View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3029_low_4 (Length: 604)

Name: NF3029_low_4
Description: NF3029
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3029_low_4
NF3029_low_4
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (1-496)||(10124166-10124661)
chr4 (35-475)||(28649788-28650229)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (31-466)||(25040582-25041017)
chr3 (35-488)||(25044298-25044751)
chr3 (7-443)||(25042759-25043190)
chr3 (262-475)||(54479360-54479573)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (7-479)||(21392801-21393273)
chr2 (12-479)||(21422111-21422587)
chr2 (262-365)||(1975176-1975279)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (7-443)||(24690534-24690970)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (322-395)||(39600467-39600540)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 10124661 - 10124166
Alignment:
Q  1 ccgcctcgtaacggaccaatccctattccattcatatgggccaccgaccgccgagcaaaaattcacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatcttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10124661 ccgcctcgtaacggaccaatccctactccattcatatgggccaccgaccgccgagcaaaaattcacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatcttta 10124562  T
Q  101 acatcacgggcgatgttcagtgcaagagttgtctaacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttggttac 200  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10124561 acatcaccggcgatgttaaatgcaagagttgtcaaacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttagttac 10124462  T
Q  201 aaacttcaacaccatgcatgatagggcaccagagactttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10124461 aaacttcaacaccatgcatgatagggcaccagagactttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaaaccggta 10124362  T
Q  301 attgctgagaagaaaaagaatatcaattggttgtttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtata 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10124361 attgctgagaagaaaaagaatatcaattggttgtttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtata 10124262  T
Q  401 atagccatcatcgaaccggtgccaagaatagggttctttatttgacttatcttgaactttgcaaacaacttgatccttccctacccttgatctaga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10124261 atagccatcatcgaaccggtgccaagaatagggttctttatttaacttatcttgaactttgcaaacaacttgatccttccctacccttgatctaga 10124166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 28650229 - 28649788
Alignment:
Q  35 tatgggccaccgaccgccgagcaaaaatt-cacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatctttaacatcacgggcgatgttcagtgcaagagttgtc 133  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||| | |||| | | || |||||||| |||||   |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  28650229 tatgggcaacctaccgtcgagcaaaaaatgcacaacctcaatcatcttctacaaaatgaaatctttaacatcatgggtgacgttcaatgcaagagttgtc 28650130  T
Q  134 taacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttggttacaaacttcaacaccatgcatgatagggcaccaga 233  Q
     ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| | | | |||| | || |||||||||||||||||||||      
T  28650129 aaacgaaattccaaatgtcgtttgattttgtggcgaaattcgatgcaatctctcaatattcgatcataaacatgaataccatgcatgatagggcaccatg 28650030  T
Q  234 gactttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattgctgagaagaaaaagaatatcaattggttg 333  Q
    || ||||||| |||| ||||||   |   |||| || |||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28650029 gattttgatgaatcctagattgccaagaagtgttcaatgcaatcgtgaaaacaatgtgaagccgataattgctgagaagaaaaagaatattaattggttg 28649930  T
Q  334 tttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtataatagccatcatcgaaccggtgcc-aagaatagg 432  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |  |||| || |||||     
T  28649929 tttttgttgttgggacaaatgcttggttgttgcaatcttaaacaattgaagtatttttgcaagtataacaaccatcatagaa-caatgccaaaaaataga 28649831  T
Q  433 gttctttatttgacttatcttgaactttgcaaacaacttgatc 475  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28649830 gttctttatttaacttatcttgaactatgcaaataacttgatc 28649788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25041017 - 25040582
Alignment:
Q  31 ttcatatgggccaccgaccgccgagcaaaaattcacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatctttaacatcacgggcgatgttcagtgcaagagtt 130  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25041017 ttcatatgggcaaccgatcgccgagcaaaaatccacagcctcaatcatctcttacaaaacagaatctttaacatcaccggcgatgttcaatgcaatagtt 25040918  T
Q  131 gtctaacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttggttacaaacttcaacaccatgcatgatagggcacc 230  Q
    |   |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25040917 gcaaaacaaagttccaaatgtcttttgatttgttggtgaaattcaatgaaatctctcaatatttggttacaaacatgaacaccatgcatgatagggcacc 25040818  T
Q  231 agagactttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattgctgagaagaaaaagaatatcaattgg 330  Q
    | | | ||||||| |||||| ||||   || ||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25040817 acaaattttgatgaatccaaaattgccaaaatgtttgcattgcaatcaagaaaatagtgttaaaccggtgattgctgagaagaaaaagaatatcaattgg 25040718  T
Q  331 ttgtttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtataatagccatcatcgaaccggtgccaagaata 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||| | |||||||||||||    
T  25040717 ttgtttctgttgctgggacaaataattggttgttgcaagcttgaacaattgaagtatttttgcaagtacaacggtcatcatcgagctggtgccaagaata 25040618  T
Q  431 gggttctttatttgacttatcttgaactttgcaaac 466  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25040617 gagttctttatttgacttattttgaactatgcaaac 25040582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 35 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 25044751 - 25044298
Alignment:
Q  35 tatgggccaccgaccgccgagcaaaaattcacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatctttaacatcacgggcgatgttcagtgcaagagttgtct 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |  |||||||| |||||  |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |     
T  25044751 tatgggcaaccgaccgccgagcaaaaattcacaaccttagtcatcttctacaaaatggaatctttaacatcaccggtgaggttcaatgcaagagttgcca 25044652  T
Q  135 aacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttggttacaaacttcaacaccatgcatgatagggcaccagag 234  Q
    |||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |      
T  25044651 aacaaaatttcaaatgtccttcgatttggtggcaaaatttgatgtaatcgctcagtatttggtcacaaacatgaataccatgcatgatagggcaccggga 25044552  T
Q  235 actttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattgctgagaagaaaaagaatatcaattggttgt 334  Q
    | ||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25044551 attttgatgaatccaagattgccaagatgtgtgcattgcaacaaagaaaacagtgtgaagccgataattgccgagaagaagaagaatatcaattggttgt 25044452  T
Q  335 ttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtataatagccatcatcgaaccggtgccaagaatagggt 434  Q
    ||||| || | ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  25044451 ttctgctgttgggacaaatgctgggttgttgcaatcttaaacaattgaagtatttttgcaagtataacaaccatcatagaacaggtgccaaaaatagggt 25044352  T
Q  435 tctttatttgacttatcttgaactttgcaaacaacttgatccttccctaccctt 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25044351 tctttatttaacttatcttgaactatgcaaacaacttgatccttctgtaccctt 25044298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25043190 - 25042759
Alignment:
Q  7 cgtaacggaccaatccctattccattcatat--gggccaccgaccgccgagcaaaaattcacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatctttaacat 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||| | ||  | || ||||||||| ||||| ||||||||||  |    
T  25043190 cgtaacggaccaatccctatccctttcatatatgggctaccaaccgccgagaaaaaattgatagtctcaatcatcttctctaaaacggaatctttaatgt 25043091  T
Q  105 cacgggcgatgttcagtgcaagagttgtctaacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttggttacaaac 204  Q
    |||   ||| |||||  |||||||||| | || ||||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  25043090 cactatcgacgttcaacgcaagagttgccaaataaagttctaaatgacgttcgatttggtgacgaaatttgacgtaatctatcaatatttggtcacaaac 25042991  T
Q  205 ttcaacaccatgcatgatagggcaccagagactttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattg 304  Q
     | |||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| |   ||||||| | |||| |||    
T  25042990 atgaacaccatacatgatagggcaccaacgcttttgatgtatccaagattgctgaagtgtgtgcatt--tatcgagata---gtgtgaaactggtacttg 25042896  T
Q  305 ctgagaagaaaaag--aatatcaattggttgtttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtataat 402  Q
    |  |||||||||||  |||||||| | | || |||||||| | |||||||||||||| || || |||||||||| | |||||||| ||| |||||         
T  25042895 ccaagaagaaaaagataatatcaactagatgcttctgttgttgggacaaatgcttggctgctgcaagcttgaaccactgaaatatattttcaagt----c 25042800  T
Q  403 agccatcatcgaaccggtgccaagaatagggttctttattt 443  Q
    | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  25042799 aaccatcatcgtaccagtgccaaaaatagggttctatattt 25042759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 475
Target Start/End: Original strand, 54479360 - 54479573
Alignment:
Q  262 tgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattgctgagaagaaaaagaatatcaattggttgtttctgttgctaggacaaatgcttggtt 361  Q
    |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  54479360 tgtgtgcactgtaatcaacaaaacagtgtgaagccggtaattgctgacaagaaacggagtatcaactggctgtttctgttattaggacaaatgcttggct 54479459  T
Q  362 gttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtataatagccatcatcgaaccggtgccaagaatagggttctttatttgacttatcttgaactttg 461  Q
    | || | || | ||||  |||| ||||| |||||  | |  |   |||||  | | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  54479460 gctgcacgcgtaaacagctgaagtatttctgcaaacacaccaagaatcatgaatcaggtgccaagaatagagttctttatttaacttatcttggactctg 54479559  T
Q  462 caaacaacttgatc 475  Q
    ||||||||||||||    
T  54479560 caaacaacttgatc 54479573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 479
Target Start/End: Original strand, 21392801 - 21393273
Alignment:
Q  7 cgtaacggaccaatccctattccattcatatgggccaccgaccgccgagcaaaaattcacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatctttaacatca 106  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| | | || |||||  | ||||||| |||||||| |||||    
T  21392801 cgtagcggaccaattcctatccctttcatatgggcaaccaatcaccgagcaaaaatccacaacctcaatcatctcttacaaaacaaaatctttagcatca 21392900  T
Q  107 cgggcgatgttcagtgcaagagttgtctaacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttggttacaaactt 206  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||| |||| ||| ||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  21392901 ccggcgatgttcaatgcaagagttgccaaacaaagtttcaaatgccgttcgatctgcgtacgaaattcgatgtaatctctcaatatttggttacgaacat 21393000  T
Q  207 caacaccatgcatgatagggcaccagagactttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattgct 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||   |  ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  21393001 gaacaccatgcatgatagggcaccaaagatcttgatgaatccaagactgccaagatgtgcacattgcaatcaagaaaacagtgtgaaaccggtaattgcc 21393100  T
Q  307 gagaagaaaaagaatatcaattggttgtttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtataatagcc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |    
T  21393101 gagaagaaaaagaatatcaattggttgtttctattgctgggacaaatgctcggttgttgcaagcttgaacaattgaagtatttttgcaagtacaacaatc 21393200  T
Q  407 atcatcgaaccggtgccaagaatagggttctttatttgacttatcttgaactttgcaaacaacttgatccttc 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21393201 atcatcgaaccggtgccaagaatagagttctttatttgacttattttgaattatgccaacaacttgatccttc 21393273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 479
Target Start/End: Original strand, 21422111 - 21422587
Alignment:
Q  12 cggaccaatccctattccattcatatgggccaccgaccgccgagcaaaaattcacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatctttaacatcacgggc 111  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||  | ||||||| ||||||||  ||||| ||     
T  21422111 cggaccaatccctattactttcatatgggaaactgatcgccgtgcaaaaatccacagcctaaatcatctcttacaaaacaaaatctttagtatcactggt 21422210  T
Q  112 gatgt-----tcagtgcaagagttgtctaacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttggttacaaactt 206  Q
    || ||     ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  21422211 gacgtgacgttcaatgcaagagttgccgaacaaagttccaaatgtcgttcgatttgcaagcaaaatttgatgtaatctctcgatatttggttacaaacat 21422310  T
Q  207 caacaccatgcatgatagggcaccagagactttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattgct 306  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  21422311 gaacaacatgcatgatagggcaccagagaatttgatgaatccaaaattgcctaaatgtgtgcattgcaatcaagaaaacagtgtcaagccaataattgct 21422410  T
Q  307 gagaagaaaaagaatatcaattggttgtttctgttgct----aggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtataat 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  21422411 gagaagaaaaagaatatctattggttgtttctgttgctggccgggacaaatgcttggttgttgcaagcttgaacatttgaagtatttttgcaagtataac 21422510  T
Q  403 agccatcatcgaaccggtgccaagaatagggttctttatttgacttatcttgaactttgcaaacaacttgatccttc 479  Q
    |  |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  21422511 aatcatcatcgcacaggtgccaagaatacagttctttatttgacttattttgaattatgccaccaacttgatccttc 21422587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1975279 - 1975176
Alignment:
Q  262 tgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattgctgagaagaaaaagaatatcaattggttgtttctgttgctaggacaaatgcttggtt 361  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  1975279 tgtgtacattgcaatcaaaaaaatagtgtgaaacctgtaattgctaagaagaaaaagagtatcaattggttgtttatgttgatgggacaaatgcttggtt 1975180  T
Q  362 gttg 365  Q
    ||||    
T  1975179 gttg 1975176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 24690970 - 24690534
Alignment:
Q  7 cgtaacggaccaatccctattccattcatatgggccaccgaccgccgagcaaaaattcacagcttgaaccatcttctccaaaacagaatctttaacatca 106  Q
    |||| ||||||||||| ||| || | | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||  | ||||| | ||| ||||||||||    
T  24690970 cgtagcggaccaatccatataccttacttatggacaaccgaccaccgagcaaaaattcacagcctcaatcatctcttacaaaatacaatttttaacatca 24690871  T
Q  107 cgggcgatgttcagtgcaagagttgtctaacaaagttccagatgtcgtttgatttggtggcgaaattcgatgtaatctcccaatatttggttacaaactt 206  Q
    |    || ||||| ||||||||||| | |||||||||| | || || ||||||||| |||  |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24690870 ccaatgacgttcaatgcaagagttgacaaacaaagttctaaatatcttttgatttgttggaaaaatgcgacgtaatttcccaatagttggttacaaactt 24690771  T
Q  207 caacaccatgcatgatagggcaccagagactttgatgtatccaagattgatgaagtgtgtgcattgcaatcaagaaaactgtgtgaagccggtaattgct 306  Q
     |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  24690770 gaacaccatgcatgatagggcaagaaagattttgatgaatccaagattgtcaaaatgtgtacattgcaatcaagaaaccaatgtgaagccggtaattatt 24690671  T
Q  307 gagaagaaaaagaatatcaattggttgtttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaagtataatagcc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| |||| |||| |  ||||||||||||||||| |  |    
T  24690670 gagaagaaaaagaatatcaattgattgtttctgtttctgagacaaatgattggttgttgcaagcatgaataattaaggtatttttgcaagtataacaatc 24690571  T
Q  407 atcatcgaaccggtgccaagaatagggttctttattt 443  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||    
T  24690570 atcatcgaacaagtgccaaaaataggtttttttattt 24690534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 39600540 - 39600467
Alignment:
Q  322 atcaattggttgtttctgttgctaggacaaatgcttggttgttgtaagcttgaacaattgaaatatttttgcaa 395  Q
    ||||||||||||||| ||||| | || || ||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  39600540 atcaattggttgtttttgttgttgggtcagatgattgggtgttgcaagcttcaacatttgaaatatttctgcaa 39600467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University