933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14684279 - 14684178
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  14684279 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctagaagttgttgcccaagcagtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgttagtgc 14684180  T
Q  111 tg 112  Q
    ||    
T  14684179 tg 14684178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17332286 - 17332225
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtggg 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17332286 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctatggctcaagctgtggg 17332225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 14992543 - 14992746
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| | |||||||   |  | ||    
T  14992543 gagatggctggtagaaacgacgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtagggcagcaaccgaatgctactgctggt---aacgatg 14992639  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||| ||| | ||||| |||||||| || ||||  || ||||| || || || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  14992640 gtgtgagcatgttggagacttttctgagaaaccatccaccaacttttaaagggaggtatgaccctgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgagag 14992739  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  14992740 gattttc 14992746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27904495 - 27904435
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27904495 agatggctggtagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 27904435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40477098 - 40476946
Alignment:
Q  67 caagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| | |||||| |||     
T  40477098 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccgattttcaaaggac 40476999  T
Q  167 gatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||    
T  40476998 gttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggaaattgagaggattttc 40476946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 51602959 - 51603019
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  51602959 agatggctggtagaaacgacgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 51603019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 53749637 - 53749697
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  53749637 agatggctggtaggaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 53749697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Original strand, 3261056 - 3261147
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||| |||||| || ||||||||    
T  3261056 aggatgctagagactttcctgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgacggtgctcagaagtggctgaaggagattga 3261147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Original strand, 29449799 - 29449890
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  29449799 aggatgctagagactttcctgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgatggtgctcagaaatggctgaaggagattga 29449890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16151748 - 16151675
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16151748 gagatggctggtcgtaatgatgctgctattgctgctgcactaaaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 16151675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16155894 - 16155821
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16155894 gagatggctggtcgtaatgatgctgctattgctgctgcactaaaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 16155821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18260548 - 18260476
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaac 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  18260548 gagatggctggtagaaacgatgccgctattgttgctgcactttatgctgttgctcaagctgtaggacagcaac 18260476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18270511 - 18270439
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaac 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  18270511 gagatggctggtagaaacgatgccgctattgttgctgcactttatgctgttgctcaagctgtaggacagcaac 18270439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 16230038 - 16230117
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16230038 gagattgctggtagaaatgatgctgctattgcagctgcacttgagactgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 16230117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Original strand, 44658128 - 44658219
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||| |||||| || ||||||||    
T  44658128 aggatgctagagactttcttgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgacggtgctcagaagtggctgaaggagattga 44658219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15267889 - 15267816
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  15267889 gagatggctggtagaaacgatcctgctatcgctgctgcgcttgaggctgttgcttaagctgtaggacagcaacc 15267816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25430468 - 25430268
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25430468 agagatggctagaagagacgacactgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 25430369  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25430368 gaagcgaggatgctagggacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatattaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgaga 25430269  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  25430268 g 25430268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 26733836 - 26734032
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  26733836 atggttggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagaagttttggctcaagctgtaggacatcagcctaatgctaatgctggtgcaaatgctgaag 26733935  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26733936 tgaggatgttggagacttttatgaggaatcaacctcctacttttaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 26734032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 21331331 - 21331527
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || || | ||||| ||    
T  21331331 atggctggaagaaacgacgctgcgactgctgctgcattggaagctgtggctcaagctgtggggcatcagcctaatgctaatgcgggagctaatgctgaag 21331430  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21331431 tgaggatgttggagacttttctgaggtatcatcctcctaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 21331527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 23536557 - 23536769
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||       
T  23536557 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgtgaatgctgaga 23536656  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  23536657 ccaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 23536756  T
Q  216 tttctgcgtgatg 228  Q
    |||||| ||||||    
T  23536757 tttctgtgtgatg 23536769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21883817 - 21883618
Alignment:
Q  20 ctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgag 119  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||   ||||    
T  21883817 ctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaggccgtagcacaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgagtcgag 21883718  T
Q  120 gatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    |||||| || |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  21883717 gatgctggaaaccttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggatattgagagagttttc 21883618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23475238 - 23475042
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||  ||||| |||||||| || || ||||| | ||||| ||    
T  23475238 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcgttggaagatgtggctcaagctgtggagcaacagcctaatgctaacgcgggtgctaatgctgaag 23475139  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23475138 ttaggatgttggagacctttttgaggaatcatccgcctactttgaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 23475042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18783163 - 18782944
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||    
T  18783163 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgtgaacgc 18783064  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18783063 tgagactaggatgttggagaccttcgtgagaaatcatcatccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 18782964  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  18782963 aggattttccgtgtgatgca 18782944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20804641 - 20804438
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||       
T  20804641 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcagtacaagctgtagctcaacctatgggacaacagcctaatgcgaatgctggagtgaatgctgaga 20804542  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| |    
T  20804541 cgaggatgcacgagaccttcatgaggaatcatcctcctattttcaagggtagatatgaccctgatggagcccatacgtggcttaaggagatcgagaggat 20804442  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  20804441 tttc 20804438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22351960 - 22351757
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||       
T  22351960 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 22351861  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22351860 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctctaactttcaaaggacgatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagaggat 22351761  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  22351760 tttc 22351757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 27664848 - 27665053
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  27664848 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 27664947  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  27664948 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 27665047  T
Q  216 tttctg 221  Q
    ||||||    
T  27665048 tttctg 27665053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27522452 - 27522244
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  27522452 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 27522353  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27522352 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 27522253  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  27522252 aggattttc 27522244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16360543 - 16360340
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  16360543 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 16360444  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16360443 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 16360344  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  16360343 tttc 16360340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19774001 - 19773798
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  19774001 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 19773902  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  19773901 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 19773802  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  19773801 tttc 19773798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 21560367 - 21560566
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||   |||||||| || || ||    
T  21560367 gagatggctggaagaaacgatgttgctattgctgctgcacttgaagctgtagctcaagttgtgggacaacagccgaatgctggtgctggtgtaaatgatg 21560466  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||| |||||| | || || ||| |||| |||||||  || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  21560467 gagccaggatgttggaaacttttttgagaaatcatccaccaactttcaaaggaaggtacgatcctgatggagctcaaaggtggctcaaagaggttgagag 21560566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 22329232 - 22329435
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||||| ||    
T  22329232 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacacaaatgctggtgcgaatgctgaag 22329331  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  22329332 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 22329431  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  22329432 tttc 22329435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34570535 - 34570332
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  34570535 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 34570436  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  34570435 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 34570336  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  34570335 tttc 34570332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22138709 - 22138513
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||    
T  22138709 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaag 22138610  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  22138609 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagag 22138513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27614402 - 27614194
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  27614402 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgc 27614303  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27614302 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 27614203  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  27614202 aggattttc 27614194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 27681745 - 27681948
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||    
T  27681745 atggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaag 27681844  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  27681845 ccaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 27681944  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  27681945 tttc 27681948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 29472418 - 29472620
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||    
T  29472418 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctttacaagctgttgcctaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaag 29472517  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  29472518 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 29472617  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  29472618 ttt 29472620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23670658 - 23670474
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    ||||||||||| ||| |  |    
T  23670658 atggctggaagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtagggcaacaaccaaatgttggtgctggtgcaaatgccgagg 23670559  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaa 200  Q
      |||||| |||| || |||||||| |||||||  || ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23670558 ttaggatgttagaaacttttctgagaaatcatccaccaactctcaagggtagatatgaccctgatggggctcagaagtggctcaa 23670474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41774884 - 41774681
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  41774884 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcgggag 41774785  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |    
T  41774784 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttcaggagattgagaggat 41774685  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  41774684 tttc 41774681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23461942 - 23461745
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| || |||      |||||||| |  | |||||       
T  23461942 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaaactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgctggagtgaatgctgaga 23461849  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||   |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||| |    
T  23461848 cgaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctccggttttcaaaggaagatacgaccctgatggagcccaggcgtggcttaaggagatcgagaggat 23461749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40712826 - 40712618
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||    
T  40712826 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctcttcaagctgttgcccaagctgtgggacaacaatctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 40712727  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| | |||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  40712726 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgattttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 40712627  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  40712626 aggattttc 40712618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 37287841 - 37288044
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| || |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||| ||    
T  37287841 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaaattgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgctgaag 37287940  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  37287941 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 37288040  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  37288041 tttc 37288044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43123496 - 43123309
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    ||||| ||||| ||| |    
T  43123496 gagatggctggaagaaatgatgctgctattactgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtagggcaacaaccaaatgttggtgctgatgcaaatgccg 43123397  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaa 200  Q
      |   ||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  43123396 aggttcggatgttagaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcaaaggtagatatgatcctgatggagctcagaagtggctcaa 43123309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 14996135 - 14996287
Alignment:
Q  67 caagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| |||     
T  14996135 caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggac 14996234  T
Q  167 gatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  14996235 gttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggattttc 14996287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 23562523 - 23562590
Alignment:
Q  25 agaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23562523 agaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacaacaaccgaatgc 23562590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 22591100 - 22591167
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22591100 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctgtagctcaagctgtaggacaaca 22591167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 22594655 - 22594722
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22594655 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctgtagctcaagctgtaggacaaca 22594722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 30614993 - 30614915
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  30614993 agatggctggaagaaacgacgctgctattgctgctgcattgaaagttgtggctcaagttgtggggcaacagcctaatgc 30614915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 17265684 - 17265744
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  17265684 agatggctggtaggaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggccgtagctcaagctgt 17265744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 16257381 - 16257448
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16257381 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctatagctcaagctgtaggacaaca 16257448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 20825461 - 20825402
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacct 87  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20825461 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtggctcaagctgtaggacagcaacct 20825402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 21619901 - 21619964
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtggg 77  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  21619901 agatggctggaagaaatgacgctgctattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtggg 21619964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 28891305 - 28891363
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  28891305 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 28891363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 28911209 - 28911267
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  28911209 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 28911267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 28926477 - 28926535
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  28926477 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 28926535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 41768310 - 41768262
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtag 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||    
T  41768310 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgtag 41768262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22465955 - 22465897
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22465955 aacgatgctgctatcgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 22465897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30609353 - 30609275
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatg 91  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||   | |||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  30609353 gagatggctggaaggaaggatgctgctattgctgctgtgttggaagttgtggctcaagctgtagggcaacagcctaatg 30609275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20771143 - 20771086
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaac 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20771143 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggatgttgctcaagctgtaggacagcaac 20771086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Original strand, 21981885 - 21982030
Alignment:
Q  67 caagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaa 166  Q
    |||||||||||||| || || |||||   ||||||||| | || || || ||||||| | || || ||| |||| |||||||  || |||||||| ||||    
T  21981885 caagctgtgggacagcagccgaatgctggtgctggtgcgaatgatggagtgaggatgttggaaacttttatgagaaatcatccaccaactttcaaaggaa 21981984  T
Q  167 gatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      || || | | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21981985 tgtacgatcctaatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 21982030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30609247 - 30609154
Alignment:
Q  125 tagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggtttt 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||||  || ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||    
T  30609247 tagagacttttctgaggaaccatccgcctaactttaagggcagatatgatcttgacggagctcagacatgactcaaagacgttgagaggatttt 30609154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21411176 - 21411100
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |  ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21411176 atggctggaaggaacgatgttgttattgctgctgcgttgcaagctttggctcaagctgtggggcaacagcctaatgc 21411100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12404 - 12208
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12404 atggctggaagaaacgacgttgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaatagcctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgaag 12305  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12304 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgatcctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgagag 12208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15229 - 15029
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15229 agagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtaggtcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaattctggtgcaagtgct 15130  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  15129 gaagcgaggatgctagagacctttctgaggaaccatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagatgtggcttaaagtgattgaga 15030  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  15029 g 15029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 41170 - 41370
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41170 agagatggctgaaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagccgtcgctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 41269  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41270 gaagcgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacttggctcaaagagatagaga 41369  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  41370 g 41370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 29848 - 29952
Alignment:
Q  127 gagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtga 226  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||    
T  29848 gagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagtccagacgtggcttaaggagatcgagagagttttccgtgtga 29947  T
Q  227 tgcat 231  Q
    |||||    
T  29948 tgcat 29952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 29792 - 29848
Alignment:
Q  19 gctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtg 75  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29792 gctggaagaaactatgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtg 29848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 157683 - 157743
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||  | || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  157683 agatggctggtcgtaatgatgctgctcttgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 157743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23066122 - 23065922
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23066122 agagatggctggaagaaccgacgctgccttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgtt 23066023  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23066022 gaagtgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcttactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgaga 23065923  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  23065922 g 23065922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23075572 - 23075372
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23075572 agagatggctggaagaaccgacgctgccttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgtt 23075473  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23075472 gaagtgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcttactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgaga 23075373  T
Q  212 g 212  Q
    |    
T  23075372 g 23075372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 22741661 - 22741880
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  22741661 cagagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcaaatgctggtgcgaatgc 22741760  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22741761 tgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 22741860  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || |||||| | ||||||||    
T  22741861 agagttttccgtgtgatgca 22741880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 22732470 - 22732688
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| | |||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||    
T  22732470 agagatggctagaagagacgacactgcgttagctgatgcactacaagtcgtagcttaagctgtgggacaacaacctgatgcaaatgctggtgcgaatgct 22732569  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  22732570 gaagtgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctccaagagatggaga 22732669  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || ||| | ||||||||    
T  22732670 gagtgttccgtgtgatgca 22732688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 23028157 - 23028376
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||    
T  23028157 cagaaatggctggaagaaaagatggtgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgc 23028256  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||| || ||||| |||    
T  23028257 tgagacgaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctgctactttcaagggaagatatgaccctgacggagcctagtcgtggcttaaggagatcgag 23028356  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || |||||| | ||||||||    
T  23028357 agagttttccgtgtgatgca 23028376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23030506 - 23030301
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||     
T  23030506 agatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagctgttggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctga 23030407  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
      |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||| || ||||| || ||     
T  23030406 gtcgaggatgcttgatacctttttgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgactccgatggagcccagatgtggcttaaggagatagaaaga 23030307  T
Q  214 gttttc 219  Q
    ||||||    
T  23030306 gttttc 23030301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24679234 - 24679027
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||    
T  24679234 agagatggccagaagagacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccgtagcacaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgct 24679135  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  24679134 gagacgaggatgcttgagacctttattaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtgacttaaggagatcgaga 24679035  T
Q  212 gggttttc 219  Q
    | ||||||    
T  24679034 gagttttc 24679027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20321734 - 20321520
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgc------tggtgca 105  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||     
T  20321734 agagatggctggaagaaacgacgttgcgttagctgctgcactacaagcagtagcttaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgcaaatgctggtgcg 20321635  T
Q  106 agtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctac-tttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagag 204  Q
    | |||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  20321634 aatgctgagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctacttttaaagggaagatatgaccccgatggatcccagacgtggcttaaagag 20321535  T
Q  205 attgagagggttttc 219  Q
    ||||| || ||||||    
T  20321534 attgaaagagttttc 20321520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 22462181 - 22462395
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  | |||||       
T  22462181 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggagtgaatgctgaga 22462280  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  22462281 ctaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccacgatggagcccagacgtggcttaaagagattgaaaggat 22462380  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| | ||||||||    
T  22462381 tttccgtgtgatgca 22462395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 23104427 - 23104616
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||    
T  23104427 cagagatggctggtagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagttgtgggacaacagccaaatgcaaatgctggtgcgaatgc 23104526  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagaga 205  Q
    |     |||  |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23104527 t-----gagtctgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcttactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagaga 23104616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 21319698 - 21319917
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    ||||||||||  ||||| | |||| |||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |  | |||    
T  21319698 cagagatggccagaagagatgatgatgcgttagctgctgcacttcaagctatagctcaagctgtgggacaacagccgaatacgaatgttggagtgaatgc 21319797  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  21319798 tgagacgaggatgctagagactttcatgaggaatcatcctccaactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagatcgaa 21319897  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  21319898 aggattttccgtgtgatgca 21319917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 24816537 - 24816742
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |     
T  24816537 agatggccggaaaaaatgacgctgcgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagttgtggggcaacagcctaatgctaatgctggtgctaatgccga 24816636  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||  |||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24816637 agttaggatgttggaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaaggtatgatccagatgtagctcagacgtggctcaaagaggttgagagg 24816736  T
Q  214 gttttc 219  Q
     |||||    
T  24816737 attttc 24816742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17002745 - 17002537
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  17002745 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 17002646  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  17002645 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 17002546  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  17002545 aggattttc 17002537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21902283 - 21902083
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||||||| || ||    
T  21902283 gagatggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagctatagctcaagctgtaggacaacatccgaatgctggtgctggtgcaaatgatg 21902184  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     || |||| || | || || |||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||    
T  21902183 gagtgaggttgttggaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcaaaggaagatacgatcctgacggagctcagaagtggcttaaagaggtggagag 21902084  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  21902083 g 21902083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9487956 - 9487753
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  9487956 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 9487857  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  9487856 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 9487757  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  9487756 tttc 9487753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 24656353 - 24656572
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  | |||    
T  24656353 cagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatactgttgtgaatgc 24656452  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||  ||  |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24656453 tgagactaggatgttggagaatttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 24656552  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  24656553 aggattttccgtgtgatgca 24656572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10872595 - 10872393
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  10872595 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 10872496  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10872495 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 10872396  T
Q  211 agg 213  Q
    |||    
T  10872395 agg 10872393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 23115759 - 23115956
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||       
T  23115759 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctattgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcagatgctggtgcgaatgctgaga 23115858  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    |||||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23115859 cgaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagagg 23115956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16932252 - 16932044
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  16932252 cagaaatggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgc 16932153  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16932152 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 16932053  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  16932052 aggattttc 16932044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9339322 - 9339119
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  9339322 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgagacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 9339223  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  9339222 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 9339123  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  9339122 tttc 9339119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27375009 - 27374806
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  27375009 atggctggaagaaacgatgttgcgtcagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 27374910  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  27374909 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 27374810  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  27374809 tttc 27374806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 171
Target Start/End: Original strand, 23039347 - 23039475
Alignment:
Q  43 gctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgagga 142  Q
    |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||    |||||||||| |||||||||||||||    
T  23039347 gctgctgcactacaagtcgtagcacaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgatggtgcgaatgctgagaggaggatgctatagacctttctgagga 23039446  T
Q  143 atcatcatcctactttcaagggaagatat 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23039447 atcatcctcctactttcaagggaagatat 23039475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16984980 - 16984777
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  16984980 atggctggaaggaatgatgctgcgttagctgctgctcttcaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 16984881  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  16984880 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 16984781  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  16984780 tttc 16984777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 24873454 - 24873656
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||       
T  24873454 atggctggaagaaatgatgttgcgttagctgctgcactacaagctgttcc-caagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 24873552  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  |||  ||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24873553 ctaggatgttggagactttcatgaataagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagaggat 24873652  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  24873653 tttc 24873656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 22322045 - 22322248
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  22322045 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcggaag 22322144  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | | |||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |    
T  22322145 ctatgatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagatgtggcttaaggagattgagaggat 22322244  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  22322245 tttc 22322248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24713774 - 24713571
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  24713774 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtcggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcggaag 24713675  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||  ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  24713674 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 24713575  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  24713574 tttc 24713571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Original strand, 24704282 - 24704396
Alignment:
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||| |||||| |    
T  24704282 cgaggatgctagagactttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcctagacgtggcttaaggagatcgagaggat 24704381  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| | ||||||||    
T  24704382 tttccgtgtgatgca 24704396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24266110 - 24265907
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||| ||    
T  24266110 atggctggaagaaacgatgctgtgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgttggtgcgaacgctgaag 24266011  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |    
T  24266010 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaggagattgagaggat 24265911  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  24265910 tttc 24265907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 41605786 - 41605989
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||| ||    
T  41605786 atggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgcgggtgcgaatgctgaag 41605885  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| |    
T  41605886 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaagggcgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggggattgagaggat 41605985  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  41605986 tttc 41605989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 44382271 - 44382474
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| | | ||||| ||    
T  44382271 atggctggaaggaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaacgccggttcgaatgctgaag 44382370  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  44382371 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 44382470  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  44382471 tttc 44382474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23003824 - 23003763
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtggg 77  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23003824 atggctggacgaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagttgtggctcaagctgtggg 23003763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 28351615 - 28351548
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  28351615 atggctggaagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggttgtagctcaagctgtaggacaaca 28351548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12578089 - 12578029
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12578089 agatggctggtagaaacgacgctgctattgctgctgcacttgaggccgtagctcaagctgt 12578029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12571607 - 12571547
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  12571607 agatggctggtagaaacgacgctgctattgctactgcacttgaggccgtagctcaagctgt 12571547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 45535251 - 45535175
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||   |  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45535251 atggctggaaggaacgatgctgctattgctgttgtgttgcaagttgtggctcaagctgtggggcaacaacctaatgc 45535175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23275318 - 23275275
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23275318 gatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 23275275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 100
Target Start/End: Original strand, 24704245 - 24704278
Alignment:
Q  67 caagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24704245 caagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgctg 24704278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 19715719 - 19715779
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||  | || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19715719 agatggctggtcgtaatgatgctgctcttgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 19715779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 19720282 - 19720342
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||  | || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19720282 agatggctggtcgtaatgatgctgctcttgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 19720342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 818
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  1036 agagatggctggaagaaacgacgctgtgttggctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgct 937  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  936 gagatgaggatgctagagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgaga 837  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || ||| ||||||||||    
T  836 gagtattccgcgtgatgca 818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3899
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatg 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  3977 gagatggctggaagaaacgacgctgcaatagctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatg 3899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3895 - 3803
Alignment:
Q  127 gagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  || || ||||| || || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  3895 gagacctttttgaggaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgatggagctcagaattggctcaaagaggttgagaggattttc 3803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2857 - 2639
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||| | ||||    
T  2857 agagatggctggaagaaacgatgatgtgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacatcagcctgctgcaaatgctggtgctaatgct 2758  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2757 gaagtgaggatgcttgagacttttctgagaaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatggagctcaaacgtggctcaaagagattgaga 2658  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || ||||| | ||||||||    
T  2657 ggattttccgtgtgatgca 2639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10092 - 9874
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||    
T  10092 agagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctcgtgcgaatgct 9993  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9992 gagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcatacttttaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagattgaga 9893  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  9892 gggtgttccgcgtgatgca 9874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 6161 - 6368
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  6161 agagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgctggtgcgaatgct 6260  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  6261 gagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagattgaaa 6360  T
Q  212 gggttttc 219  Q
    | ||||||    
T  6361 gagttttc 6368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9368 - 9150
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||  ||| ||| |||||| |||||||    
T  9368 agagatggctggaagaaacgatgatgcgattgttgctgcactagaagttgtagctaaagctgttggacatcagcctgctgcaaatactggtgtaagtgct 9269  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9268 gaagcaaggatgctagagacctttctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagttatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgaga 9169  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || ||  ||||||||||    
T  9168 gagtgtttcgcgtgatgca 9150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 3713 - 3906
Alignment:
Q  19 gctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcga 118  Q
    |||||||||||||| | |||| | |||||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3713 gctggaagaaacgacgttgcgttagctgctgcactacaggccgtggctcaagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgttgaagcga 3812  T
Q  119 ggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3813 ggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagctcagacttggctcaaagagatagagag 3906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4692 - 4490
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4692 atggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaggccgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgctggtgcaagtactgaag 4593  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  4592 cgaggatgctacagtcttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacccagatggagctcagacttggctcaaagagatagagagagt 4493  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  4492 ttt 4490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 20885 - 21075
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  20885 atggctagaagaaacgacgctgcgattgctgttgcactaaaagttgtagctcaagttgtgggacatcagcctaatgcaaatgctggtgcaaatgctgaag 20984  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagat 206  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20985 tgaggatgctagagacttttcttaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagatcagacgtggctcaaagagat 21075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33025 - 32817
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | |||    
T  33025 cagaaatggctggaagaaatgatgctgcgttagctgctgcacgacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgc 32926  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  | ||||| |||    
T  32925 tgagacgaggatgcttgagacttttttaaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttcaggagatcgag 32826  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    || ||||||    
T  32825 agagttttc 32817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 55721 - 55575
Alignment:
Q  74 tgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatga 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |  |||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55721 tgggacaacaacctaatgcaaatgctggtgcgaatgctttgtcgaggatgcttgaaaccttcctaaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatga 55622  T
Q  174 ccatgatggagctcagacgtgg-ctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    ||  |||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  55621 ccccgatggagcccagacgtggacttaaagagattgaaagagttttc 55575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 9442 - 9522
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatg 91  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || |||||||    
T  9442 cagagatggcaggaaggaacgatgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggacatcatcctaatg 9522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 15145088 - 15145306
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||||||| || ||||    
T  15145088 agagatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtaggacatcagcctgttgggaatgctggtgtaaatgct 15145187  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  15145188 gaagtgaggatgctagagacgtttctgaggaatcatcctcctatttgcaaaggaaggtatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgaga 15145287  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || ||| ||||||||||    
T  15145288 gagtgttccgcgtgatgca 15145306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14043796 - 14043600
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| |||||  |    
T  14043796 atggctggaaggaacgacgctgcgattgctgctgcacgagaagttgtggctcaagctgtgggacatcagcctaatgcaaatgctgatgcaaatgctgatg 14043697  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| || | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14043696 tgaggatgttataaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccttgatggagctcagacgtggctcaaagagatagagag 14043600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14353826 - 14353630
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| |||||  |    
T  14353826 atggctggaaggaacgacgctgcgattgctgctgcacgagaagttgtggctcaagctgtgggacatcagcctaatgcaaatgctgatgcaaatgctgatg 14353727  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| || | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14353726 tgaggatgttataaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccttgatggagctcagacgtggctcaaagagatagagag 14353630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 11526526 - 11526722
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||| || || |||||||| || | |||||| | ||||| ||    
T  11526526 atggctggaagaaacgacgatgcgattgctgctgtattggaagctgtggcttaagctgtggggcatcagcctaatgctaacgttggtgctaatgctgaag 11526625  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11526626 tgaggatgttggagacttttctgaggaatcatcctcctacttttaaaggaaaatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 11526722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8711708 - 8711500
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  8711708 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 8711609  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | |||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8711608 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 8711509  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  8711508 aggattttc 8711500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 11549269 - 11549477
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  11549269 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgttaatgc 11549368  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||| | ||||| ||  ||||||   | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11549369 tgagacgaggatgttggagactttcatgaggaggaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 11549468  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  11549469 aggattttc 11549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 18586338 - 18586546
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  18586338 cagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgc 18586437  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | |||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18586438 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccggctttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 18586537  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  18586538 aggattttc 18586546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13690139 - 13689936
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||    
T  13690139 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaag 13690040  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  13690039 ctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 13689940  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  13689939 tttc 13689936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 44787523 - 44787726
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  44787523 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaggctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaag 44787622  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  44787623 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 44787722  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  44787723 tttc 44787726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 15157229 - 15157432
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||| ||    
T  15157229 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgctgaag 15157328  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15157329 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 15157428  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  15157429 tttc 15157432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9592465 - 9592253
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  | || ||       
T  9592465 atggctggaagaaacgatgctgcattaggtgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaccaacctaacgcgaatgctggagtgaatgttgaga 9592366  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | | |||| | ||||||||  || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9592365 ccatgatgttggagaccttcatggggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagaggat 9592266  T
Q  216 tttctgcgtgatg 228  Q
    |||| | ||||||    
T  9592265 tttccgtgtgatg 9592253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 11233380 - 11233588
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |    
T  11233380 cagaaatggccggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatac 11233479  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11233480 tgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 11233579  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  11233580 aggattttc 11233588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10874550 - 10874348
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  10874550 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 10874451  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  10874450 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgacccttatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 10874351  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  10874350 ttt 10874348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14958611 - 14958403
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||||  | |||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||    
T  14958611 cagaaatggctagaagggacgatgctgcattagctgctactctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgttaatgc 14958512  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||| | ||||| ||| |||||||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  14958511 tgagacgaggatgttggagacttttatgaggaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatgtagccctgacgtggcttaaagagattgag 14958412  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  14958411 aggattttc 14958403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 16725621 - 16725833
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || |||      ||||||||||  | ||||    
T  16725621 agagatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgctggtgtgaatgct 16725714  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| |    
T  16725715 gagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtgacttaaggagattgaaa 16725814  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || | ||| | ||||||||    
T  16725815 ggatattccgtgtgatgca 16725833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 17702635 - 17702847
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || |||      ||||||||||  | ||||    
T  17702635 agagatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgctggtgtgactgct 17702728  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| |    
T  17702729 gagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtgacttaaggagattgaaa 17702828  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || | ||| | ||||||||    
T  17702829 ggatattccgtgtgatgca 17702847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20750512 - 20750309
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||  | || ||    
T  20750512 gagatggctggaagaaacgatgctgatattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacaacaaccgaatgc---tgctgctggtaatgatg 20750416  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||  || || ||||| || || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  20750415 gtgtgaggatgttggagacctttctaaggaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgatggagttcagaagtggctcaaggaggttgaaag 20750316  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  20750315 gattttc 20750309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12691604 - 12691397
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||| || | |||||| | ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||    
T  12691604 cagaaatggctagaagggacgatgctccgttagctgctactctacaagctgttgcccaaactgtgggacaacaacctaacgcgaatgttggtgttaatgc 12691505  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||| | ||||| ||  | |||||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12691504 tgagacgaggatgttggagactttcatcaggaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 12691405  T
Q  211 agggtttt 218  Q
    ||| ||||    
T  12691404 aggatttt 12691397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14336469 - 14336362
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||    
T  14336469 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgccggtgcgaatgctgaag 14336370  T
Q  116 cgaggatg 123  Q
    | ||||||    
T  14336369 ctaggatg 14336362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18181833 - 18181744
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctg 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18181833 cagaaatggctggaagaaacaatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctg 18181744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19151113 - 19151034
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19151113 gagatggctggaagaaacgatgctgatattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacaacaaccgaatgc 19151034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15628508 - 15628438
Alignment:
Q  133 tttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15628508 tttctgaggaatcacccacctactttcaagggaaggtatgatcctgatagagctcagacgtggctcaaaga 15628438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 12801411 - 12801484
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12801411 gagatggctgggagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggttgttgctcaagctgtaggacagcaacc 12801484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 14256717 - 14256778
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14256717 gagatggctgggagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgt 14256778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12693860 - 12693800
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctg 73  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12693860 gagatggctggtagaaacgacgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctg 12693800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 14282522 - 14282582
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  14282522 agatggctggtagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggttgtagctcaagctgt 14282582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15115134 - 15115058
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15115134 tgaggaatcatccaccaacattcaagggaaggtacgaccctgatggagctcaaaagtggctcaaagagattgagagg 15115058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 12202998 - 12203150
Alignment:
Q  67 caagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaa 166  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||   ||||||||||| || || || |||| || | || || |||||||| |||||||  || |||||||  || |    
T  12202998 caagctgtaagacagcaaccgaatgctggtgctggtgcaaatgatggagtgaggttgttggaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcagaggta 12203097  T
Q  167 gatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12203098 gatatgatcctgatggagctcagaagtggctcaaagaagttgagaggattttc 12203150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 18050107 - 18050167
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18050107 agatggctggtagaaacgacgctgctattgctgctgcacttgaggccgtagctcaagctgt 18050167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Original strand, 12711834 - 12711889
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12711834 gatgctgctatcgctgctgcacttgaagctgttgctcaagctgtaggacaacaacc 12711889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Original strand, 26091047 - 26091138
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||| |||||| || ||||||||    
T  26091047 aggatgctagagactttcctgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgacggtgctcagaagtggctgaaggagattga 26091138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15115255 - 15115185
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||    
T  15115255 gagatggctagaagaaattatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcgagctgtagaacaaca 15115185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14145756 - 14145684
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  14145756 agatggctggtagaaacgatgttgctatcgctgctgcacttgaggctgttgcttaagctgtaggacagcaacc 14145684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13677524 - 13677469
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  13677524 gatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagttgtaggacaacaacc 13677469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 15098871 - 15098950
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15098871 gagatggctggtagaaatgacgctgttatagctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 15098950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 62
Target Start/End: Original strand, 11769955 - 11769996
Alignment:
Q  21 tggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgt 62  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11769955 tggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattggaagctgt 11769996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 49156301 - 49156200
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  || || |||||||| || ||||| | ||| || ||||||| |||||| || || ||||| ||| |||    
T  49156301 aggatgctagagactttcctgaggaatcatccaccgaccttcaagggtaggtatgatcctgacggtgctcagaagtggctgaaggaaattgaaaggattt 49156202  T
Q  218 tc 219  Q
    ||    
T  49156201 tc 49156200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 12202956 - 12202996
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcact 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  12202956 gagatggctggaagaaacgatgttgttattgctgctgcact 12202996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14145662 - 14145606
Alignment:
Q  117 gaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatga 173  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || || ||||||||||| |||||    
T  14145662 gaggatgctggagacctttttgaggaatcatcccccaacattcaagggaaggtatga 14145606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Original strand, 48810310 - 48810358
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgt 62  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  48810310 agatggctggaagaaatgacgctgctattgctgctgcattggaagctgt 48810358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 962
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1158 atggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaggccgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgctggttcaagtgctgaag 1059  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1058 cgaggatgctatagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaatatatgaccctaatggagctcagacttggctcaaagagatagagag 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5575 - 5379
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5575 atggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaggccgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgctggttcaagtgctgaag 5476  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5475 cgaggatgctatagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaatatatgaccctaatggagctcagacttggctcaaagagatagagag 5379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 7315 - 7511
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||| | ||||| ||    
T  7315 atggatggaagaaacgacgctgcgattgcagctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacatcagcctaatgaaaatgttggtgctaatgctgaag 7414  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7415 tgaggatgttggaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattcagag 7511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 22459307 - 22459515
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  22459307 cagagatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgc 22459406  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22459407 tgagtcgaggatgcttgagaccttcttgaggaatcatcctcctactttcaaggggagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 22459506  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    || ||||||    
T  22459507 agagttttc 22459515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 22469736 - 22469944
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  22469736 cagagatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgc 22469835  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22469836 tgagtcgaggatgcttgagaccttcttgaggaatcatcctcctactttcaaggggagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 22469935  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    || ||||||    
T  22469936 agagttttc 22469944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20247349 - 20247155
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20247349 agagatggctggaagaaacgacgctacgttagctgctgcactacatgttgtggctcaagctgtgggacaacagcctaatgcgaatgctggagcaagtgct 20247250  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagat 206  Q
    | |||||||||| | ||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20247249 gaagcgaggatgttggagagttttgtgaggaatcatcctcctaatttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacttagctcaaagagat 20247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 22832386 - 22832605
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||    
T  22832386 cagaaatggctggaagaaacgatattgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcaaatgctggtgtgaatgc 22832485  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  22832486 tgagacgaggatgcttgagacttttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacctcgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgag 22832585  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||  ||||| | ||||||||    
T  22832586 agaattttccgtgtgatgca 22832605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 21044384 - 21044589
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||     
T  21044384 agatggctggaagaaacaacactgcgattgctgctgcattggaagctgtggctcaagctgtggagcaacaacctaatgctaatgctggtgctaatgctga 21044483  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||  |||||| | ||||  ||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21044484 agttaggatgttggagatttttgtgaggaatcatccacctaccttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaga 21044583  T
Q  214 gttttc 219  Q
    ||||||    
T  21044584 gttttc 21044589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21753090 - 21752954
Alignment:
Q  70 gctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagat 169  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21753090 gctgcgggacaacagcctaatgcgaatgctggagcaagtgttgaagcgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagat 21752991  T
Q  170 atgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagat 206  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21752990 atgaccctgatggaactcagacttggctcaaagagat 21752954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18273925 - 18273729
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    ||||||||||| ||||| ||    
T  18273925 atggctggaagaaatgatgttgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtaggacaacaaccgaatgttggtgctggtgcaaatgctgaag 18273826  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  18273825 ttaggatgttagagacttttctgaggaatcatccaccaactttcaaaggtagatatgatcctgatggagctcagaagtggctcaaggaggttgagag 18273729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22117841 - 22117645
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||  |||  |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| | ||||| ||    
T  22117841 atggctggaagaaacgacgctgtgattgttgctgcattggaagctgtgactcgggctgtggggcaacagccgaatgttaatgctggtgctaatgctgaag 22117742  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117741 ttaggatgttggagacctttttgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 22117645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19110498 - 19110290
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||     
T  19110498 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgttggtgtgaatga 19110399  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || | | |||||| | ||||| ||  |||||||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19110398 tgaaactaggatgttggagactttcatgaggaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 19110299  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  19110298 aggattttc 19110290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 16346824 - 16347032
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16346824 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcaaatgc 16346923  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  16346924 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatggag 16347023  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  16347024 aggattttc 16347032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 16353473 - 16353681
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16353473 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcaaatgc 16353572  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  16353573 tgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatggag 16353672  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  16353673 aggattttc 16353681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21843341 - 21843133
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||    
T  21843341 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctttacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgc 21843242  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  21843241 tgaagctaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 21843142  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  21843141 aggattttc 21843133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16380218 - 16380019
Alignment:
Q  20 ctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgct-ggtgcaagtgctgtagcga 118  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| |||||  |       
T  16380218 ctggaagaaacgacgctgtgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtgggacatcagcctaatgctaatgtttggtgcaaatgctgaggttt 16380119  T
Q  119 ggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggtttt 218  Q
    | ||| | ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16380118 gaatgttggagacttttatgaggaatcatccgcctactttcaaagggaggtatgaccctgatggagctcagacgtggcttaaagagattgagagagtttt 16380019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 41349904 - 41350107
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  41349904 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgttgctctacaagctattgcccaagctgtgggacaacaacctaacgtgaatgctggtgcgaatgctgaag 41350003  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  41350004 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 41350103  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  41350104 tttc 41350107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 22434982 - 22435189
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||            ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||  | |||    
T  22434982 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcacta------------caagctgtggggcaacagcccaatgcaaatgctggtgtgaatgc 22435069  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||  ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  22435070 tgagacgaggatgcgcgagacttttattaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgag 22435169  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  22435170 aggattttccgtgtgatgca 22435189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21834426 - 21834223
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  || | ||    
T  21834426 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctatacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgttggtgcgaacgcggaag 21834327  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  21834326 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 21834227  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  21834226 tttc 21834223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 17041243 - 17041445
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  | ||     
T  17041243 cagaaatggcgggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttacccaagctgtgggacaacaacctaatgtaaatgccggtgtgactga 17041342  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  17041343 tgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcaccctctaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 17041442  T
Q  211 agg 213  Q
    |||    
T  17041443 agg 17041445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 33387264 - 33387467
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  || | ||    
T  33387264 atggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgcggaag 33387363  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| || ||||| ||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |    
T  33387364 ctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgaccttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaggagattgagaggat 33387463  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  33387464 tttc 33387467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21177488 - 21177282
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| | ||||| || |||||| |      |||||  | || ||       
T  21177488 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagagattgtagcacaagctattggacatcagcctaattc------tggtgtgaatgttgaga 21177395  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  21177394 caaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgagaggat 21177295  T
Q  216 tttctgcgtgatg 228  Q
    |||| | ||||||    
T  21177294 tttccgtgtgatg 21177282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 51329722 - 51329930
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||| | ||||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||    
T  51329722 cagaaatggctgggaggaatgatgctgcgttagctgctgctatacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaacgc 51329821  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
     | ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  51329822 ggaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcaaaggacgttatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 51329921  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  51329922 aggattttc 51329930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 24784094 - 24784308
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | | |||       
T  24784094 atggctggaaggaatgatgctgggttagctgctgctctacaagctgttgcctaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgtgaatactgaga 24784193  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | || ||| | ||||  ||  |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  24784194 caagaatgttggagaatttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgacccagatggagcccaggcgtggcttaaggagattgagaggat 24784293  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
     ||| | ||||||||    
T  24784294 cttccgtgtgatgca 24784308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 21738268 - 21738471
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||   ||||| ||  | || ||    
T  21738268 gagatggctggtagaaatgatgctgcttttgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggccaataaccaaatgc---tgctgctgataatgatg 21738364  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||  |||||| | ||||||||||| ||||| ||||  || || ||||| || || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21738365 gagtaaggatgttggagacctttctaaggaaccatccaccaacattcaaagggaggtaggaccctgacggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 21738464  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  21738465 gattttc 21738471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 21741885 - 21741987
Alignment:
Q  117 gaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggtt 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  21741885 gaggatgttggagacctttctgaggaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgacccagatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagaggatt 21741984  T
Q  217 ttc 219  Q
    |||    
T  21741985 ttc 21741987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22401306 - 22401241
Alignment:
Q  154 actttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  22401306 actttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgggaggattttc 22401241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 16670219 - 16670277
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16670219 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 16670277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48426929 - 48426850
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||| ||||||    
T  48426929 aggatgctagagactttcctgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgacggtgctcagaagtggct 48426850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 20853013 - 20853071
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20853013 aacgatgctgctatcgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 20853071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20922457 - 20922375
Alignment:
Q  125 tagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagatt 207  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20922457 tagagacttttctaaggaaccatcctcctgttttcaaaggaaggtatgatccagatggagcacagacgtggctcaaggagatt 20922375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Original strand, 36213045 - 36213146
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||  || || |||||||| || ||||| | |||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||| |||    
T  36213045 aggatgctagagactttcttgaggaatcatccaccaacattcaagggtaggtatgatcctgatggtgctcagaaatggctgaaggagattgaaaggattt 36213144  T
Q  218 tc 219  Q
    ||    
T  36213145 tc 36213146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 121331 - 121534
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||       
T  121331 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcgaatgctggtgtgaatgctgaga 121430  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  121431 cgaggatgcttgagactttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgagaggat 121530  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  121531 tttc 121534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 71512 - 71452
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  71512 agatggctggtagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 71452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 11259 - 11334
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaa 89  Q
    ||||||||||  | || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11259 agatggctggtcgtaatgatgctgttattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtaggacagcaacctaa 11334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 10039 - 10257
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||||  ||||| | |||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
T  10039 agagatggccagaagagatgatgatgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgctggtacgaatgct 10138  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10139 gagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagattgaga 10238  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || ||| ||||||||||    
T  10239 gagtgttccgcgtgatgca 10257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 54635 - 54831
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  54635 atggctggaagaaatgatgttgtgattgctgttgcactagaagttgtagctcaagttgtgggacatcagcctgctgcaaatgctggtgctaatgctgaag 54734  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54735 tgaggatgctagaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaggagattgagag 54831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 15775 - 15971
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| | | |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15775 atggttggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcacaacaggtcgtggctcaagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgaag 15874  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  15875 cgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatagagctcagactgggctcaaagagatagagag 15971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 995 - 793
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  | |||    
T  995 cagaaatggctgggagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtggaacaacaacctaatgcaaatgcgggtgtgactgc 896  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  895 tgagactaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 796  T
Q  211 agg 213  Q
    |||    
T  795 agg 793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Original strand, 138757 - 138959
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||    
T  138757 cagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaatctaatgcaaatgctggtgtgactgc 138856  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | ||| || | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  138857 tgagactaggttgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgag 138956  T
Q  211 agg 213  Q
    |||    
T  138957 agg 138959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 33931 - 34149
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | ||||    
T  33931 agagatggctggaagaaacgacgctgcgttagttgctgcactacaagctgtagatcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgct 34030  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  34031 gagtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggaggttgaga 34130  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | |||||| | ||||||||    
T  34131 gagttttccgtgtgatgca 34149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42773 - 42577
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||| | ||||| ||    
T  42773 atggctggaagaaacgatgttgcgattgctgctgccgtagaagttgtggctcaagctgtggtacatcagcctaatgcaaatgttggtgctaatgctgaag 42674  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42673 tgaggatgctagagacttttctgaggaaccatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacttggctcaaagagatagagag 42577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 76493 - 76297
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||| | ||||| ||    
T  76493 atggctggaagaaacgatgttgcgattgctgctgccgtagaagttgtggctcaagctgtggtacatcagcctaatgcaaatgttggtgctaatgctgaag 76394  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  76393 tgaggatgctagagacttttctgaggaaccatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacttggctcaaagagatagagag 76297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 1176 - 1372
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  1176 atggctggaagaaatgacgctgcgattgctgctgcaccagaagctgtggctcaagctgtagggcatcagcctaatgcaaatgctggtgctaatgctgaag 1275  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1276 tgaggatgttggatacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagaaattgagag 1372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 4040 - 4236
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  4040 atggctggaagaaatgacgctgcgattgctgctgcaccagaagctgtggctcaagctgtagggcatcagcctaatgcaaatgctggtgctaatgctgaag 4139  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4140 tgaggatgttggatacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagaaattgagag 4236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 30158 - 30376
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||||  ||||| |||| | |||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||    
T  30158 agagatggccagaagagacgacgttgcgttagctgctgcactacaagacgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgct 30257  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30258 gagacgaggatgctagagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacctcgatggagcctagacgtggctcaaagagattgaga 30357  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || ||| ||||||||||    
T  30358 gagtgttccgcgtgatgca 30376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 1874 - 1779
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  1874 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctacacttgaagctgtggctccagctgtgggacatcagcctaatccaaatgctggtgcaaatgct 1779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9355 - 9141
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||  | |||||       
T  9355 atggctggaagtaacgatgctgcgttagttgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaatggcctaatgcaaatgctggtgtgactgctgaga 9256  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  9255 tgaggatgctagagacctttatgaggactcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagagagt 9156  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| ||||||||||    
T  9155 tttccgcgtgatgca 9141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 106935 - 107154
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  106935 cagaaatggctggaagaaacgatgttgtgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgc 107034  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  107035 tgaagctaggatgttggagacgttaatgaagaagaaccctccaactttcaaaggacgttatgaccctaatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 107134  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||||| || |||||    
T  107135 aggattttctgtgttatgca 107154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Original strand, 93078 - 93232
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctag 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||          |||| ||| | || || || ||||||||| |    
T  93078 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc---------agctgctgctaatggtgaagtgaggatgctgg 93168  T
Q  128 agacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagac 191  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  93169 agacttttctgaggaaccatccaccagcattcaagggaaggtatgaccctgatggagctcagac 93232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 255 - 436
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||       
T  255 atggccggaagaaacgatgctgcgatagctgctgcactacaagctgtagctcaagctatggggcaacaacctaatgcgaatgctggagtgaatgctgaga 354  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  355 cgaggatgctagagactttcatgaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccttgatggagctcagacgtggct 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 791 - 1007
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | || |    
T  791 agagatggctggaagaaacgacgatgtgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctgatgcgaatgtt 890  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  891 gagatgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatagagcccagacgtggctcaaggagattgaga 990  T
Q  212 gggttttctgcgtgatg 228  Q
    | || ||| ||||||||    
T  991 gagtgttccgcgtgatg 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 5)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 166
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | || ||     
T  382 agatggctggaaaaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcaaatgctggtgtgaatgatga 283  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  282 gtcgaggatgcttgagaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagatattgagaga 183  T
Q  214 gttttctgcgtgatgca 230  Q
    |||||| | ||||||||    
T  182 gttttccgtgtgatgca 166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 11577 - 11656
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11577 gagatggctggtagaaacgacgctgttatcgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 11656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 19757 - 19836
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19757 gagatggctggtagaaacgacgctgttatcgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 19836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 219
Target Start/End: Original strand, 11697 - 11780
Alignment:
Q  136 ctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    |||||||||||||  || ||||| || || || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  11697 ctgaggaatcatccaccaacttttaaagggaggtatgaccctgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgagaggattttc 11780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 219
Target Start/End: Original strand, 19877 - 19960
Alignment:
Q  136 ctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    |||||||||||||  || ||||| || || || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  19877 ctgaggaatcatccaccaacttttaaagggaggtatgaccctgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgagaggattttc 19960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 780
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  987 agagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgttgcactacaagccgtagctcaagttgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgct 888  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| || ||||| || |    
T  887 gagtcgaggatgcttgagacctttctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccccgatggatcccagacgtggcttaaggagatagaaa 788  T
Q  212 gggttttc 219  Q
    | ||||||    
T  787 gagttttc 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 577 - 358
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||    
T  577 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgctggtgtgaatgc 478  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| || ||||| |||    
T  477 tgagacgaggatgcttgagaccttcatgaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccctgatggagcccatatgtggcttaaggagatcgag 378  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  377 aggattttccgtgtgatgca 358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 23885 - 24103
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||||  ||||| | |||| |||| | |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  23885 agagatggccagaagagatgatgatgcgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagttgtgggacaatagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgct 23984  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23985 gagacgaggatgctagagacttttttgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagattgaga 24084  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  24085 gggtgttccgcgtgatgca 24103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31432 - 31214
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||    
T  31432 agagatggctggaagaaacgacgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctagtgcgaatgct 31333  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
        ||| |||||| || |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  31332 aagtcgaagatgctggaaaccttcttgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgaga 31233  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | |||||| | ||||||||    
T  31232 gagttttccgtgtgatgca 31214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 105336 - 105140
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  105336 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactaaaagttgtggctcaagctgtgtggcatcagcctaatgcaaatgctggtgcaaatgttgaag 105237  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105236 taaggatgatggagacttttccgaggaaccatcctcctactttcagaggaagatatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 105140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 49503 - 49722
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    ||||||||||  ||||| | || |||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||    
T  49503 cagagatggccagaagagaggacgctgcgttagctgctgcattacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgtgaatgctggtgcgaatgc 49602  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49603 tgaagtgaggatgctggagacctttctgaggaatcatcctccggttttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagatgtggctcaaagagattgag 49702  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || |||||| | ||||||||    
T  49703 agagttttccgtgtgatgca 49722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 43838 - 43777
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||||    
T  43838 gagatggctggtagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggttgttgctcaagctgt 43777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22746 - 22587
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||       
T  22746 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 22647  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgacc 175  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22646 cgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacc 22587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38170 - 38011
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |       
T  38170 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgcggaga 38071  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgacc 175  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38070 cgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacc 38011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9556 - 9338
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  9556 agagatggccagaagagatgatgctgcgttagctgctgcactacaagtcgtagcttaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgct 9457  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9456 gagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcttacttttaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggctcaaggagattgaga 9357  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || |||  |||||||||    
T  9356 gagtgttcctcgtgatgca 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 23389 - 23603
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||       
T  23389 atggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcactacaagctgtagctaaagatgtggggcaacaacctaatgcgaatgctggtgtgaatgctgaga 23488  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||| |    
T  23489 cgaggatgctagagactttcatgaggaatcatcctcctaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggattaaggagatcgagaggat 23588  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| | ||||||||    
T  23589 tttccgtgtgatgca 23603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9570 - 9384
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | |||    
T  9570 cagagatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgcattacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgggaatgc 9471  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
    ||   |||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9470 tgagtcgaggatgctggaaaccttcctgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggct 9384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1050 - 958
Alignment:
Q  138 gaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  1050 gaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagagagttttccgtgtgatgca 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 17141 - 17336
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |  ||| ||||||||||| | || || ||    
T  17141 atggctagaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagttgtagctcaagctgtgggacatcagcatgctgcaaatgctggtgctaatgttgaag 17240  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     |||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  17241 tgaggatgctagaaacttttctg-ggaatcatcctcctaatttcaagggaaaatatgaccctgatggagctcagacttggcttaatgagattgagag 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16551 - 16355
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||    
T  16551 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcattggaagctgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgttaatgcgggtgctaatgctgaag 16452  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||||||  ||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16451 ttaggatgttggagaccttcttgaggaatcatccgcgtaccttcaagggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 16355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9473 - 9268
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||     
T  9473 agatggctggaaggaatgatgttgctattgctgctgcgttggatgctgtagctcaagctgtaggacaacaactaaatgctaatgttggtgcgaatgctga 9374  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
     |  || ||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||  |||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||     
T  9373 ggttagaatgttagagacttttctgaggaaccatccccctgttttcaaaggaaggtatgatccagacggagcacagacgtggctcaaggagattgaaaga 9274  T
Q  214 gttttc 219  Q
    ||||||    
T  9273 gttttc 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 35978 - 36186
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  35978 cagaaatggctagaaggaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgc 36077  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| || ||||| |||    
T  36078 tgagacgaggatgcttgagacctgtatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatatgacctcgatggagccgagacgtggcttaaggagatcgag 36177  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    || ||||||    
T  36178 agagttttc 36186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27489 - 27304
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||   | |||||| |      |     
T  27489 agatggctggaagaaatgacgccgctattgctgctgcattggaagctgttgctcaagcggttgggcaacaccctaatgctggtactggtgga------ga 27396  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagaga 205  Q
    ||  || ||| | ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27395 agttagaatgttggagacttttctgaggaatcatccacttactttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtagctcaaagaga 27304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Original strand, 16527 - 16726
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagaga 130  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | | |||   |||||||||||||||    
T  16527 gatgctgcgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagctgtgggacaacagcctaatgcaaatgctgctgcgaatactgagacgaggatgctagaga 16626  T
Q  131 cctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  16627 cttttctgaggaatcatcctcctacttttaatggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaggagattgagagagtgttccgtgtgatgca 16726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 877 - 675
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||       
T  877 atggctggaagaaacgatgctgcattagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacaacctaatgcgaatgctggtgtgaatgctgaga 778  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||| |    
T  777 cgaggatgttggagactttcatgaggaatcatcctcctaccttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgttgcttaaggagatcgagaggat 678  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  677 ttt 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11907 - 11717
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||| |||||| | ||||| ||    
T  11907 atggctggaagaaacgatgatgtgattgctgttgcacttgaagctgtagctcaagctgtgggacatcagcctgctgcaaatgttggtgctaatgctgaag 11808  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagat 206  Q
     |||||||||||| || ||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11807 tgaggatgctagaaacttttttgaggaattgtcctcctacttttaagggaagatatgaccctgatggagcttagacgtggctcaaagagat 11717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16056 - 15838
Alignment:
Q  12 agagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgct 111  Q
    |||||||||  ||||| | |||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||||    
T  16056 agagatggccagaagagatgatgatgcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtgggataacagcctaatgcaaatgttggtgcgaatgct 15957  T
Q  112 gtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  15956 gagacgaggatgctagagacttttctgaggaatcatcctcttacttttaagggaagatataaccatgatggagcctagacgtggctcaaggagattgaga 15857  T
Q  212 gggttttctgcgtgatgca 230  Q
    | || ||  ||||||||||    
T  15856 gagtgtttcgcgtgatgca 15838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 495
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  | |||    
T  714 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaactcgaatgcgggtgtgaatgc 615  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||| ||  |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  614 tgagactaggatgttggagactttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaggagattgag 515  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  514 aggattttccgtgtgatgca 495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 56818 - 57014
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||    
T  56818 atggctggaagaaacgacgatgtgattgctgctgcattggaagctgtcgctcaagctatggggcaacagccaaatgctaatgttggtgctaatgctgaag 56917  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56918 ttaggatgttggagacttttatgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatacgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 57014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 65688 - 65907
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  | |||    
T  65688 cagaaatggctggaaggaacgatgtggcgttagctgctgcactacaagccgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcaaatgctggtgtgaatgc 65787  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||  ||    
T  65788 tgagacgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctcttactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcaag 65887  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || |||||| | ||||||||    
T  65888 agagttttccgagtgatgca 65907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 12761 - 12957
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||| ||    
T  12761 atggctggaagaaacgacgttgcgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtgggacaacagcctaatgctaacgctggtgctaatgctgaag 12860  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||| |||| |||||||| ||   |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12861 ttaggatgttggagacttttcagaggaatcttccatctaccttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 12957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 14746 - 14965
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||    
T  14746 cagaaatggctggaagaaacgatgttgtgttagctgctgcactacaagtcgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgcgaatgctggtgtgaatgc 14845  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   || |||| || ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  14846 tgagacgtggattcttgagaccttcatgaggaatcatcctcctattttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgag 14945  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  14946 aggattttccgtgtgatgca 14965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 30220 - 30419
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| | || ||    
T  30220 gagatggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagccgtagctcaagctgtgggacaacaaccgaatgctggtgctggtgcgaatgatg 30319  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     || ||||||| | || || ||| |||| |||||||  || |||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30320 gagtgaggatgttggaaacttttttgagaaatcatccaccaactttcaagggaaggtacgatcctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 30419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 11588 - 11790
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| || |||||||      ||||||| | |||    
T  11588 cagagatggctggaagaaacaaagctgcgattgctgctgcactagaagctggagcacaagttgttggacatcagcctaatg------ctggtgcgaatgc 11681  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||     
T  11682 tgagtcgaggatgcttgagacctttatgaggaatcatcctgctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagatagaa 11781  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    || ||||||    
T  11782 agagttttc 11790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7034
Alignment:
Q  128 agacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgat 227  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| || ||    
T  6932 agacctttatgaggaatcatcctgctactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgaaagagttttctgtgttat 7031  T
Q  228 gca 230  Q
    |||    
T  7032 gca 7034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 8511 - 8716
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |     
T  8511 agatggccggaaaaaatgacgctgcgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagttgtggggcaacagcctaatgctaatgctggtgctaatgccga 8610  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||  |||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8611 agttaggatgttggaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaaggtatgatccagatgtagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 8710  T
Q  214 gttttc 219  Q
     |||||    
T  8711 attttc 8716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 194026 - 194245
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||    
T  194026 cagagatggccagaagagacgatgttgcgttagctgctgcactacaagccatagctcaagttgtaggacaacagcctaatgcgaatgctggagcgaatgc 194125  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
         |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  194126 caagtcgaggatgcttgagacttttctgaggaatcatcctcctaggtttaagggaagatacgaccctgatggagcccagacatggctcaaagagattgag 194225  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    || || ||| | ||||||||    
T  194226 agagtcttccgtgtgatgca 194245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 16229 - 16431
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  | |||||       
T  16229 atggctggaaggaacgatgttgcattagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacaacctaacgcaaatgctggtgtgaatgctgaga 16328  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | || ||| | ||||| ||  |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  16329 caagaatgttggagactttcatgaggaatcatcctccaaccttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgagaggat 16428  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  16429 ttt 16431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 20751 - 20953
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  | |||||       
T  20751 atggctggaaggaacgatgttgcattagctgctgcactacaagctgtagctcaagctgtggggcaacaacctaacgcaaatgctggtgtgaatgctgaga 20850  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | || ||| |  |||| ||  |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  20851 caagaatgttgtagactttcatgaggaatcatcctccaaccttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgagaggat 20950  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  20951 ttt 20953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 3617 - 3678
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  3617 gagatggctggtagaaatgacgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgt 3678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 442793 - 442590
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||| ||    
T  442793 atggctagaagaaatgacgctgcgattgttgctgcattggaagttgtggctcaagctgtggggcaacagcctaatgctaatgttggtgctaatgctgaag 442694  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
      |||||| | || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  442693 ttaggatgttggaaacttttctgaggaatcatccacctactttcaaaggaaggtatgatccagatggagctcagacgtggctcaaagaggttgagaggat 442594  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  442593 tttc 442590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 167468 - 167544
Alignment:
Q  137 tgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||||||||||||  || || |||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  167468 tgaggaatcatccaccaacattcatgggaaggtacgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagagattgagagg 167544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Original strand, 164302 - 164355
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagct 66  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  164302 gagatggctggaagaaatgatgttgctattgctgctacacttgaggctgtagct 164355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 425445 - 425237
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  425445 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgcgaatgc 425346  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  425345 tgagactaggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 425246  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  425245 aggattttc 425237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 138832 - 138613
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | ||     
T  138832 cagaaatggctgggaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaatgcaaatgttggtgtgattgt 138733  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  138732 tgagactaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaagagactgag 138633  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  138632 aggattttccgtgtgatgca 138613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 13188 - 13407
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||     
T  13188 cagaaatggctggaaggaacgatgctgcattagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgtgaatga 13287  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||| ||  |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  13288 tgagaccaggatgttggagacgttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagatagag 13387  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  13388 aggattttccgtgtgatgca 13407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11505 - 11302
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||||       
T  11505 atggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgcactacaagctgttgcccaagctgtgggacaataacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 11406  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
      |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11405 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagaggat 11306  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  11305 tttc 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4659 - 4488
Alignment:
Q  40 attgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctga 139  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||  | ||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  4659 attgctgctgcacttgaagttgttgctcaagctgtgggacatcagcctgctgcaaatgctggtggtaatgctgaagtgaggatgctagaaacttttctga 4560  T
Q  140 ggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4559 ggaatcatccttgtactttcaagggaagatatgaacctgatagagctcagacttggctcaaatagattgaga 4488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15570 - 15351
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||    
T  15570 cagaaatggctggaaagaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgctaatgctggtgttaatgc 15471  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  15470 tgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgag 15371  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  15370 aggattttccgtgtgatgca 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22334 - 22115
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||    
T  22334 cagaaatggctggaaagaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgctaatgctggtgtgaatgc 22235  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22234 tgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccccgatggagcccaaacgtggcttaaagagattgag 22135  T
Q  211 agggttttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| ||||| | ||||||||    
T  22134 aggattttccgtgtgatgca 22115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6056 - 5860
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||  |||  |||||| | ||||| ||    
T  6056 atggctggatgaaacgacgttgcgattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtggggcaacagcttaatgttaatattggtgctaatgctgaag 5957  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | ||||| ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5956 ttaggatgttggagacttttctgaggaatcatccacccaccttcaaaggaaggtatgatcttgatggagctcatacgtggctcaaagagattgagag 5860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Original strand, 180023 - 180081
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  180023 aacgatgctgcaattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 180081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 38499 - 38559
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||  | || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38499 agatggctggtcgtaatgatgctgctcttgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 38559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 104723 - 104832
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  104723 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgtactagaagctgtagctcaagctgtgggacatcagcctaatgcaagtgctggtgcaaatgctgaag 104822  T
Q  116 cgaggatgct 125  Q
     |||||||||    
T  104823 tgaggatgct 104832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21276 - 21123
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||     
T  21276 agatggttggaagaaatgacgctgctattactgctgcattggaagctgtgactcaagctgtgggacaacagcctaatgcgaatgctggtgctaatgctga 21177  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaag 167  Q
    ||  || ||| | ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  21176 agttagaatgttggagaattttatgaggaatcatccacctactttcaaaggaag 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18830 - 18783
Alignment:
Q  172 gaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18830 gaccctgatggagcacagacgtggctcaaagagattgagagagttttc 18783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20194 - 20079
Alignment:
Q  59 ctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctacttt 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20194 ctgtagctcaagttgtgggacaacagcctaatgcaaatgctggtgcgaatgctgagacgaggatgctagagaccttcctgaggaatcatcctcctacttt 20095  T
Q  159 caagggaagatatgac 174  Q
    ||||||||||||||||    
T  20094 caagggaagatatgac 20079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18301 - 18098
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||| ||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||       
T  18301 atggctggaaggaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttacccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgtgaatgctgaga 18202  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||| ||  |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  18201 ccaggatgttggagacattcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggat 18102  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  18101 tttc 18098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6980 - 6930
Alignment:
Q  169 tatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  6980 tatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggattttc 6930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12590 - 12387
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||       
T  12590 atggctggaagaaacgatgatgcgttagctgctgcactacaagctgttgcctaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 12491  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
      |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12490 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgagaggat 12391  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  12390 tttc 12387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22118 - 21915
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||       
T  22118 atggctggaagaaatgatgatgcgttagctgctgcactacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgctgaga 22019  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
      |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22018 ataggatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaaggaagatatgaccctgatcgagcccagacgtggcttaaagagattgagaggat 21919  T
Q  216 tttc 219  Q
    ||||    
T  21918 tttc 21915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 56142 - 55928
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||       
T  56142 atggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctttacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacccaacgcgaatgctggtgcaaatgctgaga 56043  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttct-gaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaggg 214  Q
     ||||||| | |||| |||||| ||||||  | | ||| || |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||     
T  56042 tgaggatgttggaga-ctttctcgaggaagaaccctccaaccttcaaggggagatatgacccggatggagcccagacgtggcttaaagagatagagagga 55944  T
Q  215 ttttctgcgtgatgca 230  Q
    | ||| | ||||||||    
T  55943 tcttccgtgtgatgca 55928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 754 - 555
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||  |||  |     
T  754 agatggctggaagaaacgacgctgctcttgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtggagcaacaacctaatgc------tggtgcgggtggaga 661  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  660 agttaggatgttggagacctttttgaggaatcatccacctacttttaaaggaagatatgatcctgatggagctcggacgtggctcaaagagattgagaga 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Original strand, 229016 - 229205
Alignment:
Q  17 tggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagc 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||    |    
T  229016 tggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgtgaatgctaagac 229115  T
Q  117 gaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagat 206  Q
     |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  229116 caggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaactttcacaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagat 229205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 71249 - 71046
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||  | || ||    
T  71249 gagatggctgggagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgcttaagctgtaggacaacaaccgaatgc---tgctgctggtaatgatg 71153  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  71152 gtgtgaggatgttggagacctttctgaggaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 71053  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  71052 gattttc 71046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1072 - 868
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||| | |||||||| || ||| |||||||| |  ||||| |||| |||||| | |||||     
T  1072 agatggctggaaggaatgatgctgctattgctgctgcgttagatgatgtagctcgagttgtaggacaacagcaaaatgctaatgttggtgcgaatgctga 973  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
     |  || ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||     
T  972 ggtcagaatgttagagacttttctgaggaaccatcctcctgttttcaaaggaaggtatgatccagacggagcacagacgtggctcaaggagattgaaaga 873  T
Q  214 gtttt 218  Q
    |||||    
T  872 gtttt 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3996 - 3782
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| || |||||| || | ||| |||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||       
T  3996 atggctggaagtaatgatgcttcgttagcttctgctctacaagctgtttcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatgctggtgtgaatgatgaga 3897  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | ||| || | ||||| ||  | |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3896 ctaggttgttggagactttcataaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggctcaaagagattgagaggat 3797  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| | ||||||||    
T  3796 tttccgtgtgatgca 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8701 - 8505
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    ||||||||||| |||||    
T  8701 gagatggctgaaagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtagggcaacaaccaaatgttggtgctggtgcaaatgctg 8602  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
     ||  |||||| |||| || ||| |||| ||||| |  || |||||||| || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  8601 aagttaggatgttagaaacttttatgagaaatcacccaccaactttcaaaggtagatatgatcctgatggagctcagaagtggctcaaggaggttga 8505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7150 - 7050
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7150 aggatgttggagacctttttgaggaatcatccacctactttcaagggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagaggattt 7051  T
Q  218 t 218  Q
    |    
T  7050 t 7050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 15767 - 15882
Alignment:
Q  97 gctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggc 196  Q
    |||||||| | ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15767 gctggtgctaatgctgaagtgagaatgctagaaacttttctgaggaatcatcctcctacttttaagggaagatatgaccccgatggagctcagacgtggc 15866  T
Q  197 tcaaagagattgagag 212  Q
    |||||||||| |||||    
T  15867 tcaaagagatagagag 15882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 73
Target Start/End: Original strand, 15713 - 15770
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctg 73  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15713 atggctggaagaaacaatgttgcgatcgctgctgcactagaagctgtagcttaagctg 15770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 923 - 727
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || ||||||||      |||||  | |||||       
T  923 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgccgcactagagactgtagcacaagctattggacatcagcctaatgc------tggtgtgaatgctgaga 830  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| |    
T  829 cgaggatggttgagactttcatgaggaatcatcctcctactttcaagggaagatacgaccctgatggagcccaaacgtggcttaaggagatcgagaggat 730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 35390 - 35574
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||            ||  || || |||||||  |||| ||| || | ||||| ||    
T  35390 atggctggaagaaacgacactgcgattgctgctgcactagaagctgt------------ggagcatcagcctaatgttaatgttggagctaatgctgaag 35477  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35478 tgaggatgttagagaattttatgaggaatcatcctcctactttcaaaggaagatacgaccctgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 35574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17078 - 16875
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||   |||||||   | || ||    
T  17078 gagatggctgggagaaatgatgctgttattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtatgacaacaaccgaatgctggtgctggt---aatgatg 16982  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||||||| | |||||||||||||| || ||||  || || ||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16981 gtgtgaggatgttggagacctttctgagaaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccatgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 16882  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  16881 gattttc 16875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42298 - 42090
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  42298 cagaaatggctggaagaaacgatgttgcgttagctgctgctctacaagttgttgcccaagctgtgggataacaacctaacgcaaatgctggtgcgaatgc 42199  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | || ||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42198 tgagactagaatgttggagactttcatgaagaagaaccctccaactttcaaacgaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaagagattgag 42099  T
Q  211 agggttttc 219  Q
    ||| |||||    
T  42098 aggattttc 42090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 12290 - 12351
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagct 72  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  12290 cagaaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagct 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37584 - 37440
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  | |||    
T  37584 cagaaatggctggaagaaacgatgctgcgttagctgctgaactacaagccgtagctcaagctgtggggcaataacctaatgcgaatgttggtgtgaatgc 37485  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctac 155  Q
    ||   |||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  37484 tgagacgaggatgctcgagactttcatgaggaatcatcctcctac 37440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 49787 - 49589
Alignment:
Q  32 atgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagac 131  Q
    |||||||| | |||||||| | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| | || |     
T  49787 atgctgcgttagctgctgctcgacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaaagcgaatgctggtgcaaatgctgagacgaggatgttggaca- 49689  T
Q  132 ctttct-gaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
    |||||| ||||||  | | ||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | ||||||||    
T  49688 ctttctcgaggaagaaccctccaaccttcaagggaagatatgacccggatggagcccagacgtggcttaaagagatagagaggatcttccgtgtgatgca 49589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 162174 - 162374
Alignment:
Q  19 gctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcga 118  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||||||||  | || ||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||  || |    
T  162174 gctggaaggaatgatgatgctattgctgctgcgttggatgctatagctcgagctgtaggacaacaacaaaatgctaatgttggtgcgaatgctgaggcta 162273  T
Q  119 ggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggtttt 218  Q
    | | | ||||||| ||| ||||||| ||||  |||  |||||| ||||| ||||| |  |  ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  162274 gaacgttagagacttttttgaggaaccatccccctgttttcaaaggaaggtatgatctaggcggagcacagacgtggctgaaggagattgaaagagtttt 162373  T
Q  219 c 219  Q
    |    
T  162374 c 162374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13624
Alignment:
Q  68 aagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaag 167  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||  |||||| | ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  13480 aagctttggggcaacaacctaatgctaatgctggtgctaatgctgaagataggatgttggagacttttctaaggaatcatccacctacttttaaaggaag 13579  T
Q  168 atatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13580 gtatgaccctaatggagctcaaacatggctcaaagagattgagag 13624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 51
Target Start/End: Original strand, 13440 - 13475
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgca 51  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13440 atggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgca 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 22696 - 22892
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||| || || || |||||||| |||| |||||| | |||||  |    
T  22696 atggctggaagaaacgacgctgcaattgctgctgcattggaagttgtggctaaagctgtagggcatcagcctaatgctaatgttggtgctaatgctgagg 22795  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      |||||| | || |  ||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22796 ttaggatgttggaaaatttcttgaggaatcatccgcctactttcaaaggaaggtatgaccctaatggagcttagacgtggctcaaatagattgagag 22892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1238 - 1042
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| || |||      |||||||| |  | |||||       
T  1238 atggctggaaggaacgatgatgcgattgctgctgcactagaaactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgctggggtgaatgctgaga 1145  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||    
T  1144 cgaggatgcttgagacattcatgaggaatcatcctcctaccttcaaggaaagatatgatccagatggagcccggacgtggcttaaggagattgagagagt 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 14210 - 14418
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || |||      |||||| |||  | |||||       
T  14210 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagctattggacatcagcct------aatgctagtgtgaatgctgaga 14303  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
    | |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||| || ||||| |||||| |    
T  14304 caaggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagacatgaccctgatggagcctagacgtggcttaaggagatcgagaggat 14403  T
Q  216 tttctgcgtgatgca 230  Q
    |||| | ||||||||    
T  14404 tttccgtgtgatgca 14418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 17520 - 17709
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| || | ||  |     
T  17520 agatggctggaaggaatgatgttgttattgctgctgcattggaagttgtagctcaagctgtggggcaacagcctaatgctggtgctggcgctaatgacgg 17619  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
    ||  |||||| | || || ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17620 agttaggatgttggaaacttttctgaggaatcgtccacctgctttcaagggaaggcatgatcctgatggagctcagacgtggctcaaaga 17709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33703 - 33543
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||    
T  33703 gagatggctgggagaaacgatgttgctattgctgttgcactgcaagctgtagctcaggctgtaggacaacaaccgaatgctagtgctggtgcaaatgatg 33604  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatga 173  Q
     || |||| || | || || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||||||    
T  33603 gagtgaggttgttggaaacttttctgagaaatcatccaccaactttcaaaggtagatatga 33543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 447 - 236
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgc 110  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||| | || ||||||||      |||||  | |||    
T  447 cagaaatggttggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcgcaagctattggatatcagcctaatgc------tggtgtgactgc 354  T
Q  111 tgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgag 210  Q
    ||   | |||||||| ||||||||  |||||||||| | |||   |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  353 tgagactaggatgctggagaccttcatgaggaatcaccctccagttttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatagag 254  T
Q  211 agggttttctgcgtgatg 228  Q
    ||| ||||| | ||||||    
T  253 aggattttccgggtgatg 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5832 - 5758
Alignment:
Q  70 gctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaat 144  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5832 gctgtggggcaacagcctaatgcgaatgatggtgcaagtgctgaagcgaggatgctagagacttttctgaggaat 5758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Original strand, 14166 - 14368
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||| | | |||||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||||| | |||||  |    
T  14166 atggctggaagaaatgacgctgcgattgctgctgctttggaagttctggctcaagctgtggggcaatagcctaatgctggtgctggtgctaatgctgagg 14265  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggt 215  Q
      || ||| | || || ||| ||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  14266 ttagaatgttggaaacttttatgaggaatcatccatctactttcaaaggaaggtatgatccagatggagctcagatgtggctcaaagagattaagaggat 14365  T
Q  216 ttt 218  Q
    |||    
T  14366 ttt 14368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 147 - 343
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||   | || ||    
T  147 gagatggctgagagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtggctcaagctgtaggacaacaaccgaatgctggtgctggt---aatgatg 243  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||||||| | |||||||||||||| || ||||  || ||  |||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  244 gtgtgaggatgttggagacctttctgagaaaccatccaccaacaatcaaagggaggtatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaggaggttgagag 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 61935 - 62138
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||| ||||    |||||||   | |  ||    
T  61935 gagatggctgggagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgtacaacaacaaccgaatgttggtgctggt---aataatg 62031  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
     ||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||    
T  62032 gagtaaggatgttggagacctttctgaggaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgacggagctcagaagtggctcaaggaggttgtgag 62131  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  62132 gattttc 62138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Original strand, 64500 - 64555
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  64500 aacgatgttgtgattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtgggccaaca 64555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4069 - 3886
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||      |||| ||||||  |||  |     
T  4069 agatggctggaagaaatgacgttgctattgctgctgcattggaagttgtggctcaacttgtggggcaacagcct------aatgttggtgctggtggaga 3976  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
    ||  || ||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3975 agttagaatgttagagacttttatgaggaatcatccacctactttcaaaggaaggtatgaccctgatggagctcagacgtggctcaaaga 3886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1195 - 1005
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||| |      |     
T  1195 agatggttggaagaaatgacgctgctattgctgctgcattggaagttgtggttcaagttgtgggacaacagcctaatgctggtgctggtgga------ga 1102  T
Q  114 agcgaggatgcta-gagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    ||  || ||| || ||||| ||| ||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1101 agttagaatgttaagagacttttatgaggaatcatccatctactttcaaaggaaggtatgaccatgatggagctgagacgtggctcaaagaggttga 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17774 - 17575
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   |||||||   | || ||     
T  17774 agatggctgggagaaacgatgctactattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc---tgctggt---aatgatgg 17681  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
     | ||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||  || || ||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  17680 tgtgaggatgttggagacatttatgaggaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaggaagttgagagg 17581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 28154 - 28235
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28154 atggctggaaggaacgatgctgcgttagctgctgctctacaagctgttgcccaagctgtgggacaacaacctaacgcgaatg 28235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1180 - 1068
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||    
T  1180 aggatgttggagaccttcatgaggaatcatcctccaaccttcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaatatattgagaggattt 1081  T
Q  218 tctgcgtgatgca 230  Q
    || | ||||||||    
T  1080 tccgtgtgatgca 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1270 - 1186
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctg 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||| | |||||| | ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  1270 atggctggaaggaatgatgttgcgttagctgctactctacaagctgttgcccaagctctgggacaacaacctaacgtgaatgctg 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 11077 - 11261
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||      |||||  | |   |    
T  11077 gagatggctggaaggaatgatgctgctattgctgccgcgttggaagctgtggctcaagctgtagggcaacaacctaatgc------tggtggtaataacg 11170  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatca-tcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
     ||  |||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11171 gagttaggatgttagaaacttttctgaggaatcaatca-cctactttaaagggaaggtatgatcctgatggagctcagacgtggctcaaaga 11261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 1746 - 1825
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1746 gagatggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtggctcaagctgtaggacaacaaccgaatgc 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 1832 - 1945
Alignment:
Q  117 gaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggtt 216  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || ||||  || || ||||  || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||     
T  1832 gaggatgttggagacctttctgagaaaccatccaccaacattcactgggaggtatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaggaggttgagagagtc 1931  T
Q  217 ttctgcgtgatgca 230  Q
    ||| | ||||||||    
T  1932 ttcagggtgatgca 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4379
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4458 gagatggctgggagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggttgtagctcaagctgtaggacaacagccgaatgc 4379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26970 - 26835
Alignment:
Q  68 aagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaag 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||    || |||||| | || || ||  |||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26970 aagctgtggggcaacaacctaatgttggtgttggtgctaatggtgaagttaggatgttggaaacttttctgaggaatcatcctcctactttcaaaggaag 26871  T
Q  168 atatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
     |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  26870 gtatgacccagatggagctcagtcgtggctcaaaga 26835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 43873 - 43952
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  43873 gagatggctgggagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 43952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6318 - 6118
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||   |||||||   | |||||    
T  6318 gagatggctggtagaaattatgctgctattgttgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtacgacagcaacctaatgc---tgctggt---aatgctg 6225  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||||||| | ||||| || ||||| || ||||  || ||  |||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6224 gtgtgaggatgttggagactttcctgagaaaccatccaccaacaatcaaagggaggtatgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagaggttgagag 6125  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  6124 gattttc 6118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1894 - 1740
Alignment:
Q  59 ctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctacttt 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | |||||   ||||||||||| || || || |||| || | || || |||||||| |||||||  || |||||    
T  1894 ctgtagctcaagctgtaggacaacagtcgaatgctggtgctggtgcaaatgatggagtgaggttgttggaaacatttctgagaaatcatccaccaacttt 1795  T
Q  159 caagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1794 caaaggaagatacgatcctgacggagctcagaagtggctcaaagaggttgagagg 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4544 - 4494
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgta 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4544 gagatggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagctgta 4494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 213
Target Start/End: Original strand, 4294 - 4371
Alignment:
Q  136 ctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4294 ctgaggaatcatccaccaacattcaagggaaggtacgaccctgatggagctcagaagtggctcaaagagattgagagg 4371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 4175 - 4244
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4175 agatggctggaaggaacgatgctgctattgctgttgcactgcaagctgtggctcaagctgtaggacaaca 4244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 35 - 147
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||    
T  35 aggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaacattcaaaggaagatatgaccctgatggagcccagacgtggcttaaggagatcgagaggattt 134  T
Q  218 tctgcgtgatgca 230  Q
    || | ||||||||    
T  135 tccgtgtgatgca 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 702 - 778
Alignment:
Q  133 tttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  702 tttctgagaagtcatccacctactttcaagggaagatatgaccctgatggagcttaatcgtggctcaaagagattga 778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 16373 - 16433
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16373 agatggctggtagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 16433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 7044 - 7156
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  7044 aggatgttggagaccttcatgagaaatcatcctccaactttcaaaggaagatatgaccctgacggagcccagacgtggcttaaggagattgagaggatat 7143  T
Q  218 tctgcgtgatgca 230  Q
    || | ||||||||    
T  7144 tccgtgtgatgca 7156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23262 - 23202
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23262 agatggctggtagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 23202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52793 - 52590
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   |||||||   | || ||    
T  52793 gagatggctggtagaaatgatgctgctattgctactgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgctggtgctggt---aatgatg 52697  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
      | ||||||| | |||||||||||||| || ||||  || || ||||| || || ||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  52696 gtgtgaggatgttggagacctttctgagaaaccatccaccaacattcaaagggaggtataaccctaatgcagctcagaagtggctcaaagaggtttagag 52597  T
Q  213 ggttttc 219  Q
    | |||||    
T  52596 gattttc 52590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 172158 - 172046
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||| | ||||||||  |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||    
T  172158 aggatgttggagaccttcatgagaaatcaccctccaactttcaagggaagatatgaccccgatggagcccagacgtggcttaaggagattgataggattt 172059  T
Q  218 tctgcgtgatgca 230  Q
    || | ||||||||    
T  172058 tccgtgtgatgca 172046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 197
Target Start/End: Original strand, 5 - 159
Alignment:
Q  40 attgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctga 139  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||   |  | || || ||||||| | ||||||||| |||    
T  5 attgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacaacaaccgaatgctggtgctggt---aacgatggagtgaggatgttggagacctttttga 101  T
Q  140 ggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
    |||||||||  || || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  102 ggaatcatccaccaacattcaaaggaaggtatgaccccgatggagctcagaagtggct 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6239 - 6064
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| | |||| | | ||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||| | || ||     
T  6239 agatggctggaagaaatgacgctgctattgttgctgcattggaagttatggctcaagctgtggggaaacagcctaatgctggtgctggtgctaatggtga 6140  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcag 189  Q
    ||  |||||| | || || ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  6139 agttaggatgttggaaacttttctgaggaatcatccatctactttcaaaggaaggtatgatccagatggagctcag 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 23359 - 23481
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtag 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | | ||||| |     
T  23359 atggctggaagaaacgaagctgcgttagctgctgcactacaagtcgtggctcaagctgtgggacaacaacc-aatgcaaatgttgggactaatgctgaaa 23457  T
Q  116 cgaggatgctagagacctttctga 139  Q
     ||||| ||||||||| |||||||    
T  23458 tgaggaagctagagacttttctga 23481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 8940 - 9000
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||  | || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8940 agatggctggtcgtaatgatgctgctcttgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 9000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 46 - 125
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  46 gagatggctggtagaaatgatactgcgattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6078 - 5925
Alignment:
Q  76 ggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgacc 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   | |||||   | |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  6078 ggacaacaacctaacgcgaatgctggtctgaatgctgagaccaggatgttggagaccttcatgagaaatcatcatccaacctttaaaggaagatatgacc 5979  T
Q  176 atgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctgcgtgatgca 230  Q
       ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  5978 ccaatggagcccagacgtggcttaaa-agattgagaggattttccgtgtgatgca 5925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 28931 - 28981
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgta 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28931 gagatggctggaagaaacgatgctgctattgctgctgcacttgaagctgta 28981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1017 - 956
Alignment:
Q  11 cagagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagct 72  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  1017 cagaaatggctggaagaaacgacgctgcgattgctgctgcactagagactgtagcacaagct 956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2789 - 2704
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaaga 203  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  2789 aggatgttggagacttttctgaggaatcatccacctactttcaaaggaaggtatgatccagatggagctcagtcgtggctcaaaga 2704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 5065 - 5138
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5065 gagatggctggtagaaacgatgccgctattgctgctgcacttgaggttgttgctcaagctgtaggacaacaacc 5138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 116765 - 116692
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  116765 gagatggctggtagaaacgatgctgctattgcagctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 116692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 320383 - 320203
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||   ||||| ||  |  | ||     
T  320383 agatggctggtcgtaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtgggacaacaaccgaacgc---tgctgctggtaacggtga 320287  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggct 197  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  | ||||| ||||| ||||| | |||||| || |||| ||||||    
T  320286 agtgaggatgctggagacctttttgaggaatcatccaccagcattcaaaggaaggtatgatcctgatggtgcccagaagtggct 320203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 8963 - 9023
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  8963 agatggctggtagaaacgatgctgctattgctgcttcacttgaggctgtagctcaagctgt 9023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 48344 - 48404
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48344 agatggctggtagaaacgatgctactattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 48404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 57378 - 57438
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  57378 agatggctggtagaaacgatgctactattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 57438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 63766 - 63826
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  63766 agatggctggtagaaacgatgctactattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 63826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30765 - 30572
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   |||||||     || ||    
T  30765 gagatggctggtagaaatgacgctgctatagctgctgcactggaggttgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgctggtgctggtaacgatggtg 30666  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    |    |||||| | ||||| ||  |||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30665 tt---aggatgttggagactttcttgagaaatcatccaccaactttcaaaggaaggtatgaccatgacggagctcagaagtggctcaaggaggttga 30572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 35 - 114
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  35 gagatggctggtcgtaatgatgctgctattgctgctgcacttgaagctgttgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 702 - 635
Alignment:
Q  16 atggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaaca 83  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  702 atggctgggagaaatgatgctgctattgctgctgcgcttgaggctgtagctcaagctgtaggacaaca 635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7209 - 7130
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    |||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7209 gagatggctggaaggaatgatgttgttattgctgctgcattggaagttgtggctcaagctgtggggcaacaacctaatgc 7130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7101 - 7015
Alignment:
Q  127 gagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagg 213  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  7101 gagacttttctaaggaaccatccgcctacctttaagggcagatatgatcctgatggagctcaaacatggctcaatgaggttgagagg 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23317 - 23182
Alignment:
Q  84 acctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatgga 183  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||  ||| | ||||||| |||||||    
T  23317 acctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatgga 23218  T
Q  184 gctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23217 gcccagacgtggcttaaagagattgagaggattttc 23182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8306 - 8171
Alignment:
Q  84 acctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgtagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatgga 183  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||| ||  ||| |||  | | ||| |||||||  ||| | ||||||| |||||||    
T  8306 acctaacgtgaatgctggtgcaaatgctgaagctaggatgttggagacgttcatgaagaagaaccctccgactttcagaggacgttatgaccctgatgga 8207  T
Q  184 gctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttc 219  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8206 gcccagacgtggcttaaagagattgagaggattttc 8171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36926 - 36736
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctgt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |||| |||||||||||||||| | | |||||||    ||||||||  | ||| |     
T  36926 agatggctggaagaaacgacgctgctattgccgctgctttggaaactgtggctcaagctgtgggacgatagcctaatgtaggtgctggtgttaatgccga 36827  T
Q  114 agcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagag 204  Q
    || ||||||| | || || ||||| | |||| |||  |||| |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  36826 agtgaggatgttggaaacttttctaacgaattatccgcctattttcaaaggaaggtatgatccagatggagctcaatcgtggctcaaagag 36736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1979 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1979
Description:

Target: scaffold1979; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 237
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  298 gagatggctgggagaaatgatgatgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6476 - 6375
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttt 217  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||  || || ||||| || || |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  6476 aggatgttggagacctttttgaggaatcatccaccaacattcaaagggaggtatggccctgatggagctcagaaatggctcaaagaggttgagaggattt 6377  T
Q  218 tc 219  Q
    ||    
T  6376 tc 6375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 177119 - 177058
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  177119 gagatgactgggagaaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 177058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 97770 - 97831
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  97770 gagatggctggtcgtaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 97831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 400 - 460
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  400 agatggctggtagaaacgacgctgctattgctgctgcacttgaggcagtagctcaagctgt 460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2857 - 2662
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgcgaatgctggtgcaagtgctg 112  Q
    ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||||| | ||    |||||||   | || ||    
T  2857 gagatggctgggaggaatgatgctgctcttgctgctgcacttgaggctgtagcccaagctgtacaacaacaaccgagtgttgttgctggt---aatgatg 2761  T
Q  113 tagcgaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgaga 211  Q
      | ||||||| | |||||||||||||| || ||||  || || ||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  2760 gtgtgaggatgttggagacctttctgagaaaccatccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgatggagctctgaagtggctcaaagaggttgaga 2662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 3247 - 3319
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  3247 agatggctggtcgtaacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaacc 3319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 264366 - 264306
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  264366 agatggctggtagaaacgatgctgctattgctgctacacttgaggttgtagctcaagctgt 264306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 68
Target Start/End: Original strand, 5427 - 5481
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctca 68  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5427 agatggctggtagaaacgatgctgttattgctgctgcacttgaggctgtagctca 5481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 583 - 526
Alignment:
Q  28 aacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaac 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  583 aacgatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacagcaac 526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 62702 - 62775
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  62702 gagatgactgggagaaatgacgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctgaagctgtaggacaacaacc 62775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Original strand, 42735 - 42787
Alignment:
Q  169 tatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagagggttttctg 221  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42735 tatgaccctgatggagctcaaaagtggctcaaagaggttgagaggattttctg 42787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 42582 - 42661
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  42582 gagatggctgggagaaatgatgttgttattgctgctgcacttgaggctattgctcaagctgtaggacagcaaccgaatgc 42661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 12352
Alignment:
Q  118 aggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattga 209  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||| | ||| || |||||||  ||||| || ||||||||    
T  12443 aggatgctagagactttcctgaggaatcatccaccaactttcaagggtaggtatgatcctgacggtgctcagaaatggctgaaggagattga 12352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3743 - 3688
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacc 86  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  3743 gatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagttgtaggacaacaacc 3688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1219 - 1152
Alignment:
Q  25 agaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1219 agaaacgacgttgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggacatcaaccgaatgc 1152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30566 - 30471
Alignment:
Q  117 gaggatgctagagacctttctgaggaatcatcatcctactttcaagggaagatatgaccatgatggagctcagacgtggctcaaagagattgagag 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || | ||  || || ||||| || || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||    
T  30566 gaggatgctggagacctttctgagaaaccgtccaccaacattcaaagggaggtatgaccctgatggagcccagaagtggctcaaggaggttgagag 30471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 467
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggacaacaacctaatgc 92  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  528 gatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctataggacagcaaccgaatgc 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0947 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0947
Description:

Target: scaffold0947; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Original strand, 712 - 773
Alignment:
Q  13 gagatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  712 gagatggctggtcgtaatgatgctgctattgttgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 16980 - 17029
Alignment:
Q  31 gatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgtgggaca 80  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16980 gatgctgctattgctgctgcacttgaggctgttgctcaagctgtaggaca 17029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 52587 - 52647
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  52587 agatggctggtcgtaatgatgctgctattgctgctgcacttgaggttgtagctcaagctgt 52647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 55187 - 55127
Alignment:
Q  14 agatggctggaagaaacgatgctgcgattgctgctgcactagaagctgtagctcaagctgt 74  Q
    ||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  55187 agatggctggtcgtaatgatgctgctaatgctgctgcacttgaggctgtagctcaagctgt 55127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University