View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3021_low_63 (Length: 241)

Name: NF3021_low_63
Description: NF3021
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3021_low_63
NF3021_low_63
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (12-222)||(16710122-16710331)
chr8 (11-224)||(36021249-36021464)
chr8 (11-224)||(7311905-7312119)
chr8 (11-224)||(36004934-36005148)
chr8 (6-224)||(36425175-36425396)
chr8 (38-224)||(36076523-36076709)
chr8 (38-224)||(1238771-1238958)
chr8 (11-224)||(8012770-8012986)
chr8 (58-224)||(6464076-6464242)
chr8 (27-224)||(15012944-15013143)
chr8 (38-224)||(11357672-11357859)
chr8 (27-224)||(45067884-45068082)
chr8 (158-224)||(26250192-26250258)
chr8 (86-224)||(29336591-29336729)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (9-224)||(43268416-43268633)
chr2 (27-224)||(2158168-2158365)
chr2 (27-224)||(2164584-2164781)
chr2 (27-224)||(13901424-13901621)
chr2 (27-224)||(34834280-34834477)
chr2 (27-224)||(34840724-34840921)
chr2 (38-224)||(21341406-21341592)
chr2 (12-224)||(2020900-2021114)
chr2 (27-224)||(45012539-45012737)
chr2 (58-224)||(16816830-16816996)
chr2 (58-224)||(16855987-16856153)
chr2 (27-224)||(29485451-29485649)
chr2 (11-224)||(12951352-12951568)
chr2 (62-224)||(21067460-21067622)
chr2 (38-224)||(15853106-15853293)
chr2 (49-224)||(42930868-42931038)
chr2 (38-224)||(36781660-36781850)
chr2 (144-224)||(21331580-21331660)
chr2 (83-224)||(13163372-13163515)
chr2 (80-217)||(11909472-11909611)
chr2 (181-221)||(34744913-34744953)
chr2 (165-221)||(22197696-22197753)
chr2 (182-224)||(17864038-17864080)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (23-224)||(15949714-15949915)
chr7 (23-224)||(15915193-15915394)
chr7 (8-224)||(6795994-6796213)
chr7 (34-224)||(8141922-8142110)
chr7 (49-224)||(23612945-23613120)
chr7 (6-224)||(8184837-8185058)
chr7 (58-224)||(26602468-26602634)
chr7 (48-224)||(1948123-1948299)
chr7 (8-224)||(48352927-48353146)
chr7 (49-224)||(3923584-3923759)
chr7 (6-224)||(8192397-8192618)
chr7 (11-224)||(1379503-1379719)
chr7 (11-224)||(5049362-5049578)
chr7 (8-224)||(48346543-48346762)
chr7 (38-224)||(2447202-2447390)
chr7 (13-224)||(36876101-36876322)
chr7 (38-224)||(6020343-6020530)
chr7 (1-224)||(14299456-14299684)
chr7 (1-224)||(14288271-14288499)
chr7 (48-224)||(19090365-19090539)
chr7 (27-224)||(45434141-45434339)
chr7 (25-224)||(22853671-22853872)
chr7 (22-224)||(39433463-39433667)
chr7 (38-224)||(9642394-9642582)
chr7 (38-224)||(21643074-21643262)
chr7 (25-224)||(33850105-33850309)
chr7 (57-186)||(37026324-37026455)
chr7 (83-203)||(7412531-7412653)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (38-224)||(22360520-22360706)
chr5 (38-224)||(22314386-22314572)
chr5 (27-225)||(29974513-29974713)
chr5 (27-225)||(30021929-30022129)
chr5 (48-224)||(42151375-42151551)
chr5 (58-224)||(29414168-29414334)
chr5 (27-224)||(29981015-29981216)
chr5 (49-224)||(40958108-40958283)
chr5 (22-224)||(5876774-5876976)
chr5 (8-224)||(2958415-2958634)
chr5 (8-224)||(2966884-2967103)
chr5 (11-224)||(34356738-34356954)
chr5 (11-224)||(34358529-34358745)
chr5 (6-224)||(25894093-25894315)
chr5 (22-224)||(4974119-4974321)
chr5 (34-224)||(2439357-2439546)
chr5 (64-224)||(12505271-12505431)
chr5 (164-219)||(17346799-17346854)
chr5 (165-221)||(37335706-37335762)
chr5 (181-221)||(42747643-42747683)
chr5 (171-219)||(40153906-40153954)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (34-224)||(6239212-6239402)
chr1 (48-224)||(1175162-1175338)
chr1 (11-224)||(39052790-39053004)
chr1 (11-224)||(39059162-39059376)
chr1 (11-224)||(42092452-42092668)
chr1 (58-224)||(26622027-26622193)
chr1 (11-224)||(45016337-45016553)
chr1 (38-224)||(23761816-23762002)
chr1 (58-224)||(41305019-41305185)
chr1 (38-224)||(45023091-45023278)
chr1 (37-224)||(28996565-28996754)
chr1 (37-224)||(29002281-29002470)
chr1 (37-224)||(32798280-32798467)
chr1 (35-224)||(1115458-1115648)
chr1 (44-222)||(44916896-44917075)
chr1 (45-224)||(44241911-44242092)
chr1 (38-224)||(4600085-4600275)
chr1 (45-224)||(9869661-9869842)
chr1 (58-224)||(31072874-31073042)
chr1 (38-224)||(43687185-43687375)
chr1 (62-224)||(35085562-35085726)
chr1 (58-224)||(11912762-11912928)
chr1 (75-225)||(47647223-47647375)
chr1 (86-149)||(13249345-13249409)
chr1 (28-100)||(5444694-5444765)
chr1 (181-224)||(31473814-31473857)
chr1 (182-219)||(30660400-30660437)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (27-224)||(32327961-32328158)
chr6 (8-224)||(4019682-4019901)
chr6 (8-224)||(4026108-4026327)
chr6 (9-224)||(34655807-34656025)
chr6 (15-224)||(7061970-7062182)
chr6 (15-224)||(7069156-7069368)
chr6 (9-224)||(34649356-34649574)
chr6 (11-224)||(1427873-1428089)
chr6 (11-224)||(4717990-4718206)
chr6 (58-224)||(21262073-21262239)
chr6 (27-209)||(4737847-4738030)
chr6 (38-224)||(31548451-31548638)
chr6 (27-224)||(31128757-31128956)
chr6 (49-224)||(9864250-9864426)
chr6 (38-224)||(4187242-4187429)
chr6 (45-224)||(13671299-13671480)
chr6 (58-224)||(1166978-1167145)
chr6 (58-224)||(34711055-34711222)
chr6 (49-224)||(29907415-29907591)
chr6 (58-147)||(27670682-27670773)
chr6 (119-224)||(30121097-30121203)
chr6 (170-220)||(20382818-20382868)
chr6 (181-224)||(22870795-22870838)
chr6 (170-224)||(14759219-14759273)
chr6 (188-224)||(27670650-27670686)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (11-224)||(37355799-37356015)
chr4 (9-224)||(17457411-17457629)
chr4 (27-224)||(27590861-27591059)
chr4 (49-224)||(30238785-30238960)
chr4 (11-224)||(41373543-41373759)
chr4 (48-224)||(7780883-7781060)
chr4 (38-224)||(8104437-8104624)
chr4 (38-224)||(13594664-13594851)
chr4 (49-224)||(55462263-55462438)
chr4 (1-224)||(37367753-37367981)
chr4 (47-224)||(16405902-16406081)
chr4 (58-224)||(30211035-30211202)
chr4 (60-224)||(36754293-36754457)
chr4 (58-224)||(5660048-5660215)
chr4 (120-224)||(49358876-49358982)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (48-224)||(11622-11798)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (8-224)||(27501414-27501633)
chr3 (22-224)||(23069020-23069226)
chr3 (23-224)||(9576509-9576715)
chr3 (9-220)||(24179634-24179846)
chr3 (49-224)||(32746926-32747101)
chr3 (58-224)||(4310986-4311152)
chr3 (58-224)||(9570047-9570213)
chr3 (22-224)||(25893782-25893986)
chr3 (25-224)||(43932133-43932333)
chr3 (22-224)||(43995632-43995832)
chr3 (40-224)||(10940786-10940970)
chr3 (58-222)||(47441359-47441524)
chr3 (58-224)||(6036822-6036990)
chr3 (58-224)||(20650624-20650791)
chr3 (80-224)||(2786259-2786405)
chr3 (165-221)||(6817168-6817224)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (58-224)||(8380-8546)
scaffold0510 (34-181)||(1625-1772)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (11-224)||(50246-50462)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (11-224)||(4455-4671)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (58-224)||(3201-3369)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (38-224)||(15727-15913)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (84-224)||(2786-2928)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 16710122 - 16710331
Alignment:
Q  12 tagttttatacttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggatt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16710122 tagttttat-cttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagatagtggatt 16710220  T
Q  112 cttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16710221 cttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaagacttccatgacaatgagtagctaaatctcccttgt 16710320  T
Q  212 tgggattagag 222  Q
    |||||||||||    
T  16710321 tgggattagag 16710331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 36021249 - 36021464
Alignment:
Q  11 atagttttatacttag--tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtgg 108  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  36021249 atagttttttacttagcttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtgg 36021348  T
Q  109 attcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctt 208  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36021349 attcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctt 36021448  T
Q  209 tgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  36021449 tgttgggattagaggt 36021464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7312119 - 7311905
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtgga 109  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7312119 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtgga 7312020  T
Q  110 ttcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttccttt 209  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7312019 ttcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttt 7311920  T
Q  210 gttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||    
T  7311919 gttgggattagaggt 7311905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 36004934 - 36005148
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtgga 109  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36004934 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtgga 36005033  T
Q  110 ttcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttccttt 209  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36005034 ttcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttt 36005133  T
Q  210 gttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||    
T  36005134 gttgggattagaggt 36005148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 36425175 - 36425396
Alignment:
Q  6 gatatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaa 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  36425175 gatatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagaatgatagag 36425274  T
Q  104 agtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 202  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36425275 agtggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 36425374  T
Q  203 ttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  36425375 ctcctttgttgggattagaggt 36425396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36076709 - 36076523
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36076709 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaa 36076610  T
Q  138 gttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36076609 gttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 36076523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1238958 - 1238771
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttcta-gagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcaca 136  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238958 ttttcacttgtaatatttttaagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcaca 1238859  T
Q  137 agttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1238858 agttgtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttctatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggt 1238771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 8012770 - 8012986
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagag--agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8012770 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 8012869  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8012870 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 8012969  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  8012970 ttgttgggattagaggt 8012986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 6464076 - 6464242
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6464076 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 6464175  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6464176 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 6464242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15013143 - 15012944
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgtt 125  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15013143 tttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcattttgtt 15013044  T
Q  126 gagaaatcacaag-ttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15013043 gagagatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 15012944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 11357672 - 11357859
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11357672 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgaaagagagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 11357771  T
Q  138 gttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11357772 gttgtaaatgaatttttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatcacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 11357859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 45067884 - 45068082
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  45067884 tttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggattgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcatttgttg 45067983  T
Q  127 agaaatcacaag-ttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45067984 agagatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcatttttgcaaggcttcaatgacaaggagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 45068082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 26250192 - 26250258
Alignment:
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26250192 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 26250258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 29336591 - 29336729
Alignment:
Q  86 agagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaag-ttgt-aatgaatcttgct-tcttcaattcattcttgcaaggcttcc 182  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||| ||||||||||  | | ||| | ||| |||||||| |  | |    
T  29336591 agagtgagagtgataggaggtggattcttcaagatttgttgagaaatcactagtttgtaaatgaatcttcatcttttcca-tcaatcttgcaaag--ttc 29336687  T
Q  183 atgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  29336688 atgacaatgagtaactaattctcctttgttgggattagaggt 29336729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43268633 - 43268416
Alignment:
Q  9 atatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagt 106  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43268633 atatagttttatacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagt 43268534  T
Q  107 ggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcc 206  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43268533 ggattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 43268434  T
Q  207 tttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43268433 tttgttgggattagaggt 43268416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2158365 - 2158168
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2158365 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttg 2158266  T
Q  127 agaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2158265 agacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 2158168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2164781 - 2164584
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2164781 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttg 2164682  T
Q  127 agaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2164681 agacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 2164584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 13901424 - 13901621
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13901424 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttg 13901523  T
Q  127 agaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13901524 agacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcgattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 13901621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 34834280 - 34834477
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34834280 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttg 34834379  T
Q  127 agaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34834380 agacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggactagaggt 34834477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 34840724 - 34840921
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34840724 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttg 34840823  T
Q  127 agaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34840824 agacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggactagaggt 34840921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 21341406 - 21341592
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21341406 ttttcacttgtaatatttctagagggagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcctttgttgagaaatcacaa 21341505  T
Q  138 gttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21341506 gttgtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatatcctttgttgggattagaggt 21341592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 2020900 - 2021114
Alignment:
Q  12 tagttttatacttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttct--agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtgga 109  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2020900 tagttttaatcttagtttttcatagtttttcacttgtaatattcttggagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagggtgatagaaagtgga 2020999  T
Q  110 ttcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttccttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2021000 ttcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttt 2021099  T
Q  210 gttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||    
T  2021100 gttgggattagaggt 2021114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45012737 - 45012539
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  45012737 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattctttgttg 45012638  T
Q  127 agaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45012637 agaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 45012539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 16816830 - 16816996
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16816830 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 16816929  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16816930 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 16816996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 16855987 - 16856153
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855987 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 16856086  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16856087 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 16856153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29485649 - 29485451
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  29485649 tttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattctttgttg 29485550  T
Q  127 agaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29485549 agaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttaaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 29485451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12951568 - 12951352
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctaga--gagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12951568 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagaaagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 12951469  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12951468 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 12951369  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  12951368 ttgttgggattagaggt 12951352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Original strand, 21067460 - 21067622
Alignment:
Q  62 agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttca 161  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21067460 agagagttagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattctttatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatctttcttcttca 21067559  T
Q  162 attcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21067560 attcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 21067622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15853293 - 15853106
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15853293 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagagcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 15853194  T
Q  138 gttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15853193 gttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 15853106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Original strand, 42930868 - 42931038
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaa-tga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||      |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  42930868 aatatttctagagagagagatagggcttgttctttatagagtga------tagagagtggattcttcatcctttgttgagaaatcataagttgtaaatga 42930961  T
Q  148 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42930962 atttttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 42931038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 36781660 - 36781850
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatct-tttgttgagaaatca 134  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  36781660 ttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctgtatagagtgggagtgatagaaattgaattctacatcactttgttgagagatca 36781759  T
Q  135 caagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36781760 caagtgtgtaatggatctttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 36781850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 21331580 - 21331660
Alignment:
Q  144 atgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21331580 atgaatctttgttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatatcctttgttgggattagaggt 21331660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13163515 - 13163372
Alignment:
Q  83 catagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gta-atgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggctt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  || | |||| |||||||| | |     
T  13163515 catagagtgagtgtgatagaaggtggattcttccatatttgttgagaaatcacaagtttgtatatgaatcttcatcttttacttcaatcttgcaaagtta 13163416  T
Q  181 ccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13163415 ccatgacaatgagtagctaaatctccattgttgggattagaggt 13163372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 217
Target Start/End: Original strand, 11909472 - 11909611
Alignment:
Q  80 cttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaag-ttgta-atgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaagg 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||     || | |||| |||||||| |    
T  11909472 cttcatagggtgagagtgatagaaggtggattcttccatatttgtggagaaatcacaagtttgtatatgaatcttcaccttttagttcaatcttgcaaag 11909571  T
Q  178 cttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggat 217  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11909572 ttaccatgacaatgagtagctaaatctccattgttgggat 11909611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Original strand, 34744913 - 34744953
Alignment:
Q  181 ccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattaga 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34744913 ccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 34744953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 22197696 - 22197753
Alignment:
Q  165 cattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttc-ctttgttgggattaga 221  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22197696 catttttgcaaggtttccatgacaatgagtagctaaatttcaccttgttggtattaga 22197753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17864080 - 17864038
Alignment:
Q  182 catgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17864080 catgacaatgatcagctaaatctcctttgttgggattagaggt 17864038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15949915 - 15949714
Alignment:
Q  23 ttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttt 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949915 ttagtttttcatagtttttcacttgtaatattcttggagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttt 15949816  T
Q  123 gttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15949815 gttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctagatctcctttgttgggattagag 15949716  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  15949715 gt 15949714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15915394 - 15915193
Alignment:
Q  23 ttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttt 122  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15915394 ttagtttttcatagtttttcaattgtaatattcttggagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttt 15915295  T
Q  123 gttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagag 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15915294 gttgagaaatcacaagttgtattgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctagatctcctttgttgggattagag 15915195  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  15915194 gt 15915193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6796213 - 6795994
Alignment:
Q  8 tatatagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6796213 tatatagttttttacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagaga 6796114  T
Q  105 gtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaattt 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6796113 gtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 6796014  T
Q  205 cctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6796013 cctttgttgggattagaggt 6795994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 224
Target Start/End: Original strand, 8141922 - 8142110
Alignment:
Q  34 tagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8141922 tagtttttcacttgtaatatttctagag--agagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatc 8142019  T
Q  134 acaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8142020 acaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 8142110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23613120 - 23612945
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23613120 aatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 23613021  T
Q  149 tcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23613020 tctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 23612945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 8184837 - 8185058
Alignment:
Q  6 gatatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaa 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  8184837 gatatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagag 8184936  T
Q  104 agtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 202  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8184937 agtggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 8185036  T
Q  203 ttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  8185037 ctcctttgttgggattagaggt 8185058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26602634 - 26602468
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602634 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 26602535  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26602534 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 26602468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Original strand, 1948123 - 1948299
Alignment:
Q  48 taatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1948123 taatatttctagagagagagatagggcttgttcttcataaagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcataagttgtaatga 1948222  T
Q  148 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1948223 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatggcaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 1948299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 48352927 - 48353146
Alignment:
Q  8 tatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  48352927 tatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagag 48353026  T
Q  106 tggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaattt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48353027 tggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 48353126  T
Q  205 cctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48353127 cctttgttgggattagaggt 48353146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Original strand, 3923584 - 3923759
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3923584 aatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 3923683  T
Q  149 tcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3923684 tctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatcacctttgttgggattagaggt 3923759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 8192397 - 8192618
Alignment:
Q  6 gatatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaa 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  8192397 gatatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagaggtagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagag 8192496  T
Q  104 agtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 202  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8192497 agtggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 8192596  T
Q  203 ttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  8192597 ctcctttgttgggattagaggt 8192618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1379719 - 1379503
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1379719 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 1379620  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1379619 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 1379520  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  1379519 ttgttgggattagaggt 1379503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 5049362 - 5049578
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagag--agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5049362 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 5049461  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5049462 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 5049561  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  5049562 ttgttgggattagaggt 5049578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 48346543 - 48346762
Alignment:
Q  8 tatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  48346543 tatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagag 48346642  T
Q  106 tggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaattt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  48346643 tggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgataatgagtagctaaatct 48346742  T
Q  205 cctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48346743 cctttgttgggattagaggt 48346762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2447390 - 2447202
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcac 135  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2447390 ttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcac 2447291  T
Q  136 aagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2447290 aagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 2447202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36876322 - 36876101
Alignment:
Q  13 agttttatacttagtttctcttagtttttca--cttgt--------aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgataga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |        |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36876322 agttttatacttagtttctcttagtttttcatacttttcattttacaatatttctagagagaaagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgataga 36876223  T
Q  103 aagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36876222 gagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatctttcttcttcaattcattctttcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 36876123  T
Q  203 ttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  36876122 ctcttttgttgggattagaggt 36876101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 6020343 - 6020530
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6020343 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 6020442  T
Q  138 gttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    || || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6020443 gtcgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 6020530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14299684 - 14299456
Alignment:
Q  1 attgagatatatagttttatacttagttt---ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtg 97  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14299684 attgagatacatagttttttacttagttttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtg 14299585  T
Q  98 atagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagta 195  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14299584 atagaaagtgaattctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtaatggatctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagta 14299485  T
Q  196 gctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14299484 gctaaatctcctttgttaggattagaggt 14299456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14288499 - 14288271
Alignment:
Q  1 attgagatatatagttttatacttagttt---ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtg 97  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14288499 attgagatacatagttttttacttagttttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagataggtcttgtgctttatagagtgagagtg 14288400  T
Q  98 atagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagta 195  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14288399 atagaaagtgaattctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtaatggacctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagta 14288300  T
Q  196 gctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14288299 gctaaatctcctttgttgggattagaggt 14288271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19090539 - 19090365
Alignment:
Q  48 taatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatga 147  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19090539 taatatttctagagagaga--taggg-ttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatattttgttgagaaatcacaagttgtaatga 19090443  T
Q  148 atcttgcttc-ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19090442 atctttcttctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcttttgttgggattagaggt 19090365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45434339 - 45434141
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  45434339 tttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagatatagggcttgttcttcatagactgagagtgatagaaagtggattcttcctcatttgttt 45434240  T
Q  127 agaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45434239 agagatcataagtttgtaatgaatccttctttttcaattcattcttgcaaggcttccatggcaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 45434141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Original strand, 22853671 - 22853872
Alignment:
Q  25 agtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttg 123  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  22853671 agtttttcatagtttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattatacatcattttg 22853770  T
Q  124 ttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagag 222  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22853771 ttgagagatcacaagtgtgtaatggatccttccctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 22853870  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  22853871 gt 22853872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39433667 - 39433463
Alignment:
Q  22 cttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-tt 120  Q
    |||||||| ||||||||||    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  39433667 cttagtttttcttagttttcattttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcatt 39433568  T
Q  121 ttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggatta 219  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39433567 ttgttgagagatcacaagtgtgcaatggatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcttttgttaggatta 39433468  T
Q  220 gaggt 224  Q
    |||||    
T  39433467 gaggt 39433463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 9642394 - 9642582
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatct-tttgttgagaaatcaca 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||  ||||||    
T  9642394 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctgtatagagtgggagtgatagaaattgaattctacatcactttgttgagtgatcaca 9642493  T
Q  137 agt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9642494 agtgtgtaatggatctttctctttcaattcattcttgcaaagcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 9642582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21643262 - 21643074
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcaca 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| || |||    
T  21643262 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgggagtgatagaaagtgaattctacatcactttgttgagagataaca 21643163  T
Q  137 agt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| ||||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21643162 agtgtgtaatggatctttctctttcacttcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttggcattagaggt 21643074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Original strand, 33850105 - 33850309
Alignment:
Q  25 agtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgata----gaaagtggattcttcatc-t 119  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    ||||||||||||||| || |    
T  33850105 agtttttcatagtttttcacgtgtaatacttttagagagagaaatagggcttgttcta-atatagtgagagtgatatatagaaagtggattcttcctcat 33850203  T
Q  120 tttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggatt 218  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33850204 tttgttgagagatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagataaatctcctttgttgggatt 33850303  T
Q  219 agaggt 224  Q
    ||||||    
T  33850304 agaggt 33850309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37026455 - 37026324
Alignment:
Q  57 tagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgc 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |    
T  37026455 tagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcacaagtgtgtaatggatcattc 37026356  T
Q  155 ttcttcaattcattcttgcaaggcttccatga 186  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026355 tctttcaattcattcttgcaaggcttccatga 37026324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Original strand, 7412531 - 7412653
Alignment:
Q  83 catagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gta-atgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggctt 180  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  || | |||| |||||||| | |     
T  7412531 catagagttagagtgatagaaggtggattcttccatatttgttgagaaatcacaagtttgtatatgaatcttcatcttttacttcaatcttgcaaagtta 7412630  T
Q  181 ccatgacaatgagtagctaaatt 203  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  7412631 tcatgacaatgagtagctaaatt 7412653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22360706 - 22360520
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360706 ttttcacttgtaacattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 22360607  T
Q  138 gttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22360606 gttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 22360520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22314572 - 22314386
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22314572 ttttcacttgtaacattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 22314473  T
Q  138 gttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22314472 gttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaacctcctttgttgggattagaggt 22314386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29974713 - 29974513
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29974713 tttctcttagtttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgt 29974614  T
Q  125 tgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29974613 tgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 29974514  T
Q  225 g 225  Q
    |    
T  29974513 g 29974513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 30021929 - 30022129
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagag--agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30021929 tttctcttagtttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgt 30022028  T
Q  125 tgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30022029 tgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 30022128  T
Q  225 g 225  Q
    |    
T  30022129 g 30022129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42151551 - 42151375
Alignment:
Q  48 taatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42151551 taatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatga 42151452  T
Q  148 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  42151451 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttcattgggattagaggt 42151375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 29414168 - 29414334
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29414168 agagagagagatagggcctgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatctttcttc 29414267  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414268 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 29414334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29981216 - 29981015
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagaga----gagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  29981216 tttctcttagtttttcacttgtaatattcttagagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatccttt 29981117  T
Q  123 gttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagag 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29981116 gttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 29981017  T
Q  223 gt 224  Q
    ||    
T  29981016 gt 29981015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Original strand, 40958108 - 40958283
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40958108 aatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 40958207  T
Q  149 tcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40958208 tctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacagtgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 40958283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5876976 - 5876774
Alignment:
Q  22 cttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttt 121  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5876976 cttagtttttcatagtttttcacttgtaatattcttggagagagagatagagcttgttcttcatagagtgagaatgatagaaagtggattcttcatcttt 5876877  T
Q  122 tgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattaga 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5876876 tgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcatttttgcaaagcttccatgataatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 5876777  T
Q  222 ggt 224  Q
    |||    
T  5876776 ggt 5876774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2958634 - 2958415
Alignment:
Q  8 tatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  2958634 tatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagag 2958535  T
Q  106 tggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaattt 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2958534 tggattcttcgttctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 2958435  T
Q  205 cctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2958434 cctttgttgggattagaggt 2958415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2967103 - 2966884
Alignment:
Q  8 tatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  2967103 tatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagag 2967004  T
Q  106 tggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaattt 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2967003 tggattcttcgttctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 2966904  T
Q  205 cctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2966903 cctttgttgggattagaggt 2966884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 34356738 - 34356954
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagag--agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  34356738 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagaatgatagagagtg 34356837  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34356838 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 34356937  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  34356938 ttgttgggattagaggt 34356954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 34358529 - 34358745
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagag--agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  34358529 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagaatgatagagagtg 34358628  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34358629 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 34358728  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  34358729 ttgttgggattagaggt 34358745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 25894093 - 25894315
Alignment:
Q  6 gatatatagttttatacttagttt--ctcttagtttt--tcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatag 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25894093 gatatatagtttt-tacttagtttttctctgagtttttttcacttgtaatgtttctagagagatagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatag 25894191  T
Q  102 aaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaa 200  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894192 agagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaa 25894291  T
Q  201 atttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  25894292 atctcctttgttgggattagaggt 25894315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4974321 - 4974119
Alignment:
Q  22 cttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-tt 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4974321 cttagtttttcatagtttttcacttgtaatatttt--gagagagagatagggtttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcatt 4974224  T
Q  121 ttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggatta 219  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4974223 ttgttgagagatcacaagtgtgtaatggatcttcctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 4974124  T
Q  220 gaggt 224  Q
    |||||    
T  4974123 gaggt 4974119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2439546 - 2439357
Alignment:
Q  34 tagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatc 133  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  2439546 tagtttttaacttgtaatacttttagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaggtggattcttcctcaattgttgagaaatc 2439449  T
Q  134 acaag-ttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2439448 acaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattcttgcaaagcttccatgacattgagtagctaaatctcctttgttcggattagaggt 2439357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 12505271 - 12505431
Alignment:
Q  64 agagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa-gttgtaatgaatcttgcttcttcaa 162  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||  |||||    
T  12505271 agagatagggcttgttctt-atagagtgagagtgatagaaggtggattcttcctcatttgttgagagatcacaaagttgtaatgaatcgttctctttcaa 12505369  T
Q  163 ttcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12505370 ttcattcttgcaaagcttccatgacaatgagtagctaaatctccattgttgggattagaggt 12505431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17346854 - 17346799
Alignment:
Q  164 tcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggatta 219  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17346854 tcatttttgcaaggctaccatgacaatgagtagctaaatctcatttgttgggatta 17346799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37335762 - 37335706
Alignment:
Q  165 cattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattaga 221  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37335762 catttttgcaaagctacaatgacaatgagtagctaaatctcatttgttgggattaga 37335706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42747683 - 42747643
Alignment:
Q  181 ccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattaga 221  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42747683 ccatgagaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 42747643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40153954 - 40153906
Alignment:
Q  171 tgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggatta 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  40153954 tgcaaggttaccatgacaatgagtagttaaatctcatttgttgggatta 40153906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6239402 - 6239212
Alignment:
Q  34 tagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6239402 tagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatc 6239303  T
Q  134 acaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6239302 acaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggactagaggt 6239212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1175338 - 1175162
Alignment:
Q  48 taatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1175338 taatatttctagagagagagatagggcttgttcttcacagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatga 1175239  T
Q  148 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1175238 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 1175162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 39052790 - 39053004
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtgga 109  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39052790 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgataaagagtgga 39052889  T
Q  110 ttcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttccttt 209  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39052890 ttcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttt 39052989  T
Q  210 gttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||    
T  39052990 gttgggattagaggt 39053004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 39059162 - 39059376
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtgga 109  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39059162 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgataaagagtgga 39059261  T
Q  110 ttcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttccttt 209  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39059262 ttcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttt 39059361  T
Q  210 gttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||    
T  39059362 gttgggattagaggt 39059376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42092668 - 42092452
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42092668 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 42092569  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42092568 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 42092469  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  42092468 ttgttgggattagaggt 42092452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26622193 - 26622027
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26622193 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatctttcttc 26622094  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26622093 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 26622027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45016553 - 45016337
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45016553 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 45016454  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45016453 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 45016354  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  45016353 ttgttgggattagaggt 45016337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Original strand, 23761816 - 23762002
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23761816 ttttcacttgtaacattcttggagagagagatagagcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcatttgttgagaaatcacaa 23761915  T
Q  138 gttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23761916 gttgtaatgaatcttacttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 23762002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 41305019 - 41305185
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41305019 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttggttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 41305118  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41305119 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgataatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 41305185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45023278 - 45023091
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45023278 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 45023179  T
Q  138 gttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45023178 gttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 45023091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28996754 - 28996565
Alignment:
Q  37 tttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatct-tttgttgagaaatcac 135  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  28996754 tttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgggagtgatagaaagtgaattctacatcactttgttgagagatcac 28996655  T
Q  136 aagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    || | ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28996654 aaatgtgtaatggatctttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 28996565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29002470 - 29002281
Alignment:
Q  37 tttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatct-tttgttgagaaatcac 135  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  29002470 tttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgggagtgatagaaagtgaattctacatcactttgttgagagatcac 29002371  T
Q  136 aagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    || | ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29002370 aaatgtgtaatggatctttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 29002281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32798467 - 32798280
Alignment:
Q  37 tttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcac 135  Q
    ||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  32798467 tttttcacttgtactactttt--agagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattctttctcattttgttgagagatcac 32798370  T
Q  136 aag-ttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32798369 aagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 32798280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 224
Target Start/End: Original strand, 1115458 - 1115648
Alignment:
Q  35 agtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatc 133  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  1115458 agtttttcactggtaatacttttagagagagaaatagggtttgttcta-atagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcattttgttgagagatc 1115556  T
Q  134 acaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1115557 acaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 1115648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44917075 - 44916896
Alignment:
Q  44 cttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa-gttgt 142  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||    
T  44917075 cttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtagattcttccttatttgttgagagatcacaaagttgt 44916976  T
Q  143 aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagag 222  Q
    |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44916975 aatgaatcattctctttcaattcattcttgcaaggcttcaatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 44916896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44242092 - 44241911
Alignment:
Q  45 ttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgt 142  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  44242092 ttgtaatattcttagagagtgagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcacaagtgtgt 44241993  T
Q  143 aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44241992 aatggatcattctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccattgttgggattagaggt 44241911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4600275 - 4600085
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatca 134  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  4600275 ttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgcttgatagaatgagagtgatagaaattggattctacatcattttgttgagagatca 4600176  T
Q  135 caagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| | ||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4600175 caagtgtataatggatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 4600085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9869842 - 9869661
Alignment:
Q  45 ttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatct-tttgttgagaaatcacaagt-tgt 142  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||    
T  9869842 ttgtaatacttttagagagagagattgggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagaggattctacatcaatttgttgagagatcacaagtgtgt 9869743  T
Q  143 aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9869742 aatggatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggt 9869661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31073042 - 31072874
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaa-tcttgct 155  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||| || | ||    
T  31073042 agagagagagagagggtttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattctttctcatttgttgagagatcacaagtttgtaatgaaatccttct 31072943  T
Q  156 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31072942 ctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaacgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 31072874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43687375 - 43687185
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatct-tttgttgagaaatca 134  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  43687375 ttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctgtatagagtgggagtgatagaaattgaattctacatcactttgttgagagatca 43687276  T
Q  135 caagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43687275 caagtgtgtaatagatctttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctagatctcctttgttgggattagaggt 43687185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35085726 - 35085562
Alignment:
Q  62 agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgcttctt 159  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||  ||    
T  35085726 agagagatagagcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcacaagtgtgtaatggatatttctcttt 35085627  T
Q  160 caattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  35085626 caattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtacctaaatctcctttgttaggattaaaggt 35085562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 11912762 - 11912928
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa-gttgtaatgaatcttgctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||     
T  11912762 agagagagagatagggcttgttcta-atagagtgagagtgataataggtggattctttctcatttgttgagagatcacaaagttgtaatgaatccttctc 11912860  T
Q  157 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11912861 tttcaattcatttttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgagattagaggt 11912928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47647375 - 47647223
Alignment:
Q  75 ttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaag-ttgta-atgaatcttgcttcttcaattcattcttg 172  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  |  || | |||| |||||    
T  47647375 ttgttcttcagagagtgagagtgatagaaggtggattcttccatatttgttgagaaatcacaagtttgcatatgaatcttcatcttttacttcaatcttg 47647276  T
Q  173 caaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggtg 225  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||    
T  47647275 caaagttaccatgacaatgagtagctaaatctccattgttaggattataggtg 47647223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13249409 - 13249345
Alignment:
Q  86 agagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaag-ttgtaatgaat 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13249409 agagtgagagtgataggaagtggattcttcaatatttgttgagaaatcacaagtttgtaatgaat 13249345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 100
Target Start/End: Original strand, 5444694 - 5444765
Alignment:
Q  28 ttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgata 100  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5444694 ttctcataatttttcacctgtaatcttt-tagagagagaaatagagcttgttcttcatagagtgagagtgata 5444765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31473857 - 31473814
Alignment:
Q  181 ccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31473857 ccatgataatgagtagctaaatctactttgttgggattagaggt 31473814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30660437 - 30660400
Alignment:
Q  182 catgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggatta 219  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30660437 catgagaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 30660400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 32327961 - 32328158
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  32327961 tttctctgagtttttcacctgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttg 32328060  T
Q  127 agaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32328061 agacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctatgttgggattagaggt 32328158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 4019682 - 4019901
Alignment:
Q  8 tatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4019682 tatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagag 4019781  T
Q  106 tggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaattt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4019782 tggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 4019881  T
Q  205 cctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4019882 cctttgttgggattagaggt 4019901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 4026108 - 4026327
Alignment:
Q  8 tatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4026108 tatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagag 4026207  T
Q  106 tggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaattt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4026208 tggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 4026307  T
Q  205 cctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4026308 cctttgttgggattagaggt 4026327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34656025 - 34655807
Alignment:
Q  9 atatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34656025 atatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagt 34655926  T
Q  107 ggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttc 205  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34655925 ggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctc 34655826  T
Q  206 ctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34655825 ctttgttgggattagaggt 34655807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 7061970 - 7062182
Alignment:
Q  15 ttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattc 112  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7061970 ttttatacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattc 7062069  T
Q  113 ttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgt 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7062070 ttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgt 7062169  T
Q  212 tgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||    
T  7062170 tgggattagaggt 7062182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 7069156 - 7069368
Alignment:
Q  15 ttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattc 112  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7069156 ttttatacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattc 7069255  T
Q  113 ttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgt 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7069256 ttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgt 7069355  T
Q  212 tgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||    
T  7069356 tgggattagaggt 7069368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34649574 - 34649356
Alignment:
Q  9 atatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34649574 atatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagt 34649475  T
Q  107 ggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttc 205  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34649474 ggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctc 34649375  T
Q  206 ctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  34649374 ctttgttaggattagaggt 34649356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 1427873 - 1428089
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagag--agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1427873 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 1427972  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1427973 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 1428072  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  1428073 ttgttgggattagaggt 1428089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 4717990 - 4718206
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagag--agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4717990 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 4718089  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4718090 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 4718189  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  4718190 ttgttgggattagaggt 4718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 21262073 - 21262239
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21262073 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatctttcttc 21262172  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21262173 ttcaattcattcttgcaaggtttccatgaaaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 21262239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Original strand, 4737847 - 4738030
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  4737847 tttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagaatgagagtgatagagagtggattcttcattctttgttg 4737946  T
Q  127 agaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttccttt 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4737947 agaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttt 4738030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31548638 - 31548451
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31548638 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgaaagagagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 31548539  T
Q  138 gttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31548538 gttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 31548451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 31128757 - 31128956
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgtt 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||    
T  31128757 tttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagaaagtgaattctacatcactttgtt 31128856  T
Q  126 gagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31128857 gagagatcacaagtgtgtaatggatctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 31128956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Original strand, 9864250 - 9864426
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9864250 aatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagaaatcaaaagttgtaaatga 9864349  T
Q  148 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9864350 atatttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagataaatctcctttgttgggattagaggt 9864426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4187429 - 4187242
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4187429 ttttcacttgtaacattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaattacaa 4187330  T
Q  138 gt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    || ||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4187329 gtgtgtaatggatctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttggaattagaggt 4187242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Original strand, 13671299 - 13671480
Alignment:
Q  45 ttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgt 142  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  13671299 ttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcacaagtgtgt 13671398  T
Q  143 aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13671399 aatggatctttctctctcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 13671480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 1166978 - 1167145
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa-gttgtaatgaatcttgctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||     
T  1166978 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtaatagaaggtggattcttcgtcatttgttgagagatcacaaagttgtaatgaatccttctc 1167077  T
Q  157 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  1167078 tttcaattcattcttgcaaagcttccatgacaatgagtagctaaatctccattgctgggattagaggt 1167145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 34711055 - 34711222
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatct-tttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgct 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  34711055 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaa-gtgaatcctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtcatggatctttct 34711153  T
Q  156 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34711154 ctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 34711222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29907591 - 29907415
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatg 146  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  29907591 aatatttttagagagagaaatagggcttgttcta-atagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcattttgttgagagatcacaagttattaatg 29907493  T
Q  147 aatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     ||  | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29907492 cattcttctctttcaattatttcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggt 29907415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27670773 - 27670682
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgtaatga 147  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27670773 agagagagagatagggattgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcacaagtgtgtaatga 27670682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 30121097 - 30121203
Alignment:
Q  119 ttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggat 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||  |||    
T  30121097 ttttgttgagaaatcacaagtttgtaatgaattgttctctttcaattctttcttgcaaggcttccatgataatgagtagttgaatctcctttgttaagat 30121196  T
Q  218 tagaggt 224  Q
    |||||||    
T  30121197 tagaggt 30121203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Original strand, 20382818 - 20382868
Alignment:
Q  170 ttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattag 220  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20382818 ttgcaaggctaccatgataatgagtagctaaatctcatttgttgggattag 20382868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22870838 - 22870795
Alignment:
Q  181 ccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22870838 ccatgagaatgattagctaaatctcctttgttgggattagaggt 22870795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Original strand, 14759219 - 14759273
Alignment:
Q  170 ttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  14759219 ttgcaaggctaccatgataatgagtagttaaatctcatttgttgggattaaaggt 14759273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27670686 - 27670650
Alignment:
Q  188 aatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27670686 aatgagtagctaaatctcctttgttcggattagaggt 27670650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 37355799 - 37356015
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtgg 108  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37355799 atagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtgg 37355898  T
Q  109 attcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37355899 attcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 37355998  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  37355999 ttgttgggattagaggt 37356015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17457629 - 17457411
Alignment:
Q  9 atatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17457629 atatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagt 17457530  T
Q  107 ggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttc 205  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17457529 ggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctc 17457430  T
Q  206 ctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17457429 ctttgttgggattagaggt 17457411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27591059 - 27590861
Alignment:
Q  27 tttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  27591059 tttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattctttgttg 27590960  T
Q  127 agaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27590959 agaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 27590861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30238960 - 30238785
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30238960 aatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 30238861  T
Q  149 tcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30238860 tctttcttcttcaattcattcttgcaaggcctccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 30238785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41373759 - 41373543
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41373759 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 41373660  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41373659 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 41373560  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  41373559 ttgttgggattagaggt 41373543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7781060 - 7780883
Alignment:
Q  48 taatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaag-ttgtaatg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7781060 taatatttctagagagagagatagggcttgctcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcatttgttgagaaatcacaagtttgtaatg 7780961  T
Q  147 aatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7780960 aatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 7780883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8104624 - 8104437
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8104624 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 8104525  T
Q  138 gttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8104524 gttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 8104437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13594851 - 13594664
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13594851 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 13594752  T
Q  138 gttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13594751 gttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 13594664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Original strand, 55462263 - 55462438
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55462263 aatatttctagagagagtgatagggcttgttcttcatagagtgagagtgacagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcaaaagttgtaatgaa 55462362  T
Q  149 tcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55462363 tctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 55462438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37367753 - 37367981
Alignment:
Q  1 attgagatatatagttttatacttagttt---ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtg 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37367753 attgagatatatagttttttacttagttttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtg 37367852  T
Q  98 atagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagta 195  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37367853 atagaaagtgaattctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtaatggatctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagta 37367952  T
Q  196 gctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37367953 gctaaatctcctttgttgggattagaggt 37367981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16406081 - 16405902
Alignment:
Q  47 gtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgtaa 144  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16406081 gtaatattcttagagagtgagatagggcttgttcttgatagagtgagagtggtagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcacaagtgtgtaa 16405982  T
Q  145 tgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16405981 tgaatcattctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 16405902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 30211035 - 30211202
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgct- 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  30211035 agagagagagatagggcttgttcta-atagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcatttgttgagagatcacaagtttgtaatgaatccttctc 30211133  T
Q  156 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30211134 ttttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaataagtagctaaatctcctttgtttggattagaggt 30211202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Original strand, 36754293 - 36754457
Alignment:
Q  60 agagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa-gttgtaatgaatcttgcttct 158  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||  |    
T  36754293 agagagagataaggcttgttcta-atagagtgagagtgatcaaaggtggattcttcctcatttgttgagagatcacaaagttgtaatgaatccttctctt 36754391  T
Q  159 tcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36754392 tcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggt 36754457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 5660048 - 5660215
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa-gttgtaatgaatcttgctt 156  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||     
T  5660048 agagagagagagagggtttgttcttcatagagtgagagtgtttaaaggtggattcttcctcatttgttgagagatcacaaagttgtaaggaatccttctc 5660147  T
Q  157 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5660148 tttcaattcattcttgcaaagcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggt 5660215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 49358876 - 49358982
Alignment:
Q  120 tttgttgagaaatcacaagtt-gta-atgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggat 217  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |  || | |||| |||||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49358876 tttgttgagaactcacaagtttgtatatgaatcttcatcttttacttcaatcttgcaaagttaccatgaaaatgagtagctaaatctccattgttgggat 49358975  T
Q  218 tagaggt 224  Q
    |||||||    
T  49358976 tagaggt 49358982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Original strand, 11622 - 11798
Alignment:
Q  48 taatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11622 taatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgaaatga 11721  T
Q  148 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11722 atcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgtcaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 11798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 27501414 - 27501633
Alignment:
Q  8 tatatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27501414 tatatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagag 27501513  T
Q  106 tggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaattt 204  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27501514 tggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 27501613  T
Q  205 cctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27501614 cctttgttgggattagaggt 27501633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23069226 - 23069020
Alignment:
Q  22 cttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagaga----tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcat 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069226 cttagtttttcatagtttttcacttgtaatatttctagagagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcat 23069127  T
Q  118 cttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23069126 cttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatctttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagataaatctcctttgttgggat 23069027  T
Q  218 tagaggt 224  Q
    |||||||    
T  23069026 tagaggt 23069020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 9576509 - 9576715
Alignment:
Q  23 ttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttct----agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcat 117  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9576509 ttagtttctctttgtgttttcacttgtaatattcatagagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagatagtggattcttcat 9576608  T
Q  118 cttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggat 217  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9576609 cctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggat 9576708  T
Q  218 tagaggt 224  Q
    |||||||    
T  9576709 tagaggt 9576715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24179846 - 24179634
Alignment:
Q  9 atatagttttatacttagttt--ctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24179846 atatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagt 24179749  T
Q  107 ggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttc 205  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24179748 ggattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctc 24179649  T
Q  206 ctttgttgggattag 220  Q
    |||||||||||||||    
T  24179648 ctttgttgggattag 24179634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32747101 - 32746926
Alignment:
Q  49 aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32747101 aatatttctagagagagagatagagcttgttcttcatagagtgagagtgatagagaatggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaa 32747002  T
Q  149 tcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32747001 tctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggt 32746926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 4310986 - 4311152
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4310986 agagagagagatagggcttgttctttatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcctgcttc 4311085  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4311086 tttaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 4311152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 9570047 - 9570213
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9570047 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 9570146  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9570147 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 9570213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25893986 - 25893782
Alignment:
Q  22 cttagtttctcttagtttttcacttgt-aatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctt 120  Q
    |||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  25893986 cttagtttttcatagtttttcagttgacaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagaatgatagagagtggattcttcatcct 25893887  T
Q  121 ttgttgagaaatcacaagttgt-aatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggatta 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25893886 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 25893787  T
Q  220 gaggt 224  Q
    |||||    
T  25893786 gaggt 25893782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43932333 - 43932133
Alignment:
Q  25 agtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgt 124  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  43932333 agtttttcatagtttttaacttgtaatacttttagagagaacgatagggcttgttcttcatagcgtaagattgatagaatgtggattcttcctcaattgt 43932234  T
Q  125 tgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagagg 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43932233 tgagaaatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagagg 43932134  T
Q  224 t 224  Q
    |    
T  43932133 t 43932133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43995832 - 43995632
Alignment:
Q  22 cttagtttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttt 121  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  43995832 cttagtttctcata--ttttaacttgtaatacttttagatagagagatagggcttgttcta-atagagtgagagtgatagaaggtggattcttcctcatt 43995736  T
Q  122 tgttgagaaatcaca-agttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattag 220  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43995735 tgttgagagatcacatagttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgtaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 43995636  T
Q  221 aggt 224  Q
    ||||    
T  43995635 aggt 43995632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Original strand, 10940786 - 10940970
Alignment:
Q  40 ttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagt 139  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  10940786 ttcacttgtaatacttttagagagagagataggtcttgttcta-atagagttaaagtgatagaaagtggattcttcctcatttgttgagagatcacaagt 10940884  T
Q  140 t-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    | |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10940885 ttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcatttgttgggattagaggt 10940970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47441524 - 47441359
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa-gttgtaatgaatcttgctt 156  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  47441524 agagagagagatatggcatgttcttcatagagtgagagtgtttgaaggtggattcttcctcatttgttgagagatcacaaagttgtaatgaatcttcctc 47441425  T
Q  157 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagag 222  Q
     ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47441424 tttcaattcactcttgcaaagcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 47441359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6036990 - 6036822
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatct-tttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgct 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  6036990 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgggagtgatagaaattgaattctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtaattgatctttct 6036891  T
Q  156 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6036890 ctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctctgttgggattagaggt 6036822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 20650624 - 20650791
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcac-aagttgtaatgaatcttgctt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||  | ||     
T  20650624 agagagagagagagggcttgttcttcatagagtgagagtgtttgaaggtggattcttcctcatttgtggagagatcacaaagttgtaatgaattcttctc 20650723  T
Q  157 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20650724 tttcacttcattcttgcaaagcttccatgacaacaagtagctaaatctcctttgttaggattagaggt 20650791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2786405 - 2786259
Alignment:
Q  80 cttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaat--gaatcttgcttcttcaattcattcttgcaagg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||  |||  |||||||  |  ||||||||| |||||||| |    
T  2786405 cttcatagagtgagagtgatagaaggtggattcttccatttttgtggagaaatcacaagtttgaatatgaatcttcatctttcaattcaatcttgcaaag 2786306  T
Q  178 cttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2786305 ttatcatgacaatgagtagctaaatttccattgttgggattagaggt 2786259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 6817168 - 6817224
Alignment:
Q  165 cattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattaga 221  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  6817168 catttttgcaaggctaccatgacaatgagtagctaaatctcactttttgggattaga 6817224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 8380 - 8546
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 157  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8380 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttggttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttc 8479  T
Q  158 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8480 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 8546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1772 - 1625
Alignment:
Q  34 tagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1772 tagtttttcacttgtaatatttctagagagagagataggacttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatc 1673  T
Q  134 acaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttc 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1672 acaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttc 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50462 - 50246
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagagagagaga--tagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  50462 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 50363  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50362 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 50263  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  50262 ttgttgggattagaggt 50246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 4455 - 4671
Alignment:
Q  11 atagttttatacttagtttctcttagt-ttttcacttgtaatatttctagag--agagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 107  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4455 atagtttttcacttagtttctctctgtgttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 4554  T
Q  108 gattcttcatcttttgttgagaaatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcct 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4555 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 4654  T
Q  208 ttgttgggattagaggt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  4655 ttgttgggattagaggt 4671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3369 - 3201
Alignment:
Q  58 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagt-tgtaatgaatcttgct 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||    
T  3369 agagagagagatagggcttgttcttgatagagtgaaagtgatagaaagtggattctacatcattttgttaagagatcacaagtgtgtaatggatccttct 3270  T
Q  156 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3269 ctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggt 3201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15913 - 15727
Alignment:
Q  38 ttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaa 137  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||    
T  15913 ttttcacttgtaatacttttagagagagaggtagggcttgttcta-atagagtgagagtgatagaaactggattcttcctcatttgttgagagattacaa 15815  T
Q  138 gtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15814 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattcttgaaaggcttccatgacaatgagtagataaatctcctttgttgggattaaaggt 15727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 224
Target Start/End: Original strand, 2786 - 2928
Alignment:
Q  84 atagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatc-ttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttc 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2786 atagagtgagagtgatagaaagtggattcctcctcattttgttgagaaatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttc 2885  T
Q  182 catgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggt 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2886 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgtgattagaggt 2928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University