View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3063_low_38 (Length: 254)

Name: NF3063_low_38
Description: NF3063
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3063_low_38
NF3063_low_38
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (1-237)||(29198995-29199231)
chr5 (2-230)||(36440250-36440478)
chr5 (2-240)||(16860343-16860581)
chr5 (2-240)||(37424302-37424540)
chr5 (2-240)||(27186045-27186283)
chr5 (2-231)||(24040134-24040365)
chr5 (2-227)||(9989495-9989720)
chr5 (2-230)||(2183115-2183343)
chr5 (2-227)||(32288131-32288355)
chr5 (2-229)||(34264413-34264626)
chr5 (2-231)||(35569824-35570058)
chr5 (2-231)||(38958773-38959002)
chr5 (43-231)||(11316167-11316355)
chr5 (86-231)||(39325461-39325606)
chr5 (123-231)||(9989372-9989480)
chr5 (87-231)||(25182910-25183054)
chr5 (123-235)||(37424558-37424670)
chr5 (123-230)||(24040380-24040487)
chr5 (118-231)||(11316007-11316120)
chr5 (123-235)||(35570073-35570185)
chr5 (2-106)||(16860594-16860698)
chr5 (123-225)||(25567281-25567383)
chr5 (123-231)||(32288370-32288477)
chr5 (139-231)||(38959032-38959124)
chr5 (123-231)||(39325648-39325756)
chr5 (124-235)||(36440494-36440605)
chr5 (123-231)||(2182992-2183100)
chr5 (123-236)||(34264641-34264758)
chr5 (123-240)||(27185914-27186030)
chr5 (152-231)||(19184646-19184725)
chr5 (171-231)||(1140106-1140166)
chr5 (2-72)||(25567196-25567266)
chr5 (158-234)||(31756630-31756706)
chr5 (150-231)||(19185504-19185585)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (2-228)||(5937865-5938091)
chr6 (2-230)||(35167540-35167770)
chr6 (2-240)||(5310998-5311236)
chr6 (2-231)||(3423219-3423448)
chr6 (2-231)||(9046258-9046487)
chr6 (4-240)||(6235961-6236197)
chr6 (4-231)||(34994429-34994656)
chr6 (2-231)||(26957134-26957362)
chr6 (2-240)||(7270801-7271039)
chr6 (2-240)||(34890816-34891054)
chr6 (2-231)||(21856604-21856833)
chr6 (2-240)||(18053128-18053363)
chr6 (2-230)||(7270125-7270353)
chr6 (26-230)||(32753369-32753573)
chr6 (2-227)||(32993068-32993293)
chr6 (33-228)||(31237949-31238145)
chr6 (2-236)||(24744500-24744727)
chr6 (2-231)||(2517174-2517403)
chr6 (2-231)||(31247288-31247517)
chr6 (2-231)||(25176712-25176935)
chr6 (2-227)||(26600529-26600744)
chr6 (2-159)||(5639294-5639451)
chr6 (2-231)||(6137428-6137656)
chr6 (114-230)||(978465-978581)
chr6 (123-235)||(26600402-26600514)
chr6 (123-230)||(6532242-6532349)
chr6 (106-231)||(15932832-15932957)
chr6 (123-231)||(18053005-18053113)
chr6 (123-235)||(24744373-24744485)
chr6 (123-231)||(7270000-7270110)
chr6 (123-230)||(32753227-32753334)
chr6 (123-240)||(21540270-21540387)
chr6 (123-235)||(2517047-2517159)
chr6 (123-235)||(31237791-31237903)
chr6 (123-231)||(32993308-32993416)
chr6 (123-231)||(34994673-34994781)
chr6 (123-233)||(5310873-5310983)
chr6 (125-235)||(10412796-10412906)
chr6 (123-240)||(9046126-9046243)
chr6 (123-235)||(5639466-5639578)
chr6 (123-231)||(5938106-5938214)
chr6 (124-231)||(21856849-21856956)
chr6 (139-231)||(6137686-6137778)
chr6 (123-231)||(6236214-6236322)
chr6 (123-231)||(7270678-7270786)
chr6 (123-235)||(31247161-31247273)
chr6 (123-231)||(34890693-34890801)
chr6 (123-196)||(25176950-25177023)
chr6 (142-227)||(26957015-26957100)
chr6 (123-231)||(3423463-3423571)
chr6 (142-227)||(3035933-3036019)
chr6 (145-230)||(14276449-14276534)
chr6 (169-240)||(7438844-7438915)
chr6 (129-231)||(34517991-34518093)
chr6 (158-231)||(15286394-15286467)
chr6 (2-83)||(21540174-21540255)
chr6 (152-231)||(17244713-17244792)
chr6 (158-231)||(29261279-29261352)
chr6 (152-231)||(6228779-6228857)
chr6 (158-240)||(29260571-29260652)
chr6 (179-231)||(34517321-34517373)
chr6 (180-231)||(15932779-15932830)
chr6 (123-175)||(35167785-35167837)
chr6 (176-223)||(34251609-34251656)
chr6 (150-231)||(17245580-17245661)
chr6 (150-226)||(6229643-6229719)
chr6 (203-231)||(25180221-25180249)
chr6 (208-240)||(35167833-35167865)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (2-231)||(44322832-44323061)
chr1 (2-240)||(49140183-49140421)
chr1 (2-228)||(37284780-37285006)
chr1 (2-231)||(26707245-26707474)
chr1 (2-231)||(27547718-27547947)
chr1 (2-240)||(37576353-37576591)
chr1 (2-231)||(23476390-23476619)
chr1 (2-230)||(9006241-9006469)
chr1 (2-230)||(16024069-16024297)
chr1 (2-230)||(37304200-37304428)
chr1 (2-231)||(12481108-12481337)
chr1 (2-231)||(49643720-49643949)
chr1 (2-230)||(20306174-20306402)
chr1 (2-227)||(6797860-6798085)
chr1 (2-230)||(37585743-37585971)
chr1 (2-231)||(4696931-4697160)
chr1 (2-230)||(45052740-45052967)
chr1 (2-231)||(1762723-1762952)
chr1 (2-230)||(35612132-35612360)
chr1 (2-231)||(31703786-31704014)
chr1 (2-228)||(12127109-12127331)
chr1 (2-176)||(25995956-25996130)
chr1 (41-231)||(39486251-39486441)
chr1 (123-231)||(45843410-45843518)
chr1 (123-240)||(1762967-1763084)
chr1 (2-107)||(27400597-27400702)
chr1 (123-231)||(31703663-31703771)
chr1 (122-240)||(6798099-6798217)
chr1 (122-231)||(16023946-16024055)
chr1 (123-231)||(12481352-12481460)
chr1 (123-230)||(2064504-2064611)
chr1 (122-231)||(37304077-37304186)
chr1 (123-240)||(49140436-49140552)
chr1 (123-231)||(20306051-20306159)
chr1 (123-230)||(12127346-12127453)
chr1 (123-228)||(3089394-3089499)
chr1 (112-229)||(8760323-8760440)
chr1 (131-240)||(27547970-27548079)
chr1 (2-106)||(2064385-2064489)
chr1 (2-106)||(3089514-3089618)
chr1 (2-117)||(8762562-8762677)
chr1 (123-229)||(4330130-4330236)
chr1 (123-240)||(45052982-45053099)
chr1 (123-235)||(37576226-37576338)
chr1 (142-240)||(25995824-25995922)
chr1 (123-221)||(27400717-27400815)
chr1 (123-231)||(9006484-9006591)
chr1 (123-231)||(23476634-23476742)
chr1 (123-227)||(26723094-26723198)
chr1 (123-231)||(35612375-35612483)
chr1 (123-231)||(37285021-37285128)
chr1 (142-231)||(8762711-8762800)
chr1 (124-227)||(38000542-38000645)
chr1 (124-230)||(39486487-39486592)
chr1 (151-236)||(23598116-23598201)
chr1 (158-231)||(49837420-49837493)
chr1 (142-230)||(37586005-37586093)
chr1 (123-227)||(38127762-38127866)
chr1 (158-231)||(34967050-34967123)
chr1 (2-91)||(38127881-38127970)
chr1 (123-240)||(49643964-49644080)
chr1 (168-236)||(10831175-10831243)
chr1 (158-231)||(5537132-5537205)
chr1 (158-230)||(46592862-46592934)
chr1 (158-231)||(46593559-46593631)
chr1 (2-74)||(4330043-4330115)
chr1 (179-231)||(10831935-10831987)
chr1 (158-231)||(34966352-34966425)
chr1 (173-231)||(37467563-37467621)
chr1 (158-231)||(5536447-5536520)
chr1 (203-235)||(13109200-13109232)
chr1 (203-240)||(4697172-4697209)
chr1 (203-236)||(13183810-13183843)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (2-231)||(50525-50754)
scaffold0019 (123-230)||(50769-50876)
[»] chr4 (83 HSPs)
chr4 (2-231)||(6505586-6505814)
chr4 (2-231)||(33091502-33091731)
chr4 (2-231)||(44991328-44991556)
chr4 (2-230)||(50768993-50769221)
chr4 (2-225)||(50508512-50508735)
chr4 (2-240)||(14985503-14985741)
chr4 (2-231)||(42855388-42855617)
chr4 (2-231)||(53750951-53751180)
chr4 (2-240)||(43566418-43566656)
chr4 (2-240)||(46849709-46849947)
chr4 (2-230)||(19088391-19088619)
chr4 (2-230)||(38339664-38339892)
chr4 (2-240)||(41877900-41878137)
chr4 (2-231)||(8592141-8592370)
chr4 (2-231)||(24898361-24898590)
chr4 (2-240)||(37206467-37206705)
chr4 (2-240)||(53994974-53995212)
chr4 (2-231)||(53259187-53259416)
chr4 (2-230)||(30683576-30683806)
chr4 (2-231)||(1433320-1433549)
chr4 (2-231)||(23755467-23755696)
chr4 (5-231)||(15477694-15477920)
chr4 (2-231)||(41751866-41752094)
chr4 (2-240)||(16037834-16038072)
chr4 (2-231)||(19508461-19508691)
chr4 (2-231)||(21763229-21763459)
chr4 (2-236)||(39448532-39448766)
chr4 (2-240)||(43734326-43734564)
chr4 (2-230)||(6712135-6712362)
chr4 (2-231)||(25181861-25182090)
chr4 (2-236)||(52557131-52557365)
chr4 (2-231)||(623728-623957)
chr4 (3-240)||(36122473-36122710)
chr4 (2-228)||(12817978-12818204)
chr4 (46-240)||(8398071-8398264)
chr4 (123-240)||(16038087-16038204)
chr4 (123-240)||(46849962-46850079)
chr4 (123-231)||(8592018-8592126)
chr4 (123-240)||(19088634-19088751)
chr4 (123-231)||(33091746-33091854)
chr4 (123-231)||(42855632-42855740)
chr4 (123-230)||(25182105-25182212)
chr4 (123-230)||(53259431-53259538)
chr4 (124-230)||(39448782-39448888)
chr4 (123-240)||(6712003-6712120)
chr4 (2-95)||(23755985-23756078)
chr4 (123-240)||(37206720-37206837)
chr4 (123-240)||(53751195-53751312)
chr4 (123-231)||(14985380-14985488)
chr4 (123-235)||(21763474-21763586)
chr4 (123-231)||(30683821-30683929)
chr4 (123-231)||(43566671-43566779)
chr4 (123-230)||(20888193-20888300)
chr4 (123-230)||(24898239-24898346)
chr4 (125-231)||(15477940-15478046)
chr4 (123-240)||(19508706-19508823)
chr4 (123-240)||(38339532-38339649)
chr4 (123-240)||(43734579-43734696)
chr4 (123-236)||(50768865-50768978)
chr4 (123-231)||(623972-624080)
chr4 (123-231)||(44957438-44957546)
chr4 (2-102)||(44957561-44957661)
chr4 (123-235)||(53995227-53995340)
chr4 (123-231)||(12817855-12817963)
chr4 (123-231)||(23756093-23756201)
chr4 (142-230)||(25269312-25269400)
chr4 (123-231)||(41752109-41752217)
chr4 (142-240)||(44957669-44957767)
chr4 (123-240)||(1433564-1433681)
chr4 (123-240)||(41878152-41878268)
chr4 (123-240)||(52557380-52557497)
chr4 (124-231)||(36122727-36122833)
chr4 (123-230)||(44991571-44991678)
chr4 (147-237)||(44125665-44125755)
chr4 (142-227)||(44125782-44125867)
chr4 (123-240)||(50508750-50508867)
chr4 (125-230)||(49135928-49136037)
chr4 (142-230)||(55022334-55022421)
chr4 (158-231)||(52692768-52692841)
chr4 (168-230)||(4513254-4513316)
chr4 (158-231)||(47602992-47603065)
chr4 (182-240)||(52692064-52692122)
chr4 (179-240)||(47603710-47603771)
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (2-231)||(54107951-54108180)
chr3 (2-240)||(29818349-29818587)
chr3 (2-240)||(42591956-42592194)
chr3 (2-228)||(54752335-54752561)
chr3 (2-231)||(39664233-39664462)
chr3 (2-240)||(53716465-53716703)
chr3 (2-231)||(8473895-8474124)
chr3 (2-235)||(21568917-21569150)
chr3 (2-240)||(10505988-10506226)
chr3 (2-236)||(27801661-27801895)
chr3 (4-240)||(24428741-24428977)
chr3 (2-240)||(11256275-11256513)
chr3 (2-236)||(18464628-18464862)
chr3 (2-231)||(15986407-15986635)
chr3 (2-231)||(26318231-26318460)
chr3 (2-231)||(51509168-51509397)
chr3 (2-240)||(41834966-41835204)
chr3 (2-231)||(5900472-5900701)
chr3 (2-227)||(12203604-12203829)
chr3 (2-230)||(22152017-22152245)
chr3 (2-240)||(22201788-22202026)
chr3 (2-232)||(47303067-47303296)
chr3 (2-228)||(47669431-47669657)
chr3 (2-213)||(39241530-39241741)
chr3 (2-228)||(19883411-19883638)
chr3 (2-240)||(21969801-21970039)
chr3 (2-240)||(21992237-21992475)
chr3 (2-240)||(44893912-44894150)
chr3 (2-231)||(1994218-1994446)
chr3 (2-199)||(32633146-32633343)
chr3 (2-231)||(4757543-4757771)
chr3 (2-231)||(16931778-16932007)
chr3 (2-228)||(46152785-46153008)
chr3 (2-225)||(39951529-39951748)
chr3 (2-230)||(4773414-4773642)
chr3 (71-231)||(1999377-1999537)
chr3 (45-179)||(28986261-28986395)
chr3 (123-231)||(4757786-4757894)
chr3 (123-231)||(5900716-5900824)
chr3 (124-240)||(29818217-29818333)
chr3 (123-230)||(21568796-21568903)
chr3 (124-241)||(46152654-46152771)
chr3 (123-231)||(10506241-10506349)
chr3 (123-227)||(44893793-44893897)
chr3 (123-235)||(47669304-47669416)
chr3 (123-240)||(1994461-1994578)
chr3 (118-231)||(18464505-18464618)
chr3 (123-240)||(24428607-24428724)
chr3 (129-230)||(45306991-45307092)
chr3 (123-235)||(26318475-26318587)
chr3 (123-231)||(39241407-39241515)
chr3 (123-231)||(42591833-42591941)
chr3 (123-231)||(54108195-54108303)
chr3 (125-240)||(53716334-53716449)
chr3 (129-231)||(47303315-47303417)
chr3 (123-236)||(8474139-8474252)
chr3 (123-228)||(16931658-16931763)
chr3 (123-235)||(15986280-15986392)
chr3 (123-235)||(21969674-21969786)
chr3 (123-235)||(21992110-21992222)
chr3 (123-235)||(22151890-22152002)
chr3 (123-231)||(32633358-32633466)
chr3 (123-235)||(39951402-39951514)
chr3 (123-230)||(12203844-12203951)
chr3 (123-230)||(39664477-39664584)
chr3 (123-228)||(51509412-51509517)
chr3 (127-231)||(12791473-12791577)
chr3 (123-230)||(22201666-22201773)
chr3 (124-231)||(28986436-28986542)
chr3 (142-235)||(45306877-45306970)
chr3 (123-231)||(27801538-27801646)
chr3 (123-231)||(54752212-54752320)
chr3 (139-230)||(4773293-4773384)
chr3 (123-230)||(11256153-11256260)
chr3 (125-236)||(41835221-41835332)
chr3 (154-229)||(7681447-7681522)
chr3 (163-240)||(15790719-15790796)
chr3 (152-231)||(13866069-13866148)
chr3 (152-231)||(44317537-44317616)
chr3 (139-230)||(20963534-20963625)
chr3 (169-240)||(28985549-28985620)
chr3 (152-231)||(49528198-49528277)
chr3 (162-227)||(7163503-7163568)
chr3 (175-228)||(15791454-15791507)
chr3 (150-231)||(49529076-49529157)
chr3 (150-234)||(44316673-44316756)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (2-231)||(8600-8829)
scaffold0221 (123-225)||(8483-8585)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (2-231)||(6356937-6357166)
chr7 (2-240)||(31637983-31638221)
chr7 (2-240)||(21391230-21391468)
chr7 (2-231)||(7578921-7579150)
chr7 (2-231)||(41453054-41453283)
chr7 (2-229)||(28297991-28298218)
chr7 (2-240)||(36423541-36423779)
chr7 (2-231)||(35146748-35146976)
chr7 (2-228)||(48626115-48626341)
chr7 (2-231)||(8936898-8937127)
chr7 (2-231)||(10526483-10526711)
chr7 (2-240)||(28286157-28286395)
chr7 (2-231)||(41191731-41191963)
chr7 (28-228)||(17749987-17750187)
chr7 (42-231)||(1114257-1114446)
chr7 (2-231)||(6356457-6356686)
chr7 (2-231)||(19681544-19681773)
chr7 (33-231)||(17363437-17363637)
chr7 (2-227)||(33716760-33716980)
chr7 (2-240)||(41751822-41752060)
chr7 (2-230)||(8542671-8542898)
chr7 (2-183)||(17359353-17359538)
chr7 (2-120)||(44332679-44332797)
chr7 (123-231)||(41453298-41453406)
chr7 (123-231)||(17359230-17359338)
chr7 (2-230)||(40673058-40673283)
chr7 (2-120)||(43247587-43247705)
chr7 (123-240)||(19681788-19681905)
chr7 (123-231)||(28297868-28297976)
chr7 (123-240)||(10526351-10526468)
chr7 (2-139)||(34037052-34037189)
chr7 (123-240)||(44332812-44332929)
chr7 (123-231)||(33716637-33716745)
chr7 (123-240)||(6356805-6356922)
chr7 (123-240)||(48626356-48626473)
chr7 (123-235)||(41191978-41192090)
chr7 (124-231)||(7909460-7909567)
chr7 (126-235)||(35146985-35147094)
chr7 (123-235)||(41751695-41751807)
chr7 (142-231)||(8542548-8542637)
chr7 (123-240)||(8937142-8937259)
chr7 (123-231)||(1114103-1114211)
chr7 (123-227)||(7909339-7909443)
chr7 (123-231)||(21391483-21391591)
chr7 (123-231)||(31075486-31075594)
chr7 (127-231)||(31638240-31638344)
chr7 (123-236)||(4931566-4931679)
chr7 (139-231)||(6356335-6356427)
chr7 (123-235)||(7579165-7579277)
chr7 (123-235)||(28286410-28286522)
chr7 (123-226)||(27738958-27739060)
chr7 (142-231)||(43247464-43247554)
chr7 (147-240)||(16867747-16867840)
chr7 (123-235)||(34037204-34037316)
chr7 (157-231)||(36674024-36674098)
chr7 (123-196)||(40673298-40673371)
chr7 (163-230)||(8416535-8416602)
chr7 (123-231)||(36423418-36423526)
chr7 (152-230)||(4155648-4155726)
chr7 (158-240)||(36282826-36282908)
chr7 (158-227)||(41893403-41893472)
chr7 (158-230)||(36283533-36283605)
chr7 (158-228)||(32946669-32946739)
chr7 (158-231)||(41892015-41892088)
chr7 (179-231)||(46540017-46540069)
chr7 (123-186)||(38447600-38447662)
chr7 (179-240)||(8417285-8417346)
chr7 (150-231)||(28263545-28263626)
chr7 (129-225)||(28264587-28264683)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (2-240)||(8173925-8174163)
chr2 (2-230)||(34735393-34735621)
chr2 (2-231)||(15405805-15406034)
chr2 (2-230)||(13193160-13193388)
chr2 (2-230)||(29472414-29472642)
chr2 (2-231)||(16305197-16305426)
chr2 (2-235)||(41474254-41474487)
chr2 (2-240)||(2147925-2148164)
chr2 (2-231)||(26181749-26181978)
chr2 (2-240)||(24372007-24372245)
chr2 (2-228)||(19815756-19815982)
chr2 (2-231)||(10992023-10992252)
chr2 (35-231)||(17052259-17052455)
chr2 (2-236)||(36713760-36713991)
chr2 (2-231)||(7496029-7496257)
chr2 (2-240)||(15744629-15744857)
chr2 (66-240)||(24138108-24138282)
chr2 (2-231)||(12860429-12860645)
chr2 (2-228)||(7469338-7469556)
chr2 (123-240)||(7469206-7469323)
chr2 (123-231)||(7496272-7496380)
chr2 (123-240)||(24372260-24372377)
chr2 (123-240)||(8174178-8174295)
chr2 (123-235)||(34735636-34735748)
chr2 (123-231)||(42834471-42834579)
chr2 (124-231)||(30898595-30898702)
chr2 (123-240)||(13193028-13193145)
chr2 (123-231)||(12860660-12860768)
chr2 (123-231)||(15744506-15744614)
chr2 (123-231)||(19847611-19847719)
chr2 (123-230)||(2148179-2148286)
chr2 (123-230)||(33470216-33470323)
chr2 (123-230)||(38332754-38332861)
chr2 (124-230)||(38332974-38333080)
chr2 (123-231)||(15406049-15406157)
chr2 (123-231)||(16305074-16305182)
chr2 (123-231)||(26181993-26182101)
chr2 (123-230)||(10991901-10992008)
chr2 (123-240)||(29472282-29472399)
chr2 (123-240)||(24138799-24138917)
chr2 (123-235)||(19815997-19816109)
chr2 (151-227)||(8444875-8444951)
chr2 (2-109)||(19847490-19847596)
chr2 (2-76)||(24138710-24138784)
chr2 (123-227)||(36713641-36713745)
chr2 (2-72)||(38332876-38332946)
chr2 (123-231)||(41474131-41474239)
chr2 (163-240)||(8962400-8962477)
chr2 (170-231)||(17032642-17032703)
chr2 (170-231)||(17050978-17051039)
chr2 (164-228)||(8445123-8445187)
chr2 (179-228)||(8963166-8963215)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (2-230)||(38588759-38588987)
chr8 (2-231)||(15871670-15871899)
chr8 (2-230)||(40048227-40048454)
chr8 (2-240)||(37569354-37569593)
chr8 (2-231)||(15048571-15048800)
chr8 (2-240)||(11707790-11708028)
chr8 (2-240)||(27473112-27473349)
chr8 (2-231)||(45276646-45276874)
chr8 (2-230)||(5434950-5435178)
chr8 (2-240)||(34470716-34470954)
chr8 (2-230)||(1870105-1870335)
chr8 (2-240)||(27669588-27669830)
chr8 (2-231)||(44594650-44594879)
chr8 (2-240)||(5152575-5152812)
chr8 (2-235)||(1739993-1740226)
chr8 (2-235)||(7534887-7535111)
chr8 (80-236)||(40660027-40660183)
chr8 (118-240)||(27473359-27473481)
chr8 (2-175)||(45077307-45077481)
chr8 (2-228)||(1646553-1646785)
chr8 (90-231)||(33819834-33819975)
chr8 (123-240)||(33295977-33296094)
chr8 (124-240)||(1432171-1432287)
chr8 (123-231)||(38588636-38588744)
chr8 (123-235)||(44594894-44595006)
chr8 (123-235)||(15048444-15048556)
chr8 (123-235)||(45276889-45277001)
chr8 (128-230)||(1869983-1870085)
chr8 (123-228)||(5435193-5435298)
chr8 (123-231)||(1651865-1651972)
chr8 (123-231)||(1740241-1740348)
chr8 (2-140)||(7949584-7949722)
chr8 (2-105)||(33295859-33295962)
chr8 (123-236)||(40660179-40660292)
chr8 (123-240)||(45077496-45077613)
chr8 (124-231)||(5152828-5152935)
chr8 (2-120)||(1432303-1432421)
chr8 (123-221)||(7949471-7949569)
chr8 (123-240)||(7535126-7535243)
chr8 (142-231)||(11173946-11174035)
chr8 (2-110)||(24659366-24659474)
chr8 (123-240)||(15871914-15872031)
chr8 (139-227)||(1646815-1646903)
chr8 (123-231)||(27669465-27669573)
chr8 (129-240)||(22763232-22763343)
chr8 (123-196)||(18298522-18298595)
chr8 (2-133)||(1651719-1651850)
chr8 (123-235)||(40048112-40048216)
chr8 (39-110)||(18298410-18298481)
chr8 (154-240)||(33295776-33295862)
chr8 (2-56)||(11173858-11173912)
chr8 (179-235)||(22762558-22762614)
chr8 (142-227)||(37569627-37569712)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (2-231)||(18445-18674)
scaffold0340 (123-231)||(18322-18430)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (2-240)||(14175-14413)
scaffold0134 (124-230)||(14429-14535)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (2-240)||(81898-82136)
scaffold0032 (123-196)||(82151-82224)
scaffold0032 (174-235)||(90782-90843)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (2-227)||(15620-15845)
scaffold0072 (158-230)||(15503-15575)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (2-240)||(349245-349482)
scaffold0003 (2-240)||(113538-113776)
scaffold0003 (123-235)||(349118-349230)
scaffold0003 (151-231)||(113442-113522)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (2-231)||(19880-20109)
scaffold0182 (123-235)||(19753-19865)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (2-231)||(24334-24563)
scaffold0186 (123-236)||(24206-24319)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (2-231)||(72934-73162)
scaffold0029 (123-231)||(72811-72919)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (33-231)||(6198-6395)
scaffold0246 (123-231)||(6047-6155)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (89-227)||(56395-56533)
scaffold0037 (89-227)||(63520-63658)
scaffold0037 (123-235)||(45801-45913)
scaffold0037 (6-94)||(45932-46020)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (2-166)||(20923-21086)
scaffold0220 (123-231)||(20800-20908)
[»] scaffold0115 (3 HSPs)
scaffold0115 (123-240)||(21552-21668)
scaffold0115 (142-231)||(22465-22554)
scaffold0115 (2-133)||(21683-21814)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (123-228)||(14243-14348)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (120-236)||(147130-147246)
scaffold0001 (150-228)||(144072-144150)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (129-230)||(9832-9932)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29199231 - 29198995
Alignment:
Q  1 attatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29199231 attatttattagtatcattttaattctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatgttattgataactgttatgattcatatgtatgtgt 29199132  T
Q  101 gaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29199131 gaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaga 29199032  T
Q  201 atcgaaataaatcaatttttagttagaggactaattt 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29199031 atcgaaataaatcaatttttaattagaggactaattt 29198995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36440478 - 36440250
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36440478 ttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 36440379  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |    
T  36440378 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagagga 36440279  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36440278 ccgaaataaatcaatttttagttagagga 36440250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16860581 - 16860343
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16860581 ttatttattagtatcattttggttccatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgcatgtttg 16860482  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16860481 aaacaggaggtcagatacacacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagga 16860382  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16860381 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 16860343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37424540 - 37424302
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37424540 ttatttattaatatcattttggtcctattttttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatctgtg 37424441  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  37424440 aaacaggaggtcaggtacccaaataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaaga 37424341  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37424340 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 37424302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 27186045 - 27186283
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27186045 ttattaattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgaatggtattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 27186144  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27186145 aaacaggaggtcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 27186244  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27186245 ctgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 27186283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24040365 - 24040134
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcat--tttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtg 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24040365 ttatttattagtatcatattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattattgttcatatgtatgtg 24040266  T
Q  100 tgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaag 199  Q
    | ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24040265 taaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtg 24040166  T
Q  200 aatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24040165 gaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 24040134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 9989495 - 9989720
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9989495 ttatttattagtatcattttggtcctatgtcttattaaggtattatgattaaacagtgactaatattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 9989594  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||  |||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  9989595 aaacaggaggtcagacacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 9989694  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  9989695 ccgaaataaatcaatttttagttaga 9989720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 2183115 - 2183343
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2183115 ttatttattagtatcattttggtcatatatcttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggtttatatgtatgtgtg 2183214  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||  |||  ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2183215 aaacaggaggtcagacacccacataagacaaaccttaatgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttacagaa 2183314  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2183315 ccgaaataaatcaatttttagttaaagga 2183343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32288355 - 32288131
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32288355 ttatttattagtattattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 32288256  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    || || ||| ||| ||| |  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  32288255 aagcaagaggtcatgtatccacataacacaaa-cctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatga 32288157  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  32288156 ccgaaataaatcaatttttagttaga 32288131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34264626 - 34264413
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34264626 ttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 34264527  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34264526 aaacatgaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttattt--------------gaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 34264441  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34264440 tcgaaataaatcaatttttagttagagg 34264413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35570058 - 35569824
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtat----- 96  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  35570058 ttatttattagtatcatttcggtcttattccttgttaagttattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatatgta 35569959  T
Q  97 -gtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactt 195  Q
     |||||||||||||| ||||  ||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  35569958 tgtgtgaaacaggaggtcaga-actcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacagtgagaaactt 35569860  T
Q  196 aaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569859 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 35569824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38959002 - 38958773
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  38959002 ttatttataagtatcattttggtcttatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttacgtttcatttgtatgtgtg 38958903  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||||  |||  |||| |||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  38958902 aaataggaggtcagacacccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 38958803  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958802 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 38958773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 11316167 - 11316355
Alignment:
Q  43 attatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaact 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  || |  |||||||||||||||||  |    
T  11316167 attatgattaaatattgacttatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtaaaacatgaggtcaaatatccacataacacaaaccctaacgt 11316266  T
Q  143 ttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11316267 ttattcgaataaaattaatagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 11316355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39325606 - 39325461
Alignment:
Q  86 ttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  39325606 ttcatatgtatgtgtgaaacaggagatcagatgcccacataacagaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacag 39325507  T
Q  186 tgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39325506 tgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 39325461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9989480 - 9989372
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  9989480 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 9989381  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  9989380 ttagaggac 9989372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Original strand, 25182910 - 25183054
Alignment:
Q  87 tcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggt 186  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |    
T  25182910 tcatatgtatgtgtgaaacagaagatcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagcaacatt 25183009  T
Q  187 gagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183010 gagaagcttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 25183054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 37424558 - 37424670
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  37424558 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 37424657  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  37424658 ttagaggactaat 37424670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 24040380 - 24040487
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  24040380 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaggaacggtgagaaacttaaaggactgaaataagtcaatttttag 24040479  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  24040480 ttagagga 24040487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11316120 - 11316007
Alignment:
Q  118 accttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatt 217  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11316120 acctacataacacaaaccctaacgtttattggaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaatagtaagaaacttagaggatcgaaataaatcaatt 11316021  T
Q  218 tttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||    
T  11316020 tttagttagaggac 11316007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 35570073 - 35570185
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactta-aagaatcgaaataaatcaattttta 221  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  35570073 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaagtgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagact-aaaataaatcaattttta 35570171  T
Q  222 gttagaggactaat 235  Q
    ||||||||| ||||    
T  35570172 gttagaggagtaat 35570185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16860698 - 16860594
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16860698 ttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaatgtattatgattaattagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 16860599  T
Q  102 aaaca 106  Q
    |||||    
T  16860598 aaaca 16860594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 225
Target Start/End: Original strand, 25567281 - 25567383
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25567281 cataacaaaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaaggatcaaaataaatcaatttttag 25567380  T
Q  223 tta 225  Q
    |||    
T  25567381 tta 25567383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 32288370 - 32288477
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  32288370 cataacacaaactctaa-cattatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtattaacagtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 32288468  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  32288469 ttagaggac 32288477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 38959032 - 38959124
Alignment:
Q  139 aactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38959032 aactttatttgaataaaattaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 38959124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 39325648 - 39325756
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  39325648 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagtactaaatgtaataacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 39325747  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  39325748 ttagaggac 39325756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Original strand, 36440494 - 36440605
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  36440494 ataacacaaaccccaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagttatagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 36440593  T
Q  224 tagaggactaat 235  Q
    ||||||||||||    
T  36440594 tagaggactaat 36440605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2183100 - 2182992
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |   ||||||||||||||||||    
T  2183100 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaagctaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagacgacataaataaatcaatttttag 2183001  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  2183000 ttagaggac 2182992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 34264641 - 34264758
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaa----taaatcaattt 218  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || | |||||    |||||||||||    
T  34264641 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaatgactaaatgtaataacaatgagaaacttagaggaccgaaataattaaatcaattt 34264740  T
Q  219 ttagttagaggactaatt 236  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  34264741 ttagttagaggaccaatt 34264758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27186030 - 27185914
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  27186030 cataaaacaaaccctaacatttatttgaataaaacta-caggaaggactaaatgtagtaaaagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 27185932  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||| ||| ||| ||||    
T  27185931 ttagaagaccaatctgat 27185914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19184725 - 19184646
Alignment:
Q  152 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19184725 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggac 19184646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 231
Target Start/End: Original strand, 1140106 - 1140166
Alignment:
Q  171 taaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1140106 taaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 1140166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25567266 - 25567196
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattg 72  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25567266 ttatttattagtattattttagtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattattg 25567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 234
Target Start/End: Original strand, 31756630 - 31756706
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaa 234  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||| ||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31756630 taacagaaatgacaaaatatggtaacagtgataaagttagaggaccaaaataaatcattttttagttagaggactaa 31756706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Original strand, 19185504 - 19185585
Alignment:
Q  150 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| | | | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19185504 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggac 19185585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5938091 - 5937865
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5938091 ttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 5937992  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  5937991 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 5937892  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  5937891 ccgaaataaatcaatttttagttagag 5937865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35167770 - 35167540
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattat--gattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35167770 ttatttattagtatcattttagtcctaatccttgttaaggtattatatgattaaatagtgactgatattaatggtaactgttatggttcatatgtatgtg 35167671  T
Q  100 tgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35167670 tgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagag 35167571  T
Q  200 aatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35167570 gaccgaaataaatcaatttttagttagagga 35167540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 5310998 - 5311236
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5310998 ttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 5311097  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5311098 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagagca 5311197  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5311198 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 5311236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3423448 - 3423219
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3423448 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattacgattaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtt 3423349  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  3423348 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 3423249  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423248 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 3423219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 9046258 - 9046487
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9046258 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaagctattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgtg 9046357  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | |    
T  9046358 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaatagaactaacagaaaggactaaatgtagtagcggtgagaaacttagcgga 9046457  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9046458 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 9046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6236197 - 6235961
Alignment:
Q  4 atttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaa 103  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6236197 atttattagtatcatcttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtgaa 6236098  T
Q  104 acaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatc 203  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |    
T  6236097 acaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgcagtaacggtgagaaacttagaggacc 6235998  T
Q  204 gaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  6235997 gaaataaatcaatttttaattataggactaatctgat 6235961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34994656 - 34994429
Alignment:
Q  4 atttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34994656 atttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtgaa 34994557  T
Q  104 acaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatc 203  Q
    ||| ||| ||| |||||  |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | |    
T  34994556 acacgaggtcaagtacccacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggacc 34994457  T
Q  204 gaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34994456 gaaataaatcaatttttagttagaggac 34994429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 26957134 - 26957362
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26957134 ttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaagtgttatgattcatatgtatgtgtg 26957233  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26957234 aaacaggaggtcaggtagccacat-acacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaagga 26957332  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26957333 ccgaaataaatcaatttttagttaaaggac 26957362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 7270801 - 7271039
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7270801 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 7270900  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||| ||||   |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  7270901 aaacaggaggtcatgtactcacataacacaaaccccaacgtttatttaaataaaactaatagaaaggactaaatatagtaacgatgagaaacttagagga 7271000  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7271001 ctgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgat 7271039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 34890816 - 34891054
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34890816 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtgtgtgtg 34890915  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  34890916 aaacagaaggtcaggtacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 34891015  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34891016 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 34891054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21856833 - 21856604
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21856833 ttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaacagtgacggatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 21856734  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21856733 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 21856634  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21856633 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 21856604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 18053128 - 18053363
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||    
T  18053128 ttatttattagtatcattttggttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatggtt---atgtatgtgtg 18053224  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||  |||| ||||   |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18053225 aaacaggatgtcagatacccatataaaacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagta 18053324  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18053325 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 18053363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 7270125 - 7270353
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7270125 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattgttgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 7270224  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  7270225 aaacaggaggtcaggtacccacataccacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtaacgatgagaaatttagagaa 7270324  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  7270325 ccaaaaaaaattaatttttagttagagga 7270353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Original strand, 32753369 - 32753573
Alignment:
Q  26 ctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcat 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  32753369 ctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaagtgttatgattcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacat 32753468  T
Q  126 aacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagtta 225  Q
    ||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  32753469 aacacaaactctgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtta 32753568  T
Q  226 gagga 230  Q
    |||||    
T  32753569 gagga 32753573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32993293 - 32993068
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32993293 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtgttatgattaaataatgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 32993194  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  32993193 aaacatgaggacaggtacctacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaccaaatgtagtaacaatgagaaacttagagga 32993094  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
     | ||||||||||||||||| |||||    
T  32993093 ccaaaataaatcaatttttacttaga 32993068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Original strand, 31237949 - 31238145
Alignment:
Q  33 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  31237949 ttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattgttaactgttatggttcatatgtatgtgagaaacaggaagtcaggtacccacataacacaa 31238048  T
Q  133 accctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaa-agaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31238049 actctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 31238145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 24744500 - 24744727
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      ||| ||||||||||    
T  24744500 ttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgtt------cat-tgtatgtgtg 24744592  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24744593 aaacagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttaaagaa 24744692  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24744693 tggaaataaatcaatttttagttagaggaccaatt 24744727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 2517174 - 2517403
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||| || |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2517174 ttatttataagaatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattagtggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 2517273  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||| |||   ||||||||| | | |||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  2517274 aaacaagaggtcagatactcacataacacagatcataacgtttatttaaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 2517373  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517374 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 2517403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 31247288 - 31247517
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31247288 ttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 31247387  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaa-aga 200  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||     
T  31247388 aaacaggaagtcaggtacccacataacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgact-aatgtagtaacggtgaaaaacttaagagg 31247486  T
Q  201 atcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31247487 actgaaataaattaatttttagttagaggac 31247517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25176935 - 25176712
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176935 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 25176836  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||      | ||||||| |   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25176835 aa------ggtcaggtatccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 25176742  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25176741 ccataataaatcaatttttagttagaggac 25176712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 26600529 - 26600744
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||    
T  26600529 ttatttattagtatcattttggtcatattccttattaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgttat----------tatgtgtg 26600618  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  26600619 aaacagggggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 26600718  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  26600719 ccgaaataaatcaatttttagttaga 26600744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5639451 - 5639294
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5639451 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 5639352  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaacta 159  Q
    ||| ||||| || ||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  5639351 aaataggaggtcgggtacccacataacacaaactctaacatttatttgaataaaacta 5639294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6137656 - 6137428
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||   | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  6137656 ttatttattagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgagtgatattatttgtaattgttatgtttcatttgtctgtgtg 6137557  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||||  | |  ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  6137556 aaataggaggtcagacatccacataacacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 6137457  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6137456 ccgaaataaatc-atttttaattagaggac 6137428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 978581 - 978465
Alignment:
Q  114 aggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatc 213  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  978581 aggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatc 978482  T
Q  214 aatttttagttagagga 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  978481 aatttttagttagagga 978465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26600514 - 26600402
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  26600514 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaattaatttttag 26600415  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  26600414 ttagaggactaat 26600402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6532349 - 6532242
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6532349 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatcactaaatgtagtaacggtgagaaatttagagaaccgaaataaatcaatttttag 6532250  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  6532249 ttagagga 6532242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 15932832 - 15932957
Alignment:
Q  106 aggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcga 205  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |    
T  15932832 aggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaa 15932931  T
Q  206 aataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15932932 aataaatcaatttttagttagaggac 15932957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18053113 - 18053005
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18053113 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 18053014  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  18053013 ttagaggac 18053005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24744485 - 24744373
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  24744485 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgcagtaacggtgtgaaagttagaggaccgaaataaatcaatttttag 24744386  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  24744385 ttagaggactaat 24744373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7270110 - 7270000
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaa--ctaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttt 220  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7270110 cataacacaaaccctaacatttatttaaataaaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaattttt 7270011  T
Q  221 agttagaggac 231  Q
    |||||||||||    
T  7270010 agttagaggac 7270000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32753334 - 32753227
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  32753334 cataacacaaaccttaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 32753235  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  32753234 ttagagga 32753227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 21540270 - 21540387
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  21540270 cataacgcaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaa 21540369  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  21540370 ttagaggactaatctgat 21540387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2517159 - 2517047
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  2517159 cataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 2517060  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  2517059 ttagaggactaat 2517047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31237903 - 31237791
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  31237903 cataaaacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttag 31237804  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||| ||||||    
T  31237803 ttagagaactaat 31237791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 32993308 - 32993416
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  32993308 cataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagaaacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatttttag 32993407  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  32993408 ttagaggac 32993416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 34994673 - 34994781
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34994673 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttag 34994772  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  34994773 ttagaggac 34994781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5310983 - 5310873
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  5310983 cataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttag 5310884  T
Q  223 ttagaggacta 233  Q
    ||| |||||||    
T  5310883 ttataggacta 5310873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Original strand, 10412796 - 10412906
Alignment:
Q  125 taacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagtt 224  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  10412796 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaatagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 10412895  T
Q  225 agaggactaat 235  Q
    |||| ||||||    
T  10412896 agagaactaat 10412906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9046243 - 9046126
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  9046243 cataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgacaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttac 9046144  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  9046143 ttagaggaccaatctgat 9046126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 5639466 - 5639578
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  5639466 cataacacaaaccataatgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaataaatttttag 5639565  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  5639566 ttagaggactaat 5639578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 5938106 - 5938214
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  5938106 cataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaattgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 5938205  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  5938206 ttagaggac 5938214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 21856849 - 21856956
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||    
T  21856849 ataacaaaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagt 21856948  T
Q  224 tagaggac 231  Q
    ||||||||    
T  21856949 tagaggac 21856956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 6137686 - 6137778
Alignment:
Q  139 aactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6137686 aactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggac 6137778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 6236214 - 6236322
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  6236214 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatttagtaactgttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 6236313  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  6236314 ttagaggac 6236322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7270786 - 7270678
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||     
T  7270786 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatatagtaacggtaagaaacttaaaagatcaaaataaatcaatttttaa 7270687  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  7270686 ttagaggac 7270678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31247273 - 31247161
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  31247273 cataaaacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaacaccgaaataaatcaatttttag 31247174  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||| ||||||    
T  31247173 ttagagaactaat 31247161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34890801 - 34890693
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  || | | ||||||||||||||||||    
T  34890801 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtaataacagtgagaaactttgaggaccaaaataaatcaatttttag 34890702  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  34890701 ttagaggac 34890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Original strand, 25176950 - 25177023
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactta 196  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176950 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactta 25177023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26957100 - 26957015
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  26957100 tttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 26957015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 3423463 - 3423571
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||     
T  3423463 catatcacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaaattagaggaccgaaataaaccaatttttaa 3423562  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||| ||||    
T  3423563 ttagcggac 3423571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3036019 - 3035933
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaa-tgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  3036019 tttatttgaataaaattaacagaaaatgactaaatgtagtaagagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 3035933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14276534 - 14276449
Alignment:
Q  145 atttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14276534 atttgaataaaactaatacaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccgaagtaaatcaatttttagttagagga 14276449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7438915 - 7438844
Alignment:
Q  169 actaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7438915 actaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 7438844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Original strand, 34517991 - 34518093
Alignment:
Q  129 acaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    |||||||||||  ||| ||| | ||||  |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  34517991 acaaaccctaacgtttttttaattaaatttaacggaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaagggatcgaaataaatcaatttttagtttgag 34518090  T
Q  229 gac 231  Q
    |||    
T  34518091 gac 34518093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15286467 - 15286394
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15286467 taacggaaatgactaaatgcagtaacggtgagaaacttaagggattgaaataaatcaatttttagtcagaggac 15286394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21540255 - 21540174
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttat 83  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  21540255 ttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgattgatattattgacaactattat 21540174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17244792 - 17244713
Alignment:
Q  152 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17244792 taaaactaacagaaatgacgaaatataataacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggac 17244713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Original strand, 29261279 - 29261352
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29261279 taacggaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccgacataaatcaatttttagttagaggac 29261352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6228857 - 6228779
Alignment:
Q  152 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6228857 taaaacaaacagaaatgacgaaatatagtaacggtgataaacttagggac-caaaataaatcaatttttagttagaggac 6228779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29260652 - 29260571
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29260652 taacggaaatgactaaatgtagtaatg-tgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagtttgaggaccaatctgat 29260571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34517373 - 34517321
Alignment:
Q  179 gtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34517373 gtaacagtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 34517321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15932830 - 15932779
Alignment:
Q  180 taacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15932830 taacgatgagaaacttagaggatcaaaataaatcaatttttagttagaggac 15932779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 35167785 - 35167837
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaat 175  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  35167785 cataacacaaaccctaacgtttacttgaataaaactaacagaaaggattaaat 35167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34251656 - 34251609
Alignment:
Q  176 gtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  34251656 gtagtaacgatgagaaacttagaggatcgaaataaattaatttttagt 34251609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Original strand, 17245580 - 17245661
Alignment:
Q  150 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| | | | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17245580 aataaaattaacggaaaagactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggac 17245661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 226
Target Start/End: Original strand, 6229643 - 6229719
Alignment:
Q  150 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttag 226  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| | | | ||||||||||| ||||||||||    
T  6229643 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttag 6229719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 231
Target Start/End: Original strand, 25180221 - 25180249
Alignment:
Q  203 cgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25180221 cgaaataaatcaatttttagttagaggac 25180249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 240
Target Start/End: Original strand, 35167833 - 35167865
Alignment:
Q  208 taaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35167833 taaatcaatttttagttagaggactaatctgat 35167865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 44322832 - 44323061
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44322832 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaattgtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 44322931  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  44322932 aaacaggaggtcacgtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 44323031  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44323032 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 44323061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49140421 - 49140183
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49140421 ttatttattagtatcattttggttatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgtg 49140322  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  49140321 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 49140222  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  49140221 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 49140183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37285006 - 37284780
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37285006 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 37284907  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37284906 aaacaggaggtcaggtaccaacataacacaaaccataactcttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaatga 37284807  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  37284806 ccgaaataaatcaatttttagttagag 37284780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26707474 - 26707245
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26707474 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 26707375  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| ||||  |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  26707374 aaataggaggtcagatacccacataacacaaactccaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggggagaaacttagagga 26707275  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26707274 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 26707245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27547947 - 27547718
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27547947 ttatttattagtatcattttggtactatgctttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatactattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 27547848  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  27547847 aaacaagaggtcaggtacccacatgacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaaggactaaatgtattaacggtgagaaacttagagga 27547748  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27547747 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 27547718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 37576353 - 37576591
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37576353 ttatttataagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattaggattaaatagtgaccgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgtg 37576452  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37576453 aaacagggggtcaggtacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagaa 37576552  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37576553 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 37576591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23476619 - 23476390
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23476619 ttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtg 23476520  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  23476519 aaacaggaggtcaggtacccacataacacagattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtgga 23476420  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23476419 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 23476390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9006469 - 9006241
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9006469 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatagttcatatgtatgtgtg 9006370  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  9006369 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtactaacggtgataaacttagatga 9006270  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9006269 ccgaaataaatcaatttttagttaaagga 9006241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 16024069 - 16024297
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16024069 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttgaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 16024168  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16024169 aaacaggaggtcaggcacccacataacataaaccctaacgtttatttgaataaaactaccagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 16024268  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16024269 ccgaaataaatcaatttttagttagagga 16024297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 37304200 - 37304428
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37304200 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 37304299  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37304300 aaacaggaggtcagacacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 37304399  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37304400 ccgaaataaatcaatttttagttatagga 37304428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12481337 - 12481108
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481337 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 12481238  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| ||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12481237 aaataggaggtcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 12481138  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12481137 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 12481108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49643949 - 49643720
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  49643949 ttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgagtgatattattggtaactgctatggttcatatgtatgtatg 49643850  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  49643849 aaacaggaggtcaaatacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 49643750  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49643749 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 49643720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 20306174 - 20306402
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20306174 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 20306273  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20306274 aaacatgaggtcaagtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaagga 20306373  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  20306374 ccaaaataaatcaatctttagttggagga 20306402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6798085 - 6797860
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6798085 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 6797986  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  6797985 aaacaggaggtcaggcacccacataacacaaactctaacgtttatttgaacaaaactaacagaaatgactaaatggagtaacggtgagaaacttagagga 6797886  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
     ||||||||||||||||||| |||||    
T  6797885 ccgaaataaatcaatttttaattaga 6797860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37585971 - 37585743
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37585971 ttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 37585872  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || |    
T  37585871 aaacatgaggtcaggtagctacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatataataacggtgagaaatttagagga 37585772  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37585771 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 37585743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4697160 - 4696931
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4697160 ttatttattagtatcattttgatcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgtg 4697061  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  4697060 aaataggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaattaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 4696961  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4696960 ccaaaataaatcaatttttagttataggac 4696931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45052967 - 45052740
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45052967 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggtttatatgtatgtgtg 45052868  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||  || |  ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  45052867 aaacaagaggtcaaatatccacataaca-aaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacagtgagaaacttatagga 45052769  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45052768 ccgaaataaatcaatttttagttagagga 45052740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1762952 - 1762723
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1762952 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaagtgttctgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 1762853  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||  ||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  1762852 aaacaggaggtcaaatacccacataatacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacataaatgattaaatgttgtaacagtgagaaacttagagga 1762753  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1762752 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 1762723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35612360 - 35612132
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35612360 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaaatgttatgattcatatgtatgtgtg 35612261  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || ||| ||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  35612260 aaacagaaggtcaagtacacacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaaagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 35612161  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35612160 acaaaataaatcaatttttagttagagga 35612132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 31703786 - 31704014
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31703786 ttatttattagcatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgttatggttca-atgtatgtgtg 31703884  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   |||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  31703885 aaataggaggtcaggtacccatataacataaagcctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttataggt 31703984  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31703985 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 31704014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12127331 - 12127109
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||    
T  12127331 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgttatggttcatatgt----gtg 12127236  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||| ||    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  12127235 aaacaagaggtcagatattcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagaaacggtgagaaacttagagga 12127136  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  12127135 ccgaaataaatcaatttttagttagag 12127109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 25995956 - 25996130
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25995956 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtaatatgattaaatagtggctgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgtg 25996055  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatg 176  Q
    ||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25996056 aaataggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatg 25996130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39486441 - 39486251
Alignment:
Q  41 gtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaa 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||     
T  39486441 gtattatgattaaatagtgattgatattattagtaactattatggttcatatatatgtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaac 39486342  T
Q  141 ctttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486341 gtttatttgaatagaactaacagaaaagaccaaatgcagtaaatgtgagaaacttaaacgaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 39486251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 45843410 - 45843518
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45843410 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttag 45843509  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  45843510 ttagaggac 45843518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 1762967 - 1763084
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1762967 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 1763066  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  1763067 ttagaggaccaatttgat 1763084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27400702 - 27400597
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400702 ttatttattagtatcattttagtcttatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 27400603  T
Q  102 aaacag 107  Q
    ||||||    
T  27400602 aaacag 27400597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31703771 - 31703663
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31703771 cataacacaaaccccaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttag 31703672  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  31703671 ttagaggac 31703663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 240
Target Start/End: Original strand, 6798099 - 6798217
Alignment:
Q  122 tcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttta 221  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  6798099 tcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggatcgaaataaatcaattttta 6798198  T
Q  222 gttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  6798199 gttagaggaccaatctgat 6798217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16024055 - 16023946
Alignment:
Q  122 tcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttta 221  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  16024055 tcataacacaaaccctaacgtttatttgaataagactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 16023956  T
Q  222 gttagaggac 231  Q
    ||||||||||    
T  16023955 gttagaggac 16023946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 12481352 - 12481460
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  12481352 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 12481451  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  12481452 ttagaggac 12481460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 2064504 - 2064611
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2064504 cataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttag 2064603  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  2064604 ttagagga 2064611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37304186 - 37304077
Alignment:
Q  122 tcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttta 221  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  37304186 tcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggactgaaataaatcaattttta 37304087  T
Q  222 gttagaggac 231  Q
    ||||||||||    
T  37304086 gttagaggac 37304077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 49140436 - 49140552
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  49140436 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttataggaccgaaataaatcaa-ttttag 49140534  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  49140535 ttagaggactaatctgat 49140552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20306159 - 20306051
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20306159 cataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaaccaacagaaatgactaaatgtaataacggtgggaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttag 20306060  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  20306059 ttagaggac 20306051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 12127346 - 12127453
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  12127346 cataacacaaaccctaacgtttatttgaacaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaa 12127445  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  12127446 ttagagga 12127453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3089499 - 3089394
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3089499 cataacacaaaccctaacgtttatttgaattaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 3089400  T
Q  223 ttagag 228  Q
    ||||||    
T  3089399 ttagag 3089394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8760440 - 8760323
Alignment:
Q  112 tcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaa 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||    
T  8760440 tcaggtacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaagctaacataaatgactaaatgtagtaacactgaaaaacttagaggatcgaaataaa 8760341  T
Q  212 tcaatttttagttagagg 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8760340 tcaatttttagttagagg 8760323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Original strand, 27547970 - 27548079
Alignment:
Q  131 aaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27547970 aaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 27548069  T
Q  231 ctaatttgat 240  Q
    | ||| ||||    
T  27548070 ccaatctgat 27548079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2064489 - 2064385
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2064489 ttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactactattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 2064390  T
Q  102 aaaca 106  Q
    |||||    
T  2064389 aaaca 2064385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Original strand, 3089514 - 3089618
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3089514 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatgattcatatgtatatgtg 3089613  T
Q  102 aaaca 106  Q
    |||||    
T  3089614 aaaca 3089618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8762677 - 8762562
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8762677 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgaataaatagtaactgatattattggtaaatgttatagttcatatgtatgtgtg 8762578  T
Q  102 aaacaggagctcaggt 117  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8762577 aaacaggaggtcaggt 8762562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 229
Target Start/End: Original strand, 4330130 - 4330236
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  4330130 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaagagaaaggactaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 4330229  T
Q  223 ttagagg 229  Q
    |||||||    
T  4330230 ttagagg 4330236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 45052982 - 45053099
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  45052982 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacactgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttag 45053081  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  45053082 ttagaggaccaatctgat 45053099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37576338 - 37576226
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37576338 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatttagtaactttgataaatttagaggaccgaaataaatcaatttttag 37576239  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  37576238 ttagaggactaat 37576226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25995922 - 25995824
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  25995922 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttaattaaaggaccaatctgat 25995824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 27400717 - 27400815
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttta 221  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||||||||    
T  27400717 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaacaaaataaatcaattttta 27400815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 9006484 - 9006591
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  9006484 cataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaa-ggtgagaaacttggaggatccaaataaatcaatttttag 9006582  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  9006583 ttagaggac 9006591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 23476634 - 23476742
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  23476634 cataacacaaacattaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgaagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 23476733  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  23476734 ttagaggac 23476742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 26723094 - 26723198
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  26723094 cataacacgaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 26723193  T
Q  223 ttaga 227  Q
    |||||    
T  26723194 ttaga 26723198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 35612375 - 35612483
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  35612375 cataacacagaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacagtgataaacttagaggactgaaataaatcaatttttag 35612474  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  35612475 ttagaggac 35612483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 37285021 - 37285128
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37285021 cataacacaaaccctaacatttatttaaataaaactaacataag-gactaaatgtagtaattgtgagaaatttagagaatcgaaataaatcaatttttag 37285119  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  37285120 ttagaggac 37285128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 8762711 - 8762800
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762711 tttatttgaataaagctaacagaaaggactaaatgtagtaccgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 8762800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38000645 - 38000542
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |    
T  38000645 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaat 38000546  T
Q  224 taga 227  Q
    ||||    
T  38000545 taga 38000542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Original strand, 39486487 - 39486592
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  39486487 ataacacaaaccctaacgttt-tttgaataaaactaactgaaaggactaaatgtagtaacggtaaaaaacttagaaaacggaaataaatcaatttttagt 39486585  T
Q  224 tagagga 230  Q
    |||||||    
T  39486586 tagagga 39486592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23598201 - 23598116
Alignment:
Q  151 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23598201 ataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatt 23598116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49837493 - 49837420
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49837493 taacggaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 49837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Original strand, 37586005 - 37586093
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37586005 tttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaagaccgaaataaattaatttttaattagagga 37586093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38127866 - 38127762
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  38127866 cataaaacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagcaaggactaaatatagtaacagtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 38127767  T
Q  223 ttaga 227  Q
    |||||    
T  38127766 ttaga 38127762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Original strand, 34967050 - 34967123
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34967050 taacggaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttaatggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 34967123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Original strand, 38127881 - 38127970
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcata 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  38127881 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttattaaggtattatgattaaatagtgaatgatattattagtaactgttatagttcata 38127970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 49643964 - 49644080
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||| || | |||| ||||||||||||||     
T  49643964 cataacacaaacc-taacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggatggaaacttagaggaccgaattaaatcaatttttaa 49644062  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  49644063 ttagaggaccaatctgat 49644080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10831243 - 10831175
Alignment:
Q  168 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10831243 gactaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaggaaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatt 10831175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Original strand, 5537132 - 5537205
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537132 taacggaaatgactaaatgtagtaacagtgagaatcttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 5537205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46592934 - 46592862
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46592934 taacggaaatgactaaatgcagtaacagtgagaaacttaagggatcgaaataaatcattttttagttagagga 46592862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Original strand, 46593559 - 46593631
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46593559 taacggaaatgactaaatatagtaacagtgagaaacttaaggac-cgaaataaatcaatttttagttagaggac 46593631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4330115 - 4330043
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgat 74  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  4330115 ttatttattagtatcattttaatcatattccttgttaaggtattatggttaaatagtggctgatatcattgat 4330043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Original strand, 10831935 - 10831987
Alignment:
Q  179 gtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10831935 gtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 10831987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34966425 - 34966352
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34966425 taacataaaagactaaatgcagtaacagtgagaaacttaagggactgaaataaatcaagttttagttagaggac 34966352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 231
Target Start/End: Original strand, 37467563 - 37467621
Alignment:
Q  173 aatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37467563 aatgtagtaacagtgagaaacttaagggacctaaataaattaatttttagttagaggac 37467621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5536520 - 5536447
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   | | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5536520 taacggaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaagagacccaaataaatcaaattttaggtagaggac 5536447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 235
Target Start/End: Original strand, 13109200 - 13109232
Alignment:
Q  203 cgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13109200 cgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 13109232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 240
Target Start/End: Original strand, 4697172 - 4697209
Alignment:
Q  203 cgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4697172 cgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 4697209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13183843 - 13183810
Alignment:
Q  203 cgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13183843 cgaaataaatcaatttttagttagaagactaatt 13183810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50754 - 50525
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50754 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcttatgtatgtgtg 50655  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50654 aaagaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaataacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagga 50555  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50554 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 50525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 50769 - 50876
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  50769 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttag 50868  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  50869 ttagagga 50876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 83)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6505814 - 6505586
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6505814 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 6505715  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  6505714 aaacaggaagtcaggtacccacataacacaaaccct-aactttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 6505616  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6505615 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 6505586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33091731 - 33091502
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091731 ttatttattagtatcattttggtcctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 33091632  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |    
T  33091631 aaacaggaggtcatgtacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgcagtaatggtgagaaacttagagga 33091532  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  33091531 tcaaaataaatcaatttttagttagaggac 33091502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44991556 - 44991328
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991556 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 44991457  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  44991456 aaacag-aggtcaggtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 44991358  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44991357 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 44991328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 50768993 - 50769221
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50768993 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 50769092  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| |||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  50769093 aaacaggaggtcagatacacacataacaaaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaaagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 50769192  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50769193 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 50769221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50508735 - 50508512
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  50508735 ttatttattagtattattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgcg 50508636  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50508635 aaacaggaggtcaggtacctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagga 50508536  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagtta 225  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  50508535 ccgaaataaatcaatttttagtta 50508512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 14985503 - 14985741
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14985503 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactcttatggctcatatgtatgtgtg 14985602  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  14985603 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 14985702  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  14985703 tcaaaataaatcaatttttagttagatgaccaatctgat 14985741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42855617 - 42855388
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42855617 ttatttattagtatcattttggtcctattcctcgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgttgtggttcatatatatgtgtg 42855518  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  42855517 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacctttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 42855418  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855417 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 42855388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53751180 - 53750951
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53751180 ttatttattagtataattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgtg 53751081  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  53751080 aaacaggaggtcagatacctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 53750981  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750980 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 53750951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43566656 - 43566418
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43566656 ttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtgtg 43566557  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  43566556 aaacaggaggtcaagtagccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaattgtagtaacggtgagaaacttagagga 43566457  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43566456 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 43566418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46849947 - 46849709
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46849947 ttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 46849848  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  46849847 aaacaggggttcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagagga 46849748  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  46849747 tcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 46849709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19088619 - 19088391
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088619 ttatttattagtatcattttgatcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 19088520  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |    
T  19088519 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtattaaacttagagga 19088420  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088419 ccgaaataaatcaatttttagttagagga 19088391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 38339664 - 38339892
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38339664 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacacatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 38339763  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || |    
T  38339764 aaacaggaggtcaggtatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacagtgtgaaacttagagga 38339863  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38339864 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 38339892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41878137 - 41877900
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878137 ttatttattagtatcattttggtcatattatttgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 41878038  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |    
T  41878037 aaacaggatgtcaggtacctacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgag-aacttagagga 41877939  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  41877938 ccgaaataaatcaatttttagttagatgaccaatctgat 41877900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 8592141 - 8592370
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8592141 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 8592240  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8592241 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 8592340  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8592341 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 8592370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 24898361 - 24898590
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898361 ttatttattagtatcattttggtcacatgtcttgttaatgtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 24898460  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24898461 aaacaggaggtcagacacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 24898560  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898561 tcaaaataaatcaatttttagttagaggac 24898590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37206705 - 37206467
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37206705 ttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtggctgatattattggtaacttttatggttcatatgtatgtgtg 37206606  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |    
T  37206605 aaacaggaggtcaggtatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgaaaaacttagagga 37206506  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  37206505 ccgaaataaatcaatttttaactagaggattaatctgat 37206467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53995212 - 53994974
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  53995212 ttatttattaatatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgatatggttcatatgtatgtgtg 53995113  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| || || ||| |||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53995112 aaatagaaggtcaagtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagga 53995013  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  53995012 ccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgat 53994974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53259416 - 53259187
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53259416 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaacaatgagtgatattattggtaattattatggttcatatgtatgtgtg 53259317  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  53259316 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 53259217  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53259216 ccgaaattaattaatttttagttagaggac 53259187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30683806 - 30683576
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30683806 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatattattggcaactgttatggttcatatgtatgtgtg 30683707  T
Q  102 aaacaggagctcaggtacct-tcataacacaaaccctaaactttatttgaat-aaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaag 199  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30683706 aaacagaagatcaggtacctcacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagag 30683607  T
Q  200 aatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  30683606 gaccgaaataaatcaatttttaattggagga 30683576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1433549 - 1433320
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1433549 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttatggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 1433450  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| | ||| |||| |||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1433449 aaataagaggtcagatactcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacgatgagaaacttagagaa 1433350  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1433349 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 1433320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23755696 - 23755467
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23755696 ttatttattagtatcattttggtcatatgctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 23755597  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||||| |  | ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  23755596 aaacaggaggtcaggtagccacgtaacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacgataagaaacttagagaa 23755497  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23755496 ccgaaataaattaatttttagttagaggac 23755467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15477920 - 15477694
Alignment:
Q  5 tttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15477920 tttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactcatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtatgaaa 15477821  T
Q  105 caggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcg 204  Q
    ||| || |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||    
T  15477820 cagaaggtcaggtacccacataacacaaacactaacgtttattttaataaaactaacagaatggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccg 15477721  T
Q  205 aaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15477720 aaataaatcaatgtttagttagaggac 15477694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41752094 - 41751866
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| |||||||||  |  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41752094 ttatttattaatatcattttgatcatatgccttgctaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatttgtg 41751995  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41751994 aaacaggatgtcaggtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagtaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaag-a 41751896  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41751895 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 41751866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16038072 - 16037834
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16038072 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaagtagtgacggatattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 16037973  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| | |||||||   ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  16037972 aaataggaggttaggtacccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 16037873  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16037872 ccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 16037834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19508691 - 19508461
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19508691 ttatttattagtatgattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattagtaactgttatggttcacatgtatgtgtg 19508592  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaa-ccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaga 200  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||     
T  19508591 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaacccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtcacagtgagaaacttagagg 19508492  T
Q  201 atcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
      ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19508491 gccgacataaatcaattgttagttagaggac 19508461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21763459 - 21763229
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21763459 ttatttattagtatcattttgtttttatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatctatgtgtg 21763360  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaat-aaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaga 200  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||     
T  21763359 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaaacaaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacctggagg 21763260  T
Q  201 atcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21763259 accgaaataaatcaatttttagttggaggac 21763229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39448766 - 39448532
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39448766 ttatttattagcatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactcttatggttcatatgtatgtgtg 39448667  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||  |||| ||||  |||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39448666 aaacaagatgtcagatacccacataacacaaactctaacgcttatttaaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagga 39448567  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39448566 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatt 39448532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 43734564 - 43734326
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  43734564 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattatttgtaactgttatggtttatatgtatgtgtg 43734465  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  43734464 aaataggagatcagatacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 43734365  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43734364 ccgaaataaatctatttttagttagaggaccaatctgat 43734326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 6712135 - 6712362
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6712135 ttatttattagtatcattttggtcctgtgccttattaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaaatgttatggttcatatgtatgtgtg 6712234  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| || |    
T  6712235 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtga-aaatttagagga 6712333  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6712334 ccgaaataaatcaatttgtagttagagga 6712362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25182090 - 25181861
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||  |||||||| || |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25182090 ttatttattaacatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 25181991  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| ||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |    
T  25181990 aaataggaggtcagatacccatataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaaga 25181891  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25181890 ccaaaataaatcaatttttagttaaaggac 25181861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52557365 - 52557131
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  52557365 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtaactgatattattggtaattgttataattcatatgtatgtctg 52557266  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||  | ||| |||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |    
T  52557265 aaacagacggtcaagtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtaagaaacttatagga 52557166  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52557165 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatt 52557131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 623957 - 623728
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  623957 ttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaagatattatgattaaatagtgacagatattattggtaactgttatggttcatatatatgtgtg 623858  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   |||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  623857 aaataggaggtcaggtacccatataacataaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttatagga 623758  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  623757 ccaaaataaaacaatttttagttagaggac 623728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36122710 - 36122473
Alignment:
Q  3 tatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtga 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36122710 tatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgactaaatagtgattgatattattggtagctgatatggttcatatgtatgtgtga 36122611  T
Q  103 aacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaat 202  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||| |  |     
T  36122610 aacaggagatcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggattaaatgtagtaacagtgaaaaacttagatgac 36122511  T
Q  203 cgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36122510 aaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 36122473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 12817978 - 12818204
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12817978 ttatttatcagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattgttaaatgttatggttcatatatatgtgtg 12818077  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| || || ||||  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  12818078 aaagagaaggtcagagacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagagga 12818177  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12818178 ccgaaataaatcaagttttagttagag 12818204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8398264 - 8398071
Alignment:
Q  46 atgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaacttta 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  8398264 atgactaaatagtgactgatattattgataactattatggtttatatgtatgtgtggaacaggaggtcag-tacccacataacacaaaccctaacattta 8398166  T
Q  146 tttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8398165 tttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacaatgagaaagttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 8398071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 16038087 - 16038204
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  16038087 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 16038186  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  16038187 ttagaggaccaatctgat 16038204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 46849962 - 46850079
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  46849962 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 46850061  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  46850062 ttagaggactaatctgat 46850079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8592126 - 8592018
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  8592126 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 8592027  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  8592026 ttagaggac 8592018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 19088634 - 19088751
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  19088634 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 19088733  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  19088734 ttagaggattaatctgat 19088751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 33091746 - 33091854
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||    
T  33091746 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagatgactgaaataaatcaatttttag 33091845  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  33091846 ttagaggac 33091854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 42855632 - 42855740
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  42855632 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 42855731  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    || ||||||    
T  42855732 ttggaggac 42855740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 25182105 - 25182212
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  25182105 cataacacaaactcaaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 25182204  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  25182205 ttagagga 25182212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 53259431 - 53259538
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  53259431 cataacacaaactctaacgtgtatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 53259530  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  53259531 ttagagga 53259538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Original strand, 39448782 - 39448888
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  39448782 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 39448881  T
Q  224 tagagga 230  Q
    |||||||    
T  39448882 tagagga 39448888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6712120 - 6712003
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  6712120 cataacagaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 6712021  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  6712020 ttagaggaccaatctgat 6712003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23756078 - 23755985
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgta 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756078 ttatttattagtatcattttggtcatatgttttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgta 23755985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 37206720 - 37206837
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37206720 cataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacgatgaaaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttag 37206819  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  37206820 ttagaggactaatctgat 37206837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 53751195 - 53751312
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  53751195 cataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 53751294  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  53751295 ttagaggaccaatctgat 53751312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14985488 - 14985380
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  14985488 cataacacgaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 14985389  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  14985388 ttagaggac 14985380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 21763474 - 21763586
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  21763474 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggattaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 21763573  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  21763574 ttagaggactaat 21763586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 30683821 - 30683929
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  30683821 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgcgaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 30683920  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  30683921 ttagaggac 30683929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 43566671 - 43566779
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  43566671 cataacacaaatcctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaagactgaaataaatcaatttttag 43566770  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  43566771 ttagaggac 43566779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20888300 - 20888193
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  20888300 cataacacaaaccctaacattcatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 20888201  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  20888200 ttagagga 20888193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24898346 - 24898239
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  24898346 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaa 24898247  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  24898246 ttagagga 24898239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 231
Target Start/End: Original strand, 15477940 - 15478046
Alignment:
Q  125 taacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagtt 224  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  15477940 taacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaattaatcaatttttagtt 15478039  T
Q  225 agaggac 231  Q
    |||||||    
T  15478040 agaggac 15478046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 19508706 - 19508823
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  19508706 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaagggtgagaaacttggaggaccgaaataaatcaatttttag 19508805  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  19508806 ttagaggaccaatctgat 19508823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38339649 - 38339532
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  38339649 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaccgaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaacttagaggacctaaataaatcaatttttag 38339550  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  38339549 ttagaggaccaatctgat 38339532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 43734579 - 43734696
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  43734579 cataacacaaatcttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaatttttag 43734678  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  43734679 ttagaggaccaatctgat 43734696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 50768978 - 50768865
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  50768978 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaagtactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 50768879  T
Q  223 ttagaggactaatt 236  Q
    ||||| ||| ||||    
T  50768878 ttagatgaccaatt 50768865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 623972 - 624080
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  623972 cataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 624071  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  624072 ttagaggac 624080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44957546 - 44957438
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  44957546 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgcagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 44957447  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  44957446 ttagaggac 44957438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Original strand, 44957561 - 44957661
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44957561 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgataatgtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 44957660  T
Q  102 a 102  Q
    |    
T  44957661 a 44957661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 53995227 - 53995340
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaat--gactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  53995227 cataacacaaaccctaa-cgttatttgaataaaactaacataaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttt 53995325  T
Q  221 agttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||||    
T  53995326 agttagaggactaat 53995340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12817963 - 12817855
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12817963 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaagggctaaatgtagtaacagtgataaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttag 12817864  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  12817863 ttagaggac 12817855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 23756093 - 23756201
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||    
T  23756093 cataacgcaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaattaatttttag 23756192  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    ||| |||||    
T  23756193 ttaaaggac 23756201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Original strand, 25269312 - 25269400
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25269312 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 25269400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 41752109 - 41752217
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||    
T  41752109 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactacatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatgaatttttag 41752208  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  41752209 ttagaggac 41752217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 44957669 - 44957767
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44957669 tttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaaatgtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatttgat 44957767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 1433564 - 1433681
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||    
T  1433564 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaaattagaggaccaaaataaatcaatttttag 1433663  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  1433664 ttagaggaccaatctgat 1433681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 41878152 - 41878268
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  41878152 cataacataaaccctaacatttatttgaataaaactagcagaaaggactaa-tgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgcaataaatcaatttttag 41878250  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  41878251 ttagaggactaatctgat 41878268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 52557380 - 52557497
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||    
T  52557380 cataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccaaaataaatcaatttttag 52557479  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||| ||| ||| ||||    
T  52557480 ttagaagaccaatctgat 52557497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 36122727 - 36122833
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  36122727 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaat-aatcaatttttagt 36122825  T
Q  224 tagaggac 231  Q
    ||||||||    
T  36122826 tagaggac 36122833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 44991571 - 44991678
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||    
T  44991571 cataacacaaaccctaacgtttatttgaacaaaactaacaaaaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttcag 44991670  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  44991671 ttagagga 44991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44125755 - 44125665
Alignment:
Q  147 ttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaattt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  44125755 ttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaaaaaatcaatttttagttagagaaccaattt 44125665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Original strand, 44125782 - 44125867
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  44125782 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttaga 44125867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 50508750 - 50508867
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  50508750 cataacataaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgcagtaacggtgaaaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 50508849  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||| ||| ||| ||||    
T  50508850 ttagatgaccaatctgat 50508867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 230
Target Start/End: Original strand, 49135928 - 49136037
Alignment:
Q  125 taacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaac----agaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttt 220  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  49135928 taacacaaatcctaacgtttatttgaataaaattgacataaagaaataactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaattttt 49136027  T
Q  221 agttagagga 230  Q
    ||||||||||    
T  49136028 agttagagga 49136037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55022421 - 55022334
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022421 tttattttaataaaactaacagaaagga-taaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagagga 55022334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Original strand, 52692768 - 52692841
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  52692768 taacggaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggac 52692841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Original strand, 4513254 - 4513316
Alignment:
Q  168 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4513254 gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttagagga 4513316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47603065 - 47602992
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  47603065 taacggaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttaattagaggac 47602992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52692122 - 52692064
Alignment:
Q  182 acggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52692122 acggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 52692064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 240
Target Start/End: Original strand, 47603710 - 47603771
Alignment:
Q  179 gtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  47603710 gtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaattaatttttagttagaggaccaatctgat 47603771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54108180 - 54107951
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54108180 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcataggtatgtgtg 54108081  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  54108080 aaacaggagctcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 54107981  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54107980 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 54107951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 29818349 - 29818587
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29818349 ttatttattagtatcattttggtcatatgttttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 29818448  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||  ||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29818449 aaacaggaggtcaaatacccacataacacaatccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagga 29818548  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29818549 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 29818587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 42591956 - 42592194
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42591956 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 42592055  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| || |  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  42592056 aaagaggaggtcagatatccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 42592155  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42592156 tcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatttgat 42592194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 54752335 - 54752561
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54752335 ttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 54752434  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  54752435 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttagagca 54752534  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  54752535 ccgaaataaatcaatttttagttagag 54752561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39664462 - 39664233
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39664462 ttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaaatgttatagttcatatgtatgtgtg 39664363  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  39664362 aaataagaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 39664263  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39664262 ccgaaataaatcattttttagttagaggac 39664233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 53716465 - 53716703
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53716465 ttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 53716564  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |    
T  53716565 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgttaatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaatgatgataaacttaaagga 53716664  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  53716665 ccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgat 53716703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8474124 - 8473895
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8474124 ttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 8474025  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||| |||   ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  8474024 aaacaagaggtcagatactcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagta 8473925  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8473924 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 8473895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 21568917 - 21569150
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21568917 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactaatattattggtaactataatggttcatatgtatgtgtg 21569016  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21569017 aaacagaaggtcaagtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 21569116  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569117 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 21569150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10506226 - 10505988
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10506226 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatggttcatatgtatatgtg 10506127  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  10506126 aaacaggaggtcaggtacccatatgacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatggtgagaaacttagagga 10506027  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10506026 ccgaaataaatcaatttttagttaaaggactaatctgat 10505988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 27801661 - 27801895
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27801661 ttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtg 27801760  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| || || |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27801761 aaatagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 27801860  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27801861 ccgaaataaatcattttttaattagaggaccaatt 27801895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 24428741 - 24428977
Alignment:
Q  4 atttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaa 103  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24428741 atttattagtatcattttgctcctatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattatgcttcatatgtatgtgtgaa 24428840  T
Q  104 acaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatc 203  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | |    
T  24428841 acaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagacc 24428940  T
Q  204 gaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24428941 gaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 24428977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 11256275 - 11256513
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11256275 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 11256374  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||| || ||  |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  11256375 aaataggaggtcaagtgcccacatagcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatttagtaacggtgagaaacttaaagga 11256474  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11256475 ccgaaataaatcattttttagttagaggaccaatctgat 11256513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 18464628 - 18464862
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18464628 ttatttattagtatcattttggtcatatgcattgttaaggtattatggttaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcctatgtatatgtg 18464727  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  18464728 aaacagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgataaacttagagga 18464827  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18464828 ccgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatt 18464862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 15986407 - 15986635
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15986407 ttatttattagtatcattttggtcctattcgt-gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 15986505  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15986506 atacaggaggtcaggtacctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaacttattgaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 15986605  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15986606 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 15986635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26318460 - 26318231
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26318460 ttatttattagtatcattttggtcatattctttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 26318361  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||  |||   ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26318360 aaacaagaggtcaaatactcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 26318261  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26318260 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 26318231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51509397 - 51509168
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  51509397 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtacgtgtg 51509298  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  51509297 aaataggaggtcagatacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtaggaacggtgagaaacttagagga 51509198  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51509197 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 51509168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41835204 - 41834966
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835204 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaatgtattttgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 41835105  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  41835104 aaacaggaggtcaagtacccacataacacaaaccctaacgtttatttaaatacaactaacagaaaggattaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 41835005  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41835004 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 41834966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5900701 - 5900472
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5900701 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatttttggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 5900602  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5900601 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 5900502  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5900501 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 5900472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12203829 - 12203604
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12203829 ttatttattagtatcattttggtaatatgttttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 12203730  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  12203729 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 12203630  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
     ||||||| | |||||||||||||||    
T  12203629 ccgaaatataccaatttttagttaga 12203604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 22152017 - 22152245
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22152017 ttatttattagtatcattttggtcctattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 22152116  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || |||| ||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |    
T  22152117 aaacagaaggtcagatacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaacgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagagga 22152216  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
      |||||||||||||||||||||||||||    
T  22152217 ctgaaataaatcaatttttagttagagga 22152245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 22201788 - 22202026
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22201788 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattggtaactattatggttcatatgtatgtatg 22201887  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||  ||| |||||  |||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  22201888 aaacaggatgtcatgtacccacatagcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaaccgtgagaaacttagagga 22201987  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22201988 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 22202026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47303296 - 47303067
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| |||||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47303296 ttatttatta-tatcattttgatcatatgccttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatatgtg 47303198  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  47303197 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 47303098  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggact 232  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47303097 ccgaaataaattaatttttaattagaggact 47303067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 47669431 - 47669657
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47669431 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagatattatgattaaatagtgatagatattattgataactgttatggttcatatgtgtgtgtg 47669530  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  47669531 aaacaggaggtcaggtgcccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagtaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 47669630  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     |||||||||| |||||||||||||||    
T  47669631 ccgaaataaattaatttttagttagag 47669657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 39241530 - 39241741
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39241530 ttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataattgttatggttcatatgtatgtgtg 39241629  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  39241630 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 39241729  T
Q  202 tcgaaataaatc 213  Q
     |||||||||||    
T  39241730 ccgaaataaatc 39241741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 19883411 - 19883638
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatta-ttgataactgttatggttcatatgtatgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19883411 ttatttattagtatcattttggttctaagtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattaattggtaaatgttatggttcatatgtatgtgt 19883510  T
Q  101 gaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaga 200  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  19883511 gaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaataaaaacgattaaatgtagtaactgtgagaaacttagagg 19883610  T
Q  201 atcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19883611 accgaaataaatcattttttagttagag 19883638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 21969801 - 21970039
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21969801 ttatttattagtatcgttttggtcttattccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 21969900  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| || || |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |    
T  21969901 aaatagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagagga 21970000  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21970001 ctgaaataaatgaatttttagttagaggaccaatctgat 21970039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 21992237 - 21992475
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21992237 ttatttattagtatcgttttggtcttattccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 21992336  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| || || |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |    
T  21992337 aaatagaaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaactcagagga 21992436  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21992437 ctgaaataaatgaatttttagttagaggaccaatctgat 21992475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 44893912 - 44894150
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44893912 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaagatattatgatcaaatagtgactgatatcattggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 44894011  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| || |  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  44894012 aaataggaggtcagatatccacataacacaaactctaatgtttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggt 44894111  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44894112 ccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgat 44894150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1994446 - 1994218
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994446 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaga-attatgattaaatagtgagcgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 1994348  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  1994347 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgagaaacttagagga 1994248  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1994247 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 1994218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32633343 - 32633146
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32633343 ttatttattagtatcattttggtcatatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgtg 32633244  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaag 199  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32633243 aaacaggaggtcaggtacccacatatcataaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaag 32633146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4757771 - 4757543
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757771 ttatttattagcatcattttggttctattccttgataaga-attatgatcaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 4757673  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  4757672 aaataggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagaataaatgtagtaatggtgagaaacttagagga 4757573  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4757572 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 4757543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 16931778 - 16932007
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16931778 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattaagattaaatagttactgatattattggtagctgttatggttcatatgtatgtgtg 16931877  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| || |   || |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16931878 aaacaggaggtcagatagccatatgacacaaactctaacgtttatttgaataagactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 16931977  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931978 cagaaataaatcaatttttagttagaggac 16932007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 46152785 - 46153008
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  46152785 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaacggttatggttcatatgtacgtgtg 46152884  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| |||   |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| || |    
T  46152885 aaagaggaggtcagatactcacataacacaaacctcaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagta---gtgagaaacttatagga 46152981  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  46152982 ccgaaataaatcaatttttagttagag 46153008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 39951529 - 39951748
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39951529 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatatatgtgtg 39951628  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| |||||  |||||| |||| |    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  39951629 aaacaggaggtcagatacccacataactcaaaacctaatgtttattcgaatga----aacagaaatgactaaatgtaataacgttgaaaaacttagagaa 39951724  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagtta 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  39951725 ttgaaataaatcaatttttagtta 39951748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 4773414 - 4773642
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4773414 ttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatgtttcatttgtatgtgtg 4773513  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||||  |||  |||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  4773514 aaataggaggtcagacacccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaaga 4773613  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4773614 ccaaaataaatcaatttttagttagagga 4773642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1999537 - 1999377
Alignment:
Q  71 tgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgac 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1999537 tgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggac 1999438  T
Q  171 taaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1999437 taaatgtagcaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggac 1999377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28986395 - 28986261
Alignment:
Q  45 tatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaacttt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||| |||||| ||||  |||    
T  28986395 tatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtgaaagaggaggtcagatacccacataatacaaactctaacgttt 28986296  T
Q  145 atttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986295 atttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 28986261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 4757786 - 4757894
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  4757786 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 4757885  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  4757886 ttagaggac 4757894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 5900716 - 5900824
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  5900716 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 5900815  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  5900816 ttagaggac 5900824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29818333 - 29818217
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  29818333 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttatt 29818234  T
Q  224 tagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||| ||||    
T  29818233 tagaggactaatctgat 29818217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21568903 - 21568796
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  21568903 cataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaa 21568804  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  21568803 ttagagga 21568796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46152771 - 46152654
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  46152771 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtgatggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 46152672  T
Q  224 tagaggactaatttgatg 241  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  46152671 tagaggactaattcgatg 46152654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 10506241 - 10506349
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  10506241 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 10506340  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  10506341 ttagaggac 10506349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44893897 - 44893793
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  44893897 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 44893798  T
Q  223 ttaga 227  Q
    |||||    
T  44893797 ttaga 44893793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47669416 - 47669304
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  47669416 cataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttag 47669317  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  47669316 ttagaggactaat 47669304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 1994461 - 1994578
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1994461 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaaataacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 1994560  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  1994561 ttagaggaccaatctgat 1994578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18464618 - 18464505
Alignment:
Q  118 accttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatt 217  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  18464618 acctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 18464519  T
Q  218 tttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||    
T  18464518 tttagttagaggac 18464505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24428724 - 24428607
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24428724 cataacacaaatcccaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttag 24428625  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  24428624 ttagaggaccaatctgat 24428607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 230
Target Start/End: Original strand, 45306991 - 45307092
Alignment:
Q  129 acaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45306991 acaaaccctaacatttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 45307090  T
Q  229 ga 230  Q
    ||    
T  45307091 ga 45307092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 26318475 - 26318587
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  26318475 cataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 26318574  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||| ||||    
T  26318575 ttagaggattaat 26318587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39241515 - 39241407
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  39241515 cataacacaaacattaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 39241416  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  39241415 ttagaggac 39241407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42591941 - 42591833
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  42591941 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttag 42591842  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  42591841 ttagaggac 42591833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 54108195 - 54108303
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  54108195 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaataacactgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 54108294  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  54108295 ttagaggac 54108303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53716449 - 53716334
Alignment:
Q  125 taacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagtt 224  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  53716449 taacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaccaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagtt 53716350  T
Q  225 agaggactaatttgat 240  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  53716349 agaggaccaatctgat 53716334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Original strand, 47303315 - 47303417
Alignment:
Q  129 acaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||    
T  47303315 acaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttacttagag 47303414  T
Q  229 gac 231  Q
    |||    
T  47303415 gac 47303417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 8474139 - 8474252
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  8474139 cataacacaaacactaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtcataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaa 8474238  T
Q  223 ttagaggactaatt 236  Q
    ||||||||||||||    
T  8474239 ttagaggactaatt 8474252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16931763 - 16931658
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  16931763 cataacacaaaccctaacgtatatttgtataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 16931664  T
Q  223 ttagag 228  Q
    ||||||    
T  16931663 ttagag 16931658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15986392 - 15986280
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  15986392 cataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgcagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 15986293  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
     ||| ||||||||    
T  15986292 ctaggggactaat 15986280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21969786 - 21969674
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  21969786 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaagtaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttag 21969687  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  21969686 ttagaggactaat 21969674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21992222 - 21992110
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  21992222 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaagtaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttag 21992123  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  21992122 ttagaggactaat 21992110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22152002 - 22151890
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  22152002 cataacacaaactctatcgtttatttgaataaaattaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaaccgaaataaatcaatttttag 22151903  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  22151902 ttagaggactaat 22151890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 32633358 - 32633466
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  32633358 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 32633457  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    ||| |||||    
T  32633458 ttaaaggac 32633466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39951514 - 39951402
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  39951514 cataacacaaactctaacatttatttgaataaaactaacataaagaactaaatatagtaacgatgagaaacttaaaggatcgaaataaatcaatttttaa 39951415  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  39951414 ttagaggactaat 39951402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 12203844 - 12203951
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  12203844 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactatcagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaa 12203943  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  12203944 ttagagga 12203951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 39664477 - 39664584
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  39664477 cataacagaaactctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttag 39664576  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  39664577 ttagagga 39664584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Original strand, 51509412 - 51509517
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  51509412 cataatacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttag 51509511  T
Q  223 ttagag 228  Q
    ||||||    
T  51509512 ttagag 51509517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 12791473 - 12791577
Alignment:
Q  127 acacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttag 226  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  12791473 acacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttaattag 12791572  T
Q  227 aggac 231  Q
    |||||    
T  12791573 aggac 12791577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22201773 - 22201666
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||     
T  22201773 cataacacaaaccttaacgtttatttgaataaacctaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggacagaaataaatcaatttttat 22201674  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  22201673 ttagagga 22201666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 28986436 - 28986542
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  28986436 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaat-tagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 28986534  T
Q  224 tagaggac 231  Q
    || |||||    
T  28986535 taaaggac 28986542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45306970 - 45306877
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45306970 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaaattttagttagaggactaat 45306877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27801646 - 27801538
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27801646 cataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatctagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 27801547  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  27801546 ttagaggac 27801538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54752320 - 54752212
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  54752320 cataacacaaaccataatgtttatttgaataaaactaacagaaaggatcaaatgtagtaacggtgagaaacttatatgaccgaaataaatcaatttttag 54752221  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    ||| |||||    
T  54752220 ttacaggac 54752212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4773384 - 4773293
Alignment:
Q  139 aactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4773384 aactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagagga 4773293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11256260 - 11256153
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  11256260 cataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactatcaaaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaacttaaaggatcgaaataaattattttttag 11256161  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  11256160 ttagagga 11256153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Original strand, 41835221 - 41835332
Alignment:
Q  125 taacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagtt 224  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  41835221 taacacaaacactaacgtttatttaaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaatt 41835320  T
Q  225 agaggactaatt 236  Q
    | || |||||||    
T  41835321 aaagaactaatt 41835332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 7681447 - 7681522
Alignment:
Q  154 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagg 229  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7681447 aaactaacagaaaggactgaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagagg 7681522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15790796 - 15790719
Alignment:
Q  163 gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15790796 gaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggatggaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 15790719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13866148 - 13866069
Alignment:
Q  152 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13866148 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggac 13866069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Original strand, 44317537 - 44317616
Alignment:
Q  152 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  44317537 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggac 44317616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 230
Target Start/End: Original strand, 20963534 - 20963625
Alignment:
Q  139 aactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20963534 aacttttttttaataaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagagga 20963625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28985620 - 28985549
Alignment:
Q  169 actaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  28985620 actaaatgtaataacggtgagaaacttataggaccgaaataaatcaaattttagttagaggaccaatctgat 28985549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49528277 - 49528198
Alignment:
Q  152 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  49528277 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagctagaggac 49528198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7163568 - 7163503
Alignment:
Q  162 agaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  7163568 agaaaggactaaatgtagtaactgtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttaga 7163503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 228
Target Start/End: Original strand, 15791454 - 15791507
Alignment:
Q  175 tgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15791454 tgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag 15791507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Original strand, 49529076 - 49529157
Alignment:
Q  150 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| | | | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49529076 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggac 49529157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44316756 - 44316673
Alignment:
Q  150 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaa 234  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| | | | ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44316756 aataaaattaacggaaaggactaaaagtagtaacagagagaaatttaagggacc-aaataaatcaaattttagttaggggactaa 44316673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 8600 - 8829
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8600 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatgtgtatgtgtg 8699  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8700 aaacaggaggtcagatacccgcataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaa 8799  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
       |||||||||||||||||||||||||||    
T  8800 cataaataaatcaatttttagttagaggac 8829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8483
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8585 cataacacaaacctcaacgtttatttgaataaaactaacagaaaatactaaatattgtaacagtgagaaacttaaaggatcgaaataaatcaatttttag 8486  T
Q  223 tta 225  Q
    |||    
T  8485 tta 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 6356937 - 6357166
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356937 ttatttattagtatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaacagtgattgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 6357036  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  6357037 aaagaggaggtcaggtatccacatagcacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaactgtgagaaacttagagga 6357136  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6357137 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 6357166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31638221 - 31637983
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31638221 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 31638122  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||||||| |  | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |      
T  31638121 aaataggaggtcaggtatccacgtaacacaaaccctaacgtttatatgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggt 31638022  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31638021 tcgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 31637983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21391468 - 21391230
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21391468 ttatttattagtatcattttgatcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtgtg 21391369  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  21391368 aaacaggaggtcaggtatccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaaagactaaatgtagtagcggtgagaaacttagagga 21391269  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21391268 ccgaaataaatcaatttttagttagaggactaatctgat 21391230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7579150 - 7578921
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  7579150 ttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgta 7579051  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| || |    
T  7579050 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgaagtaacattgagaaacttagagga 7578951  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7578950 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 7578921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41453283 - 41453054
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41453283 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 41453184  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  41453183 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 41453084  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41453083 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 41453054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 28297991 - 28298218
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28297991 ttatttattagtatcattttggtcatatgactagttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattaataacttttatggttcatatgtatctgtg 28298090  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28298091 aaacaggaggtcaagtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaa 28298190  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagg 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28298191 tcgaaataaatcaatttttaattagagg 28298218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 36423541 - 36423779
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36423541 ttatttattagtatcattttggtcctatacctggttaaggtattatgatcaaatagtgactgatactatcggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 36423640  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  36423641 aaacaggagatcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacggtgagaaacttagagga 36423740  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36423741 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 36423779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35146976 - 35146748
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||| | ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35146976 ttatttatcaatatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtaagtgtg 35146877  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || |||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  35146876 aaacag-aggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 35146778  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35146777 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 35146748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48626341 - 48626115
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626341 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 48626242  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||| |||   ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  48626241 aaacaagaggtcagatactcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 48626142  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  48626141 ccgaaataaatcaatttttagttagag 48626115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8937127 - 8936898
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| |||||| || ||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8937127 ttatttattaatatcatgttggtcatattccttgttaaggtattgtgattaaatagtgattgatattattggtaactgttttggttcatatgtatgtgtg 8937028  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  8937027 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaaaagtgagaaacttagagga 8936928  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8936927 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 8936898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 10526483 - 10526711
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10526483 ttatttattagtatcattttggtccaatgcct-gttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgttatgtttcatatgtatttgtg 10526581  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| |||  ||||||||  ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  10526582 aaacaagaggccaggtacccacataacacaaaacttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 10526681  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10526682 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 10526711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28286395 - 28286157
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28286395 ttatttattagtatcattttggaactattccttcttaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattggcaactgtaatggttcatatctatgtgtg 28286296  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  28286295 aaacaggaggtcagacacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagagga 28286196  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28286195 ccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 28286157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41191963 - 41191731
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatt---gataactgttatggttcatatgtatgt 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||    
T  41191963 ttatttattagtatcattttggtcatatttcttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattattggtaactattatggttcatatgtatgt 41191864  T
Q  99 gtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaa 198  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41191863 gtgaaacatgaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaga 41191764  T
Q  199 gaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41191763 gaactgaaataaaccaatttttagttagaggac 41191731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17750187 - 17749987
Alignment:
Q  28 atgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataa 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||   ||||    
T  17750187 atgccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattgataacttttatagttcatatgtatgtgtgaaacaagaggtcatgtacccatataa 17750088  T
Q  128 cacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  17750087 cacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttaga 17749988  T
Q  228 g 228  Q
    |    
T  17749987 g 17749987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Original strand, 1114257 - 1114446
Alignment:
Q  42 tattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaac 141  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||      
T  1114257 tattatgattaaatagtgacgggtattattggtaactgttatggttcatatatatgtgtgaaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacg 1114356  T
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1114357 tttatttgaataaaactaacagaaaagagtaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggac 1114446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 6356457 - 6356686
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  6356457 ttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatgtttcatttgtatgtgtg 6356556  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||||  |||  |||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  6356557 aaataggaggtcagacacccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 6356656  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356657 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 6356686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19681773 - 19681544
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||   ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681773 ttatttattagtatcattttggtcatatttcttgttaatgcattatgattaaatattgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 19681674  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||| || |    
T  19681673 aaacaggaggtcaaatacccacataacacaaaccctaacgtttattcgactaaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacggcaaaaaacttagagga 19681574  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681573 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 19681544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 231
Target Start/End: Original strand, 17363437 - 17363637
Alignment:
Q  33 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttc----atatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||| |||| || |   |||||    
T  17363437 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtatgtgtgaaagaggaggtcagatatccatataac 17363536  T
Q  129 acaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17363537 acaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacatt--gaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 17363634  T
Q  229 gac 231  Q
    |||    
T  17363635 gac 17363637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 33716760 - 33716980
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  33716760 ttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgttatggttca----tatgtgtg 33716855  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |    
T  33716856 aaacaggaggtcaggtacccacataacaccaaccctaacgtttatttgaacaaaattaacataaatgact-aatgtagtaacaatgagaaacttaaatga 33716954  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  33716955 ccgaaataaattaatttttagttaga 33716980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 41751822 - 41752060
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41751822 ttatttattagtattattttggtcctatgtcttgttaagttattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgattcatatgtatgtgtg 41751921  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||  ||||  |||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||| |  ||||||||| || |    
T  41751922 aaacaggaggtcatatacccacatagcataaaccctaatgtttatttgattaaaactaacagaaagaactaaatatggtaacagatagaaacttagagga 41752021  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41752022 ctgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 41752060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 8542671 - 8542898
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8542671 ttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgacggatattactggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 8542770  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| || |   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || |||||||||||| || |    
T  8542771 aaataggaggtcagatatccatataacacaaaccctaacatttatttgaataaaact-acagaaaggattaaatgtagtcacagtgagaaacttagagga 8542869  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8542870 ccaaaataaatcaatttttagttagagga 8542898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 17359353 - 17359538
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttc----atatgtatg 97  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||    
T  17359353 ttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtatg 17359452  T
Q  98 tgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac 183  Q
    ||||||| ||||| |||| || |   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17359453 tgtgaaagaggaggtcagatatccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac 17359538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 44332797 - 44332679
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44332797 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 44332698  T
Q  102 aaacaggagctcaggtacc 120  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  44332697 aaataggaggtcaggtacc 44332679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 41453298 - 41453406
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41453298 cataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttag 41453397  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  41453398 ttagaggac 41453406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17359338 - 17359230
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  17359338 cataacacaaaccctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 17359239  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  17359238 ttagaggac 17359230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40673283 - 40673058
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40673283 ttatttattagta--attttagtcatatgccttgttaaagtattagaattaaatagtgactgatattattggtaagtgttatgattcatatgtatgtgtg 40673186  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaa--actttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaag 199  Q
    ||||||||| ||||  |||  ||||||||||| |||||    ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  40673185 aaacaggaggtcagacacccacataacacaaatcctaacgtgtttatttg---aaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgaaaaacttacag 40673089  T
Q  200 aatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    ||   |||||||| || ||||||||||||||    
T  40673088 aactcaaataaattaaattttagttagagga 40673058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Original strand, 43247587 - 43247705
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43247587 ttatttattagtatcattttggtcttatgcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattactggtaactggtatggttcatatgtatgtgtg 43247686  T
Q  102 aaacaggagctcaggtacc 120  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  43247687 aaacaggaggtcaggtacc 43247705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 19681788 - 19681905
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  19681788 cataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 19681887  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  19681888 ttagaggactaatctgat 19681905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28297976 - 28297868
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  28297976 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacggtgagaaacttagagaactgaaataaatcaatttttag 28297877  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  28297876 ttagaggac 28297868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10526468 - 10526351
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  10526468 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 10526369  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  10526368 ttagaggaccaatctgat 10526351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 34037189 - 34037052
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||     
T  34037189 ttatttattaatatcattttggtcatattttttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattatttgtaactgttatgattcatatgtatgtgta 34037090  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaa 139  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  34037089 aaacaggaggtcaggtactcacataacacaaaccctaa 34037052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 44332812 - 44332929
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  44332812 cataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 44332911  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  44332912 ttagaggaccaatttgat 44332929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33716745 - 33716637
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  33716745 cataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 33716646  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  33716645 ttagaggac 33716637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6356922 - 6356805
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  6356922 cataacacaaacactaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 6356823  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  6356822 ttagaggaccaatctgat 6356805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 48626356 - 48626473
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  48626356 cataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtcagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttag 48626455  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  48626456 ttagaggactaatctgat 48626473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 41191978 - 41192090
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||     
T  41191978 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagatgaccgaaataaatcaatttttac 41192077  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  41192078 ttagaggactaat 41192090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 7909460 - 7909567
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  7909460 ataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtactaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttagt 7909559  T
Q  224 tagaggac 231  Q
    ||||||||    
T  7909560 tagaggac 7909567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 235
Target Start/End: Original strand, 35146985 - 35147094
Alignment:
Q  126 aacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagtta 225  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||    
T  35146985 aacacaaaccataacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaaattttagtta 35147084  T
Q  226 gaggactaat 235  Q
    ||||||||||    
T  35147085 gaggactaat 35147094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41751807 - 41751695
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  41751807 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggattaaatgtagtaacggttagaaacttagaggaccgaaataagtcaatttttag 41751708  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  41751707 ttagaggactaat 41751695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8542637 - 8542548
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8542637 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggac 8542548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 8937142 - 8937259
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||     
T  8937142 cataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaacttttaa 8937241  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  8937242 ttagaggacaaatctgat 8937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1114211 - 1114103
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1114211 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatttagtaactgtgtgaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 1114112  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  1114111 ttagaggac 1114103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7909443 - 7909339
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  7909443 cataacacaaactataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 7909344  T
Q  223 ttaga 227  Q
    |||||    
T  7909343 ttaga 7909339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 21391483 - 21391591
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  21391483 cataacacaaacactaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaagagtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttag 21391582  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  21391583 ttagaggac 21391591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 31075486 - 31075594
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  31075486 cataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaa 31075585  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    || ||||||    
T  31075586 ttggaggac 31075594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 31638240 - 31638344
Alignment:
Q  127 acacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttag 226  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31638240 acacaaaccataacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacgatgagaaatttaaaggaccgaaataaatcaatttttagttag 31638339  T
Q  227 aggac 231  Q
    |||||    
T  31638340 aggac 31638344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 4931566 - 4931679
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  4931566 cataacacaaattctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactgaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataattcaatttttag 4931665  T
Q  223 ttagaggactaatt 236  Q
    ||||||||| ||||    
T  4931666 ttagaggaccaatt 4931679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6356427 - 6356335
Alignment:
Q  139 aactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6356427 aactttatttgaataaaactaacaaaaatgactaaatgtagtaacggtaaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttaattagaggac 6356335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 7579165 - 7579277
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  7579165 cataacaaaaaccataacgtttatttgaatataactaaaataaaggactaaatgtagtaacggtgagaaaattagatgatcgaaataaatcaatttttag 7579264  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  7579265 ttagaggactaat 7579277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 28286410 - 28286522
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  28286410 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatataaagaactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaatcaatcaatttttag 28286509  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    ||| |||||||||    
T  28286510 ttaaaggactaat 28286522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Original strand, 27738958 - 27739060
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  27738958 cataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaa-gattaaatatagtaacggtgagaaactaaaaggaccgaaataaatcaatttttag 27739056  T
Q  223 ttag 226  Q
    ||||    
T  27739057 ttag 27739060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43247554 - 43247464
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatg-actaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43247554 tttatttgaataaaactaatagaaagggagtaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 43247464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16867840 - 16867747
Alignment:
Q  147 ttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16867840 ttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 16867747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 34037204 - 34037316
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  34037204 cataacataaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgcagtaacggagataaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 34037303  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    | |||||||||||    
T  34037304 tcagaggactaat 34037316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36674098 - 36674024
Alignment:
Q  157 ctaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674098 ctaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 36674024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Original strand, 40673298 - 40673371
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactta 196  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40673298 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatatagtaacggtgagaaactta 40673371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8416602 - 8416535
Alignment:
Q  163 gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8416602 gaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagagga 8416535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36423526 - 36423418
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  || ||| || | ||| |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||    
T  36423526 cataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaaccaaaagtggcaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaattaatttttag 36423427  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  36423426 ttagaggac 36423418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4155726 - 4155648
Alignment:
Q  152 taaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4155726 taaaactaacagaaaggacgaaatatagtaacggtgataaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagagga 4155648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36282908 - 36282826
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  36282908 taacggaaaagaccaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttaaaggaccaatctgat 36282826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 41893403 - 41893472
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41893403 taacggaaaagattaaatgtagtaacggtgaaaaacttaaggaatcgaaataaataaatttttagttaga 41893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 36283533 - 36283605
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36283533 taacaaaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttaagggacggaaataaatcaatttttagttagagga 36283605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Original strand, 32946669 - 32946739
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32946669 taacagaaaggactaaatgtactaacagtgaaaaacttagaaaaccgaaataaatcaatttttagttagag 32946739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41892088 - 41892015
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41892088 taacagaaaggactaaatgtagtaacattaagaaacttaagggaccgaaagaaatcaatttttagttagaggac 41892015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 231
Target Start/End: Original strand, 46540017 - 46540069
Alignment:
Q  179 gtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46540017 gtaacggtgagaaacttaagggattgaaatgaatcaatttttagttagaggac 46540069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38447662 - 38447600
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggt 186  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  38447662 cataacacaaacccaata-tttatttgaataaaatttaaagaaatgattaaatgtagtaacggt 38447600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 240
Target Start/End: Original strand, 8417285 - 8417346
Alignment:
Q  179 gtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  8417285 gtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaattaatttttagttaaaggaccaatctgat 8417346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28263626 - 28263545
Alignment:
Q  150 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| | | | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28263626 aataaaactaacggaaacgactaaaggtggtaacgggaagaaatttaaggtaccaaaataaatcaaattttagttaggggac 28263545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 225
Target Start/End: Original strand, 28264587 - 28264683
Alignment:
Q  129 acaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagtta 225  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||||||  |||| || |||| ||||||||   ||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||    
T  28264587 acaaaccctaacgtttttttaaataaaactaatggaaaggattaaaagtagtaacatagagaaacttaagggaccaaaataaatcaaattttagtta 28264683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8174163 - 8173925
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8174163 ttatttattagtatcattttgtttttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatggttcatatgtatgtgtg 8174064  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8174063 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgttcatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 8173964  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8173963 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 8173925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34735621 - 34735393
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34735621 ttatttattagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattaggattaaatagtgactgatataattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 34735522  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||||||   |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34735521 aaacaggaggctaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 34735422  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34735421 ccgaaataaatcaatttttagttagagga 34735393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15406034 - 15405805
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406034 ttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 15405935  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  15405934 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaga 15405835  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405834 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 15405805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 13193160 - 13193388
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13193160 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaataatgactcatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 13193259  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13193260 aaataggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 13193359  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13193360 ccgaaataaatcaatttttagttagagga 13193388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 29472414 - 29472642
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29472414 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatagttcatatgtatgtgtg 29472513  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  29472514 aaacaggaggtcaggtactcacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaatttagagga 29472613  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||    
T  29472614 ccaaaataaatcaattttttgttagagga 29472642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 16305197 - 16305426
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16305197 ttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgattgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 16305296  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16305297 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccataactcttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 16305396  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16305397 ttgaaataaatcaatttttagttagaggac 16305426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 41474254 - 41474487
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41474254 ttatttattagtatcattttgatcctatgccttgttaaggtattataattaaatagtgactgatagtattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 41474353  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |    
T  41474354 aaacaggaggtcagatactcacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaactcagagga 41474453  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 235  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41474454 ccgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 41474487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2148164 - 2147925
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2148164 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 2148065  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  2148064 aaataggaggtcaggtacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggc 2147965  T
Q  202 tcgaaataaatca-atttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2147964 ccgaaataaatcatttttttagttagaggaccaatctgat 2147925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26181978 - 26181749
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26181978 ttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattagtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 26181879  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| |||   ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  26181878 aaacaggagatcagatacacacataacacaaaccttaaggtttatttgaataaaactaacagaaaggaatatatgtagtaacggtgagaaacttagagga 26181779  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26181778 ccgaaataaatcaatttttagttagtggac 26181749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24372245 - 24372007
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24372245 ttatttattagtatcattttggtcctattcctttttaaagtattatgattaaattgtgactgatattattggtaactgttttggttcatatgtatgtgtg 24372146  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| || || ||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24372145 aaacagaaggtcgggtacccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 24372046  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24372045 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 24372007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19815982 - 19815756
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19815982 ttatttattagtatcattttgctcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 19815883  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||| ||    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19815882 aaacaagaggtcagatagtcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 19815783  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  19815782 ccgaaataaatcaatttttagttagag 19815756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 10992023 - 10992252
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10992023 ttatttattagcatcattttggtcctatgtcttgctaagatattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactcttatggttcatatgtatgtgtg 10992122  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  10992123 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 10992222  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10992223 ccgaaataaatcaatttttaattagaggac 10992252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 231
Target Start/End: Original strand, 17052259 - 17052455
Alignment:
Q  35 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaac 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  17052259 gttaaggtattatgattaaataatgactgatattatagataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcgggtacccacataacacaaac 17052358  T
Q  135 cctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17052359 actaacgtttatttgaatgaaactaacagaaatgactaaatgtagtaanggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttagttagaggac 17052455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 36713760 - 36713991
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36713760 ttatttattagt--cattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaa-tagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 36713856  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  |    
T  36713857 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaacaaacagaaatgactaagtgtggtaacggtgagaaacctagatga 36713956  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
       |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36713957 cgaaaataaatcaatttttagtttgaggaccaatt 36713991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7496257 - 7496029
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7496257 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaga-attatgagtaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 7496159  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| ||||   ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |    
T  7496158 aaataggaggtcagatacccatataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttagagga 7496059  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7496058 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 7496029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 15744629 - 15744857
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15744629 ttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 15744728  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15744729 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttaaataaaac----------gactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 15744818  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15744819 ccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 15744857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24138282 - 24138108
Alignment:
Q  66 attattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaa 165  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24138282 attattggtaactgttatggctcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcatgtacacacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaa 24138183  T
Q  166 atgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24138182 aggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagtggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 24138108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12860645 - 12860429
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||             ||||||||||||||||||    
T  12860645 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacgggtattat-------------ggttcatatgtatgtgtg 12860559  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12860558 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 12860459  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12860458 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 12860429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 7469338 - 7469556
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7469338 ttatttactagtatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagttagtgatattattgttaaccgttatggttcatatgtatgtgtg 7469437  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||| ||||||||||| |  |    
T  7469438 aaagaggaggtcagatacttacataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaatgacta--------aacgatgagaaacttagacga 7469529  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  7469530 ctgaaataaatcaatttttagttagag 7469556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7469323 - 7469206
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  7469323 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 7469224  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  7469223 ttagaggactaatctgat 7469206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 7496272 - 7496380
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7496272 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttag 7496371  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  7496372 ttagaggac 7496380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 24372260 - 24372377
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  24372260 cataacacaaatcctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 24372359  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  24372360 ttagaggactaatctgat 24372377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 8174178 - 8174295
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||    
T  8174178 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagaaacggtgagaaatttaaaggaccgaaataaattaatttttag 8174277  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  8174278 ttagaggaccaatctgat 8174295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 34735636 - 34735748
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34735636 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacagtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttag 34735735  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  34735736 ttagaggactaat 34735748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42834579 - 42834471
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42834579 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaatagtgagaaacttagagaaccgaaataaatcaatttttag 42834480  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  42834479 ttagaggac 42834471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 30898595 - 30898702
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||    
T  30898595 ataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaacaaaataaatcaatttttagt 30898694  T
Q  224 tagaggac 231  Q
    ||||||||    
T  30898695 tagaggac 30898702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13193145 - 13193028
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  13193145 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 13193046  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  13193045 ttagaggaccaatctgat 13193028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 12860660 - 12860768
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  12860660 cataacacaaaccgtaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 12860759  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  12860760 ttagaggac 12860768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15744614 - 15744506
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  15744614 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 15744515  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  15744514 ttagaggac 15744506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 19847611 - 19847719
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||    
T  19847611 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaagaccgaaataaattaatttttag 19847710  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  19847711 ttagaggac 19847719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 2148179 - 2148286
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  2148179 cataacagaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttaaaggaccaaaataaatcaatttttag 2148278  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  2148279 ttagagga 2148286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Original strand, 33470216 - 33470323
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  33470216 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 33470315  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    | ||||||    
T  33470316 tcagagga 33470323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38332861 - 38332754
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  38332861 cataaaacaaaccctaacatttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 38332762  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  38332761 ttagagga 38332754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Original strand, 38332974 - 38333080
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  38332974 ataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 38333073  T
Q  224 tagagga 230  Q
    |||||||    
T  38333074 tagagga 38333080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 15406049 - 15406157
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  15406049 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagattaaatgtagtaacagtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 15406148  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  15406149 ttagaggac 15406157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16305182 - 16305074
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  16305182 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaagaactaaatgtagtaattgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 16305083  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  16305082 ttagaggac 16305074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 26181993 - 26182101
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  26181993 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagggccgaaataaatcaatttttag 26182092  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  26182093 ttagaggac 26182101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10992008 - 10991901
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  10992008 cataacacaaactgtaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgaaaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttag 10991909  T
Q  223 ttagagga 230  Q
    ||||||||    
T  10991908 ttagagga 10991901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29472399 - 29472282
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||||    
T  29472399 cataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaggaacggtgagaaacttagaggaccaaaataaatctatttttag 29472300  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  29472299 ttagaggaccaatctgat 29472282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 24138799 - 24138917
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaat-gactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttta 221  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  24138799 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaagaccgaaataaatcaattttta 24138898  T
Q  222 gttagaggactaatttgat 240  Q
     ||| || |||||||||||    
T  24138899 attaaagtactaatttgat 24138917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 19815997 - 19816109
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  19815997 cataacacagactctaacgtttatttgaataaaactagcagaaaggactaaatgtagtaatggtctgaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 19816096  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  19816097 ttagaggactaat 19816109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8444951 - 8444875
Alignment:
Q  151 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  8444951 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttagttaga 8444875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19847596 - 19847490
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847596 ttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaga-attatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 19847498  T
Q  102 aaacagga 109  Q
    ||| ||||    
T  19847497 aaatagga 19847490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24138784 - 24138710
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataa 76  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24138784 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgataa 24138710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36713745 - 36713641
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||    
T  36713745 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacactgagaaatttagaggacataaataaatcaatttttag 36713646  T
Q  223 ttaga 227  Q
    |||||    
T  36713645 ttaga 36713641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Original strand, 38332876 - 38332946
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattg 72  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332876 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattg 38332946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41474239 - 41474131
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||     
T  41474239 cataacacaaacactaacgtttatttaaataaaactaacataaaagactaaatgtaataacagtgagaaacttagaggaccgaaataaataaatttttaa 41474140  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    ||| |||||    
T  41474139 ttacaggac 41474131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8962477 - 8962400
Alignment:
Q  163 gaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8962477 gaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttgagggaccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 8962400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17032703 - 17032642
Alignment:
Q  170 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032703 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttcgaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 17032642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17051039 - 17050978
Alignment:
Q  170 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17051039 ctaaatgtagtaacggtgagaaacttcgaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 17050978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Original strand, 8445123 - 8445187
Alignment:
Q  164 aaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  8445123 aaatgactaaatgtagtaactgtgataaacttagaggaccgaagtaaatcaatttttaattagag 8445187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 8963166 - 8963215
Alignment:
Q  179 gtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||    
T  8963166 gtaacggtgagaaacttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagag 8963215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 38588759 - 38588987
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588759 ttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 38588858  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  38588859 aaacaagaggtcaggtacccacataatacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacataaaggactaaatctagtaacggtgagaaacttagagga 38588958  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588959 ccgaaataaatcaatttttagttagagga 38588987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15871899 - 15871670
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15871899 ttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatgtgtatgtgtg 15871800  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |    
T  15871799 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacataaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttagagga 15871700  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15871699 ccaaaataaattaatttttagttagaggac 15871670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 40048227 - 40048454
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40048227 ttatttattagtatcattttggtcatattcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataaccgttatggttcat-tgtatgtgtg 40048325  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40048326 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 40048425  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40048426 tcaaaataaaacaatttttagttagagga 40048454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37569593 - 37569354
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaa-tagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37569593 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaaatagtgactgatatgattggtaactgttatggttcatatgtatgtgt 37569494  T
Q  101 gaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaga 200  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  37569493 gaaacaggaggtcaggtacccacataacaaaaaccataacgtttattcgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagg 37569394  T
Q  201 atcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37569393 accgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 37569354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 15048571 - 15048800
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048571 ttatttattagtatcattttggtcatattatttgttaaggtattatgattaaataatgattgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 15048670  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||| |||   ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15048671 aaacaagaggtcagatactcacataacacaaatcataacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 15048770  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048771 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 15048800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11708028 - 11707790
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11708028 ttatttattagtatcattttgatcttatgttttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 11707929  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||| ||  ||  ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |    
T  11707928 aaacagaaggacaaatacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaagagaaatgactaaatgtattaacagtgagaaacttagagga 11707829  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11707828 tcgaaacaaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 11707790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27473349 - 27473112
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27473349 ttatttattagtatcattttggtcttattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 27473250  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    || || ||| |||| ||||  ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27473249 aagcaagaggtcagatacccacataacacaaatcataatgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaac-gtgagaaacttagagga 27473151  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27473150 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 27473112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45276874 - 45276646
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45276874 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactattatggttcatatgtatgtgtg 45276775  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
     |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  45276774 gaacaggaggtcag-tacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaactaatataaatgactaaatgtagtaacgatgagaaacttagagga 45276676  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45276675 ccgaaataaatcaatttttagttagaggac 45276646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5435178 - 5434950
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5435178 ttatttattagtatcattttggtcatatgcctagttaaggtattataattaaataatgacaaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 5435079  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5435078 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaaaa 5434979  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5434978 ccgaaataaatcaaattttaggtagagga 5434950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 34470716 - 34470954
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34470716 ttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacagatattattggtaactgttatgattcttatgtatgtgtg 34470815  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  34470816 aaacaggaactcaggtacccacataacacaaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagcaacggtgaaaaacttagagga 34470915  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34470916 ccaaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 34470954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 1870105 - 1870335
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattat--gattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtg 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  1870105 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttattaatgtattatatgattaaatagtgactgatattattagtaaccgttatggttcatatgtatgtg 1870204  T
Q  100 tgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaag 199  Q
    ||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  1870205 tgaaacaggaggtctggtgcccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaactttgagaaacttagag 1870304  T
Q  200 aatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870305 gaccgaaataaatcaatttttagttagagga 1870335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 27669588 - 27669830
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgtta-----tggttcatatgtat 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     ||||||||||||||    
T  27669588 ttatttattagtatcattttggtcatataccttgttaaattattatgattaaatagtgactgatgttattggtaactgttaatttatggttcatatgtat 27669687  T
Q  97 gtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactta 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27669688 gtgtgaaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaatgattatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgtgaaactta 27669787  T
Q  197 aagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  27669788 aag-atcgaaataaatcaatttttagttagaagaccaatctgat 27669830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44594879 - 44594650
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44594879 ttatttattagtattattttggttctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatatatgtgtg 44594780  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||| |||||| |    
T  44594779 aaataggaggtcaagtacccacatagcacaaactctaatgtttatatgaataaaactaacagaaataactaaatgtagtaacgaatataaatttaaagga 44594680  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44594679 ccgaaataaatcaatttttagttaaaggac 44594650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5152812 - 5152575
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5152812 ttatttactagtatcattttggtcatatgccttcttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactgttatggttcatatgtatatatg 5152713  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  5152712 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacaatgagaaacttagagga 5152613  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  5152612 -ccaaataaatcaatttttagtcagaggaccaatctgat 5152575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1740226 - 1739993
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  1740226 ttatttgttagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattcttatgtttcatttgtatgtgtg 1740127  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| ||||| |||  |||| |||||| | | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |    
T  1740126 aaataggaggtcaggcacccacatagcacaaatcttgacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtaataacagtgagaaacttagagga 1740027  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 235  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740026 ccgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 1739993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7535111 - 7534887
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7535111 ttatttattagtatcattttggtcttattcctcgttaacgtattatgattaaataatgactgatattatttgtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 7535012  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    |||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||  |    
T  7535011 aaacaggaggccagatacccacataacacaaatcctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggac---------taacggtgagaaacttaaatga 7534921  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 235  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7534920 ccgaaataaatcaatttttaattaaaggactaat 7534887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40660183 - 40660027
Alignment:
Q  80 ttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtag 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  40660183 ttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggaggtcaggtatccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactattagaaaagactaaatgtag 40660084  T
Q  180 taacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatt 236  Q
    |||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40660083 taacagtgagaaacttagaggactgaaataaatcaatttttagttagatgactaatt 40660027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 240
Target Start/End: Original strand, 27473359 - 27473481
Alignment:
Q  118 accttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatt 217  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  27473359 acctacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatt 27473458  T
Q  218 tttagttagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  27473459 tttagttagaggactaatctgat 27473481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45077481 - 45077307
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataac-tgttatggttcatatgtatgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||    
T  45077481 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactttttatggtccacatgtatgtgt 45077382  T
Q  101 gaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaat 175  Q
    |||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45077381 gaaagaggaggtcagatacccacataacacaaaccataacgtttatttgaataaaactaacataaaggactaaat 45077307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1646785 - 1646553
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtat----- 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| |||||         
T  1646785 ttatttattagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattatgggtaattgtaatgtttcatttgtatttgta 1646686  T
Q  97 -gtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactt 195  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||  |||| |||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1646685 tgtgtgaaataggaggtcaggcacccacatagcacaaaccttgacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacagtgagaaactt 1646586  T
Q  196 aaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1646585 agaggaccgaaataaatcaatttttagttagag 1646553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33819975 - 33819834
Alignment:
Q  90 tatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgag 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33819975 tatgtatgtgtgaaacaggaggtcatatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacggtgag 33819876  T
Q  190 aaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33819875 aaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 33819834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 33295977 - 33296094
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  33295977 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaattaatttttag 33296076  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  33296077 ttagaggactaatctgat 33296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1432287 - 1432171
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  1432287 ataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgattaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 1432188  T
Q  224 tagaggactaatttgat 240  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  1432187 tagaggaccaatctgat 1432171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38588744 - 38588636
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  38588744 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 38588645  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  38588644 ttagaggac 38588636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 44594894 - 44595006
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  44594894 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaaccgaaatgactaaatgtagtaacggttagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 44594993  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  44594994 ttagaggactaat 44595006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15048556 - 15048444
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  15048556 cataacaaaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtcagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 15048457  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  15048456 ttagaggactaat 15048444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Original strand, 45276889 - 45277001
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  45276889 cataacacaatccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaataaatttttag 45276988  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  45276989 ttagaggactaat 45277001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1870085 - 1869983
Alignment:
Q  128 cacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1870085 cacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagaaccgaaataaattaatttttagttaga 1869986  T
Q  228 gga 230  Q
    |||    
T  1869985 gga 1869983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Original strand, 5435193 - 5435298
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5435193 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacaaaagtgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaaggaccgaaataaatcaatttttag 5435292  T
Q  223 ttagag 228  Q
    ||||||    
T  5435293 ttagag 5435298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 1651865 - 1651972
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1651865 cataacacaaaacctaa-ctttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 1651963  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  1651964 ttagaggac 1651972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Original strand, 1740241 - 1740348
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1740241 cataacacaaaacctaa-ctttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 1740339  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  1740340 ttagaggac 1740348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 7949584 - 7949722
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtat-gtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |    
T  7949584 ttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactg-tattgttcatatgtatggtct 7949682  T
Q  101 gaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaa 140  Q
    |||| ||||| |||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  7949683 gaaataggaggtcagatacccacataacacaaacactaaa 7949722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33295962 - 33295859
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33295962 ttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatgattcatatgtatgtgtg 33295863  T
Q  102 aaac 105  Q
    ||||    
T  33295862 aaac 33295859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 40660179 - 40660292
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  40660179 cataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatatagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 40660278  T
Q  223 ttagaggactaatt 236  Q
    ||||||||| ||||    
T  40660279 ttagaggaccaatt 40660292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 45077496 - 45077613
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  45077496 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaatagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccaaaataaatcaatttttag 45077595  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  45077596 ttagaggaccaatctgat 45077613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 5152828 - 5152935
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  5152828 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaaaactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagt 5152927  T
Q  224 tagaggac 231  Q
    ||||||||    
T  5152928 tagaggac 5152935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Original strand, 1432303 - 1432421
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1432303 ttatttattaatatcattttgatcatatgccttgttaatgtattatgtttaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtacgtgtg 1432402  T
Q  102 aaacaggagctcaggtacc 120  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  1432403 aaacaggaggtcagatacc 1432421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7949569 - 7949471
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaattttta 221  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  7949569 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaattttta 7949471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 7535126 - 7535243
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  7535126 cataacacaaactataacgtttatttgaataaaactaacataaaggattaaatgtagtaacgatgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 7535225  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  7535226 ttagaggactaatctgat 7535243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 11173946 - 11174035
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11173946 tttatttgaataaaactaacataaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 11174035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24659474 - 24659366
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24659474 ttatttattagtatcattttggtcctctgccttattaaggtattctgattaaatagtgactgatattattactaactgttatagttaatatgtatgtgtg 24659375  T
Q  102 aaacaggag 110  Q
    |||||||||    
T  24659374 aaacaggag 24659366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Original strand, 15871914 - 15872031
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  15871914 cataacacaagctctaacgtttatttgaataaaactaacaaaaaagactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttat 15872013  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  15872014 ttagaggaccaatctgat 15872031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 227
Target Start/End: Original strand, 1646815 - 1646903
Alignment:
Q  139 aactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  1646815 aactttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 1646903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27669573 - 27669465
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27669573 cataacataaaccctaacgtttatttcaataaaactaacagaaaggactaaatgtactaacagtgagaaatttagaggaccgaaataaatcaatttttag 27669474  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  27669473 ttagaggac 27669465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 240
Target Start/End: Original strand, 22763232 - 22763343
Alignment:
Q  129 acaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    |||||||||||  ||| ||| | ||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22763232 acaaaccctaacgtttttttaattaaatttaacggaaaagactaaatgtagtaacggtgagaaacttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag 22763331  T
Q  229 gactaatttgat 240  Q
    ||| ||| ||||    
T  22763332 gaccaatctgat 22763343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Original strand, 18298522 - 18298595
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactta 196  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18298522 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaattgtgagaaactta 18298595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1651850 - 1651719
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  1651850 ttatttgttagtatcattttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattcttatgtttcatttgtatgtgtg 1651751  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaa 133  Q
    ||| ||||| ||||| |||  |||| ||||||    
T  1651750 aaataggaggtcaggcacccacatagcacaaa 1651719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40048216 - 40048112
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  40048216 cataacacaaactttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaac--------agttagagaatcaaaataaattaatttttag 40048125  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  40048124 ttagaggactaat 40048112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18298481 - 18298410
Alignment:
Q  39 aggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18298481 aggtattatgattaaatagtgacaaatattattagtaactgttatgattcatatgtatgtgtgaaataggag 18298410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33295862 - 33295776
Alignment:
Q  154 aaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  33295862 aaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgacaaacttagaataccgaaataaatcaatttttaattagaagaccaatctgat 33295776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 11173912 - 11173858
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaata 56  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11173912 ttatttattagtatcatttgggttctatgctttgttaaggtattatgaataaata 11173858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22762614 - 22762558
Alignment:
Q  179 gtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 235  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22762614 gtaacggtgagaaacttaagggatcgaaataaatcaatttttaattagaggattaat 22762558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Original strand, 37569627 - 37569712
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||   |||||| ||| || | | |||||||| |||||||| |||||    
T  37569627 tttatttgaataaaactaactgaaaagactaaatatagtaacaacgagaaatttagaggaccaaaataaataaatttttaattaga 37569712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 18445 - 18674
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18445 ttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 18544  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |    
T  18545 aaacaggcggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaagactaaatgtagtaacagtgaaaaacttagagga 18644  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18645 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 18674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18430 - 18322
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||    
T  18430 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtagcggtgagaaacttagaagacctaaataaatcaatttttag 18331  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  18330 ttagaggac 18322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14413 - 14175
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14413 ttatttattagcatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgacaaatattattggtaactcttatggttcatatgtatgtgtg 14314  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14313 aaacaagaggtcagatacccacataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagga 14214  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14213 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 14175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Original strand, 14429 - 14535
Alignment:
Q  124 ataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagt 223  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  14429 ataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacatagaggaccgaaataaatcaatttttagt 14528  T
Q  224 tagagga 230  Q
    |||||||    
T  14529 tagagga 14535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 82136 - 81898
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  82136 ttatttattaatatcattttggtcctatttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatctgtg 82037  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||   || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  82036 aaacaggaggtcaggtacccaaattacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 81937  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  81936 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 81898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Original strand, 82151 - 82224
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaactta 196  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  82151 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaactta 82224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Original strand, 90782 - 90843
Alignment:
Q  174 atgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90782 atgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggactaat 90843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 15620 - 15845
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15620 ttatttattagtatcatttttgtcctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatggttcgtatgtatatgtg 15719  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||| || |    
T  15720 aaacaggaggtcaggtacccacataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaagggattaaatgtagtcatggtgagaaacttagagga 15819  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15820 ccgaaataaatcaatttttagttaga 15845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15575 - 15503
Alignment:
Q  158 taacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagagga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15575 taacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttaaatgaccaaaataaatcaatttttaattagagga 15503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 349245 - 349482
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  349245 ttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 349344  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| || |    
T  349345 aaacaggaggtcagatacccacataacacaaaccctaacatttatttgaataaaattaacagaaaggactaaatgtagtaaaagtgag-aacttagagga 349443  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  349444 ccgaaataaatcaatttttagttagaggaccaatctgat 349482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 113538 - 113776
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  113538 ttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgctaattgttatagtgcatttgtatgtgtg 113637  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |    
T  113638 aaacaagaggtcagatacccacataacactaaccttaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaatttagatga 113737  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggactaatttgat 240  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  113738 ccgaaagaaatcaatttttagttacaggaccaatctgat 113776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 349230 - 349118
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  349230 cataacgcaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtaaaaacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttag 349131  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  349130 ttagaggactaat 349118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 113522 - 113442
Alignment:
Q  151 ataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| || ||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  113522 ataaaactaacggaaaggaataaatttactaacgatgaaaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 113442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 19880 - 20109
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880 ttatttattagcatcattttggtcatattccttgttaaggttttatgattaaatagtgacggatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 19979  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19980 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 20079  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
       |||  ||||||||||||||||||||||    
T  20080 caaaaaataatcaatttttagttagaggac 20109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19865 - 19753
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  19865 cataatacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtaagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 19766  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  19765 ttagaggactaat 19753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 24334 - 24563
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||  |||||||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334 ttatttattaacatcattttggtcctgttccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 24433  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| ||||  |||| || |   ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  24434 aaataggatatcagatatccatataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaattaacagaaatgactaaatgtagtaacagtgagaaacttagagga 24533  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24534 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 24563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24319 - 24206
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24319 cataacacaaaccctaacgtttatttgaaaaaaactaacagaaatgactaaatgtaataacggtgagaaacttagaggatcgaaataaatcaatttttag 24220  T
Q  223 ttagaggactaatt 236  Q
    ||||||||| ||||    
T  24219 ttagaggaccaatt 24206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 72934 - 73162
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72934 ttatttattagcatcattttggtcttattccttgttaaga-attatgattaaatagtgaccaatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 73032  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaa 201  Q
    ||| |||||  ||||||||   ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  73033 aaataggaggccaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagagga 73132  T
Q  202 tcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  73133 ccaaaataaatcaatttttagttagaggac 73162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 72919 - 72811
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  72919 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggaataaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 72820  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  72819 ttagaggac 72811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 231
Target Start/End: Original strand, 6198 - 6395
Alignment:
Q  33 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||    
T  6198 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataattattatgtttcttatggatgtgtgaaacaagatgtcagatacccacataacacaa 6297  T
Q  133 accctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6298 actctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaat-aatcaatttttagttagaggac 6395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6155 - 6047
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  6155 cataacacaaactctaatgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagtaacaatgagaaacttagaagaccgaaataaatcaatttttag 6056  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  6055 ttagaggac 6047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 227
Target Start/End: Original strand, 56395 - 56533
Alignment:
Q  89 atatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 188  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56395 atatgtatgtgtgaaacaggaggttaggtacccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 56494  T
Q  189 gaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  56495 gaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 56533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 227
Target Start/End: Original strand, 63520 - 63658
Alignment:
Q  89 atatgtatgtgtgaaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 188  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63520 atatgtatgtgtgaaacaggaggttaggtacccacataaaacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtga 63619  T
Q  189 gaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttaga 227  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  63620 gaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttaga 63658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45913 - 45801
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  45913 cataacacaaaccctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaaccgtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 45814  T
Q  223 ttagaggactaat 235  Q
    |||||||||||||    
T  45813 ttagaggactaat 45801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Original strand, 45932 - 46020
Alignment:
Q  6 ttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgt 94  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  45932 ttattagtttcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattggtaactgttatgatttatatgt 46020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 20923 - 21086
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20923 ttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaga-attatgattaaatagtgaccgatattattggtaactgttatggttcatatgtatgtgtg 21021  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaa 166  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  21022 aaataggaggtcaggtacccatataacacaaacccgaacgtttatttgaataaaactaatagaaa 21086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20908 - 20800
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  20908 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaacagtgtgaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 20809  T
Q  223 ttagaggac 231  Q
    |||||||||    
T  20808 ttagaggac 20800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21668 - 21552
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  21668 cataacacaaaacctaa-ctttatttgaataaaactaacaaaaaggactaaatgtagtaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 21570  T
Q  223 ttagaggactaatttgat 240  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  21569 ttagaggactaatctgat 21552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 22465 - 22554
Alignment:
Q  142 tttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagaggac 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22465 tttatttgaataaaactaacagaaaggactaaatgtagtaatagtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttagttagaggac 22554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 21683 - 21814
Alignment:
Q  2 ttatttattagtatcattttagttctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgataactgttatggttcatatgtatgtgtg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||   | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  21683 ttatttattagtatcattttggtcctatatctcgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattattggtaattgttatgtttcatttgtatgtgtg 21782  T
Q  102 aaacaggagctcaggtaccttcataacacaaa 133  Q
    ||| ||||| ||||  |||  |||||||||||    
T  21783 aaataggaggtcagacacccacataacacaaa 21814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14348 - 14243
Alignment:
Q  123 cataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttag 222  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  14348 cataacacaaactctaacgtttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatatagcaacggtgagaaacttagaggaccgaaataaatcaatttttag 14249  T
Q  223 ttagag 228  Q
    ||||||    
T  14248 ttagag 14243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 236
Target Start/End: Original strand, 147130 - 147246
Alignment:
Q  120 cttcataacacaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttt 219  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  147130 cttcataacataaatcctaacgtttattcgaataaaattaacggaaatgactaaatatagtaacgatgagaaacttaacggaccgaaataaatcaatttt 147229  T
Q  220 tagttagaggactaatt 236  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  147230 tagttcgaggaccaatt 147246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 144150 - 144072
Alignment:
Q  150 aataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  144150 aataaaaccaatggaaaagactaaaagtagtaacggtgagaaatttaagggaccgaaataaatcaatttttagttagag 144072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9932 - 9832
Alignment:
Q  129 acaaaccctaaactttatttgaataaaactaacagaaatgactaaatgtagtaacggtgagaaacttaaagaatcgaaataaatcaatttttagttagag 228  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9932 acaaaccctaacgttttttt-aataaaactaacggaaaggactaaaagtagtaacggatagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagag 9834  T
Q  229 ga 230  Q
    ||    
T  9833 ga 9832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University