View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3049_low_12 (Length: 396)

Name: NF3049_low_12
Description: NF3049
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3049_low_12
NF3049_low_12
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (16-396)||(14208-14588)
scaffold0349 (16-396)||(3272-3655)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (16-396)||(27718231-27718612)
chr6 (16-396)||(27592872-27593253)
chr6 (16-396)||(27610854-27611235)
chr6 (16-396)||(27678900-27679281)
chr6 (16-396)||(27698346-27698727)
chr6 (16-396)||(27677466-27677847)
chr6 (16-387)||(27706254-27706626)
chr6 (94-396)||(27724775-27725078)
chr6 (16-396)||(26802396-26802777)
chr6 (16-396)||(27604557-27604938)
chr6 (22-396)||(28781093-28781468)
chr6 (22-396)||(28786232-28786607)
chr6 (22-396)||(28792353-28792728)
chr6 (22-396)||(26884117-26884494)
chr6 (19-308)||(27427461-27427751)
chr6 (22-396)||(26861570-26861942)
chr6 (32-396)||(27531065-27531430)
chr6 (104-396)||(31284242-31284535)
chr6 (163-396)||(26646433-26646667)
chr6 (163-396)||(26752401-26752635)
chr6 (16-396)||(25579673-25580054)
chr6 (16-368)||(26142847-26143200)
chr6 (22-396)||(27337923-27338298)
chr6 (22-396)||(27398663-27399038)
chr6 (205-368)||(25481724-25481888)
chr6 (16-396)||(25538494-25538875)
chr6 (131-396)||(26055880-26056146)
chr6 (131-396)||(26075850-26076116)
chr6 (104-396)||(26622930-26623223)
chr6 (104-396)||(26728908-26729201)
chr6 (22-396)||(26655943-26656318)
chr6 (22-396)||(26761914-26762289)
chr6 (236-396)||(27229186-27229347)
chr6 (205-368)||(26048827-26048991)
chr6 (205-368)||(26069996-26070160)
chr6 (115-334)||(28242820-28243040)
chr6 (70-385)||(28234529-28234844)
chr6 (180-396)||(26823794-26824011)
chr6 (115-371)||(28325460-28325717)
chr6 (97-333)||(28098302-28098539)
chr6 (180-328)||(28139563-28139712)
chr6 (205-334)||(26341975-26342105)
chr6 (97-350)||(28226950-28227204)
chr6 (180-335)||(28149953-28150108)
chr6 (97-395)||(26848615-26848914)
chr6 (97-335)||(28181129-28181368)
chr6 (180-372)||(26937072-26937265)
chr6 (236-346)||(25506981-25507092)
chr6 (211-335)||(28185381-28185506)
chr6 (211-335)||(28297760-28297885)
chr6 (211-335)||(28514188-28514313)
chr6 (180-336)||(2184912-2185069)
chr6 (98-267)||(26949745-26949914)
chr6 (180-372)||(29826005-29826198)
chr6 (180-336)||(2184302-2184459)
chr6 (16-270)||(27214498-27214755)
chr6 (16-270)||(27234473-27234730)
chr6 (216-395)||(26635645-26635825)
chr6 (216-395)||(26741611-26741791)
chr6 (221-269)||(26975134-26975182)
chr6 (355-396)||(27665309-27665350)
chr6 (355-395)||(26959120-26959160)
chr6 (355-395)||(26975007-26975047)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (22-396)||(4529-4904)
scaffold0277 (22-396)||(13490-13865)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (22-396)||(7479-7854)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (19-308)||(59612-59902)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (19-308)||(18073804-18074094)
chr4 (22-395)||(18731349-18731723)
chr4 (180-396)||(18679570-18679787)
chr4 (22-395)||(18655322-18655696)
chr4 (22-395)||(18699245-18699619)
chr4 (180-396)||(18724088-18724305)
chr4 (112-384)||(5090902-5091175)
chr4 (212-308)||(17989088-17989185)
chr4 (22-91)||(18723930-18723999)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (16-387)||(28127518-28127891)
chr1 (22-396)||(268202-268577)
chr1 (16-386)||(28164202-28164572)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (130-394)||(29273736-29274001)
chr8 (291-350)||(31903851-31903910)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (257-396)||(10-150)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (70-385)||(34690-35006)
scaffold0038 (115-334)||(42982-43202)
scaffold0038 (115-371)||(116775-117032)
scaffold0038 (97-350)||(27448-27702)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (127-335)||(58245-58454)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (216-337)||(3279701-3279823)


Alignment Details
Target: scaffold0349 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 14208 - 14588
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14208 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 14307  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 14407  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14408 agcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 14506  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14507 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagcc 14588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 3272 - 3655
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttt-tcggatcattttgaaacctcttttc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3272 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttttttcggatcattttgaaacctcttttc 3371  T
Q  115 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3372 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttg 3471  T
Q  215 tagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcata-gttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 312  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3472 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcc 3571  T
Q  313 ttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3572 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagcc 3655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 27718231 - 27718612
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  27718231 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttca 27718330  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718331 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 27718430  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27718431 agcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 27718530  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27718531 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagcc 27718612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 27592872 - 27593253
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592872 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcgtctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 27592971  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||| ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27592972 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgt 27593071  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27593072 agcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 27593171  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593172 gagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 27593253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 27610854 - 27611235
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  27610854 actatcatggtagccggaaaagtttgcagcctggctcagagccactttccatccctgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttca 27610953  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610954 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcactttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 27611053  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27611054 agcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 27611153  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27611154 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagcc 27611235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27679281 - 27678900
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679281 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctttttccatccttgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 27679182  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||   |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27679181 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaacagtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgt 27679082  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27679081 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 27678982  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27678981 gagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 27678900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 27698346 - 27698727
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698346 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 27698445  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27698446 tgctcagccaatgctttgccataactacctttatgatgtctcacattagttggttccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgt 27698545  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27698546 agcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 27698645  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27698646 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagcc 27698727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 27677466 - 27677847
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677466 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgcttttcggatcattttgaaacctcttttca 27677565  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27677566 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacaatagtaggttccacagcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgt 27677665  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27677666 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 27677765  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||  |  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  27677766 gagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagcc 27677847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Original strand, 27706254 - 27706626
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706254 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 27706353  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||| || |  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27706354 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttctacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgt 27706453  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27706454 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 27706553  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtca 387  Q
    || ||||||||||||||||||||  | |||||||||   ||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27706554 gagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtca 27706626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 94 - 396
Target Start/End: Original strand, 27724775 - 27725078
Alignment:
Q  94 atcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27724775 atcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaa 27724874  T
Q  194 acgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27724875 acgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaa 27724974  T
Q  293 tcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaag 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27724975 tcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaag 27725074  T
Q  393 agcc 396  Q
    ||||    
T  27725075 agcc 27725078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26802777 - 26802396
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||    
T  26802777 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctccaacctctccatgttatccttatcattttgaaaccttttttca 26802678  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||| |||||||| ||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26802677 tgctcagccaatgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttat 26802578  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26802577 agcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 26802478  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  26802477 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagcc 26802396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Original strand, 27604557 - 27604938
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||| |||| |    
T  27604557 actatcatggtagccggaaaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctttatgttatcctcatcattttgaaaccttttttta 27604656  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27604657 tgctcagccaatgcttgaccgtaactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgt 27604756  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27604757 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggcctt 27604856  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  27604857 gagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagcc 27604938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28781468 - 28781093
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28781468 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttttcatgtcca 28781369  T
Q  122 gccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 221  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||| |||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28781368 gccaatgcttcaccataaggacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaat 28781269  T
Q  222 gaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaag 320  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  28781268 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 28781169  T
Q  321 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28781168 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagcc 28781093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28786607 - 28786232
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28786607 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttttcatgccca 28786508  T
Q  122 gccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28786507 gccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaat 28786408  T
Q  222 gaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaag 320  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  28786407 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 28786308  T
Q  321 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28786307 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagcc 28786232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28792728 - 28792353
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28792728 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttttcatgccca 28792629  T
Q  122 gccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28792628 gccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaat 28792529  T
Q  222 gaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaag 320  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  28792528 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 28792429  T
Q  321 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28792428 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagcc 28792353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26884494 - 26884117
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  26884494 atggtagccggacaagttagcaacttgcctcatagccattttccatcgctgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaaccttttttcatggtca 26884395  T
Q  122 gccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||||| ||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26884394 gccaatgcttcaccataactacctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaacaaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagt 26884295  T
Q  222 gaat--tatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgaca 318  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  26884294 gaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatg 26884195  T
Q  319 agtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26884194 agtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagcc 26884117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Original strand, 27427461 - 27427751
Alignment:
Q  19 atcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgc 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27427461 atcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgc 27427560  T
Q  119 tcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagc 218  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  27427561 tcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagc 27427660  T
Q  219 agtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaat 308  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27427661 agtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26861942 - 26861570
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26861942 atggtagcctgacaagttagcagcttggttcagagcaactttccatctctgcaacctctccatgttatccatatcattttgaaaccttttttcatgctta 26861843  T
Q  122 gccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||  |||   |||||    
T  26861842 gccaatgcttcaccataaatacctctatgatgtcgcacattagtaggatccatgccatagaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttcctt---gcagt 26861746  T
Q  222 gaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaag 320  Q
     ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  26861745 taatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgag 26861646  T
Q  321 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||  | |||||||||  |||||||||||   |   ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26861645 tgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagcc 26861570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 396
Target Start/End: Original strand, 27531065 - 27531430
Alignment:
Q  32 gacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgctt 131  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||| | |  ||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||    
T  27531065 gacaagttagccgcttggctcagagcttctttccattgctgcaacctctcagtgttatccttatcattttgaaacttttttttatgcacagctaatgctt 27531164  T
Q  132 caccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtg 231  Q
    ||||||| |||||| | |||| |||||| | |||||| ||||| |  |  |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||| | |||||    
T  27531165 caccatatctacctgtgtgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtg 27531264  T
Q  232 gactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtg 330  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    ||||||||||||    
T  27531265 aacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtg 27531364  T
Q  331 atttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27531365 atttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagcc 27531430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31284535 - 31284242
Alignment:
Q  104 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 203  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| | || ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31284535 aacctctcttcatgcttagccaatgcttctccataactacctctatgatgtcgcacatgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgac 31284436  T
Q  204 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattc 302  Q
    | |||  ||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| ||    
T  31284435 cattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactc 31284336  T
Q  303 ttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||   | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31284335 ttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagcc 31284242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 163 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26646667 - 26646433
Alignment:
Q  163 agtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagag 262  Q
    |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||    
T  26646667 agtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagag 26646568  T
Q  263 gcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcat 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |   ||||    
T  26646567 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcat 26646468  T
Q  362 caatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26646467 caatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagcc 26646433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 163 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26752635 - 26752401
Alignment:
Q  163 agtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagag 262  Q
    |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||    
T  26752635 agtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagag 26752536  T
Q  263 gcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcat 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |   ||||    
T  26752535 gcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcat 26752436  T
Q  362 caatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26752435 caatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagcc 26752401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25580054 - 25579673
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    ||||||    |||| | |||||||||||||   | |||||||||||||| ||||    
T  25580054 actataatgatagccggacaagttagcagcttgggtaagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttca 25579955  T
Q  116 tgctcagcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 214  Q
    |||| ||  | || || |||||||||| ||  |||||| ||| | || ||||||||||||     ||||||| ||||| || | || || ||||||||||    
T  25579954 tgcttagtaagatact-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttg 25579856  T
Q  215 tagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 313  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25579855 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 25579756  T
Q  314 tgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||    ||||||||||||  |||||||    
T  25579755 tgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagcc 25579673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26143200 - 26142847
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    ||||||    |||| | |||||||||||||   | |||||||||||||| ||||    
T  26143200 actataatgatagccggacaagttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttca 26143101  T
Q  116 tgctcagcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 214  Q
    |||| ||  | ||||| |||||||| | ||  |||||||||| | || ||||||||||||     ||||||| || || || | || || ||||||||||    
T  26143100 tgcttagtaagatgct-caccataaatcccactctgatttcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggaaatactaagcaactctttgtcttg 26143002  T
Q  215 tagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 313  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143001 tagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 26142902  T
Q  314 tgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaa 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  26142901 tgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaa 26142847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Original strand, 27337923 - 27338298
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||   ||||||  || ||||||||||||||||| |   | |||||| ||| | | |||||||| |    
T  27337923 atggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaacttatcttcatgctta 27338022  T
Q  122 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 220  Q
    |  | ||||| |||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||||| ||| | |   ||||||||||||||||    | |||| ||||||||||||||    
T  27338023 gtaagatgct-caccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcag 27338121  T
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 319  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27338122 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaa 27338221  T
Q  320 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27338222 gtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagcc 27338298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Original strand, 27398663 - 27399038
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||   ||||||  || ||||||||||||||||| |   | |||||| ||| | | |||||||| |    
T  27398663 atggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaacttatcttcatgctta 27398762  T
Q  122 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 220  Q
    |  | ||||| |||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||||| ||| | |   ||||||||||||||||    | |||| ||||||||||||||    
T  27398763 gtaagatgct-caccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcag 27398861  T
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 319  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27398862 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaa 27398961  T
Q  320 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27398962 gtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagcc 27399038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 205 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25481888 - 25481724
Alignment:
Q  205 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattct 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  25481888 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattct 25481789  T
Q  304 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaa 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  25481788 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaa 25481724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25538875 - 25538494
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||    ||||||    |||| | |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  25538875 actataatgatagccggacaagttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcattattttgaaacctctcttca 25538776  T
Q  116 tgctcagccaa-tgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 214  Q
    |||| ||  || |||| |||||||||| ||  |||||| ||| |  | ||||||||||||     ||||||| ||||| || | || || ||||||||||    
T  25538775 tgcttagtaaaatgct-caccataactcccactctgatgtcgtaactgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttg 25538677  T
Q  215 tagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 313  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25538676 tagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggcct 25538577  T
Q  314 tgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||  |||||||    
T  25538576 tgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagcc 25538494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26056146 - 26055880
Alignment:
Q  131 tcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgt 230  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||| | || ||||||||||||     ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  26056146 tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgt 26056047  T
Q  231 ggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgt 329  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  26056046 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgt 26055947  T
Q  330 gatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||    
T  26055946 gatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagcc 26055880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26076116 - 26075850
Alignment:
Q  131 tcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgt 230  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||| | || ||||||||||||     ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  26076116 tcaccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgt 26076017  T
Q  231 ggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgt 329  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  26076016 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgt 26075917  T
Q  330 gatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||    
T  26075916 gatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagcc 26075850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26623223 - 26622930
Alignment:
Q  104 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 203  Q
    ||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||| ||  | ||||  || | || |||||| |||||||   |||| || ||||||||||| ||||    
T  26623223 aacctctttgcatgcttagcaagtgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgac 26623124  T
Q  204 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattc 302  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  26623123 cctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactc 26623024  T
Q  303 ttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||| || || ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||   |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26623023 ttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagcc 26622930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26729201 - 26728908
Alignment:
Q  104 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 203  Q
    ||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||| ||  | ||||  || | || |||||| |||||||   |||| || ||||||||||| ||||    
T  26729201 aacctctttgcatgcttagcaagtgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgac 26729102  T
Q  204 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattc 302  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  26729101 cctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactc 26729002  T
Q  303 ttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||| || || ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||   |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26729001 ttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagcc 26728908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26656318 - 26655943
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||   ||||||  || |||||||| |||||||| |   | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  26656318 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 26656219  T
Q  122 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 220  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  |||||| ||| | || |||||| ||||| |   ||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||     
T  26656218 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaa 26656120  T
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 319  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  26656119 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacga 26656020  T
Q  320 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||    
T  26656019 gtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagcc 26655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26762289 - 26761914
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||   ||||||  || |||||||| |||||||| |   | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  26762289 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 26762190  T
Q  122 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 220  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  |||||| ||| | || |||||| ||||| |   ||||||||||||||||    | |||||||||||| |||||     
T  26762189 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaa 26762091  T
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 319  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  26762090 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacga 26761991  T
Q  320 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||    
T  26761990 gtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagcc 26761914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229186
Alignment:
Q  236 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 334  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  335 catttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    | | |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagcc 27229186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26048991 - 26048827
Alignment:
Q  205 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattct 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  26048991 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26048892  T
Q  304 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaa 368  Q
    || |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  26048891 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaa 26048827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26070160 - 26069996
Alignment:
Q  205 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattct 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  26070160 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26070061  T
Q  304 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaa 368  Q
    || |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  26070060 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaa 26069996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28243040 - 28242820
Alignment:
Q  115 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 214  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||| || |||||||| |||||||||     ||||||  |||||||| ||||| || ||| |||||    
T  28243040 atgctcagccagtgctttaccataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttg 28242941  T
Q  215 tagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 313  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28242940 cagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 28242841  T
Q  314 tgacaagtgatggtgtgattt 334  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  28242840 tgaaaagtgatggtgttattt 28242820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28234844 - 28234529
Alignment:
Q  70 ctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggt 169  Q
    |||||||||||||||||| | |   | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || |||| |||||||| || ||||    
T  28234844 ctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggt 28234745  T
Q  170 tccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 269  Q
    |||||     ||||||  |||||||| ||||| |  |||  || | |||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  28234744 tccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtctattttcctcgaagca-taaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 28234646  T
Q  270 tgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaa 368  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||     |||||||||||||    
T  28234645 tgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaa 28234546  T
Q  369 ggtgttgattcccttgt 385  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28234545 ggtgtggattcccttgt 28234529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26824011 - 26823794
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 279  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  26824011 agaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaa 26823912  T
Q  280 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 378  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||  ||||| ||  |||||||||||   |   |||||||  ||||||| ||||    
T  26823911 cacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggatt 26823812  T
Q  379 cccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||| |||||||||    
T  26823811 cccttgtctgtaagagcc 26823794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28325717 - 28325460
Alignment:
Q  115 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 214  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||| |||||||| || |||||||||   | ||||||| ||| |||| ||||| || |||   |||    
T  28325717 atgctcggccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttg 28325618  T
Q  215 tagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 313  Q
     |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28325617 aagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 28325518  T
Q  314 tgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggt 371  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  28325517 tgaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggt 28325460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 333
Target Start/End: Original strand, 28098302 - 28098539
Alignment:
Q  97 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacg 196  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| || ||||||||||    | |||| ||| ||||||    
T  28098302 attttggaacctctcttcatgcttagctaatgcttcaccataactccccgtctgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcacaaaaaataggaaaaacg 28098401  T
Q  197 aggcgaccctttgtctt-gtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatc 294  Q
    | || ||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||||    
T  28098402 aagcaacccttt-tcttcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatc 28098500  T
Q  295 ctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatt 333  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28098501 ctggactcttcgatggccttgacaagggattgtgtgatt 28098539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28139712 - 28139563
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 279  Q
    |||||||||||||||| |  |  |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28139712 agaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaa 28139613  T
Q  280 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtg 328  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  28139612 cacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtg 28139563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 205 - 334
Target Start/End: Original strand, 26341975 - 26342105
Alignment:
Q  205 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattct 303  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| || |||    
T  26341975 ctttgccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactct 26342074  T
Q  304 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 334  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26342075 tcaatggctttgacaagtgattgtgtgattt 26342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28227204 - 28226950
Alignment:
Q  97 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacg 196  Q
    |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || |||| |||||| | || |||||||||     ||||||  ||||||||     
T  28227204 attttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacatgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaaca 28227105  T
Q  197 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcc 295  Q
    ||||| |  |||  |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  28227104 aggcgccgattttccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcc 28227005  T
Q  296 tagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaag 350  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||    
T  28227004 tagattcttcaatgaccttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaag 28226950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28150108 - 28149953
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 278  Q
    |||||| ||||| ||| | || |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  28150108 agaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaa 28150009  T
Q  279 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttc 335  Q
     |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28150008 gattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttc 28149953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26848914 - 26848615
Alignment:
Q  97 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacg 196  Q
    ||||||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||| | || |||||| | ||   |||||||||| | |||     
T  26848914 attttgaaacacctcttcatgcttagcaagtgcttcaccataactactattctgatgtcgcacatgagaaggttctatgccatagaaaacaggaataacc 26848815  T
Q  197 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcc 295  Q
    | || |||||||  |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| || ||| ||||  ||||||    
T  26848814 atgctacccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcc 26848715  T
Q  296 tagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagc 395  Q
    | || |||||||||  |||||  || || |||||||| ||||  || || ||||||   |||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||    
T  26848714 tcgagtcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagc 26848615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28181368 - 28181129
Alignment:
Q  97 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacg 196  Q
    |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || |||| |||||||| || |||||||||     ||||||  ||||||||     
T  28181368 attttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaact 28181269  T
Q  197 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcc 295  Q
    || || ||  ||  |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||    
T  28181268 agacgcccgctttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcc 28181169  T
Q  296 tagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttc 335  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  28181168 tagactcttcaatggccttgaaaagtgatgatgttatttc 28181129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26937265 - 26937072
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 278  Q
    |||||| ||||||||  ||  |||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26937265 agaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaa 26937166  T
Q  279 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtg 372  Q
     ||||| ||   |||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||    ||||||||||||||||||    
T  26937165 tacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggtg 26937072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 346
Target Start/End: Original strand, 25506981 - 25507092
Alignment:
Q  236 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa-aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 334  Q
    ||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  25506981 agttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtgattt 25507080  T
Q  335 catttcctcttt 346  Q
    ||| ||||||||    
T  25507081 catctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28185506 - 28185381
Alignment:
Q  211 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 309  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28185506 cttgaagcagttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatg 28185407  T
Q  310 gccttgacaagtgatggtgtgatttc 335  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  28185406 gccttgaaaagtgatgatgttatttc 28185381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 335
Target Start/End: Original strand, 28297760 - 28297885
Alignment:
Q  211 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 309  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28297760 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28297859  T
Q  310 gccttgacaagtgatggtgtgatttc 335  Q
      ||||| |||||||||||| |||||    
T  28297860 tgcttgaaaagtgatggtgttatttc 28297885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28514313 - 28514188
Alignment:
Q  211 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 309  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28514313 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28514214  T
Q  310 gccttgacaagtgatggtgtgatttc 335  Q
      ||||| |||||||||||| |||||    
T  28514213 tgcttgaaaagtgatggtgttatttc 28514188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2185069 - 2184912
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 278  Q
    ||||||| |||| |||  |||| ||||||| |||| ||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   | || ||    
T  2185069 agaaaactggcagaaccgggcgtccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaa 2184970  T
Q  279 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttca 336  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  2184969 aacagggatgaaaattctggattcttcaatggctttcacaagcgatggtgttatttca 2184912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26949914 - 26949745
Alignment:
Q  98 ttttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacga 197  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||||||| |||||||| || |||||| ||     ||||||| |||| ||| |    
T  26949914 ttttggaacctctcttcatgcttagcaagtgcttcaccataactataattctgatgtcgcacgtgagaaggttctacatcatagaaaactggcagaacaa 26949815  T
Q  198 ggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcata 267  Q
    ||||||| |||  |||| || ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  26949814 ggcgacctttttccttgaagtagtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcata 26949745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29826198 - 29826005
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 278  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||   || | || ||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  29826198 agaaaataggcaaaacgagacgacccttcctcttgacacactcaactatatgcacaagttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaa 29826099  T
Q  279 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtg 372  Q
    || ||||||    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  29826098 aataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtg 29826005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2184459 - 2184302
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aa 278  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||| || |  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||    
T  2184459 agaaaactggtagaaccaggcgtccctttgacttggagtaacgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaa 2184360  T
Q  279 aacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttca 336  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||    
T  2184359 aacagggatgaaaattctggactcttcaatggctttcataagtgatgctgttatttca 2184302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27214755 - 27214498
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||| | |||||    ||||||  |||||||| ||||||||||| |   | |||||||||||||| ||||    
T  27214755 actataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctcttca 27214656  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttct---gatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 212  Q
    |||| ||| |  ||||||||||||||    || |   ||| ||||| || || |||||| ||||   |||||||||| | ||| |||||||| |||  ||    
T  27214655 tgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgacctttttcct 27214556  T
Q  213 tgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagtt 270  Q
    || |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27214555 tggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27214498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Original strand, 27234473 - 27234730
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||| | |||||    ||||||  |||||||| ||||||||||| |   | |||||||||||||| ||||    
T  27234473 actataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctcttca 27234572  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttct---gatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 212  Q
    |||| ||| |  ||||||||||||||    || |   ||| ||||| || || |||||| ||||   |||||||||| | ||| |||||||| |||  ||    
T  27234573 tgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgacctttttcct 27234672  T
Q  213 tgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagtt 270  Q
    || |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27234673 tggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635645
Alignment:
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| |||||   |||   |||||| || |||||||||  |||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26635726  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagc 395  Q
    ||  || || |||||||||||||  ||| ||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26635725 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagc 26635645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741611
Alignment:
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| |||||   |||   |||||| || |||||||||  |||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26741692  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagc 395  Q
    ||  || || |||||||||||||  ||| ||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26741691 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagc 26741611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26975182 - 26975134
Alignment:
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 269  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26975182 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 396
Target Start/End: Original strand, 27665309 - 27665350
Alignment:
Q  355 ttgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  27665309 ttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagcc 27665350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26959160 - 26959120
Alignment:
Q  355 ttgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagc 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  26959160 ttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagc 26959120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26975047 - 26975007
Alignment:
Q  355 ttgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagc 395  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26975047 ttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagc 26975007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Original strand, 4529 - 4904
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4529 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 4628  T
Q  122 gccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629 gccaatgcttcaccataactacctttcagatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 4728  T
Q  222 gaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaag 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  4729 gaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggag 4828  T
Q  321 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4829 ggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagcc 4904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13865
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13490 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgtcca 13589  T
Q  122 gccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13590 gccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaat 13689  T
Q  222 gaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaag 320  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  13690 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 13789  T
Q  321 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13790 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagcc 13865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7854 - 7479
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||   ||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7854 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgtcca 7755  T
Q  122 gccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  7754 gccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaat 7655  T
Q  222 gaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaag 320  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  7654 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 7555  T
Q  321 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7554 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagcc 7479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 59902 - 59612
Alignment:
Q  19 atcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgc 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  59902 atcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgc 59803  T
Q  119 tcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagc 218  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  59802 tcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagc 59703  T
Q  219 agtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaat 308  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  59702 agtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18074094 - 18073804
Alignment:
Q  19 atcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgc 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18074094 atcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttcatgc 18073995  T
Q  119 tcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagc 218  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  18073994 tcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagc 18073895  T
Q  219 agtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaat 308  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18073894 agtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 395
Target Start/End: Original strand, 18731349 - 18731723
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||   ||||||   ||||||| |||||||||||||   | |||||| || |||||||  |||| |    
T  18731349 atggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactctttttgtgctta 18731448  T
Q  122 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 220  Q
    |  | ||| |||||||||||| ||  | |||| ||| | || | |||| |||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18731449 gtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcag 18731547  T
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 319  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  18731548 tgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcga 18731647  T
Q  320 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagc 395  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| ||   |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18731648 gtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagc 18731723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 180 - 396
Target Start/End: Original strand, 18679570 - 18679787
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 279  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18679570 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18679669  T
Q  280 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 378  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||| ||   |  ||||||||||||||||| ||||    
T  18679670 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18679769  T
Q  379 cccttgtcagtaagagcc 396  Q
    || |||||||||||||||    
T  18679770 cctttgtcagtaagagcc 18679787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 395
Target Start/End: Original strand, 18655322 - 18655696
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||   ||||||   ||||||| |||||||||||||   | |||||| ||  |||||   |||| |    
T  18655322 atggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaattctttctgtgctta 18655421  T
Q  122 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 220  Q
    |  | ||| |||||||||||| ||  | |||| ||| | || |||||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18655422 gtgagatg-ttcaccataacttccagtttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcag 18655520  T
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 319  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | |    
T  18655521 tgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcga 18655620  T
Q  320 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagc 395  Q
    |||||||| |||||||||  || ||||| ||   |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18655621 gtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagc 18655696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 395
Target Start/End: Original strand, 18699245 - 18699619
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||    ||||||   ||||||| |||||||||||||   | |||||| || |||||| | |||| |    
T  18699245 atggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactctttccgtgctta 18699344  T
Q  122 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 220  Q
    |  | ||| |||||||||||| ||  | |||| ||| | || |||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18699345 gtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatctacgccatagaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgtagcag 18699443  T
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 319  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  18699444 tgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcga 18699543  T
Q  320 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagc 395  Q
    |||||||| |||||||||  || ||||| ||   |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18699544 gtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagc 18699619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 396
Target Start/End: Original strand, 18724088 - 18724305
Alignment:
Q  180 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 279  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18724088 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18724187  T
Q  280 -acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgatt 378  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||| ||   |  ||||||||||||||||| ||||    
T  18724188 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18724287  T
Q  379 cccttgtcagtaagagcc 396  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18724288 cccttgtcagtaagagcc 18724305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 384
Target Start/End: Original strand, 5090902 - 5091175
Alignment:
Q  112 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtc 211  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||| |||||| | || ||||||||| |   |||||| ||||||||| |||| ||| |||  |    
T  5090902 ttcatgctcagcaagtgcttcaccataacttccagtctgatatcgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttcc 5091001  T
Q  212 ttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatgg 310  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||   ||| | |||| ||||||||| |||||    
T  5091002 ttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatgg 5091101  T
Q  311 ccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttg 384  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  | |||||  |||||     ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5091102 ccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttg 5091175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 308
Target Start/End: Original strand, 17989088 - 17989185
Alignment:
Q  212 ttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaat 308  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17989088 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Original strand, 18723930 - 18723999
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttc 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||   ||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  18723930 atggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttc 18723999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Original strand, 28127518 - 28127891
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    ||||||   ||||| | |||||||||||||   | |||||| ||||||| | ||    
T  28127518 actataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacctctctcca 28127617  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    |||| ||| |   ||||||||||||| ||| | |||| |||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28127618 tgcttagcaagctcttcaccataactccctgtatgatatcgcacatcagtaggatccacgccaaagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgt 28127717  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28127718 agcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctt 28127817  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatt-tcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtca 387  Q
     | |||||| ||||||||||  || |||||| | ||||  |   ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28127818 taaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtca 28127891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 396
Target Start/End: Original strand, 268202 - 268577
Alignment:
Q  22 atggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctca 121  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||   ||||||   ||||||| |||||||||||||     |||||| || |||| ||| |||| |    
T  268202 atggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgctattttggaaactctcttcgtgctta 268301  T
Q  122 gcca-atgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcag 220  Q
    |  | ||| |||||||||||| ||  | |||| ||| | || |||||| |||||||   |||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  268302 gtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaatgagacgaccctttttcttgtagcag 268400  T
Q  221 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaa 319  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  268401 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcga 268500  T
Q  320 gtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||   |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  268501 gtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagcc 268577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 28164202 - 28164572
Alignment:
Q  16 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttca 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    ||||||   ||||| | |||||||||||||   | |||||| |||||||   ||    
T  28164202 actataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacctctcacca 28164301  T
Q  116 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 215  Q
    |||| ||  |   |||  |||||||| ||| | |||| |||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28164302 tgcttagtaagatctttgccataactccctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacgcc-aagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgt 28164400  T
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  28164401 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggcctt 28164500  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtc 386  Q
    ||  | ||| ||||||||||| | |||||| | ||||  |   ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28164501 gatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtc 28164572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 394
Target Start/End: Original strand, 29273736 - 29274001
Alignment:
Q  130 ttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatg 229  Q
    |||||||||||| ||  | |||| ||| | || |||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29273736 ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatg 29273835  T
Q  230 tggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtg 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |     
T  29273836 tggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatt 29273935  T
Q  329 tgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagag 394  Q
    |||||||||  |||||||||||   |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29273936 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagag 29274001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31903910 - 31903851
Alignment:
Q  291 aatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaag 350  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31903910 aatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaag 31903851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 257 - 396
Target Start/End: Original strand, 10 - 150
Alignment:
Q  257 gaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaat 355  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  356 tgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagcc 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35006 - 34690
Alignment:
Q  70 ctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggt 169  Q
    |||||||||||||||||| | |   | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || |||| |||||||| || ||||    
T  35006 ctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggt 34907  T
Q  170 tccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagt 269  Q
    |||||     ||||||  |||||||| || || ||  ||  |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  34906 tccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 34807  T
Q  270 tgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaa 368  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||     |||||||||||||    
T  34806 tgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaa 34707  T
Q  369 ggtgttgattcccttgt 385  Q
    ||||| |||||||||||    
T  34706 ggtgtggattcccttgt 34690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 43202 - 42982
Alignment:
Q  115 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 214  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||| || |||||||| |||||||||     ||||||  |||||||| ||||| || ||| |||||    
T  43202 atgctcagccagtgctttaccataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttg 43103  T
Q  215 tagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 313  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43102 cagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 43003  T
Q  314 tgacaagtgatggtgtgattt 334  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  43002 tgaaaagtgatggtgttattt 42982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 117032 - 116775
Alignment:
Q  115 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 214  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||| |||||||| || |||||||||   | ||||||| ||| |||| ||||| || |||   |||    
T  117032 atgctcggccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttg 116933  T
Q  215 tagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 313  Q
     |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  116932 aagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 116833  T
Q  314 tgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagacaattgtcatcaatgaaggt 371  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||    |||||||||||||||||    
T  116832 tgaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggt 116775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27702 - 27448
Alignment:
Q  97 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacg 196  Q
    |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || |||| |||||| | || |||||||||     ||||||  ||||||||     
T  27702 attttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacatgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaaca 27603  T
Q  197 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcc 295  Q
    ||||| |  |||  |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  27602 aggcgccgattttccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcc 27503  T
Q  296 tagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaag 350  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||    
T  27502 tagattcttcaatgaccttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaag 27448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 335
Target Start/End: Original strand, 58245 - 58454
Alignment:
Q  127 tgcttcaccataactacctttctgatttcgcacgttagtaggttccacgctgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatt 226  Q
    ||||| ||||||||| || |  |||| |||||||| || ||||||||||    ||||||  |||||||| ||||| || | |  || | ||||||||||     
T  58245 tgctttaccataacttccatcttgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcatagaaaattggcaaaactaggcgcccatattcctcgaagcagtgaatg 58344  T
Q  227 atgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgataga-aaaacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatg 325  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  58345 atgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggccttgaaaagtgatg 58444  T
Q  326 gtgtgatttc 335  Q
    |||| |||||    
T  58445 gtgttatttc 58454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279701
Alignment:
Q  216 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa-acaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 314  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  315 gacaagtgatggtgtgatttcat 337  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcat 3279701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University